# Diff of /branches/domexper/dudley/src/Util.c

trunk/esys2/finley/src/finleyC/Util.c revision 100 by jgs, Wed Dec 15 03:48:48 2004 UTC trunk/finley/src/Util.c revision 2548 by jfenwick, Mon Jul 20 06:20:06 2009 UTC
# Line 1  Line 1
/* \$Id\$ */
1
2  /**************************************************************/  /*******************************************************
3    *
4    * Copyright (c) 2003-2009 by University of Queensland
5    * Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)
6    * http://www.uq.edu.au/esscc
7    *
8    * Primary Business: Queensland, Australia
11    *
12    *******************************************************/
13
/*   Some utility routines: */
14
15  /**************************************************************/  /**************************************************************/
16
17  /*   Copyrights by ACcESS Australia, 2003 */  /*   Some utility routines: */
/*   author: gross@access.edu.au */
/*   Version: \$Id\$ */
18
19  /**************************************************************/  /**************************************************************/
20
#include "Common.h"
21  #include "Finley.h"  #include "Finley.h"
22  #include "Util.h"  #include "Util.h"
23
24    #ifdef _OPENMP
25    #include <omp.h>
26    #endif
27
28    /**************************************************************/
29
30    /*   returns true if any of the values in the short array values is not equalt to Zero */
31
32    bool_t Finley_Util_anyNonZeroDouble(dim_t N, double* values) {
33       dim_t q;
34       for (q=0;q<N;++q) if (ABS(values[q])>0) return TRUE;
35       return FALSE;
36    }
37  /**************************************************************/  /**************************************************************/
38
39  /*   gathers double values out from in by index: */  /*   gathers double values out from in by index: */
40
41  /*        out(1:numData,1:len)=in(1:numData,index(1:len)) */  /*        out(1:numData,1:len)=in(1:numData,index(1:len)) */
42
43  void Finley_Util_Gather_double(int len,maybelong* index,int numData,double* in, double * out){  void Finley_Util_Gather_double(dim_t len,index_t* index,dim_t numData,double* in, double * out){
44      int s,i;      dim_t s,i;
45      for (s=0;s<len;s++) {      for (s=0;s<len;s++) {
46         for (i=0;i<numData;i++) {         for (i=0;i<numData;i++) {
47            out[INDEX2(i,s,numData)]=in[INDEX2(i,index[s],numData)];            out[INDEX2(i,s,numData)]=in[INDEX2(i,index[s],numData)];
# Line 38  void Finley_Util_Gather_double(int len,m Line 56  void Finley_Util_Gather_double(int len,m
56
57  /*        out(1:numData,1:len)=in(1:numData,index(1:len)) */  /*        out(1:numData,1:len)=in(1:numData,index(1:len)) */
58
59  void Finley_Util_Gather_int(int len,maybelong* index,int numData, maybelong* in, maybelong * out){  void Finley_Util_Gather_int(dim_t len,index_t* index,dim_t numData, index_t* in, index_t * out){
60      int s,i;      dim_t s,i;
61      for (s=0;s<len;s++) {      for (s=0;s<len;s++) {
62         for (i=0;i<numData;i++) {         for (i=0;i<numData;i++) {
63            out[INDEX2(i,s,numData)]=in[INDEX2(i,index[s],numData)];            out[INDEX2(i,s,numData)]=in[INDEX2(i,index[s],numData)];
# Line 51  void Finley_Util_Gather_int(int len,mayb Line 69  void Finley_Util_Gather_int(int len,mayb
69
70  /*   adds a vector in into out using and index. */  /*   adds a vector in into out using and index. */
71
72  /*        out(1:numData,index(1:len))+=in(1:numData,1:len) */  /*        out(1:numData,index[p])+=in(1:numData,p) where p = {k=1...len , index[k]<upperBound}*/
73
74
75  void Finley_Util_AddScatter(int len,maybelong* index,int numData,double* in,double * out){  void Finley_Util_AddScatter(dim_t len,index_t* index,dim_t numData,double* in,double * out, index_t upperBound){
76     int i,s;     dim_t i,s;
77     for (s=0;s<len;s++) {     for (s=0;s<len;s++) {
78         for(i=0;i<numData;i++) {         for(i=0;i<numData;i++) {
79            #pragma omp atomic            if( index[s]<upperBound ) {
