/[escript]/branches/diaplayground/ripley/src/Brick.cpp
ViewVC logotype

Diff of /branches/diaplayground/ripley/src/Brick.cpp

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

revision 4013 by caltinay, Thu Oct 4 03:13:27 2012 UTC revision 4377 by caltinay, Tue Apr 23 05:30:02 2013 UTC
# Line 1  Line 1 
1    
2  /*****************************************************************************  /*****************************************************************************
3  *  *
4  * Copyright (c) 2003-2012 by University of Queensland  * Copyright (c) 2003-2013 by University of Queensland
5  * http://www.uq.edu.au  * http://www.uq.edu.au
6  *  *
7  * Primary Business: Queensland, Australia  * Primary Business: Queensland, Australia
# Line 14  Line 14 
14  *****************************************************************************/  *****************************************************************************/
15    
16  #include <ripley/Brick.h>  #include <ripley/Brick.h>
 extern "C" {  
17  #include <paso/SystemMatrix.h>  #include <paso/SystemMatrix.h>
18  }  #include <esysUtils/esysFileWriter.h>
19    
20  #ifdef USE_NETCDF  #ifdef USE_NETCDF
21  #include <netcdfcpp.h>  #include <netcdfcpp.h>
# Line 32  extern "C" { Line 31  extern "C" {
31  #include <iomanip>  #include <iomanip>
32    
33  using namespace std;  using namespace std;
34    using esysUtils::FileWriter;
35    
36  namespace ripley {  namespace ripley {
37    
38  Brick::Brick(int n0, int n1, int n2, double x0, double y0, double z0,  Brick::Brick(int n0, int n1, int n2, double x0, double y0, double z0,
39               double x1, double y1, double z1, int d0, int d1, int d2) :               double x1, double y1, double z1, int d0, int d1, int d2) :
40      RipleyDomain(3),      RipleyDomain(3)
     m_x0(x0),  
     m_y0(y0),  
     m_z0(z0),  
     m_l0(x1-x0),  
     m_l1(y1-y0),  
     m_l2(z1-z0)  
41  {  {
42      // ignore subdivision parameters for serial run      // ignore subdivision parameters for serial run
43      if (m_mpiInfo->size == 1) {      if (m_mpiInfo->size == 1) {
# Line 137  Brick::Brick(int n0, int n1, int n2, dou Line 131  Brick::Brick(int n0, int n1, int n2, dou
131          d2=m_mpiInfo->size/(d0*d1);          d2=m_mpiInfo->size/(d0*d1);
132      }      }
133    
     m_NX=d0;  
     m_NY=d1;  
     m_NZ=d2;  
   
134      // ensure number of subdivisions is valid and nodes can be distributed      // ensure number of subdivisions is valid and nodes can be distributed
135      // among number of ranks      // among number of ranks
136      if (m_NX*m_NY*m_NZ != m_mpiInfo->size)      if (d0*d1*d2 != m_mpiInfo->size)
137          throw RipleyException("Invalid number of spatial subdivisions");          throw RipleyException("Invalid number of spatial subdivisions");
138    
139      if (warn) {      if (warn) {
# Line 151  Brick::Brick(int n0, int n1, int n2, dou Line 141  Brick::Brick(int n0, int n1, int n2, dou
141              << d1 << ", d2=" << d2 << "). This may not be optimal!" << endl;              << d1 << ", d2=" << d2 << "). This may not be optimal!" << endl;
142      }      }
143    
144      if ((n0+1)%m_NX > 0) {      double l0 = x1-x0;
145          double Dx=m_l0/n0;      double l1 = y1-y0;
146        double l2 = z1-z0;
147        m_dx[0] = l0/n0;
148        m_dx[1] = l1/n1;
149        m_dx[2] = l2/n2;
150    
151        if ((n0+1)%d0 > 0) {
152          n0=(int)round((float)(n0+1)/d0+0.5)*d0-1;          n0=(int)round((float)(n0+1)/d0+0.5)*d0-1;
153          m_l0=Dx*n0;          l0=m_dx[0]*n0;
154          cout << "Warning: Adjusted number of elements and length. N0="          cout << "Warning: Adjusted number of elements and length. N0="
155              << n0 << ", l0=" << m_l0 << endl;              << n0 << ", l0=" << l0 << endl;
156      }      }
157      if ((n1+1)%m_NY > 0) {      if ((n1+1)%d1 > 0) {
         double Dy=m_l1/n1;  
158          n1=(int)round((float)(n1+1)/d1+0.5)*d1-1;          n1=(int)round((float)(n1+1)/d1+0.5)*d1-1;
159          m_l1=Dy*n1;          l1=m_dx[1]*n1;
160          cout << "Warning: Adjusted number of elements and length. N1="          cout << "Warning: Adjusted number of elements and length. N1="
161              << n1 << ", l1=" << m_l1 << endl;              << n1 << ", l1=" << l1 << endl;
162      }      }
163      if ((n2+1)%m_NZ > 0) {      if ((n2+1)%d2 > 0) {
         double Dz=m_l2/n2;  
164          n2=(int)round((float)(n2+1)/d2+0.5)*d2-1;          n2=(int)round((float)(n2+1)/d2+0.5)*d2-1;
165          m_l2=Dz*n2;          l2=m_dx[2]*n2;
166          cout << "Warning: Adjusted number of elements and length. N2="          cout << "Warning: Adjusted number of elements and length. N2="
167              << n2 << ", l2=" << m_l2 << endl;              << n2 << ", l2=" << l2 << endl;
168      }      }
169    
170      m_gNE0=n0;      if ((d0 > 1 && (n0+1)/d0<2) || (d1 > 1 && (n1+1)/d1<2) || (d2 > 1 && (n2+1)/d2<2))
     m_gNE1=n1;  
     m_gNE2=n2;  
   
     if ((m_NX > 1 && (n0+1)/m_NX<2) || (m_NY > 1 && (n1+1)/m_NY<2) || (m_NZ > 1 && (n2+1)/m_NZ<2))  
171          throw RipleyException("Too few elements for the number of ranks");          throw RipleyException("Too few elements for the number of ranks");
172    
173        m_gNE[0] = n0;
174        m_gNE[1] = n1;
175        m_gNE[2] = n2;
176        m_origin[0] = x0;
177        m_origin[1] = y0;
178        m_origin[2] = z0;
179        m_length[0] = l0;
180        m_length[1] = l1;
181        m_length[2] = l2;
182        m_NX[0] = d0;
183        m_NX[1] = d1;
184        m_NX[2] = d2;
185    
186      // local number of elements (including overlap)      // local number of elements (including overlap)
187      m_NE0 = m_ownNE0 = (m_NX>1 ? (n0+1)/m_NX : n0);      m_NE[0] = m_ownNE[0] = (d0>1 ? (n0+1)/d0 : n0);
188      if (m_mpiInfo->rank%m_NX>0 && m_mpiInfo->rank%m_NX<m_NX-1)      if (m_mpiInfo->rank%d0>0 && m_mpiInfo->rank%d0<d0-1)
189          m_NE0++;          m_NE[0]++;
190      else if (m_NX>1 && m_mpiInfo->rank%m_NX==m_NX-1)      else if (d0>1 && m_mpiInfo->rank%d0==d0-1)
191          m_ownNE0--;          m_ownNE[0]--;
192    
193      m_NE1 = m_ownNE1 = (m_NY>1 ? (n1+1)/m_NY : n1);      m_NE[1] = m_ownNE[1] = (d1>1 ? (n1+1)/d1 : n1);
194      if (m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX>0 && m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX<m_NY-1)      if (m_mpiInfo->rank%(d0*d1)/d0>0 && m_mpiInfo->rank%(d0*d1)/d0<d1-1)
195          m_NE1++;          m_NE[1]++;
196      else if (m_NY>1 && m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX==m_NY-1)      else if (d1>1 && m_mpiInfo->rank%(d0*d1)/d0==d1-1)
197          m_ownNE1--;          m_ownNE[1]--;
198    
199      m_NE2 = m_ownNE2 = (m_NZ>1 ? (n2+1)/m_NZ : n2);      m_NE[2] = m_ownNE[2] = (d2>1 ? (n2+1)/d2 : n2);
200      if (m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY)>0 && m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY)<m_NZ-1)      if (m_mpiInfo->rank/(d0*d1)>0 && m_mpiInfo->rank/(d0*d1)<d2-1)
201          m_NE2++;          m_NE[2]++;
202      else if (m_NZ>1 && m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY)==m_NZ-1)      else if (d2>1 && m_mpiInfo->rank/(d0*d1)==d2-1)
203          m_ownNE2--;          m_ownNE[2]--;
204    
205      // local number of nodes      // local number of nodes
206      m_N0 = m_NE0+1;      m_NN[0] = m_NE[0]+1;
207      m_N1 = m_NE1+1;      m_NN[1] = m_NE[1]+1;
208      m_N2 = m_NE2+1;      m_NN[2] = m_NE[2]+1;
209    
210      // bottom-left-front node is at (offset0,offset1,offset2) in global mesh      // bottom-left-front node is at (offset0,offset1,offset2) in global mesh
211      m_offset0 = (n0+1)/m_NX*(m_mpiInfo->rank%m_NX);      m_offset[0] = (n0+1)/d0*(m_mpiInfo->rank%d0);
212      if (m_offset0 > 0)      if (m_offset[0] > 0)
213          m_offset0--;          m_offset[0]--;
214      m_offset1 = (n1+1)/m_NY*(m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX);      m_offset[1] = (n1+1)/d1*(m_mpiInfo->rank%(d0*d1)/d0);
215      if (m_offset1 > 0)      if (m_offset[1] > 0)
216          m_offset1--;          m_offset[1]--;
217      m_offset2 = (n2+1)/m_NZ*(m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY));      m_offset[2] = (n2+1)/d2*(m_mpiInfo->rank/(d0*d1));
218      if (m_offset2 > 0)      if (m_offset[2] > 0)
219          m_offset2--;          m_offset[2]--;
220    
221      populateSampleIds();      populateSampleIds();
222      createPattern();      createPattern();
# Line 236  bool Brick::operator==(const AbstractDom Line 239  bool Brick::operator==(const AbstractDom
239      const Brick* o=dynamic_cast<const Brick*>(&other);      const Brick* o=dynamic_cast<const Brick*>(&other);
240      if (o) {      if (o) {
241          return (RipleyDomain::operator==(other) &&          return (RipleyDomain::operator==(other) &&
242                  m_gNE0==o->m_gNE0 && m_gNE1==o->m_gNE1 && m_gNE2==o->m_gNE2                  m_gNE[0]==o->m_gNE[0] && m_gNE[1]==o->m_gNE[1] && m_gNE[2]==o->m_gNE[2]
243                  && m_x0==o->m_x0 && m_y0==o->m_y0 && m_z0==o->m_z0                  && m_origin[0]==o->m_origin[0] && m_origin[1]==o->m_origin[1] && m_origin[2]==o->m_origin[2]
244                  && m_l0==o->m_l0 && m_l1==o->m_l1 && m_l2==o->m_l2                  && m_length[0]==o->m_length[0] && m_length[1]==o->m_length[1] && m_length[2]==o->m_length[2]
245                  && m_NX==o->m_NX && m_NY==o->m_NY && m_NZ==o->m_NZ);                  && m_NX[0]==o->m_NX[0] && m_NX[1]==o->m_NX[1] && m_NX[2]==o->m_NX[2]);
246      }      }
247    
248      return false;      return false;
249  }  }
250    
 void Brick::readBinaryGrid(escript::Data& out, string filename,  
                            const vector<int>& first,  
                            const vector<int>& numValues) const  
 {  
     // check destination function space  
     int myN0, myN1, myN2;  
     if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Nodes) {  
         myN0 = m_N0;  
         myN1 = m_N1;  
         myN2 = m_N2;  
     } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements ||  
                 out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {  
         myN0 = m_NE0;  
         myN1 = m_NE1;  
         myN2 = m_NE2;  
     } else  
         throw RipleyException("readBinaryGrid(): invalid function space for output data object");  
   
     // check file existence and size  
     ifstream f(filename.c_str(), ifstream::binary);  
     if (f.fail()) {  
         throw RipleyException("readBinaryGrid(): cannot open file");  
     }  
     f.seekg(0, ios::end);  
     const int numComp = out.getDataPointSize();  
     const int filesize = f.tellg();  
     const int reqsize = numValues[0]*numValues[1]*numValues[2]*numComp*sizeof(float);  
     if (filesize < reqsize) {  
         f.close();  
         throw RipleyException("readBinaryGrid(): not enough data in file");  
     }  
   
     // check if this rank contributes anything  
     if (first[0] >= m_offset0+myN0 || first[0]+numValues[0] <= m_offset0 ||  
             first[1] >= m_offset1+myN1 || first[1]+numValues[1] <= m_offset1 ||  
             first[2] >= m_offset2+myN2 || first[2]+numValues[2] <= m_offset2) {  
         f.close();  
         return;  
     }  
   
     // now determine how much this rank has to write  
   
     // first coordinates in data object to write to  
     const int first0 = max(0, first[0]-m_offset0);  
     const int first1 = max(0, first[1]-m_offset1);  
     const int first2 = max(0, first[2]-m_offset2);  
     // indices to first value in file  
     const int idx0 = max(0, m_offset0-first[0]);  
     const int idx1 = max(0, m_offset1-first[1]);  
     const int idx2 = max(0, m_offset2-first[2]);  
     // number of values to write  
     const int num0 = min(numValues[0]-idx0, myN0-first0);  
     const int num1 = min(numValues[1]-idx1, myN1-first1);  
     const int num2 = min(numValues[2]-idx2, myN2-first2);  
   
     out.requireWrite();  
     vector<float> values(num0*numComp);  
     const int dpp = out.getNumDataPointsPerSample();  
   
     for (index_t z=0; z<num2; z++) {  
         for (index_t y=0; y<num1; y++) {  
             const int fileofs = numComp*(idx0+(idx1+y)*numValues[0]+(idx2+z)*numValues[0]*numValues[1]);  
             f.seekg(fileofs*sizeof(float));  
             f.read((char*)&values[0], num0*numComp*sizeof(float));  
             const int dataIndex = first0+(first1+y)*myN0+(first2+z)*myN0*myN1;  
   
             for (index_t x=0; x<num0; x++) {  
                 double* dest = out.getSampleDataRW(dataIndex+x);  
                 for (index_t c=0; c<numComp; c++) {  
                     for (index_t q=0; q<dpp; q++) {  
                         *dest++ = static_cast<double>(values[x*numComp+c]);  
                     }  
                 }  
             }  
         }  
     }  
   
