/[escript]/branches/trilinos_from_5897/dudley/src/Assemble_PDE_System2_2D.cpp
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trunk/finley/src/Assemble_PDE_System2_2D.c revision 798 by gross, Fri Aug 4 01:05:36 2006 UTC branches/domexper/dudley/src/Assemble_PDE_System2_2D.c revision 3231 by jfenwick, Fri Oct 1 01:53:46 2010 UTC
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1  /*  
2   ************************************************************  /*******************************************************
3   *          Copyright 2006 by ACcESS MNRF                   *  *
4   *                                                          *  * Copyright (c) 2003-2010 by University of Queensland
5   *              http://www.access.edu.au                    *  * Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)
6   *       Primary Business: Queensland, Australia            *  * http://www.uq.edu.au/esscc
7   *  Licensed under the Open Software License version 3.0    *  *
8   *     http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php       *  * Primary Business: Queensland, Australia
9   *                                                          *  * Licensed under the Open Software License version 3.0
10   ************************************************************  * http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php
11  */  *
12    *******************************************************/
13    
14  /**************************************************************/  /**************************************************************/
15    
16  /*    assembles the system of numEq PDEs into the stiffness matrix S right hand side F  */  /*    assembles the system of numEq PDEs into the stiffness matrix S right hand side F  */
17  /*    the shape functions for test and solution must be identical */  /*    the shape functions for test and solution must be identical */
18    
   
19  /*      -(A_{k,i,m,j} u_m,j)_i-(B_{k,i,m} u_m)_i+C_{k,m,j} u_m,j-D_{k,m} u_m  and -(X_{k,i})_i + Y_k */  /*      -(A_{k,i,m,j} u_m,j)_i-(B_{k,i,m} u_m)_i+C_{k,m,j} u_m,j-D_{k,m} u_m  and -(X_{k,i})_i + Y_k */
20    
21  /*    u has p.numComp components in a 2D domain. The shape functions for test and solution must be identical  */  /*    u has p.numComp components in a 2D domain. The shape functions for test and solution must be identical  */
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30  /*      X = p.numEqu x 2  */  /*      X = p.numEqu x 2  */
31  /*      Y = p.numEqu   */  /*      Y = p.numEqu   */
32    
   
 /**************************************************************/  
   
 /*  Author: gross@access.edu.au */  
 /*  Version: $Id:$ */  
   
33  /**************************************************************/  /**************************************************************/
34    
   
35  #include "Assemble.h"  #include "Assemble.h"
36  #include "Util.h"  #include "Util.h"
37    #ifdef _OPENMP
38    #include <omp.h>
39    #endif
40    
41  /**************************************************************/  /**************************************************************/
42    
43  void  Finley_Assemble_PDE_System2_2D(Assemble_Parameters p, Finley_ElementFile* elements,  void Dudley_Assemble_PDE_System2_2D(Assemble_Parameters p, Dudley_ElementFile * elements,
44                                       Paso_SystemMatrix* Mat, escriptDataC* F,                      Paso_SystemMatrix * Mat, escriptDataC * F,
45                                       escriptDataC* A, escriptDataC* B, escriptDataC* C, escriptDataC* D, escriptDataC* X, escriptDataC* Y) {                      escriptDataC * A, escriptDataC * B, escriptDataC * C, escriptDataC * D,
46                        escriptDataC * X, escriptDataC * Y)
47    {
48    
49      #define DIM 2  #define DIM 2
50      index_t color;      index_t color;
51      dim_t e;      dim_t e;
52      bool_t extendedA=isExpanded(A);      __const double *A_p, *B_p, *C_p, *D_p, *X_p, *Y_p, *A_q, *B_q, *C_q, *D_q, *X_q, *Y_q;
53      bool_t extendedB=isExpanded(B);      double *EM_S, *EM_F, *DSDX;
54      bool_t extendedC=isExpanded(C);      index_t *row_index;
55      bool_t extendedD=isExpanded(D);      register dim_t q, s, r, k, m;
56      bool_t extendedX=isExpanded(X);      register double rtmp, rtmp0, rtmp1, rtmp00, rtmp10, rtmp01, rtmp11;
57      bool_t extendedY=isExpanded(Y);      bool_t add_EM_F, add_EM_S;
58      double *F_p=getSampleData(F,0);  
59      double *S=p.row_jac->ReferenceElement->S;      bool_t extendedA = isExpanded(A);
60      dim_t len_EM_S=p.row_NN*p.col_NN*p.numEqu*p.numComp;      bool_t extendedB = isExpanded(B);
61      dim_t len_EM_F=p.row_NN*p.numEqu;      bool_t extendedC = isExpanded(C);
62        bool_t extendedD = isExpanded(D);
63        bool_t extendedX = isExpanded(X);
64        bool_t extendedY = isExpanded(Y);
