/[escript]/trunk/escript/src/DataTagged.cpp
ViewVC logotype

Diff of /trunk/escript/src/DataTagged.cpp

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

trunk/escript/src/Data/DataTagged.cpp revision 155 by jgs, Wed Nov 9 02:02:19 2005 UTC trunk/escript/src/DataTagged.cpp revision 983 by gross, Tue Feb 20 02:49:08 2007 UTC
# Line 1  Line 1 
1  // $Id$  // $Id$
2    
3  /*  /*
4   ******************************************************************************   ************************************************************
5   *                                                                            *   *          Copyright 2006 by ACcESS MNRF                   *
6   *       COPYRIGHT  ACcESS 2004 -  All Rights Reserved                        *   *                                                          *
7   *                                                                            *   *              http://www.access.edu.au                    *
8   * This software is the property of ACcESS. No part of this code              *   *       Primary Business: Queensland, Australia            *
9   * may be copied in any form or by any means without the expressed written    *   *  Licensed under the Open Software License version 3.0    *
10   * consent of ACcESS.  Copying, use or modification of this software          *   *     http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php       *
11   * by any unauthorised person is illegal unless that person has a software    *   *                                                          *
12   * license agreement with ACcESS.                                             *   ************************************************************
  *                                                                            *  
  ******************************************************************************  
13  */  */
14    
15  #include "escript/Data/DataTagged.h"  #include "DataTagged.h"
 #include "escript/Data/DataConstant.h"  
 #include "escript/Data/DataExpanded.h"  
 #include "escript/Data/DataException.h"  
16    
17  #include <sstream>  #include "DataConstant.h"
18    #include "DataException.h"
19    #include <netcdfcpp.h>
20    
21  using namespace std;  using namespace std;
22    
# Line 28  namespace escript { Line 25  namespace escript {
25  DataTagged::DataTagged()  DataTagged::DataTagged()
26    : DataAbstract(FunctionSpace())    : DataAbstract(FunctionSpace())
27  {  {
28      // default constructor
29    
30    // create a scalar default value    // create a scalar default value
31    m_data.resize(1,0.,1);    m_data.resize(1,0.,1);
32    DataArrayView temp(m_data,DataArrayView::ShapeType());    DataArrayView temp(m_data,DataArrayView::ShapeType());
# Line 40  DataTagged::DataTagged(const TagListType Line 39  DataTagged::DataTagged(const TagListType
39                 const FunctionSpace& what)                 const FunctionSpace& what)
40    : DataAbstract(what)    : DataAbstract(what)
41  {  {
42      // constructor
43    
44    // initialise the array of data values    // initialise the array of data values
45    // the default value is always the first item in the values list    // the default value is always the first item in the values list
46    int len = defaultValue.noValues();    int len = defaultValue.noValues();
# Line 59  DataTagged::DataTagged(const TagListType Line 60  DataTagged::DataTagged(const TagListType
60  DataTagged::DataTagged(const FunctionSpace& what,  DataTagged::DataTagged(const FunctionSpace& what,
61                         const DataArrayView::ShapeType &shape,                         const DataArrayView::ShapeType &shape,
62                         const int tags[],                         const int tags[],
63                         const ValueType &data)                         const ValueType& data)
64    : DataAbstract(what)    : DataAbstract(what)
65  {  {
66      // alternative constructor
67      // not unit_tested tested yet
68    
69    // copy the data    // copy the data
70    m_data=data;    m_data=data;
71    
