# Diff of /branches/domexper/dudley/src/Util.c

trunk/esys2/finley/src/finleyC/Util.c revision 100 by jgs, Wed Dec 15 03:48:48 2004 UTC trunk/finley/src/Util.c revision 2748 by gross, Tue Nov 17 07:32:59 2009 UTC
# Line 1  Line 1
/* \$Id\$ */
1
2  /**************************************************************/  /*******************************************************
3    *
4    * Copyright (c) 2003-2009 by University of Queensland
5    * Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)
6    * http://www.uq.edu.au/esscc
7    *
8    * Primary Business: Queensland, Australia
11    *
12    *******************************************************/
13
/*   Some utility routines: */
14
15  /**************************************************************/  /**************************************************************/
16
17  /*   Copyrights by ACcESS Australia, 2003 */  /*   Some utility routines: */
/*   author: gross@access.edu.au */
/*   Version: \$Id\$ */
18
19  /**************************************************************/  /**************************************************************/
20
#include "Common.h"
21  #include "Finley.h"  #include "Finley.h"
22  #include "Util.h"  #include "Util.h"
23
24    #ifdef _OPENMP
25    #include <omp.h>
26    #endif
27
28    /**************************************************************/
29
30    /*   returns true if any of the values in the short array values is not equalt to Zero */
31
32    bool_t Finley_Util_anyNonZeroDouble(dim_t N, double* values) {
33       dim_t q;
34       for (q=0;q<N;++q) if (ABS(values[q])>0) return TRUE;
35       return FALSE;
36    }
37  /**************************************************************/  /**************************************************************/
38
39  /*   gathers double values out from in by index: */  /*   gathers double values out from in by index: */
40
41  /*        out(1:numData,1:len)=in(1:numData,index(1:len)) */  /*        out(1:numData,1:len)=in(1:numData,index(1:len)) */
42
43  void Finley_Util_Gather_double(int len,maybelong* index,int numData,double* in, double * out){  void Finley_Util_Gather_double(dim_t len,index_t* index,dim_t numData,double* in, double * out){
44      int s,i;      dim_t s,i;
45      for (s=0;s<len;s++) {      for (s=0;s<len;s++) {
46         for (i=0;i<numData;i++) {         for (i=0;i<numData;i++) {
47            out[INDEX2(i,s,numData)]=in[INDEX2(i,index[s],numData)];            out[INDEX2(i,s,numData)]=in[INDEX2(i,index[s],numData)];
# Line 38  void Finley_Util_Gather_double(int len,m Line 56  void Finley_Util_Gather_double(int len,m
56
57  /*        out(1:numData,1:len)=in(1:numData,index(1:len)) */  /*        out(1:numData,1:len)=in(1:numData,index(1:len)) */
58
59  void Finley_Util_Gather_int(int len,maybelong* index,int numData, maybelong* in, maybelong * out){  void Finley_Util_Gather_int(dim_t len,index_t* index,dim_t numData, index_t* in, index_t * out){
60      int s,i;      dim_t s,i;
61      for (s=0;s<len;s++) {      for (s=0;s<len;s++) {
62         for (i=0;i<numData;i++) {         for (i=0;i<numData;i++) {
63            out[INDEX2(i,s,numData)]=in[INDEX2(i,index[s],numData)];            out[INDEX2(i,s,numData)]=in[INDEX2(i,index[s],numData)];
# Line 51  void Finley_Util_Gather_int(int len,mayb Line 69  void Finley_Util_Gather_int(int len,mayb
69
70  /*   adds a vector in into out using and index. */  /*   adds a vector in into out using and index. */
71
72  /*        out(1:numData,index(1:len))+=in(1:numData,1:len) */  /*        out(1:numData,index[p])+=in(1:numData,p) where p = {k=1...len , index[k]<upperBound}*/
73
74  void Finley_Util_AddScatter(int len,maybelong* index,int numData,double* in,double * out){
75     int i,s;  void Finley_Util_AddScatter(dim_t len,index_t* index,dim_t numData,double* in,double * out, index_t upperBound){
76       dim_t i,s;
77     for (s=0;s<len;s++) {     for (s=0;s<len;s++) {
78         for(i=0;i<numData;i++) {         for(i=0;i<numData;i++) {
79            #pragma omp atomic            if( index[s]<upperBound ) {
80            out[INDEX2(i,index[s],numData)]+=in[INDEX2(i,s,numData)];              out[INDEX2(i,index[s],numData)]+=in[INDEX2(i,s,numData)];