80            out[INDEX2(i,index[s],numData)]+=in[INDEX2(i,s,numData)];              out[INDEX2(i,index[s],numData)]+=in[INDEX2(i,s,numData)];
81          }
82         }         }
83     }     }
84  }  }
87
88  /*          A(1:A1,1:A2)=B(1:A1,1:B2)*C(1:B2,1:A2) */  /*          A(1:A1,1:A2)=B(1:A1,1:B2)*C(1:B2,1:A2) */
89
90  void Finley_Util_SmallMatMult(int A1,int A2, double* A, int B2, double*B, double* C) {  void Finley_Util_SmallMatMult(dim_t A1,dim_t A2, double* A, dim_t B2, double*B, double* C) {
91      int i,j,s;      dim_t i,j,s;
92      for (i=0;i<A1*A2;i++) A[i]=0;      for (i=0;i<A1*A2;i++) A[i]=0;
93         for (i=0;i<A1;i++) {         for (i=0;i<A1;i++) {
94            for (j=0;j<A2;j++) {            for (j=0;j<A2;j++) {
# Line 83  void Finley_Util_SmallMatMult(int A1,int Line 103  void Finley_Util_SmallMatMult(int A1,int
103
104  /*        A(1:A1,1:A2,i)=B(1:A1,1:B2,i)*C(1:B2,1:A2,i) i=1,len */  /*        A(1:A1,1:A2,i)=B(1:A1,1:B2,i)*C(1:B2,1:A2,i) i=1,len */
105
106  void Finley_Util_SmallMatSetMult(int len,int A1,int A2, double* A, int B2, double*B, double* C) {  void Finley_Util_SmallMatSetMult(dim_t len,dim_t A1,dim_t A2, double* A, dim_t B2, double*B, double* C) {
107      int q,i,j,s;      dim_t q,i,j,s;
108      for (i=0;i<A1*A2*len;i++) A[i]=0;      for (i=0;i<A1*A2*len;i++) A[i]=0;
109      for (q=0;q<len;q++) {      for (q=0;q<len;q++) {
110         for (i=0;i<A1;i++) {         for (i=0;i<A1;i++) {
# Line 96  void Finley_Util_SmallMatSetMult(int len Line 116  void Finley_Util_SmallMatSetMult(int len
116         }         }
117      }      }
118  }  }

119  /*    inverts the set of dim x dim matrices A(:,:,1:len) with dim=1,2,3 */  /*    inverts the set of dim x dim matrices A(:,:,1:len) with dim=1,2,3 */
120  /*    the determinante is returned. */  /*    the determinante is returned. */
121
122  void Finley_Util_InvertSmallMat(int len,int dim,double* A,double *invA, double* det){  void Finley_Util_InvertSmallMat(dim_t len,dim_t dim,double* A,double *invA, double* det){
123     int q;     dim_t q;
124     double D,A11,A12,A13,A21,A22,A23,A31,A32,A33;     register double D,A11,A12,A13,A21,A22,A23,A31,A32,A33;
125
126     switch(dim) {     switch(dim) {
127        case 1:        case 1:
128           for (q=0;q<len;q++) {           for (q=0;q<len;q++) {
129              D=A[INDEX3(0,0,q,dim,dim)];              D=A[q];
130              if (D == 0 ){              if (ABS(D) > 0 ){
131                 Finley_ErrorCode=ZERO_DIVISION_ERROR;                 det[q]=D;
132                 sprintf(Finley_ErrorMsg,"Non-regular matrix");                 D=1./D;
133                   invA[q]=D;
134                } else {
135                   Finley_setError(ZERO_DIVISION_ERROR,"__FILE__: Non-regular matrix");
136                 return;                 return;
137              }              }
det[q]=D;
D=1./D;
invA[INDEX3(0,0,q,dim,dim)]=D;
138           }           }
139           break;           break;
140
141        case 2:        case 2:
142           for (q=0;q<len;q++) {           for (q=0;q<len;q++) {
143              A11=A[INDEX3(0,0,q,dim,dim)];              A11=A[INDEX3(0,0,q,2,2)];
144              A12=A[INDEX3(0,1,q,dim,dim)];              A12=A[INDEX3(0,1,q,2,2)];
145              A21=A[INDEX3(1,0,q,dim,dim)];              A21=A[INDEX3(1,0,q,2,2)];
146              A22=A[INDEX3(1,1,q,dim,dim)];              A22=A[INDEX3(1,1,q,2,2)];
147
148              D = A11*A22-A12*A21;              D = A11*A22-A12*A21;
149              if (D == 0 ){              if (ABS(D) > 0 ){
150                 Finley_ErrorCode=ZERO_DIVISION_ERROR;                 det[q]=D;
151                 sprintf(Finley_ErrorMsg,"Non-regular matrix");                 D=1./D;
152                   invA[INDEX3(0,0,q,2,2)]= A22*D;
153                   invA[INDEX3(1,0,q,2,2)]=-A21*D;
154                   invA[INDEX3(0,1,q,2,2)]=-A12*D;
155                   invA[INDEX3(1,1,q,2,2)]= A11*D;
156                } else {
