/[escript]/branches/arrexp_2137_win/escript/src/DataTagged.cpp
ViewVC logotype

Diff of /branches/arrexp_2137_win/escript/src/DataTagged.cpp

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

revision 1795 by phornby, Fri Jul 11 13:12:46 2008 UTC revision 1796 by jfenwick, Wed Sep 17 01:45:46 2008 UTC
# Line 21  Line 21 
21  #ifdef USE_NETCDF  #ifdef USE_NETCDF
22  #include <netcdfcpp.h>  #include <netcdfcpp.h>
23  #endif  #endif
24    #include "DataMaths.h"
25    
26  using namespace std;  using namespace std;
27    
28  namespace escript {  namespace escript {
29    
30  DataTagged::DataTagged()  DataTagged::DataTagged()
31    : DataAbstract(FunctionSpace())    : DataAbstract(FunctionSpace(),DataTypes::scalarShape)
32  {  {
33    // default constructor    // default constructor
34    
35    // create a scalar default value    // create a scalar default value
36    m_data.resize(1,0.,1);    m_data.resize(1,0.,1);
37    DataArrayView temp(m_data,DataArrayView::ShapeType());  /*  DataArrayView temp(m_data,DataTypes::ShapeType());
38    setPointDataView(temp);    setPointDataView(temp);*/
39  }  }
40    
41  DataTagged::DataTagged(const TagListType& tagKeys,  // DataTagged::DataTagged(const TagListType& tagKeys,
42                 const ValueListType& values,  //             const ValueListType& values,
43                 const DataArrayView& defaultValue,  //             const DataArrayView& defaultValue,
44                 const FunctionSpace& what)  //             const FunctionSpace& what)
45    : DataAbstract(what)  //   : DataAbstract(what)
46  {  // {
47    // constructor  //   // constructor
48    //
49    // initialise the array of data values  //   // initialise the array of data values
50    // the default value is always the first item in the values list  //   // the default value is always the first item in the values list
51    int len = defaultValue.noValues();  //   int len = defaultValue.noValues();
52    m_data.resize(len,0.,len);  //   m_data.resize(len,0.,len);
53    for (int i=0; i<defaultValue.noValues(); i++) {  //   for (int i=0; i<defaultValue.noValues(); i++) {
54      m_data[i]=defaultValue.getData(i);  //     m_data[i]=defaultValue.getData(i);
55    }  //   }
56    //
57    // create the data view  //   // create the data view
58    DataArrayView temp(m_data,defaultValue.getShape());  //   DataArrayView temp(m_data,defaultValue.getShape());
59    setPointDataView(temp);  //   setPointDataView(temp);
60    //
61    // add remaining tags and values  //   // add remaining tags and values
62    addTaggedValues(tagKeys,values);  //   addTaggedValues(tagKeys,values);
63  }  // }
64    
65  DataTagged::DataTagged(const FunctionSpace& what,  DataTagged::DataTagged(const FunctionSpace& what,
66                         const DataArrayView::ShapeType &shape,                         const DataTypes::ShapeType &shape,
67                         const int tags[],                         const int tags[],
68                         const ValueType& data)                         const ValueType& data)
69    : DataAbstract(what)    : DataAbstract(what,shape)
70  {  {
71    // alternative constructor    // alternative constructor
72    // not unit_tested tested yet    // not unit_tested tested yet
73      // It is not explicitly unit tested yet, but it is called from DataFactory
74    
75    // copy the data    // copy the data
76    m_data=data;    m_data=data;
77    
78    // create the view of the data    // create the view of the data
79    DataArrayView tempView(m_data,shape);  //   DataArrayView tempView(m_data,shape);
80    setPointDataView(tempView);  //   setPointDataView(tempView);
81    
82      // we can't rely on the tag array to give us the number of tags so
83      // use the data we have been passed
84      int valsize=DataTypes::noValues(shape);
85      int ntags=data.size()/valsize;
86    
87    // create the tag lookup map    // create the tag lookup map
88    for (int sampleNo=0; sampleNo<getNumSamples(); sampleNo++) {    // we assume that the first value and first tag are the default value so we skip
89      m_offsetLookup.insert(DataMapType::value_type(sampleNo,tags[sampleNo]));    for (int i=1;i<ntags;++i)
90      {
91        m_offsetLookup.insert(DataMapType::value_type(tags[i],i*valsize));
92    }    }
93  }  }
94    
95  DataTagged::DataTagged(const FunctionSpace& what,  DataTagged::DataTagged(const FunctionSpace& what,
96                         const DataArrayView::ShapeType &shape,                         const DataTypes::ShapeType &shape,
97                         const TagListType& tags,                         const TagListType& tags,
98                         const ValueType& data)                         const ValueType& data)
99    : DataAbstract(what)    : DataAbstract(what,shape)
100  {  {
101    // alternative constructor    // alternative constructor
   // not unit_tested tested yet  
102    
103    // copy the data    // copy the data
104    m_data=data;    m_data=data;
105    
106    // create the view of the data    // create the view of the data
107    DataArrayView tempView(m_data,shape);  //   DataArrayView tempView(m_data,shape);
108    setPointDataView(tempView);  //   setPointDataView(tempView);
109    
110      // create the tag lookup map
111    
112    //   for (int sampleNo=0; sampleNo<getNumSamples(); sampleNo++) {
113    //     m_offsetLookup.insert(DataMapType::value_type(sampleNo,tags[sampleNo]));
114    //   }
115    
116      // The above code looks like it will create a map the wrong way around
117    
118      int valsize=DataTypes::noValues(shape);
119      int npoints=(data.size()/valsize)-1;
120      int ntags=tags.size();
121      if (ntags>npoints)
122      {     // This throw is not unit tested yet
123        throw DataException("Programming error - Too many tags for the supplied values.");
124      }
125    
126    // create the tag lookup map    // create the tag lookup map
127    for (int sampleNo=0; sampleNo<getNumSamples(); sampleNo++) {    // we assume that the first value is the default value so we skip it (hence the i+1 below)
128      m_offsetLookup.insert(DataMapType::value_type(sampleNo,tags[sampleNo]));    for (int i=0;i<ntags;++i)
129      {
130        m_offsetLookup.insert(DataMapType::value_type(tags[i],(i+1)*valsize));
