/[escript]/branches/diaplayground/ripley/src/Brick.cpp
ViewVC logotype

Diff of /branches/diaplayground/ripley/src/Brick.cpp

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

branches/ripleygmg_from_3668/ripley/src/Brick.cpp revision 3753 by caltinay, Tue Jan 3 09:01:49 2012 UTC trunk/ripley/src/Brick.cpp revision 4009 by caltinay, Tue Oct 2 05:53:37 2012 UTC
# Line 1  Line 1 
1    
2  /*******************************************************  /*****************************************************************************
3  *  *
4  * Copyright (c) 2003-2011 by University of Queensland  * Copyright (c) 2003-2012 by University of Queensland
5  * Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)  * http://www.uq.edu.au
 * http://www.uq.edu.au/esscc  
6  *  *
7  * Primary Business: Queensland, Australia  * Primary Business: Queensland, Australia
8  * Licensed under the Open Software License version 3.0  * Licensed under the Open Software License version 3.0
9  * http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php  * http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php
10  *  *
11  *******************************************************/  * Development until 2012 by Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)
12    * Development since 2012 by School of Earth Sciences
13    *
14    *****************************************************************************/
15    
16  #include <ripley/Brick.h>  #include <ripley/Brick.h>
17  extern "C" {  extern "C" {
18  #include "paso/SystemMatrixPattern.h"  #include <paso/SystemMatrix.h>
19  }  }
20    
21  #if USE_SILO  #if USE_SILO
# Line 29  using namespace std; Line 31  using namespace std;
31    
32  namespace ripley {  namespace ripley {
33    
34  Brick::Brick(int n0, int n1, int n2, double l0, double l1, double l2, int d0,  Brick::Brick(int n0, int n1, int n2, double x0, double y0, double z0,
35               int d1, int d2) :               double x1, double y1, double z1, int d0, int d1, int d2) :
36      RipleyDomain(3),      RipleyDomain(3),
37      m_gNE0(n0),      m_x0(x0),
38      m_gNE1(n1),      m_y0(y0),
39      m_gNE2(n2),      m_z0(z0),
40      m_l0(l0),      m_l0(x1-x0),
41      m_l1(l1),      m_l1(y1-y0),
42      m_l2(l2),      m_l2(z1-z0)
     m_NX(d0),  
     m_NY(d1),  
     m_NZ(d2)  
43  {  {
44        // ignore subdivision parameters for serial run
45        if (m_mpiInfo->size == 1) {
46            d0=1;
47            d1=1;
48            d2=1;
49        }
50    
51        bool warn=false;
52        // if number of subdivisions is non-positive, try to subdivide by the same
53        // ratio as the number of elements
54        if (d0<=0 && d1<=0 && d2<=0) {
55            warn=true;
56            d0=(int)(pow(m_mpiInfo->size*(n0+1)*(n0+1)/((float)(n1+1)*(n2+1)), 1.f/3));
57            d1=(int)(d0*n1/(float)n0);
58            d2=m_mpiInfo->size/(d0*d1);
59            if (d0*d1*d2 != m_mpiInfo->size) {
60                // ratios not the same so leave "smallest" side undivided and try
61                // dividing 2 sides only
62                if (n0>=n1) {
63                    if (n1>=n2) {
64                        d0=d1=0;
65                        d2=1;
66                    } else {
67                        d0=d2=0;
68                        d1=1;
69                    }
70                } else {
71                    if (n0>=n2) {
72                        d0=d1=0;
73                        d2=1;
74                    } else {
75                        d0=1;
76                        d1=d2=0;
77                    }
78                }
79            }
80        }
81        if (d0<=0 && d1<=0) {
82            warn=true;
83            d0=int(sqrt(m_mpiInfo->size*(n0+1)/(float)(n1+1)));
84            d1=m_mpiInfo->size/d0;
85            if (d0*d1*d2 != m_mpiInfo->size) {
86                // ratios not the same so subdivide side with more elements only
87                if (n0>n1) {
88                    d0=0;
89                    d1=1;
90                } else {
91                    d0=1;
92                    d1=0;
93                }
94            }
95        } else if (d0<=0 && d2<=0) {
96            warn=true;
97            d0=int(sqrt(m_mpiInfo->size*(n0+1)/(float)(n2+1)));
98            d2=m_mpiInfo->size/d0;
99            if (d0*d1*d2 != m_mpiInfo->size) {
100                // ratios not the same so subdivide side with more elements only
101                if (n0>n2) {
102                    d0=0;
103                    d2=1;
104                } else {
105                    d0=1;
106                    d2=0;
107                }
108            }
109        } else if (d1<=0 && d2<=0) {
110            warn=true;
111            d1=int(sqrt(m_mpiInfo->size*(n1+1)/(float)(n2+1)));
112            d2=m_mpiInfo->size/d1;
113            if (d0*d1*d2 != m_mpiInfo->size) {
114                // ratios not the same so subdivide side with more elements only
115                if (n1>n2) {
116                    d1=0;
117                    d2=1;
118                } else {
119                    d1=1;
120                    d2=0;
121                }
122            }
123        }
124        if (d0<=0) {
125            // d1,d2 are preset, determine d0
126            d0=m_mpiInfo->size/(d1*d2);
127        } else if (d1<=0) {
128            // d0,d2 are preset, determine d1
129            d1=m_mpiInfo->size/(d0*d2);
130        } else if (d2<=0) {
131            // d0,d1 are preset, determine d2
132            d2=m_mpiInfo->size/(d0*d1);
133        }
134    
135        m_NX=d0;
136        m_NY=d1;
137        m_NZ=d2;
138    
139      // ensure number of subdivisions is valid and nodes can be distributed      // ensure number of subdivisions is valid and nodes can be distributed
140      // among number of ranks      // among number of ranks
141      if (m_NX*m_NY*m_NZ != m_mpiInfo->size)      if (m_NX*m_NY*m_NZ != m_mpiInfo->size)
142          throw RipleyException("Invalid number of spatial subdivisions");          throw RipleyException("Invalid number of spatial subdivisions");
143    
144      if ((n0+1)%m_NX > 0 || (n1+1)%m_NY > 0 || (n2+1)%m_NZ > 0)      if (warn) {
145          throw RipleyException("Number of elements+1 must be separable into number of ranks in each dimension");          cout << "Warning: Automatic domain subdivision (d0=" << d0 << ", d1="
146                << d1 << ", d2=" << d2 << "). This may not be optimal!" << endl;
147        }
148    
149        if ((n0+1)%m_NX > 0) {
150            double Dx=m_l0/n0;
151            n0=(int)round((float)(n0+1)/d0+0.5)*d0-1;
152            m_l0=Dx*n0;
153            cout << "Warning: Adjusted number of elements and length. N0="
154                << n0 << ", l0=" << m_l0 << endl;
155        }
156        if ((n1+1)%m_NY > 0) {
157            double Dy=m_l1/n1;
158            n1=(int)round((float)(n1+1)/d1+0.5)*d1-1;
159            m_l1=Dy*n1;
160            cout << "Warning: Adjusted number of elements and length. N1="
161                << n1 << ", l1=" << m_l1 << endl;
162        }
163        if ((n2+1)%m_NZ > 0) {
164            double Dz=m_l2/n2;
165            n2=(int)round((float)(n2+1)/d2+0.5)*d2-1;
166            m_l2=Dz*n2;
167            cout << "Warning: Adjusted number of elements and length. N2="
168                << n2 << ", l2=" << m_l2 << endl;
169        }
170    
171        m_gNE0=n0;
172        m_gNE1=n1;
173        m_gNE2=n2;
174    
175      if ((m_NX > 1 && (n0+1)/m_NX<2) || (m_NY > 1 && (n1+1)/m_NY<2) || (m_NZ > 1 && (n2+1)/m_NZ<2))      if ((m_NX > 1 && (n0+1)/m_NX<2) || (m_NY > 1 && (n1+1)/m_NY<2) || (m_NZ > 1 && (n2+1)/m_NZ<2))
176          throw RipleyException("Too few elements for the number of ranks");          throw RipleyException("Too few elements for the number of ranks");
177    
178      // local number of elements (including overlap)      // local number of elements (including overlap)
179      m_NE0 = (m_NX>1 ? (n0+1)/m_NX : n0);      m_NE0 = m_ownNE0 = (m_NX>1 ? (n0+1)/m_NX : n0);
180      if (m_mpiInfo->rank%m_NX>0 && m_mpiInfo->rank%m_NX<m_NX-1)      if (m_mpiInfo->rank%m_NX>0 && m_mpiInfo->rank%m_NX<m_NX-1)
181          m_NE0++;          m_NE0++;
182      m_NE1 = (m_NY>1 ? (n1+1)/m_NY : n1);      else if (m_NX>1 && m_mpiInfo->rank%m_NX==m_NX-1)
183            m_ownNE0--;
184    
185        m_NE1 = m_ownNE1 = (m_NY>1 ? (n1+1)/m_NY : n1);
186      if (m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX>0 && m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX<m_NY-1)      if (m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX>0 && m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX<m_NY-1)
187          m_NE1++;          m_NE1++;
188      m_NE2 = (m_NZ>1 ? (n2+1)/m_NZ : n2);      else if (m_NY>1 && m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX==m_NY-1)
189            m_ownNE1--;
190    
191        m_NE2 = m_ownNE2 = (m_NZ>1 ? (n2+1)/m_NZ : n2);
192      if (m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY)>0 && m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY)<m_NZ-1)      if (m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY)>0 && m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY)<m_NZ-1)
193          m_NE2++;          m_NE2++;
194        else if (m_NZ>1 && m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY)==m_NZ-1)
195            m_ownNE2--;
196    
197      // local number of nodes      // local number of nodes
198      m_N0 = m_NE0+1;      m_N0 = m_NE0+1;
# Line 81  Brick::Brick(int n0, int n1, int n2, dou Line 211  Brick::Brick(int n0, int n1, int n2, dou
211          m_offset2--;          m_offset2--;
212    
213      populateSampleIds();      populateSampleIds();
214        createPattern();
215  }  }
216    
217    
218  Brick::~Brick()  Brick::~Brick()
219  {  {
220        Paso_SystemMatrixPattern_free(m_pattern);
221        Paso_Connector_free(m_connector);
222  }  }
223    
224  string Brick::getDescription() const  string Brick::getDescription() const
# Line 99  bool Brick::operator==(const AbstractDom Line 232  bool Brick::operator==(const AbstractDom
232      if (o) {      if (o) {
233          return (RipleyDomain::operator==(other) &&          return (RipleyDomain::operator==(other) &&
234                  m_gNE0==o->m_gNE0 && m_gNE1==o->m_gNE1 && m_gNE2==o->m_gNE2                  m_gNE0==o->m_gNE0 && m_gNE1==o->m_gNE1 && m_gNE2==o->m_gNE2
235                    && m_x0==o->m_x0 && m_y0==o->m_y0 && m_z0==o->m_z0
236                  && m_l0==o->m_l0 && m_l1==o->m_l1 && m_l2==o->m_l2                  && m_l0==o->m_l0 && m_l1==o->m_l1 && m_l2==o->m_l2
237                  && m_NX==o->m_NX && m_NY==o->m_NY && m_NZ==o->m_NZ);                  && m_NX==o->m_NX && m_NY==o->m_NY && m_NZ==o->m_NZ);
238      }      }
# Line 106  bool Brick::operator==(const AbstractDom Line 240  bool Brick::operator==(const AbstractDom
240      return false;      return false;
241  }  }
242    
243    void Brick::readBinaryGrid(escript::Data& out, string filename,
244                               const vector<int>& first,
245                               const vector<int>& numValues) const
246    {
247        // check destination function space
248        int myN0, myN1, myN2;
249        if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Nodes) {
250            myN0 = m_N0;
251            myN1 = m_N1;
252            myN2 = m_N2;
253        } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements ||
254                    out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
255            myN0 = m_NE0;
256            myN1 = m_NE1;
257            myN2 = m_NE2;
258        } else
259            throw RipleyException("readBinaryGrid(): invalid function space for output data object");
260    
261        // check file existence and size
262        ifstream f(filename.c_str(), ifstream::binary);
263        if (f.fail()) {
264            throw RipleyException("readBinaryGrid(): cannot open file");
265        }
266        f.seekg(0, ios::end);
267        const int numComp = out.getDataPointSize();
268        const int filesize = f.tellg();
269        const int reqsize = numValues[0]*numValues[1]*numValues[2]*numComp*sizeof(float);
270        if (filesize < reqsize) {
271            f.close();
272            throw RipleyException("readBinaryGrid(): not enough data in file");
273        }
274    
275        // check if this rank contributes anything
276        if (first[0] >= m_offset0+myN0 || first[0]+numValues[0] <= m_offset0 ||
277                first[1] >= m_offset1+myN1 || first[1]+numValues[1] <= m_offset1 ||
278                first[2] >= m_offset2+myN2 || first[2]+numValues[2] <= m_offset2) {
279            f.close();
280            return;
281        }
282    
283        // now determine how much this rank has to write
284    
285        // first coordinates in data object to write to
286        const int first0 = max(0, first[0]-m_offset0);
287        const int first1 = max(0, first[1]-m_offset1);
288        const int first2 = max(0, first[2]-m_offset2);
289        // indices to first value in file
290        const int idx0 = max(0, m_offset0-first[0]);
291        const int idx1 = max(0, m_offset1-first[1]);
292        const int idx2 = max(0, m_offset2-first[2]);
293        // number of values to write
294        const int num0 = min(numValues[0]-idx0, myN0-first0);
295        const int num1 = min(numValues[1]-idx1, myN1-first1);
296        const int num2 = min(numValues[2]-idx2, myN2-first2);
297    
298        out.requireWrite();
299        vector<float> values(num0*numComp);
300        const int dpp = out.getNumDataPointsPerSample();
301    
302        for (index_t z=0; z<num2; z++) {
303            for (index_t y=0; y<num1; y++) {
304                const int fileofs = numComp*(idx0+(idx1+y)*numValues[0]+(idx2+z)*numValues[0]*numValues[1]);
305                f.seekg(fileofs*sizeof(float));
306                f.read((char*)&values[0], num0*numComp*sizeof(float));
307                const int dataIndex = first0+(first1+y)*myN0+(first2+z)*myN0*myN1;
308    
309                for (index_t x=0; x<num0; x++) {
310                    double* dest = out.getSampleDataRW(dataIndex+x);
311                    for (index_t c=0; c<numComp; c++) {
312                        for (index_t q=0; q<dpp; q++) {
313                            *dest++ = static_cast<double>(values[x*numComp+c]);
314                        }
315                    }
316                }
317            }
318        }
319    
320        f.close();
321    }
322    
323  void Brick::dump(const string& fileName) const  void Brick::dump(const string& fileName) const
324  {  {
325  #if USE_SILO  #if USE_SILO
# Line 114  void Brick::dump(const string& fileName) Line 328  void Brick::dump(const string& fileName)
328          fn+=".silo";          fn+=".silo";
329      }      }
330    
     const int NUM_SILO_FILES = 1;  
     const char* blockDirFmt = "/block%04d";  
331      int driver=DB_HDF5;          int driver=DB_HDF5;    
332      string siloPath;      string siloPath;
333      DBfile* dbfile = NULL;      DBfile* dbfile = NULL;
334    
335  #ifdef ESYS_MPI  #ifdef ESYS_MPI
336      PMPIO_baton_t* baton = NULL;      PMPIO_baton_t* baton = NULL;
337        const int NUM_SILO_FILES = 1;
338        const char* blockDirFmt = "/block%04d";
339  #endif  #endif
340    
341      if (m_mpiInfo->size > 1) {      if (m_mpiInfo->size > 1) {
# Line 247  void Brick::dump(const string& fileName) Line 461  void Brick::dump(const string& fileName)
461      }      }
462    
463  #else // USE_SILO  #else // USE_SILO
464      throw RipleyException("dump(): no Silo support");      throw RipleyException("dump: no Silo support");
465  #endif  #endif
466  }  }
467    
# Line 257  const int* Brick::borrowSampleReferenceI Line 471  const int* Brick::borrowSampleReferenceI
471          case Nodes:          case Nodes:
472          case ReducedNodes: //FIXME: reduced          case ReducedNodes: //FIXME: reduced
473              return &m_nodeId[0];              return &m_nodeId[0];
474          case DegreesOfFreedom: //FIXME          case DegreesOfFreedom:
475          case ReducedDegreesOfFreedom: //FIXME          case ReducedDegreesOfFreedom: //FIXME: reduced
476              return &m_dofId[0];              return &m_dofId[0];
477          case Elements:          case Elements:
478          case ReducedElements:          case ReducedElements:
479              return &m_elementId[0];              return &m_elementId[0];
480            case FaceElements:
481          case ReducedFaceElements:          case ReducedFaceElements:
482              return &m_faceId[0];              return &m_faceId[0];
483          default:          default:
# Line 270  const int* Brick::borrowSampleReferenceI Line 485  const int* Brick::borrowSampleReferenceI
485      }      }
486    
487      stringstream msg;      stringstream msg;
488      msg << "borrowSampleReferenceIDs() not implemented for function space type "      msg << "borrowSampleReferenceIDs: invalid function space type "<<fsType;
         << fsType;  
489      throw RipleyException(msg.str());      throw RipleyException(msg.str());
490  }  }
491    
492  bool Brick::ownSample(int fsCode, index_t id) const  bool Brick::ownSample(int fsType, index_t id) const
493  {  {
494  #ifdef ESYS_MPI      if (getMPISize()==1)
495      if (fsCode == Nodes) {          return true;
496          const index_t left = (m_offset0==0 ? 0 : 1);  
497          const index_t bottom = (m_offset1==0 ? 0 : 1);      switch (fsType) {
498          const index_t front = (m_offset2==0 ? 0 : 1);          case Nodes:
499          const index_t right = (m_mpiInfo->rank%m_NX==m_NX-1 ? m_N0 : m_N0-1);          case ReducedNodes: //FIXME: reduced
500          const index_t top = (m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX==m_NY-1 ? m_N1 : m_N1-1);              return (m_dofMap[id] < getNumDOF());
501          const index_t back = (m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY)==m_NZ-1 ? m_N2 : m_N2-1);          case DegreesOfFreedom:
502          const index_t x=id%m_N0;          case ReducedDegreesOfFreedom:
503          const index_t y=id%(m_N0*m_N1)/m_N0;              return true;
504          const index_t z=id/(m_N0*m_N1);          case Elements:
505          return (x>=left && x<right && y>=bottom && y<top && z>=front && z<back);          case ReducedElements:
506                {
507                    // check ownership of element's _last_ node
508                    const index_t x=id%m_NE0 + 1;
509                    const index_t y=id%(m_NE0*m_NE1)/m_NE0 + 1;
510                    const index_t z=id/(m_NE0*m_NE1) + 1;
511                    return (m_dofMap[x + m_N0*y +m_N0*m_N1*z] < getNumDOF());
512                }
513            case FaceElements:
514            case ReducedFaceElements:
515                {
516                    // check ownership of face element's last node
517                    const IndexVector faces = getNumFacesPerBoundary();
518                    dim_t n=0;
519                    for (size_t i=0; i<faces.size(); i++) {
520                        n+=faces[i];
521                        if (id<n) {
522                            const index_t j=id-n+faces[i];
523                            if (i>=4) { // front or back
524                                const index_t first=(i==4 ? 0 : m_N0*m_N1*(m_N2-1));
525                                return (m_dofMap[first+j%m_NE0+1+(j/m_NE0+1)*m_N0] < getNumDOF());
526                            } else if (i>=2) { // bottom or top
527                                const index_t first=(i==2 ? 0 : m_N0*(m_N1-1));
528                                return (m_dofMap[first+j%m_NE0+1+(j/m_NE0+1)*m_N0*m_N1] < getNumDOF());
529                            } else { // left or right
530                                const index_t first=(i==0 ? 0 : m_N0-1);
531                                return (m_dofMap[first+(j%m_NE1+1)*m_N0+(j/m_NE1+1)*m_N0*m_N1] < getNumDOF());
532                            }
533                        }
534                    }
535                    return false;
536                }
537            default:
538                break;
539        }
540    
541        stringstream msg;
542        msg << "ownSample: invalid function space type " << fsType;
543        throw RipleyException(msg.str());
544    }
545    
546    void Brick::setToNormal(escript::Data& out) const
547    {
548        if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == FaceElements) {
549            out.requireWrite();
550    #pragma omp parallel
551            {
552                if (m_faceOffset[0] > -1) {
553    #pragma omp for nowait
554                    for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {
555                        for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {
556                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));
557                            // set vector at four quadrature points
558                            *o++ = -1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;
559                            *o++ = -1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;
560                            *o++ = -1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;
561                            *o++ = -1.; *o++ = 0.; *o = 0.;
562                        }
563                    }
564                }
565    
566                if (m_faceOffset[1] > -1) {
567    #pragma omp for nowait
568                    for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {
569                        for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {
570                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));
571                            // set vector at four quadrature points
572                            *o++ = 1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;
573                            *o++ = 1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;
574                            *o++ = 1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;
575                            *o++ = 1.; *o++ = 0.; *o = 0.;
576                        }
577                    }
578                }
579    
580                if (m_faceOffset[2] > -1) {
581    #pragma omp for nowait
582                    for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {
583                        for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {
584                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));
585                            // set vector at four quadrature points
586                            *o++ = 0.; *o++ = -1.; *o++ = 0.;
587                            *o++ = 0.; *o++ = -1.; *o++ = 0.;
588                            *o++ = 0.; *o++ = -1.; *o++ = 0.;
589                            *o++ = 0.; *o++ = -1.; *o = 0.;
590                        }
591                    }
592                }
593    
594                if (m_faceOffset[3] > -1) {
595    #pragma omp for nowait
596                    for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {
597                        for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {
598                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));
599                            // set vector at four quadrature points
600                            *o++ = 0.; *o++ = 1.; *o++ = 0.;
601                            *o++ = 0.; *o++ = 1.; *o++ = 0.;
602                            *o++ = 0.; *o++ = 1.; *o++ = 0.;
603                            *o++ = 0.; *o++ = 1.; *o = 0.;
604                        }
605                    }
606                }
607    
608                if (m_faceOffset[4] > -1) {
609    #pragma omp for nowait
610                    for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {
611                        for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {
612                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));
613                            // set vector at four quadrature points
614                            *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = -1.;
615                            *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = -1.;
616                            *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = -1.;
617                            *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o = -1.;
618                        }
619                    }
620                }
621    
622                if (m_faceOffset[5] > -1) {
623    #pragma omp for nowait
624                    for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {
625                        for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {
626                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));
627                            // set vector at four quadrature points
628                            *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = 1.;
629                            *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = 1.;
630                            *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = 1.;
631                            *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o = 1.;
632                        }
633                    }
634                }
635            } // end of parallel section
636        } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedFaceElements) {
637            out.requireWrite();
638    #pragma omp parallel
639            {
640                if (m_faceOffset[0] > -1) {
641    #pragma omp for nowait
642                    for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {
643                        for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {
644                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));
645                            *o++ = -1.;
646                            *o++ = 0.;
647                            *o = 0.;
648                        }
649                    }
650                }
651    
652                if (m_faceOffset[1] > -1) {
653    #pragma omp for nowait
654                    for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {
655                        for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {
656                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));
657                            *o++ = 1.;
658                            *o++ = 0.;
659                            *o = 0.;
660                        }
661                    }
662                }
663    
664                if (m_faceOffset[2] > -1) {
665    #pragma omp for nowait
666                    for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {
667                        for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {
668                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));
669                            *o++ = 0.;
670                            *o++ = -1.;
671                            *o = 0.;
672                        }
673                    }
674                }
675    
676                if (m_faceOffset[3] > -1) {
677    #pragma omp for nowait
678                    for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {
679                        for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {
680                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));
681                            *o++ = 0.;
682                            *o++ = 1.;
683                            *o = 0.;
684                        }
685                    }
686                }
687    
688                if (m_faceOffset[4] > -1) {
689    #pragma omp for nowait
690                    for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {
691                        for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {
692                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));
693                            *o++ = 0.;
694                            *o++ = 0.;
695                            *o = -1.;
696                        }
697                    }
698                }
699    
700                if (m_faceOffset[5] > -1) {
701    #pragma omp for nowait
702                    for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {
703                        for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {
704                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));
705                            *o++ = 0.;
706                            *o++ = 0.;
707                            *o = 1.;
708                        }
709                    }
710                }
711            } // end of parallel section
712    
713      } else {      } else {
714          stringstream msg;          stringstream msg;
715          msg << "ownSample() not implemented for "          msg << "setToNormal: invalid function space type "
716              << functionSpaceTypeAsString(fsCode);              << out.getFunctionSpace().getTypeCode();
717          throw RipleyException(msg.str());          throw RipleyException(msg.str());
718      }      }
 #else  
     return true;  
 #endif  
719  }  }
720    
721  void Brick::setToGradient(escript::Data& out, const escript::Data& cIn) const  void Brick::setToSize(escript::Data& out) const
722    {
723        if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements
724                || out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
725            out.requireWrite();
726            const dim_t numQuad=out.getNumDataPointsPerSample();
727            const double xSize=getFirstCoordAndSpacing(0).second;
728            const double ySize=getFirstCoordAndSpacing(1).second;
729            const double zSize=getFirstCoordAndSpacing(2).second;
730            const double size=sqrt(xSize*xSize+ySize*ySize+zSize*zSize);
731    #pragma omp parallel for
732            for (index_t k = 0; k < getNumElements(); ++k) {
733                double* o = out.getSampleDataRW(k);
734                fill(o, o+numQuad, size);
735            }
736        } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == FaceElements
737                || out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedFaceElements) {
738            out.requireWrite();
739            const dim_t numQuad=out.getNumDataPointsPerSample();
740            const double xSize=getFirstCoordAndSpacing(0).second;
741            const double ySize=getFirstCoordAndSpacing(1).second;
742            const double zSize=getFirstCoordAndSpacing(2).second;
743    #pragma omp parallel
744            {
745                if (m_faceOffset[0] > -1) {
746                    const double size=min(ySize,zSize);
747    #pragma omp for nowait
748                    for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {
749                        for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {
750                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));
751                            fill(o, o+numQuad, size);
752                        }
753                    }
754                }
755    
756                if (m_faceOffset[1] > -1) {
757                    const double size=min(ySize,zSize);
758    #pragma omp for nowait
759                    for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {
760                        for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {
761                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));
762                            fill(o, o+numQuad, size);
763                        }
764                    }
765                }
766    
767                if (m_faceOffset[2] > -1) {
768                    const double size=min(xSize,zSize);
769    #pragma omp for nowait
770                    for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {
771                        for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {
772                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));
773                            fill(o, o+numQuad, size);
774                        }
775                    }
776                }
777    
778                if (m_faceOffset[3] > -1) {
779                    const double size=min(xSize,zSize);
780    #pragma omp for nowait
781                    for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {
782                        for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {
783                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));
784                            fill(o, o+numQuad, size);
785                        }
786                    }
787                }
788    
789                if (m_faceOffset[4] > -1) {
790                    const double size=min(xSize,ySize);
791    #pragma omp for nowait
792                    for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {
793                        for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {
794                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));
795                            fill(o, o+numQuad, size);
796                        }
797                    }
798                }
799    
800                if (m_faceOffset[5] > -1) {
801                    const double size=min(xSize,ySize);
802    #pragma omp for nowait
803                    for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {
804                        for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {
805                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));
806                            fill(o, o+numQuad, size);
807                        }
808                    }
809                }
810            } // end of parallel section
811    
812        } else {
813            stringstream msg;
814            msg << "setToSize: invalid function space type "
815                << out.getFunctionSpace().getTypeCode();
816            throw RipleyException(msg.str());
817        }
818    }
819    
820    Paso_SystemMatrixPattern* Brick::getPattern(bool reducedRowOrder,
821                                                bool reducedColOrder) const
822    {
823        /* FIXME: reduced
824        if (reducedRowOrder || reducedColOrder)
825            throw RipleyException("getPattern() not implemented for reduced order");
826        */
827        return m_pattern;
828    }
829    
830    void Brick::Print_Mesh_Info(const bool full) const
831    {
832        RipleyDomain::Print_Mesh_Info(full);
833        if (full) {
834            cout << "     Id  Coordinates" << endl;
835            cout.precision(15);
836            cout.setf(ios::scientific, ios::floatfield);
837            pair<double,double> xdx = getFirstCoordAndSpacing(0);
838            pair<double,double> ydy = getFirstCoordAndSpacing(1);
839            pair<double,double> zdz = getFirstCoordAndSpacing(2);
840            for (index_t i=0; i < getNumNodes(); i++) {
841                cout << "  " << setw(5) << m_nodeId[i]
842                    << "  " << xdx.first+(i%m_N0)*xdx.second
843                    << "  " << ydy.first+(i%(m_N0*m_N1)/m_N0)*ydy.second
844                    << "  " << zdz.first+(i/(m_N0*m_N1))*zdz.second << endl;
845            }
846        }
847    }
848    
849    IndexVector Brick::getNumNodesPerDim() const
850    {
851        IndexVector ret;
852        ret.push_back(m_N0);
853        ret.push_back(m_N1);
854        ret.push_back(m_N2);
855        return ret;
856    }
857    
858    IndexVector Brick::getNumElementsPerDim() const
859    {
860        IndexVector ret;
861        ret.push_back(m_NE0);
862        ret.push_back(m_NE1);
863        ret.push_back(m_NE2);
864        return ret;
865    }
866    
867    IndexVector Brick::getNumFacesPerBoundary() const
868    {
869        IndexVector ret(6, 0);
870        //left
871        if (m_offset0==0)
872            ret[0]=m_NE1*m_NE2;
873        //right
874        if (m_mpiInfo->rank%m_NX==m_NX-1)
875            ret[1]=m_NE1*m_NE2;
876        //bottom
877        if (m_offset1==0)
878            ret[2]=m_NE0*m_NE2;
879        //top