157                   Finley_setError(ZERO_DIVISION_ERROR,"__FILE__: Non-regular matrix");
158                 return;                 return;
159              }              }
det[q]=D;
D=1./D;
invA[INDEX3(0,0,q,dim,dim)]= A22*D;
invA[INDEX3(1,0,q,dim,dim)]=-A21*D;
invA[INDEX3(0,1,q,dim,dim)]=-A12*D;
invA[INDEX3(1,1,q,dim,dim)]= A11*D;
160           }           }
161           break;           break;
162
163        case 3:        case 3:
164       for (q=0;q<len;q++) {       for (q=0;q<len;q++) {
165              A11=A[INDEX3(0,0,q,dim,dim)];              A11=A[INDEX3(0,0,q,3,3)];
166              A21=A[INDEX3(1,0,q,dim,dim)];              A21=A[INDEX3(1,0,q,3,3)];
167              A31=A[INDEX3(2,0,q,dim,dim)];              A31=A[INDEX3(2,0,q,3,3)];
168              A12=A[INDEX3(0,1,q,dim,dim)];              A12=A[INDEX3(0,1,q,3,3)];
169              A22=A[INDEX3(1,1,q,dim,dim)];              A22=A[INDEX3(1,1,q,3,3)];
170              A32=A[INDEX3(2,1,q,dim,dim)];              A32=A[INDEX3(2,1,q,3,3)];
171              A13=A[INDEX3(0,2,q,dim,dim)];              A13=A[INDEX3(0,2,q,3,3)];
172              A23=A[INDEX3(1,2,q,dim,dim)];              A23=A[INDEX3(1,2,q,3,3)];
173              A33=A[INDEX3(2,2,q,dim,dim)];              A33=A[INDEX3(2,2,q,3,3)];
174
175              D  =  A11*(A22*A33-A23*A32)+ A12*(A31*A23-A21*A33)+A13*(A21*A32-A31*A22);              D  =  A11*(A22*A33-A23*A32)+ A12*(A31*A23-A21*A33)+A13*(A21*A32-A31*A22);
176              if (D == 0 ){              if (ABS(D) > 0 ){
177                 Finley_ErrorCode=ZERO_DIVISION_ERROR;                 det[q]    =D;
178                 sprintf(Finley_ErrorMsg,"Non-regular matrix");                 D=1./D;
179                   invA[INDEX3(0,0,q,3,3)]=(A22*A33-A23*A32)*D;
180                   invA[INDEX3(1,0,q,3,3)]=(A31*A23-A21*A33)*D;
181                   invA[INDEX3(2,0,q,3,3)]=(A21*A32-A31*A22)*D;
182                   invA[INDEX3(0,1,q,3,3)]=(A13*A32-A12*A33)*D;
183                   invA[INDEX3(1,1,q,3,3)]=(A11*A33-A31*A13)*D;
184                   invA[INDEX3(2,1,q,3,3)]=(A12*A31-A11*A32)*D;
185                   invA[INDEX3(0,2,q,3,3)]=(A12*A23-A13*A22)*D;
186                   invA[INDEX3(1,2,q,3,3)]=(A13*A21-A11*A23)*D;
187                   invA[INDEX3(2,2,q,3,3)]=(A11*A22-A12*A21)*D;
188                } else {
189                   Finley_setError(ZERO_DIVISION_ERROR,"__FILE__: Non-regular matrix");
190                 return;                 return;
191              }              }
det[q]    =D;
D=1./D;
invA[INDEX3(0,0,q,dim,dim)]=(A22*A33-A23*A32)*D;
invA[INDEX3(1,0,q,dim,dim)]=(A31*A23-A21*A33)*D;
invA[INDEX3(2,0,q,dim,dim)]=(A21*A32-A31*A22)*D;
invA[INDEX3(0,1,q,dim,dim)]=(A13*A32-A12*A33)*D;
invA[INDEX3(1,1,q,dim,dim)]=(A11*A33-A31*A13)*D;
invA[INDEX3(2,1,q,dim,dim)]=(A12*A31-A11*A32)*D;
invA[INDEX3(0,2,q,dim,dim)]=(A12*A23-A13*A22)*D;
invA[INDEX3(1,2,q,dim,dim)]=(A13*A21-A11*A23)*D;
invA[INDEX3(2,2,q,dim,dim)]=(A11*A22-A12*A21)*D;
192           }           }
193           break;           break;
194
# Line 179  void Finley_Util_InvertSmallMat(int len, Line 198  void Finley_Util_InvertSmallMat(int len,
198
199  /*    sets the derterminate of a set of dim x dim matrices A(:,:,1:len) with dim=1,2,3 */  /*    sets the derterminate of a set of dim x dim matrices A(:,:,1:len) with dim=1,2,3 */
200
201  void Finley_Util_DetOfSmallMat(int len,int dim,double* A, double* det){  void Finley_Util_DetOfSmallMat(dim_t len,dim_t dim,double* A, double* det){
202     int q;     dim_t q;
203     double A11,A12,A13,A21,A22,A23,A31,A32,A33;     register double A11,A12,A13,A21,A22,A23,A31,A32,A33;
204
205     switch(dim) {     switch(dim) {
206        case 1:        case 1:
207           for (q=0;q<len;q++) {           for (q=0;q<len;q++) {
208              det[q]=A[INDEX3(0,0,q,dim,dim)];              det[q]=A[q];
209           }           }
210           break;           break;
211
212        case 2:        case 2:
213           for (q=0;q<len;q++) {           for (q=0;q<len;q++) {
214              A11=A[INDEX3(0,0,q,dim,dim)];              A11=A[INDEX3(0,0,q,2,2)];