131    }    }
132  }  }
133    
134    
135  DataTagged::DataTagged(const DataTagged& other)  DataTagged::DataTagged(const DataTagged& other)
136    : DataAbstract(other.getFunctionSpace()),    : DataAbstract(other.getFunctionSpace(),other.getShape()),
137    m_data(other.m_data),    m_data(other.m_data),
138    m_offsetLookup(other.m_offsetLookup)    m_offsetLookup(other.m_offsetLookup)
139  {  {
140    // copy constructor    // copy constructor
141    
142    // create the data view    // create the data view
143    DataArrayView temp(m_data,other.getPointDataView().getShape());  //   DataArrayView temp(m_data,other.getPointDataView().getShape());
144    setPointDataView(temp);  //   setPointDataView(temp);
145  }  }
146    
147  DataTagged::DataTagged(const DataConstant& other)  DataTagged::DataTagged(const DataConstant& other)
148    : DataAbstract(other.getFunctionSpace())    : DataAbstract(other.getFunctionSpace(),other.getShape())
149  {  {
150    // copy constructor    // copy constructor
151    
152    // fill the default value with the constant value item from "other"    // fill the default value with the constant value item from "other"
153    const DataArrayView& value=other.getPointDataView();  //   const DataArrayView& value=other.getPointDataView();
154    int len = value.noValues();    int len = other.getNoValues();
155    m_data.resize(len,0.,len);    m_data.resize(len,0.,len);
156    for (int i=0; i<value.noValues(); i++) {    for (int i=0; i<len; i++) {
157      m_data[i]=value.getData(i);      m_data[i]=other.getVector()[i];
158    }    }
159    
160    // create the data view  //   // create the data view
161    DataArrayView temp(m_data,value.getShape());  //   DataArrayView temp(m_data,value.getShape());
162    setPointDataView(temp);  //   setPointDataView(temp);
163    }
164    
165    
166    // Create a new object by copying tags
167    DataTagged::DataTagged(const FunctionSpace& what,
168                 const DataTypes::ShapeType& shape,
169             const DataTypes::ValueType& defaultvalue,
170                 const DataTagged* tagsource)
171     : DataAbstract(what,shape)
172    {
173    // This constructor has not been unit tested yet
174    
175      if (defaultvalue.size()!=DataTypes::noValues(shape)) {
176        throw DataException("Programming error - defaultvalue does not match supplied shape.");
177      }
178    
179    
180      if (tagsource!=0)
181      {
182        int numtags=tagsource->getTagLookup().size();
183        //  m_offsetLookup.reserve(tagsource.getTagLookup().size());
184        m_data.resize(defaultvalue.size(),0.);  // since this is tagged data, we should have blocksize=1
185    
186           DataTagged::DataMapType::const_iterator i;
187           for (i=tagsource->getTagLookup().begin();i!=tagsource->getTagLookup().end();i++) {
188          addTag(i->first);
189           }
190      }
191      else
192      {
193        m_data.resize(defaultvalue.size());
194      }
195    
196    
197    
198      // need to set the default value ....
199      for (int i=0; i<defaultvalue.size(); i++) {
200         m_data[i]=defaultvalue[i];
201      }
202  }  }
203    
204    
205    
206  DataAbstract*  DataAbstract*
207  DataTagged::getSlice(const DataArrayView::RegionType& region) const  DataTagged::getSlice(const DataTypes::RegionType& region) const
208  {  {
209    return new DataTagged(*this, region);    return new DataTagged(*this, region);
210  }  }
211    
212  DataTagged::DataTagged(const DataTagged& other,  DataTagged::DataTagged(const DataTagged& other,
213                 const DataArrayView::RegionType& region)                 const DataTypes::RegionType& region)
214    : DataAbstract(other.getFunctionSpace())    : DataAbstract(other.getFunctionSpace(),DataTypes::getResultSliceShape(region))
215  {  {
216    // slice constructor    // slice constructor
217    
218    // get the shape of the slice to copy from other    // get the shape of the slice to copy from other
219    DataArrayView::ShapeType regionShape(DataArrayView::getResultSliceShape(region));    DataTypes::ShapeType regionShape(DataTypes::getResultSliceShape(region));
220    DataArrayView::RegionLoopRangeType regionLoopRange=getSliceRegionLoopRange(region);    DataTypes::RegionLoopRangeType regionLoopRange=DataTypes::getSliceRegionLoopRange(region);
221    
222    // allocate enough space in this for all values    // allocate enough space in this for all values
223    // (need to add one to allow for the default value)    // (need to add one to allow for the default value)
224    int len = DataArrayView::noValues(regionShape)*(other.m_offsetLookup.size()+1);    int len = DataTypes::noValues(regionShape)*(other.m_offsetLookup.size()+1);
225    m_data.resize(len,0.0,len);    m_data.resize(len,0.0,len);
226    
227    // create the data view    // create the data view
228    DataArrayView temp(m_data,regionShape);  //   DataArrayView temp(m_data,regionShape);
229    setPointDataView(temp);  //   setPointDataView(temp);
230    
231    // copy the default value from other to this    // copy the default value from other to this
232    getDefaultValue().copySlice(other.getDefaultValue(), regionLoopRange);  //   getDefaultValue().copySlice(other.getDefaultValue(), regionLoopRange);
233      const DataTypes::ShapeType& otherShape=other.getShape();
234      const DataTypes::ValueType& otherData=other.getVector();
235      DataTypes::copySlice(getVector(),getShape(),getDefaultOffset(),otherData,otherShape,other.getDefaultOffset(), regionLoopRange);
236    
237    // loop through the tag values copying these    // loop through the tag values copying these
238    DataMapType::const_iterator pos;    DataMapType::const_iterator pos;
239    DataArrayView::ValueType::size_type tagOffset=getPointDataView().noValues();    DataTypes::ValueType::size_type tagOffset=getNoValues();
240    for (pos=other.m_offsetLookup.begin();pos!=other.m_offsetLookup.end();pos++){    for (pos=other.m_offsetLookup.begin();pos!=other.m_offsetLookup.end();pos++){
241      getPointDataView().copySlice(tagOffset,other.getPointDataView(),pos->second,regionLoopRange);  //     getPointDataView().copySlice(tagOffset,other.getPointDataView(),pos->second,regionLoopRange);
