/[escript]/branches/doubleplusgood/dudley/src/Mesh_readGmsh.cpp
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trunk/finley/src/Mesh_readGmsh.c revision 1178 by gross, Wed May 30 05:03:17 2007 UTC temp_trunk_copy/finley/src/Mesh_readGmsh.c revision 1384 by phornby, Fri Jan 11 02:29:38 2008 UTC
# Line 1  Line 1 
 /*  
  ************************************************************  
  *          Copyright 2006, 2007 by ACcESS MNRF             *  
  *                                                          *  
  *              http://www.access.edu.au                    *  
  *       Primary Business: Queensland, Australia            *  
  *  Licensed under the Open Software License version 3.0    *  
  *     http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php       *  
  *                                                          *  
  ************************************************************  
 */  
1    
2  /**************************************************************/  /* $Id$ */
3    
4  /*   Finley: read mesh */  /*******************************************************
5     *
6     *           Copyright 2003-2007 by ACceSS MNRF
7     *       Copyright 2007 by University of Queensland
8     *
9     *                http://esscc.uq.edu.au
10     *        Primary Business: Queensland, Australia
11     *  Licensed under the Open Software License version 3.0
12     *     http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php
13     *
14     *******************************************************/
15    
16  /**************************************************************/  /**************************************************************/
17    
18  /*   Author: gross@access.edu.au */  /*   Finley: read mesh */
 /*   Version: $Id: Mesh_read.c 730 2006-05-15 04:03:49Z bcumming $ */  
19    
20  /**************************************************************/  /**************************************************************/
21    
# Line 31  Line 29 
29    
30  #define MAX_numNodes_gmsh 10  #define MAX_numNodes_gmsh 10
31    
32  Finley_Mesh* Finley_Mesh_readGmsh(char* fname ,index_t numDim, index_t order, index_t reduced_order, bool_t optimize_labeling) {  Finley_Mesh* Finley_Mesh_readGmsh(char* fname ,index_t numDim, index_t order, index_t reduced_order, bool_t optimize) {
33    
34    double version = 1.0;    double version = 1.0;
35    int format = 0, size = sizeof(double);    int format = 0, size = sizeof(double);
# Line 46  Finley_Mesh* Finley_Mesh_readGmsh(char* Line 44  Finley_Mesh* Finley_Mesh_readGmsh(char*
44    FILE * fileHandle_p = NULL;    FILE * fileHandle_p = NULL;
45    ElementTypeId* element_type=NULL;    ElementTypeId* element_type=NULL;
46    
47      Paso_MPIInfo *mpi_info = Paso_MPIInfo_alloc( MPI_COMM_WORLD );
48    Finley_resetError();    Finley_resetError();
49   #if PASO_MPI    if (mpi_info->size>1) {
50      sprintf(error_msg,"reading GMSH with MPI is not supported yet.");      Finley_setError(IO_ERROR,"reading GMSH with MPI is not supported yet.");
51      Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);      Paso_MPIInfo_free( mpi_info );
     return NULL;  
 #else  
   /* allocate mesh */  
   
   mesh_p = Finley_Mesh_alloc(fname,numDim,order, reduced_order);  
   if (! Finley_noError()) return NULL;  
   
   /* get file handle */  
   fileHandle_p = fopen(fname, "r");  
   if (fileHandle_p==NULL) {  
     sprintf(error_msg,"Opening Gmsh file %s for reading failed.",fname);  
     Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);  
52      return NULL;      return NULL;
53    }    } else {
54    
55    /* start reading */       /* allocate mesh */
56    while(1) {    
57      if (! Finley_noError()) break;       mesh_p = Finley_Mesh_alloc(fname,numDim,order, reduced_order, mpi_info);
58      /* find line staring with $ */       if (! Finley_noError()) return NULL;
59      do {    
60        if( ! fgets(line, sizeof(line), fileHandle_p) ) break;       /* get file handle */
61        if(feof(fileHandle_p)) break;       fileHandle_p = fopen(fname, "r");
62      } while(line[0] != '$');       if (fileHandle_p==NULL) {
63           sprintf(error_msg,"Opening Gmsh file %s for reading failed.",fname);
64      if (feof(fileHandle_p)) break;         Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);
65           Paso_MPIInfo_free( mpi_info );
66           return NULL;
67      /* format */       }