215              A12=A[INDEX3(0,1,q,dim,dim)];              A12=A[INDEX3(0,1,q,2,2)];
216              A21=A[INDEX3(1,0,q,dim,dim)];              A21=A[INDEX3(1,0,q,2,2)];
217              A22=A[INDEX3(1,1,q,dim,dim)];              A22=A[INDEX3(1,1,q,2,2)];
218
219              det[q] = A11*A22-A12*A21;              det[q] = A11*A22-A12*A21;
220           }           }
# Line 203  void Finley_Util_DetOfSmallMat(int len,i Line 222  void Finley_Util_DetOfSmallMat(int len,i
222
223        case 3:        case 3:
224       for (q=0;q<len;q++) {       for (q=0;q<len;q++) {
225              A11=A[INDEX3(0,0,q,dim,dim)];              A11=A[INDEX3(0,0,q,3,3)];
226              A21=A[INDEX3(1,0,q,dim,dim)];              A21=A[INDEX3(1,0,q,3,3)];
227              A31=A[INDEX3(2,0,q,dim,dim)];              A31=A[INDEX3(2,0,q,3,3)];
228              A12=A[INDEX3(0,1,q,dim,dim)];              A12=A[INDEX3(0,1,q,3,3)];
229              A22=A[INDEX3(1,1,q,dim,dim)];              A22=A[INDEX3(1,1,q,3,3)];
230              A32=A[INDEX3(2,1,q,dim,dim)];              A32=A[INDEX3(2,1,q,3,3)];
231              A13=A[INDEX3(0,2,q,dim,dim)];              A13=A[INDEX3(0,2,q,3,3)];
232              A23=A[INDEX3(1,2,q,dim,dim)];              A23=A[INDEX3(1,2,q,3,3)];
233              A33=A[INDEX3(2,2,q,dim,dim)];              A33=A[INDEX3(2,2,q,3,3)];
234
235              det[q]  =  A11*(A22*A33-A23*A32)+ A12*(A31*A23-A21*A33)+A13*(A21*A32-A31*A22);              det[q]  =  A11*(A22*A33-A23*A32)+ A12*(A31*A23-A21*A33)+A13*(A21*A32-A31*A22);
236           }           }
# Line 223  void Finley_Util_DetOfSmallMat(int len,i Line 242  void Finley_Util_DetOfSmallMat(int len,i
242  /*    returns the normalized vector Normal[dim,len] orthogonal to A(:,0,q) and A(:,1,q) in the case of dim=3  */  /*    returns the normalized vector Normal[dim,len] orthogonal to A(:,0,q) and A(:,1,q) in the case of dim=3  */
243  /*    or the vector A(:,0,q) in the case of dim=2                                             */  /*    or the vector A(:,0,q) in the case of dim=2                                             */
244
245  void  Finley_NormalVector(int len, int dim, int dim1, double* A,double* Normal) {  void  Finley_NormalVector(dim_t len, dim_t dim, dim_t dim1, double* A,double* Normal) {
246     int q;     dim_t q;
247     double A11,A12,CO_A13,A21,A22,CO_A23,A31,A32,CO_A33,length,invlength;     register double A11,A12,CO_A13,A21,A22,CO_A23,A31,A32,CO_A33,length,invlength;
248
249     switch(dim) {     switch(dim) {
250        case 1:        case 1:
251           for (q=0;q<len;q++) Normal[INDEX1(q)]    =1;           for (q=0;q<len;q++) Normal[q]    =1;
252           break;           break;
253        case 2:        case 2:
254           for (q=0;q<len;q++) {           for (q=0;q<len;q++) {
255              A11=A[INDEX3(0,0,q,dim,dim1)];              A11=A[INDEX3(0,0,q,2,dim1)];
256              A21=A[INDEX3(1,0,q,dim,dim1)];              A21=A[INDEX3(1,0,q,2,dim1)];
257              length = sqrt(A11*A11+A21*A21);              length = sqrt(A11*A11+A21*A21);
258              if (! length>0) {              if (! length>0) {
259                 Finley_ErrorCode=ZERO_DIVISION_ERROR;                 Finley_setError(ZERO_DIVISION_ERROR,"__FILE__: area equals zero.");
sprintf(Finley_ErrorMsg,"area equals zero.");
260                 return;                 return;
261              } else {              } else {
262                 invlength=1./length;                 invlength=1./length;
263                 Normal[INDEX2(0,q,dim)]=A21*invlength;                 Normal[INDEX2(0,q,2)]=A21*invlength;
264                 Normal[INDEX2(1,q,dim)]=-A11*invlength;                 Normal[INDEX2(1,q,2)]=-A11*invlength;
265              }              }
266           }           }
267           break;           break;
268        case 3:        case 3:
269           for (q=0;q<len;q++) {           for (q=0;q<len;q++) {
270              A11=A[INDEX3(0,0,q,dim,dim1)];              A11=A[INDEX3(0,0,q,3,dim1)];
