/[escript]/trunk/finley/src/Assemble_LumpedSystem.c
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trunk/finley/src/Assemble_PDE.c revision 1072 by gross, Thu Mar 29 06:44:30 2007 UTC trunk/finley/src/Assemble_LumpedSystem.c revision 1204 by gross, Sat Jun 23 11:43:12 2007 UTC
# Line 1  Line 1 
1  /*  /*
2   ************************************************************   ************************************************************
3   *          Copyright 2006 by ACcESS MNRF                   *   *          Copyright 2006,2007 by ACcENULLNULL MNRF              *
4   *                                                          *   *                                                          *
5   *              http://www.access.edu.au                    *   *              http://www.access.edu.au                    *
6   *       Primary Business: Queensland, Australia            *   *       Primary Business: Queensland, Australia            *
7   *  Licensed under the Open Software License version 3.0    *   *  Licensed under the Open NULLoftware License version 3.0    *
8   *     http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php       *   *     http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php       *
9   *                                                          *   *                                                          *
10   ************************************************************   ************************************************************
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13    
14  /**************************************************************/  /**************************************************************/
15    
16  /*    assembles the system of numEq PDEs into the stiffness matrix S and right hand side F */  /*    assembles the mass matrix in lumped form                */
17    
18  /*     -div(A*grad u)-div(B*u)+C*grad u + D*u= -div X + Y */  /*    The coefficient D has to be defined on the integration points or not present. */
19    
20  /*      -(A_{k,i,m,j} u_m,j)_i-(B_{k,i,m} u_m)_i+C_{k,m,j} u_m,j-D_{k,m} u_m = -(X_{k,i})_i + Y_k */  /*    lumpedMat has to be initialized before the routine is called. */
   
 /*    u has numComp components. */  
   
 /*    Shape of the coefficients: */  
   
 /*      A = numEqu x numDim x numComp x numDim */  
 /*      B = numDim x numEqu x numComp  */  
 /*      C = numEqu x numDim x numComp  */  
 /*      D = numEqu x numComp  */  
 /*      X = numEqu x numDim   */  
 /*      Y = numEqu */  
   
 /*    The coefficients A,B,C,D,X and Y have to be defined on the integartion points or not present (=NULL). */  
   
 /*    S and F have to be initialized before the routine is called. S or F can be NULL. In this case the left or */  
 /*    the right hand side of the PDE is not processed.  */  
   
 /*    The routine does not consider any boundary conditions. */  
21    
22  /**************************************************************/  /**************************************************************/
23    
24  /*  Author: gross@access.edu.au */  /*  Author: gross@access.edu.au */
25  /*  Version: $Id$ */  /*  Version: $Id:$ */
26    
27  /**************************************************************/  /**************************************************************/
28    
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35    
36  /**************************************************************/  /**************************************************************/
37    
38  void Finley_Assemble_PDE(Finley_NodeFile* nodes,Finley_ElementFile* elements,Paso_SystemMatrix* S, escriptDataC* F,  void Finley_Assemble_LumpedSystem(Finley_NodeFile* nodes,Finley_ElementFile* elements, escriptDataC* lumpedMat, escriptDataC* D)
39               escriptDataC* A, escriptDataC* B, escriptDataC* C, escriptDataC* D, escriptDataC* X, escriptDataC* Y ) {  {
40    
41    bool_t reducedIntegrationOrder=FALSE;    bool_t reducedIntegrationOrder=FALSE, expandedD;
42    char error_msg[LenErrorMsg_MAX];    char error_msg[LenErrorMsg_MAX];
43    Assemble_Parameters p;    Assemble_Parameters p;
44    double time0;    double time0;
45    dim_t dimensions[ESCRIPT_MAX_DATA_RANK];    dim_t dimensions[ESCRIPT_MAX_DATA_RANK], k, e, len_EM_lumpedMat, q, s;
46    type_t funcspace;    type_t funcspace;
47      index_t color,*row_index=NULL;
48      double *S=NULL, *EM_lumpedMat=NULL, *Vol=NULL, *D_p=NULL, *lumpedMat_p=NULL;
49      register double rtmp;
50      size_t len_EM_lumpedMat_size;
51    
52    Finley_resetError();    Finley_resetError();
53    
54    if (nodes==NULL || elements==NULL) return;    if (nodes==NULL || elements==NULL) return;
55    if (S==NULL && isEmpty(F)) return;    if (isEmpty(lumpedMat) || isEmpty(D)) return;
56      if (isEmpty(lumpedMat) && !isEmpty(D)) {
57    if (isEmpty(F) && !isEmpty(X) && !isEmpty(F)) {          Finley_setError(TYPE_ERROR,"Assemble_LumpedSystem: coefficients are non-zero but no lumped matrix is given.");
58          Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: right hand side coefficients are non-zero bat no right hand side vector given.");          return;
   }  
   
