/[escript]/branches/doubleplusgood/dudley/src/Mesh_readGmsh.cpp
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Diff of /branches/doubleplusgood/dudley/src/Mesh_readGmsh.cpp

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trunk/finley/src/Mesh_readGmsh.c revision 1062 by gross, Mon Mar 26 06:17:53 2007 UTC trunk/dudley/src/Mesh_readGmsh.c revision 3981 by jfenwick, Fri Sep 21 02:47:54 2012 UTC
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 /*  
  ************************************************************  
  *          Copyright 2006, 2007 by ACcESS MNRF             *  
  *                                                          *  
  *              http://www.access.edu.au                    *  
  *       Primary Business: Queensland, Australia            *  
  *  Licensed under the Open Software License version 3.0    *  
  *     http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php       *  
  *                                                          *  
  ************************************************************  
 */  
   
 /**************************************************************/  
1    
2  /*   Finley: read mesh */  /*****************************************************************************
3    *
4    * Copyright (c) 2003-2012 by University of Queensland
5    * http://www.uq.edu.au
6    *
7    * Primary Business: Queensland, Australia
8    * Licensed under the Open Software License version 3.0
9    * http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php
10    *
11    * Development until 2012 by Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)
12    * Development since 2012 by School of Earth Sciences
13    *
14    *****************************************************************************/
15    
16  /**************************************************************/  /************************************************************************************/
17    
18  /*   Author: gross@access.edu.au */  /*   Dudley: read mesh */
 /*   Version: $Id: Mesh_read.c 730 2006-05-15 04:03:49Z bcumming $ */  
19    
20  /**************************************************************/  /************************************************************************************/
21    
22  #include "Mesh.h"  #include "Mesh.h"
23  #include <stdio.h>  #include <stdio.h>
24    
25    #define FSCANF_CHECK(scan_ret, reason) { if (scan_ret == EOF) { perror(reason); Dudley_setError(IO_ERROR,"scan error while reading dudley file"); return NULL;} }
26    
27  /**************************************************************/  /************************************************************************************/
28    
29  /*  reads a mesh from a Finley file of name fname */  /*  reads a mesh from a Dudley file of name fname */
30    
31  #define MAX_numNodes_gmsh 10  #define MAX_numNodes_gmsh 20
32    
33  Finley_Mesh* Finley_Mesh_readGmsh(char* fname ,index_t numDim, index_t order, index_t reduced_order, bool_t optimize_labeling) {  Dudley_Mesh *Dudley_Mesh_readGmsh(char *fname, index_t numDim, index_t order, index_t reduced_order, bool_t optimize,
34                      bool_t useMacroElements)
35    double version = 1.0;  {
36    int format = 0, size = sizeof(double);  
37    dim_t numNodes, totalNumElements=0, numTags=0, numNodesPerElement, numNodesPerElement2, element_dim;      double version = 1.0;
38    index_t e, i0, j, gmsh_type, partition_id, itmp, final_element_type,  elementary_id;      int format = 0, size = sizeof(double), scan_ret;
39    index_t numElements=0, numFaceElements=0, *id=NULL, *tag=NULL, *vertices=NULL;      dim_t numNodes, totalNumElements = 0, numTags = 0, numNodesPerElement = 0, numNodesPerElement2, element_dim = 0;
40    Finley_Mesh *mesh_p=NULL;      index_t e, i0, j, gmsh_type, partition_id, itmp, elementary_id;
41    char line[LenString_MAX+1];      index_t numElements = 0, numFaceElements = 0, *id = NULL, *tag = NULL, *vertices = NULL;
