/[escript]/branches/domexper/dudley/src/Util.c
ViewVC logotype

Diff of /branches/domexper/dudley/src/Util.c

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

trunk/esys2/finley/src/finleyC/Util.c revision 100 by jgs, Wed Dec 15 03:48:48 2004 UTC trunk/finley/src/Util.c revision 888 by gross, Tue Nov 7 08:31:26 2006 UTC
# Line 1  Line 1 
1  /* $Id$ */  /*
2     ************************************************************
3     *          Copyright 2006 by ACcESS MNRF                   *
4     *                                                          *
5     *              http://www.access.edu.au                    *
6     *       Primary Business: Queensland, Australia            *
7     *  Licensed under the Open Software License version 3.0    *
8     *     http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php       *
9     *                                                          *
10     ************************************************************
11    */
12    
13  /**************************************************************/  /**************************************************************/
14    
# Line 6  Line 16 
16    
17  /**************************************************************/  /**************************************************************/
18    
 /*   Copyrights by ACcESS Australia, 2003 */  
19  /*   author: gross@access.edu.au */  /*   author: gross@access.edu.au */
20  /*   Version: $Id$ */  /*   Version: $Id$ */
21    
22  /**************************************************************/  /**************************************************************/
23    
 #include "Common.h"  
24  #include "Finley.h"  #include "Finley.h"
25  #include "Util.h"  #include "Util.h"
26    
27    #ifdef _OPENMP
28    #include <omp.h>
29    #endif
30    
31    /**************************************************************/
32    
33    /*   returns true if any of the values in the short array values is not equalt to Zero */
34    
35    bool_t Finley_Util_anyNonZeroDouble(dim_t N, double* values) {
36       dim_t q;
37       for (q=0;q<N;++q) if (ABS(values[q])>0) return TRUE;
38       return FALSE;
39    }
40  /**************************************************************/  /**************************************************************/
41    
42  /*   gathers double values out from in by index: */  /*   gathers double values out from in by index: */
43    
44  /*        out(1:numData,1:len)=in(1:numData,index(1:len)) */  /*        out(1:numData,1:len)=in(1:numData,index(1:len)) */
45    
46  void Finley_Util_Gather_double(int len,maybelong* index,int numData,double* in, double * out){  void Finley_Util_Gather_double(dim_t len,index_t* index,dim_t numData,double* in, double * out){
47      int s,i;      dim_t s,i;
48      for (s=0;s<len;s++) {      for (s=0;s<len;s++) {
49         for (i=0;i<numData;i++) {         for (i=0;i<numData;i++) {
50            out[INDEX2(i,s,numData)]=in[INDEX2(i,index[s],numData)];            out[INDEX2(i,s,numData)]=in[INDEX2(i,index[s],numData)];
# Line 38  void Finley_Util_Gather_double(int len,m Line 59  void Finley_Util_Gather_double(int len,m
59    
60  /*        out(1:numData,1:len)=in(1:numData,index(1:len)) */  /*        out(1:numData,1:len)=in(1:numData,index(1:len)) */
61    
62  void Finley_Util_Gather_int(int len,maybelong* index,int numData, maybelong* in, maybelong * out){  void Finley_Util_Gather_int(dim_t len,index_t* index,dim_t numData, index_t* in, index_t * out){
63      int s,i;      dim_t s,i;
64      for (s=0;s<len;s++) {      for (s=0;s<len;s++) {
65         for (i=0;i<numData;i++) {         for (i=0;i<numData;i++) {
66            out[INDEX2(i,s,numData)]=in[INDEX2(i,index[s],numData)];            out[INDEX2(i,s,numData)]=in[INDEX2(i,index[s],numData)];
# Line 51  void Finley_Util_Gather_int(int len,mayb Line 72  void Finley_Util_Gather_int(int len,mayb
72    
73  /*   adds a vector in into out using and index. */  /*   adds a vector in into out using and index. */
