/[escript]/branches/domexper/dudley/src/Mesh_readGmsh.c
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revision 2722 by gross, Fri Oct 16 06:45:01 2009 UTC revision 2748 by gross, Tue Nov 17 07:32:59 2009 UTC
# Line 40  Finley_Mesh* Finley_Mesh_readGmsh(char* Line 40  Finley_Mesh* Finley_Mesh_readGmsh(char*
40    char line[LenString_MAX+1];    char line[LenString_MAX+1];
41    char error_msg[LenErrorMsg_MAX];    char error_msg[LenErrorMsg_MAX];
42    double rtmp0, rtmp1;    double rtmp0, rtmp1;
43      Finley_ReferenceElementSet *refPoints=NULL, *refContactElements=NULL, *refFaceElements=NULL, *refElements=NULL;
44  #ifdef Finley_TRACE  #ifdef Finley_TRACE
45    double time0=Finley_timer();    double time0=Finley_timer();
46  #endif  #endif
# Line 124  Finley_Mesh* Finley_Mesh_readGmsh(char* Line 125  Finley_Mesh* Finley_Mesh_readGmsh(char*
125         else if(!strncmp(&line[1], "ELM", 3) ||         else if(!strncmp(&line[1], "ELM", 3) ||
126          !strncmp(&line[1], "Elements", 8)) {          !strncmp(&line[1], "Elements", 8)) {
127        
128           ElementTypeId final_element_type = NoType;           ElementTypeId final_element_type = NoRef;
129           ElementTypeId final_face_element_type = NoType;           ElementTypeId final_face_element_type = NoRef;
130           ElementTypeId contact_element_type = NoType;           ElementTypeId contact_element_type = NoRef;
131           numElements=0;           numElements=0;
132           numFaceElements=0;           numFaceElements=0;
133           scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d", &totalNumElements);           scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d", &totalNumElements);
# Line 211  Finley_Mesh* Finley_Mesh_readGmsh(char* Line 212  Finley_Mesh* Finley_Mesh_readGmsh(char*
212                        element_dim=0;                        element_dim=0;
213                        break;                        break;
214                    default:                    default:
215                       element_type[e]=NoType;                       element_type[e]=NoRef;
216                       sprintf(error_msg,"Unexected gmsh element type %d in mesh file %s.",gmsh_type,fname);                       sprintf(error_msg,"Unexected gmsh element type %d in mesh file %s.",gmsh_type,fname);
217                       Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);                       Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);
218                }                }
219                if (element_dim == numDim) {                if (element_dim == numDim) {
220                   if (final_element_type == NoType) {                   if (final_element_type == NoRef) {
221                      final_element_type = element_type[e];                      final_element_type = element_type[e];
222                   } else if (final_element_type != element_type[e]) {                   } else if (final_element_type != element_type[e]) {
223                       sprintf(error_msg,"Finley can handle a single type of internal elements only.");                       sprintf(error_msg,"Finley can handle a single type of internal elements only.");
# Line 225  Finley_Mesh* Finley_Mesh_readGmsh(char* Line 226  Finley_Mesh* Finley_Mesh_readGmsh(char*
226                   }                   }
227                   numElements++;                   numElements++;
228                } else if (element_dim == numDim-1) {                } else if (element_dim == numDim-1) {
229                   if (final_face_element_type == NoType) {                   if (final_face_element_type == NoRef) {
230                      final_face_element_type = element_type[e];                      final_face_element_type = element_type[e];
231                   } else if (final_face_element_type != element_type[e]) {                   } else if (final_face_element_type != element_type[e]) {
232                       sprintf(error_msg,"Finley can handle a single type of face elements only.");                       sprintf(error_msg,"Finley can handle a single type of face elements only.");
# Line 277  Finley_Mesh* Finley_Mesh_readGmsh(char* Line 278  Finley_Mesh* Finley_Mesh_readGmsh(char*
278                    
279              if (Finley_noError()) {              if (Finley_noError()) {
280                /* first we have to identify the elements to define Elementis and FaceElements */                /* first we have to identify the elements to define Elementis and FaceElements */
281                if (final_element_type == NoType) {                if (final_element_type == NoRef) {
282                   if (numDim==1) {                   if (numDim==1) {
283                      final_element_type=Line2;                      final_element_type=Line2;
284                   } else if (numDim==2) {                   } else if (numDim==2) {
# Line 286  Finley_Mesh* Finley_Mesh_readGmsh(char* Line 287  Finley_Mesh* Finley_Mesh_readGmsh(char*
287                      final_element_type=Tet4;                      final_element_type=Tet4;
288                   }                   }
289                }                }
290                if (final_face_element_type == NoType) {                if (final_face_element_type == NoRef) {
291                   if (numDim==1) {                   if (numDim==1) {
292                      final_face_element_type=Point1;                      final_face_element_type=Point1;
293                   } else if (numDim==2) {                   } else if (numDim==2) {
# Line 306  Finley_Mesh* Finley_Mesh_readGmsh(char* Line 307  Finley_Mesh* Finley_Mesh_readGmsh(char*
307                } else {                } else {
308                    contact_element_type=Point1_Contact;                    contact_element_type=Point1_Contact;
309                }                }
310                  refElements= Finley_ReferenceElementSet_alloc(final_element_type,mesh_p->order, mesh_p->reduced_order);