65        double *F_p = (requireWrite(F), getSampleDataRW(F, 0)); /* use comma, to get around the mixed code and declarations thing */
66        const double *S = p.shapeFns;
67        dim_t len_EM_S = p.numShapes * p.numShapes * p.numEqu * p.numComp;
68        dim_t len_EM_F = p.numShapes * p.numEqu;
69    
70      #pragma omp parallel private(color)  #pragma omp parallel private(color,EM_S, EM_F, DSDX, A_p, B_p, C_p, D_p, X_p, Y_p, A_q, B_q, C_q, D_q, X_q, Y_q,row_index,q, s,r,k,m,rtmp, rtmp0, rtmp1, rtmp00, rtmp10, rtmp01, rtmp11,add_EM_F, add_EM_S)
71      {      {
72         double EM_S[len_EM_S], EM_F[len_EM_F];  
73         index_t row_index[p.row_NN];      EM_S = THREAD_MEMALLOC(len_EM_S, double);
74         register dim_t q, s,r,k,m;      EM_F = THREAD_MEMALLOC(len_EM_F, double);
75         register double rtmp, rtmp0, rtmp1, rtmp00, rtmp10, rtmp01, rtmp11;      row_index = THREAD_MEMALLOC(p.numShapes, index_t);
76         double *Vol, *DSDX, *A_p, *B_p, *C_p, *D_p, *X_p, *Y_p;  
77         bool_t add_EM_F, add_EM_S;      if (!Dudley_checkPtr(EM_S) && !Dudley_checkPtr(EM_F) && !Dudley_checkPtr(row_index))
78        {
79         #ifndef PASO_MPI  
80         for (color=elements->minColor;color<=elements->maxColor;color++) {          for (color = elements->minColor; color <= elements->maxColor; color++)
81            /*  open loop over all elements: */          {
82            #pragma omp for private(e) schedule(static)          /*  open loop over all elements: */
83            for(e=0;e<elements->numElements;e++){  #pragma omp for private(e) schedule(static)
84               if (elements->Color[e]==color) {          for (e = 0; e < elements->numElements; e++)
85         #else          {
86         {              if (elements->Color[e] == color)
87            for(e=0;e<elements->numElements;e++) {              {
88               {  
89         #endif              A_p = getSampleDataRO(A, e);
90                  Vol=&(p.row_jac->volume[INDEX2(0,e,p.numQuad)]);              B_p = getSampleDataRO(B, e);
91                  DSDX=&(p.row_jac->DSDX[INDEX4(0,0,0,e,p.row_NN,DIM,p.numQuad)]);              C_p = getSampleDataRO(C, e);
92                  for (q=0;q<len_EM_S;++q) EM_S[q]=0;              D_p = getSampleDataRO(D, e);
93                  for (q=0;q<len_EM_F;++q) EM_F[q]=0;              X_p = getSampleDataRO(X, e);
94                  add_EM_F=FALSE;              Y_p = getSampleDataRO(Y, e);
95                  add_EM_S=FALSE;              double vol = p.row_jac->absD[e] * p.row_jac->quadweight;
96                  /**************************************************************/              DSDX = &(p.row_jac->DSDX[INDEX5(0, 0, 0, 0, e, p.numShapes, DIM, p.numQuad, 1)]);
97                  /*   process A: */              for (q = 0; q < len_EM_S; ++q)
98                  /**************************************************************/                  EM_S[q] = 0;
99                  A_p=getSampleData(A,e);              for (q = 0; q < len_EM_F; ++q)
100                  if (NULL!=A_p) {                  EM_F[q] = 0;
101                     add_EM_S=TRUE;              add_EM_F = FALSE;
102                     if (extendedA) {              add_EM_S = FALSE;
103                        for (s=0;s<p.row_NS;s++) {  
104                          for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                /**************************************************************/
105                            for (k=0;k<p.numEqu;k++) {              /*   process A: */
106                              for (m=0;m<p.numComp;m++) {                /**************************************************************/
107                                rtmp=0;              A_p = getSampleDataRO(A, e);
108                                for (q=0;q<p.numQuad;q++) {              if (NULL != A_p)
109                                   rtmp+=Vol[q]* (              {
110                                       DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,0,m,0,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)]                  add_EM_S = TRUE;
111                                      +DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,0,m,1,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)]                  if (extendedA)
112                                      +DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,1,m,0,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)]                  {
113                                      +DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX5(k,1,m,1,q,p.numEqu,DIM,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)]);                  A_q = &(A_p[INDEX6(0, 0, 0, 0, 0, 0, p.numEqu, DIM, p.numComp, DIM, p.numQuad)]);
114                                }                  for (s = 0; s < p.numShapes; s++)
115                                EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;                  {
