/[escript]/branches/domexper/dudley/src/Assemble_PDE_System2_3D.c
ViewVC logotype

Diff of /branches/domexper/dudley/src/Assemble_PDE_System2_3D.c

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

trunk/finley/src/Assemble_PDE_System2_3D.c revision 1811 by ksteube, Thu Sep 25 23:11:13 2008 UTC branches/domexper/dudley/src/Assemble_PDE_System2_3D.c revision 3080 by jfenwick, Tue Aug 3 04:28:03 2010 UTC
# Line 1  Line 1 
1    
2  /*******************************************************  /*******************************************************
3  *  *
4  * Copyright (c) 2003-2008 by University of Queensland  * Copyright (c) 2003-2010 by University of Queensland
5  * Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)  * Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)
6  * http://www.uq.edu.au/esscc  * http://www.uq.edu.au/esscc
7  *  *
# Line 51  void  Finley_Assemble_PDE_System2_3D(Ass Line 51  void  Finley_Assemble_PDE_System2_3D(Ass
51    
52      #define DIM 3      #define DIM 3
53      index_t color;      index_t color;
54      dim_t e;      dim_t e, isub;
55      double *EM_S, *EM_F, *Vol, *DSDX, *A_p, *B_p, *C_p, *D_p, *X_p, *Y_p;      __const double  *A_p, *B_p, *C_p, *D_p, *X_p, *Y_p, *A_q, *B_q, *C_q, *D_q, *X_q, *Y_q;
56        double *EM_S, *EM_F, *Vol, *DSDX;
57      index_t *row_index;      index_t *row_index;
58      register dim_t q, s,r,k,m;      register dim_t q, s,r,k,m;
59      register double rtmp, rtmp0, rtmp1, rtmp2, rtmp00, rtmp01, rtmp02, rtmp10, rtmp11, rtmp12, rtmp20, rtmp21, rtmp22;      register double rtmp, rtmp0, rtmp1, rtmp2, rtmp00, rtmp01, rtmp02, rtmp10, rtmp11, rtmp12, rtmp20, rtmp21, rtmp22;
# Line 64  void  Finley_Assemble_PDE_System2_3D(Ass Line 65  void  Finley_Assemble_PDE_System2_3D(Ass
65      bool_t extendedD=isExpanded(D);      bool_t extendedD=isExpanded(D);
66      bool_t extendedX=isExpanded(X);      bool_t extendedX=isExpanded(X);
67      bool_t extendedY=isExpanded(Y);      bool_t extendedY=isExpanded(Y);
68      double *F_p=getSampleData(F,0);      double *F_p=(requireWrite(F), getSampleDataRW(F,0));    /* use comma, to get around the mixed code and declarations thing */
69      double *S=p.row_jac->ReferenceElement->S;      double *S=p.row_jac->BasisFunctions->S;
70      dim_t len_EM_S=p.row_NN*p.col_NN*p.numEqu*p.numComp;      dim_t len_EM_S=p.row_numShapesTotal*p.col_numShapesTotal*p.numEqu*p.numComp;
71      dim_t len_EM_F=p.row_NN*p.numEqu;      dim_t len_EM_F=p.row_numShapesTotal*p.numEqu;
72    
73        #pragma omp parallel private(color,EM_S, EM_F, Vol, DSDX, A_p, B_p, C_p, D_p, X_p, Y_p, A_q, B_q, C_q, D_q, X_q, Y_q,row_index,q, s,r,k,m,rtmp, rtmp0, rtmp1, rtmp2, rtmp00, rtmp01, rtmp02, rtmp10, rtmp11, rtmp12, rtmp20, rtmp21, rtmp22,add_EM_F, add_EM_S, isub)
     #pragma omp parallel private(color,EM_S, EM_F, Vol, DSDX, A_p, B_p, C_p, D_p, X_p, Y_p,row_index,q, s,r,k,m,rtmp, rtmp0, rtmp1, rtmp2, rtmp00, rtmp01, rtmp02, rtmp10, rtmp11, rtmp12, rtmp20, rtmp21, rtmp22,add_EM_F, add_EM_S)  
74      {      {
75         EM_S=THREAD_MEMALLOC(len_EM_S,double);         EM_S=THREAD_MEMALLOC(len_EM_S,double);
76         EM_F=THREAD_MEMALLOC(len_EM_F,double);         EM_F=THREAD_MEMALLOC(len_EM_F,double);
77         row_index=THREAD_MEMALLOC(p.row_NN,index_t);         row_index=THREAD_MEMALLOC(p.row_numShapesTotal,index_t);
78                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
79         if (!Finley_checkPtr(EM_S) && !Finley_checkPtr(EM_F) && !Finley_checkPtr(row_index) ) {         if (!Finley_checkPtr(EM_S) && !Finley_checkPtr(EM_F) && !Finley_checkPtr(row_index) ) {
80    
# Line 83  void  Finley_Assemble_PDE_System2_3D(Ass Line 83  void  Finley_Assemble_PDE_System2_3D(Ass
83               #pragma omp for private(e) schedule(static)               #pragma omp for private(e) schedule(static)
84               for(e=0;e<elements->numElements;e++){               for(e=0;e<elements->numElements;e++){
85                  if (elements->Color[e]==color) {                  if (elements->Color[e]==color) {
86                     Vol=&(p.row_jac->volume[INDEX2(0,e,p.numQuad)]);  
87                     DSDX=&(p.row_jac->DSDX[INDEX4(0,0,0,e,p.row_NN,DIM,p.numQuad)]);                     A_p=getSampleDataRO(A,e);
88                     for (q=0;q<len_EM_S;++q) EM_S[q]=0;                     B_p=getSampleDataRO(B,e);
89                     for (q=0;q<len_EM_F;++q) EM_F[q]=0;                     C_p=getSampleDataRO(C,e);
90                     add_EM_F=FALSE;                     D_p=getSampleDataRO(D,e);
91                     add_EM_S=FALSE;                     X_p=getSampleDataRO(X,e);
92                     /**************************************************************/                     Y_p=getSampleDataRO(Y,e);
93                     /*   process A: */  
94                     /**************************************************************/                     for (isub=0;isub<p.numSub;isub++){
95                     A_p=getSampleData(A,e);  
96                     if (NULL!=A_p) {                        Vol=&(p.row_jac->volume[INDEX3(0,isub,e, p.numQuadSub,p.numSub)]);
97                        add_EM_S=TRUE;                        DSDX=&(p.row_jac->DSDX[INDEX5(0,0,0,isub,e,p.row_numShapesTotal,DIM,p.numQuadSub,p.numSub)]);
98                        if (extendedA) {                        for (q=0;q<len_EM_S;++q) EM_S[q]=0;
99                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                        for (q=0;q<len_EM_F;++q) EM_F[q]=0;
100                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                        add_EM_F=FALSE;
101                               for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                        add_EM_S=FALSE;
102                                 for (m=0;m<p.numComp;m++) {                
103                                    rtmp=0;                        /**************************************************************/
104                                    for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                        /*   process A: */
105                                       rtmp+=Vol[q]*(                        /**************************************************************/  
106                                         DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,0,m,0,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)]                        if (NULL!=A_p) {
