/[escript]/branches/doubleplusgood/dudley/src/Mesh_readGmsh.cpp
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trunk/finley/src/Mesh_readGmsh.c revision 1062 by gross, Mon Mar 26 06:17:53 2007 UTC branches/domexper/dudley/src/Mesh_readGmsh.c revision 3221 by jfenwick, Wed Sep 29 01:00:21 2010 UTC
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 /*  
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  *          Copyright 2006, 2007 by ACcESS MNRF             *  
  *                                                          *  
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  *  Licensed under the Open Software License version 3.0    *  
  *     http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php       *  
  *                                                          *  
  ************************************************************  
 */  
1    
2  /**************************************************************/  /*******************************************************
3    *
4    * Copyright (c) 2003-2010 by University of Queensland
5    * Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)
6    * http://www.uq.edu.au/esscc
7    *
8    * Primary Business: Queensland, Australia
9    * Licensed under the Open Software License version 3.0
10    * http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php
11    *
12    *******************************************************/
13    
 /*   Finley: read mesh */  
14    
15  /**************************************************************/  /**************************************************************/
16    
17  /*   Author: gross@access.edu.au */  /*   Dudley: read mesh */
 /*   Version: $Id: Mesh_read.c 730 2006-05-15 04:03:49Z bcumming $ */  
18    
19  /**************************************************************/  /**************************************************************/
20    
21  #include "Mesh.h"  #include "Mesh.h"
22  #include <stdio.h>  #include <stdio.h>
23    
24    #define FSCANF_CHECK(scan_ret, reason) { if (scan_ret == EOF) { perror(reason); Dudley_setError(IO_ERROR,"scan error while reading dudley file"); return NULL;} }
25    
26  /**************************************************************/  /**************************************************************/
27    
28  /*  reads a mesh from a Finley file of name fname */  /*  reads a mesh from a Dudley file of name fname */
29    
30  #define MAX_numNodes_gmsh 10  #define MAX_numNodes_gmsh 20
31    
32  Finley_Mesh* Finley_Mesh_readGmsh(char* fname ,index_t numDim, index_t order, index_t reduced_order, bool_t optimize_labeling) {  Dudley_Mesh* Dudley_Mesh_readGmsh(char* fname ,index_t numDim, index_t order, index_t reduced_order, bool_t optimize, bool_t useMacroElements) {
33    
34    double version = 1.0;    double version = 1.0;
35    int format = 0, size = sizeof(double);    int format = 0, size = sizeof(double), scan_ret;
36    dim_t numNodes, totalNumElements=0, numTags=0, numNodesPerElement, numNodesPerElement2, element_dim;    dim_t numNodes, totalNumElements=0, numTags=0, numNodesPerElement=0, numNodesPerElement2, element_dim=0;
37    index_t e, i0, j, gmsh_type, partition_id, itmp, final_element_type,  elementary_id;    index_t e, i0, j, gmsh_type, partition_id, itmp, elementary_id;
38    index_t numElements=0, numFaceElements=0, *id=NULL, *tag=NULL, *vertices=NULL;    index_t numElements=0, numFaceElements=0, *id=NULL, *tag=NULL, *vertices=NULL;
39    Finley_Mesh *mesh_p=NULL;    Dudley_Mesh *mesh_p=NULL;
40    char line[LenString_MAX+1];    char line[LenString_MAX+1];
41    char error_msg[LenErrorMsg_MAX];    char error_msg[LenErrorMsg_MAX];
42    double rtmp0, rtmp1;    double rtmp0, rtmp1;
43    double time0=Finley_timer();  #ifdef Dudley_TRACE
44      double time0=Dudley_timer();
45    #endif
46    FILE * fileHandle_p = NULL;    FILE * fileHandle_p = NULL;
47    ElementTypeId* element_type=NULL;    ElementTypeId* element_type=NULL;
48    
   Finley_resetError();  
  #if PASO_MPI  
     sprintf(error_msg,"reading GMSH with MPI is not supported yet.");  
     Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);  
     return NULL;  
   
 #else  
   /* allocate mesh */  
   
   mesh_p = Finley_Mesh_alloc(fname,numDim,order, reduced_order);  
   if (! Finley_noError()) return NULL;  
49    
50    /* get file handle */    Paso_MPIInfo *mpi_info = Paso_MPIInfo_alloc( MPI_COMM_WORLD );
51    fileHandle_p = fopen(fname, "r");    Dudley_resetError();