   if (S==NULL && !isEmpty(A) && !isEmpty(B) && !isEmpty(C) && !isEmpty(D)) {  
         Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: coefficients are non-zero but no matrix is given.");  
   }  
   
   /*  get the functionspace for this assemblage call */  
   funcspace=UNKNOWN;  
   updateFunctionSpaceType(funcspace,A);  
   updateFunctionSpaceType(funcspace,B);  
   updateFunctionSpaceType(funcspace,C);  
   updateFunctionSpaceType(funcspace,D);  
   updateFunctionSpaceType(funcspace,X);  
   updateFunctionSpaceType(funcspace,Y);  
   if (funcspace==UNKNOWN) return; /* all  data are empty */  
   
   /* check if all function spaces are the same */  
   if (! functionSpaceTypeEqual(funcspace,A) ) {  
         Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: unexpected function space type for coefficient A");  
   }  
   if (! functionSpaceTypeEqual(funcspace,B) ) {  
         Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: unexpected function space type for coefficient B");  
   }  
   if (! functionSpaceTypeEqual(funcspace,C) ) {  
         Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: unexpected function space type for coefficient C");  
59    }    }
60    if (! functionSpaceTypeEqual(funcspace,D) ) {    funcspace=getFunctionSpaceType(D);
         Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: unexpected function space type for coefficient D");  
   }  
   if (! functionSpaceTypeEqual(funcspace,X) ) {  
         Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: unexpected function space type for coefficient X");  
   }  
   if (! functionSpaceTypeEqual(funcspace,Y) ) {  
         Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: unexpected function space type for coefficient Y");  
   }  
   if (! Finley_noError()) return;  
   
61    /* check if all function spaces are the same */    /* check if all function spaces are the same */
62    if (funcspace==FINLEY_ELEMENTS) {    if (funcspace==FINLEY_ELEMENTS) {
63         reducedIntegrationOrder=FALSE;         reducedIntegrationOrder=FALSE;
64    } else if (funcspace==FINLEY_FACE_ELEMENTS)  {    } else if (funcspace==FINLEY_FACE_ELEMENTS)  {
65         reducedIntegrationOrder=FALSE;         reducedIntegrationOrder=FALSE;
   } else if (funcspace==FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1)  {  
        reducedIntegrationOrder=FALSE;  
   } else if (funcspace==FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_2)  {  
        reducedIntegrationOrder=FALSE;  
66    } else if (funcspace==FINLEY_REDUCED_ELEMENTS) {    } else if (funcspace==FINLEY_REDUCED_ELEMENTS) {
67         reducedIntegrationOrder=TRUE;         reducedIntegrationOrder=TRUE;
68    } else if (funcspace==FINLEY_REDUCED_FACE_ELEMENTS)  {    } else if (funcspace==FINLEY_REDUCED_FACE_ELEMENTS)  {
69         reducedIntegrationOrder=TRUE;         reducedIntegrationOrder=TRUE;
   } else if (funcspace==FINLEY_REDUCED_CONTACT_ELEMENTS_1)  {  
        reducedIntegrationOrder=TRUE;  
   } else if (funcspace==FINLEY_REDUCED_CONTACT_ELEMENTS_2)  {  
        reducedIntegrationOrder=TRUE;  
70    } else {    } else {
71         Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: assemblage failed because of illegal function space.");         Finley_setError(TYPE_ERROR,"Assemble_LumpedSystem: assemblage failed because of illegal function space.");
72    }    }
73    if (! Finley_noError()) return;    if (! Finley_noError()) return;
74    
75    /* set all parameters in p*/    /* set all parameters in p*/
76    Assemble_getAssembleParameters(nodes,elements,S,F, reducedIntegrationOrder, &p);    Assemble_getAssembleParameters(nodes,elements,NULL,lumpedMat, reducedIntegrationOrder, &p);
77    if (! Finley_noError()) return;    if (! Finley_noError()) return;
78    
79    /* check if all function spaces are the same */    /* check if all function spaces are the same */
80    
   if (! numSamplesEqual(A,p.numQuad,elements->numElements) ) {  
         sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: sample points of coefficient A don't match (%d,%d)",p.numQuad,elements->numElements);  
         Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
   }  
   