880        if (m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX==m_NY-1)
881            ret[3]=m_NE0*m_NE2;
882        //front
883        if (m_offset2==0)
884            ret[4]=m_NE0*m_NE1;
885        //back
886        if (m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY)==m_NZ-1)
887            ret[5]=m_NE0*m_NE1;
888        return ret;
889    }
890    
891    IndexVector Brick::getNumSubdivisionsPerDim() const
892    {
893        IndexVector ret;
894        ret.push_back(m_NX);
895        ret.push_back(m_NY);
896        ret.push_back(m_NZ);
897        return ret;
898    }
899    
900    pair<double,double> Brick::getFirstCoordAndSpacing(dim_t dim) const
901    {
902        if (dim==0)
903            return pair<double,double>(m_x0+(m_l0*m_offset0)/m_gNE0, m_l0/m_gNE0);
904        else if (dim==1)
905            return pair<double,double>(m_y0+(m_l1*m_offset1)/m_gNE1, m_l1/m_gNE1);
906        else if (dim==2)
907            return pair<double,double>(m_z0+(m_l2*m_offset2)/m_gNE2, m_l2/m_gNE2);
908    
909        throw RipleyException("getFirstCoordAndSpacing: invalid argument");
910    }
911    
912    //protected
913    dim_t Brick::getNumDOF() const
914    {
915        return (m_gNE0+1)/m_NX*(m_gNE1+1)/m_NY*(m_gNE2+1)/m_NZ;
916    }
917    
918    //protected
919    dim_t Brick::getNumFaceElements() const
920    {
921        const IndexVector faces = getNumFacesPerBoundary();
922        dim_t n=0;
923        for (size_t i=0; i<faces.size(); i++)
924            n+=faces[i];
925        return n;
926    }
927    
928    //protected
929    void Brick::assembleCoordinates(escript::Data& arg) const
930    {
931        escriptDataC x = arg.getDataC();
932        int numDim = m_numDim;
933        if (!isDataPointShapeEqual(&x, 1, &numDim))
934            throw RipleyException("setToX: Invalid Data object shape");
935        if (!numSamplesEqual(&x, 1, getNumNodes()))
936            throw RipleyException("setToX: Illegal number of samples in Data object");
937    
938        pair<double,double> xdx = getFirstCoordAndSpacing(0);
939        pair<double,double> ydy = getFirstCoordAndSpacing(1);
940        pair<double,double> zdz = getFirstCoordAndSpacing(2);
941        arg.requireWrite();
942    #pragma omp parallel for
943        for (dim_t i2 = 0; i2 < m_N2; i2++) {
944            for (dim_t i1 = 0; i1 < m_N1; i1++) {
945                for (dim_t i0 = 0; i0 < m_N0; i0++) {
946                    double* point = arg.getSampleDataRW(i0+m_N0*i1+m_N0*m_N1*i2);
947                    point[0] = xdx.first+i0*xdx.second;
948                    point[1] = ydy.first+i1*ydy.second;
949                    point[2] = zdz.first+i2*zdz.second;
950                }
951            }
952        }
953    }
954    
955    //protected
956    void Brick::assembleGradient(escript::Data& out, escript::Data& in) const
957  {  {
     escript::Data& in = *const_cast<escript::Data*>(&cIn);  
958      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();
959      const double h0 = m_l0/m_gNE0;      const double h0 = m_l0/m_gNE0;
960      const double h1 = m_l1/m_gNE1;      const double h1 = m_l1/m_gNE1;
961      const double h2 = m_l1/m_gNE2;      const double h2 = m_l2/m_gNE2;
962      const double C0 = .044658198738520451079;      const double C0 = .044658198738520451079;
963      const double C1 = .16666666666666666667;      const double C1 = .16666666666666666667;
964      const double C2 = .21132486540518711775;      const double C2 = .21132486540518711775;
# Line 317  void Brick::setToGradient(escript::Data& Line 968  void Brick::setToGradient(escript::Data&
968      const double C6 = .78867513459481288225;      const double C6 = .78867513459481288225;
969    
970      if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements) {      if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements) {
971          /*** GENERATOR SNIP_GRAD_ELEMENTS TOP */          out.requireWrite();
972  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel
973          for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {          {
974              for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {              vector<double> f_000(numComp);
975                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {              vector<double> f_001(numComp);
976                      const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_N0,m_N1));              vector<double> f_010(numComp);
977                      const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_N0,m_N1));              vector<double> f_011(numComp);
978                      const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_N0,m_N1));              vector<double> f_100(numComp);
979                      const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));              vector<double> f_101(numComp);
980                      const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_N0,m_N1));              vector<double> f_110(numComp);
981                      const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));              vector<double> f_111(numComp);
982                      const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_N0,m_N1));  #pragma omp for
983                      const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_N0,m_N1));              for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {
984                      double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE0,m_NE1));                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {
985                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {
986                          const double V0=((f_100[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_011[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
987                          const double V1=((f_110[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_001[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / h0;                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
988                          const double V2=((f_101[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_010[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / h0;                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
989                          const double V3=((f_111[i]-f_011[i])*C5 + (f_100[i]-f_000[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
990                          const double V4=((f_010[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_101[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
991                          const double V5=((f_110[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_001[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / h1;                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
992                          const double V6=((f_011[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_100[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / h1;                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
993                          const double V7=((f_111[i]-f_101[i])*C5 + (f_010[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
994                          const double V8=((f_001[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_110[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;                          double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE0,m_NE1));
995                          const double V9=((f_101[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_010[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / h2;                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
996                          const double V10=((f_011[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_100[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / h2;                              const double V0=((f_100[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_011[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;
997                          const double V11=((f_111[i]-f_110[i])*C5 + (f_001[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;                              const double V1=((f_110[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_001[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / h0;
998                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;                              const double V2=((f_101[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_010[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / h0;
999                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V4;                              const double V3=((f_111[i]-f_011[i])*C5 + (f_100[i]-f_000[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;
1000                          o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V8;                              const double V4=((f_010[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_101[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;
1001                          o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;                              const double V5=((f_110[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_001[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / h1;
1002                          o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V5;                              const double V6=((f_011[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_100[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / h1;
1003                          o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V9;                              const double V7=((f_111[i]-f_101[i])*C5 + (f_010[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;
1004                          o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V1;                              const double V8=((f_001[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_110[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;
1005                          o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V4;                              const double V9=((f_101[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_010[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / h2;
1006                          o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V10;                              const double V10=((f_011[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_100[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / h2;
1007                          o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;                              const double V11=((f_111[i]-f_110[i])*C5 + (f_001[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;
1008                          o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V5;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;
1009                          o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V11;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V4;
1010                          o[INDEX3(i,0,4,numComp,3)] = V2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V8;
1011                          o[INDEX3(i,1,4,numComp,3)] = V6;                              o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;
1012                          o[INDEX3(i,2,4,numComp,3)] = V8;                              o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V5;
1013                          o[INDEX3(i,0,5,numComp,3)] = V2;                              o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V9;
1014                          o[INDEX3(i,1,5,numComp,3)] = V7;                              o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V1;
1015                          o[INDEX3(i,2,5,numComp,3)] = V9;                              o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V4;
1016                          o[INDEX3(i,0,6,numComp,3)] = V3;                              o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V10;
1017                          o[INDEX3(i,1,6,numComp,3)] = V6;                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;
1018                          o[INDEX3(i,2,6,numComp,3)] = V10;                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V5;
1019                          o[INDEX3(i,0,7,numComp,3)] = V3;                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V11;
1020                          o[INDEX3(i,1,7,numComp,3)] = V7;                              o[INDEX3(i,0,4,numComp,3)] = V2;
1021                          o[INDEX3(i,2,7,numComp,3)] = V11;                              o[INDEX3(i,1,4,numComp,3)] = V6;
1022                      } /* end of component loop i */                              o[INDEX3(i,2,4,numComp,3)] = V8;
1023                  } /* end of k0 loop */                              o[INDEX3(i,0,5,numComp,3)] = V2;
1024              } /* end of k1 loop */                              o[INDEX3(i,1,5,numComp,3)] = V7;
1025          } /* end of k2 loop */                              o[INDEX3(i,2,5,numComp,3)] = V9;
1026          /* GENERATOR SNIP_GRAD_ELEMENTS BOTTOM */                              o[INDEX3(i,0,6,numComp,3)] = V3;
1027                                o[INDEX3(i,1,6,numComp,3)] = V6;
1028                                o[INDEX3(i,2,6,numComp,3)] = V10;
1029                                o[INDEX3(i,0,7,numComp,3)] = V3;
1030                                o[INDEX3(i,1,7,numComp,3)] = V7;
1031                                o[INDEX3(i,2,7,numComp,3)] = V11;
1032                            } // end of component loop i
1033                        } // end of k0 loop
1034                    } // end of k1 loop
1035                } // end of k2 loop
1036            } // end of parallel section
1037      } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {      } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
1038          /*** GENERATOR SNIP_GRAD_REDUCED_ELEMENTS TOP */          out.requireWrite();
1039  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel
1040          for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {          {
1041              for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {              vector<double> f_000(numComp);
1042                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {              vector<double> f_001(numComp);
1043                      const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_N0,m_N1));              vector<double> f_010(numComp);
1044                      const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_N0,m_N1));              vector<double> f_011(numComp);
1045                      const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_N0,m_N1));              vector<double> f_100(numComp);
1046                      const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));              vector<double> f_101(numComp);
1047                      const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_N0,m_N1));              vector<double> f_110(numComp);
1048                      const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_N0,m_N1));              vector<double> f_111(numComp);
1049                      const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_N0,m_N1));  #pragma omp for
1050                      const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));              for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {
1051                      double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE0,m_NE1));                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {
1052                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {
1053                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_010[i]-f_011[i])*C3 / h0;                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1054                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_100[i]-f_101[i])*C3 / h1;                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1055                          o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]+f_101[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_010[i]-f_100[i]-f_110[i])*C3 / h2;                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1056                      } /* end of component loop i */                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1057                  } /* end of k0 loop */                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1058              } /* end of k1 loop */                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1059          } /* end of k2 loop */                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1060          /* GENERATOR SNIP_GRAD_REDUCED_ELEMENTS BOTTOM */                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1061                            double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE0,m_NE1));
1062                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1063                                o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_010[i]-f_011[i])*C3 / h0;
1064                                o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_100[i]-f_101[i])*C3 / h1;
1065                                o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]+f_101[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_010[i]-f_100[i]-f_110[i])*C3 / h2;
1066                            } // end of component loop i
1067                        } // end of k0 loop
1068                    } // end of k1 loop
1069                } // end of k2 loop
1070            } // end of parallel section
1071      } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == FaceElements) {      } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == FaceElements) {
1072          /*** GENERATOR SNIP_GRAD_FACES TOP */          out.requireWrite();
1073  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1074          {          {
1075                vector<double> f_000(numComp);
1076                vector<double> f_001(numComp);
1077                vector<double> f_010(numComp);
1078                vector<double> f_011(numComp);
1079                vector<double> f_100(numComp);
1080                vector<double> f_101(numComp);
1081                vector<double> f_110(numComp);
1082                vector<double> f_111(numComp);
1083              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
1084  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1085                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {
1086                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {
1087                          const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1088                          const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1089                          const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1090                          const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1091                          const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1092                          const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1093                          const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1094                          const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1095                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));
1096                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1097                              const double V0=((f_010[i]-f_000[i])*C6 + (f_011[i]-f_001[i])*C2) / h1;                              const double V0=((f_010[i]-f_000[i])*C6 + (f_011[i]-f_001[i])*C2) / h1;
# Line 431  void Brick::setToGradient(escript::Data& Line 1110  void Brick::setToGradient(escript::Data&
1110                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_011[i])*C5 + (f_100[i]-f_000[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_011[i])*C5 + (f_100[i]-f_000[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;
1111                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V1;                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V1;
1112                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V3;                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V3;
1113                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
1114                      } /* end of k1 loop */                      } // end of k1 loop
1115                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
1116              } /* end of face 0 */              } // end of face 0
1117              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
1118  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1119                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {
1120                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {
1121                          const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1122                          const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1123                          const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1124                          const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1125                          const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1126                          const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1127                          const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1+1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1128                          const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1129                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));
1130                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1131                              const double V0=((f_110[i]-f_100[i])*C6 + (f_111[i]-f_101[i])*C2) / h1;                              const double V0=((f_110[i]-f_100[i])*C6 + (f_111[i]-f_101[i])*C2) / h1;
# Line 465  void Brick::setToGradient(escript::Data& Line 1144  void Brick::setToGradient(escript::Data&
1144                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_011[i])*C5 + (f_100[i]-f_000[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_011[i])*C5 + (f_100[i]-f_000[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;
1145                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V1;                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V1;
1146                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V3;                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V3;
1147                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
1148                      } /* end of k1 loop */                      } // end of k1 loop
1149                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
1150              } /* end of face 1 */              } // end of face 1
1151              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
1152  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1153                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {
1154                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {
1155                          const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1156                          const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1157                          const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1158                          const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1159                          const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1160                          const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1161                          const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1162                          const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1163                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));
1164                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1165                              const double V0=((f_100[i]-f_000[i])*C6 + (f_101[i]-f_001[i])*C2) / h0;                              const double V0=((f_100[i]-f_000[i])*C6 + (f_101[i]-f_001[i])*C2) / h0;
# Line 498  void Brick::setToGradient(escript::Data& Line 1177  void Brick::setToGradient(escript::Data&
1177                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V0;
1178                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_101[i])*C5 + (f_010[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_101[i])*C5 + (f_010[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;
1179                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V2;                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V2;
1180                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
1181                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
1182                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
1183              } /* end of face 2 */              } // end of face 2
1184              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
1185  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1186                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {
1187                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {
1188                          const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-2,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1189                          const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-2,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1190                          const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1191                          const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1192                          const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-2,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-2,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1193                          const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-2,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-2,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1194                          const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-2,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1195                          const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-2,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1196                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));
1197                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1198                              const double V0=((f_110[i]-f_010[i])*C6 + (f_111[i]-f_011[i])*C2) / h0;                              const double V0=((f_110[i]-f_010[i])*C6 + (f_111[i]-f_011[i])*C2) / h0;
# Line 532  void Brick::setToGradient(escript::Data& Line 1211  void Brick::setToGradient(escript::Data&
1211                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;
1212                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_101[i])*C5 + (f_010[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_101[i])*C5 + (f_010[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;
1213                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V3;                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V3;
1214                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
1215                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
1216                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
1217              } /* end of face 3 */              } // end of face 3
1218              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
1219  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1220                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {
1221                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {
1222                          const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1223                          const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1224                          const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1225                          const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1226                          const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1227                          const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1228                          const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1229                          const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1230                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));
1231                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1232                              const double V0=((f_100[i]-f_000[i])*C6 + (f_110[i]-f_010[i])*C2) / h0;                              const double V0=((f_100[i]-f_000[i])*C6 + (f_110[i]-f_010[i])*C2) / h0;
# Line 566  void Brick::setToGradient(escript::Data& Line 1245  void Brick::setToGradient(escript::Data&
1245                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;
1246                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V3;                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V3;
1247                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_110[i])*C5 + (f_001[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_110[i])*C5 + (f_001[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;
1248                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
1249                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
1250                  } /* end of k1 loop */                  } // end of k1 loop
1251              } /* end of face 4 */              } // end of face 4
1252              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
1253  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1254                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {
1255                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {
1256                          const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1257                          const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1258                          const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1259                          const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1260                          const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1261                          const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1262                          const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1263                          const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1264                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));
1265                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1266                              const double V0=((f_101[i]-f_001[i])*C6 + (f_111[i]-f_011[i])*C2) / h0;                              const double V0=((f_101[i]-f_001[i])*C6 + (f_111[i]-f_011[i])*C2) / h0;
# Line 600  void Brick::setToGradient(escript::Data& Line 1279  void Brick::setToGradient(escript::Data&
1279                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;
1280                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V3;                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V3;
1281                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = ((f_001[i]-f_000[i])*C0 + (f_111[i]-f_110[i])*C5 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = ((f_001[i]-f_000[i])*C0 + (f_111[i]-f_110[i])*C5 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;
1282                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
1283                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
1284                  } /* end of k1 loop */                  } // end of k1 loop
1285              } /* end of face 5 */              } // end of face 5
1286          } // end of parallel section          } // end of parallel section
         /* GENERATOR SNIP_GRAD_FACES BOTTOM */  
1287      } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedFaceElements) {      } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedFaceElements) {
1288          /*** GENERATOR SNIP_GRAD_REDUCED_FACES TOP */          out.requireWrite();
1289  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1290          {          {
1291                vector<double> f_000(numComp);
1292                vector<double> f_001(numComp);
1293                vector<double> f_010(numComp);
1294                vector<double> f_011(numComp);
1295                vector<double> f_100(numComp);
1296                vector<double> f_101(numComp);
1297                vector<double> f_110(numComp);
1298                vector<double> f_111(numComp);
1299              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
1300  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1301                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {
1302                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {
1303                          const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1304                          const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1305                          const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1306                          const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1307                          const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1308                          const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1309                          const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1310                          const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1311                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));
1312                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1313                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_010[i]-f_011[i])*C3 / h0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_010[i]-f_011[i])*C3 / h0;
1314                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]-f_000[i]-f_001[i])*C4 / h1;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]-f_000[i]-f_001[i])*C4 / h1;
1315                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]-f_000[i]-f_010[i])*C4 / h2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]-f_000[i]-f_010[i])*C4 / h2;
1316                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
1317                      } /* end of k1 loop */                      } // end of k1 loop
1318                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
1319              } /* end of face 0 */              } // end of face 0
1320              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
1321  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1322                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {
1323                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {
1324                          const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1325                          const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1326                          const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1327                          const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1328                          const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1329                          const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1330                          const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1+1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1331                          const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1332                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));