# Line 75  DataTagged::DataTagged(const FunctionSpa Line 79  DataTagged::DataTagged(const FunctionSpa
79    }    }
80  }  }
81    
82    DataTagged::DataTagged(const FunctionSpace& what,
83                           const DataArrayView::ShapeType &shape,
84                           const TagListType& tags,
85                           const ValueType& data)
86      : DataAbstract(what)
87    {
88      // alternative constructor
89      // not unit_tested tested yet
90    
91      // copy the data
92      m_data=data;
93    
94      // create the view of the data
95      DataArrayView tempView(m_data,shape);
96      setPointDataView(tempView);
97    
98      // create the tag lookup map
99      for (int sampleNo=0; sampleNo<getNumSamples(); sampleNo++) {
100        m_offsetLookup.insert(DataMapType::value_type(sampleNo,tags[sampleNo]));
101      }
102    }
103    
104    
105  DataTagged::DataTagged(const DataTagged& other)  DataTagged::DataTagged(const DataTagged& other)
106    : DataAbstract(other.getFunctionSpace()),    : DataAbstract(other.getFunctionSpace()),
107    m_data(other.m_data),    m_data(other.m_data),
108    m_offsetLookup(other.m_offsetLookup)    m_offsetLookup(other.m_offsetLookup)
109  {  {
110      // copy constructor
111    
112    // create the data view    // create the data view
113    DataArrayView temp(m_data,other.getPointDataView().getShape());    DataArrayView temp(m_data,other.getPointDataView().getShape());
114    setPointDataView(temp);    setPointDataView(temp);
# Line 88  DataTagged::DataTagged(const DataTagged& Line 117  DataTagged::DataTagged(const DataTagged&
117  DataTagged::DataTagged(const DataConstant& other)  DataTagged::DataTagged(const DataConstant& other)
118    : DataAbstract(other.getFunctionSpace())    : DataAbstract(other.getFunctionSpace())
119  {  {
120      // copy constructor
121    
122    // fill the default value with the constant value item from "other"    // fill the default value with the constant value item from "other"
123    const DataArrayView& value=other.getPointDataView();    const DataArrayView& value=other.getPointDataView();
124    int len = value.noValues();    int len = value.noValues();
# Line 101  DataTagged::DataTagged(const DataConstan Line 132  DataTagged::DataTagged(const DataConstan
132    setPointDataView(temp);    setPointDataView(temp);
133  }  }
134    
135    DataAbstract*
136    DataTagged::getSlice(const DataArrayView::RegionType& region) const
137    {
138      return new DataTagged(*this, region);
139    }
140    
141  DataTagged::DataTagged(const DataTagged& other,  DataTagged::DataTagged(const DataTagged& other,
142                 const DataArrayView::RegionType& region)                 const DataArrayView::RegionType& region)
143    : DataAbstract(other.getFunctionSpace())    : DataAbstract(other.getFunctionSpace())
144  {  {
145      // slice constructor
146    
147    // get the shape of the slice to copy from other    // get the shape of the slice to copy from other
148    DataArrayView::ShapeType shape(DataArrayView::getResultSliceShape(region));    DataArrayView::ShapeType regionShape(DataArrayView::getResultSliceShape(region));
149    DataArrayView::RegionLoopRangeType region_loop_range=getSliceRegionLoopRange(region);    DataArrayView::RegionLoopRangeType regionLoopRange=getSliceRegionLoopRange(region);
150    
151    // allocate enough space for all values    // allocate enough space in this for all values
152    int len = DataArrayView::noValues(shape)*(other.m_offsetLookup.size()+1);    // (need to add one to allow for the default value)
153    m_data.resize(len,0.,len);    int len = DataArrayView::noValues(regionShape)*(other.m_offsetLookup.size()+1);
154      m_data.resize(len,0.0,len);
155    
156    // create the data view    // create the data view
157    DataArrayView temp(m_data,shape);    DataArrayView temp(m_data,regionShape);
158    setPointDataView(temp);    setPointDataView(temp);
159    
160    // copy the default value    // copy the default value from other to this
161    getDefaultValue().copySlice(other.getDefaultValue(),region_loop_range);    getDefaultValue().copySlice(other.getDefaultValue(), regionLoopRange);