     f.close();  
 }  
   
251  void Brick::readNcGrid(escript::Data& out, string filename, string varname,  void Brick::readNcGrid(escript::Data& out, string filename, string varname,
252              const vector<int>& first, const vector<int>& numValues) const              const vector<int>& first, const vector<int>& numValues,
253                const vector<int>& multiplier) const
254  {  {
255  #ifdef USE_NETCDF  #ifdef USE_NETCDF
256      // check destination function space      // check destination function space
257      int myN0, myN1, myN2;      int myN0, myN1, myN2;
258      if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Nodes) {      if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Nodes) {
259          myN0 = m_N0;          myN0 = m_NN[0];
260          myN1 = m_N1;          myN1 = m_NN[1];
261          myN2 = m_N2;          myN2 = m_NN[2];
262      } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements ||      } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements ||
263                  out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {                  out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
264          myN0 = m_NE0;          myN0 = m_NE[0];
265          myN1 = m_NE1;          myN1 = m_NE[1];
266          myN2 = m_NE2;          myN2 = m_NE[2];
267      } else      } else
268          throw RipleyException("readNcGrid(): invalid function space for output data object");          throw RipleyException("readNcGrid(): invalid function space for output data object");
269    
# Line 349  void Brick::readNcGrid(escript::Data& ou Line 273  void Brick::readNcGrid(escript::Data& ou
273      if (numValues.size() != 3)      if (numValues.size() != 3)
274          throw RipleyException("readNcGrid(): argument 'numValues' must have 3 entries");          throw RipleyException("readNcGrid(): argument 'numValues' must have 3 entries");
275    
276        if (multiplier.size() != 3)
277            throw RipleyException("readNcGrid(): argument 'multiplier' must have 3 entries");
278        for (size_t i=0; i<multiplier.size(); i++)
279            if (multiplier[i]<1)
280                throw RipleyException("readNcGrid(): all multipliers must be positive");
281    
282      // check file existence and size      // check file existence and size
283      NcFile f(filename.c_str(), NcFile::ReadOnly);      NcFile f(filename.c_str(), NcFile::ReadOnly);
284      if (!f.is_valid())      if (!f.is_valid())
# Line 376  void Brick::readNcGrid(escript::Data& ou Line 306  void Brick::readNcGrid(escript::Data& ou
306      }      }
307    
308      // check if this rank contributes anything      // check if this rank contributes anything
309      if (first[0] >= m_offset0+myN0 || first[0]+numValues[0] <= m_offset0 ||      if (first[0] >= m_offset[0]+myN0 || first[0]+numValues[0]*multiplier[0] <= m_offset[0] ||
310              first[1] >= m_offset1+myN1 || first[1]+numValues[1] <= m_offset1 ||              first[1] >= m_offset[1]+myN1 || first[1]+numValues[1]*multiplier[1] <= m_offset[1] ||
311              first[2] >= m_offset2+myN2 || first[2]+numValues[2] <= m_offset2) {              first[2] >= m_offset[2]+myN2 || first[2]+numValues[2]*multiplier[2] <= m_offset[2]) {
312          return;          return;
313      }      }
314    
315      // now determine how much this rank has to write      // now determine how much this rank has to write
316    
317      // first coordinates in data object to write to      // first coordinates in data object to write to
318      const int first0 = max(0, first[0]-m_offset0);      const int first0 = max(0, first[0]-m_offset[0]);
319      const int first1 = max(0, first[1]-m_offset1);      const int first1 = max(0, first[1]-m_offset[1]);
320      const int first2 = max(0, first[2]-m_offset2);      const int first2 = max(0, first[2]-m_offset[2]);
321      // indices to first value in file      // indices to first value in file
322      const int idx0 = max(0, m_offset0-first[0]);      const int idx0 = max(0, m_offset[0]-first[0]);
323      const int idx1 = max(0, m_offset1-first[1]);      const int idx1 = max(0, m_offset[1]-first[1]);
324      const int idx2 = max(0, m_offset2-first[2]);      const int idx2 = max(0, m_offset[2]-first[2]);
325      // number of values to write      // number of values to read
326      const int num0 = min(numValues[0]-idx0, myN0-first0);      const int num0 = min(numValues[0]-idx0, myN0-first0);
327      const int num1 = min(numValues[1]-idx1, myN1-first1);      const int num1 = min(numValues[1]-idx1, myN1-first1);
328      const int num2 = min(numValues[2]-idx2, myN2-first2);      const int num2 = min(numValues[2]-idx2, myN2-first2);
# Line 416  void Brick::readNcGrid(escript::Data& ou Line 346  void Brick::readNcGrid(escript::Data& ou
346          for (index_t y=0; y<num1; y++) {          for (index_t y=0; y<num1; y++) {
347  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel for
348              for (index_t x=0; x<num0; x++) {              for (index_t x=0; x<num0; x++) {
349                  const int dataIndex = first0+(first1+y)*myN0+(first2+z)*myN0*myN1+x;                  const int baseIndex = first0+x*multiplier[0]
350                                            +(first1+y*multiplier[1])*myN0
351                                            +(first2+z*multiplier[2])*myN0*myN1;
352                  const int srcIndex=z*num1*num0+y*num0+x;                  const int srcIndex=z*num1*num0+y*num0+x;
353                  double* dest = out.getSampleDataRW(dataIndex);                  if (!isnan(values[srcIndex])) {
354                  for (index_t q=0; q<dpp; q++) {                      for (index_t m2=0; m2<multiplier[2]; m2++) {
355                      *dest++ = values[srcIndex];                          for (index_t m1=0; m1<multiplier[1]; m1++) {
356                                for (index_t m0=0; m0<multiplier[0]; m0++) {
357                                    const int dataIndex = baseIndex+m0
358                                                   +m1*myN0
359                                                   +m2*myN0*myN1;
360                                    double* dest = out.getSampleDataRW(dataIndex);
361                                    for (index_t q=0; q<dpp; q++) {
362                                        *dest++ = values[srcIndex];
363                                    }
364                                }
365                            }
366                        }
367                  }                  }
368              }              }
369          }          }
# Line 430  void Brick::readNcGrid(escript::Data& ou Line 373  void Brick::readNcGrid(escript::Data& ou
373  #endif  #endif
374  }  }
375    
376    void Brick::readBinaryGrid(escript::Data& out, string filename,
377                               const vector<int>& first,
378                               const vector<int>& numValues,
379                               const vector<int>& multiplier) const
380    {
381        // check destination function space
382        int myN0, myN1, myN2;
383        if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Nodes) {
384            myN0 = m_NN[0];
385            myN1 = m_NN[1];
386            myN2 = m_NN[2];
387        } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements ||
388                    out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
389            myN0 = m_NE[0];
390            myN1 = m_NE[1];
391            myN2 = m_NE[2];
392        } else
393            throw RipleyException("readBinaryGrid(): invalid function space for output data object");
394    
395        if (first.size() != 3)
396            throw RipleyException("readBinaryGrid(): argument 'first' must have 3 entries");
397    
398        if (numValues.size() != 3)
399            throw RipleyException("readBinaryGrid(): argument 'numValues' must have 3 entries");
400    
401        if (multiplier.size() != 3)
402            throw RipleyException("readBinaryGrid(): argument 'multiplier' must have 3 entries");
403        for (size_t i=0; i<multiplier.size(); i++)
404            if (multiplier[i]<1)
405                throw RipleyException("readBinaryGrid(): all multipliers must be positive");
406    
407        // check file existence and size
408        ifstream f(filename.c_str(), ifstream::binary);
409        if (f.fail()) {
410            throw RipleyException("readBinaryGrid(): cannot open file");
411        }
412        f.seekg(0, ios::end);
413        const int numComp = out.getDataPointSize();
414        const int filesize = f.tellg();
415        const int reqsize = numValues[0]*numValues[1]*numValues[2]*numComp*sizeof(float);
416        if (filesize < reqsize) {
417            f.close();
418            throw RipleyException("readBinaryGrid(): not enough data in file");
419        }
420    
421        // check if this rank contributes anything
422        if (first[0] >= m_offset[0]+myN0 || first[0]+numValues[0]*multiplier[0] <= m_offset[0] ||
423                first[1] >= m_offset[1]+myN1 || first[1]+numValues[1]*multiplier[1] <= m_offset[1] ||
424                first[2] >= m_offset[2]+myN2 || first[2]+numValues[2]*multiplier[2] <= m_offset[2]) {
425            f.close();
426            return;
427        }
428    
429        // now determine how much this rank has to write
430    
431        // first coordinates in data object to write to
432        const int first0 = max(0, first[0]-m_offset[0]);
433        const int first1 = max(0, first[1]-m_offset[1]);
434        const int first2 = max(0, first[2]-m_offset[2]);
435        // indices to first value in file
436        const int idx0 = max(0, m_offset[0]-first[0]);
437        const int idx1 = max(0, m_offset[1]-first[1]);
438        const int idx2 = max(0, m_offset[2]-first[2]);
439        // number of values to read
440        const int num0 = min(numValues[0]-idx0, myN0-first0);
441        const int num1 = min(numValues[1]-idx1, myN1-first1);
442        const int num2 = min(numValues[2]-idx2, myN2-first2);
443    
444        out.requireWrite();
445        vector<float> values(num0*numComp);
446        const int dpp = out.getNumDataPointsPerSample();
447    
448        for (index_t z=0; z<num2; z++) {
449            for (index_t y=0; y<num1; y++) {
450                const int fileofs = numComp*(idx0+(idx1+y)*numValues[0]+(idx2+z)*numValues[0]*numValues[1]);
451                f.seekg(fileofs*sizeof(float));
452                f.read((char*)&values[0], num0*numComp*sizeof(float));
453    
454                for (index_t x=0; x<num0; x++) {
455                    const int baseIndex = first0+x*multiplier[0]
456                                            +(first1+y*multiplier[1])*myN0
457                                            +(first2+z*multiplier[2])*myN0*myN1;
458                    for (index_t m2=0; m2<multiplier[2]; m2++) {
459                        for (index_t m1=0; m1<multiplier[1]; m1++) {
460                            for (index_t m0=0; m0<multiplier[0]; m0++) {
461                                const int dataIndex = baseIndex+m0
462                                               +m1*myN0
463                                               +m2*myN0*myN1;
464                                double* dest = out.getSampleDataRW(dataIndex);
465                                for (index_t c=0; c<numComp; c++) {
466                                    if (!std::isnan(values[x*numComp+c])) {
467                                        for (index_t q=0; q<dpp; q++) {
468                                            *dest++ = static_cast<double>(values[x*numComp+c]);
469                                        }
470                                    }
471                                }
472                            }
473                        }
474                    }
475                }
476            }
477        }
478    
479        f.close();
480    }
481    
482    void Brick::writeBinaryGrid(const escript::Data& in, string filename,
483                                int byteOrder, int dataType) const
484    {
485        // the mapping is not universally correct but should work on our
486        // supported platforms
487        switch (dataType) {
488            case DATATYPE_INT32:
489                writeBinaryGridImpl<int>(in, filename, byteOrder);
490                break;
491            case DATATYPE_FLOAT32:
492                writeBinaryGridImpl<float>(in, filename, byteOrder);
493                break;
494            case DATATYPE_FLOAT64:
495                writeBinaryGridImpl<double>(in, filename, byteOrder);
496                break;
497            default:
498                throw RipleyException("writeBinaryGrid(): invalid or unsupported datatype");
499        }
500    }
501    
502    template<typename ValueType>
503    void Brick::writeBinaryGridImpl(const escript::Data& in,
504                                    const string& filename, int byteOrder) const
505    {
506        // check function space and determine number of points
507        int myN0, myN1, myN2;
508        int totalN0, totalN1, totalN2;
509        if (in.getFunctionSpace().getTypeCode() == Nodes) {
510            myN0 = m_NN[0];
511            myN1 = m_NN[1];
512            myN2 = m_NN[2];
513            totalN0 = m_gNE[0]+1;
514            totalN1 = m_gNE[1]+1;
515            totalN2 = m_gNE[2]+1;
516        } else if (in.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements ||
517                    in.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
518            myN0 = m_NE[0];
519            myN1 = m_NE[1];
520            myN2 = m_NE[2];
521            totalN0 = m_gNE[0];
522            totalN1 = m_gNE[1];
523            totalN2 = m_gNE[2];
524        } else
525            throw RipleyException("writeBinaryGrid(): invalid function space of data object");
526    
527        const int numComp = in.getDataPointSize();
528        const int dpp = in.getNumDataPointsPerSample();
529        const int fileSize = sizeof(ValueType)*numComp*dpp*totalN0*totalN1*totalN2;
530    
531        if (numComp > 1 || dpp > 1)
532            throw RipleyException("writeBinaryGrid(): only scalar, single-value data supported");
533    
534        escript::Data* _in = const_cast<escript::Data*>(&in);
535    
536        // from here on we know that each sample consists of one value
537        FileWriter* fw = new FileWriter();
538        fw->openFile(filename, fileSize);
539        MPIBarrier();
540    
541        for (index_t z=0; z<myN2; z++) {
542            for (index_t y=0; y<myN1; y++) {
543                const int fileofs = (m_offset[0]+(m_offset[1]+y)*totalN0
544                                    +(m_offset[2]+z)*totalN0*totalN1)*sizeof(ValueType);
545                ostringstream oss;
546    
547                for (index_t x=0; x<myN0; x++) {
548                    const double* sample = _in->getSampleDataRO(z*myN0*myN1+y*myN0+x);
549                    ValueType fvalue = static_cast<ValueType>(*sample);
550                    if (byteOrder == BYTEORDER_NATIVE) {
551                        oss.write((char*)&fvalue, sizeof(fvalue));
552                    } else {
553                        char* value = reinterpret_cast<char*>(&fvalue);
554                        oss.write(byte_swap32(value), sizeof(fvalue));
555                    }
556                }
557                fw->writeAt(oss, fileofs);
558            }
559        }
560        fw->close();
561    }
562    
563  void Brick::dump(const string& fileName) const  void Brick::dump(const string& fileName) const
564  {  {
565  #if USE_SILO  #if USE_SILO
# Line 490  void Brick::dump(const string& fileName) Line 620  void Brick::dump(const string& fileName)
620      }      }
621      */      */
622    
623      boost::scoped_ptr<double> x(new double[m_N0]);      boost::scoped_ptr<double> x(new double[m_NN[0]]);
624      boost::scoped_ptr<double> y(new double[m_N1]);      boost::scoped_ptr<double> y(new double[m_NN[1]]);
625      boost::scoped_ptr<double> z(new double[m_N2]);      boost::scoped_ptr<double> z(new double[m_NN[2]]);
626      double* coords[3] = { x.get(), y.get(), z.get() };      double* coords[3] = { x.get(), y.get(), z.get() };
     pair<double,double> xdx = getFirstCoordAndSpacing(0);  
     pair<double,double> ydy = getFirstCoordAndSpacing(1);  
     pair<double,double> zdz = getFirstCoordAndSpacing(2);  
627  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
628      {      {
629  #pragma omp for  #pragma omp for
630          for (dim_t i0 = 0; i0 < m_N0; i0++) {          for (dim_t i0 = 0; i0 < m_NN[0]; i0++) {
631              coords[0][i0]=xdx.first+i0*xdx.second;              coords[0][i0]=getLocalCoordinate(i0, 0);
632          }          }
633  #pragma omp for  #pragma omp for
634          for (dim_t i1 = 0; i1 < m_N1; i1++) {          for (dim_t i1 = 0; i1 < m_NN[1]; i1++) {
635              coords[1][i1]=ydy.first+i1*ydy.second;              coords[1][i1]=getLocalCoordinate(i1, 1);
636          }          }
637  #pragma omp for  #pragma omp for
638          for (dim_t i2 = 0; i2 < m_N2; i2++) {          for (dim_t i2 = 0; i2 < m_NN[2]; i2++) {
639              coords[2][i2]=zdz.first+i2*zdz.second;              coords[2][i2]=getLocalCoordinate(i2, 2);
640          }          }
641      }      }
642      IndexVector dims = getNumNodesPerDim();      int* dims = const_cast<int*>(getNumNodesPerDim());
643      DBPutQuadmesh(dbfile, "mesh", NULL, coords, &dims[0], 3, DB_DOUBLE,  
644        // write mesh
645        DBPutQuadmesh(dbfile, "mesh", NULL, coords, dims, 3, DB_DOUBLE,
646              DB_COLLINEAR, NULL);              DB_COLLINEAR, NULL);
647    
648      DBPutQuadvar1(dbfile, "nodeId", "mesh", (void*)&m_nodeId[0], &dims[0], 3,      // write node ids
649        DBPutQuadvar1(dbfile, "nodeId", "mesh", (void*)&m_nodeId[0], dims, 3,
650              NULL, 0, DB_INT, DB_NODECENT, NULL);              NULL, 0, DB_INT, DB_NODECENT, NULL);
651    
652      // write element ids      // write element ids
653      dims = getNumElementsPerDim();      dims = const_cast<int*>(getNumElementsPerDim());
654      DBPutQuadvar1(dbfile, "elementId", "mesh", (void*)&m_elementId[0],      DBPutQuadvar1(dbfile, "elementId", "mesh", (void*)&m_elementId[0],
655              &dims[0], 3, NULL, 0, DB_INT, DB_ZONECENT, NULL);              dims, 3, NULL, 0, DB_INT, DB_ZONECENT, NULL);
656    
657      // rank 0 writes multimesh and multivar      // rank 0 writes multimesh and multivar
658      if (m_mpiInfo->rank == 0) {      if (m_mpiInfo->rank == 0) {
# Line 615  bool Brick::ownSample(int fsType, index_ Line 745  bool Brick::ownSample(int fsType, index_
745          case ReducedElements:          case ReducedElements:
746              {              {
747                  // check ownership of element's _last_ node                  // check ownership of element's _last_ node
748                  const index_t x=id%m_NE0 + 1;                  const index_t x=id%m_NE[0] + 1;
749                  const index_t y=id%(m_NE0*m_NE1)/m_NE0 + 1;                  const index_t y=id%(m_NE[0]*m_NE[1])/m_NE[0] + 1;
750                  const index_t z=id/(m_NE0*m_NE1) + 1;                  const index_t z=id/(m_NE[0]*m_NE[1]) + 1;
751                  return (m_dofMap[x + m_N0*y +m_N0*m_N1*z] < getNumDOF());                  return (m_dofMap[x + m_NN[0]*y + m_NN[0]*m_NN[1]*z] < getNumDOF());
752              }              }
753          case FaceElements:          case FaceElements:
754          case ReducedFaceElements:          case ReducedFaceElements:
755              {              {
756                  // check ownership of face element's last node                  // check ownership of face element's last node
                 const IndexVector faces = getNumFacesPerBoundary();  
757                  dim_t n=0;                  dim_t n=0;
758                  for (size_t i=0; i<faces.size(); i++) {                  for (size_t i=0; i<6; i++) {
759                      n+=faces[i];                      n+=m_faceCount[i];
760                      if (id<n) {                      if (id<n) {
761                          const index_t j=id-n+faces[i];                          const index_t j=id-n+m_faceCount[i];
762                          if (i>=4) { // front or back                          if (i>=4) { // front or back
763                              const index_t first=(i==4 ? 0 : m_N0*m_N1*(m_N2-1));                              const index_t first=(i==4 ? 0 : m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1));
764                              return (m_dofMap[first+j%m_NE0+1+(j/m_NE0+1)*m_N0] < getNumDOF());                              return (m_dofMap[first+j%m_NE[0]+1+(j/m_NE[0]+1)*m_NN[0]] < getNumDOF());
765                          } else if (i>=2) { // bottom or top                          } else if (i>=2) { // bottom or top
766                              const index_t first=(i==2 ? 0 : m_N0*(m_N1-1));                              const index_t first=(i==2 ? 0 : m_NN[0]*(m_NN[1]-1));
767                              return (m_dofMap[first+j%m_NE0+1+(j/m_NE0+1)*m_N0*m_N1] < getNumDOF());                              return (m_dofMap[first+j%m_NE[0]+1+(j/m_NE[0]+1)*m_NN[0]*m_NN[1]] < getNumDOF());
768                          } else { // left or right                          } else { // left or right
769                              const index_t first=(i==0 ? 0 : m_N0-1);                              const index_t first=(i==0 ? 0 : m_NN[0]-1);
770                              return (m_dofMap[first+(j%m_NE1+1)*m_N0+(j/m_NE1+1)*m_N0*m_N1] < getNumDOF());                              return (m_dofMap[first+(j%m_NE[1]+1)*m_NN[0]+(j/m_NE[1]+1)*m_NN[0]*m_NN[1]] < getNumDOF());
771                          }                          }
772                      }                      }
773                  }                  }
# Line 661  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 790  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
790          {          {
791              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
792  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
793                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
794                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
795                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
796                          // set vector at four quadrature points                          // set vector at four quadrature points
797                          *o++ = -1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;                          *o++ = -1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;
798                          *o++ = -1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;                          *o++ = -1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;
# Line 675  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 804  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
804    
805              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
806  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
807                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
808                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
809                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
810                          // set vector at four quadrature points                          // set vector at four quadrature points
811                          *o++ = 1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;                          *o++ = 1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;
812                          *o++ = 1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;                          *o++ = 1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;
# Line 689  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 818  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
818    
819              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
820  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
821                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
822                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
823                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
824                          // set vector at four quadrature points                          // set vector at four quadrature points
825                          *o++ = 0.; *o++ = -1.; *o++ = 0.;                          *o++ = 0.; *o++ = -1.; *o++ = 0.;
826                          *o++ = 0.; *o++ = -1.; *o++ = 0.;                          *o++ = 0.; *o++ = -1.; *o++ = 0.;
# Line 703  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 832  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
832    
833              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
834  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
835                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
836                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
837                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
838                          // set vector at four quadrature points                          // set vector at four quadrature points
839                          *o++ = 0.; *o++ = 1.; *o++ = 0.;                          *o++ = 0.; *o++ = 1.; *o++ = 0.;
840                          *o++ = 0.; *o++ = 1.; *o++ = 0.;                          *o++ = 0.; *o++ = 1.; *o++ = 0.;
# Line 717  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 846  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
846    
847              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
848  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
849                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
850                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
851                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
852                          // set vector at four quadrature points                          // set vector at four quadrature points
853                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = -1.;                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = -1.;
854                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = -1.;                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = -1.;
# Line 731  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 860  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
860    
861              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
862  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
863                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
864                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
865                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
866                          // set vector at four quadrature points                          // set vector at four quadrature points
867                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = 1.;                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = 1.;
868                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = 1.;                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = 1.;
# Line 749  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 878  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
878          {          {
879              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
880  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
881                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
882                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
883                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
884                          *o++ = -1.;                          *o++ = -1.;
885                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
886                          *o = 0.;                          *o = 0.;
# Line 761  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 890  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
890    
891              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
892  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
893                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
894                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
895                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
896                          *o++ = 1.;                          *o++ = 1.;
897                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
898                          *o = 0.;                          *o = 0.;
# Line 773  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 902  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
902    
903              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
904  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
905                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
906                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
907                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
908                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
909                          *o++ = -1.;                          *o++ = -1.;
910                          *o = 0.;                          *o = 0.;
# Line 785  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 914  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
914    
915              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
916  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
917                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
918                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
919                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
920                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
921                          *o++ = 1.;                          *o++ = 1.;
922                          *o = 0.;                          *o = 0.;
# Line 797  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 926  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
926    
927              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
928  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
929                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
930                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
931                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
932                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
933                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
934                          *o = -1.;                          *o = -1.;
# Line 809  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 938  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
938    
939              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
940  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
941                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
942                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
943                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
944                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
945                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
946                          *o = 1.;                          *o = 1.;
# Line 834  void Brick::setToSize(escript::Data& out Line 963  void Brick::setToSize(escript::Data& out
963              || out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {              || out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
964          out.requireWrite();          out.requireWrite();
965          const dim_t numQuad=out.getNumDataPointsPerSample();          const dim_t numQuad=out.getNumDataPointsPerSample();
966          const double xSize=getFirstCoordAndSpacing(0).second;          const double size=sqrt(m_dx[0]*m_dx[0]+m_dx[1]*m_dx[1]+m_dx[2]*m_dx[2]);
         const double ySize=getFirstCoordAndSpacing(1).second;  
         const double zSize=getFirstCoordAndSpacing(2).second;  
         const double size=sqrt(xSize*xSize+ySize*ySize+zSize*zSize);  
967  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel for
968          for (index_t k = 0; k < getNumElements(); ++k) {          for (index_t k = 0; k < getNumElements(); ++k) {
969              double* o = out.getSampleDataRW(k);              double* o = out.getSampleDataRW(k);
# Line 847  void Brick::setToSize(escript::Data& out Line 973  void Brick::setToSize(escript::Data& out
973              || out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedFaceElements) {              || out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedFaceElements) {
974          out.requireWrite();          out.requireWrite();
975          const dim_t numQuad=out.getNumDataPointsPerSample();          const dim_t numQuad=out.getNumDataPointsPerSample();
         const double xSize=getFirstCoordAndSpacing(0).second;  
         const double ySize=getFirstCoordAndSpacing(1).second;  
         const double zSize=getFirstCoordAndSpacing(2).second;  
976  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
977          {          {
978              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
979                  const double size=min(ySize,zSize);                  const double size=min(m_dx[1],m_dx[2]);
980  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
981                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
982                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
983                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
984                          fill(o, o+numQuad, size);                          fill(o, o+numQuad, size);
985                      }                      }
986                  }                  }
987              }              }
988    
989              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
990                  const double size=min(ySize,zSize);                  const double size=min(m_dx[1],m_dx[2]);
991  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
992                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
993                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
994                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
995                          fill(o, o+numQuad, size);                          fill(o, o+numQuad, size);
996                      }                      }
997                  }                  }
998              }              }
999    
1000              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
1001                  const double size=min(xSize,zSize);                  const double size=min(m_dx[0],m_dx[2]);
1002  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1003                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1004                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1005                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1006                          fill(o, o+numQuad, size);                          fill(o, o+numQuad, size);
1007                      }                      }
1008                  }                  }
1009              }              }
1010    
1011              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
1012                  const double size=min(xSize,zSize);                  const double size=min(m_dx[0],m_dx[2]);
1013  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1014                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1015                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1016                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1017                          fill(o, o+numQuad, size);                          fill(o, o+numQuad, size);
1018                      }                      }
1019                  }                  }
1020              }              }
1021    
1022              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
1023                  const double size=min(xSize,ySize);                  const double size=min(m_dx[0],m_dx[1]);
1024  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1025                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1026                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1027                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1028                          fill(o, o+numQuad, size);                          fill(o, o+numQuad, size);
1029                      }                      }
1030                  }                  }
1031              }              }
1032    
1033              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
1034                  const double size=min(xSize,ySize);                  const double size=min(m_dx[0],m_dx[1]);
1035  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1036                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1037                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1038                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1039                          fill(o, o+numQuad, size);                          fill(o, o+numQuad, size);
1040                      }                      }
1041                  }                  }
# Line 927  void Brick::setToSize(escript::Data& out Line 1050  void Brick::setToSize(escript::Data& out
1050      }      }
1051  }  }
1052    
 Paso_SystemMatrixPattern* Brick::getPattern(bool reducedRowOrder,  
                                             bool reducedColOrder) const  
 {  
     /* FIXME: reduced  
     if (reducedRowOrder || reducedColOrder)  
         throw RipleyException("getPattern() not implemented for reduced order");  
     */  
     return m_pattern;  
 }  
   
1053  void Brick::Print_Mesh_Info(const bool full) const  void Brick::Print_Mesh_Info(const bool full) const
1054  {  {
1055      RipleyDomain::Print_Mesh_Info(full);      RipleyDomain::Print_Mesh_Info(full);
# Line 944  void Brick::Print_Mesh_Info(const bool f Line 1057  void Brick::Print_Mesh_Info(const bool f
1057          cout << "     Id  Coordinates" << endl;          cout << "     Id  Coordinates" << endl;
1058          cout.precision(15);          cout.precision(15);
1059          cout.setf(ios::scientific, ios::floatfield);          cout.setf(ios::scientific, ios::floatfield);
         pair<double,double> xdx = getFirstCoordAndSpacing(0);  
         pair<double,double> ydy = getFirstCoordAndSpacing(1);  
         pair<double,double> zdz = getFirstCoordAndSpacing(2);  
1060          for (index_t i=0; i < getNumNodes(); i++) {          for (index_t i=0; i < getNumNodes(); i++) {
1061              cout << "  " << setw(5) << m_nodeId[i]              cout << "  " << setw(5) << m_nodeId[i]
1062                  << "  " << xdx.first+(i%m_N0)*xdx.second                  << "  " << getLocalCoordinate(i%m_NN[0], 0)
1063                  << "  " << ydy.first+(i%(m_N0*m_N1)/m_N0)*ydy.second                  << "  " << getLocalCoordinate(i%(m_NN[0]*m_NN[1])/m_NN[0], 1)
1064                  << "  " << zdz.first+(i/(m_N0*m_N1))*zdz.second << endl;                  << "  " << getLocalCoordinate(i/(m_NN[0]*m_NN[1]), 2) << endl;
1065          }          }
1066      }      }
1067  }  }
1068    
 IndexVector Brick::getNumNodesPerDim() const  
 {  
     IndexVector ret;  
     ret.push_back(m_N0);  
     ret.push_back(m_N1);  
     ret.push_back(m_N2);  
     return ret;  
 }  
   
 IndexVector Brick::getNumElementsPerDim() const  
 {  
     IndexVector ret;  
     ret.push_back(m_NE0);  
     ret.push_back(m_NE1);  
     ret.push_back(m_NE2);  
     return ret;  
 }  
   
 IndexVector Brick::getNumFacesPerBoundary() const  
 {  
     IndexVector ret(6, 0);  
     //left  
     if (m_offset0==0)  
         ret[0]=m_NE1*m_NE2;  
     //right  
     if (m_mpiInfo->rank%m_NX==m_NX-1)  
         ret[1]=m_NE1*m_NE2;  
     //bottom  
     if (m_offset1==0)  
         ret[2]=m_NE0*m_NE2;  
     //top  
     if (m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX==m_NY-1)  
         ret[3]=m_NE0*m_NE2;  
     //front  
     if (m_offset2==0)  
         ret[4]=m_NE0*m_NE1;  
     //back  
     if (m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY)==m_NZ-1)  
         ret[5]=m_NE0*m_NE1;  
     return ret;  
 }  
   
 IndexVector Brick::getNumSubdivisionsPerDim() const  
 {  
     IndexVector ret;  
     ret.push_back(m_NX);  
     ret.push_back(m_NY);  
     ret.push_back(m_NZ);  
     return ret;  
 }  
   
 pair<double,double> Brick::getFirstCoordAndSpacing(dim_t dim) const  
 {  
     if (dim==0)  
         return pair<double,double>(m_x0+(m_l0*m_offset0)/m_gNE0, m_l0/m_gNE0);  
     else if (dim==1)  
         return pair<double,double>(m_y0+(m_l1*m_offset1)/m_gNE1, m_l1/m_gNE1);  
     else if (dim==2)  
         return pair<double,double>(m_z0+(m_l2*m_offset2)/m_gNE2, m_l2/m_gNE2);  
   
     throw RipleyException("getFirstCoordAndSpacing: invalid argument");  
 }  
   
 //protected  
 dim_t Brick::getNumDOF() const  
 {  
     return (m_gNE0+1)/m_NX*(m_gNE1+1)/m_NY*(m_gNE2+1)/m_NZ;  
 }  
   