242        DataTypes::copySlice(m_data,getShape(),tagOffset,otherData, otherShape, pos->second, regionLoopRange);
243      m_offsetLookup.insert(DataMapType::value_type(pos->first,tagOffset));      m_offsetLookup.insert(DataMapType::value_type(pos->first,tagOffset));
244      tagOffset+=getPointDataView().noValues();      tagOffset+=getNoValues();
245    }    }
246  }  }
247    
248  void  void
249  DataTagged::setSlice(const DataAbstract* other,  DataTagged::setSlice(const DataAbstract* other,
250                       const DataArrayView::RegionType& region)                       const DataTypes::RegionType& region)
251  {  {
252    
253    // other must be another DataTagged object    // other must be another DataTagged object
# Line 187  DataTagged::setSlice(const DataAbstract* Line 258  DataTagged::setSlice(const DataAbstract*
258    }    }
259    
260    // determine shape of the specified region    // determine shape of the specified region
261    DataArrayView::ShapeType regionShape(DataArrayView::getResultSliceShape(region));    DataTypes::ShapeType regionShape(DataTypes::getResultSliceShape(region));
262    
263    // modify region specification as needed to match rank of this object    // modify region specification as needed to match rank of this object
264    DataArrayView::RegionLoopRangeType regionLoopRange=getSliceRegionLoopRange(region);    DataTypes::RegionLoopRangeType regionLoopRange=DataTypes::getSliceRegionLoopRange(region);
265    
266    // ensure rank/shape of this object is compatible with specified region    // ensure rank/shape of this object is compatible with specified region
267    if (getPointDataView().getRank()!=region.size()) {    if (getRank()!=region.size()) {
268      throw DataException("Error - Invalid slice region.");      throw DataException("Error - Invalid slice region.");
269    }    }
270    if (otherTemp->getPointDataView().getRank()>0 && !other->getPointDataView().checkShape(regionShape)) {    if (otherTemp->getRank()>0 && !DataTypes::checkShape(other->getShape(),regionShape)) {
271      throw DataException (other->getPointDataView().createShapeErrorMessage(      throw DataException (DataTypes::createShapeErrorMessage(
272                           "Error - Couldn't copy slice due to shape mismatch.",regionShape));                           "Error - Couldn't copy slice due to shape mismatch.",regionShape,other->getShape()));
273    }    }
274    
275      const DataTypes::ValueType& otherData=otherTemp->getVector();
276      const DataTypes::ShapeType& otherShape=otherTemp->getShape();
277    // copy slice from other default value to this default value    // copy slice from other default value to this default value
278    getDefaultValue().copySliceFrom(otherTemp->getDefaultValue(), regionLoopRange);  //   getDefaultValue().copySliceFrom(otherTemp->getDefaultValue(), regionLoopRange);
279      DataTypes::copySliceFrom(m_data,getShape(),getDefaultOffset(),otherData,otherShape,otherTemp->getDefaultOffset(),regionLoopRange);
280    
281    // loop through tag values in other, adding any which aren't in this, using default value    // loop through tag values in other, adding any which aren't in this, using default value
282    DataMapType::const_iterator pos;    DataMapType::const_iterator pos;
283    for (pos=otherTemp->m_offsetLookup.begin();pos!=otherTemp->m_offsetLookup.end();pos++) {    for (pos=otherTemp->m_offsetLookup.begin();pos!=otherTemp->m_offsetLookup.end();pos++) {
284      if (!isCurrentTag(pos->first)) {      if (!isCurrentTag(pos->first)) {
285        addTaggedValue(pos->first,getDefaultValue());        addTag(pos->first);
286      }      }
287    }    }
288    
289    // loop through the tag values copying slices from other to this    // loop through the tag values copying slices from other to this
290    for (pos=m_offsetLookup.begin();pos!=m_offsetLookup.end();pos++) {    for (pos=m_offsetLookup.begin();pos!=m_offsetLookup.end();pos++) {
291      getDataPointByTag(pos->first).copySliceFrom(otherTemp->getDataPointByTag(pos->first), regionLoopRange);  //     getDataPointByTag(pos->first).copySliceFrom(otherTemp->getDataPointByTag(pos->first), regionLoopRange);
292        DataTypes::copySliceFrom(m_data,getShape(),getOffsetForTag(pos->first),otherData, otherShape, otherTemp->getOffsetForTag(pos->first), regionLoopRange);
293    
294    }    }
295    
296  }  }
# Line 249  DataTagged::getTagNumber(int dpno) Line 325  DataTagged::getTagNumber(int dpno)
325    return(tagNo);    return(tagNo);
326  }  }
327    
328    // void
329    // DataTagged::setTaggedValues(const TagListType& tagKeys,
330    //                             const ValueListType& values)
331    // {
332    //   addTaggedValues(tagKeys,values);
333    // }
334    
335  void  void
336  DataTagged::setTaggedValues(const TagListType& tagKeys,  DataTagged::setTaggedValue(int tagKey,
337                              const ValueListType& values)                 const DataTypes::ShapeType& pointshape,
338  {                             const ValueType& value,
339    addTaggedValues(tagKeys,values);                 int dataOffset)
340    {
341      if (!DataTypes::checkShape(getShape(), pointshape)) {
342          throw DataException(DataTypes::createShapeErrorMessage(
343                              "Error - Cannot setTaggedValue due to shape mismatch.", pointshape,getShape()));
344      }
345      DataMapType::iterator pos(m_offsetLookup.find(tagKey));
346      if (pos==m_offsetLookup.end()) {
347        // tag couldn't be found so use addTaggedValue
348        addTaggedValue(tagKey,pointshape, value, dataOffset);
349      } else {
350        // copy the values into the data array at the offset determined by m_offsetLookup
351        int offset=pos->second;
352        for (int i=0; i<getNoValues(); i++) {
353          m_data[offset+i]=value[i+dataOffset];
354        }
355      }
356  }  }
357    
358    
359    /*
360  void  void
361  DataTagged::setTaggedValue(int tagKey,  DataTagged::setTaggedValue(int tagKey,
362                             const DataArrayView& value)                             const DataArrayView& value)
363  {  {
364    if (!getPointDataView().checkShape(value.getShape())) {    if (!getPointDataView().checkShape(value.getShape())) {
