/[escript]/branches/domexper/dudley/src/Assemble_PDE_System2_3D.c
ViewVC logotype

Diff of /branches/domexper/dudley/src/Assemble_PDE_System2_3D.c

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

revision 2548 by jfenwick, Mon Jul 20 06:20:06 2009 UTC revision 2748 by gross, Tue Nov 17 07:32:59 2009 UTC
# Line 51  void  Finley_Assemble_PDE_System2_3D(Ass Line 51  void  Finley_Assemble_PDE_System2_3D(Ass
51    
52      #define DIM 3      #define DIM 3
53      index_t color;      index_t color;
54      dim_t e;      dim_t e, isub;
55      __const double  *A_p, *B_p, *C_p, *D_p, *X_p, *Y_p;      __const double  *A_p, *B_p, *C_p, *D_p, *X_p, *Y_p, *A_q, *B_q, *C_q, *D_q, *X_q, *Y_q;
56      double *EM_S, *EM_F, *Vol, *DSDX;      double *EM_S, *EM_F, *Vol, *DSDX;
57      index_t *row_index;      index_t *row_index;
58      register dim_t q, s,r,k,m;      register dim_t q, s,r,k,m;
# Line 66  void  Finley_Assemble_PDE_System2_3D(Ass Line 66  void  Finley_Assemble_PDE_System2_3D(Ass
66      bool_t extendedX=isExpanded(X);      bool_t extendedX=isExpanded(X);
67      bool_t extendedY=isExpanded(Y);      bool_t extendedY=isExpanded(Y);
68      double *F_p=(requireWrite(F), getSampleDataRW(F,0));    /* use comma, to get around the mixed code and declarations thing */      double *F_p=(requireWrite(F), getSampleDataRW(F,0));    /* use comma, to get around the mixed code and declarations thing */
69      double *S=p.row_jac->ReferenceElement->S;      double *S=p.row_jac->BasisFunctions->S;
70      dim_t len_EM_S=p.row_NN*p.col_NN*p.numEqu*p.numComp;      dim_t len_EM_S=p.row_numShapesTotal*p.col_numShapesTotal*p.numEqu*p.numComp;
71      dim_t len_EM_F=p.row_NN*p.numEqu;      dim_t len_EM_F=p.row_numShapesTotal*p.numEqu;
72    
73      void* ABuff=allocSampleBuffer(A);      void* ABuff=allocSampleBuffer(A);
74      void* BBuff=allocSampleBuffer(B);      void* BBuff=allocSampleBuffer(B);
# Line 76  void  Finley_Assemble_PDE_System2_3D(Ass Line 76  void  Finley_Assemble_PDE_System2_3D(Ass
76      void* DBuff=allocSampleBuffer(D);      void* DBuff=allocSampleBuffer(D);
77      void* XBuff=allocSampleBuffer(X);      void* XBuff=allocSampleBuffer(X);
78      void* YBuff=allocSampleBuffer(Y);      void* YBuff=allocSampleBuffer(Y);
79      #pragma omp parallel private(color,EM_S, EM_F, Vol, DSDX, A_p, B_p, C_p, D_p, X_p, Y_p,row_index,q, s,r,k,m,rtmp, rtmp0, rtmp1, rtmp2, rtmp00, rtmp01, rtmp02, rtmp10, rtmp11, rtmp12, rtmp20, rtmp21, rtmp22,add_EM_F, add_EM_S)      #pragma omp parallel private(color,EM_S, EM_F, Vol, DSDX, A_p, B_p, C_p, D_p, X_p, Y_p, A_q, B_q, C_q, D_q, X_q, Y_q,row_index,q, s,r,k,m,rtmp, rtmp0, rtmp1, rtmp2, rtmp00, rtmp01, rtmp02, rtmp10, rtmp11, rtmp12, rtmp20, rtmp21, rtmp22,add_EM_F, add_EM_S, isub)
80      {      {
81         EM_S=THREAD_MEMALLOC(len_EM_S,double);         EM_S=THREAD_MEMALLOC(len_EM_S,double);
82         EM_F=THREAD_MEMALLOC(len_EM_F,double);         EM_F=THREAD_MEMALLOC(len_EM_F,double);
83         row_index=THREAD_MEMALLOC(p.row_NN,index_t);         row_index=THREAD_MEMALLOC(p.row_numShapesTotal,index_t);
84                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
85         if (!Finley_checkPtr(EM_S) && !Finley_checkPtr(EM_F) && !Finley_checkPtr(row_index) ) {         if (!Finley_checkPtr(EM_S) && !Finley_checkPtr(EM_F) && !Finley_checkPtr(row_index) ) {
86    
# Line 89  void  Finley_Assemble_PDE_System2_3D(Ass Line 89  void  Finley_Assemble_PDE_System2_3D(Ass
89               #pragma omp for private(e) schedule(static)               #pragma omp for private(e) schedule(static)
90               for(e=0;e<elements->numElements;e++){               for(e=0;e<elements->numElements;e++){
91                  if (elements->Color[e]==color) {                  if (elements->Color[e]==color) {
92                     Vol=&(p.row_jac->volume[INDEX2(0,e,p.numQuad)]);  
                    DSDX=&(p.row_jac->DSDX[INDEX4(0,0,0,e,p.row_NN,DIM,p.numQuad)]);  
                    for (q=0;q<len_EM_S;++q) EM_S[q]=0;  
                    for (q=0;q<len_EM_F;++q) EM_F[q]=0;  
                    add_EM_F=FALSE;  
                    add_EM_S=FALSE;  
                    /**************************************************************/  
                    /*   process A: */  
                    /**************************************************************/  
93                     A_p=getSampleDataRO(A,e,ABuff);                     A_p=getSampleDataRO(A,e,ABuff);
                    if (NULL!=A_p) {  
                       add_EM_S=TRUE;  
                       if (extendedA) {  
                          for (s=0;s<p.row_NS;s++) {  
                            for (r=0;r<p.col_NS;r++) {  
                              for (k=0;k<p.numEqu;k++) {  
                                for (m=0;m<p.numComp;m++) {  
                                   rtmp=0;  
                                   for (q=0;q<p.numQuad;q++) {  
                                      rtmp+=Vol[q]*(  
                                        DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,0,m,0,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)]  
                                       +DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,0,m,1,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)]  
                                       +DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,0,m,2,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)]  
                                       +DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,1,m,0,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)]  
                                       +DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,1,m,1,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)]  
                                       +DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,1,m,2,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)]  
                                       +DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,2,m,0,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)]  
                                       +DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,2,m,1,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)]  
                                       +DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,2,m,2,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)]);  
                             
                                   }  
                                   EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;  
