/[escript]/trunk/escript/py_src/linearPDEs.py
ViewVC logotype

Diff of /trunk/escript/py_src/linearPDEs.py

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

revision 1137 by gross, Thu May 10 08:11:31 2007 UTC revision 1552 by gross, Thu May 8 08:52:41 2008 UTC
# Line 1  Line 1 
1    #
2  # $Id$  # $Id$
3    #
4    #######################################################
5    #
6    #           Copyright 2003-2007 by ACceSS MNRF
7    #       Copyright 2007 by University of Queensland
8    #
9    #                http://esscc.uq.edu.au
10    #        Primary Business: Queensland, Australia
11    #  Licensed under the Open Software License version 3.0
12    #     http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php
13    #
14    #######################################################
15    #
16    
17  """  """
18  The module provides an interface to define and solve linear partial  The module provides an interface to define and solve linear partial
19  differential equations (PDEs) within L{escript}. L{linearPDEs} does not provide any  differential equations (PDEs) within L{escript}. L{linearPDEs} does not provide any
# Line 19  to define of solve these sepecial PDEs. Line 34  to define of solve these sepecial PDEs.
34  @var __date__: date of the version  @var __date__: date of the version
35  """  """
36    
37    import math
38  import escript  import escript
39  import util  import util
40  import numarray  import numarray
# Line 112  class PDECoefficient(object): Line 128  class PDECoefficient(object):
128         @param reduced: indicates if reduced         @param reduced: indicates if reduced
129         @type reduced: C{bool}         @type reduced: C{bool}
130         """         """
         
131         super(PDECoefficient, self).__init__()         super(PDECoefficient, self).__init__()
132         self.what=where         self.what=where
133         self.pattern=pattern         self.pattern=pattern
# Line 365  class LinearPDE(object): Line 380  class LinearPDE(object):
380    
381     The PDE is symmetrical if     The PDE is symmetrical if
382    
383     M{A[i,j]=A[j,i]}  and M{B[j]=C[j]} and M{A_reduced[i,j]=A_reduced[j,i]}  and M{B_reduced[j]=C_reduced[j]     M{A[i,j]=A[j,i]}  and M{B[j]=C[j]} and M{A_reduced[i,j]=A_reduced[j,i]}  and M{B_reduced[j]=C_reduced[j]}
384    
385     For a system of PDEs and a solution with several components the PDE has the form     For a system of PDEs and a solution with several components the PDE has the form
386    
# Line 416  class LinearPDE(object): Line 431  class LinearPDE(object):
431     of the solution at side 1 and at side 0, denotes the jump of M{u} across discontinuity along the normal calcualted by     of the solution at side 1 and at side 0, denotes the jump of M{u} across discontinuity along the normal calcualted by
432     L{jump<util.jump>}.     L{jump<util.jump>}.
433     The coefficient M{d_contact} is a rank two and M{y_contact} is a rank one both in the L{FunctionOnContactZero<escript.FunctionOnContactZero>} or L{FunctionOnContactOne<escript.FunctionOnContactOne>}.     The coefficient M{d_contact} is a rank two and M{y_contact} is a rank one both in the L{FunctionOnContactZero<escript.FunctionOnContactZero>} or L{FunctionOnContactOne<escript.FunctionOnContactOne>}.
434      The coefficient M{d_contact_reduced} is a rank two and M{y_contact_reduced} is a rank one both in the L{ReducedFunctionOnContactZero<escript.ReducedFunctionOnContactZero>} or L{ReducedFunctionOnContactOne<escript.ReducedFunctionOnContactOne>}.     The coefficient M{d_contact_reduced} is a rank two and M{y_contact_reduced} is a rank one both in the L{ReducedFunctionOnContactZero<escript.ReducedFunctionOnContactZero>} or L{ReducedFunctionOnContactOne<escript.ReducedFunctionOnContactOne>}.
