/[escript]/branches/trilinos_from_5897/dudley/src/Assemble_PDE_System2_2D.cpp
ViewVC logotype

Diff of /branches/trilinos_from_5897/dudley/src/Assemble_PDE_System2_2D.cpp

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

trunk/finley/src/Assemble_PDE_System2_2D.c revision 2271 by jfenwick, Mon Feb 16 05:08:29 2009 UTC branches/domexper/dudley/src/Assemble_PDE_System2_2D.c revision 3231 by jfenwick, Fri Oct 1 01:53:46 2010 UTC
# Line 1  Line 1 
1    
2  /*******************************************************  /*******************************************************
3  *  *
4  * Copyright (c) 2003-2008 by University of Queensland  * Copyright (c) 2003-2010 by University of Queensland
5  * Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)  * Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)
6  * http://www.uq.edu.au/esscc  * http://www.uq.edu.au/esscc
7  *  *
# Line 11  Line 11 
11  *  *
12  *******************************************************/  *******************************************************/
13    
   
14  /**************************************************************/  /**************************************************************/
15    
16  /*    assembles the system of numEq PDEs into the stiffness matrix S right hand side F  */  /*    assembles the system of numEq PDEs into the stiffness matrix S right hand side F  */
17  /*    the shape functions for test and solution must be identical */  /*    the shape functions for test and solution must be identical */
18    
   
19  /*      -(A_{k,i,m,j} u_m,j)_i-(B_{k,i,m} u_m)_i+C_{k,m,j} u_m,j-D_{k,m} u_m  and -(X_{k,i})_i + Y_k */  /*      -(A_{k,i,m,j} u_m,j)_i-(B_{k,i,m} u_m)_i+C_{k,m,j} u_m,j-D_{k,m} u_m  and -(X_{k,i})_i + Y_k */
20    
21  /*    u has p.numComp components in a 2D domain. The shape functions for test and solution must be identical  */  /*    u has p.numComp components in a 2D domain. The shape functions for test and solution must be identical  */
# Line 32  Line 30 
30  /*      X = p.numEqu x 2  */  /*      X = p.numEqu x 2  */
31  /*      Y = p.numEqu   */  /*      Y = p.numEqu   */
32    
   
33  /**************************************************************/  /**************************************************************/
34    
   
35  #include "Assemble.h"  #include "Assemble.h"
36  #include "Util.h"  #include "Util.h"
37  #ifdef _OPENMP  #ifdef _OPENMP
38  #include <omp.h>  #include <omp.h>
39  #endif  #endif
40    
   
41  /**************************************************************/  /**************************************************************/
42    
43  void  Finley_Assemble_PDE_System2_2D(Assemble_Parameters p, Finley_ElementFile* elements,  void Dudley_Assemble_PDE_System2_2D(Assemble_Parameters p, Dudley_ElementFile * elements,
44                                       Paso_SystemMatrix* Mat, escriptDataC* F,                      Paso_SystemMatrix * Mat, escriptDataC * F,
45                                       escriptDataC* A, escriptDataC* B, escriptDataC* C, escriptDataC* D, escriptDataC* X, escriptDataC* Y) {                      escriptDataC * A, escriptDataC * B, escriptDataC * C, escriptDataC * D,
46                        escriptDataC * X, escriptDataC * Y)
47    {
48    
49      #define DIM 2  #define DIM 2
50      index_t color;      index_t color;
51      dim_t e;      dim_t e;
52      __const double *A_p, *B_p, *C_p, *D_p, *X_p, *Y_p;      __const double *A_p, *B_p, *C_p, *D_p, *X_p, *Y_p, *A_q, *B_q, *C_q, *D_q, *X_q, *Y_q;
53      double *EM_S, *EM_F, *Vol, *DSDX;      double *EM_S, *EM_F, *DSDX;
54      index_t *row_index;      index_t *row_index;
55      register dim_t q, s,r,k,m;      register dim_t q, s, r, k, m;
56      register double rtmp, rtmp0, rtmp1, rtmp00, rtmp10, rtmp01, rtmp11;      register double rtmp, rtmp0, rtmp1, rtmp00, rtmp10, rtmp01, rtmp11;
57      bool_t add_EM_F, add_EM_S;      bool_t add_EM_F, add_EM_S;
58    
59      bool_t extendedA=isExpanded(A);      bool_t extendedA = isExpanded(A);
60      bool_t extendedB=isExpanded(B);      bool_t extendedB = isExpanded(B);
61      bool_t extendedC=isExpanded(C);      bool_t extendedC = isExpanded(C);
62      bool_t extendedD=isExpanded(D);      bool_t extendedD = isExpanded(D);
63      bool_t extendedX=isExpanded(X);      bool_t extendedX = isExpanded(X);
64      bool_t extendedY=isExpanded(Y);      bool_t extendedY = isExpanded(Y);
65      double *F_p=(requireWrite(F), getSampleDataRW(F,0));    /* use comma, to get around the mixed code and declarations thing */      double *F_p = (requireWrite(F), getSampleDataRW(F, 0)); /* use comma, to get around the mixed code and declarations thing */
66      double *S=p.row_jac->ReferenceElement->S;      const double *S = p.shapeFns;
67      dim_t len_EM_S=p.row_NN*p.col_NN*p.numEqu*p.numComp;      dim_t len_EM_S = p.numShapes * p.numShapes * p.numEqu * p.numComp;
68      dim_t len_EM_F=p.row_NN*p.numEqu;      dim_t len_EM_F = p.numShapes * p.numEqu;
69    