 //protected  
 dim_t Brick::getNumFaceElements() const  
 {  
     const IndexVector faces = getNumFacesPerBoundary();  
     dim_t n=0;  
     for (size_t i=0; i<faces.size(); i++)  
         n+=faces[i];  
     return n;  
 }  
1069    
1070  //protected  //protected
1071  void Brick::assembleCoordinates(escript::Data& arg) const  void Brick::assembleCoordinates(escript::Data& arg) const
# Line 1045  void Brick::assembleCoordinates(escript: Line 1077  void Brick::assembleCoordinates(escript:
1077      if (!numSamplesEqual(&x, 1, getNumNodes()))      if (!numSamplesEqual(&x, 1, getNumNodes()))
1078          throw RipleyException("setToX: Illegal number of samples in Data object");          throw RipleyException("setToX: Illegal number of samples in Data object");
1079    
     pair<double,double> xdx = getFirstCoordAndSpacing(0);  
     pair<double,double> ydy = getFirstCoordAndSpacing(1);  
     pair<double,double> zdz = getFirstCoordAndSpacing(2);  
1080      arg.requireWrite();      arg.requireWrite();
1081  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel for
1082      for (dim_t i2 = 0; i2 < m_N2; i2++) {      for (dim_t i2 = 0; i2 < m_NN[2]; i2++) {
1083          for (dim_t i1 = 0; i1 < m_N1; i1++) {          for (dim_t i1 = 0; i1 < m_NN[1]; i1++) {
1084              for (dim_t i0 = 0; i0 < m_N0; i0++) {              for (dim_t i0 = 0; i0 < m_NN[0]; i0++) {
1085                  double* point = arg.getSampleDataRW(i0+m_N0*i1+m_N0*m_N1*i2);                  double* point = arg.getSampleDataRW(i0+m_NN[0]*i1+m_NN[0]*m_NN[1]*i2);
1086                  point[0] = xdx.first+i0*xdx.second;                  point[0] = getLocalCoordinate(i0, 0);
1087                  point[1] = ydy.first+i1*ydy.second;                  point[1] = getLocalCoordinate(i1, 1);
1088                  point[2] = zdz.first+i2*zdz.second;                  point[2] = getLocalCoordinate(i2, 2);
1089              }              }
1090          }          }
1091      }      }
# Line 1066  void Brick::assembleCoordinates(escript: Line 1095  void Brick::assembleCoordinates(escript:
1095  void Brick::assembleGradient(escript::Data& out, escript::Data& in) const  void Brick::assembleGradient(escript::Data& out, escript::Data& in) const
1096  {  {
1097      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();
     const double h0 = m_l0/m_gNE0;  
     const double h1 = m_l1/m_gNE1;  
     const double h2 = m_l2/m_gNE2;  
1098      const double C0 = .044658198738520451079;      const double C0 = .044658198738520451079;
1099      const double C1 = .16666666666666666667;      const double C1 = .16666666666666666667;
1100      const double C2 = .21132486540518711775;      const double C2 = .21132486540518711775;
# Line 1090  void Brick::assembleGradient(escript::Da Line 1116  void Brick::assembleGradient(escript::Da
1116              vector<double> f_110(numComp);              vector<double> f_110(numComp);
1117              vector<double> f_111(numComp);              vector<double> f_111(numComp);
1118  #pragma omp for  #pragma omp for
1119              for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {              for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1120                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1121                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1122                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1123                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1124                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1125                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1126                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1127                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1128                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1129                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1130                          double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE0,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE[0],m_NE[1]));
1131                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1132                              const double V0=((f_100[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_011[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;                              const double V0=((f_100[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_011[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / m_dx[0];
1133                              const double V1=((f_110[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_001[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / h0;                              const double V1=((f_110[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_001[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / m_dx[0];
1134                              const double V2=((f_101[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_010[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / h0;                              const double V2=((f_101[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_010[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / m_dx[0];
1135                              const double V3=((f_111[i]-f_011[i])*C5 + (f_100[i]-f_000[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;                              const double V3=((f_111[i]-f_011[i])*C5 + (f_100[i]-f_000[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / m_dx[0];
1136                              const double V4=((f_010[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_101[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;                              const double V4=((f_010[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_101[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[1];
1137                              const double V5=((f_110[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_001[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / h1;                              const double V5=((f_110[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_001[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / m_dx[1];
1138                              const double V6=((f_011[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_100[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / h1;                              const double V6=((f_011[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_100[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / m_dx[1];
1139                              const double V7=((f_111[i]-f_101[i])*C5 + (f_010[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;                              const double V7=((f_111[i]-f_101[i])*C5 + (f_010[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[1];
1140                              const double V8=((f_001[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_110[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;                              const double V8=((f_001[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_110[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[2];
1141                              const double V9=((f_101[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_010[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / h2;                              const double V9=((f_101[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_010[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / m_dx[2];
1142                              const double V10=((f_011[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_100[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / h2;                              const double V10=((f_011[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_100[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / m_dx[2];
1143                              const double V11=((f_111[i]-f_110[i])*C5 + (f_001[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;                              const double V11=((f_111[i]-f_110[i])*C5 + (f_001[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[2];
1144                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;
1145                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V4;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V4;
1146                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V8;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V8;
# Line 1157  void Brick::assembleGradient(escript::Da Line 1183  void Brick::assembleGradient(escript::Da
1183              vector<double> f_110(numComp);              vector<double> f_110(numComp);
1184              vector<double> f_111(numComp);              vector<double> f_111(numComp);
1185  #pragma omp for  #pragma omp for
1186              for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {              for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1187                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1188                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1189                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1190                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1191                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1192                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1193                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1194                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1195                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1196                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1197                          double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE0,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE[0],m_NE[1]));
1198                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1199                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_010[i]-f_011[i])*C3 / h0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_010[i]-f_011[i])*C3 / m_dx[0];
1200                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_100[i]-f_101[i])*C3 / h1;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_100[i]-f_101[i])*C3 / m_dx[1];
1201                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]+f_101[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_010[i]-f_100[i]-f_110[i])*C3 / h2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]+f_101[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_010[i]-f_100[i]-f_110[i])*C3 / m_dx[2];
1202                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
1203                      } // end of k0 loop                      } // end of k0 loop
1204                  } // end of k1 loop                  } // end of k1 loop
# Line 1192  void Brick::assembleGradient(escript::Da Line 1218  void Brick::assembleGradient(escript::Da
1218              vector<double> f_111(numComp);              vector<double> f_111(numComp);
1219              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
1220  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1221                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1222                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1223                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1224                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1225                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1226                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1227                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1228                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1229                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1230                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1231                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1232                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1233                              const double V0=((f_010[i]-f_000[i])*C6 + (f_011[i]-f_001[i])*C2) / h1;                              const double V0=((f_010[i]-f_000[i])*C6 + (f_011[i]-f_001[i])*C2) / m_dx[1];
1234                              const double V1=((f_010[i]-f_000[i])*C2 + (f_011[i]-f_001[i])*C6) / h1;                              const double V1=((f_010[i]-f_000[i])*C2 + (f_011[i]-f_001[i])*C6) / m_dx[1];
1235                              const double V2=((f_001[i]-f_000[i])*C6 + (f_010[i]-f_011[i])*C2) / h2;                              const double V2=((f_001[i]-f_000[i])*C6 + (f_010[i]-f_011[i])*C2) / m_dx[2];
1236                              const double V3=((f_001[i]-f_000[i])*C2 + (f_011[i]-f_010[i])*C6) / h2;                              const double V3=((f_001[i]-f_000[i])*C2 + (f_011[i]-f_010[i])*C6) / m_dx[2];
1237                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = ((f_100[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_011[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = ((f_100[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_011[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / m_dx[0];
1238                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V0;
1239                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V2;
1240                              o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_001[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / h0;                              o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_001[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / m_dx[0];
1241                              o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V0;
1242                              o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V3;                              o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V3;
1243                              o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = ((f_101[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_010[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / h0;                              o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = ((f_101[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_010[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / m_dx[0];
1244                              o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V1;                              o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V1;
1245                              o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V2;                              o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V2;
1246                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_011[i])*C5 + (f_100[i]-f_000[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_011[i])*C5 + (f_100[i]-f_000[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / m_dx[0];
1247                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V1;                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V1;
1248                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V3;                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V3;
1249                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
# Line 1226  void Brick::assembleGradient(escript::Da Line 1252  void Brick::assembleGradient(escript::Da
1252              } // end of face 0              } // end of face 0
1253              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
1254  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1255                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1256                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1257                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1258                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1259                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1260                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1261                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1262                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1263                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1264                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1265                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1266                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1267                              const double V0=((f_110[i]-f_100[i])*C6 + (f_111[i]-f_101[i])*C2) / h1;                              const double V0=((f_110[i]-f_100[i])*C6 + (f_111[i]-f_101[i])*C2) / m_dx[1];
1268                              const double V1=((f_110[i]-f_100[i])*C2 + (f_111[i]-f_101[i])*C6) / h1;                              const double V1=((f_110[i]-f_100[i])*C2 + (f_111[i]-f_101[i])*C6) / m_dx[1];
1269                              const double V2=((f_101[i]-f_100[i])*C6 + (f_111[i]-f_110[i])*C2) / h2;                              const double V2=((f_101[i]-f_100[i])*C6 + (f_111[i]-f_110[i])*C2) / m_dx[2];
1270                              const double V3=((f_101[i]-f_100[i])*C2 + (f_111[i]-f_110[i])*C6) / h2;                              const double V3=((f_101[i]-f_100[i])*C2 + (f_111[i]-f_110[i])*C6) / m_dx[2];
1271                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = ((f_100[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_011[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = ((f_100[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_011[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / m_dx[0];
1272                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V0;
1273                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V2;
1274                              o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_001[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / h0;                              o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_001[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / m_dx[0];
1275                              o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V0;
1276                              o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V3;                              o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V3;
1277                              o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = ((f_101[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_010[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / h0;                              o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = ((f_101[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_010[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / m_dx[0];
1278                              o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V1;                              o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V1;
1279                              o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V2;                              o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V2;
1280                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_011[i])*C5 + (f_100[i]-f_000[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_011[i])*C5 + (f_100[i]-f_000[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / m_dx[0];
1281                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V1;                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V1;
1282                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V3;                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V3;
1283                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
# Line 1260  void Brick::assembleGradient(escript::Da Line 1286  void Brick::assembleGradient(escript::Da
1286              } // end of face 1              } // end of face 1
1287              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
1288  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1289                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1290                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1291                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1292                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1293                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1294                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1295                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1296                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1297                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1298                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1299                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1300                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1301                              const double V0=((f_100[i]-f_000[i])*C6 + (f_101[i]-f_001[i])*C2) / h0;                              const double V0=((f_100[i]-f_000[i])*C6 + (f_101[i]-f_001[i])*C2) / m_dx[0];
1302                              const double V1=((f_001[i]-f_000[i])*C6 + (f_101[i]-f_100[i])*C2) / h2;                              const double V1=((f_001[i]-f_000[i])*C6 + (f_101[i]-f_100[i])*C2) / m_dx[2];
1303                              const double V2=((f_001[i]-f_000[i])*C2 + (f_101[i]-f_100[i])*C6) / h2;                              const double V2=((f_001[i]-f_000[i])*C2 + (f_101[i]-f_100[i])*C6) / m_dx[2];
1304                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;
1305                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = ((f_010[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_101[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = ((f_010[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_101[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[1];
1306                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V1;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V1;
1307                              o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;
1308                              o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_001[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / h1;                              o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_001[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / m_dx[1];
1309                              o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V2;                              o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V2;
1310                              o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V0;
1311                              o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_100[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / h1;                              o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_100[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / m_dx[1];
1312                              o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V1;                              o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V1;
1313                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V0;
1314                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_101[i])*C5 + (f_010[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_101[i])*C5 + (f_010[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[1];
1315                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V2;                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V2;
1316                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
1317                      } // end of k0 loop                      } // end of k0 loop
# Line 1293  void Brick::assembleGradient(escript::Da Line 1319  void Brick::assembleGradient(escript::Da
1319              } // end of face 2              } // end of face 2
1320              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
1321  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1322                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1323                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1324                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-2,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-2,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1325                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-2,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-2,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1326                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1327                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1328                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-2,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-2,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1329                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-2,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-2,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1330                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1331                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1332                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1333                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1334                              const double V0=((f_110[i]-f_010[i])*C6 + (f_111[i]-f_011[i])*C2) / h0;                              const double V0=((f_110[i]-f_010[i])*C6 + (f_111[i]-f_011[i])*C2) / m_dx[0];
1335                              const double V1=((f_110[i]-f_010[i])*C2 + (f_111[i]-f_011[i])*C6) / h0;                              const double V1=((f_110[i]-f_010[i])*C2 + (f_111[i]-f_011[i])*C6) / m_dx[0];
1336                              const double V2=((f_011[i]-f_010[i])*C6 + (f_111[i]-f_110[i])*C2) / h2;                              const double V2=((f_011[i]-f_010[i])*C6 + (f_111[i]-f_110[i])*C2) / m_dx[2];
1337                              const double V3=((f_011[i]-f_010[i])*C2 + (f_111[i]-f_110[i])*C6) / h2;                              const double V3=((f_011[i]-f_010[i])*C2 + (f_111[i]-f_110[i])*C6) / m_dx[2];
1338                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;
1339                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = ((f_010[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_101[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = ((f_010[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_101[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[1];
1340                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V2;
1341                              o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;
1342                              o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_001[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / h1;                              o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_001[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / m_dx[1];
1343                              o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V3;                              o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V3;
1344                              o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V1;                              o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V1;
1345                              o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_100[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / h1;                              o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_100[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / m_dx[1];
1346                              o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V2;                              o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V2;
1347                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;
1348                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_101[i])*C5 + (f_010[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_101[i])*C5 + (f_010[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[1];
1349                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V3;                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V3;
1350                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
1351                      } // end of k0 loop                      } // end of k0 loop
# Line 1327  void Brick::assembleGradient(escript::Da Line 1353  void Brick::assembleGradient(escript::Da
1353              } // end of face 3              } // end of face 3
1354              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
1355  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1356                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1357                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1358                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1359                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1360                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1361                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1362                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1363                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1364                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1365                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1366                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1367                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1368                              const double V0=((f_100[i]-f_000[i])*C6 + (f_110[i]-f_010[i])*C2) / h0;                              const double V0=((f_100[i]-f_000[i])*C6 + (f_110[i]-f_010[i])*C2) / m_dx[0];
1369                              const double V1=((f_100[i]-f_000[i])*C2 + (f_110[i]-f_010[i])*C6) / h0;                              const double V1=((f_100[i]-f_000[i])*C2 + (f_110[i]-f_010[i])*C6) / m_dx[0];
1370                              const double V2=((f_010[i]-f_000[i])*C6 + (f_110[i]-f_100[i])*C2) / h1;                              const double V2=((f_010[i]-f_000[i])*C6 + (f_110[i]-f_100[i])*C2) / m_dx[1];
1371                              const double V3=((f_010[i]-f_000[i])*C2 + (f_110[i]-f_100[i])*C6) / h1;                              const double V3=((f_010[i]-f_000[i])*C2 + (f_110[i]-f_100[i])*C6) / m_dx[1];
1372                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;
1373                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V2;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V2;
1374                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = ((f_001[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_110[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = ((f_001[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_110[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[2];