435     In case of a single PDE and a single component solution the contact condition takes the form     In case of a single PDE and a single component solution the contact condition takes the form
436    
437     M{n[j]*J0_{j}=n[j]*J1_{j}=(y_contact+y_contact_reduced)-(d_contact+y_contact_reduced)*jump(u)}     M{n[j]*J0_{j}=n[j]*J1_{j}=(y_contact+y_contact_reduced)-(d_contact+y_contact_reduced)*jump(u)}
# Line 444  class LinearPDE(object): Line 459  class LinearPDE(object):
459     @cvar SCSL: SGI SCSL solver library     @cvar SCSL: SGI SCSL solver library
460     @cvar MKL: Intel's MKL solver library     @cvar MKL: Intel's MKL solver library
461     @cvar UMFPACK: the UMFPACK library     @cvar UMFPACK: the UMFPACK library
462       @cvar TRILINOS: the TRILINOS parallel solver class library from Sandia Natl Labs
463     @cvar ITERATIVE: The default iterative solver     @cvar ITERATIVE: The default iterative solver
464     @cvar AMG: algebraic multi grid     @cvar AMG: algebraic multi grid
465     @cvar RILU: recursive ILU     @cvar RILU: recursive ILU
# Line 473  class LinearPDE(object): Line 489  class LinearPDE(object):
489     PASO= 21     PASO= 21
490     AMG= 22     AMG= 22
491     RILU = 23     RILU = 23
492       TRILINOS = 24
493    
494     SMALL_TOLERANCE=1.e-13     SMALL_TOLERANCE=1.e-13
495     __PACKAGE_KEY="package"     __PACKAGE_KEY="package"
# Line 935  class LinearPDE(object): Line 952  class LinearPDE(object):
952         @param preconditioner: sets a new solver method.         @param preconditioner: sets a new solver method.
953         @type preconditioner: one of L{DEFAULT}, L{JACOBI} L{ILU0}, L{ILUT},L{SSOR}, L{RILU}         @type preconditioner: one of L{DEFAULT}, L{JACOBI} L{ILU0}, L{ILUT},L{SSOR}, L{RILU}
954         """         """
955         if solver==None: solve=self.DEFAULT         if solver==None: solver=self.__solver_method
956           if preconditioner==None: preconditioner=self.__preconditioner
957           if solver==None: solver=self.DEFAULT
958         if preconditioner==None: preconditioner=self.DEFAULT         if preconditioner==None: preconditioner=self.DEFAULT
959         if not (solver,preconditioner)==self.getSolverMethod():         if not (solver,preconditioner)==self.getSolverMethod():
960             self.__solver_method=solver             self.__solver_method=solver
# Line 979  class LinearPDE(object): Line 998  class LinearPDE(object):
998         elif p==self.MKL: package= "MKL"         elif p==self.MKL: package= "MKL"
999         elif p==self.SCSL: package= "SCSL"         elif p==self.SCSL: package= "SCSL"
1000         elif p==self.UMFPACK: package= "UMFPACK"         elif p==self.UMFPACK: package= "UMFPACK"
1001           elif p==self.TRILINOS: package= "TRILINOS"
1002         else : method="unknown"         else : method="unknown"
1003         return "%s solver of %s package"%(method,package)         return "%s solver of %s package"%(method,package)
1004    
# Line 997  class LinearPDE(object): Line 1017  class LinearPDE(object):
1017         sets a new solver package         sets a new solver package
1018    
1019         @param package: sets a new solver method.         @param package: sets a new solver method.
1020         @type package: one of L{DEFAULT}, L{PASO} L{SCSL}, L{MKL}, L{UMFPACK}         @type package: one of L{DEFAULT}, L{PASO} L{SCSL}, L{MKL}, L{UMFPACK}, L{TRILINOS}
1021         """         """
1022         if package==None: package=self.DEFAULT         if package==None: package=self.DEFAULT
1023         if not package==self.getSolverPackage():         if not package==self.getSolverPackage():
# Line 1682  class LinearPDE(object): Line 1702  class LinearPDE(object):
1702                        raise ValueError,"coefficient B in lumped matrix may not be present."                        raise ValueError,"coefficient B in lumped matrix may not be present."
1703                   if not self.getCoefficientOfGeneralPDE("C").isEmpty():                   if not self.getCoefficientOfGeneralPDE("C").isEmpty():
1704                        raise ValueError,"coefficient C in lumped matrix may not be present."                        raise ValueError,"coefficient C in lumped matrix may not be present."
1705                     if not self.getCoefficientOfGeneralPDE("d_contact").isEmpty():
1706                          raise ValueError,"coefficient d_contact in lumped matrix may not be present."
1707                   if not self.getCoefficientOfGeneralPDE("A_reduced").isEmpty():                   if not self.getCoefficientOfGeneralPDE("A_reduced").isEmpty():
1708                        raise ValueError,"coefficient A_reduced in lumped matrix may not be present."                        raise ValueError,"coefficient A_reduced in lumped matrix may not be present."