     if (!strncmp(&line[1], "MeshFormat", 10)) {  
       fscanf(fileHandle_p, "%lf %d %d\n", &version, &format, &size);  
     }  
     /* nodes are read */  
     if ( !strncmp(&line[1], "NOD", 3)   ||  
          !strncmp(&line[1], "NOE", 3)   ||  
          !strncmp(&line[1], "Nodes", 5)    ) {  
       
       fscanf(fileHandle_p, "%d", &numNodes);  
       if (! Finley_noError()) break;  
       Finley_NodeFile_allocTable(mesh_p->Nodes, numNodes);  
       if (! Finley_noError()) break;  
       for (i0 = 0; i0 < numNodes; i0++) {  
          if (1 == numDim) {  
            fscanf(fileHandle_p, "%d %le %le %le\n", &mesh_p->Nodes->Id[i0],  
                   &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0,i0,numDim)],  
                       &rtmp0,  
                       &rtmp1);  
          } else if (2 == numDim) {  
            fscanf(fileHandle_p, "%d %le %le %le\n", &mesh_p->Nodes->Id[i0],  
                   &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0,i0,numDim)],  
                   &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1,i0,numDim)],  
                       &rtmp0);  
          } else if (3 == numDim) {  
            fscanf(fileHandle_p, "%d %le %le %le\n", &mesh_p->Nodes->Id[i0],  
                   &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0,i0,numDim)],  
                   &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1,i0,numDim)],  
                   &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(2,i0,numDim)]);  
68        
69               /* start reading */
70         while(1) {
71           if (! Finley_noError()) break;
72           /* find line staring with $ */
73           do {
74             if( ! fgets(line, sizeof(line), fileHandle_p) ) break;
75             if(feof(fileHandle_p)) break;
76           } while(line[0] != '$');
77      
78           if (feof(fileHandle_p)) break;
79      
80      
81           /* format */
82           if (!strncmp(&line[1], "MeshFormat", 10)) {
83             fscanf(fileHandle_p, "%lf %d %d\n", &version, &format, &size);
84           }
85           /* nodes are read */
86           if ( !strncmp(&line[1], "NOD", 3)   ||
87                !strncmp(&line[1], "NOE", 3)   ||
88                !strncmp(&line[1], "Nodes", 5)    ) {
89            
90             fscanf(fileHandle_p, "%d", &numNodes);
91             if (! Finley_noError()) break;
92             Finley_NodeFile_allocTable(mesh_p->Nodes, numNodes);
93             if (! Finley_noError()) break;
94             for (i0 = 0; i0 < numNodes; i0++) {
95                if (1 == numDim) {
96               fscanf(fileHandle_p, "%d %le %le %le\n", &mesh_p->Nodes->Id[i0],
97                      &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0,i0,numDim)],
98                             &rtmp0,
99                             &rtmp1);
100                } else if (2 == numDim) {
101               fscanf(fileHandle_p, "%d %le %le %le\n", &mesh_p->Nodes->Id[i0],
102                      &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0,i0,numDim)],
103                      &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1,i0,numDim)],
104                             &rtmp0);
105                } else if (3 == numDim) {
106               fscanf(fileHandle_p, "%d %le %le %le\n", &mesh_p->Nodes->Id[i0],
107                      &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0,i0,numDim)],
108                      &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1,i0,numDim)],
109                      &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(2,i0,numDim)]);
110          
111              
112                }
113                mesh_p->Nodes->globalDegreesOfFreedom[i0]=mesh_p->Nodes->Id[i0];
114                mesh_p->Nodes->Tag[i0]=0;
115           }           }
116           mesh_p->Nodes->degreeOfFreedom[i0]=mesh_p->Nodes->Id[i0];         }
117           mesh_p->Nodes->Tag[i0]=0;         /* elements */
118        }         else if(!strncmp(&line[1], "ELM", 3) ||
119      }          !strncmp(&line[1], "Elements", 8)) {
120      /* elements */    
121      else if(!strncmp(&line[1], "ELM", 3) ||           ElementTypeId final_element_type = NoType;
122          !strncmp(&line[1], "Elements", 8)) {           ElementTypeId final_face_element_type = NoType;
123             numElements=0;
124        ElementTypeId final_element_type = NoType;           numFaceElements=0;