70      void* ABuff=allocSampleBuffer(A);  #pragma omp parallel private(color,EM_S, EM_F, DSDX, A_p, B_p, C_p, D_p, X_p, Y_p, A_q, B_q, C_q, D_q, X_q, Y_q,row_index,q, s,r,k,m,rtmp, rtmp0, rtmp1, rtmp00, rtmp10, rtmp01, rtmp11,add_EM_F, add_EM_S)
     void* BBuff=allocSampleBuffer(B);  
     void* CBuff=allocSampleBuffer(C);  
     void* DBuff=allocSampleBuffer(D);  
     void* XBuff=allocSampleBuffer(X);  
     void* YBuff=allocSampleBuffer(Y);  
     #pragma omp parallel private(color,EM_S, EM_F, Vol, DSDX, A_p, B_p, C_p, D_p, X_p, Y_p,row_index,q, s,r,k,m,rtmp, rtmp0, rtmp1, rtmp00, rtmp10, rtmp01, rtmp11,add_EM_F, add_EM_S)  
71      {      {
72    
73         EM_S=THREAD_MEMALLOC(len_EM_S,double);      EM_S = THREAD_MEMALLOC(len_EM_S, double);
74         EM_F=THREAD_MEMALLOC(len_EM_F,double);      EM_F = THREAD_MEMALLOC(len_EM_F, double);
75         row_index=THREAD_MEMALLOC(p.row_NN,index_t);      row_index = THREAD_MEMALLOC(p.numShapes, index_t);
76                                                                                                                                                                                                        
77         if (!Finley_checkPtr(EM_S) && !Finley_checkPtr(EM_F) && !Finley_checkPtr(row_index) ) {      if (!Dudley_checkPtr(EM_S) && !Dudley_checkPtr(EM_F) && !Dudley_checkPtr(row_index))
78        {
79            for (color=elements->minColor;color<=elements->maxColor;color++) {  
80               /*  open loop over all elements: */          for (color = elements->minColor; color <= elements->maxColor; color++)
81               #pragma omp for private(e) schedule(static)          {
82               for(e=0;e<elements->numElements;e++){          /*  open loop over all elements: */
83                  if (elements->Color[e]==color) {  #pragma omp for private(e) schedule(static)
84                     Vol=&(p.row_jac->volume[INDEX2(0,e,p.numQuad)]);          for (e = 0; e < elements->numElements; e++)
85                     DSDX=&(p.row_jac->DSDX[INDEX4(0,0,0,e,p.row_NN,DIM,p.numQuad)]);          {
86                     for (q=0;q<len_EM_S;++q) EM_S[q]=0;              if (elements->Color[e] == color)
87                     for (q=0;q<len_EM_F;++q) EM_F[q]=0;              {
88                     add_EM_F=FALSE;  
89                     add_EM_S=FALSE;              A_p = getSampleDataRO(A, e);
90                     /**************************************************************/              B_p = getSampleDataRO(B, e);
91                     /*   process A: */              C_p = getSampleDataRO(C, e);
92                     /**************************************************************/              D_p = getSampleDataRO(D, e);
93                     A_p=getSampleDataRO(A,e,ABuff);              X_p = getSampleDataRO(X, e);
94                     if (NULL!=A_p) {              Y_p = getSampleDataRO(Y, e);
95                        add_EM_S=TRUE;              double vol = p.row_jac->absD[e] * p.row_jac->quadweight;
96                        if (extendedA) {              DSDX = &(p.row_jac->DSDX[INDEX5(0, 0, 0, 0, e, p.numShapes, DIM, p.numQuad, 1)]);
97                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {              for (q = 0; q < len_EM_S; ++q)
98                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                  EM_S[q] = 0;
99                               for (k=0;k<p.numEqu;k++) {              for (q = 0; q < len_EM_F; ++q)
100                                 for (m=0;m<p.numComp;m++) {                  EM_F[q] = 0;
101                                   rtmp=0;              add_EM_F = FALSE;
102                                   for (q=0;q<p.numQuad;q++) {              add_EM_S = FALSE;
103                                      rtmp+=Vol[q]* (  
104                                          DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,0,m,0,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)]                /**************************************************************/
105                                         +DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,0,m,1,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)]              /*   process A: */
106                                         +DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,1,m,0,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)]                /**************************************************************/
107                                         +DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,1,m,1,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)]);              A_p = getSampleDataRO(A, e);
108                                   }              if (NULL != A_p)
109                                   EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;              {
110                                 }                  add_EM_S = TRUE;
111                               }                  if (extendedA)
112                             }                  {