107                                        +DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,0,m,1,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)]                           add_EM_S=TRUE;
108                                        +DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,0,m,2,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)]                           if (extendedA) {
109                                        +DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,1,m,0,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)]                      A_q=&(A_p[INDEX6(0,0,0,0,0,isub, p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM,p.numQuadSub)]);
110                                        +DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,1,m,1,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)]                              for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
111                                        +DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,1,m,2,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)]                                for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
112                                        +DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,2,m,0,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)]                                  for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
                                       +DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,2,m,1,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)]  
                                       +DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,2,m,2,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)]);  
                             
                                   }  
                                   EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;  
                                }  
                              }  
                            }  
                          }  
                       } else {  
                          for (s=0;s<p.row_NS;s++) {  
                            for (r=0;r<p.col_NS;r++) {  
                                rtmp00=0;  
                                rtmp01=0;  
                                rtmp02=0;  
                                rtmp10=0;  
                                rtmp11=0;  
                                rtmp12=0;  
                                rtmp20=0;  
                                rtmp21=0;  
                                rtmp22=0;  
                                for (q=0;q<p.numQuad;q++) {  
                                      rtmp0=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)];  
                                      rtmp00+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];  
                                      rtmp01+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)];  
                                      rtmp02+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)];  
     
                                      rtmp1=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)];  
                                      rtmp10+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];  
                                      rtmp11+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)];  
                                      rtmp12+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)];  
     
                                      rtmp2=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)];  
                                      rtmp20+=rtmp2*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];  
                                      rtmp21+=rtmp2*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)];  
                                      rtmp22+=rtmp2*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)];  
                                }  
                                for (k=0;k<p.numEqu;k++) {  
113                                    for (m=0;m<p.numComp;m++) {                                    for (m=0;m<p.numComp;m++) {
114                                       EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+= rtmp00*A_p[INDEX4(k,0,m,0,p.numEqu,DIM,p.numComp)]                                       rtmp=0;
115                                                                                          +rtmp01*A_p[INDEX4(k,0,m,1,p.numEqu,DIM,p.numComp)]                                       for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) {
116                                                                                          +rtmp02*A_p[INDEX4(k,0,m,2,p.numEqu,DIM,p.numComp)]                                          rtmp+=Vol[q]*(
117                                                                                          +rtmp10*A_p[INDEX4(k,1,m,0,p.numEqu,DIM,p.numComp)]                                            DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX5(k,0,m,0,q, p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
118                                                                                          +rtmp11*A_p[INDEX4(k,1,m,1,p.numEqu,DIM,p.numComp)]                                           +DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX5(k,0,m,1,q, p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
119                                                                                          +rtmp12*A_p[INDEX4(k,1,m,2,p.numEqu,DIM,p.numComp)]                                           +DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX5(k,0,m,2,q, p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
120                                                                                          +rtmp20*A_p[INDEX4(k,2,m,0,p.numEqu,DIM,p.numComp)]                                           +DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX5(k,1,m,0,q, p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
121                                                                                          +rtmp21*A_p[INDEX4(k,2,m,1,p.numEqu,DIM,p.numComp)]                                           +DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX5(k,1,m,1,q, p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
122                                                                                          +rtmp22*A_p[INDEX4(k,2,m,2,p.numEqu,DIM,p.numComp)];                                           +DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX5(k,1,m,2,q, p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