42    char error_msg[LenErrorMsg_MAX];      Dudley_Mesh *mesh_p = NULL;
43    double rtmp0, rtmp1;      char line[LenString_MAX + 1];
44    double time0=Finley_timer();      char error_msg[LenErrorMsg_MAX];
45    FILE * fileHandle_p = NULL;      double rtmp0, rtmp1;
46    ElementTypeId* element_type=NULL;  #ifdef Dudley_TRACE
47        double time0 = Dudley_timer();
48    Finley_resetError();  #endif
49   #if PASO_MPI      FILE *fileHandle_p = NULL;
50      sprintf(error_msg,"reading GMSH with MPI is not supported yet.");      Dudley_ElementTypeId *element_type = NULL;
51      Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);  
52      return NULL;      Esys_MPIInfo *mpi_info = Esys_MPIInfo_alloc(MPI_COMM_WORLD);
53        Dudley_resetError();
54  #else      if (mpi_info->size > 1)
55    /* allocate mesh */      {
56        Dudley_setError(IO_ERROR, "reading GMSH with MPI is not supported yet.");
57    mesh_p = Finley_Mesh_alloc(fname,numDim,order, reduced_order);      Esys_MPIInfo_free(mpi_info);
58    if (! Finley_noError()) return NULL;      return NULL;
   
   /* get file handle */  
   fileHandle_p = fopen(fname, "r");  
   if (fileHandle_p==NULL) {  
     sprintf(error_msg,"Opening Gmsh file %s for reading failed.",fname);  
     Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);  
     return NULL;  
   }  
   
   /* start reading */  
   while(1) {  
     if (! Finley_noError()) break;  
     /* find line staring with $ */  
     do {  
       if( ! fgets(line, sizeof(line), fileHandle_p) ) break;  
       if(feof(fileHandle_p)) break;  
     } while(line[0] != '$');  
   
     if (feof(fileHandle_p)) break;  
   
   
     /* format */  
     if (!strncmp(&line[1], "MeshFormat", 10)) {  
       fscanf(fileHandle_p, "%lf %d %d\n", &version, &format, &size);  
59      }      }
60      /* nodes are read */      else
61      if ( !strncmp(&line[1], "NOD", 3)   ||      {
62           !strncmp(&line[1], "NOE", 3)   ||  
63           !strncmp(&line[1], "Nodes", 5)    ) {      /* allocate mesh */
64        
65        fscanf(fileHandle_p, "%d", &numNodes);      mesh_p = Dudley_Mesh_alloc(fname, numDim, mpi_info);
66        if (! Finley_noError()) break;      if (!Dudley_noError())
67        Finley_NodeFile_allocTable(mesh_p->Nodes, numNodes);          return NULL;
68        if (! Finley_noError()) break;  
69        for (i0 = 0; i0 < numNodes; i0++) {      /* get file handle */
70           if (1 == numDim) {      fileHandle_p = fopen(fname, "r");
71             fscanf(fileHandle_p, "%d %le %le %le\n", &mesh_p->Nodes->Id[i0],      if (fileHandle_p == NULL)
72                    &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0,i0,numDim)],      {
73                        &rtmp0,          sprintf(error_msg, "Opening Gmsh file %s for reading failed.", fname);
74                        &rtmp1);          Dudley_setError(IO_ERROR, error_msg);
75           } else if (2 == numDim) {          Esys_MPIInfo_free(mpi_info);
76             fscanf(fileHandle_p, "%d %le %le %le\n", &mesh_p->Nodes->Id[i0],          return NULL;
77                    &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0,i0,numDim)],      }
78                    &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1,i0,numDim)],  
79                        &rtmp0);      /* start reading */
80           } else if (3 == numDim) {      while (1)
81             fscanf(fileHandle_p, "%d %le %le %le\n", &mesh_p->Nodes->Id[i0],      {
82                    &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0,i0,numDim)],          if (!Dudley_noError())
83                    &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1,i0,numDim)],          break;
84                    &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(2,i0,numDim)]);          /* find line staring with $ */
85              do
