/[escript]/branches/domexper/dudley/src/Assemble_PDE_System2_3D.c
ViewVC logotype

Diff of /branches/domexper/dudley/src/Assemble_PDE_System2_3D.c

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

trunk/finley/src/Assemble_PDE_System2_3D.c revision 1312 by ksteube, Mon Sep 24 06:18:44 2007 UTC branches/domexper/dudley/src/Assemble_PDE_System2_3D.c revision 3184 by jfenwick, Wed Sep 15 00:23:42 2010 UTC
# Line 1  Line 1 
1    
 /* $Id$ */  
   
2  /*******************************************************  /*******************************************************
3   *  *
4   *           Copyright 2003-2007 by ACceSS MNRF  * Copyright (c) 2003-2010 by University of Queensland
5   *       Copyright 2007 by University of Queensland  * Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)
6   *  * http://www.uq.edu.au/esscc
7   *                http://esscc.uq.edu.au  *
8   *        Primary Business: Queensland, Australia  * Primary Business: Queensland, Australia
9   *  Licensed under the Open Software License version 3.0  * Licensed under the Open Software License version 3.0
10   *     http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php  * http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php
11   *  *
12   *******************************************************/  *******************************************************/
13    
14    
15  /**************************************************************/  /**************************************************************/
16    
# Line 46  Line 45 
45    
46  /**************************************************************/  /**************************************************************/
47    
48  void  Finley_Assemble_PDE_System2_3D(Assemble_Parameters p, Finley_ElementFile* elements,  void  Dudley_Assemble_PDE_System2_3D(Assemble_Parameters p, Dudley_ElementFile* elements,
49                                       Paso_SystemMatrix* Mat, escriptDataC* F,                                       Paso_SystemMatrix* Mat, escriptDataC* F,
50                                       escriptDataC* A, escriptDataC* B, escriptDataC* C, escriptDataC* D, escriptDataC* X, escriptDataC* Y) {                                       escriptDataC* A, escriptDataC* B, escriptDataC* C, escriptDataC* D, escriptDataC* X, escriptDataC* Y) {
51    
52      #define DIM 3      #define DIM 3
53      index_t color;      index_t color;
54      dim_t e;      dim_t e;
55      double *EM_S, *EM_F, *Vol, *DSDX, *A_p, *B_p, *C_p, *D_p, *X_p, *Y_p;      __const double  *A_p, *B_p, *C_p, *D_p, *X_p, *Y_p, *A_q, *B_q, *C_q, *D_q, *X_q, *Y_q;
56        double *EM_S, *EM_F, *DSDX;
57      index_t *row_index;      index_t *row_index;
58      register dim_t q, s,r,k,m;      register dim_t q, s,r,k,m;
59      register double rtmp, rtmp0, rtmp1, rtmp2, rtmp00, rtmp01, rtmp02, rtmp10, rtmp11, rtmp12, rtmp20, rtmp21, rtmp22;      register double rtmp, rtmp0, rtmp1, rtmp2, rtmp00, rtmp01, rtmp02, rtmp10, rtmp11, rtmp12, rtmp20, rtmp21, rtmp22;
# Line 65  void  Finley_Assemble_PDE_System2_3D(Ass Line 65  void  Finley_Assemble_PDE_System2_3D(Ass
65      bool_t extendedD=isExpanded(D);      bool_t extendedD=isExpanded(D);
66      bool_t extendedX=isExpanded(X);      bool_t extendedX=isExpanded(X);
67      bool_t extendedY=isExpanded(Y);      bool_t extendedY=isExpanded(Y);
68      double *F_p=getSampleData(F,0);      double *F_p=(requireWrite(F), getSampleDataRW(F,0));    /* use comma, to get around the mixed code and declarations thing */
69      double *S=p.row_jac->ReferenceElement->S;      double *S=p.row_jac->BasisFunctions->S;
70      dim_t len_EM_S=p.row_NN*p.col_NN*p.numEqu*p.numComp;      dim_t len_EM_S=p.row_numShapesTotal*p.col_numShapesTotal*p.numEqu*p.numComp;
71      dim_t len_EM_F=p.row_NN*p.numEqu;      dim_t len_EM_F=p.row_numShapesTotal*p.numEqu;
   
72    
73      #pragma omp parallel private(color,EM_S, EM_F, Vol, DSDX, A_p, B_p, C_p, D_p, X_p, Y_p,row_index,q, s,r,k,m,rtmp, rtmp0, rtmp1, rtmp2, rtmp00, rtmp01, rtmp02, rtmp10, rtmp11, rtmp12, rtmp20, rtmp21, rtmp22,add_EM_F, add_EM_S)      #pragma omp parallel private(color,EM_S, EM_F, Vol, DSDX, A_p, B_p, C_p, D_p, X_p, Y_p, A_q, B_q, C_q, D_q, X_q, Y_q,row_index,q, s,r,k,m,rtmp, rtmp0, rtmp1, rtmp2, rtmp00, rtmp01, rtmp02, rtmp10, rtmp11, rtmp12, rtmp20, rtmp21, rtmp22,add_EM_F, add_EM_S)
74      {      {
75         EM_S=THREAD_MEMALLOC(len_EM_S,double);         EM_S=THREAD_MEMALLOC(len_EM_S,double);
76         EM_F=THREAD_MEMALLOC(len_EM_F,double);         EM_F=THREAD_MEMALLOC(len_EM_F,double);
77         row_index=THREAD_MEMALLOC(p.row_NN,index_t);         row_index=THREAD_MEMALLOC(p.row_numShapesTotal,index_t);
78                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
79         if (!Finley_checkPtr(EM_S) && !Finley_checkPtr(EM_F) && !Finley_checkPtr(row_index) ) {         if (!Dudley_checkPtr(EM_S) && !Dudley_checkPtr(EM_F) && !Dudley_checkPtr(row_index) ) {
80    
81            for (color=elements->minColor;color<=elements->maxColor;color++) {            for (color=elements->minColor;color<=elements->maxColor;color++) {
82               /*  open loop over all elements: */               /*  open loop over all elements: */
83               #pragma omp for private(e) schedule(static)               #pragma omp for private(e) schedule(static)
84               for(e=0;e<elements->numElements;e++){               for(e=0;e<elements->numElements;e++){
85                  if (elements->Color[e]==color) {                  if (elements->Color[e]==color) {
86                     Vol=&(p.row_jac->volume[INDEX2(0,e,p.numQuad)]);  
87                     DSDX=&(p.row_jac->DSDX[INDEX4(0,0,0,e,p.row_NN,DIM,p.numQuad)]);                     A_p=getSampleDataRO(A,e);
88                     for (q=0;q<len_EM_S;++q) EM_S[q]=0;                     B_p=getSampleDataRO(B,e);
89                     for (q=0;q<len_EM_F;++q) EM_F[q]=0;                     C_p=getSampleDataRO(C,e);
90                     add_EM_F=FALSE;                     D_p=getSampleDataRO(D,e);
91                     add_EM_S=FALSE;                     X_p=getSampleDataRO(X,e);
92                     /**************************************************************/                     Y_p=getSampleDataRO(Y,e);
93                     /*   process A: */            double vol=p.row_jac->absD[e]*p.row_jac->quadweight;
94                     /**************************************************************/  
95                     A_p=getSampleData(A,e);                        DSDX=&(p.row_jac->DSDX[INDEX5(0,0,0,0,e,p.row_numShapesTotal,DIM,p.numQuadTotal,1)]);
96                     if (NULL!=A_p) {                        for (q=0;q<len_EM_S;++q) EM_S[q]=0;