1333                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1334                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_010[i]-f_011[i])*C3 / h0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_010[i]-f_011[i])*C3 / h0;
1335                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_110[i]+f_111[i]-f_100[i]-f_101[i])*C4 / h1;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_110[i]+f_111[i]-f_100[i]-f_101[i])*C4 / h1;
1336                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_101[i]+f_111[i]-f_100[i]-f_110[i])*C4 / h2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_101[i]+f_111[i]-f_100[i]-f_110[i])*C4 / h2;
1337                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
1338                      } /* end of k1 loop */                      } // end of k1 loop
1339                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
1340              } /* end of face 1 */              } // end of face 1
1341              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
1342  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1343                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {
1344                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {
1345                          const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1346                          const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1347                          const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1348                          const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1349                          const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1350                          const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1351                          const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1352                          const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1353                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));
1354                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1355                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]-f_000[i]-f_001[i])*C4 / h0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]-f_000[i]-f_001[i])*C4 / h0;
1356                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_100[i]-f_101[i])*C3 / h1;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_100[i]-f_101[i])*C3 / h1;
1357                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_101[i]-f_000[i]-f_100[i])*C4 / h2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_101[i]-f_000[i]-f_100[i])*C4 / h2;
1358                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
1359                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
1360                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
1361              } /* end of face 2 */              } // end of face 2
1362              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
1363  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1364                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {
1365                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {
1366                          const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-2,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1367                          const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-2,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1368                          const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1369                          const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1370                          const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-2,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-2,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1371                          const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-2,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-2,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1372                          const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-2,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1373                          const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-2,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1374                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));
1375                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1376                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_110[i]+f_111[i]-f_010[i]-f_011[i])*C4 / h0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_110[i]+f_111[i]-f_010[i]-f_011[i])*C4 / h0;
1377                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_100[i]-f_101[i])*C3 / h1;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_100[i]-f_101[i])*C3 / h1;
1378                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_011[i]+f_111[i]-f_010[i]-f_110[i])*C4 / h2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_011[i]+f_111[i]-f_010[i]-f_110[i])*C4 / h2;
1379                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
1380                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
1381                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
1382              } /* end of face 3 */              } // end of face 3
1383              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
1384  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1385                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {
1386                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {
1387                          const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1388                          const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1389                          const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1390                          const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1391                          const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1392                          const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1393                          const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1394                          const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1395                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));
1396                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1397                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_110[i]-f_000[i]-f_010[i])*C4 / h0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_110[i]-f_000[i]-f_010[i])*C4 / h0;
1398                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_110[i]-f_000[i]-f_100[i])*C4 / h1;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_110[i]-f_000[i]-f_100[i])*C4 / h1;
1399                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]+f_101[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_010[i]-f_100[i]-f_110[i])*C4 / h2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]+f_101[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_010[i]-f_100[i]-f_110[i])*C4 / h2;
1400                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
1401                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
1402                  } /* end of k1 loop */                  } // end of k1 loop
1403              } /* end of face 4 */              } // end of face 4
1404              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
1405  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1406                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {
1407                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {
1408                          const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1409                          const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1410                          const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1411                          const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1412                          const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1413                          const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1414                          const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1415                          const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
1416                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));
1417                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1418                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_101[i]+f_111[i]-f_001[i]-f_011[i])*C4 / h0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_101[i]+f_111[i]-f_001[i]-f_011[i])*C4 / h0;
1419                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_011[i]+f_111[i]-f_001[i]-f_101[i])*C4 / h1;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_011[i]+f_111[i]-f_001[i]-f_101[i])*C4 / h1;
1420                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]+f_101[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_010[i]-f_100[i]-f_110[i])*C3 / h2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]+f_101[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_010[i]-f_100[i]-f_110[i])*C3 / h2;
1421                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
1422                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
1423                  } /* end of k1 loop */                  } // end of k1 loop
1424              } /* end of face 5 */              } // end of face 5
1425          } // end of parallel section          } // end of parallel section
         /* GENERATOR SNIP_GRAD_REDUCED_FACES BOTTOM */  
     } else {  
         stringstream msg;  
         msg << "setToGradient() not implemented for "  
             << functionSpaceTypeAsString(out.getFunctionSpace().getTypeCode());  
         throw RipleyException(msg.str());  
1426      }      }
1427  }  }
1428    
1429  void Brick::setToIntegrals(vector<double>& integrals, const escript::Data& arg) const  //protected
1430    void Brick::assembleIntegrate(vector<double>& integrals, escript::Data& arg) const
1431  {  {
1432      escript::Data& in = *const_cast<escript::Data*>(&arg);      const dim_t numComp = arg.getDataPointSize();
     const dim_t numComp = in.getDataPointSize();  
1433      const double h0 = m_l0/m_gNE0;      const double h0 = m_l0/m_gNE0;
1434      const double h1 = m_l1/m_gNE1;      const double h1 = m_l1/m_gNE1;
1435      const double h2 = m_l2/m_gNE2;      const double h2 = m_l2/m_gNE2;
1436      if (arg.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements) {      const index_t left = (m_offset0==0 ? 0 : 1);
1437        const index_t bottom = (m_offset1==0 ? 0 : 1);
1438        const index_t front = (m_offset2==0 ? 0 : 1);
1439        const int fs = arg.getFunctionSpace().getTypeCode();
1440        if (fs == Elements && arg.actsExpanded()) {
1441          const double w_0 = h0*h1*h2/8.;          const double w_0 = h0*h1*h2/8.;
1442  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1443          {          {
1444              vector<double> int_local(numComp, 0);              vector<double> int_local(numComp, 0);
1445  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1446              for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {              for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE2; ++k2) {
1447                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {
1448                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {
1449                          const double* f = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0, k1, k2, m_NE0, m_NE1));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(INDEX3(k0, k1, k2, m_NE0, m_NE1));
1450                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1451                              const register double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1452                              const register double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1453                              const register double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];                              const double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];
1454                              const register double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];                              const double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];
1455                              const register double f_4 = f[INDEX2(i,4,numComp)];                              const double f_4 = f[INDEX2(i,4,numComp)];
1456                              const register double f_5 = f[INDEX2(i,5,numComp)];                              const double f_5 = f[INDEX2(i,5,numComp)];
1457                              const register double f_6 = f[INDEX2(i,6,numComp)];                              const double f_6 = f[INDEX2(i,6,numComp)];
1458                              const register double f_7 = f[INDEX2(i,7,numComp)];                              const double f_7 = f[INDEX2(i,7,numComp)];
1459                              int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3+f_4+f_5+f_6+f_7)*w_0;                              int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3+f_4+f_5+f_6+f_7)*w_0;
1460                          }  /* end of component loop i */                          }  // end of component loop i
1461                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
1462                  } /* end of k1 loop */                  } // end of k1 loop
1463              } /* end of k2 loop */              } // end of k2 loop
1464    
1465  #pragma omp critical  #pragma omp critical
1466              for (index_t i=0; i<numComp; i++)              for (index_t i=0; i<numComp; i++)
1467                  integrals[i]+=int_local[i];                  integrals[i]+=int_local[i];
1468          } // end of parallel section          } // end of parallel section
1469      } else if (arg.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {  
1470        } else if (fs==ReducedElements || (fs==Elements && !arg.actsExpanded())) {
1471          const double w_0 = h0*h1*h2;          const double w_0 = h0*h1*h2;
1472  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1473          {          {
1474              vector<double> int_local(numComp, 0);              vector<double> int_local(numComp, 0);
1475  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1476              for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {              for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE2; ++k2) {
1477                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {
1478                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {
1479                          const double* f = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0, k1, k2, m_NE0, m_NE1));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(INDEX3(k0, k1, k2, m_NE0, m_NE1));
1480                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1481                              int_local[i]+=f[i]*w_0;                              int_local[i]+=f[i]*w_0;
1482                          }  /* end of component loop i */                          }  // end of component loop i
1483                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
1484                  } /* end of k1 loop */                  } // end of k1 loop
1485              } /* end of k2 loop */              } // end of k2 loop
1486    
1487  #pragma omp critical  #pragma omp critical
1488              for (index_t i=0; i<numComp; i++)              for (index_t i=0; i<numComp; i++)
1489                  integrals[i]+=int_local[i];                  integrals[i]+=int_local[i];
1490          } // end of parallel section          } // end of parallel section
1491      } else if (arg.getFunctionSpace().getTypeCode() == FaceElements) {  
1492        } else if (fs == FaceElements && arg.actsExpanded()) {
1493          const double w_0 = h1*h2/4.;          const double w_0 = h1*h2/4.;
1494          const double w_1 = h0*h2/4.;          const double w_1 = h0*h2/4.;
1495          const double w_2 = h0*h1/4.;          const double w_2 = h0*h1/4.;
# Line 812  void Brick::setToIntegrals(vector<double Line 1498  void Brick::setToIntegrals(vector<double
1498              vector<double> int_local(numComp, 0);              vector<double> int_local(numComp, 0);
1499              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
1500  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1501                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE2; ++k2) {
1502                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {
1503                          const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));
1504                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1505                              const register double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1506                              const register double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1507                              const register double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];                              const double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];
1508                              const register double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];                              const double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];
1509                              int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_0;                              int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_0;
1510                          }  /* end of component loop i */                          }  // end of component loop i
1511                      } /* end of k1 loop */                      } // end of k1 loop
1512                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
1513              }              }
1514    
1515              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
1516  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1517                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE2; ++k2) {
1518                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {
1519                          const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));
1520                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1521                              const register double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1522                              const register double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1523                              const register double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];                              const double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];
1524                              const register double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];                              const double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];
1525                              int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_0;                              int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_0;
1526                          }  /* end of component loop i */                          }  // end of component loop i
1527                      } /* end of k1 loop */                      } // end of k1 loop
1528                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
1529              }              }
1530    
1531              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
1532  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1533                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE2; ++k2) {
1534                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {
1535                          const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));
1536                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1537                              const register double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1538                              const register double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1539                              const register double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];                              const double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];
1540                              const register double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];                              const double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];
1541                              int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_1;                              int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_1;
1542                          }  /* end of component loop i */                          }  // end of component loop i
1543                      } /* end of k1 loop */                      } // end of k1 loop
1544                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
1545              }              }
1546    
1547              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
1548  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1549                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE2; ++k2) {
1550                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {
1551                          const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));
1552                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1553                              const register double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1554                              const register double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1555                              const register double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];                              const double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];
1556                              const register double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];                              const double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];
1557                              int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_1;                              int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_1;
1558                          }  /* end of component loop i */                          }  // end of component loop i
1559                      } /* end of k1 loop */                      } // end of k1 loop
1560                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
1561              }              }
1562    
1563              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
1564  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1565                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {
1566                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {
1567                          const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));
1568                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1569                              const register double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1570                              const register double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1571                              const register double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];                              const double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];
1572                              const register double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];                              const double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];
1573                              int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_2;                              int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_2;
1574                          }  /* end of component loop i */                          }  // end of component loop i
1575                      } /* end of k1 loop */                      } // end of k1 loop
1576                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
1577              }              }
1578    
1579              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
1580  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1581                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {
1582                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {
1583                          const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));
1584                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1585                              const register double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1586                              const register double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1587                              const register double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];                              const double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];
1588                              const register double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];                              const double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];
1589                              int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_2;                              int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_2;
1590                          }  /* end of component loop i */                          }  // end of component loop i
1591                      } /* end of k1 loop */                      } // end of k1 loop
1592                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
1593              }              }
1594    
1595  #pragma omp critical  #pragma omp critical
# Line 911  void Brick::setToIntegrals(vector<double Line 1597  void Brick::setToIntegrals(vector<double
1597                  integrals[i]+=int_local[i];                  integrals[i]+=int_local[i];
1598          } // end of parallel section          } // end of parallel section
1599    
1600      } else if (arg.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedFaceElements) {      } else if (fs==ReducedFaceElements || (fs==FaceElements && !arg.actsExpanded())) {
1601          const double w_0 = h1*h2;          const double w_0 = h1*h2;
1602          const double w_1 = h0*h2;          const double w_1 = h0*h2;
1603          const double w_2 = h0*h1;          const double w_2 = h0*h1;
# Line 920  void Brick::setToIntegrals(vector<double Line 1606  void Brick::setToIntegrals(vector<double
1606              vector<double> int_local(numComp, 0);              vector<double> int_local(numComp, 0);
1607              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
1608  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1609                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE2; ++k2) {
1610                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {
1611                          const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));
1612                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1613                              int_local[i]+=f[i]*w_0;                              int_local[i]+=f[i]*w_0;
1614                          }  /* end of component loop i */                          }  // end of component loop i
1615                      } /* end of k1 loop */                      } // end of k1 loop
1616                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
1617              }              }
1618    
1619              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
1620  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1621                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE2; ++k2) {
1622                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {
1623                          const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));
1624                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1625                              int_local[i]+=f[i]*w_0;                              int_local[i]+=f[i]*w_0;
1626                          }  /* end of component loop i */                          }  // end of component loop i
1627                      } /* end of k1 loop */                      } // end of k1 loop
1628                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
1629              }              }
1630    
1631              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
1632  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1633                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE2; ++k2) {
1634                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {
1635                          const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));
1636                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1637                              int_local[i]+=f[i]*w_1;                              int_local[i]+=f[i]*w_1;
1638                          }  /* end of component loop i */                          }  // end of component loop i
1639                      } /* end of k1 loop */                      } // end of k1 loop
1640                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
1641              }              }
1642    
1643              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
1644  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1645                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE2; ++k2) {
1646                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {
1647                          const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));
1648                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1649                              int_local[i]+=f[i]*w_1;                              int_local[i]+=f[i]*w_1;
1650                          }  /* end of component loop i */                          }  // end of component loop i
1651                      } /* end of k1 loop */                      } // end of k1 loop
1652                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
1653              }              }
1654    
1655              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
1656  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1657                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {
1658                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {
1659                          const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));
1660                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1661                              int_local[i]+=f[i]*w_2;                              int_local[i]+=f[i]*w_2;
1662                          }  /* end of component loop i */                          }  // end of component loop i
1663                      } /* end of k1 loop */                      } // end of k1 loop
1664                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
1665              }              }
1666    
1667              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
1668  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1669                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {
1670                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {
1671                          const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));
1672                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1673                              int_local[i]+=f[i]*w_2;                              int_local[i]+=f[i]*w_2;
1674                          }  /* end of component loop i */                          }  // end of component loop i
1675                      } /* end of k1 loop */                      } // end of k1 loop
1676                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
1677              }              }
1678    
1679  #pragma omp critical  #pragma omp critical
1680              for (index_t i=0; i<numComp; i++)              for (index_t i=0; i<numComp; i++)
1681                  integrals[i]+=int_local[i];                  integrals[i]+=int_local[i];
1682          } // end of parallel section          } // end of parallel section
1683        } // function space selector
     } else {  
         stringstream msg;  
         msg << "setToIntegrals() not implemented for "  
             << functionSpaceTypeAsString(arg.getFunctionSpace().getTypeCode());  
         throw RipleyException(msg.str());  
     }  
1684  }  }
1685    
1686  void Brick::setToNormal(escript::Data& out) const  //protected
1687    dim_t Brick::insertNeighbourNodes(IndexVector& index, index_t node) const
1688  {  {
1689      if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == FaceElements) {      const dim_t nDOF0 = (m_gNE0+1)/m_NX;
1690  #pragma omp parallel      const dim_t nDOF1 = (m_gNE1+1)/m_NY;
1691          {      const dim_t nDOF2 = (m_gNE2+1)/m_NZ;
1692              if (m_faceOffset[0] > -1) {      const int x=node%nDOF0;
1693  #pragma omp for nowait      const int y=node%(nDOF0*nDOF1)/nDOF0;
1694                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {      const int z=node/(nDOF0*nDOF1);
1695                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {      int num=0;
1696                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));      // loop through potential neighbours and add to index if positions are
1697                          // set vector at four quadrature points      // within bounds
1698                          *o++ = -1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;      for (int i2=-1; i2<2; i2++) {
1699                          *o++ = -1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;          for (int i1=-1; i1<2; i1++) {
1700                          *o++ = -1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;              for (int i0=-1; i0<2; i0++) {
1701                          *o++ = -1.; *o++ = 0.; *o = 0.;                  // skip node itself
1702                      }                  if (i0==0 && i1==0 && i2==0)
1703                  }                      continue;
1704              }                  // location of neighbour node
1705                    const int nx=x+i0;
1706              if (m_faceOffset[1] > -1) {                  const int ny=y+i1;
1707  #pragma omp for nowait                  const int nz=z+i2;
1708                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  if (nx>=0 && ny>=0 && nz>=0
1709                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                          && nx<nDOF0 && ny<nDOF1 && nz<nDOF2) {
1710                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                      index.push_back(nz*nDOF0*nDOF1+ny*nDOF0+nx);
1711                          // set vector at four quadrature points                      num++;
                         *o++ = 1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;  
                         *o++ = 1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;  
                         *o++ = 1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;  
                         *o++ = 1.; *o++ = 0.; *o = 0.;  
                     }  
                 }  
             }  
   
