/[escript]/branches/domexper/dudley/src/Assemble_PDE_Single2_3D.c
ViewVC logotype

Diff of /branches/domexper/dudley/src/Assemble_PDE_Single2_3D.c

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

temp/finley/src/Assemble_PDE_Single2_3D.c revision 1387 by trankine, Fri Jan 11 07:45:26 2008 UTC branches/domexper/dudley/src/Assemble_PDE_Single2_3D.c revision 3136 by jfenwick, Thu Sep 2 03:48:29 2010 UTC
# Line 1  Line 1 
1    
 /* $Id$ */  
   
2  /*******************************************************  /*******************************************************
3   *  *
4   *           Copyright 2003-2007 by ACceSS MNRF  * Copyright (c) 2003-2010 by University of Queensland
5   *       Copyright 2007 by University of Queensland  * Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)
6   *  * http://www.uq.edu.au/esscc
7   *                http://esscc.uq.edu.au  *
8   *        Primary Business: Queensland, Australia  * Primary Business: Queensland, Australia
9   *  Licensed under the Open Software License version 3.0  * Licensed under the Open Software License version 3.0
10   *     http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php  * http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php
11   *  *
12   *******************************************************/  *******************************************************/
13    
14    
15  /**************************************************************/  /**************************************************************/
16    
# Line 46  Line 45 
45    
46  /**************************************************************/  /**************************************************************/
47    
48  void  Finley_Assemble_PDE_Single2_3D(Assemble_Parameters p, Finley_ElementFile* elements,  void  Dudley_Assemble_PDE_Single2_3D(Assemble_Parameters p, Dudley_ElementFile* elements,
49                                       Paso_SystemMatrix* Mat, escriptDataC* F,                                       Paso_SystemMatrix* Mat, escriptDataC* F,
50                                       escriptDataC* A, escriptDataC* B, escriptDataC* C, escriptDataC* D, escriptDataC* X, escriptDataC* Y) {                                       escriptDataC* A, escriptDataC* B, escriptDataC* C, escriptDataC* D, escriptDataC* X, escriptDataC* Y) {
51    
52      #define DIM 3      #define DIM 3
53      index_t color;      index_t color;
54      dim_t e;      dim_t e;
55      double *EM_S, *EM_F, *Vol, *DSDX, *A_p, *B_p, *C_p, *D_p, *X_p, *Y_p;      __const double *A_p, *B_p, *C_p, *D_p, *X_p, *Y_p, *A_q, *B_q, *C_q, *D_q, *X_q, *Y_q;
56        double *EM_S, *EM_F, *Vol, *DSDX;
57      index_t *row_index;      index_t *row_index;
58      register dim_t q, s,r;      register dim_t q, s,r;
59      register double rtmp, rtmp00, rtmp01, rtmp02, rtmp10, rtmp11, rtmp12, rtmp20, rtmp21, rtmp22, rtmp0, rtmp1, rtmp2;      register double rtmp, rtmp00, rtmp01, rtmp02, rtmp10, rtmp11, rtmp12, rtmp20, rtmp21, rtmp22, rtmp0, rtmp1, rtmp2;
# Line 65  void  Finley_Assemble_PDE_Single2_3D(Ass Line 65  void  Finley_Assemble_PDE_Single2_3D(Ass
65      bool_t extendedD=isExpanded(D);      bool_t extendedD=isExpanded(D);
66      bool_t extendedX=isExpanded(X);      bool_t extendedX=isExpanded(X);
67      bool_t extendedY=isExpanded(Y);      bool_t extendedY=isExpanded(Y);
68      double *F_p=getSampleData(F,0);      double *F_p=(requireWrite(F), getSampleDataRW(F,0));    /* use comma, to get around the mixed code and declarations thing */
69      double *S=p.row_jac->ReferenceElement->S;      double *S=p.row_jac->BasisFunctions->S;
70      dim_t len_EM_S=p.row_NN*p.col_NN;      dim_t len_EM_S=p.row_numShapesTotal*p.col_numShapesTotal;
71      dim_t len_EM_F=p.row_NN;      dim_t len_EM_F=p.row_numShapesTotal;
   
72    
73      #pragma omp parallel private(color,EM_S, EM_F, Vol, DSDX, A_p, B_p, C_p, D_p, X_p, Y_p,row_index,q, s,r,rtmp, rtmp00, rtmp01, rtmp02, rtmp10, rtmp11, rtmp12, rtmp20, rtmp21, rtmp22, rtmp0, rtmp1, rtmp2,add_EM_F, add_EM_S)      #pragma omp parallel private(color,EM_S, EM_F, Vol, DSDX, A_p, B_p, C_p, D_p, X_p, Y_p, A_q, B_q, C_q, D_q, X_q, Y_q,row_index,q, s,r,rtmp, rtmp00, rtmp01, rtmp02, rtmp10, rtmp11, rtmp12, rtmp20, rtmp21, rtmp22, rtmp0, rtmp1, rtmp2,add_EM_F, add_EM_S)
74      {      {
75         EM_S=THREAD_MEMALLOC(len_EM_S,double);         EM_S=THREAD_MEMALLOC(len_EM_S,double);
76         EM_F=THREAD_MEMALLOC(len_EM_F,double);         EM_F=THREAD_MEMALLOC(len_EM_F,double);
77         row_index=THREAD_MEMALLOC(p.row_NN,index_t);         row_index=THREAD_MEMALLOC(p.row_numShapesTotal,index_t);
78                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
79         if (!Finley_checkPtr(EM_S) && !Finley_checkPtr(EM_F) && !Finley_checkPtr(row_index) ) {         if (!Dudley_checkPtr(EM_S) && !Dudley_checkPtr(EM_F) && !Dudley_checkPtr(row_index) ) {
80    
81            for (color=elements->minColor;color<=elements->maxColor;color++) {            for (color=elements->minColor;color<=elements->maxColor;color++) {
82               /*  open loop over all elements: */               /*  open loop over all elements: */
83               #pragma omp for private(e) schedule(static)               #pragma omp for private(e) schedule(static)
84               for(e=0;e<elements->numElements;e++){               for(e=0;e<elements->numElements;e++){
85                  if (elements->Color[e]==color) {                  if (elements->Color[e]==color) {
86                     Vol=&(p.row_jac->volume[INDEX2(0,e,p.numQuad)]);  
87                     DSDX=&(p.row_jac->DSDX[INDEX4(0,0,0,e,p.row_NN,DIM,p.numQuad)]);                     A_p=getSampleDataRO(A,e);
88                     for (q=0;q<len_EM_S;++q) EM_S[q]=0;                     B_p=getSampleDataRO(B,e);
89                     for (q=0;q<len_EM_F;++q) EM_F[q]=0;                     C_p=getSampleDataRO(C,e);
90                     add_EM_F=FALSE;                     D_p=getSampleDataRO(D,e);
91                     add_EM_S=FALSE;                     X_p=getSampleDataRO(X,e);
92                     /**************************************************************/                     Y_p=getSampleDataRO(Y,e);
93                     /*   process A: */  
94                     /**************************************************************/                        Vol=&(p.row_jac->volume[INDEX3(0,0,e, p.numQuadSub,1)]);
95                     A_p=getSampleData(A,e);                        DSDX=&(p.row_jac->DSDX[INDEX5(0,0,0,0,e,p.row_numShapesTotal,DIM,p.numQuadSub,1)]);