                                }  
                              }  
                            }  
                          }  
                       } else {  
                          for (s=0;s<p.row_NS;s++) {  
                            for (r=0;r<p.col_NS;r++) {  
                                rtmp00=0;  
                                rtmp01=0;  
                                rtmp02=0;  
                                rtmp10=0;  
                                rtmp11=0;  
                                rtmp12=0;  
                                rtmp20=0;  
                                rtmp21=0;  
                                rtmp22=0;  
                                for (q=0;q<p.numQuad;q++) {  
                                      rtmp0=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)];  
                                      rtmp00+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];  
                                      rtmp01+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)];  
                                      rtmp02+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)];  
     
                                      rtmp1=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)];  
                                      rtmp10+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];  
                                      rtmp11+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)];  
                                      rtmp12+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)];  
     
                                      rtmp2=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)];  
                                      rtmp20+=rtmp2*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];  
                                      rtmp21+=rtmp2*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)];  
                                      rtmp22+=rtmp2*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)];  
                                }  
                                for (k=0;k<p.numEqu;k++) {  
                                   for (m=0;m<p.numComp;m++) {  
                                      EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+= rtmp00*A_p[INDEX4(k,0,m,0,p.numEqu,DIM,p.numComp)]  
                                                                                         +rtmp01*A_p[INDEX4(k,0,m,1,p.numEqu,DIM,p.numComp)]  
                                                                                         +rtmp02*A_p[INDEX4(k,0,m,2,p.numEqu,DIM,p.numComp)]  
                                                                                         +rtmp10*A_p[INDEX4(k,1,m,0,p.numEqu,DIM,p.numComp)]  
                                                                                         +rtmp11*A_p[INDEX4(k,1,m,1,p.numEqu,DIM,p.numComp)]  
                                                                                         +rtmp12*A_p[INDEX4(k,1,m,2,p.numEqu,DIM,p.numComp)]  
                                                                                         +rtmp20*A_p[INDEX4(k,2,m,0,p.numEqu,DIM,p.numComp)]  
                                                                                         +rtmp21*A_p[INDEX4(k,2,m,1,p.numEqu,DIM,p.numComp)]  
                                                                                         +rtmp22*A_p[INDEX4(k,2,m,2,p.numEqu,DIM,p.numComp)];  
                                   }  
                                }  
                            }  
                          }  
                        }  
                    }  
                    /**************************************************************/  
                    /*   process B: */  
                    /**************************************************************/  
94                     B_p=getSampleDataRO(B,e,BBuff);                     B_p=getSampleDataRO(B,e,BBuff);
95                     if (NULL!=B_p) {                     C_p=getSampleDataRO(C,e,CBuff);
96                        add_EM_S=TRUE;                     D_p=getSampleDataRO(D,e,DBuff);
97                        if (extendedB) {                     X_p=getSampleDataRO(X,e,XBuff);
98                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                     Y_p=getSampleDataRO(Y,e,YBuff);
99                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {  
100                               for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                     for (isub=0;isub<p.numSub;isub++){
101                                 for (m=0;m<p.numComp;m++) {  
102                                    rtmp=0;                        Vol=&(p.row_jac->volume[INDEX3(0,isub,e, p.numQuadSub,p.numSub)]);
103                                    for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                        DSDX=&(p.row_jac->DSDX[INDEX5(0,0,0,isub,e,p.row_numShapesTotal,DIM,p.numQuadSub,p.numSub)]);
104                                        rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)]*(                        for (q=0;q<len_EM_S;++q) EM_S[q]=0;
105                                                DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*B_p[INDEX4(k,0,m,q,p.numEqu,DIM,p.numComp)]                        for (q=0;q<len_EM_F;++q) EM_F[q]=0;
106                                              + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*B_p[INDEX4(k,1,m,q,p.numEqu,DIM,p.numComp)]                        add_EM_F=FALSE;
107                                              + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)]*B_p[INDEX4(k,2,m,q,p.numEqu,DIM,p.numComp)] );                        add_EM_S=FALSE;
108                  
109                          /**************************************************************/
110                          /*   process A: */
111                          /**************************************************************/  
112                          if (NULL!=A_p) {
113                             add_EM_S=TRUE;
114                             if (extendedA) {
115                        A_q=&(A_p[INDEX6(0,0,0,0,0,isub, p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM,p.numQuadSub)]);
116                                for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
117                                  for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