97                        add_EM_S=TRUE;                        for (q=0;q<len_EM_F;++q) EM_F[q]=0;
98                        if (extendedA) {                        add_EM_F=FALSE;
99                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                        add_EM_S=FALSE;
100                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                
101                               for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                        /**************************************************************/
102                                 for (m=0;m<p.numComp;m++) {                        /*   process A: */
103                                    rtmp=0;                        /**************************************************************/  
104                                    for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                        if (NULL!=A_p) {
105                                       rtmp+=Vol[q]*(                           add_EM_S=TRUE;
106                                         DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,0,m,0,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)]                           if (extendedA) {
107                                        +DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,0,m,1,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)]                      A_q=&(A_p[INDEX6(0,0,0,0,0,0, p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM,p.numQuadTotal)]);
108                                        +DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,0,m,2,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)]                              for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
109                                        +DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,1,m,0,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)]                                for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
110                                        +DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,1,m,1,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)]                                  for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
                                       +DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,1,m,2,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)]  
                                       +DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,2,m,0,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)]  
                                       +DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,2,m,1,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)]  
                                       +DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,2,m,2,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)]);  
                             
                                   }  
                                   EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;  
                                }  
                              }  
                            }  
                          }  
                       } else {  
                          for (s=0;s<p.row_NS;s++) {  
                            for (r=0;r<p.col_NS;r++) {  
                                rtmp00=0;  
                                rtmp01=0;  
                                rtmp02=0;  
                                rtmp10=0;  
                                rtmp11=0;  
                                rtmp12=0;  
                                rtmp20=0;  
                                rtmp21=0;  
                                rtmp22=0;  
                                for (q=0;q<p.numQuad;q++) {  
                                      rtmp0=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)];  
                                      rtmp00+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];  
                                      rtmp01+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)];  
                                      rtmp02+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)];  
     
                                      rtmp1=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)];  
                                      rtmp10+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];  
                                      rtmp11+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)];  
                                      rtmp12+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)];  
     
                                      rtmp2=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)];  
                                      rtmp20+=rtmp2*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];  
                                      rtmp21+=rtmp2*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)];  
                                      rtmp22+=rtmp2*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)];  
                                }  
                                for (k=0;k<p.numEqu;k++) {  
111                                    for (m=0;m<p.numComp;m++) {                                    for (m=0;m<p.numComp;m++) {
112                                       EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+= rtmp00*A_p[INDEX4(k,0,m,0,p.numEqu,DIM,p.numComp)]                                       rtmp=0;
113                                                                                          +rtmp01*A_p[INDEX4(k,0,m,1,p.numEqu,DIM,p.numComp)]                                       for (q=0;q<p.numQuadTotal;q++) {
114                                                                                          +rtmp02*A_p[INDEX4(k,0,m,2,p.numEqu,DIM,p.numComp)]                                          rtmp+=vol*(
115                                                                                          +rtmp10*A_p[INDEX4(k,1,m,0,p.numEqu,DIM,p.numComp)]                                            DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX5(k,0,m,0,q, p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
116                                                                                          +rtmp11*A_p[INDEX4(k,1,m,1,p.numEqu,DIM,p.numComp)]                                           +DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX5(k,0,m,1,q, p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