1709                   if not self.getCoefficientOfGeneralPDE("B_reduced").isEmpty():                   if not self.getCoefficientOfGeneralPDE("B_reduced").isEmpty():
1710                        raise ValueError,"coefficient B_reduced in lumped matrix may not be present."                        raise ValueError,"coefficient B_reduced in lumped matrix may not be present."
1711                   if not self.getCoefficientOfGeneralPDE("C_reduced").isEmpty():                   if not self.getCoefficientOfGeneralPDE("C_reduced").isEmpty():
1712                        raise ValueError,"coefficient C_reduced in lumped matrix may not be present."                        raise ValueError,"coefficient C_reduced in lumped matrix may not be present."
1713                     if not self.getCoefficientOfGeneralPDE("d_contact_reduced").isEmpty():
1714                          raise ValueError,"coefficient d_contact_reduced in lumped matrix may not be present."
1715                   D=self.getCoefficientOfGeneralPDE("D")                   D=self.getCoefficientOfGeneralPDE("D")
1716                     d=self.getCoefficientOfGeneralPDE("d")
1717                     D_reduced=self.getCoefficientOfGeneralPDE("D_reduced")
1718                     d_reduced=self.getCoefficientOfGeneralPDE("d_reduced")
1719                   if not D.isEmpty():                   if not D.isEmpty():
1720                       if self.getNumSolutions()>1:                       if self.getNumSolutions()>1:
1721                          D_times_e=util.matrix_mult(D,numarray.ones((self.getNumSolutions(),)))                          D_times_e=util.matrix_mult(D,numarray.ones((self.getNumSolutions(),)))
# Line 1696  class LinearPDE(object): Line 1723  class LinearPDE(object):
1723                          D_times_e=D                          D_times_e=D
1724                   else:                   else:
1725                      D_times_e=escript.Data()                      D_times_e=escript.Data()
                  d=self.getCoefficientOfGeneralPDE("d")  
1726                   if not d.isEmpty():                   if not d.isEmpty():
1727                       if self.getNumSolutions()>1:                       if self.getNumSolutions()>1:
1728                          d_times_e=util.matrix_mult(d,numarray.ones((self.getNumSolutions(),)))                          d_times_e=util.matrix_mult(d,numarray.ones((self.getNumSolutions(),)))
# Line 1704  class LinearPDE(object): Line 1730  class LinearPDE(object):
1730                          d_times_e=d                          d_times_e=d
1731                   else:                   else:
1732                      d_times_e=escript.Data()                      d_times_e=escript.Data()
1733                   d_contact=self.getCoefficientOfGeneralPDE("d_contact")        
                  if not d_contact.isEmpty():  
                      if self.getNumSolutions()>1:  
                         d_contact_times_e=util.matrixmult(d_contact,numarray.ones((self.getNumSolutions(),)))  
                      else:  
                         d_contact_times_e=d_contact  
                  else:  
                     d_contact_times_e=escript.Data()  
       
                  self.__operator=self.__getNewRightHandSide()  
                  self.getDomain().addPDEToRHS(self.__operator, \  
                                               escript.Data(), \  
                                               D_times_e, \  
                                               d_times_e,\  
                                               d_contact_times_e)  
                  D_reduced=self.getCoefficientOfGeneralPDE("D_reduced")  
1734                   if not D_reduced.isEmpty():                   if not D_reduced.isEmpty():
1735                       if self.getNumSolutions()>1:                       if self.getNumSolutions()>1:
1736                          D_reduced_times_e=util.matrix_mult(D_reduced,numarray.ones((self.getNumSolutions(),)))                          D_reduced_times_e=util.matrix_mult(D_reduced,numarray.ones((self.getNumSolutions(),)))
# Line 1727  class LinearPDE(object): Line 1738  class LinearPDE(object):
1738                          D_reduced_times_e=D_reduced                          D_reduced_times_e=D_reduced
1739                   else:                   else:
1740                      D_reduced_times_e=escript.Data()                      D_reduced_times_e=escript.Data()
                  d_reduced=self.getCoefficientOfGeneralPDE("d_reduced")  
1741                   if not d_reduced.isEmpty():                   if not d_reduced.isEmpty():
1742                       if self.getNumSolutions()>1:                       if self.getNumSolutions()>1:
1743                          d_reduced_times_e=util.matrix_mult(d_reduced,numarray.ones((self.getNumSolutions(),)))                          d_reduced_times_e=util.matrix_mult(d_reduced,numarray.ones((self.getNumSolutions(),)))
