/[escript]/branches/diaplayground/ripley/src/Brick.cpp
ViewVC logotype

Diff of /branches/diaplayground/ripley/src/Brick.cpp

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

branches/ripleygmg_from_3668/ripley/src/Brick.cpp revision 3761 by caltinay, Mon Jan 9 06:50:33 2012 UTC trunk/ripley/src/Brick.cpp revision 4687 by jfenwick, Wed Feb 19 00:03:29 2014 UTC
# Line 1  Line 1 
1    
2  /*******************************************************  /*****************************************************************************
3  *  *
4  * Copyright (c) 2003-2011 by University of Queensland  * Copyright (c) 2003-2014 by University of Queensland
5  * Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)  * http://www.uq.edu.au
 * http://www.uq.edu.au/esscc  
6  *  *
7  * Primary Business: Queensland, Australia  * Primary Business: Queensland, Australia
8  * Licensed under the Open Software License version 3.0  * Licensed under the Open Software License version 3.0
9  * http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php  * http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php
10  *  *
11  *******************************************************/  * Development until 2012 by Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)
12    * Development 2012-2013 by School of Earth Sciences
13    * Development from 2014 by Centre for Geoscience Computing (GeoComp)
14    *
15    *****************************************************************************/
16    
17  #include <ripley/Brick.h>  #include <ripley/Brick.h>
18  extern "C" {  #include <paso/SystemMatrix.h>
19  #include "paso/SystemMatrix.h"  #include <esysUtils/esysFileWriter.h>
20  }  #include <ripley/DefaultAssembler3D.h>
21    #include <ripley/WaveAssembler3D.h>
22    #include <boost/scoped_array.hpp>
23    
24    #ifdef USE_NETCDF
25    #include <netcdfcpp.h>
26    #endif
27    
28  #if USE_SILO  #if USE_SILO
29  #include <silo.h>  #include <silo.h>
# Line 25  extern "C" { Line 34  extern "C" {
34    
35  #include <iomanip>  #include <iomanip>
36    
37    #include "esysUtils/EsysRandom.h"
38    #include "blocktools.h"
39    
40    
41  using namespace std;  using namespace std;
42    using esysUtils::FileWriter;
43    
44  namespace ripley {  namespace ripley {
45    
46  Brick::Brick(int n0, int n1, int n2, double l0, double l1, double l2, int d0,  Brick::Brick(int n0, int n1, int n2, double x0, double y0, double z0,
47               int d1, int d2) :               double x1, double y1, double z1, int d0, int d1, int d2,
48      RipleyDomain(3),               const std::vector<double>& points, const std::vector<int>& tags,
49      m_gNE0(n0),               const simap_t& tagnamestonums) :
50      m_gNE1(n1),      RipleyDomain(3)
51      m_gNE2(n2),  {
52      m_l0(l0),      // ignore subdivision parameters for serial run
53      m_l1(l1),      if (m_mpiInfo->size == 1) {
54      m_l2(l2),          d0=1;
55      m_NX(d0),          d1=1;
56      m_NY(d1),          d2=1;
57      m_NZ(d2)      }
58  {      bool warn=false;
59        // if number of subdivisions is non-positive, try to subdivide by the same
60        // ratio as the number of elements
61        if (d0<=0 && d1<=0 && d2<=0) {
62            warn=true;
63            d0=(int)(pow(m_mpiInfo->size*(n0+1)*(n0+1)/((float)(n1+1)*(n2+1)), 1.f/3));
64            d0=max(1, d0);
65            d1=max(1, (int)(d0*n1/(float)n0));
66            d2=m_mpiInfo->size/(d0*d1);
67            if (d0*d1*d2 != m_mpiInfo->size) {
68                // ratios not the same so leave "smallest" side undivided and try
69                // dividing 2 sides only
70                if (n0>=n1) {
71                    if (n1>=n2) {
72                        d0=d1=0;
73                        d2=1;
74                    } else {
75                        d0=d2=0;
76                        d1=1;
77                    }
78                } else {
79                    if (n0>=n2) {
80                        d0=d1=0;
81                        d2=1;
82                    } else {
83                        d0=1;
84                        d1=d2=0;
85                    }
86                }
87            }
88        }
89        if (d0<=0 && d1<=0) {
90            warn=true;
91            d0=max(1, int(sqrt(m_mpiInfo->size*(n0+1)/(float)(n1+1))));
92            d1=m_mpiInfo->size/d0;
93            if (d0*d1*d2 != m_mpiInfo->size) {
94                // ratios not the same so subdivide side with more elements only
95                if (n0>n1) {
96                    d0=0;
97                    d1=1;
98                } else {
99                    d0=1;
100                    d1=0;
101                }
102            }
103        } else if (d0<=0 && d2<=0) {
104            warn=true;
105            d0=max(1, int(sqrt(m_mpiInfo->size*(n0+1)/(float)(n2+1))));
106            d2=m_mpiInfo->size/d0;
107            if (d0*d1*d2 != m_mpiInfo->size) {
108                // ratios not the same so subdivide side with more elements only
109                if (n0>n2) {
110                    d0=0;
111                    d2=1;
112                } else {
113                    d0=1;
114                    d2=0;
115                }
116            }
117        } else if (d1<=0 && d2<=0) {
118            warn=true;
119            d1=max(1, int(sqrt(m_mpiInfo->size*(n1+1)/(float)(n2+1))));
120            d2=m_mpiInfo->size/d1;
121            if (d0*d1*d2 != m_mpiInfo->size) {
122                // ratios not the same so subdivide side with more elements only
123                if (n1>n2) {
124                    d1=0;
125                    d2=1;
126                } else {
127                    d1=1;
128                    d2=0;
129                }
130            }
131        }
132        if (d0<=0) {
133            // d1,d2 are preset, determine d0
134            d0=m_mpiInfo->size/(d1*d2);
135        } else if (d1<=0) {
136            // d0,d2 are preset, determine d1
137            d1=m_mpiInfo->size/(d0*d2);
138        } else if (d2<=0) {
139            // d0,d1 are preset, determine d2
140            d2=m_mpiInfo->size/(d0*d1);
141        }
142    
143      // ensure number of subdivisions is valid and nodes can be distributed      // ensure number of subdivisions is valid and nodes can be distributed
144      // among number of ranks      // among number of ranks
145      if (m_NX*m_NY*m_NZ != m_mpiInfo->size)      if (d0*d1*d2 != m_mpiInfo->size)
146          throw RipleyException("Invalid number of spatial subdivisions");          throw RipleyException("Invalid number of spatial subdivisions");
147    
148      if ((n0+1)%m_NX > 0 || (n1+1)%m_NY > 0 || (n2+1)%m_NZ > 0)      if (warn) {
149          throw RipleyException("Number of elements+1 must be separable into number of ranks in each dimension");          cout << "Warning: Automatic domain subdivision (d0=" << d0 << ", d1="
150                << d1 << ", d2=" << d2 << "). This may not be optimal!" << endl;
151        }
152    
153        double l0 = x1-x0;
154        double l1 = y1-y0;
155        double l2 = z1-z0;
156        m_dx[0] = l0/n0;
157        m_dx[1] = l1/n1;
158        m_dx[2] = l2/n2;
159    
160        if ((n0+1)%d0 > 0) {
161            n0=(int)round((float)(n0+1)/d0+0.5)*d0-1;
162            l0=m_dx[0]*n0;
163            cout << "Warning: Adjusted number of elements and length. N0="
164                << n0 << ", l0=" << l0 << endl;
165        }
166        if ((n1+1)%d1 > 0) {
167            n1=(int)round((float)(n1+1)/d1+0.5)*d1-1;
168            l1=m_dx[1]*n1;
169            cout << "Warning: Adjusted number of elements and length. N1="
170                << n1 << ", l1=" << l1 << endl;
171        }
172        if ((n2+1)%d2 > 0) {
173            n2=(int)round((float)(n2+1)/d2+0.5)*d2-1;
174            l2=m_dx[2]*n2;
175            cout << "Warning: Adjusted number of elements and length. N2="
176                << n2 << ", l2=" << l2 << endl;
177        }
178    
179      if ((m_NX > 1 && (n0+1)/m_NX<2) || (m_NY > 1 && (n1+1)/m_NY<2) || (m_NZ > 1 && (n2+1)/m_NZ<2))      if ((d0 > 1 && (n0+1)/d0<2) || (d1 > 1 && (n1+1)/d1<2) || (d2 > 1 && (n2+1)/d2<2))
180          throw RipleyException("Too few elements for the number of ranks");          throw RipleyException("Too few elements for the number of ranks");
181    
182        m_gNE[0] = n0;
183        m_gNE[1] = n1;
184        m_gNE[2] = n2;
185        m_origin[0] = x0;
186        m_origin[1] = y0;
187        m_origin[2] = z0;
188        m_length[0] = l0;
189        m_length[1] = l1;
190        m_length[2] = l2;
191        m_NX[0] = d0;
192        m_NX[1] = d1;
193        m_NX[2] = d2;
194    
195      // local number of elements (including overlap)      // local number of elements (including overlap)
196      m_NE0 = (m_NX>1 ? (n0+1)/m_NX : n0);      m_NE[0] = m_ownNE[0] = (d0>1 ? (n0+1)/d0 : n0);
197      if (m_mpiInfo->rank%m_NX>0 && m_mpiInfo->rank%m_NX<m_NX-1)      if (m_mpiInfo->rank%d0>0 && m_mpiInfo->rank%d0<d0-1)
198          m_NE0++;          m_NE[0]++;
199      m_NE1 = (m_NY>1 ? (n1+1)/m_NY : n1);      else if (d0>1 && m_mpiInfo->rank%d0==d0-1)
200      if (m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX>0 && m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX<m_NY-1)          m_ownNE[0]--;
201          m_NE1++;  
202      m_NE2 = (m_NZ>1 ? (n2+1)/m_NZ : n2);      m_NE[1] = m_ownNE[1] = (d1>1 ? (n1+1)/d1 : n1);
203      if (m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY)>0 && m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY)<m_NZ-1)      if (m_mpiInfo->rank%(d0*d1)/d0>0 && m_mpiInfo->rank%(d0*d1)/d0<d1-1)
204          m_NE2++;          m_NE[1]++;
205        else if (d1>1 && m_mpiInfo->rank%(d0*d1)/d0==d1-1)
206            m_ownNE[1]--;
207    
208        m_NE[2] = m_ownNE[2] = (d2>1 ? (n2+1)/d2 : n2);
209        if (m_mpiInfo->rank/(d0*d1)>0 && m_mpiInfo->rank/(d0*d1)<d2-1)
210            m_NE[2]++;
211        else if (d2>1 && m_mpiInfo->rank/(d0*d1)==d2-1)
212            m_ownNE[2]--;
213    
214      // local number of nodes      // local number of nodes
215      m_N0 = m_NE0+1;      m_NN[0] = m_NE[0]+1;
216      m_N1 = m_NE1+1;      m_NN[1] = m_NE[1]+1;
217      m_N2 = m_NE2+1;      m_NN[2] = m_NE[2]+1;
218    
219      // bottom-left-front node is at (offset0,offset1,offset2) in global mesh      // bottom-left-front node is at (offset0,offset1,offset2) in global mesh
220      m_offset0 = (n0+1)/m_NX*(m_mpiInfo->rank%m_NX);      m_offset[0] = (n0+1)/d0*(m_mpiInfo->rank%d0);
221      if (m_offset0 > 0)      if (m_offset[0] > 0)
222          m_offset0--;          m_offset[0]--;
223      m_offset1 = (n1+1)/m_NY*(m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX);      m_offset[1] = (n1+1)/d1*(m_mpiInfo->rank%(d0*d1)/d0);
224      if (m_offset1 > 0)      if (m_offset[1] > 0)
225          m_offset1--;          m_offset[1]--;
226      m_offset2 = (n2+1)/m_NZ*(m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY));      m_offset[2] = (n2+1)/d2*(m_mpiInfo->rank/(d0*d1));
227      if (m_offset2 > 0)      if (m_offset[2] > 0)
228          m_offset2--;          m_offset[2]--;
229    
230      populateSampleIds();      populateSampleIds();
231      createPattern();      createPattern();
232        
233        assembler = new DefaultAssembler3D(this, m_dx, m_NX, m_NE, m_NN);
234        for (map<string, int>::const_iterator i = tagnamestonums.begin();
235                i != tagnamestonums.end(); i++) {
236            setTagMap(i->first, i->second);
237        }
238        addPoints(tags.size(), &points[0], &tags[0]);
239  }  }
240    
241    
242  Brick::~Brick()  Brick::~Brick()
243  {  {
244        Paso_SystemMatrixPattern_free(m_pattern);
245        Paso_Connector_free(m_connector);
246        delete assembler;
247  }  }
248    
249  string Brick::getDescription() const  string Brick::getDescription() const
# Line 99  bool Brick::operator==(const AbstractDom Line 256  bool Brick::operator==(const AbstractDom
256      const Brick* o=dynamic_cast<const Brick*>(&other);      const Brick* o=dynamic_cast<const Brick*>(&other);
257      if (o) {      if (o) {
258          return (RipleyDomain::operator==(other) &&          return (RipleyDomain::operator==(other) &&
259                  m_gNE0==o->m_gNE0 && m_gNE1==o->m_gNE1 && m_gNE2==o->m_gNE2                  m_gNE[0]==o->m_gNE[0] && m_gNE[1]==o->m_gNE[1] && m_gNE[2]==o->m_gNE[2]
260                  && m_l0==o->m_l0 && m_l1==o->m_l1 && m_l2==o->m_l2                  && m_origin[0]==o->m_origin[0] && m_origin[1]==o->m_origin[1] && m_origin[2]==o->m_origin[2]
261                  && m_NX==o->m_NX && m_NY==o->m_NY && m_NZ==o->m_NZ);                  && m_length[0]==o->m_length[0] && m_length[1]==o->m_length[1] && m_length[2]==o->m_length[2]
262                    && m_NX[0]==o->m_NX[0] && m_NX[1]==o->m_NX[1] && m_NX[2]==o->m_NX[2]);
263      }      }
264    
265      return false;      return false;
266  }  }
267    
268    void Brick::readNcGrid(escript::Data& out, string filename, string varname,
269                const ReaderParameters& params) const
270    {
271    #ifdef USE_NETCDF
272        // check destination function space
273        int myN0, myN1, myN2;
274        if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Nodes) {
275            myN0 = m_NN[0];
276            myN1 = m_NN[1];
277            myN2 = m_NN[2];
278        } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements ||
279                    out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
280            myN0 = m_NE[0];
281            myN1 = m_NE[1];
282            myN2 = m_NE[2];
283        } else
284            throw RipleyException("readNcGrid(): invalid function space for output data object");
285    
286        if (params.first.size() != 3)
287            throw RipleyException("readNcGrid(): argument 'first' must have 3 entries");
288    
289        if (params.numValues.size() != 3)
290            throw RipleyException("readNcGrid(): argument 'numValues' must have 3 entries");
291    
292        if (params.multiplier.size() != 3)
293            throw RipleyException("readNcGrid(): argument 'multiplier' must have 3 entries");
294        for (size_t i=0; i<params.multiplier.size(); i++)
295            if (params.multiplier[i]<1)
296                throw RipleyException("readNcGrid(): all multipliers must be positive");
297    
298        // check file existence and size
299        NcFile f(filename.c_str(), NcFile::ReadOnly);
300        if (!f.is_valid())
301            throw RipleyException("readNcGrid(): cannot open file");
302    
303        NcVar* var = f.get_var(varname.c_str());
304        if (!var)
305            throw RipleyException("readNcGrid(): invalid variable name");
306    
307        // TODO: rank>0 data support
308        const int numComp = out.getDataPointSize();
309        if (numComp > 1)
310            throw RipleyException("readNcGrid(): only scalar data supported");
311    
312        const int dims = var->num_dims();
313        boost::scoped_array<long> edges(var->edges());
314    
315        // is this a slice of the data object (dims!=3)?
316        // note the expected ordering of edges (as in numpy: z,y,x)
317        if ( (dims==3 && (params.numValues[2] > edges[0] ||
318                          params.numValues[1] > edges[1] ||
319                          params.numValues[0] > edges[2]))
320                || (dims==2 && params.numValues[2]>1)
321                || (dims==1 && (params.numValues[2]>1 || params.numValues[1]>1)) ) {
322            throw RipleyException("readNcGrid(): not enough data in file");
323        }
324    
325        // check if this rank contributes anything
326        if (params.first[0] >= m_offset[0]+myN0 ||
327                params.first[0]+params.numValues[0]*params.multiplier[0] <= m_offset[0] ||
328                params.first[1] >= m_offset[1]+myN1 ||
329                params.first[1]+params.numValues[1]*params.multiplier[1] <= m_offset[1] ||
330                params.first[2] >= m_offset[2]+myN2 ||
331                params.first[2]+params.numValues[2]*params.multiplier[2] <= m_offset[2]) {
332            return;
333        }
334    
335        // now determine how much this rank has to write
336    
337        // first coordinates in data object to write to
338        const int first0 = max(0, params.first[0]-m_offset[0]);
339        const int first1 = max(0, params.first[1]-m_offset[1]);
340        const int first2 = max(0, params.first[2]-m_offset[2]);
341        // indices to first value in file (not accounting for reverse yet)
342        int idx0 = max(0, m_offset[0]-params.first[0]);
343        int idx1 = max(0, m_offset[1]-params.first[1]);
344        int idx2 = max(0, m_offset[2]-params.first[2]);
345        // number of values to read
346        const int num0 = min(params.numValues[0]-idx0, myN0-first0);
347        const int num1 = min(params.numValues[1]-idx1, myN1-first1);
348        const int num2 = min(params.numValues[2]-idx2, myN2-first2);
349    
350        // make sure we read the right block if going backwards through file
351        if (params.reverse[0])
352            idx0 = edges[dims-1]-num0-idx0;
353        if (dims>1 && params.reverse[1])
354            idx1 = edges[dims-2]-num1-idx1;
355        if (dims>2 && params.reverse[2])
356            idx2 = edges[dims-3]-num2-idx2;
357    
358    
359        vector<double> values(num0*num1*num2);
360        if (dims==3) {
361            var->set_cur(idx2, idx1, idx0);
362            var->get(&values[0], num2, num1, num0);
363        } else if (dims==2) {
364            var->set_cur(idx1, idx0);
365            var->get(&values[0], num1, num0);
366        } else {
367            var->set_cur(idx0);
368            var->get(&values[0], num0);
369        }
370    
371        const int dpp = out.getNumDataPointsPerSample();
372        out.requireWrite();
373    
374        // helpers for reversing
375        const int x0 = (params.reverse[0] ? num0-1 : 0);
376        const int x_mult = (params.reverse[0] ? -1 : 1);
377        const int y0 = (params.reverse[1] ? num1-1 : 0);
378        const int y_mult = (params.reverse[1] ? -1 : 1);
379        const int z0 = (params.reverse[2] ? num2-1 : 0);
380        const int z_mult = (params.reverse[2] ? -1 : 1);
381    
382        for (index_t z=0; z<num2; z++) {
383            for (index_t y=0; y<num1; y++) {
384    #pragma omp parallel for
385                for (index_t x=0; x<num0; x++) {
386                    const int baseIndex = first0+x*params.multiplier[0]
387                                         +(first1+y*params.multiplier[1])*myN0
388                                         +(first2+z*params.multiplier[2])*myN0*myN1;
389                    const int srcIndex=(z0+z_mult*z)*num1*num0
390                                      +(y0+y_mult*y)*num0
391                                      +(x0+x_mult*x);
392                    if (!isnan(values[srcIndex])) {
393                        for (index_t m2=0; m2<params.multiplier[2]; m2++) {
394                            for (index_t m1=0; m1<params.multiplier[1]; m1++) {
395                                for (index_t m0=0; m0<params.multiplier[0]; m0++) {
396                                    const int dataIndex = baseIndex+m0
397                                                   +m1*myN0
398                                                   +m2*myN0*myN1;
399                                    double* dest = out.getSampleDataRW(dataIndex);
400                                    for (index_t q=0; q<dpp; q++) {
401                                        *dest++ = values[srcIndex];
402                                    }
403                                }
404                            }
405                        }