123                                    }                                           +DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX5(k,2,m,0,q, p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
124                                 }                                           +DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX5(k,2,m,1,q, p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
125                             }                                           +DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX5(k,2,m,2,q, p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]);
126                           }                              
127                         }                                       }
128                     }                                       EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+=rtmp;
                    /**************************************************************/  
                    /*   process B: */  
                    /**************************************************************/  
                    B_p=getSampleData(B,e);  
                    if (NULL!=B_p) {  
                       add_EM_S=TRUE;  
                       if (extendedB) {  
                          for (s=0;s<p.row_NS;s++) {  
                            for (r=0;r<p.col_NS;r++) {  
                              for (k=0;k<p.numEqu;k++) {  
                                for (m=0;m<p.numComp;m++) {  
                                   rtmp=0;  
                                   for (q=0;q<p.numQuad;q++) {  
                                       rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)]*(  
                                               DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*B_p[INDEX4(k,0,m,q,p.numEqu,DIM,p.numComp)]  
                                             + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*B_p[INDEX4(k,1,m,q,p.numEqu,DIM,p.numComp)]  
                                             + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)]*B_p[INDEX4(k,2,m,q,p.numEqu,DIM,p.numComp)] );  
129                                    }                                    }
130                                    EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;                                  }
131                                 }                                }
132                               }                              }
133                             }                           } else {
134                           }                              for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
135                        } else {                                for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
136                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                                    rtmp00=0;
137                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                                    rtmp01=0;
138                                    rtmp0=0;                                    rtmp02=0;
139                                    rtmp1=0;                                    rtmp10=0;
140                                    rtmp2=0;                                    rtmp11=0;
141                                    for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                                    rtmp12=0;
142                                         rtmp=Vol[q]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)];                                    rtmp20=0;
143                                         rtmp0+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)];                                    rtmp21=0;
144                                         rtmp1+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)];                                    rtmp22=0;
145                                         rtmp2+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)];                                    for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) {
146                                            rtmp0=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
147                                            rtmp00+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
148                                            rtmp01+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
149                                            rtmp02+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
150          
151                                            rtmp1=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
152                                            rtmp10+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
153                                            rtmp11+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
154                                            rtmp12+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
155          
156                                            rtmp2=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
157                                            rtmp20+=rtmp2*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
158                                            rtmp21+=rtmp2*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
159                                            rtmp22+=rtmp2*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
160                                    }                                    }
161                                    for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                                    for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
162                                       for (m=0;m<p.numComp;m++) {                                       for (m=0;m<p.numComp;m++) {
163                                          EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp0*B_p[INDEX3(k,0,m,p.numEqu,DIM)]                                          EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+= rtmp00*A_p[INDEX4(k,0,m,0, p.numEqu,DIM,p.numComp)]
164                                                                                            +rtmp1*B_p[INDEX3(k,1,m,p.numEqu,DIM)]                                                                                             +rtmp01*A_p[INDEX4(k,0,m,1, p.numEqu,DIM,p.numComp)]