365        throw DataException(getPointDataView().createShapeErrorMessage(        throw DataException(DataTypes::createShapeErrorMessage(
366                            "Error - Cannot setTaggedValue due to shape mismatch.", value.getShape()));                            "Error - Cannot setTaggedValue due to shape mismatch.", value.getShape(),getShape()));
367    }    }
368    DataMapType::iterator pos(m_offsetLookup.find(tagKey));    DataMapType::iterator pos(m_offsetLookup.find(tagKey));
369    if (pos==m_offsetLookup.end()) {    if (pos==m_offsetLookup.end()) {
# Line 275  DataTagged::setTaggedValue(int tagKey, Line 376  DataTagged::setTaggedValue(int tagKey,
376        m_data[offset+i]=value.getData(i);        m_data[offset+i]=value.getData(i);
377      }      }
378    }    }
379    }*/
380    
381    // void
382    // DataTagged::addTaggedValues(const TagListType& tagKeys,
383    //                             const ValueListType& values)
384    // {
385    //   if (values.size()==0) {
386    //     // copy the current default value for each of the tags
387    //     TagListType::const_iterator iT;
388    //     for (iT=tagKeys.begin();iT!=tagKeys.end();iT++) {
389    //       // the point data view for DataTagged points at the default value
390    //       addTaggedValue(*iT,getPointDataView());
391    //     }
392    //   } else if (values.size()==1 && tagKeys.size()>1) {
393    //     // assume the one given value will be used for all tag values
394    //     TagListType::const_iterator iT;
395    //     for (iT=tagKeys.begin();iT!=tagKeys.end();iT++) {
396    //       addTaggedValue(*iT,values[0]);
397    //     }
398    //   } else {
399    //     if (tagKeys.size()!=values.size()) {
400    //       stringstream temp;
401    //       temp << "Error - (addTaggedValue) Number of tags: " << tagKeys.size()
402    //     << " doesn't match number of values: " << values.size();
403    //       throw DataException(temp.str());
404    //     } else {
405    //       unsigned int i;
406    //       for (i=0;i<tagKeys.size();i++) {
407    //         addTaggedValue(tagKeys[i],values[i]);
408    //       }
409    //     }
410    //   }
411    // }
412    
413    
414    void
415    DataTagged::addTaggedValues(const TagListType& tagKeys,
416                                const ValueBatchType& values,
417                                const ShapeType& vShape)
418    {
419      DataTypes::ValueType t(values.size(),0);
420      for (int i=0;i<values.size();++i)
421      {
422        t[i]=values[i];
423      }
424      addTaggedValues(tagKeys,t,vShape);
425  }  }
426    
427    
428    // Note: The check to see if vShape==our shape is done in the addTaggedValue method
429  void  void
430  DataTagged::addTaggedValues(const TagListType& tagKeys,  DataTagged::addTaggedValues(const TagListType& tagKeys,
431                              const ValueListType& values)                              const ValueType& values,
432                                const ShapeType& vShape)
433  {  {
434      int n=getNoValues();
435      int numVals=values.size()/n;
436    if (values.size()==0) {    if (values.size()==0) {
437      // copy the current default value for each of the tags      // copy the current default value for each of the tags
438      TagListType::const_iterator iT;      TagListType::const_iterator iT;
439      for (iT=tagKeys.begin();iT!=tagKeys.end();iT++) {      for (iT=tagKeys.begin();iT!=tagKeys.end();iT++) {
440        // the point data view for DataTagged points at the default value        // the point data view for DataTagged points at the default value
441        addTaggedValue(*iT,getPointDataView());        addTag(*iT);
442      }      }
443    } else if (values.size()==1 && tagKeys.size()>1) {    } else if (numVals==1 && tagKeys.size()>1) {
444      // assume the one given value will be used for all tag values      // assume the one given value will be used for all tag values
445      TagListType::const_iterator iT;      TagListType::const_iterator iT;
446      for (iT=tagKeys.begin();iT!=tagKeys.end();iT++) {      for (iT=tagKeys.begin();iT!=tagKeys.end();iT++) {
447        addTaggedValue(*iT,values[0]);        addTaggedValue(*iT, vShape, values,0);
448      }      }
449    } else {    } else {
450      if (tagKeys.size()!=values.size()) {      if (tagKeys.size()!=numVals) {
451        stringstream temp;        stringstream temp;
452        temp << "Error - (addTaggedValue) Number of tags: " << tagKeys.size()        temp << "Error - (addTaggedValue) Number of tags: " << tagKeys.size()
453         << " doesn't match number of values: " << values.size();         << " doesn't match number of values: " << values.size();
454        throw DataException(temp.str());        throw DataException(temp.str());
455      } else {      } else {
456        unsigned int i;        unsigned int i;
457        for (i=0;i<tagKeys.size();i++) {        int offset=0;
458          addTaggedValue(tagKeys[i],values[i]);        for (i=0;i<tagKeys.size();i++ ,offset+=n) {
459            addTaggedValue(tagKeys[i],vShape,values,offset);
460        }        }
461      }      }
462    }    }
463  }  }
464    
465    
466    
467    
468  void  void
469  DataTagged::addTaggedValue(int tagKey,  DataTagged::addTaggedValue(int tagKey,
470                             const DataArrayView& value)                 const DataTypes::ShapeType& pointshape,
471  {                             const ValueType& value,
472    if (!getPointDataView().checkShape(value.getShape())) {                 int dataOffset)
473      throw DataException(getPointDataView().createShapeErrorMessage(  {
474                          "Error - Cannot addTaggedValue due to shape mismatch.", value.getShape()));    if (!DataTypes::checkShape(getShape(), pointshape)) {
475        throw DataException(DataTypes::createShapeErrorMessage(
476                            "Error - Cannot addTaggedValue due to shape mismatch.", pointshape,getShape()));
477      }
478      DataMapType::iterator pos(m_offsetLookup.find(tagKey));
479      if (pos!=m_offsetLookup.end()) {
480        // tag already exists so use setTaggedValue
481        setTaggedValue(tagKey,pointshape, value, dataOffset);
482      } else {
483        // save the key and the location of its data in the lookup tab