117                                                                                          +rtmp12*A_p[INDEX4(k,1,m,2,p.numEqu,DIM,p.numComp)]                                           +DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX5(k,0,m,2,q, p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
118                                                                                          +rtmp20*A_p[INDEX4(k,2,m,0,p.numEqu,DIM,p.numComp)]                                           +DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX5(k,1,m,0,q, p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
119                                                                                          +rtmp21*A_p[INDEX4(k,2,m,1,p.numEqu,DIM,p.numComp)]                                           +DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX5(k,1,m,1,q, p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
120                                                                                          +rtmp22*A_p[INDEX4(k,2,m,2,p.numEqu,DIM,p.numComp)];                                           +DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX5(k,1,m,2,q, p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
121                                    }                                           +DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX5(k,2,m,0,q, p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
122                                 }                                           +DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX5(k,2,m,1,q, p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
123                             }                                           +DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*A_q[INDEX5(k,2,m,2,q, p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]);
124                           }                              
125                         }                                       }
126                     }                                       EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+=rtmp;
                    /**************************************************************/  
                    /*   process B: */  
                    /**************************************************************/  
                    B_p=getSampleData(B,e);  
                    if (NULL!=B_p) {  
                       add_EM_S=TRUE;  
                       if (extendedB) {  
                          for (s=0;s<p.row_NS;s++) {  
                            for (r=0;r<p.col_NS;r++) {  
                              for (k=0;k<p.numEqu;k++) {  
                                for (m=0;m<p.numComp;m++) {  
                                   rtmp=0;  
                                   for (q=0;q<p.numQuad;q++) {  
                                       rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)]*(  
                                               DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*B_p[INDEX4(k,0,m,q,p.numEqu,DIM,p.numComp)]  
                                             + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*B_p[INDEX4(k,1,m,q,p.numEqu,DIM,p.numComp)]  
                                             + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)]*B_p[INDEX4(k,2,m,q,p.numEqu,DIM,p.numComp)] );  
127                                    }                                    }
128                                    EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;                                  }
129                                 }                                }
130                               }                              }
131                             }                           } else {
132                           }                              for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
133                        } else {                                for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
134                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                                    rtmp00=0;
135                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                                    rtmp01=0;
136                                    rtmp0=0;                                    rtmp02=0;
137                                    rtmp1=0;                                    rtmp10=0;
138                                    rtmp2=0;                                    rtmp11=0;
139                                    for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                                    rtmp12=0;
140                                         rtmp=Vol[q]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)];                                    rtmp20=0;
141                                         rtmp0+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)];                                    rtmp21=0;
142                                         rtmp1+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)];                                    rtmp22=0;
143                                         rtmp2+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)];                                    for (q=0;q<p.numQuadTotal;q++) {
144                                            rtmp0=vol*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
145                                            rtmp00+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
146                                            rtmp01+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
147                                            rtmp02+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
148          
149                                            rtmp1=vol*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
150                                            rtmp10+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
151                                            rtmp11+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
152                                            rtmp12+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
153          
154                                            rtmp2=vol*DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
155                                            rtmp20+=rtmp2*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
156                                            rtmp21+=rtmp2*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
157                                            rtmp22+=rtmp2*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
158                                    }                                    }