118                                    for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
119                                      for (m=0;m<p.numComp;m++) {
120                                         rtmp=0;
121                                         for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) {
122                                            rtmp+=Vol[q]*(
123                                              DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX5(k,0,m,0,q, p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
124                                             +DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX5(k,0,m,1,q, p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
125                                             +DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX5(k,0,m,2,q, p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
126                                             +DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX5(k,1,m,0,q, p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
127                                             +DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX5(k,1,m,1,q, p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
128                                             +DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX5(k,1,m,2,q, p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
129                                             +DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX5(k,2,m,0,q, p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
130                                             +DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX5(k,2,m,1,q, p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
131                                             +DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX5(k,2,m,2,q, p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]);
132                                
133                                         }
134                                         EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+=rtmp;
135                                    }                                    }
136                                    EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;                                  }
137                                 }                                }
138                               }                              }
139                             }                           } else {
140                           }                              for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
141                        } else {                                for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
142                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                                    rtmp00=0;
143                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                                    rtmp01=0;
144                                    rtmp0=0;                                    rtmp02=0;
145                                    rtmp1=0;                                    rtmp10=0;
146                                    rtmp2=0;                                    rtmp11=0;
147                                    for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                                    rtmp12=0;
148                                         rtmp=Vol[q]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)];                                    rtmp20=0;
149                                         rtmp0+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)];                                    rtmp21=0;
150                                         rtmp1+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)];                                    rtmp22=0;
151                                         rtmp2+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)];                                    for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) {
152                                            rtmp0=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
153                                            rtmp00+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
154                                            rtmp01+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
155                                            rtmp02+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
156          
157                                            rtmp1=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
158                                            rtmp10+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
159                                            rtmp11+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
160                                            rtmp12+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
161          
162                                            rtmp2=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
163                                            rtmp20+=rtmp2*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
164                                            rtmp21+=rtmp2*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
165                                            rtmp22+=rtmp2*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
166                                    }                                    }
167                                    for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                                    for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
168                                       for (m=0;m<p.numComp;m++) {                                       for (m=0;m<p.numComp;m++) {
169                                          EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp0*B_p[INDEX3(k,0,m,p.numEqu,DIM)]                                          EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+= rtmp00*A_p[INDEX4(k,0,m,0, p.numEqu,DIM,p.numComp)]
170                                                                                            +rtmp1*B_p[INDEX3(k,1,m,p.numEqu,DIM)]                                                                                             +rtmp01*A_p[INDEX4(k,0,m,1, p.numEqu,DIM,p.numComp)]
171                                                                                            +rtmp2*B_p[INDEX3(k,2,m,p.numEqu,DIM)];                                                                                             +rtmp02*A_p[INDEX4(k,0,m,2, p.numEqu,DIM,p.numComp)]