162    
163    // loop through the tag values copying these    // loop through the tag values copying these
164    DataMapType::const_iterator pos;    DataMapType::const_iterator pos;
165    DataArrayView::ValueType::size_type tagOffset=getPointDataView().noValues();    DataArrayView::ValueType::size_type tagOffset=getPointDataView().noValues();
166    for (pos=other.m_offsetLookup.begin();pos!=other.m_offsetLookup.end();pos++){    for (pos=other.m_offsetLookup.begin();pos!=other.m_offsetLookup.end();pos++){
167      getPointDataView().copySlice(tagOffset,other.getPointDataView(),pos->second,region_loop_range);      getPointDataView().copySlice(tagOffset,other.getPointDataView(),pos->second,regionLoopRange);
168      m_offsetLookup.insert(DataMapType::value_type(pos->first,tagOffset));      m_offsetLookup.insert(DataMapType::value_type(pos->first,tagOffset));
169      tagOffset+=getPointDataView().noValues();      tagOffset+=getPointDataView().noValues();
170    }    }
171  }  }
172    
173  void  void
174  DataTagged::reshapeDataPoint(const DataArrayView::ShapeType& shape)  DataTagged::setSlice(const DataAbstract* other,
175                         const DataArrayView::RegionType& region)
176  {  {
   // can only reshape a rank zero data point  
   if (getPointDataView().getRank()!=0) {  
     stringstream temp;  
     temp << "Error - Can only reshape Data with data points of rank 0. "  
      << "This Data has data points with rank: "  
      << getPointDataView().getRank();  
     throw DataException(temp.str());  
   }  
   
   // allocate enough space for all values  
   DataArrayView::ValueType newData(DataArrayView::noValues(shape)*(m_offsetLookup.size()+1));  
   DataArrayView newView(newData,shape);  
   newView.copy(0,getDefaultValue()());  
   
   // loop through the tag values  
   DataMapType::iterator pos;  
   DataArrayView::ValueType::size_type tagOffset=DataArrayView::noValues(shape);  
   for (pos=m_offsetLookup.begin();pos!=m_offsetLookup.end();pos++){  
     newView.copy(tagOffset,m_data[pos->second]);  
     pos->second=tagOffset;  
     tagOffset+=DataArrayView::noValues(shape);  
   }  
   m_data=newData;  
   DataArrayView temp(m_data,shape);  
   setPointDataView(temp);  
 }  
177    
178  DataAbstract*    // other must be another DataTagged object
179  DataTagged::getSlice(const DataArrayView::RegionType& region) const    // Data:setSlice implementation should ensure this
180  {    const DataTagged* otherTemp=dynamic_cast<const DataTagged*>(other);
181    return new DataTagged(*this,region);    if (otherTemp==0) {
 }  
   
 void  
 DataTagged::setSlice(const DataAbstract* value,  
                      const DataArrayView::RegionType& region)  
 {  
   const DataTagged* tempDataTag=dynamic_cast<const DataTagged*>(value);  
   if (tempDataTag==0) {  
182      throw DataException("Programming error - casting to DataTagged.");      throw DataException("Programming error - casting to DataTagged.");
183    }    }
184    
185    DataArrayView::ShapeType shape(DataArrayView::getResultSliceShape(region));    // determine shape of the specified region
186    DataArrayView::RegionLoopRangeType region_loop_range=getSliceRegionLoopRange(region);    DataArrayView::ShapeType regionShape(DataArrayView::getResultSliceShape(region));
187    
188      // modify region specification as needed to match rank of this object
189      DataArrayView::RegionLoopRangeType regionLoopRange=getSliceRegionLoopRange(region);
190    
191      // ensure rank/shape of this object is compatible with specified region
192    if (getPointDataView().getRank()!=region.size()) {    if (getPointDataView().getRank()!=region.size()) {
193      throw DataException("Error - Invalid slice region.");      throw DataException("Error - Invalid slice region.");
194    }    }
195    if (tempDataTag->getPointDataView().getRank()>0 && !value->getPointDataView().checkShape(shape)) {    if (otherTemp->getPointDataView().getRank()>0 && !other->getPointDataView().checkShape(regionShape)) {
196      throw DataException (value->getPointDataView().createShapeErrorMessage(      throw DataException (other->getPointDataView().createShapeErrorMessage(