271              A21=A[INDEX3(1,0,q,dim,dim1)];              A21=A[INDEX3(1,0,q,3,dim1)];
272              A31=A[INDEX3(2,0,q,dim,dim1)];              A31=A[INDEX3(2,0,q,3,dim1)];
273              A12=A[INDEX3(0,1,q,dim,dim1)];              A12=A[INDEX3(0,1,q,3,dim1)];
274              A22=A[INDEX3(1,1,q,dim,dim1)];              A22=A[INDEX3(1,1,q,3,dim1)];
275              A32=A[INDEX3(2,1,q,dim,dim1)];              A32=A[INDEX3(2,1,q,3,dim1)];
276              CO_A13=A21*A32-A31*A22;              CO_A13=A21*A32-A31*A22;
277              CO_A23=A31*A12-A11*A32;              CO_A23=A31*A12-A11*A32;
278              CO_A33=A11*A22-A21*A12;              CO_A33=A11*A22-A21*A12;
279              length=sqrt(CO_A13*CO_A13+CO_A23*CO_A23+CO_A33*CO_A33);              length=sqrt(CO_A13*CO_A13+CO_A23*CO_A23+CO_A33*CO_A33);
280              if (! length>0) {              if (! length>0) {
281                 Finley_ErrorCode=ZERO_DIVISION_ERROR;                 Finley_setError(ZERO_DIVISION_ERROR,"__FILE__: area equals zero.");
sprintf(Finley_ErrorMsg,"area equals zero.");
282                 return;                 return;
283              } else {              } else {
284                 invlength=1./length;                 invlength=1./length;
285                 Normal[INDEX2(0,q,dim)]=CO_A13*invlength;                 Normal[INDEX2(0,q,3)]=CO_A13*invlength;
286                 Normal[INDEX2(1,q,dim)]=CO_A23*invlength;                 Normal[INDEX2(1,q,3)]=CO_A23*invlength;
287                 Normal[INDEX2(2,q,dim)]=CO_A33*invlength;                 Normal[INDEX2(2,q,3)]=CO_A33*invlength;
288             }             }
289
290        }        }
# Line 280  void  Finley_NormalVector(int len, int d Line 297  void  Finley_NormalVector(int len, int d
297  /*    return the length of the vector which is orthogonal to the vectors A(:,0,q) and A(:,1,q) in the case of dim=3 */  /*    return the length of the vector which is orthogonal to the vectors A(:,0,q) and A(:,1,q) in the case of dim=3 */
298  /*    or the vector A(:,0,q) in the case of dim=2                                                                   */  /*    or the vector A(:,0,q) in the case of dim=2                                                                   */
299
300  void  Finley_LengthOfNormalVector(int len, int dim, int dim1, double* A,double* length) {  void  Finley_LengthOfNormalVector(dim_t len, dim_t dim, dim_t dim1, double* A,double* length) {
301     int q;     dim_t q;
302     double A11,A12,CO_A13,A21,A22,CO_A23,A31,A32,CO_A33;     double A11,A12,CO_A13,A21,A22,CO_A23,A31,A32,CO_A33;
303
304     switch(dim) {     switch(dim) {
305        case 1:        case 1:
306           for (q=0;q<len;q++) length[INDEX1(q)]    =1;           for (q=0;q<len;q++) length[q]    =1;
307           break;           break;
308        case 2:        case 2:
309           for (q=0;q<len;q++) {           for (q=0;q<len;q++) {
310              A11=A[INDEX3(0,0,q,dim,dim1)];              A11=A[INDEX3(0,0,q,2,dim1)];
311              A21=A[INDEX3(1,0,q,dim,dim1)];              A21=A[INDEX3(1,0,q,2,dim1)];
312              length[q] = sqrt(A11*A11+A21*A21);              length[q] = sqrt(A11*A11+A21*A21);
313           }           }
314           break;           break;
315        case 3:        case 3:
316           for (q=0;q<len;q++) {           for (q=0;q<len;q++) {
317              A11=A[INDEX3(0,0,q,dim,dim1)];              A11=A[INDEX3(0,0,q,3,dim1)];
318              A21=A[INDEX3(1,0,q,dim,dim1)];              A21=A[INDEX3(1,0,q,3,dim1)];
319              A31=A[INDEX3(2,0,q,dim,dim1)];              A31=A[INDEX3(2,0,q,3,dim1)];
320              A12=A[INDEX3(0,1,q,dim,dim1)];              A12=A[INDEX3(0,1,q,3,dim1)];
321              A22=A[INDEX3(1,1,q,dim,dim1)];              A22=A[INDEX3(1,1,q,3,dim1)];
322              A32=A[INDEX3(2,1,q,dim,dim1)];              A32=A[INDEX3(2,1,q,3,dim1)];
323              CO_A13=A21*A32-A31*A22;              CO_A13=A21*A32-A31*A22;
