/[escript]/branches/diaplayground/ripley/src/Brick.cpp
ViewVC logotype

Diff of /branches/diaplayground/ripley/src/Brick.cpp

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

branches/ripleygmg_from_3668/ripley/src/Brick.cpp revision 3761 by caltinay, Mon Jan 9 06:50:33 2012 UTC trunk/ripley/src/Brick.cpp revision 4377 by caltinay, Tue Apr 23 05:30:02 2013 UTC
# Line 1  Line 1 
1    
2  /*******************************************************  /*****************************************************************************
3  *  *
4  * Copyright (c) 2003-2011 by University of Queensland  * Copyright (c) 2003-2013 by University of Queensland
5  * Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)  * http://www.uq.edu.au
 * http://www.uq.edu.au/esscc  
6  *  *
7  * Primary Business: Queensland, Australia  * Primary Business: Queensland, Australia
8  * Licensed under the Open Software License version 3.0  * Licensed under the Open Software License version 3.0
9  * http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php  * http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php
10  *  *
11  *******************************************************/  * Development until 2012 by Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)
12    * Development since 2012 by School of Earth Sciences
13    *
14    *****************************************************************************/
15    
16  #include <ripley/Brick.h>  #include <ripley/Brick.h>
17  extern "C" {  #include <paso/SystemMatrix.h>
18  #include "paso/SystemMatrix.h"  #include <esysUtils/esysFileWriter.h>
19  }  
20    #ifdef USE_NETCDF
21    #include <netcdfcpp.h>
22    #endif
23    
24  #if USE_SILO  #if USE_SILO
25  #include <silo.h>  #include <silo.h>
# Line 26  extern "C" { Line 31  extern "C" {
31  #include <iomanip>  #include <iomanip>
32    
33  using namespace std;  using namespace std;
34    using esysUtils::FileWriter;
35    
36  namespace ripley {  namespace ripley {
37    
38  Brick::Brick(int n0, int n1, int n2, double l0, double l1, double l2, int d0,  Brick::Brick(int n0, int n1, int n2, double x0, double y0, double z0,
39               int d1, int d2) :               double x1, double y1, double z1, int d0, int d1, int d2) :
40      RipleyDomain(3),      RipleyDomain(3)
     m_gNE0(n0),  
     m_gNE1(n1),  
     m_gNE2(n2),  
     m_l0(l0),  
     m_l1(l1),  
     m_l2(l2),  
     m_NX(d0),  
     m_NY(d1),  
     m_NZ(d2)  
41  {  {
42        // ignore subdivision parameters for serial run
43        if (m_mpiInfo->size == 1) {
44            d0=1;
45            d1=1;
46            d2=1;
47        }
48    
49        bool warn=false;
50        // if number of subdivisions is non-positive, try to subdivide by the same
51        // ratio as the number of elements
52        if (d0<=0 && d1<=0 && d2<=0) {
53            warn=true;
54            d0=(int)(pow(m_mpiInfo->size*(n0+1)*(n0+1)/((float)(n1+1)*(n2+1)), 1.f/3));
55            d0=max(1, d0);
56            d1=max(1, (int)(d0*n1/(float)n0));
57            d2=m_mpiInfo->size/(d0*d1);
58            if (d0*d1*d2 != m_mpiInfo->size) {
59                // ratios not the same so leave "smallest" side undivided and try
60                // dividing 2 sides only
61                if (n0>=n1) {
62                    if (n1>=n2) {
63                        d0=d1=0;
64                        d2=1;
65                    } else {
66                        d0=d2=0;
67                        d1=1;
68                    }
69                } else {
70                    if (n0>=n2) {
71                        d0=d1=0;
72                        d2=1;
73                    } else {
74                        d0=1;
75                        d1=d2=0;
76                    }
77                }
78            }
79        }
80        if (d0<=0 && d1<=0) {
81            warn=true;
82            d0=max(1, int(sqrt(m_mpiInfo->size*(n0+1)/(float)(n1+1))));
83            d1=m_mpiInfo->size/d0;
84            if (d0*d1*d2 != m_mpiInfo->size) {
85                // ratios not the same so subdivide side with more elements only
86                if (n0>n1) {
87                    d0=0;
88                    d1=1;
89                } else {
90                    d0=1;
91                    d1=0;
92                }
93            }
94        } else if (d0<=0 && d2<=0) {
95            warn=true;
96            d0=max(1, int(sqrt(m_mpiInfo->size*(n0+1)/(float)(n2+1))));
97            d2=m_mpiInfo->size/d0;
98            if (d0*d1*d2 != m_mpiInfo->size) {
99                // ratios not the same so subdivide side with more elements only
100                if (n0>n2) {
101                    d0=0;
102                    d2=1;
103                } else {
104                    d0=1;
105                    d2=0;
106                }
107            }
108        } else if (d1<=0 && d2<=0) {
109            warn=true;
110            d1=max(1, int(sqrt(m_mpiInfo->size*(n1+1)/(float)(n2+1))));
111            d2=m_mpiInfo->size/d1;
112            if (d0*d1*d2 != m_mpiInfo->size) {
113                // ratios not the same so subdivide side with more elements only
114                if (n1>n2) {
115                    d1=0;
116                    d2=1;
117                } else {
118                    d1=1;
119                    d2=0;
120                }
121            }
122        }
123        if (d0<=0) {
124            // d1,d2 are preset, determine d0
125            d0=m_mpiInfo->size/(d1*d2);
126        } else if (d1<=0) {
127            // d0,d2 are preset, determine d1
128            d1=m_mpiInfo->size/(d0*d2);
129        } else if (d2<=0) {
130            // d0,d1 are preset, determine d2
131            d2=m_mpiInfo->size/(d0*d1);
132        }
133    
134      // ensure number of subdivisions is valid and nodes can be distributed      // ensure number of subdivisions is valid and nodes can be distributed
135      // among number of ranks      // among number of ranks
136      if (m_NX*m_NY*m_NZ != m_mpiInfo->size)      if (d0*d1*d2 != m_mpiInfo->size)
137          throw RipleyException("Invalid number of spatial subdivisions");          throw RipleyException("Invalid number of spatial subdivisions");
138    
139      if ((n0+1)%m_NX > 0 || (n1+1)%m_NY > 0 || (n2+1)%m_NZ > 0)      if (warn) {
140          throw RipleyException("Number of elements+1 must be separable into number of ranks in each dimension");          cout << "Warning: Automatic domain subdivision (d0=" << d0 << ", d1="
141                << d1 << ", d2=" << d2 << "). This may not be optimal!" << endl;
142        }
143    
144        double l0 = x1-x0;
145        double l1 = y1-y0;
146        double l2 = z1-z0;
147        m_dx[0] = l0/n0;
148        m_dx[1] = l1/n1;
149        m_dx[2] = l2/n2;
150    
151        if ((n0+1)%d0 > 0) {
152            n0=(int)round((float)(n0+1)/d0+0.5)*d0-1;
153            l0=m_dx[0]*n0;
154            cout << "Warning: Adjusted number of elements and length. N0="
155                << n0 << ", l0=" << l0 << endl;
156        }
157        if ((n1+1)%d1 > 0) {
158            n1=(int)round((float)(n1+1)/d1+0.5)*d1-1;
159            l1=m_dx[1]*n1;
160            cout << "Warning: Adjusted number of elements and length. N1="
161                << n1 << ", l1=" << l1 << endl;
162        }
163        if ((n2+1)%d2 > 0) {
164            n2=(int)round((float)(n2+1)/d2+0.5)*d2-1;
165            l2=m_dx[2]*n2;
166            cout << "Warning: Adjusted number of elements and length. N2="
167                << n2 << ", l2=" << l2 << endl;
168        }
169    
170      if ((m_NX > 1 && (n0+1)/m_NX<2) || (m_NY > 1 && (n1+1)/m_NY<2) || (m_NZ > 1 && (n2+1)/m_NZ<2))      if ((d0 > 1 && (n0+1)/d0<2) || (d1 > 1 && (n1+1)/d1<2) || (d2 > 1 && (n2+1)/d2<2))
171          throw RipleyException("Too few elements for the number of ranks");          throw RipleyException("Too few elements for the number of ranks");
172    
173        m_gNE[0] = n0;
174        m_gNE[1] = n1;
175        m_gNE[2] = n2;
176        m_origin[0] = x0;
177        m_origin[1] = y0;
178        m_origin[2] = z0;
179        m_length[0] = l0;
180        m_length[1] = l1;
181        m_length[2] = l2;
182        m_NX[0] = d0;
183        m_NX[1] = d1;
184        m_NX[2] = d2;
185    
186      // local number of elements (including overlap)      // local number of elements (including overlap)
187      m_NE0 = (m_NX>1 ? (n0+1)/m_NX : n0);      m_NE[0] = m_ownNE[0] = (d0>1 ? (n0+1)/d0 : n0);
188      if (m_mpiInfo->rank%m_NX>0 && m_mpiInfo->rank%m_NX<m_NX-1)      if (m_mpiInfo->rank%d0>0 && m_mpiInfo->rank%d0<d0-1)
189          m_NE0++;          m_NE[0]++;
190      m_NE1 = (m_NY>1 ? (n1+1)/m_NY : n1);      else if (d0>1 && m_mpiInfo->rank%d0==d0-1)
191      if (m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX>0 && m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX<m_NY-1)          m_ownNE[0]--;
192          m_NE1++;  
193      m_NE2 = (m_NZ>1 ? (n2+1)/m_NZ : n2);      m_NE[1] = m_ownNE[1] = (d1>1 ? (n1+1)/d1 : n1);
194      if (m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY)>0 && m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY)<m_NZ-1)      if (m_mpiInfo->rank%(d0*d1)/d0>0 && m_mpiInfo->rank%(d0*d1)/d0<d1-1)
195          m_NE2++;          m_NE[1]++;
196        else if (d1>1 && m_mpiInfo->rank%(d0*d1)/d0==d1-1)
197            m_ownNE[1]--;
198    
199        m_NE[2] = m_ownNE[2] = (d2>1 ? (n2+1)/d2 : n2);
200        if (m_mpiInfo->rank/(d0*d1)>0 && m_mpiInfo->rank/(d0*d1)<d2-1)
201            m_NE[2]++;
202        else if (d2>1 && m_mpiInfo->rank/(d0*d1)==d2-1)
203            m_ownNE[2]--;
204    
205      // local number of nodes      // local number of nodes
206      m_N0 = m_NE0+1;      m_NN[0] = m_NE[0]+1;
207      m_N1 = m_NE1+1;      m_NN[1] = m_NE[1]+1;
208      m_N2 = m_NE2+1;      m_NN[2] = m_NE[2]+1;
209    
210      // bottom-left-front node is at (offset0,offset1,offset2) in global mesh      // bottom-left-front node is at (offset0,offset1,offset2) in global mesh
211      m_offset0 = (n0+1)/m_NX*(m_mpiInfo->rank%m_NX);      m_offset[0] = (n0+1)/d0*(m_mpiInfo->rank%d0);
212      if (m_offset0 > 0)      if (m_offset[0] > 0)
213          m_offset0--;          m_offset[0]--;
214      m_offset1 = (n1+1)/m_NY*(m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX);      m_offset[1] = (n1+1)/d1*(m_mpiInfo->rank%(d0*d1)/d0);
215      if (m_offset1 > 0)      if (m_offset[1] > 0)
216          m_offset1--;          m_offset[1]--;
217      m_offset2 = (n2+1)/m_NZ*(m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY));      m_offset[2] = (n2+1)/d2*(m_mpiInfo->rank/(d0*d1));
218      if (m_offset2 > 0)      if (m_offset[2] > 0)
219          m_offset2--;          m_offset[2]--;
220    
221      populateSampleIds();      populateSampleIds();
222      createPattern();      createPattern();
# Line 87  Brick::Brick(int n0, int n1, int n2, dou Line 225  Brick::Brick(int n0, int n1, int n2, dou
225    
226  Brick::~Brick()  Brick::~Brick()
227  {  {
228        Paso_SystemMatrixPattern_free(m_pattern);
229        Paso_Connector_free(m_connector);
230  }  }
231    
232  string Brick::getDescription() const  string Brick::getDescription() const
# Line 99  bool Brick::operator==(const AbstractDom Line 239  bool Brick::operator==(const AbstractDom
239      const Brick* o=dynamic_cast<const Brick*>(&other);      const Brick* o=dynamic_cast<const Brick*>(&other);
240      if (o) {      if (o) {
241          return (RipleyDomain::operator==(other) &&          return (RipleyDomain::operator==(other) &&
242                  m_gNE0==o->m_gNE0 && m_gNE1==o->m_gNE1 && m_gNE2==o->m_gNE2                  m_gNE[0]==o->m_gNE[0] && m_gNE[1]==o->m_gNE[1] && m_gNE[2]==o->m_gNE[2]
243                  && m_l0==o->m_l0 && m_l1==o->m_l1 && m_l2==o->m_l2                  && m_origin[0]==o->m_origin[0] && m_origin[1]==o->m_origin[1] && m_origin[2]==o->m_origin[2]
244                  && m_NX==o->m_NX && m_NY==o->m_NY && m_NZ==o->m_NZ);                  && m_length[0]==o->m_length[0] && m_length[1]==o->m_length[1] && m_length[2]==o->m_length[2]
245                    && m_NX[0]==o->m_NX[0] && m_NX[1]==o->m_NX[1] && m_NX[2]==o->m_NX[2]);
246      }      }
247    
248      return false;      return false;
249  }  }
250    
251    void Brick::readNcGrid(escript::Data& out, string filename, string varname,
252                const vector<int>& first, const vector<int>& numValues,
253                const vector<int>& multiplier) const
254    {
255    #ifdef USE_NETCDF
256        // check destination function space
257        int myN0, myN1, myN2;
258        if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Nodes) {
259            myN0 = m_NN[0];
260            myN1 = m_NN[1];
261            myN2 = m_NN[2];
262        } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements ||
263                    out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
264            myN0 = m_NE[0];
265            myN1 = m_NE[1];
266            myN2 = m_NE[2];
267        } else
268            throw RipleyException("readNcGrid(): invalid function space for output data object");
269    
270        if (first.size() != 3)
271            throw RipleyException("readNcGrid(): argument 'first' must have 3 entries");
272    
273        if (numValues.size() != 3)
274            throw RipleyException("readNcGrid(): argument 'numValues' must have 3 entries");
275    
276        if (multiplier.size() != 3)
277            throw RipleyException("readNcGrid(): argument 'multiplier' must have 3 entries");
278        for (size_t i=0; i<multiplier.size(); i++)
279            if (multiplier[i]<1)
280                throw RipleyException("readNcGrid(): all multipliers must be positive");
281    
282        // check file existence and size
283        NcFile f(filename.c_str(), NcFile::ReadOnly);
284        if (!f.is_valid())
285            throw RipleyException("readNcGrid(): cannot open file");
286    
287        NcVar* var = f.get_var(varname.c_str());
288        if (!var)
289            throw RipleyException("readNcGrid(): invalid variable name");
290    
291        // TODO: rank>0 data support
292        const int numComp = out.getDataPointSize();
293        if (numComp > 1)
294            throw RipleyException("readNcGrid(): only scalar data supported");
295    
296        const int dims = var->num_dims();
297        const long *edges = var->edges();
298    
299        // is this a slice of the data object (dims!=3)?
300        // note the expected ordering of edges (as in numpy: z,y,x)
301        if ( (dims==3 && (numValues[2] > edges[0] || numValues[1] > edges[1]
302                          || numValues[0] > edges[2]))
303                || (dims==2 && numValues[2]>1)
304                || (dims==1 && (numValues[2]>1 || numValues[1]>1)) ) {
305            throw RipleyException("readNcGrid(): not enough data in file");
306        }
307    
308        // check if this rank contributes anything
309        if (first[0] >= m_offset[0]+myN0 || first[0]+numValues[0]*multiplier[0] <= m_offset[0] ||
310                first[1] >= m_offset[1]+myN1 || first[1]+numValues[1]*multiplier[1] <= m_offset[1] ||
311                first[2] >= m_offset[2]+myN2 || first[2]+numValues[2]*multiplier[2] <= m_offset[2]) {
312            return;
313        }
314    
315        // now determine how much this rank has to write
316    
317        // first coordinates in data object to write to
318        const int first0 = max(0, first[0]-m_offset[0]);
319        const int first1 = max(0, first[1]-m_offset[1]);
320        const int first2 = max(0, first[2]-m_offset[2]);
321        // indices to first value in file
322        const int idx0 = max(0, m_offset[0]-first[0]);
323        const int idx1 = max(0, m_offset[1]-first[1]);
324        const int idx2 = max(0, m_offset[2]-first[2]);
325        // number of values to read
326        const int num0 = min(numValues[0]-idx0, myN0-first0);
327        const int num1 = min(numValues[1]-idx1, myN1-first1);
328        const int num2 = min(numValues[2]-idx2, myN2-first2);
329    
330        vector<double> values(num0*num1*num2);
331        if (dims==3) {
332            var->set_cur(idx2, idx1, idx0);
333            var->get(&values[0], num2, num1, num0);
334        } else if (dims==2) {
335            var->set_cur(idx1, idx0);
336            var->get(&values[0], num1, num0);
337        } else {
338            var->set_cur(idx0);
339            var->get(&values[0], num0);
340        }
341    
342        const int dpp = out.getNumDataPointsPerSample();
343        out.requireWrite();
344    
345        for (index_t z=0; z<num2; z++) {
346            for (index_t y=0; y<num1; y++) {
347    #pragma omp parallel for
348                for (index_t x=0; x<num0; x++) {
349                    const int baseIndex = first0+x*multiplier[0]
350                                            +(first1+y*multiplier[1])*myN0
351                                            +(first2+z*multiplier[2])*myN0*myN1;
352                    const int srcIndex=z*num1*num0+y*num0+x;
353                    if (!isnan(values[srcIndex])) {
354                        for (index_t m2=0; m2<multiplier[2]; m2++) {
355                            for (index_t m1=0; m1<multiplier[1]; m1++) {
356                                for (index_t m0=0; m0<multiplier[0]; m0++) {
357                                    const int dataIndex = baseIndex+m0
358                                                   +m1*myN0
359                                                   +m2*myN0*myN1;
360                                    double* dest = out.getSampleDataRW(dataIndex);
361                                    for (index_t q=0; q<dpp; q++) {
362                                        *dest++ = values[srcIndex];
363                                    }
364                                }
365                            }
366                        }
367                    }
368                }
369            }
370        }
371    #else
372        throw RipleyException("readNcGrid(): not compiled with netCDF support");
373    #endif
374    }
375    
376    void Brick::readBinaryGrid(escript::Data& out, string filename,
377                               const vector<int>& first,
378                               const vector<int>& numValues,
379                               const vector<int>& multiplier) const
380    {
381        // check destination function space
382        int myN0, myN1, myN2;
383        if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Nodes) {
384            myN0 = m_NN[0];
385            myN1 = m_NN[1];
386            myN2 = m_NN[2];
387        } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements ||
388                    out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
389            myN0 = m_NE[0];
390            myN1 = m_NE[1];
391            myN2 = m_NE[2];
392        } else
393            throw RipleyException("readBinaryGrid(): invalid function space for output data object");
394    
395        if (first.size() != 3)
396            throw RipleyException("readBinaryGrid(): argument 'first' must have 3 entries");
397    
398        if (numValues.size() != 3)
399            throw RipleyException("readBinaryGrid(): argument 'numValues' must have 3 entries");
400    
401        if (multiplier.size() != 3)
402            throw RipleyException("readBinaryGrid(): argument 'multiplier' must have 3 entries");
403        for (size_t i=0; i<multiplier.size(); i++)
404            if (multiplier[i]<1)
405                throw RipleyException("readBinaryGrid(): all multipliers must be positive");
406    
407        // check file existence and size
408        ifstream f(filename.c_str(), ifstream::binary);
409        if (f.fail()) {
410            throw RipleyException("readBinaryGrid(): cannot open file");
411        }
412        f.seekg(0, ios::end);
413        const int numComp = out.getDataPointSize();
414        const int filesize = f.tellg();
415        const int reqsize = numValues[0]*numValues[1]*numValues[2]*numComp*sizeof(float);
416        if (filesize < reqsize) {
417            f.close();
418            throw RipleyException("readBinaryGrid(): not enough data in file");
419        }
420    
421        // check if this rank contributes anything
422        if (first[0] >= m_offset[0]+myN0 || first[0]+numValues[0]*multiplier[0] <= m_offset[0] ||
423                first[1] >= m_offset[1]+myN1 || first[1]+numValues[1]*multiplier[1] <= m_offset[1] ||
424                first[2] >= m_offset[2]+myN2 || first[2]+numValues[2]*multiplier[2] <= m_offset[2]) {
425            f.close();
426            return;
427        }
428    
429        // now determine how much this rank has to write
430    
431        // first coordinates in data object to write to
432        const int first0 = max(0, first[0]-m_offset[0]);
433        const int first1 = max(0, first[1]-m_offset[1]);
434        const int first2 = max(0, first[2]-m_offset[2]);
435        // indices to first value in file
436        const int idx0 = max(0, m_offset[0]-first[0]);
437        const int idx1 = max(0, m_offset[1]-first[1]);
438        const int idx2 = max(0, m_offset[2]-first[2]);
439        // number of values to read
440        const int num0 = min(numValues[0]-idx0, myN0-first0);
441        const int num1 = min(numValues[1]-idx1, myN1-first1);
442        const int num2 = min(numValues[2]-idx2, myN2-first2);
443    
444        out.requireWrite();
445        vector<float> values(num0*numComp);
446        const int dpp = out.getNumDataPointsPerSample();
447    
448        for (index_t z=0; z<num2; z++) {
449            for (index_t y=0; y<num1; y++) {
450                const int fileofs = numComp*(idx0+(idx1+y)*numValues[0]+(idx2+z)*numValues[0]*numValues[1]);
451                f.seekg(fileofs*sizeof(float));
452                f.read((char*)&values[0], num0*numComp*sizeof(float));
453    
454                for (index_t x=0; x<num0; x++) {
455                    const int baseIndex = first0+x*multiplier[0]
456                                            +(first1+y*multiplier[1])*myN0
457                                            +(first2+z*multiplier[2])*myN0*myN1;
458                    for (index_t m2=0; m2<multiplier[2]; m2++) {
459                        for (index_t m1=0; m1<multiplier[1]; m1++) {
460                            for (index_t m0=0; m0<multiplier[0]; m0++) {
461                                const int dataIndex = baseIndex+m0
462                                               +m1*myN0
463                                               +m2*myN0*myN1;
464                                double* dest = out.getSampleDataRW(dataIndex);
465                                for (index_t c=0; c<numComp; c++) {
466                                    if (!std::isnan(values[x*numComp+c])) {
467                                        for (index_t q=0; q<dpp; q++) {
468                                            *dest++ = static_cast<double>(values[x*numComp+c]);
469                                        }
470                                    }
471                                }
472                            }
473                        }
474                    }
475                }
476            }
477        }
478    
479        f.close();
480    }
481    
482    void Brick::writeBinaryGrid(const escript::Data& in, string filename,
483                                int byteOrder, int dataType) const
484    {
485        // the mapping is not universally correct but should work on our
486        // supported platforms
487        switch (dataType) {
488            case DATATYPE_INT32:
489                writeBinaryGridImpl<int>(in, filename, byteOrder);
490                break;
491            case DATATYPE_FLOAT32:
492                writeBinaryGridImpl<float>(in, filename, byteOrder);
493                break;
494            case DATATYPE_FLOAT64:
495                writeBinaryGridImpl<double>(in, filename, byteOrder);
496                break;
497            default:
498                throw RipleyException("writeBinaryGrid(): invalid or unsupported datatype");
499        }
500    }
501    
502    template<typename ValueType>
503    void Brick::writeBinaryGridImpl(const escript::Data& in,
504                                    const string& filename, int byteOrder) const
505    {
506        // check function space and determine number of points
507        int myN0, myN1, myN2;
508        int totalN0, totalN1, totalN2;
509        if (in.getFunctionSpace().getTypeCode() == Nodes) {
510            myN0 = m_NN[0];
511            myN1 = m_NN[1];
512            myN2 = m_NN[2];
513            totalN0 = m_gNE[0]+1;
514            totalN1 = m_gNE[1]+1;
515            totalN2 = m_gNE[2]+1;
516        } else if (in.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements ||
517                    in.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
518            myN0 = m_NE[0];
519            myN1 = m_NE[1];
520            myN2 = m_NE[2];
521            totalN0 = m_gNE[0];
522            totalN1 = m_gNE[1];
523            totalN2 = m_gNE[2];
524        } else
525            throw RipleyException("writeBinaryGrid(): invalid function space of data object");
526    
527        const int numComp = in.getDataPointSize();
528        const int dpp = in.getNumDataPointsPerSample();
529        const int fileSize = sizeof(ValueType)*numComp*dpp*totalN0*totalN1*totalN2;
530    
531        if (numComp > 1 || dpp > 1)
532            throw RipleyException("writeBinaryGrid(): only scalar, single-value data supported");
533    
534        escript::Data* _in = const_cast<escript::Data*>(&in);
535    
536        // from here on we know that each sample consists of one value
537        FileWriter* fw = new FileWriter();
538        fw->openFile(filename, fileSize);
539        MPIBarrier();
540    
541        for (index_t z=0; z<myN2; z++) {
542            for (index_t y=0; y<myN1; y++) {
543                const int fileofs = (m_offset[0]+(m_offset[1]+y)*totalN0
544                                    +(m_offset[2]+z)*totalN0*totalN1)*sizeof(ValueType);
545                ostringstream oss;
546    
547                for (index_t x=0; x<myN0; x++) {
548                    const double* sample = _in->getSampleDataRO(z*myN0*myN1+y*myN0+x);
549                    ValueType fvalue = static_cast<ValueType>(*sample);
550                    if (byteOrder == BYTEORDER_NATIVE) {
551                        oss.write((char*)&fvalue, sizeof(fvalue));
552                    } else {
553                        char* value = reinterpret_cast<char*>(&fvalue);
554                        oss.write(byte_swap32(value), sizeof(fvalue));
555                    }
556                }
557                fw->writeAt(oss, fileofs);
558            }
559        }
560        fw->close();
561    }
562    
563  void Brick::dump(const string& fileName) const  void Brick::dump(const string& fileName) const
564  {  {
565  #if USE_SILO  #if USE_SILO
# Line 115  void Brick::dump(const string& fileName) Line 568  void Brick::dump(const string& fileName)
568          fn+=".silo";          fn+=".silo";
569      }      }
570    
     const int NUM_SILO_FILES = 1;  
     const char* blockDirFmt = "/block%04d";  
571      int driver=DB_HDF5;          int driver=DB_HDF5;    
572      string siloPath;      string siloPath;
573      DBfile* dbfile = NULL;      DBfile* dbfile = NULL;
574    
575  #ifdef ESYS_MPI  #ifdef ESYS_MPI
576      PMPIO_baton_t* baton = NULL;      PMPIO_baton_t* baton = NULL;
577        const int NUM_SILO_FILES = 1;
578        const char* blockDirFmt = "/block%04d";
579  #endif  #endif
580    
581      if (m_mpiInfo->size > 1) {      if (m_mpiInfo->size > 1) {
# Line 167  void Brick::dump(const string& fileName) Line 620  void Brick::dump(const string& fileName)
620      }      }
621      */      */
622    
623      boost::scoped_ptr<double> x(new double[m_N0]);      boost::scoped_ptr<double> x(new double[m_NN[0]]);
624      boost::scoped_ptr<double> y(new double[m_N1]);      boost::scoped_ptr<double> y(new double[m_NN[1]]);
625      boost::scoped_ptr<double> z(new double[m_N2]);      boost::scoped_ptr<double> z(new double[m_NN[2]]);
626      double* coords[3] = { x.get(), y.get(), z.get() };      double* coords[3] = { x.get(), y.get(), z.get() };
     pair<double,double> xdx = getFirstCoordAndSpacing(0);  
     pair<double,double> ydy = getFirstCoordAndSpacing(1);  
     pair<double,double> zdz = getFirstCoordAndSpacing(2);  
627  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
628      {      {
629  #pragma omp for  #pragma omp for
630          for (dim_t i0 = 0; i0 < m_N0; i0++) {          for (dim_t i0 = 0; i0 < m_NN[0]; i0++) {
631              coords[0][i0]=xdx.first+i0*xdx.second;              coords[0][i0]=getLocalCoordinate(i0, 0);
632          }          }
633  #pragma omp for  #pragma omp for
634          for (dim_t i1 = 0; i1 < m_N1; i1++) {          for (dim_t i1 = 0; i1 < m_NN[1]; i1++) {
635              coords[1][i1]=ydy.first+i1*ydy.second;              coords[1][i1]=getLocalCoordinate(i1, 1);
636          }          }
637  #pragma omp for  #pragma omp for
638          for (dim_t i2 = 0; i2 < m_N2; i2++) {          for (dim_t i2 = 0; i2 < m_NN[2]; i2++) {
639              coords[2][i2]=zdz.first+i2*zdz.second;              coords[2][i2]=getLocalCoordinate(i2, 2);
640          }          }
641      }      }
642      IndexVector dims = getNumNodesPerDim();      int* dims = const_cast<int*>(getNumNodesPerDim());
643      DBPutQuadmesh(dbfile, "mesh", NULL, coords, &dims[0], 3, DB_DOUBLE,  
644        // write mesh
645        DBPutQuadmesh(dbfile, "mesh", NULL, coords, dims, 3, DB_DOUBLE,
646              DB_COLLINEAR, NULL);              DB_COLLINEAR, NULL);
647    
648      DBPutQuadvar1(dbfile, "nodeId", "mesh", (void*)&m_nodeId[0], &dims[0], 3,      // write node ids
649        DBPutQuadvar1(dbfile, "nodeId", "mesh", (void*)&m_nodeId[0], dims, 3,
650              NULL, 0, DB_INT, DB_NODECENT, NULL);              NULL, 0, DB_INT, DB_NODECENT, NULL);
651    
652      // write element ids      // write element ids
653      dims = getNumElementsPerDim();      dims = const_cast<int*>(getNumElementsPerDim());
654      DBPutQuadvar1(dbfile, "elementId", "mesh", (void*)&m_elementId[0],      DBPutQuadvar1(dbfile, "elementId", "mesh", (void*)&m_elementId[0],
655              &dims[0], 3, NULL, 0, DB_INT, DB_ZONECENT, NULL);              dims, 3, NULL, 0, DB_INT, DB_ZONECENT, NULL);
656    
657      // rank 0 writes multimesh and multivar      // rank 0 writes multimesh and multivar
658      if (m_mpiInfo->rank == 0) {      if (m_mpiInfo->rank == 0) {
# Line 248  void Brick::dump(const string& fileName) Line 701  void Brick::dump(const string& fileName)
701      }      }
702    
703  #else // USE_SILO  #else // USE_SILO
704      throw RipleyException("dump(): no Silo support");      throw RipleyException("dump: no Silo support");
705  #endif  #endif
706  }  }
707    
# Line 272  const int* Brick::borrowSampleReferenceI Line 725  const int* Brick::borrowSampleReferenceI
725      }      }
726    
727      stringstream msg;      stringstream msg;
728      msg << "borrowSampleReferenceIDs() not implemented for function space type "      msg << "borrowSampleReferenceIDs: invalid function space type "<<fsType;
         << fsType;  
729      throw RipleyException(msg.str());      throw RipleyException(msg.str());
730  }  }
731    
# Line 293  bool Brick::ownSample(int fsType, index_ Line 745  bool Brick::ownSample(int fsType, index_
745          case ReducedElements:          case ReducedElements:
746              {              {
747                  // check ownership of element's _last_ node                  // check ownership of element's _last_ node
748                  const index_t x=id%m_NE0 + 1;                  const index_t x=id%m_NE[0] + 1;
749                  const index_t y=id%(m_NE0*m_NE1)/m_NE0 + 1;                  const index_t y=id%(m_NE[0]*m_NE[1])/m_NE[0] + 1;
750                  const index_t z=id/(m_NE0*m_NE1) + 1;                  const index_t z=id/(m_NE[0]*m_NE[1]) + 1;
751                  return (m_dofMap[x + m_N0*y +m_N0*m_N1*z] < getNumDOF());                  return (m_dofMap[x + m_NN[0]*y + m_NN[0]*m_NN[1]*z] < getNumDOF());
752              }              }
753          case FaceElements:          case FaceElements:
754          case ReducedFaceElements:          case ReducedFaceElements:
755              {              {
756                  // check ownership of face element's last node                  // check ownership of face element's last node
                 const IndexVector faces = getNumFacesPerBoundary();  
757                  dim_t n=0;                  dim_t n=0;
758                  for (size_t i=0; i<faces.size(); i++) {                  for (size_t i=0; i<6; i++) {
759                      n+=faces[i];                      n+=m_faceCount[i];
760                      if (id<n) {                      if (id<n) {
761                          const index_t j=id-n+faces[i];                          const index_t j=id-n+m_faceCount[i];
762                          if (i>=4) { // front or back                          if (i>=4) { // front or back
763                              const index_t first=(i==4 ? 0 : m_N0*m_N1*(m_N2-1));                              const index_t first=(i==4 ? 0 : m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1));
764                              return (m_dofMap[first+j%m_NE0+1+(j/m_NE0+1)*m_N0] < getNumDOF());                              return (m_dofMap[first+j%m_NE[0]+1+(j/m_NE[0]+1)*m_NN[0]] < getNumDOF());
765                          } else if (i>=2) { // bottom or top                          } else if (i>=2) { // bottom or top
766                              const index_t first=(i==2 ? 0 : m_N0*(m_N1-1));                              const index_t first=(i==2 ? 0 : m_NN[0]*(m_NN[1]-1));
767                              return (m_dofMap[first+j%m_NE0+1+(j/m_NE0+1)*m_N0*m_N1] < getNumDOF());                              return (m_dofMap[first+j%m_NE[0]+1+(j/m_NE[0]+1)*m_NN[0]*m_NN[1]] < getNumDOF());
768                          } else { // left or right                          } else { // left or right
769                              const index_t first=(i==0 ? 0 : m_N0-1);                              const index_t first=(i==0 ? 0 : m_NN[0]-1);
770                              return (m_dofMap[first+(j%m_NE1+1)*m_N0+(j/m_NE1+1)*m_N0*m_N1] < getNumDOF());                              return (m_dofMap[first+(j%m_NE[1]+1)*m_NN[0]+(j/m_NE[1]+1)*m_NN[0]*m_NN[1]] < getNumDOF());
771                          }                          }
772                      }                      }
773                  }                  }
# Line 327  bool Brick::ownSample(int fsType, index_ Line 778  bool Brick::ownSample(int fsType, index_
778      }      }
779    
780      stringstream msg;      stringstream msg;
781      msg << "ownSample() not implemented for "      msg << "ownSample: invalid function space type " << fsType;
         << functionSpaceTypeAsString(fsType);  
782      throw RipleyException(msg.str());      throw RipleyException(msg.str());
783  }  }
784    
 void Brick::setToGradient(escript::Data& out, const escript::Data& cIn) const  
 {  
     escript::Data& in = *const_cast<escript::Data*>(&cIn);  
     const dim_t numComp = in.getDataPointSize();  
     const double h0 = m_l0/m_gNE0;  
     const double h1 = m_l1/m_gNE1;  
     const double h2 = m_l1/m_gNE2;  
     const double C0 = .044658198738520451079;  
     const double C1 = .16666666666666666667;  
     const double C2 = .21132486540518711775;  
     const double C3 = .25;  
     const double C4 = .5;  
     const double C5 = .62200846792814621559;  
     const double C6 = .78867513459481288225;  
   