74    
75  /*        out(1:numData,index(1:len))+=in(1:numData,1:len) */  /*        out(1:numData,index[p])+=in(1:numData,p) where p = {k=1...len , index[k]<upperBound}*/
76    
77  void Finley_Util_AddScatter(int len,maybelong* index,int numData,double* in,double * out){  
78     int i,s;  void Finley_Util_AddScatter(dim_t len,index_t* index,dim_t numData,double* in,double * out, index_t upperBound){
79       dim_t i,s;
80     for (s=0;s<len;s++) {     for (s=0;s<len;s++) {
81         for(i=0;i<numData;i++) {         for(i=0;i<numData;i++) {
82            #pragma omp atomic            if( index[s]<upperBound ) {
83            out[INDEX2(i,index[s],numData)]+=in[INDEX2(i,s,numData)];              #pragma omp atomic
84                out[INDEX2(i,index[s],numData)]+=in[INDEX2(i,s,numData)];
85          }
86         }         }
87     }     }
88  }  }
# Line 67  void Finley_Util_AddScatter(int len,mayb Line 91  void Finley_Util_AddScatter(int len,mayb
91    
92  /*          A(1:A1,1:A2)=B(1:A1,1:B2)*C(1:B2,1:A2) */  /*          A(1:A1,1:A2)=B(1:A1,1:B2)*C(1:B2,1:A2) */
93    
94  void Finley_Util_SmallMatMult(int A1,int A2, double* A, int B2, double*B, double* C) {  void Finley_Util_SmallMatMult(dim_t A1,dim_t A2, double* A, dim_t B2, double*B, double* C) {
95      int i,j,s;      dim_t i,j,s;
96      for (i=0;i<A1*A2;i++) A[i]=0;      for (i=0;i<A1*A2;i++) A[i]=0;
97         for (i=0;i<A1;i++) {         for (i=0;i<A1;i++) {
98            for (j=0;j<A2;j++) {            for (j=0;j<A2;j++) {
# Line 83  void Finley_Util_SmallMatMult(int A1,int Line 107  void Finley_Util_SmallMatMult(int A1,int
107    
108  /*        A(1:A1,1:A2,i)=B(1:A1,1:B2,i)*C(1:B2,1:A2,i) i=1,len */  /*        A(1:A1,1:A2,i)=B(1:A1,1:B2,i)*C(1:B2,1:A2,i) i=1,len */
109    
110  void Finley_Util_SmallMatSetMult(int len,int A1,int A2, double* A, int B2, double*B, double* C) {  void Finley_Util_SmallMatSetMult(dim_t len,dim_t A1,dim_t A2, double* A, dim_t B2, double*B, double* C) {
111      int q,i,j,s;      dim_t q,i,j,s;
112      for (i=0;i<A1*A2*len;i++) A[i]=0;      for (i=0;i<A1*A2*len;i++) A[i]=0;
113      for (q=0;q<len;q++) {      for (q=0;q<len;q++) {
114         for (i=0;i<A1;i++) {         for (i=0;i<A1;i++) {
# Line 96  void Finley_Util_SmallMatSetMult(int len Line 120  void Finley_Util_SmallMatSetMult(int len
120         }         }
121      }      }
122  }  }
   
123  /*    inverts the set of dim x dim matrices A(:,:,1:len) with dim=1,2,3 */  /*    inverts the set of dim x dim matrices A(:,:,1:len) with dim=1,2,3 */
124  /*    the determinante is returned. */  /*    the determinante is returned. */
125    
126  void Finley_Util_InvertSmallMat(int len,int dim,double* A,double *invA, double* det){  void Finley_Util_InvertSmallMat(dim_t len,dim_t dim,double* A,double *invA, double* det){
127     int q;     dim_t q;
128     double D,A11,A12,A13,A21,A22,A23,A31,A32,A33;     register double D,A11,A12,A13,A21,A22,A23,A31,A32,A33;
129    
130     switch(dim) {     switch(dim) {
131        case 1:        case 1:
132           for (q=0;q<len;q++) {           for (q=0;q<len;q++) {
133              D=A[INDEX3(0,0,q,dim,dim)];              D=A[q];
134              if (D == 0 ){              if (ABS(D) > 0 ){
135                 Finley_ErrorCode=ZERO_DIVISION_ERROR;                 det[q]=D;
136                 sprintf(Finley_ErrorMsg,"Non-regular matrix");                 D=1./D;
137                   invA[q]=D;
138                } else {
139                   Finley_setError(ZERO_DIVISION_ERROR,"__FILE__: Non-regular matrix");
140                 return;                 return;
141              }              }
             det[q]=D;  
             D=1./D;  
             invA[INDEX3(0,0,q,dim,dim)]=D;  
142           }           }
143           break;           break;
144    
145        case 2:        case 2:
146           for (q=0;q<len;q++) {           for (q=0;q<len;q++) {