             if (m_faceOffset[2] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));  
                         // set vector at four quadrature points  
                         *o++ = 0.; *o++ = -1.; *o++ = 0.;  
                         *o++ = 0.; *o++ = -1.; *o++ = 0.;  
                         *o++ = 0.; *o++ = -1.; *o++ = 0.;  
                         *o++ = 0.; *o++ = -1.; *o = 0.;  
                     }  
                 }  
             }  
   
             if (m_faceOffset[3] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));  
                         // set vector at four quadrature points  
                         *o++ = 0.; *o++ = 1.; *o++ = 0.;  
                         *o++ = 0.; *o++ = 1.; *o++ = 0.;  
                         *o++ = 0.; *o++ = 1.; *o++ = 0.;  
                         *o++ = 0.; *o++ = 1.; *o = 0.;  
                     }  
                 }  
             }  
   
             if (m_faceOffset[4] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                     for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));  
                         // set vector at four quadrature points  
                         *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = -1.;  
                         *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = -1.;  
                         *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = -1.;  
                         *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o = -1.;  
                     }  
                 }  
             }  
   
             if (m_faceOffset[5] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                     for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));  
                         // set vector at four quadrature points  
                         *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = 1.;  
                         *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = 1.;  
                         *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = 1.;  
                         *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o = 1.;  
                     }  
                 }  
             }  
         } // end of parallel section  
     } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedFaceElements) {  
 #pragma omp parallel  
         {  
             if (m_faceOffset[0] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));  
                         *o++ = -1.;  
                         *o++ = 0.;  
                         *o = 0.;  
                     }  
                 }  
             }  
   
             if (m_faceOffset[1] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));  
                         *o++ = 1.;  
                         *o++ = 0.;  
                         *o = 0.;  
                     }  
                 }  
             }  
   
             if (m_faceOffset[2] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));  
                         *o++ = 0.;  
                         *o++ = -1.;  
                         *o = 0.;  
                     }  
                 }  
             }  
   
             if (m_faceOffset[3] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));  
                         *o++ = 0.;  
                         *o++ = 1.;  
                         *o = 0.;  
                     }  
                 }  
             }  
   
             if (m_faceOffset[4] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                     for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));  
                         *o++ = 0.;  
                         *o++ = 0.;  
                         *o = -1.;  
                     }  
                 }  
             }  
   
             if (m_faceOffset[5] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                     for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));  
                         *o++ = 0.;  
                         *o++ = 0.;  
                         *o = 1.;  
                     }  
1712                  }                  }
1713              }              }
         } // end of parallel section  
   
     } else {  
         stringstream msg;  
         msg << "setToNormal() not implemented for "  
             << functionSpaceTypeAsString(out.getFunctionSpace().getTypeCode());  
         throw RipleyException(msg.str());  
     }  
 }  
   
 Paso_SystemMatrixPattern* Brick::getPattern(bool reducedRowOrder,  
                                             bool reducedColOrder) const  
 {  
     if (reducedRowOrder || reducedColOrder)  
         throw RipleyException("getPattern() not implemented for reduced order");  
   
     throw RipleyException("getPattern() not implemented");  
 }  
   
 void Brick::Print_Mesh_Info(const bool full) const  
 {  
     RipleyDomain::Print_Mesh_Info(full);  
     if (full) {  
         cout << "     Id  Coordinates" << endl;  
         cout.precision(15);  
         cout.setf(ios::scientific, ios::floatfield);  
         pair<double,double> xdx = getFirstCoordAndSpacing(0);  
         pair<double,double> ydy = getFirstCoordAndSpacing(1);  
         pair<double,double> zdz = getFirstCoordAndSpacing(2);  
         for (index_t i=0; i < getNumNodes(); i++) {  
             cout << "  " << setw(5) << m_nodeId[i]  
                 << "  " << xdx.first+(i%m_N0)*xdx.second  
                 << "  " << ydy.first+(i%(m_N0*m_N1)/m_N0)*ydy.second  
                 << "  " << zdz.first+(i/(m_N0*m_N1))*zdz.second << endl;  
1714          }          }
1715      }      }
 }  
1716    
1717  IndexVector Brick::getNumNodesPerDim() const      return num;
 {  
     IndexVector ret;  
     ret.push_back(m_N0);  
     ret.push_back(m_N1);  
     ret.push_back(m_N2);  
     return ret;  
 }  
   
 IndexVector Brick::getNumElementsPerDim() const  
 {  
     IndexVector ret;  
     ret.push_back(m_NE0);  
     ret.push_back(m_NE1);  
     ret.push_back(m_NE2);  
     return ret;  
 }  
   