1375                              o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;
1376                              o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V3;                              o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V3;
1377                              o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = ((f_101[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_010[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / h2;                              o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = ((f_101[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_010[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / m_dx[2];
1378                              o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V1;                              o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V1;
1379                              o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V2;                              o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V2;
1380                              o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_100[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / h2;                              o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_100[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / m_dx[2];
1381                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;
1382                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V3;                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V3;
1383                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_110[i])*C5 + (f_001[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_110[i])*C5 + (f_001[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[2];
1384                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
1385                      } // end of k0 loop                      } // end of k0 loop
1386                  } // end of k1 loop                  } // end of k1 loop
1387              } // end of face 4              } // end of face 4
1388              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
1389  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1390                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1391                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1392                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1393                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1394                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1395                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1396                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1397                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1398                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1399                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1400                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1401                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1402                              const double V0=((f_101[i]-f_001[i])*C6 + (f_111[i]-f_011[i])*C2) / h0;                              const double V0=((f_101[i]-f_001[i])*C6 + (f_111[i]-f_011[i])*C2) / m_dx[0];
1403                              const double V1=((f_101[i]-f_001[i])*C2 + (f_111[i]-f_011[i])*C6) / h0;                              const double V1=((f_101[i]-f_001[i])*C2 + (f_111[i]-f_011[i])*C6) / m_dx[0];
1404                              const double V2=((f_011[i]-f_001[i])*C6 + (f_111[i]-f_101[i])*C2) / h1;                              const double V2=((f_011[i]-f_001[i])*C6 + (f_111[i]-f_101[i])*C2) / m_dx[1];
1405                              const double V3=((f_011[i]-f_001[i])*C2 + (f_111[i]-f_101[i])*C6) / h1;                              const double V3=((f_011[i]-f_001[i])*C2 + (f_111[i]-f_101[i])*C6) / m_dx[1];
1406                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;
1407                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V2;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V2;
1408                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = ((f_001[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_110[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = ((f_001[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_110[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[2];
1409                              o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;                              o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;
1410                              o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V3;                              o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V3;
1411                              o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_010[i])*C0 + (f_101[i]-f_100[i])*C5 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / h2;                              o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_010[i])*C0 + (f_101[i]-f_100[i])*C5 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / m_dx[2];
1412                              o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V1;                              o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V1;
1413                              o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V2;                              o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V2;
1414                              o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_100[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / h2;                              o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_100[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / m_dx[2];
1415                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;                              o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;
1416                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V3;                              o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V3;
1417                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = ((f_001[i]-f_000[i])*C0 + (f_111[i]-f_110[i])*C5 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;                              o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = ((f_001[i]-f_000[i])*C0 + (f_111[i]-f_110[i])*C5 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[2];
1418                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
1419                      } // end of k0 loop                      } // end of k0 loop
1420                  } // end of k1 loop                  } // end of k1 loop
# Line 1408  void Brick::assembleGradient(escript::Da Line 1434  void Brick::assembleGradient(escript::Da
1434              vector<double> f_111(numComp);              vector<double> f_111(numComp);
1435              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
1436  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1437                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1438                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1439                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1440                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1441                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1442                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1443                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1444                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1445                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1446                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1447                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1448                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1449                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_010[i]-f_011[i])*C3 / h0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_010[i]-f_011[i])*C3 / m_dx[0];
1450                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]-f_000[i]-f_001[i])*C4 / h1;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]-f_000[i]-f_001[i])*C4 / m_dx[1];
1451                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]-f_000[i]-f_010[i])*C4 / h2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]-f_000[i]-f_010[i])*C4 / m_dx[2];
1452                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
1453                      } // end of k1 loop                      } // end of k1 loop
1454                  } // end of k2 loop                  } // end of k2 loop
1455              } // end of face 0              } // end of face 0
1456              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
1457  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1458                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1459                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1460                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1461                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1462                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1463                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1464                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1465                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1466                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1467                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1468                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1469                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1470                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_010[i]-f_011[i])*C3 / h0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_010[i]-f_011[i])*C3 / m_dx[0];
1471                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_110[i]+f_111[i]-f_100[i]-f_101[i])*C4 / h1;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_110[i]+f_111[i]-f_100[i]-f_101[i])*C4 / m_dx[1];
1472                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_101[i]+f_111[i]-f_100[i]-f_110[i])*C4 / h2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_101[i]+f_111[i]-f_100[i]-f_110[i])*C4 / m_dx[2];
1473                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
1474                      } // end of k1 loop                      } // end of k1 loop
1475                  } // end of k2 loop                  } // end of k2 loop
1476              } // end of face 1              } // end of face 1
1477              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
1478  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1479                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1480                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1481                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1482                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1483                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1484                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1485                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1486                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1487                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1488                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1489                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1490                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1491                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]-f_000[i]-f_001[i])*C4 / h0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]-f_000[i]-f_001[i])*C4 / m_dx[0];
1492                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_100[i]-f_101[i])*C3 / h1;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_100[i]-f_101[i])*C3 / m_dx[1];
1493                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_101[i]-f_000[i]-f_100[i])*C4 / h2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_101[i]-f_000[i]-f_100[i])*C4 / m_dx[2];
1494                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
1495                      } // end of k0 loop                      } // end of k0 loop
1496                  } // end of k2 loop                  } // end of k2 loop
1497              } // end of face 2              } // end of face 2
1498              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
1499  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1500                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1501                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1502                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-2,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-2,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1503                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-2,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-2,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1504                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1505                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1506                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-2,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-2,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1507                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-2,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-2,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1508                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1509                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1510                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1511                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1512                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_110[i]+f_111[i]-f_010[i]-f_011[i])*C4 / h0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_110[i]+f_111[i]-f_010[i]-f_011[i])*C4 / m_dx[0];
1513                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_100[i]-f_101[i])*C3 / h1;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_100[i]-f_101[i])*C3 / m_dx[1];
1514                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_011[i]+f_111[i]-f_010[i]-f_110[i])*C4 / h2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_011[i]+f_111[i]-f_010[i]-f_110[i])*C4 / m_dx[2];
1515                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
1516                      } // end of k0 loop                      } // end of k0 loop
1517                  } // end of k2 loop                  } // end of k2 loop
1518              } // end of face 3              } // end of face 3
1519              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
1520  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1521                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1522                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1523                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1524                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1525                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1526                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1527                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1528                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1529                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1530                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1531                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1532                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1533                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_110[i]-f_000[i]-f_010[i])*C4 / h0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_110[i]-f_000[i]-f_010[i])*C4 / m_dx[0];
1534                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_110[i]-f_000[i]-f_100[i])*C4 / h1;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_110[i]-f_000[i]-f_100[i])*C4 / m_dx[1];
1535                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]+f_101[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_010[i]-f_100[i]-f_110[i])*C4 / h2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]+f_101[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_010[i]-f_100[i]-f_110[i])*C4 / m_dx[2];
1536                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
1537                      } // end of k0 loop                      } // end of k0 loop
1538                  } // end of k1 loop                  } // end of k1 loop
1539              } // end of face 4              } // end of face 4
1540              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
1541  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1542                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1543                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1544                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1545                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1546                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1547                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1548                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1549                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1550                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1551                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1552                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1553                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1554                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_101[i]+f_111[i]-f_001[i]-f_011[i])*C4 / h0;                              o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_101[i]+f_111[i]-f_001[i]-f_011[i])*C4 / m_dx[0];
1555                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_011[i]+f_111[i]-f_001[i]-f_101[i])*C4 / h1;                              o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_011[i]+f_111[i]-f_001[i]-f_101[i])*C4 / m_dx[1];
1556                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]+f_101[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_010[i]-f_100[i]-f_110[i])*C3 / h2;                              o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]+f_101[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_010[i]-f_100[i]-f_110[i])*C3 / m_dx[2];
1557                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
1558                      } // end of k0 loop                      } // end of k0 loop
1559                  } // end of k1 loop                  } // end of k1 loop
# Line 1540  void Brick::assembleGradient(escript::Da Line 1566  void Brick::assembleGradient(escript::Da
1566  void Brick::assembleIntegrate(vector<double>& integrals, escript::Data& arg) const  void Brick::assembleIntegrate(vector<double>& integrals, escript::Data& arg) const
1567  {  {
1568      const dim_t numComp = arg.getDataPointSize();      const dim_t numComp = arg.getDataPointSize();
1569      const double h0 = m_l0/m_gNE0;      const index_t left = (m_offset[0]==0 ? 0 : 1);
1570      const double h1 = m_l1/m_gNE1;      const index_t bottom = (m_offset[1]==0 ? 0 : 1);
1571      const double h2 = m_l2/m_gNE2;      const index_t front = (m_offset[2]==0 ? 0 : 1);
     const index_t left = (m_offset0==0 ? 0 : 1);  
     const index_t bottom = (m_offset1==0 ? 0 : 1);  
     const index_t front = (m_offset2==0 ? 0 : 1);  
1572      const int fs = arg.getFunctionSpace().getTypeCode();      const int fs = arg.getFunctionSpace().getTypeCode();
1573      if (fs == Elements && arg.actsExpanded()) {      if (fs == Elements && arg.actsExpanded()) {
1574          const double w_0 = h0*h1*h2/8.;          const double w_0 = m_dx[0]*m_dx[1]*m_dx[2]/8.;
1575  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1576          {          {
1577              vector<double> int_local(numComp, 0);              vector<double> int_local(numComp, 0);
1578  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1579              for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE2; ++k2) {              for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1580                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1581                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1582                          const double* f = arg.getSampleDataRO(INDEX3(k0, k1, k2, m_NE0, m_NE1));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(INDEX3(k0, k1, k2, m_NE[0], m_NE[1]));
1583                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1584                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1585                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
# Line 1578  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou Line 1601  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou
1601          } // end of parallel section          } // end of parallel section
1602    
1603      } else if (fs==ReducedElements || (fs==Elements && !arg.actsExpanded())) {      } else if (fs==ReducedElements || (fs==Elements && !arg.actsExpanded())) {
1604          const double w_0 = h0*h1*h2;          const double w_0 = m_dx[0]*m_dx[1]*m_dx[2];
1605  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1606          {          {
1607              vector<double> int_local(numComp, 0);              vector<double> int_local(numComp, 0);
1608  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1609              for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE2; ++k2) {              for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1610                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1611                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1612                          const double* f = arg.getSampleDataRO(INDEX3(k0, k1, k2, m_NE0, m_NE1));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(INDEX3(k0, k1, k2, m_NE[0], m_NE[1]));
1613                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1614                              int_local[i]+=f[i]*w_0;                              int_local[i]+=f[i]*w_0;
1615                          }  // end of component loop i                          }  // end of component loop i
# Line 1600  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou Line 1623  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou
1623          } // end of parallel section          } // end of parallel section
1624    
1625      } else if (fs == FaceElements && arg.actsExpanded()) {      } else if (fs == FaceElements && arg.actsExpanded()) {
1626          const double w_0 = h1*h2/4.;          const double w_0 = m_dx[1]*m_dx[2]/4.;
1627          const double w_1 = h0*h2/4.;          const double w_1 = m_dx[0]*m_dx[2]/4.;
1628          const double w_2 = h0*h1/4.;          const double w_2 = m_dx[0]*m_dx[1]/4.;
1629  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1630          {          {
1631              vector<double> int_local(numComp, 0);              vector<double> int_local(numComp, 0);
1632              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
1633  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1634                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1635                      for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1636                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1637                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1638                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1639                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
# Line 1624  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou Line 1647  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou
1647    
1648              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
1649  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1650                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1651                      for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1652                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1653                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1654                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1655                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
# Line 1640  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou Line 1663  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou
1663    
1664              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
1665  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1666                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1667                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1668                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1669                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1670                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1671                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
# Line 1656  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou Line 1679  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou
1679    
1680              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
1681  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1682                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1683                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1684                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1685                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1686                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1687                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
# Line 1672  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou Line 1695  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou
1695    
1696              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
1697  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1698                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1699                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1700                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1701                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1702                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1703                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
# Line 1688  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou Line 1711  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou
1711    
1712              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
1713  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1714                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1715                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1716                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1717                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1718                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                              const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1719                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                              const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
# Line 1708  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou Line 1731  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou
1731          } // end of parallel section          } // end of parallel section
1732    
1733      } else if (fs==ReducedFaceElements || (fs==FaceElements && !arg.actsExpanded())) {      } else if (fs==ReducedFaceElements || (fs==FaceElements && !arg.actsExpanded())) {
1734          const double w_0 = h1*h2;          const double w_0 = m_dx[1]*m_dx[2];
1735          const double w_1 = h0*h2;          const double w_1 = m_dx[0]*m_dx[2];
1736          const double w_2 = h0*h1;          const double w_2 = m_dx[0]*m_dx[1];
1737  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1738          {          {
1739              vector<double> int_local(numComp, 0);              vector<double> int_local(numComp, 0);
1740              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
1741  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1742                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1743                      for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1744                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1745                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1746                              int_local[i]+=f[i]*w_0;                              int_local[i]+=f[i]*w_0;
1747                          }  // end of component loop i                          }  // end of component loop i
# Line 1728  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou Line 1751  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou
1751    
1752              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
1753  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1754                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1755                      for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1756                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1757                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1758                              int_local[i]+=f[i]*w_0;                              int_local[i]+=f[i]*w_0;
1759                          }  // end of component loop i                          }  // end of component loop i
# Line 1740  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou Line 1763  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou
1763    
1764              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
1765  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1766                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1767                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1768                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1769                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1770                              int_local[i]+=f[i]*w_1;                              int_local[i]+=f[i]*w_1;
1771                          }  // end of component loop i                          }  // end of component loop i