165                                                                                            +rtmp2*B_p[INDEX3(k,2,m,p.numEqu,DIM)];                                                                                             +rtmp02*A_p[INDEX4(k,0,m,2, p.numEqu,DIM,p.numComp)]
166                                                                                               +rtmp10*A_p[INDEX4(k,1,m,0, p.numEqu,DIM,p.numComp)]
167                                                                                               +rtmp11*A_p[INDEX4(k,1,m,1, p.numEqu,DIM,p.numComp)]
168                                                                                               +rtmp12*A_p[INDEX4(k,1,m,2, p.numEqu,DIM,p.numComp)]
169                                                                                               +rtmp20*A_p[INDEX4(k,2,m,0, p.numEqu,DIM,p.numComp)]
170                                                                                               +rtmp21*A_p[INDEX4(k,2,m,1, p.numEqu,DIM,p.numComp)]
171                                                                                               +rtmp22*A_p[INDEX4(k,2,m,2, p.numEqu,DIM,p.numComp)];
172                                       }                                       }
173                                    }                                    }
174                             }                                }
175                           }                              }
176                              }
177                        }                        }
178                     }                        /**************************************************************/
179                     /**************************************************************/                        /*   process B: */
180                     /*   process C: */                        /**************************************************************/
181                     /**************************************************************/                        if (NULL!=B_p) {
182                     C_p=getSampleData(C,e);                           add_EM_S=TRUE;
183                     if (NULL!=C_p) {                           if (extendedB) {
184                       add_EM_S=TRUE;                      B_q=&(B_p[INDEX5(0,0,0,0,isub, p.numEqu,DIM,p.numComp,p.numQuadSub)]);
185                       if (extendedC) {                              for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
186                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                                for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
187                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                                  for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
188                               for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                                    for (m=0;m<p.numComp;m++) {
189                                 for (m=0;m<p.numComp;m++) {                                       rtmp=0;
190                                   rtmp=0;                                       for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) {
191                                   for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                                           rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(r,q,p.row_numShapes)]*(
192                                        rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*(                                                   DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*B_q[INDEX4(k,0,m,q,p.numEqu,DIM,p.numComp)]
193                                                   C_p[INDEX4(k,m,0,q,p.numEqu,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)]                                                 + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*B_q[INDEX4(k,1,m,q,p.numEqu,DIM,p.numComp)]
194                                                  +C_p[INDEX4(k,m,1,q,p.numEqu,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)]                                                 + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*B_q[INDEX4(k,2,m,q,p.numEqu,DIM,p.numComp)] );
195                                                  +C_p[INDEX4(k,m,2,q,p.numEqu,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)]);                                       }
196                                   }                                       EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+=rtmp;
197                                   EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;                                    }
198                                 }                                  }
199                               }                                }
200                             }                              }
201                             } else {
202                                for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
203                                  for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
204                                         rtmp0=0;
205                                         rtmp1=0;
206                                         rtmp2=0;
207                                         for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) {
208                                              rtmp=Vol[q]*S[INDEX2(r,q,p.row_numShapes)];
209                                              rtmp0+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
210                                              rtmp1+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
211                                              rtmp2+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
212                                         }
213                                         for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
214                                            for (m=0;m<p.numComp;m++) {
215                                               EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+=rtmp0*B_p[INDEX3(k,0,m,p.numEqu,DIM)]
216                                                                                                 +rtmp1*B_p[INDEX3(k,1,m,p.numEqu,DIM)]
217                                                                                                 +rtmp2*B_p[INDEX3(k,2,m,p.numEqu,DIM)];
218                                            }
219                                         }
220                                  }
221                                }