406                    }
407                }
408            }
409        }
410    #else
411        throw RipleyException("readNcGrid(): not compiled with netCDF support");
412    #endif
413    }
414    
415    void Brick::readBinaryGrid(escript::Data& out, string filename,
416                               const ReaderParameters& params) const
417    {
418        // the mapping is not universally correct but should work on our
419        // supported platforms
420        switch (params.dataType) {
421            case DATATYPE_INT32:
422                readBinaryGridImpl<int>(out, filename, params);
423                break;
424            case DATATYPE_FLOAT32:
425                readBinaryGridImpl<float>(out, filename, params);
426                break;
427            case DATATYPE_FLOAT64:
428                readBinaryGridImpl<double>(out, filename, params);
429                break;
430            default:
431                throw RipleyException("readBinaryGrid(): invalid or unsupported datatype");
432        }
433    }
434    
435    template<typename ValueType>
436    void Brick::readBinaryGridImpl(escript::Data& out, const string& filename,
437                                   const ReaderParameters& params) const
438    {
439        // check destination function space
440        int myN0, myN1, myN2;
441        if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Nodes) {
442            myN0 = m_NN[0];
443            myN1 = m_NN[1];
444            myN2 = m_NN[2];
445        } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements ||
446                    out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
447            myN0 = m_NE[0];
448            myN1 = m_NE[1];
449            myN2 = m_NE[2];
450        } else
451            throw RipleyException("readBinaryGrid(): invalid function space for output data object");
452    
453        if (params.first.size() != 3)
454            throw RipleyException("readBinaryGrid(): argument 'first' must have 3 entries");
455    
456        if (params.numValues.size() != 3)
457            throw RipleyException("readBinaryGrid(): argument 'numValues' must have 3 entries");
458    
459        if (params.multiplier.size() != 3)
460            throw RipleyException("readBinaryGrid(): argument 'multiplier' must have 3 entries");
461        for (size_t i=0; i<params.multiplier.size(); i++)
462            if (params.multiplier[i]<1)
463                throw RipleyException("readBinaryGrid(): all multipliers must be positive");
464    
465        // check file existence and size
466        ifstream f(filename.c_str(), ifstream::binary);
467        if (f.fail()) {
468            throw RipleyException("readBinaryGrid(): cannot open file");
469        }
470        f.seekg(0, ios::end);
471        const int numComp = out.getDataPointSize();
472        const int filesize = f.tellg();
473        const int reqsize = params.numValues[0]*params.numValues[1]*params.numValues[2]*numComp*sizeof(ValueType);
474        if (filesize < reqsize) {
475            f.close();
476            throw RipleyException("readBinaryGrid(): not enough data in file");
477        }
478    
479        // check if this rank contributes anything
480        if (params.first[0] >= m_offset[0]+myN0 ||
481                params.first[0]+params.numValues[0]*params.multiplier[0] <= m_offset[0] ||
482                params.first[1] >= m_offset[1]+myN1 ||
483                params.first[1]+params.numValues[1]*params.multiplier[1] <= m_offset[1] ||
484                params.first[2] >= m_offset[2]+myN2 ||
485                params.first[2]+params.numValues[2]*params.multiplier[2] <= m_offset[2]) {
486            f.close();
487            return;
488        }
489    
490        // now determine how much this rank has to write
491    
492        // first coordinates in data object to write to
493        const int first0 = max(0, params.first[0]-m_offset[0]);
494        const int first1 = max(0, params.first[1]-m_offset[1]);
495        const int first2 = max(0, params.first[2]-m_offset[2]);
496        // indices to first value in file
497        const int idx0 = max(0, m_offset[0]-params.first[0]);
498        const int idx1 = max(0, m_offset[1]-params.first[1]);
499        const int idx2 = max(0, m_offset[2]-params.first[2]);
500        // number of values to read
501        const int num0 = min(params.numValues[0]-idx0, myN0-first0);
502        const int num1 = min(params.numValues[1]-idx1, myN1-first1);
503        const int num2 = min(params.numValues[2]-idx2, myN2-first2);
504    
505        out.requireWrite();
506        vector<ValueType> values(num0*numComp);
507        const int dpp = out.getNumDataPointsPerSample();
508    
509        for (int z=0; z<num2; z++) {
510            for (int y=0; y<num1; y++) {
511                const int fileofs = numComp*(idx0+(idx1+y)*params.numValues[0]
512                                 +(idx2+z)*params.numValues[0]*params.numValues[1]);
513                f.seekg(fileofs*sizeof(ValueType));
514                f.read((char*)&values[0], num0*numComp*sizeof(ValueType));
515    
516                for (int x=0; x<num0; x++) {
517                    const int baseIndex = first0+x*params.multiplier[0]
518                                         +(first1+y*params.multiplier[1])*myN0
519                                         +(first2+z*params.multiplier[2])*myN0*myN1;
520                    for (int m2=0; m2<params.multiplier[2]; m2++) {
521                        for (int m1=0; m1<params.multiplier[1]; m1++) {
522                            for (int m0=0; m0<params.multiplier[0]; m0++) {
523                                const int dataIndex = baseIndex+m0
524                                               +m1*myN0
525                                               +m2*myN0*myN1;
526                                double* dest = out.getSampleDataRW(dataIndex);
527                                for (int c=0; c<numComp; c++) {
528                                    ValueType val = values[x*numComp+c];
529    
530                                    if (params.byteOrder != BYTEORDER_NATIVE) {
531                                        char* cval = reinterpret_cast<char*>(&val);
532                                        // this will alter val!!
533                                        byte_swap32(cval);
534                                    }
535                                    if (!std::isnan(val)) {
536                                        for (int q=0; q<dpp; q++) {
537                                            *dest++ = static_cast<double>(val);
538                                        }
539                                    }
540                                }
541                            }
542                        }
543                    }
544                }
545            }
546        }
547    
548        f.close();
549    }
550    
551    void Brick::writeBinaryGrid(const escript::Data& in, string filename,
552                                int byteOrder, int dataType) const
553    {
554        // the mapping is not universally correct but should work on our
555        // supported platforms
556        switch (dataType) {
557            case DATATYPE_INT32:
558                writeBinaryGridImpl<int>(in, filename, byteOrder);
559                break;
560            case DATATYPE_FLOAT32:
561                writeBinaryGridImpl<float>(in, filename, byteOrder);
562                break;
563            case DATATYPE_FLOAT64:
564                writeBinaryGridImpl<double>(in, filename, byteOrder);
565                break;
566            default:
567                throw RipleyException("writeBinaryGrid(): invalid or unsupported datatype");
568        }
569    }
570    
571    template<typename ValueType>
572    void Brick::writeBinaryGridImpl(const escript::Data& in,
573                                    const string& filename, int byteOrder) const
574    {
575        // check function space and determine number of points
576        int myN0, myN1, myN2;
577        int totalN0, totalN1, totalN2;
578        if (in.getFunctionSpace().getTypeCode() == Nodes) {
579            myN0 = m_NN[0];
580            myN1 = m_NN[1];
581            myN2 = m_NN[2];
582            totalN0 = m_gNE[0]+1;
583            totalN1 = m_gNE[1]+1;
584            totalN2 = m_gNE[2]+1;
585        } else if (in.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements ||
586                    in.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
587            myN0 = m_NE[0];
588            myN1 = m_NE[1];
589            myN2 = m_NE[2];
590            totalN0 = m_gNE[0];
591            totalN1 = m_gNE[1];
592            totalN2 = m_gNE[2];
593        } else
594            throw RipleyException("writeBinaryGrid(): invalid function space of data object");
595    
596        const int numComp = in.getDataPointSize();
597        const int dpp = in.getNumDataPointsPerSample();
598        const int fileSize = sizeof(ValueType)*numComp*dpp*totalN0*totalN1*totalN2;
599    
600        if (numComp > 1 || dpp > 1)
601            throw RipleyException("writeBinaryGrid(): only scalar, single-value data supported");
602    
603        // from here on we know that each sample consists of one value
604        FileWriter fw;
605        fw.openFile(filename, fileSize);
606        MPIBarrier();
607    
608        for (index_t z=0; z<myN2; z++) {
609            for (index_t y=0; y<myN1; y++) {
610                const int fileofs = (m_offset[0]+(m_offset[1]+y)*totalN0
611                                    +(m_offset[2]+z)*totalN0*totalN1)*sizeof(ValueType);
612                ostringstream oss;
613    
614                for (index_t x=0; x<myN0; x++) {
615                    const double* sample = in.getSampleDataRO(z*myN0*myN1+y*myN0+x);
616                    ValueType fvalue = static_cast<ValueType>(*sample);
617                    if (byteOrder == BYTEORDER_NATIVE) {
618                        oss.write((char*)&fvalue, sizeof(fvalue));
619                    } else {
620                        char* value = reinterpret_cast<char*>(&fvalue);
621                        oss.write(byte_swap32(value), sizeof(fvalue));
622                    }
623                }
624                fw.writeAt(oss, fileofs);
625            }
626        }
627        fw.close();
628    }
629    
630  void Brick::dump(const string& fileName) const  void Brick::dump(const string& fileName) const
631  {  {
632  #if USE_SILO  #if USE_SILO
# Line 115  void Brick::dump(const string& fileName) Line 635  void Brick::dump(const string& fileName)
635          fn+=".silo";          fn+=".silo";
636      }      }
637    
     const int NUM_SILO_FILES = 1;  
     const char* blockDirFmt = "/block%04d";  
638      int driver=DB_HDF5;          int driver=DB_HDF5;    
639      string siloPath;      string siloPath;
640      DBfile* dbfile = NULL;      DBfile* dbfile = NULL;
641    
642  #ifdef ESYS_MPI  #ifdef ESYS_MPI
643      PMPIO_baton_t* baton = NULL;      PMPIO_baton_t* baton = NULL;
644        const int NUM_SILO_FILES = 1;
645        const char* blockDirFmt = "/block%04d";
646  #endif  #endif
647    
648      if (m_mpiInfo->size > 1) {      if (m_mpiInfo->size > 1) {
# Line 167  void Brick::dump(const string& fileName) Line 687  void Brick::dump(const string& fileName)
687      }      }
688      */      */
689    
690      boost::scoped_ptr<double> x(new double[m_N0]);      boost::scoped_ptr<double> x(new double[m_NN[0]]);
691      boost::scoped_ptr<double> y(new double[m_N1]);      boost::scoped_ptr<double> y(new double[m_NN[1]]);
692      boost::scoped_ptr<double> z(new double[m_N2]);      boost::scoped_ptr<double> z(new double[m_NN[2]]);
693      double* coords[3] = { x.get(), y.get(), z.get() };      double* coords[3] = { x.get(), y.get(), z.get() };
     pair<double,double> xdx = getFirstCoordAndSpacing(0);  
     pair<double,double> ydy = getFirstCoordAndSpacing(1);  
     pair<double,double> zdz = getFirstCoordAndSpacing(2);  
694  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
695      {      {
696  #pragma omp for  #pragma omp for
697          for (dim_t i0 = 0; i0 < m_N0; i0++) {          for (dim_t i0 = 0; i0 < m_NN[0]; i0++) {
698              coords[0][i0]=xdx.first+i0*xdx.second;              coords[0][i0]=getLocalCoordinate(i0, 0);
699          }          }
700  #pragma omp for  #pragma omp for
701          for (dim_t i1 = 0; i1 < m_N1; i1++) {          for (dim_t i1 = 0; i1 < m_NN[1]; i1++) {
702              coords[1][i1]=ydy.first+i1*ydy.second;              coords[1][i1]=getLocalCoordinate(i1, 1);
703          }          }
704  #pragma omp for  #pragma omp for
705          for (dim_t i2 = 0; i2 < m_N2; i2++) {          for (dim_t i2 = 0; i2 < m_NN[2]; i2++) {
706              coords[2][i2]=zdz.first+i2*zdz.second;              coords[2][i2]=getLocalCoordinate(i2, 2);
707          }          }
708      }      }
709      IndexVector dims = getNumNodesPerDim();      int* dims = const_cast<int*>(getNumNodesPerDim());
710      DBPutQuadmesh(dbfile, "mesh", NULL, coords, &dims[0], 3, DB_DOUBLE,  
711        // write mesh
712        DBPutQuadmesh(dbfile, "mesh", NULL, coords, dims, 3, DB_DOUBLE,
713              DB_COLLINEAR, NULL);              DB_COLLINEAR, NULL);
714    
715      DBPutQuadvar1(dbfile, "nodeId", "mesh", (void*)&m_nodeId[0], &dims[0], 3,      // write node ids
716        DBPutQuadvar1(dbfile, "nodeId", "mesh", (void*)&m_nodeId[0], dims, 3,
717              NULL, 0, DB_INT, DB_NODECENT, NULL);              NULL, 0, DB_INT, DB_NODECENT, NULL);
718    
719      // write element ids      // write element ids
720      dims = getNumElementsPerDim();      dims = const_cast<int*>(getNumElementsPerDim());
721      DBPutQuadvar1(dbfile, "elementId", "mesh", (void*)&m_elementId[0],      DBPutQuadvar1(dbfile, "elementId", "mesh", (void*)&m_elementId[0],
722              &dims[0], 3, NULL, 0, DB_INT, DB_ZONECENT, NULL);              dims, 3, NULL, 0, DB_INT, DB_ZONECENT, NULL);
723    
724      // rank 0 writes multimesh and multivar      // rank 0 writes multimesh and multivar
725      if (m_mpiInfo->rank == 0) {      if (m_mpiInfo->rank == 0) {
# Line 248  void Brick::dump(const string& fileName) Line 768  void Brick::dump(const string& fileName)
768      }      }
769    
770  #else // USE_SILO  #else // USE_SILO
771      throw RipleyException("dump(): no Silo support");      throw RipleyException("dump: no Silo support");
772  #endif  #endif
773  }  }
774    
# Line 267  const int* Brick::borrowSampleReferenceI Line 787  const int* Brick::borrowSampleReferenceI
787          case FaceElements:          case FaceElements:
788          case ReducedFaceElements:          case ReducedFaceElements:
789              return &m_faceId[0];              return &m_faceId[0];
790            case Points:
791                return &m_diracPointNodeIDs[0];
792          default:          default:
793              break;              break;
794      }      }
795    
796      stringstream msg;      stringstream msg;
797      msg << "borrowSampleReferenceIDs() not implemented for function space type "      msg << "borrowSampleReferenceIDs: invalid function space type "<<fsType;
         << fsType;  
798      throw RipleyException(msg.str());      throw RipleyException(msg.str());
799  }  }
800    
# Line 293  bool Brick::ownSample(int fsType, index_ Line 814  bool Brick::ownSample(int fsType, index_
814          case ReducedElements:          case ReducedElements:
815              {              {
816                  // check ownership of element's _last_ node                  // check ownership of element's _last_ node
817                  const index_t x=id%m_NE0 + 1;                  const index_t x=id%m_NE[0] + 1;
818                  const index_t y=id%(m_NE0*m_NE1)/m_NE0 + 1;                  const index_t y=id%(m_NE[0]*m_NE[1])/m_NE[0] + 1;
819                  const index_t z=id/(m_NE0*m_NE1) + 1;                  const index_t z=id/(m_NE[0]*m_NE[1]) + 1;
820                  return (m_dofMap[x + m_N0*y +m_N0*m_N1*z] < getNumDOF());                  return (m_dofMap[x + m_NN[0]*y + m_NN[0]*m_NN[1]*z] < getNumDOF());
821              }              }
822          case FaceElements:          case FaceElements:
823          case ReducedFaceElements:          case ReducedFaceElements:
824              {              {
825                  // check ownership of face element's last node                  // check ownership of face element's last node
                 const IndexVector faces = getNumFacesPerBoundary();  
826                  dim_t n=0;                  dim_t n=0;
827                  for (size_t i=0; i<faces.size(); i++) {                  for (size_t i=0; i<6; i++) {
828                      n+=faces[i];                      n+=m_faceCount[i];
829                      if (id<n) {                      if (id<n) {
830                          const index_t j=id-n+faces[i];                          const index_t j=id-n+m_faceCount[i];
831                          if (i>=4) { // front or back                          if (i>=4) { // front or back
832                              const index_t first=(i==4 ? 0 : m_N0*m_N1*(m_N2-1));                              const index_t first=(i==4 ? 0 : m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1));
833                              return (m_dofMap[first+j%m_NE0+1+(j/m_NE0+1)*m_N0] < getNumDOF());                              return (m_dofMap[first+j%m_NE[0]+1+(j/m_NE[0]+1)*m_NN[0]] < getNumDOF());
834                          } else if (i>=2) { // bottom or top                          } else if (i>=2) { // bottom or top
835                              const index_t first=(i==2 ? 0 : m_N0*(m_N1-1));                              const index_t first=(i==2 ? 0 : m_NN[0]*(m_NN[1]-1));
836                              return (m_dofMap[first+j%m_NE0+1+(j/m_NE0+1)*m_N0*m_N1] < getNumDOF());                              return (m_dofMap[first+j%m_NE[0]+1+(j/m_NE[0]+1)*m_NN[0]*m_NN[1]] < getNumDOF());
837                          } else { // left or right                          } else { // left or right
838                              const index_t first=(i==0 ? 0 : m_N0-1);                              const index_t first=(i==0 ? 0 : m_NN[0]-1);
839                              return (m_dofMap[first+(j%m_NE1+1)*m_N0+(j/m_NE1+1)*m_N0*m_N1] < getNumDOF());                              return (m_dofMap[first+(j%m_NE[1]+1)*m_NN[0]+(j/m_NE[1]+1)*m_NN[0]*m_NN[1]] < getNumDOF());
840                          }                          }
841                      }                      }
842                  }                  }
# Line 327  bool Brick::ownSample(int fsType, index_ Line 847  bool Brick::ownSample(int fsType, index_
847      }      }
848    
849      stringstream msg;      stringstream msg;
850      msg << "ownSample() not implemented for "      msg << "ownSample: invalid function space type " << fsType;
         << functionSpaceTypeAsString(fsType);  
851      throw RipleyException(msg.str());      throw RipleyException(msg.str());
852  }  }
853    
 void Brick::setToGradient(escript::Data& out, const escript::Data& cIn) const  
 {  
     escript::Data& in = *const_cast<escript::Data*>(&cIn);  
     const dim_t numComp = in.getDataPointSize();  
     const double h0 = m_l0/m_gNE0;  
     const double h1 = m_l1/m_gNE1;  
     const double h2 = m_l1/m_gNE2;  
     const double C0 = .044658198738520451079;  
     const double C1 = .16666666666666666667;  
     const double C2 = .21132486540518711775;  
     const double C3 = .25;  
     const double C4 = .5;  
     const double C5 = .62200846792814621559;  
     const double C6 = .78867513459481288225;  
   
