/[escript]/branches/doubleplusgood/dudley/src/Assemble_PDE_Single2_1D.cpp
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Diff of /branches/doubleplusgood/dudley/src/Assemble_PDE_Single2_1D.cpp

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temp/finley/src/Assemble_PDE_Single2_1D.c revision 1387 by trankine, Fri Jan 11 07:45:26 2008 UTC trunk/dudley/src/Assemble_PDE_Single2_1D.c revision 3911 by jfenwick, Thu Jun 14 01:01:03 2012 UTC
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1    
 /* $Id$ */  
   
2  /*******************************************************  /*******************************************************
3   *  *
4   *           Copyright 2003-2007 by ACceSS MNRF  * Copyright (c) 2003-2012 by University of Queensland
5   *       Copyright 2007 by University of Queensland  * Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)
6   *  * http://www.uq.edu.au/esscc
7   *                http://esscc.uq.edu.au  *
8   *        Primary Business: Queensland, Australia  * Primary Business: Queensland, Australia
9   *  Licensed under the Open Software License version 3.0  * Licensed under the Open Software License version 3.0
10   *     http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php  * http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php
11   *  *
12   *******************************************************/  *******************************************************/
13    
14  /**************************************************************/  /**************************************************************/
15    
16  /*    assembles the system of numEq PDEs into the stiffness matrix S right hand side F  */  /*    assembles the system of numEq PDEs into the stiffness matrix S right hand side F  */
17  /*    the shape functions for test and solution must be identical */  /*    the shape functions for test and solution must be identical */
18    
   
19  /*      -(A_{i,j} u_,j)_i-(B_{i} u)_i+C_{j} u_,j-D u_m  and -(X_,i)_i + Y */  /*      -(A_{i,j} u_,j)_i-(B_{i} u)_i+C_{j} u_,j-D u_m  and -(X_,i)_i + Y */
20    
21  /*    in a 1D domain. The shape functions for test and solution must be identical  */  /*    in a 1D domain. The shape functions for test and solution must be identical  */
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30  /*      X = 1  */  /*      X = 1  */
31  /*      Y = scalar   */  /*      Y = scalar   */
32    
   
33  /**************************************************************/  /**************************************************************/
34    
   
35  #include "Assemble.h"  #include "Assemble.h"
36  #include "Util.h"  #include "Util.h"
37  #ifdef _OPENMP  #ifdef _OPENMP
38  #include <omp.h>  #include <omp.h>
39  #endif  #endif
40    
   
41  /**************************************************************/  /**************************************************************/
42    
43  void  Finley_Assemble_PDE_Single2_1D(Assemble_Parameters p, Finley_ElementFile* elements,  void Dudley_Assemble_PDE_Single2_1D(Dudley_Assemble_Parameters p, Dudley_ElementFile * elements,
44                                       Paso_SystemMatrix* Mat, escriptDataC* F,                      Paso_SystemMatrix * Mat, escriptDataC * F,
45                                       escriptDataC* A, escriptDataC* B, escriptDataC* C, escriptDataC* D, escriptDataC* X, escriptDataC* Y) {                      escriptDataC * A, escriptDataC * B, escriptDataC * C, escriptDataC * D,
46                        escriptDataC * X, escriptDataC * Y)
47    {
48    
49      #define DIM 1  #define DIM 1
50      index_t color;      index_t color;
51      dim_t e;      dim_t e;
52      double *EM_S, *EM_F, *Vol, *DSDX, *A_p, *B_p, *C_p, *D_p, *X_p, *Y_p;      __const double *A_p, *B_p, *C_p, *D_p, *X_p, *Y_p, *A_q, *B_q, *C_q, *D_q, *X_q, *Y_q;
53        double *EM_S, *EM_F, *DSDX;
54      index_t *row_index;      index_t *row_index;
55      register dim_t q, s,r;      register dim_t q, s, r;
56      register double rtmp;      register double rtmp;
57      bool_t add_EM_F, add_EM_S;      bool_t add_EM_F, add_EM_S;
58    
59      bool_t extendedA=isExpanded(A);      bool_t extendedA = isExpanded(A);
60      bool_t extendedB=isExpanded(B);      bool_t extendedB = isExpanded(B);
61      bool_t extendedC=isExpanded(C);      bool_t extendedC = isExpanded(C);
62      bool_t extendedD=isExpanded(D);      bool_t extendedD = isExpanded(D);
63      bool_t extendedX=isExpanded(X);      bool_t extendedX = isExpanded(X);
64      bool_t extendedY=isExpanded(Y);      bool_t extendedY = isExpanded(Y);
65      double *F_p=getSampleData(F,0);      double *F_p = (requireWrite(F), getSampleDataRW(F, 0)); /* use comma, to get around the mixed code and declarations thing */
66      double *S=p.row_jac->ReferenceElement->S;      double *S = p.row_jac->BasisFunctions->S;
67      dim_t len_EM_S=p.row_NN*p.col_NN;      dim_t len_EM_S = p.row_numShapesTotal * p.row_numShapesTotal;
68      dim_t len_EM_F=p.row_NN;      dim_t len_EM_F = p.row_numShapesTotal;
   
69    
70      #pragma omp parallel private(color, EM_S, EM_F, Vol, DSDX, A_p, B_p, C_p, D_p, X_p, Y_p, row_index, q, s,r,rtmp,add_EM_F, add_EM_S)  #pragma omp parallel private(color, EM_S, EM_F, Vol, DSDX, A_p, B_p, C_p, D_p, X_p, Y_p, A_q, B_q, C_q, D_q, X_q, Y_q, row_index, q, s,r,rtmp,add_EM_F, add_EM_S)
71      {      {
72         EM_S=THREAD_MEMALLOC(len_EM_S,double);      EM_S = THREAD_MEMALLOC(len_EM_S, double);
73         EM_F=THREAD_MEMALLOC(len_EM_F,double);      EM_F = THREAD_MEMALLOC(len_EM_F, double);
74         row_index=THREAD_MEMALLOC(p.row_NN,index_t);      row_index = THREAD_MEMALLOC(p.row_numShapesTotal, index_t);