147              A11=A[INDEX3(0,0,q,dim,dim)];              A11=A[INDEX3(0,0,q,2,2)];
148              A12=A[INDEX3(0,1,q,dim,dim)];              A12=A[INDEX3(0,1,q,2,2)];
149              A21=A[INDEX3(1,0,q,dim,dim)];              A21=A[INDEX3(1,0,q,2,2)];
150              A22=A[INDEX3(1,1,q,dim,dim)];              A22=A[INDEX3(1,1,q,2,2)];
151    
152              D = A11*A22-A12*A21;              D = A11*A22-A12*A21;
153              if (D == 0 ){              if (ABS(D) > 0 ){
154                 Finley_ErrorCode=ZERO_DIVISION_ERROR;                 det[q]=D;
155                 sprintf(Finley_ErrorMsg,"Non-regular matrix");                 D=1./D;
156                   invA[INDEX3(0,0,q,2,2)]= A22*D;
157                   invA[INDEX3(1,0,q,2,2)]=-A21*D;
158                   invA[INDEX3(0,1,q,2,2)]=-A12*D;
159                   invA[INDEX3(1,1,q,2,2)]= A11*D;
160                } else {
161                   Finley_setError(ZERO_DIVISION_ERROR,"__FILE__: Non-regular matrix");
162                 return;                 return;
163              }              }
             det[q]=D;  
             D=1./D;  
             invA[INDEX3(0,0,q,dim,dim)]= A22*D;  
             invA[INDEX3(1,0,q,dim,dim)]=-A21*D;  
             invA[INDEX3(0,1,q,dim,dim)]=-A12*D;  
             invA[INDEX3(1,1,q,dim,dim)]= A11*D;  
164           }           }
165           break;           break;
166    
167        case 3:        case 3:
168       for (q=0;q<len;q++) {       for (q=0;q<len;q++) {
169              A11=A[INDEX3(0,0,q,dim,dim)];              A11=A[INDEX3(0,0,q,3,3)];
170              A21=A[INDEX3(1,0,q,dim,dim)];              A21=A[INDEX3(1,0,q,3,3)];
171              A31=A[INDEX3(2,0,q,dim,dim)];              A31=A[INDEX3(2,0,q,3,3)];
172              A12=A[INDEX3(0,1,q,dim,dim)];              A12=A[INDEX3(0,1,q,3,3)];
173              A22=A[INDEX3(1,1,q,dim,dim)];              A22=A[INDEX3(1,1,q,3,3)];
174              A32=A[INDEX3(2,1,q,dim,dim)];              A32=A[INDEX3(2,1,q,3,3)];
175              A13=A[INDEX3(0,2,q,dim,dim)];              A13=A[INDEX3(0,2,q,3,3)];
176              A23=A[INDEX3(1,2,q,dim,dim)];              A23=A[INDEX3(1,2,q,3,3)];
177              A33=A[INDEX3(2,2,q,dim,dim)];              A33=A[INDEX3(2,2,q,3,3)];
178    
179              D  =  A11*(A22*A33-A23*A32)+ A12*(A31*A23-A21*A33)+A13*(A21*A32-A31*A22);              D  =  A11*(A22*A33-A23*A32)+ A12*(A31*A23-A21*A33)+A13*(A21*A32-A31*A22);
180              if (D == 0 ){              if (ABS(D) > 0 ){
181                 Finley_ErrorCode=ZERO_DIVISION_ERROR;                 det[q]    =D;
182                 sprintf(Finley_ErrorMsg,"Non-regular matrix");                 D=1./D;
183                   invA[INDEX3(0,0,q,3,3)]=(A22*A33-A23*A32)*D;
184                   invA[INDEX3(1,0,q,3,3)]=(A31*A23-A21*A33)*D;
185                   invA[INDEX3(2,0,q,3,3)]=(A21*A32-A31*A22)*D;
186                   invA[INDEX3(0,1,q,3,3)]=(A13*A32-A12*A33)*D;
187                   invA[INDEX3(1,1,q,3,3)]=(A11*A33-A31*A13)*D;
188                   invA[INDEX3(2,1,q,3,3)]=(A12*A31-A11*A32)*D;
189                   invA[INDEX3(0,2,q,3,3)]=(A12*A23-A13*A22)*D;
190                   invA[INDEX3(1,2,q,3,3)]=(A13*A21-A11*A23)*D;
191                   invA[INDEX3(2,2,q,3,3)]=(A11*A22-A12*A21)*D;
192                } else {
193                   Finley_setError(ZERO_DIVISION_ERROR,"__FILE__: Non-regular matrix");
194                 return;                 return;
195              }              }
             det[q]    =D;  
             D=1./D;  
             invA[INDEX3(0,0,q,dim,dim)]=(A22*A33-A23*A32)*D;  
             invA[INDEX3(1,0,q,dim,dim)]=(A31*A23-A21*A33)*D;  
             invA[INDEX3(2,0,q,dim,dim)]=(A21*A32-A31*A22)*D;  
             invA[INDEX3(0,1,q,dim,dim)]=(A13*A32-A12*A33)*D;  
             invA[INDEX3(1,1,q,dim,dim)]=(A11*A33-A31*A13)*D;  
             invA[INDEX3(2,1,q,dim,dim)]=(A12*A31-A11*A32)*D;  