     if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements) {  
         out.requireWrite();  
         /*** GENERATOR SNIP_GRAD_ELEMENTS TOP */  
 #pragma omp parallel for  
         for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
             for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                 for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                     const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_N0,m_N1));  
                     const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                     const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                     const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                     const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_N0,m_N1));  
                     const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                     const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_N0,m_N1));  
                     const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_N0,m_N1));  
                     double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE0,m_NE1));  
                     for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                         const double V0=((f_100[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_011[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;  
                         const double V1=((f_110[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_001[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / h0;  
                         const double V2=((f_101[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_010[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / h0;  
                         const double V3=((f_111[i]-f_011[i])*C5 + (f_100[i]-f_000[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;  
                         const double V4=((f_010[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_101[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;  
                         const double V5=((f_110[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_001[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / h1;  
                         const double V6=((f_011[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_100[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / h1;  
                         const double V7=((f_111[i]-f_101[i])*C5 + (f_010[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;  
                         const double V8=((f_001[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_110[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;  
                         const double V9=((f_101[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_010[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / h2;  
                         const double V10=((f_011[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_100[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / h2;  
                         const double V11=((f_111[i]-f_110[i])*C5 + (f_001[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;  
                         o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;  
                         o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V4;  
                         o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V8;  
                         o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;  
                         o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V5;  
                         o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V9;  
                         o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V1;  
                         o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V4;  
                         o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V10;  
                         o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;  
                         o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V5;  
                         o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V11;  
                         o[INDEX3(i,0,4,numComp,3)] = V2;  
                         o[INDEX3(i,1,4,numComp,3)] = V6;  
                         o[INDEX3(i,2,4,numComp,3)] = V8;  
                         o[INDEX3(i,0,5,numComp,3)] = V2;  
                         o[INDEX3(i,1,5,numComp,3)] = V7;  
                         o[INDEX3(i,2,5,numComp,3)] = V9;  
                         o[INDEX3(i,0,6,numComp,3)] = V3;  
                         o[INDEX3(i,1,6,numComp,3)] = V6;  
                         o[INDEX3(i,2,6,numComp,3)] = V10;  
                         o[INDEX3(i,0,7,numComp,3)] = V3;  
                         o[INDEX3(i,1,7,numComp,3)] = V7;  
                         o[INDEX3(i,2,7,numComp,3)] = V11;  
                     } /* end of component loop i */  
                 } /* end of k0 loop */  
             } /* end of k1 loop */  
         } /* end of k2 loop */  
         /* GENERATOR SNIP_GRAD_ELEMENTS BOTTOM */  
     } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {  
         out.requireWrite();  
         /*** GENERATOR SNIP_GRAD_REDUCED_ELEMENTS TOP */  
 #pragma omp parallel for  
         for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
             for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                 for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                     const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_N0,m_N1));  
                     const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                     const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                     const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                     const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_N0,m_N1));  
                     const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_N0,m_N1));  
                     const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_N0,m_N1));  
                     const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                     double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE0,m_NE1));  
                     for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                         o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_010[i]-f_011[i])*C3 / h0;  
                         o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_100[i]-f_101[i])*C3 / h1;  
                         o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]+f_101[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_010[i]-f_100[i]-f_110[i])*C3 / h2;  
                     } /* end of component loop i */  
                 } /* end of k0 loop */  
             } /* end of k1 loop */  
         } /* end of k2 loop */  
         /* GENERATOR SNIP_GRAD_REDUCED_ELEMENTS BOTTOM */  
     } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == FaceElements) {  
         out.requireWrite();  
         /*** GENERATOR SNIP_GRAD_FACES TOP */  
 #pragma omp parallel  
         {  
             if (m_faceOffset[0] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                         const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2, m_N0,m_N1));  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             const double V0=((f_010[i]-f_000[i])*C6 + (f_011[i]-f_001[i])*C2) / h1;  
                             const double V1=((f_010[i]-f_000[i])*C2 + (f_011[i]-f_001[i])*C6) / h1;  
                             const double V2=((f_001[i]-f_000[i])*C6 + (f_010[i]-f_011[i])*C2) / h2;  
                             const double V3=((f_001[i]-f_000[i])*C2 + (f_011[i]-f_010[i])*C6) / h2;  
                             o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = ((f_100[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_011[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;  
                             o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V0;  
                             o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V2;  
                             o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_001[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / h0;  
                             o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V0;  
                             o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V3;  
                             o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = ((f_101[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_010[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / h0;  
                             o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V1;  
                             o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V2;  
                             o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_011[i])*C5 + (f_100[i]-f_000[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;  
                             o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V1;  
                             o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V3;  
                         } /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             } /* end of face 0 */  
             if (m_faceOffset[1] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                         const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1+1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2, m_N0,m_N1));  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             const double V0=((f_110[i]-f_100[i])*C6 + (f_111[i]-f_101[i])*C2) / h1;  
                             const double V1=((f_110[i]-f_100[i])*C2 + (f_111[i]-f_101[i])*C6) / h1;  
                             const double V2=((f_101[i]-f_100[i])*C6 + (f_111[i]-f_110[i])*C2) / h2;  
                             const double V3=((f_101[i]-f_100[i])*C2 + (f_111[i]-f_110[i])*C6) / h2;  
                             o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = ((f_100[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_011[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;  
                             o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V0;  
                             o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V2;  
                             o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_001[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / h0;  
                             o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V0;  
                             o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V3;  
                             o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = ((f_101[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_010[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / h0;  
                             o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V1;  
                             o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V2;  
                             o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_011[i])*C5 + (f_100[i]-f_000[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / h0;  
                             o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V1;  
                             o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V3;  
                         } /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             } /* end of face 1 */  
             if (m_faceOffset[2] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2, m_N0,m_N1));  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             const double V0=((f_100[i]-f_000[i])*C6 + (f_101[i]-f_001[i])*C2) / h0;  
                             const double V1=((f_001[i]-f_000[i])*C6 + (f_101[i]-f_100[i])*C2) / h2;  
                             const double V2=((f_001[i]-f_000[i])*C2 + (f_101[i]-f_100[i])*C6) / h2;  
                             o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;  
                             o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = ((f_010[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_101[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;  
                             o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V1;  
                             o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;  
                             o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_001[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / h1;  
                             o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V2;  
                             o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V0;  
                             o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_100[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / h1;  
                             o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V1;  
                             o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V0;  
                             o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_101[i])*C5 + (f_010[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;  
                             o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V2;  
                         } /* end of component loop i */  
                     } /* end of k0 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             } /* end of face 2 */  
             if (m_faceOffset[3] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-2,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-2,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-2,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-2,k2, m_N0,m_N1));  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             const double V0=((f_110[i]-f_010[i])*C6 + (f_111[i]-f_011[i])*C2) / h0;  
                             const double V1=((f_110[i]-f_010[i])*C2 + (f_111[i]-f_011[i])*C6) / h0;  
                             const double V2=((f_011[i]-f_010[i])*C6 + (f_111[i]-f_110[i])*C2) / h2;  
                             const double V3=((f_011[i]-f_010[i])*C2 + (f_111[i]-f_110[i])*C6) / h2;  
                             o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;  
                             o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = ((f_010[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_101[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;  
                             o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V2;  
                             o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;  
                             o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_001[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / h1;  
                             o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V3;  
                             o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V1;  
                             o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_100[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / h1;  
                             o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V2;  
                             o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;  
                             o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_101[i])*C5 + (f_010[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / h1;  
                             o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V3;  
                         } /* end of component loop i */  
                     } /* end of k0 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             } /* end of face 3 */  
             if (m_faceOffset[4] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,1, m_N0,m_N1));  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             const double V0=((f_100[i]-f_000[i])*C6 + (f_110[i]-f_010[i])*C2) / h0;  
                             const double V1=((f_100[i]-f_000[i])*C2 + (f_110[i]-f_010[i])*C6) / h0;  
                             const double V2=((f_010[i]-f_000[i])*C6 + (f_110[i]-f_100[i])*C2) / h1;  
                             const double V3=((f_010[i]-f_000[i])*C2 + (f_110[i]-f_100[i])*C6) / h1;  
                             o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;  
                             o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V2;  
                             o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = ((f_001[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_110[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;  
                             o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;  
                             o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V3;  
                             o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = ((f_101[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_010[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / h2;  
                             o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V1;  
                             o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V2;  
                             o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_100[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / h2;  
                             o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;  
                             o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V3;  
                             o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_110[i])*C5 + (f_001[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;  
                         } /* end of component loop i */  
                     } /* end of k0 loop */  
                 } /* end of k1 loop */  
             } /* end of face 4 */  
             if (m_faceOffset[5] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-2, m_N0,m_N1));  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             const double V0=((f_101[i]-f_001[i])*C6 + (f_111[i]-f_011[i])*C2) / h0;  
                             const double V1=((f_101[i]-f_001[i])*C2 + (f_111[i]-f_011[i])*C6) / h0;  
                             const double V2=((f_011[i]-f_001[i])*C6 + (f_111[i]-f_101[i])*C2) / h1;  
                             const double V3=((f_011[i]-f_001[i])*C2 + (f_111[i]-f_101[i])*C6) / h1;  
                             o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;  
                             o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V2;  
                             o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = ((f_001[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_110[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;  
                             o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;  
                             o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V3;  
                             o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_010[i])*C0 + (f_101[i]-f_100[i])*C5 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / h2;  
                             o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V1;  
                             o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V2;  
                             o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_100[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / h2;  
                             o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;  
                             o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V3;  
                             o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = ((f_001[i]-f_000[i])*C0 + (f_111[i]-f_110[i])*C5 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / h2;  
                         } /* end of component loop i */  
                     } /* end of k0 loop */  
                 } /* end of k1 loop */  
             } /* end of face 5 */  
         } // end of parallel section  
         /* GENERATOR SNIP_GRAD_FACES BOTTOM */  
     } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedFaceElements) {  
         out.requireWrite();  
         /*** GENERATOR SNIP_GRAD_REDUCED_FACES TOP */  
 #pragma omp parallel  
         {  
             if (m_faceOffset[0] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                         const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_010[i]-f_011[i])*C3 / h0;  
                             o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]-f_000[i]-f_001[i])*C4 / h1;  
                             o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]-f_000[i]-f_010[i])*C4 / h2;  
                         } /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             } /* end of face 0 */  
             if (m_faceOffset[1] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                         const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-2,k1+1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_010[i]-f_011[i])*C3 / h0;  
                             o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_110[i]+f_111[i]-f_100[i]-f_101[i])*C4 / h1;  
                             o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_101[i]+f_111[i]-f_100[i]-f_110[i])*C4 / h2;  
                         } /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             } /* end of face 1 */  
             if (m_faceOffset[2] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]-f_000[i]-f_001[i])*C4 / h0;  
                             o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_100[i]-f_101[i])*C3 / h1;  
                             o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_101[i]-f_000[i]-f_100[i])*C4 / h2;  
                         } /* end of component loop i */  
                     } /* end of k0 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             } /* end of face 2 */  
             if (m_faceOffset[3] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-2,k2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-2,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-2,k2+1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-2,k2, m_N0,m_N1));  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_110[i]+f_111[i]-f_010[i]-f_011[i])*C4 / h0;  
                             o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_100[i]-f_101[i])*C3 / h1;  
                             o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_011[i]+f_111[i]-f_010[i]-f_110[i])*C4 / h2;  
                         } /* end of component loop i */  
                     } /* end of k0 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             } /* end of face 3 */  
             if (m_faceOffset[4] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,1, m_N0,m_N1));  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_110[i]-f_000[i]-f_010[i])*C4 / h0;  
                             o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_110[i]-f_000[i]-f_100[i])*C4 / h1;  
                             o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]+f_101[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_010[i]-f_100[i]-f_110[i])*C4 / h2;  
                         } /* end of component loop i */  
                     } /* end of k0 loop */  
                 } /* end of k1 loop */  
             } /* end of face 4 */  
             if (m_faceOffset[5] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-2, m_N0,m_N1));  
                         const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-2, m_N0,m_N1));  
                         double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_101[i]+f_111[i]-f_001[i]-f_011[i])*C4 / h0;  
                             o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_011[i]+f_111[i]-f_001[i]-f_101[i])*C4 / h1;  
                             o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]+f_101[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_010[i]-f_100[i]-f_110[i])*C3 / h2;  
                         } /* end of component loop i */  
                     } /* end of k0 loop */  
                 } /* end of k1 loop */  
             } /* end of face 5 */  
         } // end of parallel section  
         /* GENERATOR SNIP_GRAD_REDUCED_FACES BOTTOM */  
     } else {  
         stringstream msg;  
         msg << "setToGradient() not implemented for "  
             << functionSpaceTypeAsString(out.getFunctionSpace().getTypeCode());  
         throw RipleyException(msg.str());  
     }  
 }  
   
 void Brick::setToIntegrals(vector<double>& integrals, const escript::Data& arg) const  
 {  
     escript::Data& in = *const_cast<escript::Data*>(&arg);  
     const dim_t numComp = in.getDataPointSize();  
     const double h0 = m_l0/m_gNE0;  
     const double h1 = m_l1/m_gNE1;  
     const double h2 = m_l2/m_gNE2;  
     if (arg.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements) {  
         const double w_0 = h0*h1*h2/8.;  
 #pragma omp parallel  
         {  
             vector<double> int_local(numComp, 0);  
 #pragma omp for nowait  
             for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                 for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                     for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const double* f = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0, k1, k2, m_NE0, m_NE1));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             const register double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];  
                             const register double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];  
                             const register double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];  
                             const register double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];  
                             const register double f_4 = f[INDEX2(i,4,numComp)];  
                             const register double f_5 = f[INDEX2(i,5,numComp)];  
                             const register double f_6 = f[INDEX2(i,6,numComp)];  
                             const register double f_7 = f[INDEX2(i,7,numComp)];  
                             int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3+f_4+f_5+f_6+f_7)*w_0;  
                         }  /* end of component loop i */  
                     } /* end of k0 loop */  
                 } /* end of k1 loop */  
             } /* end of k2 loop */  
   
 #pragma omp critical  
             for (index_t i=0; i<numComp; i++)  
                 integrals[i]+=int_local[i];  
         } // end of parallel section  
     } else if (arg.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {  
         const double w_0 = h0*h1*h2;  
 #pragma omp parallel  
         {  
             vector<double> int_local(numComp, 0);  
 #pragma omp for nowait  
             for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                 for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                     for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const double* f = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0, k1, k2, m_NE0, m_NE1));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             int_local[i]+=f[i]*w_0;  
                         }  /* end of component loop i */  
                     } /* end of k0 loop */  
                 } /* end of k1 loop */  
             } /* end of k2 loop */  
   
 #pragma omp critical  
             for (index_t i=0; i<numComp; i++)  
                 integrals[i]+=int_local[i];  
         } // end of parallel section  
     } else if (arg.getFunctionSpace().getTypeCode() == FaceElements) {  
         const double w_0 = h1*h2/4.;  
         const double w_1 = h0*h2/4.;  
         const double w_2 = h0*h1/4.;  
 #pragma omp parallel  
         {  
             vector<double> int_local(numComp, 0);  
             if (m_faceOffset[0] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                         const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             const register double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];  
                             const register double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];  
                             const register double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];  
                             const register double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];  
                             int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_0;  
                         }  /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             }  
   
             if (m_faceOffset[1] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                         const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             const register double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];  
                             const register double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];  
                             const register double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];  
                             const register double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];  
                             int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_0;  
                         }  /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             }  
   
             if (m_faceOffset[2] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             const register double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];  
                             const register double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];  
                             const register double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];  
                             const register double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];  
                             int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_1;  
                         }  /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             }  
   
             if (m_faceOffset[3] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             const register double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];  
                             const register double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];  
                             const register double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];  
                             const register double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];  
                             int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_1;  
                         }  /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             }  
   
             if (m_faceOffset[4] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             const register double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];  
                             const register double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];  
                             const register double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];  
                             const register double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];  
                             int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_2;  
                         }  /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             }  
   
             if (m_faceOffset[5] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             const register double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];  
                             const register double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];  
                             const register double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];  
                             const register double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];  
                             int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_2;  
                         }  /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             }  
   
 #pragma omp critical  
             for (index_t i=0; i<numComp; i++)  
                 integrals[i]+=int_local[i];  
         } // end of parallel section  
   
     } else if (arg.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedFaceElements) {  
         const double w_0 = h1*h2;  
         const double w_1 = h0*h2;  
         const double w_2 = h0*h1;  
 #pragma omp parallel  
         {  
             vector<double> int_local(numComp, 0);  
             if (m_faceOffset[0] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                         const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             int_local[i]+=f[i]*w_0;  
                         }  /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             }  
   
             if (m_faceOffset[1] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                         const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             int_local[i]+=f[i]*w_0;  
                         }  /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             }  
   
             if (m_faceOffset[2] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             int_local[i]+=f[i]*w_1;  
                         }  /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             }  
   
             if (m_faceOffset[3] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             int_local[i]+=f[i]*w_1;  
                         }  /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             }  
   
             if (m_faceOffset[4] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             int_local[i]+=f[i]*w_2;  
                         }  /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             }  
   
             if (m_faceOffset[5] > -1) {  
 #pragma omp for nowait  
                 for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {  
                     for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {  
                         const double* f = in.getSampleDataRO(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));  
                         for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {  
                             int_local[i]+=f[i]*w_2;  
                         }  /* end of component loop i */  
                     } /* end of k1 loop */  
                 } /* end of k2 loop */  
             }  
   