75    
76         if (!Finley_checkPtr(EM_S) && !Finley_checkPtr(EM_F) && !Finley_checkPtr(row_index) ) {      if (!Dudley_checkPtr(EM_S) && !Dudley_checkPtr(EM_F) && !Dudley_checkPtr(row_index))
77        {
78            for (color=elements->minColor;color<=elements->maxColor;color++) {  
79               /*  open loop over all elements: */          for (color = elements->minColor; color <= elements->maxColor; color++)
80               #pragma omp for private(e) schedule(static)          {
81               for(e=0;e<elements->numElements;e++){          /*  open loop over all elements: */
82                  if (elements->Color[e]==color) {  #pragma omp for private(e) schedule(static)
83                     Vol=&(p.row_jac->volume[INDEX2(0,e,p.numQuad)]);          for (e = 0; e < elements->numElements; e++)
84                     DSDX=&(p.row_jac->DSDX[INDEX4(0,0,0,e,p.row_NN,DIM,p.numQuad)]);          {
85                     for (q=0;q<len_EM_S;++q) EM_S[q]=0;              if (elements->Color[e] == color)
86                     for (q=0;q<len_EM_F;++q) EM_F[q]=0;              {
87                     add_EM_F=FALSE;  
88                     add_EM_S=FALSE;              A_p = getSampleDataRO(A, e);
89                     /**************************************************************/              C_p = getSampleDataRO(C, e);
90                     /*   process A: */              B_p = getSampleDataRO(B, e);
91                     /**************************************************************/              D_p = getSampleDataRO(D, e);
92                     A_p=getSampleData(A,e);              X_p = getSampleDataRO(X, e);
93                     if (NULL!=A_p) {              Y_p = getSampleDataRO(Y, e);
94                        add_EM_S=TRUE;  
95                        if (extendedA) {              double vol = p.row_jac->absD[e] * p.row_jac->quadweight;
96                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {              DSDX = &(p.row_jac->DSDX[INDEX5(0, 0, 0, 0, e, p.row_numShapesTotal, DIM, p.numQuadTotal, 1)]);
97                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {              for (q = 0; q < len_EM_S; ++q)
98                                rtmp=0;                  EM_S[q] = 0;
99                                for (q=0;q<p.numQuad;q++) {              for (q = 0; q < len_EM_F; ++q)
100                                   rtmp+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX3(0,0,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];                  EM_F[q] = 0;
101                               }              add_EM_F = FALSE;
102                               EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;              add_EM_S = FALSE;
103                             }                /**************************************************************/
104                           }              /*   process A: */
105                        } else {                /**************************************************************/
106                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {              if (NULL != A_p)
107                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {              {
108                                 rtmp=0;                  add_EM_S = TRUE;
109                                 for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];                  if (extendedA)
110                                 EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp*A_p[INDEX2(0,0,DIM)];                  {
111                             }                  A_q = &(A_p[INDEX4(0, 0, 0, 0, DIM, DIM, p.numQuadTotal)]);
112                           }                  for (s = 0; s < p.row_numShapes; s++)
113                         }                  {
114                     }                      for (r = 0; r < p.row_numShapes; r++)
115                     /**************************************************************/                      {
116                     /*   process B: */                      rtmp = 0;
117                     /**************************************************************/                      for (q = 0; q < p.numQuadTotal; q++)
118                     B_p=getSampleData(B,e);                      {
119                     if (NULL!=B_p) {                          rtmp +=
120                        add_EM_S=TRUE;                          vol * DSDX[INDEX3(s, 0, q, p.row_numShapesTotal, DIM)] *
121                        if (extendedB) {                          A_q[INDEX3(0, 0, q, DIM, DIM)] *
122                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                          DSDX[INDEX3(r, 0, q, p.row_numShapesTotal, DIM)];
123                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                      }
124                               rtmp=0;                      EM_S[INDEX4(0, 0, s, r, p.numEqu, p.numComp, p.row_numShapesTotal)] += rtmp;
125                               for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                      }
126                                  rtmp+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*B_p[INDEX2(0,q,DIM)]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)];                  }
127                               }                  }
128                               EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;                  else
129                             }                  {
130                           }                  for (s = 0; s < p.row_numShapes; s++)
131                        } else {                  {