113                           }                  A_q = &(A_p[INDEX6(0, 0, 0, 0, 0, 0, p.numEqu, DIM, p.numComp, DIM, p.numQuad)]);
114                        } else {                  for (s = 0; s < p.numShapes; s++)
115                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                  {
116                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                      for (r = 0; r < p.numShapes; r++)
117                                rtmp00=0;                      {
118                                rtmp01=0;                      for (k = 0; k < p.numEqu; k++)
119                                rtmp10=0;                      {
120                                rtmp11=0;                          for (m = 0; m < p.numComp; m++)
121                                for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                          {
122                                      rtmp0=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)];                          rtmp = 0;
123                                      rtmp1=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)];                          for (q = 0; q < p.numQuad; q++)
124                                      rtmp00+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];                          {
125                                      rtmp01+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)];                              rtmp +=
126                                      rtmp10+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];                              vol * (DSDX[INDEX3(s, 0, q, p.numShapes, DIM)] *
127                                      rtmp11+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)];                                     A_q[INDEX5(k, 0, m, 0, q, p.numEqu, DIM, p.numComp, DIM)]
128                                }                                     * DSDX[INDEX3(r, 0, q, p.numShapes, DIM)] +
129                                for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                                     DSDX[INDEX3(s, 0, q, p.numShapes, DIM)] *
130                                    for (m=0;m<p.numComp;m++) {                                     A_q[INDEX5(k, 0, m, 1, q, p.numEqu, DIM, p.numComp, DIM)]
131                                       EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=                                     * DSDX[INDEX3(r, 1, q, p.numShapes, DIM)] +
132                                                  rtmp00*A_p[INDEX4(k,0,m,0,p.numEqu,DIM,p.numComp)]                                     DSDX[INDEX3(s, 1, q, p.numShapes, DIM)] *
133                                                 +rtmp01*A_p[INDEX4(k,0,m,1,p.numEqu,DIM,p.numComp)]                                     A_q[INDEX5(k, 1, m, 0, q, p.numEqu, DIM, p.numComp, DIM)]
134                                                 +rtmp10*A_p[INDEX4(k,1,m,0,p.numEqu,DIM,p.numComp)]                                     * DSDX[INDEX3(r, 0, q, p.numShapes, DIM)] +
135                                                 +rtmp11*A_p[INDEX4(k,1,m,1,p.numEqu,DIM,p.numComp)];                                     DSDX[INDEX3(s, 1, q, p.numShapes, DIM)] *
136                                    }                                     A_q[INDEX5(k, 1, m, 1, q, p.numEqu, DIM, p.numComp, DIM)]
137                                }                                     * DSDX[INDEX3(r, 1, q, p.numShapes, DIM)]);
138                             }                          }
139                           }                          EM_S[INDEX4(k, m, s, r, p.numEqu, p.numComp, p.numShapes)] += rtmp;
140                       }                          }
141                     }                      }
142                     /**************************************************************/                      }
143                     /*   process B: */                  }
144                     /**************************************************************/                  }
145                     B_p=getSampleDataRO(B,e,BBuff);                  else
146                     if (NULL!=B_p) {                  {
147                        add_EM_S=TRUE;                  for (s = 0; s < p.numShapes; s++)
148                        if (extendedB) {                  {
149                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                      for (r = 0; r < p.numShapes; r++)
150                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                      {
151                               for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                      rtmp00 = 0;
152                                 for (m=0;m<p.numComp;m++) {                      rtmp01 = 0;
153                                    rtmp=0;                      rtmp10 = 0;
154                                    for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                      rtmp11 = 0;
155                                       rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)]*                      for (q = 0; q < p.numQuad; q++)
