/[escript]/trunk/escript/src/DataTagged.cpp
ViewVC logotype

Diff of /trunk/escript/src/DataTagged.cpp

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

trunk/esys2/escript/src/Data/DataTagged.cpp revision 97 by jgs, Tue Dec 14 05:39:33 2004 UTC trunk/escript/src/DataTagged.cpp revision 1796 by jfenwick, Wed Sep 17 01:45:46 2008 UTC
# Line 1  Line 1 
 // $Id$  
 /*  
  ******************************************************************************  
  *                                                                            *  
  *       COPYRIGHT  ACcESS 2004 -  All Rights Reserved                        *  
  *                                                                            *  
  * This software is the property of ACcESS. No part of this code              *  
  * may be copied in any form or by any means without the expressed written    *  
  * consent of ACcESS.  Copying, use or modification of this software          *  
  * by any unauthorised person is illegal unless that person has a software    *  
  * license agreement with ACcESS.                                             *  
  *                                                                            *  
  ******************************************************************************  
 */  
1    
2  #include "escript/Data/DataTagged.h"  /* $Id$ */
 #include "escript/Data/DataConstant.h"  
3    
4  #include <sstream>  /*******************************************************
5     *
6     *           Copyright 2003-2007 by ACceSS MNRF
7     *       Copyright 2007 by University of Queensland
8     *
9     *                http://esscc.uq.edu.au
10     *        Primary Business: Queensland, Australia
11     *  Licensed under the Open Software License version 3.0
12     *     http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php
13     *
14     *******************************************************/
15    
16    #include "DataTagged.h"
17    #include "esysUtils/esys_malloc.h"
18    
19    #include "DataConstant.h"
20    #include "DataException.h"
21    #ifdef USE_NETCDF
22    #include <netcdfcpp.h>
23    #endif
24    #include "DataMaths.h"
25    
26  using namespace std;  using namespace std;
27    
28  namespace escript {  namespace escript {
29    
30  DataTagged::DataTagged():  DataTagged::DataTagged()
31    DataAbstract(FunctionSpace())    : DataAbstract(FunctionSpace(),DataTypes::scalarShape)
32  {  {
33    //    // default constructor
34    
35    // create a scalar default value    // create a scalar default value
36    m_data.push_back(0.0);    m_data.resize(1,0.,1);
37    DataArrayView temp(m_data,DataArrayView::ShapeType());  /*  DataArrayView temp(m_data,DataTypes::ShapeType());
38    setPointDataView(temp);    setPointDataView(temp);*/
39    }
40    
41    // DataTagged::DataTagged(const TagListType& tagKeys,
42    //             const ValueListType& values,
43    //             const DataArrayView& defaultValue,
44    //             const FunctionSpace& what)
45    //   : DataAbstract(what)
46    // {
47    //   // constructor
48    //
49    //   // initialise the array of data values
50    //   // the default value is always the first item in the values list
51    //   int len = defaultValue.noValues();
52    //   m_data.resize(len,0.,len);
53    //   for (int i=0; i<defaultValue.noValues(); i++) {
54    //     m_data[i]=defaultValue.getData(i);
55    //   }
56    //
57    //   // create the data view
58    //   DataArrayView temp(m_data,defaultValue.getShape());
59    //   setPointDataView(temp);
60    //
61    //   // add remaining tags and values
62    //   addTaggedValues(tagKeys,values);
63    // }
64    
65    DataTagged::DataTagged(const FunctionSpace& what,
66                           const DataTypes::ShapeType &shape,
67                           const int tags[],
68                           const ValueType& data)
69      : DataAbstract(what,shape)
70    {
71      // alternative constructor
72      // not unit_tested tested yet
73      // It is not explicitly unit tested yet, but it is called from DataFactory
74    
75      // copy the data
76      m_data=data;
77    
78      // create the view of the data
79    //   DataArrayView tempView(m_data,shape);
80    //   setPointDataView(tempView);
81    
82      // we can't rely on the tag array to give us the number of tags so
83      // use the data we have been passed
84      int valsize=DataTypes::noValues(shape);
85      int ntags=data.size()/valsize;
86    
87      // create the tag lookup map
88      // we assume that the first value and first tag are the default value so we skip
89      for (int i=1;i<ntags;++i)
90      {
91        m_offsetLookup.insert(DataMapType::value_type(tags[i],i*valsize));
92      }
93    }
94    
95    DataTagged::DataTagged(const FunctionSpace& what,
96                           const DataTypes::ShapeType &shape,
97                           const TagListType& tags,
98                           const ValueType& data)
99      : DataAbstract(what,shape)
100    {
101      // alternative constructor
102    
103      // copy the data
104      m_data=data;
105    
106      // create the view of the data
107    //   DataArrayView tempView(m_data,shape);
108    //   setPointDataView(tempView);
109    
110      // create the tag lookup map
111    
112    //   for (int sampleNo=0; sampleNo<getNumSamples(); sampleNo++) {
113    //     m_offsetLookup.insert(DataMapType::value_type(sampleNo,tags[sampleNo]));
114    //   }
115    
116      // The above code looks like it will create a map the wrong way around
117    
118      int valsize=DataTypes::noValues(shape);
119      int npoints=(data.size()/valsize)-1;
120      int ntags=tags.size();
121      if (ntags>npoints)
122      {     // This throw is not unit tested yet
123        throw DataException("Programming error - Too many tags for the supplied values.");
124      }
125    
126      // create the tag lookup map
127      // we assume that the first value is the default value so we skip it (hence the i+1 below)
128      for (int i=0;i<ntags;++i)
129      {
130        m_offsetLookup.insert(DataMapType::value_type(tags[i],(i+1)*valsize));
131      }
132  }  }
133    
 DataTagged::DataTagged(const TagListType& tagKeys,  
                const ValueListType& values,  
                const DataArrayView& defaultValue,  
                const FunctionSpace& what)  
   : DataAbstract(what)  
 {  
   //  