 IndexVector Brick::getNumFacesPerBoundary() const  
 {  
     IndexVector ret(6, 0);  
     //left  
     if (m_offset0==0)  
         ret[0]=m_NE1*m_NE2;  
     //right  
     if (m_mpiInfo->rank%m_NX==m_NX-1)  
         ret[1]=m_NE1*m_NE2;  
     //bottom  
     if (m_offset1==0)  
         ret[2]=m_NE0*m_NE2;  
     //top  
     if (m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX==m_NY-1)  
         ret[3]=m_NE0*m_NE2;  
     //front  
     if (m_offset2==0)  
         ret[4]=m_NE0*m_NE1;  
     //back  
     if (m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY)==m_NZ-1)  
         ret[5]=m_NE0*m_NE1;  
     return ret;  
 }  
   
 pair<double,double> Brick::getFirstCoordAndSpacing(dim_t dim) const  
 {  
     if (dim==0)  
         return pair<double,double>((m_l0*m_offset0)/m_gNE0, m_l0/m_gNE0);  
     else if (dim==1)  
         return pair<double,double>((m_l1*m_offset1)/m_gNE1, m_l1/m_gNE1);  
     else if (dim==2)  
         return pair<double,double>((m_l2*m_offset2)/m_gNE2, m_l2/m_gNE2);  
   