# Line 1752  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou Line 1775  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou
1775    
1776              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
1777  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1778                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1779                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1780                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1781                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1782                              int_local[i]+=f[i]*w_1;                              int_local[i]+=f[i]*w_1;
1783                          }  // end of component loop i                          }  // end of component loop i
# Line 1764  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou Line 1787  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou
1787    
1788              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
1789  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1790                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1791                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1792                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1793                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1794                              int_local[i]+=f[i]*w_2;                              int_local[i]+=f[i]*w_2;
1795                          }  // end of component loop i                          }  // end of component loop i
# Line 1776  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou Line 1799  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou
1799    
1800              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
1801  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1802                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1803                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1804                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1805                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1806                              int_local[i]+=f[i]*w_2;                              int_local[i]+=f[i]*w_2;
1807                          }  // end of component loop i                          }  // end of component loop i
# Line 1796  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou Line 1819  void Brick::assembleIntegrate(vector<dou
1819  //protected  //protected
1820  dim_t Brick::insertNeighbourNodes(IndexVector& index, index_t node) const  dim_t Brick::insertNeighbourNodes(IndexVector& index, index_t node) const
1821  {  {
1822      const dim_t nDOF0 = (m_gNE0+1)/m_NX;      const dim_t nDOF0 = (m_gNE[0]+1)/m_NX[0];
1823      const dim_t nDOF1 = (m_gNE1+1)/m_NY;      const dim_t nDOF1 = (m_gNE[1]+1)/m_NX[1];
1824      const dim_t nDOF2 = (m_gNE2+1)/m_NZ;      const dim_t nDOF2 = (m_gNE[2]+1)/m_NX[2];
1825      const int x=node%nDOF0;      const int x=node%nDOF0;
1826      const int y=node%(nDOF0*nDOF1)/nDOF0;      const int y=node%(nDOF0*nDOF1)/nDOF0;
1827      const int z=node/(nDOF0*nDOF1);      const int z=node/(nDOF0*nDOF1);
# Line 1833  void Brick::nodesToDOF(escript::Data& ou Line 1856  void Brick::nodesToDOF(escript::Data& ou
1856      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();
1857      out.requireWrite();      out.requireWrite();
1858    
1859      const index_t left = (m_offset0==0 ? 0 : 1);      const index_t left = (m_offset[0]==0 ? 0 : 1);
1860      const index_t bottom = (m_offset1==0 ? 0 : 1);      const index_t bottom = (m_offset[1]==0 ? 0 : 1);
1861      const index_t front = (m_offset2==0 ? 0 : 1);      const index_t front = (m_offset[2]==0 ? 0 : 1);
1862      const dim_t nDOF0 = (m_gNE0+1)/m_NX;      const dim_t nDOF0 = (m_gNE[0]+1)/m_NX[0];
1863      const dim_t nDOF1 = (m_gNE1+1)/m_NY;      const dim_t nDOF1 = (m_gNE[1]+1)/m_NX[1];
1864      const dim_t nDOF2 = (m_gNE2+1)/m_NZ;      const dim_t nDOF2 = (m_gNE[2]+1)/m_NX[2];
1865  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel for
1866      for (index_t i=0; i<nDOF2; i++) {      for (index_t i=0; i<nDOF2; i++) {
1867          for (index_t j=0; j<nDOF1; j++) {          for (index_t j=0; j<nDOF1; j++) {
1868              for (index_t k=0; k<nDOF0; k++) {              for (index_t k=0; k<nDOF0; k++) {
1869                  const index_t n=k+left+(j+bottom)*m_N0+(i+front)*m_N0*m_N1;                  const index_t n=k+left+(j+bottom)*m_NN[0]+(i+front)*m_NN[0]*m_NN[1];
1870                  const double* src=in.getSampleDataRO(n);                  const double* src=in.getSampleDataRO(n);
1871                  copy(src, src+numComp, out.getSampleDataRW(k+j*nDOF0+i*nDOF0*nDOF1));                  copy(src, src+numComp, out.getSampleDataRW(k+j*nDOF0+i*nDOF0*nDOF1));
1872              }              }
# Line 1876  void Brick::dofToNodes(escript::Data& ou Line 1899  void Brick::dofToNodes(escript::Data& ou
1899  //private  //private
1900  void Brick::populateSampleIds()  void Brick::populateSampleIds()
1901  {  {
1902      // identifiers are ordered from left to right, bottom to top, front to back      // degrees of freedom are numbered from left to right, bottom to top, front
1903      // globally      // to back in each rank, continuing on the next rank (ranks also go
1904        // left-right, bottom-top, front-back).
1905        // This means rank 0 has id 0...n0-1, rank 1 has id n0...n1-1 etc. which
1906        // helps when writing out data rank after rank.
1907    
1908      // build node distribution vector first.      // build node distribution vector first.
1909      // rank i owns m_nodeDistribution[i+1]-nodeDistribution[i] nodes which is      // rank i owns m_nodeDistribution[i+1]-nodeDistribution[i] nodes which is
# Line 1891  void Brick::populateSampleIds() Line 1917  void Brick::populateSampleIds()
1917      m_nodeId.resize(getNumNodes());      m_nodeId.resize(getNumNodes());
1918      m_dofId.resize(numDOF);      m_dofId.resize(numDOF);
1919      m_elementId.resize(getNumElements());      m_elementId.resize(getNumElements());
1920    
1921        // populate face element counts
1922        //left
1923        if (m_offset[0]==0)
1924            m_faceCount[0]=m_NE[1]*m_NE[2];
1925        else
1926            m_faceCount[0]=0;
1927        //right
1928        if (m_mpiInfo->rank%m_NX[0]==m_NX[0]-1)
1929            m_faceCount[1]=m_NE[1]*m_NE[2];
1930        else
1931            m_faceCount[1]=0;
1932        //bottom
1933        if (m_offset[1]==0)
1934            m_faceCount[2]=m_NE[0]*m_NE[2];
1935        else
1936            m_faceCount[2]=0;
1937        //top
1938        if (m_mpiInfo->rank%(m_NX[0]*m_NX[1])/m_NX[0]==m_NX[1]-1)
1939            m_faceCount[3]=m_NE[0]*m_NE[2];
1940        else
1941            m_faceCount[3]=0;
1942        //front
1943        if (m_offset[2]==0)
1944            m_faceCount[4]=m_NE[0]*m_NE[1];
1945        else
1946            m_faceCount[4]=0;
1947        //back
1948        if (m_mpiInfo->rank/(m_NX[0]*m_NX[1])==m_NX[2]-1)
1949            m_faceCount[5]=m_NE[0]*m_NE[1];
1950        else
1951            m_faceCount[5]=0;
1952    
1953      m_faceId.resize(getNumFaceElements());      m_faceId.resize(getNumFaceElements());
1954    
1955        const index_t left = (m_offset[0]==0 ? 0 : 1);
1956        const index_t bottom = (m_offset[1]==0 ? 0 : 1);
1957        const index_t front = (m_offset[2]==0 ? 0 : 1);
1958        const dim_t nDOF0 = (m_gNE[0]+1)/m_NX[0];
1959        const dim_t nDOF1 = (m_gNE[1]+1)/m_NX[1];
1960        const dim_t nDOF2 = (m_gNE[2]+1)/m_NX[2];
1961    
1962        // the following is a compromise between efficiency and code length to
1963        // set the node id's according to the order mentioned above.
1964        // First we set all the edge and corner id's in a rather slow way since
1965        // they might or might not be owned by this rank. Next come the own
1966        // node id's which are identical to the DOF id's (simple loop), and finally
1967        // the 6 faces are set but only if required...
1968    
1969    #define globalNodeId(x,y,z) \
1970        ((m_offset[0]+x)/nDOF0)*nDOF0*nDOF1*nDOF2+(m_offset[0]+x)%nDOF0\
1971        + ((m_offset[1]+y)/nDOF1)*nDOF0*nDOF1*nDOF2*m_NX[0]+((m_offset[1]+y)%nDOF1)*nDOF0\
1972        + ((m_offset[2]+z)/nDOF2)*nDOF0*nDOF1*nDOF2*m_NX[0]*m_NX[1]+((m_offset[2]+z)%nDOF2)*nDOF0*nDOF1
1973    
1974  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1975      {      {
1976            // set edge id's
1977            // edges in x-direction, including corners
1978  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1979          // nodes          for (dim_t i=0; i<m_NN[0]; i++) {
1980          for (dim_t i2=0; i2<m_N2; i2++) {              m_nodeId[i] = globalNodeId(i, 0, 0); // LF
1981              for (dim_t i1=0; i1<m_N1; i1++) {              m_nodeId[m_NN[0]*(m_NN[1]-1)+i] = globalNodeId(i, m_NN[1]-1, 0); // UF
1982                  for (dim_t i0=0; i0<m_N0; i0++) {              m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1)+i] = globalNodeId(i, 0, m_NN[2]-1); // LB
1983                      m_nodeId[i0+i1*m_N0+i2*m_N0*m_N1] =              m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*m_NN[2]-m_NN[0]+i] = globalNodeId(i, m_NN[1]-1, m_NN[2]-1); // UB
1984                          (m_offset2+i2)*(m_gNE0+1)*(m_gNE1+1)          }
1985                          +(m_offset1+i1)*(m_gNE0+1)          // edges in y-direction, without corners
1986                          +m_offset0+i0;  #pragma omp for nowait
1987            for (dim_t i=1; i<m_NN[1]-1; i++) {
1988                m_nodeId[m_NN[0]*i] = globalNodeId(0, i, 0); // FL
1989                m_nodeId[m_NN[0]*(i+1)-1] = globalNodeId(m_NN[0]-1, i, 0); // FR
1990                m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1)+m_NN[0]*i] = globalNodeId(0, i, m_NN[2]-1); // BL
1991                m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1)+m_NN[0]*(i+1)-1] = globalNodeId(m_NN[0]-1, i, m_NN[2]-1); // BR
1992            }
1993            // edges in z-direction, without corners
1994    #pragma omp for
1995            for (dim_t i=1; i<m_NN[2]-1; i++) {
1996                m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*i] = globalNodeId(0, 0, i); // LL
1997                m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*i+m_NN[0]-1] = globalNodeId(m_NN[0]-1, 0, i); // LR
1998                m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*(i+1)-m_NN[0]] = globalNodeId(0, m_NN[1]-1, i); // UL
1999                m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*(i+1)-1] = globalNodeId(m_NN[0]-1, m_NN[1]-1, i); // UR
2000            }
2001            // implicit barrier here because some node IDs will be overwritten
2002            // below
2003    
2004            // populate degrees of freedom and own nodes (identical id)
2005    #pragma omp for nowait
2006            for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++) {
2007                for (dim_t j=0; j<nDOF1; j++) {
2008                    for (dim_t k=0; k<nDOF0; k++) {
2009                        const index_t nodeIdx=k+left+(j+bottom)*m_NN[0]+(i+front)*m_NN[0]*m_NN[1];
2010                        const index_t dofIdx=k+j*nDOF0+i*nDOF0*nDOF1;
2011                        m_dofId[dofIdx] = m_nodeId[nodeIdx]
2012                            = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank]+dofIdx;
2013                  }                  }
2014              }              }
2015          }          }
2016    
2017          // degrees of freedom          // populate the rest of the nodes (shared with other ranks)
2018            if (m_faceCount[0]==0) { // left plane
2019  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2020          for (dim_t k=0; k<numDOF; k++)              for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++) {
2021              m_dofId[k] = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank]+k;                  for (dim_t j=0; j<nDOF1; j++) {
2022                        const index_t nodeIdx=(j+bottom)*m_NN[0]+(i+front)*m_NN[0]*m_NN[1];
2023                        const index_t dofId=(j+1)*nDOF0-1+i*nDOF0*nDOF1;
2024                        m_nodeId[nodeIdx]
2025                            = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank-1]+dofId;
2026                    }
2027                }
2028            }
2029            if (m_faceCount[1]==0) { // right plane
2030    #pragma omp for nowait
2031                for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++) {
2032                    for (dim_t j=0; j<nDOF1; j++) {
2033                        const index_t nodeIdx=(j+bottom+1)*m_NN[0]-1+(i+front)*m_NN[0]*m_NN[1];
2034                        const index_t dofId=j*nDOF0+i*nDOF0*nDOF1;
2035                        m_nodeId[nodeIdx]
2036                            = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank+1]+dofId;
2037                    }
2038                }
2039            }
2040            if (m_faceCount[2]==0) { // bottom plane
2041    #pragma omp for nowait
2042                for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++) {
2043                    for (dim_t k=0; k<nDOF0; k++) {
2044                        const index_t nodeIdx=k+left+(i+front)*m_NN[0]*m_NN[1];
2045                        const index_t dofId=nDOF0*(nDOF1-1)+k+i*nDOF0*nDOF1;
2046                        m_nodeId[nodeIdx]
2047                            = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank-m_NX[0]]+dofId;
2048                    }
2049                }
2050            }
2051            if (m_faceCount[3]==0) { // top plane
2052    #pragma omp for nowait
2053                for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++) {
2054                    for (dim_t k=0; k<nDOF0; k++) {
2055                        const index_t nodeIdx=k+left+(i+front)*m_NN[0]*m_NN[1]+m_NN[0]*(m_NN[1]-1);
2056                        const index_t dofId=k+i*nDOF0*nDOF1;
2057                        m_nodeId[nodeIdx]
2058                            = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank+m_NX[0]]+dofId;
2059                    }
2060                }
2061            }
2062            if (m_faceCount[4]==0) { // front plane
2063    #pragma omp for nowait
2064                for (dim_t j=0; j<nDOF1; j++) {
2065                    for (dim_t k=0; k<nDOF0; k++) {
2066                        const index_t nodeIdx=k+left+(j+bottom)*m_NN[0];
2067                        const index_t dofId=k+j*nDOF0+nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);
2068                        m_nodeId[nodeIdx]
2069                            = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank-m_NX[0]*m_NX[1]]+dofId;
2070                    }
2071                }
2072            }
2073            if (m_faceCount[5]==0) { // back plane
2074    #pragma omp for nowait
2075                for (dim_t j=0; j<nDOF1; j++) {
2076                    for (dim_t k=0; k<nDOF0; k++) {
2077                        const index_t nodeIdx=k+left+(j+bottom)*m_NN[0]+m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1);
2078                        const index_t dofId=k+j*nDOF0;
2079                        m_nodeId[nodeIdx]
2080                            = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank+m_NX[0]*m_NX[1]]+dofId;
2081                    }
2082                }
2083            }
2084    
2085          // elements          // populate element id's
2086  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2087          for (dim_t i2=0; i2<m_NE2; i2++) {          for (dim_t i2=0; i2<m_NE[2]; i2++) {
2088              for (dim_t i1=0; i1<m_NE1; i1++) {              for (dim_t i1=0; i1<m_NE[1]; i1++) {
2089                  for (dim_t i0=0; i0<m_NE0; i0++) {                  for (dim_t i0=0; i0<m_NE[0]; i0++) {
2090                      m_elementId[i0+i1*m_NE0+i2*m_NE0*m_NE1] =                      m_elementId[i0+i1*m_NE[0]+i2*m_NE[0]*m_NE[1]] =
2091                          (m_offset2+i2)*m_gNE0*m_gNE1                          (m_offset[2]+i2)*m_gNE[0]*m_gNE[1]
2092                          +(m_offset1+i1)*m_gNE0                          +(m_offset[1]+i1)*m_gNE[0]
2093                          +m_offset0+i0;                          +m_offset[0]+i0;
2094                  }                  }
2095              }              }
2096          }          }
# Line 1932  void Brick::populateSampleIds() Line 2101  void Brick::populateSampleIds()
2101              m_faceId[k]=k;              m_faceId[k]=k;
2102      } // end parallel section      } // end parallel section
2103    
2104    #undef globalNodeId
2105    
2106      m_nodeTags.assign(getNumNodes(), 0);      m_nodeTags.assign(getNumNodes(), 0);
2107      updateTagsInUse(Nodes);      updateTagsInUse(Nodes);
2108    
# Line 1939  void Brick::populateSampleIds() Line 2110  void Brick::populateSampleIds()
2110      updateTagsInUse(Elements);      updateTagsInUse(Elements);
2111    
2112      // generate face offset vector and set face tags      // generate face offset vector and set face tags
     const IndexVector facesPerEdge = getNumFacesPerBoundary();  
2113      const index_t LEFT=1, RIGHT=2, BOTTOM=10, TOP=20, FRONT=100, BACK=200;      const index_t LEFT=1, RIGHT=2, BOTTOM=10, TOP=20, FRONT=100, BACK=200;
2114      const index_t faceTag[] = { LEFT, RIGHT, BOTTOM, TOP, FRONT, BACK };      const index_t faceTag[] = { LEFT, RIGHT, BOTTOM, TOP, FRONT, BACK };
2115      m_faceOffset.assign(facesPerEdge.size(), -1);      m_faceOffset.assign(6, -1);
2116      m_faceTags.clear();      m_faceTags.clear();
2117      index_t offset=0;      index_t offset=0;
2118      for (size_t i=0; i<facesPerEdge.size(); i++) {      for (size_t i=0; i<6; i++) {
2119          if (facesPerEdge[i]>0) {          if (m_faceCount[i]>0) {
2120              m_faceOffset[i]=offset;              m_faceOffset[i]=offset;
2121              offset+=facesPerEdge[i];              offset+=m_faceCount[i];
2122              m_faceTags.insert(m_faceTags.end(), facesPerEdge[i], faceTag[i]);              m_faceTags.insert(m_faceTags.end(), m_faceCount[i], faceTag[i]);
2123          }          }
2124      }      }
2125      setTagMap("left", LEFT);      setTagMap("left", LEFT);
# Line 1964  void Brick::populateSampleIds() Line 2134  void Brick::populateSampleIds()
2134  //private  //private
2135  void Brick::createPattern()  void Brick::createPattern()
2136  {  {
2137      const dim_t nDOF0 = (m_gNE0+1)/m_NX;      const dim_t nDOF0 = (m_gNE[0]+1)/m_NX[0];
2138      const dim_t nDOF1 = (m_gNE1+1)/m_NY;      const dim_t nDOF1 = (m_gNE[1]+1)/m_NX[1];
2139      const dim_t nDOF2 = (m_gNE2+1)/m_NZ;      const dim_t nDOF2 = (m_gNE[2]+1)/m_NX[2];
2140      const index_t left = (m_offset0==0 ? 0 : 1);      const index_t left = (m_offset[0]==0 ? 0 : 1);
2141      const index_t bottom = (m_offset1==0 ? 0 : 1);      const index_t bottom = (m_offset[1]==0 ? 0 : 1);
2142      const index_t front = (m_offset2==0 ? 0 : 1);      const index_t front = (m_offset[2]==0 ? 0 : 1);
2143    
2144      // populate node->DOF mapping with own degrees of freedom.      // populate node->DOF mapping with own degrees of freedom.
2145      // The rest is assigned in the loop further down      // The rest is assigned in the loop further down
# Line 1978  void Brick::createPattern() Line 2148  void Brick::createPattern()
2148      for (index_t i=front; i<front+nDOF2; i++) {      for (index_t i=front; i<front+nDOF2; i++) {
2149          for (index_t j=bottom; j<bottom+nDOF1; j++) {          for (index_t j=bottom; j<bottom+nDOF1; j++) {
2150              for (index_t k=left; k<left+nDOF0; k++) {              for (index_t k=left; k<left+nDOF0; k++) {
2151                  m_dofMap[i*m_N0*m_N1+j*m_N0+k]=(i-front)*nDOF0*nDOF1+(j-bottom)*nDOF0+k-left;                  m_dofMap[i*m_NN[0]*m_NN[1]+j*m_NN[0]+k]=(i-front)*nDOF0*nDOF1+(j-bottom)*nDOF0+k-left;
2152              }              }
2153          }          }
2154      }      }
# Line 1992  void Brick::createPattern() Line 2162  void Brick::createPattern()
2162      IndexVector offsetInShared(1,0);      IndexVector offsetInShared(1,0);
2163      IndexVector sendShared, recvShared;      IndexVector sendShared, recvShared;
2164      int numShared=0;      int numShared=0;
2165      const int x=m_mpiInfo->rank%m_NX;      const int x=m_mpiInfo->rank%m_NX[0];
2166      const int y=m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX;      const int y=m_mpiInfo->rank%(m_NX[0]*m_NX[1])/m_NX[0];
2167      const int z=m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY);      const int z=m_mpiInfo->rank/(m_NX[0]*m_NX[1]);
2168      for (int i2=-1; i2<2; i2++) {      for (int i2=-1; i2<2; i2++) {
2169          for (int i1=-1; i1<2; i1++) {          for (int i1=-1; i1<2; i1++) {
2170              for (int i0=-1; i0<2; i0++) {              for (int i0=-1; i0<2; i0++) {
# Line 2005  void Brick::createPattern() Line 2175  void Brick::createPattern()
2175                  const int nx=x+i0;                  const int nx=x+i0;
2176                  const int ny=y+i1;                  const int ny=y+i1;
2177                  const int nz=z+i2;                  const int nz=z+i2;
2178                  if (nx>=0 && ny>=0 && nz>=0 && nx<m_NX && ny<m_NY && nz<m_NZ) {                  if (nx>=0 && ny>=0 && nz>=0 && nx<m_NX[0] && ny<m_NX[1] && nz<m_NX[2]) {
2179                      neighbour.push_back(nz*m_NX*m_NY+ny*m_NX+nx);                      neighbour.push_back(nz*m_NX[0]*m_NX[1]+ny*m_NX[0]+nx);
2180                      if (i0==0 && i1==0) {                      if (i0==0 && i1==0) {
2181                          // sharing front or back plane                          // sharing front or back plane
2182                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF0*nDOF1);                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF0*nDOF1);
2183                          for (dim_t i=0; i<nDOF1; i++) {                          for (dim_t i=0; i<nDOF1; i++) {
2184                              const int firstDOF=(i2==-1 ? i*nDOF0                              const int firstDOF=(i2==-1 ? i*nDOF0
2185                                      : i*nDOF0 + nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1));                                      : i*nDOF0 + nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1));
2186                              const int firstNode=(i2==-1 ? left+(i+bottom)*m_N0                              const int firstNode=(i2==-1 ? left+(i+bottom)*m_NN[0]
2187                                      : left+(i+bottom)*m_N0+m_N0*m_N1*(m_N2-1));                                      : left+(i+bottom)*m_NN[0]+m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1));
2188                              for (dim_t j=0; j<nDOF0; j++, numShared++) {                              for (dim_t j=0; j<nDOF0; j++, numShared++) {
2189                                  sendShared.push_back(firstDOF+j);                                  sendShared.push_back(firstDOF+j);
2190                                  recvShared.push_back(numDOF+numShared);                                  recvShared.push_back(numDOF+numShared);
# Line 2047  void Brick::createPattern() Line 2217  void Brick::createPattern()
2217                              const int firstDOF=(i1==-1 ? i*nDOF0*nDOF1                              const int firstDOF=(i1==-1 ? i*nDOF0*nDOF1
2218                                      : nDOF0*((i+1)*nDOF1-1));                                      : nDOF0*((i+1)*nDOF1-1));
2219                              const int firstNode=(i1==-1 ?                              const int firstNode=(i1==-1 ?
2220                                      left+(i+front)*m_N0*m_N1                                      left+(i+front)*m_NN[0]*m_NN[1]
2221                                      : left+m_N0*((i+1+front)*m_N1-1));                                      : left+m_NN[0]*((i+1+front)*m_NN[1]-1));
2222                              for (dim_t j=0; j<nDOF0; j++, numShared++) {                              for (dim_t j=0; j<nDOF0; j++, numShared++) {
2223                                  sendShared.push_back(firstDOF+j);                                  sendShared.push_back(firstDOF+j);
2224                                  recvShared.push_back(numDOF+numShared);                                  recvShared.push_back(numDOF+numShared);
# Line 2081  void Brick::createPattern() Line 2251  void Brick::createPattern()
2251                              const int firstDOF=(i0==-1 ? i*nDOF0*nDOF1                              const int firstDOF=(i0==-1 ? i*nDOF0*nDOF1
2252                                      : nDOF0*(1+i*nDOF1)-1);                                      : nDOF0*(1+i*nDOF1)-1);
2253                              const int firstNode=(i0==-1 ?                              const int firstNode=(i0==-1 ?
2254                                      (bottom+(i+front)*m_N1)*m_N0                                      (bottom+(i+front)*m_NN[1])*m_NN[0]
2255                                      : (bottom+1+(i+front)*m_N1)*m_N0-1);                                      : (bottom+1+(i+front)*m_NN[1])*m_NN[0]-1);
2256                              for (dim_t j=0; j<nDOF1; j++, numShared++) {                              for (dim_t j=0; j<nDOF1; j++, numShared++) {
2257                                  sendShared.push_back(firstDOF+j*nDOF0);                                  sendShared.push_back(firstDOF+j*nDOF0);
2258                                  recvShared.push_back(numDOF+numShared);                                  recvShared.push_back(numDOF+numShared);
# Line 2105  void Brick::createPattern() Line 2275  void Brick::createPattern()
2275                                      if (i<nDOF2-1)                                      if (i<nDOF2-1)
2276                                          colIndices[firstDOF+(j+1)*nDOF0+nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);                                          colIndices[firstDOF+(j+1)*nDOF0+nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);
2277                                  }                                  }
2278                                  m_dofMap[firstNode+j*m_N0]=numDOF+numShared;                                  m_dofMap[firstNode+j*m_NN[0]]=numDOF+numShared;
2279                              }                              }
2280                          }                          }
2281                      } else if (i0==0) {                      } else if (i0==0) {
# Line 2113  void Brick::createPattern() Line 2283  void Brick::createPattern()
2283                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF0);                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF0);
2284                          const int firstDOF=(i1+1)/2*nDOF0*(nDOF1-1)                          const int firstDOF=(i1+1)/2*nDOF0*(nDOF1-1)
2285                                             +(i2+1)/2*nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);                                             +(i2+1)/2*nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);
2286                          const int firstNode=left+(i1+1)/2*m_N0*(m_N1-1)                          const int firstNode=left+(i1+1)/2*m_NN[0]*(m_NN[1]-1)
2287                                              +(i2+1)/2*m_N0*m_N1*(m_N2-1);                                              +(i2+1)/2*m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1);
2288                          for (dim_t i=0; i<nDOF0; i++, numShared++) {                          for (dim_t i=0; i<nDOF0; i++, numShared++) {
2289                              sendShared.push_back(firstDOF+i);                              sendShared.push_back(firstDOF+i);
2290                              recvShared.push_back(numDOF+numShared);                              recvShared.push_back(numDOF+numShared);
# Line 2130  void Brick::createPattern() Line 2300  void Brick::createPattern()
2300                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF1);                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF1);
2301                          const int firstDOF=(i0+1)/2*(nDOF0-1)                          const int firstDOF=(i0+1)/2*(nDOF0-1)
2302                                             +(i2+1)/2*nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);                                             +(i2+1)/2*nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);
2303                          const int firstNode=bottom*m_N0                          const int firstNode=bottom*m_NN[0]
2304                                              +(i0+1)/2*(m_N0-1)                                              +(i0+1)/2*(m_NN[0]-1)
2305                                              +(i2+1)/2*m_N0*m_N1*(m_N2-1);                                              +(i2+1)/2*m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1);
2306                          for (dim_t i=0; i<nDOF1; i++, numShared++) {                          for (dim_t i=0; i<nDOF1; i++, numShared++) {
2307                              sendShared.push_back(firstDOF+i*nDOF0);                              sendShared.push_back(firstDOF+i*nDOF0);
2308                              recvShared.push_back(numDOF+numShared);                              recvShared.push_back(numDOF+numShared);
# Line 2141  void Brick::createPattern() Line 2311  void Brick::createPattern()
2311                              colIndices[firstDOF+i*nDOF0].push_back(numShared);                              colIndices[firstDOF+i*nDOF0].push_back(numShared);
2312                              if (i<nDOF1-1)                              if (i<nDOF1-1)
2313                                  colIndices[firstDOF+(i+1)*nDOF0].push_back(numShared);                                  colIndices[firstDOF+(i+1)*nDOF0].push_back(numShared);
2314                              m_dofMap[firstNode+i*m_N0]=numDOF+numShared;                              m_dofMap[firstNode+i*m_NN[0]]=numDOF+numShared;
2315                          }                          }
2316                      } else if (i2==0) {                      } else if (i2==0) {
2317                          // sharing an edge in z direction                          // sharing an edge in z direction
2318                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF2);                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF2);
2319                          const int firstDOF=(i0+1)/2*(nDOF0-1)                          const int firstDOF=(i0+1)/2*(nDOF0-1)
2320                                             +(i1+1)/2*nDOF0*(nDOF1-1);                                             +(i1+1)/2*nDOF0*(nDOF1-1);
2321                          const int firstNode=front*m_N0*m_N1                          const int firstNode=front*m_NN[0]*m_NN[1]
2322                                              +(i0+1)/2*(m_N0-1)                                              +(i0+1)/2*(m_NN[0]-1)