125        ElementTypeId final_face_element_type = NoType;           fscanf(fileHandle_p, "%d", &totalNumElements);
126        numElements=0;    
127        numFaceElements=0;           id=TMPMEMALLOC(totalNumElements,index_t);
128        fscanf(fileHandle_p, "%d", &totalNumElements);           tag=TMPMEMALLOC(totalNumElements,index_t);
129      
130        id=TMPMEMALLOC(totalNumElements,index_t);    
131        tag=TMPMEMALLOC(totalNumElements,index_t);           element_type=TMPMEMALLOC(totalNumElements,ElementTypeId);
132             vertices=TMPMEMALLOC(totalNumElements*MAX_numNodes_gmsh,index_t);
133             if (! (Finley_checkPtr(id) || Finley_checkPtr(tag) || Finley_checkPtr(element_type) || Finley_checkPtr(vertices) ) ) {
134        element_type=TMPMEMALLOC(totalNumElements,ElementTypeId);              /* read all in */
135        vertices=TMPMEMALLOC(totalNumElements*MAX_numNodes_gmsh,index_t);              for(e = 0; e < totalNumElements; e++) {
136        if (! (Finley_checkPtr(id) || Finley_checkPtr(tag) || Finley_checkPtr(element_type) || Finley_checkPtr(vertices) ) ) {                fscanf(fileHandle_p, "%d %d", &id[e], &gmsh_type);
137           /* read all in */                switch (gmsh_type) {
138           for(e = 0; e < totalNumElements; e++) {                    case 1:  /* line order 1 */
139             fscanf(fileHandle_p, "%d %d", &id[e], &gmsh_type);                        element_type[e]=Line2;
140             switch (gmsh_type) {                        element_dim=1;
141                 case 1:  /* line order 1 */                        numNodesPerElement=2;  
142                     element_type[e]=Line2;                        break;
143                     element_dim=1;                    case 2:  /* traingle order 1 */
144                     numNodesPerElement=2;                          element_type[e]=Tri3;
145                     break;                        numNodesPerElement= 3;
146                 case 2:  /* traingle order 1 */                        element_dim=2;
147                     element_type[e]=Tri3;                        break;
148                     numNodesPerElement= 3;                    case 3:  /* quadrilateral order 1 */
149                     element_dim=2;                        element_type[e]=Rec4;
150                     break;                        numNodesPerElement= 4;
151                 case 3:  /* quadrilateral order 1 */                        element_dim=2;
152                     element_type[e]=Rec4;                        break;
153                     numNodesPerElement= 4;                    case 4:  /* tetrahedron order 1 */
154                     element_dim=2;                        element_type[e]=Tet4;
155                     break;                        numNodesPerElement= 4;
156                 case 4:  /* tetrahedron order 1 */                        element_dim=3;
157                     element_type[e]=Tet4;                        break;
158                     numNodesPerElement= 4;                    case 5:  /* hexahedron order 1 */
159                     element_dim=3;                        element_type[e]=Hex8;
160                     break;                        numNodesPerElement= 8;
161                 case 5:  /* hexahedron order 1 */                        element_dim=3;
162                     element_type[e]=Hex8;                        break;
163                     numNodesPerElement= 8;                    case 8:  /* line order 2 */
164                     element_dim=3;                        element_type[e]=Line3;
165                     break;                        numNodesPerElement= 3;
166                 case 8:  /* line order 2 */                        element_dim=1;
167                     element_type[e]=Line3;                        break;
168                     numNodesPerElement= 3;                    case 9:  /* traingle order 2 */
169                     element_dim=1;                        element_type[e]=Tri6;
170                     break;                        numNodesPerElement= 6;
171                 case 9:  /* traingle order 2 */                        element_dim=2;
172                     element_type[e]=Tri6;                        break;
173                     numNodesPerElement= 6;                    case 10:  /* quadrilateral order 2 */