86                  {
87           }          if (!fgets(line, sizeof(line), fileHandle_p))
88           mesh_p->Nodes->degreeOfFreedom[i0]=mesh_p->Nodes->Id[i0];              break;
89           mesh_p->Nodes->Tag[i0]=0;          if (feof(fileHandle_p))
90        }              break;
91            }
92            while (line[0] != '$');
93    
94            if (feof(fileHandle_p))
95            break;
96    
97            /* format */
98            if (!strncmp(&line[1], "MeshFormat", 10))
99            {
100            scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%lf %d %d\n", &version, &format, &size);
101            FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Dudley_Mesh_readGmsh");
102            }
103            /* nodes are read */
104            if (!strncmp(&line[1], "NOD", 3) || !strncmp(&line[1], "NOE", 3) || !strncmp(&line[1], "Nodes", 5))
105            {
106    
107            scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d", &numNodes);
108            FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Dudley_Mesh_readGmsh");
109            if (!Dudley_noError())
110                break;
111            Dudley_NodeFile_allocTable(mesh_p->Nodes, numNodes);
112            if (!Dudley_noError())
113                break;
114            for (i0 = 0; i0 < numNodes; i0++)
115            {
116                if (1 == numDim)
117                {
118                scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d %le %le %le\n", &mesh_p->Nodes->Id[i0],
119                          &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0, i0, numDim)], &rtmp0, &rtmp1);
120                FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Dudley_Mesh_readGmsh");
121                }
122                else if (2 == numDim)
123                {
124                scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d %le %le %le\n", &mesh_p->Nodes->Id[i0],
125                          &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0, i0, numDim)],
126                          &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1, i0, numDim)], &rtmp0);
127                FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Dudley_Mesh_readGmsh");
128                }
129                else if (3 == numDim)
130                {
131                scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d %le %le %le\n", &mesh_p->Nodes->Id[i0],
132                          &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0, i0, numDim)],
133                          &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1, i0, numDim)],
134                          &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(2, i0, numDim)]);
135                FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Dudley_Mesh_readGmsh");
136                }
137                mesh_p->Nodes->globalDegreesOfFreedom[i0] = mesh_p->Nodes->Id[i0];
138                mesh_p->Nodes->Tag[i0] = 0;
139            }
140            }
141            /* elements */
142            else if (!strncmp(&line[1], "ELM", 3) || !strncmp(&line[1], "Elements", 8))
143            {
144    
145            Dudley_ElementTypeId final_element_type = Dudley_NoRef;
146            Dudley_ElementTypeId final_face_element_type = Dudley_NoRef;
147            numElements = 0;
148            numFaceElements = 0;
149            scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d", &totalNumElements);
150            FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Dudley_Mesh_readGmsh");
151    
152            id = TMPMEMALLOC(totalNumElements, index_t);
153            tag = TMPMEMALLOC(totalNumElements, index_t);
154    
155            element_type = TMPMEMALLOC(totalNumElements, Dudley_ElementTypeId);
156            vertices = TMPMEMALLOC(totalNumElements * MAX_numNodes_gmsh, index_t);
157            if (!