156                                            ( DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*B_p[INDEX4(k,0,m,q,p.numEqu,DIM,p.numComp)]                      {
157                                            + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*B_p[INDEX4(k,1,m,q,p.numEqu,DIM,p.numComp)]);                          rtmp0 = vol * DSDX[INDEX3(s, 0, q, p.numShapes, DIM)];
158                                    }                          rtmp1 = vol * DSDX[INDEX3(s, 1, q, p.numShapes, DIM)];
159                                    EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;                          rtmp00 += rtmp0 * DSDX[INDEX3(r, 0, q, p.numShapes, DIM)];
160                                 }                          rtmp01 += rtmp0 * DSDX[INDEX3(r, 1, q, p.numShapes, DIM)];
161                               }                          rtmp10 += rtmp1 * DSDX[INDEX3(r, 0, q, p.numShapes, DIM)];
162                             }                          rtmp11 += rtmp1 * DSDX[INDEX3(r, 1, q, p.numShapes, DIM)];
163                           }                      }
164                        } else {                      for (k = 0; k < p.numEqu; k++)
165                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                      {
166                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                          for (m = 0; m < p.numComp; m++)
167                                 rtmp0=0;                          {
168                                 rtmp1=0;                          EM_S[INDEX4(k, m, s, r, p.numEqu, p.numComp, p.numShapes)] +=
169                                 for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                              rtmp00 * A_p[INDEX4(k, 0, m, 0, p.numEqu, DIM, p.numComp)]
170                                     rtmp=Vol[q]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)];                              + rtmp01 * A_p[INDEX4(k, 0, m, 1, p.numEqu, DIM, p.numComp)]
171                                     rtmp0+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)];                              + rtmp10 * A_p[INDEX4(k, 1, m, 0, p.numEqu, DIM, p.numComp)]
172                                     rtmp1+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)];                              + rtmp11 * A_p[INDEX4(k, 1, m, 1, p.numEqu, DIM, p.numComp)];
173                                 }                          }
174                                 for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                      }
175                                    for (m=0;m<p.numComp;m++) {                      }
176                                       EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+= rtmp0*B_p[INDEX3(k,0,m,p.numEqu,DIM)]                  }
177                                                                                         + rtmp1*B_p[INDEX3(k,1,m,p.numEqu,DIM)];                  }
178                                    }              }
179                                 }                /**************************************************************/
180                             }              /*   process B: */
181                           }                /**************************************************************/
182                        }              B_p = getSampleDataRO(B, e);
183                     }              if (NULL != B_p)
184                     /**************************************************************/              {
185                     /*   process C: */                  add_EM_S = TRUE;
186                     /**************************************************************/                  if (extendedB)
187                     C_p=getSampleDataRO(C,e,CBuff);                  {
188                     if (NULL!=C_p) {                  B_q = &(B_p[INDEX5(0, 0, 0, 0, 0, p.numEqu, DIM, p.numComp, p.numQuad)]);
189                       add_EM_S=TRUE;                  for (s = 0; s < p.numShapes; s++)
190                       if (extendedC) {                  {
191                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                      for (r = 0; r < p.numShapes; r++)
192                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                      {
193                               for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                      for (k = 0; k < p.numEqu; k++)
194                                 for (m=0;m<p.numComp;m++) {                      {
195                                    rtmp=0;                          for (m = 0; m < p.numComp; m++)
196                                    for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                          {
197                                        rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*                          rtmp = 0;