81          }
82         }         }
83     }     }
84  }  }
87
88  /*          A(1:A1,1:A2)=B(1:A1,1:B2)*C(1:B2,1:A2) */  /*          A(1:A1,1:A2)=B(1:A1,1:B2)*C(1:B2,1:A2) */
89
90  void Finley_Util_SmallMatMult(int A1,int A2, double* A, int B2, double*B, double* C) {  void Finley_Util_SmallMatMult(dim_t A1,dim_t A2, double* A, dim_t B2, double*B, double* C) {
91      int i,j,s;      dim_t i,j,s;
92      for (i=0;i<A1*A2;i++) A[i]=0;      register double rtmp;
93         for (i=0;i<A1;i++) {         for (i=0;i<A1;i++) {
94            for (j=0;j<A2;j++) {            for (j=0;j<A2;j++) {
95               for (s=0;s<B2;s++) {               rtmp=0;
96                  A[INDEX2(i,j,A1)]+=B[INDEX2(i,s,A1)]*C[INDEX2(s,j,B2)];               for (s=0;s<B2;s++) rtmp+=B[INDEX2(i,s,A1)]*C[INDEX2(s,j,B2)];
97               }               A[INDEX2(i,j,A1)]=rtmp;
98            }            }
99         }         }
100  }  }
# Line 83  void Finley_Util_SmallMatMult(int A1,int Line 103  void Finley_Util_SmallMatMult(int A1,int
103
104  /*        A(1:A1,1:A2,i)=B(1:A1,1:B2,i)*C(1:B2,1:A2,i) i=1,len */  /*        A(1:A1,1:A2,i)=B(1:A1,1:B2,i)*C(1:B2,1:A2,i) i=1,len */
105
106  void Finley_Util_SmallMatSetMult(int len,int A1,int A2, double* A, int B2, double*B, double* C) {  void Finley_Util_SmallMatSetMult(dim_t len,dim_t A1,dim_t A2, double* A, dim_t B2, double*B, double* C) {
107      int q,i,j,s;      dim_t q,i,j,s;
108      for (i=0;i<A1*A2*len;i++) A[i]=0;      register double rtmp;
109      for (q=0;q<len;q++) {      for (q=0;q<len;q++) {
110         for (i=0;i<A1;i++) {         for (i=0;i<A1;i++) {
111            for (j=0;j<A2;j++) {            for (j=0;j<A2;j++) {
112               for (s=0;s<B2;s++) {               rtmp=0;
113                  A[INDEX3(i,j,q,A1,A2)]+=B[INDEX3(i,s,q,A1,B2)]*C[INDEX3(s,j,q,B2,A2)];               for (s=0;s<B2;s++) rtmp+=B[INDEX3(i,s,q,A1,B2)]*C[INDEX3(s,j,q,B2,A2)];
114               }               A[INDEX3(i,j,q, A1,A2)]=rtmp;
115            }            }
116         }         }
117      }      }
118  }  }
119    /*    multiplies a set of matries with a single matrix: */
120
121    /*        A(1:A1,1:A2,i)=B(1:A1,1:B2,i)*C(1:B2,1:A2) i=1,len */
122
123    void Finley_Util_SmallMatSetMult1(dim_t len,dim_t A1,dim_t A2, double* A, dim_t B2, double*B, double* C) {
124        dim_t q,i,j,s;
125        register double rtmp;
126        for (q=0;q<len;q++) {
127           for (i=0;i<A1;i++) {
128              for (j=0;j<A2;j++) {
129                 rtmp=0;
130                 for (s=0;s<B2;s++) rtmp+=B[INDEX3(i,s,q, A1,B2)]*C[INDEX2(s,j,B2)];
131                 A[INDEX3(i,j,q,A1,A2)]=rtmp;
132              }
133           }
134        }
135    }
136  /*    inverts the set of dim x dim matrices A(:,:,1:len) with dim=1,2,3 */  /*    inverts the set of dim x dim matrices A(:,:,1:len) with dim=1,2,3 */
137  /*    the determinante is returned. */  /*    the determinante is returned. */
138
139  void Finley_Util_InvertSmallMat(int len,int dim,double* A,double *invA, double* det){  void Finley_Util_InvertSmallMat(dim_t len,dim_t dim,double* A,double *invA, double* det){
140     int q;     dim_t q;
141     double D,A11,A12,A13,A21,A22,A23,A31,A32,A33;     register double D,A11,A12,A13,A21,A22,A23,A31,A32,A33;
142
143     switch(dim) {     switch(dim) {
144        case 1:        case 1:
145           for (q=0;q<len;q++) {           for (q=0;q<len;q++) {
146              D=A[INDEX3(0,0,q,dim,dim)];              D=A[q];
147              if (D == 0 ){              if (ABS(D) > 0 ){
148                 Finley_ErrorCode=ZERO_DIVISION_ERROR;                 det[q]=D;
149                 sprintf(Finley_ErrorMsg,"Non-regular matrix");                 D=1./D;
150                   invA[q]=D;
151                } else {
152                   Finley_setError(ZERO_DIVISION_ERROR,"__FILE__: Non-regular matrix");
153                 return;                 return;
154              }              }
det[q]=D;
D=1./D;
invA[INDEX3(0,0,q,dim,dim)]=D;
155           }           }
156           break;           break;
157
158        case 2:        case 2:
159           for (q=0;q<len;q++) {           for (q=0;q<len;q++) {
