/[escript]/branches/diaplayground/ripley/src/Brick.cpp
ViewVC logotype

Diff of /branches/diaplayground/ripley/src/Brick.cpp

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

revision 3962 by jfenwick, Tue Sep 11 09:12:07 2012 UTC revision 4482 by caltinay, Tue Jun 25 05:20:01 2013 UTC
# Line 1  Line 1 
1    
2  /*******************************************************  /*****************************************************************************
3  *  *
4  * Copyright (c) 2003-2012 by University of Queensland  * Copyright (c) 2003-2013 by University of Queensland
5  * Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)  * http://www.uq.edu.au
 * http://www.uq.edu.au/esscc  
6  *  *
7  * Primary Business: Queensland, Australia  * Primary Business: Queensland, Australia
8  * Licensed under the Open Software License version 3.0  * Licensed under the Open Software License version 3.0
9  * http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php  * http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php
10  *  *
11  *******************************************************/  * Development until 2012 by Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)
12    * Development since 2012 by School of Earth Sciences
13    *
14    *****************************************************************************/
15    
16  #include <ripley/Brick.h>  #include <ripley/Brick.h>
 extern "C" {  
17  #include <paso/SystemMatrix.h>  #include <paso/SystemMatrix.h>
18  }  #include <esysUtils/esysFileWriter.h>
19    
20    #include <boost/scoped_array.hpp>
21    
22    #ifdef USE_NETCDF
23    #include <netcdfcpp.h>
24    #endif
25    
26  #if USE_SILO  #if USE_SILO
27  #include <silo.h>  #include <silo.h>
# Line 26  extern "C" { Line 33  extern "C" {
33  #include <iomanip>  #include <iomanip>
34    
35  using namespace std;  using namespace std;
36    using esysUtils::FileWriter;
37    
38  namespace ripley {  namespace ripley {
39    
40  Brick::Brick(int n0, int n1, int n2, double x0, double y0, double z0,  Brick::Brick(int n0, int n1, int n2, double x0, double y0, double z0,
41               double x1, double y1, double z1, int d0, int d1, int d2) :               double x1, double y1, double z1, int d0, int d1, int d2) :
42      RipleyDomain(3),      RipleyDomain(3)
     m_x0(x0),  
     m_y0(y0),  
     m_z0(z0),  
     m_l0(x1-x0),  
     m_l1(y1-y0),  
     m_l2(z1-z0)  
43  {  {
44      // ignore subdivision parameters for serial run      // ignore subdivision parameters for serial run
45      if (m_mpiInfo->size == 1) {      if (m_mpiInfo->size == 1) {
# Line 52  Brick::Brick(int n0, int n1, int n2, dou Line 54  Brick::Brick(int n0, int n1, int n2, dou
54      if (d0<=0 && d1<=0 && d2<=0) {      if (d0<=0 && d1<=0 && d2<=0) {
55          warn=true;          warn=true;
56          d0=(int)(pow(m_mpiInfo->size*(n0+1)*(n0+1)/((float)(n1+1)*(n2+1)), 1.f/3));          d0=(int)(pow(m_mpiInfo->size*(n0+1)*(n0+1)/((float)(n1+1)*(n2+1)), 1.f/3));
57          d1=(int)(d0*n1/(float)n0);          d0=max(1, d0);
58            d1=max(1, (int)(d0*n1/(float)n0));
59          d2=m_mpiInfo->size/(d0*d1);          d2=m_mpiInfo->size/(d0*d1);
60          if (d0*d1*d2 != m_mpiInfo->size) {          if (d0*d1*d2 != m_mpiInfo->size) {
61              // ratios not the same so leave "smallest" side undivided and try              // ratios not the same so leave "smallest" side undivided and try
# Line 78  Brick::Brick(int n0, int n1, int n2, dou Line 81  Brick::Brick(int n0, int n1, int n2, dou
81      }      }
82      if (d0<=0 && d1<=0) {      if (d0<=0 && d1<=0) {
83          warn=true;          warn=true;
84          d0=int(sqrt(m_mpiInfo->size*(n0+1)/(float)(n1+1)));          d0=max(1, int(sqrt(m_mpiInfo->size*(n0+1)/(float)(n1+1))));
85          d1=m_mpiInfo->size/d0;          d1=m_mpiInfo->size/d0;
86          if (d0*d1*d2 != m_mpiInfo->size) {          if (d0*d1*d2 != m_mpiInfo->size) {
87              // ratios not the same so subdivide side with more elements only              // ratios not the same so subdivide side with more elements only
# Line 92  Brick::Brick(int n0, int n1, int n2, dou Line 95  Brick::Brick(int n0, int n1, int n2, dou
95          }          }
96      } else if (d0<=0 && d2<=0) {      } else if (d0<=0 && d2<=0) {
97          warn=true;          warn=true;
98          d0=int(sqrt(m_mpiInfo->size*(n0+1)/(float)(n2+1)));          d0=max(1, int(sqrt(m_mpiInfo->size*(n0+1)/(float)(n2+1))));
99          d2=m_mpiInfo->size/d0;          d2=m_mpiInfo->size/d0;
100          if (d0*d1*d2 != m_mpiInfo->size) {          if (d0*d1*d2 != m_mpiInfo->size) {
101              // ratios not the same so subdivide side with more elements only              // ratios not the same so subdivide side with more elements only
# Line 106  Brick::Brick(int n0, int n1, int n2, dou Line 109  Brick::Brick(int n0, int n1, int n2, dou
109          }          }
110      } else if (d1<=0 && d2<=0) {      } else if (d1<=0 && d2<=0) {
111          warn=true;          warn=true;
112          d1=int(sqrt(m_mpiInfo->size*(n1+1)/(float)(n2+1)));          d1=max(1, int(sqrt(m_mpiInfo->size*(n1+1)/(float)(n2+1))));
113          d2=m_mpiInfo->size/d1;          d2=m_mpiInfo->size/d1;
114          if (d0*d1*d2 != m_mpiInfo->size) {          if (d0*d1*d2 != m_mpiInfo->size) {
115              // ratios not the same so subdivide side with more elements only              // ratios not the same so subdivide side with more elements only
# Line 130  Brick::Brick(int n0, int n1, int n2, dou Line 133  Brick::Brick(int n0, int n1, int n2, dou
133          d2=m_mpiInfo->size/(d0*d1);          d2=m_mpiInfo->size/(d0*d1);
134      }      }
135    
     m_NX=d0;  
     m_NY=d1;  
     m_NZ=d2;  
   
136      // ensure number of subdivisions is valid and nodes can be distributed      // ensure number of subdivisions is valid and nodes can be distributed
137      // among number of ranks      // among number of ranks
138      if (m_NX*m_NY*m_NZ != m_mpiInfo->size)      if (d0*d1*d2 != m_mpiInfo->size)
139          throw RipleyException("Invalid number of spatial subdivisions");          throw RipleyException("Invalid number of spatial subdivisions");
140    
141      if (warn) {      if (warn) {
# Line 144  Brick::Brick(int n0, int n1, int n2, dou Line 143  Brick::Brick(int n0, int n1, int n2, dou
143              << d1 << ", d2=" << d2 << "). This may not be optimal!" << endl;              << d1 << ", d2=" << d2 << "). This may not be optimal!" << endl;
144      }      }
145    
146      if ((n0+1)%m_NX > 0) {      double l0 = x1-x0;
147          double Dx=m_l0/n0;      double l1 = y1-y0;
148        double l2 = z1-z0;
149        m_dx[0] = l0/n0;
150        m_dx[1] = l1/n1;
151        m_dx[2] = l2/n2;
152    
153        if ((n0+1)%d0 > 0) {
154          n0=(int)round((float)(n0+1)/d0+0.5)*d0-1;          n0=(int)round((float)(n0+1)/d0+0.5)*d0-1;
155          m_l0=Dx*n0;          l0=m_dx[0]*n0;
156          cout << "Warning: Adjusted number of elements and length. N0="          cout << "Warning: Adjusted number of elements and length. N0="
157              << n0 << ", l0=" << m_l0 << endl;              << n0 << ", l0=" << l0 << endl;
158      }      }
159      if ((n1+1)%m_NY > 0) {      if ((n1+1)%d1 > 0) {
         double Dy=m_l1/n1;  
160          n1=(int)round((float)(n1+1)/d1+0.5)*d1-1;          n1=(int)round((float)(n1+1)/d1+0.5)*d1-1;
161          m_l1=Dy*n1;          l1=m_dx[1]*n1;
162          cout << "Warning: Adjusted number of elements and length. N1="          cout << "Warning: Adjusted number of elements and length. N1="
163              << n1 << ", l1=" << m_l1 << endl;              << n1 << ", l1=" << l1 << endl;
164      }      }
165      if ((n2+1)%m_NZ > 0) {      if ((n2+1)%d2 > 0) {
         double Dz=m_l2/n2;  
166          n2=(int)round((float)(n2+1)/d2+0.5)*d2-1;          n2=(int)round((float)(n2+1)/d2+0.5)*d2-1;
167          m_l2=Dz*n2;          l2=m_dx[2]*n2;
168          cout << "Warning: Adjusted number of elements and length. N2="          cout << "Warning: Adjusted number of elements and length. N2="
169              << n2 << ", l2=" << m_l2 << endl;              << n2 << ", l2=" << l2 << endl;
170      }      }
171    
172      m_gNE0=n0;      if ((d0 > 1 && (n0+1)/d0<2) || (d1 > 1 && (n1+1)/d1<2) || (d2 > 1 && (n2+1)/d2<2))
     m_gNE1=n1;  
     m_gNE2=n2;  
   
     if ((m_NX > 1 && (n0+1)/m_NX<2) || (m_NY > 1 && (n1+1)/m_NY<2) || (m_NZ > 1 && (n2+1)/m_NZ<2))  
173          throw RipleyException("Too few elements for the number of ranks");          throw RipleyException("Too few elements for the number of ranks");
174    
175        m_gNE[0] = n0;
176        m_gNE[1] = n1;
177        m_gNE[2] = n2;
178        m_origin[0] = x0;
179        m_origin[1] = y0;
180        m_origin[2] = z0;
181        m_length[0] = l0;
182        m_length[1] = l1;
183        m_length[2] = l2;
184        m_NX[0] = d0;
185        m_NX[1] = d1;
186        m_NX[2] = d2;
187    
188      // local number of elements (including overlap)      // local number of elements (including overlap)
189      m_NE0 = m_ownNE0 = (m_NX>1 ? (n0+1)/m_NX : n0);      m_NE[0] = m_ownNE[0] = (d0>1 ? (n0+1)/d0 : n0);
190      if (m_mpiInfo->rank%m_NX>0 && m_mpiInfo->rank%m_NX<m_NX-1)      if (m_mpiInfo->rank%d0>0 && m_mpiInfo->rank%d0<d0-1)
191          m_NE0++;          m_NE[0]++;
192      else if (m_NX>1 && m_mpiInfo->rank%m_NX==m_NX-1)      else if (d0>1 && m_mpiInfo->rank%d0==d0-1)
193          m_ownNE0--;          m_ownNE[0]--;
194    
195      m_NE1 = m_ownNE1 = (m_NY>1 ? (n1+1)/m_NY : n1);      m_NE[1] = m_ownNE[1] = (d1>1 ? (n1+1)/d1 : n1);
196      if (m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX>0 && m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX<m_NY-1)      if (m_mpiInfo->rank%(d0*d1)/d0>0 && m_mpiInfo->rank%(d0*d1)/d0<d1-1)
197          m_NE1++;          m_NE[1]++;
198      else if (m_NY>1 && m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX==m_NY-1)      else if (d1>1 && m_mpiInfo->rank%(d0*d1)/d0==d1-1)
199          m_ownNE1--;          m_ownNE[1]--;
200    
201      m_NE2 = m_ownNE2 = (m_NZ>1 ? (n2+1)/m_NZ : n2);      m_NE[2] = m_ownNE[2] = (d2>1 ? (n2+1)/d2 : n2);
202      if (m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY)>0 && m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY)<m_NZ-1)      if (m_mpiInfo->rank/(d0*d1)>0 && m_mpiInfo->rank/(d0*d1)<d2-1)
203          m_NE2++;          m_NE[2]++;
204      else if (m_NZ>1 && m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY)==m_NZ-1)      else if (d2>1 && m_mpiInfo->rank/(d0*d1)==d2-1)
205          m_ownNE2--;          m_ownNE[2]--;
206    
207      // local number of nodes      // local number of nodes
208      m_N0 = m_NE0+1;      m_NN[0] = m_NE[0]+1;
209      m_N1 = m_NE1+1;      m_NN[1] = m_NE[1]+1;
210      m_N2 = m_NE2+1;      m_NN[2] = m_NE[2]+1;
211    
212      // bottom-left-front node is at (offset0,offset1,offset2) in global mesh      // bottom-left-front node is at (offset0,offset1,offset2) in global mesh
213      m_offset0 = (n0+1)/m_NX*(m_mpiInfo->rank%m_NX);      m_offset[0] = (n0+1)/d0*(m_mpiInfo->rank%d0);
214      if (m_offset0 > 0)      if (m_offset[0] > 0)
215          m_offset0--;          m_offset[0]--;
216      m_offset1 = (n1+1)/m_NY*(m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX);      m_offset[1] = (n1+1)/d1*(m_mpiInfo->rank%(d0*d1)/d0);
217      if (m_offset1 > 0)      if (m_offset[1] > 0)
218          m_offset1--;          m_offset[1]--;
219      m_offset2 = (n2+1)/m_NZ*(m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY));      m_offset[2] = (n2+1)/d2*(m_mpiInfo->rank/(d0*d1));
220      if (m_offset2 > 0)      if (m_offset[2] > 0)
221          m_offset2--;          m_offset[2]--;
222    
223      populateSampleIds();      populateSampleIds();
224      createPattern();      createPattern();
# Line 229  bool Brick::operator==(const AbstractDom Line 241  bool Brick::operator==(const AbstractDom
241      const Brick* o=dynamic_cast<const Brick*>(&other);      const Brick* o=dynamic_cast<const Brick*>(&other);
242      if (o) {      if (o) {
243          return (RipleyDomain::operator==(other) &&          return (RipleyDomain::operator==(other) &&
244                  m_gNE0==o->m_gNE0 && m_gNE1==o->m_gNE1 && m_gNE2==o->m_gNE2                  m_gNE[0]==o->m_gNE[0] && m_gNE[1]==o->m_gNE[1] && m_gNE[2]==o->m_gNE[2]
245                  && m_x0==o->m_x0 && m_y0==o->m_y0 && m_z0==o->m_z0                  && m_origin[0]==o->m_origin[0] && m_origin[1]==o->m_origin[1] && m_origin[2]==o->m_origin[2]
246                  && m_l0==o->m_l0 && m_l1==o->m_l1 && m_l2==o->m_l2                  && m_length[0]==o->m_length[0] && m_length[1]==o->m_length[1] && m_length[2]==o->m_length[2]
247                  && m_NX==o->m_NX && m_NY==o->m_NY && m_NZ==o->m_NZ);                  && m_NX[0]==o->m_NX[0] && m_NX[1]==o->m_NX[1] && m_NX[2]==o->m_NX[2]);
248      }      }
249    
250      return false;      return false;
251  }  }
252    
253    void Brick::readNcGrid(escript::Data& out, string filename, string varname,
254                const vector<int>& first, const vector<int>& numValues,
255                const vector<int>& multiplier) const
256    {
257    #ifdef USE_NETCDF
258        // check destination function space
259        int myN0, myN1, myN2;
260        if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Nodes) {
261            myN0 = m_NN[0];
262            myN1 = m_NN[1];
263            myN2 = m_NN[2];
264        } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements ||
265                    out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
266            myN0 = m_NE[0];
267            myN1 = m_NE[1];
268            myN2 = m_NE[2];
269        } else
270            throw RipleyException("readNcGrid(): invalid function space for output data object");
271    
272        if (first.size() != 3)
273            throw RipleyException("readNcGrid(): argument 'first' must have 3 entries");
274    
275        if (numValues.size() != 3)
276            throw RipleyException("readNcGrid(): argument 'numValues' must have 3 entries");
277    
278        if (multiplier.size() != 3)
279            throw RipleyException("readNcGrid(): argument 'multiplier' must have 3 entries");
280        for (size_t i=0; i<multiplier.size(); i++)
281            if (multiplier[i]<1)
282                throw RipleyException("readNcGrid(): all multipliers must be positive");
283    
284        // check file existence and size
285        NcFile f(filename.c_str(), NcFile::ReadOnly);
286        if (!f.is_valid())
287            throw RipleyException("readNcGrid(): cannot open file");
288    
289        NcVar* var = f.get_var(varname.c_str());
290        if (!var)
291            throw RipleyException("readNcGrid(): invalid variable name");
292    
293        // TODO: rank>0 data support
294        const int numComp = out.getDataPointSize();
295        if (numComp > 1)
296            throw RipleyException("readNcGrid(): only scalar data supported");
297    
298        const int dims = var->num_dims();
299        boost::scoped_array<long> edges(var->edges());
300    
301        // is this a slice of the data object (dims!=3)?