198                                             ( C_p[INDEX4(k,m,0,q,p.numEqu,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)]                          for (q = 0; q < p.numQuad; q++)
199                                             + C_p[INDEX4(k,m,1,q,p.numEqu,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)]);                          {
200                                    }                              rtmp += vol * S[INDEX2(r, q, p.numShapes)] *
201                                    EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;                              (DSDX[INDEX3(s, 0, q, p.numShapes, DIM)] *
202                                 }                               B_q[INDEX4(k, 0, m, q, p.numEqu, DIM, p.numComp)] +
203                               }                               DSDX[INDEX3(s, 1, q, p.numShapes, DIM)] *
204                             }                               B_q[INDEX4(k, 1, m, q, p.numEqu, DIM, p.numComp)]);
205                           }                          }
206                       } else {                          EM_S[INDEX4(k, m, s, r, p.numEqu, p.numComp, p.numShapes)] += rtmp;
207                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                          }
208                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                      }
209                                rtmp0=0;                      }
210                                rtmp1=0;                  }
211                                for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                  }
212                                        rtmp=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)];                  else
213                                        rtmp0+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];                  {
214                                        rtmp1+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)];                  for (s = 0; s < p.numShapes; s++)
215                                }                  {
216                                for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                      for (r = 0; r < p.numShapes; r++)
217                                   for (m=0;m<p.numComp;m++) {                      {
218                                          EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp0*C_p[INDEX3(k,m,0,p.numEqu,p.numComp)]                      rtmp0 = 0;
219                                                                                            +rtmp1*C_p[INDEX3(k,m,1,p.numEqu,p.numComp)];                      rtmp1 = 0;
220                                   }                      for (q = 0; q < p.numQuad; q++)
221                                }                      {
222                             }                          rtmp = vol * S[INDEX2(r, q, p.numShapes)];
223                           }                          rtmp0 += rtmp * DSDX[INDEX3(s, 0, q, p.numShapes, DIM)];
224                       }                          rtmp1 += rtmp * DSDX[INDEX3(s, 1, q, p.numShapes, DIM)];
225                     }                      }
226                     /************************************************************* */                      for (k = 0; k < p.numEqu; k++)
227                     /* process D */                      {
228                     /**************************************************************/                          for (m = 0; m < p.numComp; m++)
229                     D_p=getSampleDataRO(D,e,DBuff);                          {
230                     if (NULL!=D_p) {                          EM_S[INDEX4(k, m, s, r, p.numEqu, p.numComp, p.numShapes)] +=
231                       add_EM_S=TRUE;                              rtmp0 * B_p[INDEX3(k, 0, m, p.numEqu, DIM)] +
232                       if (extendedD) {                              rtmp1 * B_p[INDEX3(k, 1, m, p.numEqu, DIM)];
233                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                          }
234                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                      }
235                               for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                      }
236                                 for (m=0;m<p.numComp;m++) {                  }
237                                   rtmp=0;                  }
238                                   for (q=0;q<p.numQuad;q++) {              }
239                                       rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*D_p[INDEX3(k,m,q,p.numEqu,p.numComp)]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)];                /**************************************************************/
240                                   }              /*   process C: */
241                                   EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;                /**************************************************************/
242                                 }              C_p = getSampleDataRO(C, e);
243                               }              if (NULL != C_p)