160              A11=A[INDEX3(0,0,q,dim,dim)];              A11=A[INDEX3(0,0,q,2,2)];
161              A12=A[INDEX3(0,1,q,dim,dim)];              A12=A[INDEX3(0,1,q,2,2)];
162              A21=A[INDEX3(1,0,q,dim,dim)];              A21=A[INDEX3(1,0,q,2,2)];
163              A22=A[INDEX3(1,1,q,dim,dim)];              A22=A[INDEX3(1,1,q,2,2)];
164
165              D = A11*A22-A12*A21;              D = A11*A22-A12*A21;
166              if (D == 0 ){              if (ABS(D) > 0 ){
167                 Finley_ErrorCode=ZERO_DIVISION_ERROR;                 det[q]=D;
168                 sprintf(Finley_ErrorMsg,"Non-regular matrix");                 D=1./D;
169                   invA[INDEX3(0,0,q,2,2)]= A22*D;
170                   invA[INDEX3(1,0,q,2,2)]=-A21*D;
171                   invA[INDEX3(0,1,q,2,2)]=-A12*D;
172                   invA[INDEX3(1,1,q,2,2)]= A11*D;
173                } else {
174                   Finley_setError(ZERO_DIVISION_ERROR,"__FILE__: Non-regular matrix");
175                 return;                 return;
176              }              }
det[q]=D;
D=1./D;
invA[INDEX3(0,0,q,dim,dim)]= A22*D;
invA[INDEX3(1,0,q,dim,dim)]=-A21*D;
invA[INDEX3(0,1,q,dim,dim)]=-A12*D;
invA[INDEX3(1,1,q,dim,dim)]= A11*D;
177           }           }
178           break;           break;
179
180        case 3:        case 3:
181       for (q=0;q<len;q++) {       for (q=0;q<len;q++) {
182              A11=A[INDEX3(0,0,q,dim,dim)];              A11=A[INDEX3(0,0,q,3,3)];
183              A21=A[INDEX3(1,0,q,dim,dim)];              A21=A[INDEX3(1,0,q,3,3)];
184              A31=A[INDEX3(2,0,q,dim,dim)];              A31=A[INDEX3(2,0,q,3,3)];
185              A12=A[INDEX3(0,1,q,dim,dim)];              A12=A[INDEX3(0,1,q,3,3)];
186              A22=A[INDEX3(1,1,q,dim,dim)];              A22=A[INDEX3(1,1,q,3,3)];
187              A32=A[INDEX3(2,1,q,dim,dim)];              A32=A[INDEX3(2,1,q,3,3)];
188              A13=A[INDEX3(0,2,q,dim,dim)];              A13=A[INDEX3(0,2,q,3,3)];
189              A23=A[INDEX3(1,2,q,dim,dim)];              A23=A[INDEX3(1,2,q,3,3)];
190              A33=A[INDEX3(2,2,q,dim,dim)];              A33=A[INDEX3(2,2,q,3,3)];
191
192              D  =  A11*(A22*A33-A23*A32)+ A12*(A31*A23-A21*A33)+A13*(A21*A32-A31*A22);              D  =  A11*(A22*A33-A23*A32)+ A12*(A31*A23-A21*A33)+A13*(A21*A32-A31*A22);
193              if (D == 0 ){              if (ABS(D) > 0 ){
194                 Finley_ErrorCode=ZERO_DIVISION_ERROR;                 det[q]    =D;
195                 sprintf(Finley_ErrorMsg,"Non-regular matrix");                 D=1./D;
196                   invA[INDEX3(0,0,q,3,3)]=(A22*A33-A23*A32)*D;
197                   invA[INDEX3(1,0,q,3,3)]=(A31*A23-A21*A33)*D;
198                   invA[INDEX3(2,0,q,3,3)]=(A21*A32-A31*A22)*D;
199                   invA[INDEX3(0,1,q,3,3)]=(A13*A32-A12*A33)*D;
200                   invA[INDEX3(1,1,q,3,3)]=(A11*A33-A31*A13)*D;
201                   invA[INDEX3(2,1,q,3,3)]=(A12*A31-A11*A32)*D;
202                   invA[INDEX3(0,2,q,3,3)]=(A12*A23-A13*A22)*D;
203                   invA[INDEX3(1,2,q,3,3)]=(A13*A21-A11*A23)*D;
204                   invA[INDEX3(2,2,q,3,3)]=(A11*A22-A12*A21)*D;
205                } else {
206                   Finley_setError(ZERO_DIVISION_ERROR,"__FILE__: Non-regular matrix");
207                 return;                 return;
208              }              }
det[q]    =D;
D=1./D;
invA[INDEX3(0,0,q,dim,dim)]=(A22*A33-A23*A32)*D;
invA[INDEX3(1,0,q,dim,dim)]=(A31*A23-A21*A33)*D;
invA[INDEX3(2,0,q,dim,dim)]=(A21*A32-A31*A22)*D;
invA[INDEX3(0,1,q,dim,dim)]=(A13*A32-A12*A33)*D;
invA[INDEX3(1,1,q,dim,dim)]=(A11*A33-A31*A13)*D;
invA[INDEX3(2,1,q,dim,dim)]=(A12*A31-A11*A32)*D;
invA[INDEX3(0,2,q,dim,dim)]=(A12*A23-A13*A22)*D;
invA[INDEX3(1,2,q,dim,dim)]=(A13*A21-A11*A23)*D;
invA[INDEX3(2,2,q,dim,dim)]=(A11*A22-A12*A21)*D;
209           }           }
210           break;           break;
211
# Line 179  void Finley_Util_InvertSmallMat(int len, Line 215  void Finley_Util_InvertSmallMat(int len,
215
216  /*    sets the derterminate of a set of dim x dim matrices A(:,:,1:len) with dim=1,2,3 */  /*    sets the derterminate of a set of dim x dim matrices A(:,:,1:len) with dim=1,2,3 */