52    if (fileHandle_p==NULL) {    if (mpi_info->size>1) {
53      sprintf(error_msg,"Opening Gmsh file %s for reading failed.",fname);      Dudley_setError(IO_ERROR,"reading GMSH with MPI is not supported yet.");
54      Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);      Paso_MPIInfo_free( mpi_info );
55      return NULL;      return NULL;
56    }    } else {
57    
58    /* start reading */       /* allocate mesh */
59    while(1) {    
60      if (! Finley_noError()) break;       mesh_p = Dudley_Mesh_alloc(fname,numDim, mpi_info);
61      /* find line staring with $ */       if (! Dudley_noError()) return NULL;
62      do {    
63        if( ! fgets(line, sizeof(line), fileHandle_p) ) break;       /* get file handle */
64        if(feof(fileHandle_p)) break;       fileHandle_p = fopen(fname, "r");
65      } while(line[0] != '$');       if (fileHandle_p==NULL) {
66           sprintf(error_msg,"Opening Gmsh file %s for reading failed.",fname);
67      if (feof(fileHandle_p)) break;         Dudley_setError(IO_ERROR,error_msg);
68           Paso_MPIInfo_free( mpi_info );
69           return NULL;
70      /* format */       }
     if (!strncmp(&line[1], "MeshFormat", 10)) {  
       fscanf(fileHandle_p, "%lf %d %d\n", &version, &format, &size);  
     }  
     /* nodes are read */  
     if ( !strncmp(&line[1], "NOD", 3)   ||  
          !strncmp(&line[1], "NOE", 3)   ||  
          !strncmp(&line[1], "Nodes", 5)    ) {  
       
       fscanf(fileHandle_p, "%d", &numNodes);  
       if (! Finley_noError()) break;  
       Finley_NodeFile_allocTable(mesh_p->Nodes, numNodes);  
       if (! Finley_noError()) break;  
       for (i0 = 0; i0 < numNodes; i0++) {  
          if (1 == numDim) {  
            fscanf(fileHandle_p, "%d %le %le %le\n", &mesh_p->Nodes->Id[i0],  
                   &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0,i0,numDim)],  
                       &rtmp0,  
                       &rtmp1);  
          } else if (2 == numDim) {  
            fscanf(fileHandle_p, "%d %le %le %le\n", &mesh_p->Nodes->Id[i0],  
                   &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0,i0,numDim)],  
                   &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1,i0,numDim)],  
                       &rtmp0);  
          } else if (3 == numDim) {  
            fscanf(fileHandle_p, "%d %le %le %le\n", &mesh_p->Nodes->Id[i0],  
                   &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0,i0,numDim)],  
                   &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1,i0,numDim)],  
                   &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(2,i0,numDim)]);  
71        
72               /* start reading */
73         while(1) {
74           if (! Dudley_noError()) break;
75           /* find line staring with $ */
76           do {
77             if( ! fgets(line, sizeof(line), fileHandle_p) ) break;
78             if(feof(fileHandle_p)) break;
79           } while(line[0] != '$');
80      
81           if (feof(fileHandle_p)) break;
82      
83      
84           /* format */
85           if (!strncmp(&line[1], "MeshFormat", 10)) {
86             scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%lf %d %d\n", &version, &format, &size);
87         FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Dudley_Mesh_readGmsh");
88           }
89           /* nodes are read */
90           if ( !strncmp(&line[1], "NOD", 3)   ||
91                !strncmp(&line[1], "NOE", 3)   ||
92                !strncmp(&line[1], "Nodes", 5)    ) {
93            
94             scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d", &numNodes);
95         FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Dudley_Mesh_readGmsh");
96             if (! Dudley_noError()) break;
97             Dudley_NodeFile_allocTable(mesh_p->Nodes, numNodes);
98             if (! Dudley_noError()) break;
99             for (i0 = 0; i0 < numNodes; i0++) {
100                if (1 == numDim) {
101               scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d %le %le %le\n", &mesh_p->Nodes->Id[i0],
102                      &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0,i0,numDim)],
103                             &rtmp0,
104                             &rtmp1);
105               FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Dudley_Mesh_readGmsh");
106                } else if (2 == numDim) {