484        m_offsetLookup.insert(DataMapType::value_type(tagKey,m_data.size()));
485        // add the data given in "value" at the end of m_data
486        // need to make a temp copy of m_data, resize m_data, then copy
487        // all the old values plus the value to be added back into m_data
488        ValueType m_data_temp(m_data);
489        int oldSize=m_data.size();
490        int newSize=m_data.size()+getNoValues();
491        m_data.resize(newSize,0.,newSize);
492        for (int i=0;i<oldSize;i++) {
493          m_data[i]=m_data_temp[i];
494        }
495        for (int i=0;i<getNoValues();i++) {
496          m_data[oldSize+i]=value[i+dataOffset];
497        }
498    }    }
499    }
500    
501    
502    
503    
504    // void
505    // DataTagged::addTaggedValue(int tagKey,
506    //                            const DataArrayView& value)
507    // {
508    //   if (!getPointDataView().checkShape(value.getShape())) {
509    //     throw DataException(DataTypes::createShapeErrorMessage(
510    //                         "Error - Cannot addTaggedValue due to shape mismatch.", value.getShape(),getShape()));
511    //   }
512    //   DataMapType::iterator pos(m_offsetLookup.find(tagKey));
513    //   if (pos!=m_offsetLookup.end()) {
514    //     // tag already exists so use setTaggedValue
515    //     setTaggedValue(tagKey,value);
516    //   } else {
517    //     // save the key and the location of its data in the lookup tab
518    //     m_offsetLookup.insert(DataMapType::value_type(tagKey,m_data.size()));
519    //     // add the data given in "value" at the end of m_data
520    //     // need to make a temp copy of m_data, resize m_data, then copy
521    //     // all the old values plus the value to be added back into m_data
522    //     ValueType m_data_temp(m_data);
523    //     int oldSize=m_data.size();
524    //     int newSize=m_data.size()+value.noValues();
525    //     m_data.resize(newSize,0.,newSize);
526    //     for (int i=0;i<oldSize;i++) {
527    //       m_data[i]=m_data_temp[i];
528    //     }
529    //     for (int i=0;i<value.noValues();i++) {
530    //       m_data[oldSize+i]=value.getData(i);
531    //     }
532    //   }
533    // }
534    
535    
536    void
537    DataTagged::addTag(int tagKey)
538    {
539    DataMapType::iterator pos(m_offsetLookup.find(tagKey));    DataMapType::iterator pos(m_offsetLookup.find(tagKey));
540    if (pos!=m_offsetLookup.end()) {    if (pos!=m_offsetLookup.end()) {
541      // tag already exists so use setTaggedValue      // tag already exists so use setTaggedValue
542      setTaggedValue(tagKey,value);  //    setTaggedValue(tagKey,value);
543    } else {    } else {
544      // save the key and the location of its data in the lookup tab      // save the key and the location of its data in the lookup tab
545      m_offsetLookup.insert(DataMapType::value_type(tagKey,m_data.size()));      m_offsetLookup.insert(DataMapType::value_type(tagKey,m_data.size()));
# Line 329  DataTagged::addTaggedValue(int tagKey, Line 548  DataTagged::addTaggedValue(int tagKey,
548      // all the old values plus the value to be added back into m_data      // all the old values plus the value to be added back into m_data
549      ValueType m_data_temp(m_data);      ValueType m_data_temp(m_data);
550      int oldSize=m_data.size();      int oldSize=m_data.size();
551      int newSize=m_data.size()+value.noValues();      int newSize=m_data.size()+getNoValues();
552      m_data.resize(newSize,0.,newSize);      m_data.resize(newSize,0.,newSize);
553      for (int i=0;i<oldSize;i++) {      for (int i=0;i<oldSize;i++) {
554        m_data[i]=m_data_temp[i];        m_data[i]=m_data_temp[i];
555      }      }
556      for (int i=0;i<value.noValues();i++) {      for (int i=0;i<getNoValues();i++) {
557        m_data[oldSize+i]=value.getData(i);        m_data[oldSize+i]=m_data[m_defaultValueOffset+i];
558      }      }
559    }    }
560  }  }
561    
562    
563  double*  double*
564  DataTagged::getSampleDataByTag(int tag)  DataTagged::getSampleDataByTag(int tag)
565  {  {
# Line 356  DataTagged::getSampleDataByTag(int tag) Line 576  DataTagged::getSampleDataByTag(int tag)
576  string  string
577  DataTagged::toString() const  DataTagged::toString() const
578  {  {
579      using namespace escript::DataTypes;
580      string empty="";
581    stringstream temp;    stringstream temp;
582    DataMapType::const_iterator i;    DataMapType::const_iterator i;
583    temp << "Tag(Default)" << endl;    temp << "Tag(Default)" << endl;
584    temp << getDefaultValue().toString() << endl;    temp << pointToString(m_data,getShape(),getDefaultOffset(),empty) << endl;
585    // create a temporary view as the offset will be changed    // create a temporary view as the offset will be changed
586    DataArrayView tempView(getPointDataView().getData(), getPointDataView().getShape());  //   DataArrayView tempView(getPointDataView().getData(), getPointDataView().getShape());
587    for (i=m_offsetLookup.begin();i!=m_offsetLookup.end();++i) {    for (i=m_offsetLookup.begin();i!=m_offsetLookup.end();++i) {
588      temp << "Tag(" << i->first << ")" << endl;      temp << "Tag(" << i->first << ")" << endl;
589      tempView.setOffset(i->second);      temp << pointToString(m_data,getShape(),i->second,empty);
590      temp << tempView.toString() << endl;  //     tempView.setOffset(i->second);
591    //     temp << tempView.toString() << endl;
592    }    }
593    return temp.str();    return temp.str();
594  }  }
595    
596  DataArrayView::ValueType::size_type  DataTypes::ValueType::size_type
597  DataTagged::getPointOffset(int sampleNo,  DataTagged::getPointOffset(int sampleNo,
598                             int dataPointNo) const                             int dataPointNo) const
599  {  {
600    int tagKey=getFunctionSpace().getTagFromSampleNo(sampleNo);    int tagKey=getFunctionSpace().getTagFromSampleNo(sampleNo);
601    DataMapType::const_iterator pos(m_offsetLookup.find(tagKey));    DataMapType::const_iterator pos(m_offsetLookup.find(tagKey));
602    DataArrayView::ValueType::size_type offset=m_defaultValueOffset;    DataTypes::ValueType::size_type offset=m_defaultValueOffset;
603    if (pos!=m_offsetLookup.end()) {    if (pos!=m_offsetLookup.end()) {