217
218  void Finley_Util_DetOfSmallMat(int len,int dim,double* A, double* det){  void Finley_Util_DetOfSmallMat(dim_t len,dim_t dim,double* A, double* det){
219     int q;     dim_t q;
220     double A11,A12,A13,A21,A22,A23,A31,A32,A33;     register double A11,A12,A13,A21,A22,A23,A31,A32,A33;
221
222     switch(dim) {     switch(dim) {
223        case 1:        case 1:
224           for (q=0;q<len;q++) {           for (q=0;q<len;q++) {
225              det[q]=A[INDEX3(0,0,q,dim,dim)];              det[q]=A[q];
226           }           }
227           break;           break;
228
229        case 2:        case 2:
230           for (q=0;q<len;q++) {           for (q=0;q<len;q++) {
231              A11=A[INDEX3(0,0,q,dim,dim)];              A11=A[INDEX3(0,0,q,2,2)];
232              A12=A[INDEX3(0,1,q,dim,dim)];              A12=A[INDEX3(0,1,q,2,2)];
233              A21=A[INDEX3(1,0,q,dim,dim)];              A21=A[INDEX3(1,0,q,2,2)];
234              A22=A[INDEX3(1,1,q,dim,dim)];              A22=A[INDEX3(1,1,q,2,2)];
235
236              det[q] = A11*A22-A12*A21;              det[q] = A11*A22-A12*A21;
237           }           }
# Line 203  void Finley_Util_DetOfSmallMat(int len,i Line 239  void Finley_Util_DetOfSmallMat(int len,i
239
240        case 3:        case 3:
241       for (q=0;q<len;q++) {       for (q=0;q<len;q++) {
242              A11=A[INDEX3(0,0,q,dim,dim)];              A11=A[INDEX3(0,0,q,3,3)];
243              A21=A[INDEX3(1,0,q,dim,dim)];              A21=A[INDEX3(1,0,q,3,3)];
244              A31=A[INDEX3(2,0,q,dim,dim)];              A31=A[INDEX3(2,0,q,3,3)];
245              A12=A[INDEX3(0,1,q,dim,dim)];              A12=A[INDEX3(0,1,q,3,3)];
246              A22=A[INDEX3(1,1,q,dim,dim)];              A22=A[INDEX3(1,1,q,3,3)];
247              A32=A[INDEX3(2,1,q,dim,dim)];              A32=A[INDEX3(2,1,q,3,3)];
248              A13=A[INDEX3(0,2,q,dim,dim)];              A13=A[INDEX3(0,2,q,3,3)];
249              A23=A[INDEX3(1,2,q,dim,dim)];              A23=A[INDEX3(1,2,q,3,3)];
250              A33=A[INDEX3(2,2,q,dim,dim)];              A33=A[INDEX3(2,2,q,3,3)];
251
252              det[q]  =  A11*(A22*A33-A23*A32)+ A12*(A31*A23-A21*A33)+A13*(A21*A32-A31*A22);              det[q]  =  A11*(A22*A33-A23*A32)+ A12*(A31*A23-A21*A33)+A13*(A21*A32-A31*A22);
253           }           }
# Line 223  void Finley_Util_DetOfSmallMat(int len,i Line 259  void Finley_Util_DetOfSmallMat(int len,i
259  /*    returns the normalized vector Normal[dim,len] orthogonal to A(:,0,q) and A(:,1,q) in the case of dim=3  */  /*    returns the normalized vector Normal[dim,len] orthogonal to A(:,0,q) and A(:,1,q) in the case of dim=3  */
260  /*    or the vector A(:,0,q) in the case of dim=2                                             */  /*    or the vector A(:,0,q) in the case of dim=2                                             */
261
262  void  Finley_NormalVector(int len, int dim, int dim1, double* A,double* Normal) {  void  Finley_NormalVector(dim_t len, dim_t dim, dim_t dim1, double* A,double* Normal) {
263     int q;     dim_t q;
264     double A11,A12,CO_A13,A21,A22,CO_A23,A31,A32,CO_A33,length,invlength;     register double A11,A12,CO_A13,A21,A22,CO_A23,A31,A32,CO_A33,length,invlength;
265
266     switch(dim) {     switch(dim) {
267        case 1:        case 1:
268           for (q=0;q<len;q++) Normal[INDEX1(q)]    =1;           for (q=0;q<len;q++) Normal[q]    =1;
269           break;           break;
270        case 2:        case 2:
271           for (q=0;q<len;q++) {           for (q=0;q<len;q++) {
272              A11=A[INDEX3(0,0,q,dim,dim1)];              A11=A[INDEX3(0,0,q,2,dim1)];
273              A21=A[INDEX3(1,0,q,dim,dim1)];              A21=A[INDEX3(1,0,q,2,dim1)];
274              length = sqrt(A11*A11+A21*A21);              length = sqrt(A11*A11+A21*A21);
275              if (! length>0) {              if (! length>0) {
276                 Finley_ErrorCode=ZERO_DIVISION_ERROR;                 Finley_setError(ZERO_DIVISION_ERROR,"__FILE__: area equals zero.");
sprintf(Finley_ErrorMsg,"area equals zero.");
277                 return;                 return;