 #pragma omp critical  
             for (index_t i=0; i<numComp; i++)  
                 integrals[i]+=int_local[i];  
         } // end of parallel section  
   
     } else {  
         stringstream msg;  
         msg << "setToIntegrals() not implemented for "  
             << functionSpaceTypeAsString(arg.getFunctionSpace().getTypeCode());  
         throw RipleyException(msg.str());  
     }  
 }  
   
854  void Brick::setToNormal(escript::Data& out) const  void Brick::setToNormal(escript::Data& out) const
855  {  {
856      if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == FaceElements) {      if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == FaceElements) {
# Line 1046  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 859  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
859          {          {
860              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
861  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
862                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
863                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
864                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
865                          // set vector at four quadrature points                          // set vector at four quadrature points
866                          *o++ = -1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;                          *o++ = -1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;
867                          *o++ = -1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;                          *o++ = -1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;
# Line 1060  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 873  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
873    
874              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
875  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
876                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
877                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
878                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
879                          // set vector at four quadrature points                          // set vector at four quadrature points
880                          *o++ = 1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;                          *o++ = 1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;
881                          *o++ = 1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;                          *o++ = 1.; *o++ = 0.; *o++ = 0.;
# Line 1074  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 887  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
887    
888              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
889  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
890                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
891                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
892                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
893                          // set vector at four quadrature points                          // set vector at four quadrature points
894                          *o++ = 0.; *o++ = -1.; *o++ = 0.;                          *o++ = 0.; *o++ = -1.; *o++ = 0.;
895                          *o++ = 0.; *o++ = -1.; *o++ = 0.;                          *o++ = 0.; *o++ = -1.; *o++ = 0.;
# Line 1088  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 901  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
901    
902              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
903  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
904                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
905                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
906                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
907                          // set vector at four quadrature points                          // set vector at four quadrature points
908                          *o++ = 0.; *o++ = 1.; *o++ = 0.;                          *o++ = 0.; *o++ = 1.; *o++ = 0.;
909                          *o++ = 0.; *o++ = 1.; *o++ = 0.;                          *o++ = 0.; *o++ = 1.; *o++ = 0.;
# Line 1102  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 915  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
915    
916              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
917  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
918                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
919                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
920                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
921                          // set vector at four quadrature points                          // set vector at four quadrature points
922                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = -1.;                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = -1.;
923                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = -1.;                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = -1.;
# Line 1116  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 929  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
929    
930              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
931  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
932                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
933                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
934                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
935                          // set vector at four quadrature points                          // set vector at four quadrature points
936                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = 1.;                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = 1.;
937                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = 1.;                          *o++ = 0.; *o++ = 0.; *o++ = 1.;
# Line 1134  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 947  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
947          {          {
948              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
949  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
950                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
951                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
952                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
953                          *o++ = -1.;                          *o++ = -1.;
954                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
955                          *o = 0.;                          *o = 0.;
# Line 1146  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 959  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
959    
960              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
961  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
962                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
963                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
964                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
965                          *o++ = 1.;                          *o++ = 1.;
966                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
967                          *o = 0.;                          *o = 0.;
# Line 1158  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 971  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
971    
972              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
973  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
974                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
975                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
976                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
977                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
978                          *o++ = -1.;                          *o++ = -1.;
979                          *o = 0.;                          *o = 0.;
# Line 1170  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 983  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
983    
984              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
985  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
986                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
987                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
988                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
989                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
990                          *o++ = 1.;                          *o++ = 1.;
991                          *o = 0.;                          *o = 0.;
# Line 1182  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 995  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
995    
996              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
997  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
998                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
999                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1000                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1001                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
1002                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
1003                          *o = -1.;                          *o = -1.;
# Line 1194  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 1007  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
1007    
1008              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
1009  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1010                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1011                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1012                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1013                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
1014                          *o++ = 0.;                          *o++ = 0.;
1015                          *o = 1.;                          *o = 1.;
# Line 1207  void Brick::setToNormal(escript::Data& o Line 1020  void Brick::setToNormal(escript::Data& o
1020    
1021      } else {      } else {
1022          stringstream msg;          stringstream msg;
1023          msg << "setToNormal() not implemented for "          msg << "setToNormal: invalid function space type "
1024              << functionSpaceTypeAsString(out.getFunctionSpace().getTypeCode());              << out.getFunctionSpace().getTypeCode();
1025          throw RipleyException(msg.str());          throw RipleyException(msg.str());
1026      }      }
1027  }  }
# Line 1219  void Brick::setToSize(escript::Data& out Line 1032  void Brick::setToSize(escript::Data& out
1032              || out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {              || out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
1033          out.requireWrite();          out.requireWrite();
1034          const dim_t numQuad=out.getNumDataPointsPerSample();          const dim_t numQuad=out.getNumDataPointsPerSample();
1035          const double xSize=getFirstCoordAndSpacing(0).second;          const double size=sqrt(m_dx[0]*m_dx[0]+m_dx[1]*m_dx[1]+m_dx[2]*m_dx[2]);
         const double ySize=getFirstCoordAndSpacing(1).second;  
         const double zSize=getFirstCoordAndSpacing(2).second;  
         const double size=min(min(xSize,ySize),zSize);  
1036  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel for
1037          for (index_t k = 0; k < getNumElements(); ++k) {          for (index_t k = 0; k < getNumElements(); ++k) {
1038              double* o = out.getSampleDataRW(k);              double* o = out.getSampleDataRW(k);
# Line 1232  void Brick::setToSize(escript::Data& out Line 1042  void Brick::setToSize(escript::Data& out
1042              || out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedFaceElements) {              || out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedFaceElements) {
1043          out.requireWrite();          out.requireWrite();
1044          const dim_t numQuad=out.getNumDataPointsPerSample();          const dim_t numQuad=out.getNumDataPointsPerSample();
         const double xSize=getFirstCoordAndSpacing(0).second;  
         const double ySize=getFirstCoordAndSpacing(1).second;  
         const double zSize=getFirstCoordAndSpacing(2).second;  
1045  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1046          {          {
1047              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
1048                  const double size=min(ySize,zSize);                  const double size=min(m_dx[1],m_dx[2]);
1049  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1050                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1051                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1052                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1053                          fill(o, o+numQuad, size);                          fill(o, o+numQuad, size);
1054                      }                      }
1055                  }                  }
1056              }              }
1057    
1058              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
1059                  const double size=min(ySize,zSize);                  const double size=min(m_dx[1],m_dx[2]);
1060  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1061                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1062                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1063                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1064                          fill(o, o+numQuad, size);                          fill(o, o+numQuad, size);
1065                      }                      }
1066                  }                  }
1067              }              }
1068    
1069              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
1070                  const double size=min(xSize,zSize);                  const double size=min(m_dx[0],m_dx[2]);
1071  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1072                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1073                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1074                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1075                          fill(o, o+numQuad, size);                          fill(o, o+numQuad, size);
1076                      }                      }
1077                  }                  }
1078              }              }
1079    
1080              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
1081                  const double size=min(xSize,zSize);                  const double size=min(m_dx[0],m_dx[2]);
1082  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1083                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2 = 0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1084                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1085                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1086                          fill(o, o+numQuad, size);                          fill(o, o+numQuad, size);
1087                      }                      }
1088                  }                  }
1089              }              }
1090    
1091              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
1092                  const double size=min(xSize,ySize);                  const double size=min(m_dx[0],m_dx[1]);
1093  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1094                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1095                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1096                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1097                          fill(o, o+numQuad, size);                          fill(o, o+numQuad, size);
1098                      }                      }
1099                  }                  }
1100              }              }
1101    
1102              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
1103                  const double size=min(xSize,ySize);                  const double size=min(m_dx[0],m_dx[1]);
1104  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1105                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1106                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1107                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1108                          fill(o, o+numQuad, size);                          fill(o, o+numQuad, size);
1109                      }                      }
1110                  }                  }
# Line 1306  void Brick::setToSize(escript::Data& out Line 1113  void Brick::setToSize(escript::Data& out
1113    
1114      } else {      } else {
1115          stringstream msg;          stringstream msg;
1116          msg << "setToSize() not implemented for "          msg << "setToSize: invalid function space type "
1117              << functionSpaceTypeAsString(out.getFunctionSpace().getTypeCode());              << out.getFunctionSpace().getTypeCode();
1118          throw RipleyException(msg.str());          throw RipleyException(msg.str());
1119      }      }
1120  }  }
1121    
 Paso_SystemMatrixPattern* Brick::getPattern(bool reducedRowOrder,  
                                             bool reducedColOrder) const  
 {  
     if (reducedRowOrder || reducedColOrder)  
         throw RipleyException("getPattern() not implemented for reduced order");  
   
     return m_pattern;  
 }  
   
1122  void Brick::Print_Mesh_Info(const bool full) const  void Brick::Print_Mesh_Info(const bool full) const
1123  {  {
1124      RipleyDomain::Print_Mesh_Info(full);      RipleyDomain::Print_Mesh_Info(full);
# Line 1328  void Brick::Print_Mesh_Info(const bool f Line 1126  void Brick::Print_Mesh_Info(const bool f
1126          cout << "     Id  Coordinates" << endl;          cout << "     Id  Coordinates" << endl;
1127          cout.precision(15);          cout.precision(15);
1128          cout.setf(ios::scientific, ios::floatfield);          cout.setf(ios::scientific, ios::floatfield);
         pair<double,double> xdx = getFirstCoordAndSpacing(0);  
         pair<double,double> ydy = getFirstCoordAndSpacing(1);  
         pair<double,double> zdz = getFirstCoordAndSpacing(2);  
1129          for (index_t i=0; i < getNumNodes(); i++) {          for (index_t i=0; i < getNumNodes(); i++) {
1130              cout << "  " << setw(5) << m_nodeId[i]              cout << "  " << setw(5) << m_nodeId[i]
1131                  << "  " << xdx.first+(i%m_N0)*xdx.second                  << "  " << getLocalCoordinate(i%m_NN[0], 0)
1132                  << "  " << ydy.first+(i%(m_N0*m_N1)/m_N0)*ydy.second                  << "  " << getLocalCoordinate(i%(m_NN[0]*m_NN[1])/m_NN[0], 1)
1133                  << "  " << zdz.first+(i/(m_N0*m_N1))*zdz.second << endl;                  << "  " << getLocalCoordinate(i/(m_NN[0]*m_NN[1]), 2) << endl;
1134          }          }
1135      }      }
1136  }  }
1137    
 IndexVector Brick::getNumNodesPerDim() const  
 {  
     IndexVector ret;  
     ret.push_back(m_N0);  
     ret.push_back(m_N1);  
     ret.push_back(m_N2);  
     return ret;  
 }  
   
 IndexVector Brick::getNumElementsPerDim() const  
 {  
     IndexVector ret;  
     ret.push_back(m_NE0);  
     ret.push_back(m_NE1);  
     ret.push_back(m_NE2);  
     return ret;  
 }  
   
 IndexVector Brick::getNumFacesPerBoundary() const  
 {  
     IndexVector ret(6, 0);  
     //left  
     if (m_offset0==0)  
         ret[0]=m_NE1*m_NE2;  
     //right  
     if (m_mpiInfo->rank%m_NX==m_NX-1)  
         ret[1]=m_NE1*m_NE2;  
     //bottom  
     if (m_offset1==0)  
         ret[2]=m_NE0*m_NE2;  
     //top  
     if (m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX==m_NY-1)  
         ret[3]=m_NE0*m_NE2;  
     //front  
     if (m_offset2==0)  
         ret[4]=m_NE0*m_NE1;  
     //back  
     if (m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY)==m_NZ-1)  
         ret[5]=m_NE0*m_NE1;  
     return ret;  
 }  
   
 pair<double,double> Brick::getFirstCoordAndSpacing(dim_t dim) const  
 {  
     if (dim==0)  
         return pair<double,double>((m_l0*m_offset0)/m_gNE0, m_l0/m_gNE0);  
     else if (dim==1)  
         return pair<double,double>((m_l1*m_offset1)/m_gNE1, m_l1/m_gNE1);  
     else if (dim==2)  
         return pair<double,double>((m_l2*m_offset2)/m_gNE2, m_l2/m_gNE2);  
   
     throw RipleyException("getFirstCoordAndSpacing(): invalid argument");  
 }  
   
 //protected  
 dim_t Brick::getNumDOF() const  
 {  
     return (m_gNE0+1)/m_NX*(m_gNE1+1)/m_NY*(m_gNE2+1)/m_NZ;  
 }  
   