116                              }                      for (r = 0; r < p.numShapes; r++)
117                            }                      {
118                          }                      for (k = 0; k < p.numEqu; k++)
119                        }                      {
120                     } else {                          for (m = 0; m < p.numComp; m++)
121                        for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                          {
122                          for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                          rtmp = 0;
123                             rtmp00=0;                          for (q = 0; q < p.numQuad; q++)
124                             rtmp01=0;                          {
125                             rtmp10=0;                              rtmp +=
126                             rtmp11=0;                              vol * (DSDX[INDEX3(s, 0, q, p.numShapes, DIM)] *
127                             for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                                     A_q[INDEX5(k, 0, m, 0, q, p.numEqu, DIM, p.numComp, DIM)]
128                                   rtmp0=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)];                                     * DSDX[INDEX3(r, 0, q, p.numShapes, DIM)] +
129                                   rtmp1=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)];                                     DSDX[INDEX3(s, 0, q, p.numShapes, DIM)] *
130                                   rtmp00+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];                                     A_q[INDEX5(k, 0, m, 1, q, p.numEqu, DIM, p.numComp, DIM)]
131                                   rtmp01+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)];                                     * DSDX[INDEX3(r, 1, q, p.numShapes, DIM)] +
132                                   rtmp10+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];                                     DSDX[INDEX3(s, 1, q, p.numShapes, DIM)] *
133                                   rtmp11+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)];                                     A_q[INDEX5(k, 1, m, 0, q, p.numEqu, DIM, p.numComp, DIM)]
134                             }                                     * DSDX[INDEX3(r, 0, q, p.numShapes, DIM)] +
135                             for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                                     DSDX[INDEX3(s, 1, q, p.numShapes, DIM)] *
136                                 for (m=0;m<p.numComp;m++) {                                     A_q[INDEX5(k, 1, m, 1, q, p.numEqu, DIM, p.numComp, DIM)]
137                                    EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=                                     * DSDX[INDEX3(r, 1, q, p.numShapes, DIM)]);
138                                               rtmp00*A_p[INDEX4(k,0,m,0,p.numEqu,DIM,p.numComp)]                          }
139                                              +rtmp01*A_p[INDEX4(k,0,m,1,p.numEqu,DIM,p.numComp)]                          EM_S[INDEX4(k, m, s, r, p.numEqu, p.numComp, p.numShapes)] += rtmp;
140                                              +rtmp10*A_p[INDEX4(k,1,m,0,p.numEqu,DIM,p.numComp)]                          }
141                                              +rtmp11*A_p[INDEX4(k,1,m,1,p.numEqu,DIM,p.numComp)];                      }
142                                 }                      }
143                             }                  }
144                          }                  }
145                        }                  else
146                    }                  {
147                  }                  for (s = 0; s < p.numShapes; s++)
148                  /**************************************************************/                  {
149                  /*   process B: */                      for (r = 0; r < p.numShapes; r++)
150                  /**************************************************************/                      {
151                  B_p=getSampleData(B,e);                      rtmp00 = 0;
152                  if (NULL!=B_p) {                      rtmp01 = 0;
153                     add_EM_S=TRUE;                      rtmp10 = 0;
154                     if (extendedB) {                      rtmp11 = 0;
155                        for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                      for (q = 0; q < p.numQuad; q++)
156                          for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                      {
157                            for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                          rtmp0 = vol * DSDX[INDEX3(s, 0, q, p.numShapes, DIM)];