96                     if (NULL!=A_p) {                        for (q=0;q<len_EM_S;++q) EM_S[q]=0;
97                        add_EM_S=TRUE;                        for (q=0;q<len_EM_F;++q) EM_F[q]=0;
98                        if (extendedA) {                        add_EM_F=FALSE;
99                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                        add_EM_S=FALSE;
100                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {  
101                               rtmp=0;                        /**************************************************************/
102                               for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                        /*   process A: */
103                                     rtmp+=Vol[q]*( DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX3(0,0,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)]                        /**************************************************************/
104                                                  + DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX3(0,1,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)]                        if (NULL!=A_p) {
105                                                  + DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX3(0,2,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)]                           add_EM_S=TRUE;
106                                                  + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX3(1,0,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)]                           if (extendedA) {
107                                                  + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX3(1,1,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)]                  A_q=&(A_p[INDEX4(0,0,0,0, DIM,DIM,p.numQuadSub)]);
108                                                  + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX3(1,2,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)]                              for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
109                                                  + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX3(2,0,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)]                                for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
110                                                  + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX3(2,1,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)]                                  rtmp=0;
111                                                  + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX3(2,2,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)]);                                  for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) {
112                               }                                        rtmp+=Vol[q]*( DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX3(0,0,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
113                               EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;                                                     + DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX3(0,1,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
114                             }                                                     + DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX3(0,2,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
115                           }                                                     + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX3(1,0,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
116                        } else {                                                     + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX3(1,1,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
117                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                                                     + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX3(1,2,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
118                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                                                     + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX3(2,0,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
119                                      rtmp00=0;                                                     + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX3(2,1,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
120                                      rtmp01=0;                                                     + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX3(2,2,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]);
121                                      rtmp02=0;                                  }
122                                      rtmp10=0;                                  EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+=rtmp;
123                                      rtmp11=0;                                }
124                                      rtmp12=0;                              }
125                                      rtmp20=0;                           } else {
126                                      rtmp21=0;                              for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
127                                      rtmp22=0;                                for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
128                                      for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                                         rtmp00=0;
129                                             rtmp01=0;
130                                          rtmp0=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)];                                         rtmp02=0;
131                                          rtmp00+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];                                         rtmp10=0;
132                                          rtmp01+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)];                                         rtmp11=0;
133                                          rtmp02+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)];                                         rtmp12=0;
134                                             rtmp20=0;