158                (Dudley_checkPtr(id) || Dudley_checkPtr(tag) || Dudley_checkPtr(element_type)
159                 || Dudley_checkPtr(vertices)))
160            {
161                /* read all in */
162                for (e = 0; e < totalNumElements; e++)
163                {
164                scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d %d", &id[e], &gmsh_type);
165                FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Dudley_Mesh_readGmsh");
166                switch (gmsh_type)
167                {
168                case 1: /* line order 1 */
169                    element_type[e] = Dudley_Line2;
170                    element_dim = 1;
171                    numNodesPerElement = 2;
172                    break;
173                case 2: /* triangle order 1 */
174                    element_type[e] = Dudley_Tri3;
175                    numNodesPerElement = 3;
176                    element_dim = 2;
177                    break;
178                case 4: /* tetrahedron order 1 */
179                    element_type[e] = Dudley_Tet4;
180                    numNodesPerElement = 4;
181                    element_dim = 3;
182                    break;
183                case 15:    /* point */
184                    element_type[e] = Dudley_Point1;
185                    numNodesPerElement = 1;
186                    element_dim = 0;
187                    break;
188                default:
189                    element_type[e] = Dudley_NoRef;
190                    sprintf(error_msg, "Unexected gmsh element type %d in mesh file %s.", gmsh_type, fname);
191                    Dudley_setError(IO_ERROR, error_msg);
192                }
193                if (element_dim == numDim)
194                {
195                    if (final_element_type == Dudley_NoRef)
196                    {
197                    final_element_type = element_type[e];
198                    }
199                    else if (final_element_type != element_type[e])
200                    {
201                    sprintf(error_msg, "Dudley can handle a single type of internal elements only.");
202                    Dudley_setError(IO_ERROR, error_msg);
203                    break;
204                    }
205                    numElements++;
206                }
207                else if (element_dim == numDim - 1)
208                {
209                    if (final_face_element_type == Dudley_NoRef)
210                    {
211                    final_face_element_type = element_type[e];
212                    }
213                    else if (final_face_element_type != element_type[e])
214                    {
215                    sprintf(error_msg, "Dudley can handle a single type of face elements only.");
216                    Dudley_setError(IO_ERROR, error_msg);
217                    break;
218                    }
219                    numFaceElements++;
220                }
221    
222                if (version <= 1.0)
223                {
224                    scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d %d %d", &tag[e], &elementary_id, &numNodesPerElement2);
225                    FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Dudley_Mesh_readGmsh");
226                    partition_id = 1;
227                    if (numNodesPerElement2 != numNodesPerElement)
228                    {
229                    sprintf(error_msg, "Illegal number of nodes for element %d in mesh file %s.", id[e],
230                        fname);
231                    Dudley_setError(IO_ERROR, error_msg);
232                    }
233                }
234                else
235                {
236                    scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d", &numTags);
237                    FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Dudley_Mesh_readGmsh");
238                    elementary_id = tag[e] = partition_id = 1;
239                    numNodesPerElement2 = -1;
240                    for (j = 0; j < numTags; j++)
241                    {
242                    scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d", &itmp);
243                    FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Dudley_Mesh_readGmsh");
244                    if (j == 0)
245                    {
246                        tag[e] = itmp;
247                    }
248                    else if (j == 1)
249                    {
250                        elementary_id = itmp;
251                    }
252                    else if (j == 2)
253                    {
254                        partition_id = itmp;
255                    }
256                    /* ignore any other tags */