     if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements) {  
         out.requireWrite();  
         /*** GENERATOR SNIP_GRAD_ELEMENTS TOP */  
 #pragma omp parallel for  
         for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
             for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                 for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                     const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_N0,m_N1));  
                     const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                     const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                     const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                     const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_N0,m_N1));  
                     const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                     const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_N0,m_N1));  
                     const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_N0,m_N1));  
                     double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE0,m_NE1));  
                     for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                         const double V0=((f_100[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_011[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;  
                         const double V1=((f_110[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_001[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / h0;  
                         const double V2=((f_101[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_010[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / h0;  
                         const double V3=((f_111[i]-f_011[i])*C5 + (f_100[i]-f_000[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;  
                         const double V4=((f_010[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_101[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;  
                         const double V5=((f_110[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_001[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / h1;  
                         const double V6=((f_011[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_100[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / h1;  
                         const double V7=((f_111[i]-f_101[i])*C5 + (f_010[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;  
                         const double V8=((f_001[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_110[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;  
                         const double V9=((f_101[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_010[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / h2;  
                         const double V10=((f_011[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_100[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / h2;  
                         const double V11=((f_111[i]-f_110[i])*C5 + (f_001[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;  
                         o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;  
                         o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V4;  
                         o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V8;  
                         o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;  
                         o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V5;  
                         o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V9;  
                         o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V1;  
                         o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V4;  
                         o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V10;  
                         o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;  
                         o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V5;  
                         o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V11;  
                         o[INDEX3(i,0,4,numComp,3)] = V2;  
                         o[INDEX3(i,1,4,numComp,3)] = V6;  
                         o[INDEX3(i,2,4,numComp,3)] = V8;  
                         o[INDEX3(i,0,5,numComp,3)] = V2;  
                         o[INDEX3(i,1,5,numComp,3)] = V7;  
                         o[INDEX3(i,2,5,numComp,3)] = V9;  
                         o[INDEX3(i,0,6,numComp,3)] = V3;  
                         o[INDEX3(i,1,6,numComp,3)] = V6;  
                         o[INDEX3(i,2,6,numComp,3)] = V10;  
                         o[INDEX3(i,0,7,numComp,3)] = V3;  
                         o[INDEX3(i,1,7,numComp,3)] = V7;  
                         o[INDEX3(i,2,7,numComp,3)] = V11;  
                     } /* end of component loop i */  
                 } /* end of k0 loop */  
             } /* end of k1 loop */  
         } /* end of k2 loop */  
         /* GENERATOR SNIP_GRAD_ELEMENTS BOTTOM */  
     } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {  
         out.requireWrite();  
         /*** GENERATOR SNIP_GRAD_REDUCED_ELEMENTS TOP */  
 #pragma omp parallel for  
         for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
             for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                 for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                     const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_N0,m_N1));  
                     const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                     const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                     const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                     const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_N0,m_N1));  
                     const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_N0,m_N1));  
                     const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_N0,m_N1));  
                     const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                     double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE0,m_NE1));  
                     for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                         o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_010[i]-f_011[i])*C3 / h0;  
                         o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_100[i]-f_101[i])*C3 / h1;  
                         o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]+f_101[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_010[i]-f_100[i]-f_110[i])*C3 / h2;  
                     } /* end of component loop i */  
                 } /* end of k0 loop */  
             } /* end of k1 loop */  
         } /* end of k2 loop */  
         /* GENERATOR SNIP_GRAD_REDUCED_ELEMENTS BOTTOM */  
     } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == FaceElements) {  
         out.requireWrite();  
         /*** GENERATOR SNIP_GRAD_FACES TOP */  
 #pragma omp parallel  
         {  
             if (m_faceOffset[0] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                         const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2, m_N0,m_N1));  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             const double V0=((f_010[i]-f_000[i])*C6 + (f_011[i]-f_001[i])*C2) / h1;  
                             const double V1=((f_010[i]-f_000[i])*C2 + (f_011[i]-f_001[i])*C6) / h1;  
                             const double V2=((f_001[i]-f_000[i])*C6 + (f_010[i]-f_011[i])*C2) / h2;  
                             const double V3=((f_001[i]-f_000[i])*C2 + (f_011[i]-f_010[i])*C6) / h2;  
                             o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = ((f_100[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_011[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;  
                             o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V0;  
                             o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V2;  
                             o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_001[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / h0;  
                             o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V0;  
                             o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V3;  
                             o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = ((f_101[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_010[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / h0;  
                             o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V1;  
                             o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V2;  
                             o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_011[i])*C5 + (f_100[i]-f_000[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;  
                             o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V1;  
                             o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V3;  
                         } /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             } /* end of face 0 */  
             if (m_faceOffset[1] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                         const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1+1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2, m_N0,m_N1));  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             const double V0=((f_110[i]-f_100[i])*C6 + (f_111[i]-f_101[i])*C2) / h1;  
                             const double V1=((f_110[i]-f_100[i])*C2 + (f_111[i]-f_101[i])*C6) / h1;  
                             const double V2=((f_101[i]-f_100[i])*C6 + (f_111[i]-f_110[i])*C2) / h2;  
                             const double V3=((f_101[i]-f_100[i])*C2 + (f_111[i]-f_110[i])*C6) / h2;  
                             o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = ((f_100[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_011[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;  
                             o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V0;  
                             o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V2;  
                             o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_001[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / h0;  
                             o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V0;  
                             o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V3;  
                             o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = ((f_101[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_010[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / h0;  
                             o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V1;  
                             o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V2;  
                             o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_011[i])*C5 + (f_100[i]-f_000[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;  
                             o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V1;  
                             o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V3;  
                         } /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             } /* end of face 1 */  
             if (m_faceOffset[2] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2, m_N0,m_N1));  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             const double V0=((f_100[i]-f_000[i])*C6 + (f_101[i]-f_001[i])*C2) / h0;  
                             const double V1=((f_001[i]-f_000[i])*C6 + (f_101[i]-f_100[i])*C2) / h2;  
                             const double V2=((f_001[i]-f_000[i])*C2 + (f_101[i]-f_100[i])*C6) / h2;  
                             o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;  
                             o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = ((f_010[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_101[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;  
                             o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V1;  
                             o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;  
                             o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_001[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / h1;  
                             o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V2;  
                             o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V0;  
                             o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_100[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / h1;  
                             o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V1;  
                             o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V0;  
                             o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_101[i])*C5 + (f_010[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;  
                             o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V2;  
                         } /* end of component loop i */  
                     } /* end of k0 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             } /* end of face 2 */  
             if (m_faceOffset[3] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-2,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-2,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-2,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-2,k2, m_N0,m_N1));  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             const double V0=((f_110[i]-f_010[i])*C6 + (f_111[i]-f_011[i])*C2) / h0;  
                             const double V1=((f_110[i]-f_010[i])*C2 + (f_111[i]-f_011[i])*C6) / h0;  
                             const double V2=((f_011[i]-f_010[i])*C6 + (f_111[i]-f_110[i])*C2) / h2;  
                             const double V3=((f_011[i]-f_010[i])*C2 + (f_111[i]-f_110[i])*C6) / h2;  
                             o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;  
                             o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = ((f_010[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_101[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;  
                             o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V2;  
                             o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;  
                             o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_001[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / h1;  
                             o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V3;  
                             o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V1;  
                             o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_100[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / h1;  
                             o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V2;  
                             o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;  
                             o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_101[i])*C5 + (f_010[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;  
                             o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V3;  
                         } /* end of component loop i */  
                     } /* end of k0 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             } /* end of face 3 */  
             if (m_faceOffset[4] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,1, m_N0,m_N1));  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             const double V0=((f_100[i]-f_000[i])*C6 + (f_110[i]-f_010[i])*C2) / h0;  
                             const double V1=((f_100[i]-f_000[i])*C2 + (f_110[i]-f_010[i])*C6) / h0;  
                             const double V2=((f_010[i]-f_000[i])*C6 + (f_110[i]-f_100[i])*C2) / h1;  
                             const double V3=((f_010[i]-f_000[i])*C2 + (f_110[i]-f_100[i])*C6) / h1;  
                             o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;  
                             o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V2;  
                             o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = ((f_001[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_110[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;  
                             o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;  
                             o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V3;  
                             o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = ((f_101[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_010[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / h2;  
                             o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V1;  
                             o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V2;  
                             o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_100[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / h2;  
                             o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;  
                             o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V3;  
                             o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_110[i])*C5 + (f_001[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;  
                         } /* end of component loop i */  
                     } /* end of k0 loop */  
                 } /* end of k1 loop */  
             } /* end of face 4 */  
             if (m_faceOffset[5] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-2, m_N0,m_N1));  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             const double V0=((f_101[i]-f_001[i])*C6 + (f_111[i]-f_011[i])*C2) / h0;  
                             const double V1=((f_101[i]-f_001[i])*C2 + (f_111[i]-f_011[i])*C6) / h0;  
                             const double V2=((f_011[i]-f_001[i])*C6 + (f_111[i]-f_101[i])*C2) / h1;  
                             const double V3=((f_011[i]-f_001[i])*C2 + (f_111[i]-f_101[i])*C6) / h1;  
                             o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;  
                             o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V2;  
                             o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = ((f_001[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_110[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;  
                             o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;  
                             o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V3;  
                             o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_010[i])*C0 + (f_101[i]-f_100[i])*C5 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / h2;  
                             o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V1;  
                             o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V2;  
                             o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_100[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / h2;  
                             o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;  
                             o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V3;  
                             o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = ((f_001[i]-f_000[i])*C0 + (f_111[i]-f_110[i])*C5 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;  
                         } /* end of component loop i */  
                     } /* end of k0 loop */  
                 } /* end of k1 loop */  
             } /* end of face 5 */  
         } // end of parallel section  
         /* GENERATOR SNIP_GRAD_FACES BOTTOM */  
     } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedFaceElements) {  
         out.requireWrite();  
         /*** GENERATOR SNIP_GRAD_REDUCED_FACES TOP */  
 #pragma omp parallel  
         {  
             if (m_faceOffset[0] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                         const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_010[i]-f_011[i])*C3 / h0;  
                             o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]-f_000[i]-f_001[i])*C4 / h1;  
                             o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]-f_000[i]-f_010[i])*C4 / h2;  
                         } /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             } /* end of face 0 */  
             if (m_faceOffset[1] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                         const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1+1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_010[i]-f_011[i])*C3 / h0;  
                             o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_110[i]+f_111[i]-f_100[i]-f_101[i])*C4 / h1;  
                             o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_101[i]+f_111[i]-f_100[i]-f_110[i])*C4 / h2;  
                         } /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             } /* end of face 1 */  
             if (m_faceOffset[2] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]-f_000[i]-f_001[i])*C4 / h0;  
                             o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_100[i]-f_101[i])*C3 / h1;  
                             o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_101[i]-f_000[i]-f_100[i])*C4 / h2;  
                         } /* end of component loop i */  
                     } /* end of k0 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             } /* end of face 2 */  
             if (m_faceOffset[3] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-2,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-2,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-2,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-2,k2, m_N0,m_N1));  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_110[i]+f_111[i]-f_010[i]-f_011[i])*C4 / h0;  
                             o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_100[i]-f_101[i])*C3 / h1;  
                             o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_011[i]+f_111[i]-f_010[i]-f_110[i])*C4 / h2;  
                         } /* end of component loop i */  
                     } /* end of k0 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             } /* end of face 3 */  
             if (m_faceOffset[4] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,1, m_N0,m_N1));  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_110[i]-f_000[i]-f_010[i])*C4 / h0;  
                             o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_110[i]-f_000[i]-f_100[i])*C4 / h1;  
                             o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]+f_101[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_010[i]-f_100[i]-f_110[i])*C4 / h2;  
                         } /* end of component loop i */  
                     } /* end of k0 loop */  
                 } /* end of k1 loop */  
             } /* end of face 4 */  
             if (m_faceOffset[5] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-2, m_N0,m_N1));  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_101[i]+f_111[i]-f_001[i]-f_011[i])*C4 / h0;  
                             o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_011[i]+f_111[i]-f_001[i]-f_101[i])*C4 / h1;  
                             o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]+f_101[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_010[i]-f_100[i]-f_110[i])*C3 / h2;  
                         } /* end of component loop i */  
                     } /* end of k0 loop */  
                 } /* end of k1 loop */  
             } /* end of face 5 */  
         } // end of parallel section  
         /* GENERATOR SNIP_GRAD_REDUCED_FACES BOTTOM */  
     } else {  
         stringstream msg;  
         msg << "setToGradient() not implemented for "  
             << functionSpaceTypeAsString(out.getFunctionSpace().getTypeCode());  
         throw RipleyException(msg.str());  
     }  
 }  
   