302        // note the expected ordering of edges (as in numpy: z,y,x)
303        if ( (dims==3 && (numValues[2] > edges[0] || numValues[1] > edges[1]
304                          || numValues[0] > edges[2]))
305                || (dims==2 && numValues[2]>1)
306                || (dims==1 && (numValues[2]>1 || numValues[1]>1)) ) {
307            throw RipleyException("readNcGrid(): not enough data in file");
308        }
309    
310        // check if this rank contributes anything
311        if (first[0] >= m_offset[0]+myN0 || first[0]+numValues[0]*multiplier[0] <= m_offset[0] ||
312                first[1] >= m_offset[1]+myN1 || first[1]+numValues[1]*multiplier[1] <= m_offset[1] ||
313                first[2] >= m_offset[2]+myN2 || first[2]+numValues[2]*multiplier[2] <= m_offset[2]) {
314            return;
315        }
316    
317        // now determine how much this rank has to write
318    
319        // first coordinates in data object to write to
320        const int first0 = max(0, first[0]-m_offset[0]);
321        const int first1 = max(0, first[1]-m_offset[1]);
322        const int first2 = max(0, first[2]-m_offset[2]);
323        // indices to first value in file
324        const int idx0 = max(0, m_offset[0]-first[0]);
325        const int idx1 = max(0, m_offset[1]-first[1]);
326        const int idx2 = max(0, m_offset[2]-first[2]);
327        // number of values to read
328        const int num0 = min(numValues[0]-idx0, myN0-first0);
329        const int num1 = min(numValues[1]-idx1, myN1-first1);
330        const int num2 = min(numValues[2]-idx2, myN2-first2);
331    
332        vector<double> values(num0*num1*num2);
333        if (dims==3) {
334            var->set_cur(idx2, idx1, idx0);
335            var->get(&values[0], num2, num1, num0);
336        } else if (dims==2) {
337            var->set_cur(idx1, idx0);
338            var->get(&values[0], num1, num0);
339        } else {
340            var->set_cur(idx0);
341            var->get(&values[0], num0);
342        }
343    
344        const int dpp = out.getNumDataPointsPerSample();
345        out.requireWrite();
346    
347        for (index_t z=0; z<num2; z++) {
348            for (index_t y=0; y<num1; y++) {
349    #pragma omp parallel for
350                for (index_t x=0; x<num0; x++) {
351                    const int baseIndex = first0+x*multiplier[0]
352                                            +(first1+y*multiplier[1])*myN0
353                                            +(first2+z*multiplier[2])*myN0*myN1;
354                    const int srcIndex=z*num1*num0+y*num0+x;
355                    if (!isnan(values[srcIndex])) {
356                        for (index_t m2=0; m2<multiplier[2]; m2++) {
357                            for (index_t m1=0; m1<multiplier[1]; m1++) {
358                                for (index_t m0=0; m0<multiplier[0]; m0++) {
359                                    const int dataIndex = baseIndex+m0
360                                                   +m1*myN0
361                                                   +m2*myN0*myN1;
362                                    double* dest = out.getSampleDataRW(dataIndex);
363                                    for (index_t q=0; q<dpp; q++) {
364                                        *dest++ = values[srcIndex];
365                                    }
366                                }
367                            }
368                        }
369                    }
370                }
371            }
372        }
373    #else
374        throw RipleyException("readNcGrid(): not compiled with netCDF support");
375    #endif
376    }
377    
378    void Brick::readBinaryGrid(escript::Data& out, string filename,
379                               const vector<int>& first,
380                               const vector<int>& numValues,
381                               const vector<int>& multiplier) const
382    {
383        // check destination function space
384        int myN0, myN1, myN2;
385        if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Nodes) {
386            myN0 = m_NN[0];
387            myN1 = m_NN[1];
388            myN2 = m_NN[2];
389        } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements ||
390                    out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
391            myN0 = m_NE[0];
392            myN1 = m_NE[1];
393            myN2 = m_NE[2];
394        } else
395            throw RipleyException("readBinaryGrid(): invalid function space for output data object");
396    
397        if (first.size() != 3)
398            throw RipleyException("readBinaryGrid(): argument 'first' must have 3 entries");
399    
400        if (numValues.size() != 3)
401            throw RipleyException("readBinaryGrid(): argument 'numValues' must have 3 entries");
402    
403        if (multiplier.size() != 3)
404            throw RipleyException("readBinaryGrid(): argument 'multiplier' must have 3 entries");
405        for (size_t i=0; i<multiplier.size(); i++)
406            if (multiplier[i]<1)
407                throw RipleyException("readBinaryGrid(): all multipliers must be positive");
408    
409        // check file existence and size
410        ifstream f(filename.c_str(), ifstream::binary);
411        if (f.fail()) {
412            throw RipleyException("readBinaryGrid(): cannot open file");
413        }
414        f.seekg(0, ios::end);
415        const int numComp = out.getDataPointSize();
416        const int filesize = f.tellg();
417        const int reqsize = numValues[0]*numValues[1]*numValues[2]*numComp*sizeof(float);
418        if (filesize < reqsize) {
419            f.close();
420            throw RipleyException("readBinaryGrid(): not enough data in file");
421        }
422    
423        // check if this rank contributes anything
424        if (first[0] >= m_offset[0]+myN0 || first[0]+numValues[0]*multiplier[0] <= m_offset[0] ||
425                first[1] >= m_offset[1]+myN1 || first[1]+numValues[1]*multiplier[1] <= m_offset[1] ||
426                first[2] >= m_offset[2]+myN2 || first[2]+numValues[2]*multiplier[2] <= m_offset[2]) {
427            f.close();
428            return;
429        }
430    
431        // now determine how much this rank has to write
432    
433        // first coordinates in data object to write to
434        const int first0 = max(0, first[0]-m_offset[0]);
435        const int first1 = max(0, first[1]-m_offset[1]);
436        const int first2 = max(0, first[2]-m_offset[2]);
437        // indices to first value in file
438        const int idx0 = max(0, m_offset[0]-first[0]);
439        const int idx1 = max(0, m_offset[1]-first[1]);
440        const int idx2 = max(0, m_offset[2]-first[2]);
441        // number of values to read
442        const int num0 = min(numValues[0]-idx0, myN0-first0);
443        const int num1 = min(numValues[1]-idx1, myN1-first1);
444        const int num2 = min(numValues[2]-idx2, myN2-first2);
445    
446        out.requireWrite();
447        vector<float> values(num0*numComp);
448        const int dpp = out.getNumDataPointsPerSample();
449    
450        for (index_t z=0; z<num2; z++) {
451            for (index_t y=0; y<num1; y++) {
452                const int fileofs = numComp*(idx0+(idx1+y)*numValues[0]+(idx2+z)*numValues[0]*numValues[1]);
453                f.seekg(fileofs*sizeof(float));
454                f.read((char*)&values[0], num0*numComp*sizeof(float));
455    
456                for (index_t x=0; x<num0; x++) {
457                    const int baseIndex = first0+x*multiplier[0]
458                                            +(first1+y*multiplier[1])*myN0
459                                            +(first2+z*multiplier[2])*myN0*myN1;
460                    for (index_t m2=0; m2<multiplier[2]; m2++) {
461                        for (index_t m1=0; m1<multiplier[1]; m1++) {
462                            for (index_t m0=0; m0<multiplier[0]; m0++) {
463                                const int dataIndex = baseIndex+m0
464                                               +m1*myN0
465                                               +m2*myN0*myN1;
466                                double* dest = out.getSampleDataRW(dataIndex);
467                                for (index_t c=0; c<numComp; c++) {
468                                    if (!std::isnan(values[x*numComp+c])) {
469                                        for (index_t q=0; q<dpp; q++) {
470                                            *dest++ = static_cast<double>(values[x*numComp+c]);
471                                        }
472                                    }
473                                }
474                            }
475                        }
476                    }
477                }
478            }
479        }
480    
481        f.close();
482    }
483    
484    void Brick::writeBinaryGrid(const escript::Data& in, string filename,
485                                int byteOrder, int dataType) const
486    {
487        // the mapping is not universally correct but should work on our
488        // supported platforms
489        switch (dataType) {
490            case DATATYPE_INT32:
491                writeBinaryGridImpl<int>(in, filename, byteOrder);
492                break;
493            case DATATYPE_FLOAT32:
494                writeBinaryGridImpl<float>(in, filename, byteOrder);
495                break;
496            case DATATYPE_FLOAT64:
497                writeBinaryGridImpl<double>(in, filename, byteOrder);
498                break;
499            default:
500                throw RipleyException("writeBinaryGrid(): invalid or unsupported datatype");
501        }
502    }
503    
504    template<typename ValueType>
505    void Brick::writeBinaryGridImpl(const escript::Data& in,
506                                    const string& filename, int byteOrder) const
507    {
508        // check function space and determine number of points
509        int myN0, myN1, myN2;
510        int totalN0, totalN1, totalN2;
511        if (in.getFunctionSpace().getTypeCode() == Nodes) {
512            myN0 = m_NN[0];
513            myN1 = m_NN[1];
514            myN2 = m_NN[2];
515            totalN0 = m_gNE[0]+1;
516            totalN1 = m_gNE[1]+1;
517            totalN2 = m_gNE[2]+1;
518        } else if (in.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements ||
519                    in.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
520            myN0 = m_NE[0];
521            myN1 = m_NE[1];
522            myN2 = m_NE[2];
523            totalN0 = m_gNE[0];
524            totalN1 = m_gNE[1];
525            totalN2 = m_gNE[2];
526        } else
527            throw RipleyException("writeBinaryGrid(): invalid function space of data object");
528    
529        const int numComp = in.getDataPointSize();
530        const int dpp = in.getNumDataPointsPerSample();
531        const int fileSize = sizeof(ValueType)*numComp*dpp*totalN0*totalN1*totalN2;
532    
533        if (numComp > 1 || dpp > 1)
534            throw RipleyException("writeBinaryGrid(): only scalar, single-value data supported");
535    
536        escript::Data* _in = const_cast<escript::Data*>(&in);
537    
538        // from here on we know that each sample consists of one value
539        FileWriter fw;
540        fw.openFile(filename, fileSize);
541        MPIBarrier();
542    
543        for (index_t z=0; z<myN2; z++) {
544            for (index_t y=0; y<myN1; y++) {
545                const int fileofs = (m_offset[0]+(m_offset[1]+y)*totalN0
546                                    +(m_offset[2]+z)*totalN0*totalN1)*sizeof(ValueType);
547                ostringstream oss;
548    
549                for (index_t x=0; x<myN0; x++) {
550                    const double* sample = _in->getSampleDataRO(z*myN0*myN1+y*myN0+x);
551                    ValueType fvalue = static_cast<ValueType>(*sample);
552                    if (byteOrder == BYTEORDER_NATIVE) {
553                        oss.write((char*)&fvalue, sizeof(fvalue));
554                    } else {
555                        char* value = reinterpret_cast<char*>(&fvalue);
556                        oss.write(byte_swap32(value), sizeof(fvalue));
557                    }
558                }
559                fw.writeAt(oss, fileofs);
560            }
561        }
562        fw.close();
563    }
564    
565  void Brick::dump(const string& fileName) const  void Brick::dump(const string& fileName) const
566  {  {
567  #if USE_SILO  #if USE_SILO
# Line 298  void Brick::dump(const string& fileName) Line 622  void Brick::dump(const string& fileName)
622      }      }
623      */      */
624    
625      boost::scoped_ptr<double> x(new double[m_N0]);      boost::scoped_ptr<double> x(new double[m_NN[0]]);
626      boost::scoped_ptr<double> y(new double[m_N1]);      boost::scoped_ptr<double> y(new double[m_NN[1]]);
627      boost::scoped_ptr<double> z(new double[m_N2]);      boost::scoped_ptr<double> z(new double[m_NN[2]]);
628      double* coords[3] = { x.get(), y.get(), z.get() };      double* coords[3] = { x.get(), y.get(), z.get() };
     pair<double,double> xdx = getFirstCoordAndSpacing(0);  
     pair<double,double> ydy = getFirstCoordAndSpacing(1);  
     pair<double,double> zdz = getFirstCoordAndSpacing(2);  
629  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
630      {      {
631  #pragma omp for  #pragma omp for
632          for (dim_t i0 = 0; i0 < m_N0; i0++) {          for (dim_t i0 = 0; i0 < m_NN[0]; i0++) {
633              coords[0][i0]=xdx.first+i0*xdx.second;              coords[0][i0]=getLocalCoordinate(i0, 0);
634          }          }
635  #pragma omp for  #pragma omp for
636          for (dim_t i1 = 0; i1 < m_N1; i1++) {          for (dim_t i1 = 0; i1 < m_NN[1]; i1++) {
637              coords[1][i1]=ydy.first+i1*ydy.second;              coords[1][i1]=getLocalCoordinate(i1, 1);
638          }          }
639  #pragma omp for  #pragma omp for
640          for (dim_t i2 = 0; i2 < m_N2; i2++) {          for (dim_t i2 = 0; i2 < m_NN[2]; i2++) {
641              coords[2][i2]=zdz.first+i2*zdz.second;              coords[2][i2]=getLocalCoordinate(i2, 2);
642          }          }
643      }      }
644      IndexVector dims = getNumNodesPerDim();      int* dims = const_cast<int*>(getNumNodesPerDim());
645      DBPutQuadmesh(dbfile, "mesh", NULL, coords, &dims[0], 3, DB_DOUBLE,  
646        // write mesh
647        DBPutQuadmesh(dbfile, "mesh", NULL, coords, dims, 3, DB_DOUBLE,
648              DB_COLLINEAR, NULL);              DB_COLLINEAR, NULL);
649    
650      DBPutQuadvar1(dbfile, "nodeId", "mesh", (void*)&m_nodeId[0], &dims[0], 3,      // write node ids
651        DBPutQuadvar1(dbfile, "nodeId", "mesh", (void*)&m_nodeId[0], dims, 3,
652              NULL, 0, DB_INT, DB_NODECENT, NULL);              NULL, 0, DB_INT, DB_NODECENT, NULL);
653    
654      // write element ids      // write element ids
655      dims = getNumElementsPerDim();      dims = const_cast<int*>(getNumElementsPerDim());
656      DBPutQuadvar1(dbfile, "elementId", "mesh", (void*)&m_elementId[0],      DBPutQuadvar1(dbfile, "elementId", "mesh", (void*)&m_elementId[0],
657              &dims[0], 3, NULL, 0, DB_INT, DB_ZONECENT, NULL);              dims, 3, NULL, 0, DB_INT, DB_ZONECENT, NULL);
658    
659      // rank 0 writes multimesh and multivar      // rank 0 writes multimesh and multivar
660      if (m_mpiInfo->rank == 0) {      if (m_mpiInfo->rank == 0) {
# Line 423  bool Brick::ownSample(int fsType, index_ Line 747  bool Brick::ownSample(int fsType, index_
747          case ReducedElements:          case ReducedElements:
748              {              {
749                  // check ownership of element's _last_ node                  // check ownership of element's _last_ node
750                  const index_t x=id%m_NE0 + 1;                  const index_t x=id%m_NE[0] + 1;
751                  const index_t y=id%(m_NE0*m_NE1)/m_NE0 + 1;                  const index_t y=id%(m_NE[0]*m_NE[1])/m_NE[0] + 1;
752                  const index_t z=id/(m_NE0*m_NE1) + 1;                  const index_t z=id/(m_NE[0]*m_NE[1]) + 1;
753                  return (m_dofMap[x + m_N0*y +m_N0*m_N1*z] < getNumDOF());                  return (m_dofMap[x + m_NN[0]*y + m_NN[0]*m_NN[1]*z] < getNumDOF());
754              }              }
755          case FaceElements:          case FaceElements:
756          case ReducedFaceElements:          case ReducedFaceElements:
757              {              {
758                  // check ownership of face element's last node                  // check ownership of face element's last node
                 const IndexVector faces = getNumFacesPerBoundary();  
759                  dim_t n=0;                  dim_t n=0;
760                  for (size_t i=0; i<faces.size(); i++) {                  for (size_t i=0; i<6; i++) {
761                      n+=faces[i];                      n+=m_faceCount[i];
762                      if (id<n) {                      if (id<n) {
763                          const index_t j=id-n+faces[i];                          const index_t j=id-n+m_faceCount[i];
764                          if (i>=4) { // front or back                          if (i>=4) { // front or back
765                              const index_t first=(i==4 ? 0 : m_N0*m_N1*(m_N2-1));                              const index_t first=(i==4 ? 0 : m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1));
766                              return (m_dofMap[first+j%m_NE0+1+(j/m_NE0+1)*m_N0] < getNumDOF());                              return (m_dofMap[first+j%m_NE[0]+1+(j/m_NE[0]+1)*m_NN[0]] < getNumDOF());
767                          } else if (i>=2) { // bottom or top                          } else if (i>=2) { // bottom or top
768                              const index_t first=(i==2 ? 0 : m_N0*(m_N1-1));                              const index_t first=(i==2 ? 0 : m_NN[0]*(m_NN[1]-1));
769                              return (m_dofMap[first+j%m_NE0+1+(j/m_NE0+1)*m_N0*m_N1] < getNumDOF());                              return (m_dofMap[first+j%m_NE[0]+1+(j/m_NE[0]+1)*m_NN[0]*m_NN[1]] < getNumDOF());
770                          } else { // left or right                          } else { // left or right
771                              const index_t first=(i==0 ? 0 : m_N0-1);                              const index_t first=(i==0 ? 0 : m_NN[0]-1);
772                              return (m_dofMap[first+(j%m_NE1+1)*m_N0+(j/m_NE1+1)*m_N0*m_N1] < getNumDOF());                              return (m_dofMap[first+(j%m_NE[1]+1)*m_NN[0]+(j/m_NE[1]+1)*m_NN[0]*m_NN[1]] < getNumDOF());
773                          }                          }
774                      }                      }
775                  }                  }
# Line 469  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 792  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
792          {          {
793              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
794  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
795                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
796                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
797                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
798                          // set vector at four quadrature points                          // set vector at four quadrature points
799                          *o++ = -1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;                          *o++ = -1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;
800                          *o++ = -1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;                          *o++ = -1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;
# Line 483  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 806  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
806    
807              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
808  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
809                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
810                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
811                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
812                          // set vector at four quadrature points                          // set vector at four quadrature points
813                          *o++ = 1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;                          *o++ = 1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;
814                          *o++ = 1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;                          *o++ = 1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;
# Line 497  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 820  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
820    
821              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
822  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
823                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
824                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
825                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
826                          // set vector at four quadrature points                          // set vector at four quadrature points
827                          *o++ = 0.; *o++ = -1.; *o++ = 0.;                          *o++ = 0.; *o++ = -1.; *o++ = 0.;
828                          *o++ = 0.; *o++ = -1.; *o++ = 0.;                          *o++ = 0.; *o++ = -1.; *o++ = 0.;
# Line 511  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 834  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
834    
835              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
836  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
837                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
838                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
839                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
840                          // set vector at four quadrature points                          // set vector at four quadrature points
841                          *o++ = 0.; *o++ = 1.; *o++ = 0.;                          *o++ = 0.; *o++ = 1.; *o++ = 0.;
842                          *o++ = 0.; *o++ = 1.; *o++ = 0.;                          *o++ = 0.; *o++ = 1.; *o++ = 0.;
# Line 525  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 848  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
848    
849              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
850  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
851                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
852                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
853                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
854                          // set vector at four quadrature points                          // set vector at four quadrature points
855                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = -1.;                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = -1.;
856                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = -1.;                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = -1.;
# Line 539  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 862  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
862    
863              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
864  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
865                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
866                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
867                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
868                          // set vector at four quadrature points                          // set vector at four quadrature points
869                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = 1.;                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = 1.;
870                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = 1.;                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = 1.;
# Line 557  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 880  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
880          {          {
881              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
882  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
883                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
884                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
885                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
886                          *o++ = -1.;                          *o++ = -1.;
887                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
888                          *o = 0.;                          *o = 0.;
# Line 569  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 892  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
892    
893              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
894  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
895                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
896                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
897                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
898                          *o++ = 1.;                          *o++ = 1.;
899                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
900                          *o = 0.;                          *o = 0.;
# Line 581  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 904  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
904    
905              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
906  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
907                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
908                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
909                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
910                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
911                          *o++ = -1.;                          *o++ = -1.;
912                          *o = 0.;                          *o = 0.;
# Line 593  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 916  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
916    
917              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
918  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
919                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
920                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
921                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
922                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
923                          *o++ = 1.;                          *o++ = 1.;
924                          *o = 0.;                          *o = 0.;
# Line 605  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 928  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
928    
929              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
930  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
931                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
932                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
933                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
934                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
935                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
936                          *o = -1.;                          *o = -1.;
# Line 617  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 940  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
940    
941              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
942  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
943                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
944                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
945                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
946                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
947                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
948                          *o = 1.;                          *o = 1.;
# Line 642  void Brick::setToSize(escript::Data& out Line 965  void Brick::setToSize(escript::Data& out
965              || out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {              || out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
966          out.requireWrite();          out.requireWrite();
967          const dim_t numQuad=out.getNumDataPointsPerSample();          const dim_t numQuad=out.getNumDataPointsPerSample();
968          const double xSize=getFirstCoordAndSpacing(0).second;          const double size=sqrt(m_dx[0]*m_dx[0]+m_dx[1]*m_dx[1]+m_dx[2]*m_dx[2]);
         const double ySize=getFirstCoordAndSpacing(1).second;  
         const double zSize=getFirstCoordAndSpacing(2).second;  
         const double size=sqrt(xSize*xSize+ySize*ySize+zSize*zSize);  
969  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel for
970          for (index_t k = 0; k < getNumElements(); ++k) {          for (index_t k = 0; k < getNumElements(); ++k) {
971              double* o = out.getSampleDataRW(k);              double* o = out.getSampleDataRW(k);
# Line 655  void Brick::setToSize(escript::Data& out Line 975  void Brick::setToSize(escript::Data& out
975              || out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedFaceElements) {              || out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedFaceElements) {
976          out.requireWrite();          out.requireWrite();
977          const dim_t numQuad=out.getNumDataPointsPerSample();          const dim_t numQuad=out.getNumDataPointsPerSample();
         const double xSize=getFirstCoordAndSpacing(0).second;  
         const double ySize=getFirstCoordAndSpacing(1).second;  
         const double zSize=getFirstCoordAndSpacing(2).second;  
978  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
979          {          {
980              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
981                  const double size=min(ySize,zSize);                  const double size=min(m_dx[1],m_dx[2]);
982  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
983                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
984                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
985                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
986                          fill(o, o+numQuad, size);                          fill(o, o+numQuad, size);
987                      }                      }
988                  }                  }
989              }              }
990    
991              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
992                  const double size=min(ySize,zSize);                  const double size=min(m_dx[1],m_dx[2]);
993  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
994                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
995                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
996                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
997                          fill(o, o+numQuad, size);                          fill(o, o+numQuad, size);
998                      }                      }
999                  }                  }
1000              }              }
1001    
1002              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
1003                  const double size=min(xSize,zSize);                  const double size=min(m_dx[0],m_dx[2]);
1004  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1005                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1006                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1007                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1008                          fill(o, o+numQuad, size);                          fill(o, o+numQuad, size);
1009                      }                      }
1010                  }                  }
1011              }              }
1012    
1013              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
1014                  const double size=min(xSize,zSize);                  const double size=min(m_dx[0],m_dx[2]);
1015  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1016                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1017                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1018                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1019                          fill(o, o+numQuad, size);                          fill(o, o+numQuad, size);
1020                      }                      }
1021                  }                  }
1022              }              }
1023    
1024              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
1025                  const double size=min(xSize,ySize);                  const double size=min(m_dx[0],m_dx[1]);
1026  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1027                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1028                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1029                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1030                          fill(o, o+numQuad, size);                          fill(o, o+numQuad, size);
1031                      }                      }
1032                  }                  }
1033              }              }
1034    
1035              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
1036                  const double size=min(xSize,ySize);                  const double size=min(m_dx[0],m_dx[1]);
1037  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1038                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1039                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1040                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1041                          fill(o, o+numQuad, size);                          fill(o, o+numQuad, size);
1042                      }                      }
1043                  }                  }
# Line 735  void Brick::setToSize(escript::Data& out Line 1052  void Brick::setToSize(escript::Data& out
1052      }      }
1053  }  }
1054    
 Paso_SystemMatrixPattern* Brick::getPattern(bool reducedRowOrder,  
                                             bool reducedColOrder) const  
 {  
     /* FIXME: reduced  
     if (reducedRowOrder || reducedColOrder)  
         throw RipleyException("getPattern() not implemented for reduced order");  
     */  
     return m_pattern;  
 }  
   
1055  void Brick::Print_Mesh_Info(const bool full) const  void Brick::Print_Mesh_Info(const bool full) const
1056  {  {
1057      RipleyDomain::Print_Mesh_Info(full);      RipleyDomain::Print_Mesh_Info(full);
# Line 752  void Brick::Print_Mesh_Info(const bool f Line 1059  void Brick::Print_Mesh_Info(const bool f
1059          cout << "     Id  Coordinates" << endl;          cout << "     Id  Coordinates" << endl;
1060          cout.precision(15);          cout.precision(15);
1061          cout.setf(ios::scientific, ios::floatfield);          cout.setf(ios::scientific, ios::floatfield);
         pair<double,double> xdx = getFirstCoordAndSpacing(0);  
         pair<double,double> ydy = getFirstCoordAndSpacing(1);  
         pair<double,double> zdz = getFirstCoordAndSpacing(2);  
1062          for (index_t i=0; i < getNumNodes(); i++) {          for (index_t i=0; i < getNumNodes(); i++) {
1063              cout << "  " << setw(5) << m_nodeId[i]              cout << "  " << setw(5) << m_nodeId[i]
1064                  << "  " << xdx.first+(i%m_N0)*xdx.second                  << "  " << getLocalCoordinate(i%m_NN[0], 0)
1065                  << "  " << ydy.first+(i%(m_N0*m_N1)/m_N0)*ydy.second                  << "  " << getLocalCoordinate(i%(m_NN[0]*m_NN[1])/m_NN[0], 1)
1066                  << "  " << zdz.first+(i/(m_N0*m_N1))*zdz.second << endl;                  << "  " << getLocalCoordinate(i/(m_NN[0]*m_NN[1]), 2) << endl;
1067          }          }
1068      }      }
1069  }  }
1070    
 IndexVector Brick::getNumNodesPerDim() const  
 {  
     IndexVector ret;  
     ret.push_back(m_N0);  
     ret.push_back(m_N1);  
     ret.push_back(m_N2);  
     return ret;  
 }  
   
 IndexVector Brick::getNumElementsPerDim() const  
 {  
     IndexVector ret;  
     ret.push_back(m_NE0);  
     ret.push_back(m_NE1);  
     ret.push_back(m_NE2);  
     return ret;  
 }  
   
 IndexVector Brick::getNumFacesPerBoundary() const  
 {  
     IndexVector ret(6, 0);  
     //left  
     if (m_offset0==0)  
         ret[0]=m_NE1*m_NE2;  
     //right  
     if (m_mpiInfo->rank%m_NX==m_NX-1)  
         ret[1]=m_NE1*m_NE2;  
     //bottom  
     if (m_offset1==0)  
         ret[2]=m_NE0*m_NE2;  
     //top  
     if (m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX==m_NY-1)  
         ret[3]=m_NE0*m_NE2;  
     //front  
     if (m_offset2==0)  
         ret[4]=m_NE0*m_NE1;  
     //back  
     if (m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY)==m_NZ-1)  
         ret[5]=m_NE0*m_NE1;  
     return ret;  
 }  
   
 IndexVector Brick::getNumSubdivisionsPerDim() const  
 {  
     IndexVector ret;  
     ret.push_back(m_NX);  
     ret.push_back(m_NY);  
     ret.push_back(m_NZ);  
     return ret;  
 }  
   
 pair<double,double> Brick::getFirstCoordAndSpacing(dim_t dim) const  
 {  
     if (dim==0)  
         return pair<double,double>(m_x0+(m_l0*m_offset0)/m_gNE0, m_l0/m_gNE0);  
     else if (dim==1)  
         return pair<double,double>(m_y0+(m_l1*m_offset1)/m_gNE1, m_l1/m_gNE1);  
     else if (dim==2)  
         return pair<double,double>(m_z0+(m_l2*m_offset2)/m_gNE2, m_l2/m_gNE2);  
   
     throw RipleyException("getFirstCoordAndSpacing: invalid argument");  
 }  
   
 //protected  
 dim_t Brick::getNumDOF() const  
 {  
     return (m_gNE0+1)/m_NX*(m_gNE1+1)/m_NY*(m_gNE2+1)/m_NZ;  
 }  
   
 //protected  
 dim_t Brick::getNumFaceElements() const  
 {  
     const IndexVector faces = getNumFacesPerBoundary();  
     dim_t n=0;  
     for (size_t i=0; i<faces.size(); i++)  
         n+=faces[i];  
     return n;  
 }  
1071    
1072  //protected  //protected
1073  void Brick::assembleCoordinates(escript::Data& arg) const  void Brick::assembleCoordinates(escript::Data& arg) const
# Line 853  void Brick::assembleCoordinates(escript: Line 1079  void Brick::assembleCoordinates(escript:
1079      if (!numSamplesEqual(&x, 1, getNumNodes()))      if (!numSamplesEqual(&x, 1, getNumNodes()))
1080          throw RipleyException("setToX: Illegal number of samples in Data object");          throw RipleyException("setToX: Illegal number of samples in Data object");
1081    
     pair<double,double> xdx = getFirstCoordAndSpacing(0);  
     pair<double,double> ydy = getFirstCoordAndSpacing(1);  
     pair<double,double> zdz = getFirstCoordAndSpacing(2);  
1082      arg.requireWrite();      arg.requireWrite();
1083  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel for
1084      for (dim_t i2 = 0; i2 < m_N2; i2++) {      for (dim_t i2 = 0; i2 < m_NN[2]; i2++) {
1085          for (dim_t i1 = 0; i1 < m_N1; i1++) {          for (dim_t i1 = 0; i1 < m_NN[1]; i1++) {
1086              for (dim_t i0 = 0; i0 < m_N0; i0++) {              for (dim_t i0 = 0; i0 < m_NN[0]; i0++) {
1087                  double* point = arg.getSampleDataRW(i0+m_N0*i1+m_N0*m_N1*i2);                  double* point = arg.getSampleDataRW(i0+m_NN[0]*i1+m_NN[0]*m_NN[1]*i2);