158                              for (m=0;m<p.numComp;m++) {                          rtmp1 = vol * DSDX[INDEX3(s, 1, q, p.numShapes, DIM)];
159                                 rtmp=0;                          rtmp00 += rtmp0 * DSDX[INDEX3(r, 0, q, p.numShapes, DIM)];
160                                 for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                          rtmp01 += rtmp0 * DSDX[INDEX3(r, 1, q, p.numShapes, DIM)];
161                                    rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)]*                          rtmp10 += rtmp1 * DSDX[INDEX3(r, 0, q, p.numShapes, DIM)];
162                                         ( DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*B_p[INDEX4(k,0,m,q,p.numEqu,DIM,p.numComp)]                          rtmp11 += rtmp1 * DSDX[INDEX3(r, 1, q, p.numShapes, DIM)];
163                                         + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*B_p[INDEX4(k,1,m,q,p.numEqu,DIM,p.numComp)]);                      }
164                                 }                      for (k = 0; k < p.numEqu; k++)
165                                 EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;                      {
166                              }                          for (m = 0; m < p.numComp; m++)
167                            }                          {
168                          }                          EM_S[INDEX4(k, m, s, r, p.numEqu, p.numComp, p.numShapes)] +=
169                        }                              rtmp00 * A_p[INDEX4(k, 0, m, 0, p.numEqu, DIM, p.numComp)]
170                     } else {                              + rtmp01 * A_p[INDEX4(k, 0, m, 1, p.numEqu, DIM, p.numComp)]
171                        for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                              + rtmp10 * A_p[INDEX4(k, 1, m, 0, p.numEqu, DIM, p.numComp)]
172                          for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                              + rtmp11 * A_p[INDEX4(k, 1, m, 1, p.numEqu, DIM, p.numComp)];
173                              rtmp0=0;                          }
174                              rtmp1=0;                      }
175                              for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                      }
176                                  rtmp=Vol[q]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)];                  }
177                                  rtmp0+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)];                  }
178                                  rtmp1+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)];              }
179                              }                /**************************************************************/
180                              for (k=0;k<p.numEqu;k++) {              /*   process B: */
181                                 for (m=0;m<p.numComp;m++) {                /**************************************************************/
182                                    EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+= rtmp0*B_p[INDEX3(k,0,m,p.numEqu,DIM)]              B_p = getSampleDataRO(B, e);
183                                                                                      + rtmp1*B_p[INDEX3(k,1,m,p.numEqu,DIM)];              if (NULL != B_p)
184                                 }              {
185                              }                  add_EM_S = TRUE;
186                          }                  if (extendedB)
187                        }                  {
188                     }                  B_q = &(B_p[INDEX5(0, 0, 0, 0, 0, p.numEqu, DIM, p.numComp, p.numQuad)]);
189                  }                  for (s = 0; s < p.numShapes; s++)
190                  /**************************************************************/                  {
191                  /*   process C: */                      for (r = 0; r < p.numShapes; r++)
192                  /**************************************************************/                      {
193                  C_p=getSampleData(C,e);                      for (k = 0; k < p.numEqu; k++)
194                  if (NULL!=C_p) {                      {
195                    add_EM_S=TRUE;                          for (m = 0; m < p.numComp; m++)
196                    if (extendedC) {                          {
197                        for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                          rtmp = 0;
198                          for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                          for (q = 0; q < p.numQuad; q++)
199                            for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                          {
200                              for (m=0;m<p.numComp;m++) {                              rtmp += vol * S[INDEX2(r, q, p.numShapes)] *