# Line 1735  class LinearPDE(object): Line 1745  class LinearPDE(object):
1745                          d_reduced_times_e=d_reduced                          d_reduced_times_e=d_reduced
1746                   else:                   else:
1747                      d_reduced_times_e=escript.Data()                      d_reduced_times_e=escript.Data()
1748                   d_contact_reduced=self.getCoefficientOfGeneralPDE("d_contact_reduced")  
                  if not d_contact_reduced.isEmpty():  
                      if self.getNumSolutions()>1:  
                         d_contact_reduced_times_e=util.matrixmult(d_contact_reduced,numarray.ones((self.getNumSolutions(),)))  
                      else:  
                         d_contact_reduced_times_e=d_contact_reduced  
                  else:  
                     d_contact_reduced_times_e=escript.Data()  
       
1749                   self.__operator=self.__getNewRightHandSide()                   self.__operator=self.__getNewRightHandSide()
1750                   self.getDomain().addPDEToRHS(self.__operator, \                   if hasattr(self.getDomain(), "addPDEToLumpedSystem") :
1751                                                escript.Data(), \                      self.getDomain().addPDEToLumpedSystem(self.__operator, D_times_e, d_times_e)
1752                                                D_times_e, \                      self.getDomain().addPDEToLumpedSystem(self.__operator, D_reduced_times_e, d_reduced_times_e)
1753                                                d_times_e,\                   else:
1754                                                d_contact_times_e)                      self.getDomain().addPDEToRHS(self.__operator, \
1755                   self.getDomain().addPDEToRHS(self.__operator, \                                                   escript.Data(), \
1756                                                escript.Data(), \                                                   D_times_e, \
1757                                                D_reduced_times_e, \                                                   d_times_e,\
1758                                                d_reduced_times_e,\                                                   escript.Data())
1759                                                d_contact_reduced_times_e)                      self.getDomain().addPDEToRHS(self.__operator, \
1760                                                     escript.Data(), \
1761                                                     D_reduced_times_e, \
1762                                                     d_reduced_times_e,\
1763                                                     escript.Data())
1764                   self.__operator=1./self.__operator                   self.__operator=1./self.__operator
1765                   self.trace("New lumped operator has been built.")                   self.trace("New lumped operator has been built.")
1766                   self.__operator_is_Valid=True                   self.__operator_is_Valid=True
# Line 2185  class LameEquation(LinearPDE): Line 2191  class LameEquation(LinearPDE):
2191       else:       else:
2192          raise IllegalCoefficient,"illegal coefficient %s requested for general PDE."%name          raise IllegalCoefficient,"illegal coefficient %s requested for general PDE."%name
2193    
2194    def LinearSinglePDE(domain,debug=False):
2195       """
2196       defines a single linear PDEs
2197    
2198       @param domain: domain of the PDE
2199       @type domain: L{Domain<escript.Domain>}
2200       @param debug: if True debug informations are printed.
2201       @rtype: L{LinearPDE}
2202       """
2203       return LinearPDE(domain,numEquations=1,numSolutions=1,debug=debug)
2204    
2205    def LinearPDESystem(domain,debug=False):
2206       """
2207       defines a system of linear PDEs
2208    
2209       @param domain: domain of the PDE
2210       @type domain: L{Domain<escript.Domain>}
2211       @param debug: if True debug informations are printed.
2212       @rtype: L{LinearPDE}
2213       """
2214       return LinearPDE(domain,numEquations=domain.getDim(),numSolutions=domain.getDim(),debug=debug)
2215    
2216    class TransportPDE(object):
2217         """
2218         Warning: This is still a very experimental. The class is still changing!
2219    
2220         Mu_{,t} =-(A_{ij}u_{,j})_j-(B_{j}u)_{,j} + C_{j} u_{,j} + Y_i + X_{i,i}
2221        
2222         u=r where q>0
2223        
2224         all coefficients are constant over time.
2225    
2226         typical usage:
2227    
2228             p=TransportPDE(dom)
2229             p.setValue(M=Scalar(1.,Function(dom),C=Scalar(1.,Function(dom)*[-1.,0.])