   // The default value is always the first item in the values list  
   m_data.insert(m_data.end(), &defaultValue.getData(0), &defaultValue.getData(defaultValue.noValues()) );  
   DataArrayView temp(m_data,defaultValue.getShape());  
   setPointDataView(temp);  
   // add remaining tags and values  
   addTaggedValues(tagKeys,values);  
 }  
134    
135  DataTagged::DataTagged(const DataTagged& other)  DataTagged::DataTagged(const DataTagged& other)
136    : DataAbstract(other.getFunctionSpace()),    : DataAbstract(other.getFunctionSpace(),other.getShape()),
137    m_data(other.m_data),    m_data(other.m_data),
138    m_offsetLookup(other.m_offsetLookup)    m_offsetLookup(other.m_offsetLookup)
139  {  {
140    DataArrayView temp(m_data,other.getPointDataView().getShape());    // copy constructor
141    setPointDataView(temp);  
142      // create the data view
143    //   DataArrayView temp(m_data,other.getPointDataView().getShape());
144    //   setPointDataView(temp);
145  }  }
146    
147  DataTagged::DataTagged(const DataConstant& other)  DataTagged::DataTagged(const DataConstant& other)
148    : DataAbstract(other.getFunctionSpace())    : DataAbstract(other.getFunctionSpace(),other.getShape())
149  {  {
150    //    // copy constructor
   // Fill the default value with the constant value item from other  
   const DataArrayView& value=other.getPointDataView();  
   m_data.insert(m_data.end(), &value.getData(0), &value.getData(value.noValues()) );  
   DataArrayView temp(m_data,value.getShape());  
   setPointDataView(temp);  
 }  
151    
152  DataTagged::DataTagged(const DataTagged& other,    // fill the default value with the constant value item from "other"
153                 const DataArrayView::RegionType& region)  //   const DataArrayView& value=other.getPointDataView();
154    : DataAbstract(other.getFunctionSpace())    int len = other.getNoValues();
155  {    m_data.resize(len,0.,len);
156    //    for (int i=0; i<len; i++) {
157    // get the shape of the slice to copy from other      m_data[i]=other.getVector()[i];
158    DataArrayView::ShapeType shape(DataArrayView::getResultSliceShape(region));    }
159    //  
160    // allocate enough space for all values  //   // create the data view
161    m_data.resize(DataArrayView::noValues(shape)*(other.m_offsetLookup.size()+1));  //   DataArrayView temp(m_data,value.getShape());
162    DataArrayView temp(m_data,shape);  //   setPointDataView(temp);
   setPointDataView(temp);  
   getDefaultValue().copySlice(other.getDefaultValue(),region);  
   //  
   // Loop through the tag values  
   DataMapType::const_iterator pos;  
   DataArrayView::ValueType::size_type tagOffset=getPointDataView().noValues();  
   for (pos=other.m_offsetLookup.begin();pos!=other.m_offsetLookup.end();++pos){  
     getPointDataView().copySlice(tagOffset,other.getPointDataView(), pos->second,region);  
     m_offsetLookup.insert(DataMapType::value_type(pos->first,tagOffset));  
     tagOffset+=getPointDataView().noValues();  
   }  
163  }  }
164    
165  void  
166  DataTagged::reshapeDataPoint(const DataArrayView::ShapeType& shape)  // Create a new object by copying tags
167    DataTagged::DataTagged(const FunctionSpace& what,
168                 const DataTypes::ShapeType& shape,
169             const DataTypes::ValueType& defaultvalue,
170                 const DataTagged* tagsource)
171     : DataAbstract(what,shape)
172  {  {
173    //  // This constructor has not been unit tested yet
174    // can only reshape a rank zero data point  
175    if (getPointDataView().getRank()!=0) {    if (defaultvalue.size()!=DataTypes::noValues(shape)) {
176      stringstream temp;      throw DataException("Programming error - defaultvalue does not match supplied shape.");
177      temp << "Error - Can only reshape Data with data points of rank 0. "    }
178       << "This Data has data points with rank: "  
179       << getPointDataView().getRank();  
180      throw DataException(temp.str());    if (tagsource!=0)
181      {
182        int numtags=tagsource->getTagLookup().size();
183        //  m_offsetLookup.reserve(tagsource.getTagLookup().size());
184        m_data.resize(defaultvalue.size(),0.);  // since this is tagged data, we should have blocksize=1
185    
186           DataTagged::DataMapType::const_iterator i;
187           for (i=tagsource->getTagLookup().begin();i!=tagsource->getTagLookup().end();i++) {
188          addTag(i->first);
189           }
190      }
191      else
192      {
193        m_data.resize(defaultvalue.size());
194      }
195    
196    
197    
198      // need to set the default value ....
199      for (int i=0; i<defaultvalue.size(); i++) {
200         m_data[i]=defaultvalue[i];
201    }    }
   //  
   // allocate enough space for all values  
   DataArrayView::ValueType newData(DataArrayView::noValues(shape)*(m_offsetLookup.size()+1));  
   DataArrayView newView(newData,shape);  
   newView.copy(0,getDefaultValue()());  
   //  
   // Loop through the tag values  
   DataMapType::iterator pos;  
   DataArrayView::ValueType::size_type tagOffset=DataArrayView::noValues(shape);  
   for (pos=m_offsetLookup.begin();pos!=m_offsetLookup.end();++pos){  
     newView.copy(tagOffset,m_data[pos->second]);  
     pos->second=tagOffset;  
     tagOffset+=DataArrayView::noValues(shape);  
   }  
   m_data=newData;  
   DataArrayView temp(m_data,shape);  
   setPointDataView(temp);  
202  }  }
203    
204    
205    
206  DataAbstract*  DataAbstract*
207  DataTagged::getSlice(const DataArrayView::RegionType& region) const  DataTagged::getSlice(const DataTypes::RegionType& region) const
208    {
209      return new DataTagged(*this, region);
210    }
211    
212    DataTagged::DataTagged(const DataTagged& other,
213                   const DataTypes::RegionType& region)
214      : DataAbstract(other.getFunctionSpace(),DataTypes::getResultSliceShape(region))
215  {  {
216    return new DataTagged(*this,region);    // slice constructor
217    
218      // get the shape of the slice to copy from other
219      DataTypes::ShapeType regionShape(DataTypes::getResultSliceShape(region));
220      DataTypes::RegionLoopRangeType regionLoopRange=DataTypes::getSliceRegionLoopRange(region);
221    
222      // allocate enough space in this for all values
223      // (need to add one to allow for the default value)
224      int len = DataTypes::noValues(regionShape)*(other.m_offsetLookup.size()+1);
225      m_data.resize(len,0.0,len);
226    