132                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                      for (r = 0; r < p.row_numShapes; r++)
133                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                      {
134                                 rtmp=0;                      rtmp = 0;
135                                 for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)];                      for (q = 0; q < p.numQuadTotal; q++)
136                                 EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp*B_p[0];                          rtmp +=
137                             }                          vol * DSDX[INDEX3(s, 0, q, p.row_numShapesTotal, DIM)] *
138                           }                          DSDX[INDEX3(r, 0, q, p.row_numShapesTotal, DIM)];
139                        }                      EM_S[INDEX4(0, 0, s, r, p.numEqu, p.numComp, p.row_numShapesTotal)] +=
140                     }                          rtmp * A_p[INDEX2(0, 0, DIM)];
141                     /**************************************************************/                      }
142                     /*   process C: */                  }
143                     /**************************************************************/                  }
144                     C_p=getSampleData(C,e);              }
145                     if (NULL!=C_p) {                /**************************************************************/
146                        add_EM_S=TRUE;              /*   process B: */
147                       if (extendedC) {                /**************************************************************/
148                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {              if (NULL != B_p)
149                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {              {
150                               rtmp=0;                  add_EM_S = TRUE;
151                               for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                  if (extendedB)
152                                  rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*C_p[INDEX2(0,q,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];                  {
153                               }                  B_q = &(B_p[INDEX3(0, 0, 0, DIM, p.numQuadTotal)]);
154                               EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;                  for (s = 0; s < p.row_numShapes; s++)
155                             }                  {
156                           }                      for (r = 0; r < p.row_numShapes; r++)
157                       } else {                      {
158                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                      rtmp = 0;
159                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                      for (q = 0; q < p.numQuadTotal; q++)
160                                rtmp=0;                      {
161                                for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];                          rtmp +=
162                                EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp*C_p[0];                          vol * DSDX[INDEX3(s, 0, q, p.row_numShapesTotal, DIM)] *
163                             }                          B_q[INDEX2(0, q, DIM)] * S[INDEX2(r, q, p.row_numShapes)];
164                           }                      }
165                       }                      EM_S[INDEX4(0, 0, s, r, p.numEqu, p.numComp, p.row_numShapesTotal)] += rtmp;
166                     }                      }
167                     /************************************************************* */                  }
168                     /* process D */                  }
169                     /**************************************************************/                  else
170                     D_p=getSampleData(D,e);                  {
171                     if (NULL!=D_p) {                  for (s = 0; s < p.row_numShapes; s++)
172                       add_EM_S=TRUE;                  {
173                       if (extendedD) {                      for (r = 0; r < p.row_numShapes; r++)
174                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                      {
175                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                      rtmp = 0;
176                                rtmp=0;                      for (q = 0; q < p.numQuadTotal; q++)
177                                for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                          rtmp +=
178                                   rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*D_p[q]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)];                          vol * DSDX[INDEX3(s, 0, q, p.row_numShapesTotal, DIM)] *
179                               }                          S[INDEX2(r, q, p.row_numShapes)];
180                               EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;                      EM_S[INDEX4(0, 0, s, r, p.numEqu, p.numComp, p.row_numShapesTotal)] +=
181                             }                          rtmp * B_p[0];
182                           }                      }
183                       } else {                  }
184                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                  }
185                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {              }
186                                 rtmp=0;                /**************************************************************/