135                                          rtmp1=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)];                                         rtmp21=0;
136                                          rtmp10+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];                                         rtmp22=0;
137                                          rtmp11+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)];                                         for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) {
138                                          rtmp12+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)];        
139                                                 rtmp0=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
140                                          rtmp2=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)];                                             rtmp00+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
141                                          rtmp20+=rtmp2*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];                                             rtmp01+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
142                                          rtmp21+=rtmp2*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)];                                             rtmp02+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
143                                          rtmp22+=rtmp2*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)];        
144                                      }                                             rtmp1=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
145                                      EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp00*A_p[INDEX2(0,0,DIM)]                                             rtmp10+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
146                                                                                        +rtmp01*A_p[INDEX2(0,1,DIM)]                                             rtmp11+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
147                                                                                        +rtmp02*A_p[INDEX2(0,2,DIM)]                                             rtmp12+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
148                                                                                        +rtmp10*A_p[INDEX2(1,0,DIM)]        
149                                                                                        +rtmp11*A_p[INDEX2(1,1,DIM)]                                             rtmp2=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
150                                                                                        +rtmp12*A_p[INDEX2(1,2,DIM)]                                             rtmp20+=rtmp2*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
151                                                                                        +rtmp20*A_p[INDEX2(2,0,DIM)]                                             rtmp21+=rtmp2*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
152                                                                                        +rtmp21*A_p[INDEX2(2,1,DIM)]                                             rtmp22+=rtmp2*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
153                                                                                        +rtmp22*A_p[INDEX2(2,2,DIM)];                                         }
154                             }                                         EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+=rtmp00*A_p[INDEX2(0,0,DIM)]
155                           }                                                                                           +rtmp01*A_p[INDEX2(0,1,DIM)]
156                         }                                                                                           +rtmp02*A_p[INDEX2(0,2,DIM)]
157                     }                                                                                           +rtmp10*A_p[INDEX2(1,0,DIM)]
158                     /**************************************************************/                                                                                           +rtmp11*A_p[INDEX2(1,1,DIM)]
159                     /*   process B: */                                                                                           +rtmp12*A_p[INDEX2(1,2,DIM)]
160                     /**************************************************************/                                                                                           +rtmp20*A_p[INDEX2(2,0,DIM)]
161                     B_p=getSampleData(B,e);                                                                                           +rtmp21*A_p[INDEX2(2,1,DIM)]
162                     if (NULL!=B_p) {                                                                                           +rtmp22*A_p[INDEX2(2,2,DIM)];
163                        add_EM_S=TRUE;                                }
164                        if (extendedB) {                              }
165                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                            }
166                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                        }
167                               rtmp=0;                        /**************************************************************/
168                               for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                        /*   process B: */
169                                   rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)]*                        /**************************************************************/
170                                                ( DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*B_p[INDEX2(0,q,DIM)]                        if (NULL!=B_p) {
171                                                + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*B_p[INDEX2(1,q,DIM)]                           add_EM_S=TRUE;
172                                                + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)]*B_p[INDEX2(2,q,DIM)]);                           if (extendedB) {
173                               }                      B_q=&(B_p[INDEX3(0,0,0, DIM,p.numQuadSub)]);
174                               EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;                              for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