174                     element_dim=2;                        element_type[e]=Rec9;
175                     break;                        numNodesPerElement= 9;
176                 case 10:  /* quadrilateral order 2 */                        element_dim=2;
177                     element_type[e]=Rec9;                        break;
178                     numNodesPerElement= 9;                    case 11:  /* tetrahedron order 2 */
179                     element_dim=2;                        element_type[e]=Tet10;
180                     break;                        numNodesPerElement= 10;
181                 case 11:  /* tetrahedron order 2 */                        element_dim=3;
182                     element_type[e]=Tet10;                        break;
183                     numNodesPerElement= 10;                    case 15 :  /* point */
184                     element_dim=3;                        element_type[e]=Point1;
185                     break;                        numNodesPerElement= 1;
186                 case 15 :  /* point */                        element_dim=0;
187                     element_type[e]=Point1;                        break;
188                     numNodesPerElement= 1;                    default:
189                     element_dim=0;                       element_type[e]=NoType;
190                     break;                       sprintf(error_msg,"Unexected gmsh element type %d in mesh file %s.",gmsh_type,fname);
191                 default:                       Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);
                   element_type[e]=NoType;  
                   sprintf(error_msg,"Unexected gmsh element type %d in mesh file %s.",gmsh_type,fname);  
                   Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);  
            }  
            if (element_dim == numDim) {  
               if (final_element_type == NoType) {  
                  final_element_type = element_type[e];  
               } else if (final_element_type != element_type[e]) {  
                   sprintf(error_msg,"Finley can handle a single type of internal elements only.");  
                   Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);  
                   break;  
192                }                }
193                numElements++;                if (element_dim == numDim) {
194             } else if (element_dim == numDim-1) {                   if (final_element_type == NoType) {
195                if (final_face_element_type == NoType) {                      final_element_type = element_type[e];
196                   final_face_element_type = element_type[e];                   } else if (final_element_type != element_type[e]) {
197                } else if (final_face_element_type != element_type[e]) {                       sprintf(error_msg,"Finley can handle a single type of internal elements only.");
198                    sprintf(error_msg,"Finley can handle a single type of face elements only.");                       Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);
199                    Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);                       break;
200                    break;                   }
201                     numElements++;
202                  } else if (element_dim == numDim-1) {
203                     if (final_face_element_type == NoType) {
204                        final_face_element_type = element_type[e];
205                     } else if (final_face_element_type != element_type[e]) {
206                         sprintf(error_msg,"Finley can handle a single type of face elements only.");
207                         Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);
208                         break;
209                     }
210                     numFaceElements++;
211                }                }
212                numFaceElements++;                
213             }         if(version <= 1.0){
214                       fscanf(fileHandle_p, "%d %d %d", &tag[e], &elementary_id, &numNodesPerElement2);
215         if(version <= 1.0){           partition_id = 1;
216           fscanf(fileHandle_p, "%d %d %d", &tag[e], &elementary_id, &numNodesPerElement2);                  if (numNodesPerElement2 != numNodesPerElement) {
217           partition_id = 1;                       sprintf(error_msg,"Illegal number of nodes for element %d in mesh file %s.",id[e],fname);