172                                                                                               +rtmp10*A_p[INDEX4(k,1,m,0, p.numEqu,DIM,p.numComp)]
173                                                                                               +rtmp11*A_p[INDEX4(k,1,m,1, p.numEqu,DIM,p.numComp)]
174                                                                                               +rtmp12*A_p[INDEX4(k,1,m,2, p.numEqu,DIM,p.numComp)]
175                                                                                               +rtmp20*A_p[INDEX4(k,2,m,0, p.numEqu,DIM,p.numComp)]
176                                                                                               +rtmp21*A_p[INDEX4(k,2,m,1, p.numEqu,DIM,p.numComp)]
177                                                                                               +rtmp22*A_p[INDEX4(k,2,m,2, p.numEqu,DIM,p.numComp)];
178                                       }                                       }
179                                    }                                    }
180                             }                                }
181                           }                              }
182                              }
183                        }                        }
184                     }                        /**************************************************************/
185                     /**************************************************************/                        /*   process B: */
186                     /*   process C: */                        /**************************************************************/
187                     /**************************************************************/                        if (NULL!=B_p) {
188                     C_p=getSampleDataRO(C,e,CBuff);                           add_EM_S=TRUE;
189                     if (NULL!=C_p) {                           if (extendedB) {
190                       add_EM_S=TRUE;                      B_q=&(B_p[INDEX5(0,0,0,0,isub, p.numEqu,DIM,p.numComp,p.numQuadSub)]);
191                       if (extendedC) {                              for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
192                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                                for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
193                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                                  for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
194                               for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                                    for (m=0;m<p.numComp;m++) {
195                                 for (m=0;m<p.numComp;m++) {                                       rtmp=0;
196                                   rtmp=0;                                       for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) {
197                                   for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                                           rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(r,q,p.row_numShapes)]*(
198                                        rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*(                                                   DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*B_q[INDEX4(k,0,m,q,p.numEqu,DIM,p.numComp)]
199                                                   C_p[INDEX4(k,m,0,q,p.numEqu,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)]                                                 + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*B_q[INDEX4(k,1,m,q,p.numEqu,DIM,p.numComp)]
200                                                  +C_p[INDEX4(k,m,1,q,p.numEqu,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)]                                                 + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*B_q[INDEX4(k,2,m,q,p.numEqu,DIM,p.numComp)] );
201                                                  +C_p[INDEX4(k,m,2,q,p.numEqu,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)]);                                       }
202                                   }                                       EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+=rtmp;
203                                   EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;                                    }
204                                 }                                  }
205                               }                                }
206                             }                              }
207                             } else {
208                                for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
209                                  for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
210                                         rtmp0=0;
211                                         rtmp1=0;
212                                         rtmp2=0;
213                                         for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) {
214                                              rtmp=Vol[q]*S[INDEX2(r,q,p.row_numShapes)];
215                                              rtmp0+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
216                                              rtmp1+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
217                                              rtmp2+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
218                                         }
219                                         for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
220                                            for (m=0;m<p.numComp;m++) {
221                                               EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+=rtmp0*B_p[INDEX3(k,0,m,p.numEqu,DIM)]
222                                                                                                 +rtmp1*B_p[INDEX3(k,1,m,p.numEqu,DIM)]
223                                                                                                 +rtmp2*B_p[INDEX3(k,2,m,p.numEqu,DIM)];
224                                            }
225                                         }
226                                  }
227                                }
228                           }                           }