175                             }                                for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
176                           }                                  rtmp=0;
177                        } else {                                  for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) {
178                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                                      rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(r,q,p.row_numShapes)]*
179                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                                                   ( DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*B_q[INDEX2(0,q,DIM)]
180                                 rtmp0=0;                                                   + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*B_q[INDEX2(1,q,DIM)]
181                                 rtmp1=0;                                                   + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*B_q[INDEX2(2,q,DIM)]);
182                                 rtmp2=0;                                  }
183                                 for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                                  EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+=rtmp;
184                                     rtmp=Vol[q]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)];                                }
185                                     rtmp0+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)];                              }
186                                     rtmp1+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)];                           } else {
187                                     rtmp2+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)];                              for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
188                                 }                                for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
189                                 EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp0*B_p[0]+rtmp1*B_p[1]+rtmp2*B_p[2];                                    rtmp0=0;
190                             }                                    rtmp1=0;
191                                      rtmp2=0;
192                                      for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) {
193                                          rtmp=Vol[q]*S[INDEX2(r,q,p.row_numShapes)];
194                                          rtmp0+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
195                                          rtmp1+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
196                                          rtmp2+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
197                                      }
198                                      EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+=rtmp0*B_p[0]+rtmp1*B_p[1]+rtmp2*B_p[2];
199                                  }
200                                }
201                           }                           }
202                        }                        }
203                     }                        /**************************************************************/
204                     /**************************************************************/                        /*   process C: */
205                     /*   process C: */                        /**************************************************************/
206                     /**************************************************************/                        if (NULL!=C_p) {
207                     C_p=getSampleData(C,e);                          add_EM_S=TRUE;
208                     if (NULL!=C_p) {                          if (extendedC) {
209                       add_EM_S=TRUE;                              C_q=&(C_p[INDEX3(0,0,0, DIM, p.numQuadSub)]);
210                       if (extendedC) {                              for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
211                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                                for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
212                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                                  rtmp=0;
213                               rtmp=0;                                  for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) {
214                               for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                                     rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_numShapes)]*
215                                  rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*                                           ( C_q[INDEX2(0,q,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
216                                        ( C_p[INDEX2(0,q,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)]                                           + C_q[INDEX2(1,q,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
217                                        + C_p[INDEX2(1,q,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)]                                           + C_q[INDEX2(2,q,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]);
218                                        + C_p[INDEX2(2,q,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)]);                                  }
219                               }                                  EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+=rtmp;
220                               EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;                                }
221                                }
222                            } else {
223                                for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
224                                  for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
225                                      rtmp0=0;
226                                      rtmp1=0;
227                                      rtmp2=0;
228                                      for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) {
229                                          rtmp=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_numShapes)];