107               scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d %le %le %le\n", &mesh_p->Nodes->Id[i0],
108                      &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0,i0,numDim)],
109                      &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1,i0,numDim)],
110                             &rtmp0);
111               FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Dudley_Mesh_readGmsh");
112                } else if (3 == numDim) {
113               scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d %le %le %le\n", &mesh_p->Nodes->Id[i0],
114                      &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0,i0,numDim)],
115                      &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1,i0,numDim)],
116                      &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(2,i0,numDim)]);
117               FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Dudley_Mesh_readGmsh");
118                }
119                mesh_p->Nodes->globalDegreesOfFreedom[i0]=mesh_p->Nodes->Id[i0];
120                mesh_p->Nodes->Tag[i0]=0;
121           }           }
122           mesh_p->Nodes->degreeOfFreedom[i0]=mesh_p->Nodes->Id[i0];         }
123           mesh_p->Nodes->Tag[i0]=0;         /* elements */
124        }         else if(!strncmp(&line[1], "ELM", 3) ||
125      }          !strncmp(&line[1], "Elements", 8)) {
126      /* elements */    
127      else if(!strncmp(&line[1], "ELM", 3) ||           ElementTypeId final_element_type = NoRef;
128          !strncmp(&line[1], "Elements", 8)) {           ElementTypeId final_face_element_type = NoRef;
129             numElements=0;
130        ElementTypeId final_element_type = NoType;           numFaceElements=0;
131        ElementTypeId final_face_element_type = NoType;           scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d", &totalNumElements);
132        numElements=0;       FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Dudley_Mesh_readGmsh");
133        numFaceElements=0;    
134        fscanf(fileHandle_p, "%d", &totalNumElements);           id=TMPMEMALLOC(totalNumElements,index_t);
135             tag=TMPMEMALLOC(totalNumElements,index_t);
136        id=TMPMEMALLOC(totalNumElements,index_t);    
137        tag=TMPMEMALLOC(totalNumElements,index_t);    
138             element_type=TMPMEMALLOC(totalNumElements,ElementTypeId);
139             vertices=TMPMEMALLOC(totalNumElements*MAX_numNodes_gmsh,index_t);
140        element_type=TMPMEMALLOC(totalNumElements,ElementTypeId);           if (! (Dudley_checkPtr(id) || Dudley_checkPtr(tag) || Dudley_checkPtr(element_type) || Dudley_checkPtr(vertices) ) ) {
141        vertices=TMPMEMALLOC(totalNumElements*MAX_numNodes_gmsh,index_t);              /* read all in */
142        if (! (Finley_checkPtr(id) || Finley_checkPtr(tag) || Finley_checkPtr(element_type) || Finley_checkPtr(vertices) ) ) {              for(e = 0; e < totalNumElements; e++) {
143           /* read all in */                scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d %d", &id[e], &gmsh_type);
144           for(e = 0; e < totalNumElements; e++) {            FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Dudley_Mesh_readGmsh");
145             fscanf(fileHandle_p, "%d %d", &id[e], &gmsh_type);                switch (gmsh_type) {
146             switch (gmsh_type) {                    case 1:  /* line order 1 */
147                 case 1:  /* line order 1 */                        element_type[e]=Line2;
148                     element_type[e]=Line2;                        element_dim=1;
149                     element_dim=1;                        numNodesPerElement=2;  
150                     numNodesPerElement=2;                          break;
151                     break;                    case 2:  /* traingle order 1 */
152                 case 2:  /* traingle order 1 */                        element_type[e]=Tri3;
153                     element_type[e]=Tri3;                        numNodesPerElement= 3;
154                     numNodesPerElement= 3;                        element_dim=2;
155                     element_dim=2;                        break;
156                     break;                    case 4:  /* tetrahedron order 1 */
157                 case 3:  /* quadrilateral order 1 */                        element_type[e]=Tet4;
158                     element_type[e]=Rec4;                        numNodesPerElement= 4;