 //protected  
 dim_t Brick::getNumFaceElements() const  
 {  
     const IndexVector faces = getNumFacesPerBoundary();  
     dim_t n=0;  
     for (size_t i=0; i<faces.size(); i++)  
         n+=faces[i];  
     return n;  
 }  
1138    
1139  //protected  //protected
1140  void Brick::assembleCoordinates(escript::Data& arg) const  void Brick::assembleCoordinates(escript::Data& arg) const
# Line 1420  void Brick::assembleCoordinates(escript: Line 1146  void Brick::assembleCoordinates(escript:
1146      if (!numSamplesEqual(&x, 1, getNumNodes()))      if (!numSamplesEqual(&x, 1, getNumNodes()))
1147          throw RipleyException("setToX: Illegal number of samples in Data object");          throw RipleyException("setToX: Illegal number of samples in Data object");
1148    
     pair<double,double> xdx = getFirstCoordAndSpacing(0);  
     pair<double,double> ydy = getFirstCoordAndSpacing(1);  
     pair<double,double> zdz = getFirstCoordAndSpacing(2);  
1149      arg.requireWrite();      arg.requireWrite();
1150  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel for
1151      for (dim_t i2 = 0; i2 < m_N2; i2++) {      for (dim_t i2 = 0; i2 < m_NN[2]; i2++) {
1152          for (dim_t i1 = 0; i1 < m_N1; i1++) {          for (dim_t i1 = 0; i1 < m_NN[1]; i1++) {
1153              for (dim_t i0 = 0; i0 < m_N0; i0++) {              for (dim_t i0 = 0; i0 < m_NN[0]; i0++) {
1154                  double* point = arg.getSampleDataRW(i0+m_N0*i1+m_N0*m_N1*i2);                  double* point = arg.getSampleDataRW(i0+m_NN[0]*i1+m_NN[0]*m_NN[1]*i2);
1155                  point[0] = xdx.first+i0*xdx.second;                  point[0] = getLocalCoordinate(i0, 0);
1156                  point[1] = ydy.first+i1*ydy.second;                  point[1] = getLocalCoordinate(i1, 1);
1157                  point[2] = zdz.first+i2*zdz.second;                  point[2] = getLocalCoordinate(i2, 2);
1158              }              }
1159          }          }
1160      }      }
1161  }  }
1162    
1163  //protected  //protected
1164    void Brick::assembleGradient(escript::Data& out, const escript::Data& in) const
1165    {
1166        const dim_t numComp = in.getDataPointSize();
1167        const double C0 = .044658198738520451079;
1168        const double C1 = .16666666666666666667;
1169        const double C2 = .21132486540518711775;
1170        const double C3 = .25;
1171        const double C4 = .5;
1172        const double C5 = .62200846792814621559;
1173        const double C6 = .78867513459481288225;
1174    
1175        if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements) {
1176            out.requireWrite();
1177    #pragma omp parallel
1178            {
1179                vector<double> f_000(numComp);
1180                vector<double> f_001(numComp);
1181                vector<double> f_010(numComp);
1182                vector<double> f_011(numComp);
1183                vector<double> f_100(numComp);
1184                vector<double> f_101(numComp);
1185                vector<double> f_110(numComp);
1186                vector<double> f_111(numComp);
1187    #pragma omp for
1188                for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1189                    for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1190                        for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1191                            memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1192                            memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1193                            memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1194                            memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1195                            memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1196                            memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1197                            memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1198                            memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1199                            double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE[0],m_NE[1]));
1200                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1201                                const double V0=((f_100[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_011[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / m_dx[0];
1202                                const double V1=((f_110[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_001[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / m_dx[0];
1203                                const double V2=((f_101[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_010[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / m_dx[0];
1204                                const double V3=((f_111[i]-f_011[i])*C5 + (f_100[i]-f_000[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / m_dx[0];
1205                                const double V4=((f_010[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_101[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[1];
1206                                const double V5=((f_110[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_001[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / m_dx[1];
1207                                const double V6=((f_011[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_100[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / m_dx[1];
1208                                const double V7=((f_111[i]-f_101[i])*C5 + (f_010[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[1];
1209                                const double V8=((f_001[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_110[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[2];
1210                                const double V9=((f_101[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_010[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / m_dx[2];
1211                                const double V10=((f_011[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_100[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / m_dx[2];
1212                                const double V11=((f_111[i]-f_110[i])*C5 + (f_001[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[2];
1213                                o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;
1214                                o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V4;
1215                                o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V8;
1216                                o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;
1217                                o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V5;
1218                                o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V9;
1219                                o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V1;
1220                                o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V4;
1221                                o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V10;
1222                                o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;
1223                                o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V5;
1224                                o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V11;
1225                                o[INDEX3(i,0,4,numComp,3)] = V2;
1226                                o[INDEX3(i,1,4,numComp,3)] = V6;
1227                                o[INDEX3(i,2,4,numComp,3)] = V8;
1228                                o[INDEX3(i,0,5,numComp,3)] = V2;
1229                                o[INDEX3(i,1,5,numComp,3)] = V7;
1230                                o[INDEX3(i,2,5,numComp,3)] = V9;
1231                                o[INDEX3(i,0,6,numComp,3)] = V3;
1232                                o[INDEX3(i,1,6,numComp,3)] = V6;
1233                                o[INDEX3(i,2,6,numComp,3)] = V10;
1234                                o[INDEX3(i,0,7,numComp,3)] = V3;
1235                                o[INDEX3(i,1,7,numComp,3)] = V7;
1236                                o[INDEX3(i,2,7,numComp,3)] = V11;
1237                            } // end of component loop i
1238                        } // end of k0 loop
1239                    } // end of k1 loop
1240                } // end of k2 loop
1241            } // end of parallel section
1242        } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
1243            out.requireWrite();
1244    #pragma omp parallel
1245            {
1246                vector<double> f_000(numComp);
1247                vector<double> f_001(numComp);
1248                vector<double> f_010(numComp);
1249                vector<double> f_011(numComp);
1250                vector<double> f_100(numComp);
1251                vector<double> f_101(numComp);
1252                vector<double> f_110(numComp);
1253                vector<double> f_111(numComp);
1254    #pragma omp for
1255                for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1256                    for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1257                        for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1258                            memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1259                            memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1260                            memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1261                            memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1262                            memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1263                            memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1264                            memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1265                            memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1266                            double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE[0],m_NE[1]));
1267                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1268                                o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_010[i]-f_011[i])*C3 / m_dx[0];
1269                                o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_100[i]-f_101[i])*C3 / m_dx[1];
1270                                o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]+f_101[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_010[i]-f_100[i]-f_110[i])*C3 / m_dx[2];
1271                            } // end of component loop i
1272                        } // end of k0 loop
1273                    } // end of k1 loop
1274                } // end of k2 loop
1275            } // end of parallel section
1276        } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == FaceElements) {
1277            out.requireWrite();
1278    #pragma omp parallel
1279            {
1280                vector<double> f_000(numComp);
1281                vector<double> f_001(numComp);
1282                vector<double> f_010(numComp);
1283                vector<double> f_011(numComp);
1284                vector<double> f_100(numComp);
1285                vector<double> f_101(numComp);
1286                vector<double> f_110(numComp);
1287                vector<double> f_111(numComp);
1288                if (m_faceOffset[0] > -1) {
1289    #pragma omp for nowait
1290                    for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1291                        for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1292                            memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1293                            memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1294                            memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1295                            memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1296                            memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1297                            memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1298                            memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1299                            memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1300                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1301                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1302                                const double V0=((f_010[i]-f_000[i])*C6 + (f_011[i]-f_001[i])*C2) / m_dx[1];
1303                                const double V1=((f_010[i]-f_000[i])*C2 + (f_011[i]-f_001[i])*C6) / m_dx[1];
1304                                const double V2=((f_001[i]-f_000[i])*C6 + (f_010[i]-f_011[i])*C2) / m_dx[2];
1305                                const double V3=((f_001[i]-f_000[i])*C2 + (f_011[i]-f_010[i])*C6) / m_dx[2];
1306                                o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = ((f_100[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_011[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / m_dx[0];
1307                                o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V0;
1308                                o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V2;
1309                                o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_001[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / m_dx[0];
1310                                o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V0;
1311                                o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V3;
1312                                o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = ((f_101[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_010[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / m_dx[0];
1313                                o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V1;
1314                                o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V2;
1315                                o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_011[i])*C5 + (f_100[i]-f_000[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / m_dx[0];
1316                                o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V1;
1317                                o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V3;
1318                            } // end of component loop i
1319                        } // end of k1 loop
1320                    } // end of k2 loop
1321                } // end of face 0
1322                if (m_faceOffset[1] > -1) {
1323    #pragma omp for nowait
1324                    for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1325                        for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1326                            memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1327                            memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1328                            memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1329                            memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1330                            memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1331                            memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1332                            memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1333                            memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1334                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1335                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1336                                const double V0=((f_110[i]-f_100[i])*C6 + (f_111[i]-f_101[i])*C2) / m_dx[1];
1337                                const double V1=((f_110[i]-f_100[i])*C2 + (f_111[i]-f_101[i])*C6) / m_dx[1];
1338                                const double V2=((f_101[i]-f_100[i])*C6 + (f_111[i]-f_110[i])*C2) / m_dx[2];
1339                                const double V3=((f_101[i]-f_100[i])*C2 + (f_111[i]-f_110[i])*C6) / m_dx[2];
1340                                o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = ((f_100[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_011[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / m_dx[0];
1341                                o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V0;
1342                                o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V2;
1343                                o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_001[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / m_dx[0];
1344                                o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V0;
1345                                o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V3;
1346                                o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = ((f_101[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_010[i])*C0 + (f_100[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_011[i])*C1) / m_dx[0];
1347                                o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V1;
1348                                o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V2;
1349                                o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_011[i])*C5 + (f_100[i]-f_000[i])*C0 + (f_101[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_010[i])*C1) / m_dx[0];
1350                                o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V1;
1351                                o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V3;
1352                            } // end of component loop i
1353                        } // end of k1 loop
1354                    } // end of k2 loop
1355                } // end of face 1
1356                if (m_faceOffset[2] > -1) {
1357    #pragma omp for nowait
1358                    for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1359                        for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1360                            memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1361                            memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1362                            memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1363                            memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1364                            memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1365                            memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1366                            memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1367                            memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1368                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1369                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1370                                const double V0=((f_100[i]-f_000[i])*C6 + (f_101[i]-f_001[i])*C2) / m_dx[0];
1371                                const double V1=((f_001[i]-f_000[i])*C6 + (f_101[i]-f_100[i])*C2) / m_dx[2];
1372                                const double V2=((f_001[i]-f_000[i])*C2 + (f_101[i]-f_100[i])*C6) / m_dx[2];
1373                                o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;
1374                                o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = ((f_010[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_101[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[1];
1375                                o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V1;
1376                                o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;
1377                                o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_001[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / m_dx[1];
1378                                o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V2;
1379                                o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V0;
1380                                o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_100[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / m_dx[1];
1381                                o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V1;
1382                                o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V0;
1383                                o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_101[i])*C5 + (f_010[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[1];
1384                                o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V2;
1385                            } // end of component loop i
1386                        } // end of k0 loop
1387                    } // end of k2 loop
1388                } // end of face 2
1389                if (m_faceOffset[3] > -1) {
1390    #pragma omp for nowait
1391                    for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1392                        for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1393                            memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-2,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1394                            memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-2,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1395                            memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1396                            memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1397                            memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-2,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1398                            memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-2,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1399                            memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1400                            memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1401                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1402                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1403                                const double V0=((f_110[i]-f_010[i])*C6 + (f_111[i]-f_011[i])*C2) / m_dx[0];
1404                                const double V1=((f_110[i]-f_010[i])*C2 + (f_111[i]-f_011[i])*C6) / m_dx[0];
1405                                const double V2=((f_011[i]-f_010[i])*C6 + (f_111[i]-f_110[i])*C2) / m_dx[2];
1406                                const double V3=((f_011[i]-f_010[i])*C2 + (f_111[i]-f_110[i])*C6) / m_dx[2];
1407                                o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;
1408                                o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = ((f_010[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_101[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[1];
1409                                o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = V2;
1410                                o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;
1411                                o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = ((f_110[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_001[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / m_dx[1];
1412                                o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = V3;
1413                                o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V1;
1414                                o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_001[i])*C5 + (f_110[i]-f_100[i])*C0 + (f_010[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_101[i])*C1) / m_dx[1];
1415                                o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = V2;
1416                                o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;
1417                                o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_101[i])*C5 + (f_010[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_110[i]-f_001[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[1];
1418                                o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = V3;
1419                            } // end of component loop i
1420                        } // end of k0 loop
1421                    } // end of k2 loop
1422                } // end of face 3
1423                if (m_faceOffset[4] > -1) {
1424    #pragma omp for nowait
1425                    for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1426                        for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1427                            memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1428                            memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1429                            memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1430                            memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1431                            memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1432                            memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1433                            memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1434                            memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1435                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1436                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1437                                const double V0=((f_100[i]-f_000[i])*C6 + (f_110[i]-f_010[i])*C2) / m_dx[0];
1438                                const double V1=((f_100[i]-f_000[i])*C2 + (f_110[i]-f_010[i])*C6) / m_dx[0];
1439                                const double V2=((f_010[i]-f_000[i])*C6 + (f_110[i]-f_100[i])*C2) / m_dx[1];
1440                                const double V3=((f_010[i]-f_000[i])*C2 + (f_110[i]-f_100[i])*C6) / m_dx[1];
1441                                o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;
1442                                o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V2;
1443                                o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = ((f_001[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_110[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[2];
1444                                o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;
1445                                o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V3;
1446                                o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = ((f_101[i]-f_100[i])*C5 + (f_011[i]-f_010[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / m_dx[2];
1447                                o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V1;
1448                                o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V2;
1449                                o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_100[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / m_dx[2];
1450                                o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;
1451                                o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V3;
1452                                o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = ((f_111[i]-f_110[i])*C5 + (f_001[i]-f_000[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[2];
1453                            } // end of component loop i
1454                        } // end of k0 loop
1455                    } // end of k1 loop
1456                } // end of face 4
1457                if (m_faceOffset[5] > -1) {
1458    #pragma omp for nowait
1459                    for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1460                        for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1461                            memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1462                            memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1463                            memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1464                            memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1465                            memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1466                            memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1467                            memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1468                            memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1469                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1470                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1471                                const double V0=((f_101[i]-f_001[i])*C6 + (f_111[i]-f_011[i])*C2) / m_dx[0];
1472                                const double V1=((f_101[i]-f_001[i])*C2 + (f_111[i]-f_011[i])*C6) / m_dx[0];
1473                                const double V2=((f_011[i]-f_001[i])*C6 + (f_111[i]-f_101[i])*C2) / m_dx[1];
1474                                const double V3=((f_011[i]-f_001[i])*C2 + (f_111[i]-f_101[i])*C6) / m_dx[1];
1475                                o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = V0;
1476                                o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = V2;
1477                                o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = ((f_001[i]-f_000[i])*C5 + (f_111[i]-f_110[i])*C0 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[2];
1478                                o[INDEX3(i,0,1,numComp,3)] = V0;
1479                                o[INDEX3(i,1,1,numComp,3)] = V3;
1480                                o[INDEX3(i,2,1,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_010[i])*C0 + (f_101[i]-f_100[i])*C5 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / m_dx[2];
1481                                o[INDEX3(i,0,2,numComp,3)] = V1;
1482                                o[INDEX3(i,1,2,numComp,3)] = V2;
1483                                o[INDEX3(i,2,2,numComp,3)] = ((f_011[i]-f_010[i])*C5 + (f_101[i]-f_100[i])*C0 + (f_001[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_110[i])*C1) / m_dx[2];
1484                                o[INDEX3(i,0,3,numComp,3)] = V1;
1485                                o[INDEX3(i,1,3,numComp,3)] = V3;
1486                                o[INDEX3(i,2,3,numComp,3)] = ((f_001[i]-f_000[i])*C0 + (f_111[i]-f_110[i])*C5 + (f_011[i]+f_101[i]-f_010[i]-f_100[i])*C1) / m_dx[2];
1487                            } // end of component loop i
1488                        } // end of k0 loop