   if (! numSamplesEqual(B,p.numQuad,elements->numElements) ) {  
         sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: sample points of coefficient B don't match (%d,%d)",p.numQuad,elements->numElements);  
         Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
   }  
   
   if (! numSamplesEqual(C,p.numQuad,elements->numElements) ) {  
         sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: sample points of coefficient C don't match (%d,%d)",p.numQuad,elements->numElements);  
         Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
   }  
   
81    if (! numSamplesEqual(D,p.numQuad,elements->numElements) ) {    if (! numSamplesEqual(D,p.numQuad,elements->numElements) ) {
82          sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: sample points of coefficient D don't match (%d,%d)",p.numQuad,elements->numElements);          sprintf(error_msg,"Assemble_LumpedSystem: sample points of coefficient D don't match (%d,%d)",p.numQuad,elements->numElements);
         Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
   }  
   
   if (! numSamplesEqual(X,p.numQuad,elements->numElements) ) {  
         sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: sample points of coefficient X don't match (%d,%d)",p.numQuad,elements->numElements);  
         Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
   }  
   
   if (! numSamplesEqual(Y,p.numQuad,elements->numElements) ) {  
         sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: sample points of coefficient Y don't match (%d,%d)",p.numQuad,elements->numElements);  
83          Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);          Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);
84    }    }
85    
86    /*  check the dimensions: */    /*  check the dimensions: */
87        
88    if (p.numEqu==1 && p.numComp==1) {    if (p.numEqu==1) {
     if (!isEmpty(A)) {  
       dimensions[0]=p.numDim;  
       dimensions[1]=p.numDim;  
       if (!isDataPointShapeEqual(A,2,dimensions)) {  
           sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: coefficient A: illegal shape, expected shape (%d,%d)",dimensions[0],dimensions[1]);  
           Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
       }  
     }  
     if (!isEmpty(B)) {  
        dimensions[0]=p.numDim;  
        if (!isDataPointShapeEqual(B,1,dimensions)) {  
           sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: coefficient B: illegal shape (%d,)",dimensions[0]);  
           Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
        }  
     }  
     if (!isEmpty(C)) {  
        dimensions[0]=p.numDim;  
        if (!isDataPointShapeEqual(C,1,dimensions)) {  
           sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: coefficient C, expected shape (%d,)",dimensions[0]);  
           Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
        }  
     }  
89      if (!isEmpty(D)) {      if (!isEmpty(D)) {
90         if (!isDataPointShapeEqual(D,0,dimensions)) {         if (!isDataPointShapeEqual(D,0,dimensions)) {
91            Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: coefficient D, rank 0 expected.");            Finley_setError(TYPE_ERROR,"Assemble_LumpedSystem: coefficient D, rank 0 expected.");
        }  
     }  
     if (!isEmpty(X)) {  
        dimensions[0]=p.numDim;  
        if (!isDataPointShapeEqual(X,1,dimensions)) {  
           sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: coefficient X, expected shape (%d,",dimensions[0]);  
           Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
92         }         }
93    
94      }      }
     if (!isEmpty(Y)) {  
        if (!isDataPointShapeEqual(Y,0,dimensions)) {  
           Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: coefficient Y, rank 0 expected.");  
        }  
     }  
95    } else {    } else {
     if (!isEmpty(A)) {  
       dimensions[0]=p.numEqu;  
       dimensions[1]=p.numDim;  
       dimensions[2]=p.numComp;  
       dimensions[3]=p.numDim;  
       if (!isDataPointShapeEqual(A,4,dimensions)) {  
           sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: coefficient A, expected shape (%d,%d,%d,%d)",dimensions[0],dimensions[1],dimensions[2],dimensions[3]);  
           Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
       }  
     }  
     if (!isEmpty(B)) {  
       dimensions[0]=p.numEqu;  
       dimensions[1]=p.numDim;  
       dimensions[2]=p.numComp;  
       if (!isDataPointShapeEqual(B,3,dimensions)) {  
           sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: coefficient B, expected shape (%d,%d,%d)",dimensions[0],dimensions[1],dimensions[2]);  
           Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
       }  
     }  
     if (!isEmpty(C)) {  
       dimensions[0]=p.numEqu;  
       dimensions[1]=p.numComp;  
       dimensions[2]=p.numDim;  
       if (!isDataPointShapeEqual(C,3,dimensions)) {  
           sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: coefficient C, expected shape (%d,%d,%d)",dimensions[0],dimensions[1],dimensions[2]);  
           Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
       }  
     }  
96      if (!isEmpty(D)) {      if (!isEmpty(D)) {
97        dimensions[0]=p.numEqu;        dimensions[0]=p.numEqu;
98        dimensions[1]=p.numComp;        if (!isDataPointShapeEqual(D,1,dimensions)) {
99        if (!isDataPointShapeEqual(D,2,dimensions)) {            sprintf(error_msg,"Assemble_LumpedSystem: coefficient D, expected shape (%d,)",dimensions[0]);
           sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: coefficient D, expected shape (%d,%d)",dimensions[0],dimensions[1]);  
           Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
       }  
     }  
     if (!isEmpty(X)) {  
       dimensions[0]=p.numEqu;  
       dimensions[1]=p.numDim;  
       if (!isDataPointShapeEqual(X,2,dimensions)) {  
           sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: coefficient X, expected shape (%d,%d)",dimensions[0],dimensions[1]);  
           Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
       }  
     }  
     if (!isEmpty(Y)) {  
       dimensions[0]=p.numEqu;  
       if (!isDataPointShapeEqual(Y,1,dimensions)) {  
           sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: coefficient Y, expected shape (%d,)",dimensions[0]);  
100            Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);            Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);
101        }        }
102      }      }
103    }    }
104    
105    if (Finley_noError()) {    if (Finley_noError()) {
106       time0=Finley_timer();      lumpedMat_p=getSampleData(lumpedMat,0);
107       if (p.numEqu == p. numComp) {      len_EM_lumpedMat=p.row_NN*p.numEqu;
108          if (p.numEqu > 1) {      len_EM_lumpedMat_size=len_EM_lumpedMat*sizeof(double);
109            /* system of PDESs */      expandedD=isExpanded(D);
110            if (p.numDim==3) {      S=p.row_jac->ReferenceElement->S;
111              if (p.row_NS == p.col_NS && p.row_NS == p.row_NN && p.col_NS == p.col_NN ) {  
112                 Finley_Assemble_PDE_System2_3D(p,elements,S,F,A,B,C,D,X,Y);      #pragma omp parallel private(color, EM_lumpedMat, row_index, Vol, D_p, s, q, k, rtmp)
113              } else if ( p.row_NS == p.col_NS &&  2*p.row_NS == p.row_NN && 2*p.col_NS == p.col_NN ) {      {
114                 if ( !isEmpty(A) || !isEmpty(B) || !isEmpty(C) || !isEmpty(X) ) {         EM_lumpedMat=THREAD_MEMALLOC(len_EM_lumpedMat,double);
115                    Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: Contact elements require A, B, C and X to be empty.");         row_index=THREAD_MEMALLOC(p.row_NN,index_t);
116                 } else {         if ( !Finley_checkPtr(EM_lumpedMat) && !Finley_checkPtr(row_index) ) {
117                    Finley_Assemble_PDE_System2_C(p,elements,S,F,D,Y);            if (p.numEqu == 1) {
118                 }               if (expandedD) {
119              } else {                   #ifndef PASO_MPI
120                 Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE supports numShape=NumNodes or 2*numShape=NumNodes only.");                   for (color=elements->minColor;color<=elements->maxColor;color++) {
121              }                      /*  open loop over all elements: */
122            } else if (p.numDim==2) {                      #pragma omp for private(e) schedule(static)