227      // create the data view
228    //   DataArrayView temp(m_data,regionShape);
229    //   setPointDataView(temp);
230    
231      // copy the default value from other to this
232    //   getDefaultValue().copySlice(other.getDefaultValue(), regionLoopRange);
233      const DataTypes::ShapeType& otherShape=other.getShape();
234      const DataTypes::ValueType& otherData=other.getVector();
235      DataTypes::copySlice(getVector(),getShape(),getDefaultOffset(),otherData,otherShape,other.getDefaultOffset(), regionLoopRange);
236    
237      // loop through the tag values copying these
238      DataMapType::const_iterator pos;
239      DataTypes::ValueType::size_type tagOffset=getNoValues();
240      for (pos=other.m_offsetLookup.begin();pos!=other.m_offsetLookup.end();pos++){
241    //     getPointDataView().copySlice(tagOffset,other.getPointDataView(),pos->second,regionLoopRange);
242        DataTypes::copySlice(m_data,getShape(),tagOffset,otherData, otherShape, pos->second, regionLoopRange);
243        m_offsetLookup.insert(DataMapType::value_type(pos->first,tagOffset));
244        tagOffset+=getNoValues();
245      }
246  }  }
247    
248  void  void
249  DataTagged::setSlice(const DataAbstract* value,  DataTagged::setSlice(const DataAbstract* other,
250                       const DataArrayView::RegionType& region)                       const DataTypes::RegionType& region)
251  {  {
252    const DataTagged* tempDataTag=dynamic_cast<const DataTagged*>(value);  
253    if (tempDataTag==0) {    // other must be another DataTagged object
254      // Data:setSlice implementation should ensure this
255      const DataTagged* otherTemp=dynamic_cast<const DataTagged*>(other);
256      if (otherTemp==0) {
257      throw DataException("Programming error - casting to DataTagged.");      throw DataException("Programming error - casting to DataTagged.");
258    }    }
259    if (getPointDataView().getRank()!=region.size()) {  
260      // determine shape of the specified region
261      DataTypes::ShapeType regionShape(DataTypes::getResultSliceShape(region));
262    
263      // modify region specification as needed to match rank of this object
264      DataTypes::RegionLoopRangeType regionLoopRange=DataTypes::getSliceRegionLoopRange(region);
265    
266      // ensure rank/shape of this object is compatible with specified region
267      if (getRank()!=region.size()) {
268      throw DataException("Error - Invalid slice region.");      throw DataException("Error - Invalid slice region.");
269    }    }
270      if (otherTemp->getRank()>0 && !DataTypes::checkShape(other->getShape(),regionShape)) {
271        throw DataException (DataTypes::createShapeErrorMessage(
272                             "Error - Couldn't copy slice due to shape mismatch.",regionShape,other->getShape()));
273      }
274    
275      const DataTypes::ValueType& otherData=otherTemp->getVector();
276      const DataTypes::ShapeType& otherShape=otherTemp->getShape();
277      // copy slice from other default value to this default value
278    //   getDefaultValue().copySliceFrom(otherTemp->getDefaultValue(), regionLoopRange);
279      DataTypes::copySliceFrom(m_data,getShape(),getDefaultOffset(),otherData,otherShape,otherTemp->getDefaultOffset(),regionLoopRange);
280    
281      // loop through tag values in other, adding any which aren't in this, using default value
282      DataMapType::const_iterator pos;
283      for (pos=otherTemp->m_offsetLookup.begin();pos!=otherTemp->m_offsetLookup.end();pos++) {
284        if (!isCurrentTag(pos->first)) {
285          addTag(pos->first);
286        }
287      }
288    
289      // loop through the tag values copying slices from other to this
290      for (pos=m_offsetLookup.begin();pos!=m_offsetLookup.end();pos++) {
291    //     getDataPointByTag(pos->first).copySliceFrom(otherTemp->getDataPointByTag(pos->first), regionLoopRange);
292        DataTypes::copySliceFrom(m_data,getShape(),getOffsetForTag(pos->first),otherData, otherShape, otherTemp->getOffsetForTag(pos->first), regionLoopRange);
293    
294      }
295    
296    }
297    
298    int
299    DataTagged::getTagNumber(int dpno)
300    {
301    //    //
302    // get the shape of the slice    // Get the number of samples and data-points per sample
303    DataArrayView::ShapeType shape(DataArrayView::getResultSliceShape(region));    int numSamples = getNumSamples();
304    if (!value->getPointDataView().checkShape(shape)) {    int numDataPointsPerSample = getNumDPPSample();
305      throw DataException (value->getPointDataView().createShapeErrorMessage(    int numDataPoints = numSamples * numDataPointsPerSample;
306                  "Error - Couldn't copy slice due to shape mismatch.",shape));  
307      if (numDataPointsPerSample==0) {
308        throw DataException("DataTagged::getTagNumber error: no data-points associated with this object.");
309      }
310    
311      if (dpno<0 || dpno>numDataPoints-1) {
312        throw DataException("DataTagged::getTagNumber error: invalid data-point number supplied.");
313    }    }
314    
315    //    //
316    getDefaultValue().copySliceFrom(tempDataTag->getDefaultValue(),region);    // Determine the sample number which corresponds to this data-point number
317      int sampleNo = dpno / numDataPointsPerSample;
318    
319    //    //
320    // Loop through the tag values    // Determine the tag number which corresponds to this sample number
321    DataMapType::const_iterator pos;    int tagNo = getFunctionSpace().getTagFromSampleNo(sampleNo);
322    for (pos=m_offsetLookup.begin();pos!=m_offsetLookup.end();++pos){  
323      getDataPointByTag(pos->first).copySliceFrom(tempDataTag->getDataPointByTag(pos->first),region);    //
324    }    // return the tag number
325      return(tagNo);
326  }  }
327    
328    // void
329    // DataTagged::setTaggedValues(const TagListType& tagKeys,
330    //                             const ValueListType& values)
331    // {
332    //   addTaggedValues(tagKeys,values);
333    // }
334    
335  void  void
336  DataTagged::setTaggedValue(int tagKey,  DataTagged::setTaggedValue(int tagKey,
337                             const DataArrayView& value)                 const DataTypes::ShapeType& pointshape,
338  {                             const ValueType& value,
339                   int dataOffset)
340    {
341      if (!DataTypes::checkShape(getShape(), pointshape)) {
342          throw DataException(DataTypes::createShapeErrorMessage(