1489                    } // end of k1 loop
1490                } // end of face 5
1491            } // end of parallel section
1492        } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedFaceElements) {
1493            out.requireWrite();
1494    #pragma omp parallel
1495            {
1496                vector<double> f_000(numComp);
1497                vector<double> f_001(numComp);
1498                vector<double> f_010(numComp);
1499                vector<double> f_011(numComp);
1500                vector<double> f_100(numComp);
1501                vector<double> f_101(numComp);
1502                vector<double> f_110(numComp);
1503                vector<double> f_111(numComp);
1504                if (m_faceOffset[0] > -1) {
1505    #pragma omp for nowait
1506                    for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1507                        for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1508                            memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1509                            memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1510                            memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1511                            memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1512                            memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1513                            memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1514                            memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1515                            memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1516                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1517                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1518                                o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_010[i]-f_011[i])*C3 / m_dx[0];
1519                                o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]-f_000[i]-f_001[i])*C4 / m_dx[1];
1520                                o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]-f_000[i]-f_010[i])*C4 / m_dx[2];
1521                            } // end of component loop i
1522                        } // end of k1 loop
1523                    } // end of k2 loop
1524                } // end of face 0
1525                if (m_faceOffset[1] > -1) {
1526    #pragma omp for nowait
1527                    for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1528                        for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1529                            memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1530                            memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1531                            memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1532                            memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-2,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1533                            memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1534                            memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1535                            memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1536                            memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1537                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1538                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1539                                o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_010[i]-f_011[i])*C3 / m_dx[0];
1540                                o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_110[i]+f_111[i]-f_100[i]-f_101[i])*C4 / m_dx[1];
1541                                o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_101[i]+f_111[i]-f_100[i]-f_110[i])*C4 / m_dx[2];
1542                            } // end of component loop i
1543                        } // end of k1 loop
1544                    } // end of k2 loop
1545                } // end of face 1
1546                if (m_faceOffset[2] > -1) {
1547    #pragma omp for nowait
1548                    for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1549                        for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1550                            memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1551                            memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1552                            memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1553                            memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1554                            memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1555                            memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1556                            memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1557                            memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1558                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1559                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1560                                o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_101[i]-f_000[i]-f_001[i])*C4 / m_dx[0];
1561                                o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_100[i]-f_101[i])*C3 / m_dx[1];
1562                                o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_101[i]-f_000[i]-f_100[i])*C4 / m_dx[2];
1563                            } // end of component loop i
1564                        } // end of k0 loop
1565                    } // end of k2 loop
1566                } // end of face 2
1567                if (m_faceOffset[3] > -1) {
1568    #pragma omp for nowait
1569                    for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
1570                        for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1571                            memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-2,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1572                            memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-2,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1573                            memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1574                            memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1575                            memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-2,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1576                            memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-2,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1577                            memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1578                            memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1579                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1580                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1581                                o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_110[i]+f_111[i]-f_010[i]-f_011[i])*C4 / m_dx[0];
1582                                o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_011[i]+f_110[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_001[i]-f_100[i]-f_101[i])*C3 / m_dx[1];
1583                                o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_011[i]+f_111[i]-f_010[i]-f_110[i])*C4 / m_dx[2];
1584                            } // end of component loop i
1585                        } // end of k0 loop
1586                    } // end of k2 loop
1587                } // end of face 3
1588                if (m_faceOffset[4] > -1) {
1589    #pragma omp for nowait
1590                    for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1591                        for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1592                            memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1593                            memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1594                            memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1595                            memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1596                            memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1597                            memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1598                            memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1599                            memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1600                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1601                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1602                                o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_100[i]+f_110[i]-f_000[i]-f_010[i])*C4 / m_dx[0];
1603                                o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_010[i]+f_110[i]-f_000[i]-f_100[i])*C4 / m_dx[1];
1604                                o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]+f_101[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_010[i]-f_100[i]-f_110[i])*C4 / m_dx[2];
1605                            } // end of component loop i
1606                        } // end of k0 loop
1607                    } // end of k1 loop
1608                } // end of face 4
1609                if (m_faceOffset[5] > -1) {
1610    #pragma omp for nowait
1611                    for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1612                        for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1613                            memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1614                            memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1615                            memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1616                            memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1617                            memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1618                            memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1619                            memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_NN[2]-2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1620                            memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
1621                            double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1622                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1623                                o[INDEX3(i,0,0,numComp,3)] = (f_101[i]+f_111[i]-f_001[i]-f_011[i])*C4 / m_dx[0];
1624                                o[INDEX3(i,1,0,numComp,3)] = (f_011[i]+f_111[i]-f_001[i]-f_101[i])*C4 / m_dx[1];
1625                                o[INDEX3(i,2,0,numComp,3)] = (f_001[i]+f_011[i]+f_101[i]+f_111[i]-f_000[i]-f_010[i]-f_100[i]-f_110[i])*C3 / m_dx[2];
1626                            } // end of component loop i
1627                        } // end of k0 loop
1628                    } // end of k1 loop
1629                } // end of face 5
1630            } // end of parallel section
1631        }
1632    }
1633    
1634    //protected
1635    void Brick::assembleIntegrate(vector<double>& integrals, const escript::Data& arg) const
1636    {
1637        const dim_t numComp = arg.getDataPointSize();
1638        const index_t left = (m_offset[0]==0 ? 0 : 1);
1639        const index_t bottom = (m_offset[1]==0 ? 0 : 1);
1640        const index_t front = (m_offset[2]==0 ? 0 : 1);
1641        const int fs = arg.getFunctionSpace().getTypeCode();
1642        if (fs == Elements && arg.actsExpanded()) {
1643            const double w_0 = m_dx[0]*m_dx[1]*m_dx[2]/8.;
1644    #pragma omp parallel
1645            {
1646                vector<double> int_local(numComp, 0);
1647    #pragma omp for nowait
1648                for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1649                    for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1650                        for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1651                            const double* f = arg.getSampleDataRO(INDEX3(k0, k1, k2, m_NE[0], m_NE[1]));
1652                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1653                                const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1654                                const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1655                                const double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];
1656                                const double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];
1657                                const double f_4 = f[INDEX2(i,4,numComp)];
1658                                const double f_5 = f[INDEX2(i,5,numComp)];
1659                                const double f_6 = f[INDEX2(i,6,numComp)];
1660                                const double f_7 = f[INDEX2(i,7,numComp)];
1661                                int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3+f_4+f_5+f_6+f_7)*w_0;
1662                            }  // end of component loop i
1663                        } // end of k0 loop
1664                    } // end of k1 loop
1665                } // end of k2 loop
1666    
1667    #pragma omp critical
1668                for (index_t i=0; i<numComp; i++)
1669                    integrals[i]+=int_local[i];
1670            } // end of parallel section
1671    
1672        } else if (fs==ReducedElements || (fs==Elements && !arg.actsExpanded())) {
1673            const double w_0 = m_dx[0]*m_dx[1]*m_dx[2];
1674    #pragma omp parallel
1675            {
1676                vector<double> int_local(numComp, 0);
1677    #pragma omp for nowait
1678                for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1679                    for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1680                        for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1681                            const double* f = arg.getSampleDataRO(INDEX3(k0, k1, k2, m_NE[0], m_NE[1]));
1682                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1683                                int_local[i]+=f[i]*w_0;
1684                            }  // end of component loop i
1685                        } // end of k0 loop
1686                    } // end of k1 loop
1687                } // end of k2 loop
1688    
1689    #pragma omp critical
1690                for (index_t i=0; i<numComp; i++)
1691                    integrals[i]+=int_local[i];
1692            } // end of parallel section
1693    
1694        } else if (fs == FaceElements && arg.actsExpanded()) {
1695            const double w_0 = m_dx[1]*m_dx[2]/4.;
1696            const double w_1 = m_dx[0]*m_dx[2]/4.;
1697            const double w_2 = m_dx[0]*m_dx[1]/4.;
1698    #pragma omp parallel
1699            {
1700                vector<double> int_local(numComp, 0);
1701                if (m_faceOffset[0] > -1) {
1702    #pragma omp for nowait
1703                    for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1704                        for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1705                            const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1706                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1707                                const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1708                                const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1709                                const double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];
1710                                const double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];
1711                                int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_0;
1712                            }  // end of component loop i
1713                        } // end of k1 loop
1714                    } // end of k2 loop
1715                }
1716    
1717                if (m_faceOffset[1] > -1) {
1718    #pragma omp for nowait
1719                    for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1720                        for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1721                            const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1722                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1723                                const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1724                                const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1725                                const double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];
1726                                const double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];
1727                                int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_0;
1728                            }  // end of component loop i
1729                        } // end of k1 loop
1730                    } // end of k2 loop
1731                }
1732    
1733                if (m_faceOffset[2] > -1) {
1734    #pragma omp for nowait
1735                    for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1736                        for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1737                            const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1738                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1739                                const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1740                                const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1741                                const double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];
1742                                const double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];
1743                                int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_1;
1744                            }  // end of component loop i
1745                        } // end of k1 loop
1746                    } // end of k2 loop
1747                }
1748    
1749                if (m_faceOffset[3] > -1) {
1750    #pragma omp for nowait
1751                    for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1752                        for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1753                            const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1754                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1755                                const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1756                                const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1757                                const double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];
1758                                const double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];
1759                                int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_1;
1760                            }  // end of component loop i
1761                        } // end of k1 loop
1762                    } // end of k2 loop
1763                }
1764    
1765                if (m_faceOffset[4] > -1) {
1766    #pragma omp for nowait
1767                    for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1768                        for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1769                            const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1770                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1771                                const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1772                                const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1773                                const double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];
1774                                const double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];
1775                                int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_2;
1776                            }  // end of component loop i
1777                        } // end of k1 loop
1778                    } // end of k2 loop
1779                }
1780    
1781                if (m_faceOffset[5] > -1) {
1782    #pragma omp for nowait
1783                    for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1784                        for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1785                            const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1786                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1787                                const double f_0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1788                                const double f_1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1789                                const double f_2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];
1790                                const double f_3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];
1791                                int_local[i]+=(f_0+f_1+f_2+f_3)*w_2;
1792                            }  // end of component loop i
1793                        } // end of k1 loop
1794                    } // end of k2 loop
1795                }
1796    
1797    #pragma omp critical
1798                for (index_t i=0; i<numComp; i++)
1799                    integrals[i]+=int_local[i];
1800            } // end of parallel section
1801    
1802        } else if (fs==ReducedFaceElements || (fs==FaceElements && !arg.actsExpanded())) {
1803            const double w_0 = m_dx[1]*m_dx[2];
1804            const double w_1 = m_dx[0]*m_dx[2];
1805            const double w_2 = m_dx[0]*m_dx[1];
1806    #pragma omp parallel
1807            {
1808                vector<double> int_local(numComp, 0);
1809                if (m_faceOffset[0] > -1) {
1810    #pragma omp for nowait
1811                    for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1812                        for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1813                            const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1814                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1815                                int_local[i]+=f[i]*w_0;
1816                            }  // end of component loop i
1817                        } // end of k1 loop
1818                    } // end of k2 loop
1819                }
1820    
1821                if (m_faceOffset[1] > -1) {
1822    #pragma omp for nowait
1823                    for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1824                        for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1825                            const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
1826                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1827                                int_local[i]+=f[i]*w_0;
1828                            }  // end of component loop i
1829                        } // end of k1 loop
1830                    } // end of k2 loop
1831                }
1832    
1833                if (m_faceOffset[2] > -1) {
1834    #pragma omp for nowait
1835                    for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1836                        for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1837                            const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1838                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1839                                int_local[i]+=f[i]*w_1;
1840                            }  // end of component loop i
1841                        } // end of k1 loop
1842                    } // end of k2 loop
1843                }
1844    
1845                if (m_faceOffset[3] > -1) {
1846    #pragma omp for nowait
1847                    for (index_t k2 = front; k2 < front+m_ownNE[2]; ++k2) {
1848                        for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1849                            const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
1850                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1851                                int_local[i]+=f[i]*w_1;
1852                            }  // end of component loop i
1853                        } // end of k1 loop
1854                    } // end of k2 loop
1855                }
1856    
1857                if (m_faceOffset[4] > -1) {
1858    #pragma omp for nowait
1859                    for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1860                        for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1861                            const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1862                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1863                                int_local[i]+=f[i]*w_2;
1864                            }  // end of component loop i
1865                        } // end of k1 loop
1866                    } // end of k2 loop
1867                }
1868    
1869                if (m_faceOffset[5] > -1) {
1870    #pragma omp for nowait
1871                    for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1872                        for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1873                            const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1874                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1875                                int_local[i]+=f[i]*w_2;
1876                            }  // end of component loop i
1877                        } // end of k1 loop
1878                    } // end of k2 loop
1879                }
1880    
1881    #pragma omp critical
1882                for (index_t i=0; i<numComp; i++)
1883                    integrals[i]+=int_local[i];
1884            } // end of parallel section
1885        } // function space selector
1886    }
1887    
1888    //protected
1889  dim_t Brick::insertNeighbourNodes(IndexVector& index, index_t node) const  dim_t Brick::insertNeighbourNodes(IndexVector& index, index_t node) const
1890  {  {
1891      const dim_t nDOF0 = (m_gNE0+1)/m_NX;      const dim_t nDOF0 = (m_gNE[0]+1)/m_NX[0];
1892      const dim_t nDOF1 = (m_gNE1+1)/m_NY;      const dim_t nDOF1 = (m_gNE[1]+1)/m_NX[1];
1893      const dim_t nDOF2 = (m_gNE2+1)/m_NZ;      const dim_t nDOF2 = (m_gNE[2]+1)/m_NX[2];
1894      const int x=node%nDOF0;      const int x=node%nDOF0;
1895      const int y=node%(nDOF0*nDOF1)/nDOF0;      const int y=node%(nDOF0*nDOF1)/nDOF0;
1896      const int z=node/(nDOF0*nDOF1);      const int z=node/(nDOF0*nDOF1);
# Line 1472  dim_t Brick::insertNeighbourNodes(IndexV Line 1920  dim_t Brick::insertNeighbourNodes(IndexV
1920  }  }
1921    
1922  //protected  //protected
1923  void Brick::nodesToDOF(escript::Data& out, escript::Data& in) const  void Brick::nodesToDOF(escript::Data& out, const escript::Data& in) const
1924  {  {
1925      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();
1926      out.requireWrite();      out.requireWrite();
1927    
1928      const index_t left = (m_offset0==0 ? 0 : 1);      const index_t left = (m_offset[0]==0 ? 0 : 1);
1929      const index_t bottom = (m_offset1==0 ? 0 : 1);      const index_t bottom = (m_offset[1]==0 ? 0 : 1);
1930      const index_t front = (m_offset2==0 ? 0 : 1);      const index_t front = (m_offset[2]==0 ? 0 : 1);
1931      const dim_t nDOF0 = (m_gNE0+1)/m_NX;      const dim_t nDOF0 = (m_gNE[0]+1)/m_NX[0];
1932      const dim_t nDOF1 = (m_gNE1+1)/m_NY;      const dim_t nDOF1 = (m_gNE[1]+1)/m_NX[1];
1933      const dim_t nDOF2 = (m_gNE2+1)/m_NZ;      const dim_t nDOF2 = (m_gNE[2]+1)/m_NX[2];
1934  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel for
1935      for (index_t i=0; i<nDOF2; i++) {      for (index_t i=0; i<nDOF2; i++) {
1936          for (index_t j=0; j<nDOF1; j++) {          for (index_t j=0; j<nDOF1; j++) {
1937              for (index_t k=0; k<nDOF0; k++) {              for (index_t k=0; k<nDOF0; k++) {
1938                  const index_t n=k+left+(j+bottom)*m_N0+(i+front)*m_N0*m_N1;                  const index_t n=k+left+(j+bottom)*m_NN[0]+(i+front)*m_NN[0]*m_NN[1];
1939                  const double* src=in.getSampleDataRO(n);                  const double* src=in.getSampleDataRO(n);
1940                  copy(src, src+numComp, out.getSampleDataRW(k+j*nDOF0+i*nDOF0*nDOF1));                  copy(src, src+numComp, out.getSampleDataRW(k+j*nDOF0+i*nDOF0*nDOF1));
1941              }              }
# Line 1496  void Brick::nodesToDOF(escript::Data& ou Line 1944  void Brick::nodesToDOF(escript::Data& ou
1944  }  }
1945    
1946  //protected  //protected
1947  void Brick::dofToNodes(escript::Data& out, escript::Data& in) const  void Brick::dofToNodes(escript::Data& out, const escript::Data& in) const
1948  {  {
1949      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();
1950      Paso_Coupler* coupler = Paso_Coupler_alloc(m_connector, numComp);      Paso_Coupler* coupler = Paso_Coupler_alloc(m_connector, numComp);
1951      in.requireWrite();      // expand data object if necessary to be able to grab the whole data
1952      Paso_Coupler_startCollect(coupler, in.getSampleDataRW(0));      const_cast<escript::Data*>(&in)->expand();
1953        Paso_Coupler_startCollect(coupler, in.getSampleDataRO(0));
1954    
1955      const dim_t numDOF = getNumDOF();      const dim_t numDOF = getNumDOF();
1956      out.requireWrite();      out.requireWrite();
# Line 1514  void Brick::dofToNodes(escript::Data& ou Line 1963  void Brick::dofToNodes(escript::Data& ou
1963                  : &buffer[(m_dofMap[i]-numDOF)*numComp]);                  : &buffer[(m_dofMap[i]-numDOF)*numComp]);
1964          copy(src, src+numComp, out.getSampleDataRW(i));          copy(src, src+numComp, out.getSampleDataRW(i));
1965      }      }
1966        Paso_Coupler_free(coupler);
1967  }  }
1968    
1969  //private  //private
1970  void Brick::populateSampleIds()  void Brick::populateSampleIds()
1971  {  {
1972      // identifiers are ordered from left to right, bottom to top, front to back      // degrees of freedom are numbered from left to right, bottom to top, front
1973      // globally      // to back in each rank, continuing on the next rank (ranks also go
1974        // left-right, bottom-top, front-back).
1975        // This means rank 0 has id 0...n0-1, rank 1 has id n0...n1-1 etc. which
1976        // helps when writing out data rank after rank.
1977    
1978      // build node distribution vector first.      // build node distribution vector first.