324              CO_A23=A31*A12-A11*A32;              CO_A23=A31*A12-A11*A32;
325              CO_A33=A11*A22-A21*A12;              CO_A33=A11*A22-A21*A12;
# Line 318  void  Finley_LengthOfNormalVector(int le Line 335  void  Finley_LengthOfNormalVector(int le
335  /* there is no range checking! */  /* there is no range checking! */
336  /* at output Map[invMap[i]]=i for i=0:lenInvMap */  /* at output Map[invMap[i]]=i for i=0:lenInvMap */
337
338  void Finley_Util_InvertMap(int lenInvMap, maybelong* invMap,int lenMap, maybelong* Map) {  void Finley_Util_InvertMap(dim_t lenInvMap, index_t* invMap,dim_t lenMap, index_t* Map) {
339     int i;     dim_t i;
340     for (i=0;i<lenInvMap;i++) invMap[i]=0;     for (i=0;i<lenInvMap;i++) invMap[i]=0;
341     for (i=0;i<lenMap;i++) {     for (i=0;i<lenMap;i++) {
342        if (Map[i]>=0) invMap[Map[i]]=i;        if (Map[i]>=0) invMap[Map[i]]=i;
# Line 335  int Finley_Util_ValueAndIndex_compar(con Line 352  int Finley_Util_ValueAndIndex_compar(con
352     e2=(Finley_Util_ValueAndIndex*) arg2;     e2=(Finley_Util_ValueAndIndex*) arg2;
353     if (e1->value < e2->value) return -1;     if (e1->value < e2->value) return -1;
354     if (e1->value > e2->value) return  1;     if (e1->value > e2->value) return  1;
355       if (e1->index < e2->index) return -1;
356       if (e1->index > e2->index) return  1;
357     return 0;     return 0;
358  }  }
359  void Finley_Util_sortValueAndIndex(int n,Finley_Util_ValueAndIndex* array) {
360    void Finley_Util_sortValueAndIndex(dim_t n,Finley_Util_ValueAndIndex* array) {
361       /* OMP : needs parallelization !*/       /* OMP : needs parallelization !*/
362       qsort(array,n,sizeof(Finley_Util_ValueAndIndex),Finley_Util_ValueAndIndex_compar);       qsort(array,n,sizeof(Finley_Util_ValueAndIndex),Finley_Util_ValueAndIndex_compar);
363  }  }
# Line 347  void Finley_Util_sortValueAndIndex(int n Line 367  void Finley_Util_sortValueAndIndex(int n
367
368  /* calculates the minimum value from a dim X N integer array */  /* calculates the minimum value from a dim X N integer array */
369
370  maybelong Finley_Util_getMinInt(int dim,int N,maybelong* values) {  index_t Finley_Util_getMinInt(dim_t dim,dim_t N,index_t* values) {
371     maybelong i,j,out;     dim_t i,j;
372     out=MAYBELONG_MAX;     index_t out,out_local;
373       out=INDEX_T_MAX;
374     if (values!=NULL && dim*N>0 ) {     if (values!=NULL && dim*N>0 ) {
/* OMP */
375       out=values[0];       out=values[0];
376       for (j=0;j<N;j++) {       #pragma omp parallel private(out_local)
377         for (i=0;i<dim;i++) out=MIN(out,values[INDEX2(i,j,dim)]);       {
378             out_local=out;
379             #pragma omp for private(i,j) schedule(static)
380             for (j=0;j<N;j++) {
381               for (i=0;i<dim;i++) out_local=MIN(out_local,values[INDEX2(i,j,dim)]);
382             }
383             #pragma omp critical
384             out=MIN(out_local,out);
385       }       }
386     }     }
387     return out;     return out;
# Line 362  maybelong Finley_Util_getMinInt(int dim, Line 389  maybelong Finley_Util_getMinInt(int dim,
389
390  /* calculates the maximum value from a dim X N integer array */  /* calculates the maximum value from a dim X N integer array */
391
392  maybelong Finley_Util_getMaxInt(int dim,int N,maybelong* values) {  index_t Finley_Util_getMaxInt(dim_t dim,dim_t N,index_t* values) {
393     maybelong i,j,out;     dim_t i,j;
394     out=-MAYBELONG_MAX;     index_t out,out_local;
395       out=-INDEX_T_MAX;
396       if (values!=NULL && dim*N>0 ) {
397         out=values[0];
398         #pragma omp parallel private(out_local)
399         {
400             out_local=out;
401             #pragma omp for private(i,j) schedule(static)
402             for (j=0;j<N;j++) {
403                 for (i=0;i<dim;i++) out_local=MAX(out_local,values[INDEX2(i,j,dim)]);
404             }
405             #pragma omp critical
406             out=MAX(out_local,out);
407          }
408       }
409       return out;
410    }