             invA[INDEX3(0,2,q,dim,dim)]=(A12*A23-A13*A22)*D;  
             invA[INDEX3(1,2,q,dim,dim)]=(A13*A21-A11*A23)*D;  
             invA[INDEX3(2,2,q,dim,dim)]=(A11*A22-A12*A21)*D;  
196           }           }
197           break;           break;
198    
# Line 179  void Finley_Util_InvertSmallMat(int len, Line 202  void Finley_Util_InvertSmallMat(int len,
202    
203  /*    sets the derterminate of a set of dim x dim matrices A(:,:,1:len) with dim=1,2,3 */  /*    sets the derterminate of a set of dim x dim matrices A(:,:,1:len) with dim=1,2,3 */
204    
205  void Finley_Util_DetOfSmallMat(int len,int dim,double* A, double* det){  void Finley_Util_DetOfSmallMat(dim_t len,dim_t dim,double* A, double* det){
206     int q;     dim_t q;
207     double A11,A12,A13,A21,A22,A23,A31,A32,A33;     register double A11,A12,A13,A21,A22,A23,A31,A32,A33;
208    
209     switch(dim) {     switch(dim) {
210        case 1:        case 1:
211           for (q=0;q<len;q++) {           for (q=0;q<len;q++) {
212              det[q]=A[INDEX3(0,0,q,dim,dim)];              det[q]=A[q];
213           }           }
214           break;           break;
215    
216        case 2:        case 2:
217           for (q=0;q<len;q++) {           for (q=0;q<len;q++) {
218              A11=A[INDEX3(0,0,q,dim,dim)];              A11=A[INDEX3(0,0,q,2,2)];
219              A12=A[INDEX3(0,1,q,dim,dim)];              A12=A[INDEX3(0,1,q,2,2)];
220              A21=A[INDEX3(1,0,q,dim,dim)];              A21=A[INDEX3(1,0,q,2,2)];
221              A22=A[INDEX3(1,1,q,dim,dim)];              A22=A[INDEX3(1,1,q,2,2)];
222    
223              det[q] = A11*A22-A12*A21;              det[q] = A11*A22-A12*A21;
224           }           }
# Line 203  void Finley_Util_DetOfSmallMat(int len,i Line 226  void Finley_Util_DetOfSmallMat(int len,i
226    
227        case 3:        case 3:
228       for (q=0;q<len;q++) {       for (q=0;q<len;q++) {
229              A11=A[INDEX3(0,0,q,dim,dim)];              A11=A[INDEX3(0,0,q,3,3)];
230              A21=A[INDEX3(1,0,q,dim,dim)];              A21=A[INDEX3(1,0,q,3,3)];
231              A31=A[INDEX3(2,0,q,dim,dim)];              A31=A[INDEX3(2,0,q,3,3)];
232              A12=A[INDEX3(0,1,q,dim,dim)];              A12=A[INDEX3(0,1,q,3,3)];
233              A22=A[INDEX3(1,1,q,dim,dim)];              A22=A[INDEX3(1,1,q,3,3)];
234              A32=A[INDEX3(2,1,q,dim,dim)];              A32=A[INDEX3(2,1,q,3,3)];
235              A13=A[INDEX3(0,2,q,dim,dim)];              A13=A[INDEX3(0,2,q,3,3)];
236              A23=A[INDEX3(1,2,q,dim,dim)];              A23=A[INDEX3(1,2,q,3,3)];
237              A33=A[INDEX3(2,2,q,dim,dim)];              A33=A[INDEX3(2,2,q,3,3)];
238    
239              det[q]  =  A11*(A22*A33-A23*A32)+ A12*(A31*A23-A21*A33)+A13*(A21*A32-A31*A22);              det[q]  =  A11*(A22*A33-A23*A32)+ A12*(A31*A23-A21*A33)+A13*(A21*A32-A31*A22);
240           }           }
# Line 223  void Finley_Util_DetOfSmallMat(int len,i Line 246  void Finley_Util_DetOfSmallMat(int len,i
246  /*    returns the normalized vector Normal[dim,len] orthogonal to A(:,0,q) and A(:,1,q) in the case of dim=3  */  /*    returns the normalized vector Normal[dim,len] orthogonal to A(:,0,q) and A(:,1,q) in the case of dim=3  */
247  /*    or the vector A(:,0,q) in the case of dim=2                                             */  /*    or the vector A(:,0,q) in the case of dim=2                                             */
248    
249  void  Finley_NormalVector(int len, int dim, int dim1, double* A,double* Normal) {  void  Finley_NormalVector(dim_t len, dim_t dim, dim_t dim1, double* A,double* Normal) {
250     int q;     dim_t q;
251     double A11,A12,CO_A13,A21,A22,CO_A23,A31,A32,CO_A33,length,invlength;     register double A11,A12,CO_A13,A21,A22,CO_A23,A31,A32,CO_A33,length,invlength;
252    
253     switch(dim) {     switch(dim) {
254        case 1:        case 1:
255           for (q=0;q<len;q++) Normal[INDEX1(q)]    =1;           for (q=0;q<len;q++) Normal[q]    =1;