257                    }
258                }
259                if (!Dudley_noError())
260                    break;
261                for (j = 0; j < numNodesPerElement; j++)
262                {
263                    scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d", &vertices[INDEX2(j, e, MAX_numNodes_gmsh)]);
264                    FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Dudley_Mesh_readGmsh");
265                }
266                }
267                /* all elements have been read, now we have to identify the elements for dudley */
268    
269                if (Dudley_noError())
270                {
271                /* first we have to identify the elements to define Elementis and FaceElements */
272                if (final_element_type == Dudley_NoRef)
273                {
274                    if (numDim == 1)
275                    {
276                    final_element_type = Dudley_Line2;
277                    }
278                    else if (numDim == 2)
279                    {
280                    final_element_type = Dudley_Tri3;
281                    }
282                    else if (numDim == 3)
283                    {
284                    final_element_type = Dudley_Tet4;
285                    }
286                }
287                if (final_face_element_type == Dudley_NoRef)
288                {
289                    if (numDim == 1)
290                    {
291                    final_face_element_type = Dudley_Point1;
292                    }
293                    else if (numDim == 2)
294                    {
295                    final_face_element_type = Dudley_Line2;
296                    }
297                    else if (numDim == 3)
298                    {
299                    final_face_element_type = Dudley_Tri3;
300                    }
301                }
302                mesh_p->Elements = Dudley_ElementFile_alloc(final_element_type, mpi_info);
303                mesh_p->FaceElements = Dudley_ElementFile_alloc(final_face_element_type, mpi_info);
304                mesh_p->Points = Dudley_ElementFile_alloc(Dudley_Point1, mpi_info);
305                if (Dudley_noError())
306                {
307                    Dudley_ElementFile_allocTable(mesh_p->Elements, numElements);
308                    Dudley_ElementFile_allocTable(mesh_p->FaceElements, numFaceElements);
309                    Dudley_ElementFile_allocTable(mesh_p->Points, 0);
310                    if (Dudley_noError())
311                    {
312                    mesh_p->Elements->minColor = 0;
313                    mesh_p->Elements->maxColor = numElements - 1;
314                    mesh_p->FaceElements->minColor = 0;
315                    mesh_p->FaceElements->maxColor = numFaceElements - 1;
316                    mesh_p->Points->minColor = 0;
317                    mesh_p->Points->maxColor = 0;
318                    numElements = 0;
319                    numFaceElements = 0;
320                    for (e = 0; e < totalNumElements; e++)
321                    {
322                        if (element_type[e] == final_element_type)
323                        {
324                        mesh_p->Elements->Id[numElements] = id[e];
325                        mesh_p->Elements->Tag[numElements] = tag[e];
326                        mesh_p->Elements->Color[numElements] = numElements;
327                        mesh_p->Elements->Owner[numElements] = 0;
328                        for (j = 0; j < mesh_p->Elements-> /*referenceElementSet-> */ numNodes; ++j)
329                        {
330                            mesh_p->Elements->Nodes[INDEX2
331                                        (j, numElements,
332                                         mesh_p->
333                                         Elements-> /*referenceElementSet-> */ numNodes)] =
334                            vertices[INDEX2(j, e, MAX_numNodes_gmsh)];
335                        }
336                        numElements++;
337                        }
338                        else if (element_type[e] == final_face_element_type)
339                        {
340                        mesh_p->FaceElements->Id[numFaceElements] = id[e];
341                        mesh_p->FaceElements->Tag[numFaceElements] = tag[e];
342                        mesh_p->FaceElements->Color[numFaceElements] = numFaceElements;
343                        mesh_p->FaceElements->Owner[numFaceElements] = 0;
344                        for (j = 0; j < mesh_p->FaceElements-> /*referenceElementSet-> */ numNodes; ++j)
345                        {
346                            mesh_p->FaceElements->Nodes[INDEX2