1088                  point[0] = xdx.first+i0*xdx.second;                  point[0] = getLocalCoordinate(i0, 0);
1089                  point[1] = ydy.first+i1*ydy.second;                  point[1] = getLocalCoordinate(i1, 1);
1090                  point[2] = zdz.first+i2*zdz.second;                  point[2] = getLocalCoordinate(i2, 2);
1091              }              }
1092          }          }
1093      }      }
# Line 874  void Brick::assembleCoordinates(escript: Line 1097  void Brick::assembleCoordinates(escript:
1097  void Brick::assembleGradient(escript::Data& out, escript::Data& in) const  void Brick::assembleGradient(escript::Data& out, escript::Data& in) const
1098  {  {
1099      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();
     const double h0 = m_l0/m_gNE0;  
     const double h1 = m_l1/m_gNE1;  
     const double h2 = m_l2/m_gNE2;  
1100      const double C0 = .044658198738520451079;      const double C0 = .044658198738520451079;
1101      const double C1 = .16666666666666666667;      const double C1 = .16666666666666666667;
1102      const double C2 = .21132486540518711775;      const double C2 = .21132486540518711775;
# Line 898  void Brick::assembleGradient(escript::Da Line 1118  void Brick::assembleGradient(escript::Da
1118              vector<double> f_110(numComp);              vector<double> f_110(numComp);
1119              vector<double> f_111(numComp);              vector<double> f_111(numComp);
1120  #pragma omp for  #pragma omp for
1121              for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {              for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1122                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1123                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1124                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1125                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1126                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1127                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1128                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1129                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1130                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1131                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1132                          double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE0,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE[0],m_NE[1]));
1133                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1134                              const double V0=((f_100[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_011[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;                              const double V0=((f_100[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_011[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / m_dx[0];
1135                              const double V1=((f_110[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_001[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / h0;                              const double V1=((f_110[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_001[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / m_dx[0];
1136                              const double V2=((f_101[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_010[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / h0;                              const double V2=((f_101[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_010[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / m_dx[0];
1137                              const double V3=((f_111[i]-f_011[i])*C5 + (f_100[i]-f_000[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;                              const double V3=((f_111[i]-f_011[i])*C5 + (f_100[i]-f_000[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / m_dx[0];
1138                              const double V4=((f_010[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_101[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;                              const double V4=((f_010[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_101[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[1];
1139                              const double V5=((f_110[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_001[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / h1;                              const double V5=((f_110[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_001[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / m_dx[1];
1140                              const double V6=((f_011[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_100[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / h1;                              const double V6=((f_011[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_100[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / m_dx[1];
1141                              const double V7=((f_111[i]-f_101[i])*C5 + (f_010[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;                              const double V7=((f_111[i]-f_101[i])*C5 + (f_010[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[1];
1142                              const double V8=((f_001[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_110[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;                              const double V8=((f_001[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_110[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[2];
1143                              const double V9=((f_101[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_010[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / h2;                              const double V9=((f_101[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_010[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / m_dx[2];
1144                              const double V10=((f_011[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_100[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / h2;                              const double V10=((f_011[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_100[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / m_dx[2];
1145                              const double V11=((f_111[i]-f_110[i])*C5 + (f_001[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;                              const double V11=((f_111[i]-f_110[i])*C5 + (f_001[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[2];
1146                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;
1147                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V4;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V4;
1148                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V8;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V8;
# Line 965  void Brick::assembleGradient(escript::Da Line 1185  void Brick::assembleGradient(escript::Da
1185              vector<double> f_110(numComp);              vector<double> f_110(numComp);
1186              vector<double> f_111(numComp);              vector<double> f_111(numComp);
1187  #pragma omp for  #pragma omp for
1188              for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {              for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1189                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1190                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1191                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1192                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1193                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1194                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1195                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1196                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1197                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1198                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1199                          double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE0,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE[0],m_NE[1]));
1200                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1201                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_010[i]-f_011[i])*C3 / h0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_010[i]-f_011[i])*C3 / m_dx[0];
1202                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_100[i]-f_101[i])*C3 / h1;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_100[i]-f_101[i])*C3 / m_dx[1];
1203                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]+f_101[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_010[i]-f_100[i]-f_110[i])*C3 / h2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]+f_101[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_010[i]-f_100[i]-f_110[i])*C3 / m_dx[2];
1204                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
1205                      } // end of k0 loop                      } // end of k0 loop
1206                  } // end of k1 loop                  } // end of k1 loop
# Line 1000  void Brick::assembleGradient(escript::Da Line 1220  void Brick::assembleGradient(escript::Da
1220              vector<double> f_111(numComp);              vector<double> f_111(numComp);
1221              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
1222  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1223                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1224                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1225                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1226                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1227                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1228                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1229                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1230                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1231                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1232                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1233                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1234                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1235                              const double V0=((f_010[i]-f_000[i])*C6 + (f_011[i]-f_001[i])*C2) / h1;                              const double V0=((f_010[i]-f_000[i])*C6 + (f_011[i]-f_001[i])*C2) / m_dx[1];
1236                              const double V1=((f_010[i]-f_000[i])*C2 + (f_011[i]-f_001[i])*C6) / h1;                              const double V1=((f_010[i]-f_000[i])*C2 + (f_011[i]-f_001[i])*C6) / m_dx[1];
1237                              const double V2=((f_001[i]-f_000[i])*C6 + (f_010[i]-f_011[i])*C2) / h2;                              const double V2=((f_001[i]-f_000[i])*C6 + (f_010[i]-f_011[i])*C2) / m_dx[2];
1238                              const double V3=((f_001[i]-f_000[i])*C2 + (f_011[i]-f_010[i])*C6) / h2;                              const double V3=((f_001[i]-f_000[i])*C2 + (f_011[i]-f_010[i])*C6) / m_dx[2];
1239                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = ((f_100[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_011[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = ((f_100[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_011[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / m_dx[0];
1240                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V0;
1241                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V2;
1242                              o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_001[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / h0;                              o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_001[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / m_dx[0];
1243                              o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V0;
1244                              o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V3;                              o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V3;
1245                              o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = ((f_101[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_010[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / h0;                              o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = ((f_101[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_010[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / m_dx[0];
1246                              o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V1;                              o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V1;
1247                              o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V2;                              o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V2;
1248                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_011[i])*C5 + (f_100[i]-f_000[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_011[i])*C5 + (f_100[i]-f_000[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / m_dx[0];
1249                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V1;                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V1;
1250                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V3;                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V3;
1251                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
# Line 1034  void Brick::assembleGradient(escript::Da Line 1254  void Brick::assembleGradient(escript::Da
1254              } // end of face 0              } // end of face 0
1255              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
1256  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1257                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1258                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1259                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1260                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1261                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1262                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1263                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1264                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1265                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1266                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1267                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1268                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1269                              const double V0=((f_110[i]-f_100[i])*C6 + (f_111[i]-f_101[i])*C2) / h1;                              const double V0=((f_110[i]-f_100[i])*C6 + (f_111[i]-f_101[i])*C2) / m_dx[1];
1270                              const double V1=((f_110[i]-f_100[i])*C2 + (f_111[i]-f_101[i])*C6) / h1;                              const double V1=((f_110[i]-f_100[i])*C2 + (f_111[i]-f_101[i])*C6) / m_dx[1];
1271                              const double V2=((f_101[i]-f_100[i])*C6 + (f_111[i]-f_110[i])*C2) / h2;                              const double V2=((f_101[i]-f_100[i])*C6 + (f_111[i]-f_110[i])*C2) / m_dx[2];
1272                              const double V3=((f_101[i]-f_100[i])*C2 + (f_111[i]-f_110[i])*C6) / h2;                              const double V3=((f_101[i]-f_100[i])*C2 + (f_111[i]-f_110[i])*C6) / m_dx[2];
1273                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = ((f_100[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_011[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = ((f_100[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_011[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / m_dx[0];
1274                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V0;
1275                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V2;
1276                              o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_001[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / h0;                              o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_001[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / m_dx[0];
1277                              o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V0;
1278                              o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V3;                              o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V3;
1279                              o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = ((f_101[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_010[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / h0;                              o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = ((f_101[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_010[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / m_dx[0];
1280                              o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V1;                              o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V1;
1281                              o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V2;                              o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V2;
1282                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_011[i])*C5 + (f_100[i]-f_000[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_011[i])*C5 + (f_100[i]-f_000[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / m_dx[0];
1283                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V1;                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V1;
1284                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V3;                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V3;
1285                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
# Line 1068  void Brick::assembleGradient(escript::Da Line 1288  void Brick::assembleGradient(escript::Da
1288              } // end of face 1              } // end of face 1
1289              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
1290  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1291                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1292                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1293                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1294                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1295                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1296                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1297                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1298                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1299                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1300                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1301                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1302                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1303                              const double V0=((f_100[i]-f_000[i])*C6 + (f_101[i]-f_001[i])*C2) / h0;                              const double V0=((f_100[i]-f_000[i])*C6 + (f_101[i]-f_001[i])*C2) / m_dx[0];
1304                              const double V1=((f_001[i]-f_000[i])*C6 + (f_101[i]-f_100[i])*C2) / h2;                              const double V1=((f_001[i]-f_000[i])*C6 + (f_101[i]-f_100[i])*C2) / m_dx[2];
1305                              const double V2=((f_001[i]-f_000[i])*C2 + (f_101[i]-f_100[i])*C6) / h2;                              const double V2=((f_001[i]-f_000[i])*C2 + (f_101[i]-f_100[i])*C6) / m_dx[2];
1306                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;
1307                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = ((f_010[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_101[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = ((f_010[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_101[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[1];
1308                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V1;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V1;
1309                              o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;
1310                              o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_001[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / h1;                              o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_001[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / m_dx[1];
1311                              o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V2;                              o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V2;
1312                              o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V0;
1313                              o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_100[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / h1;                              o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_100[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / m_dx[1];
1314                              o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V1;                              o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V1;
1315                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V0;
1316                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_101[i])*C5 + (f_010[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_101[i])*C5 + (f_010[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[1];
1317                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V2;                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V2;
1318                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
1319                      } // end of k0 loop                      } // end of k0 loop
# Line 1101  void Brick::assembleGradient(escript::Da Line 1321  void Brick::assembleGradient(escript::Da
1321              } // end of face 2              } // end of face 2
1322              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
1323  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1324                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1325                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1326                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-2,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-2,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1327                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-2,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-2,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1328                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1329                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1330                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-2,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-2,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1331                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-2,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-2,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1332                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1333                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1334                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1335                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1336                              const double V0=((f_110[i]-f_010[i])*C6 + (f_111[i]-f_011[i])*C2) / h0;                              const double V0=((f_110[i]-f_010[i])*C6 + (f_111[i]-f_011[i])*C2) / m_dx[0];
1337                              const double V1=((f_110[i]-f_010[i])*C2 + (f_111[i]-f_011[i])*C6) / h0;                              const double V1=((f_110[i]-f_010[i])*C2 + (f_111[i]-f_011[i])*C6) / m_dx[0];
1338                              const double V2=((f_011[i]-f_010[i])*C6 + (f_111[i]-f_110[i])*C2) / h2;                              const double V2=((f_011[i]-f_010[i])*C6 + (f_111[i]-f_110[i])*C2) / m_dx[2];
1339                              const double V3=((f_011[i]-f_010[i])*C2 + (f_111[i]-f_110[i])*C6) / h2;                              const double V3=((f_011[i]-f_010[i])*C2 + (f_111[i]-f_110[i])*C6) / m_dx[2];
1340                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;
1341                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = ((f_010[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_101[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = ((f_010[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_101[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[1];
1342                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V2;
1343                              o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;
1344                              o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_001[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / h1;                              o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_001[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / m_dx[1];
1345                              o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V3;                              o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V3;
1346                              o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V1;                              o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V1;
1347                              o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_100[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / h1;                              o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_100[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / m_dx[1];
1348                              o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V2;                              o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V2;
1349                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;
1350                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_101[i])*C5 + (f_010[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_101[i])*C5 + (f_010[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[1];
1351                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V3;                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V3;
1352                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
1353                      } // end of k0 loop                      } // end of k0 loop
# Line 1135  void Brick::assembleGradient(escript::Da Line 1355  void Brick::assembleGradient(escript::Da
1355              } // end of face 3              } // end of face 3
1356              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
1357  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1358                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1359                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1360                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1361                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1362                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1363                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1364                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1365                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1366                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1367                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1368                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1369                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1370                              const double V0=((f_100[i]-f_000[i])*C6 + (f_110[i]-f_010[i])*C2) / h0;                              const double V0=((f_100[i]-f_000[i])*C6 + (f_110[i]-f_010[i])*C2) / m_dx[0];
1371                              const double V1=((f_100[i]-f_000[i])*C2 + (f_110[i]-f_010[i])*C6) / h0;                              const double V1=((f_100[i]-f_000[i])*C2 + (f_110[i]-f_010[i])*C6) / m_dx[0];
1372                              const double V2=((f_010[i]-f_000[i])*C6 + (f_110[i]-f_100[i])*C2) / h1;                              const double V2=((f_010[i]-f_000[i])*C6 + (f_110[i]-f_100[i])*C2) / m_dx[1];
1373                              const double V3=((f_010[i]-f_000[i])*C2 + (f_110[i]-f_100[i])*C6) / h1;                              const double V3=((f_010[i]-f_000[i])*C2 + (f_110[i]-f_100[i])*C6) / m_dx[1];
1374                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;
1375                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V2;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V2;
1376                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = ((f_001[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_110[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = ((f_001[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_110[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[2];
1377                              o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;
1378                              o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V3;                              o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V3;
1379                              o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = ((f_101[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_010[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / h2;                              o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = ((f_101[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_010[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / m_dx[2];
1380                              o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V1;                              o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V1;
1381                              o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V2;                              o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V2;
1382                              o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_100[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / h2;                              o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_100[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / m_dx[2];
1383                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;
1384                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V3;                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V3;
1385                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_110[i])*C5 + (f_001[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_110[i])*C5 + (f_001[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[2];
1386                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
1387                      } // end of k0 loop                      } // end of k0 loop
1388                  } // end of k1 loop                  } // end of k1 loop
1389              } // end of face 4              } // end of face 4
1390              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
1391  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1392                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1393                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1394                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1395                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1396                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1397                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1398                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1399                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1400                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1401                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1402                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1403                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1404                              const double V0=((f_101[i]-f_001[i])*C6 + (f_111[i]-f_011[i])*C2) / h0;                              const double V0=((f_101[i]-f_001[i])*C6 + (f_111[i]-f_011[i])*C2) / m_dx[0];
1405                              const double V1=((f_101[i]-f_001[i])*C2 + (f_111[i]-f_011[i])*C6) / h0;                              const double V1=((f_101[i]-f_001[i])*C2 + (f_111[i]-f_011[i])*C6) / m_dx[0];
1406                              const double V2=((f_011[i]-f_001[i])*C6 + (f_111[i]-f_101[i])*C2) / h1;                              const double V2=((f_011[i]-f_001[i])*C6 + (f_111[i]-f_101[i])*C2) / m_dx[1];
1407                              const double V3=((f_011[i]-f_001[i])*C2 + (f_111[i]-f_101[i])*C6) / h1;                              const double V3=((f_011[i]-f_001[i])*C2 + (f_111[i]-f_101[i])*C6) / m_dx[1];
1408                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;
1409                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V2;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V2;
1410                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = ((f_001[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_110[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = ((f_001[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_110[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[2];
1411                              o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;
1412                              o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V3;                              o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V3;
1413                              o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_010[i])*C0 + (f_101[i]-f_100[i])*C5 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / h2;                              o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_010[i])*C0 + (f_101[i]-f_100[i])*C5 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / m_dx[2];
1414                              o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V1;                              o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V1;
1415                              o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V2;                              o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V2;
1416                              o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_100[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / h2;                              o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_100[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / m_dx[2];
1417                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;
1418                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V3;                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V3;
1419                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = ((f_001[i]-f_000[i])*C0 + (f_111[i]-f_110[i])*C5 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = ((f_001[i]-f_000[i])*C0 + (f_111[i]-f_110[i])*C5 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[2];
1420                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
1421                      } // end of k0 loop                      } // end of k0 loop
1422                  } // end of k1 loop                  } // end of k1 loop
# Line 1216  void Brick::assembleGradient(escript::Da Line 1436  void Brick::assembleGradient(escript::Da
1436              vector<double> f_111(numComp);              vector<double> f_111(numComp);
1437              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
1438  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1439                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1440                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1441                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1442                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1443                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1444                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1445                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1446                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1447                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1448                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1449                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1450                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1451                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_010[i]-f_011[i])*C3 / h0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_010[i]-f_011[i])*C3 / m_dx[0];
1452                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]-f_000[i]-f_001[i])*C4 / h1;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]-f_000[i]-f_001[i])*C4 / m_dx[1];
1453                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]-f_000[i]-f_010[i])*C4 / h2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]-f_000[i]-f_010[i])*C4 / m_dx[2];
1454                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
1455                      } // end of k1 loop                      } // end of k1 loop
1456                  } // end of k2 loop                  } // end of k2 loop
1457              } // end of face 0              } // end of face 0
1458              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
1459  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1460                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1461                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1462                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1463                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1464                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1465                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1466                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1467                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1468                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1469                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1470                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1471                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1472                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_010[i]-f_011[i])*C3 / h0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_010[i]-f_011[i])*C3 / m_dx[0];
1473                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_110[i]+f_111[i]-f_100[i]-f_101[i])*C4 / h1;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_110[i]+f_111[i]-f_100[i]-f_101[i])*C4 / m_dx[1];
1474                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_101[i]+f_111[i]-f_100[i]-f_110[i])*C4 / h2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_101[i]+f_111[i]-f_100[i]-f_110[i])*C4 / m_dx[2];