256           break;           break;
257        case 2:        case 2:
258           for (q=0;q<len;q++) {           for (q=0;q<len;q++) {
259              A11=A[INDEX3(0,0,q,dim,dim1)];              A11=A[INDEX3(0,0,q,2,dim1)];
260              A21=A[INDEX3(1,0,q,dim,dim1)];              A21=A[INDEX3(1,0,q,2,dim1)];
261              length = sqrt(A11*A11+A21*A21);              length = sqrt(A11*A11+A21*A21);
262              if (! length>0) {              if (! length>0) {
263                 Finley_ErrorCode=ZERO_DIVISION_ERROR;                 Finley_setError(ZERO_DIVISION_ERROR,"__FILE__: area equals zero.");
                sprintf(Finley_ErrorMsg,"area equals zero.");  
264                 return;                 return;
265              } else {              } else {
266                 invlength=1./length;                 invlength=1./length;
267                 Normal[INDEX2(0,q,dim)]=A21*invlength;                 Normal[INDEX2(0,q,2)]=A21*invlength;
268                 Normal[INDEX2(1,q,dim)]=-A11*invlength;                 Normal[INDEX2(1,q,2)]=-A11*invlength;
269              }              }
270           }           }
271           break;           break;
272        case 3:        case 3:
273           for (q=0;q<len;q++) {           for (q=0;q<len;q++) {
274              A11=A[INDEX3(0,0,q,dim,dim1)];              A11=A[INDEX3(0,0,q,3,dim1)];
275              A21=A[INDEX3(1,0,q,dim,dim1)];              A21=A[INDEX3(1,0,q,3,dim1)];
276              A31=A[INDEX3(2,0,q,dim,dim1)];              A31=A[INDEX3(2,0,q,3,dim1)];
277              A12=A[INDEX3(0,1,q,dim,dim1)];              A12=A[INDEX3(0,1,q,3,dim1)];
278              A22=A[INDEX3(1,1,q,dim,dim1)];              A22=A[INDEX3(1,1,q,3,dim1)];
279              A32=A[INDEX3(2,1,q,dim,dim1)];              A32=A[INDEX3(2,1,q,3,dim1)];
280              CO_A13=A21*A32-A31*A22;              CO_A13=A21*A32-A31*A22;
281              CO_A23=A31*A12-A11*A32;              CO_A23=A31*A12-A11*A32;
282              CO_A33=A11*A22-A21*A12;              CO_A33=A11*A22-A21*A12;
283              length=sqrt(CO_A13*CO_A13+CO_A23*CO_A23+CO_A33*CO_A33);              length=sqrt(CO_A13*CO_A13+CO_A23*CO_A23+CO_A33*CO_A33);
284              if (! length>0) {              if (! length>0) {
285                 Finley_ErrorCode=ZERO_DIVISION_ERROR;                 Finley_setError(ZERO_DIVISION_ERROR,"__FILE__: area equals zero.");
                sprintf(Finley_ErrorMsg,"area equals zero.");  
286                 return;                 return;
287              } else {              } else {
288                 invlength=1./length;                 invlength=1./length;
289                 Normal[INDEX2(0,q,dim)]=CO_A13*invlength;                 Normal[INDEX2(0,q,3)]=CO_A13*invlength;
290                 Normal[INDEX2(1,q,dim)]=CO_A23*invlength;                 Normal[INDEX2(1,q,3)]=CO_A23*invlength;
291                 Normal[INDEX2(2,q,dim)]=CO_A33*invlength;                 Normal[INDEX2(2,q,3)]=CO_A33*invlength;
292             }             }
293                            
294        }        }
# Line 280  void  Finley_NormalVector(int len, int d Line 301  void  Finley_NormalVector(int len, int d
301  /*    return the length of the vector which is orthogonal to the vectors A(:,0,q) and A(:,1,q) in the case of dim=3 */  /*    return the length of the vector which is orthogonal to the vectors A(:,0,q) and A(:,1,q) in the case of dim=3 */
302  /*    or the vector A(:,0,q) in the case of dim=2                                                                   */  /*    or the vector A(:,0,q) in the case of dim=2                                                                   */
303    
304  void  Finley_LengthOfNormalVector(int len, int dim, int dim1, double* A,double* length) {  void  Finley_LengthOfNormalVector(dim_t len, dim_t dim, dim_t dim1, double* A,double* length) {
305     int q;     dim_t q;