2323                                              +(i1+1)/2*m_N0*(m_N1-1);                                              +(i1+1)/2*m_NN[0]*(m_NN[1]-1);
2324                          for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++, numShared++) {                          for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++, numShared++) {
2325                              sendShared.push_back(firstDOF+i*nDOF0*nDOF1);                              sendShared.push_back(firstDOF+i*nDOF0*nDOF1);
2326                              recvShared.push_back(numDOF+numShared);                              recvShared.push_back(numDOF+numShared);
# Line 2159  void Brick::createPattern() Line 2329  void Brick::createPattern()
2329                              colIndices[firstDOF+i*nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);                              colIndices[firstDOF+i*nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);
2330                              if (i<nDOF2-1)                              if (i<nDOF2-1)
2331                                  colIndices[firstDOF+(i+1)*nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);                                  colIndices[firstDOF+(i+1)*nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);
2332                              m_dofMap[firstNode+i*m_N0*m_N1]=numDOF+numShared;                              m_dofMap[firstNode+i*m_NN[0]*m_NN[1]]=numDOF+numShared;
2333                          }                          }
2334                      } else {                      } else {
2335                          // sharing a node                          // sharing a node
2336                          const int dof=(i0+1)/2*(nDOF0-1)                          const int dof=(i0+1)/2*(nDOF0-1)
2337                                        +(i1+1)/2*nDOF0*(nDOF1-1)                                        +(i1+1)/2*nDOF0*(nDOF1-1)
2338                                        +(i2+1)/2*nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);                                        +(i2+1)/2*nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);
2339                          const int node=(i0+1)/2*(m_N0-1)                          const int node=(i0+1)/2*(m_NN[0]-1)
2340                                         +(i1+1)/2*m_N0*(m_N1-1)                                         +(i1+1)/2*m_NN[0]*(m_NN[1]-1)
2341                                         +(i2+1)/2*m_N0*m_N1*(m_N2-1);                                         +(i2+1)/2*m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1);
2342                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+1);                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+1);
2343                          sendShared.push_back(dof);                          sendShared.push_back(dof);
2344                          recvShared.push_back(numDOF+numShared);                          recvShared.push_back(numDOF+numShared);
# Line 2279  void Brick::addToMatrixAndRHS(Paso_Syste Line 2449  void Brick::addToMatrixAndRHS(Paso_Syste
2449      IndexVector rowIndex;      IndexVector rowIndex;
2450      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode]);      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode]);
2451      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+1]);      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+1]);
2452      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_N0]);      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_NN[0]]);
2453      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_N0+1]);      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_NN[0]+1]);
2454      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_N0*m_N1]);      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_NN[0]*m_NN[1]]);
2455      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_N0*m_N1+1]);      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_NN[0]*m_NN[1]+1]);
2456      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_N0*(m_N1+1)]);      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_NN[0]*(m_NN[1]+1)]);
2457      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_N0*(m_N1+1)+1]);      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_NN[0]*(m_NN[1]+1)+1]);
2458      if (addF) {      if (addF) {
2459          double *F_p=F.getSampleDataRW(0);          double *F_p=F.getSampleDataRW(0);
2460          for (index_t i=0; i<rowIndex.size(); i++) {          for (index_t i=0; i<rowIndex.size(); i++) {
# Line 2307  void Brick::interpolateNodesOnElements(e Line 2477  void Brick::interpolateNodesOnElements(e
2477      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();
2478      if (reduced) {      if (reduced) {
2479          out.requireWrite();          out.requireWrite();
         const double c0 = .125;  
2480  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
2481          {          {
2482              vector<double> f_000(numComp);              vector<double> f_000(numComp);
# Line 2319  void Brick::interpolateNodesOnElements(e Line 2488  void Brick::interpolateNodesOnElements(e
2488              vector<double> f_110(numComp);              vector<double> f_110(numComp);
2489              vector<double> f_111(numComp);              vector<double> f_111(numComp);
2490  #pragma omp for  #pragma omp for
2491              for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {              for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2492                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2493                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2494                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2495                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2496                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2497                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2498                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2499                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2500                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2501                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2502                          double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE0,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE[0],m_NE[1]));
2503                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2504                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_000[i] + f_001[i] + f_010[i] + f_011[i] + f_100[i] + f_101[i] + f_110[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_000[i] + f_001[i] + f_010[i] + f_011[i] + f_100[i] + f_101[i] + f_110[i] + f_111[i])/8;
2505                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
2506                      } // end of k0 loop                      } // end of k0 loop
2507                  } // end of k1 loop                  } // end of k1 loop
# Line 2355  void Brick::interpolateNodesOnElements(e Line 2524  void Brick::interpolateNodesOnElements(e
2524              vector<double> f_110(numComp);              vector<double> f_110(numComp);
2525              vector<double> f_111(numComp);              vector<double> f_111(numComp);
2526  #pragma omp for  #pragma omp for
2527              for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {              for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2528                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2529                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2530                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2531                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2532                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2533                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2534                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2535                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2536                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2537                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2538                          double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE0,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE[0],m_NE[1]));
2539                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2540                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c3 + f_111[i]*c0 + c2*(f_001[i] + f_010[i] + f_100[i]) + c1*(f_011[i] + f_101[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c3 + f_111[i]*c0 + c2*(f_001[i] + f_010[i] + f_100[i]) + c1*(f_011[i] + f_101[i] + f_110[i]);
2541                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_011[i]*c0 + f_100[i]*c3 + c2*(f_000[i] + f_101[i] + f_110[i]) + c1*(f_001[i] + f_010[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_011[i]*c0 + f_100[i]*c3 + c2*(f_000[i] + f_101[i] + f_110[i]) + c1*(f_001[i] + f_010[i] + f_111[i]);
# Line 2391  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr Line 2560  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr
2560      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();
2561      if (reduced) {      if (reduced) {
2562          out.requireWrite();          out.requireWrite();
         const double c0 = .25;  
2563  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
2564          {          {
2565              vector<double> f_000(numComp);              vector<double> f_000(numComp);
# Line 2404  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr Line 2572  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr
2572              vector<double> f_111(numComp);              vector<double> f_111(numComp);
2573              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
2574  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2575                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2576                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2577                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2578                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2579                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2580                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2581                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
2582                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2583                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_000[i] + f_001[i] + f_010[i] + f_011[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_000[i] + f_001[i] + f_010[i] + f_011[i])/4;
2584                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
2585                      } // end of k1 loop                      } // end of k1 loop
2586                  } // end of k2 loop                  } // end of k2 loop
2587              } // end of face 0              } // end of face 0
2588              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
2589  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2590                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2591                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2592                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2593                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2594                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2595                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2596                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
2597                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2598                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_100[i] + f_101[i] + f_110[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_100[i] + f_101[i] + f_110[i] + f_111[i])/4;
2599                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
2600                      } // end of k1 loop                      } // end of k1 loop
2601                  } // end of k2 loop                  } // end of k2 loop
2602              } // end of face 1              } // end of face 1
2603              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
2604  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2605                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2606                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2607                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2608                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2609                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2610                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2611                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
2612                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2613                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_000[i] + f_001[i] + f_100[i] + f_101[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_000[i] + f_001[i] + f_100[i] + f_101[i])/4;
2614                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
2615                      } // end of k0 loop                      } // end of k0 loop
2616                  } // end of k2 loop                  } // end of k2 loop
2617              } // end of face 2              } // end of face 2
2618              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
2619  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2620                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2621                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2622                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2623                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2624                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2625                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2626                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
2627                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2628                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_010[i] + f_011[i] + f_110[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_010[i] + f_011[i] + f_110[i] + f_111[i])/4;
2629                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
2630                      } // end of k0 loop                      } // end of k0 loop
2631                  } // end of k2 loop                  } // end of k2 loop
2632              } // end of face 3              } // end of face 3
2633              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
2634  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2635                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2636                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2637                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2638                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2639                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2640                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2641                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
2642                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2643                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_000[i] + f_010[i] + f_100[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_000[i] + f_010[i] + f_100[i] + f_110[i])/4;
2644                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
2645                      } // end of k0 loop                      } // end of k0 loop
2646                  } // end of k1 loop                  } // end of k1 loop
2647              } // end of face 4              } // end of face 4
2648              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
2649  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2650                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2651                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2652                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2653                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2654                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2655                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2656                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
2657                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2658                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_001[i] + f_011[i] + f_101[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_001[i] + f_011[i] + f_101[i] + f_111[i])/4;
2659                          } // end of component loop i                          } // end of component loop i
2660                      } // end of k0 loop                      } // end of k0 loop
2661                  } // end of k1 loop                  } // end of k1 loop
# Line 2510  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr Line 2678  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr
2678              vector<double> f_111(numComp);              vector<double> f_111(numComp);
2679              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
2680  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2681                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2682                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2683                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2684                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2685                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2686                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2687                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
2688                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2689                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c2 + f_011[i]*c0 + c1*(f_001[i] + f_010[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c2 + f_011[i]*c0 + c1*(f_001[i] + f_010[i]);
2690                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_001[i]*c0 + f_010[i]*c2 + c1*(f_000[i] + f_011[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_001[i]*c0 + f_010[i]*c2 + c1*(f_000[i] + f_011[i]);
# Line 2528  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr Line 2696  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr
2696              } // end of face 0              } // end of face 0
2697              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
2698  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2699                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2700                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2701                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2702                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2703                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2704                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2705                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
2706                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2707                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_100[i]*c2 + f_111[i]*c0 + c1*(f_101[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_100[i]*c2 + f_111[i]*c0 + c1*(f_101[i] + f_110[i]);
2708                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_101[i]*c0 + f_110[i]*c2 + c1*(f_100[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_101[i]*c0 + f_110[i]*c2 + c1*(f_100[i] + f_111[i]);
# Line 2546  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr Line 2714  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr
2714              } // end of face 1              } // end of face 1
2715              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
2716  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2717                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2718                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2719                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2720                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2721                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2722                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2723                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
2724                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2725                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c2 + f_101[i]*c0 + c1*(f_001[i] + f_100[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c2 + f_101[i]*c0 + c1*(f_001[i] + f_100[i]);
2726                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_001[i]*c0 + f_100[i]*c2 + c1*(f_000[i] + f_101[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_001[i]*c0 + f_100[i]*c2 + c1*(f_000[i] + f_101[i]);
# Line 2564  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr Line 2732  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr
2732              } // end of face 2              } // end of face 2
2733              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
2734  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2735                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2736                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2737                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2738                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2739                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2740                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2741                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
2742                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2743                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_010[i]*c2 + f_111[i]*c0 + c1*(f_011[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_010[i]*c2 + f_111[i]*c0 + c1*(f_011[i] + f_110[i]);
2744                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_011[i]*c0 + f_110[i]*c2 + c1*(f_010[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_011[i]*c0 + f_110[i]*c2 + c1*(f_010[i] + f_111[i]);
# Line 2582  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr Line 2750  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr
2750              } // end of face 3              } // end of face 3
2751              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
2752  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2753                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2754                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2755                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2756                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2757                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2758                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2759                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
2760                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2761                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c2 + f_110[i]*c0 + c1*(f_010[i] + f_100[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c2 + f_110[i]*c0 + c1*(f_010[i] + f_100[i]);
2762                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_010[i]*c0 + f_100[i]*c2 + c1*(f_000[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_010[i]*c0 + f_100[i]*c2 + c1*(f_000[i] + f_110[i]);
# Line 2600  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr Line 2768  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr
2768              } // end of face 4              } // end of face 4
2769              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
2770  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2771                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2772                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2773                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2774                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2775                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2776                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1)), numComp*sizeof(double));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2777                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
2778                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2779                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_001[i]*c2 + f_111[i]*c0 + c1*(f_011[i] + f_101[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_001[i]*c2 + f_111[i]*c0 + c1*(f_011[i] + f_101[i]);
2780                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_011[i]*c0 + f_101[i]*c2 + c1*(f_001[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_011[i]*c0 + f_101[i]*c2 + c1*(f_001[i] + f_111[i]);
# Line 2626  void Brick::assemblePDESingle(Paso_Syste Line 2794  void Brick::assemblePDESingle(Paso_Syste
2794          const escript::Data& C, const escript::Data& D,          const escript::Data& C, const escript::Data& D,
2795          const escript::Data& X, const escript::Data& Y) const          const escript::Data& X, const escript::Data& Y) const
2796  {  {
2797      const double h0 = m_l0/m_gNE0;      /* GENERATOR SNIP_PDE_SINGLE_PRE TOP */
2798      const double h1 = m_l1/m_gNE1;      const double w0 = 0.00093037914038584273081*m_dx[1]*m_dx[2]/m_dx[0];
2799      const double h2 = m_l2/m_gNE2;      const double w1 = 0.00093037914038584273081*m_dx[2];
2800      const double w0 = 0.0009303791403858427308*h1*h2/h0;      const double w2 = -0.000249294339321148701*m_dx[1];
2801      const double w1 = 0.0009303791403858427308*h2;      const double w3 = 0.00093037914038584273081*m_dx[0]*m_dx[2]/m_dx[1];
2802      const double w2 = -0.00024929433932114870101*h1;      const double w4 = -0.000249294339321148701*m_dx[0];
2803      const double w3 = 0.0009303791403858427308*h0*h2/h1;      const double w5 = 0.00093037914038584273081*m_dx[1];
2804      const double w4 = -0.00024929433932114870101*h0;      const double w6 = 0.00093037914038584273081*m_dx[0];
2805      const double w5 = 0.0009303791403858427308*h1;      const double w7 = -0.000249294339321148701*m_dx[0]*m_dx[1]/m_dx[2];
2806      const double w6 = 0.0009303791403858427308*h0;      const double w8 = 0.0034722222222222222222*m_dx[2];
2807      const double w7 = -0.00024929433932114870101*h0*h1/h2;      const double w9 = 0.012958509748503046158*m_dx[0]*m_dx[2]/m_dx[1];
2808      const double w8 = 0.0034722222222222222222*h2;      const double w10 = -0.0034722222222222222222*m_dx[0];
2809      const double w9 = -0.0009303791403858427308*h1;      const double w11 = 0.0034722222222222222222*m_dx[1];
2810      const double w10 = 0.012958509748503046158*h0*h2/h1;      const double w12 = 0.012958509748503046158*m_dx[0];
2811      const double w11 = -0.0034722222222222222222*h0;      const double w13 = -0.0034722222222222222222*m_dx[0]*m_dx[1]/m_dx[2];
2812      const double w12 = 0.0034722222222222222222*h1;      const double w14 = 0.012958509748503046158*m_dx[1]*m_dx[2]/m_dx[0];
2813      const double w13 = 0.012958509748503046158*h0;      const double w15 = 0.012958509748503046158*m_dx[1];
2814      const double w14 = -0.0034722222222222222222*h0*h1/h2;      const double w16 = 0.012958509748503046158*m_dx[2];
2815      const double w15 = 0.012958509748503046158*h1*h2/h0;      const double w17 = 0.04836181677178996241*m_dx[1];
2816      const double w16 = -0.0034722222222222222222*h1;      const double w18 = 0.04836181677178996241*m_dx[0];
2817      const double w17 = -0.0009303791403858427308*h0;      const double w19 = -0.04836181677178996241*m_dx[0]*m_dx[1]/m_dx[2];
2818      const double w18 = 0.012958509748503046158*h1;      const double w20 = -0.000249294339321148701*m_dx[2];
2819      const double w19 = 0.0034722222222222222222*h0;      const double w21 = -0.04836181677178996241*m_dx[2];
2820      const double w20 = 0.012958509748503046158*h2;      const double w22 = -0.0034722222222222222222*m_dx[0]*m_dx[2]/m_dx[1];
2821      const double w21 = -0.012958509748503046158*h1;      const double w23 = 0.00093037914038584273081*m_dx[0]*m_dx[1]/m_dx[2];
2822      const double w22 = -0.012958509748503046158*h0;      const double w24 = -0.04836181677178996241*m_dx[0]*m_dx[2]/m_dx[1];
2823      const double w23 = 0.04836181677178996241*h1;      const double w25 = 0.012958509748503046158*m_dx[0]*m_dx[1]/m_dx[2];
2824      const double w24 = 0.04836181677178996241*h0;      const double w26 = -0.000249294339321148701*m_dx[0]*m_dx[2]/m_dx[1];
2825      const double w25 = -0.04836181677178996241*h0*h1/h2;      const double w27 = -0.0034722222222222222222*m_dx[1]*m_dx[2]/m_dx[0];
2826      const double w26 = 0.00024929433932114870101*h1;      const double w28 = -0.000249294339321148701*m_dx[1]*m_dx[2]/m_dx[0];
2827      const double w27 = 0.00024929433932114870101*h0;      const double w29 = -0.04836181677178996241*m_dx[1]*m_dx[2]/m_dx[0];
2828      const double w28 = -0.04836181677178996241*h1;      const double w30 = 0.0001966122466178319053*m_dx[1]*m_dx[2];
2829      const double w29 = -0.04836181677178996241*h0;      const double w31 = 0.0001966122466178319053*m_dx[0]*m_dx[2];
2830      const double w30 = -0.0009303791403858427308*h1*h2/h0;      const double w32 = 0.0001966122466178319053*m_dx[0]*m_dx[1];
2831      const double w31 = -0.0009303791403858427308*h2;      const double w33 = 0.0007337668937680108255*m_dx[1]*m_dx[2];
2832      const double w32 = -0.0009303791403858427308*h0*h2/h1;      const double w34 = 0.0027384553284542113967*m_dx[0]*m_dx[2];
2833      const double w33 = 0.0034722222222222222222*h0*h1/h2;      const double w35 = 0.0027384553284542113967*m_dx[0]*m_dx[1];
2834      const double w34 = -0.0034722222222222222222*h2;      const double w36 = 0.0027384553284542113967*m_dx[1]*m_dx[2];
2835      const double w35 = -0.00024929433932114870101*h2;      const double w37 = 0.0007337668937680108255*m_dx[0]*m_dx[2];
2836      const double w36 = -0.012958509748503046158*h1*h2/h0;      const double w38 = 0.010220054420048834761*m_dx[1]*m_dx[2];
2837      const double w37 = -0.012958509748503046158*h2;      const double w39 = 0.010220054420048834761*m_dx[0]*m_dx[2];
2838      const double w38 = -0.012958509748503046158*h0*h2/h1;      const double w40 = 0.038141762351741127649*m_dx[0]*m_dx[1];
2839      const double w39 = -0.04836181677178996241*h2;      const double w41 = 0.000052682092703316795698*m_dx[0]*m_dx[1];
2840      const double w40 = -0.0034722222222222222222*h0*h2/h1;      const double w42 = 0.0007337668937680108255*m_dx[0]*m_dx[1];
2841      const double w41 = 0.0009303791403858427308*h0*h1/h2;      const double w43 = 0.010220054420048834761*m_dx[0]*m_dx[1];