343                              "Error - Cannot setTaggedValue due to shape mismatch.", pointshape,getShape()));
344      }
345    DataMapType::iterator pos(m_offsetLookup.find(tagKey));    DataMapType::iterator pos(m_offsetLookup.find(tagKey));
346    if (pos==m_offsetLookup.end()) {    if (pos==m_offsetLookup.end()) {
347      //      // tag couldn't be found so use addTaggedValue
348      // tag couldn't be found so add as a new tag      addTaggedValue(tagKey,pointshape, value, dataOffset);
     addTaggedValue(tagKey,value);  
349    } else {    } else {
350      if (!getPointDataView().checkShape(value.getShape())) {      // copy the values into the data array at the offset determined by m_offsetLookup
351        throw DataException(getPointDataView().createShapeErrorMessage(      int offset=pos->second;
352           "Error - Cannot setTaggedValue due to shape mismatch.", value.getShape()));      for (int i=0; i<getNoValues(); i++) {
353          m_data[offset+i]=value[i+dataOffset];
354      }      }
     //  
     // copy the values into tagged data storage  
     copy(&value.getData(0), &value.getData(getPointDataView().noValues()), &m_data[pos->second]);  
355    }    }
356  }  }
357    
358    
359    /*
360  void  void
361  DataTagged::setTaggedValues(const TagListType& tagKeys,  DataTagged::setTaggedValue(int tagKey,
362                              const ValueListType& values)                             const DataArrayView& value)
363  {  {
364    for (int i=0;i<tagKeys.size();++i) {    if (!getPointDataView().checkShape(value.getShape())) {
365      setTaggedValue(tagKeys[i],values[i]);        throw DataException(DataTypes::createShapeErrorMessage(
366                              "Error - Cannot setTaggedValue due to shape mismatch.", value.getShape(),getShape()));
367    }    }
368  }    DataMapType::iterator pos(m_offsetLookup.find(tagKey));
369      if (pos==m_offsetLookup.end()) {
370        // tag couldn't be found so use addTaggedValue
371        addTaggedValue(tagKey,value);
372      } else {
373        // copy the values into the data array at the offset determined by m_offsetLookup
374        int offset=pos->second;
375        for (int i=0; i<getPointDataView().noValues(); i++) {
376          m_data[offset+i]=value.getData(i);
377        }
378      }
379    }*/
380    
381    // void
382    // DataTagged::addTaggedValues(const TagListType& tagKeys,
383    //                             const ValueListType& values)
384    // {
385    //   if (values.size()==0) {
386    //     // copy the current default value for each of the tags
387    //     TagListType::const_iterator iT;
388    //     for (iT=tagKeys.begin();iT!=tagKeys.end();iT++) {
389    //       // the point data view for DataTagged points at the default value
390    //       addTaggedValue(*iT,getPointDataView());
391    //     }
392    //   } else if (values.size()==1 && tagKeys.size()>1) {
393    //     // assume the one given value will be used for all tag values
394    //     TagListType::const_iterator iT;
395    //     for (iT=tagKeys.begin();iT!=tagKeys.end();iT++) {
396    //       addTaggedValue(*iT,values[0]);
397    //     }
398    //   } else {
399    //     if (tagKeys.size()!=values.size()) {
400    //       stringstream temp;
401    //       temp << "Error - (addTaggedValue) Number of tags: " << tagKeys.size()
402    //     << " doesn't match number of values: " << values.size();
403    //       throw DataException(temp.str());
404    //     } else {
405    //       unsigned int i;
406    //       for (i=0;i<tagKeys.size();i++) {
407    //         addTaggedValue(tagKeys[i],values[i]);
408    //       }
409    //     }
410    //   }
411    // }
412    
413    
414  void  void
415  DataTagged::addTaggedValue(int tagKey,  DataTagged::addTaggedValues(const TagListType& tagKeys,
416                             const DataArrayView& value)                              const ValueBatchType& values,
417                                const ShapeType& vShape)
418  {  {
419    if (!getPointDataView().checkShape(value.getShape())) {    DataTypes::ValueType t(values.size(),0);
420      throw DataException(getPointDataView().createShapeErrorMessage(    for (int i=0;i<values.size();++i)
421           "Error - Cannot addTaggedValue due to shape mismatch.", value.getShape()));    {
422        t[i]=values[i];
423    }    }
424    //    addTaggedValues(tagKeys,t,vShape);
   // save the key and the location of its data  
   m_offsetLookup.insert( DataMapType::value_type(tagKey,m_data.size()) );  
   //  
   // insert the data given in value at the end of m_data  
   m_data.insert( m_data.end(), &(value.getData(0)), &(value.getData(value.noValues())) );  
425  }  }
426    
427    
428    // Note: The check to see if vShape==our shape is done in the addTaggedValue method
429  void  void
430  DataTagged::addTaggedValues(const TagListType& tagKeys,  DataTagged::addTaggedValues(const TagListType& tagKeys,
431                              const ValueListType& values)                              const ValueType& values,
432                                const ShapeType& vShape)
433  {  {
434      int n=getNoValues();
435      int numVals=values.size()/n;
436    if (values.size()==0) {    if (values.size()==0) {
437      //      // copy the current default value for each of the tags
     // Copy the default value for each of the tags  
438      TagListType::const_iterator iT;      TagListType::const_iterator iT;
439      for (iT=tagKeys.begin();iT!=tagKeys.end();++iT) {      for (iT=tagKeys.begin();iT!=tagKeys.end();iT++) {
       //  
440        // the point data view for DataTagged points at the default value        // the point data view for DataTagged points at the default value
441        addTaggedValue(*iT,getPointDataView());        addTag(*iT);
442      }      }
443    } else if (values.size()==1 && tagKeys.size()>1) {    } else if (numVals==1 && tagKeys.size()>1) {
444      //      // assume the one given value will be used for all tag values
     // assume the one value will be used for all tag values  
     // Copy the input data  
445      TagListType::const_iterator iT;      TagListType::const_iterator iT;
446      for (iT=tagKeys.begin();iT!=tagKeys.end();++iT) {      for (iT=tagKeys.begin();iT!=tagKeys.end();iT++) {
447        addTaggedValue(*iT,values[0]);        addTaggedValue(*iT, vShape, values,0);
448      }      }
449    } else {    } else {