306     double A11,A12,CO_A13,A21,A22,CO_A23,A31,A32,CO_A33;     double A11,A12,CO_A13,A21,A22,CO_A23,A31,A32,CO_A33;
307    
308     switch(dim) {     switch(dim) {
309        case 1:        case 1:
310           for (q=0;q<len;q++) length[INDEX1(q)]    =1;           for (q=0;q<len;q++) length[q]    =1;
311           break;           break;
312        case 2:        case 2:
313           for (q=0;q<len;q++) {           for (q=0;q<len;q++) {
314              A11=A[INDEX3(0,0,q,dim,dim1)];              A11=A[INDEX3(0,0,q,2,dim1)];
315              A21=A[INDEX3(1,0,q,dim,dim1)];              A21=A[INDEX3(1,0,q,2,dim1)];
316              length[q] = sqrt(A11*A11+A21*A21);              length[q] = sqrt(A11*A11+A21*A21);
317           }           }
318           break;           break;
319        case 3:        case 3:
320           for (q=0;q<len;q++) {           for (q=0;q<len;q++) {
321              A11=A[INDEX3(0,0,q,dim,dim1)];              A11=A[INDEX3(0,0,q,3,dim1)];
322              A21=A[INDEX3(1,0,q,dim,dim1)];              A21=A[INDEX3(1,0,q,3,dim1)];
323              A31=A[INDEX3(2,0,q,dim,dim1)];              A31=A[INDEX3(2,0,q,3,dim1)];
324              A12=A[INDEX3(0,1,q,dim,dim1)];              A12=A[INDEX3(0,1,q,3,dim1)];
325              A22=A[INDEX3(1,1,q,dim,dim1)];              A22=A[INDEX3(1,1,q,3,dim1)];
326              A32=A[INDEX3(2,1,q,dim,dim1)];              A32=A[INDEX3(2,1,q,3,dim1)];
327              CO_A13=A21*A32-A31*A22;              CO_A13=A21*A32-A31*A22;
328              CO_A23=A31*A12-A11*A32;              CO_A23=A31*A12-A11*A32;
329              CO_A33=A11*A22-A21*A12;              CO_A33=A11*A22-A21*A12;
# Line 318  void  Finley_LengthOfNormalVector(int le Line 339  void  Finley_LengthOfNormalVector(int le
339  /* there is no range checking! */  /* there is no range checking! */
340  /* at output Map[invMap[i]]=i for i=0:lenInvMap */  /* at output Map[invMap[i]]=i for i=0:lenInvMap */
341    
342  void Finley_Util_InvertMap(int lenInvMap, maybelong* invMap,int lenMap, maybelong* Map) {  void Finley_Util_InvertMap(dim_t lenInvMap, index_t* invMap,dim_t lenMap, index_t* Map) {
343     int i;     dim_t i;
344     for (i=0;i<lenInvMap;i++) invMap[i]=0;     for (i=0;i<lenInvMap;i++) invMap[i]=0;
345     for (i=0;i<lenMap;i++) {     for (i=0;i<lenMap;i++) {
346        if (Map[i]>=0) invMap[Map[i]]=i;        if (Map[i]>=0) invMap[Map[i]]=i;
# Line 335  int Finley_Util_ValueAndIndex_compar(con Line 356  int Finley_Util_ValueAndIndex_compar(con
356     e2=(Finley_Util_ValueAndIndex*) arg2;     e2=(Finley_Util_ValueAndIndex*) arg2;
357     if (e1->value < e2->value) return -1;     if (e1->value < e2->value) return -1;
358     if (e1->value > e2->value) return  1;     if (e1->value > e2->value) return  1;
359       if (e1->index < e2->index) return -1;
360       if (e1->index > e2->index) return  1;
361     return 0;     return 0;
362  }  }
363  void Finley_Util_sortValueAndIndex(int n,Finley_Util_ValueAndIndex* array) {  
364    void Finley_Util_sortValueAndIndex(dim_t n,Finley_Util_ValueAndIndex* array) {
365       /* OMP : needs parallelization !*/       /* OMP : needs parallelization !*/
366       qsort(array,n,sizeof(Finley_Util_ValueAndIndex),Finley_Util_ValueAndIndex_compar);       qsort(array,n,sizeof(Finley_Util_ValueAndIndex),Finley_Util_ValueAndIndex_compar);
367  }  }
# Line 347  void Finley_Util_sortValueAndIndex(int n Line 371  void Finley_Util_sortValueAndIndex(int n
371    
372  /* calculates the minimum value from a dim X N integer array */  /* calculates the minimum value from a dim X N integer array */
373    
374  maybelong Finley_Util_getMinInt(int dim,int N,maybelong* values) {  index_t Finley_Util_getMinInt(dim_t dim,dim_t N,index_t* values) {
375     maybelong i,j,out;     dim_t i,j;
376     out=MAYBELONG_MAX;     index_t out,out_local;
377       out=INDEX_T_MAX;
378     if (values!=NULL && dim*N>0 ) {     if (values!=NULL && dim*N>0 ) {
      /* OMP */  