604      offset=pos->second;      offset=pos->second;
605    }    }
606    return offset;    return offset;
607  }  }
608    
609  DataArrayView  // DataArrayView
610  DataTagged::getDataPointByTag(int tag) const  // DataTagged::getDataPointByTag(int tag) const
611    // {
612    //   DataMapType::const_iterator pos(m_offsetLookup.find(tag));
613    //   DataTypes::ValueType::size_type offset=m_defaultValueOffset;
614    //   if (pos!=m_offsetLookup.end()) {
615    //     offset=pos->second;
616    //   }
617    //   DataArrayView temp(getPointDataView());
618    //   temp.setOffset(offset);
619    //   return temp;
620    // }
621    //
622    
623    
624    DataTypes::ValueType::size_type
625    DataTagged::getOffsetForTag(int tag) const
626  {  {
627    DataMapType::const_iterator pos(m_offsetLookup.find(tag));    DataMapType::const_iterator pos(m_offsetLookup.find(tag));
628    DataArrayView::ValueType::size_type offset=m_defaultValueOffset;    DataTypes::ValueType::size_type offset=m_defaultValueOffset;
629    if (pos!=m_offsetLookup.end()) {    if (pos!=m_offsetLookup.end()) {
630      offset=pos->second;      offset=pos->second;
631    }    }
632    DataArrayView temp(getPointDataView());    return offset;
   temp.setOffset(offset);  
   return temp;  
633  }  }
634    
635  DataArrayView  DataTypes::ValueType::const_reference
636  DataTagged::getDataPoint(int sampleNo,  DataTagged::getDataByTag(int tag, DataTypes::ValueType::size_type i) const
                          int dataPointNo)  
637  {  {
638    EsysAssert(validSampleNo(sampleNo),"(getDataPoint) Invalid sampleNo: " << sampleNo);    DataMapType::const_iterator pos(m_offsetLookup.find(tag));
639    int tagKey=getFunctionSpace().getTagFromSampleNo(sampleNo);    DataTypes::ValueType::size_type offset=m_defaultValueOffset;
640    return getDataPointByTag(tagKey);    if (pos!=m_offsetLookup.end()) {
641        offset=pos->second;
642      }
643      return m_data[offset+i];
644    /*  DataArrayView temp(getPointDataView());
645      temp.setOffset(offset);
646      return temp.getData()[offset+i];*/
647  }  }
648    
 int  
 DataTagged::archiveData(ofstream& archiveFile,  
                         const DataArrayView::ValueType::size_type noValues) const  
 {  
   return(m_data.archiveData(archiveFile, noValues));  
 }  
649    
650  int  DataTypes::ValueType::reference
651  DataTagged::extractData(ifstream& archiveFile,  DataTagged::getDataByTag(int tag, DataTypes::ValueType::size_type i)
                         const DataArrayView::ValueType::size_type noValues)  
652  {  {
653    return(m_data.extractData(archiveFile, noValues));    DataMapType::const_iterator pos(m_offsetLookup.find(tag));
654      DataTypes::ValueType::size_type offset=m_defaultValueOffset;
655      if (pos!=m_offsetLookup.end()) {
656        offset=pos->second;
657      }
658      return m_data[offset+i];
659    /*  DataArrayView temp(getPointDataView());
660      temp.setOffset(offset);
661      return temp.getData()[offset+i];*/
662  }  }
663    
664    
665    
666    
667    
668    
669    // DataArrayView
670    // DataTagged::getDataPoint(int sampleNo,
671    //                          int dataPointNo)
672    // {
673    //   EsysAssert(validSampleNo(sampleNo),"(getDataPoint) Invalid sampleNo: " << sampleNo);
674    //   int tagKey=getFunctionSpace().getTagFromSampleNo(sampleNo);
675    //   return getDataPointByTag(tagKey);
676    // }
677    
678    
679  void  void
680  DataTagged::symmetric(DataAbstract* ev)  DataTagged::symmetric(DataAbstract* ev)
681  {  {
# Line 428  DataTagged::symmetric(DataAbstract* ev) Line 686  DataTagged::symmetric(DataAbstract* ev)
686    const DataTagged::DataMapType& thisLookup=getTagLookup();    const DataTagged::DataMapType& thisLookup=getTagLookup();
687    DataTagged::DataMapType::const_iterator i;    DataTagged::DataMapType::const_iterator i;
688    DataTagged::DataMapType::const_iterator thisLookupEnd=thisLookup.end();    DataTagged::DataMapType::const_iterator thisLookupEnd=thisLookup.end();
689      ValueType& evVec=temp_ev->getVector();
690      const ShapeType& evShape=temp_ev->getShape();
691    for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) {    for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) {
692        temp_ev->addTaggedValue(i->first,temp_ev->getDefaultValue());        temp_ev->addTag(i->first);
693        DataArrayView thisView=getDataPointByTag(i->first);        DataTypes::ValueType::size_type offset=getOffsetForTag(i->first);
694        DataArrayView evView=temp_ev->getDataPointByTag(i->first);  //       DataArrayView thisView=getDataPointByTag(i->first);
695        DataArrayView::symmetric(thisView,0,evView,0);  //       DataArrayView evView=temp_ev->getDataPointByTag(i->first);
696          DataTypes::ValueType::size_type evoffset=temp_ev->getOffsetForTag(i->first);
697    
698    //       DataArrayView::symmetric(thisView,0,evView,0);
699          DataMaths::symmetric(m_data,getShape(),offset,evVec, evShape, evoffset);
700    }    }
701    DataArrayView::symmetric(getDefaultValue(),0,temp_ev->getDefaultValue(),0);  //   symmetric(m_data,getShape(),getDefaultOffset(),
702      DataMaths::symmetric(m_data,getShape(),getDefaultOffset(),evVec,evShape,temp_ev->getDefaultOffset());
703  }  }
704    
705    
706  void  void
707  DataTagged::nonsymmetric(DataAbstract* ev)  DataTagged::nonsymmetric(DataAbstract* ev)
708  {  {
# Line 446  DataTagged::nonsymmetric(DataAbstract* e Line 713  DataTagged::nonsymmetric(DataAbstract* e
713    const DataTagged::DataMapType& thisLookup=getTagLookup();    const DataTagged::DataMapType& thisLookup=getTagLookup();
714    DataTagged::DataMapType::const_iterator i;    DataTagged::DataMapType::const_iterator i;
715    DataTagged::DataMapType::const_iterator thisLookupEnd=thisLookup.end();    DataTagged::DataMapType::const_iterator thisLookupEnd=thisLookup.end();
716      ValueType& evVec=temp_ev->getVector();
717      const ShapeType& evShape=temp_ev->getShape();
718    for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) {    for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) {
719        temp_ev->addTaggedValue(i->first,temp_ev->getDefaultValue());        temp_ev->addTag(i->first);