197                  "Error - Couldn't copy slice due to shape mismatch.",shape));                           "Error - Couldn't copy slice due to shape mismatch.",regionShape));
198    }    }
199    
200    getDefaultValue().copySliceFrom(tempDataTag->getDefaultValue(),region_loop_range);    // copy slice from other default value to this default value
201      getDefaultValue().copySliceFrom(otherTemp->getDefaultValue(), regionLoopRange);
202    
203    // loop through the tag values    // loop through tag values in other, adding any which aren't in this, using default value
204    DataMapType::const_iterator pos;    DataMapType::const_iterator pos;
205      for (pos=otherTemp->m_offsetLookup.begin();pos!=otherTemp->m_offsetLookup.end();pos++) {
206        if (!isCurrentTag(pos->first)) {
207          addTaggedValue(pos->first,getDefaultValue());
208        }
209      }
210    
211      // loop through the tag values copying slices from other to this
212    for (pos=m_offsetLookup.begin();pos!=m_offsetLookup.end();pos++) {    for (pos=m_offsetLookup.begin();pos!=m_offsetLookup.end();pos++) {
213      getDataPointByTag(pos->first).copySliceFrom(tempDataTag->getDataPointByTag(pos->first),region_loop_range);      getDataPointByTag(pos->first).copySliceFrom(otherTemp->getDataPointByTag(pos->first), regionLoopRange);
214    }    }
215    
216  }  }
217    
218  int  int
# Line 207  DataTagged::getTagNumber(int dpno) Line 228  DataTagged::getTagNumber(int dpno)
228      throw DataException("DataTagged::getTagNumber error: no data-points associated with this object.");      throw DataException("DataTagged::getTagNumber error: no data-points associated with this object.");
229    }    }
230    
231    if (dpno<0 || dpno>numDataPoints) {    if (dpno<0 || dpno>numDataPoints-1) {
232      throw DataException("DataTagged::getTagNumber error: invalid data-point number supplied.");      throw DataException("DataTagged::getTagNumber error: invalid data-point number supplied.");
233    }    }
234    
# Line 225  DataTagged::getTagNumber(int dpno) Line 246  DataTagged::getTagNumber(int dpno)
246  }  }
247    
248  void  void
249    DataTagged::setTaggedValues(const TagListType& tagKeys,
250                                const ValueListType& values)
251    {
252      addTaggedValues(tagKeys,values);
253    }
254    
255    void
256  DataTagged::setTaggedValue(int tagKey,  DataTagged::setTaggedValue(int tagKey,
257                             const DataArrayView& value)                             const DataArrayView& value)
258  {  {
# Line 246  DataTagged::setTaggedValue(int tagKey, Line 274  DataTagged::setTaggedValue(int tagKey,
274  }  }
275    
276  void  void
277    DataTagged::addTaggedValues(const TagListType& tagKeys,
278                                const ValueListType& values)
279    {
280      if (values.size()==0) {
281        // copy the current default value for each of the tags
282        TagListType::const_iterator iT;
283        for (iT=tagKeys.begin();iT!=tagKeys.end();iT++) {
284          // the point data view for DataTagged points at the default value
285          addTaggedValue(*iT,getPointDataView());
286        }
287      } else if (values.size()==1 && tagKeys.size()>1) {
288        // assume the one given value will be used for all tag values
289        TagListType::const_iterator iT;
290        for (iT=tagKeys.begin();iT!=tagKeys.end();iT++) {
291          addTaggedValue(*iT,values[0]);
292        }
293      } else {
294        if (tagKeys.size()!=values.size()) {
295          stringstream temp;
296          temp << "Error - (addTaggedValue) Number of tags: " << tagKeys.size()
297           << " doesn't match number of values: " << values.size();
298          throw DataException(temp.str());
299        } else {
300          for (int i=0;i<tagKeys.size();i++) {
301            addTaggedValue(tagKeys[i],values[i]);
302          }
303        }
304      }
305    }
306    
307    void
308  DataTagged::addTaggedValue(int tagKey,  DataTagged::addTaggedValue(int tagKey,