411    /**************************************************************/
412
413    /* calculates the minimum value from a dim X N integer array */
414
415    index_t Finley_Util_getFlaggedMinInt(dim_t dim,dim_t N,index_t* values, index_t ignore) {
416       dim_t i,j;
417       index_t out,out_local;
418       out=INDEX_T_MAX;
419     if (values!=NULL && dim*N>0 ) {     if (values!=NULL && dim*N>0 ) {
/* OMP */
420       out=values[0];       out=values[0];
421       for (j=0;j<N;j++) {       #pragma omp parallel private(out_local)
422         for (i=0;i<dim;i++) out=MAX(out,values[INDEX2(i,j,dim)]);       {
423             out_local=out;
424             #pragma omp for private(i,j) schedule(static)
425             for (j=0;j<N;j++) {
426               for (i=0;i<dim;i++) if (values[INDEX2(i,j,dim)]!=ignore) out_local=MIN(out_local,values[INDEX2(i,j,dim)]);
427             }
428             #pragma omp critical
429             out=MIN(out_local,out);
430       }       }
431     }     }
432     return out;     return out;
433  }  }
434
435    /* calculates the maximum value from a dim X N integer array */
436
437    index_t Finley_Util_getFlaggedMaxInt(dim_t dim,dim_t N,index_t* values, index_t ignore) {
438       dim_t i,j;
439       index_t out,out_local;
440       out=-INDEX_T_MAX;
441       if (values!=NULL && dim*N>0 ) {
442         out=values[0];
443         #pragma omp parallel private(out_local)
444         {
445             out_local=out;
446             #pragma omp for private(i,j) schedule(static)
447             for (j=0;j<N;j++) {
448                 for (i=0;i<dim;i++) if (values[INDEX2(i,j,dim)]!=ignore) out_local=MAX(out_local,values[INDEX2(i,j,dim)]);
449             }
450             #pragma omp critical
451             out=MAX(out_local,out);
452          }
453       }
454       return out;
455    }
456
457  /* set the index of the positive entries in mask. The length of index is returned. */  /* set the index of the positive entries in mask. The length of index is returned. */
458
460        maybelong out,k;        dim_t out,k;
461        out=0;        out=0;
462        /*OMP */        /*OMP */
463        for (k=0;k<N;k++) {        for (k=0;k<N;k++) {
470  }  }
471
472  /* returns true if array contains value */  /* returns true if array contains value */
473  int Finley_Util_isAny(maybelong N,maybelong* array,maybelong value) {  bool_t Finley_Util_isAny(dim_t N,index_t* array,index_t value) {
474     int out=FALSE;     bool_t out=FALSE;
475     maybelong i;     dim_t i;
476     #pragma omp parallel for private(i) schedule(static) reduction(||:out)     #pragma omp parallel for private(i) schedule(static) reduction(||:out)
477     for (i=0;i<N;i++) out=out || (array[i]==value);     for (i=0;i<N;i++) out = out || (array[i]==value);
478       return out;
479    }
480    /* calculates the cummultative sum in array and returns the total sum */
481    index_t Finley_Util_cumsum(dim_t N,index_t* array) {
482       index_t out=0,tmp;
483       dim_t i;
484       #ifdef _OPENMP
485          index_t *partial_sums=NULL, sum;
487          #pragma omp parallel private(sum,i,tmp)
488          {
489            sum=0;
490            #pragma omp for schedule(static)
491            for (i=0;i<N;++i) sum+=array[i];
493            #pragma omp barrier
494            #pragma omp master
495            {
496              out=0;
498                 tmp=out;
499                 out+=partial_sums[i];
500                 partial_sums[i]=tmp;
501               }
502            }
503            #pragma omp barrier
505            #pragma omp for schedule(static)
506            for (i=0;i<N;++i) {
507              tmp=sum;
508              sum+=array[i];
509              array[i]=tmp;
510            }
511          }
512          TMPMEMFREE(partial_sums);
513       #else
514          for (i=0;i<N;++i) {
515             tmp=out;
516             out+=array[i];
517             array[i]=tmp;
518          }
519       #endif
520     return out;     return out;
521  }  }