2230             p.setInitialSolution(u=exp(-length(dom.getX()-[0.1,0.1])**2)
2231             t=0
2232             dt=0.1
2233             while (t<1.):
2234                  u=p.solve(dt)
2235    
2236         """
2237         def __init__(self,domain,num_equations=1,theta=0.5,useSUPG=False,trace=True):
2238            self.__domain=domain
2239            self.__num_equations=num_equations
2240            self.__useSUPG=useSUPG
2241            self.__trace=trace
2242            self.__theta=theta
2243            self.__matrix_type=0
2244            self.__reduced=True
2245            self.__reassemble=True
2246            if self.__useSUPG:
2247               self.__pde=LinearPDE(domain,numEquations=num_equations,numSolutions=num_equations,debug=trace)
2248               self.__pde.setSymmetryOn()
2249               self.__pde.setReducedOrderOn()
2250            else:
2251               self.__transport_problem=self.__getNewTransportProblem()
2252            self.setTolerance()
2253            self.__M=escript.Data()
2254            self.__A=escript.Data()
2255            self.__B=escript.Data()
2256            self.__C=escript.Data()
2257            self.__D=escript.Data()
2258            self.__X=escript.Data()
2259            self.__Y=escript.Data()
2260            self.__d=escript.Data()
2261            self.__y=escript.Data()
2262            self.__d_contact=escript.Data()
2263            self.__y_contact=escript.Data()
2264            self.__r=escript.Data()
2265            self.__q=escript.Data()
2266    
2267         def trace(self,text):
2268                 if self.__trace: print text
2269         def getSafeTimeStepSize(self):
2270            if self.__useSUPG:
2271                if self.__reassemble:
2272                   h=self.__domain.getSize()
2273                   dt=None
2274                   if not self.__A.isEmpty():
2275                      dt2=util.inf(h**2*self.__M/util.length(self.__A))
2276                      if dt == None:
2277                         dt = dt2
2278                      else:
2279                         dt=1./(1./dt+1./dt2)
2280                   if not self.__B.isEmpty():
2281                      dt2=util.inf(h*self.__M/util.length(self.__B))
2282                      if dt == None:
2283                         dt = dt2
2284                      else:
2285                         dt=1./(1./dt+1./dt2)
2286                   if not  self.__C.isEmpty():
2287                      dt2=util.inf(h*self.__M/util.length(self.__C))
2288                      if dt == None:
2289                         dt = dt2
2290                      else:
2291                         dt=1./(1./dt+1./dt2)
2292                   if not self.__D.isEmpty():
2293                      dt2=util.inf(self.__M/util.length(self.__D))
2294                      if dt == None:
2295                         dt = dt2
2296                      else:
2297                         dt=1./(1./dt+1./dt2)
2298                   self.__dt = dt/2
2299                return self.__dt
2300            else:
2301                return self.__getTransportProblem().getSafeTimeStepSize()
2302         def getDomain(self):
2303            return self.__domain
2304         def getTheta(self):
2305            return self.__theta
2306         def getNumEquations(self):
2307            return self.__num_equations
2308         def setReducedOn(self):
2309              if not self.reduced():
2310                  if self.__useSUPG:
2311                     self.__pde.setReducedOrderOn()
2312                  else:
2313                     self.__transport_problem=self.__getNewTransportProblem()
2314              self.__reduced=True
2315         def setReducedOff(self):
2316              if self.reduced():
2317                  if self.__useSUPG:
2318                     self.__pde.setReducedOrderOff()
2319                  else:
2320                     self.__transport_problem=self.__getNewTransportProblem()
2321              self.__reduced=False
2322         def reduced(self):
2323             return self.__reduced
2324         def getFunctionSpace(self):
2325            if self.reduced():
2326               return escript.ReducedSolution(self.getDomain())
2327            else:
2328               return escript.Solution(self.getDomain())
2329    
2330         def setTolerance(self,tol=1.e-8):
2331            self.__tolerance=tol
2332            if self.__useSUPG:
2333                  self.__pde.setTolerance(self.__tolerance)
2334    
2335         def __getNewTransportProblem(self):
2336           """
2337           returns an instance of a new operator
2338           """
2339           self.trace("New Transport problem is allocated.")