450      if (tagKeys.size()!=values.size()) {      if (tagKeys.size()!=numVals) {
451        stringstream temp;        stringstream temp;
452        temp << "Error - (addTaggedValue) Number of tags: " << tagKeys.size()        temp << "Error - (addTaggedValue) Number of tags: " << tagKeys.size()
453         << " doesn't match the number of values: " << values.size();         << " doesn't match number of values: " << values.size();
454        throw DataException(temp.str());        throw DataException(temp.str());
455      } else {      } else {
456        for (int i=0;i<tagKeys.size();++i) {        unsigned int i;
457          addTaggedValue(tagKeys[i],values[i]);        int offset=0;
458          for (i=0;i<tagKeys.size();i++ ,offset+=n) {
459            addTaggedValue(tagKeys[i],vShape,values,offset);
460        }        }
461      }      }
462    }    }
463  }  }
464    
465    
466    
467    
468    void
469    DataTagged::addTaggedValue(int tagKey,
470                   const DataTypes::ShapeType& pointshape,
471                               const ValueType& value,
472                   int dataOffset)
473    {
474      if (!DataTypes::checkShape(getShape(), pointshape)) {
475        throw DataException(DataTypes::createShapeErrorMessage(
476                            "Error - Cannot addTaggedValue due to shape mismatch.", pointshape,getShape()));
477      }
478      DataMapType::iterator pos(m_offsetLookup.find(tagKey));
479      if (pos!=m_offsetLookup.end()) {
480        // tag already exists so use setTaggedValue
481        setTaggedValue(tagKey,pointshape, value, dataOffset);
482      } else {
483        // save the key and the location of its data in the lookup tab
484        m_offsetLookup.insert(DataMapType::value_type(tagKey,m_data.size()));
485        // add the data given in "value" at the end of m_data
486        // need to make a temp copy of m_data, resize m_data, then copy
487        // all the old values plus the value to be added back into m_data
488        ValueType m_data_temp(m_data);
489        int oldSize=m_data.size();
490        int newSize=m_data.size()+getNoValues();
491        m_data.resize(newSize,0.,newSize);
492        for (int i=0;i<oldSize;i++) {
493          m_data[i]=m_data_temp[i];
494        }
495        for (int i=0;i<getNoValues();i++) {
496          m_data[oldSize+i]=value[i+dataOffset];
497        }
498      }
499    }
500    
501    
502    
503    
504    // void
505    // DataTagged::addTaggedValue(int tagKey,
506    //                            const DataArrayView& value)
507    // {
508    //   if (!getPointDataView().checkShape(value.getShape())) {
509    //     throw DataException(DataTypes::createShapeErrorMessage(
510    //                         "Error - Cannot addTaggedValue due to shape mismatch.", value.getShape(),getShape()));
511    //   }
512    //   DataMapType::iterator pos(m_offsetLookup.find(tagKey));
513    //   if (pos!=m_offsetLookup.end()) {
514    //     // tag already exists so use setTaggedValue
515    //     setTaggedValue(tagKey,value);
516    //   } else {
517    //     // save the key and the location of its data in the lookup tab
518    //     m_offsetLookup.insert(DataMapType::value_type(tagKey,m_data.size()));
519    //     // add the data given in "value" at the end of m_data
520    //     // need to make a temp copy of m_data, resize m_data, then copy
521    //     // all the old values plus the value to be added back into m_data
522    //     ValueType m_data_temp(m_data);
523    //     int oldSize=m_data.size();
524    //     int newSize=m_data.size()+value.noValues();
525    //     m_data.resize(newSize,0.,newSize);
526    //     for (int i=0;i<oldSize;i++) {
527    //       m_data[i]=m_data_temp[i];
528    //     }
529    //     for (int i=0;i<value.noValues();i++) {
530    //       m_data[oldSize+i]=value.getData(i);
531    //     }
532    //   }
533    // }
534    
535    
536    void
537    DataTagged::addTag(int tagKey)
538    {
539      DataMapType::iterator pos(m_offsetLookup.find(tagKey));
540      if (pos!=m_offsetLookup.end()) {
541        // tag already exists so use setTaggedValue
542    //    setTaggedValue(tagKey,value);
543      } else {
544        // save the key and the location of its data in the lookup tab
545        m_offsetLookup.insert(DataMapType::value_type(tagKey,m_data.size()));
546        // add the data given in "value" at the end of m_data
547        // need to make a temp copy of m_data, resize m_data, then copy
548        // all the old values plus the value to be added back into m_data
549        ValueType m_data_temp(m_data);
550        int oldSize=m_data.size();
551        int newSize=m_data.size()+getNoValues();
552        m_data.resize(newSize,0.,newSize);
553        for (int i=0;i<oldSize;i++) {
554          m_data[i]=m_data_temp[i];
555        }
556        for (int i=0;i<getNoValues();i++) {
557          m_data[oldSize+i]=m_data[m_defaultValueOffset+i];
558        }
559      }
560    }
561    
562    
563  double*  double*
564  DataTagged::getSampleDataByTag(int tag)  DataTagged::getSampleDataByTag(int tag)
565  {  {
566    DataMapType::iterator pos(m_offsetLookup.find(tag));    DataMapType::iterator pos(m_offsetLookup.find(tag));
567    if (pos==m_offsetLookup.end()) {    if (pos==m_offsetLookup.end()) {
     //  
568      // tag couldn't be found so return the default value      // tag couldn't be found so return the default value
569      return &(m_data[0]);      return &(m_data[0]);
570    } else {    } else {
     //  
571      // return the data-point corresponding to the given tag      // return the data-point corresponding to the given tag
572      return &(m_data[pos->second]);      return &(m_data[pos->second]);
573    }    }
# Line 254  DataTagged::getSampleDataByTag(int tag) Line 576  DataTagged::getSampleDataByTag(int tag)
576  string  string
577  DataTagged::toString() const  DataTagged::toString() const
578  {  {
579      using namespace escript::DataTypes;
580      string empty="";
581    stringstream temp;    stringstream temp;
582    DataMapType::const_iterator i;    DataMapType::const_iterator i;
583    temp << "Tag(Default)" << endl;    temp << "Tag(Default)" << endl;
584    temp << getDefaultValue().toString() << endl;    temp << pointToString(m_data,getShape(),getDefaultOffset(),empty) << endl;
   //  
585    // create a temporary view as the offset will be changed    // create a temporary view as the offset will be changed