218               if (numNodesPerElement2 != numNodesPerElement) {                       Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);
219                    sprintf(error_msg,"Illegal number of nodes for element %d in mesh file %s.",id[e],fname);                  }
220                    Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);         } else {
221               }           fscanf(fileHandle_p, "%d", &numTags);
222         } else {           elementary_id = tag[e] = partition_id = 1;
223           fscanf(fileHandle_p, "%d", &numTags);                  numNodesPerElement2=-1;
224           elementary_id = tag[e] = partition_id = 1;           for(j = 0; j < numTags; j++){
225               numNodesPerElement2=-1;             fscanf(fileHandle_p, "%d", &itmp);      
226           for(j = 0; j < numTags; j++){             if (j == 0) {
227             fscanf(fileHandle_p, "%d", &itmp);                     tag[e] = itmp;
228             if (j == 0) {             } else if (j == 1) {
229               tag[e] = itmp;               elementary_id = itmp;
230             } else if (j == 1) {             } else if (j == 2) {
231               elementary_id = itmp;               partition_id = itmp;
232             } else if (j == 2) {                    }
233               partition_id = itmp;             /* ignore any other tags */
234                 }           }
235             /* ignore any other tags */         }
236           }                if (! Finley_noError()) break;
237         }                for(j = 0; j < numNodesPerElement; j++) fscanf(fileHandle_p, "%d", &vertices[INDEX2(j,e,MAX_numNodes_gmsh)]);
238             if (! Finley_noError()) break;                /* for tet10 the last two nodes need to be swapped */
239             for(j = 0; j < numNodesPerElement; j++) fscanf(fileHandle_p, "%d", &vertices[INDEX2(j,e,MAX_numNodes_gmsh)]);                if (element_type[e]==Tet10) {
240           }                     itmp=vertices[INDEX2(9,e,MAX_numNodes_gmsh)];
241           /* all elements have been read, now we have to identify the elements for finley */                     vertices[INDEX2(9,e,MAX_numNodes_gmsh)]=vertices[INDEX2(8,e,MAX_numNodes_gmsh)];
242                           vertices[INDEX2(8,e,MAX_numNodes_gmsh)]=itmp;
243           if (Finley_noError()) {                }
244             /* first we have to identify the elements to define Elementis and FaceElements */              }
245             if (final_element_type == NoType) {              /* all elements have been read, now we have to identify the elements for finley */
246                if (numDim==1) {          
247                   final_element_type=Line2;              if (Finley_noError()) {
248                } else if (numDim==2) {                /* first we have to identify the elements to define Elementis and FaceElements */
249                   final_element_type=Tri3;                if (final_element_type == NoType) {
250                } else if (numDim==3) {                   if (numDim==1) {
251                   final_element_type=Tet4;                      final_element_type=Line2;
252                     } else if (numDim==2) {
253                        final_element_type=Tri3;
254                     } else if (numDim==3) {
255                        final_element_type=Tet4;
256                     }
257                }                }
258             }                if (final_face_element_type == NoType) {
259             if (final_face_element_type == NoType) {                   if (numDim==1) {
260                if (numDim==1) {                      final_face_element_type=Point1;
261                   final_face_element_type=Point1;                   } else if (numDim==2) {
262                } else if (numDim==2) {                      final_face_element_type=Line2;
263                   final_face_element_type=Line2;                   } else if (numDim==3) {
264                } else if (numDim==3) {                      final_face_element_type=Tri3;
265                   final_face_element_type=Tri3;                   }
266                }                }
267             }                mesh_p->Elements=Finley_ElementFile_alloc(final_element_type,mesh_p->order, mesh_p->reduced_order, mpi_info);