347                                        (j, numFaceElements,
348                                         mesh_p->
349                                         FaceElements-> /*referenceElementSet-> */
350                                         numNodes)] =
351                            vertices[INDEX2(j, e, MAX_numNodes_gmsh)];
352                        }
353                        numFaceElements++;
354                        }
355                    }
356                    }
357                }
358                }
359            }
360            /* and clean up */
361            TMPMEMFREE(id);
362            TMPMEMFREE(tag);
363            TMPMEMFREE(element_type);
364            TMPMEMFREE(vertices);
365            }      
366            /* name tags (thanks to Antoine Lefebvre, antoine.lefebvre2@mail.mcgill.ca ) */
367            else if (!strncmp(&line[1], "PhysicalNames", 13)) {
368                char name[LenString_MAX+1];
369                index_t tag_key;
370            scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d", &numTags);
371            FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Dudley_Mesh_readGmsh");
372            if (! Dudley_noError()) break;
373            for (i0 = 0; i0 < numTags; i0++) {
374                scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d %d %s\n", &itmp, &tag_key, name);
375                FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Dudley_Mesh_readGmsh");
376                if (! (itmp == 2)) Dudley_setError(IO_ERROR,"Dudley_Mesh_readGmsh: expecting two entries per physical name.");
377                if ( strlen(name) < 3 ) Dudley_setError(IO_ERROR,"Dudley_Mesh_readGmsh: illegal tagname (\" missing?)");
378                if (! Dudley_noError()) break;
379                name[strlen(name)-1]='\0';
380                Dudley_Mesh_addTagMap(mesh_p,&name[1],tag_key);
381            }
382              }
383            /* serach for end of data block */
384            do
385            {
386            if (!fgets(line, sizeof(line), fileHandle_p))
387            {
388                sprintf(error_msg, "Unexected end of file in %s", fname);
389                Dudley_setError(IO_ERROR, error_msg);
390            }
391            if (feof(fileHandle_p))
392            {
393                sprintf(error_msg, "Unexected end of file in %s", fname);
394                Dudley_setError(IO_ERROR, error_msg);
395            }
396            if (!Dudley_noError())
397                break;
398            }
399            while (line[0] != '$');
400        }
401    
402        /* close file */
403        fclose(fileHandle_p);
404        /* clean up */
405        if (!Dudley_noError())
406        {
407            Dudley_Mesh_free(mesh_p);
408            return NULL;
409        }
410        /*   resolve id's : */
411        if (Dudley_noError())
412            Dudley_Mesh_resolveNodeIds(mesh_p);
413        /* rearrange elements: */
414        if (Dudley_noError())
415            Dudley_Mesh_prepare(mesh_p, optimize);
416        /* free up memory */
417        Esys_MPIInfo_free(mpi_info);
418        if (!Dudley_noError())
419        {
420            Dudley_Mesh_free(mesh_p);
421            return NULL;
422        }
423        else
424        {
425            return mesh_p;
426        }
427      }      }
     /* elements */  
     else if(!strncmp(&line[1], "ELM", 3) ||  
         !strncmp(&line[1], "Elements", 8)) {  
   
       ElementTypeId final_element_type = NoType;  
       ElementTypeId final_face_element_type = NoType;  
       numElements=0;  
       numFaceElements=0;  
       fscanf(fileHandle_p, "%d", &totalNumElements);  
   
       id=TMPMEMALLOC(totalNumElements,index_t);  
       tag=TMPMEMALLOC(totalNumElements,index_t);  
   
   
       element_type=TMPMEMALLOC(totalNumElements,ElementTypeId);  
       vertices=TMPMEMALLOC(totalNumElements*MAX_numNodes_gmsh,index_t);  
       if (! (Finley_checkPtr(id) || Finley_checkPtr(tag) || Finley_checkPtr(element_type) || Finley_checkPtr(vertices) ) ) {  
          /* read all in */  
          for(e = 0; e < totalNumElements; e++) {  
            fscanf(fileHandle_p, "%d %d", &id[e], &gmsh_type);  
            switch (gmsh_type) {  
                case 1:  /* line order 1 */  
                    element_type[e]=Line2;  
                    element_dim=1;  
                    numNodesPerElement=2;    
                    break;  
                case 2:  /* traingle order 1 */  
                    element_type[e]=Tri3;  
                    numNodesPerElement= 3;  
                    element_dim=2;  
                    break;  
                case 3:  /* quadrilateral order 1 */  