244                             }              {
245                           }                  add_EM_S = TRUE;
246                       } else {                  if (extendedC)
247                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                  {
248                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                  C_q = &(C_p[INDEX5(0, 0, 0, 0, 0, p.numEqu, p.numComp, DIM, p.numQuad)]);
249                                 rtmp=0;                  for (s = 0; s < p.numShapes; s++)
250                                 for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)];                  {
251                                 for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                      for (r = 0; r < p.numShapes; r++)
252                                     for (m=0;m<p.numComp;m++) {                      {
253                                       EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp*D_p[INDEX2(k,m,p.numEqu)];                      for (k = 0; k < p.numEqu; k++)
254                                    }                      {
255                                 }                          for (m = 0; m < p.numComp; m++)
256                             }                          {
257                           }                          rtmp = 0;
258                       }                          for (q = 0; q < p.numQuad; q++)
259                     }                          {
260                     /**************************************************************/                              rtmp += vol * S[INDEX2(s, q, p.numShapes)] *
261                     /*   process X: */                              (C_q[INDEX4(k, m, 0, q, p.numEqu, p.numComp, DIM)] *
262                     /**************************************************************/                               DSDX[INDEX3(r, 0, q, p.numShapes, DIM)] +
263                     X_p=getSampleDataRO(X,e,XBuff);                               C_q[INDEX4(k, m, 1, q, p.numEqu, p.numComp, DIM)] *
264                     if (NULL!=X_p) {                               DSDX[INDEX3(r, 1, q, p.numShapes, DIM)]);
265                       add_EM_F=TRUE;                          }
266                       if (extendedX) {                          EM_S[INDEX4(k, m, s, r, p.numEqu, p.numComp, p.numShapes)] += rtmp;
267                          for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                          }
268                             for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                      }
269                               rtmp=0;                      }
270                               for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                  }
271                                    rtmp+=Vol[q]*(DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*X_p[INDEX3(k,0,q,p.numEqu,DIM)]                  }
272                                                 +DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*X_p[INDEX3(k,1,q,p.numEqu,DIM)]);                  else
273                               }                  {
274                               EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp;                  for (s = 0; s < p.numShapes; s++)
275                             }                  {
276                          }                      for (r = 0; r < p.numShapes; r++)
277                       } else {                      {
278                          for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                      rtmp0 = 0;
279                                rtmp0=0;                      rtmp1 = 0;
280                                rtmp1=0;                      for (q = 0; q < p.numQuad; q++)
281                                for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                      {
282                                    rtmp0+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)];                          rtmp = vol * S[INDEX2(s, q, p.numShapes)];
283                                    rtmp1+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)];                          rtmp0 += rtmp * DSDX[INDEX3(r, 0, q, p.numShapes, DIM)];
284                                }                          rtmp1 += rtmp * DSDX[INDEX3(r, 1, q, p.numShapes, DIM)];
285                                for (k=0;k<p.numEqu;k++) EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp0*X_p[INDEX2(k,0,p.numEqu)]+rtmp1*X_p[INDEX2(k,1,p.numEqu)];                      }
286                          }                      for (k = 0; k < p.numEqu; k++)
287                       }                      {
288                    }                          for (m = 0; m < p.numComp; m++)
289                    /**************************************************************/                          {
290                    /*   process Y: */                          EM_S[INDEX4(k, m, s, r, p.numEqu, p.numComp, p.numShapes)] +=