2842      const double w42 = 0.04836181677178996241*h2;      const double w44 = -0.038141762351741127649*m_dx[0]*m_dx[2];
2843      const double w43 = -0.04836181677178996241*h0*h2/h1;      const double w45 = -0.000052682092703316795698*m_dx[0]*m_dx[2];
2844      const double w44 = 0.012958509748503046158*h0*h1/h2;      const double w46 = 0.000052682092703316795698*m_dx[1]*m_dx[2];
2845      const double w45 = -0.00024929433932114870101*h0*h2/h1;      const double w47 = 0.038141762351741127649*m_dx[1]*m_dx[2];
2846      const double w46 = 0.00024929433932114870101*h2;      const double w48 = 0.027777777777777777778*m_dx[1]*m_dx[2];
2847      const double w47 = -0.0034722222222222222222*h1*h2/h0;      const double w49 = 0.027777777777777777778*m_dx[0]*m_dx[2];
2848      const double w48 = -0.00024929433932114870101*h1*h2/h0;      const double w50 = 0.055555555555555555556*m_dx[0]*m_dx[1];
2849      const double w49 = -0.04836181677178996241*h1*h2/h0;      const double w51 = -0.055555555555555555556*m_dx[0]*m_dx[2];
2850      const double w50 = 0.0034722222222222222222*h0*h2/h1;      const double w52 = -0.027777777777777777778*m_dx[0]*m_dx[1];
2851      const double w51 = -0.0009303791403858427308*h0*h1/h2;      const double w53 = -0.013888888888888888889*m_dx[1]*m_dx[2];
2852      const double w52 = -0.012958509748503046158*h0*h1/h2;      const double w54 = 0.0000415490565535247835*m_dx[0]*m_dx[1]*m_dx[2];
2853      const double w53 = 0.0034722222222222222222*h1*h2/h0;      const double w55 = 0.0005787037037037037037*m_dx[0]*m_dx[1]*m_dx[2];
2854      const double w54 = 0.00024929433932114870101*h0*h1/h2;      const double w56 = 0.0080603027952983270684*m_dx[0]*m_dx[1]*m_dx[2];
2855      const double w55 = 0.04836181677178996241*h0*h2/h1;      const double w57 = 0.0001550631900643071218*m_dx[0]*m_dx[1]*m_dx[2];
2856      const double w56 = 0.04836181677178996241*h1*h2/h0;      const double w58 = 0.002159751624750507693*m_dx[0]*m_dx[1]*m_dx[2];
2857      const double w57 = 0.04836181677178996241*h0*h1/h2;      const double w59 = 0.03008145955644280058*m_dx[0]*m_dx[1]*m_dx[2];
2858      const double w58 = 0.00024929433932114870101*h1*h2/h0;      const double w60 = 0.000011133036149792012194*m_dx[0]*m_dx[1]*m_dx[2];
2859      const double w59 = 0.00024929433932114870101*h0*h2/h1;      const double w61 = -0.077751058491018276948*m_dx[1]*m_dx[2];
2860      const double w60 = 0.055555555555555555556*h1*h2/h0;      const double w62 = -0.077751058491018276948*m_dx[0]*m_dx[2];
2861      const double w61 = 0.041666666666666666667*h2;      const double w63 = -0.077751058491018276948*m_dx[0]*m_dx[1];
2862      const double w62 = -0.083333333333333333333*h1;      const double w64 = -0.020833333333333333333*m_dx[0]*m_dx[2];
2863      const double w63 = 0.055555555555555555556*h0*h2/h1;      const double w65 = -0.020833333333333333333*m_dx[0]*m_dx[1];
2864      const double w64 = -0.083333333333333333333*h0;      const double w66 = -0.020833333333333333333*m_dx[1]*m_dx[2];
2865      const double w65 = 0.083333333333333333333*h1;      const double w67 = -0.0055822748423150563848*m_dx[0]*m_dx[1];
2866      const double w66 = 0.083333333333333333333*h0;      const double w68 = -0.0055822748423150563848*m_dx[0]*m_dx[2];
2867      const double w67 = -0.11111111111111111111*h0*h1/h2;      const double w69 = -0.0055822748423150563848*m_dx[1]*m_dx[2];
2868      const double w68 = -0.055555555555555555556*h1*h2/h0;      const double w70 = 0.061320326520293008568*m_dx[0]*m_dx[1]*m_dx[2];
2869      const double w69 = -0.083333333333333333333*h2;      const double w71 = 0.01643073197072526838*m_dx[0]*m_dx[1]*m_dx[2];
2870      const double w70 = -0.041666666666666666667*h1;      const double w72 = 0.004402601362608064953*m_dx[0]*m_dx[1]*m_dx[2];
2871      const double w71 = -0.055555555555555555556*h0*h2/h1;      const double w73 = 0.0011796734797069914318*m_dx[0]*m_dx[1]*m_dx[2];
2872      const double w72 = -0.041666666666666666667*h0;      /* GENERATOR SNIP_PDE_SINGLE_PRE BOTTOM */
     const double w73 = 0.041666666666666666667*h1;  
     const double w74 = 0.041666666666666666667*h0;  
     const double w75 = 0.027777777777777777778*h0*h1/h2;  
     const double w76 = 0.083333333333333333333*h2;  
     const double w77 = -0.11111111111111111111*h0*h2/h1;  
     const double w78 = 0.055555555555555555556*h0*h1/h2;  
     const double w79 = -0.11111111111111111111*h1*h2/h0;  
     const double w80 = -0.027777777777777777778*h1*h2/h0;  
     const double w81 = -0.041666666666666666667*h2;  
     const double w82 = -0.027777777777777777778*h0*h2/h1;  
     const double w83 = -0.027777777777777777778*h0*h1/h2;  
     const double w84 = 0.027777777777777777778*h0*h2/h1;  
     const double w85 = -0.055555555555555555556*h0*h1/h2;  
     const double w86 = 0.11111111111111111111*h1*h2/h0;  
     const double w87 = 0.11111111111111111111*h0*h2/h1;  
     const double w88 = 0.11111111111111111111*h0*h1/h2;  
     const double w89 = 0.027777777777777777778*h1*h2/h0;  
     const double w90 = 0.0001966122466178319053*h1*h2;  
     const double w91 = 0.0001966122466178319053*h0*h2;  
     const double w92 = 0.0001966122466178319053*h0*h1;  
     const double w93 = 0.0007337668937680108255*h1*h2;  
     const double w94 = 0.0027384553284542113967*h0*h2;  
     const double w95 = 0.0027384553284542113967*h0*h1;  
     const double w96 = 0.0027384553284542113967*h1*h2;  
     const double w97 = 0.0007337668937680108255*h0*h2;  
     const double w98 = 0.010220054420048834761*h1*h2;  
     const double w99 = 0.010220054420048834761*h0*h2;  
     const double w100 = 0.038141762351741127649*h0*h1;  
     const double w101 = 0.000052682092703316795705*h0*h1;  
     const double w102 = 0.0007337668937680108255*h0*h1;  
     const double w103 = 0.010220054420048834761*h0*h1;  
     const double w104 = -0.0001966122466178319053*h1*h2;  
     const double w105 = -0.0001966122466178319053*h0*h2;  
     const double w106 = -0.0007337668937680108255*h1*h2;  
     const double w107 = -0.0007337668937680108255*h0*h2;  
     const double w108 = -0.0027384553284542113967*h1*h2;  
     const double w109 = -0.0027384553284542113967*h0*h2;  
     const double w110 = -0.010220054420048834761*h1*h2;  
     const double w111 = -0.010220054420048834761*h0*h2;  
     const double w112 = -0.0007337668937680108255*h0*h1;  
     const double w113 = -0.010220054420048834761*h0*h1;  
     const double w114 = -0.038141762351741127649*h0*h2;  
     const double w115 = -0.000052682092703316795705*h0*h2;  
     const double w116 = -0.0001966122466178319053*h0*h1;  
     const double w117 = -0.0027384553284542113967*h0*h1;  
     const double w118 = 0.000052682092703316795705*h0*h2;  
     const double w119 = 0.038141762351741127649*h0*h2;  
     const double w120 = 0.000052682092703316795705*h1*h2;  
     const double w121 = 0.038141762351741127649*h1*h2;  
     const double w122 = -0.000052682092703316795705*h0*h1;  
     const double w123 = -0.038141762351741127649*h0*h1;  
     const double w124 = -0.000052682092703316795705*h1*h2;  
     const double w125 = -0.038141762351741127649*h1*h2;  
     const double w126 = 0.027777777777777777778*h1*h2;  
     const double w127 = 0.027777777777777777778*h0*h2;  
     const double w128 = 0.055555555555555555556*h0*h1;  
     const double w129 = -0.027777777777777777778*h1*h2;  
     const double w130 = -0.027777777777777777778*h0*h2;  
     const double w131 = 0.013888888888888888889*h0*h1;  
     const double w132 = -0.055555555555555555556*h0*h2;  
     const double w133 = -0.027777777777777777778*h0*h1;  
     const double w134 = 0.055555555555555555556*h0*h2;  
     const double w135 = 0.027777777777777777778*h0*h1;  
     const double w136 = -0.013888888888888888889*h0*h1;  
     const double w137 = 0.055555555555555555556*h1*h2;  
     const double w138 = -0.013888888888888888889*h1*h2;  
     const double w139 = -0.013888888888888888889*h0*h2;  
     const double w140 = -0.055555555555555555556*h0*h1;  
     const double w141 = 0.013888888888888888889*h1*h2;  
     const double w142 = 0.013888888888888888889*h0*h2;  
     const double w143 = -0.055555555555555555556*h1*h2;  
     const double w144 = 0.000041549056553524783501*h0*h1*h2;  
     const double w145 = 0.0005787037037037037037*h0*h1*h2;  
     const double w146 = 0.0080603027952983270684*h0*h1*h2;  
     const double w147 = 0.0001550631900643071218*h0*h1*h2;  
     const double w148 = 0.002159751624750507693*h0*h1*h2;  
     const double w149 = 0.03008145955644280058*h0*h1*h2;  
     const double w150 = 0.000011133036149792012204*h0*h1*h2;  
     const double w151 = 0.018518518518518518519*h0*h1*h2;  
     const double w152 = 0.0092592592592592592592*h0*h1*h2;  
     const double w153 = 0.0046296296296296296296*h0*h1*h2;  
     const double w154 = 0.037037037037037037037*h0*h1*h2;  
     const double w155 = -0.077751058491018276949*h1*h2;  
     const double w156 = -0.077751058491018276949*h0*h2;  
     const double w157 = -0.077751058491018276949*h0*h1;  
     const double w158 = -0.020833333333333333333*h0*h2;  
     const double w159 = -0.020833333333333333333*h0*h1;  
     const double w160 = -0.020833333333333333333*h1*h2;  
     const double w161 = -0.0055822748423150563848*h0*h1;  
     const double w162 = -0.0055822748423150563848*h0*h2;  
     const double w163 = -0.0055822748423150563848*h1*h2;  
     const double w164 = 0.077751058491018276949*h1*h2;  
     const double w165 = 0.020833333333333333333*h1*h2;  
     const double w166 = 0.0055822748423150563848*h1*h2;  
     const double w167 = 0.077751058491018276949*h0*h2;  
     const double w168 = 0.020833333333333333333*h0*h2;  
     const double w169 = 0.0055822748423150563848*h0*h2;  
     const double w170 = 0.077751058491018276949*h0*h1;  
     const double w171 = 0.020833333333333333333*h0*h1;  
     const double w172 = 0.0055822748423150563848*h0*h1;  
     const double w173 = -0.25*h1*h2;  
     const double w174 = -0.25*h0*h2;  
     const double w175 = -0.25*h0*h1;  
     const double w176 = 0.25*h1*h2;  
     const double w177 = 0.25*h0*h2;  
     const double w178 = 0.25*h0*h1;  
     const double w179 = 0.061320326520293008568*h0*h1*h2;  
     const double w180 = 0.01643073197072526838*h0*h1*h2;  
     const double w181 = 0.004402601362608064953*h0*h1*h2;  
     const double w182 = 0.0011796734797069914318*h0*h1*h2;  
     const double w183 = 0.125*h0*h1*h2;  
2873    
2874      rhs.requireWrite();      rhs.requireWrite();
2875  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
2876      {      {
2877          for (index_t k2_0=0; k2_0<2; k2_0++) { // colouring          for (index_t k2_0=0; k2_0<2; k2_0++) { // colouring
2878  #pragma omp for  #pragma omp for
2879              for (index_t k2=k2_0; k2<m_NE2; k2+=2) {              for (index_t k2=k2_0; k2<m_NE[2]; k2+=2) {
2880                  for (index_t k1=0; k1<m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1<m_NE[1]; ++k1) {
2881                      for (index_t k0=0; k0<m_NE0; ++k0)  {                      for (index_t k0=0; k0<m_NE[0]; ++k0)  {
2882                          bool add_EM_S=false;                          bool add_EM_S=false;
2883                          bool add_EM_F=false;                          bool add_EM_F=false;
2884                          vector<double> EM_S(8*8, 0);                          vector<double> EM_S(8*8, 0);
2885                          vector<double> EM_F(8, 0);                          vector<double> EM_F(8, 0);
2886                          const index_t e = k0 + m_NE0*k1 + m_NE0*m_NE1*k2;                          const index_t e = k0 + m_NE[0]*k1 + m_NE[0]*m_NE[1]*k2;
2887                            /* GENERATOR SNIP_PDE_SINGLE TOP */
2888                          ///////////////                          ///////////////
2889                          // process A //                          // process A //
2890                          ///////////////                          ///////////////
2891                          if (!A.isEmpty()) {                          if (!A.isEmpty()) {
2892                              add_EM_S=true;                              add_EM_S = true;
2893                              const double* A_p=const_cast<escript::Data*>(&A)->getSampleDataRO(e);                              const double* A_p = const_cast<escript::Data*>(&A)->getSampleDataRO(e);
2894                              if (A.actsExpanded()) {                              if (A.actsExpanded()) {
2895                                  const double A_00_0 = A_p[INDEX3(0,0,0,3,3)];                                  const double A_00_0 = A_p[INDEX3(0,0,0,3,3)];
2896                                  const double A_01_0 = A_p[INDEX3(0,1,0,3,3)];                                  const double A_01_0 = A_p[INDEX3(0,1,0,3,3)];
# Line 2906  void Brick::assemblePDESingle(Paso_Syste Line 2964  void Brick::assemblePDESingle(Paso_Syste
2964                                  const double A_20_7 = A_p[INDEX3(2,0,7,3,3)];                                  const double A_20_7 = A_p[INDEX3(2,0,7,3,3)];
2965                                  const double A_21_7 = A_p[INDEX3(2,1,7,3,3)];                                  const double A_21_7 = A_p[INDEX3(2,1,7,3,3)];
2966                                  const double A_22_7 = A_p[INDEX3(2,2,7,3,3)];                                  const double A_22_7 = A_p[INDEX3(2,2,7,3,3)];
2967                                  const double tmp160_0 = A_12_0 + A_12_6 + A_21_0 + A_21_6;                                  const double tmp0 = w18*(-A_12_7 + A_21_3);
2968                                  const double tmp8_0 = A_21_0 + A_21_6;                                  const double tmp1 = w13*(A_22_1 + A_22_2 + A_22_5 + A_22_6);
2969                                  const double tmp135_0 = A_10_1 + A_10_2 + A_10_5 + A_10_6;                                  const double tmp2 = w11*(-A_02_2 - A_02_5 + A_20_1 + A_20_6);
2970                                  const double tmp67_0 = A_02_2 + A_02_7;                                  const double tmp3 = w14*(A_00_2 + A_00_3 + A_00_6 + A_00_7);
2971                                  const double tmp211_0 = A_12_6 + A_21_6;                                  const double tmp4 = w7*(A_22_0 + A_22_4);
2972                                  const double tmp180_0 = A_10_2 + A_10_6;                                  const double tmp5 = w10*(A_12_1 + A_12_6 - A_21_2 - A_21_5);
2973                                  const double tmp37_0 = A_00_0 + A_00_1 + A_00_2 + A_00_3;                                  const double tmp6 = w3*(A_11_0 + A_11_2 + A_11_4 + A_11_6);
2974                                  const double tmp92_0 = A_11_0 + A_11_1 + A_11_2 + A_11_3 + A_11_4 + A_11_5 + A_11_6 + A_11_7;                                  const double tmp7 = w1*(A_01_0 + A_01_4 + A_10_0 + A_10_4);
2975                                  const double tmp195_0 = A_02_2 + A_20_2;                                  const double tmp8 = w4*(A_12_0 - A_21_4);
2976                                  const double tmp70_0 = A_01_0 + A_01_7;                                  const double tmp9 = w15*(-A_02_3 - A_02_6 + A_20_2 + A_20_7);
2977                                  const double tmp139_0 = A_02_3 + A_02_4 + A_20_1 + A_20_6;                                  const double tmp10 = w0*(A_00_0 + A_00_1 + A_00_4 + A_00_5);
2978                                  const double tmp200_0 = A_12_3 + A_12_5 + A_21_3 + A_21_5;                                  const double tmp11 = w16*(A_01_3 + A_01_7 + A_10_3 + A_10_7);
2979                                  const double tmp60_0 = A_22_0 + A_22_2 + A_22_4 + A_22_6;                                  const double tmp12 = w9*(A_11_1 + A_11_3 + A_11_5 + A_11_7);
2980                                  const double tmp192_0 = A_01_5 + A_10_5;                                  const double tmp13 = w12*(-A_12_3 - A_12_5 + A_21_1 + A_21_7);
2981                                  const double tmp46_0 = A_21_0 + A_21_7;                                  const double tmp14 = w5*(-A_02_1 - A_02_4 + A_20_0 + A_20_5);
2982                                  const double tmp48_0 = A_10_0 + A_10_7;                                  const double tmp15 = w8*(A_01_1 + A_01_2 + A_01_5 + A_01_6 + A_10_1 + A_10_2 + A_10_5 + A_10_6);
2983                                  const double tmp166_0 = A_11_5 + A_11_7;                                  const double tmp16 = w6*(-A_12_2 - A_12_4 + A_21_0 + A_21_6);
2984                                  const double tmp221_0 = A_02_1 + A_02_6 + A_20_3 + A_20_4;                                  const double tmp17 = w19*(A_22_3 + A_22_7);
2985                                  const double tmp50_0 = A_02_4 + A_02_6 + A_20_4 + A_20_6;                                  const double tmp18 = w17*(-A_02_7 + A_20_3);
2986                                  const double tmp217_0 = A_02_3 + A_02_4 + A_20_3 + A_20_4;                                  const double tmp19 = w2*(A_02_0 - A_20_4);
2987                                  const double tmp216_0 = A_01_2 + A_01_5 + A_10_2 + A_10_5;                                  const double tmp20 = w13*(-A_22_0 - A_22_1 - A_22_2 - A_22_3 - A_22_4 - A_22_5 - A_22_6 - A_22_7);
2988                                  const double tmp104_0 = A_22_2 + A_22_6;                                  const double tmp21 = w11*(-A_02_1 - A_02_3 - A_02_4 - A_02_6 + A_20_0 + A_20_2 + A_20_5 + A_20_7);
2989                                  const double tmp72_0 = A_20_3 + A_20_6;                                  const double tmp22 = w14*(-A_00_4 - A_00_5 - A_00_6 - A_00_7);
2990                                  const double tmp79_0 = A_10_4 + A_10_7;                                  const double tmp23 = w20*(A_01_2 + A_10_1);
2991                                  const double tmp86_0 = A_01_2 + A_01_6 + A_10_1 + A_10_5;                                  const double tmp24 = w10*(A_12_2 + A_12_3 + A_12_4 + A_12_5 - A_21_0 - A_21_1 - A_21_6 - A_21_7);
2992                                  const double tmp214_0 = A_12_0 + A_12_7 + A_21_0 + A_21_7;                                  const double tmp25 = w3*(-A_11_0 - A_11_1 - A_11_2 - A_11_3);
2993                                  const double tmp32_0 = A_02_0 + A_02_2;                                  const double tmp26 = w1*(-A_01_0 - A_01_3 - A_10_0 - A_10_3);
2994                                  const double tmp112_0 = A_01_0 + A_01_4 + A_10_3 + A_10_7;                                  const double tmp27 = w15*(-A_02_5 - A_02_7 + A_20_4 + A_20_6);
2995                                  const double tmp197_0 = A_12_0 + A_21_0;                                  const double tmp28 = w0*(-A_00_0 - A_00_1 - A_00_2 - A_00_3);
2996                                  const double tmp106_0 = A_22_1 + A_22_5;                                  const double tmp29 = w16*(-A_01_4 - A_01_7 - A_10_4 - A_10_7);
2997                                  const double tmp2_0 = A_00_0 + A_00_1 + A_00_4 + A_00_5;                                  const double tmp30 = w9*(-A_11_4 - A_11_5 - A_11_6 - A_11_7);
2998                                  const double tmp115_0 = A_02_5 + A_02_7 + A_20_0 + A_20_2;                                  const double tmp31 = w21*(A_01_5 + A_10_6);
2999                                  const double tmp175_0 = A_01_3 + A_01_7;                                  const double tmp32 = w12*(-A_12_6 - A_12_7 + A_21_4 + A_21_5);
3000                                  const double tmp126_0 = A_01_2 + A_01_5 + A_10_1 + A_10_6;                                  const double tmp33 = w5*(-A_02_0 - A_02_2 + A_20_1 + A_20_3);
3001                                  const double tmp90_0 = A_00_0 + A_00_1 + A_00_2 + A_00_3 + A_00_4 + A_00_5 + A_00_6 + A_00_7;                                  const double tmp34 = w8*(-A_01_1 - A_01_6 - A_10_2 - A_10_5);
3002                                  const double tmp47_0 = A_12_0 + A_12_6;                                  const double tmp35 = w6*(-A_12_0 - A_12_1 + A_21_2 + A_21_3);
3003                                  const double tmp205_0 = A_02_7 + A_20_7;                                  const double tmp36 = w20*(-A_01_6 + A_10_4);
3004                                  const double tmp148_0 = A_01_3 + A_01_4;                                  const double tmp37 = w18*(A_12_3 - A_21_1);
3005                                  const double tmp113_0 = A_01_3 + A_01_7 + A_10_0 + A_10_4;                                  const double tmp38 = w11*(-A_02_0 - A_02_2 - A_02_5 - A_02_7 - A_20_0 - A_20_2 - A_20_5 - A_20_7);
3006                                  const double tmp43_0 = A_20_4 + A_20_6;                                  const double tmp39 = w14*(A_00_0 + A_00_1 + A_00_2 + A_00_3);
3007                                  const double tmp161_0 = A_02_1 + A_02_6 + A_20_1 + A_20_6;                                  const double tmp40 = w26*(A_11_4 + A_11_6);
3008                                  const double tmp69_0 = A_12_0 + A_12_1 + A_12_6 + A_12_7 + A_21_0 + A_21_1 + A_21_6 + A_21_7;                                  const double tmp41 = w0*(A_00_4 + A_00_5 + A_00_6 + A_00_7);
3009                                  const double tmp176_0 = A_01_1 + A_01_2 + A_01_5 + A_01_6;                                  const double tmp42 = w10*(-A_12_2 - A_12_5 + A_21_0 + A_21_7);
3010                                  const double tmp105_0 = A_01_2 + A_01_6 + A_10_2 + A_10_6;                                  const double tmp43 = w22*(A_11_0 + A_11_2 + A_11_5 + A_11_7);
3011                                  const double tmp22_0 = A_01_5 + A_10_6;                                  const double tmp44 = w1*(A_01_4 + A_01_7 - A_10_5 - A_10_6);
3012                                  const double tmp91_0 = A_02_4 + A_02_6 + A_20_1 + A_20_3;                                  const double tmp45 = w25*(A_22_1 + A_22_3 + A_22_5 + A_22_7);
3013                                  const double tmp206_0 = A_12_7 + A_21_7;                                  const double tmp46 = w4*(-A_12_4 + A_21_6);
3014                                  const double tmp188_0 = A_02_5 + A_20_5;                                  const double tmp47 = w15*(-A_02_1 - A_02_3 - A_20_1 - A_20_3);
3015                                  const double tmp117_0 = A_21_1 + A_21_6;                                  const double tmp48 = w21*(-A_01_1 + A_10_3);
3016                                  const double tmp165_0 = A_01_1 + A_01_6;                                  const double tmp49 = w16*(A_01_0 + A_01_3 - A_10_1 - A_10_2);
3017                                  const double tmp66_0 = A_00_4 + A_00_5;                                  const double tmp50 = w5*(-A_02_4 - A_02_6 - A_20_4 - A_20_6);
3018                                  const double tmp57_0 = A_02_0 + A_02_2 + A_02_5 + A_02_7 + A_20_0 + A_20_2 + A_20_5 + A_20_7;                                  const double tmp51 = w12*(A_12_1 + A_12_7 - A_21_3 - A_21_5);
3019                                  const double tmp31_0 = A_21_4 + A_21_5;                                  const double tmp52 = w24*(A_11_1 + A_11_3);
3020                                  const double tmp3_0 = A_11_0 + A_11_2 + A_11_4 + A_11_6;                                  const double tmp53 = w8*(A_01_2 + A_01_5 - A_10_0 - A_10_7);
3021                                  const double tmp183_0 = A_12_0 + A_12_7;                                  const double tmp54 = w6*(A_12_0 + A_12_6 - A_21_2 - A_21_4);
3022                                  const double tmp61_0 = A_02_1 + A_02_3 + A_20_1 + A_20_3;                                  const double tmp55 = w23*(A_22_0 + A_22_2 + A_22_4 + A_22_6);
3023                                  const double tmp54_0 = A_10_5 + A_10_6;                                  const double tmp56 = w18*(A_12_4 - A_21_6);
3024                                  const double tmp18_0 = A_02_3 + A_02_6;                                  const double tmp57 = w14*(A_00_4 + A_00_5 + A_00_6 + A_00_7);
3025                                  const double tmp119_0 = A_12_2 + A_12_3 + A_12_4 + A_12_5 + A_21_2 + A_21_3 + A_21_4 + A_21_5;                                  const double tmp58 = w26*(A_11_1 + A_11_3);
3026                                  const double tmp29_0 = A_21_2 + A_21_3;                                  const double tmp59 = w20*(-A_01_1 + A_10_3);
3027                                  const double tmp17_0 = A_01_3 + A_01_7 + A_10_3 + A_10_7;                                  const double tmp60 = w1*(A_01_0 + A_01_3 - A_10_1 - A_10_2);
3028                                  const double tmp212_0 = A_02_6 + A_20_6;                                  const double tmp61 = w25*(A_22_0 + A_22_2 + A_22_4 + A_22_6);
3029                                  const double tmp220_0 = A_02_3 + A_20_6;                                  const double tmp62 = w4*(-A_12_3 + A_21_1);
3030                                  const double tmp78_0 = A_20_0 + A_20_7;                                  const double tmp63 = w15*(-A_02_4 - A_02_6 - A_20_4 - A_20_6);
3031                                  const double tmp215_0 = A_01_6 + A_10_6;                                  const double tmp64 = w0*(A_00_0 + A_00_1 + A_00_2 + A_00_3);
3032                                  const double tmp203_0 = A_01_7 + A_10_7;                                  const double tmp65 = w16*(A_01_4 + A_01_7 - A_10_5 - A_10_6);
3033                                  const double tmp87_0 = A_12_2 + A_12_3 + A_21_4 + A_21_5;                                  const double tmp66 = w24*(A_11_4 + A_11_6);
3034                                  const double tmp114_0 = A_02_0 + A_02_2 + A_20_5 + A_20_7;                                  const double tmp67 = w21*(-A_01_6 + A_10_4);
3035                                  const double tmp0_0 = A_01_0 + A_01_4 + A_10_0 + A_10_4;                                  const double tmp68 = w12*(A_12_0 + A_12_6 - A_21_2 - A_21_4);
3036                                  const double tmp202_0 = A_01_3 + A_01_4 + A_10_3 + A_10_4;                                  const double tmp69 = w5*(-A_02_1 - A_02_3 - A_20_1 - A_20_3);
3037                                  const double tmp4_0 = A_20_0 + A_20_5;                                  const double tmp70 = w6*(A_12_1 + A_12_7 - A_21_3 - A_21_5);
3038                                  const double tmp65_0 = A_00_2 + A_00_3;                                  const double tmp71 = w23*(A_22_1 + A_22_3 + A_22_5 + A_22_7);
3039                                  const double tmp24_0 = A_20_1 + A_20_3;                                  const double tmp72 = w20*(A_01_5 + A_10_6);
3040                                  const double tmp64_0 = A_10_0 + A_10_3;                                  const double tmp73 = w14*(-A_00_0 - A_00_1 - A_00_2 - A_00_3);
3041                                  const double tmp170_0 = A_02_0 + A_02_2 + A_20_0 + A_20_2;                                  const double tmp74 = w0*(-A_00_4 - A_00_5 - A_00_6 - A_00_7);
3042                                  const double tmp11_0 = A_20_1 + A_20_6;                                  const double tmp75 = w3*(-A_11_4 - A_11_5 - A_11_6 - A_11_7);
3043                                  const double tmp82_0 = A_12_4 + A_12_5 + A_21_4 + A_21_5;                                  const double tmp76 = w1*(-A_01_4 - A_01_7 - A_10_4 - A_10_7);
3044                                  const double tmp99_0 = A_01_4 + A_10_7;                                  const double tmp77 = w15*(-A_02_0 - A_02_2 + A_20_1 + A_20_3);
3045                                  const double tmp49_0 = A_12_1 + A_12_7;                                  const double tmp78 = w21*(A_01_2 + A_10_1);
3046                                  const double tmp130_0 = A_12_0 + A_12_1 + A_12_6 + A_12_7;                                  const double tmp79 = w16*(-A_01_0 - A_01_3 - A_10_0 - A_10_3);
3047                                  const double tmp144_0 = A_01_0 + A_10_3;                                  const double tmp80 = w9*(-A_11_0 - A_11_1 - A_11_2 - A_11_3);
3048                                  const double tmp109_0 = A_22_0 + A_22_3 + A_22_4 + A_22_7;                                  const double tmp81 = w12*(-A_12_0 - A_12_1 + A_21_2 + A_21_3);
3049                                  const double tmp185_0 = A_02_0 + A_02_7 + A_20_2 + A_20_5;                                  const double tmp82 = w5*(-A_02_5 - A_02_7 + A_20_4 + A_20_6);
3050                                  const double tmp157_0 = A_01_4 + A_10_4;                                  const double tmp83 = w6*(-A_12_6 - A_12_7 + A_21_4 + A_21_5);
3051                                  const double tmp51_0 = A_22_1 + A_22_3 + A_22_5 + A_22_7;                                  const double tmp84 = w6*(-A_12_2 - A_12_3 - A_21_2 - A_21_3);
3052                                  const double tmp146_0 = A_00_6 + A_00_7;                                  const double tmp85 = w11*(A_02_1 + A_02_6 - A_20_0 - A_20_7);
3053                                  const double tmp147_0 = A_12_0 + A_12_1 + A_21_0 + A_21_1;                                  const double tmp86 = w20*(A_01_3 - A_10_2);
3054                                  const double tmp150_0 = A_00_2 + A_00_3 + A_00_4 + A_00_5;                                  const double tmp87 = w10*(A_12_0 + A_12_1 + A_12_6 + A_12_7 + A_21_0 + A_21_1 + A_21_6 + A_21_7);
3055                                  const double tmp62_0 = A_21_3 + A_21_5;                                  const double tmp88 = w3*(A_11_0 + A_11_1 + A_11_2 + A_11_3);
3056                                  const double tmp223_0 = A_12_2 + A_21_4;                                  const double tmp89 = w23*(A_22_2 + A_22_3 + A_22_6 + A_22_7);
3057                                  const double tmp16_0 = A_02_2 + A_02_5;                                  const double tmp90 = w1*(-A_01_1 - A_01_2 + A_10_0 + A_10_3);
3058                                  const double tmp168_0 = A_11_1 + A_11_3 + A_11_4 + A_11_6;                                  const double tmp91 = w25*(A_22_0 + A_22_1 + A_22_4 + A_22_5);
3059                                  const double tmp88_0 = A_12_4 + A_12_5 + A_21_2 + A_21_3;                                  const double tmp92 = w15*(A_02_0 + A_02_5 - A_20_1 - A_20_4);
3060                                  const double tmp142_0 = A_01_7 + A_10_4;                                  const double tmp93 = w21*(A_01_4 - A_10_5);
3061                                  const double tmp34_0 = A_20_0 + A_20_2 + A_20_5 + A_20_7;                                  const double tmp94 = w16*(-A_01_5 - A_01_6 + A_10_4 + A_10_7);
3062                                  const double tmp71_0 = A_00_0 + A_00_1 + A_00_6 + A_00_7;                                  const double tmp95 = w28*(A_00_2 + A_00_3);
3063                                  const double tmp213_0 = A_02_1 + A_20_1;                                  const double tmp96 = w12*(-A_12_4 - A_12_5 - A_21_4 - A_21_5);
3064                                  const double tmp227_0 = A_12_2 + A_12_5 + A_21_3 + A_21_4;                                  const double tmp97 = w29*(A_00_4 + A_00_5);