230                                          rtmp0+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
231                                          rtmp1+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
232                                          rtmp2+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
233                                      }
234                                      EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+=rtmp0*C_p[0]+rtmp1*C_p[1]+rtmp2*C_p[2];
235                                  }
236                                }
237                            }
238                          }
239                          /************************************************************* */
240                          /* process D */
241                          /**************************************************************/
242                          if (NULL!=D_p) {
243                            add_EM_S=TRUE;
244                            if (extendedD) {
245                    D_q=&(D_p[INDEX2(0,0, p.numQuadSub)]);
246                                for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
247                                  for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
248                                    rtmp=0;
249                                    for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_numShapes)]*D_q[q]*S[INDEX2(r,q,p.row_numShapes)];
250                                    EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+=rtmp;
251                                  }
252                                }
253                            } else {
254                                for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
255                                  for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
256                                      rtmp=0;
257                                      for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_numShapes)]*S[INDEX2(r,q,p.row_numShapes)];
258                                      EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+=rtmp*D_p[0];
259                                  }
260                                }
261                            }
262                          }
263                          /**************************************************************/
264                          /*   process X: */
265                          /**************************************************************/
266                          if (NULL!=X_p) {
267                            add_EM_F=TRUE;
268                            if (extendedX) {
269                   X_q=&(X_p[INDEX3(0,0,0, DIM,p.numQuadSub)]);
270                               for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
271                                  rtmp=0;
272                                  for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) {
273                                       rtmp+=Vol[q]*( DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*X_q[INDEX2(0,q,DIM)]
274                                                    + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*X_q[INDEX2(1,q,DIM)]
275                                                    + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*X_q[INDEX2(2,q,DIM)]);
276                                  }
277                                  EM_F[INDEX2(0,s,p.numEqu)]+=rtmp;
278                             }                             }
279                           }                           } else {
280                       } else {                             for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
281                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                                rtmp0=0;
282                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                                rtmp1=0;
283                                 rtmp0=0;                                rtmp2=0;
284                                 rtmp1=0;                                for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) {
285                                 rtmp2=0;                                     rtmp0+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
286                                 for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                                     rtmp1+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
287                                     rtmp=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)];                                     rtmp2+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
288                                     rtmp0+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];                                }
289                                     rtmp1+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)];                                EM_F[INDEX2(0,s,p.numEqu)]+=rtmp0*X_p[0]+rtmp1*X_p[1]+rtmp2*X_p[2];
                                    rtmp2+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)];  
                                }  
                                EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp0*C_p[0]+rtmp1*C_p[1]+rtmp2*C_p[2];  
290                             }                             }
291                           }                          }
292                       }                       }
293                     }                       /**************************************************************/
294                     /************************************************************* */                       /*   process Y: */
295                     /* process D */                       /**************************************************************/
296                     /**************************************************************/                        if (NULL!=Y_p) {
297                     D_p=getSampleData(D,e);                          add_EM_F=TRUE;
298                     if (NULL!=D_p) {                          if (extendedY) {
299                       add_EM_S=TRUE;                 Y_q=&(Y_p[INDEX2(0,0, p.numQuadSub)]);
300                       if (extendedD) {                             for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
301                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                                rtmp=0;