291                    /**************************************************************/                              rtmp0 * C_p[INDEX3(k, m, 0, p.numEqu, p.numComp)] +
292                     Y_p=getSampleDataRO(Y,e,YBuff);                              rtmp1 * C_p[INDEX3(k, m, 1, p.numEqu, p.numComp)];
293                     if (NULL!=Y_p) {                          }
294                       add_EM_F=TRUE;                      }
295                       if (extendedY) {                      }
296                          for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                  }
297                             for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                  }
298                                rtmp=0;              }
299                                for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*Y_p[INDEX2(k,q,p.numEqu)];                /************************************************************* */
300                                EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp;              /* process D */
301                             }                /**************************************************************/
302                          }              D_p = getSampleDataRO(D, e);
303                        } else {              if (NULL != D_p)
304                          for (s=0;s<p.row_NS;s++) {              {
305                              rtmp=0;                  add_EM_S = TRUE;
306                              for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)];                  if (extendedD)
307                              for (k=0;k<p.numEqu;k++) EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp*Y_p[k];                  {
308                          }                  D_q = &(D_p[INDEX4(0, 0, 0, 0, p.numEqu, p.numComp, p.numQuad)]);
309                        }                  for (s = 0; s < p.numShapes; s++)
310                      }                  {
311                      /***********************************************************************************************/                      for (r = 0; r < p.numShapes; r++)
312                      /* add the element matrices onto the matrix and right hand side                                */                      {
313                      /***********************************************************************************************/                      for (k = 0; k < p.numEqu; k++)
314                      for (q=0;q<p.row_NN;q++) row_index[q]=p.row_DOF[elements->Nodes[INDEX2(p.row_node[q],e,p.NN)]];                      {
315                      if (add_EM_F) Finley_Util_AddScatter(p.row_NN,row_index,p.numEqu,EM_F,F_p, p.row_DOF_UpperBound);                          for (m = 0; m < p.numComp; m++)
316                      if (add_EM_S) Finley_Assemble_addToSystemMatrix(Mat,p.row_NN,row_index,p.numEqu,p.col_NN,row_index,p.numComp,EM_S);                          {
317                              rtmp = 0;
318                  } /* end color check */                          for (q = 0; q < p.numQuad; q++)
319               } /* end element loop */                          {
320           } /* end color loop */                              rtmp +=
321                                          vol * S[INDEX2(s, q, p.numShapes)] *
322           THREAD_MEMFREE(EM_S);                              D_q[INDEX3(k, m, q, p.numEqu, p.numComp)] *
323           THREAD_MEMFREE(EM_F);                              S[INDEX2(r, q, p.numShapes)];
324           THREAD_MEMFREE(row_index);                          }
325                            EM_S[INDEX4(k, m, s, r, p.numEqu, p.numComp, p.numShapes)] += rtmp;
326        } /* end of pointer check */                          }
327     } /* end parallel region */                      }
328     freeSampleBuffer(ABuff);                      }
329     freeSampleBuffer(BBuff);                  }
330     freeSampleBuffer(CBuff);                  }
331     freeSampleBuffer(DBuff);                  else
332     freeSampleBuffer(XBuff);                  {
333     freeSampleBuffer(YBuff);                  for (s = 0; s < p.numShapes; s++)
334                    {
335                        for (r = 0; r < p.numShapes; r++)
336                        {
337                        rtmp = 0;
338                        for (q = 0; q < p.numQuad; q++)
339                            rtmp += vol * S[INDEX2(s, q, p.numShapes)] * S[INDEX2(r, q, p.numShapes)];
340                        for (k = 0; k < p.numEqu; k++)
341                        {
342                            for (m = 0; m < p.numComp; m++)
343                            {
344                            EM_S[INDEX4(k, m, s, r, p.numEqu, p.numComp, p.numShapes)] +=
345                                rtmp * D_p[INDEX2(k, m, p.numEqu)];
346                            }
347                        }
348                        }
349                    }
350                    }
351                }