278              } else {              } else {
279                 invlength=1./length;                 invlength=1./length;
280                 Normal[INDEX2(0,q,dim)]=A21*invlength;                 Normal[INDEX2(0,q,2)]=A21*invlength;
281                 Normal[INDEX2(1,q,dim)]=-A11*invlength;                 Normal[INDEX2(1,q,2)]=-A11*invlength;
282              }              }
283           }           }
284           break;           break;
285        case 3:        case 3:
286           for (q=0;q<len;q++) {           for (q=0;q<len;q++) {
287              A11=A[INDEX3(0,0,q,dim,dim1)];              A11=A[INDEX3(0,0,q,3,dim1)];
288              A21=A[INDEX3(1,0,q,dim,dim1)];              A21=A[INDEX3(1,0,q,3,dim1)];
289              A31=A[INDEX3(2,0,q,dim,dim1)];              A31=A[INDEX3(2,0,q,3,dim1)];
290              A12=A[INDEX3(0,1,q,dim,dim1)];              A12=A[INDEX3(0,1,q,3,dim1)];
291              A22=A[INDEX3(1,1,q,dim,dim1)];              A22=A[INDEX3(1,1,q,3,dim1)];
292              A32=A[INDEX3(2,1,q,dim,dim1)];              A32=A[INDEX3(2,1,q,3,dim1)];
293              CO_A13=A21*A32-A31*A22;              CO_A13=A21*A32-A31*A22;
294              CO_A23=A31*A12-A11*A32;              CO_A23=A31*A12-A11*A32;
295              CO_A33=A11*A22-A21*A12;              CO_A33=A11*A22-A21*A12;
296              length=sqrt(CO_A13*CO_A13+CO_A23*CO_A23+CO_A33*CO_A33);              length=sqrt(CO_A13*CO_A13+CO_A23*CO_A23+CO_A33*CO_A33);
297              if (! length>0) {              if (! length>0) {
298                 Finley_ErrorCode=ZERO_DIVISION_ERROR;                 Finley_setError(ZERO_DIVISION_ERROR,"__FILE__: area equals zero.");
sprintf(Finley_ErrorMsg,"area equals zero.");
299                 return;                 return;
300              } else {              } else {
301                 invlength=1./length;                 invlength=1./length;
302                 Normal[INDEX2(0,q,dim)]=CO_A13*invlength;                 Normal[INDEX2(0,q,3)]=CO_A13*invlength;
303                 Normal[INDEX2(1,q,dim)]=CO_A23*invlength;                 Normal[INDEX2(1,q,3)]=CO_A23*invlength;
304                 Normal[INDEX2(2,q,dim)]=CO_A33*invlength;                 Normal[INDEX2(2,q,3)]=CO_A33*invlength;
305             }             }
306
307        }        }
# Line 280  void  Finley_NormalVector(int len, int d Line 314  void  Finley_NormalVector(int len, int d
314  /*    return the length of the vector which is orthogonal to the vectors A(:,0,q) and A(:,1,q) in the case of dim=3 */  /*    return the length of the vector which is orthogonal to the vectors A(:,0,q) and A(:,1,q) in the case of dim=3 */
315  /*    or the vector A(:,0,q) in the case of dim=2                                                                   */  /*    or the vector A(:,0,q) in the case of dim=2                                                                   */
316
317  void  Finley_LengthOfNormalVector(int len, int dim, int dim1, double* A,double* length) {  void  Finley_LengthOfNormalVector(dim_t len, dim_t dim, dim_t dim1, double* A,double* length) {
318     int q;     dim_t q;
319     double A11,A12,CO_A13,A21,A22,CO_A23,A31,A32,CO_A33;     double A11,A12,CO_A13,A21,A22,CO_A23,A31,A32,CO_A33;
320
321     switch(dim) {     switch(dim) {
322        case 1:        case 1:
323           for (q=0;q<len;q++) length[INDEX1(q)]    =1;           for (q=0;q<len;q++) length[q]    =1;
324           break;           break;
325        case 2:        case 2:
326           for (q=0;q<len;q++) {           for (q=0;q<len;q++) {
327              A11=A[INDEX3(0,0,q,dim,dim1)];              A11=A[INDEX3(0,0,q,2,dim1)];
328              A21=A[INDEX3(1,0,q,dim,dim1)];              A21=A[INDEX3(1,0,q,2,dim1)];
329              length[q] = sqrt(A11*A11+A21*A21);              length[q] = sqrt(A11*A11+A21*A21);
330           }           }
331           break;           break;
332        case 3:        case 3:
333           for (q=0;q<len;q++) {           for (q=0;q<len;q++) {
334              A11=A[INDEX3(0,0,q,dim,dim1)];              A11=A[INDEX3(0,0,q,3,dim1)];
335              A21=A[INDEX3(1,0,q,dim,dim1)];              A21=A[INDEX3(1,0,q,3,dim1)];