159                                    for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                                    for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
160                                       for (m=0;m<p.numComp;m++) {                                       for (m=0;m<p.numComp;m++) {
161                                          EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp0*B_p[INDEX3(k,0,m,p.numEqu,DIM)]                                          EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+= rtmp00*A_p[INDEX4(k,0,m,0, p.numEqu,DIM,p.numComp)]
162                                                                                            +rtmp1*B_p[INDEX3(k,1,m,p.numEqu,DIM)]                                                                                             +rtmp01*A_p[INDEX4(k,0,m,1, p.numEqu,DIM,p.numComp)]
163                                                                                            +rtmp2*B_p[INDEX3(k,2,m,p.numEqu,DIM)];                                                                                             +rtmp02*A_p[INDEX4(k,0,m,2, p.numEqu,DIM,p.numComp)]
164                                                                                               +rtmp10*A_p[INDEX4(k,1,m,0, p.numEqu,DIM,p.numComp)]
165                                                                                               +rtmp11*A_p[INDEX4(k,1,m,1, p.numEqu,DIM,p.numComp)]
166                                                                                               +rtmp12*A_p[INDEX4(k,1,m,2, p.numEqu,DIM,p.numComp)]
167                                                                                               +rtmp20*A_p[INDEX4(k,2,m,0, p.numEqu,DIM,p.numComp)]
168                                                                                               +rtmp21*A_p[INDEX4(k,2,m,1, p.numEqu,DIM,p.numComp)]
169                                                                                               +rtmp22*A_p[INDEX4(k,2,m,2, p.numEqu,DIM,p.numComp)];
170                                       }                                       }
171                                    }                                    }
172                             }                                }
173                           }                              }
174                              }
175                        }                        }
176                     }                        /**************************************************************/
177                     /**************************************************************/                        /*   process B: */
178                     /*   process C: */                        /**************************************************************/
179                     /**************************************************************/                        if (NULL!=B_p) {
180                     C_p=getSampleData(C,e);                           add_EM_S=TRUE;
181                     if (NULL!=C_p) {                           if (extendedB) {
182                       add_EM_S=TRUE;                      B_q=&(B_p[INDEX5(0,0,0,0,0, p.numEqu,DIM,p.numComp,p.numQuadTotal)]);
183                       if (extendedC) {                              for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
184                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                                for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
185                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                                  for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
186                               for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                                    for (m=0;m<p.numComp;m++) {
187                                 for (m=0;m<p.numComp;m++) {                                       rtmp=0;
188                                   rtmp=0;                                       for (q=0;q<p.numQuadTotal;q++) {
189                                   for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                                           rtmp+=vol*S[INDEX2(r,q,p.row_numShapes)]*(
190                                        rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*(                                                   DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*B_q[INDEX4(k,0,m,q,p.numEqu,DIM,p.numComp)]
191                                                   C_p[INDEX4(k,m,0,q,p.numEqu,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)]                                                 + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*B_q[INDEX4(k,1,m,q,p.numEqu,DIM,p.numComp)]
192                                                  +C_p[INDEX4(k,m,1,q,p.numEqu,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)]                                                 + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*B_q[INDEX4(k,2,m,q,p.numEqu,DIM,p.numComp)] );
193                                                  +C_p[INDEX4(k,m,2,q,p.numEqu,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)]);                                       }
194                                   }                                       EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+=rtmp;
195                                   EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;                                    }
196                                 }                                  }
197                               }                                }
198                             }                              }
199                             } else {
200                                for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
201                                  for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
202                                         rtmp0=0;
203                                         rtmp1=0;
204                                         rtmp2=0;
205                                         for (q=0;q<p.numQuadTotal;q++) {
206                                              rtmp=vol*S[INDEX2(r,q,p.row_numShapes)];
207                                              rtmp0+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
208                                              rtmp1+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
209                                              rtmp2+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
210                                         }