123              if ((p.row_NS == p.col_NS) && (p.row_NS == p.row_NN) && (p.col_NS == p.col_NN )) {                      for(e=0;e<elements->numElements;e++){
124                 Finley_Assemble_PDE_System2_2D(p,elements,S,F,A,B,C,D,X,Y);                         if (elements->Color[e]==color) {
125              } else if ( p.row_NS == p.col_NS &&  2*p.row_NS == p.row_NN && 2*p.col_NS == p.col_NN ) {                   #else
126                 if ( !isEmpty(A) || !isEmpty(B) || !isEmpty(C) || !isEmpty(X) ) {                   {
127                    Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: Contact elements require A, B, C and X to be empty.");                      for(e=0;e<elements->numElements;e++) {
128                 } else {                         {
129                    Finley_Assemble_PDE_System2_C(p,elements,S,F,D,Y);                   #endif
130                 }                            Vol=&(p.row_jac->volume[INDEX2(0,e,p.numQuad)]);
131              } else {                            memset(EM_lumpedMat,0,len_EM_lumpedMat_size);
132                 Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE supports numShape=NumNodes or 2*numShape=NumNodes only.");                            D_p=getSampleData(D,e);
133              }                            for (s=0;s<p.row_NS;s++) {
134            } else if (p.numDim==2) {                                rtmp=0;
135              if (p.row_NS == p.col_NS && p.row_NS == p.row_NN && p.col_NS == p.col_NN ) {                                for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*D_p[q];
136                 Finley_Assemble_PDE_System2_1D(p,elements,S,F,A,B,C,D,X,Y);                                EM_lumpedMat[INDEX2(0,s,p.numEqu)]+=rtmp;
137              } else if ( p.row_NS == p.col_NS &&  2*p.row_NS == p.row_NN && 2*p.col_NS == p.col_NN ) {                            }
138                 if ( !isEmpty(A) || !isEmpty(B) || !isEmpty(C) || !isEmpty(X) ) {                            for (q=0;q<p.row_NN;q++) row_index[q]=p.row_DOF[elements->Nodes[INDEX2(p.row_node[q],e,p.NN)]];
139                    Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: Contact elements require A, B, C and X to be empty.");                            Finley_Util_AddScatter(p.row_NN,row_index,p.numEqu,EM_lumpedMat,lumpedMat_p, p.row_DOF_UpperBound);
140                 } else {                         } /* end color check */
141                    Finley_Assemble_PDE_System2_C(p,elements,S,F,D,Y);                      } /* end element loop */
142                 }                    } /* end color loop */
143              } else {               } else  {
144                 Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE supports numShape=NumNodes or 2*numShape=NumNodes only.");                   #ifndef PASO_MPI
145              }                   for (color=elements->minColor;color<=elements->maxColor;color++) {
146                     /*  open loop over all elements: */
147                     #pragma omp for private(e) schedule(static)
148                     for(e=0;e<elements->numElements;e++){
149                        if (elements->Color[e]==color) {
150                     #else
151                     {
152                        for(e=0;e<elements->numElements;e++) {
153                           {
154                     #endif
155                               Vol=&(p.row_jac->volume[INDEX2(0,e,p.numQuad)]);
156                               memset(EM_lumpedMat,0,len_EM_lumpedMat_size);
157                               D_p=getSampleData(D,e);
158                               for (s=0;s<p.row_NS;s++) {
159                                   rtmp=0;
160                                   for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)];
161                                   EM_lumpedMat[INDEX2(0,s,p.numEqu)]+=rtmp*D_p[0];
162                               }
163                               for (q=0;q<p.row_NN;q++) row_index[q]=p.row_DOF[elements->Nodes[INDEX2(p.row_node[q],e,p.NN)]];
164                               Finley_Util_AddScatter(p.row_NN,row_index,p.numEqu,EM_lumpedMat,lumpedMat_p, p.row_DOF_UpperBound);