 void Brick::setToIntegrals(vector<double>& integrals, const escript::Data& arg) const  
 {  
     escript::Data& in = *const_cast<escript::Data*>(&arg);  
     const dim_t numComp = in.getDataPointSize();  
     const double h0 = m_l0/m_gNE0;  
     const double h1 = m_l1/m_gNE1;  
     const double h2 = m_l2/m_gNE2;  
     if (arg.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements) {  
         const double w_0 = h0*h1*h2/8.;  
 #pragma omp parallel  
         {  
             vector<double> int_local(numComp, 0);  
 #pragma omp for nowait  
             for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                 for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                     for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const double* f = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0, k1, k2, m_NE0, m_NE1));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             const register double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];  
                             const register double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];  
                             const register double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];  
                             const register double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];  
                             const register double f_4 = f[INDEX2(i,4,numComp)];  
                             const register double f_5 = f[INDEX2(i,5,numComp)];  
                             const register double f_6 = f[INDEX2(i,6,numComp)];  
                             const register double f_7 = f[INDEX2(i,7,numComp)];  
                             int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3+f_4+f_5+f_6+f_7)*w_0;  
                         }  /* end of component loop i */  
                     } /* end of k0 loop */  
                 } /* end of k1 loop */  
             } /* end of k2 loop */  
   
 #pragma omp critical  
             for (index_t i=0; i<numComp; i++)  
                 integrals[i]+=int_local[i];  
         } // end of parallel section  
     } else if (arg.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {  
         const double w_0 = h0*h1*h2;  
 #pragma omp parallel  
         {  
             vector<double> int_local(numComp, 0);  
 #pragma omp for nowait  
             for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                 for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                     for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const double* f = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0, k1, k2, m_NE0, m_NE1));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             int_local[i]+=f[i]*w_0;  
                         }  /* end of component loop i */  
                     } /* end of k0 loop */  
                 } /* end of k1 loop */  
             } /* end of k2 loop */  
   
 #pragma omp critical  
             for (index_t i=0; i<numComp; i++)  
                 integrals[i]+=int_local[i];  
         } // end of parallel section  
     } else if (arg.getFunctionSpace().getTypeCode() == FaceElements) {  
         const double w_0 = h1*h2/4.;  
         const double w_1 = h0*h2/4.;  
         const double w_2 = h0*h1/4.;  
 #pragma omp parallel  
         {  
             vector<double> int_local(numComp, 0);  
             if (m_faceOffset[0] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                         const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             const register double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];  
                             const register double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];  
                             const register double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];  
                             const register double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];  
                             int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_0;  
                         }  /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             }  
   
             if (m_faceOffset[1] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                         const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             const register double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];  
                             const register double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];  
                             const register double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];  
                             const register double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];  
                             int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_0;  
                         }  /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             }  
   
             if (m_faceOffset[2] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             const register double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];  
                             const register double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];  
                             const register double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];  
                             const register double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];  
                             int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_1;  
                         }  /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             }  
   
             if (m_faceOffset[3] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             const register double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];  
                             const register double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];  
                             const register double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];  
                             const register double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];  
                             int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_1;  
                         }  /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             }  
   
             if (m_faceOffset[4] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             const register double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];  
                             const register double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];  
                             const register double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];  
                             const register double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];  
                             int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_2;  
                         }  /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             }  
   
             if (m_faceOffset[5] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             const register double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];  
                             const register double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];  
                             const register double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];  
                             const register double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];  
                             int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_2;  
                         }  /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             }  
   
 #pragma omp critical  
             for (index_t i=0; i<numComp; i++)  
                 integrals[i]+=int_local[i];  
         } // end of parallel section  
   
     } else if (arg.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedFaceElements) {  
         const double w_0 = h1*h2;  
         const double w_1 = h0*h2;  
         const double w_2 = h0*h1;  
 #pragma omp parallel  
         {  
             vector<double> int_local(numComp, 0);  
             if (m_faceOffset[0] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                         const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             int_local[i]+=f[i]*w_0;  
                         }  /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             }  
   
             if (m_faceOffset[1] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                         const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             int_local[i]+=f[i]*w_0;  
                         }  /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             }  
   
             if (m_faceOffset[2] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             int_local[i]+=f[i]*w_1;  
                         }  /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             }  
   
             if (m_faceOffset[3] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             int_local[i]+=f[i]*w_1;  
                         }  /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             }  
   
             if (m_faceOffset[4] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             int_local[i]+=f[i]*w_2;  
                         }  /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             }  
   
             if (m_faceOffset[5] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             int_local[i]+=f[i]*w_2;  
                         }  /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             }  
   
 #pragma omp critical  
             for (index_t i=0; i<numComp; i++)  
                 integrals[i]+=int_local[i];  
         } // end of parallel section  
   
     } else {  
         stringstream msg;  
         msg << "setToIntegrals() not implemented for "  
             << functionSpaceTypeAsString(arg.getFunctionSpace().getTypeCode());  
         throw RipleyException(msg.str());  
     }  
 }  
   