211                                         for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
212                                            for (m=0;m<p.numComp;m++) {
213                                               EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+=rtmp0*B_p[INDEX3(k,0,m,p.numEqu,DIM)]
214                                                                                                 +rtmp1*B_p[INDEX3(k,1,m,p.numEqu,DIM)]
215                                                                                                 +rtmp2*B_p[INDEX3(k,2,m,p.numEqu,DIM)];
216                                            }
217                                         }
218                                  }
219                                }
220                           }                           }
221                       } else {                        }
222                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                        /**************************************************************/
223                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                        /*   process C: */
224                                    rtmp0=0;                        /**************************************************************/
225                                    rtmp1=0;                        if (NULL!=C_p) {
226                                    rtmp2=0;                          add_EM_S=TRUE;
227                                    for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                          if (extendedC) {
228                                       rtmp=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)];                  C_q=&(C_p[INDEX5(0,0,0,0,0 ,p.numEqu,p.numComp,DIM, p.numQuadTotal)]);
229                                       rtmp0+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];                              for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
230                                       rtmp1+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)];                                for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
231                                       rtmp2+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)];                                  for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
232                                      for (m=0;m<p.numComp;m++) {
233                                        rtmp=0;
234                                        for (q=0;q<p.numQuadTotal;q++) {
235                                             rtmp+=vol*S[INDEX2(s,q,p.row_numShapes)]*(
236                                                        C_q[INDEX4(k,m,0,q,p.numEqu,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
237                                                       +C_q[INDEX4(k,m,1,q,p.numEqu,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]
238                                                       +C_q[INDEX4(k,m,2,q,p.numEqu,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]);
239                                        }
240                                        EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+=rtmp;
241                                      }
242                                    }
243                                  }
244                                }
245                            } else {
246                                for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
247                                  for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
248                                         rtmp0=0;
249                                         rtmp1=0;
250                                         rtmp2=0;
251                                         for (q=0;q<p.numQuadTotal;q++) {
252                                            rtmp=vol*S[INDEX2(s,q,p.row_numShapes)];
253                                            rtmp0+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
254                                            rtmp1+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
255                                            rtmp2+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
256                                         }
257                                         for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
258                                            for (m=0;m<p.numComp;m++) {
259                                                  EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+=rtmp0*C_p[INDEX3(k,m,0,p.numEqu,p.numComp)]
260                                                                                                    +rtmp1*C_p[INDEX3(k,m,1,p.numEqu,p.numComp)]
261                                                                                                    +rtmp2*C_p[INDEX3(k,m,2,p.numEqu,p.numComp)];
262                                             }
263                                         }
264                                  }
265                                }
266                            }
267                          }
268                          /************************************************************* */
269                          /* process D */
270                          /**************************************************************/
271                          if (NULL!=D_p) {
272                            add_EM_S=TRUE;
273                            if (extendedD) {
274                    D_q=&(D_p[INDEX4(0,0,0,0 ,p.numEqu,p.numComp, p.numQuadTotal)]);
275                                for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
276                                  for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
277                                    for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
278                                      for (m=0;m<p.numComp;m++) {
279                                        rtmp=0;
280                                        for (q=0;q<p.numQuadTotal;q++) {
281                                            rtmp+=vol*S[INDEX2(s,q,p.row_numShapes)]*D_q[INDEX3(k,m,q,p.numEqu,p.numComp)]*S[INDEX2(r,q,p.row_numShapes)];
282                                        }
283                                        EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+=rtmp;
284                                    }                                    }
285                                    }
286                                  }
287                                }
288                            } else {
289                                for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