159                     numNodesPerElement= 4;                        element_dim=3;
160                     element_dim=2;                        break;
161                     break;                    case 15 :  /* point */
162                 case 4:  /* tetrahedron order 1 */                        element_type[e]=Point1;
163                     element_type[e]=Tet4;                        numNodesPerElement= 1;
164                     numNodesPerElement= 4;                        element_dim=0;
165                     element_dim=3;                        break;
166                     break;                    default:
167                 case 5:  /* hexahedron order 1 */                       element_type[e]=NoRef;
168                     element_type[e]=Hex8;                       sprintf(error_msg,"Unexected gmsh element type %d in mesh file %s.",gmsh_type,fname);
169                     numNodesPerElement= 8;                       Dudley_setError(IO_ERROR,error_msg);
                    element_dim=3;  
                    break;  
                case 8:  /* line order 2 */  
                    element_type[e]=Line3;  
                    numNodesPerElement= 3;  
                    element_dim=1;  
                    break;  
                case 9:  /* traingle order 2 */  
                    element_type[e]=Tri6;  
                    numNodesPerElement= 6;  
                    element_dim=2;  
                    break;  
                case 10:  /* quadrilateral order 2 */  
                    element_type[e]=Rec9;  
                    numNodesPerElement= 9;  
                    element_dim=2;  
                    break;  
                case 11:  /* tetrahedron order 2 */  
                    element_type[e]=Tet10;  
                    numNodesPerElement= 10;  
                    element_dim=3;  
                    break;  
                case 15 :  /* point */  
                    element_type[e]=Point1;  
                    numNodesPerElement= 1;  
                    element_dim=0;  
                    break;  
                default:  
                   element_type[e]=NoType;  
                   sprintf(error_msg,"Unexected gmsh element type %d in mesh file %s.",gmsh_type,fname);  
                   Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);  
            }  
            if (element_dim == numDim) {  
               if (final_element_type == NoType) {  
                  final_element_type = element_type[e];  
               } else if (final_element_type != element_type[e]) {  
                   sprintf(error_msg,"Finley can handle a single type of internal elements only.");  
                   Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);  
                   break;  
170                }                }
171                numElements++;                if (element_dim == numDim) {
172             } else if (element_dim == numDim-1) {                   if (final_element_type == NoRef) {
173                if (final_face_element_type == NoType) {                      final_element_type = element_type[e];
174                   final_face_element_type = element_type[e];                   } else if (final_element_type != element_type[e]) {
175                } else if (final_face_element_type != element_type[e]) {                       sprintf(error_msg,"Dudley can handle a single type of internal elements only.");
176                    sprintf(error_msg,"Finley can handle a single type of face elements only.");                       Dudley_setError(IO_ERROR,error_msg);
177                    Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);                       break;
178                    break;                   }
179                     numElements++;
180                  } else if (element_dim == numDim-1) {
181                     if (final_face_element_type == NoRef) {
182                        final_face_element_type = element_type[e];
183                     } else if (final_face_element_type != element_type[e]) {
184                         sprintf(error_msg,"Dudley can handle a single type of face elements only.");
185                         Dudley_setError(IO_ERROR,error_msg);
186                         break;
187                     }
188                     numFaceElements++;
189                }                }
190                numFaceElements++;                