785  void Brick::setToNormal(escript::Data& out) const  void Brick::setToNormal(escript::Data& out) const
786  {  {
787      if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == FaceElements) {      if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == FaceElements) {
# Line 1046  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 790  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
790          {          {
791              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
792  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
793                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
794                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
795                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
796                          // set vector at four quadrature points                          // set vector at four quadrature points
797                          *o++ = -1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;                          *o++ = -1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;
798                          *o++ = -1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;                          *o++ = -1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;
# Line 1060  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 804  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
804    
805              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
806  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
807                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
808                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
809                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
810                          // set vector at four quadrature points                          // set vector at four quadrature points
811                          *o++ = 1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;                          *o++ = 1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;
812                          *o++ = 1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;                          *o++ = 1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;
# Line 1074  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 818  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
818    
819              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
820  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
821                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
822                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
823                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
824                          // set vector at four quadrature points                          // set vector at four quadrature points
825                          *o++ = 0.; *o++ = -1.; *o++ = 0.;                          *o++ = 0.; *o++ = -1.; *o++ = 0.;
826                          *o++ = 0.; *o++ = -1.; *o++ = 0.;                          *o++ = 0.; *o++ = -1.; *o++ = 0.;
# Line 1088  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 832  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
832    
833              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
834  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
835                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
836                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
837                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
838                          // set vector at four quadrature points                          // set vector at four quadrature points
839                          *o++ = 0.; *o++ = 1.; *o++ = 0.;                          *o++ = 0.; *o++ = 1.; *o++ = 0.;
840                          *o++ = 0.; *o++ = 1.; *o++ = 0.;                          *o++ = 0.; *o++ = 1.; *o++ = 0.;
# Line 1102  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 846  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
846    
847              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
848  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
849                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
850                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
851                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
852                          // set vector at four quadrature points                          // set vector at four quadrature points
853                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = -1.;                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = -1.;
854                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = -1.;                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = -1.;
# Line 1116  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 860  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
860    
861              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
862  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
863                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
864                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
865                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
866                          // set vector at four quadrature points                          // set vector at four quadrature points
867                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = 1.;                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = 1.;
868                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = 1.;                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = 1.;
# Line 1134  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 878  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
878          {          {
879              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
880  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
881                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
882                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
883                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
884                          *o++ = -1.;                          *o++ = -1.;
885                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
886                          *o = 0.;                          *o = 0.;
# Line 1146  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 890  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
890    
891              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
892  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
893                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
894                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
895                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
896                          *o++ = 1.;                          *o++ = 1.;
897                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
898                          *o = 0.;                          *o = 0.;
# Line 1158  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 902  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
902    
903              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
904  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
905                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
906                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
907                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
908                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
909                          *o++ = -1.;                          *o++ = -1.;
910                          *o = 0.;                          *o = 0.;
# Line 1170  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 914  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
914    
915              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
916  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
917                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
918                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
919                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
920                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
921                          *o++ = 1.;                          *o++ = 1.;
922                          *o = 0.;                          *o = 0.;
# Line 1182  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 926  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
926    
927              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
928  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
929                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
930                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
931                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
932                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
933                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
934                          *o = -1.;                          *o = -1.;
# Line 1194  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 938  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
938    
939              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
940  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
941                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
942                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
943                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
944                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
945                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
946                          *o = 1.;                          *o = 1.;
# Line 1207  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 951  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
951    
952      } else {      } else {
953          stringstream msg;          stringstream msg;
954          msg << "setToNormal() not implemented for "          msg << "setToNormal: invalid function space type "
955              << functionSpaceTypeAsString(out.getFunctionSpace().getTypeCode());              << out.getFunctionSpace().getTypeCode();
956          throw RipleyException(msg.str());          throw RipleyException(msg.str());
957      }      }
958  }  }
# Line 1219  void Brick::setToSize(escript::Data& out Line 963  void Brick::setToSize(escript::Data& out
963              || out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {              || out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
964          out.requireWrite();          out.requireWrite();
965          const dim_t numQuad=out.getNumDataPointsPerSample();          const dim_t numQuad=out.getNumDataPointsPerSample();
966          const double xSize=getFirstCoordAndSpacing(0).second;          const double size=sqrt(m_dx[0]*m_dx[0]+m_dx[1]*m_dx[1]+m_dx[2]*m_dx[2]);
         const double ySize=getFirstCoordAndSpacing(1).second;  
         const double zSize=getFirstCoordAndSpacing(2).second;  
         const double size=min(min(xSize,ySize),zSize);  
967  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel for
968          for (index_t k = 0; k < getNumElements(); ++k) {          for (index_t k = 0; k < getNumElements(); ++k) {
969              double* o = out.getSampleDataRW(k);              double* o = out.getSampleDataRW(k);
# Line 1232  void Brick::setToSize(escript::Data& out Line 973  void Brick::setToSize(escript::Data& out
973              || out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedFaceElements) {              || out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedFaceElements) {
974          out.requireWrite();          out.requireWrite();
975          const dim_t numQuad=out.getNumDataPointsPerSample();          const dim_t numQuad=out.getNumDataPointsPerSample();
         const double xSize=getFirstCoordAndSpacing(0).second;  
         const double ySize=getFirstCoordAndSpacing(1).second;  
         const double zSize=getFirstCoordAndSpacing(2).second;  
976  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
977          {          {
978              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
979                  const double size=min(ySize,zSize);                  const double size=min(m_dx[1],m_dx[2]);
980  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
981                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
982                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
983                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
984                          fill(o, o+numQuad, size);                          fill(o, o+numQuad, size);
985                      }                      }
986                  }                  }
987              }              }
988    
989              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
990                  const double size=min(ySize,zSize);                  const double size=min(m_dx[1],m_dx[2]);
991  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
992                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
993                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
994                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
995                          fill(o, o+numQuad, size);                          fill(o, o+numQuad, size);
996                      }                      }
997                  }                  }
998              }              }
999    
1000              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
1001                  const double size=min(xSize,zSize);                  const double size=min(m_dx[0],m_dx[2]);
1002  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1003                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1004                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1005                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1006                          fill(o, o+numQuad, size);                          fill(o, o+numQuad, size);
1007                      }                      }
1008                  }                  }
1009              }              }
1010    
1011              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
1012                  const double size=min(xSize,zSize);                  const double size=min(m_dx[0],m_dx[2]);
1013  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1014                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1015                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1016                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1017                          fill(o, o+numQuad, size);                          fill(o, o+numQuad, size);
1018                      }                      }
1019                  }                  }
1020              }              }
1021    
1022              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
1023                  const double size=min(xSize,ySize);                  const double size=min(m_dx[0],m_dx[1]);
1024  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1025                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1026                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1027                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1028                          fill(o, o+numQuad, size);                          fill(o, o+numQuad, size);
1029                      }                      }
1030                  }                  }
1031              }              }
1032    
1033              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
1034                  const double size=min(xSize,ySize);                  const double size=min(m_dx[0],m_dx[1]);
1035  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1036                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1037                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1038                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1039                          fill(o, o+numQuad, size);                          fill(o, o+numQuad, size);
1040                      }                      }
1041                  }                  }
# Line 1306  void Brick::setToSize(escript::Data& out Line 1044  void Brick::setToSize(escript::Data& out
1044    
1045      } else {      } else {
1046          stringstream msg;          stringstream msg;
1047          msg << "setToSize() not implemented for "          msg << "setToSize: invalid function space type "
1048              << functionSpaceTypeAsString(out.getFunctionSpace().getTypeCode());              << out.getFunctionSpace().getTypeCode();
1049          throw RipleyException(msg.str());          throw RipleyException(msg.str());
1050      }      }
1051  }  }
1052    
 Paso_SystemMatrixPattern* Brick::getPattern(bool reducedRowOrder,  
                                             bool reducedColOrder) const  
 {  
     if (reducedRowOrder || reducedColOrder)  
         throw RipleyException("getPattern() not implemented for reduced order");  
   
     return m_pattern;  
 }  
   
1053  void Brick::Print_Mesh_Info(const bool full) const  void Brick::Print_Mesh_Info(const bool full) const
1054  {  {
1055      RipleyDomain::Print_Mesh_Info(full);      RipleyDomain::Print_Mesh_Info(full);
# Line 1328  void Brick::Print_Mesh_Info(const bool f Line 1057  void Brick::Print_Mesh_Info(const bool f
1057          cout << "     Id  Coordinates" << endl;          cout << "     Id  Coordinates" << endl;
1058          cout.precision(15);          cout.precision(15);
1059          cout.setf(ios::scientific, ios::floatfield);          cout.setf(ios::scientific, ios::floatfield);
         pair<double,double> xdx = getFirstCoordAndSpacing(0);  
         pair<double,double> ydy = getFirstCoordAndSpacing(1);  
         pair<double,double> zdz = getFirstCoordAndSpacing(2);  
1060          for (index_t i=0; i < getNumNodes(); i++) {          for (index_t i=0; i < getNumNodes(); i++) {
1061              cout << "  " << setw(5) << m_nodeId[i]              cout << "  " << setw(5) << m_nodeId[i]
1062                  << "  " << xdx.first+(i%m_N0)*xdx.second                  << "  " << getLocalCoordinate(i%m_NN[0], 0)
1063                  << "  " << ydy.first+(i%(m_N0*m_N1)/m_N0)*ydy.second                  << "  " << getLocalCoordinate(i%(m_NN[0]*m_NN[1])/m_NN[0], 1)
1064                  << "  " << zdz.first+(i/(m_N0*m_N1))*zdz.second << endl;                  << "  " << getLocalCoordinate(i/(m_NN[0]*m_NN[1]), 2) << endl;
1065          }          }
1066      }      }
1067  }  }
1068    
 IndexVector Brick::getNumNodesPerDim() const  
 {  
     IndexVector ret;  
     ret.push_back(m_N0);  
     ret.push_back(m_N1);  
     ret.push_back(m_N2);  
     return ret;  
 }  
   
 IndexVector Brick::getNumElementsPerDim() const  
 {  
     IndexVector ret;  
     ret.push_back(m_NE0);  
     ret.push_back(m_NE1);  
     ret.push_back(m_NE2);  
     return ret;  
 }  
   
 IndexVector Brick::getNumFacesPerBoundary() const  
 {  
     IndexVector ret(6, 0);  
     //left  
     if (m_offset0==0)  
         ret[0]=m_NE1*m_NE2;  
     //right  
     if (m_mpiInfo->rank%m_NX==m_NX-1)  
         ret[1]=m_NE1*m_NE2;  
     //bottom  
     if (m_offset1==0)  
         ret[2]=m_NE0*m_NE2;  
     //top  
     if (m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX==m_NY-1)  
         ret[3]=m_NE0*m_NE2;  
     //front  
     if (m_offset2==0)  
         ret[4]=m_NE0*m_NE1;  
     //back  
     if (m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY)==m_NZ-1)  
         ret[5]=m_NE0*m_NE1;  
     return ret;  
 }  
   
 pair<double,double> Brick::getFirstCoordAndSpacing(dim_t dim) const  
 {  
     if (dim==0)  
         return pair<double,double>((m_l0*m_offset0)/m_gNE0, m_l0/m_gNE0);  
     else if (dim==1)  
         return pair<double,double>((m_l1*m_offset1)/m_gNE1, m_l1/m_gNE1);  
     else if (dim==2)  
         return pair<double,double>((m_l2*m_offset2)/m_gNE2, m_l2/m_gNE2);  
   
     throw RipleyException("getFirstCoordAndSpacing(): invalid argument");  
 }  
   
 //protected  
 dim_t Brick::getNumDOF() const  
 {  
     return (m_gNE0+1)/m_NX*(m_gNE1+1)/m_NY*(m_gNE2+1)/m_NZ;  
 }  
   