2340           return self.getDomain().newTransportProblem( \
2341                                   self.getTheta(),
2342                                   self.getNumEquations(), \
2343                                   self.getFunctionSpace(), \
2344                                   self.__matrix_type)
2345              
2346         def __getNewSolutionVector(self):
2347             if self.getNumEquations() ==1 :
2348                    out=escript.Data(0.0,(),self.getFunctionSpace())
2349             else:
2350                    out=escript.Data(0.0,(self.getNumEquations(),),self.getFunctionSpace())
2351             return out
2352    
2353         def __getTransportProblem(self):
2354           if self.__reassemble:
2355                 self.__source=self.__getNewSolutionVector()
2356                 self.__transport_problem.reset()
2357                 self.getDomain().addPDEToTransportProblem(
2358                             self.__transport_problem,
2359                             self.__source,
2360                             self.__M,
2361                             self.__A,
2362                             self.__B,
2363                             self.__C,
2364                             self.__D,
2365                             self.__X,
2366                             self.__Y,
2367                             self.__d,
2368                             self.__y,
2369                             self.__d_contact,
2370                             self.__y_contact)
2371                 self.__transport_problem.insertConstraint(self.__source,self.__q,self.__r)
2372                 self.__reassemble=False
2373           return self.__transport_problem
2374         def setValue(self,M=None, A=None, B=None, C=None, D=None, X=None, Y=None,
2375                      d=None, y=None, d_contact=None, y_contact=None, q=None, r=None):
2376                 if not M==None:
2377                      self.__reassemble=True
2378                      self.__M=M
2379                 if not A==None:
2380                      self.__reassemble=True
2381                      self.__A=A
2382                 if not B==None:
2383                      self.__reassemble=True
2384                      self.__B=B
2385                 if not C==None:
2386                      self.__reassemble=True
2387                      self.__C=C
2388                 if not D==None:
2389                      self.__reassemble=True
2390                      self.__D=D
2391                 if not X==None:
2392                      self.__reassemble=True
2393                      self.__X=X
2394                 if not Y==None:
2395                      self.__reassemble=True
2396                      self.__Y=Y
2397                 if not d==None:
2398                      self.__reassemble=True
2399                      self.__d=d
2400                 if not y==None:
2401                      self.__reassemble=True
2402                      self.__y=y
2403                 if not d_contact==None:
2404                      self.__reassemble=True
2405                      self.__d_contact=d_contact
2406                 if not y_contact==None:
2407                      self.__reassemble=True
2408                      self.__y_contact=y_contact
2409                 if not q==None:
2410                      self.__reassemble=True
2411                      self.__q=q
2412                 if not r==None:
2413                      self.__reassemble=True
2414                      self.__r=r
2415    
2416         def setInitialSolution(self,u):
2417                 if self.__useSUPG:
2418                     self.__u=util.interpolate(u,self.getFunctionSpace())
2419                 else:
2420                     self.__transport_problem.setInitialValue(util.interpolate(u,self.getFunctionSpace()))
2421    
2422         def solve(self,dt,**kwarg):
2423               if self.__useSUPG:
2424                    if self.__reassemble:
2425                        self.__pde.setValue(D=self.__M,d=self.__d,d_contact=self.__d_contact,q=self.__q) # ,r=self.__r)
2426                        self.__reassemble=False
2427                    dt2=self.getSafeTimeStepSize()
2428                    nn=max(math.ceil(dt/self.getSafeTimeStepSize()),1.)
2429                    dt2=dt/nn
2430                    nnn=0
2431                    u=self.__u
2432                    self.trace("number of substeps is %d."%nn)
2433                    while nnn<nn :
2434                        self.__setSUPG(u,u,dt2/2)
2435                        u_half=self.__pde.getSolution(verbose=True)
2436                        self.__setSUPG(u,u_half,dt2)
2437                        u=self.__pde.getSolution(verbose=True)
2438                        nnn+=1
2439                    self.__u=u
2440                    return self.__u
2441               else:
2442                   kwarg["tolerance"]=self.__tolerance
2443                   tp=self.__getTransportProblem()
2444                   return tp.solve(self.__source,dt,kwarg)
2445         def __setSUPG(self,u0,u,dt):
2446                g=util.grad(u)
2447                X=0
2448                Y=self.__M*u0
2449                X=0
2450                self.__pde.setValue(r=u0)
2451                if not self.__A.isEmpty():
2452                   X=X+dt*util.matrixmult(self.__A,g)
2453                if not self.__B.isEmpty():
2454                   X=X+dt*self.__B*u
2455                if not  self.__C.isEmpty():
2456                   Y=Y+dt*util.inner(self.__C,g)
2457                if not self.__D.isEmpty():
2458                   Y=Y+dt*self.__D*u
2459                if not self.__X.isEmpty():
2460                   X=X+dt*self.__X
2461                if not self.__Y.isEmpty():
2462                   Y=Y+dt*self.__Y
2463                self.__pde.setValue(X=X,Y=Y)
2464                if not self.__y.isEmpty():
2465                   self.__pde.setValue(y=dt*self.__y)
2466                if not self.__y_contact.isEmpty():
2467                   self.__pde.setValue(y=dt*self.__y_contact)
2468                self.__pde.setValue(r=u0)

Legend:
Removed from v.1137  
changed lines
  Added in v.1552

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.26