191             }         if(version <= 1.0){
192                       scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d %d %d", &tag[e], &elementary_id, &numNodesPerElement2);
193         if(version <= 1.0){           FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Dudley_Mesh_readGmsh");
194           fscanf(fileHandle_p, "%d %d %d", &tag[e], &elementary_id, &numNodesPerElement2);           partition_id = 1;
195           partition_id = 1;                  if (numNodesPerElement2 != numNodesPerElement) {
196               if (numNodesPerElement2 != numNodesPerElement) {                       sprintf(error_msg,"Illegal number of nodes for element %d in mesh file %s.",id[e],fname);
197                    sprintf(error_msg,"Illegal number of nodes for element %d in mesh file %s.",id[e],fname);                       Dudley_setError(IO_ERROR,error_msg);
198                    Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);                  }
199               }         } else {
200         } else {           scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d", &numTags);
201           fscanf(fileHandle_p, "%d", &numTags);           FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Dudley_Mesh_readGmsh");
202           elementary_id = tag[e] = partition_id = 1;           elementary_id = tag[e] = partition_id = 1;
203               numNodesPerElement2=-1;                  numNodesPerElement2=-1;
204           for(j = 0; j < numTags; j++){           for(j = 0; j < numTags; j++){
205             fscanf(fileHandle_p, "%d", &itmp);                   scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d", &itmp);        
206             if (j == 0) {             FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Dudley_Mesh_readGmsh");
207               tag[e] = itmp;             if (j == 0) {
208             } else if (j == 1) {               tag[e] = itmp;
209               elementary_id = itmp;             } else if (j == 1) {
210             } else if (j == 2) {               elementary_id = itmp;
211               partition_id = itmp;             } else if (j == 2) {
212                 }               partition_id = itmp;
213             /* ignore any other tags */                    }
214           }             /* ignore any other tags */
215         }           }
216             if (! Finley_noError()) break;         }
217             for(j = 0; j < numNodesPerElement; j++) fscanf(fileHandle_p, "%d", &vertices[INDEX2(j,e,MAX_numNodes_gmsh)]);                if (! Dudley_noError()) break;
218           }                for(j = 0; j < numNodesPerElement; j++) {
219           /* all elements have been read, now we have to identify the elements for finley */          scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d", &vertices[INDEX2(j,e,MAX_numNodes_gmsh)]);
220                    FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Dudley_Mesh_readGmsh");
221           if (Finley_noError()) {            }
222             /* first we have to identify the elements to define Elementis and FaceElements */              }
223             if (final_element_type == NoType) {              /* all elements have been read, now we have to identify the elements for dudley */
224                if (numDim==1) {          
225                   final_element_type=Line2;              if (Dudley_noError()) {
226                } else if (numDim==2) {                /* first we have to identify the elements to define Elementis and FaceElements */
227                   final_element_type=Tri3;                if (final_element_type == NoRef) {
228                } else if (numDim==2) {                   if (numDim==1) {
229                   final_element_type=Tet4;                      final_element_type=Line2;
230                     } else if (numDim==2) {
231                        final_element_type=Tri3;
232                     } else if (numDim==3) {
233                        final_element_type=Tet4;
234                     }
235                }                }
236             }                if (final_face_element_type == NoRef) {
237             if (final_face_element_type == NoType) {                   if (numDim==1) {
238                if (numDim==1) {                      final_face_element_type=Point1;
239                   final_face_element_type=Point1;                   } else if (numDim==2) {
240                } else if (numDim==2) {                      final_face_element_type=Line2;