586    DataArrayView tempView(getPointDataView().getData(), getPointDataView().getShape());  //   DataArrayView tempView(getPointDataView().getData(), getPointDataView().getShape());
587    for (i=m_offsetLookup.begin();i!=m_offsetLookup.end();++i) {    for (i=m_offsetLookup.begin();i!=m_offsetLookup.end();++i) {
588      temp << "Tag(" << i->first << ")" << endl;      temp << "Tag(" << i->first << ")" << endl;
589      tempView.setOffset(i->second);      temp << pointToString(m_data,getShape(),i->second,empty);
590      temp << tempView.toString() << endl;  //     tempView.setOffset(i->second);
591    //     temp << tempView.toString() << endl;
592    }    }
593    return temp.str();    return temp.str();
594  }  }
595    
596  DataArrayView  DataTypes::ValueType::size_type
597  DataTagged::getDataPointByTag(int tag) const  DataTagged::getPointOffset(int sampleNo,
598                               int dataPointNo) const
599    {
600      int tagKey=getFunctionSpace().getTagFromSampleNo(sampleNo);
601      DataMapType::const_iterator pos(m_offsetLookup.find(tagKey));
602      DataTypes::ValueType::size_type offset=m_defaultValueOffset;
603      if (pos!=m_offsetLookup.end()) {
604        offset=pos->second;
605      }
606      return offset;
607    }
608    
609    // DataArrayView
610    // DataTagged::getDataPointByTag(int tag) const
611    // {
612    //   DataMapType::const_iterator pos(m_offsetLookup.find(tag));
613    //   DataTypes::ValueType::size_type offset=m_defaultValueOffset;
614    //   if (pos!=m_offsetLookup.end()) {
615    //     offset=pos->second;
616    //   }
617    //   DataArrayView temp(getPointDataView());
618    //   temp.setOffset(offset);
619    //   return temp;
620    // }
621    //
622    
623    
624    DataTypes::ValueType::size_type
625    DataTagged::getOffsetForTag(int tag) const
626  {  {
627    DataMapType::const_iterator pos(m_offsetLookup.find(tag));    DataMapType::const_iterator pos(m_offsetLookup.find(tag));
628    DataArrayView::ValueType::size_type offset=m_defaultValueOffset;    DataTypes::ValueType::size_type offset=m_defaultValueOffset;
629    if (pos!=m_offsetLookup.end()) {    if (pos!=m_offsetLookup.end()) {
630      offset=pos->second;      offset=pos->second;
631    }    }
632    DataArrayView temp(getPointDataView());    return offset;
633    }
634    
635    DataTypes::ValueType::const_reference
636    DataTagged::getDataByTag(int tag, DataTypes::ValueType::size_type i) const
637    {
638      DataMapType::const_iterator pos(m_offsetLookup.find(tag));
639      DataTypes::ValueType::size_type offset=m_defaultValueOffset;
640      if (pos!=m_offsetLookup.end()) {
641        offset=pos->second;
642      }
643      return m_data[offset+i];
644    /*  DataArrayView temp(getPointDataView());
645    temp.setOffset(offset);    temp.setOffset(offset);
646    return temp;    return temp.getData()[offset+i];*/
647  }  }
648    
649  DataArrayView::ValueType::size_type  
650  DataTagged::getPointOffset(int sampleNo,  DataTypes::ValueType::reference
651                             int dataPointNo) const  DataTagged::getDataByTag(int tag, DataTypes::ValueType::size_type i)
652  {  {
653    int tagKey=getFunctionSpace().getTagFromSampleNo(sampleNo);    DataMapType::const_iterator pos(m_offsetLookup.find(tag));
654    DataMapType::const_iterator pos(m_offsetLookup.find(tagKey));    DataTypes::ValueType::size_type offset=m_defaultValueOffset;
   DataArrayView::ValueType::size_type offset=m_defaultValueOffset;  
655    if (pos!=m_offsetLookup.end()) {    if (pos!=m_offsetLookup.end()) {
656      offset=pos->second;      offset=pos->second;
657    }    }
658    return offset;    return m_data[offset+i];
659    /*  DataArrayView temp(getPointDataView());
660      temp.setOffset(offset);
661      return temp.getData()[offset+i];*/
662  }  }
663    
664  DataArrayView  
665  DataTagged::getDataPoint(int sampleNo,  
666                           int dataPointNo)  
667    
668    
669    // DataArrayView
670    // DataTagged::getDataPoint(int sampleNo,
671    //                          int dataPointNo)
672    // {
673    //   EsysAssert(validSampleNo(sampleNo),"(getDataPoint) Invalid sampleNo: " << sampleNo);
674    //   int tagKey=getFunctionSpace().getTagFromSampleNo(sampleNo);
675    //   return getDataPointByTag(tagKey);
676    // }
677    
678    
679    void
680    DataTagged::symmetric(DataAbstract* ev)
681  {  {
682    EsysAssert(validSampleNo(sampleNo),"(getDataPoint) Invalid sampleNo: " << sampleNo);    DataTagged* temp_ev=dynamic_cast<DataTagged*>(ev);
683    int tagKey=getFunctionSpace().getTagFromSampleNo(sampleNo);    if (temp_ev==0) {
684    return getDataPointByTag(tagKey);      throw DataException("Error - DataTagged::symmetric casting to DataTagged failed (probably a programming error).");
685      }
686      const DataTagged::DataMapType& thisLookup=getTagLookup();
687      DataTagged::DataMapType::const_iterator i;
688      DataTagged::DataMapType::const_iterator thisLookupEnd=thisLookup.end();
689      ValueType& evVec=temp_ev->getVector();
690      const ShapeType& evShape=temp_ev->getShape();
691      for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) {
692          temp_ev->addTag(i->first);
693          DataTypes::ValueType::size_type offset=getOffsetForTag(i->first);
694    //       DataArrayView thisView=getDataPointByTag(i->first);
695    //       DataArrayView evView=temp_ev->getDataPointByTag(i->first);
696          DataTypes::ValueType::size_type evoffset=temp_ev->getOffsetForTag(i->first);
697    
698    //       DataArrayView::symmetric(thisView,0,evView,0);
699          DataMaths::symmetric(m_data,getShape(),offset,evVec, evShape, evoffset);
700      }
701    //   symmetric(m_data,getShape(),getDefaultOffset(),
702      DataMaths::symmetric(m_data,getShape(),getDefaultOffset(),evVec,evShape,temp_ev->getDefaultOffset());
703    }
704    
705    
706    void
707    DataTagged::nonsymmetric(DataAbstract* ev)
708    {
709      DataTagged* temp_ev=dynamic_cast<DataTagged*>(ev);
710      if (temp_ev==0) {
711        throw DataException("Error - DataTagged::nonsymmetric casting to DataTagged failed (probably a programming error).");
712      }
713      const DataTagged::DataMapType& thisLookup=getTagLookup();
714      DataTagged::DataMapType::const_iterator i;
715      DataTagged::DataMapType::const_iterator thisLookupEnd=thisLookup.end();
716      ValueType& evVec=temp_ev->getVector();