                    element_type[e]=Rec4;  
                    numNodesPerElement= 4;  
                    element_dim=2;  
                    break;  
                case 4:  /* tetrahedron order 1 */  
                    element_type[e]=Tet4;  
                    numNodesPerElement= 4;  
                    element_dim=3;  
                    break;  
                case 5:  /* hexahedron order 1 */  
                    element_type[e]=Hex8;  
                    numNodesPerElement= 8;  
                    element_dim=3;  
                    break;  
                case 8:  /* line order 2 */  
                    element_type[e]=Line3;  
                    numNodesPerElement= 3;  
                    element_dim=1;  
                    break;  
                case 9:  /* traingle order 2 */  
                    element_type[e]=Tri6;  
                    numNodesPerElement= 6;  
                    element_dim=2;  
                    break;  
                case 10:  /* quadrilateral order 2 */  
                    element_type[e]=Rec9;  
                    numNodesPerElement= 9;  
                    element_dim=2;  
                    break;  
                case 11:  /* tetrahedron order 2 */  
                    element_type[e]=Tet10;  
                    numNodesPerElement= 10;  
                    element_dim=3;  
                    break;  
                case 15 :  /* point */  
                    element_type[e]=Point1;  
                    numNodesPerElement= 1;  
                    element_dim=0;  
                    break;  
                default:  
                   element_type[e]=NoType;  
                   sprintf(error_msg,"Unexected gmsh element type %d in mesh file %s.",gmsh_type,fname);  
                   Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);  
            }  
            if (element_dim == numDim) {  
               if (final_element_type == NoType) {  
                  final_element_type = element_type[e];  
               } else if (final_element_type != element_type[e]) {  
                   sprintf(error_msg,"Finley can handle a single type of internal elements only.");  
                   Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);  
                   break;  
               }  
               numElements++;  
            } else if (element_dim == numDim-1) {  
               if (final_face_element_type == NoType) {  
                  final_face_element_type = element_type[e];  
               } else if (final_face_element_type != element_type[e]) {  
                   sprintf(error_msg,"Finley can handle a single type of face elements only.");  
                   Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);  
                   break;  
               }  
               numFaceElements++;  
            }  
             
        if(version <= 1.0){  
          fscanf(fileHandle_p, "%d %d %d", &tag[e], &elementary_id, &numNodesPerElement2);  
          partition_id = 1;  
              if (numNodesPerElement2 != numNodesPerElement) {  
                   sprintf(error_msg,"Illegal number of nodes for element %d in mesh file %s.",id[e],fname);  
                   Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);  
              }  
        } else {  
          fscanf(fileHandle_p, "%d", &numTags);  
          elementary_id = tag[e] = partition_id = 1;  
              numNodesPerElement2=-1;  
          for(j = 0; j < numTags; j++){  
            fscanf(fileHandle_p, "%d", &itmp);        
            if (j == 0) {  
              tag[e] = itmp;  
            } else if (j == 1) {  
              elementary_id = itmp;  
            } else if (j == 2) {  
              partition_id = itmp;  
                }  
            /* ignore any other tags */  
          }  
        }  
            if (! Finley_noError()) break;  
            for(j = 0; j < numNodesPerElement; j++) fscanf(fileHandle_p, "%d", &vertices[INDEX2(j,e,MAX_numNodes_gmsh)]);  
          }  
          /* all elements have been read, now we have to identify the elements for finley */  
       
          if (Finley_noError()) {  
            /* first we have to identify the elements to define Elementis and FaceElements */  
            if (final_element_type == NoType) {  
               if (numDim==1) {  
                  final_element_type=Line2;  
               } else if (numDim==2) {  
                  final_element_type=Tri3;  
               } else if (numDim==2) {  
                  final_element_type=Tet4;  
               }  
            }  
            if (final_face_element_type == NoType) {  
               if (numDim==1) {  