336              A31=A[INDEX3(2,0,q,dim,dim1)];              A31=A[INDEX3(2,0,q,3,dim1)];
337              A12=A[INDEX3(0,1,q,dim,dim1)];              A12=A[INDEX3(0,1,q,3,dim1)];
338              A22=A[INDEX3(1,1,q,dim,dim1)];              A22=A[INDEX3(1,1,q,3,dim1)];
339              A32=A[INDEX3(2,1,q,dim,dim1)];              A32=A[INDEX3(2,1,q,3,dim1)];
340              CO_A13=A21*A32-A31*A22;              CO_A13=A21*A32-A31*A22;
341              CO_A23=A31*A12-A11*A32;              CO_A23=A31*A12-A11*A32;
342              CO_A33=A11*A22-A21*A12;              CO_A33=A11*A22-A21*A12;
# Line 318  void  Finley_LengthOfNormalVector(int le Line 352  void  Finley_LengthOfNormalVector(int le
352  /* there is no range checking! */  /* there is no range checking! */
353  /* at output Map[invMap[i]]=i for i=0:lenInvMap */  /* at output Map[invMap[i]]=i for i=0:lenInvMap */
354
355  void Finley_Util_InvertMap(int lenInvMap, maybelong* invMap,int lenMap, maybelong* Map) {  void Finley_Util_InvertMap(dim_t lenInvMap, index_t* invMap,dim_t lenMap, index_t* Map) {
356     int i;     dim_t i;
357     for (i=0;i<lenInvMap;i++) invMap[i]=0;     for (i=0;i<lenInvMap;i++) invMap[i]=0;
358     for (i=0;i<lenMap;i++) {     for (i=0;i<lenMap;i++) {
359        if (Map[i]>=0) invMap[Map[i]]=i;        if (Map[i]>=0) invMap[Map[i]]=i;
# Line 335  int Finley_Util_ValueAndIndex_compar(con Line 369  int Finley_Util_ValueAndIndex_compar(con
369     e2=(Finley_Util_ValueAndIndex*) arg2;     e2=(Finley_Util_ValueAndIndex*) arg2;
370     if (e1->value < e2->value) return -1;     if (e1->value < e2->value) return -1;
371     if (e1->value > e2->value) return  1;     if (e1->value > e2->value) return  1;
372       if (e1->index < e2->index) return -1;
373       if (e1->index > e2->index) return  1;
374     return 0;     return 0;
375  }  }
376  void Finley_Util_sortValueAndIndex(int n,Finley_Util_ValueAndIndex* array) {
377    void Finley_Util_sortValueAndIndex(dim_t n,Finley_Util_ValueAndIndex* array) {
378       /* OMP : needs parallelization !*/       /* OMP : needs parallelization !*/
379       qsort(array,n,sizeof(Finley_Util_ValueAndIndex),Finley_Util_ValueAndIndex_compar);       qsort(array,n,sizeof(Finley_Util_ValueAndIndex),Finley_Util_ValueAndIndex_compar);
380  }  }
# Line 347  void Finley_Util_sortValueAndIndex(int n Line 384  void Finley_Util_sortValueAndIndex(int n
384
385  /* calculates the minimum value from a dim X N integer array */  /* calculates the minimum value from a dim X N integer array */
386
387  maybelong Finley_Util_getMinInt(int dim,int N,maybelong* values) {  index_t Finley_Util_getMinInt(dim_t dim,dim_t N,index_t* values) {
388     maybelong i,j,out;     dim_t i,j;
389     out=MAYBELONG_MAX;     index_t out,out_local;
390       out=INDEX_T_MAX;
391     if (values!=NULL && dim*N>0 ) {     if (values!=NULL && dim*N>0 ) {
/* OMP */
392       out=values[0];       out=values[0];
393       for (j=0;j<N;j++) {       #pragma omp parallel private(out_local)
394         for (i=0;i<dim;i++) out=MIN(out,values[INDEX2(i,j,dim)]);       {
395             out_local=out;
396             #pragma omp for private(i,j) schedule(static)
397             for (j=0;j<N;j++) {
398               for (i=0;i<dim;i++) out_local=MIN(out_local,values[INDEX2(i,j,dim)]);
399             }
400             #pragma omp critical
401             out=MIN(out_local,out);
402       }       }
403     }     }
404     return out;     return out;
# Line 362  maybelong Finley_Util_getMinInt(int dim, Line 406  maybelong Finley_Util_getMinInt(int dim,
406
407  /* calculates the maximum value from a dim X N integer array */  /* calculates the maximum value from a dim X N integer array */
408
409  maybelong Finley_Util_getMaxInt(int dim,int N,maybelong* values) {  index_t Finley_Util_getMaxInt(dim_t dim,dim_t N,index_t* values) {
410     maybelong i,j,out;     dim_t i,j;
411     out=-MAYBELONG_MAX;     index_t out,out_local;
412       out=-INDEX_T_MAX;
413     if (values!=NULL && dim*N>0 ) {     if (values!=NULL && dim*N>0 ) {
/* OMP */
414       out=values[0];       out=values[0];
415       for (j=0;j<N;j++) {       #pragma omp parallel private(out_local)