222                           }                           }
223                       } else {                        }
224                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                        /**************************************************************/
225                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                        /*   process C: */
226                                    rtmp0=0;                        /**************************************************************/
227                                    rtmp1=0;                        if (NULL!=C_p) {
228                                    rtmp2=0;                          add_EM_S=TRUE;
229                                    for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                          if (extendedC) {
230                                       rtmp=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)];                  C_q=&(C_p[INDEX5(0,0,0,0,isub ,p.numEqu,p.numComp,DIM, p.numQuadSub)]);
231                                       rtmp0+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];                              for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
232                                       rtmp1+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)];                                for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
233                                       rtmp2+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)];                                  for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
234                                      for (m=0;m<p.numComp;m++) {
235                                        rtmp=0;
236                                        for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) {
237                                             rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_numShapes)]*(
238                                                        C_q[INDEX4(k,m,0,q,p.numEqu,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
239                                                       +C_q[INDEX4(k,m,1,q,p.numEqu,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
240                                                       +C_q[INDEX4(k,m,2,q,p.numEqu,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]);
241                                        }
242                                        EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+=rtmp;
243                                      }
244                                    }
245                                  }
246                                }
247                            } else {
248                                for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
249                                  for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
250                                         rtmp0=0;
251                                         rtmp1=0;
252                                         rtmp2=0;
253                                         for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) {
254                                            rtmp=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_numShapes)];
255                                            rtmp0+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
256                                            rtmp1+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
257                                            rtmp2+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
258                                         }
259                                         for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
260                                            for (m=0;m<p.numComp;m++) {
261                                                  EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+=rtmp0*C_p[INDEX3(k,m,0,p.numEqu,p.numComp)]
262                                                                                                    +rtmp1*C_p[INDEX3(k,m,1,p.numEqu,p.numComp)]
263                                                                                                    +rtmp2*C_p[INDEX3(k,m,2,p.numEqu,p.numComp)];
264                                             }
265                                         }
266                                  }
267                                }
268                            }
269                          }
270                          /************************************************************* */
271                          /* process D */
272                          /**************************************************************/
273                          if (NULL!=D_p) {
274                            add_EM_S=TRUE;
275                            if (extendedD) {
276                    D_q=&(D_p[INDEX4(0,0,0,isub ,p.numEqu,p.numComp, p.numQuadSub)]);
277                                for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
278                                  for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
279                                    for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
280                                      for (m=0;m<p.numComp;m++) {
281                                        rtmp=0;
282                                        for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) {
283                                            rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_numShapes)]*D_q[INDEX3(k,m,q,p.numEqu,p.numComp)]*S[INDEX2(r,q,p.row_numShapes)];
284                                        }
285                                        EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+=rtmp;
286                                    }                                    }
287                                    }
288                                  }
289                                }
290                            } else {
291                                for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
292                                  for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
293                                      rtmp=0;
294                                      for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_numShapes)]*S[INDEX2(r,q,p.row_numShapes)];
295                                    for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                                    for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