201                                 rtmp=0;                              (DSDX[INDEX3(s, 0, q, p.numShapes, DIM)] *
202                                 for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                               B_q[INDEX4(k, 0, m, q, p.numEqu, DIM, p.numComp)] +
203                                     rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*                               DSDX[INDEX3(s, 1, q, p.numShapes, DIM)] *
204                                          ( C_p[INDEX4(k,m,0,q,p.numEqu,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)]                               B_q[INDEX4(k, 1, m, q, p.numEqu, DIM, p.numComp)]);
205                                          + C_p[INDEX4(k,m,1,q,p.numEqu,p.numComp,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)]);                          }
206                                 }                          EM_S[INDEX4(k, m, s, r, p.numEqu, p.numComp, p.numShapes)] += rtmp;
207                                 EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;                          }
208                              }                      }
209                            }                      }
210                          }                  }
211                        }                  }
212                    } else {                  else
213                        for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                  {
214                          for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                  for (s = 0; s < p.numShapes; s++)
215                             rtmp0=0;                  {
216                             rtmp1=0;                      for (r = 0; r < p.numShapes; r++)
217                             for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                      {
218                                     rtmp=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)];                      rtmp0 = 0;
219                                     rtmp0+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];                      rtmp1 = 0;
220                                     rtmp1+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)];                      for (q = 0; q < p.numQuad; q++)
221                             }                      {
222                             for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                          rtmp = vol * S[INDEX2(r, q, p.numShapes)];
223                                for (m=0;m<p.numComp;m++) {                          rtmp0 += rtmp * DSDX[INDEX3(s, 0, q, p.numShapes, DIM)];
224                                       EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp0*C_p[INDEX3(k,m,0,p.numEqu,p.numComp)]                          rtmp1 += rtmp * DSDX[INDEX3(s, 1, q, p.numShapes, DIM)];
225                                                                                         +rtmp1*C_p[INDEX3(k,m,1,p.numEqu,p.numComp)];                      }
226                                }                      for (k = 0; k < p.numEqu; k++)
227                             }                      {
228                          }                          for (m = 0; m < p.numComp; m++)
229                        }                          {
230                    }                          EM_S[INDEX4(k, m, s, r, p.numEqu, p.numComp, p.numShapes)] +=
231                  }                              rtmp0 * B_p[INDEX3(k, 0, m, p.numEqu, DIM)] +
232                  /************************************************************* */                              rtmp1 * B_p[INDEX3(k, 1, m, p.numEqu, DIM)];
233                  /* process D */                          }
234                  /**************************************************************/                      }
235                  D_p=getSampleData(D,e);                      }
236                  if (NULL!=D_p) {                  }
237                    add_EM_S=TRUE;                  }
238                    if (extendedD) {              }
239                        for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                /**************************************************************/
240                          for (r=0;r<p.col_NS;r++) {              /*   process C: */
241                            for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                /**************************************************************/
242                              for (m=0;m<p.numComp;m++) {              C_p = getSampleDataRO(C, e);
243                                rtmp=0;              if (NULL != C_p)
244                                for (q=0;q<p.numQuad;q++) {              {
245                                    rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*D_p[INDEX3(k,m,q,p.numEqu,p.numComp)]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)];                  add_EM_S = TRUE;