1475                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
1476                      } // end of k1 loop                      } // end of k1 loop
1477                  } // end of k2 loop                  } // end of k2 loop
1478              } // end of face 1              } // end of face 1
1479              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
1480  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1481                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1482                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1483                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1484                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1485                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1486                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1487                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1488                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1489                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1490                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1491                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1492                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1493                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]-f_000[i]-f_001[i])*C4 / h0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]-f_000[i]-f_001[i])*C4 / m_dx[0];
1494                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_100[i]-f_101[i])*C3 / h1;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_100[i]-f_101[i])*C3 / m_dx[1];
1495                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_101[i]-f_000[i]-f_100[i])*C4 / h2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_101[i]-f_000[i]-f_100[i])*C4 / m_dx[2];
1496                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
1497                      } // end of k0 loop                      } // end of k0 loop
1498                  } // end of k2 loop                  } // end of k2 loop
1499              } // end of face 2              } // end of face 2
1500              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
1501  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1502                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1503                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1504                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-2,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-2,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1505                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-2,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-2,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1506                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1507                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1508                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-2,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-2,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1509                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-2,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-2,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1510                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1511                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1512                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1513                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1514                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_110[i]+f_111[i]-f_010[i]-f_011[i])*C4 / h0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_110[i]+f_111[i]-f_010[i]-f_011[i])*C4 / m_dx[0];
1515                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_100[i]-f_101[i])*C3 / h1;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_100[i]-f_101[i])*C3 / m_dx[1];
1516                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_011[i]+f_111[i]-f_010[i]-f_110[i])*C4 / h2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_011[i]+f_111[i]-f_010[i]-f_110[i])*C4 / m_dx[2];
1517                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
1518                      } // end of k0 loop                      } // end of k0 loop
1519                  } // end of k2 loop                  } // end of k2 loop
1520              } // end of face 3              } // end of face 3
1521              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
1522  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1523                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1524                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1525                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1526                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1527                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1528                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1529                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1530                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1531                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1532                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1533                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1534                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1535                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_110[i]-f_000[i]-f_010[i])*C4 / h0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_110[i]-f_000[i]-f_010[i])*C4 / m_dx[0];
1536                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_110[i]-f_000[i]-f_100[i])*C4 / h1;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_110[i]-f_000[i]-f_100[i])*C4 / m_dx[1];
1537                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]+f_101[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_010[i]-f_100[i]-f_110[i])*C4 / h2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]+f_101[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_010[i]-f_100[i]-f_110[i])*C4 / m_dx[2];
1538                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
1539                      } // end of k0 loop                      } // end of k0 loop
1540                  } // end of k1 loop                  } // end of k1 loop
1541              } // end of face 4              } // end of face 4
1542              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
1543  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1544                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1545                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1546                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1547                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1548                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1549                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1550                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1551                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1552                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1553                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1554                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1555                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1556                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_101[i]+f_111[i]-f_001[i]-f_011[i])*C4 / h0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_101[i]+f_111[i]-f_001[i]-f_011[i])*C4 / m_dx[0];
1557                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_011[i]+f_111[i]-f_001[i]-f_101[i])*C4 / h1;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_011[i]+f_111[i]-f_001[i]-f_101[i])*C4 / m_dx[1];
1558                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]+f_101[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_010[i]-f_100[i]-f_110[i])*C3 / h2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]+f_101[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_010[i]-f_100[i]-f_110[i])*C3 / m_dx[2];
1559                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
1560                      } // end of k0 loop                      } // end of k0 loop
1561                  } // end of k1 loop                  } // end of k1 loop
# Line 1348  void Brick::assembleGradient(escript::Da Line 1568  void Brick::assembleGradient(escript::Da
1568  void Brick::assembleIntegrate(vector<double>& integrals, escript::Data& arg) const  void Brick::assembleIntegrate(vector<double>& integrals, escript::Data& arg) const
1569  {  {
1570      const dim_t numComp = arg.getDataPointSize();      const dim_t numComp = arg.getDataPointSize();
1571      const double h0 = m_l0/m_gNE0;      const index_t left = (m_offset[0]==0 ? 0 : 1);
1572      const double h1 = m_l1/m_gNE1;      const index_t bottom = (m_offset[1]==0 ? 0 : 1);
1573      const double h2 = m_l2/m_gNE2;      const index_t front = (m_offset[2]==0 ? 0 : 1);
     const index_t left = (m_offset0==0 ? 0 : 1);  
     const index_t bottom = (m_offset1==0 ? 0 : 1);  
     const index_t front = (m_offset2==0 ? 0 : 1);  
1574      const int fs = arg.getFunctionSpace().getTypeCode();      const int fs = arg.getFunctionSpace().getTypeCode();
1575      if (fs == Elements && arg.actsExpanded()) {      if (fs == Elements && arg.actsExpanded()) {
1576          const double w_0 = h0*h1*h2/8.;          const double w_0 = m_dx[0]*m_dx[1]*m_dx[2]/8.;
1577  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1578          {          {
1579              vector<double> int_local(numComp, 0);              vector<double> int_local(numComp, 0);
1580  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1581              for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE2; ++k2) {              for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1582                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1583                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1584                          const double* f = arg.getSampleDataRO(INDEX3(k0, k1, k2, m_NE0, m_NE1));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(INDEX3(k0, k1, k2, m_NE[0], m_NE[1]));
1585                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1586                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1587                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
# Line 1386  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou Line 1603  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou
1603          } // end of parallel section          } // end of parallel section
1604    
1605      } else if (fs==ReducedElements || (fs==Elements && !arg.actsExpanded())) {      } else if (fs==ReducedElements || (fs==Elements && !arg.actsExpanded())) {
1606          const double w_0 = h0*h1*h2;          const double w_0 = m_dx[0]*m_dx[1]*m_dx[2];
1607  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1608          {          {
1609              vector<double> int_local(numComp, 0);              vector<double> int_local(numComp, 0);
1610  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1611              for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE2; ++k2) {              for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1612                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1613                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1614                          const double* f = arg.getSampleDataRO(INDEX3(k0, k1, k2, m_NE0, m_NE1));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(INDEX3(k0, k1, k2, m_NE[0], m_NE[1]));
1615                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1616                              int_local[i]+=f[i]*w_0;                              int_local[i]+=f[i]*w_0;
1617                          }  // end of component loop i                          }  // end of component loop i
# Line 1408  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou Line 1625  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou
1625          } // end of parallel section          } // end of parallel section
1626    
1627      } else if (fs == FaceElements && arg.actsExpanded()) {      } else if (fs == FaceElements && arg.actsExpanded()) {
1628          const double w_0 = h1*h2/4.;          const double w_0 = m_dx[1]*m_dx[2]/4.;
1629          const double w_1 = h0*h2/4.;          const double w_1 = m_dx[0]*m_dx[2]/4.;
1630          const double w_2 = h0*h1/4.;          const double w_2 = m_dx[0]*m_dx[1]/4.;
1631  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1632          {          {
1633              vector<double> int_local(numComp, 0);              vector<double> int_local(numComp, 0);
1634              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
1635  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1636                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1637                      for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1638                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1639                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1640                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1641                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
# Line 1432  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou Line 1649  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou
1649    
1650              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
1651  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1652                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1653                      for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1654                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1655                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1656                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1657                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
# Line 1448  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou Line 1665  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou
1665    
1666              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
1667  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1668                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1669                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1670                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1671                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1672                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1673                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
# Line 1464  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou Line 1681  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou
1681    
1682              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
1683  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1684                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1685                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1686                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1687                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1688                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1689                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
# Line 1480  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou Line 1697  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou
1697    
1698              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
1699  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1700                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1701                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1702                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1703                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1704                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1705                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
# Line 1496  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou Line 1713  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou
1713    
1714              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
1715  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1716                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1717                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1718                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1719                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1720                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1721                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
# Line 1516  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou Line 1733  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou
1733          } // end of parallel section          } // end of parallel section
1734    
1735      } else if (fs==ReducedFaceElements || (fs==FaceElements && !arg.actsExpanded())) {      } else if (fs==ReducedFaceElements || (fs==FaceElements && !arg.actsExpanded())) {
1736          const double w_0 = h1*h2;          const double w_0 = m_dx[1]*m_dx[2];
1737          const double w_1 = h0*h2;          const double w_1 = m_dx[0]*m_dx[2];
1738          const double w_2 = h0*h1;          const double w_2 = m_dx[0]*m_dx[1];
1739  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1740          {          {
1741              vector<double> int_local(numComp, 0);              vector<double> int_local(numComp, 0);
1742              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
1743  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1744                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1745                      for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1746                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1747                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1748                              int_local[i]+=f[i]*w_0;                              int_local[i]+=f[i]*w_0;
1749                          }  // end of component loop i                          }  // end of component loop i
# Line 1536  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou Line 1753  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou
1753    
1754              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
1755  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1756                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1757                      for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1758                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1759                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1760                              int_local[i]+=f[i]*w_0;                              int_local[i]+=f[i]*w_0;
1761                          }  // end of component loop i                          }  // end of component loop i
# Line 1548  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou Line 1765  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou
1765    
1766              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
1767  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1768                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1769                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1770                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1771                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1772                              int_local[i]+=f[i]*w_1;                              int_local[i]+=f[i]*w_1;
1773                          }  // end of component loop i                          }  // end of component loop i
# Line 1560  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou Line 1777  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou
1777    
1778              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
1779  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1780                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1781                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1782                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1783                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1784                              int_local[i]+=f[i]*w_1;                              int_local[i]+=f[i]*w_1;
1785                          }  // end of component loop i                          }  // end of component loop i
# Line 1572  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou Line 1789  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou
1789    
1790              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
1791  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1792                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1793                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1794                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1795                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1796                              int_local[i]+=f[i]*w_2;                              int_local[i]+=f[i]*w_2;
1797                          }  // end of component loop i                          }  // end of component loop i
# Line 1584  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou Line 1801  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou
1801    
1802              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
1803  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1804                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1805                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1806                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1807                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1808                              int_local[i]+=f[i]*w_2;                              int_local[i]+=f[i]*w_2;
1809                          }  // end of component loop i                          }  // end of component loop i
# Line 1604  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou Line 1821  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou
1821  //protected  //protected
1822  dim_t Brick::insertNeighbourNodes(IndexVector& index, index_t node) const  dim_t Brick::insertNeighbourNodes(IndexVector& index, index_t node) const
1823  {  {
1824      const dim_t nDOF0 = (m_gNE0+1)/m_NX;      const dim_t nDOF0 = (m_gNE[0]+1)/m_NX[0];
1825      const dim_t nDOF1 = (m_gNE1+1)/m_NY;      const dim_t nDOF1 = (m_gNE[1]+1)/m_NX[1];
1826      const dim_t nDOF2 = (m_gNE2+1)/m_NZ;      const dim_t nDOF2 = (m_gNE[2]+1)/m_NX[2];
1827      const int x=node%nDOF0;      const int x=node%nDOF0;
1828      const int y=node%(nDOF0*nDOF1)/nDOF0;      const int y=node%(nDOF0*nDOF1)/nDOF0;
1829      const int z=node/(nDOF0*nDOF1);      const int z=node/(nDOF0*nDOF1);
# Line 1641  void Brick::nodesToDOF(escript::Data& ou Line 1858  void Brick::nodesToDOF(escript::Data& ou
1858      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();
1859      out.requireWrite();      out.requireWrite();
1860    
1861      const index_t left = (m_offset0==0 ? 0 : 1);      const index_t left = (m_offset[0]==0 ? 0 : 1);
1862      const index_t bottom = (m_offset1==0 ? 0 : 1);      const index_t bottom = (m_offset[1]==0 ? 0 : 1);
1863      const index_t front = (m_offset2==0 ? 0 : 1);      const index_t front = (m_offset[2]==0 ? 0 : 1);
1864      const dim_t nDOF0 = (m_gNE0+1)/m_NX;      const dim_t nDOF0 = (m_gNE[0]+1)/m_NX[0];
1865      const dim_t nDOF1 = (m_gNE1+1)/m_NY;      const dim_t nDOF1 = (m_gNE[1]+1)/m_NX[1];
1866      const dim_t nDOF2 = (m_gNE2+1)/m_NZ;      const dim_t nDOF2 = (m_gNE[2]+1)/m_NX[2];
1867  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel for
1868      for (index_t i=0; i<nDOF2; i++) {      for (index_t i=0; i<nDOF2; i++) {
1869          for (index_t j=0; j<nDOF1; j++) {          for (index_t j=0; j<nDOF1; j++) {
1870              for (index_t k=0; k<nDOF0; k++) {              for (index_t k=0; k<nDOF0; k++) {
1871                  const index_t n=k+left+(j+bottom)*m_N0+(i+front)*m_N0*m_N1;                  const index_t n=k+left+(j+bottom)*m_NN[0]+(i+front)*m_NN[0]*m_NN[1];
1872                  const double* src=in.getSampleDataRO(n);                  const double* src=in.getSampleDataRO(n);
1873                  copy(src, src+numComp, out.getSampleDataRW(k+j*nDOF0+i*nDOF0*nDOF1));                  copy(src, src+numComp, out.getSampleDataRW(k+j*nDOF0+i*nDOF0*nDOF1));
1874              }              }
# Line 1678  void Brick::dofToNodes(escript::Data& ou Line 1895  void Brick::dofToNodes(escript::Data& ou
1895                  : &buffer[(m_dofMap[i]-numDOF)*numComp]);                  : &buffer[(m_dofMap[i]-numDOF)*numComp]);
1896          copy(src, src+numComp, out.getSampleDataRW(i));          copy(src, src+numComp, out.getSampleDataRW(i));
1897      }      }
1898        Paso_Coupler_free(coupler);
1899  }  }
1900    
1901  //private  //private
1902  void Brick::populateSampleIds()  void Brick::populateSampleIds()
1903  {  {
1904      // identifiers are ordered from left to right, bottom to top, front to back      // degrees of freedom are numbered from left to right, bottom to top, front
1905      // globally      // to back in each rank, continuing on the next rank (ranks also go
1906        // left-right, bottom-top, front-back).
1907        // This means rank 0 has id 0...n0-1, rank 1 has id n0...n1-1 etc. which
1908        // helps when writing out data rank after rank.
1909    
1910      // build node distribution vector first.      // build node distribution vector first.
1911      // rank i owns m_nodeDistribution[i+1]-nodeDistribution[i] nodes which is      // rank i owns m_nodeDistribution[i+1]-nodeDistribution[i] nodes which is
# Line 1698  void Brick::populateSampleIds() Line 1919  void Brick::populateSampleIds()
1919      m_nodeId.resize(getNumNodes());      m_nodeId.resize(getNumNodes());
1920      m_dofId.resize(numDOF);      m_dofId.resize(numDOF);
1921      m_elementId.resize(getNumElements());      m_elementId.resize(getNumElements());
1922    
1923        // populate face element counts
1924        //left
1925        if (m_offset[0]==0)
1926            m_faceCount[0]=m_NE[1]*m_NE[2];
1927        else
1928            m_faceCount[0]=0;
1929        //right
1930        if (m_mpiInfo->rank%m_NX[0]==m_NX[0]-1)
1931            m_faceCount[1]=m_NE[1]*m_NE[2];
1932        else
1933            m_faceCount[1]=0;
1934        //bottom
1935        if (m_offset[1]==0)
1936            m_faceCount[2]=m_NE[0]*m_NE[2];
1937        else
1938            m_faceCount[2]=0;
1939        //top
1940        if (m_mpiInfo->rank%(m_NX[0]*m_NX[1])/m_NX[0]==m_NX[1]-1)
1941            m_faceCount[3]=m_NE[0]*m_NE[2];
1942        else
1943            m_faceCount[3]=0;
1944        //front
1945        if (m_offset[2]==0)
1946            m_faceCount[4]=m_NE[0]*m_NE[1];
1947        else
1948            m_faceCount[4]=0;
1949        //back
1950        if (m_mpiInfo->rank/(m_NX[0]*m_NX[1])==m_NX[2]-1)
1951            m_faceCount[5]=m_NE[0]*m_NE[1];
1952        else
1953            m_faceCount[5]=0;
1954    
1955      m_faceId.resize(getNumFaceElements());      m_faceId.resize(getNumFaceElements());
1956    
1957        const index_t left = (m_offset[0]==0 ? 0 : 1);
1958        const index_t bottom = (m_offset[1]==0 ? 0 : 1);
1959        const index_t front = (m_offset[2]==0 ? 0 : 1);
1960        const dim_t nDOF0 = (m_gNE[0]+1)/m_NX[0];
1961        const dim_t nDOF1 = (m_gNE[1]+1)/m_NX[1];
1962        const dim_t nDOF2 = (m_gNE[2]+1)/m_NX[2];
1963    
1964        // the following is a compromise between efficiency and code length to
1965        // set the node id's according to the order mentioned above.
1966        // First we set all the edge and corner id's in a rather slow way since
1967        // they might or might not be owned by this rank. Next come the own
1968        // node id's which are identical to the DOF id's (simple loop), and finally
1969        // the 6 faces are set but only if required...
1970    
1971    #define globalNodeId(x,y,z) \
1972        ((m_offset[0]+x)/nDOF0)*nDOF0*nDOF1*nDOF2+(m_offset[0]+x)%nDOF0\
1973        + ((m_offset[1]+y)/nDOF1)*nDOF0*nDOF1*nDOF2*m_NX[0]+((m_offset[1]+y)%nDOF1)*nDOF0\
1974        + ((m_offset[2]+z)/nDOF2)*nDOF0*nDOF1*nDOF2*m_NX[0]*m_NX[1]+((m_offset[2]+z)%nDOF2)*nDOF0*nDOF1
1975    
1976  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1977      {      {
1978            // set edge id's
1979            // edges in x-direction, including corners
1980  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1981          // nodes          for (dim_t i=0; i<m_NN[0]; i++) {
1982          for (dim_t i2=0; i2<m_N2; i2++) {              m_nodeId[i] = globalNodeId(i, 0, 0); // LF
1983              for (dim_t i1=0; i1<m_N1; i1++) {              m_nodeId[m_NN[0]*(m_NN[1]-1)+i] = globalNodeId(i, m_NN[1]-1, 0); // UF
1984                  for (dim_t i0=0; i0<m_N0; i0++) {              m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1)+i] = globalNodeId(i, 0, m_NN[2]-1); // LB
1985                      m_nodeId[i0+i1*m_N0+i2*m_N0*m_N1] =              m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*m_NN[2]-m_NN[0]+i] = globalNodeId(i, m_NN[1]-1, m_NN[2]-1); // UB
1986                          (m_offset2+i2)*(m_gNE0+1)*(m_gNE1+1)          }
1987                          +(m_offset1+i1)*(m_gNE0+1)          // edges in y-direction, without corners
1988                          +m_offset0+i0;  #pragma omp for nowait
1989            for (dim_t i=1; i<m_NN[1]-1; i++) {
1990                m_nodeId[m_NN[0]*i] = globalNodeId(0, i, 0); // FL
1991                m_nodeId[m_NN[0]*(i+1)-1] = globalNodeId(m_NN[0]-1, i, 0); // FR
1992                m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1)+m_NN[0]*i] = globalNodeId(0, i, m_NN[2]-1); // BL
1993                m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1)+m_NN[0]*(i+1)-1] = globalNodeId(m_NN[0]-1, i, m_NN[2]-1); // BR
1994            }
1995            // edges in z-direction, without corners
1996    #pragma omp for
1997            for (dim_t i=1; i<m_NN[2]-1; i++) {
1998                m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*i] = globalNodeId(0, 0, i); // LL
1999                m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*i+m_NN[0]-1] = globalNodeId(m_NN[0]-1, 0, i); // LR
2000                m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*(i+1)-m_NN[0]] = globalNodeId(0, m_NN[1]-1, i); // UL
2001                m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*(i+1)-1] = globalNodeId(m_NN[0]-1, m_NN[1]-1, i); // UR
2002            }
2003            // implicit barrier here because some node IDs will be overwritten
2004            // below
2005    
2006            // populate degrees of freedom and own nodes (identical id)
2007    #pragma omp for nowait
2008            for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++) {
2009                for (dim_t j=0; j<nDOF1; j++) {
2010                    for (dim_t k=0; k<nDOF0; k++) {
2011                        const index_t nodeIdx=k+left+(j+bottom)*m_NN[0]+(i+front)*m_NN[0]*m_NN[1];
2012                        const index_t dofIdx=k+j*nDOF0+i*nDOF0*nDOF1;
2013                        m_dofId[dofIdx] = m_nodeId[nodeIdx]
2014                            = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank]+dofIdx;
2015                  }                  }
2016              }              }
2017          }          }
2018    
2019          // degrees of freedom          // populate the rest of the nodes (shared with other ranks)
2020            if (m_faceCount[0]==0) { // left plane
2021    #pragma omp for nowait
2022                for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++) {
2023                    for (dim_t j=0; j<nDOF1; j++) {
2024                        const index_t nodeIdx=(j+bottom)*m_NN[0]+(i+front)*m_NN[0]*m_NN[1];
2025                        const index_t dofId=(j+1)*nDOF0-1+i*nDOF0*nDOF1;
2026                        m_nodeId[nodeIdx]
2027                            = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank-1]+dofId;
2028                    }
2029                }
2030            }
2031            if (m_faceCount[1]==0) { // right plane
2032  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2033          for (dim_t k=0; k<numDOF; k++)              for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++) {
2034              m_dofId[k] = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank]+k;                  for (dim_t j=0; j<nDOF1; j++) {
2035                        const index_t nodeIdx=(j+bottom+1)*m_NN[0]-1+(i+front)*m_NN[0]*m_NN[1];
2036                        const index_t dofId=j*nDOF0+i*nDOF0*nDOF1;
2037                        m_nodeId[nodeIdx]
2038                            = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank+1]+dofId;
2039                    }
2040                }
2041            }
2042            if (m_faceCount[2]==0) { // bottom plane
2043    #pragma omp for nowait
2044                for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++) {
2045                    for (dim_t k=0; k<nDOF0; k++) {
2046                        const index_t nodeIdx=k+left+(i+front)*m_NN[0]*m_NN[1];
2047                        const index_t dofId=nDOF0*(nDOF1-1)+k+i*nDOF0*nDOF1;
2048                        m_nodeId[nodeIdx]
2049                            = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank-m_NX[0]]+dofId;
2050                    }
2051                }
2052            }
2053            if (m_faceCount[3]==0) { // top plane
2054    #pragma omp for nowait
2055                for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++) {
2056                    for (dim_t k=0; k<nDOF0; k++) {
2057                        const index_t nodeIdx=k+left+(i+front)*m_NN[0]*m_NN[1]+m_NN[0]*(m_NN[1]-1);
2058                        const index_t dofId=k+i*nDOF0*nDOF1;
2059                        m_nodeId[nodeIdx]
2060                            = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank+m_NX[0]]+dofId;
2061                    }
2062                }
2063            }
2064            if (m_faceCount[4]==0) { // front plane
2065    #pragma omp for nowait
2066                for (dim_t j=0; j<nDOF1; j++) {
2067                    for (dim_t k=0; k<nDOF0; k++) {
2068                        const index_t nodeIdx=k+left+(j+bottom)*m_NN[0];
2069                        const index_t dofId=k+j*nDOF0+nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);
2070                        m_nodeId[nodeIdx]
2071                            = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank-m_NX[0]*m_NX[1]]+dofId;
2072                    }
2073                }
2074            }
2075            if (m_faceCount[5]==0) { // back plane
2076    #pragma omp for nowait
2077                for (dim_t j=0; j<nDOF1; j++) {
2078                    for (dim_t k=0; k<nDOF0; k++) {
2079                        const index_t nodeIdx=k+left+(j+bottom)*m_NN[0]+m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1);
2080                        const index_t dofId=k+j*nDOF0;
2081                        m_nodeId[nodeIdx]
2082                            = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank+m_NX[0]*m_NX[1]]+dofId;
2083                    }
2084                }
2085            }
2086    
2087          // elements          // populate element id's
2088  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2089          for (dim_t i2=0; i2<m_NE2; i2++) {          for (dim_t i2=0; i2<m_NE[2]; i2++) {
2090              for (dim_t i1=0; i1<m_NE1; i1++) {              for (dim_t i1=0; i1<m_NE[1]; i1++) {
2091                  for (dim_t i0=0; i0<m_NE0; i0++) {                  for (dim_t i0=0; i0<m_NE[0]; i0++) {
2092                      m_elementId[i0+i1*m_NE0+i2*m_NE0*m_NE1] =                      m_elementId[i0+i1*m_NE[0]+i2*m_NE[0]*m_NE[1]] =
2093                          (m_offset2+i2)*m_gNE0*m_gNE1                          (m_offset[2]+i2)*m_gNE[0]*m_gNE[1]
2094                          +(m_offset1+i1)*m_gNE0                          +(m_offset[1]+i1)*m_gNE[0]
2095                          +m_offset0+i0;                          +m_offset[0]+i0;
2096                  }                  }
2097              }              }
2098          }          }
# Line 1739  void Brick::populateSampleIds() Line 2103  void Brick::populateSampleIds()
2103              m_faceId[k]=k;              m_faceId[k]=k;
2104      } // end parallel section      } // end parallel section
2105    
2106    #undef globalNodeId
2107    
2108      m_nodeTags.assign(getNumNodes(), 0);      m_nodeTags.assign(getNumNodes(), 0);
2109      updateTagsInUse(Nodes);      updateTagsInUse(Nodes);
2110    
# Line 1746  void Brick::populateSampleIds() Line 2112  void Brick::populateSampleIds()
2112      updateTagsInUse(Elements);      updateTagsInUse(Elements);
2113    
2114      // generate face offset vector and set face tags      // generate face offset vector and set face tags
     const IndexVector facesPerEdge = getNumFacesPerBoundary();  
2115      const index_t LEFT=1, RIGHT=2, BOTTOM=10, TOP=20, FRONT=100, BACK=200;      const index_t LEFT=1, RIGHT=2, BOTTOM=10, TOP=20, FRONT=100, BACK=200;
2116      const index_t faceTag[] = { LEFT, RIGHT, BOTTOM, TOP, FRONT, BACK };      const index_t faceTag[] = { LEFT, RIGHT, BOTTOM, TOP, FRONT, BACK };
2117      m_faceOffset.assign(facesPerEdge.size(), -1);      m_faceOffset.assign(6, -1);
2118      m_faceTags.clear();      m_faceTags.clear();
2119      index_t offset=0;      index_t offset=0;
2120      for (size_t i=0; i<facesPerEdge.size(); i++) {      for (size_t i=0; i<6; i++) {
2121          if (facesPerEdge[i]>0) {          if (m_faceCount[i]>0) {
2122              m_faceOffset[i]=offset;              m_faceOffset[i]=offset;
2123              offset+=facesPerEdge[i];              offset+=m_faceCount[i];
2124              m_faceTags.insert(m_faceTags.end(), facesPerEdge[i], faceTag[i]);              m_faceTags.insert(m_faceTags.end(), m_faceCount[i], faceTag[i]);
2125          }          }
2126      }      }
2127      setTagMap("left", LEFT);      setTagMap("left", LEFT);
# Line 1771  void Brick::populateSampleIds() Line 2136  void Brick::populateSampleIds()
2136  //private  //private
2137  void Brick::createPattern()  void Brick::createPattern()
2138  {  {
2139      const dim_t nDOF0 = (m_gNE0+1)/m_NX;      const dim_t nDOF0 = (m_gNE[0]+1)/m_NX[0];
2140      const dim_t nDOF1 = (m_gNE1+1)/m_NY;      const dim_t nDOF1 = (m_gNE[1]+1)/m_NX[1];
2141      const dim_t nDOF2 = (m_gNE2+1)/m_NZ;      const dim_t nDOF2 = (m_gNE[2]+1)/m_NX[2];
2142      const index_t left = (m_offset0==0 ? 0 : 1);      const index_t left = (m_offset[0]==0 ? 0 : 1);
2143      const index_t bottom = (m_offset1==0 ? 0 : 1);      const index_t bottom = (m_offset[1]==0 ? 0 : 1);
2144      const index_t front = (m_offset2==0 ? 0 : 1);      const index_t front = (m_offset[2]==0 ? 0 : 1);
2145    
2146      // populate node->DOF mapping with own degrees of freedom.      // populate node->DOF mapping with own degrees of freedom.