229                       } else {                        }
230                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                        /**************************************************************/
231                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                        /*   process C: */
232                                    rtmp0=0;                        /**************************************************************/
233                                    rtmp1=0;                        if (NULL!=C_p) {
234                                    rtmp2=0;                          add_EM_S=TRUE;
235                                    for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                          if (extendedC) {
236                                       rtmp=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)];                  C_q=&(C_p[INDEX5(0,0,0,0,isub ,p.numEqu,p.numComp,DIM, p.numQuadSub)]);
237                                       rtmp0+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];                              for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
238                                       rtmp1+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)];                                for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
239                                       rtmp2+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)];                                  for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
240                                      for (m=0;m<p.numComp;m++) {
241                                        rtmp=0;
242                                        for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) {
243                                             rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_numShapes)]*(
244                                                        C_q[INDEX4(k,m,0,q,p.numEqu,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
245                                                       +C_q[INDEX4(k,m,1,q,p.numEqu,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
246                                                       +C_q[INDEX4(k,m,2,q,p.numEqu,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]);
247                                        }
248                                        EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+=rtmp;
249                                    }                                    }
250                                    }
251                                  }
252                                }
253                            } else {
254                                for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
255                                  for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
256                                         rtmp0=0;
257                                         rtmp1=0;
258                                         rtmp2=0;
259                                         for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) {
260                                            rtmp=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_numShapes)];
261                                            rtmp0+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
262                                            rtmp1+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
263                                            rtmp2+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
264                                         }
265                                         for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
266                                            for (m=0;m<p.numComp;m++) {
267                                                  EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+=rtmp0*C_p[INDEX3(k,m,0,p.numEqu,p.numComp)]
268                                                                                                    +rtmp1*C_p[INDEX3(k,m,1,p.numEqu,p.numComp)]
269                                                                                                    +rtmp2*C_p[INDEX3(k,m,2,p.numEqu,p.numComp)];
270                                             }
271                                         }
272                                  }
273                                }
274                            }
275                          }
276                          /************************************************************* */
277                          /* process D */
278                          /**************************************************************/
279                          if (NULL!=D_p) {
280                            add_EM_S=TRUE;
281                            if (extendedD) {
282                    D_q=&(D_p[INDEX4(0,0,0,isub ,p.numEqu,p.numComp, p.numQuadSub)]);
283                                for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
284                                  for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
285                                    for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
286                                      for (m=0;m<p.numComp;m++) {
287                                        rtmp=0;
288                                        for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) {
289                                            rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_numShapes)]*D_q[INDEX3(k,m,q,p.numEqu,p.numComp)]*S[INDEX2(r,q,p.row_numShapes)];
290                                        }
291                                        EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+=rtmp;
292                                      }
293                                    }
294                                  }
295                                }
296                            } else {
297                                for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
298                                  for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
299                                      rtmp=0;
300                                      for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_numShapes)]*S[INDEX2(r,q,p.row_numShapes)];
301                                    for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                                    for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