 //protected  
 dim_t Brick::getNumFaceElements() const  
 {  
     const IndexVector faces = getNumFacesPerBoundary();  
     dim_t n=0;  
     for (size_t i=0; i<faces.size(); i++)  
         n+=faces[i];  
     return n;  
 }  
1069    
1070  //protected  //protected
1071  void Brick::assembleCoordinates(escript::Data& arg) const  void Brick::assembleCoordinates(escript::Data& arg) const
# Line 1420  void Brick::assembleCoordinates(escript: Line 1077  void Brick::assembleCoordinates(escript:
1077      if (!numSamplesEqual(&x, 1, getNumNodes()))      if (!numSamplesEqual(&x, 1, getNumNodes()))
1078          throw RipleyException("setToX: Illegal number of samples in Data object");          throw RipleyException("setToX: Illegal number of samples in Data object");
1079    
     pair<double,double> xdx = getFirstCoordAndSpacing(0);  
     pair<double,double> ydy = getFirstCoordAndSpacing(1);  
     pair<double,double> zdz = getFirstCoordAndSpacing(2);  
1080      arg.requireWrite();      arg.requireWrite();
1081  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel for
1082      for (dim_t i2 = 0; i2 < m_N2; i2++) {      for (dim_t i2 = 0; i2 < m_NN[2]; i2++) {
1083          for (dim_t i1 = 0; i1 < m_N1; i1++) {          for (dim_t i1 = 0; i1 < m_NN[1]; i1++) {
1084              for (dim_t i0 = 0; i0 < m_N0; i0++) {              for (dim_t i0 = 0; i0 < m_NN[0]; i0++) {
1085                  double* point = arg.getSampleDataRW(i0+m_N0*i1+m_N0*m_N1*i2);                  double* point = arg.getSampleDataRW(i0+m_NN[0]*i1+m_NN[0]*m_NN[1]*i2);
1086                  point[0] = xdx.first+i0*xdx.second;                  point[0] = getLocalCoordinate(i0, 0);
1087                  point[1] = ydy.first+i1*ydy.second;                  point[1] = getLocalCoordinate(i1, 1);
1088                  point[2] = zdz.first+i2*zdz.second;                  point[2] = getLocalCoordinate(i2, 2);
1089              }              }
1090          }          }
1091      }      }
1092  }  }
1093    
1094  //protected  //protected
1095    void Brick::assembleGradient(escript::Data& out, escript::Data& in) const
1096    {
1097        const dim_t numComp = in.getDataPointSize();
1098        const double C0 = .044658198738520451079;
1099        const double C1 = .16666666666666666667;
1100        const double C2 = .21132486540518711775;
1101        const double C3 = .25;
1102        const double C4 = .5;
1103        const double C5 = .62200846792814621559;
1104        const double C6 = .78867513459481288225;
1105    
1106        if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements) {
1107            out.requireWrite();
1108    #pragma omp parallel
1109            {
1110                vector<double> f_000(numComp);
1111                vector<double> f_001(numComp);
1112                vector<double> f_010(numComp);
1113                vector<double> f_011(numComp);
1114                vector<double> f_100(numComp);
1115                vector<double> f_101(numComp);
1116                vector<double> f_110(numComp);
1117                vector<double> f_111(numComp);
1118    #pragma omp for
1119                for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1120                    for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1121                        for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1122                            memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1123                            memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1124                            memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1125                            memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1126                            memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1127                            memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1128                            memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1129                            memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1130                            double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE[0],m_NE[1]));
1131                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1132                                const double V0=((f_100[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_011[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / m_dx[0];
1133                                const double V1=((f_110[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_001[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / m_dx[0];
1134                                const double V2=((f_101[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_010[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / m_dx[0];
1135                                const double V3=((f_111[i]-f_011[i])*C5 + (f_100[i]-f_000[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / m_dx[0];
1136                                const double V4=((f_010[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_101[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[1];
1137                                const double V5=((f_110[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_001[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / m_dx[1];
1138                                const double V6=((f_011[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_100[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / m_dx[1];
1139                                const double V7=((f_111[i]-f_101[i])*C5 + (f_010[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[1];
1140                                const double V8=((f_001[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_110[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[2];
1141                                const double V9=((f_101[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_010[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / m_dx[2];
1142                                const double V10=((f_011[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_100[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / m_dx[2];
1143                                const double V11=((f_111[i]-f_110[i])*C5 + (f_001[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[2];
1144                                o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;
1145                                o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V4;
1146                                o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V8;
1147                                o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;
1148                                o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V5;
1149                                o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V9;
1150                                o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V1;
1151                                o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V4;
1152                                o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V10;
1153                                o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;
1154                                o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V5;
1155                                o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V11;
1156                                o[INDEX3(i,0,4,numComp,3)] = V2;
1157                                o[INDEX3(i,1,4,numComp,3)] = V6;
1158                                o[INDEX3(i,2,4,numComp,3)] = V8;
1159                                o[INDEX3(i,0,5,numComp,3)] = V2;
1160                                o[INDEX3(i,1,5,numComp,3)] = V7;
1161                                o[INDEX3(i,2,5,numComp,3)] = V9;
1162                                o[INDEX3(i,0,6,numComp,3)] = V3;
1163                                o[INDEX3(i,1,6,numComp,3)] = V6;
1164                                o[INDEX3(i,2,6,numComp,3)] = V10;
1165                                o[INDEX3(i,0,7,numComp,3)] = V3;
1166                                o[INDEX3(i,1,7,numComp,3)] = V7;
1167                                o[INDEX3(i,2,7,numComp,3)] = V11;
1168                            } // end of component loop i
1169                        } // end of k0 loop
1170                    } // end of k1 loop
1171                } // end of k2 loop
1172            } // end of parallel section
1173        } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
1174            out.requireWrite();
1175    #pragma omp parallel
1176            {
1177                vector<double> f_000(numComp);
1178                vector<double> f_001(numComp);
1179                vector<double> f_010(numComp);
1180                vector<double> f_011(numComp);
1181                vector<double> f_100(numComp);
1182                vector<double> f_101(numComp);
1183                vector<double> f_110(numComp);
1184                vector<double> f_111(numComp);
1185    #pragma omp for
1186                for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1187                    for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1188                        for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1189                            memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1190                            memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1191                            memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1192                            memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1193                            memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1194                            memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1195                            memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1196                            memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1197                            double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE[0],m_NE[1]));
1198                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1199                                o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_010[i]-f_011[i])*C3 / m_dx[0];
1200                                o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_100[i]-f_101[i])*C3 / m_dx[1];
1201                                o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]+f_101[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_010[i]-f_100[i]-f_110[i])*C3 / m_dx[2];
1202                            } // end of component loop i
1203                        } // end of k0 loop
1204                    } // end of k1 loop
1205                } // end of k2 loop
1206            } // end of parallel section
1207        } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == FaceElements) {
1208            out.requireWrite();
1209    #pragma omp parallel
1210            {
1211                vector<double> f_000(numComp);
1212                vector<double> f_001(numComp);
1213                vector<double> f_010(numComp);
1214                vector<double> f_011(numComp);
1215                vector<double> f_100(numComp);
1216                vector<double> f_101(numComp);
1217                vector<double> f_110(numComp);
1218                vector<double> f_111(numComp);
1219                if (m_faceOffset[0] > -1) {
1220    #pragma omp for nowait
1221                    for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1222                        for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1223                            memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1224                            memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1225                            memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1226                            memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1227                            memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1228                            memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1229                            memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1230                            memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1231                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1232                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1233                                const double V0=((f_010[i]-f_000[i])*C6 + (f_011[i]-f_001[i])*C2) / m_dx[1];
1234                                const double V1=((f_010[i]-f_000[i])*C2 + (f_011[i]-f_001[i])*C6) / m_dx[1];
1235                                const double V2=((f_001[i]-f_000[i])*C6 + (f_010[i]-f_011[i])*C2) / m_dx[2];
1236                                const double V3=((f_001[i]-f_000[i])*C2 + (f_011[i]-f_010[i])*C6) / m_dx[2];
1237                                o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = ((f_100[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_011[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / m_dx[0];
1238                                o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V0;
1239                                o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V2;
1240                                o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_001[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / m_dx[0];
1241                                o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V0;
1242                                o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V3;
1243                                o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = ((f_101[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_010[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / m_dx[0];
1244                                o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V1;
1245                                o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V2;
1246                                o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_011[i])*C5 + (f_100[i]-f_000[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / m_dx[0];
1247                                o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V1;
1248                                o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V3;
1249                            } // end of component loop i
1250                        } // end of k1 loop
1251                    } // end of k2 loop
1252                } // end of face 0
1253                if (m_faceOffset[1] > -1) {
1254    #pragma omp for nowait
1255                    for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1256                        for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1257                            memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1258                            memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1259                            memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1260                            memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1261                            memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1262                            memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1263                            memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1264                            memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1265                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1266                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1267                                const double V0=((f_110[i]-f_100[i])*C6 + (f_111[i]-f_101[i])*C2) / m_dx[1];
1268                                const double V1=((f_110[i]-f_100[i])*C2 + (f_111[i]-f_101[i])*C6) / m_dx[1];
1269                                const double V2=((f_101[i]-f_100[i])*C6 + (f_111[i]-f_110[i])*C2) / m_dx[2];
1270                                const double V3=((f_101[i]-f_100[i])*C2 + (f_111[i]-f_110[i])*C6) / m_dx[2];
1271                                o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = ((f_100[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_011[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / m_dx[0];
1272                                o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V0;
1273                                o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V2;
1274                                o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_001[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / m_dx[0];
1275                                o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V0;
1276                                o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V3;
1277                                o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = ((f_101[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_010[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / m_dx[0];
1278                                o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V1;
1279                                o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V2;
1280                                o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_011[i])*C5 + (f_100[i]-f_000[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / m_dx[0];
1281                                o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V1;
1282                                o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V3;
1283                            } // end of component loop i
1284                        } // end of k1 loop
1285                    } // end of k2 loop
1286                } // end of face 1
1287                if (m_faceOffset[2] > -1) {
1288    #pragma omp for nowait
1289                    for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1290                        for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1291                            memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1292                            memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1293                            memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1294                            memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1295                            memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1296                            memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1297                            memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1298                            memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1299                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1300                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1301                                const double V0=((f_100[i]-f_000[i])*C6 + (f_101[i]-f_001[i])*C2) / m_dx[0];
1302                                const double V1=((f_001[i]-f_000[i])*C6 + (f_101[i]-f_100[i])*C2) / m_dx[2];
1303                                const double V2=((f_001[i]-f_000[i])*C2 + (f_101[i]-f_100[i])*C6) / m_dx[2];
1304                                o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;
1305                                o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = ((f_010[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_101[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[1];
1306                                o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V1;
1307                                o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;
1308                                o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_001[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / m_dx[1];
1309                                o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V2;
1310                                o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V0;
1311                                o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_100[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / m_dx[1];
1312                                o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V1;
1313                                o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V0;
1314                                o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_101[i])*C5 + (f_010[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[1];
1315                                o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V2;
1316                            } // end of component loop i
1317                        } // end of k0 loop
1318                    } // end of k2 loop
1319                } // end of face 2
1320                if (m_faceOffset[3] > -1) {
1321    #pragma omp for nowait
1322                    for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1323                        for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1324                            memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-2,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1325                            memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-2,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1326                            memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1327                            memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1328                            memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-2,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1329                            memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-2,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1330                            memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1331                            memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1332                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1333                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1334                                const double V0=((f_110[i]-f_010[i])*C6 + (f_111[i]-f_011[i])*C2) / m_dx[0];
1335                                const double V1=((f_110[i]-f_010[i])*C2 + (f_111[i]-f_011[i])*C6) / m_dx[0];
1336                                const double V2=((f_011[i]-f_010[i])*C6 + (f_111[i]-f_110[i])*C2) / m_dx[2];
1337                                const double V3=((f_011[i]-f_010[i])*C2 + (f_111[i]-f_110[i])*C6) / m_dx[2];
1338                                o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;
1339                                o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = ((f_010[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_101[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[1];
1340                                o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V2;
1341                                o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;
1342                                o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_001[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / m_dx[1];
1343                                o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V3;
1344                                o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V1;
1345                                o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_100[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / m_dx[1];
1346                                o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V2;
1347                                o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;
1348                                o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_101[i])*C5 + (f_010[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[1];
1349                                o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V3;
1350                            } // end of component loop i
1351                        } // end of k0 loop
1352                    } // end of k2 loop
1353                } // end of face 3
1354                if (m_faceOffset[4] > -1) {
1355    #pragma omp for nowait
1356                    for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1357                        for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1358                            memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1359                            memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1360                            memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1361                            memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1362                            memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1363                            memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1364                            memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1365                            memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1366                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1367                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1368                                const double V0=((f_100[i]-f_000[i])*C6 + (f_110[i]-f_010[i])*C2) / m_dx[0];
1369                                const double V1=((f_100[i]-f_000[i])*C2 + (f_110[i]-f_010[i])*C6) / m_dx[0];
1370                                const double V2=((f_010[i]-f_000[i])*C6 + (f_110[i]-f_100[i])*C2) / m_dx[1];
1371                                const double V3=((f_010[i]-f_000[i])*C2 + (f_110[i]-f_100[i])*C6) / m_dx[1];
1372                                o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;
1373                                o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V2;
1374                                o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = ((f_001[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_110[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[2];
1375                                o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;
1376                                o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V3;
1377                                o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = ((f_101[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_010[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / m_dx[2];
1378                                o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V1;
1379                                o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V2;
1380                                o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_100[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / m_dx[2];
1381                                o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;
1382                                o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V3;
1383                                o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_110[i])*C5 + (f_001[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[2];
1384                            } // end of component loop i
1385                        } // end of k0 loop
1386                    } // end of k1 loop
1387                } // end of face 4
1388                if (m_faceOffset[5] > -1) {
1389    #pragma omp for nowait
1390                    for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1391                        for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1392                            memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1393                            memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1394                            memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1395                            memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1396                            memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1397                            memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1398                            memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1399                            memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1400                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1401                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1402                                const double V0=((f_101[i]-f_001[i])*C6 + (f_111[i]-f_011[i])*C2) / m_dx[0];
1403                                const double V1=((f_101[i]-f_001[i])*C2 + (f_111[i]-f_011[i])*C6) / m_dx[0];
1404                                const double V2=((f_011[i]-f_001[i])*C6 + (f_111[i]-f_101[i])*C2) / m_dx[1];
1405                                const double V3=((f_011[i]-f_001[i])*C2 + (f_111[i]-f_101[i])*C6) / m_dx[1];
1406                                o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;
1407                                o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V2;
1408                                o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = ((f_001[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_110[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[2];
1409                                o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;
1410                                o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V3;
1411                                o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_010[i])*C0 + (f_101[i]-f_100[i])*C5 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / m_dx[2];
1412                                o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V1;
1413                                o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V2;
1414                                o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_100[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / m_dx[2];
1415                                o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;
1416                                o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V3;
1417                                o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = ((f_001[i]-f_000[i])*C0 + (f_111[i]-f_110[i])*C5 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[2];
1418                            } // end of component loop i
1419                        } // end of k0 loop
1420                    } // end of k1 loop
1421                } // end of face 5
1422            } // end of parallel section
1423        } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedFaceElements) {
1424            out.requireWrite();
1425    #pragma omp parallel
1426            {
1427                vector<double> f_000(numComp);
1428                vector<double> f_001(numComp);
1429                vector<double> f_010(numComp);
1430                vector<double> f_011(numComp);
1431                vector<double> f_100(numComp);
1432                vector<double> f_101(numComp);
1433                vector<double> f_110(numComp);
1434                vector<double> f_111(numComp);
1435                if (m_faceOffset[0] > -1) {
1436    #pragma omp for nowait
1437                    for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1438                        for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1439                            memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1440                            memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1441                            memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1442                            memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1443                            memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1444                            memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1445                            memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1446                            memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1447                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1448                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1449                                o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_010[i]-f_011[i])*C3 / m_dx[0];