246                                }                  if (extendedC)
247                                EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;                  {
248                              }                  C_q = &(C_p[INDEX5(0, 0, 0, 0, 0, p.numEqu, p.numComp, DIM, p.numQuad)]);
249                            }                  for (s = 0; s < p.numShapes; s++)
250                          }                  {
251                        }                      for (r = 0; r < p.numShapes; r++)
252                    } else {                      {
253                        for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                      for (k = 0; k < p.numEqu; k++)
254                          for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                      {
255                              rtmp=0;                          for (m = 0; m < p.numComp; m++)
256                              for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)];                          {
257                              for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                          rtmp = 0;
258                                  for (m=0;m<p.numComp;m++) {                          for (q = 0; q < p.numQuad; q++)
259                                    EM_S[INDEX4(k,m,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp*D_p[INDEX2(k,m,p.numEqu)];                          {
260                                 }                              rtmp += vol * S[INDEX2(s, q, p.numShapes)] *
261                              }                              (C_q[INDEX4(k, m, 0, q, p.numEqu, p.numComp, DIM)] *
262                          }                               DSDX[INDEX3(r, 0, q, p.numShapes, DIM)] +
263                        }                               C_q[INDEX4(k, m, 1, q, p.numEqu, p.numComp, DIM)] *
264                    }                               DSDX[INDEX3(r, 1, q, p.numShapes, DIM)]);
265                  }                          }
266                  /**************************************************************/                          EM_S[INDEX4(k, m, s, r, p.numEqu, p.numComp, p.numShapes)] += rtmp;
267                  /*   process X: */                          }
268                  /**************************************************************/                      }
269                  X_p=getSampleData(X,e);                      }
270                  if (NULL!=X_p) {                  }
271                    add_EM_F=TRUE;                  }
272                    if (extendedX) {                  else
273                       for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                  {
274                          for (k=0;k<p.numEqu;k++) {                  for (s = 0; s < p.numShapes; s++)
275                            rtmp=0;                  {
276                            for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                      for (r = 0; r < p.numShapes; r++)
277                                 rtmp+=Vol[q]*(DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*X_p[INDEX3(k,0,q,p.numEqu,DIM)]                      {
278                                              +DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*X_p[INDEX3(k,1,q,p.numEqu,DIM)]);                      rtmp0 = 0;
279                            }                      rtmp1 = 0;
280                            EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp;                      for (q = 0; q < p.numQuad; q++)
281                          }                      {
282                       }                          rtmp = vol * S[INDEX2(s, q, p.numShapes)];
283                    } else {                          rtmp0 += rtmp * DSDX[INDEX3(r, 0, q, p.numShapes, DIM)];
284                       for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                          rtmp1 += rtmp * DSDX[INDEX3(r, 1, q, p.numShapes, DIM)];
285                             rtmp0=0;                      }
286                             rtmp1=0;                      for (k = 0; k < p.numEqu; k++)
287                             for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                      {
288                                 rtmp0+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)];                          for (m = 0; m < p.numComp; m++)
289                                 rtmp1+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)];                          {
290                             }                          EM_S[INDEX4(k, m, s, r, p.numEqu, p.numComp, p.numShapes)] +=
291                             for (k=0;k<p.numEqu;k++) EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp0*X_p[INDEX2(k,0,p.numEqu)]+rtmp1*X_p[INDEX2(k,1,p.numEqu)];                              rtmp0 * C_p[INDEX3(k, m, 0, p.numEqu, p.numComp)] +