187                                 for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)];              /*   process C: */
188                                 EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp*D_p[0];                /**************************************************************/
189                             }              if (NULL != C_p)
190                           }              {
191                       }                  add_EM_S = TRUE;
192                     }                  if (extendedC)
193                     /**************************************************************/                  {
194                     /*   process X: */                  C_q = &(C_p[INDEX3(0, 0, 0, DIM, p.numQuadTotal)]);
195                     /**************************************************************/                  for (s = 0; s < p.row_numShapes; s++)
196                     X_p=getSampleData(X,e);                  {
197                     if (NULL!=X_p) {                      for (r = 0; r < p.row_numShapes; r++)
198                       add_EM_F=TRUE;                      {
199                       if (extendedX) {                      rtmp = 0;
200                          for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                      for (q = 0; q < p.numQuadTotal; q++)
201                            rtmp=0;                      {
202                            for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*X_p[INDEX2(0,q,DIM)];                          rtmp +=
203                            EM_F[INDEX2(0,s,p.numEqu)]+=rtmp;                          vol * S[INDEX2(s, q, p.row_numShapes)] * C_q[INDEX2(0, q, DIM)] *
204                          }                          DSDX[INDEX3(r, 0, q, p.row_numShapesTotal, DIM)];
205                       } else {                      }
206                          for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                      EM_S[INDEX4(0, 0, s, r, p.numEqu, p.numComp, p.row_numShapesTotal)] += rtmp;
207                            rtmp=0;                      }
208                            for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)];                  }
209                            EM_F[INDEX2(0,s,p.numEqu)]+=rtmp*X_p[0];                  }
210                          }                  else
211                       }                  {
212                    }                  for (s = 0; s < p.row_numShapes; s++)
213                    /**************************************************************/                  {
214                    /*   process Y: */                      for (r = 0; r < p.row_numShapes; r++)
215                    /**************************************************************/                      {
216                     Y_p=getSampleData(Y,e);                      rtmp = 0;
217                     if (NULL!=Y_p) {                      for (q = 0; q < p.numQuadTotal; q++)
218                       add_EM_F=TRUE;                          rtmp +=
219                       if (extendedY) {                          vol * S[INDEX2(s, q, p.row_numShapes)] *
220                          for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                          DSDX[INDEX3(r, 0, q, p.row_numShapesTotal, DIM)];
221                             rtmp=0;                      EM_S[INDEX4(0, 0, s, r, p.numEqu, p.numComp, p.row_numShapesTotal)] +=
222                             for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*Y_p[q];                          rtmp * C_p[0];
223                             EM_F[INDEX2(0,s,p.numEqu)]+=rtmp;                      }
224                          }                  }
225                        } else {                  }
226                          for (s=0;s<p.row_NS;s++) {              }
227                              rtmp=0;                /************************************************************* */
228                              for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)];              /* process D */
229                              EM_F[INDEX2(0,s,p.numEqu)]+=rtmp*Y_p[0];                /**************************************************************/
230                          }              if (NULL != D_p)
231                        }              {
232                      }                  add_EM_S = TRUE;
233                      /***********************************************************************************************/                  if (extendedD)
234                      /* add the element matrices onto the matrix and right hand side                                */                  {
235                      /***********************************************************************************************/                  D_q = &(D_p[INDEX2(0, 0, p.numQuadTotal)]);
236                      for (q=0;q<p.row_NN;q++) row_index[q]=p.row_DOF[elements->Nodes[INDEX2(p.row_node[q],e,p.NN)]];                  for (s = 0; s < p.row_numShapes; s++)
237                      if (add_EM_F) Finley_Util_AddScatter(p.row_NN,row_index,p.numEqu,EM_F,F_p, p.row_DOF_UpperBound);                  {
238                      if (add_EM_S) Finley_Assemble_addToSystemMatrix(Mat,p.row_NN,row_index,p.numEqu,p.col_NN,row_index,p.numComp,EM_S);                      for (r = 0; r < p.row_numShapes; r++)
239                          {
240                  } /* end color check */                      rtmp = 0;
241               } /* end element loop */                      for (q = 0; q < p.numQuadTotal; q++)