1450                                o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]-f_000[i]-f_001[i])*C4 / m_dx[1];
1451                                o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]-f_000[i]-f_010[i])*C4 / m_dx[2];
1452                            } // end of component loop i
1453                        } // end of k1 loop
1454                    } // end of k2 loop
1455                } // end of face 0
1456                if (m_faceOffset[1] > -1) {
1457    #pragma omp for nowait
1458                    for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1459                        for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1460                            memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1461                            memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1462                            memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1463                            memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1464                            memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1465                            memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1466                            memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1467                            memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1468                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1469                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1470                                o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_010[i]-f_011[i])*C3 / m_dx[0];
1471                                o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_110[i]+f_111[i]-f_100[i]-f_101[i])*C4 / m_dx[1];
1472                                o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_101[i]+f_111[i]-f_100[i]-f_110[i])*C4 / m_dx[2];
1473                            } // end of component loop i
1474                        } // end of k1 loop
1475                    } // end of k2 loop
1476                } // end of face 1
1477                if (m_faceOffset[2] > -1) {
1478    #pragma omp for nowait
1479                    for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1480                        for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1481                            memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1482                            memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1483                            memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1484                            memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1485                            memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1486                            memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1487                            memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1488                            memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1489                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1490                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1491                                o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]-f_000[i]-f_001[i])*C4 / m_dx[0];
1492                                o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_100[i]-f_101[i])*C3 / m_dx[1];
1493                                o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_101[i]-f_000[i]-f_100[i])*C4 / m_dx[2];
1494                            } // end of component loop i
1495                        } // end of k0 loop
1496                    } // end of k2 loop
1497                } // end of face 2
1498                if (m_faceOffset[3] > -1) {
1499    #pragma omp for nowait
1500                    for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1501                        for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1502                            memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-2,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1503                            memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-2,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1504                            memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1505                            memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1506                            memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-2,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1507                            memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-2,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1508                            memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1509                            memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1510                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1511                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1512                                o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_110[i]+f_111[i]-f_010[i]-f_011[i])*C4 / m_dx[0];
1513                                o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_100[i]-f_101[i])*C3 / m_dx[1];
1514                                o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_011[i]+f_111[i]-f_010[i]-f_110[i])*C4 / m_dx[2];
1515                            } // end of component loop i
1516                        } // end of k0 loop
1517                    } // end of k2 loop
1518                } // end of face 3
1519                if (m_faceOffset[4] > -1) {
1520    #pragma omp for nowait
1521                    for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1522                        for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1523                            memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1524                            memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1525                            memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1526                            memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1527                            memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1528                            memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1529                            memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1530                            memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1531                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1532                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1533                                o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_110[i]-f_000[i]-f_010[i])*C4 / m_dx[0];
1534                                o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_110[i]-f_000[i]-f_100[i])*C4 / m_dx[1];
1535                                o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]+f_101[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_010[i]-f_100[i]-f_110[i])*C4 / m_dx[2];
1536                            } // end of component loop i
1537                        } // end of k0 loop
1538                    } // end of k1 loop
1539                } // end of face 4
1540                if (m_faceOffset[5] > -1) {
1541    #pragma omp for nowait
1542                    for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1543                        for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1544                            memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1545                            memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1546                            memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1547                            memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1548                            memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1549                            memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1550                            memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1551                            memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1552                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1553                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1554                                o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_101[i]+f_111[i]-f_001[i]-f_011[i])*C4 / m_dx[0];
1555                                o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_011[i]+f_111[i]-f_001[i]-f_101[i])*C4 / m_dx[1];
1556                                o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]+f_101[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_010[i]-f_100[i]-f_110[i])*C3 / m_dx[2];
1557                            } // end of component loop i
1558                        } // end of k0 loop
1559                    } // end of k1 loop
1560                } // end of face 5
1561            } // end of parallel section
1562        }
1563    }
1564    
1565    //protected
1566    void Brick::assembleIntegrate(vector<double>& integrals, escript::Data& arg) const
1567    {
1568        const dim_t numComp = arg.getDataPointSize();
1569        const index_t left = (m_offset[0]==0 ? 0 : 1);
1570        const index_t bottom = (m_offset[1]==0 ? 0 : 1);
1571        const index_t front = (m_offset[2]==0 ? 0 : 1);
1572        const int fs = arg.getFunctionSpace().getTypeCode();
1573        if (fs == Elements && arg.actsExpanded()) {
1574            const double w_0 = m_dx[0]*m_dx[1]*m_dx[2]/8.;
1575    #pragma omp parallel
1576            {
1577                vector<double> int_local(numComp, 0);
1578    #pragma omp for nowait
1579                for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1580                    for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1581                        for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1582                            const double* f = arg.getSampleDataRO(INDEX3(k0, k1, k2, m_NE[0], m_NE[1]));
1583                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1584                                const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1585                                const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1586                                const double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];
1587                                const double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];
1588                                const double f_4 = f[INDEX2(i,4,numComp)];
1589                                const double f_5 = f[INDEX2(i,5,numComp)];
1590                                const double f_6 = f[INDEX2(i,6,numComp)];
1591                                const double f_7 = f[INDEX2(i,7,numComp)];
1592                                int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3+f_4+f_5+f_6+f_7)*w_0;
1593                            }  // end of component loop i
1594                        } // end of k0 loop
1595                    } // end of k1 loop
1596                } // end of k2 loop
1597    
1598    #pragma omp critical
1599                for (index_t i=0; i<numComp; i++)
1600                    integrals[i]+=int_local[i];
1601            } // end of parallel section
1602    
1603        } else if (fs==ReducedElements || (fs==Elements && !arg.actsExpanded())) {
1604            const double w_0 = m_dx[0]*m_dx[1]*m_dx[2];
1605    #pragma omp parallel
1606            {
1607                vector<double> int_local(numComp, 0);
1608    #pragma omp for nowait
1609                for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1610                    for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1611                        for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1612                            const double* f = arg.getSampleDataRO(INDEX3(k0, k1, k2, m_NE[0], m_NE[1]));
1613                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1614                                int_local[i]+=f[i]*w_0;
1615                            }  // end of component loop i
1616                        } // end of k0 loop
1617                    } // end of k1 loop
1618                } // end of k2 loop
1619    
1620    #pragma omp critical
1621                for (index_t i=0; i<numComp; i++)
1622                    integrals[i]+=int_local[i];
1623            } // end of parallel section
1624    
1625        } else if (fs == FaceElements && arg.actsExpanded()) {
1626            const double w_0 = m_dx[1]*m_dx[2]/4.;
1627            const double w_1 = m_dx[0]*m_dx[2]/4.;
1628            const double w_2 = m_dx[0]*m_dx[1]/4.;
1629    #pragma omp parallel
1630            {
1631                vector<double> int_local(numComp, 0);
1632                if (m_faceOffset[0] > -1) {
1633    #pragma omp for nowait
1634                    for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1635                        for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1636                            const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1637                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1638                                const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1639                                const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1640                                const double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];
1641                                const double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];
1642                                int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_0;
1643                            }  // end of component loop i
1644                        } // end of k1 loop
1645                    } // end of k2 loop
1646                }
1647    
1648                if (m_faceOffset[1] > -1) {
1649    #pragma omp for nowait
1650                    for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1651                        for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1652                            const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1653                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1654                                const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1655                                const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1656                                const double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];
1657                                const double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];
1658                                int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_0;
1659                            }  // end of component loop i
1660                        } // end of k1 loop
1661                    } // end of k2 loop
1662                }
1663    
1664                if (m_faceOffset[2] > -1) {
1665    #pragma omp for nowait
1666                    for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1667                        for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1668                            const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1669                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1670                                const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1671                                const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1672                                const double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];
1673                                const double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];
1674                                int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_1;
1675                            }  // end of component loop i
1676                        } // end of k1 loop
1677                    } // end of k2 loop
1678                }
1679    
1680                if (m_faceOffset[3] > -1) {
1681    #pragma omp for nowait
1682                    for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1683                        for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1684                            const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1685                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1686                                const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1687                                const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1688                                const double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];
1689                                const double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];
1690                                int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_1;
1691                            }  // end of component loop i
1692                        } // end of k1 loop
1693                    } // end of k2 loop
1694                }
1695    
1696                if (m_faceOffset[4] > -1) {
1697    #pragma omp for nowait
1698                    for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1699                        for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1700                            const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1701                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1702                                const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1703                                const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1704                                const double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];
1705                                const double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];
1706                                int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_2;
1707                            }  // end of component loop i
1708                        } // end of k1 loop
1709                    } // end of k2 loop
1710                }
1711    
1712                if (m_faceOffset[5] > -1) {
1713    #pragma omp for nowait
1714                    for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1715                        for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1716                            const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1717                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1718                                const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1719                                const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1720                                const double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];
1721                                const double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];
1722                                int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_2;
1723                            }  // end of component loop i
1724                        } // end of k1 loop
1725                    } // end of k2 loop
1726                }
1727    
1728    #pragma omp critical
1729                for (index_t i=0; i<numComp; i++)
1730                    integrals[i]+=int_local[i];
1731            } // end of parallel section
1732    
1733        } else if (fs==ReducedFaceElements || (fs==FaceElements && !arg.actsExpanded())) {
1734            const double w_0 = m_dx[1]*m_dx[2];
1735            const double w_1 = m_dx[0]*m_dx[2];
1736            const double w_2 = m_dx[0]*m_dx[1];
1737    #pragma omp parallel
1738            {
1739                vector<double> int_local(numComp, 0);
1740                if (m_faceOffset[0] > -1) {
1741    #pragma omp for nowait
1742                    for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1743                        for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1744                            const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1745                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1746                                int_local[i]+=f[i]*w_0;
1747                            }  // end of component loop i
1748                        } // end of k1 loop
1749                    } // end of k2 loop
1750                }
1751    
1752                if (m_faceOffset[1] > -1) {
1753    #pragma omp for nowait
1754                    for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1755                        for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1756                            const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1757                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1758                                int_local[i]+=f[i]*w_0;
1759                            }  // end of component loop i
1760                        } // end of k1 loop
1761                    } // end of k2 loop
1762                }
1763    
1764                if (m_faceOffset[2] > -1) {
1765    #pragma omp for nowait
1766                    for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1767                        for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1768                            const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1769                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1770                                int_local[i]+=f[i]*w_1;
1771                            }  // end of component loop i
1772                        } // end of k1 loop
1773                    } // end of k2 loop
1774                }
1775    
1776                if (m_faceOffset[3] > -1) {
1777    #pragma omp for nowait
1778                    for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1779                        for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1780                            const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1781                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1782                                int_local[i]+=f[i]*w_1;
1783                            }  // end of component loop i
1784                        } // end of k1 loop
1785                    } // end of k2 loop
1786                }
1787    
1788                if (m_faceOffset[4] > -1) {
1789    #pragma omp for nowait
1790                    for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1791                        for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1792                            const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1793                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1794                                int_local[i]+=f[i]*w_2;
1795                            }  // end of component loop i
1796                        } // end of k1 loop
1797                    } // end of k2 loop
1798                }
1799    
1800                if (m_faceOffset[5] > -1) {
1801    #pragma omp for nowait
1802                    for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1803                        for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1804                            const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1805                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1806                                int_local[i]+=f[i]*w_2;
1807                            }  // end of component loop i
1808                        } // end of k1 loop
1809                    } // end of k2 loop
1810                }
1811    
1812    #pragma omp critical
1813                for (index_t i=0; i<numComp; i++)
1814                    integrals[i]+=int_local[i];
1815            } // end of parallel section
1816        } // function space selector
1817    }
1818    
1819    //protected
1820  dim_t Brick::insertNeighbourNodes(IndexVector& index, index_t node) const  dim_t Brick::insertNeighbourNodes(IndexVector& index, index_t node) const
1821  {  {
1822      const dim_t nDOF0 = (m_gNE0+1)/m_NX;      const dim_t nDOF0 = (m_gNE[0]+1)/m_NX[0];
1823      const dim_t nDOF1 = (m_gNE1+1)/m_NY;      const dim_t nDOF1 = (m_gNE[1]+1)/m_NX[1];
1824      const dim_t nDOF2 = (m_gNE2+1)/m_NZ;      const dim_t nDOF2 = (m_gNE[2]+1)/m_NX[2];
1825      const int x=node%nDOF0;      const int x=node%nDOF0;
1826      const int y=node%(nDOF0*nDOF1)/nDOF0;      const int y=node%(nDOF0*nDOF1)/nDOF0;
1827      const int z=node/(nDOF0*nDOF1);      const int z=node/(nDOF0*nDOF1);
# Line 1477  void Brick::nodesToDOF(escript::Data& ou Line 1856  void Brick::nodesToDOF(escript::Data& ou
1856      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();
1857      out.requireWrite();      out.requireWrite();
1858    
1859      const index_t left = (m_offset0==0 ? 0 : 1);      const index_t left = (m_offset[0]==0 ? 0 : 1);
1860      const index_t bottom = (m_offset1==0 ? 0 : 1);      const index_t bottom = (m_offset[1]==0 ? 0 : 1);
1861      const index_t front = (m_offset2==0 ? 0 : 1);      const index_t front = (m_offset[2]==0 ? 0 : 1);
1862      const dim_t nDOF0 = (m_gNE0+1)/m_NX;      const dim_t nDOF0 = (m_gNE[0]+1)/m_NX[0];
1863      const dim_t nDOF1 = (m_gNE1+1)/m_NY;      const dim_t nDOF1 = (m_gNE[1]+1)/m_NX[1];
1864      const dim_t nDOF2 = (m_gNE2+1)/m_NZ;      const dim_t nDOF2 = (m_gNE[2]+1)/m_NX[2];
1865  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel for
1866      for (index_t i=0; i<nDOF2; i++) {      for (index_t i=0; i<nDOF2; i++) {
1867          for (index_t j=0; j<nDOF1; j++) {          for (index_t j=0; j<nDOF1; j++) {
1868              for (index_t k=0; k<nDOF0; k++) {              for (index_t k=0; k<nDOF0; k++) {
1869                  const index_t n=k+left+(j+bottom)*m_N0+(i+front)*m_N0*m_N1;                  const index_t n=k+left+(j+bottom)*m_NN[0]+(i+front)*m_NN[0]*m_NN[1];
1870                  const double* src=in.getSampleDataRO(n);                  const double* src=in.getSampleDataRO(n);
1871                  copy(src, src+numComp, out.getSampleDataRW(k+j*nDOF0+i*nDOF0*nDOF1));                  copy(src, src+numComp, out.getSampleDataRW(k+j*nDOF0+i*nDOF0*nDOF1));
1872              }              }
# Line 1514  void Brick::dofToNodes(escript::Data& ou Line 1893  void Brick::dofToNodes(escript::Data& ou
1893                  : &buffer[(m_dofMap[i]-numDOF)*numComp]);                  : &buffer[(m_dofMap[i]-numDOF)*numComp]);
1894          copy(src, src+numComp, out.getSampleDataRW(i));          copy(src, src+numComp, out.getSampleDataRW(i));
1895      }      }
1896        Paso_Coupler_free(coupler);
1897  }  }
1898    
1899  //private  //private
1900  void Brick::populateSampleIds()  void Brick::populateSampleIds()
1901  {  {
1902      // identifiers are ordered from left to right, bottom to top, front to back      // degrees of freedom are numbered from left to right, bottom to top, front
1903      // globally      // to back in each rank, continuing on the next rank (ranks also go
1904        // left-right, bottom-top, front-back).
1905        // This means rank 0 has id 0...n0-1, rank 1 has id n0...n1-1 etc. which
1906        // helps when writing out data rank after rank.
1907    
1908      // build node distribution vector first.      // build node distribution vector first.
1909      // rank i owns m_nodeDistribution[i+1]-nodeDistribution[i] nodes      // rank i owns m_nodeDistribution[i+1]-nodeDistribution[i] nodes which is
1910        // constant for all ranks in this implementation
1911      m_nodeDistribution.assign(m_mpiInfo->size+1, 0);      m_nodeDistribution.assign(m_mpiInfo->size+1, 0);
1912      const dim_t numDOF=getNumDOF();      const dim_t numDOF=getNumDOF();
1913      for (dim_t k=1; k<m_mpiInfo->size; k++) {      for (dim_t k=1; k<m_mpiInfo->size; k++) {
# Line 1533  void Brick::populateSampleIds() Line 1917  void Brick::populateSampleIds()
1917      m_nodeId.resize(getNumNodes());      m_nodeId.resize(getNumNodes());
1918      m_dofId.resize(numDOF);      m_dofId.resize(numDOF);
1919      m_elementId.resize(getNumElements());      m_elementId.resize(getNumElements());
1920    
1921        // populate face element counts
1922        //left
1923        if (m_offset[0]==0)
1924            m_faceCount[0]=m_NE[1]*m_NE[2];
1925        else
1926            m_faceCount[0]=0;
1927        //right
1928        if (m_mpiInfo->rank%m_NX[0]==m_NX[0]-1)
1929            m_faceCount[1]=m_NE[1]*m_NE[2];
1930        else
1931            m_faceCount[1]=0;
1932        //bottom
1933        if (m_offset[1]==0)
1934            m_faceCount[2]=m_NE[0]*m_NE[2];
1935        else
1936            m_faceCount[2]=0;
1937        //top
1938        if (m_mpiInfo->rank%(m_NX[0]*m_NX[1])/m_NX[0]==m_NX[1]-1)
1939            m_faceCount[3]=m_NE[0]*m_NE[2];
1940        else
1941            m_faceCount[3]=0;
1942        //front
1943        if (m_offset[2]==0)
1944            m_faceCount[4]=m_NE[0]*m_NE[1];
1945        else
1946            m_faceCount[4]=0;
1947        //back
1948        if (m_mpiInfo->rank/(m_NX[0]*m_NX[1])==m_NX[2]-1)
1949            m_faceCount[5]=m_NE[0]*m_NE[1];
1950        else
1951            m_faceCount[5]=0;
1952    
1953      m_faceId.resize(getNumFaceElements());      m_faceId.resize(getNumFaceElements());
1954    
1955        const index_t left = (m_offset[0]==0 ? 0 : 1);
1956        const index_t bottom = (m_offset[1]==0 ? 0 : 1);
1957        const index_t front = (m_offset[2]==0 ? 0 : 1);
1958        const dim_t nDOF0 = (m_gNE[0]+1)/m_NX[0];
1959        const dim_t nDOF1 = (m_gNE[1]+1)/m_NX[1];
1960        const dim_t nDOF2 = (m_gNE[2]+1)/m_NX[2];
1961    
1962        // the following is a compromise between efficiency and code length to
1963        // set the node id's according to the order mentioned above.
1964        // First we set all the edge and corner id's in a rather slow way since
1965        // they might or might not be owned by this rank. Next come the own
1966        // node id's which are identical to the DOF id's (simple loop), and finally
1967        // the 6 faces are set but only if required...
1968    
1969    #define globalNodeId(x,y,z) \
1970        ((m_offset[0]+x)/nDOF0)*nDOF0*nDOF1*nDOF2+(m_offset[0]+x)%nDOF0\
1971        + ((m_offset[1]+y)/nDOF1)*nDOF0*nDOF1*nDOF2*m_NX[0]+((m_offset[1]+y)%nDOF1)*nDOF0\
1972        + ((m_offset[2]+z)/nDOF2)*nDOF0*nDOF1*nDOF2*m_NX[0]*m_NX[1]+((m_offset[2]+z)%nDOF2)*nDOF0*nDOF1
1973    
1974  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1975      {      {
1976            // set edge id's
1977            // edges in x-direction, including corners
1978    #pragma omp for nowait
1979            for (dim_t i=0; i<m_NN[0]; i++) {
1980                m_nodeId[i] = globalNodeId(i, 0, 0); // LF
1981                m_nodeId[m_NN[0]*(m_NN[1]-1)+i] = globalNodeId(i, m_NN[1]-1, 0); // UF
1982                m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1)+i] = globalNodeId(i, 0, m_NN[2]-1); // LB
1983                m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*m_NN[2]-m_NN[0]+i] = globalNodeId(i, m_NN[1]-1, m_NN[2]-1); // UB
1984            }
1985            // edges in y-direction, without corners
1986  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1987          // nodes          for (dim_t i=1; i<m_NN[1]-1; i++) {