416         for (i=0;i<dim;i++) out=MAX(out,values[INDEX2(i,j,dim)]);       {
417             out_local=out;
418             #pragma omp for private(i,j) schedule(static)
419             for (j=0;j<N;j++) {
420                 for (i=0;i<dim;i++) out_local=MAX(out_local,values[INDEX2(i,j,dim)]);
421             }
422             #pragma omp critical
423             out=MAX(out_local,out);
424          }
425       }
426       return out;
427    }
428    /**************************************************************/
429
430    /* calculates the minimum value from a dim X N integer array */
431
432    index_t Finley_Util_getFlaggedMinInt(dim_t dim,dim_t N,index_t* values, index_t ignore) {
433       dim_t i,j;
434       index_t out,out_local;
435       out=INDEX_T_MAX;
436       if (values!=NULL && dim*N>0 ) {
437         out=values[0];
438         #pragma omp parallel private(out_local)
439         {
440             out_local=out;
441             #pragma omp for private(i,j) schedule(static)
442             for (j=0;j<N;j++) {
443               for (i=0;i<dim;i++) if (values[INDEX2(i,j,dim)]!=ignore) out_local=MIN(out_local,values[INDEX2(i,j,dim)]);
444             }
445             #pragma omp critical
446             out=MIN(out_local,out);
447       }       }
448     }     }
449     return out;     return out;
450  }  }
451
452    /* calculates the maximum value from a dim X N integer array */
453
454    index_t Finley_Util_getFlaggedMaxInt(dim_t dim,dim_t N,index_t* values, index_t ignore) {
455       dim_t i,j;
456       index_t out,out_local;
457       out=-INDEX_T_MAX;
458       if (values!=NULL && dim*N>0 ) {
459         out=values[0];
460         #pragma omp parallel private(out_local)
461         {
462             out_local=out;
463             #pragma omp for private(i,j) schedule(static)
464             for (j=0;j<N;j++) {
465                 for (i=0;i<dim;i++) if (values[INDEX2(i,j,dim)]!=ignore) out_local=MAX(out_local,values[INDEX2(i,j,dim)]);
466             }
467             #pragma omp critical
468             out=MAX(out_local,out);
469          }
470       }
471       return out;
472    }
473
474  /* set the index of the positive entries in mask. The length of index is returned. */  /* set the index of the positive entries in mask. The length of index is returned. */
475
477        maybelong out,k;        dim_t out,k;
478        out=0;        out=0;
479        /*OMP */        /*OMP */
480        for (k=0;k<N;k++) {        for (k=0;k<N;k++) {
487  }  }
488
489  /* returns true if array contains value */  /* returns true if array contains value */
490  int Finley_Util_isAny(maybelong N,maybelong* array,maybelong value) {  bool_t Finley_Util_isAny(dim_t N,index_t* array,index_t value) {
491     int out=FALSE;     bool_t out=FALSE;
492     maybelong i;     dim_t i;
493     #pragma omp parallel for private(i) schedule(static) reduction(||:out)     #pragma omp parallel for private(i) schedule(static) reduction(||:out)
494     for (i=0;i<N;i++) out=out || (array[i]==value);     for (i=0;i<N;i++) out = out || (array[i]==value);
495     return out;     return out;
496  }  }
497    /* calculates the cummultative sum in array and returns the total sum */
498    index_t Finley_Util_cumsum(dim_t N,index_t* array) {
499       index_t out=0,tmp;
500       dim_t i;
501       #ifdef _OPENMP
502          index_t *partial_sums=NULL, sum;
504          #pragma omp parallel private(sum,i,tmp)
505          {
506            sum=0;
507            #pragma omp for schedule(static)
508            for (i=0;i<N;++i) sum+=array[i];
510            #pragma omp barrier
511            #pragma omp master
512            {
513              out=0;
515                 tmp=out;
516                 out+=partial_sums[i];
517                 partial_sums[i]=tmp;
518               }
519            }
520            #pragma omp barrier
522            #pragma omp for schedule(static)
523            for (i=0;i<N;++i) {
524              tmp=sum;
525              sum+=array[i];
526              array[i]=tmp;
527            }
528          }
529          TMPMEMFREE(partial_sums);
530       #else
531          for (i=0;i<N;++i) {
532             tmp=out;
533             out+=array[i];