242           } /* end color loop */                      {
243                                      rtmp +=
244           THREAD_MEMFREE(EM_S);                          vol * S[INDEX2(s, q, p.row_numShapes)] * D_q[q] *
245           THREAD_MEMFREE(EM_F);                          S[INDEX2(r, q, p.row_numShapes)];
246           THREAD_MEMFREE(row_index);                      }
247                        EM_S[INDEX4(0, 0, s, r, p.numEqu, p.numComp, p.row_numShapesTotal)] += rtmp;
248                        }
249                    }
250                    }
251                    else
252                    {
253                    for (s = 0; s < p.row_numShapes; s++)
254                    {
255                        for (r = 0; r < p.row_numShapes; r++)
256                        {
257                        rtmp = 0;
258                        for (q = 0; q < p.numQuadTotal; q++)
259                            rtmp +=
260                            vol * S[INDEX2(s, q, p.row_numShapes)] *
261                            S[INDEX2(r, q, p.row_numShapes)];
262                        EM_S[INDEX4(0, 0, s, r, p.numEqu, p.numComp, p.row_numShapesTotal)] +=
263                            rtmp * D_p[0];
264                        }
265                    }
266                    }
267                }
268                  /**************************************************************/
269                /*   process X: */
270                  /**************************************************************/
271                if (NULL != X_p)
272                {
273                    add_EM_F = TRUE;
274                    if (extendedX)
275                    {
276                    X_q = &(X_p[INDEX3(0, 0, 0, DIM, p.numQuadTotal)]);
277                    for (s = 0; s < p.row_numShapes; s++)
278                    {
279                        rtmp = 0;
280                        for (q = 0; q < p.numQuadTotal; q++)
281                        rtmp +=
282                            vol * DSDX[INDEX3(s, 0, q, p.row_numShapesTotal, DIM)] *
283                            X_q[INDEX2(0, q, DIM)];
284                        EM_F[INDEX2(0, s, p.numEqu)] += rtmp;
285                    }
286                    }
287                    else
288                    {
289                    for (s = 0; s < p.row_numShapes; s++)
290                    {
291                        rtmp = 0;
292                        for (q = 0; q < p.numQuadTotal; q++)
293                        rtmp += vol * DSDX[INDEX3(s, 0, q, p.row_numShapesTotal, DIM)];
294                        EM_F[INDEX2(0, s, p.numEqu)] += rtmp * X_p[0];
295                    }
296                    }
297                }
298                 /**************************************************************/
299                /*   process Y: */
300                 /**************************************************************/
301                if (NULL != Y_p)
302                {
303                    add_EM_F = TRUE;
304                    if (extendedY)
305                    {
306                    Y_q = &(Y_p[INDEX2(0, 0, p.numQuadTotal)]);
307                    for (s = 0; s < p.row_numShapes; s++)
308                    {
309                        rtmp = 0;
310                        for (q = 0; q < p.numQuadTotal; q++)
311                        rtmp += vol * S[INDEX2(s, q, p.row_numShapes)] * Y_q[q];
312                        EM_F[INDEX2(0, s, p.numEqu)] += rtmp;
313                    }
314                    }
315                    else
316                    {
317                    for (s = 0; s < p.row_numShapes; s++)
318                    {
319                        rtmp = 0;
320                        for (q = 0; q < p.numQuadTotal; q++)
321                        rtmp += vol * S[INDEX2(s, q, p.row_numShapes)];
322                        EM_F[INDEX2(0, s, p.numEqu)] += rtmp * Y_p[0];
323                    }
324                    }
325                }
326                   /***********************************************************************************************/
327                /* add the element matrices onto the matrix and right hand side                                */
328                   /***********************************************************************************************/
329                for (q = 0; q < p.row_numShapesTotal; q++)
330                    row_index[q] = p.row_DOF[elements->Nodes[INDEX2(q, e, p.NN)]];
331    
332                if (add_EM_F)
333                    Dudley_Util_AddScatter(p.row_numShapesTotal, row_index, p.numEqu, EM_F, F_p,
334                               p.row_DOF_UpperBound);
335                if (add_EM_S)
336                    Dudley_Assemble_addToSystemMatrix(Mat, p.row_numShapesTotal, row_index, p.numEqu,
337                                      p.row_numShapesTotal, row_index, p.numComp, EM_S);
338    
339                }       /* end color check */
340            }       /* end element loop */
341            }           /* end color loop */
342    
343            THREAD_MEMFREE(EM_S);   /* these FREEs appear to be inside the if because if any of the allocs */
344            THREAD_MEMFREE(EM_F);   /* failed it means an out of memory (which is not recoverable anyway) */
345            THREAD_MEMFREE(row_index);
346    
347        } /* end of pointer check */      }           /* end of pointer check */
348     } /* end parallel region */      }               /* end parallel region */
349  }  }
350    
351  /*  /*
352   * $Log$   * $Log$
353   */   */

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