     throw RipleyException("getFirstCoordAndSpacing(): invalid argument");  
1718  }  }
1719    
1720  //protected  //protected
1721  dim_t Brick::getNumDOF() const  void Brick::nodesToDOF(escript::Data& out, escript::Data& in) const
1722  {  {
1723      return (m_gNE0+1)/m_NX*(m_gNE1+1)/m_NY*(m_gNE2+1)/m_NZ;      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();
1724  }      out.requireWrite();
1725    
1726  //protected      const index_t left = (m_offset0==0 ? 0 : 1);
1727  dim_t Brick::getNumFaceElements() const      const index_t bottom = (m_offset1==0 ? 0 : 1);
1728  {      const index_t front = (m_offset2==0 ? 0 : 1);
1729      const IndexVector faces = getNumFacesPerBoundary();      const dim_t nDOF0 = (m_gNE0+1)/m_NX;
1730      dim_t n=0;      const dim_t nDOF1 = (m_gNE1+1)/m_NY;
1731      for (size_t i=0; i<faces.size(); i++)      const dim_t nDOF2 = (m_gNE2+1)/m_NZ;
1732          n+=faces[i];  #pragma omp parallel for
1733      return n;      for (index_t i=0; i<nDOF2; i++) {
1734            for (index_t j=0; j<nDOF1; j++) {
1735                for (index_t k=0; k<nDOF0; k++) {
1736                    const index_t n=k+left+(j+bottom)*m_N0+(i+front)*m_N0*m_N1;
1737                    const double* src=in.getSampleDataRO(n);
1738                    copy(src, src+numComp, out.getSampleDataRW(k+j*nDOF0+i*nDOF0*nDOF1));
1739                }
1740            }
1741        }
1742  }  }
1743    
1744  //protected  //protected
1745  void Brick::assembleCoordinates(escript::Data& arg) const  void Brick::dofToNodes(escript::Data& out, escript::Data& in) const
1746  {  {
1747      escriptDataC x = arg.getDataC();      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();
1748      int numDim = m_numDim;      Paso_Coupler* coupler = Paso_Coupler_alloc(m_connector, numComp);
1749      if (!isDataPointShapeEqual(&x, 1, &numDim))      in.requireWrite();
1750          throw RipleyException("setToX: Invalid Data object shape");      Paso_Coupler_startCollect(coupler, in.getSampleDataRW(0));
1751      if (!numSamplesEqual(&x, 1, getNumNodes()))  
1752          throw RipleyException("setToX: Illegal number of samples in Data object");      const dim_t numDOF = getNumDOF();
1753        out.requireWrite();
1754        const double* buffer = Paso_Coupler_finishCollect(coupler);
1755    
     pair<double,double> xdx = getFirstCoordAndSpacing(0);  
     pair<double,double> ydy = getFirstCoordAndSpacing(1);  
     pair<double,double> zdz = getFirstCoordAndSpacing(2);  
     arg.requireWrite();  
1756  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel for
1757      for (dim_t i2 = 0; i2 < m_N2; i2++) {      for (index_t i=0; i<getNumNodes(); i++) {
1758          for (dim_t i1 = 0; i1 < m_N1; i1++) {          const double* src=(m_dofMap[i]<numDOF ?
1759              for (dim_t i0 = 0; i0 < m_N0; i0++) {                  in.getSampleDataRO(m_dofMap[i])
1760                  double* point = arg.getSampleDataRW(i0+m_N0*i1+m_N0*m_N1*i2);                  : &buffer[(m_dofMap[i]-numDOF)*numComp]);
1761                  point[0] = xdx.first+i0*xdx.second;          copy(src, src+numComp, out.getSampleDataRW(i));
                 point[1] = ydy.first+i1*ydy.second;  
                 point[2] = zdz.first+i2*zdz.second;  
             }  
         }  
1762      }      }
1763        Paso_Coupler_free(coupler);
1764  }  }
1765    
1766  //private  //private
# Line 1308  void Brick::populateSampleIds() Line 1770  void Brick::populateSampleIds()
1770      // globally      // globally
1771    
1772      // build node distribution vector first.      // build node distribution vector first.
1773      // rank i owns m_nodeDistribution[i+1]-nodeDistribution[i] nodes      // rank i owns m_nodeDistribution[i+1]-nodeDistribution[i] nodes which is
1774        // constant for all ranks in this implementation
1775      m_nodeDistribution.assign(m_mpiInfo->size+1, 0);      m_nodeDistribution.assign(m_mpiInfo->size+1, 0);
1776      const dim_t numDOF=getNumDOF();      const dim_t numDOF=getNumDOF();
1777      for (dim_t k=1; k<m_mpiInfo->size; k++) {      for (dim_t k=1; k<m_mpiInfo->size; k++) {
# Line 1342  void Brick::populateSampleIds() Line 1805  void Brick::populateSampleIds()
1805    
1806          // elements          // elements
1807  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1808          for (dim_t k=0; k<getNumElements(); k++)          for (dim_t i2=0; i2<m_NE2; i2++) {
1809              m_elementId[k]=k;              for (dim_t i1=0; i1<m_NE1; i1++) {
1810                    for (dim_t i0=0; i0<m_NE0; i0++) {
1811                        m_elementId[i0+i1*m_NE0+i2*m_NE0*m_NE1] =
1812                            (m_offset2+i2)*m_gNE0*m_gNE1
1813                            +(m_offset1+i1)*m_gNE0
1814                            +m_offset0+i0;
1815                    }
1816                }
1817            }
1818    
1819          // face elements          // face elements
1820  #pragma omp for  #pragma omp for
# Line 1380  void Brick::populateSampleIds() Line 1851  void Brick::populateSampleIds()
1851      updateTagsInUse(FaceElements);      updateTagsInUse(FaceElements);
1852  }  }
1853    
1854    //private
1855    void Brick::createPattern()
1856    {
1857        const dim_t nDOF0 = (m_gNE0+1)/m_NX;
1858        const dim_t nDOF1 = (m_gNE1+1)/m_NY;
1859        const dim_t nDOF2 = (m_gNE2+1)/m_NZ;
1860        const index_t left = (m_offset0==0 ? 0 : 1);
1861        const index_t bottom = (m_offset1==0 ? 0 : 1);
1862        const index_t front = (m_offset2==0 ? 0 : 1);
1863    
1864        // populate node->DOF mapping with own degrees of freedom.
1865        // The rest is assigned in the loop further down
1866        m_dofMap.assign(getNumNodes(), 0);
1867    #pragma omp parallel for
1868        for (index_t i=front; i<front+nDOF2; i++) {
1869            for (index_t j=bottom; j<bottom+nDOF1; j++) {
1870                for (index_t k=left; k<left+nDOF0; k++) {
1871                    m_dofMap[i*m_N0*m_N1+j*m_N0+k]=(i-front)*nDOF0*nDOF1+(j-bottom)*nDOF0+k-left;
1872                }
1873            }
1874        }
1875    
1876        // build list of shared components and neighbours by looping through
1877        // all potential neighbouring ranks and checking if positions are
1878        // within bounds
1879        const dim_t numDOF=nDOF0*nDOF1*nDOF2;
1880        vector<IndexVector> colIndices(numDOF); // for the couple blocks
1881        RankVector neighbour;
1882        IndexVector offsetInShared(1,0);
1883        IndexVector sendShared, recvShared;
1884        int numShared=0;
1885        const int x=m_mpiInfo->rank%m_NX;
1886        const int y=m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX;
1887        const int z=m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY);
1888        for (int i2=-1; i2<2; i2++) {
1889            for (int i1=-1; i1<2; i1++) {
1890                for (int i0=-1; i0<2; i0++) {
1891                    // skip this rank
1892                    if (i0==0 && i1==0 && i2==0)
1893                        continue;
1894                    // location of neighbour rank
1895                    const int nx=x+i0;
1896                    const int ny=y+i1;
1897                    const int nz=z+i2;
1898                    if (nx>=0 && ny>=0 && nz>=0 && nx<m_NX && ny<m_NY && nz<m_NZ) {
1899                        neighbour.push_back(nz*m_NX*m_NY+ny*m_NX+nx);
1900                        if (i0==0 && i1==0) {
1901                            // sharing front or back plane
1902                            offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF0*nDOF1);
1903                            for (dim_t i=0; i<nDOF1; i++) {
1904                                const int firstDOF=(i2==-1 ? i*nDOF0
1905                                        : i*nDOF0 + nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1));
1906                                const int firstNode=(i2==-1 ? left+(i+bottom)*m_N0
1907                                        : left+(i+bottom)*m_N0+m_N0*m_N1*(m_N2-1));
1908                                for (dim_t j=0; j<nDOF0; j++, numShared++) {
1909                                    sendShared.push_back(firstDOF+j);
1910                                    recvShared.push_back(numDOF+numShared);
1911                                    if (j>0) {
1912                                        if (i>0)
1913                                            colIndices[firstDOF+j-1-nDOF0].push_back(numShared);
1914                                        colIndices[firstDOF+j-1].push_back(numShared);
1915                                        if (i<nDOF1-1)
1916                                            colIndices[firstDOF+j-1+nDOF0].push_back(numShared);
1917                                    }
1918                                    if (i>0)
1919                                        colIndices[firstDOF+j-nDOF0].push_back(numShared);
1920                                    colIndices[firstDOF+j].push_back(numShared);
1921                                    if (i<nDOF1-1)
1922                                        colIndices[firstDOF+j+nDOF0].push_back(numShared);
1923                                    if (j<nDOF0-1) {
1924                                        if (i>0)
1925                                            colIndices[firstDOF+j+1-nDOF0].push_back(numShared);
1926                                        colIndices[firstDOF+j+1].push_back(numShared);
1927                                        if (i<nDOF1-1)
1928                                            colIndices[firstDOF+j+1+nDOF0].push_back(numShared);
1929                                    }
1930                                    m_dofMap[firstNode+j]=numDOF+numShared;
1931                                }
1932                            }
1933                        } else if (i0==0 && i2==0) {
1934                            // sharing top or bottom plane
1935                            offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF0*nDOF2);
1936                            for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++) {
1937                                const int firstDOF=(i1==-1 ? i*nDOF0*nDOF1
1938                                        : nDOF0*((i+1)*nDOF1-1));
1939                                const int firstNode=(i1==-1 ?
1940                                        left+(i+front)*m_N0*m_N1
1941                                        : left+m_N0*((i+1+front)*m_N1-1));
1942                                for (dim_t j=0; j<nDOF0; j++, numShared++) {
1943                                    sendShared.push_back(firstDOF+j);
1944                                    recvShared.push_back(numDOF+numShared);
1945                                    if (j>0) {
1946                                        if (i>0)
1947                                            colIndices[firstDOF+j-1-nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);
1948                                        colIndices[firstDOF+j-1].push_back(numShared);
1949                                        if (i<nDOF2-1)
1950                                            colIndices[firstDOF+j-1+nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);
1951                                    }
1952                                    if (i>0)
1953                                        colIndices[firstDOF+j-nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);
1954                                    colIndices[firstDOF+j].push_back(numShared);
1955                                    if (i<nDOF2-1)
1956                                        colIndices[firstDOF+j+nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);
1957                                    if (j<nDOF0-1) {
1958                                        if (i>0)
1959                                            colIndices[firstDOF+j+1-nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);
1960                                        colIndices[firstDOF+j+1].push_back(numShared);
1961                                        if (i<nDOF2-1)
1962                                            colIndices[firstDOF+j+1+nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);
1963                                    }
1964                                    m_dofMap[firstNode+j]=numDOF+numShared;
1965                                }
1966                            }
1967                        } else if (i1==0 && i2==0) {
1968                            // sharing left or right plane
1969                            offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF1*nDOF2);
1970                            for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++) {
1971                                const int firstDOF=(i0==-1 ? i*nDOF0*nDOF1
1972                                        : nDOF0*(1+i*nDOF1)-1);
1973                                const int firstNode=(i0==-1 ?
1974                                        (bottom+(i+front)*m_N1)*m_N0
1975                                        : (bottom+1+(i+front)*m_N1)*m_N0-1);
1976                                for (dim_t j=0; j<nDOF1; j++, numShared++) {
1977                                    sendShared.push_back(firstDOF+j*nDOF0);
1978                                    recvShared.push_back(numDOF+numShared);
1979                                    if (j>0) {
1980                                        if (i>0)
1981                                            colIndices[firstDOF+(j-1)*nDOF0-nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);
1982                                        colIndices[firstDOF+(j-1)*nDOF0].push_back(numShared);
1983                                        if (i<nDOF2-1)
1984                                            colIndices[firstDOF+(j-1)*nDOF0+nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);
1985                                    }
1986                                    if (i>0)
1987                                        colIndices[firstDOF+j*nDOF0-nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);
1988                                    colIndices[firstDOF+j*nDOF0].push_back(numShared);
1989                                    if (i<nDOF2-1)
1990                                        colIndices[firstDOF+j*nDOF0+nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);
1991                                    if (j<nDOF1-1) {
1992                                        if (i>0)
1993                                            colIndices[firstDOF+(j+1)*nDOF0-nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);
1994                                        colIndices[firstDOF+(j+1)*nDOF0].push_back(numShared);
1995                                        if (i<nDOF2-1)
1996                                            colIndices[firstDOF+(j+1)*nDOF0+nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);
1997                                    }
1998                                    m_dofMap[firstNode+j*m_N0]=numDOF+numShared;
1999                                }
2000                            }
2001                        } else if (i0==0) {
2002                            // sharing an edge in x direction
2003                            offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF0);
2004                            const int firstDOF=(i1+1)/2*nDOF0*(nDOF1-1)
2005                                               +(i2+1)/2*nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);
2006                            const int firstNode=left+(i1+1)/2*m_N0*(m_N1-1)
2007                                                +(i2+1)/2*m_N0*m_N1*(m_N2-1);
2008                            for (dim_t i=0; i<nDOF0; i++, numShared++) {
2009                                sendShared.push_back(firstDOF+i);
2010                                recvShared.push_back(numDOF+numShared);
2011                                if (i>0)
2012                                    colIndices[firstDOF+i-1].push_back(numShared);
2013                                colIndices[firstDOF+i].push_back(numShared);
2014                                if (i<nDOF0-1)
2015                                    colIndices[firstDOF+i+1].push_back(numShared);
2016                                m_dofMap[firstNode+i]=numDOF+numShared;
2017                            }
2018                        } else if (i1==0) {
2019                            // sharing an edge in y direction
2020                            offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF1);
2021                            const int firstDOF=(i0+1)/2*(nDOF0-1)
2022                                               +(i2+1)/2*nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);
2023                            const int firstNode=bottom*m_N0
2024                                                +(i0+1)/2*(m_N0-1)
2025                                                +(i2+1)/2*m_N0*m_N1*(m_N2-1);
2026                            for (dim_t i=0; i<nDOF1; i++, numShared++) {
2027                                sendShared.push_back(firstDOF+i*nDOF0);
2028                                recvShared.push_back(numDOF+numShared);
2029                                if (i>0)
2030                                    colIndices[firstDOF+(i-1)*nDOF0].push_back(numShared);
2031                                colIndices[firstDOF+i*nDOF0].push_back(numShared);
2032                                if (i<nDOF1-1)
2033                                    colIndices[firstDOF+(i+1)*nDOF0].push_back(numShared);
2034                                m_dofMap[firstNode+i*m_N0]=numDOF+numShared;
2035                            }
2036                        } else if (i2==0) {
2037                            // sharing an edge in z direction
2038                            offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF2);
2039                            const int firstDOF=(i0+1)/2*(nDOF0-1)
2040                                               +(i1+1)/2*nDOF0*(nDOF1-1);
2041                            const int firstNode=front*m_N0*m_N1
2042                                                +(i0+1)/2*(m_N0-1)
2043                                                +(i1+1)/2*m_N0*(m_N1-1);
2044                            for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++, numShared++) {
2045                                sendShared.push_back(firstDOF+i*nDOF0*nDOF1);
2046                                recvShared.push_back(numDOF+numShared);
2047                                if (i>0)
2048                                    colIndices[firstDOF+(i-1)*nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);
2049                                colIndices[firstDOF+i*nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);
2050                                if (i<nDOF2-1)
2051                                    colIndices[firstDOF+(i+1)*nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);
2052                                m_dofMap[firstNode+i*m_N0*m_N1]=numDOF+numShared;
2053                            }
2054                        } else {
2055                            // sharing a node
2056                            const int dof=(i0+1)/2*(nDOF0-1)
2057                                          +(i1+1)/2*nDOF0*(nDOF1-1)
2058                                          +(i2+1)/2*nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);
2059                            const int node=(i0+1)/2*(m_N0-1)
2060                                           +(i1+1)/2*m_N0*(m_N1-1)
2061                                           +(i2+1)/2*m_N0*m_N1*(m_N2-1);
2062                            offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+1);
2063                            sendShared.push_back(dof);
2064                            recvShared.push_back(numDOF+numShared);
2065                            colIndices[dof].push_back(numShared);
2066                            m_dofMap[node]=numDOF+numShared;
2067                            ++numShared;
2068                        }
2069                    }
2070                }
2071            }
2072        }
2073    
2074        // create connector
2075        Paso_SharedComponents *snd_shcomp = Paso_SharedComponents_alloc(
2076                numDOF, neighbour.size(), &neighbour[0], &sendShared[0],
2077                &offsetInShared[0], 1, 0, m_mpiInfo);
2078        Paso_SharedComponents *rcv_shcomp = Paso_SharedComponents_alloc(
2079                numDOF, neighbour.size(), &neighbour[0], &recvShared[0],
2080                &offsetInShared[0], 1, 0, m_mpiInfo);
2081        m_connector = Paso_Connector_alloc(snd_shcomp, rcv_shcomp);
2082        Paso_SharedComponents_free(snd_shcomp);
2083        Paso_SharedComponents_free(rcv_shcomp);
2084    
2085        // create main and couple blocks
2086        Paso_Pattern *mainPattern = createMainPattern();
2087        Paso_Pattern *colPattern, *rowPattern;
2088        createCouplePatterns(colIndices, numShared, &colPattern, &rowPattern);
2089    
2090        // allocate paso distribution
2091        Paso_Distribution* distribution = Paso_Distribution_alloc(m_mpiInfo,
2092                const_cast<index_t*>(&m_nodeDistribution[0]), 1, 0);
2093    
2094        // finally create the system matrix
2095        m_pattern = Paso_SystemMatrixPattern_alloc(MATRIX_FORMAT_DEFAULT,
2096                distribution, distribution, mainPattern, colPattern, rowPattern,
2097                m_connector, m_connector);
2098    
2099        Paso_Distribution_free(distribution);
2100    
2101        // useful debug output
2102        /*
2103        cout << "--- rcv_shcomp ---" << endl;
2104        cout << "numDOF=" << numDOF << ", numNeighbors=" << neighbour.size() << endl;
2105        for (size_t i=0; i<neighbour.size(); i++) {
2106            cout << "neighbor[" << i << "]=" << neighbour[i]
2107                << " offsetInShared[" << i+1 << "]=" << offsetInShared[i+1] << endl;
2108        }
2109        for (size_t i=0; i<recvShared.size(); i++) {
2110            cout << "shared[" << i << "]=" << recvShared[i] << endl;
2111        }
2112        cout << "--- snd_shcomp ---" << endl;
2113        for (size_t i=0; i<sendShared.size(); i++) {
2114            cout << "shared[" << i << "]=" << sendShared[i] << endl;
2115        }
2116        cout << "--- dofMap ---" << endl;
2117        for (size_t i=0; i<m_dofMap.size(); i++) {
2118            cout << "m_dofMap[" << i << "]=" << m_dofMap[i] << endl;
2119        }
2120        cout << "--- colIndices ---" << endl;
2121        for (size_t i=0; i<colIndices.size(); i++) {
2122            cout << "colIndices[" << i << "].size()=" << colIndices[i].size() << endl;
2123        }
2124        */
2125    
2126        /*
2127        cout << "--- main_pattern ---" << endl;
2128        cout << "M=" << mainPattern->numOutput << ", N=" << mainPattern->numInput << endl;
2129        for (size_t i=0; i<mainPattern->numOutput+1; i++) {
2130            cout << "ptr[" << i << "]=" << mainPattern->ptr[i] << endl;
2131        }
2132        for (size_t i=0; i<mainPattern->ptr[mainPattern->numOutput]; i++) {
2133            cout << "index[" << i << "]=" << mainPattern->index[i] << endl;
2134        }
2135        */
2136    
2137        /*
2138        cout << "--- colCouple_pattern ---" << endl;
2139        cout << "M=" << colPattern->numOutput << ", N=" << colPattern->numInput << endl;
2140        for (size_t i=0; i<colPattern->numOutput+1; i++) {
2141            cout << "ptr[" << i << "]=" << colPattern->ptr[i] << endl;
2142        }
2143        for (size_t i=0; i<colPattern->ptr[colPattern->numOutput]; i++) {
2144            cout << "index[" << i << "]=" << colPattern->index[i] << endl;
2145        }
2146        */
2147    
2148        /*
2149        cout << "--- rowCouple_pattern ---" << endl;
2150        cout << "M=" << rowPattern->numOutput << ", N=" << rowPattern->numInput << endl;
2151        for (size_t i=0; i<rowPattern->numOutput+1; i++) {
2152            cout << "ptr[" << i << "]=" << rowPattern->ptr[i] << endl;
2153        }
2154        for (size_t i=0; i<rowPattern->ptr[rowPattern->numOutput]; i++) {
2155            cout << "index[" << i << "]=" << rowPattern->index[i] << endl;
2156        }
2157        */
2158    
2159        Paso_Pattern_free(mainPattern);
2160        Paso_Pattern_free(colPattern);
2161        Paso_Pattern_free(rowPattern);
2162    }
2163    
2164    //private
2165    void Brick::addToMatrixAndRHS(Paso_SystemMatrix* S, escript::Data& F,
2166             const vector<double>& EM_S, const vector<double>& EM_F, bool addS,
2167             bool addF, index_t firstNode, dim_t nEq, dim_t nComp) const
2168    {
2169        IndexVector rowIndex;
2170        rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode]);
2171        rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+1]);
2172        rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_N0]);
2173        rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_N0+1]);
2174        rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_N0*m_N1]);
2175        rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_N0*m_N1+1]);
2176        rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_N0*(m_N1+1)]);
2177        rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_N0*(m_N1+1)+1]);
2178        if (addF) {
2179            double *F_p=F.getSampleDataRW(0);
2180            for (index_t i=0; i<rowIndex.size(); i++) {
2181                if (rowIndex[i]<getNumDOF()) {
2182                    for (index_t eq=0; eq<nEq; eq++) {
2183                        F_p[INDEX2(eq, rowIndex[i], nEq)]+=EM_F[INDEX2(eq,i,nEq)];
2184                    }
2185                }
2186            }
2187        }
2188        if (addS) {
2189            addToSystemMatrix(S, rowIndex, nEq, rowIndex, nComp, EM_S);
2190        }
2191    }
2192    
2193  //protected  //protected
2194  void Brick::interpolateNodesOnElements(escript::Data& out, escript::Data& in,  void Brick::interpolateNodesOnElements(escript::Data& out, escript::Data& in,
2195                                         bool reduced) const                                         bool reduced) const
2196  {  {
2197      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();
2198      if (reduced) {      if (reduced) {
2199          /*** GENERATOR SNIP_INTERPOLATE_REDUCED_ELEMENTS TOP */          out.requireWrite();
2200          const double c0 = .125;          const double c0 = .125;
2201  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel
2202          for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {          {
2203              for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {              vector<double> f_000(numComp);
2204                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {              vector<double> f_001(numComp);
2205                      const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_N0,m_N1));              vector<double> f_010(numComp);
2206                      const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_N0,m_N1));              vector<double> f_011(numComp);
2207                      const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_N0,m_N1));              vector<double> f_100(numComp);
2208                      const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));              vector<double> f_101(numComp);
2209                      const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_N0,m_N1));              vector<double> f_110(numComp);
2210                      const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_N0,m_N1));              vector<double> f_111(numComp);
2211                      const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_N0,m_N1));  #pragma omp for
2212                      const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));              for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {
2213                      double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE0,m_NE1));                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {
2214                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {
2215                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_000[i] + f_001[i] + f_010[i] + f_011[i] + f_100[i] + f_101[i] + f_110[i] + f_111[i]);                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2216                      } /* end of component loop i */                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2217                  } /* end of k0 loop */                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2218              } /* end of k1 loop */                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2219          } /* end of k2 loop */                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2220          /* GENERATOR SNIP_INTERPOLATE_REDUCED_ELEMENTS BOTTOM */                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2221                            memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2222                            memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2223                            double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE0,m_NE1));
2224                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2225                                o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_000[i] + f_001[i] + f_010[i] + f_011[i] + f_100[i] + f_101[i] + f_110[i] + f_111[i]);
2226                            } // end of component loop i
2227                        } // end of k0 loop
2228                    } // end of k1 loop
2229                } // end of k2 loop
2230            } // end of parallel section