2147      // The rest is assigned in the loop further down      // The rest is assigned in the loop further down
# Line 1785  void Brick::createPattern() Line 2150  void Brick::createPattern()
2150      for (index_t i=front; i<front+nDOF2; i++) {      for (index_t i=front; i<front+nDOF2; i++) {
2151          for (index_t j=bottom; j<bottom+nDOF1; j++) {          for (index_t j=bottom; j<bottom+nDOF1; j++) {
2152              for (index_t k=left; k<left+nDOF0; k++) {              for (index_t k=left; k<left+nDOF0; k++) {
2153                  m_dofMap[i*m_N0*m_N1+j*m_N0+k]=(i-front)*nDOF0*nDOF1+(j-bottom)*nDOF0+k-left;                  m_dofMap[i*m_NN[0]*m_NN[1]+j*m_NN[0]+k]=(i-front)*nDOF0*nDOF1+(j-bottom)*nDOF0+k-left;
2154              }              }
2155          }          }
2156      }      }
# Line 1799  void Brick::createPattern() Line 2164  void Brick::createPattern()
2164      IndexVector offsetInShared(1,0);      IndexVector offsetInShared(1,0);
2165      IndexVector sendShared, recvShared;      IndexVector sendShared, recvShared;
2166      int numShared=0;      int numShared=0;
2167      const int x=m_mpiInfo->rank%m_NX;      const int x=m_mpiInfo->rank%m_NX[0];
2168      const int y=m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX;      const int y=m_mpiInfo->rank%(m_NX[0]*m_NX[1])/m_NX[0];
2169      const int z=m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY);      const int z=m_mpiInfo->rank/(m_NX[0]*m_NX[1]);
2170      for (int i2=-1; i2<2; i2++) {      for (int i2=-1; i2<2; i2++) {
2171          for (int i1=-1; i1<2; i1++) {          for (int i1=-1; i1<2; i1++) {
2172              for (int i0=-1; i0<2; i0++) {              for (int i0=-1; i0<2; i0++) {
# Line 1812  void Brick::createPattern() Line 2177  void Brick::createPattern()
2177                  const int nx=x+i0;                  const int nx=x+i0;
2178                  const int ny=y+i1;                  const int ny=y+i1;
2179                  const int nz=z+i2;                  const int nz=z+i2;
2180                  if (nx>=0 && ny>=0 && nz>=0 && nx<m_NX && ny<m_NY && nz<m_NZ) {                  if (nx>=0 && ny>=0 && nz>=0 && nx<m_NX[0] && ny<m_NX[1] && nz<m_NX[2]) {
2181                      neighbour.push_back(nz*m_NX*m_NY+ny*m_NX+nx);                      neighbour.push_back(nz*m_NX[0]*m_NX[1]+ny*m_NX[0]+nx);
2182                      if (i0==0 && i1==0) {                      if (i0==0 && i1==0) {
2183                          // sharing front or back plane                          // sharing front or back plane
2184                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF0*nDOF1);                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF0*nDOF1);
2185                          for (dim_t i=0; i<nDOF1; i++) {                          for (dim_t i=0; i<nDOF1; i++) {
2186                              const int firstDOF=(i2==-1 ? i*nDOF0                              const int firstDOF=(i2==-1 ? i*nDOF0
2187                                      : i*nDOF0 + nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1));                                      : i*nDOF0 + nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1));
2188                              const int firstNode=(i2==-1 ? left+(i+bottom)*m_N0                              const int firstNode=(i2==-1 ? left+(i+bottom)*m_NN[0]
2189                                      : left+(i+bottom)*m_N0+m_N0*m_N1*(m_N2-1));                                      : left+(i+bottom)*m_NN[0]+m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1));
2190                              for (dim_t j=0; j<nDOF0; j++, numShared++) {                              for (dim_t j=0; j<nDOF0; j++, numShared++) {
2191                                  sendShared.push_back(firstDOF+j);                                  sendShared.push_back(firstDOF+j);
2192                                  recvShared.push_back(numDOF+numShared);                                  recvShared.push_back(numDOF+numShared);
# Line 1854  void Brick::createPattern() Line 2219  void Brick::createPattern()
2219                              const int firstDOF=(i1==-1 ? i*nDOF0*nDOF1                              const int firstDOF=(i1==-1 ? i*nDOF0*nDOF1
2220                                      : nDOF0*((i+1)*nDOF1-1));                                      : nDOF0*((i+1)*nDOF1-1));
2221                              const int firstNode=(i1==-1 ?                              const int firstNode=(i1==-1 ?
2222                                      left+(i+front)*m_N0*m_N1                                      left+(i+front)*m_NN[0]*m_NN[1]
2223                                      : left+m_N0*((i+1+front)*m_N1-1));                                      : left+m_NN[0]*((i+1+front)*m_NN[1]-1));
2224                              for (dim_t j=0; j<nDOF0; j++, numShared++) {                              for (dim_t j=0; j<nDOF0; j++, numShared++) {
2225                                  sendShared.push_back(firstDOF+j);                                  sendShared.push_back(firstDOF+j);
2226                                  recvShared.push_back(numDOF+numShared);                                  recvShared.push_back(numDOF+numShared);
# Line 1888  void Brick::createPattern() Line 2253  void Brick::createPattern()
2253                              const int firstDOF=(i0==-1 ? i*nDOF0*nDOF1                              const int firstDOF=(i0==-1 ? i*nDOF0*nDOF1
2254                                      : nDOF0*(1+i*nDOF1)-1);                                      : nDOF0*(1+i*nDOF1)-1);
2255                              const int firstNode=(i0==-1 ?                              const int firstNode=(i0==-1 ?
2256                                      (bottom+(i+front)*m_N1)*m_N0                                      (bottom+(i+front)*m_NN[1])*m_NN[0]
2257                                      : (bottom+1+(i+front)*m_N1)*m_N0-1);                                      : (bottom+1+(i+front)*m_NN[1])*m_NN[0]-1);
2258                              for (dim_t j=0; j<nDOF1; j++, numShared++) {                              for (dim_t j=0; j<nDOF1; j++, numShared++) {
2259                                  sendShared.push_back(firstDOF+j*nDOF0);                                  sendShared.push_back(firstDOF+j*nDOF0);
2260                                  recvShared.push_back(numDOF+numShared);                                  recvShared.push_back(numDOF+numShared);
# Line 1912  void Brick::createPattern() Line 2277  void Brick::createPattern()
2277                                      if (i<nDOF2-1)                                      if (i<nDOF2-1)
2278                                          colIndices[firstDOF+(j+1)*nDOF0+nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);                                          colIndices[firstDOF+(j+1)*nDOF0+nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);
2279                                  }                                  }
2280                                  m_dofMap[firstNode+j*m_N0]=numDOF+numShared;                                  m_dofMap[firstNode+j*m_NN[0]]=numDOF+numShared;
2281                              }                              }
2282                          }                          }
2283                      } else if (i0==0) {                      } else if (i0==0) {
# Line 1920  void Brick::createPattern() Line 2285  void Brick::createPattern()
2285                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF0);                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF0);
2286                          const int firstDOF=(i1+1)/2*nDOF0*(nDOF1-1)                          const int firstDOF=(i1+1)/2*nDOF0*(nDOF1-1)
2287                                             +(i2+1)/2*nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);                                             +(i2+1)/2*nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);
2288                          const int firstNode=left+(i1+1)/2*m_N0*(m_N1-1)                          const int firstNode=left+(i1+1)/2*m_NN[0]*(m_NN[1]-1)
2289                                              +(i2+1)/2*m_N0*m_N1*(m_N2-1);                                              +(i2+1)/2*m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1);
2290                          for (dim_t i=0; i<nDOF0; i++, numShared++) {                          for (dim_t i=0; i<nDOF0; i++, numShared++) {
2291                              sendShared.push_back(firstDOF+i);                              sendShared.push_back(firstDOF+i);
2292                              recvShared.push_back(numDOF+numShared);                              recvShared.push_back(numDOF+numShared);
# Line 1937  void Brick::createPattern() Line 2302  void Brick::createPattern()
2302                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF1);                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF1);
2303                          const int firstDOF=(i0+1)/2*(nDOF0-1)                          const int firstDOF=(i0+1)/2*(nDOF0-1)
2304                                             +(i2+1)/2*nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);                                             +(i2+1)/2*nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);
2305                          const int firstNode=bottom*m_N0                          const int firstNode=bottom*m_NN[0]
2306                                              +(i0+1)/2*(m_N0-1)                                              +(i0+1)/2*(m_NN[0]-1)
2307                                              +(i2+1)/2*m_N0*m_N1*(m_N2-1);                                              +(i2+1)/2*m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1);
2308                          for (dim_t i=0; i<nDOF1; i++, numShared++) {                          for (dim_t i=0; i<nDOF1; i++, numShared++) {
2309                              sendShared.push_back(firstDOF+i*nDOF0);                              sendShared.push_back(firstDOF+i*nDOF0);
2310                              recvShared.push_back(numDOF+numShared);                              recvShared.push_back(numDOF+numShared);
# Line 1948  void Brick::createPattern() Line 2313  void Brick::createPattern()
2313                              colIndices[firstDOF+i*nDOF0].push_back(numShared);                              colIndices[firstDOF+i*nDOF0].push_back(numShared);
2314                              if (i<nDOF1-1)                              if (i<nDOF1-1)
2315                                  colIndices[firstDOF+(i+1)*nDOF0].push_back(numShared);                                  colIndices[firstDOF+(i+1)*nDOF0].push_back(numShared);
2316                              m_dofMap[firstNode+i*m_N0]=numDOF+numShared;                              m_dofMap[firstNode+i*m_NN[0]]=numDOF+numShared;
2317                          }                          }
2318                      } else if (i2==0) {                      } else if (i2==0) {
2319                          // sharing an edge in z direction                          // sharing an edge in z direction
2320                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF2);                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF2);
2321                          const int firstDOF=(i0+1)/2*(nDOF0-1)                          const int firstDOF=(i0+1)/2*(nDOF0-1)
2322                                             +(i1+1)/2*nDOF0*(nDOF1-1);                                             +(i1+1)/2*nDOF0*(nDOF1-1);
2323                          const int firstNode=front*m_N0*m_N1                          const int firstNode=front*m_NN[0]*m_NN[1]
2324                                              +(i0+1)/2*(m_N0-1)                                              +(i0+1)/2*(m_NN[0]-1)
2325                                              +(i1+1)/2*m_N0*(m_N1-1);                                              +(i1+1)/2*m_NN[0]*(m_NN[1]-1);
2326                          for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++, numShared++) {                          for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++, numShared++) {
2327                              sendShared.push_back(firstDOF+i*nDOF0*nDOF1);                              sendShared.push_back(firstDOF+i*nDOF0*nDOF1);
2328                              recvShared.push_back(numDOF+numShared);                              recvShared.push_back(numDOF+numShared);
# Line 1966  void Brick::createPattern() Line 2331  void Brick::createPattern()
2331                              colIndices[firstDOF+i*nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);                              colIndices[firstDOF+i*nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);
2332                              if (i<nDOF2-1)                              if (i<nDOF2-1)
2333                                  colIndices[firstDOF+(i+1)*nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);                                  colIndices[firstDOF+(i+1)*nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);
2334                              m_dofMap[firstNode+i*m_N0*m_N1]=numDOF+numShared;                              m_dofMap[firstNode+i*m_NN[0]*m_NN[1]]=numDOF+numShared;
2335                          }                          }
2336                      } else {                      } else {
2337                          // sharing a node                          // sharing a node
2338                          const int dof=(i0+1)/2*(nDOF0-1)                          const int dof=(i0+1)/2*(nDOF0-1)
2339                                        +(i1+1)/2*nDOF0*(nDOF1-1)                                        +(i1+1)/2*nDOF0*(nDOF1-1)
2340                                        +(i2+1)/2*nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);                                        +(i2+1)/2*nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);
2341                          const int node=(i0+1)/2*(m_N0-1)                          const int node=(i0+1)/2*(m_NN[0]-1)
2342                                         +(i1+1)/2*m_N0*(m_N1-1)                                         +(i1+1)/2*m_NN[0]*(m_NN[1]-1)
2343                                         +(i2+1)/2*m_N0*m_N1*(m_N2-1);                                         +(i2+1)/2*m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1);
2344                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+1);                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+1);
2345                          sendShared.push_back(dof);                          sendShared.push_back(dof);
2346                          recvShared.push_back(numDOF+numShared);                          recvShared.push_back(numDOF+numShared);
# Line 2086  void Brick::addToMatrixAndRHS(Paso_Syste Line 2451  void Brick::addToMatrixAndRHS(Paso_Syste
2451      IndexVector rowIndex;      IndexVector rowIndex;
2452      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode]);      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode]);
2453      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+1]);      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+1]);
2454      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_N0]);      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_NN[0]]);
2455      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_N0+1]);      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_NN[0]+1]);
2456      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_N0*m_N1]);      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_NN[0]*m_NN[1]]);
2457      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_N0*m_N1+1]);      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_NN[0]*m_NN[1]+1]);
2458      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_N0*(m_N1+1)]);      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_NN[0]*(m_NN[1]+1)]);
2459      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_N0*(m_N1+1)+1]);      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_NN[0]*(m_NN[1]+1)+1]);
2460      if (addF) {      if (addF) {
2461          double *F_p=F.getSampleDataRW(0);          double *F_p=F.getSampleDataRW(0);
2462          for (index_t i=0; i<rowIndex.size(); i++) {          for (index_t i=0; i<rowIndex.size(); i++) {
# Line 2114  void Brick::interpolateNodesOnElements(e Line 2479  void Brick::interpolateNodesOnElements(e
2479      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();
2480      if (reduced) {      if (reduced) {
2481          out.requireWrite();          out.requireWrite();
         const double c0 = .125;  
2482  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
2483          {          {
2484              vector<double> f_000(numComp);              vector<double> f_000(numComp);
# Line 2126  void Brick::interpolateNodesOnElements(e Line 2490  void Brick::interpolateNodesOnElements(e
2490              vector<double> f_110(numComp);              vector<double> f_110(numComp);
2491              vector<double> f_111(numComp);              vector<double> f_111(numComp);
2492  #pragma omp for  #pragma omp for
2493              for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {              for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2494                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2495                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2496                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2497                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2498                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2499                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2500                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2501                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2502                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2503                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2504                          double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE0,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE[0],m_NE[1]));
2505                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2506                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_000[i] + f_001[i] + f_010[i] + f_011[i] + f_100[i] + f_101[i] + f_110[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_000[i] + f_001[i] + f_010[i] + f_011[i] + f_100[i] + f_101[i] + f_110[i] + f_111[i])/8;
2507                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
2508                      } // end of k0 loop                      } // end of k0 loop
2509                  } // end of k1 loop                  } // end of k1 loop
# Line 2162  void Brick::interpolateNodesOnElements(e Line 2526  void Brick::interpolateNodesOnElements(e
2526              vector<double> f_110(numComp);              vector<double> f_110(numComp);
2527              vector<double> f_111(numComp);              vector<double> f_111(numComp);
2528  #pragma omp for  #pragma omp for
2529              for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {              for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2530                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2531                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2532                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2533                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2534                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2535                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2536                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2537                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2538                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2539                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2540                          double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE0,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE[0],m_NE[1]));
2541                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2542                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c3 + f_111[i]*c0 + c2*(f_001[i] + f_010[i] + f_100[i]) + c1*(f_011[i] + f_101[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c3 + f_111[i]*c0 + c2*(f_001[i] + f_010[i] + f_100[i]) + c1*(f_011[i] + f_101[i] + f_110[i]);
2543                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_011[i]*c0 + f_100[i]*c3 + c2*(f_000[i] + f_101[i] + f_110[i]) + c1*(f_001[i] + f_010[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_011[i]*c0 + f_100[i]*c3 + c2*(f_000[i] + f_101[i] + f_110[i]) + c1*(f_001[i] + f_010[i] + f_111[i]);
# Line 2198  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr Line 2562  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr
2562      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();
2563      if (reduced) {      if (reduced) {
2564          out.requireWrite();          out.requireWrite();
         const double c0 = .25;  
2565  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
2566          {          {
2567              vector<double> f_000(numComp);              vector<double> f_000(numComp);
# Line 2211  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr Line 2574  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr
2574              vector<double> f_111(numComp);              vector<double> f_111(numComp);
2575              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
2576  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2577                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2578                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2579                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2580                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2581                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2582                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2583                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
2584                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2585                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_000[i] + f_001[i] + f_010[i] + f_011[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_000[i] + f_001[i] + f_010[i] + f_011[i])/4;
2586                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
2587                      } // end of k1 loop                      } // end of k1 loop
2588                  } // end of k2 loop                  } // end of k2 loop
2589              } // end of face 0              } // end of face 0
2590              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
2591  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2592                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2593                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2594                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2595                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2596                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2597                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2598                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
2599                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2600                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_100[i] + f_101[i] + f_110[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_100[i] + f_101[i] + f_110[i] + f_111[i])/4;
2601                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
2602                      } // end of k1 loop                      } // end of k1 loop
2603                  } // end of k2 loop                  } // end of k2 loop
2604              } // end of face 1              } // end of face 1
2605              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
2606  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2607                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2608                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2609                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2610                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2611                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2612                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2613                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
2614                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2615                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_000[i] + f_001[i] + f_100[i] + f_101[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_000[i] + f_001[i] + f_100[i] + f_101[i])/4;
2616                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
2617                      } // end of k0 loop                      } // end of k0 loop
2618                  } // end of k2 loop                  } // end of k2 loop
