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trunk/finley/src/ElementFile_jacobeans.c revision 776 by gross, Wed Jul 12 00:07:31 2006 UTC branches/domexper/dudley/src/ElementFile_jacobeans.c revision 3144 by jfenwick, Fri Sep 3 00:49:02 2010 UTC
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 /*  
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  *          Copyright 2006 by ACcESS MNRF                   *  
  *                                                          *  
  *              http://www.access.edu.au                    *  
  *       Primary Business: Queensland, Australia            *  
  *  Licensed under the Open Software License version 3.0    *  
  *     http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php       *  
  *                                                          *  
  ************************************************************  
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1    
2    /*******************************************************
3    *
4    * Copyright (c) 2003-2010 by University of Queensland
5    * Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)
6    * http://www.uq.edu.au/esscc
7    *
8    * Primary Business: Queensland, Australia
9    * Licensed under the Open Software License version 3.0
10    * http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php
11    *
12    *******************************************************/
13    
 /**************************************************************/  
   
 /**************************************************************/  
   
 /*  Author: gross@access.edu.au */  
 /*  Version: $Id$ */  
   
 /**************************************************************/  
14    
15    #include "ElementFile.h"
16  #include "Assemble.h"  #include "Assemble.h"
17  #ifdef _OPENMP  #ifdef _OPENMP
18  #include <omp.h>  #include <omp.h>
# Line 28  Line 21 
21    
22  /**************************************************************/  /**************************************************************/
23    
24  Finley_ElementFile_Jacobeans* Finley_ElementFile_Jacobeans_alloc(void)  Dudley_ElementFile_Jacobeans* Dudley_ElementFile_Jacobeans_alloc(Dudley_ShapeFunction* BasisFunctions)
25  {  {
26    Finley_ElementFile_Jacobeans* out=MEMALLOC(1,Finley_ElementFile_Jacobeans);    Dudley_ElementFile_Jacobeans* out=MEMALLOC(1,Dudley_ElementFile_Jacobeans);
27    if (Finley_checkPtr(out)) {    if (Dudley_checkPtr(out)) {
28       return NULL;       return NULL;
29    } else {    } else {
30       out->status=FINLEY_INITIAL_STATUS-1;       out->status=DUDLEY_INITIAL_STATUS-1;
31         out->BasisFunctions=Dudley_ShapeFunction_reference(BasisFunctions);
32         out->numDim=0;
33         out->numQuadTotal=0;
34         out->numElements=0;
35       out->volume=NULL;       out->volume=NULL;
36       out->DSDX=NULL;       out->DSDX=NULL;
37       return out;       return out;
# Line 43  Finley_ElementFile_Jacobeans* Finley_Ele Line 40  Finley_ElementFile_Jacobeans* Finley_Ele
40    
41  /**************************************************************/  /**************************************************************/
42    
43  void Finley_ElementFile_Jacobeans_dealloc(Finley_ElementFile_Jacobeans* in)  void Dudley_ElementFile_Jacobeans_dealloc(Dudley_ElementFile_Jacobeans* in)
44  {  {
45    if (in!=NULL) {    if (in!=NULL) {
46      if (in->volume!=NULL) MEMFREE(in->volume);      Dudley_ShapeFunction_dealloc(in->BasisFunctions);  
47      if (in->DSDX!=NULL) MEMFREE(in->DSDX);        MEMFREE(in->volume);
48        MEMFREE(in->DSDX);
49      MEMFREE(in);      MEMFREE(in);
50    }    }
51  }  }
# Line 55  void Finley_ElementFile_Jacobeans_deallo Line 53  void Finley_ElementFile_Jacobeans_deallo
53  /**************************************************************/  /**************************************************************/
54    
55    
56  /**************************************************************/  Dudley_ElementFile_Jacobeans* Dudley_ElementFile_borrowJacobeans(Dudley_ElementFile* self, Dudley_NodeFile* nodes,
57                                                                     bool_t reducedShapefunction, bool_t reducedIntegrationOrder) {
58  Finley_ElementFile_Jacobeans* Finley_ElementFile_borrowJacobeans(Finley_ElementFile* self, Finley_NodeFile* nodes,    Dudley_ElementFile_Jacobeans *out = NULL;