2231      } else {      } else {
2232          /*** GENERATOR SNIP_INTERPOLATE_ELEMENTS TOP */          out.requireWrite();
2233          const double c0 = .0094373878376559314545;          const double c0 = .0094373878376559314545;
2234          const double c1 = .035220810900864519624;          const double c1 = .035220810900864519624;
2235          const double c2 = .13144585576580214704;          const double c2 = .13144585576580214704;
2236          const double c3 = .49056261216234406855;          const double c3 = .49056261216234406855;
2237  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel
2238          for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {          {
2239              for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {              vector<double> f_000(numComp);
2240                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {              vector<double> f_001(numComp);
2241                      const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_N0,m_N1));              vector<double> f_010(numComp);
2242                      const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_N0,m_N1));              vector<double> f_011(numComp);
2243                      const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_N0,m_N1));              vector<double> f_100(numComp);
2244                      const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));              vector<double> f_101(numComp);
2245                      const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_N0,m_N1));              vector<double> f_110(numComp);
2246                      const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_N0,m_N1));              vector<double> f_111(numComp);
2247                      const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_N0,m_N1));  #pragma omp for
2248                      const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));              for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {
2249                      double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE0,m_NE1));                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {
2250                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {
2251                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c3 + f_111[i]*c0 + c2*(f_001[i] + f_010[i] + f_100[i]) + c1*(f_011[i] + f_101[i] + f_110[i]);                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2252                          o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_011[i]*c0 + f_100[i]*c3 + c2*(f_000[i] + f_101[i] + f_110[i]) + c1*(f_001[i] + f_010[i] + f_111[i]);                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2253                          o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_010[i]*c3 + f_101[i]*c0 + c2*(f_000[i] + f_011[i] + f_110[i]) + c1*(f_001[i] + f_100[i] + f_111[i]);                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2254                          o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_001[i]*c0 + f_110[i]*c3 + c2*(f_010[i] + f_100[i] + f_111[i]) + c1*(f_000[i] + f_011[i] + f_101[i]);                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2255                          o[INDEX2(i,numComp,4)] = f_001[i]*c3 + f_110[i]*c0 + c2*(f_000[i] + f_011[i] + f_101[i]) + c1*(f_010[i] + f_100[i] + f_111[i]);                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2256                          o[INDEX2(i,numComp,5)] = f_010[i]*c0 + f_101[i]*c3 + c2*(f_001[i] + f_100[i] + f_111[i]) + c1*(f_000[i] + f_011[i] + f_110[i]);                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2257                          o[INDEX2(i,numComp,6)] = f_011[i]*c3 + f_100[i]*c0 + c2*(f_001[i] + f_010[i] + f_111[i]) + c1*(f_000[i] + f_101[i] + f_110[i]);                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2258                          o[INDEX2(i,numComp,7)] = f_000[i]*c0 + f_111[i]*c3 + c2*(f_011[i] + f_101[i] + f_110[i]) + c1*(f_001[i] + f_010[i] + f_100[i]);                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2259                      } /* end of component loop i */                          double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE0,m_NE1));
2260                  } /* end of k0 loop */                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2261              } /* end of k1 loop */                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c3 + f_111[i]*c0 + c2*(f_001[i] + f_010[i] + f_100[i]) + c1*(f_011[i] + f_101[i] + f_110[i]);
2262          } /* end of k2 loop */                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_011[i]*c0 + f_100[i]*c3 + c2*(f_000[i] + f_101[i] + f_110[i]) + c1*(f_001[i] + f_010[i] + f_111[i]);
2263          /* GENERATOR SNIP_INTERPOLATE_ELEMENTS BOTTOM */                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_010[i]*c3 + f_101[i]*c0 + c2*(f_000[i] + f_011[i] + f_110[i]) + c1*(f_001[i] + f_100[i] + f_111[i]);
2264                                o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_001[i]*c0 + f_110[i]*c3 + c2*(f_010[i] + f_100[i] + f_111[i]) + c1*(f_000[i] + f_011[i] + f_101[i]);
2265                                o[INDEX2(i,numComp,4)] = f_001[i]*c3 + f_110[i]*c0 + c2*(f_000[i] + f_011[i] + f_101[i]) + c1*(f_010[i] + f_100[i] + f_111[i]);
2266                                o[INDEX2(i,numComp,5)] = f_010[i]*c0 + f_101[i]*c3 + c2*(f_001[i] + f_100[i] + f_111[i]) + c1*(f_000[i] + f_011[i] + f_110[i]);
2267                                o[INDEX2(i,numComp,6)] = f_011[i]*c3 + f_100[i]*c0 + c2*(f_001[i] + f_010[i] + f_111[i]) + c1*(f_000[i] + f_101[i] + f_110[i]);
2268                                o[INDEX2(i,numComp,7)] = f_000[i]*c0 + f_111[i]*c3 + c2*(f_011[i] + f_101[i] + f_110[i]) + c1*(f_001[i] + f_010[i] + f_100[i]);
2269                            } // end of component loop i
2270                        } // end of k0 loop
2271                    } // end of k1 loop
2272                } // end of k2 loop
2273            } // end of parallel section
2274      }      }
2275  }  }
2276    
# Line 1450  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr Line 2280  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr
2280  {  {
2281      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();
2282      if (reduced) {      if (reduced) {
2283            out.requireWrite();
2284          const double c0 = .25;          const double c0 = .25;
2285  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
2286          {          {
2287              /*** GENERATOR SNIP_INTERPOLATE_REDUCED_FACES TOP */              vector<double> f_000(numComp);
2288                vector<double> f_001(numComp);
2289                vector<double> f_010(numComp);
2290                vector<double> f_011(numComp);
2291                vector<double> f_100(numComp);
2292                vector<double> f_101(numComp);
2293                vector<double> f_110(numComp);
2294                vector<double> f_111(numComp);
2295              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
2296  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2297                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {
2298                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {
2299                          const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2300                          const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2301                          const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2302                          const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2303                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));
2304                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2305                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_000[i] + f_001[i] + f_010[i] + f_011[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_000[i] + f_001[i] + f_010[i] + f_011[i]);
2306                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2307                      } /* end of k1 loop */                      } // end of k1 loop
2308                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
2309              } /* end of face 0 */              } // end of face 0
2310              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
2311  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2312                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {
2313                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {
2314                          const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2315                          const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2316                          const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2317                          const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2318                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));
2319                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2320                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_100[i] + f_101[i] + f_110[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_100[i] + f_101[i] + f_110[i] + f_111[i]);
2321                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2322                      } /* end of k1 loop */                      } // end of k1 loop
2323                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
2324              } /* end of face 1 */              } // end of face 1
2325              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
2326  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2327                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {
2328                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {
2329                          const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2330                          const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2331                          const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2332                          const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2333                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));
2334                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2335                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_000[i] + f_001[i] + f_100[i] + f_101[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_000[i] + f_001[i] + f_100[i] + f_101[i]);
2336                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2337                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
2338                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
2339              } /* end of face 2 */              } // end of face 2
2340              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
2341  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2342                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {
2343                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {
2344                          const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2345                          const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2346                          const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2347                          const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2348                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));
2349                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2350                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_010[i] + f_011[i] + f_110[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_010[i] + f_011[i] + f_110[i] + f_111[i]);
2351                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2352                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
2353                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
2354              } /* end of face 3 */              } // end of face 3
2355              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
2356  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2357                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {
2358                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {
2359                          const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2360                          const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2361                          const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2362                          const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2363                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));
2364                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2365                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_000[i] + f_010[i] + f_100[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_000[i] + f_010[i] + f_100[i] + f_110[i]);
2366                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2367                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
2368                  } /* end of k1 loop */                  } // end of k1 loop
2369              } /* end of face 4 */              } // end of face 4
2370              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
2371  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2372                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {
2373                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {
2374                          const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2375                          const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2376                          const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2377                          const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2378                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));
2379                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2380                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_001[i] + f_011[i] + f_101[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_001[i] + f_011[i] + f_101[i] + f_111[i]);
2381                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2382                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
2383                  } /* end of k1 loop */                  } // end of k1 loop
2384              } /* end of face 5 */              } // end of face 5
             /* GENERATOR SNIP_INTERPOLATE_REDUCED_FACES BOTTOM */  
2385          } // end of parallel section          } // end of parallel section
2386      } else {      } else {
2387            out.requireWrite();
2388          const double c0 = 0.044658198738520451079;          const double c0 = 0.044658198738520451079;
2389          const double c1 = 0.16666666666666666667;          const double c1 = 0.16666666666666666667;
2390          const double c2 = 0.62200846792814621559;          const double c2 = 0.62200846792814621559;
2391  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
2392          {          {
2393              /*** GENERATOR SNIP_INTERPOLATE_FACES TOP */              vector<double> f_000(numComp);
2394                vector<double> f_001(numComp);
2395                vector<double> f_010(numComp);
2396                vector<double> f_011(numComp);
2397                vector<double> f_100(numComp);
2398                vector<double> f_101(numComp);
2399                vector<double> f_110(numComp);
2400                vector<double> f_111(numComp);
2401              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
2402  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2403                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {
2404                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {
2405                          const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2406                          const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2407                          const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2408                          const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2409                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));
2410                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2411                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c2 + f_011[i]*c0 + c1*(f_001[i] + f_010[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c2 + f_011[i]*c0 + c1*(f_001[i] + f_010[i]);
2412                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_001[i]*c0 + f_010[i]*c2 + c1*(f_000[i] + f_011[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_001[i]*c0 + f_010[i]*c2 + c1*(f_000[i] + f_011[i]);
2413                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_001[i]*c2 + f_010[i]*c0 + c1*(f_000[i] + f_011[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_001[i]*c2 + f_010[i]*c0 + c1*(f_000[i] + f_011[i]);
2414                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_000[i]*c0 + f_011[i]*c2 + c1*(f_001[i] + f_010[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_000[i]*c0 + f_011[i]*c2 + c1*(f_001[i] + f_010[i]);
2415                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2416                      } /* end of k1 loop */                      } // end of k1 loop
2417                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
2418              } /* end of face 0 */              } // end of face 0
2419              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
2420  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2421                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {
2422                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {
2423                          const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2424                          const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2425                          const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2426                          const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2427                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));
2428                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2429                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_100[i]*c2 + f_111[i]*c0 + c1*(f_101[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_100[i]*c2 + f_111[i]*c0 + c1*(f_101[i] + f_110[i]);
2430                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_101[i]*c0 + f_110[i]*c2 + c1*(f_100[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_101[i]*c0 + f_110[i]*c2 + c1*(f_100[i] + f_111[i]);
2431                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_101[i]*c2 + f_110[i]*c0 + c1*(f_100[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_101[i]*c2 + f_110[i]*c0 + c1*(f_100[i] + f_111[i]);
2432                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_100[i]*c0 + f_111[i]*c2 + c1*(f_101[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_100[i]*c0 + f_111[i]*c2 + c1*(f_101[i] + f_110[i]);
2433                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2434                      } /* end of k1 loop */                      } // end of k1 loop
2435                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
2436              } /* end of face 1 */              } // end of face 1
2437              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
2438  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2439                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {
2440                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {
2441                          const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2442                          const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2443                          const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2444                          const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2445                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));
2446                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2447                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c2 + f_101[i]*c0 + c1*(f_001[i] + f_100[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c2 + f_101[i]*c0 + c1*(f_001[i] + f_100[i]);
2448                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_001[i]*c0 + f_100[i]*c2 + c1*(f_000[i] + f_101[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_001[i]*c0 + f_100[i]*c2 + c1*(f_000[i] + f_101[i]);
2449                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_001[i]*c2 + f_100[i]*c0 + c1*(f_000[i] + f_101[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_001[i]*c2 + f_100[i]*c0 + c1*(f_000[i] + f_101[i]);
2450                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_000[i]*c0 + f_101[i]*c2 + c1*(f_001[i] + f_100[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_000[i]*c0 + f_101[i]*c2 + c1*(f_001[i] + f_100[i]);
2451                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2452                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
2453                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
2454              } /* end of face 2 */              } // end of face 2
2455              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
2456  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2457                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {
2458                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {
2459                          const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2460                          const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2461                          const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2462                          const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2463                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));
2464                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2465                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_010[i]*c2 + f_111[i]*c0 + c1*(f_011[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_010[i]*c2 + f_111[i]*c0 + c1*(f_011[i] + f_110[i]);
2466                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_011[i]*c0 + f_110[i]*c2 + c1*(f_010[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_011[i]*c0 + f_110[i]*c2 + c1*(f_010[i] + f_111[i]);
2467                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_011[i]*c2 + f_110[i]*c0 + c1*(f_010[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_011[i]*c2 + f_110[i]*c0 + c1*(f_010[i] + f_111[i]);
2468                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_010[i]*c0 + f_111[i]*c2 + c1*(f_011[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_010[i]*c0 + f_111[i]*c2 + c1*(f_011[i] + f_110[i]);
2469                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2470                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
2471                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
2472              } /* end of face 3 */              } // end of face 3
2473              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
2474  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2475                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {
2476                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {
2477                          const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2478                          const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2479                          const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2480                          const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2481                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));
2482                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2483                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c2 + f_110[i]*c0 + c1*(f_010[i] + f_100[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c2 + f_110[i]*c0 + c1*(f_010[i] + f_100[i]);
2484                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_010[i]*c0 + f_100[i]*c2 + c1*(f_000[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_010[i]*c0 + f_100[i]*c2 + c1*(f_000[i] + f_110[i]);
2485                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_010[i]*c2 + f_100[i]*c0 + c1*(f_000[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_010[i]*c2 + f_100[i]*c0 + c1*(f_000[i] + f_110[i]);
2486                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_000[i]*c0 + f_110[i]*c2 + c1*(f_010[i] + f_100[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_000[i]*c0 + f_110[i]*c2 + c1*(f_010[i] + f_100[i]);
2487                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2488                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
2489                  } /* end of k1 loop */                  } // end of k1 loop
2490              } /* end of face 4 */              } // end of face 4
2491              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
2492  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2493                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {
2494                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {
2495                          const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2496                          const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2497                          const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2498                          const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));
2499                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));
2500                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2501                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_001[i]*c2 + f_111[i]*c0 + c1*(f_011[i] + f_101[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_001[i]*c2 + f_111[i]*c0 + c1*(f_011[i] + f_101[i]);
2502                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_011[i]*c0 + f_101[i]*c2 + c1*(f_001[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_011[i]*c0 + f_101[i]*c2 + c1*(f_001[i] + f_111[i]);
2503                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_011[i]*c2 + f_101[i]*c0 + c1*(f_001[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_011[i]*c2 + f_101[i]*c0 + c1*(f_001[i] + f_111[i]);
2504                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_001[i]*c0 + f_111[i]*c2 + c1*(f_011[i] + f_101[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_001[i]*c0 + f_111[i]*c2 + c1*(f_011[i] + f_101[i]);
2505                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2506                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
2507                  } /* end of k1 loop */                  } // end of k1 loop
2508              } /* end of face 5 */              } // end of face 5
             /* GENERATOR SNIP_INTERPOLATE_FACES BOTTOM */  
2509          } // end of parallel section          } // end of parallel section
2510      }      }
2511  }  }
2512    
2513  //protected  //protected
2514  void Brick::nodesToDOF(escript::Data& out, escript::Data& in) const  void Brick::assemblePDESingle(Paso_SystemMatrix* mat, escript::Data& rhs,
2515            const escript::Data& A, const escript::Data& B,
2516            const escript::Data& C, const escript::Data& D,
2517            const escript::Data& X, const escript::Data& Y) const
2518  {  {
2519      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();      const double h0 = m_l0/m_gNE0;
2520      out.requireWrite();      const double h1 = m_l1/m_gNE1;
2521        const double h2 = m_l2/m_gNE2;
2522        const double w0 = 0.0009303791403858427308*h1*h2/h0;
2523        const double w1 = 0.0009303791403858427308*h2;
2524        const double w2 = -0.00024929433932114870101*h1;
2525        const double w3 = 0.0009303791403858427308*h0*h2/h1;
2526        const double w4 = -0.00024929433932114870101*h0;
2527        const double w5 = 0.0009303791403858427308*h1;
2528        const double w6 = 0.0009303791403858427308*h0;
2529        const double w7 = -0.00024929433932114870101*h0*h1/h2;
2530        const double w8 = 0.0034722222222222222222*h2;
2531        const double w9 = -0.0009303791403858427308*h1;
2532        const double w10 = 0.012958509748503046158*h0*h2/h1;
2533        const double w11 = -0.0034722222222222222222*h0;
2534        const double w12 = 0.0034722222222222222222*h1;
2535        const double w13 = 0.012958509748503046158*h0;
2536        const double w14 = -0.0034722222222222222222*h0*h1/h2;
2537        const double w15 = 0.012958509748503046158*h1*h2/h0;
2538        const double w16 = -0.0034722222222222222222*h1;
2539        const double w17 = -0.0009303791403858427308*h0;
2540        const double w18 = 0.012958509748503046158*h1;
2541        const double w19 = 0.0034722222222222222222*h0;
2542        const double w20 = 0.012958509748503046158*h2;
2543        const double w21 = -0.012958509748503046158*h1;