720        DataArrayView thisView=getDataPointByTag(i->first);  /*      DataArrayView thisView=getDataPointByTag(i->first);
721        DataArrayView evView=temp_ev->getDataPointByTag(i->first);        DataArrayView evView=temp_ev->getDataPointByTag(i->first);*/
722        DataArrayView::nonsymmetric(thisView,0,evView,0);        DataTypes::ValueType::size_type offset=getOffsetForTag(i->first);
723          DataTypes::ValueType::size_type evoffset=temp_ev->getOffsetForTag(i->first);
724          DataMaths::nonsymmetric(m_data,getShape(),offset,evVec, evShape, evoffset);
725    }    }
726    DataArrayView::nonsymmetric(getDefaultValue(),0,temp_ev->getDefaultValue(),0);    DataMaths::nonsymmetric(m_data,getShape(),getDefaultOffset(),evVec,evShape,temp_ev->getDefaultOffset());
727  }  }
728    
729    
730  void  void
731  DataTagged::trace(DataAbstract* ev, int axis_offset)  DataTagged::trace(DataAbstract* ev, int axis_offset)
732  {  {
# Line 464  DataTagged::trace(DataAbstract* ev, int Line 737  DataTagged::trace(DataAbstract* ev, int
737    const DataTagged::DataMapType& thisLookup=getTagLookup();    const DataTagged::DataMapType& thisLookup=getTagLookup();
738    DataTagged::DataMapType::const_iterator i;    DataTagged::DataMapType::const_iterator i;
739    DataTagged::DataMapType::const_iterator thisLookupEnd=thisLookup.end();    DataTagged::DataMapType::const_iterator thisLookupEnd=thisLookup.end();
740      ValueType& evVec=temp_ev->getVector();
741      const ShapeType& evShape=temp_ev->getShape();
742    for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) {    for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) {
743        temp_ev->addTaggedValue(i->first,temp_ev->getDefaultValue());        temp_ev->addTag(i->first);
744        DataArrayView thisView=getDataPointByTag(i->first);  //       DataArrayView thisView=getDataPointByTag(i->first);
745        DataArrayView evView=temp_ev->getDataPointByTag(i->first);  //       DataArrayView evView=temp_ev->getDataPointByTag(i->first);
746        DataArrayView::trace(thisView,0,evView,0, axis_offset);        DataTypes::ValueType::size_type offset=getOffsetForTag(i->first);
747          DataTypes::ValueType::size_type evoffset=temp_ev->getOffsetForTag(i->first);
748          DataMaths::trace(m_data,getShape(),offset,evVec, evShape, evoffset, axis_offset);
749    }    }
750    DataArrayView::trace(getDefaultValue(),0,temp_ev->getDefaultValue(),0,axis_offset);    DataMaths::trace(m_data,getShape(),getDefaultOffset(),evVec,evShape,temp_ev->getDefaultOffset(),axis_offset);
751  }  }
752    
753  void  void
# Line 483  DataTagged::transpose(DataAbstract* ev, Line 760  DataTagged::transpose(DataAbstract* ev,
760    const DataTagged::DataMapType& thisLookup=getTagLookup();    const DataTagged::DataMapType& thisLookup=getTagLookup();
761    DataTagged::DataMapType::const_iterator i;    DataTagged::DataMapType::const_iterator i;
762    DataTagged::DataMapType::const_iterator thisLookupEnd=thisLookup.end();    DataTagged::DataMapType::const_iterator thisLookupEnd=thisLookup.end();
763      ValueType& evVec=temp_ev->getVector();
764      const ShapeType& evShape=temp_ev->getShape();
765    for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) {    for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) {
766        temp_ev->addTaggedValue(i->first,temp_ev->getDefaultValue());        temp_ev->addTag(i->first);
767        DataArrayView thisView=getDataPointByTag(i->first);  //       DataArrayView thisView=getDataPointByTag(i->first);
768        DataArrayView evView=temp_ev->getDataPointByTag(i->first);  //       DataArrayView evView=temp_ev->getDataPointByTag(i->first);
769        DataArrayView::transpose(thisView,0,evView,0, axis_offset);        DataTypes::ValueType::size_type offset=getOffsetForTag(i->first);
770          DataTypes::ValueType::size_type evoffset=temp_ev->getOffsetForTag(i->first);
771          DataMaths::transpose(m_data,getShape(),offset,evVec, evShape, evoffset, axis_offset);
772    }    }
773    DataArrayView::transpose(getDefaultValue(),0,temp_ev->getDefaultValue(),0,axis_offset);    DataMaths::transpose(m_data,getShape(),getDefaultOffset(),evVec,evShape,temp_ev->getDefaultOffset(),axis_offset);
774  }  }
775    
776  void  void
# Line 502  DataTagged::swapaxes(DataAbstract* ev, i Line 783  DataTagged::swapaxes(DataAbstract* ev, i
783    const DataTagged::DataMapType& thisLookup=getTagLookup();    const DataTagged::DataMapType& thisLookup=getTagLookup();
784    DataTagged::DataMapType::const_iterator i;    DataTagged::DataMapType::const_iterator i;
785    DataTagged::DataMapType::const_iterator thisLookupEnd=thisLookup.end();    DataTagged::DataMapType::const_iterator thisLookupEnd=thisLookup.end();
786      ValueType& evVec=temp_ev->getVector();
787      const ShapeType& evShape=temp_ev->getShape();
788    for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) {    for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) {
789        temp_ev->addTaggedValue(i->first,temp_ev->getDefaultValue());        temp_ev->addTag(i->first);
790        DataArrayView thisView=getDataPointByTag(i->first);  /*      DataArrayView thisView=getDataPointByTag(i->first);
791        DataArrayView evView=temp_ev->getDataPointByTag(i->first);        DataArrayView evView=temp_ev->getDataPointByTag(i->first);*/
792        DataArrayView::swapaxes(thisView,0,evView,0,axis0,axis1);        DataTypes::ValueType::size_type offset=getOffsetForTag(i->first);
793          DataTypes::ValueType::size_type evoffset=temp_ev->getOffsetForTag(i->first);
794          DataMaths::swapaxes(m_data,getShape(),offset,evVec, evShape, evoffset,axis0,axis1);
795    }    }
796    DataArrayView::swapaxes(getDefaultValue(),0,temp_ev->getDefaultValue(),0,axis0,axis1);    DataMaths::swapaxes(m_data,getShape(),getDefaultOffset(),evVec,evShape,temp_ev->getDefaultOffset(),axis0,axis1);
797  }  }
798    
799  void  void
# Line 521  DataTagged::eigenvalues(DataAbstract* ev Line 806  DataTagged::eigenvalues(DataAbstract* ev
806    const DataTagged::DataMapType& thisLookup=getTagLookup();    const DataTagged::DataMapType& thisLookup=getTagLookup();
807    DataTagged::DataMapType::const_iterator i;    DataTagged::DataMapType::const_iterator i;