309                             const DataArrayView& value)                             const DataArrayView& value)
310  {  {
# Line 276  DataTagged::addTaggedValue(int tagKey, Line 335  DataTagged::addTaggedValue(int tagKey,
335    }    }
336  }  }
337    
 void  
 DataTagged::setTaggedValues(const TagListType& tagKeys,  
                             const ValueListType& values)  
 {  
   addTaggedValues(tagKeys,values);  
 }  
   
 void  
 DataTagged::addTaggedValues(const TagListType& tagKeys,  
                             const ValueListType& values)  
 {  
   if (values.size()==0) {  
     // copy the default value for each of the tags  
     TagListType::const_iterator iT;  
     for (iT=tagKeys.begin();iT!=tagKeys.end();iT++) {  
       // the point data view for DataTagged points at the default value  
       addTaggedValue(*iT,getPointDataView());  
     }  
   } else if (values.size()==1 && tagKeys.size()>1) {  
     // assume the one value will be used for all tag values  
     TagListType::const_iterator iT;  
     for (iT=tagKeys.begin();iT!=tagKeys.end();iT++) {  
       addTaggedValue(*iT,values[0]);  
     }  
   } else {  
     if (tagKeys.size()!=values.size()) {  
       stringstream temp;  
       temp << "Error - (addTaggedValue) Number of tags: " << tagKeys.size()  
        << " doesn't match the number of values: " << values.size();  
       throw DataException(temp.str());  
     } else {  
       for (int i=0;i<tagKeys.size();i++) {  
         addTaggedValue(tagKeys[i],values[i]);  
       }  
     }  
   }  
 }  
   
338  double*  double*
339  DataTagged::getSampleDataByTag(int tag)  DataTagged::getSampleDataByTag(int tag)
340  {  {
# Line 344  DataTagged::toString() const Line 365  DataTagged::toString() const
365    return temp.str();    return temp.str();
366  }  }
367    
368  DataArrayView  DataArrayView::ValueType::size_type
369  DataTagged::getDataPointByTag(int tag) const  DataTagged::getPointOffset(int sampleNo,
370                               int dataPointNo) const
371  {  {
372    DataMapType::const_iterator pos(m_offsetLookup.find(tag));    int tagKey=getFunctionSpace().getTagFromSampleNo(sampleNo);
373      DataMapType::const_iterator pos(m_offsetLookup.find(tagKey));
374    DataArrayView::ValueType::size_type offset=m_defaultValueOffset;    DataArrayView::ValueType::size_type offset=m_defaultValueOffset;
375    if (pos!=m_offsetLookup.end()) {    if (pos!=m_offsetLookup.end()) {
376      offset=pos->second;      offset=pos->second;
377    }    }
378    DataArrayView temp(getPointDataView());    return offset;
   temp.setOffset(offset);  
   return temp;  
379  }  }
380    
381  DataArrayView::ValueType::size_type  DataArrayView
382  DataTagged::getPointOffset(int sampleNo,  DataTagged::getDataPointByTag(int tag) const
                            int dataPointNo) const  
383  {  {
384    int tagKey=getFunctionSpace().getTagFromSampleNo(sampleNo);    DataMapType::const_iterator pos(m_offsetLookup.find(tag));
   DataMapType::const_iterator pos(m_offsetLookup.find(tagKey));  
385    DataArrayView::ValueType::size_type offset=m_defaultValueOffset;    DataArrayView::ValueType::size_type offset=m_defaultValueOffset;
386    if (pos!=m_offsetLookup.end()) {    if (pos!=m_offsetLookup.end()) {
387      offset=pos->second;      offset=pos->second;
388    }    }
389    return offset;    DataArrayView temp(getPointDataView());
390      temp.setOffset(offset);
391      return temp;
392  }  }
393    
394  DataArrayView  DataArrayView
# Line 379  DataTagged::getDataPoint(int sampleNo, Line 400  DataTagged::getDataPoint(int sampleNo,
400    return getDataPointByTag(tagKey);    return getDataPointByTag(tagKey);
401  }  }
402    
 const DataTagged::DataMapType&  
 DataTagged::getTagLookup() const  
 {  
   return m_offsetLookup;  
 }  
   
 DataArrayView::ValueType::size_type  
 DataTagged::getLength() const  
 {  
   return m_data.size();  
 }  
   
403  int  int
404  DataTagged::archiveData(ofstream& archiveFile,  DataTagged::archiveData(ofstream& archiveFile,
405                          const DataArrayView::ValueType::size_type noValues) const                          const DataArrayView::ValueType::size_type noValues) const