59                                                               bool_t reducedShapefunction, bool_t reducedIntegrationOrder) {    Dudley_ShapeFunction *shape=NULL, *basis;
60    Finley_ElementFile_Jacobeans *out = NULL;    Dudley_ReferenceElement*  refElement=NULL;
61      double *dBdv;
62      
63      dim_t numNodes=self->numNodes;
64        
65    if (reducedShapefunction) {    if (reducedShapefunction) {
66         if (reducedIntegrationOrder) {         if (reducedIntegrationOrder) {
# Line 74  Finley_ElementFile_Jacobeans* Finley_Ele Line 75  Finley_ElementFile_Jacobeans* Finley_Ele
75             out=self->jacobeans;             out=self->jacobeans;
76         }         }
77    }    }
   
78    if (out->status < nodes->status) {    if (out->status < nodes->status) {
79       Finley_RefElement *shape, *test;      
80         basis=out->BasisFunctions;
81         shape=Dudley_ReferenceElementSet_borrowParametrization(self->referenceElementSet, reducedIntegrationOrder);
82         refElement= Dudley_ReferenceElementSet_borrowReferenceElement(self->referenceElementSet, reducedIntegrationOrder);
83    
84         out->numDim=nodes->numDim;
85         out->numQuadTotal=shape->numQuadNodes;
86         out->numShapesTotal=basis->Type->numShapes;
87         out->numElements=self->numElements;
88        
89       if (reducedShapefunction) {       if (reducedShapefunction) {
90         if (reducedIntegrationOrder) {          out->offsets=refElement->LinearType->offsets;
91             shape=self->LinearReferenceElement;          dBdv=basis->dSdv;
            test=self->LinearReferenceElement;  
        } else {  
            shape=self->LinearReferenceElement;  
            test=self->LinearReferenceElement;  
        }  
92       } else {       } else {
93         if (reducedIntegrationOrder) {          out->offsets=refElement->Type->offsets;
94             shape=self->ReferenceElement;          dBdv=refElement->DBasisFunctionDv;
            test=self->ReferenceElement;  
        } else {  
            shape=self->ReferenceElement;  
            test=self->ReferenceElement;  
        }  
95       }       }
96        
97         if (out->numQuadTotal != basis->numQuadNodes) {
98            Dudley_setError(SYSTEM_ERROR,"Dudley_ElementFile_borrowJacobeans: Incorrect total number of quadrature points.");
99            return NULL;
100         }
101         if (refElement->numNodes> numNodes) {
102               Dudley_setError(SYSTEM_ERROR,"Dudley_ElementFile_borrowJacobeans: Too many nodes expected.");
103               return NULL;
104         }
105    
106         if (out->volume==NULL) out->volume=MEMALLOC((out->numElements)*(out->numQuadTotal),double);
107         if (out->DSDX==NULL) out->DSDX=MEMALLOC((out->numElements)
108                                                *(out->numShapesTotal)
109                                                *(out->numDim)
110                                                *(out->numQuadTotal),double);
111         if (! (Dudley_checkPtr(out->volume) || Dudley_checkPtr(out->DSDX)) ) {
112              /*========================== dim = 1 ============================================== */
113              if (out->numDim==1) {
114                 if (refElement->numLocalDim==0) {
115              Dudley_setError(SYSTEM_ERROR,"Dudley_ElementFile_borrowJacobeans: 1D does not support local dimension 0.");
116                 } else if (refElement->numLocalDim==1) {
117                           Assemble_jacobeans_1D(nodes->Coordinates,out->numQuadTotal,shape->QuadWeights,
118                                                shape->Type->numShapes,self->numElements,numNodes,self->Nodes,
119                                                shape->dSdv,basis->Type->numShapes,dBdv, out->DSDX,out->volume,self->Id);
120    
      if (out->volume==NULL) out->volume=MEMALLOC((self->numElements)*(shape->numQuadNodes),double);  
      if (out->DSDX==NULL) out->DSDX=MEMALLOC((self->numElements)*(test->Type->numShapes)*(shape->Type->numDim)*(shape->numQuadNodes),double);  
      if (! (Finley_checkPtr(out->volume) || Finley_checkPtr(out->DSDX)) ) {  
           if (nodes->numDim==1) {  
              if (shape->Type->numDim==0) {  
   
              } else if (shape->Type->numDim==1) {  