241                   final_face_element_type=Line2;                   } else if (numDim==3) {
242                } else if (numDim==2) {                      final_face_element_type=Tri3;
243                   final_face_element_type=Tri3;                   }
244                }                }
245             }                mesh_p->Elements=Dudley_ElementFile_alloc(final_element_type, mpi_info);
246             mesh_p->Elements=Finley_ElementFile_alloc(final_element_type,mesh_p->order, mesh_p->reduced_order);                mesh_p->FaceElements=Dudley_ElementFile_alloc(final_face_element_type, mpi_info);
247             mesh_p->FaceElements=Finley_ElementFile_alloc(final_face_element_type,mesh_p->order, mesh_p->reduced_order);                mesh_p->Points=Dudley_ElementFile_alloc(Point1, mpi_info);
248             mesh_p->ContactElements=Finley_ElementFile_alloc(Point1_Contact,mesh_p->order, mesh_p->reduced_order);                if (Dudley_noError()) {
249             mesh_p->Points=Finley_ElementFile_alloc(Point1,mesh_p->order, mesh_p->reduced_order);                    Dudley_ElementFile_allocTable(mesh_p->Elements, numElements);
250             if (Finley_noError()) {                    Dudley_ElementFile_allocTable(mesh_p->FaceElements, numFaceElements);
251                 Finley_ElementFile_allocTable(mesh_p->Elements, numElements);                    Dudley_ElementFile_allocTable(mesh_p->Points, 0);
252                 Finley_ElementFile_allocTable(mesh_p->FaceElements, numFaceElements);                    if (Dudley_noError()) {
253                 Finley_ElementFile_allocTable(mesh_p->ContactElements, 0);                        mesh_p->Elements->minColor=0;
254                 Finley_ElementFile_allocTable(mesh_p->Points, 0);                        mesh_p->Elements->maxColor=numElements-1;
255                 if (Finley_noError()) {                        mesh_p->FaceElements->minColor=0;
256                     mesh_p->Elements->minColor=0;                        mesh_p->FaceElements->maxColor=numFaceElements-1;
257                     mesh_p->Elements->maxColor=numElements-1;                        mesh_p->Points->minColor=0;
258                     mesh_p->FaceElements->minColor=0;                        mesh_p->Points->maxColor=0;
259                     mesh_p->FaceElements->maxColor=numFaceElements-1;                        numElements=0;
260                     mesh_p->ContactElements->minColor=0;                        numFaceElements=0;
261                     mesh_p->ContactElements->maxColor=0;                        for(e = 0; e < totalNumElements; e++) {
262                     mesh_p->Points->minColor=0;                           if (element_type[e] == final_element_type) {
263                     mesh_p->Points->maxColor=0;                              mesh_p->Elements->Id[numElements]=id[e];
264                     numElements=0;                              mesh_p->Elements->Tag[numElements]=tag[e];
265                     numFaceElements=0;                              mesh_p->Elements->Color[numElements]=numElements;
266                     for(e = 0; e < totalNumElements; e++) {                              mesh_p->Elements->Owner[numElements]=0;
267                        if (element_type[e] == final_element_type) {                              for (j = 0; j<  mesh_p->Elements->/*referenceElementSet->*/numNodes; ++j)  {
268                           mesh_p->Elements->Id[numElements]=id[e];                                    mesh_p->Elements->Nodes[INDEX2(j, numElements, mesh_p->Elements->/*referenceElementSet->*/numNodes)]=vertices[INDEX2(j,e,MAX_numNodes_gmsh)];
269                           mesh_p->Elements->Tag[numElements]=tag[e];                              }
270                           mesh_p->Elements->Color[numElements]=numElements;                              numElements++;
271                           for (j = 0; j<  mesh_p->Elements->ReferenceElement->Type->numNodes; ++j)                           } else if (element_type[e] == final_face_element_type) {
272                                    mesh_p->Elements->Nodes[INDEX2(j, numElements, mesh_p->Elements->ReferenceElement->Type->numNodes)]=                              mesh_p->FaceElements->Id[numFaceElements]=id[e];
273                                                                                                    vertices[INDEX2(j,e,MAX_numNodes_gmsh)];                              mesh_p->FaceElements->Tag[numFaceElements]=tag[e];