522    void Finley_Util_setValuesInUse(const index_t *values, const dim_t numValues, dim_t *numValuesInUse, index_t **valuesInUse, Paso_MPIInfo* mpiinfo)
523    {
524       dim_t i;
525       index_t lastFoundValue=INDEX_T_MIN, minFoundValue, local_minFoundValue, *newValuesInUse=NULL;
526       register index_t itmp;
527       bool_t allFound=FALSE;
528       dim_t nv=0;
529
530       while (! allFound) {
531           /*
532            *  find smallest value bigger than lastFoundValue
533            */
534            minFoundValue=INDEX_T_MAX;
535            #pragma omp parallel private(local_minFoundValue)
536            {
537                local_minFoundValue=minFoundValue;
538                #pragma omp for private(i,itmp) schedule(static)
539                for (i=0;i< numValues;i++) {
540                   itmp=values[i];
541                   if ((itmp>lastFoundValue) && (itmp<local_minFoundValue)) local_minFoundValue=itmp;
542                }
543                #pragma omp critical
544                {
545                   if (local_minFoundValue<minFoundValue) minFoundValue=local_minFoundValue;
546                }
547
548  void Finley_copyDouble(int n,double* source, double* target) {           }
549    int i;           #ifdef PASO_MPI
550    for (i=0;i<n;i++) target[i]=source[i];           local_minFoundValue=minFoundValue;
551  }           MPI_Allreduce(&local_minFoundValue,&minFoundValue, 1, MPI_INT, MPI_MIN, mpiinfo->comm );
552             #endif
553  /*           /* if we found a new tag we need to add this too the valuesInUseList */
554   * \$Log\$
555   * Revision 1.3  2004/12/15 03:48:47  jgs           if (minFoundValue < INDEX_T_MAX) {
556   * *** empty log message ***               newValuesInUse=MEMALLOC(nv+1,index_t);
557   *               if (*valuesInUse!=NULL) {
558   * Revision 1.1.1.1  2004/10/26 06:53:57  jgs                   memcpy(newValuesInUse,*valuesInUse,sizeof(index_t)*nv);
559   * initial import of project esys2                   MEMFREE(*valuesInUse);
560   *               }
561   * Revision 1.3  2004/08/26 12:03:52  gross               newValuesInUse[nv]=minFoundValue;
562   * Some other bug in Finley_Assemble_gradient fixed.               *valuesInUse=newValuesInUse;
563   *               newValuesInUse=NULL;
564   * Revision 1.2  2004/07/02 04:21:13  gross               nv++;
565   * Finley C code has been included               lastFoundValue=minFoundValue;
566   *           } else {
567   * Revision 1.1.1.1  2004/06/24 04:00:40  johng               allFound=TRUE;
568   * Initial version of eys using boost-python.           }
569   *     }
570   *     *numValuesInUse=nv;
571   */  }
572
573
574    #ifdef PASO_MPI
575    void Finley_printDoubleArray( FILE *fid, dim_t n, double *array, char *name  )
576    {
577      index_t i;
578
579      if( name )
580        fprintf( fid, "%s [ ", name );
581      else
582        fprintf( fid, "[ " );
583      for( i=0; i<(n<60 ? n : 60); i++ )
584        fprintf( fid, "%g ", array[i] );
585      if( n>=30 )
586        fprintf( fid, "... " );
587      fprintf( fid, "]\n" );
588    }
589    void Finley_printIntArray( FILE *fid, dim_t n, int *array, char *name  )
590    {
591      index_t i;
592
593      if( name )
594        fprintf( fid, "%s [ ", name );
595      else
596        fprintf( fid, "[ " );
597      for( i=0; i<(n<60 ? n : 60); i++ )
598        fprintf( fid, "%d ", array[i] );
599      if( n>=30 )
600        fprintf( fid, "... " );
601      fprintf( fid, "]\n" );
602    }
603    void Finley_printMaskArray( FILE *fid, dim_t n, int *array, char *name  )
604    {
605      index_t i;
606
607      if( name )
608        fprintf( fid, "%s [ ", name );
609      else
610        fprintf( fid, "[ " );
611      for( i=0; i<(n<60 ? n : 60); i++ )
612        if( array[i]!=-1 )
613          fprintf( fid, "%3d ", array[i] );
614        else
615          fprintf( fid, "  * " );
616      if( n>=30 )
617        fprintf( fid, "... " );
618      fprintf( fid, "]\n" );
619    }
620    #endif

Legend:
 Removed from v.100 changed lines Added in v.2548