                   Assemble_jacobeans_1D(nodes->Coordinates,shape->numQuadNodes,shape->QuadWeights,shape->Type->numShapes,  
                                         self->numElements,self->Nodes,  
                                         shape->dSdv,test->Type->numShapes,test->dSdv,  
                                         out->DSDX,out->volume,self->Id);  
121               } else {               } else {
122                    Finley_setError(SYSTEM_ERROR,"Finley_ElementFile_borrowJacobeans: local dimenion in a 1D domain has to be less or equal 1.");                    Dudley_setError(SYSTEM_ERROR,"Dudley_ElementFile_borrowJacobeans: local dimenion in a 1D domain has to be 0 or 1.");
123               }               }
124            } else if (nodes->numDim==2) {            /*========================== dim = 2 ============================================== */
125               if (shape->Type->numDim==0) {            } else if (out->numDim==2) {
126                 if (refElement->numLocalDim==0) {
127               } else if (shape->Type->numDim==1) {                   Dudley_setError(SYSTEM_ERROR,"Dudley_ElementFile_borrowJacobeans: 2D does not support local dimension 0.");
128                    Assemble_jacobeans_2D_M1D(nodes->Coordinates,shape->numQuadNodes,shape->QuadWeights,shape->Type->numShapes,               } else if (refElement->numLocalDim==1) {
129                                              self->numElements,self->Nodes,                    if (out->BasisFunctions->Type->numDim==2) {
130                                              shape->dSdv,test->Type->numShapes,test->dSdv,                          Assemble_jacobeans_2D_M1D_E2D(nodes->Coordinates,out->numQuadTotal,shape->QuadWeights,
131                                              out->DSDX,out->volume,self->Id);                                                        shape->Type->numShapes,self->numElements,numNodes,self->Nodes,
132               } else if (shape->Type->numDim==2) {                                                        shape->dSdv,basis->Type->numShapes,dBdv,
133                    Assemble_jacobeans_2D(nodes->Coordinates,shape->numQuadNodes,shape->QuadWeights,shape->Type->numShapes,                                                        out->DSDX,out->volume,self->Id);
134                                          self->numElements,self->Nodes,                    }  else if (out->BasisFunctions->Type->numDim==1) {
135                                          shape->dSdv,test->Type->numShapes,test->dSdv,                          Assemble_jacobeans_2D_M1D_E1D(nodes->Coordinates,out->numQuadTotal,shape->QuadWeights,
136                                          out->DSDX,out->volume,self->Id);                                                        shape->Type->numShapes,self->numElements,numNodes,self->Nodes,
137                                                          shape->dSdv,basis->Type->numShapes,dBdv,
138                                                          out->DSDX,out->volume,self->Id);
139                      } else {
140                        Dudley_setError(SYSTEM_ERROR,"Dudley_ElementFile_borrowJacobeans: element dimension for local dimenion 1 in a 2D domain has to be 1 or 2.");
141                      }
142                 } else if (refElement->numLocalDim==2) {
143                         Assemble_jacobeans_2D(nodes->Coordinates,out->numQuadTotal,shape->QuadWeights,
144                                               shape->Type->numShapes,self->numElements,numNodes,self->Nodes,
145                                               shape->dSdv,basis->Type->numShapes,dBdv,
146                                               out->DSDX,out->volume,self->Id);
147               } else {               } else {
148                 Finley_setError(SYSTEM_ERROR,"Finley_ElementFile_borrowJacobeans: local dimenion in a 2D domain has to be less or equal 2.");                 Dudley_setError(SYSTEM_ERROR,"Dudley_ElementFile_borrowJacobeans: local dimenion in a 2D domain has to be  1 or 2.");
149               }               }
150            } else if (nodes->numDim==3) {            /*========================== dim = 3 ============================================== */
151               if (shape->Type->numDim==0) {            } else if (out->numDim==3) {