292                       }                              rtmp1 * C_p[INDEX3(k, m, 1, p.numEqu, p.numComp)];
293                    }                          }
294                 }                      }
295                 /**************************************************************/                      }
296                 /*   process Y: */                  }
297                 /**************************************************************/                  }
298                  Y_p=getSampleData(Y,e);              }
299                  if (NULL!=Y_p) {                /************************************************************* */
300                    add_EM_F=TRUE;              /* process D */
301                    if (extendedY) {                /**************************************************************/
302                       for (s=0;s<p.row_NS;s++) {              D_p = getSampleDataRO(D, e);
303                          for (k=0;k<p.numEqu;k++) {              if (NULL != D_p)
304                             rtmp=0;              {
305                             for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*Y_p[INDEX2(k,q,p.numEqu)];                  add_EM_S = TRUE;
306                             EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp;                  if (extendedD)
307                          }                  {
308                       }                  D_q = &(D_p[INDEX4(0, 0, 0, 0, p.numEqu, p.numComp, p.numQuad)]);
309                     } else {                  for (s = 0; s < p.numShapes; s++)
310                       for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                  {
311                           rtmp=0;                      for (r = 0; r < p.numShapes; r++)
312                           for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)];                      {
313                           for (k=0;k<p.numEqu;k++) EM_F[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp*Y_p[k];                      for (k = 0; k < p.numEqu; k++)
314                       }                      {
315                     }                          for (m = 0; m < p.numComp; m++)
316                   }                          {
317                   /***********************************************************************************************/                          rtmp = 0;
318                   /* add the element matrices onto the matrix and right hand side                                */                          for (q = 0; q < p.numQuad; q++)
319                   /***********************************************************************************************/                          {
320                   for (q=0;q<p.row_NN;q++) row_index[q]=p.row_DOF[elements->Nodes[INDEX2(p.row_node[q],e,p.NN)]];                              rtmp +=
321                   if (add_EM_F) Finley_Util_AddScatter(p.row_NN,row_index,p.numEqu,EM_F,F_p, p.row_DOF_UpperBound);                              vol * S[INDEX2(s, q, p.numShapes)] *
322                   if (add_EM_S) Finley_Assemble_addToSystemMatrix(Mat,p.row_NN,row_index,p.numEqu,p.col_NN,row_index,p.numComp,EM_S);                              D_q[INDEX3(k, m, q, p.numEqu, p.numComp)] *
323                                S[INDEX2(r, q, p.numShapes)];
324               } /* end color check */                          }
325            } /* end element loop */                          EM_S[INDEX4(k, m, s, r, p.numEqu, p.numComp, p.numShapes)] += rtmp;
326        } /* end color loop */                          }
327     } /* end parallel region */                      }
328                        }
329                    }
330                    }
331                    else
332                    {
333                    for (s = 0; s < p.numShapes; s++)
334                    {
335                        for (r = 0; r < p.numShapes; r++)
336                        {
337                        rtmp = 0;
338                        for (q = 0; q < p.numQuad; q++)
339                            rtmp += vol * S[INDEX2(s, q, p.numShapes)] * S[INDEX2(r, q, p.numShapes)];
340                        for (k = 0; k < p.numEqu; k++)
341                        {
342                            for (m = 0; m < p.numComp; m++)
343                            {
344                            EM_S[INDEX4(k, m, s, r, p.numEqu, p.numComp, p.numShapes)] +=
345                                rtmp * D_p[INDEX2(k, m, p.numEqu)];
346                            }
347                        }
348                        }
349                    }
350                    }
351                }
352                  /**************************************************************/