3065                                  const double tmp228_0 = A_12_1 + A_21_7;                                  const double tmp98 = w5*(A_02_2 + A_02_7 - A_20_3 - A_20_6);
3066                                  const double tmp140_0 = A_01_2 + A_01_6;                                  const double tmp99 = w8*(-A_01_0 - A_01_7 + A_10_1 + A_10_6);
3067                                  const double tmp74_0 = A_22_0 + A_22_1 + A_22_4 + A_22_5;                                  const double tmp100 = w9*(A_11_4 + A_11_5 + A_11_6 + A_11_7);
3068                                  const double tmp167_0 = A_11_0 + A_11_2;                                  const double tmp101 = w27*(A_00_0 + A_00_1 + A_00_6 + A_00_7);
3069                                  const double tmp143_0 = A_01_3 + A_01_4 + A_10_0 + A_10_7;                                  const double tmp102 = w17*(A_02_4 - A_20_5);
3070                                  const double tmp83_0 = A_02_0 + A_02_5;                                  const double tmp103 = w2*(-A_02_3 + A_20_2);
3071                                  const double tmp14_0 = A_22_1 + A_22_2 + A_22_5 + A_22_6;                                  const double tmp104 = w13*(A_22_0 + A_22_1 + A_22_2 + A_22_3 + A_22_4 + A_22_5 + A_22_6 + A_22_7);
3072                                  const double tmp5_0 = A_12_1 + A_12_6;                                  const double tmp105 = w6*(-A_12_4 - A_12_5 - A_21_2 - A_21_3);
3073                                  const double tmp94_0 = A_02_1 + A_02_3;                                  const double tmp106 = w22*(A_11_0 + A_11_1 + A_11_2 + A_11_3 + A_11_4 + A_11_5 + A_11_6 + A_11_7);
3074                                  const double tmp193_0 = A_01_1 + A_01_6 + A_10_1 + A_10_6;                                  const double tmp107 = w1*(-A_01_2 - A_01_6 - A_10_1 - A_10_5);
3075                                  const double tmp97_0 = A_02_0 + A_02_2 + A_02_5 + A_02_7;                                  const double tmp108 = w15*(-A_02_1 - A_02_3 - A_20_4 - A_20_6);
3076                                  const double tmp131_0 = A_01_1 + A_01_5;                                  const double tmp109 = w16*(-A_01_1 - A_01_5 - A_10_2 - A_10_6);
3077                                  const double tmp124_0 = A_01_6 + A_10_5;                                  const double tmp110 = w12*(-A_12_2 - A_12_3 - A_21_4 - A_21_5);
3078                                  const double tmp149_0 = A_12_6 + A_12_7 + A_21_6 + A_21_7;                                  const double tmp111 = w5*(-A_02_4 - A_02_6 - A_20_1 - A_20_3);
3079                                  const double tmp187_0 = A_01_2 + A_10_2;                                  const double tmp112 = w8*(-A_01_0 - A_01_3 - A_01_4 - A_01_7 - A_10_0 - A_10_3 - A_10_4 - A_10_7);
3080                                  const double tmp93_0 = A_01_1 + A_01_2 + A_10_1 + A_10_2;                                  const double tmp113 = w27*(A_00_0 + A_00_1 + A_00_2 + A_00_3 + A_00_4 + A_00_5 + A_00_6 + A_00_7);
3081                                  const double tmp25_0 = A_01_4 + A_01_7 + A_10_4 + A_10_7;                                  const double tmp114 = w11*(A_02_0 + A_02_2 + A_02_5 + A_02_7 - A_20_1 - A_20_3 - A_20_4 - A_20_6);
3082                                  const double tmp156_0 = A_12_2 + A_12_5 + A_21_2 + A_21_5;                                  const double tmp115 = w21*(-A_01_4 - A_10_7);
3083                                  const double tmp20_0 = A_21_2 + A_21_5;                                  const double tmp116 = w20*(-A_01_3 - A_10_0);
3084                                  const double tmp55_0 = A_21_2 + A_21_4;                                  const double tmp117 = w15*(A_02_4 + A_02_6 - A_20_5 - A_20_7);
3085                                  const double tmp208_0 = A_12_1 + A_12_6 + A_21_0 + A_21_7;                                  const double tmp118 = w16*(A_01_5 + A_01_6 + A_10_5 + A_10_6);
3086                                  const double tmp125_0 = A_12_4 + A_12_5;                                  const double tmp119 = w5*(A_02_1 + A_02_3 - A_20_0 - A_20_2);
3087                                  const double tmp158_0 = A_01_0 + A_01_7 + A_10_0 + A_10_7;                                  const double tmp120 = w8*(A_01_0 + A_01_7 + A_10_3 + A_10_4);
3088                                  const double tmp108_0 = A_01_1 + A_01_5 + A_10_1 + A_10_5;                                  const double tmp121 = w1*(A_01_1 + A_01_2 + A_10_1 + A_10_2);
3089                                  const double tmp199_0 = A_12_2 + A_12_4 + A_21_2 + A_21_4;                                  const double tmp122 = w18*(A_12_2 - A_21_6);
3090                                  const double tmp10_0 = A_02_1 + A_02_4;                                  const double tmp123 = w13*(A_22_0 + A_22_3 + A_22_4 + A_22_7);
3091                                  const double tmp182_0 = A_02_3 + A_02_6 + A_20_3 + A_20_6;                                  const double tmp124 = w11*(-A_02_0 - A_02_7 + A_20_3 + A_20_4);
3092                                  const double tmp132_0 = A_02_1 + A_20_4;                                  const double tmp125 = w7*(A_22_1 + A_22_5);
3093                                  const double tmp191_0 = A_12_3 + A_12_4 + A_21_3 + A_21_4;                                  const double tmp126 = w10*(-A_12_3 - A_12_4 + A_21_0 + A_21_7);
3094                                  const double tmp35_0 = A_11_0 + A_11_1 + A_11_2 + A_11_3;                                  const double tmp127 = w3*(A_11_1 + A_11_3 + A_11_5 + A_11_7);
3095                                  const double tmp164_0 = A_10_3 + A_10_4;                                  const double tmp128 = w1*(-A_01_1 - A_01_5 - A_10_1 - A_10_5);
3096                                  const double tmp190_0 = A_12_5 + A_21_5;                                  const double tmp129 = w4*(-A_12_5 + A_21_1);
3097                                  const double tmp73_0 = A_02_1 + A_02_6;                                  const double tmp130 = w16*(-A_01_2 - A_01_6 - A_10_2 - A_10_6);
3098                                  const double tmp98_0 = A_01_0 + A_01_7 + A_10_3 + A_10_4;                                  const double tmp131 = w9*(A_11_0 + A_11_2 + A_11_4 + A_11_6);
3099                                  const double tmp225_0 = A_12_4 + A_21_2;                                  const double tmp132 = w19*(A_22_2 + A_22_6);
3100                                  const double tmp103_0 = A_02_4 + A_02_6;                                  const double tmp133 = w17*(-A_02_2 + A_20_6);
3101                                  const double tmp194_0 = A_02_0 + A_02_7 + A_20_0 + A_20_7;                                  const double tmp134 = w2*(A_02_5 - A_20_1);
3102                                  const double tmp207_0 = A_12_0 + A_21_6;                                  const double tmp135 = w11*(A_02_1 + A_02_3 + A_02_4 + A_02_6 + A_20_1 + A_20_3 + A_20_4 + A_20_6);
3103                                  const double tmp102_0 = A_20_5 + A_20_7;                                  const double tmp136 = w1*(A_01_3 + A_01_7 + A_10_0 + A_10_4);
3104                                  const double tmp1_0 = A_22_3 + A_22_7;                                  const double tmp137 = w15*(A_02_0 + A_02_2 + A_20_5 + A_20_7);
3105                                  const double tmp172_0 = A_10_1 + A_10_5;                                  const double tmp138 = w16*(A_01_0 + A_01_4 + A_10_3 + A_10_7);
3106                                  const double tmp222_0 = A_12_5 + A_21_3;                                  const double tmp139 = w5*(A_02_5 + A_02_7 + A_20_0 + A_20_2);
3107                                  const double tmp201_0 = A_02_2 + A_02_5 + A_20_2 + A_20_5;                                  const double tmp140 = w18*(A_12_5 - A_21_1);
3108                                  const double tmp155_0 = A_12_4 + A_21_4;                                  const double tmp141 = w14*(A_00_0 + A_00_1 + A_00_4 + A_00_5);
3109                                  const double tmp174_0 = A_02_1 + A_02_4 + A_20_1 + A_20_4;                                  const double tmp142 = w7*(A_22_2 + A_22_6);
3110                                  const double tmp59_0 = A_01_0 + A_01_3;                                  const double tmp143 = w1*(-A_01_2 - A_01_6 - A_10_2 - A_10_6);
3111                                  const double tmp21_0 = A_20_2 + A_20_7;                                  const double tmp144 = w4*(-A_12_2 + A_21_6);
3112                                  const double tmp141_0 = A_02_2 + A_02_7 + A_20_2 + A_20_7;                                  const double tmp145 = w15*(-A_02_1 - A_02_4 + A_20_0 + A_20_5);
3113                                  const double tmp210_0 = A_01_1 + A_10_1;                                  const double tmp146 = w0*(A_00_2 + A_00_3 + A_00_6 + A_00_7);
3114                                  const double tmp145_0 = A_00_0 + A_00_1;                                  const double tmp147 = w16*(-A_01_1 - A_01_5 - A_10_1 - A_10_5);
3115                                  const double tmp121_0 = A_12_0 + A_12_1 + A_21_6 + A_21_7;                                  const double tmp148 = w5*(-A_02_3 - A_02_6 + A_20_2 + A_20_7);
3116                                  const double tmp224_0 = A_12_3 + A_12_4 + A_21_2 + A_21_5;                                  const double tmp149 = w19*(A_22_1 + A_22_5);
3117                                  const double tmp186_0 = A_02_2 + A_20_7;                                  const double tmp150 = w17*(-A_02_5 + A_20_1);
3118                                  const double tmp53_0 = A_11_4 + A_11_6;                                  const double tmp151 = w2*(A_02_2 - A_20_6);
3119                                  const double tmp184_0 = A_02_5 + A_20_0;                                  const double tmp152 = w18*(A_12_3 - A_21_7);
3120                                  const double tmp38_0 = A_12_0 + A_12_1;                                  const double tmp153 = w11*(A_02_1 + A_02_6 - A_20_2 - A_20_5);
3121                                  const double tmp12_0 = A_01_1 + A_01_2 + A_01_5 + A_01_6 + A_10_1 + A_10_2 + A_10_5 + A_10_6;                                  const double tmp154 = w10*(-A_12_2 - A_12_5 + A_21_1 + A_21_6);
3122                                  const double tmp230_0 = A_12_6 + A_21_0;                                  const double tmp155 = w4*(-A_12_4 + A_21_0);
3123                                  const double tmp23_0 = A_11_4 + A_11_5 + A_11_6 + A_11_7;                                  const double tmp156 = w15*(A_02_2 + A_02_7 - A_20_3 - A_20_6);
3124                                  const double tmp81_0 = A_20_1 + A_20_4;                                  const double tmp157 = w5*(A_02_0 + A_02_5 - A_20_1 - A_20_4);
3125                                  const double tmp134_0 = A_10_3 + A_10_7;                                  const double tmp158 = w17*(A_02_3 - A_20_7);
3126                                  const double tmp129_0 = A_21_0 + A_21_1;                                  const double tmp159 = w2*(-A_02_4 + A_20_0);
3127                                  const double tmp137_0 = A_01_0 + A_01_3 + A_01_4 + A_01_7;                                  const double tmp160 = w6*(A_12_6 + A_12_7 + A_21_0 + A_21_1);
3128                                  const double tmp198_0 = A_01_0 + A_10_0;                                  const double tmp161 = w10*(-A_12_2 - A_12_3 - A_12_4 - A_12_5 - A_21_2 - A_21_3 - A_21_4 - A_21_5);
3129                                  const double tmp9_0 = A_21_1 + A_21_7;                                  const double tmp162 = w1*(A_01_0 + A_01_4 + A_10_3 + A_10_7);
3130                                  const double tmp179_0 = A_01_0 + A_01_4;                                  const double tmp163 = w16*(A_01_3 + A_01_7 + A_10_0 + A_10_4);
3131                                  const double tmp100_0 = A_20_1 + A_20_3 + A_20_4 + A_20_6;                                  const double tmp164 = w12*(A_12_0 + A_12_1 + A_21_6 + A_21_7);
3132                                  const double tmp173_0 = A_02_0 + A_20_5;                                  const double tmp165 = w20*(A_01_6 + A_10_5);
3133                                  const double tmp42_0 = A_21_0 + A_21_1 + A_21_6 + A_21_7;                                  const double tmp166 = w10*(-A_12_0 - A_12_1 - A_12_6 - A_12_7 + A_21_2 + A_21_3 + A_21_4 + A_21_5);
3134                                  const double tmp226_0 = A_12_3 + A_21_5;                                  const double tmp167 = w15*(A_02_1 + A_02_3 - A_20_0 - A_20_2);
3135                                  const double tmp6_0 = A_22_0 + A_22_4;                                  const double tmp168 = w21*(A_01_1 + A_10_2);
3136                                  const double tmp218_0 = A_12_1 + A_21_1;                                  const double tmp169 = w12*(A_12_2 + A_12_3 - A_21_0 - A_21_1);
3137                                  const double tmp28_0 = A_01_2 + A_10_1;                                  const double tmp170 = w5*(A_02_4 + A_02_6 - A_20_5 - A_20_7);
3138                                  const double tmp133_0 = A_02_6 + A_20_3;                                  const double tmp171 = w8*(-A_01_2 - A_01_5 - A_10_1 - A_10_6);
3139                                  const double tmp13_0 = A_00_2 + A_00_3 + A_00_6 + A_00_7;                                  const double tmp172 = w6*(A_12_4 + A_12_5 - A_21_6 - A_21_7);
3140                                  const double tmp27_0 = A_12_2 + A_12_3 + A_12_4 + A_12_5;                                  const double tmp173 = w2*(A_02_1 + A_20_4);
3141                                  const double tmp75_0 = A_10_1 + A_10_6;                                  const double tmp174 = w11*(-A_02_3 - A_02_4 - A_20_1 - A_20_6);
3142                                  const double tmp36_0 = A_01_0 + A_01_3 + A_10_0 + A_10_3;                                  const double tmp175 = w14*(-A_00_2 - A_00_3 - A_00_6 - A_00_7);
3143                                  const double tmp138_0 = A_10_0 + A_10_4;                                  const double tmp176 = w22*(-A_11_0 - A_11_1 - A_11_2 - A_11_3 - A_11_4 - A_11_5 - A_11_6 - A_11_7);
3144                                  const double tmp189_0 = A_12_2 + A_21_2;                                  const double tmp177 = w1*(A_01_1 + A_01_5 - A_10_0 - A_10_4);
3145                                  const double tmp181_0 = A_02_7 + A_20_2;                                  const double tmp178 = w25*(-A_22_2 - A_22_3 - A_22_6 - A_22_7);
3146                                  const double tmp85_0 = A_02_1 + A_02_3 + A_20_4 + A_20_6;                                  const double tmp179 = w15*(-A_02_2 - A_02_7 - A_20_2 - A_20_7);
3147                                  const double tmp122_0 = A_01_1 + A_10_2;                                  const double tmp180 = w0*(-A_00_0 - A_00_1 - A_00_4 - A_00_5);
3148                                  const double tmp95_0 = A_01_3 + A_10_0;                                  const double tmp181 = w16*(A_01_2 + A_01_6 - A_10_3 - A_10_7);
3149                                  const double tmp120_0 = A_12_6 + A_12_7 + A_21_0 + A_21_1;                                  const double tmp182 = w12*(-A_12_6 - A_12_7 + A_21_2 + A_21_3);
3150                                  const double tmp196_0 = A_02_0 + A_20_0;                                  const double tmp183 = w5*(-A_02_0 - A_02_5 - A_20_0 - A_20_5);
3151                                  const double tmp171_0 = A_02_3 + A_02_4;                                  const double tmp184 = w8*(A_01_0 + A_01_3 + A_01_4 + A_01_7 - A_10_1 - A_10_2 - A_10_5 - A_10_6);
3152                                  const double tmp204_0 = A_12_1 + A_12_6 + A_21_1 + A_21_6;                                  const double tmp185 = w6*(-A_12_0 - A_12_1 + A_21_4 + A_21_5);
3153                                  const double tmp45_0 = A_10_1 + A_10_2;                                  const double tmp186 = w17*(-A_02_6 - A_20_3);
3154                                  const double tmp101_0 = A_01_5 + A_01_6 + A_10_5 + A_10_6;                                  const double tmp187 = w23*(-A_22_0 - A_22_1 - A_22_4 - A_22_5);
3155                                  const double tmp58_0 = A_11_0 + A_11_2 + A_11_5 + A_11_7;                                  const double tmp188 = w18*(A_12_4 - A_21_0);
3156                                  const double tmp107_0 = A_20_3 + A_20_4;                                  const double tmp189 = w7*(A_22_3 + A_22_7);
3157                                  const double tmp30_0 = A_01_1 + A_01_6 + A_10_2 + A_10_5;                                  const double tmp190 = w1*(A_01_3 + A_01_7 + A_10_3 + A_10_7);
3158                                  const double tmp63_0 = A_12_2 + A_12_5;                                  const double tmp191 = w4*(-A_12_3 + A_21_7);
3159                                  const double tmp127_0 = A_12_2 + A_12_3;                                  const double tmp192 = w16*(A_01_0 + A_01_4 + A_10_0 + A_10_4);
3160                                  const double tmp177_0 = A_02_2 + A_02_5 + A_20_0 + A_20_7;                                  const double tmp193 = w19*(A_22_0 + A_22_4);
3161                                  const double tmp178_0 = A_10_0 + A_10_3 + A_10_4 + A_10_7;                                  const double tmp194 = w17*(A_02_4 - A_20_0);
3162                                  const double tmp76_0 = A_01_1 + A_01_2;                                  const double tmp195 = w2*(-A_02_3 + A_20_7);
3163                                  const double tmp80_0 = A_22_2 + A_22_3 + A_22_6 + A_22_7;                                  const double tmp196 = w20*(-A_01_7 - A_10_4);
3164                                  const double tmp41_0 = A_12_6 + A_12_7;                                  const double tmp197 = w21*(-A_01_0 - A_10_3);
3165                                  const double tmp89_0 = A_01_0 + A_01_3 + A_01_4 + A_01_7 + A_10_0 + A_10_3 + A_10_4 + A_10_7;                                  const double tmp198 = w16*(A_01_1 + A_01_2 + A_10_1 + A_10_2);
3166                                  const double tmp116_0 = A_02_1 + A_02_3 + A_02_4 + A_02_6 + A_20_1 + A_20_3 + A_20_4 + A_20_6;                                  const double tmp199 = w8*(A_01_3 + A_01_4 + A_10_0 + A_10_7);
3167                                  const double tmp33_0 = A_22_0 + A_22_1 + A_22_2 + A_22_3 + A_22_4 + A_22_5 + A_22_6 + A_22_7;                                  const double tmp200 = w1*(A_01_5 + A_01_6 + A_10_5 + A_10_6);
3168                                  const double tmp169_0 = A_21_3 + A_21_4;                                  const double tmp201 = w27*(A_00_2 + A_00_3 + A_00_4 + A_00_5);
3169                                  const double tmp96_0 = A_20_0 + A_20_2;                                  const double tmp202 = w11*(-A_02_2 - A_02_5 + A_20_3 + A_20_4);
3170                                  const double tmp111_0 = A_12_3 + A_12_4;                                  const double tmp203 = w20*(A_01_0 - A_10_1);
3171                                  const double tmp118_0 = A_20_2 + A_20_5;                                  const double tmp204 = w23*(A_22_0 + A_22_1 + A_22_4 + A_22_5);
3172                                  const double tmp19_0 = A_12_3 + A_12_5;                                  const double tmp205 = w25*(A_22_2 + A_22_3 + A_22_6 + A_22_7);
3173                                  const double tmp68_0 = A_01_5 + A_01_6;                                  const double tmp206 = w21*(A_01_7 - A_10_6);
3174                                  const double tmp7_0 = A_11_1 + A_11_3 + A_11_5 + A_11_7;                                  const double tmp207 = w12*(A_12_6 + A_12_7 + A_21_6 + A_21_7);
3175                                  const double tmp154_0 = A_12_3 + A_21_3;                                  const double tmp208 = w28*(A_00_0 + A_00_1);
3176                                  const double tmp152_0 = A_02_4 + A_20_4;                                  const double tmp209 = w29*(A_00_6 + A_00_7);
3177                                  const double tmp153_0 = A_02_3 + A_20_3;                                  const double tmp210 = w8*(-A_01_3 - A_01_4 + A_10_2 + A_10_5);
3178                                  const double tmp163_0 = A_02_5 + A_02_7 + A_20_5 + A_20_7;                                  const double tmp211 = w6*(A_12_0 + A_12_1 + A_21_0 + A_21_1);
3179                                  const double tmp44_0 = A_01_4 + A_01_7;                                  const double tmp212 = w17*(-A_02_7 + A_20_6);
3180                                  const double tmp39_0 = A_02_1 + A_02_3 + A_02_4 + A_02_6;                                  const double tmp213 = w2*(A_02_0 - A_20_1);
3181                                  const double tmp123_0 = A_21_2 + A_21_3 + A_21_4 + A_21_5;                                  const double tmp214 = w13*(-A_22_1 - A_22_2 - A_22_5 - A_22_6);
3182                                  const double tmp40_0 = A_02_5 + A_02_7;                                  const double tmp215 = w22*(-A_11_0 - A_11_2 - A_11_5 - A_11_7);
3183                                  const double tmp110_0 = A_02_0 + A_02_7;                                  const double tmp216 = w8*(A_01_0 + A_01_7 + A_10_0 + A_10_7);
3184                                  const double tmp77_0 = A_12_2 + A_12_3 + A_21_2 + A_21_3;                                  const double tmp217 = w27*(-A_00_0 - A_00_1 - A_00_6 - A_00_7);
3185                                  const double tmp209_0 = A_12_7 + A_21_1;                                  const double tmp218 = w17*(-A_02_3 - A_20_3);
3186                                  const double tmp219_0 = A_02_4 + A_20_1;                                  const double tmp219 = w2*(A_02_4 + A_20_4);
3187                                  const double tmp84_0 = A_01_1 + A_01_5 + A_10_2 + A_10_6;                                  const double tmp220 = w11*(-A_02_1 - A_02_6 - A_20_1 - A_20_6);
3188                                  const double tmp162_0 = A_12_1 + A_12_7 + A_21_1 + A_21_7;                                  const double tmp221 = w26*(-A_11_4 - A_11_6);
3189                                  const double tmp159_0 = A_01_3 + A_10_3;                                  const double tmp222 = w10*(A_12_2 + A_12_5 + A_21_2 + A_21_5);
3190                                  const double tmp56_0 = A_11_1 + A_11_3;                                  const double tmp223 = w20*(-A_01_4 - A_10_4);
3191                                  const double tmp52_0 = A_01_2 + A_01_5;                                  const double tmp224 = w21*(-A_01_3 - A_10_3);
3192                                  const double tmp26_0 = A_00_4 + A_00_5 + A_00_6 + A_00_7;                                  const double tmp225 = w6*(-A_12_0 - A_12_6 - A_21_0 - A_21_6);
3193                                  const double tmp229_0 = A_12_0 + A_12_7 + A_21_1 + A_21_6;                                  const double tmp226 = w7*(-A_22_0 - A_22_4);
3194                                  const double tmp151_0 = A_10_2 + A_10_5;                                  const double tmp227 = w24*(-A_11_1 - A_11_3);
3195                                  const double tmp136_0 = A_02_0 + A_02_5 + A_20_0 + A_20_5;                                  const double tmp228 = w19*(-A_22_3 - A_22_7);
3196                                  const double tmp128_0 = A_21_6 + A_21_7;                                  const double tmp229 = w18*(-A_12_3 - A_21_3);
3197                                  const double tmp15_0 = A_12_2 + A_12_4;                                  const double tmp230 = w4*(A_12_4 + A_21_4);
3198                                  const double tmp296_1 = tmp159_0*w42;                                  const double tmp231 = w28*(-A_00_4 - A_00_5);
3199                                  const double tmp130_1 = tmp67_0*w5;                                  const double tmp232 = w12*(-A_12_1 - A_12_7 - A_21_1 - A_21_7);
3200                                  const double tmp98_1 = A_01_6*w42;                                  const double tmp233 = w29*(-A_00_2 - A_00_3);
3201                                  const double tmp231_1 = tmp125_0*w6;                                  const double tmp234 = w20*(-A_01_5 + A_10_7);
3202                                  const double tmp42_1 = tmp34_0*w12;                                  const double tmp235 = w18*(-A_12_0 + A_21_2);
3203                                  const double tmp199_1 = A_02_5*w28;                                  const double tmp236 = w26*(A_11_5 + A_11_7);
3204                                  const double tmp113_1 = tmp29_0*w13;                                  const double tmp237 = w10*(A_12_1 + A_12_6 - A_21_3 - A_21_4);
3205                                  const double tmp330_1 = tmp152_0*w28;                                  const double tmp238 = w22*(A_11_1 + A_11_3 + A_11_4 + A_11_6);
3206                                  const double tmp90_1 = A_01_1*w46;                                  const double tmp239 = w4*(A_12_7 - A_21_5);
3207                                  const double tmp446_1 = tmp77_0*w22;                                  const double tmp240 = w15*(A_02_0 + A_02_2 + A_20_0 + A_20_2);
3208                                  const double tmp108_1 = tmp43_0*w5;                                  const double tmp241 = w21*(-A_01_2 + A_10_0);
3209                                  const double tmp524_1 = A_12_6*w29;                                  const double tmp242 = w5*(A_02_5 + A_02_7 + A_20_5 + A_20_7);
3210                                  const double tmp232_1 = tmp126_0*w34;                                  const double tmp243 = w12*(-A_12_2 - A_12_4 + A_21_0 + A_21_6);
3211                                  const double tmp33_1 = tmp25_0*w37;                                  const double tmp244 = w24*(A_11_0 + A_11_2);
3212                                  const double tmp461_1 = tmp180_0*w1;                                  const double tmp245 = w8*(A_01_1 + A_01_6 - A_10_3 - A_10_4);
3213                                  const double tmp14_1 = tmp8_0*w6;                                  const double tmp246 = w6*(-A_12_3 - A_12_5 + A_21_1 + A_21_7);
3214                                  const double tmp447_1 = tmp205_0*w26;                                  const double tmp247 = w11*(A_02_3 + A_02_4 - A_20_2 - A_20_5);
3215                                  const double tmp452_1 = tmp198_0*w42;                                  const double tmp248 = w20*(-A_01_1 + A_10_0);
3216                                  const double tmp217_1 = tmp81_0*w9;                                  const double tmp249 = w21*(-A_01_6 + A_10_7);
3217                                  const double tmp76_1 = tmp59_0*w20;                                  const double tmp250 = w8*(A_01_2 + A_01_5 - A_10_3 - A_10_4);
3218                                  const double tmp421_1 = tmp134_0*w31;                                  const double tmp251 = w17*(A_02_6 - A_20_7);
3219                                  const double tmp485_1 = tmp51_0*w51;                                  const double tmp252 = w2*(-A_02_1 + A_20_0);
3220                                  const double tmp240_1 = tmp131_0*w1;                                  const double tmp253 = w17*(-A_02_4 - A_20_4);
3221                                  const double tmp160_1 = tmp91_0*w9;                                  const double tmp254 = w2*(A_02_3 + A_20_3);
3222                                  const double tmp174_1 = A_20_1*w26;                                  const double tmp255 = w26*(-A_11_1 - A_11_3);
3223                                  const double tmp273_1 = A_10_1*w46;                                  const double tmp256 = w20*(-A_01_3 - A_10_3);
3224                                  const double tmp159_1 = tmp90_0*w47;                                  const double tmp257 = w21*(-A_01_4 - A_10_4);
3225                                  const double tmp228_1 = tmp103_0*w5;                                  const double tmp258 = w6*(-A_12_1 - A_12_7 - A_21_1 - A_21_7);
3226                                  const double tmp313_1 = tmp166_0*w45;                                  const double tmp259 = w7*(-A_22_3 - A_22_7);
3227                                  const double tmp45_1 = tmp37_0*w30;                                  const double tmp260 = w15*(-A_02_0 - A_02_5 - A_20_0 - A_20_5);
3228                                  const double tmp512_1 = tmp147_0*w13;                                  const double tmp261 = w24*(-A_11_4 - A_11_6);
3229                                  const double tmp73_1 = tmp56_0*w43;                                  const double tmp262 = w19*(-A_22_0 - A_22_4);
3230                                  const double tmp61_1 = A_01_6*w46;                                  const double tmp263 = w18*(-A_12_4 - A_21_4);
3231                                  const double tmp316_1 = tmp167_0*w43;                                  const double tmp264 = w4*(A_12_3 + A_21_3);
3232                                  const double tmp189_1 = tmp112_0*w20;                                  const double tmp265 = w28*(-A_00_2 - A_00_3);
3233                                  const double tmp455_1 = tmp215_0*w39;                                  const double tmp266 = w12*(-A_12_0 - A_12_6 - A_21_0 - A_21_6);
3234                                  const double tmp360_1 = A_21_5*w24;                                  const double tmp267 = w5*(-A_02_2 - A_02_7 - A_20_2 - A_20_7);
3235                                  const double tmp258_1 = A_20_7*w2;                                  const double tmp268 = w29*(-A_00_4 - A_00_5);
3236                                  const double tmp196_1 = A_20_6*w26;                                  const double tmp269 = w11*(A_02_2 + A_02_5 + A_20_0 + A_20_7);
3237                                  const double tmp37_1 = tmp29_0*w6;                                  const double tmp270 = w1*(-A_01_0 - A_01_4 + A_10_1 + A_10_5);
3238                                  const double tmp9_1 = A_12_7*w29;                                  const double tmp271 = w15*(A_02_3 + A_02_6 + A_20_3 + A_20_6);
3239                                  const double tmp80_1 = tmp63_0*w19;                                  const double tmp272 = w16*(-A_01_3 - A_01_7 + A_10_2 + A_10_6);
3240                                  const double tmp312_1 = tmp165_0*w8;                                  const double tmp273 = w5*(A_02_1 + A_02_4 + A_20_1 + A_20_4);
3241                                  const double tmp264_1 = tmp101_0*w1;                                  const double tmp274 = w8*(-A_01_1 - A_01_2 - A_01_5 - A_01_6 + A_10_0 + A_10_3 + A_10_4 + A_10_7);
3242                                  const double tmp124_1 = A_02_3*w26;                                  const double tmp275 = w17*(A_02_7 + A_20_2);
3243                                  const double tmp229_1 = tmp123_0*w11;                                  const double tmp276 = w2*(-A_02_0 - A_20_5);
3244               &nbs