808    DataTagged::DataMapType::const_iterator thisLookupEnd=thisLookup.end();    DataTagged::DataMapType::const_iterator thisLookupEnd=thisLookup.end();
809      ValueType& evVec=temp_ev->getVector();
810      const ShapeType& evShape=temp_ev->getShape();
811    for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) {    for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) {
812        temp_ev->addTaggedValue(i->first,temp_ev->getDefaultValue());        temp_ev->addTag(i->first);
813        DataArrayView thisView=getDataPointByTag(i->first);  //       DataArrayView thisView=getDataPointByTag(i->first);
814        DataArrayView evView=temp_ev->getDataPointByTag(i->first);  //       DataArrayView evView=temp_ev->getDataPointByTag(i->first);
815        DataArrayView::eigenvalues(thisView,0,evView,0);        DataTypes::ValueType::size_type offset=getOffsetForTag(i->first);
816          DataTypes::ValueType::size_type evoffset=temp_ev->getOffsetForTag(i->first);
817          DataMaths::eigenvalues(m_data,getShape(),offset,evVec, evShape, evoffset);
818    }    }
819    DataArrayView::eigenvalues(getDefaultValue(),0,temp_ev->getDefaultValue(),0);    DataMaths::eigenvalues(m_data,getShape(),getDefaultOffset(),evVec, evShape, temp_ev->getDefaultOffset());
820  }  }
821  void  void
822  DataTagged::eigenvalues_and_eigenvectors(DataAbstract* ev,DataAbstract* V,const double tol)  DataTagged::eigenvalues_and_eigenvectors(DataAbstract* ev,DataAbstract* V,const double tol)
# Line 543  DataTagged::eigenvalues_and_eigenvectors Line 832  DataTagged::eigenvalues_and_eigenvectors
832    const DataTagged::DataMapType& thisLookup=getTagLookup();    const DataTagged::DataMapType& thisLookup=getTagLookup();
833    DataTagged::DataMapType::const_iterator i;    DataTagged::DataMapType::const_iterator i;
834    DataTagged::DataMapType::const_iterator thisLookupEnd=thisLookup.end();    DataTagged::DataMapType::const_iterator thisLookupEnd=thisLookup.end();
835      ValueType& evVec=temp_ev->getVector();
836      const ShapeType& evShape=temp_ev->getShape();
837      ValueType& VVec=temp_V->getVector();
838      const ShapeType& VShape=temp_V->getShape();
839    for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) {    for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) {
840        temp_ev->addTaggedValue(i->first,temp_ev->getDefaultValue());        temp_ev->addTag(i->first);
841        temp_V->addTaggedValue(i->first,temp_V->getDefaultValue());        temp_V->addTag(i->first);
842        DataArrayView thisView=getDataPointByTag(i->first);  /*      DataArrayView thisView=getDataPointByTag(i->first);
843        DataArrayView evView=temp_ev->getDataPointByTag(i->first);        DataArrayView evView=temp_ev->getDataPointByTag(i->first);
844        DataArrayView VView=temp_V->getDataPointByTag(i->first);        DataArrayView VView=temp_V->getDataPointByTag(i->first);*/
845        DataArrayView::eigenvalues_and_eigenvectors(thisView,0,evView,0,VView,0,tol);        DataTypes::ValueType::size_type offset=getOffsetForTag(i->first);
846          DataTypes::ValueType::size_type evoffset=temp_ev->getOffsetForTag(i->first);
847          DataTypes::ValueType::size_type Voffset=temp_V->getOffsetForTag(i->first);
848    /*      DataArrayView::eigenvalues_and_eigenvectors(thisView,0,evView,0,VView,0,tol);*/
849          DataMaths::eigenvalues_and_eigenvectors(m_data,getShape(),offset,evVec, evShape, evoffset,VVec,VShape,Voffset,tol);
850    
851    }    }
852    DataArrayView::eigenvalues_and_eigenvectors(getDefaultValue(),0,    DataMaths::eigenvalues_and_eigenvectors(m_data,getShape(),getDefaultOffset(),evVec, evShape,
853                                                temp_ev->getDefaultValue(),0,                        temp_ev->getDefaultOffset(),VVec,VShape,
854                                                temp_V->getDefaultValue(),0,                        temp_V->getDefaultOffset(), tol);
                                               tol);  
855    
856    
857  }  }
858    
859  void  void
860  DataTagged::setToZero(){  DataTagged::setToZero(){
861      DataArrayView::ValueType::size_type n=m_data.size();      DataTypes::ValueType::size_type n=m_data.size();
862      for (int i=0; i<n ;++i) m_data[i]=0.;      for (int i=0; i<n ;++i) m_data[i]=0.;
863  }  }
864    
# Line 572  DataTagged::dump(const std::string fileN Line 869  DataTagged::dump(const std::string fileN
869     throw DataException("Error - DataTagged:: dump is not implemented for MPI yet.");     throw DataException("Error - DataTagged:: dump is not implemented for MPI yet.");
870     #endif     #endif
871     #ifdef USE_NETCDF     #ifdef USE_NETCDF
872     const int ldims=DataArrayView::maxRank+1;     const int ldims=DataTypes::maxRank+1;
873     const NcDim* ncdims[ldims];     const NcDim* ncdims[ldims];
874     NcVar *var, *tags_var;     NcVar *var, *tags_var;
875     int rank = getPointDataView().getRank();     int rank = getRank();
876     int type=  getFunctionSpace().getTypeCode();     int type=  getFunctionSpace().getTypeCode();
877     int ndims =0;     int ndims =0;
878     long dims[ldims];     long dims[ldims];
879     const double* d_ptr=&(m_data[0]);     const double* d_ptr=&(m_data[0]);
880     DataArrayView::ShapeType shape = getPointDataView().getShape();     DataTypes::ShapeType shape = getShape();
881    
882     // netCDF error handler     // netCDF error handler
883     NcError err(NcError::verbose_nonfatal);     NcError err(NcError::verbose_nonfatal);
# Line 655  DataTagged::dump(const std::string fileN Line 952  DataTagged::dump(const std::string fileN
952     throw DataException("Error - DataTagged:: dump is not configured with netCDF. Please contact your installation manager.");     throw DataException("Error - DataTagged:: dump is not configured with netCDF. Please contact your installation manager.");
953     #endif     #endif
954  }  }
955    
956    DataTypes::ValueType&
957    DataTagged::getVector()
958    {
959        return m_data;
960    }
961    
962    const DataTypes::ValueType&
963    DataTagged::getVector() const
964    {
965        return m_data;
966    }
967    
968  }  // end of namespace  }  // end of namespace

Legend:
Removed from v.1795  
changed lines
  Added in v.1796

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.26