352                  /**************************************************************/
353                /*   process X: */
354                  /**************************************************************/
355                X_p = getSampleDataRO(X, e);
356                if (NULL != X_p)
357                {
358                    add_EM_F = TRUE;
359                    if (extendedX)
360                    {
361                    X_q = &(X_p[INDEX4(0, 0, 0, 0, p.numEqu, DIM, p.numQuad)]);
362                    for (s = 0; s < p.numShapes; s++)
363                    {
364                        for (k = 0; k < p.numEqu; k++)
365                        {
366                        rtmp = 0;
367                        for (q = 0; q < p.numQuad; q++)
368                        {
369                            rtmp +=
370                            vol * (DSDX[INDEX3(s, 0, q, p.numShapes, DIM)] *
371                                   X_q[INDEX3(k, 0, q, p.numEqu, DIM)] +
372                                   DSDX[INDEX3(s, 1, q, p.numShapes, DIM)] *
373                                   X_q[INDEX3(k, 1, q, p.numEqu, DIM)]);
374                        }
375                        EM_F[INDEX2(k, s, p.numEqu)] += rtmp;
376                        }
377                    }
378                    }
379                    else
380                    {
381                    for (s = 0; s < p.numShapes; s++)
382                    {
383                        rtmp0 = 0;
384                        rtmp1 = 0;
385                        for (q = 0; q < p.numQuad; q++)
386                        {
387                        rtmp0 += vol * DSDX[INDEX3(s, 0, q, p.numShapes, DIM)];
388                        rtmp1 += vol * DSDX[INDEX3(s, 1, q, p.numShapes, DIM)];
389                        }
390                        for (k = 0; k < p.numEqu; k++)
391                        EM_F[INDEX2(k, s, p.numEqu)] +=
392                            rtmp0 * X_p[INDEX2(k, 0, p.numEqu)] + rtmp1 * X_p[INDEX2(k, 1, p.numEqu)];
393                    }
394                    }
395                }
396                 /**************************************************************/
397                /*   process Y: */
398                 /**************************************************************/
399                Y_p = getSampleDataRO(Y, e);
400                if (NULL != Y_p)
401                {
402                    add_EM_F = TRUE;
403                    if (extendedY)
404                    {
405                    Y_q = &(Y_p[INDEX3(0, 0, 0, p.numEqu, p.numQuad)]);
406                    for (s = 0; s < p.numShapes; s++)
407                    {
408                        for (k = 0; k < p.numEqu; k++)
409                        {
410                        rtmp = 0;
411                        for (q = 0; q < p.numQuad; q++)
412                            rtmp += vol * S[INDEX2(s, q, p.numShapes)] * Y_q[INDEX2(k, q, p.numEqu)];
413                        EM_F[INDEX2(k, s, p.numEqu)] += rtmp;
414                        }
415                    }
416                    }
417                    else
418                    {
419                    for (s = 0; s < p.numShapes; s++)
420                    {
421                        rtmp = 0;
422                        for (q = 0; q < p.numQuad; q++)
423                        rtmp += vol * S[INDEX2(s, q, p.numShapes)];
424                        for (k = 0; k < p.numEqu; k++)
425                        EM_F[INDEX2(k, s, p.numEqu)] += rtmp * Y_p[k];
426                    }
427                    }
428                }
429                   /***********************************************************************************************/
430                /* add the element matrices onto the matrix and right hand side                                */
431                   /***********************************************************************************************/
432                for (q = 0; q < p.numShapes; q++)
433                    row_index[q] = p.row_DOF[elements->Nodes[INDEX2(q, e, p.NN)]];
434    
435                if (add_EM_F)
436                    Dudley_Util_AddScatter(p.numShapes, row_index, p.numEqu, EM_F, F_p, p.row_DOF_UpperBound);
437                if (add_EM_S)
438                    Dudley_Assemble_addToSystemMatrix(Mat, p.numShapes, row_index, p.numEqu,
439                                      p.numShapes, row_index, p.numComp, EM_S);
440    
441                }       /* end color check */
442            }       /* end element loop */
443            }           /* end color loop */
444    
445            THREAD_MEMFREE(EM_S);
446            THREAD_MEMFREE(EM_F);
447            THREAD_MEMFREE(row_index);
448    
449        }           /* end of pointer check */
450        }               /* end parallel region */
451  }  }
452    
453  /*  /*
454   * $Log$   * $Log$
455   */   */

Legend:
Removed from v.2271  
changed lines
  Added in v.3231

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.26