1988          for (dim_t i2=0; i2<m_N2; i2++) {              m_nodeId[m_NN[0]*i] = globalNodeId(0, i, 0); // FL
1989              for (dim_t i1=0; i1<m_N1; i1++) {              m_nodeId[m_NN[0]*(i+1)-1] = globalNodeId(m_NN[0]-1, i, 0); // FR
1990                  for (dim_t i0=0; i0<m_N0; i0++) {              m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1)+m_NN[0]*i] = globalNodeId(0, i, m_NN[2]-1); // BL
1991                      m_nodeId[i0+i1*m_N0+i2*m_N0*m_N1] =              m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1)+m_NN[0]*(i+1)-1] = globalNodeId(m_NN[0]-1, i, m_NN[2]-1); // BR
1992                          (m_offset2+i2)*(m_gNE0+1)*(m_gNE1+1)          }
1993                          +(m_offset1+i1)*(m_gNE0+1)          // edges in z-direction, without corners
1994                          +m_offset0+i0;  #pragma omp for
1995            for (dim_t i=1; i<m_NN[2]-1; i++) {
1996                m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*i] = globalNodeId(0, 0, i); // LL
1997                m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*i+m_NN[0]-1] = globalNodeId(m_NN[0]-1, 0, i); // LR
1998                m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*(i+1)-m_NN[0]] = globalNodeId(0, m_NN[1]-1, i); // UL
1999                m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*(i+1)-1] = globalNodeId(m_NN[0]-1, m_NN[1]-1, i); // UR
2000            }
2001            // implicit barrier here because some node IDs will be overwritten
2002            // below
2003    
2004            // populate degrees of freedom and own nodes (identical id)
2005    #pragma omp for nowait
2006            for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++) {
2007                for (dim_t j=0; j<nDOF1; j++) {
2008                    for (dim_t k=0; k<nDOF0; k++) {
2009                        const index_t nodeIdx=k+left+(j+bottom)*m_NN[0]+(i+front)*m_NN[0]*m_NN[1];
2010                        const index_t dofIdx=k+j*nDOF0+i*nDOF0*nDOF1;
2011                        m_dofId[dofIdx] = m_nodeId[nodeIdx]
2012                            = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank]+dofIdx;
2013                  }                  }
2014              }              }
2015          }          }
2016    
2017          // degrees of freedom          // populate the rest of the nodes (shared with other ranks)
2018            if (m_faceCount[0]==0) { // left plane
2019    #pragma omp for nowait
2020                for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++) {
2021                    for (dim_t j=0; j<nDOF1; j++) {
2022                        const index_t nodeIdx=(j+bottom)*m_NN[0]+(i+front)*m_NN[0]*m_NN[1];
2023                        const index_t dofId=(j+1)*nDOF0-1+i*nDOF0*nDOF1;
2024                        m_nodeId[nodeIdx]
2025                            = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank-1]+dofId;
2026                    }
2027                }
2028            }
2029            if (m_faceCount[1]==0) { // right plane
2030    #pragma omp for nowait
2031                for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++) {
2032                    for (dim_t j=0; j<nDOF1; j++) {
2033                        const index_t nodeIdx=(j+bottom+1)*m_NN[0]-1+(i+front)*m_NN[0]*m_NN[1];
2034                        const index_t dofId=j*nDOF0+i*nDOF0*nDOF1;
2035                        m_nodeId[nodeIdx]
2036                            = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank+1]+dofId;
2037                    }
2038                }
2039            }
2040            if (m_faceCount[2]==0) { // bottom plane
2041  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2042          for (dim_t k=0; k<numDOF; k++)              for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++) {
2043              m_dofId[k] = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank]+k;                  for (dim_t k=0; k<nDOF0; k++) {
2044                        const index_t nodeIdx=k+left+(i+front)*m_NN[0]*m_NN[1];
2045                        const index_t dofId=nDOF0*(nDOF1-1)+k+i*nDOF0*nDOF1;
2046                        m_nodeId[nodeIdx]
2047                            = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank-m_NX[0]]+dofId;
2048                    }
2049                }
2050            }
2051            if (m_faceCount[3]==0) { // top plane
2052    #pragma omp for nowait
2053                for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++) {
2054                    for (dim_t k=0; k<nDOF0; k++) {
2055                        const index_t nodeIdx=k+left+(i+front)*m_NN[0]*m_NN[1]+m_NN[0]*(m_NN[1]-1);
2056                        const index_t dofId=k+i*nDOF0*nDOF1;
2057                        m_nodeId[nodeIdx]
2058                            = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank+m_NX[0]]+dofId;
2059                    }
2060                }
2061            }
2062            if (m_faceCount[4]==0) { // front plane
2063    #pragma omp for nowait
2064                for (dim_t j=0; j<nDOF1; j++) {
2065                    for (dim_t k=0; k<nDOF0; k++) {
2066                        const index_t nodeIdx=k+left+(j+bottom)*m_NN[0];
2067                        const index_t dofId=k+j*nDOF0+nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);
2068                        m_nodeId[nodeIdx]
2069                            = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank-m_NX[0]*m_NX[1]]+dofId;
2070                    }
2071                }
2072            }
2073            if (m_faceCount[5]==0) { // back plane
2074    #pragma omp for nowait
2075                for (dim_t j=0; j<nDOF1; j++) {
2076                    for (dim_t k=0; k<nDOF0; k++) {
2077                        const index_t nodeIdx=k+left+(j+bottom)*m_NN[0]+m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1);
2078                        const index_t dofId=k+j*nDOF0;
2079                        m_nodeId[nodeIdx]
2080                            = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank+m_NX[0]*m_NX[1]]+dofId;
2081                    }
2082                }
2083            }
2084    
2085          // elements          // populate element id's
2086  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2087          for (dim_t i2=0; i2<m_NE2; i2++) {          for (dim_t i2=0; i2<m_NE[2]; i2++) {
2088              for (dim_t i1=0; i1<m_NE1; i1++) {              for (dim_t i1=0; i1<m_NE[1]; i1++) {
2089                  for (dim_t i0=0; i0<m_NE0; i0++) {                  for (dim_t i0=0; i0<m_NE[0]; i0++) {
2090                      m_elementId[i0+i1*m_NE0+i2*m_NE0*m_NE1] =                      m_elementId[i0+i1*m_NE[0]+i2*m_NE[0]*m_NE[1]] =
2091                          (m_offset2+i2)*m_gNE0*m_gNE1                          (m_offset[2]+i2)*m_gNE[0]*m_gNE[1]
2092                          +(m_offset1+i1)*m_gNE0                          +(m_offset[1]+i1)*m_gNE[0]
2093                          +m_offset0+i0;                          +m_offset[0]+i0;
2094                  }                  }
2095              }              }
2096          }          }
# Line 1574  void Brick::populateSampleIds() Line 2101  void Brick::populateSampleIds()
2101              m_faceId[k]=k;              m_faceId[k]=k;
2102      } // end parallel section      } // end parallel section
2103    
2104    #undef globalNodeId
2105    
2106      m_nodeTags.assign(getNumNodes(), 0);      m_nodeTags.assign(getNumNodes(), 0);
2107      updateTagsInUse(Nodes);      updateTagsInUse(Nodes);
2108    
# Line 1581  void Brick::populateSampleIds() Line 2110  void Brick::populateSampleIds()
2110      updateTagsInUse(Elements);      updateTagsInUse(Elements);
2111    
2112      // generate face offset vector and set face tags      // generate face offset vector and set face tags
     const IndexVector facesPerEdge = getNumFacesPerBoundary();  
2113      const index_t LEFT=1, RIGHT=2, BOTTOM=10, TOP=20, FRONT=100, BACK=200;      const index_t LEFT=1, RIGHT=2, BOTTOM=10, TOP=20, FRONT=100, BACK=200;
2114      const index_t faceTag[] = { LEFT, RIGHT, BOTTOM, TOP, FRONT, BACK };      const index_t faceTag[] = { LEFT, RIGHT, BOTTOM, TOP, FRONT, BACK };
2115      m_faceOffset.assign(facesPerEdge.size(), -1);      m_faceOffset.assign(6, -1);
2116      m_faceTags.clear();      m_faceTags.clear();
2117      index_t offset=0;      index_t offset=0;
2118      for (size_t i=0; i<facesPerEdge.size(); i++) {      for (size_t i=0; i<6; i++) {
2119          if (facesPerEdge[i]>0) {          if (m_faceCount[i]>0) {
2120              m_faceOffset[i]=offset;              m_faceOffset[i]=offset;
2121              offset+=facesPerEdge[i];              offset+=m_faceCount[i];
2122              m_faceTags.insert(m_faceTags.end(), facesPerEdge[i], faceTag[i]);              m_faceTags.insert(m_faceTags.end(), m_faceCount[i], faceTag[i]);
2123          }          }
2124      }      }
2125      setTagMap("left", LEFT);      setTagMap("left", LEFT);
# Line 1606  void Brick::populateSampleIds() Line 2134  void Brick::populateSampleIds()
2134  //private  //private
2135  void Brick::createPattern()  void Brick::createPattern()
2136  {  {
2137      const dim_t nDOF0 = (m_gNE0+1)/m_NX;      const dim_t nDOF0 = (m_gNE[0]+1)/m_NX[0];
2138      const dim_t nDOF1 = (m_gNE1+1)/m_NY;      const dim_t nDOF1 = (m_gNE[1]+1)/m_NX[1];
2139      const dim_t nDOF2 = (m_gNE2+1)/m_NZ;      const dim_t nDOF2 = (m_gNE[2]+1)/m_NX[2];
2140      const index_t left = (m_offset0==0 ? 0 : 1);      const index_t left = (m_offset[0]==0 ? 0 : 1);
2141      const index_t bottom = (m_offset1==0 ? 0 : 1);      const index_t bottom = (m_offset[1]==0 ? 0 : 1);
2142      const index_t front = (m_offset2==0 ? 0 : 1);      const index_t front = (m_offset[2]==0 ? 0 : 1);
2143    
2144      // populate node->DOF mapping with own degrees of freedom.      // populate node->DOF mapping with own degrees of freedom.
2145      // The rest is assigned in the loop further down      // The rest is assigned in the loop further down
2146      m_dofMap.assign(getNumNodes(), 0);      m_dofMap.assign(getNumNodes(), 0);
2147  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel for
2148      for (index_t i=front; i<m_N2; i++) {      for (index_t i=front; i<front+nDOF2; i++) {
2149          for (index_t j=bottom; j<m_N1; j++) {          for (index_t j=bottom; j<bottom+nDOF1; j++) {
2150              for (index_t k=left; k<m_N0; k++) {              for (index_t k=left; k<left+nDOF0; k++) {
2151                  m_dofMap[i*m_N0*m_N1+j*m_N0+k]=(i-front)*nDOF0*nDOF1+(j-bottom)*nDOF0+k-left;                  m_dofMap[i*m_NN[0]*m_NN[1]+j*m_NN[0]+k]=(i-front)*nDOF0*nDOF1+(j-bottom)*nDOF0+k-left;
2152              }              }
2153          }          }
2154      }      }
# Line 1634  void Brick::createPattern() Line 2162  void Brick::createPattern()
2162      IndexVector offsetInShared(1,0);      IndexVector offsetInShared(1,0);
2163      IndexVector sendShared, recvShared;      IndexVector sendShared, recvShared;
2164      int numShared=0;      int numShared=0;
2165      const int x=m_mpiInfo->rank%m_NX;      const int x=m_mpiInfo->rank%m_NX[0];
2166      const int y=m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX;      const int y=m_mpiInfo->rank%(m_NX[0]*m_NX[1])/m_NX[0];
2167      const int z=m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY);      const int z=m_mpiInfo->rank/(m_NX[0]*m_NX[1]);
2168      for (int i2=-1; i2<2; i2++) {      for (int i2=-1; i2<2; i2++) {
2169          for (int i1=-1; i1<2; i1++) {          for (int i1=-1; i1<2; i1++) {
2170              for (int i0=-1; i0<2; i0++) {              for (int i0=-1; i0<2; i0++) {
# Line 1647  void Brick::createPattern() Line 2175  void Brick::createPattern()
2175                  const int nx=x+i0;                  const int nx=x+i0;
2176                  const int ny=y+i1;                  const int ny=y+i1;
2177                  const int nz=z+i2;                  const int nz=z+i2;
2178                  if (nx>=0 && ny>=0 && nz>=0 && nx<m_NX && ny<m_NY && nz<m_NZ) {                  if (nx>=0 && ny>=0 && nz>=0 && nx<m_NX[0] && ny<m_NX[1] && nz<m_NX[2]) {
2179                      neighbour.push_back(nz*m_NX*m_NY+ny*m_NX+nx);                      neighbour.push_back(nz*m_NX[0]*m_NX[1]+ny*m_NX[0]+nx);
2180                      if (i0==0 && i1==0) {                      if (i0==0 && i1==0) {
2181                          // sharing front or back plane                          // sharing front or back plane
2182                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF0*nDOF1);                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF0*nDOF1);
2183                          for (dim_t i=0; i<nDOF1; i++) {                          for (dim_t i=0; i<nDOF1; i++) {
2184                              const int firstDOF=(i2==-1 ? i*nDOF0                              const int firstDOF=(i2==-1 ? i*nDOF0
2185                                      : i*nDOF0 + nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1));                                      : i*nDOF0 + nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1));
2186                              const int firstNode=(i2==-1 ? left+(i+bottom)*m_N0                              const int firstNode=(i2==-1 ? left+(i+bottom)*m_NN[0]
2187                                      : left+(i+bottom)*m_N0+m_N0*m_N1*(m_N2-1));                                      : left+(i+bottom)*m_NN[0]+m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1));
2188                              for (dim_t j=0; j<nDOF0; j++, numShared++) {                              for (dim_t j=0; j<nDOF0; j++, numShared++) {
2189                                  sendShared.push_back(firstDOF+j);                                  sendShared.push_back(firstDOF+j);
2190                                  recvShared.push_back(numDOF+numShared);                                  recvShared.push_back(numDOF+numShared);
# Line 1689  void Brick::createPattern() Line 2217  void Brick::createPattern()
2217                              const int firstDOF=(i1==-1 ? i*nDOF0*nDOF1                              const int firstDOF=(i1==-1 ? i*nDOF0*nDOF1
2218                                      : nDOF0*((i+1)*nDOF1-1));                                      : nDOF0*((i+1)*nDOF1-1));
2219                              const int firstNode=(i1==-1 ?                              const int firstNode=(i1==-1 ?
2220                                      left+(i+front)*m_N0*m_N1                                      left+(i+front)*m_NN[0]*m_NN[1]
2221                                      : left+m_N0*((i+1+front)*m_N1-1));                                      : left+m_NN[0]*((i+1+front)*m_NN[1]-1));
2222                              for (dim_t j=0; j<nDOF0; j++, numShared++) {                              for (dim_t j=0; j<nDOF0; j++, numShared++) {
2223                                  sendShared.push_back(firstDOF+j);                                  sendShared.push_back(firstDOF+j);
2224                                  recvShared.push_back(numDOF+numShared);                                  recvShared.push_back(numDOF+numShared);
# Line 1723  void Brick::createPattern() Line 2251  void Brick::createPattern()
2251                              const int firstDOF=(i0==-1 ? i*nDOF0*nDOF1                              const int firstDOF=(i0==-1 ? i*nDOF0*nDOF1
2252                                      : nDOF0*(1+i*nDOF1)-1);                                      : nDOF0*(1+i*nDOF1)-1);
2253                              const int firstNode=(i0==-1 ?                              const int firstNode=(i0==-1 ?
2254                                      (bottom+(i+front)*m_N1)*m_N0                                      (bottom+(i+front)*m_NN[1])*m_NN[0]
2255                                      : (bottom+1+(i+front)*m_N1)*m_N0-1);                                      : (bottom+1+(i+front)*m_NN[1])*m_NN[0]-1);
2256                              for (dim_t j=0; j<nDOF1; j++, numShared++) {                              for (dim_t j=0; j<nDOF1; j++, numShared++) {
2257                                  sendShared.push_back(firstDOF+j*nDOF0);                                  sendShared.push_back(firstDOF+j*nDOF0);
2258                                  recvShared.push_back(numDOF+numShared);                                  recvShared.push_back(numDOF+numShared);
# Line 1747  void Brick::createPattern() Line 2275  void Brick::createPattern()
2275                                      if (i<nDOF2-1)                                      if (i<nDOF2-1)
2276                                          colIndices[firstDOF+(j+1)*nDOF0+nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);                                          colIndices[firstDOF+(j+1)*nDOF0+nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);
2277                                  }                                  }
2278                                  m_dofMap[firstNode+j*m_N0]=numDOF+numShared;                                  m_dofMap[firstNode+j*m_NN[0]]=numDOF+numShared;
2279                              }                              }
2280                          }                          }
2281                      } else if (i0==0) {                      } else if (i0==0) {
# Line 1755  void Brick::createPattern() Line 2283  void Brick::createPattern()
2283                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF0);                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF0);
2284                          const int firstDOF=(i1+1)/2*nDOF0*(nDOF1-1)                          const int firstDOF=(i1+1)/2*nDOF0*(nDOF1-1)
2285                                             +(i2+1)/2*nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);                                             +(i2+1)/2*nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);
2286                          const int firstNode=(i1+1)/2*m_N0*(m_N1-1)                          const int firstNode=left+(i1+1)/2*m_NN[0]*(m_NN[1]-1)
2287                                              +(i2+1)/2*m_N0*m_N1*(m_N2-1);                                              +(i2+1)/2*m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1);
2288                          for (dim_t i=0; i<nDOF0; i++, numShared++) {                          for (dim_t i=0; i<nDOF0; i++, numShared++) {
2289                              sendShared.push_back(firstDOF+i);                              sendShared.push_back(firstDOF+i);
2290                              recvShared.push_back(numDOF+numShared);                              recvShared.push_back(numDOF+numShared);
# Line 1772  void Brick::createPattern() Line 2300  void Brick::createPattern()
2300                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF1);                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF1);
2301                          const int firstDOF=(i0+1)/2*(nDOF0-1)                          const int firstDOF=(i0+1)/2*(nDOF0-1)
2302                                             +(i2+1)/2*nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);                                             +(i2+1)/2*nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);
2303                          const int firstNode=(i0+1)/2*(m_N0-1)                          const int firstNode=bottom*m_NN[0]
2304                                              +(i2+1)/2*m_N0*m_N1*(m_N2-1);                                              +(i0+1)/2*(m_NN[0]-1)
2305                                                +(i2+1)/2*m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1);
2306                          for (dim_t i=0; i<nDOF1; i++, numShared++) {                          for (dim_t i=0; i<nDOF1; i++, numShared++) {
2307                              sendShared.push_back(firstDOF+i*nDOF0);                              sendShared.push_back(firstDOF+i*nDOF0);
2308                              recvShared.push_back(numDOF+numShared);                              recvShared.push_back(numDOF+numShared);
# Line 1782  void Brick::createPattern() Line 2311  void Brick::createPattern()
2311                              colIndices[firstDOF+i*nDOF0].push_back(numShared);                              colIndices[firstDOF+i*nDOF0].push_back(numShared);
2312                              if (i<nDOF1-1)                              if (i<nDOF1-1)
2313                                  colIndices[firstDOF+(i+1)*nDOF0].push_back(numShared);                                  colIndices[firstDOF+(i+1)*nDOF0].push_back(numShared);
2314                              m_dofMap[firstNode+i*m_N0]=numDOF+numShared;                              m_dofMap[firstNode+i*m_NN[0]]=numDOF+numShared;
2315                          }                          }
2316                      } else if (i2==0) {                      } else if (i2==0) {
2317                          // sharing an edge in z direction                          // sharing an edge in z direction
2318                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF2);                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF2);
2319                          const int firstDOF=(i0+1)/2*(nDOF0-1)                          const int firstDOF=(i0+1)/2*(nDOF0-1)
2320                                             +(i1+1)/2*nDOF0*(nDOF1-1);                                             +(i1+1)/2*nDOF0*(nDOF1-1);
2321                          const int firstNode=(i0+1)/2*(m_N0-1)                          const int firstNode=front*m_NN[0]*m_NN[1]
2322                                              +(i1+1)/2*m_N0*(m_N1-1);                                              +(i0+1)/2*(m_NN[0]-1)
2323                                                +(i1+1)/2*m_NN[0]*(m_NN[1]-1);
2324                          for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++, numShared++) {                          for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++, numShared++) {
2325                              sendShared.push_back(firstDOF+i*nDOF0*nDOF1);                              sendShared.push_back(firstDOF+i*nDOF0*nDOF1);
2326                              recvShared.push_back(numDOF+numShared);                              recvShared.push_back(numDOF+numShared);
# Line 1799  void Brick::createPattern() Line 2329  void Brick::createPattern()
2329                              colIndices[firstDOF+i*nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);                              colIndices[firstDOF+i*nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);
2330                              if (i<nDOF2-1)                              if (i<nDOF2-1)
2331                                  colIndices[firstDOF+(i+1)*nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);                                  colIndices[firstDOF+(i+1)*nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);
2332                              m_dofMap[firstNode+i*m_N0*m_N1]=numDOF+numShared;                              m_dofMap[firstNode+i*m_NN[0]*m_NN[1]]=numDOF+numShared;
2333                          }                          }
2334                      } else {                      } else {
2335                          // sharing a node                          // sharing a node
2336                          const int dof=(i0+1)/2*(nDOF0-1)                          const int dof=(i0+1)/2*(nDOF0-1)
2337                                        +(i1+1)/2*nDOF0*(nDOF1-1)                                        +(i1+1)/2*nDOF0*(nDOF1-1)
2338                                        +(i2+1)/2*nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);                                        +(i2+1)/2*nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);
2339                          const int node=(i0+1)/2*(m_N0-1)                          const int node=(i0+1)/2*(m_NN[0]-1)
2340                                         +(i1+1)/2*m_N0*(m_N1-1)                                         +(i1+1)/2*m_NN[0]*(m_NN[1]-1)
2341                                         +(i2+1)/2*m_N0*m_N1*(m_N2-1);                                         +(i2+1)/2*m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1);
2342                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+1);                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+1);
2343                          sendShared.push_back(dof);                          sendShared.push_back(dof);
2344                          recvShared.push_back(numDOF+numShared);                          recvShared.push_back(numDOF+numShared);
# Line 1911  void Brick::createPattern() Line 2441  void Brick::createPattern()
2441      Paso_Pattern_free(rowPattern);      Paso_Pattern_free(rowPattern);
2442  }  }
2443    
2444    //private
2445    void Brick::addToMatrixAndRHS(Paso_SystemMatrix* S, escript::Data& F,
2446             const vector<double>& EM_S, const vector<double>& EM_F, bool addS,
2447             bool addF, index_t firstNode, dim_t nEq, dim_t nComp) const
2448    {
2449        IndexVector rowIndex;
2450        rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode]);
2451        rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+1]);
2452        rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_NN[0]]);
2453        rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_NN[0]+1]);
2454        rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_NN[0]*m_NN[1]]);
2455        rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_NN[0]*m_NN[1]+1]);
2456        rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_NN[0]*(m_NN[1]+1)]);
2457        rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_NN[0]*(m_NN[1]+1)+1]);
2458        if (addF) {
2459            double *F_p=F.getSampleDataRW(0);
2460            for (index_t i=0; i<rowIndex.size(); i++) {
2461                if (rowIndex[i]<getNumDOF()) {
2462                    for (index_t eq=0; eq<nEq; eq++) {
2463                        F_p[INDEX2(eq, rowIndex[i], nEq)]+=EM_F[INDEX2(eq,i,nEq)];
2464                    }
2465                }
2466            }
2467        }
2468        if (addS) {
2469            addToSystemMatrix(S, rowIndex, nEq, rowIndex, nComp, EM_S);
2470        }
2471    }
2472    
2473  //protected  //protected
2474  void Brick::interpolateNodesOnElements(escript::Data& out, escript::Data& in,  void Brick::interpolateNodesOnElements(escript::Data& out, escript::Data& in,
2475                                         bool reduced) const                                         bool reduced) const
# Line 1918  void Brick::interpolateNodesOnElements(e Line 2477  void Brick::interpolateNodesOnElements(e
2477      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();
2478      if (reduced) {      if (reduced) {
2479          out.requireWrite();          out.requireWrite();
2480          /*** GENERATOR SNIP_INTERPOLATE_REDUCED_ELEMENTS TOP */  #pragma omp parallel
2481          const double c0 = .125;          {
2482  #pragma omp parallel for              vector<double> f_000(numComp);
2483          for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {              vector<double> f_001(numComp);
2484              for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {              vector<double> f_010(numComp);
2485                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {              vector<double> f_011(numComp);
2486                      const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_N0,m_N1));              vector<double> f_100(numComp);
2487                      const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_N0,m_N1));              vector<double> f_101(numComp);
2488                      const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_N0,m_N1));              vector<double> f_110(numComp);
2489                      const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));              vector<double> f_111(numComp);
2490                      const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_N0,m_N1));  #pragma omp for
2491                      const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_N0,m_N1));              for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2492                      const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_N0,m_N1));                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2493                      const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2494                      double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE0,m_NE1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2495                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2496                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_000[i] + f_001[i] + f_010[i] + f_011[i] + f_100[i] + f_101[i] + f_110[i] + f_111[i]);                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2497                      } /* end of component loop i */                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2498                  } /* end of k0 loop */                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2499              } /* end of k1 loop */                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2500          } /* end of k2 loop */                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2501          /* GENERATOR SNIP_INTERPOLATE_REDUCED_ELEMENTS BOTTOM */                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2502                            double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE[0],m_NE[1]));
2503                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2504                                o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_000[i] + f_001[i] + f_010[i] + f_011[i] + f_100[i] + f_101[i] + f_110[i] + f_111[i])/8;
2505                            } // end of component loop i
2506                        } // end of k0 loop
2507                    } // end of k1 loop
2508                } // end of k2 loop
2509            } // end of parallel section
2510      } else {      } else {
2511          out.requireWrite();          out.requireWrite();
         /*** GENERATOR SNIP_INTERPOLATE_ELEMENTS TOP */  
2512          const double c0 = .0094373878376559314545;          const double c0 = .0094373878376559314545;
2513          const double c1 = .035220810900864519624;          const double c1 = .035220810900864519624;
2514          const double c2 = .13144585576580214704;          const double c2 = .13144585576580214704;
2515          const double c3 = .49056261216234406855;          const double c3 = .49056261216234406855;
2516  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel
2517          for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {          {
2518              for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {              vector<double> f_000(numComp);
2519                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {              vector<double> f_001(numComp);
2520                      const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_N0,m_N1));              vector<double> f_010(numComp);
2521                      const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_N0,m_N1));              vector<double> f_011(numComp);
2522                      const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_N0,m_N1));              vector<double> f_100(numComp);
2523                      const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));              vector<double> f_101(numComp);
2524                      const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_N0,m_N1));              vector<double> f_110(numComp);
2525                      const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_N0,m_N1));              vector<double> f_111(numComp);
2526                      const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_N0,m_N1));  #pragma omp for