353                /*   process X: */
354                  /**************************************************************/
355                X_p = getSampleDataRO(X, e);
356                if (NULL != X_p)
357                {
358                    add_EM_F = TRUE;
359                    if (extendedX)
360                    {
361                    X_q = &(X_p[INDEX4(0, 0, 0, 0, p.numEqu, DIM, p.numQuad)]);
362                    for (s = 0; s < p.numShapes; s++)
363                    {
364                        for (k = 0; k < p.numEqu; k++)
365                        {
366                        rtmp = 0;
367                        for (q = 0; q < p.numQuad; q++)
368                        {
369                            rtmp +=
370                            vol * (DSDX[INDEX3(s, 0, q, p.numShapes, DIM)] *
371                                   X_q[INDEX3(k, 0, q, p.numEqu, DIM)] +
372                                   DSDX[INDEX3(s, 1, q, p.numShapes, DIM)] *
373                                   X_q[INDEX3(k, 1, q, p.numEqu, DIM)]);
374                        }
375                        EM_F[INDEX2(k, s, p.numEqu)] += rtmp;
376                        }
377                    }
378                    }
379                    else
380                    {
381                    for (s = 0; s < p.numShapes; s++)
382                    {
383                        rtmp0 = 0;
384                        rtmp1 = 0;
385                        for (q = 0; q < p.numQuad; q++)
386                        {
387                        rtmp0 += vol * DSDX[INDEX3(s, 0, q, p.numShapes, DIM)];
388                        rtmp1 += vol * DSDX[INDEX3(s, 1, q, p.numShapes, DIM)];
389                        }
390                        for (k = 0; k < p.numEqu; k++)
391                        EM_F[INDEX2(k, s, p.numEqu)] +=
392                            rtmp0 * X_p[INDEX2(k, 0, p.numEqu)] + rtmp1 * X_p[INDEX2(k, 1, p.numEqu)];
393                    }
394                    }
395                }
396                 /**************************************************************/
397                /*   process Y: */
398                 /**************************************************************/
399                Y_p = getSampleDataRO(Y, e);
400                if (NULL != Y_p)
401                {
402                    add_EM_F = TRUE;
403                    if (extendedY)
404                    {
405                    Y_q = &(Y_p[INDEX3(0, 0, 0, p.numEqu, p.numQuad)]);
406                    for (s = 0; s < p.numShapes; s++)
407                    {
408                        for (k = 0; k < p.numEqu; k++)
409                        {
410                        rtmp = 0;
411                        for (q = 0; q < p.numQuad; q++)
412                            rtmp += vol * S[INDEX2(s, q, p.numShapes)] * Y_q[INDEX2(k, q, p.numEqu)];
413                        EM_F[INDEX2(k, s, p.numEqu)] += rtmp;
414                        }
415                    }
416                    }
417                    else
418                    {
419                    for (s = 0; s < p.numShapes; s++)
420                    {
421                        rtmp = 0;
422                        for (q = 0; q < p.numQuad; q++)
423                        rtmp += vol * S[INDEX2(s, q, p.numShapes)];
424                        for (k = 0; k < p.numEqu; k++)
425                        EM_F[INDEX2(k, s, p.numEqu)] += rtmp * Y_p[k];
426                    }
427                    }
428                }
429                   /***********************************************************************************************/
430                /* add the element matrices onto the matrix and right hand side                                */
431                   /***********************************************************************************************/
432                for (q = 0; q < p.numShapes; q++)
433                    row_index[q] = p.row_DOF[elements->Nodes[INDEX2(q, e, p.NN)]];
434    
435                if (add_EM_F)
436                    Dudley_Util_AddScatter(p.numShapes, row_index, p.numEqu, EM_F, F_p, p.row_DOF_UpperBound);
437                if (add_EM_S)
438                    Dudley_Assemble_addToSystemMatrix(Mat, p.numShapes, row_index, p.numEqu,
439                                      p.numShapes, row_index, p.numComp, EM_S);
440    
441                }       /* end color check */
442            }       /* end element loop */
443            }           /* end color loop */
444    
445            THREAD_MEMFREE(EM_S);
446            THREAD_MEMFREE(EM_F);
447            THREAD_MEMFREE(row_index);
448    
449        }           /* end of pointer check */
450        }               /* end parallel region */
451  }  }
452    
453  /*  /*
454   * $Log$   * $Log$
455   */   */

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