268             mesh_p->Elements=Finley_ElementFile_alloc(final_element_type,mesh_p->order, mesh_p->reduced_order);                mesh_p->FaceElements=Finley_ElementFile_alloc(final_face_element_type,mesh_p->order, mesh_p->reduced_order, mpi_info);
269             mesh_p->FaceElements=Finley_ElementFile_alloc(final_face_element_type,mesh_p->order, mesh_p->reduced_order);                mesh_p->ContactElements=Finley_ElementFile_alloc(Point1_Contact,mesh_p->order, mesh_p->reduced_order, mpi_info);
270             mesh_p->ContactElements=Finley_ElementFile_alloc(Point1_Contact,mesh_p->order, mesh_p->reduced_order);                mesh_p->Points=Finley_ElementFile_alloc(Point1,mesh_p->order, mesh_p->reduced_order, mpi_info);
271             mesh_p->Points=Finley_ElementFile_alloc(Point1,mesh_p->order, mesh_p->reduced_order);                if (Finley_noError()) {
272             if (Finley_noError()) {                    Finley_ElementFile_allocTable(mesh_p->Elements, numElements);
273                 Finley_ElementFile_allocTable(mesh_p->Elements, numElements);                    Finley_ElementFile_allocTable(mesh_p->FaceElements, numFaceElements);
274                 Finley_ElementFile_allocTable(mesh_p->FaceElements, numFaceElements);                    Finley_ElementFile_allocTable(mesh_p->ContactElements, 0);
275                 Finley_ElementFile_allocTable(mesh_p->ContactElements, 0);                    Finley_ElementFile_allocTable(mesh_p->Points, 0);
276                 Finley_ElementFile_allocTable(mesh_p->Points, 0);                    if (Finley_noError()) {
277                 if (Finley_noError()) {                        mesh_p->Elements->minColor=0;
278                     mesh_p->Elements->minColor=0;                        mesh_p->Elements->maxColor=numElements-1;
279                     mesh_p->Elements->maxColor=numElements-1;                        mesh_p->FaceElements->minColor=0;
280                     mesh_p->FaceElements->minColor=0;                        mesh_p->FaceElements->maxColor=numFaceElements-1;
281                     mesh_p->FaceElements->maxColor=numFaceElements-1;                        mesh_p->ContactElements->minColor=0;
282                     mesh_p->ContactElements->minColor=0;                        mesh_p->ContactElements->maxColor=0;
283                     mesh_p->ContactElements->maxColor=0;                        mesh_p->Points->minColor=0;
284                     mesh_p->Points->minColor=0;                        mesh_p->Points->maxColor=0;
285                     mesh_p->Points->maxColor=0;                        numElements=0;
286                     numElements=0;                        numFaceElements=0;
287                     numFaceElements=0;                        for(e = 0; e < totalNumElements; e++) {
288                     for(e = 0; e < totalNumElements; e++) {                           if (element_type[e] == final_element_type) {
289                        if (element_type[e] == final_element_type) {                              mesh_p->Elements->Id[numElements]=id[e];
290                           mesh_p->Elements->Id[numElements]=id[e];                              mesh_p->Elements->Tag[numElements]=tag[e];
291                           mesh_p->Elements->Tag[numElements]=tag[e];                              mesh_p->Elements->Color[numElements]=numElements;
292                           mesh_p->Elements->Color[numElements]=numElements;                              for (j = 0; j<  mesh_p->Elements->ReferenceElement->Type->numNodes; ++j)  {
293                           for (j = 0; j<  mesh_p->Elements->ReferenceElement->Type->numNodes; ++j)                                    mesh_p->Elements->Nodes[INDEX2(j, numElements, mesh_p->Elements->ReferenceElement->Type->numNodes)]=vertices[INDEX2(j,e,MAX_numNodes_gmsh)];
294                                    mesh_p->Elements->Nodes[INDEX2(j, numElements, mesh_p->Elements->ReferenceElement->Type->numNodes)]=                              }
295                                                                                                    vertices[INDEX2(j,e,MAX_numNodes_gmsh)];                              numElements++;
296                           numElements++;                           } else if (element_type[e] == final_face_element_type) {
297                        } else if (element_type[e] == final_face_element_type) {                              mesh_p->FaceElements->Id[numFaceElements]=id[e];