717      const ShapeType& evShape=temp_ev->getShape();
718      for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) {
719          temp_ev->addTag(i->first);
720    /*      DataArrayView thisView=getDataPointByTag(i->first);
721          DataArrayView evView=temp_ev->getDataPointByTag(i->first);*/
722          DataTypes::ValueType::size_type offset=getOffsetForTag(i->first);
723          DataTypes::ValueType::size_type evoffset=temp_ev->getOffsetForTag(i->first);
724          DataMaths::nonsymmetric(m_data,getShape(),offset,evVec, evShape, evoffset);
725      }
726      DataMaths::nonsymmetric(m_data,getShape(),getDefaultOffset(),evVec,evShape,temp_ev->getDefaultOffset());
727    }
728    
729    
730    void
731    DataTagged::trace(DataAbstract* ev, int axis_offset)
732    {
733      DataTagged* temp_ev=dynamic_cast<DataTagged*>(ev);
734      if (temp_ev==0) {
735        throw DataException("Error - DataTagged::trace casting to DataTagged failed (probably a programming error).");
736      }
737      const DataTagged::DataMapType& thisLookup=getTagLookup();
738      DataTagged::DataMapType::const_iterator i;
739      DataTagged::DataMapType::const_iterator thisLookupEnd=thisLookup.end();
740      ValueType& evVec=temp_ev->getVector();
741      const ShapeType& evShape=temp_ev->getShape();
742      for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) {
743          temp_ev->addTag(i->first);
744    //       DataArrayView thisView=getDataPointByTag(i->first);
745    //       DataArrayView evView=temp_ev->getDataPointByTag(i->first);
746          DataTypes::ValueType::size_type offset=getOffsetForTag(i->first);
747          DataTypes::ValueType::size_type evoffset=temp_ev->getOffsetForTag(i->first);
748          DataMaths::trace(m_data,getShape(),offset,evVec, evShape, evoffset, axis_offset);
749      }
750      DataMaths::trace(m_data,getShape(),getDefaultOffset(),evVec,evShape,temp_ev->getDefaultOffset(),axis_offset);
751  }  }
752    
753  const DataTagged::DataMapType&  void
754  DataTagged::getTagLookup() const  DataTagged::transpose(DataAbstract* ev, int axis_offset)
755    {
756      DataTagged* temp_ev=dynamic_cast<DataTagged*>(ev);
757      if (temp_ev==0) {
758        throw DataException("Error - DataTagged::transpose casting to DataTagged failed (probably a programming error).");
759      }
760      const DataTagged::DataMapType& thisLookup=getTagLookup();
761      DataTagged::DataMapType::const_iterator i;
762      DataTagged::DataMapType::const_iterator thisLookupEnd=thisLookup.end();
763      ValueType& evVec=temp_ev->getVector();
764      const ShapeType& evShape=temp_ev->getShape();
765      for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) {
766          temp_ev->addTag(i->first);
767    //       DataArrayView thisView=getDataPointByTag(i->first);
768    //       DataArrayView evView=temp_ev->getDataPointByTag(i->first);
769          DataTypes::ValueType::size_type offset=getOffsetForTag(i->first);
770          DataTypes::ValueType::size_type evoffset=temp_ev->getOffsetForTag(i->first);
771          DataMaths::transpose(m_data,getShape(),offset,evVec, evShape, evoffset, axis_offset);
772      }
773      DataMaths::transpose(m_data,getShape(),getDefaultOffset(),evVec,evShape,temp_ev->getDefaultOffset(),axis_offset);
774    }
775    
776    void
777    DataTagged::swapaxes(DataAbstract* ev, int axis0, int axis1)
778    {
779      DataTagged* temp_ev=dynamic_cast<DataTagged*>(ev);
780      if (temp_ev==0) {
781        throw DataException("Error - DataTagged::swapaxes casting to DataTagged failed (probably a programming error).");
782      }
783      const DataTagged::DataMapType& thisLookup=getTagLookup();
784      DataTagged::DataMapType::const_iterator i;
785      DataTagged::DataMapType::const_iterator thisLookupEnd=thisLookup.end();
786      ValueType& evVec=temp_ev->getVector();
787      const ShapeType& evShape=temp_ev->getShape();
788      for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) {
789          temp_ev->addTag(i->first);
790    /*      DataArrayView thisView=getDataPointByTag(i->first);
791          DataArrayView evView=temp_ev->getDataPointByTag(i->first);*/
792          DataTypes::ValueType::size_type offset=getOffsetForTag(i->first);
793          DataTypes::ValueType::size_type evoffset=temp_ev->getOffsetForTag(i->first);
794          DataMaths::swapaxes(m_data,getShape(),offset,evVec, evShape, evoffset,axis0,axis1);
795      }
796      DataMaths::swapaxes(m_data,getShape(),getDefaultOffset(),evVec,evShape,temp_ev->getDefaultOffset(),axis0,axis1);
797    }
798    
799    void
800    DataTagged::eigenvalues(DataAbstract* ev)
801    {
802      DataTagged* temp_ev=dynamic_cast<DataTagged*>(ev);
803      if (temp_ev==0) {
804        throw DataException("Error - DataTagged::eigenvalues casting to DataTagged failed (propably a programming error).");
805      }
806      const DataTagged::DataMapType& thisLookup=getTagLookup();
807      DataTagged::DataMapType::const_iterator i;
808      DataTagged::DataMapType::const_iterator thisLookupEnd=thisLookup.end();
809      ValueType& evVec=temp_ev->getVector();
810      const ShapeType& evShape=temp_ev->getShape();
811      for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) {
812          temp_ev->addTag(i->first);
813    //       DataArrayView thisView=getDataPointByTag(i->first);
814    //       DataArrayView evView=temp_ev->getDataPointByTag(i->first);
815          DataTypes::ValueType::size_type offset=getOffsetForTag(i->first);
816          DataTypes::ValueType::size_type evoffset=temp_ev->getOffsetForTag(i->first);
817          DataMaths::eigenvalues(m_data,getShape(),offset,evVec, evShape, evoffset);
818      }
819      DataMaths::eigenvalues(m_data,getShape(),getDefaultOffset(),evVec, evShape, temp_ev->getDefaultOffset());
820    }
821    void
822    DataTagged::eigenvalues_and_eigenvectors(DataAbstract* ev,DataAbstract* V,const double tol)
823    {
824      DataTagged* temp_ev=dynamic_cast<DataTagged*>(ev);
825      if (temp_ev==0) {
826        throw DataException("Error - DataTagged::eigenvalues_and_eigenvectors casting to DataTagged failed (propably a programming error).");
827      }
828      DataTagged* temp_V=dynamic_cast<DataTagged*>(V);
829      if (temp_V==0) {
830        throw DataException("Error - DataTagged::eigenvalues_and_eigenvectors casting to DataTagged failed (propably a programming error).");
831      }