# Line 404  DataTagged::extractData(ifstream& archiv Line 413  DataTagged::extractData(ifstream& archiv
413  {  {
414    return(m_data.extractData(archiveFile, noValues));    return(m_data.extractData(archiveFile, noValues));
415  }  }
416    void
417    DataTagged::symmetric(DataAbstract* ev)
418    {
419      DataTagged* temp_ev=dynamic_cast<DataTagged*>(ev);
420      if (temp_ev==0) {
421        throw DataException("Error - DataTagged::symmetric casting to DataTagged failed (probably a programming error).");
422      }
423      const DataTagged::DataMapType& thisLookup=getTagLookup();
424      DataTagged::DataMapType::const_iterator i;
425      DataTagged::DataMapType::const_iterator thisLookupEnd=thisLookup.end();
426      for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) {
427          temp_ev->addTaggedValue(i->first,temp_ev->getDefaultValue());
428          DataArrayView thisView=getDataPointByTag(i->first);
429          DataArrayView evView=temp_ev->getDataPointByTag(i->first);
430          DataArrayView::symmetric(thisView,0,evView,0);
431      }
432      DataArrayView::symmetric(getDefaultValue(),0,temp_ev->getDefaultValue(),0);
433    }
434    void
435    DataTagged::nonsymmetric(DataAbstract* ev)
436    {
437      DataTagged* temp_ev=dynamic_cast<DataTagged*>(ev);
438      if (temp_ev==0) {
439        throw DataException("Error - DataTagged::nonsymmetric casting to DataTagged failed (probably a programming error).");
440      }
441      const DataTagged::DataMapType& thisLookup=getTagLookup();
442      DataTagged::DataMapType::const_iterator i;
443      DataTagged::DataMapType::const_iterator thisLookupEnd=thisLookup.end();
444      for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) {
445          temp_ev->addTaggedValue(i->first,temp_ev->getDefaultValue());
446          DataArrayView thisView=getDataPointByTag(i->first);
447          DataArrayView evView=temp_ev->getDataPointByTag(i->first);
448          DataArrayView::nonsymmetric(thisView,0,evView,0);
449      }
450      DataArrayView::nonsymmetric(getDefaultValue(),0,temp_ev->getDefaultValue(),0);
451    }
452    void
453    DataTagged::trace(DataAbstract* ev, int axis_offset)
454    {
455      DataTagged* temp_ev=dynamic_cast<DataTagged*>(ev);
456      if (temp_ev==0) {
457        throw DataException("Error - DataTagged::trace casting to DataTagged failed (probably a programming error).");
458      }
459      const DataTagged::DataMapType& thisLookup=getTagLookup();
460      DataTagged::DataMapType::const_iterator i;
461      DataTagged::DataMapType::const_iterator thisLookupEnd=thisLookup.end();
462      for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) {
463          temp_ev->addTaggedValue(i->first,temp_ev->getDefaultValue());
464          DataArrayView thisView=getDataPointByTag(i->first);
465          DataArrayView evView=temp_ev->getDataPointByTag(i->first);
466          DataArrayView::trace(thisView,0,evView,0, axis_offset);
467      }
468      DataArrayView::trace(getDefaultValue(),0,temp_ev->getDefaultValue(),0,axis_offset);
469    }
470    
471    void
472    DataTagged::transpose(DataAbstract* ev, int axis_offset)
473    {
474      DataTagged* temp_ev=dynamic_cast<DataTagged*>(ev);
475      if (temp_ev==0) {
476        throw DataException("Error - DataTagged::transpose casting to DataTagged failed (probably a programming error).");
477      }
478      const DataTagged::DataMapType& thisLookup=getTagLookup();
479      DataTagged::DataMapType::const_iterator i;
480      DataTagged::DataMapType::const_iterator thisLookupEnd=thisLookup.end();
481      for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) {
482          temp_ev->addTaggedValue(i->first,temp_ev->getDefaultValue());
483          DataArrayView thisView=getDataPointByTag(i->first);
484          DataArrayView evView=temp_ev->getDataPointByTag(i->first);
485          DataArrayView::transpose(thisView,0,evView,0, axis_offset);
486      }
487      DataArrayView::transpose(getDefaultValue(),0,temp_ev->getDefaultValue(),0,axis_offset);
488    }
489    
490    void