1979      // rank i owns m_nodeDistribution[i+1]-nodeDistribution[i] nodes      // rank i owns m_nodeDistribution[i+1]-nodeDistribution[i] nodes which is
1980        // constant for all ranks in this implementation
1981      m_nodeDistribution.assign(m_mpiInfo->size+1, 0);      m_nodeDistribution.assign(m_mpiInfo->size+1, 0);
1982      const dim_t numDOF=getNumDOF();      const dim_t numDOF=getNumDOF();
1983      for (dim_t k=1; k<m_mpiInfo->size; k++) {      for (dim_t k=1; k<m_mpiInfo->size; k++) {
# Line 1533  void Brick::populateSampleIds() Line 1987  void Brick::populateSampleIds()
1987      m_nodeId.resize(getNumNodes());      m_nodeId.resize(getNumNodes());
1988      m_dofId.resize(numDOF);      m_dofId.resize(numDOF);
1989      m_elementId.resize(getNumElements());      m_elementId.resize(getNumElements());
1990    
1991        // populate face element counts
1992        //left
1993        if (m_offset[0]==0)
1994            m_faceCount[0]=m_NE[1]*m_NE[2];
1995        else
1996            m_faceCount[0]=0;
1997        //right
1998        if (m_mpiInfo->rank%m_NX[0]==m_NX[0]-1)
1999            m_faceCount[1]=m_NE[1]*m_NE[2];
2000        else
2001            m_faceCount[1]=0;
2002        //bottom
2003        if (m_offset[1]==0)
2004            m_faceCount[2]=m_NE[0]*m_NE[2];
2005        else
2006            m_faceCount[2]=0;
2007        //top
2008        if (m_mpiInfo->rank%(m_NX[0]*m_NX[1])/m_NX[0]==m_NX[1]-1)
2009            m_faceCount[3]=m_NE[0]*m_NE[2];
2010        else
2011            m_faceCount[3]=0;
2012        //front
2013        if (m_offset[2]==0)
2014            m_faceCount[4]=m_NE[0]*m_NE[1];
2015        else
2016            m_faceCount[4]=0;
2017        //back
2018        if (m_mpiInfo->rank/(m_NX[0]*m_NX[1])==m_NX[2]-1)
2019            m_faceCount[5]=m_NE[0]*m_NE[1];
2020        else
2021            m_faceCount[5]=0;
2022    
2023      m_faceId.resize(getNumFaceElements());      m_faceId.resize(getNumFaceElements());
2024    
2025        const index_t left = (m_offset[0]==0 ? 0 : 1);
2026        const index_t bottom = (m_offset[1]==0 ? 0 : 1);
2027        const index_t front = (m_offset[2]==0 ? 0 : 1);
2028        const dim_t nDOF0 = (m_gNE[0]+1)/m_NX[0];
2029        const dim_t nDOF1 = (m_gNE[1]+1)/m_NX[1];
2030        const dim_t nDOF2 = (m_gNE[2]+1)/m_NX[2];
2031    
2032        // the following is a compromise between efficiency and code length to
2033        // set the node id's according to the order mentioned above.
2034        // First we set all the edge and corner id's in a rather slow way since
2035        // they might or might not be owned by this rank. Next come the own
2036        // node id's which are identical to the DOF id's (simple loop), and finally
2037        // the 6 faces are set but only if required...
2038    
2039    #define globalNodeId(x,y,z) \
2040        ((m_offset[0]+x)/nDOF0)*nDOF0*nDOF1*nDOF2+(m_offset[0]+x)%nDOF0\
2041        + ((m_offset[1]+y)/nDOF1)*nDOF0*nDOF1*nDOF2*m_NX[0]+((m_offset[1]+y)%nDOF1)*nDOF0\
2042        + ((m_offset[2]+z)/nDOF2)*nDOF0*nDOF1*nDOF2*m_NX[0]*m_NX[1]+((m_offset[2]+z)%nDOF2)*nDOF0*nDOF1
2043    
2044  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
2045      {      {
2046            // set edge id's
2047            // edges in x-direction, including corners
2048    #pragma omp for nowait
2049            for (dim_t i=0; i<m_NN[0]; i++) {
2050                m_nodeId[i] = globalNodeId(i, 0, 0); // LF
2051                m_nodeId[m_NN[0]*(m_NN[1]-1)+i] = globalNodeId(i, m_NN[1]-1, 0); // UF
2052                m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1)+i] = globalNodeId(i, 0, m_NN[2]-1); // LB
2053                m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*m_NN[2]-m_NN[0]+i] = globalNodeId(i, m_NN[1]-1, m_NN[2]-1); // UB
2054            }
2055            // edges in y-direction, without corners
2056  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2057          // nodes          for (dim_t i=1; i<m_NN[1]-1; i++) {
2058          for (dim_t i2=0; i2<m_N2; i2++) {              m_nodeId[m_NN[0]*i] = globalNodeId(0, i, 0); // FL
2059              for (dim_t i1=0; i1<m_N1; i1++) {              m_nodeId[m_NN[0]*(i+1)-1] = globalNodeId(m_NN[0]-1, i, 0); // FR
2060                  for (dim_t i0=0; i0<m_N0; i0++) {              m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1)+m_NN[0]*i] = globalNodeId(0, i, m_NN[2]-1); // BL
2061                      m_nodeId[i0+i1*m_N0+i2*m_N0*m_N1] =              m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1)+m_NN[0]*(i+1)-1] = globalNodeId(m_NN[0]-1, i, m_NN[2]-1); // BR
2062                          (m_offset2+i2)*(m_gNE0+1)*(m_gNE1+1)          }
2063                          +(m_offset1+i1)*(m_gNE0+1)          // edges in z-direction, without corners
2064                          +m_offset0+i0;  #pragma omp for
2065            for (dim_t i=1; i<m_NN[2]-1; i++) {
2066                m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*i] = globalNodeId(0, 0, i); // LL
2067                m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*i+m_NN[0]-1] = globalNodeId(m_NN[0]-1, 0, i); // LR
2068                m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*(i+1)-m_NN[0]] = globalNodeId(0, m_NN[1]-1, i); // UL
2069                m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]*(i+1)-1] = globalNodeId(m_NN[0]-1, m_NN[1]-1, i); // UR
2070            }
2071            // implicit barrier here because some node IDs will be overwritten
2072            // below
2073    
2074            // populate degrees of freedom and own nodes (identical id)
2075    #pragma omp for nowait
2076            for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++) {
2077                for (dim_t j=0; j<nDOF1; j++) {
2078                    for (dim_t k=0; k<nDOF0; k++) {
2079                        const index_t nodeIdx=k+left+(j+bottom)*m_NN[0]+(i+front)*m_NN[0]*m_NN[1];
2080                        const index_t dofIdx=k+j*nDOF0+i*nDOF0*nDOF1;
2081                        m_dofId[dofIdx] = m_nodeId[nodeIdx]
2082                            = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank]+dofIdx;
2083                  }                  }
2084              }              }
2085          }          }
2086    
2087          // degrees of freedom          // populate the rest of the nodes (shared with other ranks)
2088            if (m_faceCount[0]==0) { // left plane
2089    #pragma omp for nowait
2090                for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++) {
2091                    for (dim_t j=0; j<nDOF1; j++) {
2092                        const index_t nodeIdx=(j+bottom)*m_NN[0]+(i+front)*m_NN[0]*m_NN[1];
2093                        const index_t dofId=(j+1)*nDOF0-1+i*nDOF0*nDOF1;
2094                        m_nodeId[nodeIdx]
2095                            = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank-1]+dofId;
2096                    }
2097                }
2098            }
2099            if (m_faceCount[1]==0) { // right plane
2100    #pragma omp for nowait
2101                for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++) {
2102                    for (dim_t j=0; j<nDOF1; j++) {
2103                        const index_t nodeIdx=(j+bottom+1)*m_NN[0]-1+(i+front)*m_NN[0]*m_NN[1];
2104                        const index_t dofId=j*nDOF0+i*nDOF0*nDOF1;
2105                        m_nodeId[nodeIdx]
2106                            = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank+1]+dofId;
2107                    }
2108                }
2109            }
2110            if (m_faceCount[2]==0) { // bottom plane
2111  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2112          for (dim_t k=0; k<numDOF; k++)              for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++) {
2113              m_dofId[k] = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank]+k;                  for (dim_t k=0; k<nDOF0; k++) {
2114                        const index_t nodeIdx=k+left+(i+front)*m_NN[0]*m_NN[1];
2115                        const index_t dofId=nDOF0*(nDOF1-1)+k+i*nDOF0*nDOF1;
2116                        m_nodeId[nodeIdx]
2117                            = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank-m_NX[0]]+dofId;
2118                    }
2119                }
2120            }
2121            if (m_faceCount[3]==0) { // top plane
2122    #pragma omp for nowait
2123                for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++) {
2124                    for (dim_t k=0; k<nDOF0; k++) {
2125                        const index_t nodeIdx=k+left+(i+front)*m_NN[0]*m_NN[1]+m_NN[0]*(m_NN[1]-1);
2126                        const index_t dofId=k+i*nDOF0*nDOF1;
2127                        m_nodeId[nodeIdx]
2128                            = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank+m_NX[0]]+dofId;
2129                    }
2130                }
2131            }
2132            if (m_faceCount[4]==0) { // front plane
2133    #pragma omp for nowait
2134                for (dim_t j=0; j<nDOF1; j++) {
2135                    for (dim_t k=0; k<nDOF0; k++) {
2136                        const index_t nodeIdx=k+left+(j+bottom)*m_NN[0];
2137                        const index_t dofId=k+j*nDOF0+nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);
2138                        m_nodeId[nodeIdx]
2139                            = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank-m_NX[0]*m_NX[1]]+dofId;
2140                    }
2141                }
2142            }
2143            if (m_faceCount[5]==0) { // back plane
2144    #pragma omp for nowait
2145                for (dim_t j=0; j<nDOF1; j++) {
2146                    for (dim_t k=0; k<nDOF0; k++) {
2147                        const index_t nodeIdx=k+left+(j+bottom)*m_NN[0]+m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1);
2148                        const index_t dofId=k+j*nDOF0;
2149                        m_nodeId[nodeIdx]
2150                            = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank+m_NX[0]*m_NX[1]]+dofId;
2151                    }
2152                }
2153            }
2154    
2155          // elements          // populate element id's
2156  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2157          for (dim_t i2=0; i2<m_NE2; i2++) {          for (dim_t i2=0; i2<m_NE[2]; i2++) {
2158              for (dim_t i1=0; i1<m_NE1; i1++) {              for (dim_t i1=0; i1<m_NE[1]; i1++) {
2159                  for (dim_t i0=0; i0<m_NE0; i0++) {                  for (dim_t i0=0; i0<m_NE[0]; i0++) {
2160                      m_elementId[i0+i1*m_NE0+i2*m_NE0*m_NE1] =                      m_elementId[i0+i1*m_NE[0]+i2*m_NE[0]*m_NE[1]] =
2161                          (m_offset2+i2)*m_gNE0*m_gNE1                          (m_offset[2]+i2)*m_gNE[0]*m_gNE[1]
2162                          +(m_offset1+i1)*m_gNE0                          +(m_offset[1]+i1)*m_gNE[0]
2163                          +m_offset0+i0;                          +m_offset[0]+i0;
2164                  }                  }
2165              }              }
2166          }          }
# Line 1574  void Brick::populateSampleIds() Line 2171  void Brick::populateSampleIds()
2171              m_faceId[k]=k;              m_faceId[k]=k;
2172      } // end parallel section      } // end parallel section
2173    
2174    #undef globalNodeId
2175    
2176      m_nodeTags.assign(getNumNodes(), 0);      m_nodeTags.assign(getNumNodes(), 0);
2177      updateTagsInUse(Nodes);      updateTagsInUse(Nodes);
2178    
# Line 1581  void Brick::populateSampleIds() Line 2180  void Brick::populateSampleIds()
2180      updateTagsInUse(Elements);      updateTagsInUse(Elements);
2181    
2182      // generate face offset vector and set face tags      // generate face offset vector and set face tags
     const IndexVector facesPerEdge = getNumFacesPerBoundary();  
2183      const index_t LEFT=1, RIGHT=2, BOTTOM=10, TOP=20, FRONT=100, BACK=200;      const index_t LEFT=1, RIGHT=2, BOTTOM=10, TOP=20, FRONT=100, BACK=200;
2184      const index_t faceTag[] = { LEFT, RIGHT, BOTTOM, TOP, FRONT, BACK };      const index_t faceTag[] = { LEFT, RIGHT, BOTTOM, TOP, FRONT, BACK };
2185      m_faceOffset.assign(facesPerEdge.size(), -1);      m_faceOffset.assign(6, -1);
2186      m_faceTags.clear();      m_faceTags.clear();
2187      index_t offset=0;      index_t offset=0;
2188      for (size_t i=0; i<facesPerEdge.size(); i++) {      for (size_t i=0; i<6; i++) {
2189          if (facesPerEdge[i]>0) {          if (m_faceCount[i]>0) {
2190              m_faceOffset[i]=offset;              m_faceOffset[i]=offset;
2191              offset+=facesPerEdge[i];              offset+=m_faceCount[i];
2192              m_faceTags.insert(m_faceTags.end(), facesPerEdge[i], faceTag[i]);              m_faceTags.insert(m_faceTags.end(), m_faceCount[i], faceTag[i]);
2193          }          }
2194      }      }
2195      setTagMap("left", LEFT);      setTagMap("left", LEFT);
# Line 1606  void Brick::populateSampleIds() Line 2204  void Brick::populateSampleIds()
2204  //private  //private
2205  void Brick::createPattern()  void Brick::createPattern()
2206  {  {
2207      const dim_t nDOF0 = (m_gNE0+1)/m_NX;      const dim_t nDOF0 = (m_gNE[0]+1)/m_NX[0];
2208      const dim_t nDOF1 = (m_gNE1+1)/m_NY;      const dim_t nDOF1 = (m_gNE[1]+1)/m_NX[1];
2209      const dim_t nDOF2 = (m_gNE2+1)/m_NZ;      const dim_t nDOF2 = (m_gNE[2]+1)/m_NX[2];
2210      const index_t left = (m_offset0==0 ? 0 : 1);      const index_t left = (m_offset[0]==0 ? 0 : 1);
2211      const index_t bottom = (m_offset1==0 ? 0 : 1);      const index_t bottom = (m_offset[1]==0 ? 0 : 1);
2212      const index_t front = (m_offset2==0 ? 0 : 1);      const index_t front = (m_offset[2]==0 ? 0 : 1);
2213    
2214      // populate node->DOF mapping with own degrees of freedom.      // populate node->DOF mapping with own degrees of freedom.
2215      // The rest is assigned in the loop further down      // The rest is assigned in the loop further down
2216      m_dofMap.assign(getNumNodes(), 0);      m_dofMap.assign(getNumNodes(), 0);
2217  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel for
2218      for (index_t i=front; i<m_N2; i++) {      for (index_t i=front; i<front+nDOF2; i++) {
2219          for (index_t j=bottom; j<m_N1; j++) {          for (index_t j=bottom; j<bottom+nDOF1; j++) {
2220              for (index_t k=left; k<m_N0; k++) {              for (index_t k=left; k<left+nDOF0; k++) {
2221                  m_dofMap[i*m_N0*m_N1+j*m_N0+k]=(i-front)*nDOF0*nDOF1+(j-bottom)*nDOF0+k-left;                  m_dofMap[i*m_NN[0]*m_NN[1]+j*m_NN[0]+k]=(i-front)*nDOF0*nDOF1+(j-bottom)*nDOF0+k-left;
2222              }              }
2223          }          }
2224      }      }
# Line 1634  void Brick::createPattern() Line 2232  void Brick::createPattern()
2232      IndexVector offsetInShared(1,0);      IndexVector offsetInShared(1,0);
2233      IndexVector sendShared, recvShared;      IndexVector sendShared, recvShared;
2234      int numShared=0;      int numShared=0;
2235      const int x=m_mpiInfo->rank%m_NX;      const int x=m_mpiInfo->rank%m_NX[0];
2236      const int y=m_mpiInfo->rank%(m_NX*m_NY)/m_NX;      const int y=m_mpiInfo->rank%(m_NX[0]*m_NX[1])/m_NX[0];
2237      const int z=m_mpiInfo->rank/(m_NX*m_NY);      const int z=m_mpiInfo->rank/(m_NX[0]*m_NX[1]);
2238      for (int i2=-1; i2<2; i2++) {      for (int i2=-1; i2<2; i2++) {
2239          for (int i1=-1; i1<2; i1++) {          for (int i1=-1; i1<2; i1++) {
2240              for (int i0=-1; i0<2; i0++) {              for (int i0=-1; i0<2; i0++) {
# Line 1647  void Brick::createPattern() Line 2245  void Brick::createPattern()
2245                  const int nx=x+i0;                  const int nx=x+i0;
2246                  const int ny=y+i1;                  const int ny=y+i1;
2247                  const int nz=z+i2;                  const int nz=z+i2;
2248                  if (nx>=0 && ny>=0 && nz>=0 && nx<m_NX && ny<m_NY && nz<m_NZ) {                  if (nx>=0 && ny>=0 && nz>=0 && nx<m_NX[0] && ny<m_NX[1] && nz<m_NX[2]) {
2249                      neighbour.push_back(nz*m_NX*m_NY+ny*m_NX+nx);                      neighbour.push_back(nz*m_NX[0]*m_NX[1]+ny*m_NX[0]+nx);
2250                      if (i0==0 && i1==0) {                      if (i0==0 && i1==0) {
2251                          // sharing front or back plane                          // sharing front or back plane
2252                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF0*nDOF1);                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF0*nDOF1);
2253                          for (dim_t i=0; i<nDOF1; i++) {                          for (dim_t i=0; i<nDOF1; i++) {
2254                              const int firstDOF=(i2==-1 ? i*nDOF0                              const int firstDOF=(i2==-1 ? i*nDOF0
2255                                      : i*nDOF0 + nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1));                                      : i*nDOF0 + nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1));
2256                              const int firstNode=(i2==-1 ? left+(i+bottom)*m_N0                              const int firstNode=(i2==-1 ? left+(i+bottom)*m_NN[0]
2257                                      : left+(i+bottom)*m_N0+m_N0*m_N1*(m_N2-1));                                      : left+(i+bottom)*m_NN[0]+m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1));
2258                              for (dim_t j=0; j<nDOF0; j++, numShared++) {                              for (dim_t j=0; j<nDOF0; j++, numShared++) {
2259                                  sendShared.push_back(firstDOF+j);                                  sendShared.push_back(firstDOF+j);
2260                                  recvShared.push_back(numDOF+numShared);                                  recvShared.push_back(numDOF+numShared);
# Line 1689  void Brick::createPattern() Line 2287  void Brick::createPattern()
2287                              const int firstDOF=(i1==-1 ? i*nDOF0*nDOF1                              const int firstDOF=(i1==-1 ? i*nDOF0*nDOF1
2288                                      : nDOF0*((i+1)*nDOF1-1));                                      : nDOF0*((i+1)*nDOF1-1));
2289                              const int firstNode=(i1==-1 ?                              const int firstNode=(i1==-1 ?
2290                                      left+(i+front)*m_N0*m_N1                                      left+(i+front)*m_NN[0]*m_NN[1]
2291                                      : left+m_N0*((i+1+front)*m_N1-1));                                      : left+m_NN[0]*((i+1+front)*m_NN[1]-1));
2292                              for (dim_t j=0; j<nDOF0; j++, numShared++) {                              for (dim_t j=0; j<nDOF0; j++, numShared++) {
2293                                  sendShared.push_back(firstDOF+j);                                  sendShared.push_back(firstDOF+j);
2294                                  recvShared.push_back(numDOF+numShared);                                  recvShared.push_back(numDOF+numShared);
# Line 1723  void Brick::createPattern() Line 2321  void Brick::createPattern()
2321                              const int firstDOF=(i0==-1 ? i*nDOF0*nDOF1                              const int firstDOF=(i0==-1 ? i*nDOF0*nDOF1
2322                                      : nDOF0*(1+i*nDOF1)-1);                                      : nDOF0*(1+i*nDOF1)-1);
2323                              const int firstNode=(i0==-1 ?                              const int firstNode=(i0==-1 ?
2324                                      (bottom+(i+front)*m_N1)*m_N0                                      (bottom+(i+front)*m_NN[1])*m_NN[0]
2325                                      : (bottom+1+(i+front)*m_N1)*m_N0-1);                                      : (bottom+1+(i+front)*m_NN[1])*m_NN[0]-1);
2326                              for (dim_t j=0; j<nDOF1; j++, numShared++) {                              for (dim_t j=0; j<nDOF1; j++, numShared++) {
2327                                  sendShared.push_back(firstDOF+j*nDOF0);                                  sendShared.push_back(firstDOF+j*nDOF0);
2328                                  recvShared.push_back(numDOF+numShared);                                  recvShared.push_back(numDOF+numShared);
# Line 1747  void Brick::createPattern() Line 2345  void Brick::createPattern()
2345                                      if (i<nDOF2-1)                                      if (i<nDOF2-1)
2346                                          colIndices[firstDOF+(j+1)*nDOF0+nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);                                          colIndices[firstDOF+(j+1)*nDOF0+nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);
2347                                  }                                  }
2348                                  m_dofMap[firstNode+j*m_N0]=numDOF+numShared;                                  m_dofMap[firstNode+j*m_NN[0]]=numDOF+numShared;
2349                              }                              }
2350                          }                          }
2351                      } else if (i0==0) {                      } else if (i0==0) {
# Line 1755  void Brick::createPattern() Line 2353  void Brick::createPattern()
2353                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF0);                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF0);
2354                          const int firstDOF=(i1+1)/2*nDOF0*(nDOF1-1)                          const int firstDOF=(i1+1)/2*nDOF0*(nDOF1-1)
2355                                             +(i2+1)/2*nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);                                             +(i2+1)/2*nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);
2356                          const int firstNode=(i1+1)/2*m_N0*(m_N1-1)                          const int firstNode=left+(i1+1)/2*m_NN[0]*(m_NN[1]-1)
2357                                              +(i2+1)/2*m_N0*m_N1*(m_N2-1);                                              +(i2+1)/2*m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1);
2358                          for (dim_t i=0; i<nDOF0; i++, numShared++) {                          for (dim_t i=0; i<nDOF0; i++, numShared++) {
2359                              sendShared.push_back(firstDOF+i);                              sendShared.push_back(firstDOF+i);
2360                              recvShared.push_back(numDOF+numShared);                              recvShared.push_back(numDOF+numShared);
# Line 1772  void Brick::createPattern() Line 2370  void Brick::createPattern()
2370                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF1);                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF1);
2371                          const int firstDOF=(i0+1)/2*(nDOF0-1)                          const int firstDOF=(i0+1)/2*(nDOF0-1)
2372                                             +(i2+1)/2*nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);                                             +(i2+1)/2*nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);
2373                          const int firstNode=(i0+1)/2*(m_N0-1)                          const int firstNode=bottom*m_NN[0]
2374                                              +(i2+1)/2*m_N0*m_N1*(m_N2-1);                                              +(i0+1)/2*(m_NN[0]-1)
2375                                                +(i2+1)/2*m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1);
2376                          for (dim_t i=0; i<nDOF1; i++, numShared++) {                          for (dim_t i=0; i<nDOF1; i++, numShared++) {
2377                              sendShared.push_back(firstDOF+i*nDOF0);                              sendShared.push_back(firstDOF+i*nDOF0);
2378                              recvShared.push_back(numDOF+numShared);                              recvShared.push_back(numDOF+numShared);
# Line 1782  void Brick::createPattern() Line 2381  void Brick::createPattern()
2381                              colIndices[firstDOF+i*nDOF0].push_back(numShared);                              colIndices[firstDOF+i*nDOF0].push_back(numShared);
2382                              if (i<nDOF1-1)                              if (i<nDOF1-1)
2383                                  colIndices[firstDOF+(i+1)*nDOF0].push_back(numShared);                                  colIndices[firstDOF+(i+1)*nDOF0].push_back(numShared);
2384                              m_dofMap[firstNode+i*m_N0]=numDOF+numShared;                              m_dofMap[firstNode+i*m_NN[0]]=numDOF+numShared;
2385                          }                          }
2386                      } else if (i2==0) {                      } else if (i2==0) {
2387                          // sharing an edge in z direction                          // sharing an edge in z direction
2388                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF2);                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF2);
2389                          const int firstDOF=(i0+1)/2*(nDOF0-1)                          const int firstDOF=(i0+1)/2*(nDOF0-1)
2390                                             +(i1+1)/2*nDOF0*(nDOF1-1);                                             +(i1+1)/2*nDOF0*(nDOF1-1);
2391                          const int firstNode=(i0+1)/2*(m_N0-1)                          const int firstNode=front*m_NN[0]*m_NN[1]
2392                                              +(i1+1)/2*m_N0*(m_N1-1);                                              +(i0+1)/2*(m_NN[0]-1)
2393                                                +(i1+1)/2*m_NN[0]*(m_NN[1]-1);
2394                          for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++, numShared++) {                          for (dim_t i=0; i<nDOF2; i++, numShared++) {
2395                              sendShared.push_back(firstDOF+i*nDOF0*nDOF1);                              sendShared.push_back(firstDOF+i*nDOF0*nDOF1);
2396                              recvShared.push_back(numDOF+numShared);                              recvShared.push_back(numDOF+numShared);
# Line 1799  void Brick::createPattern() Line 2399  void Brick::createPattern()
2399                              colIndices[firstDOF+i*nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);                              colIndices[firstDOF+i*nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);
2400                              if (i<nDOF2-1)                              if (i<nDOF2-1)
2401                                  colIndices[firstDOF+(i+1)*nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);                                  colIndices[firstDOF+(i+1)*nDOF0*nDOF1].push_back(numShared);
2402                              m_dofMap[firstNode+i*m_N0*m_N1]=numDOF+numShared;                              m_dofMap[firstNode+i*m_NN[0]*m_NN[1]]=numDOF+numShared;
2403                          }                          }
2404                      } else {                      } else {
2405                          // sharing a node                          // sharing a node
2406                          const int dof=(i0+1)/2*(nDOF0-1)                          const int dof=(i0+1)/2*(nDOF0-1)
2407                                        +(i1+1)/2*nDOF0*(nDOF1-1)                                        +(i1+1)/2*nDOF0*(nDOF1-1)
2408                                        +(i2+1)/2*nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);                                        +(i2+1)/2*nDOF0*nDOF1*(nDOF2-1);
2409                          const int node=(i0+1)/2*(m_N0-1)                          const int node=(i0+1)/2*(m_NN[0]-1)
2410                                         +(i1+1)/2*m_N0*(m_N1-1)                                         +(i1+1)/2*m_NN[0]*(m_NN[1]-1)
2411                                         +(i2+1)/2*m_N0*m_N1*(m_N2-1);                                         +(i2+1)/2*m_NN[0]*m_NN[1]*(m_NN[2]-1);
2412                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+1);                          offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+1);
2413                          sendShared.push_back(dof);                          sendShared.push_back(dof);
2414                          recvShared.push_back(numDOF+numShared);                          recvShared.push_back(numDOF+numShared);
# Line 1911  void Brick::createPattern() Line 2511  void Brick::createPattern()
2511      Paso_Pattern_free(rowPattern);      Paso_Pattern_free(rowPattern);
2512  }  }
2513    
2514    //private
2515    void Brick::addToMatrixAndRHS(Paso_SystemMatrix* S, escript::Data& F,
2516             const vector<double>& EM_S, const vector<double>& EM_F, bool addS,
2517             bool addF, index_t firstNode, dim_t nEq, dim_t nComp) const
2518    {
2519        IndexVector rowIndex;
2520        rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode]);
2521        rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+1]);
2522        rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_NN[0]]);
2523        rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_NN[0]+1]);
2524        rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_NN[0]*m_NN[1]]);
2525        rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_NN[0]*m_NN[1]+1]);
2526        rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_NN[0]*(m_NN[1]+1)]);
2527        rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_NN[0]*(m_NN[1]+1)+1]);
2528        if (addF) {
2529            double *F_p=F.getSampleDataRW(0);
2530            for (index_t i=0; i<rowIndex.size(); i++) {
2531                if (rowIndex[i]<getNumDOF()) {
2532                    for (index_t eq=0; eq<nEq; eq++) {
2533                        F_p[INDEX2(eq, rowIndex[i], nEq)]+=EM_F[INDEX2(eq,i,nEq)];
2534                    }
2535                }
2536            }
2537        }
2538        if (addS) {
2539            addToSystemMatrix(S, rowIndex, nEq, rowIndex, nComp, EM_S);
2540        }
2541    }
2542    
2543  //protected  //protected
2544  void Brick::interpolateNodesOnElements(escript::Data& out, escript::Data& in,  void Brick::interpolateNodesOnElements(escript::Data& out,
2545                                           const escript::Data& in,
2546                                         bool reduced) const                                         bool reduced) const
2547  {  {
2548      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();
2549      if (reduced) {      if (reduced) {
2550          out.requireWrite();          out.requireWrite();
2551          /*** GENERATOR SNIP_INTERPOLATE_REDUCED_ELEMENTS TOP */  #pragma omp parallel
2552          const double c0 = .125;          {