302                                       for (m=0;m<p.numComp;m++) {                                        for (m=0;m<p.numComp;m++) {
303                                             EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp0*C_p[INDEX3(k,m,0,p.numEqu,p.numComp)]                                          EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+=rtmp*D_p[INDEX2(k,m,p.numEqu)];
304                                                                                               +rtmp1*C_p[INDEX3(k,m,1,p.numEqu,p.numComp)]                                       }
                                                                                              +rtmp2*C_p[INDEX3(k,m,2,p.numEqu,p.numComp)];  
                                       }  
305                                    }                                    }
306                             }                                }
307                           }                              }
308                       }                          }
309                     }                        }
310                     /************************************************************* */                        /**************************************************************/
311                     /* process D */                        /*   process X: */
312                     /**************************************************************/                        /**************************************************************/
313                     D_p=getSampleDataRO(D,e,DBuff);                        if (NULL!=X_p) {
314                     if (NULL!=D_p) {                          add_EM_F=TRUE;
315                       add_EM_S=TRUE;                          if (extendedX) {
316                       if (extendedD) {                 X_q=&(X_p[INDEX4(0,0,0,isub, p.numEqu,DIM,p.numQuadSub)]);
317                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                             for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
318                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                                for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
                              for (k=0;k<p.numEqu;k++) {  
                                for (m=0;m<p.numComp;m++) {  
319                                   rtmp=0;                                   rtmp=0;
320                                   for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                                   for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) {
321                                       rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*D_p[INDEX3(k,m,q,p.numEqu,p.numComp)]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)];                                         rtmp+=Vol[q]* ( DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*X_q[INDEX3(k,0,q,p.numEqu,DIM)]
322                                                         + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*X_q[INDEX3(k,1,q,p.numEqu,DIM)]
323                                                         + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*X_q[INDEX3(k,2,q,p.numEqu,DIM)]);
324                                   }                                   }
325                                   EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;                                   EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp;
326                                 }                                }
                              }  
327                             }                             }
328                           }                          } else {
329                       } else {                             for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
330                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                               rtmp0=0;
331                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                               rtmp1=0;
332                                 rtmp=0;                               rtmp2=0;
333                                 for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)];                               for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) {
334                                 for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                                  rtmp0+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
335                                     for (m=0;m<p.numComp;m++) {                                  rtmp1+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
336                                       EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp*D_p[INDEX2(k,m,p.numEqu)];                                  rtmp2+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
337                                    }                               }
338                                 }                               for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
339                                           EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp0*X_p[INDEX2(k,0,p.numEqu)]
340                                                                      +rtmp1*X_p[INDEX2(k,1,p.numEqu)]
341                                                                      +rtmp2*X_p[INDEX2(k,2,p.numEqu)];
342                                 }
343                             }                             }
344                           }                          }
345                       }                       }
346                     }                       /**************************************************************/
347                     /**************************************************************/                       /*   process Y: */
348                     /*   process X: */                       /**************************************************************/
349                     /**************************************************************/                        if (NULL!=Y_p) {
350                     X_p=getSampleDataRO(X,e,XBuff);                          add_EM_F=TRUE;
351                     if (NULL!=X_p) {                          if (extendedY) {
352                       add_EM_F=TRUE;                 Y_q=&(Y_p[INDEX3(0,0,isub, p.numEqu,p.numQuadSub)]);