534             array[i]=tmp;
535          }
536       #endif
537       return out;
538    }
539    void Finley_Util_setValuesInUse(const index_t *values, const dim_t numValues, dim_t *numValuesInUse, index_t **valuesInUse, Paso_MPIInfo* mpiinfo)
540    {
541       dim_t i;
542       index_t lastFoundValue=INDEX_T_MIN, minFoundValue, local_minFoundValue, *newValuesInUse=NULL;
543       register index_t itmp;
544       bool_t allFound=FALSE;
545       dim_t nv=0;
546
547       while (! allFound) {
548           /*
549            *  find smallest value bigger than lastFoundValue
550            */
551            minFoundValue=INDEX_T_MAX;
552            #pragma omp parallel private(local_minFoundValue)
553            {
554                local_minFoundValue=minFoundValue;
555                #pragma omp for private(i,itmp) schedule(static)
556                for (i=0;i< numValues;i++) {
557                   itmp=values[i];
558                   if ((itmp>lastFoundValue) && (itmp<local_minFoundValue)) local_minFoundValue=itmp;
559                }
560                #pragma omp critical
561                {
562                   if (local_minFoundValue<minFoundValue) minFoundValue=local_minFoundValue;
563                }
564
565  void Finley_copyDouble(int n,double* source, double* target) {           }
566    int i;           #ifdef PASO_MPI
567    for (i=0;i<n;i++) target[i]=source[i];           local_minFoundValue=minFoundValue;
568  }           MPI_Allreduce(&local_minFoundValue,&minFoundValue, 1, MPI_INT, MPI_MIN, mpiinfo->comm );
569             #endif
570  /*           /* if we found a new tag we need to add this too the valuesInUseList */
571   * \$Log\$
572   * Revision 1.3  2004/12/15 03:48:47  jgs           if (minFoundValue < INDEX_T_MAX) {
573   * *** empty log message ***               newValuesInUse=MEMALLOC(nv+1,index_t);
574   *               if (*valuesInUse!=NULL) {
575   * Revision 1.1.1.1  2004/10/26 06:53:57  jgs                   memcpy(newValuesInUse,*valuesInUse,sizeof(index_t)*nv);
576   * initial import of project esys2                   MEMFREE(*valuesInUse);
577   *               }
578   * Revision 1.3  2004/08/26 12:03:52  gross               newValuesInUse[nv]=minFoundValue;
579   * Some other bug in Finley_Assemble_gradient fixed.               *valuesInUse=newValuesInUse;
580   *               newValuesInUse=NULL;
581   * Revision 1.2  2004/07/02 04:21:13  gross               nv++;
582   * Finley C code has been included               lastFoundValue=minFoundValue;
583   *           } else {
584   * Revision 1.1.1.1  2004/06/24 04:00:40  johng               allFound=TRUE;
585   * Initial version of eys using boost-python.           }
586   *     }
587   *     *numValuesInUse=nv;
588   */  }
589
590
591    #ifdef PASO_MPI
592    void Finley_printDoubleArray( FILE *fid, dim_t n, double *array, char *name  )
593    {
594      index_t i;
595
596      if( name )
597        fprintf( fid, "%s [ ", name );
598      else
599        fprintf( fid, "[ " );
600      for( i=0; i<(n<60 ? n : 60); i++ )
601        fprintf( fid, "%g ", array[i] );
602      if( n>=30 )
603        fprintf( fid, "... " );
604      fprintf( fid, "]\n" );
605    }
606    void Finley_printIntArray( FILE *fid, dim_t n, int *array, char *name  )
607    {
608      index_t i;
609
610      if( name )
611        fprintf( fid, "%s [ ", name );
612      else
613        fprintf( fid, "[ " );
614      for( i=0; i<(n<60 ? n : 60); i++ )
615        fprintf( fid, "%d ", array[i] );
616      if( n>=30 )
617        fprintf( fid, "... " );
618      fprintf( fid, "]\n" );
619    }
620    void Finley_printMaskArray( FILE *fid, dim_t n, int *array, char *name  )
621    {
622      index_t i;
623
624      if( name )
625        fprintf( fid, "%s [ ", name );
626      else
627        fprintf( fid, "[ " );
628      for( i=0; i<(n<60 ? n : 60); i++ )
629        if( array[i]!=-1 )
630          fprintf( fid, "%3d ", array[i] );
631        else
632          fprintf( fid, "  * " );
633      if( n>=30 )
634        fprintf( fid, "... " );
635      fprintf( fid, "]\n" );
636    }
637    #endif

Legend:
 Removed from v.100 changed lines Added in v.2748