311                mesh_p->Elements=Finley_ElementFile_alloc(final_element_type,mesh_p->order, mesh_p->reduced_order, mpi_info);                refFaceElements=Finley_ReferenceElementSet_alloc(final_face_element_type,mesh_p->order, mesh_p->reduced_order);
312                mesh_p->FaceElements=Finley_ElementFile_alloc(final_face_element_type,mesh_p->order, mesh_p->reduced_order, mpi_info);                refContactElements= Finley_ReferenceElementSet_alloc(contact_element_type,mesh_p->order, mesh_p->reduced_order);
313                mesh_p->ContactElements=Finley_ElementFile_alloc(contact_element_type,mesh_p->order, mesh_p->reduced_order, mpi_info);                refPoints= Finley_ReferenceElementSet_alloc(Point1,mesh_p->order, mesh_p->reduced_order);
314                mesh_p->Points=Finley_ElementFile_alloc(Point1,mesh_p->order, mesh_p->reduced_order, mpi_info);                mesh_p->Elements=Finley_ElementFile_alloc(refElements, mpi_info);
315                  mesh_p->FaceElements=Finley_ElementFile_alloc(refFaceElements, mpi_info);
316                  mesh_p->ContactElements=Finley_ElementFile_alloc(refContactElements, mpi_info);
317                  mesh_p->Points=Finley_ElementFile_alloc(refPoints, mpi_info);
318                if (Finley_noError()) {                if (Finley_noError()) {
319                    Finley_ElementFile_allocTable(mesh_p->Elements, numElements);                    Finley_ElementFile_allocTable(mesh_p->Elements, numElements);
320                    Finley_ElementFile_allocTable(mesh_p->FaceElements, numFaceElements);                    Finley_ElementFile_allocTable(mesh_p->FaceElements, numFaceElements);
# Line 333  Finley_Mesh* Finley_Mesh_readGmsh(char* Line 337  Finley_Mesh* Finley_Mesh_readGmsh(char*
337                              mesh_p->Elements->Tag[numElements]=tag[e];                              mesh_p->Elements->Tag[numElements]=tag[e];
338                              mesh_p->Elements->Color[numElements]=numElements;                              mesh_p->Elements->Color[numElements]=numElements;
339                              mesh_p->Elements->Owner[numElements]=0;                              mesh_p->Elements->Owner[numElements]=0;
340                              for (j = 0; j<  mesh_p->Elements->ReferenceElement->Type->numNodes; ++j)  {                              for (j = 0; j<  mesh_p->Elements->referenceElementSet->numNodes; ++j)  {
341                                    mesh_p->Elements->Nodes[INDEX2(j, numElements, mesh_p->Elements->ReferenceElement->Type->numNodes)]=vertices[INDEX2(j,e,MAX_numNodes_gmsh)];                                    mesh_p->Elements->Nodes[INDEX2(j, numElements, mesh_p->Elements->referenceElementSet->numNodes)]=vertices[INDEX2(j,e,MAX_numNodes_gmsh)];
342                              }                              }
343                              numElements++;                              numElements++;
344                           } else if (element_type[e] == final_face_element_type) {                           } else if (element_type[e] == final_face_element_type) {
# Line 342  Finley_Mesh* Finley_Mesh_readGmsh(char* Line 346  Finley_Mesh* Finley_Mesh_readGmsh(char*
346                              mesh_p->FaceElements->Tag[numFaceElements]=tag[e];                              mesh_p->FaceElements->Tag[numFaceElements]=tag[e];
347                              mesh_p->FaceElements->Color[numFaceElements]=numFaceElements;                              mesh_p->FaceElements->Color[numFaceElements]=numFaceElements;
348                              mesh_p->FaceElements->Owner[numFaceElements]=0;                              mesh_p->FaceElements->Owner[numFaceElements]=0;
349                              for (j = 0; j<  mesh_p->FaceElements->ReferenceElement->Type->numNodes; ++j) {                              for (j = 0; j<  mesh_p->FaceElements->referenceElementSet->numNodes; ++j) {
350                                       mesh_p->FaceElements->Nodes[INDEX2(j, numFaceElements, mesh_p->FaceElements->ReferenceElement->Type->numNodes)]=vertices[INDEX2(j,e,MAX_numNodes_gmsh)];                                       mesh_p->FaceElements->Nodes[INDEX2(j, numFaceElements, mesh_p->FaceElements->referenceElementSet->numNodes)]=vertices[INDEX2(j,e,MAX_numNodes_gmsh)];
351                              }                              }
352                              numFaceElements++;                              numFaceElements++;
353                           }                           }
# Line 380  Finley_Mesh* Finley_Mesh_readGmsh(char* Line 384  Finley_Mesh* Finley_Mesh_readGmsh(char*
384          return NULL;          return NULL;
385       }       }
386       /*   resolve id's : */       /*   resolve id's : */
387       Finley_Mesh_resolveNodeIds(mesh_p);       if (Finley_noError()) Finley_Mesh_resolveNodeIds(mesh_p);
388       /* rearrange elements: */       /* rearrange elements: */
389       Finley_Mesh_prepare(mesh_p, optimize);       if (Finley_noError()) Finley_Mesh_prepare(mesh_p, optimize);
390       /* that's it */       /* free up memory */
391       #ifdef Finley_TRACE       Finley_ReferenceElementSet_dealloc(refPoints);
392       printf("timing: reading mesh: %.4e sec\n",Finley_timer()-time0);       Finley_ReferenceElementSet_dealloc(refContactElements);
393       #endif       Finley_ReferenceElementSet_dealloc(refFaceElements);
394       Paso_MPIInfo_free( mpi_info );       Finley_ReferenceElementSet_dealloc(refElements);
395       return mesh_p;       Paso_MPIInfo_free( mpi_info );
396         if (! Finley_noError()) {
397            Finley_Mesh_free(mesh_p);
398            return NULL;
399         } else {
400             return mesh_p;
401         }
402    }    }
403  }  }

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changed lines
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