2527                      const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));              for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2528                      double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE0,m_NE1));                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2529                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2530                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c3 + f_111[i]*c0 + c2*(f_001[i] + f_010[i] + f_100[i]) + c1*(f_011[i] + f_101[i] + f_110[i]);                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2531                          o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_011[i]*c0 + f_100[i]*c3 + c2*(f_000[i] + f_101[i] + f_110[i]) + c1*(f_001[i] + f_010[i] + f_111[i]);                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2532                          o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_010[i]*c3 + f_101[i]*c0 + c2*(f_000[i] + f_011[i] + f_110[i]) + c1*(f_001[i] + f_100[i] + f_111[i]);                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2533                          o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_001[i]*c0 + f_110[i]*c3 + c2*(f_010[i] + f_100[i] + f_111[i]) + c1*(f_000[i] + f_011[i] + f_101[i]);                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2534                          o[INDEX2(i,numComp,4)] = f_001[i]*c3 + f_110[i]*c0 + c2*(f_000[i] + f_011[i] + f_101[i]) + c1*(f_010[i] + f_100[i] + f_111[i]);                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2535                          o[INDEX2(i,numComp,5)] = f_010[i]*c0 + f_101[i]*c3 + c2*(f_001[i] + f_100[i] + f_111[i]) + c1*(f_000[i] + f_011[i] + f_110[i]);                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2536                          o[INDEX2(i,numComp,6)] = f_011[i]*c3 + f_100[i]*c0 + c2*(f_001[i] + f_010[i] + f_111[i]) + c1*(f_000[i] + f_101[i] + f_110[i]);                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2537                          o[INDEX2(i,numComp,7)] = f_000[i]*c0 + f_111[i]*c3 + c2*(f_011[i] + f_101[i] + f_110[i]) + c1*(f_001[i] + f_010[i] + f_100[i]);                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2538                      } /* end of component loop i */                          double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE[0],m_NE[1]));
2539                  } /* end of k0 loop */                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2540              } /* end of k1 loop */                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c3 + f_111[i]*c0 + c2*(f_001[i] + f_010[i] + f_100[i]) + c1*(f_011[i] + f_101[i] + f_110[i]);
2541          } /* end of k2 loop */                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_011[i]*c0 + f_100[i]*c3 + c2*(f_000[i] + f_101[i] + f_110[i]) + c1*(f_001[i] + f_010[i] + f_111[i]);
2542          /* GENERATOR SNIP_INTERPOLATE_ELEMENTS BOTTOM */                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_010[i]*c3 + f_101[i]*c0 + c2*(f_000[i] + f_011[i] + f_110[i]) + c1*(f_001[i] + f_100[i] + f_111[i]);
2543                                o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_001[i]*c0 + f_110[i]*c3 + c2*(f_010[i] + f_100[i] + f_111[i]) + c1*(f_000[i] + f_011[i] + f_101[i]);
2544                                o[INDEX2(i,numComp,4)] = f_001[i]*c3 + f_110[i]*c0 + c2*(f_000[i] + f_011[i] + f_101[i]) + c1*(f_010[i] + f_100[i] + f_111[i]);
2545                                o[INDEX2(i,numComp,5)] = f_010[i]*c0 + f_101[i]*c3 + c2*(f_001[i] + f_100[i] + f_111[i]) + c1*(f_000[i] + f_011[i] + f_110[i]);
2546                                o[INDEX2(i,numComp,6)] = f_011[i]*c3 + f_100[i]*c0 + c2*(f_001[i] + f_010[i] + f_111[i]) + c1*(f_000[i] + f_101[i] + f_110[i]);
2547                                o[INDEX2(i,numComp,7)] = f_000[i]*c0 + f_111[i]*c3 + c2*(f_011[i] + f_101[i] + f_110[i]) + c1*(f_001[i] + f_010[i] + f_100[i]);
2548                            } // end of component loop i
2549                        } // end of k0 loop
2550                    } // end of k1 loop
2551                } // end of k2 loop
2552            } // end of parallel section
2553      }      }
2554  }  }
2555    
# Line 1984  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr Line 2560  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr
2560      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();
2561      if (reduced) {      if (reduced) {
2562          out.requireWrite();          out.requireWrite();
         const double c0 = .25;  
2563  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
2564          {          {
2565              /*** GENERATOR SNIP_INTERPOLATE_REDUCED_FACES TOP */              vector<double> f_000(numComp);
2566                vector<double> f_001(numComp);
2567                vector<double> f_010(numComp);
2568                vector<double> f_011(numComp);
2569                vector<double> f_100(numComp);
2570                vector<double> f_101(numComp);
2571                vector<double> f_110(numComp);
2572                vector<double> f_111(numComp);
2573              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
2574  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2575                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2576                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2577                          const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2578                          const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2579                          const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2580                          const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2581                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
2582                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2583                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_000[i] + f_001[i] + f_010[i] + f_011[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_000[i] + f_001[i] + f_010[i] + f_011[i])/4;
2584                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2585                      } /* end of k1 loop */                      } // end of k1 loop
2586                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
2587              } /* end of face 0 */              } // end of face 0
2588              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
2589  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2590                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2591                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2592                          const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2593                          const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2594                          const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2595                          const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2596                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
2597                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2598                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_100[i] + f_101[i] + f_110[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_100[i] + f_101[i] + f_110[i] + f_111[i])/4;
2599                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2600                      } /* end of k1 loop */                      } // end of k1 loop
2601                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
2602              } /* end of face 1 */              } // end of face 1
2603              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
2604  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2605                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2606                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2607                          const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2608                          const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2609                          const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2610                          const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2611                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
2612                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2613                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_000[i] + f_001[i] + f_100[i] + f_101[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_000[i] + f_001[i] + f_100[i] + f_101[i])/4;
2614                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2615                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
2616                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
2617              } /* end of face 2 */              } // end of face 2
2618              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
2619  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2620                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2621                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2622                          const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2623                          const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2624                          const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2625                          const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2626                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
2627                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2628                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_010[i] + f_011[i] + f_110[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_010[i] + f_011[i] + f_110[i] + f_111[i])/4;
2629                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2630                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
2631                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
2632              } /* end of face 3 */              } // end of face 3
2633              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
2634  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2635                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2636                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2637                          const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2638                          const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2639                          const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2640                          const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2641                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
2642                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2643                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_000[i] + f_010[i] + f_100[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_000[i] + f_010[i] + f_100[i] + f_110[i])/4;
2644                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2645                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
2646                  } /* end of k1 loop */                  } // end of k1 loop
2647              } /* end of face 4 */              } // end of face 4
2648              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
2649  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2650                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2651                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2652                          const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2653                          const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2654                          const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2655                          const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2656                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
2657                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2658                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_001[i] + f_011[i] + f_101[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_001[i] + f_011[i] + f_101[i] + f_111[i])/4;
2659                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2660                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
2661                  } /* end of k1 loop */                  } // end of k1 loop
2662              } /* end of face 5 */              } // end of face 5
             /* GENERATOR SNIP_INTERPOLATE_REDUCED_FACES BOTTOM */  
2663          } // end of parallel section          } // end of parallel section
2664      } else {      } else {
2665          out.requireWrite();          out.requireWrite();
# Line 2087  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr Line 2668  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr
2668          const double c2 = 0.62200846792814621559;          const double c2 = 0.62200846792814621559;
2669  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
2670          {          {
2671              /*** GENERATOR SNIP_INTERPOLATE_FACES TOP */              vector<double> f_000(numComp);
2672                vector<double> f_001(numComp);
2673                vector<double> f_010(numComp);
2674                vector<double> f_011(numComp);
2675                vector<double> f_100(numComp);
2676                vector<double> f_101(numComp);
2677                vector<double> f_110(numComp);
2678                vector<double> f_111(numComp);
2679              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
2680  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2681                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2682                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2683                          const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2684                          const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2685                          const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2686                          const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2687                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
2688                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2689                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c2 + f_011[i]*c0 + c1*(f_001[i] + f_010[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c2 + f_011[i]*c0 + c1*(f_001[i] + f_010[i]);
2690                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_001[i]*c0 + f_010[i]*c2 + c1*(f_000[i] + f_011[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_001[i]*c0 + f_010[i]*c2 + c1*(f_000[i] + f_011[i]);
2691                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_001[i]*c2 + f_010[i]*c0 + c1*(f_000[i] + f_011[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_001[i]*c2 + f_010[i]*c0 + c1*(f_000[i] + f_011[i]);
2692                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_000[i]*c0 + f_011[i]*c2 + c1*(f_001[i] + f_010[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_000[i]*c0 + f_011[i]*c2 + c1*(f_001[i] + f_010[i]);
2693                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2694                      } /* end of k1 loop */                      } // end of k1 loop
2695                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
2696              } /* end of face 0 */              } // end of face 0
2697              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
2698  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2699                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2700                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2701                          const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2702                          const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2703                          const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2704                          const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2705                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
2706                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2707                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_100[i]*c2 + f_111[i]*c0 + c1*(f_101[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_100[i]*c2 + f_111[i]*c0 + c1*(f_101[i] + f_110[i]);
2708                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_101[i]*c0 + f_110[i]*c2 + c1*(f_100[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_101[i]*c0 + f_110[i]*c2 + c1*(f_100[i] + f_111[i]);
2709                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_101[i]*c2 + f_110[i]*c0 + c1*(f_100[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_101[i]*c2 + f_110[i]*c0 + c1*(f_100[i] + f_111[i]);
2710                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_100[i]*c0 + f_111[i]*c2 + c1*(f_101[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_100[i]*c0 + f_111[i]*c2 + c1*(f_101[i] + f_110[i]);
2711                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2712                      } /* end of k1 loop */                      } // end of k1 loop
2713                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
2714              } /* end of face 1 */              } // end of face 1
2715              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
2716  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2717                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2718                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2719                          const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2720                          const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2721                          const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2722                          const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2723                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
2724                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2725                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c2 + f_101[i]*c0 + c1*(f_001[i] + f_100[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c2 + f_101[i]*c0 + c1*(f_001[i] + f_100[i]);
2726                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_001[i]*c0 + f_100[i]*c2 + c1*(f_000[i] + f_101[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_001[i]*c0 + f_100[i]*c2 + c1*(f_000[i] + f_101[i]);
2727                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_001[i]*c2 + f_100[i]*c0 + c1*(f_000[i] + f_101[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_001[i]*c2 + f_100[i]*c0 + c1*(f_000[i] + f_101[i]);
2728                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_000[i]*c0 + f_101[i]*c2 + c1*(f_001[i] + f_100[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_000[i]*c0 + f_101[i]*c2 + c1*(f_001[i] + f_100[i]);
2729                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2730                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
2731                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
2732              } /* end of face 2 */              } // end of face 2
2733              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
2734  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2735                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2736                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2737                          const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2738                          const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2739                          const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2740                          const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2741                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
2742                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2743                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_010[i]*c2 + f_111[i]*c0 + c1*(f_011[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_010[i]*c2 + f_111[i]*c0 + c1*(f_011[i] + f_110[i]);
2744                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_011[i]*c0 + f_110[i]*c2 + c1*(f_010[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_011[i]*c0 + f_110[i]*c2 + c1*(f_010[i] + f_111[i]);
2745                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_011[i]*c2 + f_110[i]*c0 + c1*(f_010[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_011[i]*c2 + f_110[i]*c0 + c1*(f_010[i] + f_111[i]);
2746                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_010[i]*c0 + f_111[i]*c2 + c1*(f_011[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_010[i]*c0 + f_111[i]*c2 + c1*(f_011[i] + f_110[i]);
2747                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2748                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
2749                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
2750              } /* end of face 3 */              } // end of face 3
2751              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
2752  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2753                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2754                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2755                          const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2756                          const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2757                          const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2758                          const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2759                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
2760                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2761                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c2 + f_110[i]*c0 + c1*(f_010[i] + f_100[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c2 + f_110[i]*c0 + c1*(f_010[i] + f_100[i]);
2762                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_010[i]*c0 + f_100[i]*c2 + c1*(f_000[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_010[i]*c0 + f_100[i]*c2 + c1*(f_000[i] + f_110[i]);
2763                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_010[i]*c2 + f_100[i]*c0 + c1*(f_000[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_010[i]*c2 + f_100[i]*c0 + c1*(f_000[i] + f_110[i]);
2764                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_000[i]*c0 + f_110[i]*c2 + c1*(f_010[i] + f_100[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_000[i]*c0 + f_110[i]*c2 + c1*(f_010[i] + f_100[i]);
2765                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2766                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
2767                  } /* end of k1 loop */                  } // end of k1 loop
2768              } /* end of face 4 */              } // end of face 4
2769              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
2770  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2771                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2772                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2773                          const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2774                          const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2775                          const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2776                          const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2777                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
2778                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2779                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_001[i]*c2 + f_111[i]*c0 + c1*(f_011[i] + f_101[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_001[i]*c2 + f_111[i]*c0 + c1*(f_011[i] + f_101[i]);
2780                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_011[i]*c0 + f_101[i]*c2 + c1*(f_001[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_011[i]*c0 + f_101[i]*c2 + c1*(f_001[i] + f_111[i]);
2781                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_011[i]*c2 + f_101[i]*c0 + c1*(f_001[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_011[i]*c2 + f_101[i]*c0 + c1*(f_001[i] + f_111[i]);
2782                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_001[i]*c0 + f_111[i]*c2 + c1*(f_011[i] + f_101[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_001[i]*c0 + f_111[i]*c2 + c1*(f_011[i] + f_101[i]);
2783                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2784                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
2785                  } /* end of k1 loop */                  } // end of k1 loop
2786              } /* end of face 5 */              } // end of face 5
             /* GENERATOR SNIP_INTERPOLATE_FACES BOTTOM */  
2787          } // end of parallel section          } // end of parallel section
2788      }      }
2789  }  }
# Line 2205  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr Line 2792  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr
2792  void Brick::assemblePDESingle(Paso_SystemMatrix* mat, escript::Data& rhs,  void Brick::assemblePDESingle(Paso_SystemMatrix* mat, escript::Data& rhs,
2793          const escript::Data& A, const escript::Data& B,          const escript::Data& A, const escript::Data& B,
2794          const escript::Data& C, const escript::Data& D,          const escript::Data& C, const escript::Data& D,
2795          const escript::Data& X, const escript::Data& Y,          const escript::Data& X, const escript::Data& Y) const
         const escript::Data& d, const escript::Data& y) const  
2796  {  {
2797      const double h0 = m_l0/m_gNE0;      /* GENERATOR SNIP_PDE_SINGLE_PRE TOP */
2798      const double h1 = m_l1/m_gNE1;      const double w0 = 0.00093037914038584273081*m_dx[1]*m_dx[2]/m_dx[0];
2799      const double h2 = m_l2/m_gNE2;      const double w1 = 0.00093037914038584273081*m_dx[2];
2800      /*** GENERATOR SNIP_PDE_SINGLE_PRE TOP */      const double w2 = -0.000249294339321148701*m_dx[1];
2801      const double w0 = 0.0009303791403858427308*h1*h2/h0;      const double w3 = 0.00093037914038584273081*m_dx[0]*m_dx[2]/m_dx[1];
2802      const double w1 = 0.0009303791403858427308*h2;      const double w4 = -0.000249294339321148701*m_dx[0];
2803      const double w10 = 0.012958509748503046158*h0*h2/h1;      const double w5 = 0.00093037914038584273081*m_dx[1];
2804      const double w100 = 0.038141762351741127649*h0*h1;      const double w6 = 0.00093037914038584273081*m_dx[0];
2805      const double w101 = 0.000052682092703316795705*h0*h1;      const double w7 = -0.000249294339321148701*m_dx[0]*m_dx[1]/m_dx[2];
2806      const double w102 = 0.0007337668937680108255*h0*h1;      const double w8 = 0.0034722222222222222222*m_dx[2];
2807      const double w103 = 0.010220054420048834761*h0*h1;      const double w9 = 0.012958509748503046158*m_dx[0]*m_dx[2]/m_dx[1];
2808      const double w104 = -0.0001966122466178319053*h1*h2;      const double w10 = -0.0034722222222222222222*m_dx[0];
2809      const double w105 = -0.0001966122466178319053*h0*h2;      const double w11 = 0.0034722222222222222222*m_dx[1];
2810      const double w106 = -0.0007337668937680108255*h1*h2;      const double w12 = 0.012958509748503046158*m_dx[0];
2811      const double w107 = -0.0007337668937680108255*h0*h2;      const double w13 = -0.0034722222222222222222*m_dx[0]*m_dx[1]/m_dx[2];
2812      const double w108 = -0.0027384553284542113967*h1*h2;      const double w14 = 0.012958509748503046158*m_dx[1]*m_dx[2]/m_dx[0];
2813      const double w109 = -0.0027384553284542113967*h0*h2;      const double w15 = 0.012958509748503046158*m_dx[1];
2814      const double w11 = -0.0034722222222222222222*h0;      const double w16 = 0.012958509748503046158*m_dx[2];
2815      const double w110 = -0.010220054420048834761*h1*h2;      const double w17 = 0.04836181677178996241*m_dx[1];
2816      const double w111 = -0.010220054420048834761*h0*h2;      const double w18 = 0.04836181677178996241*m_dx[0];
2817      const double w112 = -0.0007337668937680108255*h0*h1;      const double w19 = -0.04836181677178996241*m_dx[0]*m_dx[1]/m_dx[2];
2818      const double w113 = -0.010220054420048834761*h0*h1;      const double w20 = -0.000249294339321148701*m_dx[2];
2819      const double w114 = -0.038141762351741127649*h0*h2;      const double w21 = -0.04836181677178996241*m_dx[2];
2820      const double w115 = -0.000052682092703316795705*h0*h2;      const double w22 = -0.0034722222222222222222*m_dx[0]*m_dx[2]/m_dx[1];
2821      const double w116 = -0.0001966122466178319053*h0*h1;      const double w23 = 0.00093037914038584273081*m_dx[0]*m_dx[1]/m_dx[2];
2822      const double w117 = -0.0027384553284542113967*h0*h1;      const double w24 = -0.04836181677178996241*m_dx[0]*m_dx[2]/m_dx[1];
2823      const double w118 = 0.000052682092703316795705*h0*h2;      const double w25 = 0.012958509748503046158*m_dx[0]*m_dx[1]/m_dx[2];
2824      const double w119 = 0.038141762351741127649*h0*h2;      const double w26 = -0.000249294339321148701*m_dx[0]*m_dx[2]/m_dx[1];
2825      const double w12 = 0.0034722222222222222222*h1;      const double w27 = -0.0034722222222222222222*m_dx[1]*m_dx[2]/m_dx[0];
2826      const double w120 = 0.000052682092703316795705*h1*h2;      const double w28 = -0.000249294339321148701*m_dx[1]*m_dx[2]/m_dx[0];
2827      const double w121 = 0.038141762351741127649*h1*h2;      const double w29 = -0.04836181677178996241*m_dx[1]*m_dx[2]/m_dx[0];
2828      const double w122 = -0.000052682092703316795705*h0*h1;      const double w30 = 0.0001966122466178319053*m_dx[1]*m_dx[2];
2829      const double w123 = -0.038141762351741127649*h0*h1;      const double w31 = 0.0001966122466178319053*m_dx[0]*m_dx[2];
2830      const double w124 = -0.000052682092703316795705*h1*h2;      const double w32 = 0.0001966122466178319053*m_dx[0]*m_dx[1];
2831      const double w125 = -0.038141762351741127649*h1*h2;      const double w33 = 0.0007337668937680108255*m_dx[1]*m_dx[2];
2832      const double w126 = 0.027777777777777777778*h1*h2;      const double w34 = 0.0027384553284542113967*m_dx[0]*m_dx[2];
2833      const double w127 = 0.027777777777777777778*h0*h2;      const double w35 = 0.0027384553284542113967*m_dx[0]*m_dx[1];
2834      const double w128 = 0.055555555555555555556*h0*h1;      const double w36 = 0.0027384553284542113967*m_dx[1]*m_dx[2];
2835      const double w129 = -0.027777777777777777778*h1*h2;      const double w37 = 0.0007337668937680108255*m_dx[0]*m_dx[2];
2836      const double w13 = 0.012958509748503046158*h0;      const double w38 = 0.010220054420048834761*m_dx[1]*m_dx[2];
2837      const double w130 = -0.027777777777777777778*h0*h2;      const double w39 = 0.010220054420048834761*m_dx[0]*m_dx[2];
2838      const double w131 = 0.013888888888888888889*h0*h1;      const double w40 = 0.038141762351741127649*m_dx[0]*m_dx[1];
2839      const double w132 = -0.055555555555555555556*h0*h2;      const double w41 = 0.000052682092703316795698*m_dx[0]*m_dx[1];
2840      const double w133 = -0.027777777777777777778*h0*h1;      const double w42 = 0.0007337668937680108255*m_dx[0]*m_dx[1];
2841      const double w134 = 0.055555555555555555556*h0*h2;      const double w43 = 0.010220054420048834761*m_dx[0]*m_dx[1];
2842      const double w135 = 0.027777777777777777778*h0*h1;      const double w44 = -0.038141762351741127649*m_dx[0]*m_dx[2];