2553  #pragma omp parallel for              vector<double> f_000(numComp);
2554          for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {              vector<double> f_001(numComp);
2555              for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {              vector<double> f_010(numComp);
2556                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {              vector<double> f_011(numComp);
2557                      const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_N0,m_N1));              vector<double> f_100(numComp);
2558                      const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_N0,m_N1));              vector<double> f_101(numComp);
2559                      const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_N0,m_N1));              vector<double> f_110(numComp);
2560                      const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));              vector<double> f_111(numComp);
2561                      const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_N0,m_N1));  #pragma omp for
2562                      const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_N0,m_N1));              for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2563                      const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_N0,m_N1));                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2564                      const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2565                      double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE0,m_NE1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2566                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2567                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_000[i] + f_001[i] + f_010[i] + f_011[i] + f_100[i] + f_101[i] + f_110[i] + f_111[i]);                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2568                      } /* end of component loop i */                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2569                  } /* end of k0 loop */                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2570              } /* end of k1 loop */                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2571          } /* end of k2 loop */                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2572          /* GENERATOR SNIP_INTERPOLATE_REDUCED_ELEMENTS BOTTOM */                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2573                            double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE[0],m_NE[1]));
2574                            for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2575                                o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_000[i] + f_001[i] + f_010[i] + f_011[i] + f_100[i] + f_101[i] + f_110[i] + f_111[i])/8;
2576                            } // end of component loop i
2577                        } // end of k0 loop
2578                    } // end of k1 loop
2579                } // end of k2 loop
2580            } // end of parallel section
2581      } else {      } else {
2582          out.requireWrite();          out.requireWrite();
         /*** GENERATOR SNIP_INTERPOLATE_ELEMENTS TOP */  
2583          const double c0 = .0094373878376559314545;          const double c0 = .0094373878376559314545;
2584          const double c1 = .035220810900864519624;          const double c1 = .035220810900864519624;
2585          const double c2 = .13144585576580214704;          const double c2 = .13144585576580214704;
2586          const double c3 = .49056261216234406855;          const double c3 = .49056261216234406855;
2587  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel
2588          for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {          {
2589              for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {              vector<double> f_000(numComp);
2590                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {              vector<double> f_001(numComp);
2591                      const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_N0,m_N1));              vector<double> f_010(numComp);
2592                      const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_N0,m_N1));              vector<double> f_011(numComp);
2593                      const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_N0,m_N1));              vector<double> f_100(numComp);
2594                      const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));              vector<double> f_101(numComp);
2595                      const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_N0,m_N1));              vector<double> f_110(numComp);
2596                      const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_N0,m_N1));              vector<double> f_111(numComp);
2597                      const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_N0,m_N1));  #pragma omp for
2598                      const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));              for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2599                      double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE0,m_NE1));                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2600                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2601                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c3 + f_111[i]*c0 + c2*(f_001[i] + f_010[i] + f_100[i]) + c1*(f_011[i] + f_101[i] + f_110[i]);                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2602                          o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_011[i]*c0 + f_100[i]*c3 + c2*(f_000[i] + f_101[i] + f_110[i]) + c1*(f_001[i] + f_010[i] + f_111[i]);                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2603                          o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_010[i]*c3 + f_101[i]*c0 + c2*(f_000[i] + f_011[i] + f_110[i]) + c1*(f_001[i] + f_100[i] + f_111[i]);                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2604                          o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_001[i]*c0 + f_110[i]*c3 + c2*(f_010[i] + f_100[i] + f_111[i]) + c1*(f_000[i] + f_011[i] + f_101[i]);                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2605                          o[INDEX2(i,numComp,4)] = f_001[i]*c3 + f_110[i]*c0 + c2*(f_000[i] + f_011[i] + f_101[i]) + c1*(f_010[i] + f_100[i] + f_111[i]);                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2606                          o[INDEX2(i,numComp,5)] = f_010[i]*c0 + f_101[i]*c3 + c2*(f_001[i] + f_100[i] + f_111[i]) + c1*(f_000[i] + f_011[i] + f_110[i]);                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2607                          o[INDEX2(i,numComp,6)] = f_011[i]*c3 + f_100[i]*c0 + c2*(f_001[i] + f_010[i] + f_111[i]) + c1*(f_000[i] + f_101[i] + f_110[i]);                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2608                          o[INDEX2(i,numComp,7)] = f_000[i]*c0 + f_111[i]*c3 + c2*(f_011[i] + f_101[i] + f_110[i]) + c1*(f_001[i] + f_010[i] + f_100[i]);                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2609                      } /* end of component loop i */                          double* o = out.getSampleDataRW(INDEX3(k0,k1,k2,m_NE[0],m_NE[1]));
2610                  } /* end of k0 loop */                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2611              } /* end of k1 loop */                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c3 + f_111[i]*c0 + c2*(f_001[i] + f_010[i] + f_100[i]) + c1*(f_011[i] + f_101[i] + f_110[i]);
2612          } /* end of k2 loop */                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_011[i]*c0 + f_100[i]*c3 + c2*(f_000[i] + f_101[i] + f_110[i]) + c1*(f_001[i] + f_010[i] + f_111[i]);
2613          /* GENERATOR SNIP_INTERPOLATE_ELEMENTS BOTTOM */                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_010[i]*c3 + f_101[i]*c0 + c2*(f_000[i] + f_011[i] + f_110[i]) + c1*(f_001[i] + f_100[i] + f_111[i]);
2614                                o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_001[i]*c0 + f_110[i]*c3 + c2*(f_010[i] + f_100[i] + f_111[i]) + c1*(f_000[i] + f_011[i] + f_101[i]);
2615                                o[INDEX2(i,numComp,4)] = f_001[i]*c3 + f_110[i]*c0 + c2*(f_000[i] + f_011[i] + f_101[i]) + c1*(f_010[i] + f_100[i] + f_111[i]);
2616                                o[INDEX2(i,numComp,5)] = f_010[i]*c0 + f_101[i]*c3 + c2*(f_001[i] + f_100[i] + f_111[i]) + c1*(f_000[i] + f_011[i] + f_110[i]);
2617                                o[INDEX2(i,numComp,6)] = f_011[i]*c3 + f_100[i]*c0 + c2*(f_001[i] + f_010[i] + f_111[i]) + c1*(f_000[i] + f_101[i] + f_110[i]);
2618                                o[INDEX2(i,numComp,7)] = f_000[i]*c0 + f_111[i]*c3 + c2*(f_011[i] + f_101[i] + f_110[i]) + c1*(f_001[i] + f_010[i] + f_100[i]);
2619                            } // end of component loop i
2620                        } // end of k0 loop
2621                    } // end of k1 loop
2622                } // end of k2 loop
2623            } // end of parallel section
2624      }      }
2625  }  }
2626    
2627  //protected  //protected
2628  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escript::Data& out, escript::Data& in,  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escript::Data& out, const escript::Data& in,
2629                                      bool reduced) const                                      bool reduced) const
2630  {  {
2631      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();
2632      if (reduced) {      if (reduced) {
2633          out.requireWrite();          out.requireWrite();
         const double c0 = .25;  
2634  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
2635          {          {
2636              /*** GENERATOR SNIP_INTERPOLATE_REDUCED_FACES TOP */              vector<double> f_000(numComp);
2637                vector<double> f_001(numComp);
2638                vector<double> f_010(numComp);
2639                vector<double> f_011(numComp);
2640                vector<double> f_100(numComp);
2641                vector<double> f_101(numComp);
2642                vector<double> f_110(numComp);
2643                vector<double> f_111(numComp);
2644              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
2645  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2646                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2647                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2648                          const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2649                          const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2650                          const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2651                          const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2652                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
2653                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2654                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_000[i] + f_001[i] + f_010[i] + f_011[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_000[i] + f_001[i] + f_010[i] + f_011[i])/4;
2655                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2656                      } /* end of k1 loop */                      } // end of k1 loop
2657                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
2658              } /* end of face 0 */              } // end of face 0
2659              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
2660  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2661                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2662                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2663                          const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2664                          const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2665                          const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2666                          const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2667                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
2668                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2669                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_100[i] + f_101[i] + f_110[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_100[i] + f_101[i] + f_110[i] + f_111[i])/4;
2670                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2671                      } /* end of k1 loop */                      } // end of k1 loop
2672                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
2673              } /* end of face 1 */              } // end of face 1
2674              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
2675  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2676                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2677                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2678                          const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2679                          const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2680                          const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2681                          const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2682                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
2683                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2684                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_000[i] + f_001[i] + f_100[i] + f_101[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_000[i] + f_001[i] + f_100[i] + f_101[i])/4;
2685                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2686                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
2687                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
2688              } /* end of face 2 */              } // end of face 2
2689              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
2690  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2691                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2692                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2693                          const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2694                          const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2695                          const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2696                          const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2697                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
2698                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2699                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_010[i] + f_011[i] + f_110[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_010[i] + f_011[i] + f_110[i] + f_111[i])/4;
2700                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2701                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
2702                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
2703              } /* end of face 3 */              } // end of face 3
2704              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
2705  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2706                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2707                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2708                          const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2709                          const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2710                          const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2711                          const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2712                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
2713                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2714                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_000[i] + f_010[i] + f_100[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_000[i] + f_010[i] + f_100[i] + f_110[i])/4;
2715                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2716                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
2717                  } /* end of k1 loop */                  } // end of k1 loop
2718              } /* end of face 4 */              } // end of face 4
2719              if (m_faceOffset[5] > -1) {              if (m_faceOffset[5] > -1) {
2720  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2721                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2722                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2723                          const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2724                          const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2725                          const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_N2-1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2726                          const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_N2-1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,m_NN[2]-1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2727                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[5]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
2728                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2729                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_001[i] + f_011[i] + f_101[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_001[i] + f_011[i] + f_101[i] + f_111[i])/4;
2730                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2731                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
2732                  } /* end of k1 loop */                  } // end of k1 loop
2733              } /* end of face 5 */              } // end of face 5
             /* GENERATOR SNIP_INTERPOLATE_REDUCED_FACES BOTTOM */  
2734          } // end of parallel section          } // end of parallel section
2735      } else {      } else {
2736          out.requireWrite();          out.requireWrite();
# Line 2087  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr Line 2739  void Brick::interpolateNodesOnFaces(escr
2739          const double c2 = 0.62200846792814621559;          const double c2 = 0.62200846792814621559;
2740  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
2741          {          {
2742              /*** GENERATOR SNIP_INTERPOLATE_FACES TOP */              vector<double> f_000(numComp);
2743                vector<double> f_001(numComp);
2744                vector<double> f_010(numComp);
2745                vector<double> f_011(numComp);
2746                vector<double> f_100(numComp);
2747                vector<double> f_101(numComp);
2748                vector<double> f_110(numComp);
2749                vector<double> f_111(numComp);
2750              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
2751  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2752                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2753                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2754                          const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2755                          const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2756                          const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2757                          const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(0,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2758                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
2759                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2760                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c2 + f_011[i]*c0 + c1*(f_001[i] + f_010[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c2 + f_011[i]*c0 + c1*(f_001[i] + f_010[i]);
2761                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_001[i]*c0 + f_010[i]*c2 + c1*(f_000[i] + f_011[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_001[i]*c0 + f_010[i]*c2 + c1*(f_000[i] + f_011[i]);
2762                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_001[i]*c2 + f_010[i]*c0 + c1*(f_000[i] + f_011[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_001[i]*c2 + f_010[i]*c0 + c1*(f_000[i] + f_011[i]);
2763                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_000[i]*c0 + f_011[i]*c2 + c1*(f_001[i] + f_010[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_000[i]*c0 + f_011[i]*c2 + c1*(f_001[i] + f_010[i]);
2764                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2765                      } /* end of k1 loop */                      } // end of k1 loop
2766                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
2767              } /* end of face 0 */              } // end of face 0
2768              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
2769  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2770                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2771                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                      for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2772                          const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2773                          const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2774                          const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2775                          const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(m_N0-1,k1+1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(m_NN[0]-1,k1+1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2776                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE1));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+INDEX2(k1,k2,m_NE[1]));
2777                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2778                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_100[i]*c2 + f_111[i]*c0 + c1*(f_101[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_100[i]*c2 + f_111[i]*c0 + c1*(f_101[i] + f_110[i]);
2779                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_101[i]*c0 + f_110[i]*c2 + c1*(f_100[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_101[i]*c0 + f_110[i]*c2 + c1*(f_100[i] + f_111[i]);
2780                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_101[i]*c2 + f_110[i]*c0 + c1*(f_100[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_101[i]*c2 + f_110[i]*c0 + c1*(f_100[i] + f_111[i]);
2781                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_100[i]*c0 + f_111[i]*c2 + c1*(f_101[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_100[i]*c0 + f_111[i]*c2 + c1*(f_101[i] + f_110[i]);
2782                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2783                      } /* end of k1 loop */                      } // end of k1 loop
2784                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
2785              } /* end of face 1 */              } // end of face 1
2786              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
2787  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2788                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2789                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2790                          const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2791                          const register double* f_001 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_001[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2792                          const register double* f_101 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2793                          const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_101[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,0,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2794                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
2795                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2796                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c2 + f_101[i]*c0 + c1*(f_001[i] + f_100[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c2 + f_101[i]*c0 + c1*(f_001[i] + f_100[i]);
2797                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_001[i]*c0 + f_100[i]*c2 + c1*(f_000[i] + f_101[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_001[i]*c0 + f_100[i]*c2 + c1*(f_000[i] + f_101[i]);
2798                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_001[i]*c2 + f_100[i]*c0 + c1*(f_000[i] + f_101[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_001[i]*c2 + f_100[i]*c0 + c1*(f_000[i] + f_101[i]);
2799                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_000[i]*c0 + f_101[i]*c2 + c1*(f_001[i] + f_100[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_000[i]*c0 + f_101[i]*c2 + c1*(f_001[i] + f_100[i]);
2800                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2801                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
2802                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
2803              } /* end of face 2 */              } // end of face 2
2804              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
2805  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2806                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE2; ++k2) {                  for (index_t k2=0; k2 < m_NE[2]; ++k2) {
2807                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2808                          const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2809                          const register double* f_011 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_011[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2810                          const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,m_N1-1,k2, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2811                          const register double* f_111 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_N1-1,k2+1, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_111[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,m_NN[1]-1,k2+1, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2812                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+INDEX2(k0,k2,m_NE[0]));
2813                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2814                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_010[i]*c2 + f_111[i]*c0 + c1*(f_011[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_010[i]*c2 + f_111[i]*c0 + c1*(f_011[i] + f_110[i]);
2815                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_011[i]*c0 + f_110[i]*c2 + c1*(f_010[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_011[i]*c0 + f_110[i]*c2 + c1*(f_010[i] + f_111[i]);
2816                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_011[i]*c2 + f_110[i]*c0 + c1*(f_010[i] + f_111[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_011[i]*c2 + f_110[i]*c0 + c1*(f_010[i] + f_111[i]);
2817                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_010[i]*c0 + f_111[i]*c2 + c1*(f_011[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_010[i]*c0 + f_111[i]*c2 + c1*(f_011[i] + f_110[i]);
2818                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2819                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
2820                  } /* end of k2 loop */                  } // end of k2 loop
2821              } /* end of face 3 */              } // end of face 3
2822              if (m_faceOffset[4] > -1) {              if (m_faceOffset[4] > -1) {
2823  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
2824                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
2825                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                      for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
2826                          const register double* f_000 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_000[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2827                          const register double* f_100 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_010[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2828                          const register double* f_110 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_100[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2829                          const register double* f_010 = in.getSampleDataRO(INDEX3(k0,k1+1,0, m_N0,m_N1));                          memcpy(&f_110[0], in.getSampleDataRO(INDEX3(k0+1,k1+1,0, m_NN[0],m_NN[1])), numComp*sizeof(double));
2830                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE0));                          double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[4]+INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
2831                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                          for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
2832                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c2 + f_110[i]*c0 + c1*(f_010[i] + f_100[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_000[i]*c2 + f_110[i]*c0 + c1*(f_010[i] + f_100[i]);
2833                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_010[i]*c0 + f_100[i]*c2 + c1*(f_000[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_010[i]*c0 + f_100[i]*c2 + c1*(f_000[i] + f_110[i]);
2834                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_010[i]*c2 + f_100[i]*c0 + c1*(f_000[i] + f_110[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_010[i]*c2 + f_100[i]*c0 + c1*(f_000[i] + f_110[i]);
2835                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_000[i]*c0 + f_110[i]*c2 + c1*(f_010[i] + f_100[i]);                              o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_000[i]*c0 + f_110[i]*c2 + c1*(f_010[i] + f_100[i]);
2836                          } /* end of component loop i */                          } // end of component loop i
2837                      } /* end of k0 loop */                      } // end of k0 loop
2838                  } /* end of k1 loop */                  } // end of k1 loop