379       out=values[0];       out=values[0];
380       for (j=0;j<N;j++) {       #pragma omp parallel private(out_local)
381         for (i=0;i<dim;i++) out=MIN(out,values[INDEX2(i,j,dim)]);       {
382             out_local=out;
383             #pragma omp for private(i,j) schedule(static)
384             for (j=0;j<N;j++) {
385               for (i=0;i<dim;i++) out_local=MIN(out_local,values[INDEX2(i,j,dim)]);
386             }
387             #pragma omp critical
388             out=MIN(out_local,out);
389       }       }
390     }     }
391     return out;     return out;
# Line 362  maybelong Finley_Util_getMinInt(int dim, Line 393  maybelong Finley_Util_getMinInt(int dim,
393                                                                                                                                                                                                                                                                                                        
394  /* calculates the maximum value from a dim X N integer array */  /* calculates the maximum value from a dim X N integer array */
395    
396  maybelong Finley_Util_getMaxInt(int dim,int N,maybelong* values) {  index_t Finley_Util_getMaxInt(dim_t dim,dim_t N,index_t* values) {
397     maybelong i,j,out;     dim_t i,j;
398     out=-MAYBELONG_MAX;     index_t out,out_local;
399       out=-INDEX_T_MAX;
400     if (values!=NULL && dim*N>0 ) {     if (values!=NULL && dim*N>0 ) {
      /* OMP */  
401       out=values[0];       out=values[0];
402       for (j=0;j<N;j++) {       #pragma omp parallel private(out_local)
403         for (i=0;i<dim;i++) out=MAX(out,values[INDEX2(i,j,dim)]);       {
404       }           out_local=out;
405             #pragma omp for private(i,j) schedule(static)
406             for (j=0;j<N;j++) {
407                 for (i=0;i<dim;i++) out_local=MAX(out_local,values[INDEX2(i,j,dim)]);
408             }
409             #pragma omp critical
410             out=MAX(out_local,out);
411          }
412     }     }
413     return out;     return out;
414  }  }
415    
416  /* set the index of the positive entries in mask. The length of index is returned. */  /* set the index of the positive entries in mask. The length of index is returned. */
417    
418  maybelong Finley_Util_packMask(maybelong N,maybelong* mask,maybelong* index) {  dim_t Finley_Util_packMask(dim_t N,index_t* mask,index_t* index) {
419        maybelong out,k;        dim_t out,k;
420        out=0;        out=0;
421        /*OMP */        /*OMP */
422        for (k=0;k<N;k++) {        for (k=0;k<N;k++) {
# Line 391  maybelong Finley_Util_packMask(maybelong Line 429  maybelong Finley_Util_packMask(maybelong
429  }  }
430    
431  /* returns true if array contains value */  /* returns true if array contains value */
432  int Finley_Util_isAny(maybelong N,maybelong* array,maybelong value) {  bool_t Finley_Util_isAny(dim_t N,index_t* array,index_t value) {
433     int out=FALSE;     bool_t out=FALSE;
434     maybelong i;     dim_t i;
435     #pragma omp parallel for private(i) schedule(static) reduction(||:out)     #pragma omp parallel for private(i) schedule(static) reduction(||:out)
436     for (i=0;i<N;i++) out=out || (array[i]==value);     for (i=0;i<N;i++) out = out || (array[i]==value);
437       return out;
438    }
439    /* calculates the cummultative sum in array and returns the total sum */
440    index_t Finley_Util_cumsum(dim_t N,index_t* array) {
441       index_t out=0,tmp;
442       dim_t i;
443       #ifdef _OPENMP
444          index_t partial_sums[omp_get_max_threads()],sum;
445          #pragma omp parallel private(sum,i,tmp)
446          {
447            sum=0;
448            #pragma omp for schedule(static)
449            for (i=0;i<N;++i) sum+=array[i];
450            partial_sums[omp_get_thread_num()]=sum;
451            #pragma omp barrier
452            #pragma omp master
453            {
454              out=0;