152                 if (refElement->numLocalDim==0) {
153               } else if (shape->Type->numDim==1) {            Dudley_setError(SYSTEM_ERROR,"Dudley_ElementFile_borrowJacobeans: 3D does not support local dimension 0.");
154                    Assemble_jacobeans_3D_M1D(nodes->Coordinates,shape->numQuadNodes,shape->QuadWeights,shape->Type->numShapes,               } else if (refElement->numLocalDim==2) {
155                                              self->numElements,self->Nodes,                    if (out->BasisFunctions->Type->numDim==3) {
156                                              shape->dSdv,test->Type->numShapes,test->dSdv,                          Assemble_jacobeans_3D_M2D_E3D(nodes->Coordinates,out->numQuadTotal,shape->QuadWeights,
157                                              out->DSDX,out->volume,self->Id);                                                        shape->Type->numShapes,self->numElements,numNodes,self->Nodes,
158               } else if (shape->Type->numDim==2) {                                                        shape->dSdv,basis->Type->numShapes,dBdv,
159                    Assemble_jacobeans_3D_M2D(nodes->Coordinates,shape->numQuadNodes,shape->QuadWeights,shape->Type->numShapes,                                                        out->DSDX,out->volume,self->Id);
160                                              self->numElements,self->Nodes,                    }  else if (out->BasisFunctions->Type->numDim==2) {
161                                              shape->dSdv,test->Type->numShapes,test->dSdv,                          Assemble_jacobeans_3D_M2D_E2D(nodes->Coordinates,out->numQuadTotal,shape->QuadWeights,
162                                              out->DSDX,out->volume,self->Id);                                                        shape->Type->numShapes,self->numElements,numNodes,self->Nodes,
163               } else if (shape->Type->numDim==3) {                                                        shape->dSdv,basis->Type->numShapes,dBdv,
164                    Assemble_jacobeans_3D(nodes->Coordinates,shape->numQuadNodes,shape->QuadWeights,shape->Type->numShapes,                                                        out->DSDX,out->volume,self->Id);
165                                          self->numElements,self->Nodes,                    } else {
166                                          shape->dSdv,test->Type->numShapes,test->dSdv,                      Dudley_setError(SYSTEM_ERROR,"Dudley_ElementFile_borrowJacobeans: element dimension for local dimenion 2 in a 3D domain has to be 3 or 2.");
167                                          out->DSDX,out->volume,self->Id);                    }
168                 } else if (refElement->numLocalDim==3) {
169                         Assemble_jacobeans_3D(nodes->Coordinates,out->numQuadTotal,shape->QuadWeights,
170                                               shape->Type->numShapes,self->numElements,numNodes,self->Nodes,
171                                               shape->dSdv,basis->Type->numShapes,dBdv,
172                                               out->DSDX,out->volume,self->Id);
173               } else {               } else {
174                 Finley_setError(SYSTEM_ERROR,"Finley_ElementFile_borrowJacobeans: local dimenion in a 3D domain has to be less or equal 3.");                 Dudley_setError(SYSTEM_ERROR,"Dudley_ElementFile_borrowJacobeans: local dimenion in a 3D domain has to be 2 or 3.");
175               }               }
176            } else {            } else {
177              Finley_setError(SYSTEM_ERROR,"Finley_ElementFile_borrowJacobeans: spatial dimension has to be less or equal 3.");              Dudley_setError(SYSTEM_ERROR,"Dudley_ElementFile_borrowJacobeans: spatial dimension has to be 1, 2 or 3.");
178            }            }
179       }       }
180       if (Finley_noError()) {       if (Dudley_noError()) {
181           out->status = nodes->status;           out->status = nodes->status;
182       } else {       } else {
183           out=NULL;           out=NULL;
# Line 160  Finley_ElementFile_Jacobeans* Finley_Ele Line 187  Finley_ElementFile_Jacobeans* Finley_Ele
187    
188     return out;     return out;
189  }  }
 /*  
  * $Log$  
  *  
  */  

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