                  final_face_element_type=Point1;  
               } else if (numDim==2) {  
                  final_face_element_type=Line2;  
               } else if (numDim==2) {  
                  final_face_element_type=Tri3;  
               }  
            }  
            mesh_p->Elements=Finley_ElementFile_alloc(final_element_type,mesh_p->order, mesh_p->reduced_order);  
            mesh_p->FaceElements=Finley_ElementFile_alloc(final_face_element_type,mesh_p->order, mesh_p->reduced_order);  
            mesh_p->ContactElements=Finley_ElementFile_alloc(Point1_Contact,mesh_p->order, mesh_p->reduced_order);  
            mesh_p->Points=Finley_ElementFile_alloc(Point1,mesh_p->order, mesh_p->reduced_order);  
            if (Finley_noError()) {  
                Finley_ElementFile_allocTable(mesh_p->Elements, numElements);  
                Finley_ElementFile_allocTable(mesh_p->FaceElements, numFaceElements);  
                Finley_ElementFile_allocTable(mesh_p->ContactElements, 0);  
                Finley_ElementFile_allocTable(mesh_p->Points, 0);  
                if (Finley_noError()) {  
                    mesh_p->Elements->minColor=0;  
                    mesh_p->Elements->maxColor=numElements-1;  
                    mesh_p->FaceElements->minColor=0;  
                    mesh_p->FaceElements->maxColor=numFaceElements-1;  
                    mesh_p->ContactElements->minColor=0;  
                    mesh_p->ContactElements->maxColor=0;  
                    mesh_p->Points->minColor=0;  
                    mesh_p->Points->maxColor=0;  
                    numElements=0;  
                    numFaceElements=0;  
                    for(e = 0; e < totalNumElements; e++) {  
                       if (element_type[e] == final_element_type) {  
                          mesh_p->Elements->Id[numElements]=id[e];  
                          mesh_p->Elements->Tag[numElements]=tag[e];  
                          mesh_p->Elements->Color[numElements]=numElements;  
                          for (j = 0; j<  mesh_p->Elements->ReferenceElement->Type->numNodes; ++j)  
                                   mesh_p->Elements->Nodes[INDEX2(j, numElements, mesh_p->Elements->ReferenceElement->Type->numNodes)]=  
                                                                                                   vertices[INDEX2(j,e,MAX_numNodes_gmsh)];  
                          numElements++;  
                       } else if (element_type[e] == final_face_element_type) {  
                          mesh_p->FaceElements->Id[numFaceElements]=id[e];  
                          mesh_p->FaceElements->Tag[numFaceElements]=tag[e];  
                          mesh_p->FaceElements->Color[numFaceElements]=numFaceElements;  
                          for (j = 0; j<  mesh_p->FaceElements->ReferenceElement->Type->numNodes; ++j)  
                                   mesh_p->FaceElements->Nodes[INDEX2(j, numFaceElements, mesh_p->FaceElements->ReferenceElement->Type->numNodes)]=  
                                                                                                   vertices[INDEX2(j,e,MAX_numNodes_gmsh)];  
                          numFaceElements++;  
                       }  
                    }  
               }  
            }  
          }  
       }  
       /* and clean up */  
       TMPMEMFREE(id);  
       TMPMEMFREE(tag);  
       TMPMEMFREE(element_type);  
       TMPMEMFREE(vertices);  
    }  
    /* serach for end of data block */  
    do {  
       if (!fgets(line, sizeof(line), fileHandle_p)) {  
          sprintf(error_msg,"Unexected end of file in %s",fname);  
          Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);  
       }  
       if (feof(fileHandle_p)) {  
          sprintf(error_msg,"Unexected end of file in %s",fname);  
          Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);  
       }  
       if (! Finley_noError()) break;  
     } while(line[0] != '$');  
   }  
   
   /* close file */  
   fclose(fileHandle_p);  
   /* clean up */  
   if (! Finley_noError()) {  
      Finley_Mesh_dealloc(mesh_p);  
      return NULL;  
   }  
   /*   resolve id's : */  
   Finley_Mesh_resolveNodeIds(mesh_p);  
   /* rearrange elements: */  
   Finley_Mesh_prepare(mesh_p);  
   /* that's it */  
   #ifdef Finley_TRACE  
   printf("timing: reading mesh: %.4e sec\n",Finley_timer()-time0);  
   #endif  
   #endif  
   if (Finley_noError()) {  
        if (  ! Finley_Mesh_isPrepared(mesh_p)) {  
           Finley_setError(SYSTEM_ERROR,"Mesh is not prepared for calculation. Contact the programmers.");  
        }  
   }  
   return mesh_p;  
428  }  }

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