455              for (i=0;i<omp_get_max_threads();++i) {
456                 tmp=out;
457                 out+=partial_sums[i];
458                 partial_sums[i]=tmp;
459               }
460            }
461            #pragma omp barrier
462            sum=partial_sums[omp_get_thread_num()];
463            #pragma omp for schedule(static)
464            for (i=0;i<N;++i) {
465              tmp=sum;
466              sum+=array[i];
467              array[i]=tmp;
468            }
469          }
470       #else
471          for (i=0;i<N;++i) {
472             tmp=out;
473             out+=array[i];
474             array[i]=tmp;
475          }
476       #endif
477     return out;     return out;
478  }  }
479    
480  void Finley_copyDouble(int n,double* source, double* target) {  void Finley_copyDouble(dim_t n,double* source, double* target) {
481    int i;    dim_t i;
482    for (i=0;i<n;i++) target[i]=source[i];    for (i=0;i<n;i++) target[i]=source[i];
483  }  }
484    
485    #ifdef PASO_MPI
486    void Finley_printDoubleArray( FILE *fid, dim_t n, double *array, char *name  )
487    {
488      index_t i;
489      
490      if( name )
491        fprintf( fid, "%s [ ", name );
492      else
493        fprintf( fid, "[ " );  
494      for( i=0; i<(n<60 ? n : 60); i++ )
495        fprintf( fid, "%g ", array[i] );
496      if( n>=30 )
497        fprintf( fid, "... " );
498      fprintf( fid, "]\n" );
499    }
500    void Finley_printIntArray( FILE *fid, dim_t n, int *array, char *name  )
501    {
502      index_t i;
503      
504      if( name )
505        fprintf( fid, "%s [ ", name );
506      else
507        fprintf( fid, "[ " );  
508      for( i=0; i<(n<60 ? n : 60); i++ )
509        fprintf( fid, "%d ", array[i] );
510      if( n>=30 )
511        fprintf( fid, "... " );
512      fprintf( fid, "]\n" );
513    }
514    void Finley_printMaskArray( FILE *fid, dim_t n, int *array, char *name  )
515    {
516      index_t i;
517      
518      if( name )
519        fprintf( fid, "%s [ ", name );
520      else
521        fprintf( fid, "[ " );  
522      for( i=0; i<(n<60 ? n : 60); i++ )
523        if( array[i]!=-1 )
524          fprintf( fid, "%3d ", array[i] );
525        else
526          fprintf( fid, "  * " );
527      if( n>=30 )
528        fprintf( fid, "... " );
529      fprintf( fid, "]\n" );
530    }
531    #endif
532    
533  /*  /*
534   * $Log$   * Revision 1.8  2005/08/12 01:45:43  jgs
535   * Revision 1.3  2004/12/15 03:48:47  jgs   *
536   * *** empty log message ***   * Revision 1.7.2.2  2005/09/07 06:26:22  gross
537     * the solver from finley are put into the standalone package paso now
538     *
539     * Revision 1.7.2.1  2005/08/04 22:41:11  gross
540     * some extra routines for finley that might speed-up RHS assembling in some cases (not actived right now)
541     *
542     * Revision 1.7  2005/07/08 04:07:59  jgs
543     * Merge of development branch back to main trunk on 2005-07-08
544     *
545     * Revision 1.1.1.1.2.4  2005/06/29 02:34:57  gross
546     * some changes towards 64 integers in finley
547     *
548     * Revision 1.1.1.1.2.3  2005/03/02 23:35:06  gross
549     * reimplementation of the ILU in Finley. block size>1 still needs some testing
550     *
551     * Revision 1.1.1.1.2.2  2005/02/18 02:27:31  gross
552     * two function that will be used for a reimplementation of the ILU preconditioner
553     *
554     * Revision 1.1.1.1.2.1  2004/11/12 06:58:19  gross
555     * a lot of changes to get the linearPDE class running: most important change is that there is no matrix format exposed to the user anymore. the format is chosen by the Domain according to the solver and symmetry
556   *   *
557   * Revision 1.1.1.1  2004/10/26 06:53:57  jgs   * Revision 1.1.1.1  2004/10/26 06:53:57  jgs
558   * initial import of project esys2   * initial import of project esys2

Legend:
Removed from v.100  
changed lines
  Added in v.888

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.26