353                       if (extendedX) {                             for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
354                          for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                                for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
355                             for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                                   rtmp=0.;
356                                rtmp=0;                                   for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_numShapes)]*Y_q[INDEX2(k,q,p.numEqu)];
357                                for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                                   EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp;
                                     rtmp+=Vol[q]* ( DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*X_p[INDEX3(k,0,q,p.numEqu,DIM)]  
                                                   + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*X_p[INDEX3(k,1,q,p.numEqu,DIM)]  
                                                   + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)]*X_p[INDEX3(k,2,q,p.numEqu,DIM)]);  
358                                }                                }
                               EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp;  
359                             }                             }
360                          }                           } else {
361                       } else {                             for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
362                          for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                                 rtmp=0;
363                            rtmp0=0;                                 for (q=0;q<p.numQuadSub;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_numShapes)];
364                            rtmp1=0;                                 for (k=0;k<p.numEqu;k++) EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp*Y_p[k];
                           rtmp2=0;  
                           for (q=0;q<p.numQuad;q++) {  
                              rtmp0+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)];  
                              rtmp1+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)];  
                              rtmp2+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)];  
                           }  
                           for (k=0;k<p.numEqu;k++) {  
                                     EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp0*X_p[INDEX2(k,0,p.numEqu)]  
                                                                +rtmp1*X_p[INDEX2(k,1,p.numEqu)]  
                                                                +rtmp2*X_p[INDEX2(k,2,p.numEqu)];  
                           }  
                         }  
                      }  
                   }  
                   /**************************************************************/  
                   /*   process Y: */  
                   /**************************************************************/  
                    Y_p=getSampleDataRO(Y,e,YBuff);  
                    if (NULL!=Y_p) {  
                      add_EM_F=TRUE;  
                      if (extendedY) {  
                         for (s=0;s<p.row_NS;s++) {  
                            for (k=0;k<p.numEqu;k++) {  
                               rtmp=0.;  
                               for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*Y_p[INDEX2(k,q,p.numEqu)];  
                               EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp;  
365                             }                             }
366                          }                           }
367                        } else {                         }
368                          for (s=0;s<p.row_NS;s++) {  
369                              rtmp=0;                         /***********************************************************************************************/
370                              for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)];                         /* add the element matrices onto the matrix and right hand side                                */          
371                              for (k=0;k<p.numEqu;k++) EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp*Y_p[k];                         /***********************************************************************************************/
372                          }                         for (q=0;q<p.row_numShapesTotal;q++) row_index[q]=p.row_DOF[elements->Nodes[INDEX2(p.row_node[INDEX2(q,isub,p.row_numShapesTotal)],e,p.NN)]];
373                        }                        
374                      }                 if (add_EM_F) Finley_Util_AddScatter(p.row_numShapesTotal,row_index,p.numEqu,EM_F,F_p, p.row_DOF_UpperBound);
375                      /***********************************************************************************************/                         if (add_EM_S) Finley_Assemble_addToSystemMatrix(Mat,p.row_numShapesTotal,row_index,p.numEqu,p.col_numShapesTotal,row_index,p.numComp,EM_S);
376                      /* add the element matrices onto the matrix and right hand side                                */                     } /* end of subn */
                     /***********************************************************************************************/  
                     for (q=0;q<p.row_NN;q++) row_index[q]=p.row_DOF[elements->Nodes[INDEX2(p.row_node[q],e,p.NN)]];  
                     if (add_EM_F) Finley_Util_AddScatter(p.row_NN,row_index,p.numEqu,EM_F,F_p, p.row_DOF_UpperBound);  
                     if (add_EM_S) Finley_Assemble_addToSystemMatrix(Mat,p.row_NN,row_index,p.numEqu,p.col_NN,row_index,p.numComp,EM_S);  
     
377                  } /* end color check */                  } /* end color check */
378               } /* end element loop */               } /* end element loop */
379           } /* end color loop */           } /* end color loop */
# Line 378  void  Finley_Assemble_PDE_System2_3D(Ass Line 391  void  Finley_Assemble_PDE_System2_3D(Ass
391     freeSampleBuffer(XBuff);     freeSampleBuffer(XBuff);
392     freeSampleBuffer(YBuff);     freeSampleBuffer(YBuff);
393  }  }
 /*  
  * $Log$  
  */  

Legend:
Removed from v.2548  
changed lines
  Added in v.2748

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.26