296                                       for (m=0;m<p.numComp;m++) {                                        for (m=0;m<p.numComp;m++) {
297                                             EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp0*C_p[INDEX3(k,m,0,p.numEqu,p.numComp)]                                          EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+=rtmp*D_p[INDEX2(k,m,p.numEqu)];
298                                                                                               +rtmp1*C_p[INDEX3(k,m,1,p.numEqu,p.numComp)]                                       }
                                                                                              +rtmp2*C_p[INDEX3(k,m,2,p.numEqu,p.numComp)];  
                                       }  
299                                    }                                    }
300                             }                                }
301                           }                              }
302                       }                          }
303                     }                        }
304                     /************************************************************* */                        /**************************************************************/
305                     /* process D */                        /*   process X: */
306                     /**************************************************************/                        /**************************************************************/
307                     D_p=getSampleData(D,e);                        if (NULL!=X_p) {
308                     if (NULL!=D_p) {                          add_EM_F=TRUE;
309                       add_EM_S=TRUE;                          if (extendedX) {
310                       if (extendedD) {                 X_q=&(X_p[INDEX4(0,0,0,isub, p.numEqu,DIM,p.numQuadSub)]);
311                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                             for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
312                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                                for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
                              for (k=0;k<p.numEqu;k++) {  
                                for (m=0;m<p.numComp;m++) {  
313                                   rtmp=0;                                   rtmp=0;
314                                   for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                                   for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) {
315                                       rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*D_p[INDEX3(k,m,q,p.numEqu,p.numComp)]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)];                                         rtmp+=Vol[q]* ( DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*X_q[INDEX3(k,0,q,p.numEqu,DIM)]
316                                                         + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*X_q[INDEX3(k,1,q,p.numEqu,DIM)]
317                                                         + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*X_q[INDEX3(k,2,q,p.numEqu,DIM)]);
318                                   }                                   }
319                                   EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;                                   EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp;
320                                 }                                }
                              }  
321                             }                             }
322                           }                          } else {
323                       } else {                             for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
324                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                               rtmp0=0;
325                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                               rtmp1=0;
326                                 rtmp=0;                               rtmp2=0;
327                                 for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)];                               for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) {
328                                 for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                                  rtmp0+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
329                                     for (m=0;m<p.numComp;m++) {                                  rtmp1+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
330                                       EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp*D_p[INDEX2(k,m,p.numEqu)];                                  rtmp2+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
331                                    }                               }
332                                 }                               for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
333                                           EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp0*X_p[INDEX2(k,0,p.numEqu)]
334                                                                      +rtmp1*X_p[INDEX2(k,1,p.numEqu)]
335                                                                      +rtmp2*X_p[INDEX2(k,2,p.numEqu)];
336                                 }
337                             }                             }
338                           }                          }
339                       }                       }
340                     }                       /**************************************************************/
341                     /**************************************************************/                       /*   process Y: */
342                     /*   process X: */                       /**************************************************************/
343                     /**************************************************************/                        if (NULL!=Y_p) {
344                     X_p=getSampleData(X,e);                          add_EM_F=TRUE;
345                     if (NULL!=X_p) {                          if (extendedY) {
346                       add_EM_F=TRUE;                 Y_q=&(Y_p[INDEX3(0,0,isub, p.numEqu,p.numQuadSub)]);