274                           numElements++;                              mesh_p->FaceElements->Color[numFaceElements]=numFaceElements;
275                        } else if (element_type[e] == final_face_element_type) {                              mesh_p->FaceElements->Owner[numFaceElements]=0;
276                           mesh_p->FaceElements->Id[numFaceElements]=id[e];                              for (j = 0; j<  mesh_p->FaceElements->/*referenceElementSet->*/numNodes; ++j) {
277                           mesh_p->FaceElements->Tag[numFaceElements]=tag[e];                                       mesh_p->FaceElements->Nodes[INDEX2(j, numFaceElements, mesh_p->FaceElements->/*referenceElementSet->*/numNodes)]=vertices[INDEX2(j,e,MAX_numNodes_gmsh)];
278                           mesh_p->FaceElements->Color[numFaceElements]=numFaceElements;                              }
279                           for (j = 0; j<  mesh_p->FaceElements->ReferenceElement->Type->numNodes; ++j)                              numFaceElements++;
280                                    mesh_p->FaceElements->Nodes[INDEX2(j, numFaceElements, mesh_p->FaceElements->ReferenceElement->Type->numNodes)]=                           }
                                                                                                   vertices[INDEX2(j,e,MAX_numNodes_gmsh)];  
                          numFaceElements++;  
281                        }                        }
282                     }                   }
283                }                }
284             }              }
285           }           }
286             /* and clean up */
287             TMPMEMFREE(id);
288             TMPMEMFREE(tag);
289             TMPMEMFREE(element_type);
290             TMPMEMFREE(vertices);
291        }        }
292        /* and clean up */        /* serach for end of data block */
293        TMPMEMFREE(id);        do {
294        TMPMEMFREE(tag);           if (!fgets(line, sizeof(line), fileHandle_p)) {
295        TMPMEMFREE(element_type);              sprintf(error_msg,"Unexected end of file in %s",fname);
296        TMPMEMFREE(vertices);              Dudley_setError(IO_ERROR,error_msg);
297     }           }
298     /* serach for end of data block */           if (feof(fileHandle_p)) {
299     do {              sprintf(error_msg,"Unexected end of file in %s",fname);
300        if (!fgets(line, sizeof(line), fileHandle_p)) {              Dudley_setError(IO_ERROR,error_msg);
301           sprintf(error_msg,"Unexected end of file in %s",fname);           }
302           Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);           if (! Dudley_noError()) break;
303        }         } while(line[0] != '$');
304        if (feof(fileHandle_p)) {       }
305           sprintf(error_msg,"Unexected end of file in %s",fname);    
306           Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);       /* close file */
307        }       fclose(fileHandle_p);
308        if (! Finley_noError()) break;       /* clean up */
309      } while(line[0] != '$');       if (! Dudley_noError()) {
310    }          Dudley_Mesh_free(mesh_p);
311            return NULL;
312    /* close file */       }
313    fclose(fileHandle_p);       /*   resolve id's : */
314    /* clean up */       if (Dudley_noError()) Dudley_Mesh_resolveNodeIds(mesh_p);
315    if (! Finley_noError()) {       /* rearrange elements: */
316       Finley_Mesh_dealloc(mesh_p);       if (Dudley_noError()) Dudley_Mesh_prepare(mesh_p, optimize);
317       return NULL;       /* free up memory */
318    }       Paso_MPIInfo_free( mpi_info );
319    /*   resolve id's : */       if (! Dudley_noError()) {
320    Finley_Mesh_resolveNodeIds(mesh_p);          Dudley_Mesh_free(mesh_p);
321    /* rearrange elements: */          return NULL;
322    Finley_Mesh_prepare(mesh_p);       } else {
323    /* that's it */           return mesh_p;
324    #ifdef Finley_TRACE       }
   printf("timing: reading mesh: %.4e sec\n",Finley_timer()-time0);  
   #endif  
   #endif  
   if (Finley_noError()) {  
        if (  ! Finley_Mesh_isPrepared(mesh_p)) {  
           Finley_setError(SYSTEM_ERROR,"Mesh is not prepared for calculation. Contact the programmers.");  
        }  
325    }    }
   return mesh_p;  
326  }  }

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changed lines
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