832      const DataTagged::DataMapType& thisLookup=getTagLookup();
833      DataTagged::DataMapType::const_iterator i;
834      DataTagged::DataMapType::const_iterator thisLookupEnd=thisLookup.end();
835      ValueType& evVec=temp_ev->getVector();
836      const ShapeType& evShape=temp_ev->getShape();
837      ValueType& VVec=temp_V->getVector();
838      const ShapeType& VShape=temp_V->getShape();
839      for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) {
840          temp_ev->addTag(i->first);
841          temp_V->addTag(i->first);
842    /*      DataArrayView thisView=getDataPointByTag(i->first);
843          DataArrayView evView=temp_ev->getDataPointByTag(i->first);
844          DataArrayView VView=temp_V->getDataPointByTag(i->first);*/
845          DataTypes::ValueType::size_type offset=getOffsetForTag(i->first);
846          DataTypes::ValueType::size_type evoffset=temp_ev->getOffsetForTag(i->first);
847          DataTypes::ValueType::size_type Voffset=temp_V->getOffsetForTag(i->first);
848    /*      DataArrayView::eigenvalues_and_eigenvectors(thisView,0,evView,0,VView,0,tol);*/
849          DataMaths::eigenvalues_and_eigenvectors(m_data,getShape(),offset,evVec, evShape, evoffset,VVec,VShape,Voffset,tol);
850    
851      }
852      DataMaths::eigenvalues_and_eigenvectors(m_data,getShape(),getDefaultOffset(),evVec, evShape,
853                          temp_ev->getDefaultOffset(),VVec,VShape,
854                          temp_V->getDefaultOffset(), tol);
855    
856    
857    }
858    
859    void
860    DataTagged::setToZero(){
861        DataTypes::ValueType::size_type n=m_data.size();
862        for (int i=0; i<n ;++i) m_data[i]=0.;
863    }
864    
865    void
866    DataTagged::dump(const std::string fileName) const
867    {
868       #ifdef PASO_MPI
869       throw DataException("Error - DataTagged:: dump is not implemented for MPI yet.");
870       #endif
871       #ifdef USE_NETCDF
872       const int ldims=DataTypes::maxRank+1;
873       const NcDim* ncdims[ldims];
874       NcVar *var, *tags_var;
875       int rank = getRank();
876       int type=  getFunctionSpace().getTypeCode();
877       int ndims =0;
878       long dims[ldims];
879       const double* d_ptr=&(m_data[0]);
880       DataTypes::ShapeType shape = getShape();
881    
882       // netCDF error handler
883       NcError err(NcError::verbose_nonfatal);
884       // Create the file.
885       NcFile dataFile(fileName.c_str(), NcFile::Replace);
886       // check if writing was successful
887       if (!dataFile.is_valid())
888            throw DataException("Error - DataTagged:: opening of netCDF file for output failed.");
889       if (!dataFile.add_att("type_id",1) )
890            throw DataException("Error - DataTagged:: appending data type to netCDF file failed.");
891       if (!dataFile.add_att("rank",rank) )
892            throw DataException("Error - DataTagged:: appending rank attribute to netCDF file failed.");
893       if (!dataFile.add_att("function_space_type",type))
894            throw DataException("Error - DataTagged:: appending function space attribute to netCDF file failed.");
895       ndims=rank+1;
896       if ( rank >0 ) {
897           dims[0]=shape[0];
898           if (! (ncdims[0] = dataFile.add_dim("d0",shape[0])) )
899                throw DataException("Error - DataTagged:: appending ncdimsion 0 to netCDF file failed.");
900       }
901       if ( rank >1 ) {
902           dims[1]=shape[1];
903           if (! (ncdims[1] = dataFile.add_dim("d1",shape[1])) )
904                throw DataException("Error - DataTagged:: appending ncdimsion 1 to netCDF file failed.");
905       }
906       if ( rank >2 ) {
907           dims[2]=shape[2];
908           if (! (ncdims[2] = dataFile.add_dim("d2", shape[2])) )
909                throw DataException("Error - DataTagged:: appending ncdimsion 2 to netCDF file failed.");
910       }
911       if ( rank >3 ) {
912           dims[3]=shape[3];
913           if (! (ncdims[3] = dataFile.add_dim("d3", shape[3])) )
914                throw DataException("Error - DataTagged:: appending ncdimsion 3 to netCDF file failed.");
915       }
916       const DataTagged::DataMapType& thisLookup=getTagLookup();
917       DataTagged::DataMapType::const_iterator i;
918       DataTagged::DataMapType::const_iterator thisLookupEnd=thisLookup.end();
919       int ntags=1;
920       for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) ntags++;
921       int* tags =(int*) esysUtils::malloc(ntags*sizeof(int));
922       int c=1;
923       tags[0]=-1;
924       for (i=thisLookup.begin();i!=thisLookupEnd;i++) tags[c++]=i->first;
925       dims[rank]=ntags;
926       if (! (ncdims[rank] = dataFile.add_dim("num_tags", dims[rank])) )
927       {
928           esysUtils::free(tags);
929               throw DataException("Error - DataTagged:: appending num_tags to netCDF file failed.");
930       }
931       if (! ( tags_var = dataFile.add_var("tags", ncInt, ncdims[rank])) )
932       {
933        esysUtils::free(tags);
934            throw DataException("Error - DataTagged:: appending tags to netCDF file failed.");
935       }
936       if (! (tags_var->put(tags,dims[rank])) )
937       {
938        esysUtils::free(tags);
939            throw DataException("Error - DataTagged:: copy tags to netCDF buffer failed.");
940       }
941       if (! ( var = dataFile.add_var("data", ncDouble, ndims, ncdims)) )
942       {
943        esysUtils::free(tags);
944            throw DataException("Error - DataTagged:: appending variable to netCDF file failed.");
945       }
946       if (! (var->put(d_ptr,dims)) )
947       {
948        esysUtils::free(tags);
949            throw DataException("Error - DataTagged:: copy data to netCDF buffer failed.");
950       }
951       #else
952       throw DataException("Error - DataTagged:: dump is not configured with netCDF. Please contact your installation manager.");
953       #endif
954    }
955    
956    DataTypes::ValueType&
957    DataTagged::getVector()
958  {  {
959    return m_offsetLookup;      return m_data;
960  }  }
961    
962  DataArrayView::ValueType::size_type  const DataTypes::ValueType&
963  DataTagged::getLength() const  DataTagged::getVector() const
964  {  {
965    return m_data.size();      return m_data;
966  }  }
967    
968  }  // end of namespace  }  // end of namespace

Legend:
Removed from v.97  
changed lines
  Added in v.1796

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.26