302                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                                for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_numShapes)]*Y_q[q];
303                               rtmp=0;                                EM_F[INDEX2(0,s,p.numEqu)]+=rtmp;
                              for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*D_p[q]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)];  
                              EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;  
304                             }                             }
305                           }                           } else {
306                       } else {                             for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
                          for (s=0;s<p.row_NS;s++) {  
                            for (r=0;r<p.col_NS;r++) {  
307                                 rtmp=0;                                 rtmp=0;
308                                 for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)];                                 for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_numShapes)];
309                                 EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp*D_p[0];                                 EM_F[INDEX2(0,s,p.numEqu)]+=rtmp*Y_p[0];
310                             }                             }
311                           }                           }
312                       }                         }
313                     }                         /***********************************************************************************************/
314                     /**************************************************************/                         /* add the element matrices onto the matrix and right hand side                                */
315                     /*   process X: */                         /***********************************************************************************************/
316                     /**************************************************************/  
317                     X_p=getSampleData(X,e);                         for (q=0;q<p.row_numShapesTotal;q++) row_index[q]=p.row_DOF[elements->Nodes[INDEX2(p.row_node[INDEX2(q,0,p.row_numShapesTotal)],e,p.NN)]];
318                     if (NULL!=X_p) {  
319                       add_EM_F=TRUE;                         if (add_EM_F) Dudley_Util_AddScatter(p.row_numShapesTotal,row_index,p.numEqu,EM_F,F_p, p.row_DOF_UpperBound);
320                       if (extendedX) {                         if (add_EM_S) Dudley_Assemble_addToSystemMatrix(Mat,p.row_numShapesTotal,row_index,p.numEqu,p.col_numShapesTotal,row_index,p.numComp,EM_S);
321                          for (s=0;s<p.row_NS;s++) {  
                            rtmp=0;  
                            for (q=0;q<p.numQuad;q++) {  
                                 rtmp+=Vol[q]*( DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*X_p[INDEX2(0,q,DIM)]  
                                              + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*X_p[INDEX2(1,q,DIM)]  
                                              + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)]*X_p[INDEX2(2,q,DIM)]);  
                            }  
                            EM_F[INDEX2(0,s,p.numEqu)]+=rtmp;  
                         }  
                       } else {  
                         for (s=0;s<p.row_NS;s++) {  
                            rtmp0=0;  
                            rtmp1=0;  
                            rtmp2=0;  
                            for (q=0;q<p.numQuad;q++) {  
                                 rtmp0+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)];  
                                 rtmp1+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)];  
                                 rtmp2+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)];  
                            }  
                            EM_F[INDEX2(0,s,p.numEqu)]+=rtmp0*X_p[0]+rtmp1*X_p[1]+rtmp2*X_p[2];  
                         }  
                      }  
                   }  
                   /**************************************************************/  
                   /*   process Y: */  
                   /**************************************************************/  
                    Y_p=getSampleData(Y,e);  
                    if (NULL!=Y_p) {  
                      add_EM_F=TRUE;  
                      if (extendedY) {  
                         for (s=0;s<p.row_NS;s++) {  
                            rtmp=0;  
                            for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*Y_p[q];  
                            EM_F[INDEX2(0,s,p.numEqu)]+=rtmp;  
                         }  
                       } else {  
                         for (s=0;s<p.row_NS;s++) {  
                             rtmp=0;  
                             for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)];  
                             EM_F[INDEX2(0,s,p.numEqu)]+=rtmp*Y_p[0];  
                         }  
                       }  
                     }  
                     /***********************************************************************************************/  
                     /* add the element matrices onto the matrix and right hand side                                */  
                     /***********************************************************************************************/  
                     for (q=0;q<p.row_NN;q++) row_index[q]=p.row_DOF[elements->Nodes[INDEX2(p.row_node[q],e,p.NN)]];  
                     if (add_EM_F) Finley_Util_AddScatter(p.row_NN,row_index,p.numEqu,EM_F,F_p, p.row_DOF_UpperBound);  
                     if (add_EM_S) Finley_Assemble_addToSystemMatrix(Mat,p.row_NN,row_index,p.numEqu,p.col_NN,row_index,p.numComp,EM_S);  
     
322                  } /* end color check */                  } /* end color check */
323               } /* end element loop */               } /* end element loop */
324           } /* end color loop */           } /* end color loop */
# Line 320  void  Finley_Assemble_PDE_Single2_3D(Ass Line 330  void  Finley_Assemble_PDE_Single2_3D(Ass
330        } /* end of pointer check */        } /* end of pointer check */
331     } /* end parallel region */     } /* end parallel region */
332  }  }
 /*  
  * $Log$  
  */  

Legend:
Removed from v.1387  
changed lines
  Added in v.3136

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.26