165                          } /* end color check */
166                        } /* end element loop */
167                     } /* end color loop */
168                 }
169            } else {            } else {
170              Finley_setError(VALUE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE supports spatial dimensions 1,2,3 only.");               if (expandedD) {
171                     #ifndef PASO_MPI
172                     for (color=elements->minColor;color<=elements->maxColor;color++) {
173                        /*  open loop over all elements: */
174                        #pragma omp for private(e) schedule(static)
175                        for(e=0;e<elements->numElements;e++){
176                           if (elements->Color[e]==color) {
177                     #else
178                     {
179                        for(e=0;e<elements->numElements;e++) {
180                           {
181                     #endif
182                              Vol=&(p.row_jac->volume[INDEX2(0,e,p.numQuad)]);
183                              memset(EM_lumpedMat,0,len_EM_lumpedMat_size);
184                              D_p=getSampleData(D,e);
185                              for (s=0;s<p.row_NS;s++) {
186                                  for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
187                                      rtmp=0.;
188                                      for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*D_p[INDEX2(k,q,p.numEqu)];
189                                      EM_lumpedMat[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp;
190                                  }
191                              }
192                              for (q=0;q<p.row_NN;q++) row_index[q]=p.row_DOF[elements->Nodes[INDEX2(p.row_node[q],e,p.NN)]];
193                              Finley_Util_AddScatter(p.row_NN,row_index,p.numEqu,EM_lumpedMat,lumpedMat_p, p.row_DOF_UpperBound);
194                           } /* end color check */
195                        } /* end element loop */
196                    } /* end color loop */
197                 } else {
198                     #ifndef PASO_MPI
199                     for (color=elements->minColor;color<=elements->maxColor;color++) {
200                        /*  open loop over all elements: */
201                        #pragma omp for private(e) schedule(static)
202                        for(e=0;e<elements->numElements;e++){
203                           if (elements->Color[e]==color) {
204                     #else
205                     {
206                        for(e=0;e<elements->numElements;e++) {
207                           {
208                     #endif
209                              Vol=&(p.row_jac->volume[INDEX2(0,e,p.numQuad)]);
210                              memset(EM_lumpedMat,0,len_EM_lumpedMat_size);
211                              D_p=getSampleData(D,e);
212                              for (s=0;s<p.row_NS;s++) {
213                                  rtmp=0;
214                                  for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)];
215                                  for (k=0;k<p.numEqu;k++) EM_lumpedMat[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp*D_p[k];
216                              }
217                              for (q=0;q<p.row_NN;q++) row_index[q]=p.row_DOF[elements->Nodes[INDEX2(p.row_node[q],e,p.NN)]];
218                              Finley_Util_AddScatter(p.row_NN,row_index,p.numEqu,EM_lumpedMat,lumpedMat_p, p.row_DOF_UpperBound);
219                           } /* end color check */
220                        } /* end element loop */
221                    } /* end color loop */
222                 }
223            }            }
224          } else {         } /* end of pointer check */
225            /* single PDES */         THREAD_MEMFREE(EM_lumpedMat);
226            if (p.numDim==3) {         THREAD_MEMFREE(row_index);
227              if (p.row_NS == p.col_NS && p.row_NS == p.row_NN && p.col_NS == p.col_NN ) {      } /* end parallel region */
228                 Finley_Assemble_PDE_Single2_3D(p,elements,S,F,A,B,C,D,X,Y);    }