2544        const double w22 = -0.012958509748503046158*h0;
2545        const double w23 = 0.04836181677178996241*h1;
2546        const double w24 = 0.04836181677178996241*h0;
2547        const double w25 = -0.04836181677178996241*h0*h1/h2;
2548        const double w26 = 0.00024929433932114870101*h1;
2549        const double w27 = 0.00024929433932114870101*h0;
2550        const double w28 = -0.04836181677178996241*h1;
2551        const double w29 = -0.04836181677178996241*h0;
2552        const double w30 = -0.0009303791403858427308*h1*h2/h0;
2553        const double w31 = -0.0009303791403858427308*h2;
2554        const double w32 = -0.0009303791403858427308*h0*h2/h1;
2555        const double w33 = 0.0034722222222222222222*h0*h1/h2;
2556        const double w34 = -0.0034722222222222222222*h2;
2557        const double w35 = -0.00024929433932114870101*h2;
2558        const double w36 = -0.012958509748503046158*h1*h2/h0;
2559        const double w37 = -0.012958509748503046158*h2;
2560        const double w38 = -0.012958509748503046158*h0*h2/h1;
2561        const double w39 = -0.04836181677178996241*h2;
2562        const double w40 = -0.0034722222222222222222*h0*h2/h1;
2563        const double w41 = 0.0009303791403858427308*h0*h1/h2;
2564        const double w42 = 0.04836181677178996241*h2;
2565        const double w43 = -0.04836181677178996241*h0*h2/h1;
2566        const double w44 = 0.012958509748503046158*h0*h1/h2;
2567        const double w45 = -0.00024929433932114870101*h0*h2/h1;
2568        const double w46 = 0.00024929433932114870101*h2;
2569        const double w47 = -0.0034722222222222222222*h1*h2/h0;
2570        const double w48 = -0.00024929433932114870101*h1*h2/h0;
2571        const double w49 = -0.04836181677178996241*h1*h2/h0;
2572        const double w50 = 0.0034722222222222222222*h0*h2/h1;
2573        const double w51 = -0.0009303791403858427308*h0*h1/h2;
2574        const double w52 = -0.012958509748503046158*h0*h1/h2;
2575        const double w53 = 0.0034722222222222222222*h1*h2/h0;
2576        const double w54 = 0.00024929433932114870101*h0*h1/h2;
2577        const double w55 = 0.04836181677178996241*h0*h2/h1;
2578        const double w56 = 0.04836181677178996241*h1*h2/h0;
2579        const double w57 = 0.04836181677178996241*h0*h1/h2;
2580        const double w58 = 0.00024929433932114870101*h1*h2/h0;
2581        const double w59 = 0.00024929433932114870101*h0*h2/h1;
2582        const double w60 = 0.055555555555555555556*h1*h2/h0;
2583        const double w61 = 0.041666666666666666667*h2;
2584        const double w62 = -0.083333333333333333333*h1;
2585        const double w63 = 0.055555555555555555556*h0*h2/h1;
2586        const double w64 = -0.083333333333333333333*h0;
2587        const double w65 = 0.083333333333333333333*h1;
2588        const double w66 = 0.083333333333333333333*h0;
2589        const double w67 = -0.11111111111111111111*h0*h1/h2;
2590        const double w68 = -0.055555555555555555556*h1*h2/h0;
2591        const double w69 = -0.083333333333333333333*h2;
2592        const double w70 = -0.041666666666666666667*h1;
2593        const double w71 = -0.055555555555555555556*h0*h2/h1;
2594        const double w72 = -0.041666666666666666667*h0;
2595        const double w73 = 0.041666666666666666667*h1;
2596        const double w74 = 0.041666666666666666667*h0;
2597        const double w75 = 0.027777777777777777778*h0*h1/h2;
2598        const double w76 = 0.083333333333333333333*h2;
2599        const double w77 = -0.11111111111111111111*h0*h2/h1;
2600        const double w78 = 0.055555555555555555556*h0*h1/h2;
2601        const double w79 = -0.11111111111111111111*h1*h2/h0;
2602        const double w80 = -0.027777777777777777778*h1*h2/h0;
2603        const double w81 = -0.041666666666666666667*h2;
2604        const double w82 = -0.027777777777777777778*h0*h2/h1;
2605        const double w83 = -0.027777777777777777778*h0*h1/h2;
2606        const double w84 = 0.027777777777777777778*h0*h2/h1;
2607        const double w85 = -0.055555555555555555556*h0*h1/h2;
2608        const double w86 = 0.11111111111111111111*h1*h2/h0;
2609        const double w87 = 0.11111111111111111111*h0*h2/h1;
2610        const double w88 = 0.11111111111111111111*h0*h1/h2;
2611        const double w89 = 0.027777777777777777778*h1*h2/h0;
2612        const double w90 = 0.0001966122466178319053*h1*h2;
2613        const double w91 = 0.0001966122466178319053*h0*h2;
2614        const double w92 = 0.0001966122466178319053*h0*h1;
2615        const double w93 = 0.0007337668937680108255*h1*h2;
2616        const double w94 = 0.0027384553284542113967*h0*h2;
2617        const double w95 = 0.0027384553284542113967*h0*h1;
2618        const double w96 = 0.0027384553284542113967*h1*h2;
2619        const double w97 = 0.0007337668937680108255*h0*h2;
2620        const double w98 = 0.010220054420048834761*h1*h2;
2621        const double w99 = 0.010220054420048834761*h0*h2;
2622        const double w100 = 0.038141762351741127649*h0*h1;
2623        const double w101 = 0.000052682092703316795705*h0*h1;
2624        const double w102 = 0.0007337668937680108255*h0*h1;
2625        const double w103 = 0.010220054420048834761*h0*h1;
2626        const double w104 = -0.0001966122466178319053*h1*h2;
2627        const double w105 = -0.0001966122466178319053*h0*h2;
2628        const double w106 = -0.0007337668937680108255*h1*h2;
2629        const double w107 = -0.0007337668937680108255*h0*h2;
2630        const double w108 = -0.0027384553284542113967*h1*h2;
2631        const double w109 = -0.0027384553284542113967*h0*h2;
2632        const double w110 = -0.010220054420048834761*h1*h2;
2633        const double w111 = -0.010220054420048834761*h0*h2;
2634        const double w112 = -0.0007337668937680108255*h0*h1;
2635        const double w113 = -0.010220054420048834761*h0*h1;
2636        const double w114 = -0.038141762351741127649*h0*h2;
2637        const double w115 = -0.000052682092703316795705*h0*h2;
2638        const double w116 = -0.0001966122466178319053*h0*h1;
2639        const double w117 = -0.0027384553284542113967*h0*h1;
2640        const double w118 = 0.000052682092703316795705*h0*h2;
2641        const double w119 = 0.038141762351741127649*h0*h2;
2642        const double w120 = 0.000052682092703316795705*h1*h2;
2643        const double w121 = 0.038141762351741127649*h1*h2;
2644        const double w122 = -0.000052682092703316795705*h0*h1;
2645        const double w123 = -0.038141762351741127649*h0*h1;
2646        const double w124 = -0.000052682092703316795705*h1*h2;
2647        const double w125 = -0.038141762351741127649*h1*h2;
2648        const double w126 = 0.027777777777777777778*h1*h2;
2649        const double w127 = 0.027777777777777777778*h0*h2;
2650        const double w128 = 0.055555555555555555556*h0*h1;
2651        const double w129 = -0.027777777777777777778*h1*h2;
2652        const double w130 = -0.027777777777777777778*h0*h2;
2653        const double w131 = 0.013888888888888888889*h0*h1;
2654        const double w132 = -0.055555555555555555556*h0*h2;
2655        const double w133 = -0.027777777777777777778*h0*h1;
2656        const double w134 = 0.055555555555555555556*h0*h2;
2657        const double w135 = 0.027777777777777777778*h0*h1;
2658        const double w136 = -0.013888888888888888889*h0*h1;
2659        const double w137 = 0.055555555555555555556*h1*h2;
2660        const double w138 = -0.013888888888888888889*h1*h2;
2661        const double w139 = -0.013888888888888888889*h0*h2;
2662        const double w140 = -0.055555555555555555556*h0*h1;
2663        const double w141 = 0.013888888888888888889*h1*h2;
2664        const double w142 = 0.013888888888888888889*h0*h2;
2665        const double w143 = -0.055555555555555555556*h1*h2;
2666        const double w144 = 0.000041549056553524783501*h0*h1*h2;
2667        const double w145 = 0.0005787037037037037037*h0*h1*h2;
2668        const double w146 = 0.0080603027952983270684*h0*h1*h2;
2669        const double w147 = 0.0001550631900643071218*h0*h1*h2;
2670        const double w148 = 0.002159751624750507693*h0*h1*h2;
2671        const double w149 = 0.03008145955644280058*h0*h1*h2;
2672        const double w150 = 0.000011133036149792012204*h0*h1*h2;
2673        const double w151 = 0.018518518518518518519*h0*h1*h2;
2674        const double w152 = 0.0092592592592592592592*h0*h1*h2;
2675        const double w153 = 0.0046296296296296296296*h0*h1*h2;
2676        const double w154 = 0.037037037037037037037*h0*h1*h2;
2677        const double w155 = -0.077751058491018276949*h1*h2;
2678        const double w156 = -0.077751058491018276949*h0*h2;
2679        const double w157 = -0.077751058491018276949*h0*h1;
2680        const double w158 = -0.020833333333333333333*h0*h2;
2681        const double w159 = -0.020833333333333333333*h0*h1;
2682        const double w160 = -0.020833333333333333333*h1*h2;
2683        const double w161 = -0.0055822748423150563848*h0*h1;
2684        const double w162 = -0.0055822748423150563848*h0*h2;
2685        const double w163 = -0.0055822748423150563848*h1*h2;
2686        const double w164 = 0.077751058491018276949*h1*h2;
2687        const double w165 = 0.020833333333333333333*h1*h2;
2688        const double w166 = 0.0055822748423150563848*h1*h2;
2689        const double w167 = 0.077751058491018276949*h0*h2;
2690        const double w168 = 0.020833333333333333333*h0*h2;
2691        const double w169 = 0.0055822748423150563848*h0*h2;
2692        const double w170 = 0.077751058491018276949*h0*h1;
2693        const double w171 = 0.020833333333333333333*h0*h1;
2694        const double w172 = 0.0055822748423150563848*h0*h1;
2695        const double w173 = -0.25*h1*h2;
2696        const double w174 = -0.25*h0*h2;
2697        const double w175 = -0.25*h0*h1;
2698        const double w176 = 0.25*h1*h2;
2699        const double w177 = 0.25*h0*h2;
2700        const double w178 = 0.25*h0*h1;
2701        const double w179 = 0.061320326520293008568*h0*h1*h2;
2702        const double w180 = 0.01643073197072526838*h0*h1*h2;
2703        const double w181 = 0.004402601362608064953*h0*h1*h2;
2704        const double w182 = 0.0011796734797069914318*h0*h1*h2;
2705        const double w183 = 0.125*h0*h1*h2;
2706    
2707      const index_t left = (m_offset0==0 ? 0 : 1);      rhs.requireWrite();
2708      const index_t bottom = (m_offset1==0 ? 0 : 1);  #pragma omp parallel
2709      const index_t front = (m_offset2==0 ? 0 : 1);      {
2710      const index_t right = (m_mpiInfo->rank%m_NX==m_NX-1 ? m_N0 : m_N0-1);          for (index_t k2_0=0; k2_0<2; k2_0++) { // colouring
2711      const index_t top = (m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX==m_NY-1 ? m_N1 : m_N1-1);  #pragma omp for
2712      const index_t back = (m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY)==m_NZ-1 ? m_N2 : m_N2-1);              for (index_t k2=k2_0; k2<m_NE2; k2+=2) {
2713      index_t n=0;                  for (index_t k1=0; k1<m_NE1; ++k1) {
2714      for (index_t i=front; i<back; i++) {                      for (index_t k0=0; k0<m_NE0; ++k0)  {
2715          for (index_t j=bottom; j<top; j++) {                          bool add_EM_S=false;
2716              for (index_t k=left; k<right; k++, n++) {                          bool add_EM_F=false;
2717                  const double* src=in.getSampleDataRO(k+j*m_N0+i*m_N0*m_N1);                          vector<double> EM_S(8*8, 0);
2718                  copy(src, src+numComp, out.getSampleDataRW(n));                          vector<double> EM_F(8, 0);
2719              }                          const index_t e = k0 + m_NE0*k1 + m_NE0*m_NE1*k2;
2720          }                          ///////////////
2721                            // process A //
2722                            ///////////////
2723                            if (!A.isEmpty()) {
2724                                add_EM_S=true;
2725                                const double* A_p=const_cast<escript::Data*>(&A)->getSampleDataRO(e);
2726                                if (A.actsExpanded()) {
2727                                    const double A_00_0 = A_p[INDEX3(0,0,0,3,3)];
2728                                    const double A_01_0 = A_p[INDEX3(0,1,0,3,3)];
2729                                    const double A_02_0 = A_p[INDEX3(0,2,0,3,3)];
2730                                    const double A_10_0 = A_p[INDEX3(1,0,0,3,3)];
2731                                    const double A_11_0 = A_p[INDEX3(1,1,0,3,3)];
2732                                    const double A_12_0 = A_p[INDEX3(1,2,0,3,3)];
2733                                    const double A_20_0 = A_p[INDEX3(2,0,0,3,3)];
2734                                    const double A_21_0 = A_p[INDEX3(2,1,0,3,3)];
2735                                    const double A_22_0 = A_p[INDEX3(2,2,0,3,3)];
2736                                    const double A_00_1 = A_p[INDEX3(0,0,1,3,3)];
2737                                    const double A_01_1 = A_p[INDEX3(0,1,1,3,3)];
2738                                    const double A_02_1 = A_p[INDEX3(0,2,1,3,3)];
2739                                    const double A_10_1 = A_p[INDEX3(1,0,1,3,3)];
2740                                    const double A_11_1 = A_p[INDEX3(1,1,1,3,3)];
2741                                    const double A_12_1 = A_p[INDEX3(1,2,1,3,3)];
2742                                    const double A_20_1 = A_p[INDEX3(2,0,1,3,3)];
2743                                    const double A_21_1 = A_p[INDEX3(2,1,1,3,3)];
2744                                    const double A_22_1 = A_p[INDEX3(2,2,1,3,3)];
2745                                    const double A_00_2 = A_p[INDEX3(0,0,2,3,3)];
2746                                    const double A_01_2 = A_p[INDEX3(0,1,2,3,3)];
2747                                    const double A_02_2 = A_p[INDEX3(0,2,2,3,3)];
2748                                    const double A_10_2 = A_p[INDEX3(1,0,2,3,3)];
2749                                    const double A_11_2 = A_p[INDEX3(1,1,2,3,3)];
2750                                    const double A_12_2 = A_p[INDEX3(1,2,2,3,3)];
2751                                    const double A_20_2 = A_p[INDEX3(2,0,2,3,3)];
2752                                    const double A_21_2 = A_p[INDEX3(2,1,2,3,3)];
2753                                    const double A_22_2 = A_p[INDEX3(2,2,2,3,3)];
2754                                    const double A_00_3 = A_p[INDEX3(0,0,3,3,3)];
2755                                    const double A_01_3 = A_p[INDEX3(0,1,3,3,3)];
2756                                    const double A_02_3 = A_p[INDEX3(0,2,3,3,3)];
2757                                    const double A_10_3 = A_p[INDEX3(1,0,3,3,3)];
2758                                    const double A_11_3 = A_p[INDEX3(1,1,3,3,3)];
2759                                    const double A_12_3 = A_p[INDEX3(1,2,3,3,3)];
2760                                    const double A_20_3 = A_p[INDEX3(2,0,3,3,3)];
2761                                    const double A_21_3 = A_p[INDEX3(2,1,3,3,3)];
2762                                    const double A_22_3 = A_p[INDEX3(2,2,3,3,3)];
2763                                    const double A_00_4 = A_p[INDEX3(0,0,4,3,3)];
2764                                    const double A_01_4 = A_p[INDEX3(0,1,4,3,3)];
2765                                    const double A_02_4 = A_p[INDEX3(0,2,4,3,3)];
2766                                    const double A_10_4 = A_p[INDEX3(1,0,4,3,3)];
2767                                    const double A_11_4 = A_p[INDEX3(1,1,4,3,3)];
2768                                    const double A_12_4 = A_p[INDEX3(1,2,4,3,3)];
2769                                    const double A_20_4 = A_p[INDEX3(2,0,4,3,3)];
2770                                    const double A_21_4 = A_p[INDEX3(2,1,4,3,3)];
2771                                    const double A_22_4 = A_p[INDEX3(2,2,4,3,3)];
2772                                    const double A_00_5 = A_p[INDEX3(0,0,5,3,3)];
2773                                    const double A_01_5 = A_p[INDEX3(0,1,5,3,3)];
2774                                    const double A_02_5 = A_p[INDEX3(0,2,5,3,3)];
2775                                    const double A_10_5 = A_p[INDEX3(1,0,5,3,3)];
2776                                    const double A_11_5 = A_p[INDEX3(1,1,5,3,3)];
2777                                    const double A_12_5 = A_p[INDEX3(1,2,5,3,3)];
2778                                    const double A_20_5 = A_p[INDEX3(2,0,5,3,3)];
2779                                    const double A_21_5 = A_p[INDEX3(2,1,5,3,3)];
2780                                    const double A_22_5 = A_p[INDEX3(2,2,5,3,3)];
2781                                    const double A_00_6 = A_p[INDEX3(0,0,6,3,3)];
2782                                    const double A_01_6 = A_p[INDEX3(0,1,6,3,3)];
2783                                    const double A_02_6 = A_p[INDEX3(0,2,6,3,3)];
2784                                    const double A_10_6 = A_p[INDEX3(1,0,6,3,3)];
2785                                    const double A_11_6 = A_p[INDEX3(1,1,6,3,3)];
2786                                    const double A_12_6 = A_p[INDEX3(1,2,6,3,3)];
2787                                    const double A_20_6 = A_p[INDEX3(2,0,6,3,3)];
2788                                    const double A_21_6 = A_p[INDEX3(2,1,6,3,3)];
2789                                    const double A_22_6 = A_p[INDEX3(2,2,6,3,3)];
2790                                    const double A_00_7 = A_p[INDEX3(0,0,7,3,3)];
2791                                    const double A_01_7 = A_p[INDEX3(0,1,7,3,3)];
2792                                    const double A_02_7 = A_p[INDEX3(0,2,7,3,3)];
2793                                    const double A_10_7 = A_p[INDEX3(1,0,7,3,3)];
2794                                    const double A_11_7 = A_p[INDEX3(1,1,7,3,3)];
2795                                    const double A_12_7 = A_p[INDEX3(1,2,7,3,3)];
2796                                    const double A_20_7 = A_p[INDEX3(2,0,7,3,3)];
2797                                    const double A_21_7 = A_p[INDEX3(2,1,7,3,3)];
2798                                    const double A_22_7 = A_p[INDEX3(2,2,7,3,3)];
2799                                    const double tmp160_0 = A_12_0 + A_12_6 + A_21_0 + A_21_6;
2800                                    const double tmp8_0 = A_21_0 + A_21_6;
2801                                    const double tmp135_0 = A_10_1 + A_10_2 + A_10_5 + A_10_6;
2802                                    const double tmp67_0 = A_02_2 + A_02_7;
2803                                    const double tmp211_0 = A_12_6 + A_21_6;
2804                                    const double tmp180_0 = A_10_2 + A_10_6;
2805                                    const double tmp37_0 = A_00_0 + A_00_1 + A_00_2 + A_00_3;
2806                                    const double tmp92_0 = A_11_0 + A_11_1 + A_11_2 + A_11_3 + A_11_4 + A_11_5 + A_11_6 + A_11_7;
2807                                    const double tmp195_0 = A_02_2 + A_20_2;
2808                                    const double tmp70_0 = A_01_0 + A_01_7;
2809                                    const double tmp139_0 = A_02_3 + A_02_4 + A_20_1 + A_20_6;
2810                                    const double tmp200_0 = A_12_3 + A_12_5 + A_21_3 + A_21_5;
2811                                    const double tmp60_0 = A_22_0 + A_22_2 + A_22_4 + A_22_6;
2812                                    const double tmp192_0 = A_01_5 + A_10_5;
2813                                    const double tmp46_0 = A_21_0 + A_21_7;
2814                                    const double tmp48_0 = A_10_0 + A_10_7;
2815                                    const double tmp166_0 = A_11_5 + A_11_7;
2816                                    const double tmp221_0 = A_02_1 + A_02_6 + A_20_3 + A_20_4;
2817                                    const double tmp50_0 = A_02_4 + A_02_6 + A_20_4 + A_20_6;
2818                                    const double tmp217_0 = A_02_3 + A_02_4 + A_20_3 + A_20_4;
2819                                    const double tmp216_0 = A_01_2 + A_01_5 + A_10_2 + A_10_5;
2820                                    const double tmp104_0 = A_22_2 + A_22_6;
2821                                    const double tmp72_0 = A_20_3 + A_20_6;
2822                                    const double tmp79_0 = A_10_4 + A_10_7;
2823                                    const double tmp86_0 = A_01_2 + A_01_6 + A_10_1 + A_10_5;
2824                                    const double tmp214_0 = A_12_0 + A_12_7 + A_21_0 + A_21_7;
2825                                    const double tmp32_0 = A_02_0 + A_02_2;
2826                                    const double tmp112_0 = A_01_0 + A_01_4 + A_10_3 + A_10_7;
2827                                    const double tmp197_0 = A_12_0 + A_21_0;
2828                                    const double tmp106_0 = A_22_1 + A_22_5;
2829                                    const double tmp2_0 = A_00_0 + A_00_1 + A_00_4 + A_00_5;
2830                                    const double tmp115_0 = A_02_5 + A_02_7 + A_20_0 + A_20_2;
2831                                    const double tmp175_0 = A_01_3 + A_01_7;
2832                                    const double tmp126_0 = A_01_2 + A_01_5 + A_10_1 + A_10_6;
2833                                    const double tmp90_0 = A_00_0 + A_00_1 + A_00_2 + A_00_3 + A_00_4 + A_00_5 + A_00_6 + A_00_7;
2834                                    const double tmp47_0 = A_12_0 + A_12_6;
2835                                    const double tmp205_0 = A_02_7 + A_20_7;
2836                                    const double tmp148_0 = A_01_3 + A_01_4;
2837                                    const double tmp113_0 = A_01_3 + A_01_7 + A_10_0 + A_10_4;
2838                                    const double tmp43_0 = A_20_4 + A_20_6;
2839                                    const double tmp161_0 = A_02_1 + A_02_6 + A_20_1 + A_20_6;
2840                                    const double tmp69_0 = A_12_0 + A_12_1 + A_12_6 + A_12_7 + A_21_0 + A_21_1 + A_21_6 + A_21_7;
2841                                    const double tmp176_0 = A_01_1 + A_01_2 + A_01_5 + A_01_6;
2842                                    const double tmp105_0 = A_01_2 + A_01_6 + A_10_2 + A_10_6;
2843                                    const double tmp22_0 = A_01_5 + A_10_6;
2844                                    const double tmp91_0 = A_02_4 + A_02_6 + A_20_1 + A_20_3;
2845                                    const double tmp206_0 = A_12_7 + A_21_7;
2846                                    const double tmp188_0 = A_02_5 + A_20_5;
2847                                    const double tmp117_0 = A_21_1 + A_21_6;
2848                                    const double tmp165_0 = A_01_1 + A_01_6;
2849                                    const double tmp66_0 = A_00_4 + A_00_5;
2850                                    const double tmp57_0 = A_02_0 + A_02_2 + A_02_5 + A_02_7 + A_20_0 + A_20_2 + A_20_5 + A_20_7;
2851                                    const double tmp31_0 = A_21_4 + A_21_5;
2852                                    const double tmp3_0 = A_11_0 + A_11_2 + A_11_4 + A_11_6;
2853                                    const double tmp183_0 = A_12_0 + A_12_7;
2854                                    const double tmp61_0 = A_02_1 + A_02_3 + A_20_1 + A_20_3;
2855                                    const double tmp54_0 = A_10_5 + A_10_6;
2856                                    const double tmp18_0 = A_02_3 + A_02_6;
2857                                    const double tmp119_0 = A_12_2 + A_12_3 + A_12_4 + A_12_5 + A_21_2 + A_21_3 + A_21_4 + A_21_5;
2858                                    const double tmp29_0 = A_21_2 + A_21_3;
2859                                    const double tmp17_0 = A_01_3 + A_01_7 + A_10_3 + A_10_7;
2860                                    const double tmp212_0 = A_02_6 + A_20_6;
2861                                    const double tmp220_0 = A_02_3 + A_20_6;
2862                                    const double tmp78_0 = A_20_0 + A_20_7;
2863                                    const double tmp215_0 = A_01_6 + A_10_6;
2864                                    const double tmp203_0 = A_01_7 + A_10_7;
2865                                    const double tmp87_0 = A_12_2 + A_12_3 + A_21_4 + A_21_5;
2866                                    const double tmp114_0 = A_02_0 + A_02_2 + A_20_5 + A_20_7;
2867                                    const double tmp0_0 = A_01_0 + A_01_4 + A_10_0 + A_10_4;
2868                                    const double tmp202_0 = A_01_3 + A_01_4 + A_10_3 + A_10_4;
2869                                    const double tmp4_0 = A_20_0 + A_20_5;
2870                                    const double tmp65_0 = A_00_2 + A_00_3;
2871                                    const double tmp24_0 = A_20_1 + A_20_3;
2872                                    const double tmp64_0 = A_10_0 + A_10_3;
2873                                    const double tmp170_0 = A_02_0 + A_02_2 + A_20_0 + A_20_2;
2874                                    const double tmp11_0 = A_20_1 + A_20_6;
2875                                    const double tmp82_0 = A_12_4 + A_12_5 + A_21_4 + A_21_5;
2876                                    const double tmp99_0 = A_01_4 + A_10_7;
2877                                    const double tmp49_0 = A_12_1 + A_12_7;
2878                                    const double tmp130_0 = A_12_0 + A_12_1 + A_12_6 + A_12_7;
2879                                    const double tmp144_0 = A_01_0 + A_10_3;
2880                                    const double tmp109_0 = A_22_0 + A_22_3 + A_22_4 + A_22_7;
2881                                    const double tmp185_0 = A_02_0 + A_02_7 + A_20_2 + A_20_5;
2882                                    const double tmp157_0 = A_01_4 + A_10_4;
2883                                    const double tmp51_0 = A_22_1 + A_22_3 + A_22_5 + A_22_7;
2884                                    const double tmp146_0 = A_00_6 + A_00_7;
2885                                    const double tmp147_0 = A_12_0 + A_12_1 + A_21_0 + A_21_1;
2886                                    const double tmp150_0 = A_00_2 + A_00_3 + A_00_4 + A_00_5;
2887                                    const double tmp62_0 = A_21_3 + A_21_5;
2888                                    const double tmp223_0 = A_12_2 + A_21_4;
2889                                    const double tmp16_0 = A_02_2 + A_02_5;
2890                                    const double tmp168_0 = A_11_1 + A_11_3 + A_11_4 + A_11_6;
2891                                    const double tmp88_0 = A_12_4 + A_12_5 + A_21_2 + A_21_3;
2892                                    const double tmp142_0 = A_01_7 + A_10_4;
2893                                    const double tmp34_0 = A_20_0 + A_20_2 + A_20_5 + A_20_7;
2894                                    const double tmp71_0 = A_00_0 + A_00_1 + A_00_6 + A_00_7;
2895                                    const double tmp213_0 = A_02_1 + A_20_1;
2896                                    const double tmp227_0 = A_12_2 + A_12_5 + A_21_3 + A_21_4;
2897                                    const double tmp228_0 = A_12_1 + A_21_7;
2898                                    const double tmp140_0 = A_01_2 + A_01_6;
2899                                    const double tmp74_0 = A_22_0 + A_22_1 + A_22_4 + A_22_5;
2900                                    const double tmp167_0 = A_11_0 + A_11_2;
2901                                    const double tmp143_0 = A_01_3 + A_01_4 + A_10_0 + A_10_7;
2902                                    const double tmp83_0 = A_02_0 + A_02_5;
2903                                    const double tmp14_0 = A_22_1 + A_22_2 + A_22_5 + A_22_6;
2904                                    const double tmp5_0 = A_12_1 + A_12_6;
2905                                    const double tmp94_0 = A_02_1 + A_02_3;
2906                                    const double tmp193_0 = A_01_1 + A_01_6 + A_10_1 + A_10_6;
2907                                    const double tmp97_0 = A_02_0 + A_02_2 + A_02_5 + A_02_7;
2908                                    const double tmp131_0 = A_01_1 + A_01_5;
2909                                    const double tmp124_0 = A_01_6 + A_10_5;
2910                                    const double tmp149_0 = A_12_6 + A_12_7 + A_21_6 + A_21_7;
2911                                    const double tmp187_0 = A_01_2 + A_10_2;
2912                                    const double tmp93_0 = A_01_1 + A_01_2 + A_10_1 + A_10_2;
2913                                    const double tmp25_0 = A_01_4 + A_01_7 + A_10_4 + A_10_7;
2914                                    const double tmp156_0 = A_12_2 + A_12_5 + A_21_2 + A_21_5;
2915                                    const double tmp20_0 = A_21_2 + A_21_5;
2916                                    const double tmp55_0 = A_21_2 + A_21_4;
2917                                    const double tmp208_0 = A_12_1 + A_12_6 + A_21_0 + A_21_7;
2918                                    const double tmp125_0 = A_12_4 + A_12_5;
2919                                    const double tmp158_0 = A_01_0 + A_01_7 + A_10_0 + A_10_7;
2920                                    const double tmp108_0 = A_01_1 + A_01_5 + A_10_1 + A_10_5;
2921                                    const double tmp199_0 = A_12_2 + A_12_4 + A_21_2 + A_21_4;
2922                                    const double tmp10_0 = A_02_1 + A_02_4;
2923                                    const double tmp182_0 = A_02_3 + A_02_6 + A_20_3 + A_20_6;
2924                                    const double tmp132_0 = A_02_1 + A_20_4;
2925                                    const double tmp191_0 = A_12_3 + A_12_4 + A_21_3 + A_21_4;
2926                                    const double tmp35_0 = A_11_0 + A_11_1 + A_11_2 + A_11_3;
2927                   &n