2619              } // end of face 2              } // end of face 2
2620              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
2621  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2622                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2623                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2624                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2625                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2626                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2627                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2628                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
2629                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2630                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_010[i] + f_011[i] + f_110[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_010[i] + f_011[i] + f_110[i] + f_111[i])/4;
2631                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
2632                      } // end of k0 loop                      } // end of k0 loop
2633                  } // end of k2 loop                  } // end of k2 loop
2634              } // end of face 3              } // end of face 3
2635              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
2636  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2637                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2638                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2639                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2640                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2641                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2642                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2643                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
2644                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2645                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_000[i] + f_010[i] + f_100[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_000[i] + f_010[i] + f_100[i] + f_110[i])/4;
2646                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
2647                      } // end of k0 loop                      } // end of k0 loop
2648                  } // end of k1 loop                  } // end of k1 loop
2649              } // end of face 4              } // end of face 4
2650              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
2651  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2652                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2653                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2654                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2655                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2656                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2657                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2658                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
2659                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2660                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_001[i] + f_011[i] + f_101[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_001[i] + f_011[i] + f_101[i] + f_111[i])/4;
2661                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
2662                      } // end of k0 loop                      } // end of k0 loop
2663                  } // end of k1 loop                  } // end of k1 loop
# Line 2317  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr Line 2680  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr
2680              vector<double> f_111(numComp);              vector<double> f_111(numComp);
2681              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
2682  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2683                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2684                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2685                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2686                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2687                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2688                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2689                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
2690                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2691                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c2 + f_011[i]*c0 + c1*(f_001[i] + f_010[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c2 + f_011[i]*c0 + c1*(f_001[i] + f_010[i]);
2692                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_001[i]*c0 + f_010[i]*c2 + c1*(f_000[i] + f_011[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_001[i]*c0 + f_010[i]*c2 + c1*(f_000[i] + f_011[i]);
# Line 2335  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr Line 2698  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr
2698              } // end of face 0              } // end of face 0
2699              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
2700  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2701                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2702                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2703                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2704                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2705                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2706                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2707                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
2708                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2709                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_100[i]*c2 + f_111[i]*c0 + c1*(f_101[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_100[i]*c2 + f_111[i]*c0 + c1*(f_101[i] + f_110[i]);
2710                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_101[i]*c0 + f_110[i]*c2 + c1*(f_100[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_101[i]*c0 + f_110[i]*c2 + c1*(f_100[i] + f_111[i]);
# Line 2353  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr Line 2716  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr
2716              } // end of face 1              } // end of face 1
2717              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
2718  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2719                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2720                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2721                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2722                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2723                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2724                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2725                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
2726                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2727                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c2 + f_101[i]*c0 + c1*(f_001[i] + f_100[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c2 + f_101[i]*c0 + c1*(f_001[i] + f_100[i]);
2728                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_001[i]*c0 + f_100[i]*c2 + c1*(f_000[i] + f_101[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_001[i]*c0 + f_100[i]*c2 + c1*(f_000[i] + f_101[i]);
# Line 2371  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr Line 2734  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr
2734              } // end of face 2              } // end of face 2
2735              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
2736  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2737                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2738                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2739                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2740                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2741                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2742                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2743                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
2744                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2745                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_010[i]*c2 + f_111[i]*c0 + c1*(f_011[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_010[i]*c2 + f_111[i]*c0 + c1*(f_011[i] + f_110[i]);
2746                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_011[i]*c0 + f_110[i]*c2 + c1*(f_010[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_011[i]*c0 + f_110[i]*c2 + c1*(f_010[i] + f_111[i]);
# Line 2389  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr Line 2752  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr
2752              } // end of face 3              } // end of face 3
2753              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
2754  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2755                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2756                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2757                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2758                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2759                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2760                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2761                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
2762                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2763                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c2 + f_110[i]*c0 + c1*(f_010[i] + f_100[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c2 + f_110[i]*c0 + c1*(f_010[i] + f_100[i]);
2764                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_010[i]*c0 + f_100[i]*c2 + c1*(f_000[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_010[i]*c0 + f_100[i]*c2 + c1*(f_000[i] + f_110[i]);
# Line 2407  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr Line 2770  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr
2770              } // end of face 4              } // end of face 4
2771              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
2772  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2773                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2774                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2775                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2776                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2777                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2778                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2779                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
2780                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2781                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_001[i]*c2 + f_111[i]*c0 + c1*(f_011[i] + f_101[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_001[i]*c2 + f_111[i]*c0 + c1*(f_011[i] + f_101[i]);
2782                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_011[i]*c0 + f_101[i]*c2 + c1*(f_001[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_011[i]*c0 + f_101[i]*c2 + c1*(f_001[i] + f_111[i]);
# Line 2433  void Brick::assemblePDESingle(Paso_Syste Line 2796  void Brick::assemblePDESingle(Paso_Syste
2796          const escript::Data& C, const escript::Data& D,          const escript::Data& C, const escript::Data& D,
2797          const escript::Data& X, const escript::Data& Y) const          const escript::Data& X, const escript::Data& Y) const
2798  {  {
2799      const double h0 = m_l0/m_gNE0;      const double SQRT3 = 1.73205080756887719318;
2800      const double h1 = m_l1/m_gNE1;      const double w10 = -m_dx[0]/288;
2801      const double h2 = m_l2/m_gNE2;      const double w6 = w10*(SQRT3 - 2);
2802      const double w0 = 0.0009303791403858427308*h1*h2/h0;      const double w12 = w10*(-SQRT3 - 2);
2803      const double w1 = 0.0009303791403858427308*h2;      const double w4 = w10*(-4*SQRT3 + 7);
2804      const double w2 = -0.00024929433932114870101*h1;      const double w18 = w10*(-4*SQRT3 - 7);
2805      const double w3 = 0.0009303791403858427308*h0*h2/h1;      const double w11 = m_dx[1]/288;
2806      const double w4 = -0.00024929433932114870101*h0;      const double w5 = w11*(-SQRT3 + 2);
2807      const double w5 = 0.0009303791403858427308*h1;      const double w15 = w11*(SQRT3 + 2);
2808      const double w6 = 0.0009303791403858427308*h0;      const double w2 = w11*(4*SQRT3 - 7);
2809      const double w7 = -0.00024929433932114870101*h0*h1/h2;      const double w17 = w11*(4*SQRT3 + 7);
2810      const double w8 = 0.0034722222222222222222*h2;      const double w8 = m_dx[2]/288;
2811      const double w9 = -0.0009303791403858427308*h1;      const double w1 = w8*(-SQRT3 + 2);
2812      const double w10 = 0.012958509748503046158*h0*h2/h1;      const double w16 = w8*(SQRT3 + 2);
2813      const double w11 = -0.0034722222222222222222*h0;      const double w20 = w8*(4*SQRT3 - 7);
2814      const double w12 = 0.0034722222222222222222*h1;      const double w21 = w8*(-4*SQRT3 - 7);
2815      const double w13 = 0.012958509748503046158*h0;      const double w50 = m_dx[0]*m_dx[1]/72;
2816      const double w14 = -0.0034722222222222222222*h0*h1/h2;      const double w65 = -m_dx[0]*m_dx[1]/48;
2817      const double w15 = 0.012958509748503046158*h1*h2/h0;      const double w35 = w65*(-SQRT3 - 3)/36;
2818      const double w16 = -0.0034722222222222222222*h1;      const double w42 = w65*(SQRT3 - 3)/36;
2819      const double w17 = -0.0009303791403858427308*h0;      const double w32 = w65*(5*SQRT3 - 9)/36;
2820      const double w18 = 0.012958509748503046158*h1;      const double w43 = w65*(-5*SQRT3 - 9)/36;
2821      const double w19 = 0.0034722222222222222222*h0;      const double w40 = w65*(-19*SQRT3 - 33)/36;
2822      const double w20 = 0.012958509748503046158*h2;      const double w41 = w65*(19*SQRT3 - 33)/36;
2823      const double w21 = -0.012958509748503046158*h1;      const double w63 = w65*(SQRT3 + 2);
2824      const double w22 = -0.012958509748503046158*h0;      const double w67 = w65*(-SQRT3 + 2);
2825      const double w23 = 0.04836181677178996241*h1;      const double w51 = -m_dx[0]*m_dx[2]/72;
2826      const double w24 = 0.04836181677178996241*h0;      const double w64 = -m_dx[0]*m_dx[2]/48;
2827      const double w25 = -0.04836181677178996241*h0*h1/h2;      const double w34 = w64*(-SQRT3 - 3)/36;
2828      const double w26 = 0.00024929433932114870101*h1;      const double w37 = w64*(SQRT3 - 3)/36;
2829      const double w27 = 0.00024929433932114870101*h0;      const double w31 = w64*(5*SQRT3 - 9)/36;
2830      const double w28 = -0.04836181677178996241*h1;      const double w39 = w64*(-5*SQRT3 - 9)/36;
2831      const double w29 = -0.04836181677178996241*h0;      const double w44 = w64*(19*SQRT3 + 33)/36;
2832      const double w30 = -0.0009303791403858427308*h1*h2/h0;      const double w45 = w64*(-19*SQRT3 + 33)/36;
2833      const double w31 = -0.0009303791403858427308*h2;      const double w62 = w64*(SQRT3 + 2);
2834      const double w32 = -0.0009303791403858427308*h0*h2/h1;      const double w68 = w64*(-SQRT3 + 2);
2835      const double w33 = 0.0034722222222222222222*h0*h1/h2;      const double w53 = -m_dx[1]*m_dx[2]/72;
2836      const double w34 = -0.0034722222222222222222*h2;      const double w66 = -m_dx[1]*m_dx[2]/48;
2837      const double w35 = -0.00024929433932114870101*h2;      const double w33 = w66*(SQRT3 - 3)/36;
2838      const double w36 = -0.012958509748503046158*h1*h2/h0;      const double w36 = w66*(-SQRT3 - 3)/36;
2839      const double w37 = -0.012958509748503046158*h2;      const double w30 = w66*(5*SQRT3 - 9)/36;
2840      const double w38 = -0.012958509748503046158*h0*h2/h1;      const double w38 = w66*(-5*SQRT3 - 9)/36;
2841      const double w39 = -0.04836181677178996241*h2;      const double w46 = w66*(19*SQRT3 - 33)/36;
2842      const double w40 = -0.0034722222222222222222*h0*h2/h1;      const double w47 = w66*(-19*SQRT3 - 33)/36;
2843      const double w41 = 0.0009303791403858427308*h0*h1/h2;      const double w61 = w66*(SQRT3 + 2);
2844      const double w42 = 0.04836181677178996241*h2;      const double w69 = w66*(-SQRT3 + 2);
2845      const double w43 = -0.04836181677178996241*h0*h2/h1;      const double w55 = m_dx[0]*m_dx[1]*m_dx[2]/1728;
2846      const double w44 = 0.012958509748503046158*h0*h1/h2;      const double w57 = w55*(-SQRT3 + 2);
2847      const double w45 = -0.00024929433932114870101*h0*h2/h1;      const double w58 = w55*(SQRT3 + 2);
2848      const double w46 = 0.00024929433932114870101*h2;      const double w54 = w55*(-4*SQRT3 + 7);
2849      const double w47 = -0.0034722222222222222222*h1*h2/h0;      const double w56 = w55*(4*SQRT3 + 7);
2850      const double w48 = -0.00024929433932114870101*h1*h2/h0;      const double w59 = w55*(15*SQRT3 + 26);
2851      const double w49 = -0.04836181677178996241*h1*h2/h0;      const double w60 = w55*(-15*SQRT3 + 26);
2852      const double w50 = 0.0034722222222222222222*h0*h2/h1;      const double w71 = w55*6*(SQRT3 + 3);
2853      const double w51 = -0.0009303791403858427308*h0*h1/h2;      const double w72 = w55*6*(-SQRT3 + 3);
2854      const double w52 = -0.012958509748503046158*h0*h1/h2;      const double w70 = w55*6*(5*SQRT3 + 9);
2855      const double w53 = 0.0034722222222222222222*h1*h2/h0;      const double w73 = w55*6*(-5*SQRT3 + 9);
2856      const double w54 = 0.00024929433932114870101*h0*h1/h2;      const double w13 = -m_dx[0]*m_dx[1]/(288*m_dx[2]);
2857      const double w55 = 0.04836181677178996241*h0*h2/h1;      const double w23 = w13*(SQRT3 - 2);
2858      const double w56 = 0.04836181677178996241*h1*h2/h0;      const double w25 = w13*(-SQRT3 - 2);
2859      const double w57 = 0.04836181677178996241*h0*h1/h2;      const double w7 = w13*(-4*SQRT3 + 7);
2860      const double w58 = 0.00024929433932114870101*h1*h2/h0;      const double w19 = w13*(4*SQRT3 + 7);
2861      const double w59 = 0.00024929433932114870101*h0*h2/h1;      const double w22 = -m_dx[0]*m_dx[2]/(288*m_dx[1]);
2862      const double w60 = 0.055555555555555555556*h1*h2/h0;      const double w3 = w22*(SQRT3 - 2);
2863      const double w61 = 0.041666666666666666667*h2;      const double w9 = w22*(-SQRT3 - 2);
2864      const double w62 = -0.083333333333333333333*h1;      const double w24 = w22*(4*SQRT3 + 7);
2865      const double w63 = 0.055555555555555555556*h0*h2/h1;      const double w26 = w22*(-4*SQRT3 + 7);
2866      const double w64 = -0.083333333333333333333*h0;      const double w27 = -m_dx[1]*m_dx[2]/(288*m_dx[0]);
2867      const double w65 = 0.083333333333333333333*h1;      const double w0 = w27*(SQRT3 - 2);
2868      const double w66 = 0.083333333333333333333*h0;      const double w14 = w27*(-SQRT3 - 2);
2869      const double w67 = -0.11111111111111111111*h0*h1/h2;      const double w28 = w27*(-4*SQRT3 + 7);
2870      const double w68 = -0.055555555555555555556*h1*h2/h0;      const double w29 = w27*(4*SQRT3 + 7);
     const double w69 = -0.083333333333333333333*h2;  
     const double w70 = -0.041666666666666666667*h1;  
     const double w71 = -0.055555555555555555556*h0*h2/h1;  
     const double w72 = -0.041666666666666666667*h0;  
     const double w73 = 0.041666666666666666667*h1;  
     const double w74 = 0.041666666666666666667*h0;  
     const double w75 = 0.027777777777777777778*h0*h1/h2;  
     const double w76 = 0.083333333333333333333*h2;  
     const double w77 = -0.11111111111111111111*h0*h2/h1;  
     const double w78 = 0.055555555555555555556*h0*h1/h2;  
     const double w79 = -0.11111111111111111111*h1*h2/h0;  
     const double w80 = -0.027777777777777777778*h1*h2/h0;  
     const double w81 = -0.041666666666666666667*h2;  
     const double w82 = -0.027777777777777777778*h0*h2/h1;  
     const double w83 = -0.027777777777777777778*h0*h1/h2;  
     const double w84 = 0.027777777777777777778*h0*h2/h1;  
     const double w85 = -0.055555555555555555556*h0*h1/h2;  
     const double w86 = 0.11111111111111111111*h1*h2/h0;  
     const double w87 = 0.11111111111111111111*h0*h2/h1;  
     const double w88 = 0.11111111111111111111*h0*h1/h2;  
     const double w89 = 0.027777777777777777778*h1*h2/h0;  
     const double w90 = 0.0001966122466178319053*h1*h2;  
     const double w91 = 0.0001966122466178319053*h0*h2;  
     const double w92 = 0.0001966122466178319053*h0*h1;  
     const double w93 = 0.0007337668937680108255*h1*h2;  
     const double w94 = 0.0027384553284542113967*h0*h2;  
     const double w95 = 0.0027384553284542113967*h0*h1;  
     const double w96 = 0.0027384553284542113967*h1*h2;  
     const double w97 = 0.0007337668937680108255*h0*h2;  
     const double w98 = 0.010220054420048834761*h1*h2;  
     const double w99 = 0.010220054420048834761*h0*h2;  
     const double w100 = 0.038141762351741127649*h0*h1;  
     const double w101 = 0.000052682092703316795705*h0*h1;  
     const double w102 = 0.0007337668937680108255*h0*h1;  
     const double w103 = 0.010220054420048834761*h0*h1;  
     const double w104 = -0.0001966122466178319053*h1*h2;  
     const double w105 = -0.0001966122466178319053*h0*h2;  
     const double w106 = -0.0007337668937680108255*h1*h2;  
     const double w107 = -0.0007337668937680108255*h0*h2;  
     const double w108 = -0.0027384553284542113967*h1*h2;  
     const double w109 = -0.0027384553284542113967*h0*h2;  
     const double w110 = -0.010220054420048834761*h1*h2;  
     const double w111 = -0.010220054420048834761*h0*h2;  
     const double w112 = -0.0007337668937680108255*h0*h1;  
     const double w113 = -0.010220054420048834761*h0*h1;  
     const double w114 = -0.038141762351741127649*h0*h2;  
     const double w115 = -0.000052682092703316795705*h0*h2;  
     const double w116 = -0.0001966122466178319053*h0*h1;  
     const double w117 = -0.0027384553284542113967*h0*h1;  
     const double w118 = 0.000052682092703316795705*h0*h2;  
     const double w119 = 0.038141762351741127649*h0*h2;  
     const double w120 = 0.000052682092703316795705*h1*h2;  
     const double w121 = 0.038141762351741127649*h1*h2;  
     const double w122 = -0.000052682092703316795705*h0*h1;  
     const double w123 = -0.038141762351741127649*h0*h1;  
     const double w124 = -0.000052682092703316795705*h1*h2;  
     const double w125 = -0.038141762351741127649*h1*h2;  
     const double w126 = 0.027777777777777777778*h1*h2;  
     const double w127 = 0.027777777777777777778*h0*h2;  
     const double w128 = 0.055555555555555555556*h0*h1;  
     const double w129 = -0.027777777777777777778*h1*h2;  
     const double w130 = -0.027777777777777777778*h0*h2;  
     const double w131 = 0.013888888888888888889*h0*h1;  
     const double w132 = -0.055555555555555555556*h0*h2;  
     const double w133 = -0.027777777777777777778*h0*h1;  
     const double w134 = 0.055555555555555555556*h0*h2;  
     const double w135 = 0.027777777777777777778*h0*h1;  
     const double w136 = -0.013888888888888888889*h0*h1;  
     const double w137 = 0.055555555555555555556*h1*h2;  
     const double w138 = -0.013888888888888888889*h1*h2;  
     const double w139 = -0.013888888888888888889*h0*h2;  
     const double w140 = -0.055555555555555555556*h0*h1;  
     const double w141 = 0.013888888888888888889*h1*h2;  
     const double w142 = 0.013888888888888888889*h0*h2;  
     const double w143 = -0.055555555555555555556*h1*h2;  
     const double w144 = 0.000041549056553524783501*h0*h1*h2;  
     const double w145 = 0.0005787037037037037037*h0*h1*h2;  
     const double w146 = 0.0080603027952983270684*h0*h1*h2;  
     const double w147 = 0.0001550631900643071218*h0*h1*h2;  
     const double w148 = 0.002159751624750507693*h0*h1*h2;  
     const double w149 = 0.03008145955644280058*h0*h1*h2;  
     const double w150 = 0.000011133036149792012204*h0*h1*h2;  
     const double w151 = 0.018518518518518518519*h0*h1*h2;  
     const double w152 = 0.0092592592592592592592*h0*h1*h2;  
     const double w153 = 0.0046296296296296296296*h0*h1*h2;  
     const double w154 = 0.037037037037037037037*h0*h1*h2;  
     const double w155 = -0.077751058491018276949*h1*h2;  
     const double w156 = -0.077751058491018276949*h0*h2;  
     const double w157 = -0.077751058491018276949*h0*h1;  
     const double w158 = -0.020833333333333333333*h0*h2;  
     const double w159 = -0.020833333333333333333*h0*h1;  
     const double w160 = -0.020833333333333333333*h1*h2;  
     const double w161 = -0.0055822748423150563848*h0*h1;  
     const double w162 = -0.0055822748423150563848*h0*h2;  
     const double w163 = -0.0055822748423150563848*h1*h2;  
     const double w164 = 0.077751058491018276949*h1*h2;  