290                                  for (r=0;r<p.col_numShapes;r++) {
291                                      rtmp=0;
292                                      for (q=0;q<p.numQuadTotal;q++) rtmp+=vol*S[INDEX2(s,q,p.row_numShapes)]*S[INDEX2(r,q,p.row_numShapes)];
293                                    for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                                    for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
294                                       for (m=0;m<p.numComp;m++) {                                        for (m=0;m<p.numComp;m++) {
295                                             EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp0*C_p[INDEX3(k,m,0,p.numEqu,p.numComp)]                                          EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_numShapesTotal)]+=rtmp*D_p[INDEX2(k,m,p.numEqu)];
296                                                                                               +rtmp1*C_p[INDEX3(k,m,1,p.numEqu,p.numComp)]                                       }
                                                                                              +rtmp2*C_p[INDEX3(k,m,2,p.numEqu,p.numComp)];  
                                       }  
297                                    }                                    }
298                             }                                }
299                           }                              }
300                       }                          }
301                     }                        }
302                     /************************************************************* */                        /**************************************************************/
303                     /* process D */                        /*   process X: */
304                     /**************************************************************/                        /**************************************************************/
305                     D_p=getSampleData(D,e);                        if (NULL!=X_p) {
306                     if (NULL!=D_p) {                          add_EM_F=TRUE;
307                       add_EM_S=TRUE;                          if (extendedX) {
308                       if (extendedD) {                 X_q=&(X_p[INDEX4(0,0,0,0, p.numEqu,DIM,p.numQuadTotal)]);
309                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                             for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
310                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                                for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
                              for (k=0;k<p.numEqu;k++) {  
                                for (m=0;m<p.numComp;m++) {  
311                                   rtmp=0;                                   rtmp=0;
312                                   for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                                   for (q=0;q<p.numQuadTotal;q++) {
313                                       rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*D_p[INDEX3(k,m,q,p.numEqu,p.numComp)]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)];                                         rtmp+=vol* ( DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*X_q[INDEX3(k,0,q,p.numEqu,DIM)]
314                                                         + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*X_q[INDEX3(k,1,q,p.numEqu,DIM)]
315                                                         + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)]*X_q[INDEX3(k,2,q,p.numEqu,DIM)]);
316                                   }                                   }
317                                   EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;                                   EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp;
318                                 }                                }
                              }  
319                             }                             }
320                           }                          } else {
321                       } else {                             for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
322                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                               rtmp0=0;
323                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                               rtmp1=0;
324                                 rtmp=0;                               rtmp2=0;
325                                 for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)];                               for (q=0;q<p.numQuadTotal;q++) {
326                                 for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                                  rtmp0+=vol*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
327                                     for (m=0;m<p.numComp;m++) {                                  rtmp1+=vol*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
328                                       EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp*D_p[INDEX2(k,m,p.numEqu)];                                  rtmp2+=vol*DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_numShapesTotal,DIM)];
329                                    }                               }
330                                 }                               for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
331                                           EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp0*X_p[INDEX2(k,0,p.numEqu)]
332                                                                      +rtmp1*X_p[INDEX2(k,1,p.numEqu)]
333                                                                      +rtmp2*X_p[INDEX2(k,2,p.numEqu)];
334                                 }
335                             }                             }
336                           }                          }
337                       }                       }
338                     }                       /**************************************************************/
339                     /**************************************************************/                       /*   process Y: */
340                     /*   process X: */                       /**************************************************************/
341                     /**************************************************************/                        if (NULL!=Y_p) {
342                     X_p=getSampleData(X,e);                          add_EM_F=TRUE;