491    DataTagged::swapaxes(DataAbstract* ev, int axis0, int axis1)
492    {
493      DataTagged* temp_ev=dynamic_cast<DataTagged*>(ev);
494      if (temp_ev==0) {
495        throw DataException("Error - DataTagged::swapaxes casting to DataTagged failed (probably a programming error).");
496      }
497      const DataTagged::DataMapType& thisLookup=getTagLookup();
498      DataTagged::DataMapType::const_iterator i;
499      DataTagged::DataMapType::const_iterator thisLookupEnd=thisLookup.end();
500      for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) {
501          temp_ev->addTaggedValue(i->first,temp_ev->getDefaultValue());
502          DataArrayView thisView=getDataPointByTag(i->first);
503          DataArrayView evView=temp_ev->getDataPointByTag(i->first);
504          DataArrayView::swapaxes(thisView,0,evView,0,axis0,axis1);
505      }
506      DataArrayView::swapaxes(getDefaultValue(),0,temp_ev->getDefaultValue(),0,axis0,axis1);
507    }
508    
509    void
510    DataTagged::eigenvalues(DataAbstract* ev)
511    {
512      DataTagged* temp_ev=dynamic_cast<DataTagged*>(ev);
513      if (temp_ev==0) {
514        throw DataException("Error - DataTagged::eigenvalues casting to DataTagged failed (propably a programming error).");
515      }
516      const DataTagged::DataMapType& thisLookup=getTagLookup();
517      DataTagged::DataMapType::const_iterator i;
518      DataTagged::DataMapType::const_iterator thisLookupEnd=thisLookup.end();
519      for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) {
520          temp_ev->addTaggedValue(i->first,temp_ev->getDefaultValue());
521          DataArrayView thisView=getDataPointByTag(i->first);
522          DataArrayView evView=temp_ev->getDataPointByTag(i->first);
523          DataArrayView::eigenvalues(thisView,0,evView,0);
524      }
525      DataArrayView::eigenvalues(getDefaultValue(),0,temp_ev->getDefaultValue(),0);
526    }
527    void
528    DataTagged::eigenvalues_and_eigenvectors(DataAbstract* ev,DataAbstract* V,const double tol)
529    {
530      DataTagged* temp_ev=dynamic_cast<DataTagged*>(ev);
531      if (temp_ev==0) {
532        throw DataException("Error - DataTagged::eigenvalues_and_eigenvectors casting to DataTagged failed (propably a programming error).");
533      }
534      DataTagged* temp_V=dynamic_cast<DataTagged*>(V);
535      if (temp_V==0) {
536        throw DataException("Error - DataTagged::eigenvalues_and_eigenvectors casting to DataTagged failed (propably a programming error).");
537      }
538      const DataTagged::DataMapType& thisLookup=getTagLookup();
539      DataTagged::DataMapType::const_iterator i;
540      DataTagged::DataMapType::const_iterator thisLookupEnd=thisLookup.end();
541      for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) {
542          temp_ev->addTaggedValue(i->first,temp_ev->getDefaultValue());
543          temp_V->addTaggedValue(i->first,temp_V->getDefaultValue());
544          DataArrayView thisView=getDataPointByTag(i->first);
545          DataArrayView evView=temp_ev->getDataPointByTag(i->first);
546          DataArrayView VView=temp_V->getDataPointByTag(i->first);
547          DataArrayView::eigenvalues_and_eigenvectors(thisView,0,evView,0,VView,0,tol);
548      }
549      DataArrayView::eigenvalues_and_eigenvectors(getDefaultValue(),0,
550                                                  temp_ev->getDefaultValue(),0,
551                                                  temp_V->getDefaultValue(),0,
552                                                  tol);
553    
554    
555    }
556    
557    void
558    DataTagged::dump(const std::string fileName) const
559    {
560       const int ldims=DataArrayView::maxRank+1;
561       const NcDim* ncdims[ldims];
562       NcVar *var, *tags_var;
563       int rank = getPointDataView().getRank();
564       int type=  getFunctionSpace().getTypeCode();
565       int ndims =0;
566       long dims[ldims];
567       DataArrayView::ShapeType shape = getPointDataView().getShape();
568    
569       // netCDF error handler
570       NcError err(NcError::verbose_nonfatal);
571       // Create the file.