     const double w165 = 0.020833333333333333333*h1*h2;  
     const double w166 = 0.0055822748423150563848*h1*h2;  
     const double w167 = 0.077751058491018276949*h0*h2;  
     const double w168 = 0.020833333333333333333*h0*h2;  
     const double w169 = 0.0055822748423150563848*h0*h2;  
     const double w170 = 0.077751058491018276949*h0*h1;  
     const double w171 = 0.020833333333333333333*h0*h1;  
     const double w172 = 0.0055822748423150563848*h0*h1;  
     const double w173 = -0.25*h1*h2;  
     const double w174 = -0.25*h0*h2;  
     const double w175 = -0.25*h0*h1;  
     const double w176 = 0.25*h1*h2;  
     const double w177 = 0.25*h0*h2;  
     const double w178 = 0.25*h0*h1;  
     const double w179 = 0.061320326520293008568*h0*h1*h2;  
     const double w180 = 0.01643073197072526838*h0*h1*h2;  
     const double w181 = 0.004402601362608064953*h0*h1*h2;  
     const double w182 = 0.0011796734797069914318*h0*h1*h2;  
     const double w183 = 0.125*h0*h1*h2;  
2871    
2872      rhs.requireWrite();      rhs.requireWrite();
2873  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
2874      {      {
2875          for (index_t k2_0=0; k2_0<2; k2_0++) { // colouring          for (index_t k2_0=0; k2_0<2; k2_0++) { // colouring
2876  #pragma omp for  #pragma omp for
2877              for (index_t k2=k2_0; k2<m_NE2; k2+=2) {              for (index_t k2=k2_0; k2<m_NE[2]; k2+=2) {
2878                  for (index_t k1=0; k1<m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1<m_NE[1]; ++k1) {
2879                      for (index_t k0=0; k0<m_NE0; ++k0)  {                      for (index_t k0=0; k0<m_NE[0]; ++k0)  {
2880                          bool add_EM_S=false;                          bool add_EM_S=false;
2881                          bool add_EM_F=false;                          bool add_EM_F=false;
2882                          vector<double> EM_S(8*8, 0);                          vector<double> EM_S(8*8, 0);
2883                          vector<double> EM_F(8, 0);                          vector<double> EM_F(8, 0);
2884                          const index_t e = k0 + m_NE0*k1 + m_NE0*m_NE1*k2;                          const index_t e = k0 + m_NE[0]*k1 + m_NE[0]*m_NE[1]*k2;
2885                          ///////////////                          ///////////////
2886                          // process A //                          // process A //
2887                          ///////////////                          ///////////////
2888                          if (!A.isEmpty()) {                          if (!A.isEmpty()) {
2889                              add_EM_S=true;                              add_EM_S = true;
2890                              const double* A_p=const_cast<escript::Data*>(&A)->getSampleDataRO(e);                              const double* A_p = const_cast<escript::Data*>(&A)->getSampleDataRO(e);
2891                              if (A.actsExpanded()) {                              if (A.actsExpanded()) {
2892                                  const double A_00_0 = A_p[INDEX3(0,0,0,3,3)];                                  const double A_00_0 = A_p[INDEX3(0,0,0,3,3)];
2893                                  const double A_01_0 = A_p[INDEX3(0,1,0,3,3)];                                  const double A_01_0 = A_p[INDEX3(0,1,0,3,3)];
# Line 2713  void Brick::assemblePDESingle(Paso_Syste Line 2961  void Brick::assemblePDESingle(Paso_Syste
2961                                  const double A_20_7 = A_p[INDEX3(2,0,7,3,3)];                                  const double A_20_7 = A_p[INDEX3(2,0,7,3,3)];
2962                                  const double A_21_7 = A_p[INDEX3(2,1,7,3,3)];                                  const double A_21_7 = A_p[INDEX3(2,1,7,3,3)];
2963                                  const double A_22_7 = A_p[INDEX3(2,2,7,3,3)];                                  const double A_22_7 = A_p[INDEX3(2,2,7,3,3)];
2964                                  const double tmp160_0 = A_12_0 + A_12_6 + A_21_0 + A_21_6;                                  const double tmp0 = w18*(-A_12_7 + A_21_3);
2965                                  const double tmp8_0 = A_21_0 + A_21_6;                                  const double tmp1 = w13*(A_22_1 + A_22_2 + A_22_5 + A_22_6);
2966                                  const double tmp135_0 = A_10_1 + A_10_2 + A_10_5 + A_10_6;                                  const double tmp2 = w11*(-A_02_2 - A_02_5 + A_20_1 + A_20_6);
2967                                  const double tmp67_0 = A_02_2 + A_02_7;                                  const double tmp3 = w14*(A_00_2 + A_00_3 + A_00_6 + A_00_7);
2968                                  const double tmp211_0 = A_12_6 + A_21_6;                                  const double tmp4 = w7*(A_22_0 + A_22_4);
2969                                  const double tmp180_0 = A_10_2 + A_10_6;                                  const double tmp5 = w10*(A_12_1 + A_12_6 - A_21_2 - A_21_5);
2970                                  const double tmp37_0 = A_00_0 + A_00_1 + A_00_2 + A_00_3;                                  const double tmp6 = w3*(A_11_0 + A_11_2 + A_11_4 + A_11_6);
2971                                  const double tmp92_0 = A_11_0 + A_11_1 + A_11_2 + A_11_3 + A_11_4 + A_11_5 + A_11_6 + A_11_7;                                  const double tmp7 = w1*(A_01_0 + A_01_4 + A_10_0 + A_10_4);
2972                                  const double tmp195_0 = A_02_2 + A_20_2;                                  const double tmp8 = w4*(A_12_0 - A_21_4);
2973                                  const double tmp70_0 = A_01_0 + A_01_7;                                  const double tmp9 = w15*(-A_02_3 - A_02_6 + A_20_2 + A_20_7);
2974                                  const double tmp139_0 = A_02_3 + A_02_4 + A_20_1 + A_20_6;                                  const double tmp10 = w0*(A_00_0 + A_00_1 + A_00_4 + A_00_5);
2975                                  const double tmp200_0 = A_12_3 + A_12_5 + A_21_3 + A_21_5;                                  const double tmp11 = w16*(A_01_3 + A_01_7 + A_10_3 + A_10_7);
2976                                  const double tmp60_0 = A_22_0 + A_22_2 + A_22_4 + A_22_6;                                  const double tmp12 = w9*(A_11_1 + A_11_3 + A_11_5 + A_11_7);
2977                                  const double tmp192_0 = A_01_5 + A_10_5;                                  const double tmp13 = w12*(-A_12_3 - A_12_5 + A_21_1 + A_21_7);
2978                                  const double tmp46_0 = A_21_0 + A_21_7;                                  const double tmp14 = w5*(-A_02_1 - A_02_4 + A_20_0 + A_20_5);
2979                                  const double tmp48_0 = A_10_0 + A_10_7;                                  const double tmp15 = w8*(A_01_1 + A_01_2 + A_01_5 + A_01_6 + A_10_1 + A_10_2 + A_10_5 + A_10_6);
2980                                  const double tmp166_0 = A_11_5 + A_11_7;                                  const double tmp16 = w6*(-A_12_2 - A_12_4 + A_21_0 + A_21_6);
2981                                  const double tmp221_0 = A_02_1 + A_02_6 + A_20_3 + A_20_4;                                  const double tmp17 = w19*(A_22_3 + A_22_7);
2982                                  const double tmp50_0 = A_02_4 + A_02_6 + A_20_4 + A_20_6;                                  const double tmp18 = w17*(-A_02_7 + A_20_3);
2983                                  const double tmp217_0 = A_02_3 + A_02_4 + A_20_3 + A_20_4;                                  const double tmp19 = w2*(A_02_0 - A_20_4);
2984                                  const double tmp216_0 = A_01_2 + A_01_5 + A_10_2 + A_10_5;                                  const double tmp20 = w13*(-A_22_0 - A_22_1 - A_22_2 - A_22_3 - A_22_4 - A_22_5 - A_22_6 - A_22_7);
2985                                  const double tmp104_0 = A_22_2 + A_22_6;                                  const double tmp21 = w11*(-A_02_1 - A_02_3 - A_02_4 - A_02_6 + A_20_0 + A_20_2 + A_20_5 + A_20_7);
2986                                  const double tmp72_0 = A_20_3 + A_20_6;                                  const double tmp22 = w14*(-A_00_4 - A_00_5 - A_00_6 - A_00_7);
2987                                  const double tmp79_0 = A_10_4 + A_10_7;                                  const double tmp23 = w20*(A_01_2 + A_10_1);
2988                                  const double tmp86_0 = A_01_2 + A_01_6 + A_10_1 + A_10_5;                                  const double tmp24 = w10*(A_12_2 + A_12_3 + A_12_4 + A_12_5 - A_21_0 - A_21_1 - A_21_6 - A_21_7);
2989                                  const double tmp214_0 = A_12_0 + A_12_7 + A_21_0 + A_21_7;                                  const double tmp25 = w3*(-A_11_0 - A_11_1 - A_11_2 - A_11_3);
2990                                  const double tmp32_0 = A_02_0 + A_02_2;                                  const double tmp26 = w1*(-A_01_0 - A_01_3 - A_10_0 - A_10_3);
2991                                  const double tmp112_0 = A_01_0 + A_01_4 + A_10_3 + A_10_7;                                  const double tmp27 = w15*(-A_02_5 - A_02_7 + A_20_4 + A_20_6);
2992                                  const double tmp197_0 = A_12_0 + A_21_0;                                  const double tmp28 = w0*(-A_00_0 - A_00_1 - A_00_2 - A_00_3);
2993                                  const double tmp106_0 = A_22_1 + A_22_5;                                  const double tmp29 = w16*(-A_01_4 - A_01_7 - A_10_4 - A_10_7);
2994                                  const double tmp2_0 = A_00_0 + A_00_1 + A_00_4 + A_00_5;                                  const double tmp30 = w9*(-A_11_4 - A_11_5 - A_11_6 - A_11_7);
2995                                  const double tmp115_0 = A_02_5 + A_02_7 + A_20_0 + A_20_2;                                  const double tmp31 = w21*(A_01_5 + A_10_6);
2996                                  const double tmp175_0 = A_01_3 + A_01_7;                                  const double tmp32 = w12*(-A_12_6 - A_12_7 + A_21_4 + A_21_5);
2997                                  const double tmp126_0 = A_01_2 + A_01_5 + A_10_1 + A_10_6;                                  const double tmp33 = w5*(-A_02_0 - A_02_2 + A_20_1 + A_20_3);
2998                                  const double tmp90_0 = A_00_0 + A_00_1 + A_00_2 + A_00_3 + A_00_4 + A_00_5 + A_00_6 + A_00_7;                                  const double tmp34 = w8*(-A_01_1 - A_01_6 - A_10_2 - A_10_5);
2999                                  const double tmp47_0 = A_12_0 + A_12_6;                                  const double tmp35 = w6*(-A_12_0 - A_12_1 + A_21_2 + A_21_3);
3000                                  const double tmp205_0 = A_02_7 + A_20_7;                                  const double tmp36 = w20*(-A_01_6 + A_10_4);
3001                                  const double tmp148_0 = A_01_3 + A_01_4;                                  const double tmp37 = w18*(A_12_3 - A_21_1);
3002                                  const double tmp113_0 = A_01_3 + A_01_7 + A_10_0 + A_10_4;                                  const double tmp38 = w11*(-A_02_0 - A_02_2 - A_02_5 - A_02_7 - A_20_0 - A_20_2 - A_20_5 - A_20_7);
3003                                  const double tmp43_0 = A_20_4 + A_20_6;                                  const double tmp39 = w14*(A_00_0 + A_00_1 + A_00_2 + A_00_3);
3004                                  const double tmp161_0 = A_02_1 + A_02_6 + A_20_1 + A_20_6;                                  const double tmp40 = w26*(A_11_4 + A_11_6);
3005                                  const double tmp69_0 = A_12_0 + A_12_1 + A_12_6 + A_12_7 + A_21_0 + A_21_1 + A_21_6 + A_21_7;                                  const double tmp41 = w0*(A_00_4 + A_00_5 + A_00_6 + A_00_7);
3006                                  const double tmp176_0 = A_01_1 + A_01_2 + A_01_5 + A_01_6;                                  const double tmp42 = w10*(-A_12_2 - A_12_5 + A_21_0 + A_21_7);
3007                                  const double tmp105_0 = A_01_2 + A_01_6 + A_10_2 + A_10_6;                                  const double tmp43 = w22*(A_11_0 + A_11_2 + A_11_5 + A_11_7);
3008                                  const double tmp22_0 = A_01_5 + A_10_6;                                  const double tmp44 = w1*(A_01_4 + A_01_7 - A_10_5 - A_10_6);
3009                                  const double tmp91_0 = A_02_4 + A_02_6 + A_20_1 + A_20_3;                                  const double tmp45 = w25*(A_22_1 + A_22_3 + A_22_5 + A_22_7);
3010                                  const double tmp206_0 = A_12_7 + A_21_7;                                  const double tmp46 = w4*(-A_12_4 + A_21_6);
3011                                  const double tmp188_0 = A_02_5 + A_20_5;                                  const double tmp47 = w15*(-A_02_1 - A_02_3 - A_20_1 - A_20_3);
3012                                  const double tmp117_0 = A_21_1 + A_21_6;                                  const double tmp48 = w21*(-A_01_1 + A_10_3);
3013                                  const double tmp165_0 = A_01_1 + A_01_6;                                  const double tmp49 = w16*(A_01_0 + A_01_3 - A_10_1 - A_10_2);
3014                                  const double tmp66_0 = A_00_4 + A_00_5;                                  const double tmp50 = w5*(-A_02_4 - A_02_6 - A_20_4 - A_20_6);
3015                                  const double tmp57_0 = A_02_0 + A_02_2 + A_02_5 + A_02_7 + A_20_0 + A_20_2 + A_20_5 + A_20_7;                                  const double tmp51 = w12*(A_12_1 + A_12_7 - A_21_3 - A_21_5);
3016                                  const double tmp31_0 = A_21_4 + A_21_5;                                  const double tmp52 = w24*(A_11_1 + A_11_3);
3017                                  const double tmp3_0 = A_11_0 + A_11_2 + A_11_4 + A_11_6;                                  const double tmp53 = w8*(A_01_2 + A_01_5 - A_10_0 - A_10_7);
3018                                  const double tmp183_0 = A_12_0 + A_12_7;                                  const double tmp54 = w6*(A_12_0 + A_12_6 - A_21_2 - A_21_4);
3019                                  const double tmp61_0 = A_02_1 + A_02_3 + A_20_1 + A_20_3;                                  const double tmp55 = w23*(A_22_0 + A_22_2 + A_22_4 + A_22_6);
3020                                  const double tmp54_0 = A_10_5 + A_10_6;                                  const double tmp56 = w18*(A_12_4 - A_21_6);
3021                                  const double tmp18_0 = A_02_3 + A_02_6;                                  const double tmp57 = w14*(A_00_4 + A_00_5 + A_00_6 + A_00_7);
3022                                  const double tmp119_0 = A_12_2 + A_12_3 + A_12_4 + A_12_5 + A_21_2 + A_21_3 + A_21_4 + A_21_5;                                  const double tmp58 = w26*(A_11_1 + A_11_3);
3023                                  const double tmp29_0 = A_21_2 + A_21_3;                                  const double tmp59 = w20*(-A_01_1 + A_10_3);
3024                                  const double tmp17_0 = A_01_3 + A_01_7 + A_10_3 + A_10_7;                                  const double tmp60 = w1*(A_01_0 + A_01_3 - A_10_1 - A_10_2);
3025                                  const double tmp212_0 = A_02_6 + A_20_6;                                  const double tmp61 = w25*(A_22_0 + A_22_2 + A_22_4 + A_22_6);
3026                                  const double tmp220_0 = A_02_3 + A_20_6;                                  const double tmp62 = w4*(-A_12_3 + A_21_1);
3027                                  const double tmp78_0 = A_20_0 + A_20_7;                                  const double tmp63 = w15*(-A_02_4 - A_02_6 - A_20_4 - A_20_6);
3028                                  const double tmp215_0 = A_01_6 + A_10_6;                                  const double tmp64 = w0*(A_00_0 + A_00_1 + A_00_2 + A_00_3);
3029                                  const double tmp203_0 = A_01_7 + A_10_7;                                  const double tmp65 = w16*(A_01_4 + A_01_7 - A_10_5 - A_10_6);
3030                                  const double tmp87_0 = A_12_2 + A_12_3 + A_21_4 + A_21_5;                                  const double tmp66 = w24*(A_11_4 + A_11_6);
3031                                  const double tmp114_0 = A_02_0 + A_02_2 + A_20_5 + A_20_7;                                  const double tmp67 = w21*(-A_01_6 + A_10_4);
3032                                  const double tmp0_0 = A_01_0 + A_01_4 + A_10_0 + A_10_4;                                  const double tmp68 = w12*(A_12_0 + A_12_6 - A_21_2 - A_21_4);
3033                                  const double tmp202_0 = A_01_3 + A_01_4 + A_10_3 + A_10_4;                                  const double tmp69 = w5*(-A_02_1 - A_02_3 - A_20_1 - A_20_3);
3034                                  const double tmp4_0 = A_20_0 + A_20_5;                                  const double tmp70 = w6*(A_12_1 + A_12_7 - A_21_3 - A_21_5);
3035                                  const double tmp65_0 = A_00_2 + A_00_3;                                  const double tmp71 = w23*(A_22_1 + A_22_3 + A_22_5 + A_22_7);
3036                                  const double tmp24_0 = A_20_1 + A_20_3;                                  const double tmp72 = w20*(A_01_5 + A_10_6);
3037                                  const double tmp64_0 = A_10_0 + A_10_3;                                  const double tmp73 = w14*(-A_00_0 - A_00_1 - A_00_2 - A_00_3);
3038                                  const double tmp170_0 = A_02_0 + A_02_2 + A_20_0 + A_20_2;                                  const double tmp74 = w0*(-A_00_4 - A_00_5 - A_00_6 - A_00_7);
3039                                  const double tmp11_0 = A_20_1 + A_20_6;                                  const double tmp75 = w3*(-A_11_4 - A_11_5 - A_11_6 - A_11_7);
3040                                  const double tmp82_0 = A_12_4 + A_12_5 + A_21_4 + A_21_5;                                  const double tmp76 = w1*(-A_01_4 - A_01_7 - A_10_4 - A_10_7);
3041                                  const double tmp99_0 = A_01_4 + A_10_7;                                  const double tmp77 = w15*(-A_02_0 - A_02_2 + A_20_1 + A_20_3);
3042                                  const double tmp49_0 = A_12_1 + A_12_7;                                  const double tmp78 = w21*(A_01_2 + A_10_1);
3043                                  const double tmp130_0 = A_12_0 + A_12_1 + A_12_6 + A_12_7;                                  const double tmp79 = w16*(-A_01_0 - A_01_3 - A_10_0 - A_10_3);
3044                                  const double tmp144_0 = A_01_0 + A_10_3;                                  const double tmp80 = w9*(-A_11_0 - A_11_1 - A_11_2 - A_11_3);
3045                                  const double tmp109_0 = A_22_0 + A_22_3 + A_22_4 + A_22_7;                                  const double tmp81 = w12*(-A_12_0 - A_12_1 + A_21_2 + A_21_3);
3046                                  const double tmp185_0 = A_02_0 + A_02_7 + A_20_2 + A_20_5;                                  const double tmp82 = w5*(-A_02_5 - A_02_7 + A_20_4 + A_20_6);
3047                                  const double tmp157_0 = A_01_4 + A_10_4;                                  const double tmp83 = w6*(-A_12_6 - A_12_7 + A_21_4 + A_21_5);
3048                                  const double tmp51_0 = A_22_1 + A_22_3 + A_22_5 + A_22_7;                                  const double tmp84 = w6*(-A_12_2 - A_12_3 - A_21_2 - A_21_3);
3049                                  const double tmp146_0 = A_00_6 + A_00_7;                                  const double tmp85 = w11*(A_02_1 + A_02_6 - A_20_0 - A_20_7);
3050                                  const double tmp147_0 = A_12_0 + A_12_1 + A_21_0 + A_21_1;                                  const double tmp86 = w20*(A_01_3 - A_10_2);
3051                                  const double tmp150_0 = A_00_2 + A_00_3 + A_00_4 + A_00_5;                                  const double tmp87 = w10*(A_12_0 + A_12_1 + A_12_6 + A_12_7 + A_21_0 + A_21_1 + A_21_6 + A_21_7);
3052                                  const double tmp62_0 = A_21_3 + A_21_5;                                  const double tmp88 = w3*(A_11_0 + A_11_1 + A_11_2 + A_11_3);
3053                                  const double tmp223_0 = A_12_2 + A_21_4;                                  const double tmp89 = w23*(A_22_2 + A_22_3 + A_22_6 + A_22_7);
3054                                  const double tmp16_0 = A_02_2 + A_02_5;                                  const double tmp90 = w1*(-A_01_1 - A_01_2 + A_10_0 + A_10_3);
3055                                  const double tmp168_0 = A_11_1 + A_11_3 + A_11_4 + A_11_6;                                  const double tmp91 = w25*(A_22_0 + A_22_1 + A_22_4 + A_22_5);
3056                                  const double tmp88_0 = A_12_4 + A_12_5 + A_21_2 + A_21_3;                                  const double tmp92 = w15*(A_02_0 + A_02_5 - A_20_1 - A_20_4);
3057                                  const double tmp142_0 = A_01_7 + A_10_4;                                  const double tmp93 = w21*(A_01_4 - A_10_5);
3058                                  const double tmp34_0 = A_20_0 + A_20_2 + A_20_5 + A_20_7;                                  const double tmp94 = w16*(-A_01_5 - A_01_6 + A_10_4 + A_10_7);
3059                                  const double tmp71_0 = A_00_0 + A_00_1 + A_00_6 + A_00_7;                                  const double tmp95 = w28*(A_00_2 + A_00_3);
3060                                  const double tmp213_0 = A_02_1 + A_20_1;                                  const double tmp96 = w12*(-A_12_4 - A_12_5 - A_21_4 - A_21_5);
3061                                  const double tmp227_0 = A_12_2 + A_12_5 + A_21_3 + A_21_4;                                  const double tmp97 = w29*(A_00_4 + A_00_5);
3062                                  const double tmp228_0 = A_12_1 + A_21_7;                                  const double tmp98 = w5*(A_02_2 + A_02_7 - A_20_3 - A_20_6);
3063                                  const double tmp140_0 = A_01_2 + A_01_6;                                  const double tmp99 = w8*(-A_01_0 - A_01_7 + A_10_1 + A_10_6);
3064                                  const double tmp74_0 = A_22_0 + A_22_1 + A_22_4 + A_22_5;                                  const double tmp100 = w9*(A_11_4 + A_11_5 + A_11_6 + A_11_7);
3065                                  const double tmp167_0 = A_11_0 + A_11_2;                                  const double tmp101 = w27*(A_00_0 + A_00_1 + A_00_6 + A_00_7);
3066                                  const double tmp143_0 = A_01_3 + A_01_4 + A_10_0 + A_10_7;                                  const double tmp102 = w17*(A_02_4 - A_20_5);
3067                                  const double tmp83_0 = A_02_0 + A_02_5;                                  const double tmp103 = w2*(-A_02_3 + A_20_2);
3068                                  const double tmp14_0 = A_22_1 + A_22_2 + A_22_5 + A_22_6;                                  const double tmp104 = w13*(A_22_0 + A_22_1 + A_22_2 + A_22_3 + A_22_4 + A_22_5 + A_22_6 + A_22_7);
3069                                  const double tmp5_0 = A_12_1 + A_12_6;                                  const double tmp105 = w6*(-A_12_4 - A_12_5 - A_21_2 - A_21_3);
3070                                  const double tmp94_0 = A_02_1 + A_02_3;                                  const double tmp106 = w22*(A_11_0 + A_11_1 + A_11_2 + A_11_3 + A_11_4 + A_11_5 + A_11_6 + A_11_7);
3071                                  const double tmp193_0 = A_01_1 + A_01_6 + A_10_1 + A_10_6;                                  const double tmp107 = w1*(-A_01_2 - A_01_6 - A_10_1 - A_10_5);
3072                                  const double tmp97_0 = A_02_0 + A_02_2 + A_02_5 + A_02_7;                                  const double tmp108 = w15*(-A_02_1 - A_02_3 - A_20_4 - A_20_6);
3073                                  const double tmp131_0 = A_01_1 + A_01_5;                                  const double tmp109 = w16*(-A_01_1 - A_01_5 - A_10_2 - A_10_6);
3074                                  const double tmp124_0 = A_01_6 + A_10_5;                                  const double tmp110 = w12*(-A_12_2 - A_12_3 - A_21_4 - A_21_5);
3075                                  const double tmp149_0 = A_12_6 + A_12_7 + A_21_6 + A_21_7;                                  const double tmp111 = w5*(-A_02_4 - A_02_6 - A_20_1 - A_20_3);
3076                                  const double tmp187_0 = A_01_2 + A_10_2;                                  const double tmp112 = w8*(-A_01_0 - A_01_3 - A_01_4 - A_01_7 - A_10_0 - A_10_3 - A_10_4 - A_10_7);
3077                                  const double tmp93_0 = A_01_1 + A_01_2 + A_10_1 + A_10_2;                                  const double tmp113 = w27*(A_00_0 + A_00_1 + A_00_2 + A_00_3 + A_00_4 + A_00_5 + A_00_6 + A_00_7);
3078                                  const double tmp25_0 = A_01_4 + A_01_7 + A_10_4 + A_10_7;                                  const double tmp114 = w11*(A_02_0 + A_02_2 + A_02_5 + A_02_7 - A_20_1 - A_20_3 - A_20_4 - A_20_6);
3079                                  const double tmp156_0 = A_12_2 + A_12_5 + A_21_2 + A_21_5;                                  const double tmp115 = w21*(-A_01_4 - A_10_7);
3080                                  const double tmp20_0 = A_21_2 + A_21_5;                                  const double tmp116 = w20*(-A_01_3 - A_10_0);