347                       if (extendedX) {                             for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
348                          for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                                for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
349                             for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                                   rtmp=0.;
350                                rtmp=0;                                   for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_numShapes)]*Y_q[INDEX2(k,q,p.numEqu)];
351                                for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                                   EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp;
                                     rtmp+=Vol[q]* ( DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*X_p[INDEX3(k,0,q,p.numEqu,DIM)]  
                                                   + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*X_p[INDEX3(k,1,q,p.numEqu,DIM)]  
                                                   + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)]*X_p[INDEX3(k,2,q,p.numEqu,DIM)]);  
352                                }                                }
                               EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp;  
353                             }                             }
354                          }                           } else {
355                       } else {                             for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
356                          for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                                 rtmp=0;
357                            rtmp0=0;                                 for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_numShapes)];
358                            rtmp1=0;                                 for (k=0;k<p.numEqu;k++) EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp*Y_p[k];
                           rtmp2=0;  
                           for (q=0;q<p.numQuad;q++) {  
                              rtmp0+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)];  
                              rtmp1+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)];  
                              rtmp2+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)];  
                           }  
                           for (k=0;k<p.numEqu;k++) {  
                                     EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp0*X_p[INDEX2(k,0,p.numEqu)]  
                                                                +rtmp1*X_p[INDEX2(k,1,p.numEqu)]  
                                                                +rtmp2*X_p[INDEX2(k,2,p.numEqu)];  
                           }  
                         }  
                      }  
                   }  
                   /**************************************************************/  
                   /*   process Y: */  
                   /**************************************************************/  
                    Y_p=getSampleData(Y,e);  
                    if (NULL!=Y_p) {  
                      add_EM_F=TRUE;  
                      if (extendedY) {  
                         for (s=0;s<p.row_NS;s++) {  
                            for (k=0;k<p.numEqu;k++) {  
                               rtmp=0.;  
                               for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*Y_p[INDEX2(k,q,p.numEqu)];  
                               EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp;  
359                             }                             }
360                          }                           }
361                        } else {                         }
362                          for (s=0;s<p.row_NS;s++) {  
363                              rtmp=0;                         /***********************************************************************************************/
364                              for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)];                         /* add the element matrices onto the matrix and right hand side                                */          
365                              for (k=0;k<p.numEqu;k++) EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp*Y_p[k];                         /***********************************************************************************************/
366                          }                         for (q=0;q<p.row_numShapesTotal;q++) row_index[q]=p.row_DOF[elements->Nodes[INDEX2(p.row_node[INDEX2(q,isub,p.row_numShapesTotal)],e,p.NN)]];
367                        }                        
368                      }                 if (add_EM_F) Finley_Util_AddScatter(p.row_numShapesTotal,row_index,p.numEqu,EM_F,F_p, p.row_DOF_UpperBound);
369                      /***********************************************************************************************/                         if (add_EM_S) Finley_Assemble_addToSystemMatrix(Mat,p.row_numShapesTotal,row_index,p.numEqu,p.col_numShapesTotal,row_index,p.numComp,EM_S);
370                      /* add the element matrices onto the matrix and right hand side                                */                     } /* end of subn */
                     /***********************************************************************************************/  
                     for (q=0;q<p.row_NN;q++) row_index[q]=p.row_DOF[elements->Nodes[INDEX2(p.row_node[q],e,p.NN)]];  
                     if (add_EM_F) Finley_Util_AddScatter(p.row_NN,row_index,p.numEqu,EM_F,F_p, p.row_DOF_UpperBound);  
                     if (add_EM_S) Finley_Assemble_addToSystemMatrix(Mat,p.row_NN,row_index,p.numEqu,p.col_NN,row_index,p.numComp,EM_S);  
     
371                  } /* end color check */                  } /* end color check */
372               } /* end element loop */               } /* end element loop */
373           } /* end color loop */           } /* end color loop */
# Line 366  void  Finley_Assemble_PDE_System2_3D(Ass Line 379  void  Finley_Assemble_PDE_System2_3D(Ass
379        } /* end of pointer check */        } /* end of pointer check */
380     } /* end parallel region */     } /* end parallel region */
381  }  }
 /*  
  * $Log$  
  */  

Legend:
Removed from v.1811  
changed lines
  Added in v.3080

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.26