298                           mesh_p->FaceElements->Id[numFaceElements]=id[e];                              mesh_p->FaceElements->Tag[numFaceElements]=tag[e];
299                           mesh_p->FaceElements->Tag[numFaceElements]=tag[e];                              mesh_p->FaceElements->Color[numFaceElements]=numFaceElements;
300                           mesh_p->FaceElements->Color[numFaceElements]=numFaceElements;                              for (j = 0; j<  mesh_p->FaceElements->ReferenceElement->Type->numNodes; ++j) {
301                           for (j = 0; j<  mesh_p->FaceElements->ReferenceElement->Type->numNodes; ++j)                                       mesh_p->FaceElements->Nodes[INDEX2(j, numFaceElements, mesh_p->FaceElements->ReferenceElement->Type->numNodes)]=vertices[INDEX2(j,e,MAX_numNodes_gmsh)];
302                                    mesh_p->FaceElements->Nodes[INDEX2(j, numFaceElements, mesh_p->FaceElements->ReferenceElement->Type->numNodes)]=                              }
303                                                                                                    vertices[INDEX2(j,e,MAX_numNodes_gmsh)];                              numFaceElements++;
304                           numFaceElements++;                           }
305                        }                        }
306                     }                   }
307                }                }
308             }              }
309           }           }
310             /* and clean up */
311             TMPMEMFREE(id);
312             TMPMEMFREE(tag);
313             TMPMEMFREE(element_type);
314             TMPMEMFREE(vertices);
315        }        }
316        /* and clean up */        /* serach for end of data block */
317        TMPMEMFREE(id);        do {
318        TMPMEMFREE(tag);           if (!fgets(line, sizeof(line), fileHandle_p)) {
319        TMPMEMFREE(element_type);              sprintf(error_msg,"Unexected end of file in %s",fname);
320        TMPMEMFREE(vertices);              Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);
321     }           }
322     /* serach for end of data block */           if (feof(fileHandle_p)) {
323     do {              sprintf(error_msg,"Unexected end of file in %s",fname);
324        if (!fgets(line, sizeof(line), fileHandle_p)) {              Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);
325           sprintf(error_msg,"Unexected end of file in %s",fname);           }
326           Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);           if (! Finley_noError()) break;
327        }         } while(line[0] != '$');
328        if (feof(fileHandle_p)) {       }
329           sprintf(error_msg,"Unexected end of file in %s",fname);    
330           Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);       /* close file */
331        }       fclose(fileHandle_p);
332        if (! Finley_noError()) break;       /* clean up */
333      } while(line[0] != '$');       if (! Finley_noError()) {
334    }          Finley_Mesh_free(mesh_p);
335            return NULL;
336    /* close file */       }
337    fclose(fileHandle_p);       /*   resolve id's : */
338    /*   resolve id's : */       Finley_Mesh_resolveNodeIds(mesh_p);
339  printf("resolve nodes\n");       /* rearrange elements: */
340    if (Finley_noError()) {       Finley_Mesh_prepare(mesh_p, optimize);
341        Finley_Mesh_resolveNodeIds(mesh_p);       /* that's it */
342    }       #ifdef Finley_TRACE
343  printf("resolve nodes\n");       printf("timing: reading mesh: %.4e sec\n",Finley_timer()-time0);
344    /* rearrange elements: */       #endif
345  printf("prepare\n");       Paso_MPIInfo_free( mpi_info );
346    if (Finley_noError()) {       return mesh_p;
      Finley_Mesh_prepare(mesh_p);  
   }  
 printf("prepare\n");  
   
   /* optimize node labeling*/  
   if (Finley_noError()) {  
       if (optimize_labeling) Finley_Mesh_optimizeNodeLabeling(mesh_p);  
   }  
   /* that's it */  
   #ifdef Finley_TRACE  
   printf("timing: reading mesh: %.4e sec\n",Finley_timer()-time0);  
   #endif  
   #endif  
   if (Finley_noError()) {  
        if (  ! Finley_Mesh_isPrepared(mesh_p)) {  
           Finley_setError(SYSTEM_ERROR,"Mesh is not prepared for calculation. Contact the programmers.");  
        }  
   } else {  
      Finley_Mesh_dealloc(mesh_p);  
347    }    }
   return mesh_p;  
348  }  }

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