572       NcFile dataFile(fileName.c_str(), NcFile::Replace);
573       // check if writing was successful
574       if (!dataFile.is_valid())
575            throw DataException("Error - DataTagged:: opening of netCDF file for output failed.");
576       if (!dataFile.add_att("type","tagged") )
577            throw DataException("Error - DataTagged:: appending data type to netCDF file failed.");
578       if (!dataFile.add_att("rank",rank) )
579            throw DataException("Error - DataTagged:: appending rank attribute to netCDF file failed.");
580       if (!dataFile.add_att("function_space_type",type))
581            throw DataException("Error - DataTagged:: appending function space attribute to netCDF file failed.");
582       ndims=rank+1;
583       if ( rank >0 ) {
584           dims[0]=shape[0];
585           if (! (ncdims[0] = dataFile.add_dim("d0",shape[0])) )
586                throw DataException("Error - DataTagged:: appending ncdimsion 0 to netCDF file failed.");
587       }
588       if ( rank >1 ) {
589           dims[1]=shape[1];
590           if (! (ncdims[1] = dataFile.add_dim("d1",shape[1])) )
591                throw DataException("Error - DataTagged:: appending ncdimsion 1 to netCDF file failed.");
592       }
593       if ( rank >2 ) {
594           dims[2]=shape[2];
595           if (! (ncdims[2] = dataFile.add_dim("d2", shape[2])) )
596                throw DataException("Error - DataTagged:: appending ncdimsion 2 to netCDF file failed.");
597       }
598       if ( rank >3 ) {
599           dims[3]=shape[3];
600           if (! (ncdims[3] = dataFile.add_dim("d3", shape[3])) )
601                throw DataException("Error - DataTagged:: appending ncdimsion 3 to netCDF file failed.");
602       }
603       const DataTagged::DataMapType& thisLookup=getTagLookup();
604       DataTagged::DataMapType::const_iterator i;
605       DataTagged::DataMapType::const_iterator thisLookupEnd=thisLookup.end();
606       int ntags=1;
607       for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) ntags++;
608       int tags[ntags], c=1;
609       tags[0]=-1;
610       for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) tags[c++]=i->first;
611       dims[rank]=ntags;
612       if (! (ncdims[rank] = dataFile.add_dim("num_tags", dims[rank])) )
613                throw DataException("Error - DataTagged:: appending num_tags to netCDF file failed.");
614       if (! ( tags_var = dataFile.add_var("tags", ncInt, ncdims[rank])) )
615            throw DataException("Error - DataTagged:: appending tags to netCDF file failed.");
616       if (! (tags_var->put(tags,dims[rank])) )
617            throw DataException("Error - DataTagged:: copy tags to netCDF buffer failed.");
618       if (! ( var = dataFile.add_var("data", ncDouble, ndims, ncdims)) )
619            throw DataException("Error - DataTagged:: appending variable to netCDF file failed.");
620       if (! (var->put(&m_data[0],dims)) )
621            throw DataException("Error - DataTagged:: copy data to netCDF buffer failed.");
622    }
623    
624    
625  }  // end of namespace  }  // end of namespace

Legend:
Removed from v.155  
changed lines
  Added in v.983

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.26