343                     if (NULL!=X_p) {                          if (extendedY) {
344                       add_EM_F=TRUE;                 Y_q=&(Y_p[INDEX3(0,0,0, p.numEqu,p.numQuadTotal)]);
345                       if (extendedX) {                             for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
346                          for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                                for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
347                             for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                                   rtmp=0.;
348                                rtmp=0;                                   for (q=0;q<p.numQuadTotal;q++) rtmp+=vol*S[INDEX2(s,q,p.row_numShapes)]*Y_q[INDEX2(k,q,p.numEqu)];
349                                for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                                   EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp;
                                     rtmp+=Vol[q]* ( DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*X_p[INDEX3(k,0,q,p.numEqu,DIM)]  
                                                   + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*X_p[INDEX3(k,1,q,p.numEqu,DIM)]  
                                                   + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)]*X_p[INDEX3(k,2,q,p.numEqu,DIM)]);  
350                                }                                }
                               EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp;  
351                             }                             }
352                          }                           } else {
353                       } else {                             for (s=0;s<p.row_numShapes;s++) {
354                          for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                                 rtmp=0;
355                            rtmp0=0;                                 for (q=0;q<p.numQuadTotal;q++) rtmp+=vol*S[INDEX2(s,q,p.row_numShapes)];
356                            rtmp1=0;                                 for (k=0;k<p.numEqu;k++) EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp*Y_p[k];
                           rtmp2=0;  
                           for (q=0;q<p.numQuad;q++) {  
                              rtmp0+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)];  
                              rtmp1+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)];  
                              rtmp2+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)];  
                           }  
                           for (k=0;k<p.numEqu;k++) {  
                                     EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp0*X_p[INDEX2(k,0,p.numEqu)]  
                                                                +rtmp1*X_p[INDEX2(k,1,p.numEqu)]  
                                                                +rtmp2*X_p[INDEX2(k,2,p.numEqu)];  
                           }  
                         }  
                      }  
                   }  
                   /**************************************************************/  
                   /*   process Y: */  
                   /**************************************************************/  
                    Y_p=getSampleData(Y,e);  
                    if (NULL!=Y_p) {  
                      add_EM_F=TRUE;  
                      if (extendedY) {  
                         for (s=0;s<p.row_NS;s++) {  
                            for (k=0;k<p.numEqu;k++) {  
                               rtmp=0.;  
                               for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*Y_p[INDEX2(k,q,p.numEqu)];  
                               EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp;  
357                             }                             }
358                          }                           }
359                        } else {                         }
360                          for (s=0;s<p.row_NS;s++) {  
361                              rtmp=0;                         /***********************************************************************************************/
362                              for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)];                         /* add the element matrices onto the matrix and right hand side                                */          
363                              for (k=0;k<p.numEqu;k++) EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp*Y_p[k];                         /***********************************************************************************************/
364                          }                         for (q=0;q<p.row_numShapesTotal;q++) row_index[q]=p.row_DOF[elements->Nodes[INDEX2(q,e,p.NN)]];
365                        }                        
366                      }                 if (add_EM_F) Dudley_Util_AddScatter(p.row_numShapesTotal,row_index,p.numEqu,EM_F,F_p, p.row_DOF_UpperBound);
367                      /***********************************************************************************************/                         if (add_EM_S) Dudley_Assemble_addToSystemMatrix(Mat,p.row_numShapesTotal,row_index,p.numEqu,p.col_numShapesTotal,row_index,p.numComp,EM_S);
                     /* add the element matrices onto the matrix and right hand side                                */  
                     /***********************************************************************************************/  
                     for (q=0;q<p.row_NN;q++) row_index[q]=p.row_DOF[elements->Nodes[INDEX2(p.row_node[q],e,p.NN)]];  
                     if (add_EM_F) Finley_Util_AddScatter(p.row_NN,row_index,p.numEqu,EM_F,F_p, p.row_DOF_UpperBound);  
                     if (add_EM_S) Finley_Assemble_addToSystemMatrix(Mat,p.row_NN,row_index,p.numEqu,p.col_NN,row_index,p.numComp,EM_S);  
     
368                  } /* end color check */                  } /* end color check */
369               } /* end element loop */               } /* end element loop */
370           } /* end color loop */           } /* end color loop */
# Line 367  void  Finley_Assemble_PDE_System2_3D(Ass Line 376  void  Finley_Assemble_PDE_System2_3D(Ass
376        } /* end of pointer check */        } /* end of pointer check */
377     } /* end parallel region */     } /* end parallel region */
378  }  }
 /*  
  * $Log$  
  */  

Legend:
Removed from v.1312  
changed lines
  Added in v.3184

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.26