229              } else if ( p.row_NS == p.col_NS &&  2*p.row_NS == p.row_NN && 2*p.col_NS == p.col_NN ) {    #ifdef Finley_TRACE
230                 if ( !isEmpty(A) || !isEmpty(B) || !isEmpty(C) || !isEmpty(X) ) {    printf("timing: assemblage lumped PDE: %.4e sec\n",Finley_timer()-time0);
231                    Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: Contact elements require A, B, C and X to be empty.");    #endif
                } else {  
                   Finley_Assemble_PDE_Single2_C(p,elements,S,F,D,Y);  
                }  
             } else {  
                Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE supports numShape=NumNodes or 2*numShape=NumNodes only.");  
             }  
           } else if (p.numDim==2) {  
             if ((p.row_NS == p.col_NS) && (p.row_NS == p.row_NN) && (p.col_NS == p.col_NN )) {  
                Finley_Assemble_PDE_Single2_2D(p,elements,S,F,A,B,C,D,X,Y);  
             } else if ( p.row_NS == p.col_NS &&  2*p.row_NS == p.row_NN && 2*p.col_NS == p.col_NN ) {  
                if ( !isEmpty(A) || !isEmpty(B) || !isEmpty(C) || !isEmpty(X) ) {  
                   Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: Contact elements require A, B, C and X to be empty.");  
                } else {  
                   Finley_Assemble_PDE_Single2_C(p,elements,S,F,D,Y);  
                }  
             } else {  
                Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE supports numShape=NumNodes or 2*numShape=NumNodes only.");  
             }  
           } else if (p.numDim==2) {  
             if (p.row_NS == p.col_NS && p.row_NS == p.row_NN && p.col_NS == p.col_NN ) {  
                Finley_Assemble_PDE_Single2_1D(p,elements,S,F,A,B,C,D,X,Y);  
             } else if ( p.row_NS == p.col_NS &&  2*p.row_NS == p.row_NN && 2*p.col_NS == p.col_NN ) {  
                if ( !isEmpty(A) || !isEmpty(B) || !isEmpty(C) || !isEmpty(X) ) {  
                   Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: Contact elements require A, B, C and X to be empty.");  
                } else {  
                   Finley_Assemble_PDE_Single2_C(p,elements,S,F,D,Y);  
                }  
             } else {  
                Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE supports numShape=NumNodes or 2*numShape=NumNodes only.");  
             }  
           } else {  
             Finley_setError(VALUE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE supports spatial dimensions 1,2,3 only.");  
           }  
         }  
      } else {  
           Finley_setError(VALUE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE requires number of equations == number of solutions  .");  
      }  
      #ifdef Finley_TRACE  
      printf("timing: assemblage PDE: %.4e sec\n",Finley_timer()-time0);  
      #endif  
   }  
232  }  }
 /*  
  * $Log$  
  * Revision 1.8  2005/09/15 03:44:21  jgs  
  * Merge of development branch dev-02 back to main trunk on 2005-09-15  
  *  
  * Revision 1.7  2005/09/01 03:31:35  jgs  
  * Merge of development branch dev-02 back to main trunk on 2005-09-01  
  *  
  * Revision 1.6  2005/08/12 01:45:42  jgs  
  * erge of development branch dev-02 back to main trunk on 2005-08-12  
  *  
  * Revision 1.5.2.3  2005/09/07 06:26:17  gross  
  * the solver from finley are put into the standalone package paso now  
  *  
  * Revision 1.5.2.2  2005/08/24 02:02:18  gross  
  * timing output switched off. solver output can be swiched through getSolution(verbose=True) now.  
  *  
  * Revision 1.5.2.1  2005/08/03 08:54:27  gross  
  * contact element assemblage was called with wrong element table pointer  
  *  
  * Revision 1.5  2005/07/08 04:07:46  jgs  
  * Merge of development branch back to main trunk on 2005-07-08  
  *  
  * Revision 1.4  2004/12/15 07:08:32  jgs  
  * *** empty log message ***  
  * Revision 1.1.1.1.2.2  2005/06/29 02:34:47  gross  
  * some changes towards 64 integers in finley  
  *  
  * Revision 1.1.1.1.2.1  2004/11/24 01:37:12  gross  
  * some changes dealing with the integer overflow in memory allocation. Finley solves 4M unknowns now  
  *  
  *  
  *  
  */  

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changed lines
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