3081                                  const double tmp55_0 = A_21_2 + A_21_4;                                  const double tmp117 = w15*(A_02_4 + A_02_6 - A_20_5 - A_20_7);
3082                                  const double tmp208_0 = A_12_1 + A_12_6 + A_21_0 + A_21_7;                                  const double tmp118 = w16*(A_01_5 + A_01_6 + A_10_5 + A_10_6);
3083                                  const double tmp125_0 = A_12_4 + A_12_5;                                  const double tmp119 = w5*(A_02_1 + A_02_3 - A_20_0 - A_20_2);
3084                                  const double tmp158_0 = A_01_0 + A_01_7 + A_10_0 + A_10_7;                                  const double tmp120 = w8*(A_01_0 + A_01_7 + A_10_3 + A_10_4);
3085                                  const double tmp108_0 = A_01_1 + A_01_5 + A_10_1 + A_10_5;                                  const double tmp121 = w1*(A_01_1 + A_01_2 + A_10_1 + A_10_2);
3086                                  const double tmp199_0 = A_12_2 + A_12_4 + A_21_2 + A_21_4;                                  const double tmp122 = w18*(A_12_2 - A_21_6);
3087                                  const double tmp10_0 = A_02_1 + A_02_4;                                  const double tmp123 = w13*(A_22_0 + A_22_3 + A_22_4 + A_22_7);
3088                                  const double tmp182_0 = A_02_3 + A_02_6 + A_20_3 + A_20_6;                                  const double tmp124 = w11*(-A_02_0 - A_02_7 + A_20_3 + A_20_4);
3089                                  const double tmp132_0 = A_02_1 + A_20_4;                                  const double tmp125 = w7*(A_22_1 + A_22_5);
3090                                  const double tmp191_0 = A_12_3 + A_12_4 + A_21_3 + A_21_4;                                  const double tmp126 = w10*(-A_12_3 - A_12_4 + A_21_0 + A_21_7);
3091                                  const double tmp35_0 = A_11_0 + A_11_1 + A_11_2 + A_11_3;                                  const double tmp127 = w3*(A_11_1 + A_11_3 + A_11_5 + A_11_7);
3092                                  const double tmp164_0 = A_10_3 + A_10_4;                                  const double tmp128 = w1*(-A_01_1 - A_01_5 - A_10_1 - A_10_5);
3093                                  const double tmp190_0 = A_12_5 + A_21_5;                                  const double tmp129 = w4*(-A_12_5 + A_21_1);
3094                                  const double tmp73_0 = A_02_1 + A_02_6;                                  const double tmp130 = w16*(-A_01_2 - A_01_6 - A_10_2 - A_10_6);
3095                                  const double tmp98_0 = A_01_0 + A_01_7 + A_10_3 + A_10_4;                                  const double tmp131 = w9*(A_11_0 + A_11_2 + A_11_4 + A_11_6);
3096                                  const double tmp225_0 = A_12_4 + A_21_2;                                  const double tmp132 = w19*(A_22_2 + A_22_6);
3097                                  const double tmp103_0 = A_02_4 + A_02_6;                                  const double tmp133 = w17*(-A_02_2 + A_20_6);
3098                                  const double tmp194_0 = A_02_0 + A_02_7 + A_20_0 + A_20_7;                                  const double tmp134 = w2*(A_02_5 - A_20_1);
3099                                  const double tmp207_0 = A_12_0 + A_21_6;                                  const double tmp135 = w11*(A_02_1 + A_02_3 + A_02_4 + A_02_6 + A_20_1 + A_20_3 + A_20_4 + A_20_6);
3100                                  const double tmp102_0 = A_20_5 + A_20_7;                                  const double tmp136 = w1*(A_01_3 + A_01_7 + A_10_0 + A_10_4);
3101                                  const double tmp1_0 = A_22_3 + A_22_7;                                  const double tmp137 = w15*(A_02_0 + A_02_2 + A_20_5 + A_20_7);
3102                                  const double tmp172_0 = A_10_1 + A_10_5;                                  const double tmp138 = w16*(A_01_0 + A_01_4 + A_10_3 + A_10_7);
3103                                  const double tmp222_0 = A_12_5 + A_21_3;                                  const double tmp139 = w5*(A_02_5 + A_02_7 + A_20_0 + A_20_2);
3104                                  const double tmp201_0 = A_02_2 + A_02_5 + A_20_2 + A_20_5;                                  const double tmp140 = w18*(A_12_5 - A_21_1);
3105                                  const double tmp155_0 = A_12_4 + A_21_4;                                  const double tmp141 = w14*(A_00_0 + A_00_1 + A_00_4 + A_00_5);
3106                                  const double tmp174_0 = A_02_1 + A_02_4 + A_20_1 + A_20_4;                                  const double tmp142 = w7*(A_22_2 + A_22_6);
3107                                  const double tmp59_0 = A_01_0 + A_01_3;                                  const double tmp143 = w1*(-A_01_2 - A_01_6 - A_10_2 - A_10_6);
3108                                  const double tmp21_0 = A_20_2 + A_20_7;                                  const double tmp144 = w4*(-A_12_2 + A_21_6);
3109                                  const double tmp141_0 = A_02_2 + A_02_7 + A_20_2 + A_20_7;                                  const double tmp145 = w15*(-A_02_1 - A_02_4 + A_20_0 + A_20_5);
3110                                  const double tmp210_0 = A_01_1 + A_10_1;                                  const double tmp146 = w0*(A_00_2 + A_00_3 + A_00_6 + A_00_7);
3111                                  const double tmp145_0 = A_00_0 + A_00_1;                                  const double tmp147 = w16*(-A_01_1 - A_01_5 - A_10_1 - A_10_5);
3112                                  const double tmp121_0 = A_12_0 + A_12_1 + A_21_6 + A_21_7;                                  const double tmp148 = w5*(-A_02_3 - A_02_6 + A_20_2 + A_20_7);
3113                                  const double tmp224_0 = A_12_3 + A_12_4 + A_21_2 + A_21_5;                                  const double tmp149 = w19*(A_22_1 + A_22_5);
3114                                  const double tmp186_0 = A_02_2 + A_20_7;                                  const double tmp150 = w17*(-A_02_5 + A_20_1);
3115                                  const double tmp53_0 = A_11_4 + A_11_6;                                  const double tmp151 = w2*(A_02_2 - A_20_6);
3116                                  const double tmp184_0 = A_02_5 + A_20_0;                                  const double tmp152 = w18*(A_12_3 - A_21_7);
3117                                  const double tmp38_0 = A_12_0 + A_12_1;                                  const double tmp153 = w11*(A_02_1 + A_02_6 - A_20_2 - A_20_5);
3118                                  const double tmp12_0 = A_01_1 + A_01_2 + A_01_5 + A_01_6 + A_10_1 + A_10_2 + A_10_5 + A_10_6;                                  const double tmp154 = w10*(-A_12_2 - A_12_5 + A_21_1 + A_21_6);
3119                                  const double tmp230_0 = A_12_6 + A_21_0;                                  const double tmp155 = w4*(-A_12_4 + A_21_0);
3120                                  const double tmp23_0 = A_11_4 + A_11_5 + A_11_6 + A_11_7;                                  const double tmp156 = w15*(A_02_2 + A_02_7 - A_20_3 - A_20_6);
3121                                  const double tmp81_0 = A_20_1 + A_20_4;                                  const double tmp157 = w5*(A_02_0 + A_02_5 - A_20_1 - A_20_4);
3122                                  const double tmp134_0 = A_10_3 + A_10_7;                                  const double tmp158 = w17*(A_02_3 - A_20_7);
3123                                  const double tmp129_0 = A_21_0 + A_21_1;                                  const double tmp159 = w2*(-A_02_4 + A_20_0);
3124                                  const double tmp137_0 = A_01_0 + A_01_3 + A_01_4 + A_01_7;                                  const double tmp160 = w6*(A_12_6 + A_12_7 + A_21_0 + A_21_1);
3125                                  const double tmp198_0 = A_01_0 + A_10_0;                                  const double tmp161 = w10*(-A_12_2 - A_12_3 - A_12_4 - A_12_5 - A_21_2 - A_21_3 - A_21_4 - A_21_5);
3126                                  const double tmp9_0 = A_21_1 + A_21_7;                                  const double tmp162 = w1*(A_01_0 + A_01_4 + A_10_3 + A_10_7);
3127                                  const double tmp179_0 = A_01_0 + A_01_4;                                  const double tmp163 = w16*(A_01_3 + A_01_7 + A_10_0 + A_10_4);
3128                                  const double tmp100_0 = A_20_1 + A_20_3 + A_20_4 + A_20_6;                                  const double tmp164 = w12*(A_12_0 + A_12_1 + A_21_6 + A_21_7);
3129                                  const double tmp173_0 = A_02_0 + A_20_5;                                  const double tmp165 = w20*(A_01_6 + A_10_5);
3130                                  const double tmp42_0 = A_21_0 + A_21_1 + A_21_6 + A_21_7;                                  const double tmp166 = w10*(-A_12_0 - A_12_1 - A_12_6 - A_12_7 + A_21_2 + A_21_3 + A_21_4 + A_21_5);
3131                                  const double tmp226_0 = A_12_3 + A_21_5;                                  const double tmp167 = w15*(A_02_1 + A_02_3 - A_20_0 - A_20_2);
3132                                  const double tmp6_0 = A_22_0 + A_22_4;                                  const double tmp168 = w21*(A_01_1 + A_10_2);
3133                                  const double tmp218_0 = A_12_1 + A_21_1;                                  const double tmp169 = w12*(A_12_2 + A_12_3 - A_21_0 - A_21_1);
3134                                  const double tmp28_0 = A_01_2 + A_10_1;                                  const double tmp170 = w5*(A_02_4 + A_02_6 - A_20_5 - A_20_7);
3135                                  const double tmp133_0 = A_02_6 + A_20_3;                                  const double tmp171 = w8*(-A_01_2 - A_01_5 - A_10_1 - A_10_6);
3136                                  const double tmp13_0 = A_00_2 + A_00_3 + A_00_6 + A_00_7;                                  const double tmp172 = w6*(A_12_4 + A_12_5 - A_21_6 - A_21_7);
3137                                  const double tmp27_0 = A_12_2 + A_12_3 + A_12_4 + A_12_5;                                  const double tmp173 = w2*(A_02_1 + A_20_4);
3138                                  const double tmp75_0 = A_10_1 + A_10_6;                                  const double tmp174 = w11*(-A_02_3 - A_02_4 - A_20_1 - A_20_6);
3139                                  const double tmp36_0 = A_01_0 + A_01_3 + A_10_0 + A_10_3;                                  const double tmp175 = w14*(-A_00_2 - A_00_3 - A_00_6 - A_00_7);
3140                                  const double tmp138_0 = A_10_0 + A_10_4;                                  const double tmp176 = w22*(-A_11_0 - A_11_1 - A_11_2 - A_11_3 - A_11_4 - A_11_5 - A_11_6 - A_11_7);
3141                                  const double tmp189_0 = A_12_2 + A_21_2;                                  const double tmp177 = w1*(A_01_1 + A_01_5 - A_10_0 - A_10_4);
3142                                  const double tmp181_0 = A_02_7 + A_20_2;                                  const double tmp178 = w25*(-A_22_2 - A_22_3 - A_22_6 - A_22_7);
3143                                  const double tmp85_0 = A_02_1 + A_02_3 + A_20_4 + A_20_6;                                  const double tmp179 = w15*(-A_02_2 - A_02_7 - A_20_2 - A_20_7);
3144                                  const double tmp122_0 = A_01_1 + A_10_2;                                  const double tmp180 = w0*(-A_00_0 - A_00_1 - A_00_4 - A_00_5);
3145                                  const double tmp95_0 = A_01_3 + A_10_0;                                  const double tmp181 = w16*(A_01_2 + A_01_6 - A_10_3 - A_10_7);
3146                                  const double tmp120_0 = A_12_6 + A_12_7 + A_21_0 + A_21_1;                                  const double tmp182 = w12*(-A_12_6 - A_12_7 + A_21_2 + A_21_3);
3147                                  const double tmp196_0 = A_02_0 + A_20_0;                                  const double tmp183 = w5*(-A_02_0 - A_02_5 - A_20_0 - A_20_5);
3148                                  const double tmp171_0 = A_02_3 + A_02_4;                                  const double tmp184 = w8*(A_01_0 + A_01_3 + A_01_4 + A_01_7 - A_10_1 - A_10_2 - A_10_5 - A_10_6);
3149                                  const double tmp204_0 = A_12_1 + A_12_6 + A_21_1 + A_21_6;                                  const double tmp185 = w6*(-A_12_0 - A_12_1 + A_21_4 + A_21_5);
3150                                  const double tmp45_0 = A_10_1 + A_10_2;                                  const double tmp186 = w17*(-A_02_6 - A_20_3);
3151                                  const double tmp101_0 = A_01_5 + A_01_6 + A_10_5 + A_10_6;                                  const double tmp187 = w23*(-A_22_0 - A_22_1 - A_22_4 - A_22_5);
3152                                  const double tmp58_0 = A_11_0 + A_11_2 + A_11_5 + A_11_7;                                  const double tmp188 = w18*(A_12_4 - A_21_0);
3153                                  const double tmp107_0 = A_20_3 + A_20_4;                                  const double tmp189 = w7*(A_22_3 + A_22_7);
3154                                  const double tmp30_0 = A_01_1 + A_01_6 + A_10_2 + A_10_5;                                  const double tmp190 = w1*(A_01_3 + A_01_7 + A_10_3 + A_10_7);
3155                                  const double tmp63_0 = A_12_2 + A_12_5;                                  const double tmp191 = w4*(-A_12_3 + A_21_7);
3156                                  const double tmp127_0 = A_12_2 + A_12_3;                                  const double tmp192 = w16*(A_01_0 + A_01_4 + A_10_0 + A_10_4);
3157                                  const double tmp177_0 = A_02_2 + A_02_5 + A_20_0 + A_20_7;                                  const double tmp193 = w19*(A_22_0 + A_22_4);
3158                                  const double tmp178_0 = A_10_0 + A_10_3 + A_10_4 + A_10_7;                                  const double tmp194 = w17*(A_02_4 - A_20_0);
3159                                  const double tmp76_0 = A_01_1 + A_01_2;                                  const double tmp195 = w2*(-A_02_3 + A_20_7);
3160                                  const double tmp80_0 = A_22_2 + A_22_3 + A_22_6 + A_22_7;                                  const double tmp196 = w20*(-A_01_7 - A_10_4);
3161                                  const double tmp41_0 = A_12_6 + A_12_7;                                  const double tmp197 = w21*(-A_01_0 - A_10_3);
3162                                  const double tmp89_0 = A_01_0 + A_01_3 + A_01_4 + A_01_7 + A_10_0 + A_10_3 + A_10_4 + A_10_7;                                  const double tmp198 = w16*(A_01_1 + A_01_2 + A_10_1 + A_10_2);
3163                                  const double tmp116_0 = A_02_1 + A_02_3 + A_02_4 + A_02_6 + A_20_1 + A_20_3 + A_20_4 + A_20_6;                                  const double tmp199 = w8*(A_01_3 + A_01_4 + A_10_0 + A_10_7);
3164                                  const double tmp33_0 = A_22_0 + A_22_1 + A_22_2 + A_22_3 + A_22_4 + A_22_5 + A_22_6 + A_22_7;                                  const double tmp200 = w1*(A_01_5 + A_01_6 + A_10_5 + A_10_6);
3165                                  const double tmp169_0 = A_21_3 + A_21_4;                                  const double tmp201 = w27*(A_00_2 + A_00_3 + A_00_4 + A_00_5);
3166                                  const double tmp96_0 = A_20_0 + A_20_2;                                  const double tmp202 = w11*(-A_02_2 - A_02_5 + A_20_3 + A_20_4);
3167                                  const double tmp111_0 = A_12_3 + A_12_4;                                  const double tmp203 = w20*(A_01_0 - A_10_1);
3168                                  const double tmp118_0 = A_20_2 + A_20_5;                                  const double tmp204 = w23*(A_22_0 + A_22_1 + A_22_4 + A_22_5);
3169                                  const double tmp19_0 = A_12_3 + A_12_5;                                  const double tmp205 = w25*(A_22_2 + A_22_3 + A_22_6 + A_22_7);
3170                                  const double tmp68_0 = A_01_5 + A_01_6;                                  const double tmp206 = w21*(A_01_7 - A_10_6);
3171                                  const double tmp7_0 = A_11_1 + A_11_3 + A_11_5 + A_11_7;                                  const double tmp207 = w12*(A_12_6 + A_12_7 + A_21_6 + A_21_7);
3172                                  const double tmp154_0 = A_12_3 + A_21_3;                                  const double tmp208 = w28*(A_00_0 + A_00_1);
3173                                  const double tmp152_0 = A_02_4 + A_20_4;                                  const double tmp209 = w29*(A_00_6 + A_00_7);
3174                                  const double tmp153_0 = A_02_3 + A_20_3;                                  const double tmp210 = w8*(-A_01_3 - A_01_4 + A_10_2 + A_10_5);
3175                                  const double tmp163_0 = A_02_5 + A_02_7 + A_20_5 + A_20_7;                                  const double tmp211 = w6*(A_12_0 + A_12_1 + A_21_0 + A_21_1);
3176                                  const double tmp44_0 = A_01_4 + A_01_7;                                  const double tmp212 = w17*(-A_02_7 + A_20_6);
3177                                  const double tmp39_0 = A_02_1 + A_02_3 + A_02_4 + A_02_6;                                  const double tmp213 = w2*(A_02_0 - A_20_1);
3178                                  const double tmp123_0 = A_21_2 + A_21_3 + A_21_4 + A_21_5;                                  const double tmp214 = w13*(-A_22_1 - A_22_2 - A_22_5 - A_22_6);
3179                                  const double tmp40_0 = A_02_5 + A_02_7;                                  const double tmp215 = w22*(-A_11_0 - A_11_2 - A_11_5 - A_11_7);
3180                                  const double tmp110_0 = A_02_0 + A_02_7;                                  const double tmp216 = w8*(A_01_0 + A_01_7 + A_10_0 + A_10_7);
3181                                  const double tmp77_0 = A_12_2 + A_12_3 + A_21_2 + A_21_3;                                  const double tmp217 = w27*(-A_00_0 - A_00_1 - A_00_6 - A_00_7);
3182                                  const double tmp209_0 = A_12_7 + A_21_1;                                  const double tmp218 = w17*(-A_02_3 - A_20_3);
3183                                  const double tmp219_0 = A_02_4 + A_20_1;                                  const double tmp219 = w2*(A_02_4 + A_20_4);
3184                                  const double tmp84_0 = A_01_1 + A_01_5 + A_10_2 + A_10_6;                                  const double tmp220 = w11*(-A_02_1 - A_02_6 - A_20_1 - A_20_6);
3185                                  const double tmp162_0 = A_12_1 + A_12_7 + A_21_1 + A_21_7;                                  const double tmp221 = w26*(-A_11_4 - A_11_6);
3186                                  const double tmp159_0 = A_01_3 + A_10_3;                                  const double tmp222 = w10*(A_12_2 + A_12_5 + A_21_2 + A_21_5);
3187                                  const double tmp56_0 = A_11_1 + A_11_3;                                  const double tmp223 = w20*(-A_01_4 - A_10_4);
3188                                  const double tmp52_0 = A_01_2 + A_01_5;                                  const double tmp224 = w21*(-A_01_3 - A_10_3);
3189                                  const double tmp26_0 = A_00_4 + A_00_5 + A_00_6 + A_00_7;                                  const double tmp225 = w6*(-A_12_0 - A_12_6 - A_21_0 - A_21_6);
3190                                  const double tmp229_0 = A_12_0 + A_12_7 + A_21_1 + A_21_6;                                  const double tmp226 = w7*(-A_22_0 - A_22_4);
3191                                  const double tmp151_0 = A_10_2 + A_10_5;                                  const double tmp227 = w24*(-A_11_1 - A_11_3);
3192                                  const double tmp136_0 = A_02_0 + A_02_5 + A_20_0 + A_20_5;                                  const double tmp228 = w19*(-A_22_3 - A_22_7);
3193                                  const double tmp128_0 = A_21_6 + A_21_7;                                  const double tmp229 = w18*(-A_12_3 - A_21_3);
3194                                  const double tmp15_0 = A_12_2 + A_12_4;                                  const double tmp230 = w4*(A_12_4 + A_21_4);
3195                                  const double tmp296_1 = tmp159_0*w42;                                  const double tmp231 = w28*(-A_00_4 - A_00_5);
3196                                  const double tmp130_1 = tmp67_0*w5;                                  const double tmp232 = w12*(-A_12_1 - A_12_7 - A_21_1 - A_21_7);
3197                                  const double tmp98_1 = A_01_6*w42;                                  const double tmp233 = w29*(-A_00_2 - A_00_3);
3198                                  const double tmp231_1 = tmp125_0*w6;                                  const double tmp234 = w20*(-A_01_5 + A_10_7);
3199                                  const double tmp42_1 = tmp34_0*w12;                                  const double tmp235 = w18*(-A_12_0 + A_21_2);
3200                                  const double tmp199_1 = A_02_5*w28;                                  const double tmp236 = w26*(A_11_5 + A_11_7);
3201                                  const double tmp113_1 = tmp29_0*w13;                                  const double tmp237 = w10*(A_12_1 + A_12_6 - A_21_3 - A_21_4);
3202                                  const double tmp330_1 = tmp152_0*w28;                                  const double tmp238 = w22*(A_11_1 + A_11_3 + A_11_4 + A_11_6);
3203                                  const double tmp90_1 = A_01_1*w46;                                  const double tmp239 = w4*(A_12_7 - A_21_5);
3204                                  const double tmp446_1 = tmp77_0*w22;                                  const double tmp240 = w15*(A_02_0 + A_02_2 + A_20_0 + A_20_2);
3205                                  const double tmp108_1 = tmp43_0*w5;                                  const double tmp241 = w21*(-A_01_2 + A_10_0);
3206                                  const double tmp524_1 = A_12_6*w29;                                  const double tmp242 = w5*(A_02_5 + A_02_7 + A_20_5 + A_20_7);
3207                                  const double tmp232_1 = tmp126_0*w34;                                  const double tmp243 = w12*(-A_12_2 - A_12_4 + A_21_0 + A_21_6);
3208                                  const double tmp33_1 = tmp25_0*w37;                                  const double tmp244 = w24*(A_11_0 + A_11_2);
3209                                  const double tmp461_1 = tmp180_0*w1;                                  const double tmp245 = w8*(A_01_1 + A_01_6 - A_10_3 - A_10_4);
3210                                  const double tmp14_1 = tmp8_0*w6;                                  const double tmp246 = w6*(-A_12_3 - A_12_5 + A_21_1 + A_21_7);
3211                                  const double tmp447_1 = tmp205_0*w26;                                  const double tmp247 = w11*(A_02_3 + A_02_4 - A_20_2 - A_20_5);
3212                                  const double tmp452_1 = tmp198_0*w42;                                  const double tmp248 = w20*(-A_01_1 + A_10_0);
3213                                  const double tmp217_1 = tmp81_0*w9;                                  const double tmp249 = w21*(-A_01_6 + A_10_7);
3214                                  const double tmp76_1 = tmp59_0*w20;                                  const double tmp250 = w8*(A_01_2 + A_01_5 - A_10_3 - A_10_4);
3215                                  const double tmp421_1 = tmp134_0*w31;                                  const double tmp251 = w17*(A_02_6 - A_20_7);
3216                                  const double tmp485_1 = tmp51_0*w51;                                  const double tmp252 = w2*(-A_02_1 + A_20_0);
3217                                  const double tmp240_1 = tmp131_0*w1;                                  const double tmp253 = w17*(-A_02_4 - A_20_4);
3218                                  const double tmp160_1 = tmp91_0*w9;                                  const double tmp254 = w2*(A_02_3 + A_20_3);
3219                                  const double tmp174_1 = A_20_1*w26;                                  const double tmp255 = w26*(-A_11_1 - A_11_3);
3220                                  const double tmp273_1 = A_10_1*w46;                                  const double tmp256 = w20*(-A_01_3 - A_10_3);
3221                                  const double tmp159_1 = tmp90_0*w47;                                  const double tmp257 = w21*(-A_01_4 - A_10_4);
3222                                  const double tmp228_1 = tmp103_0*w5;                                  const double tmp258 = w6*(-A_12_1 - A_12_7 - A_21_1 - A_21_7);
3223                                  const double tmp313_1 = tmp166_0*w45;                                  const double tmp259 = w7*(-A_22_3 - A_22_7);
3224                                  const double tmp45_1 = tmp37_0*w30;                                  const double tmp260 = w15*(-A_02_0 - A_02_5 - A_20_0 - A_20_5);
3225                                  const double tmp512_1 = tmp147_0*w13;                                  const double tmp261 = w24*(-A_11_4 - A_11_6);
3226                                  const double tmp73_1 = tmp56_0*w43;                                  const double tmp262 = w19*(-A_22_0 - A_22_4);
3227                                  const double tmp61_1 = A_01_6*w46;