/[escript]/trunk/finley/src/Assemble_LumpedSystem.c
ViewVC logotype

Diff of /trunk/finley/src/Assemble_LumpedSystem.c

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

trunk/finley/src/Assemble_PDE.c revision 971 by ksteube, Wed Feb 14 04:40:49 2007 UTC trunk/finley/src/Assemble_LumpedSystem.c revision 2548 by jfenwick, Mon Jul 20 06:20:06 2009 UTC
# Line 1  Line 1 
 /*  
  ************************************************************  
  *          Copyright 2006 by ACcESS MNRF                   *  
  *                                                          *  
  *              http://www.access.edu.au                    *  
  *       Primary Business: Queensland, Australia            *  
  *  Licensed under the Open Software License version 3.0    *  
  *     http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php       *  
  *                                                          *  
  ************************************************************  
 */  
1    
2    /*******************************************************
3    *
4    * Copyright (c) 2003-2009 by University of Queensland
5    * Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)
6    * http://www.uq.edu.au/esscc
7    *
8    * Primary Business: Queensland, Australia
9    * Licensed under the Open Software License version 3.0
10    * http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php
11    *
12    *******************************************************/
13    
 /**************************************************************/  
   
 /*    assembles the system of numEq PDEs into the stiffness matrix S and right hand side F */  
   
 /*     -div(A*grad u)-div(B*u)+C*grad u + D*u= -div X + Y */  
   
 /*      -(A_{k,i,m,j} u_m,j)_i-(B_{k,i,m} u_m)_i+C_{k,m,j} u_m,j-D_{k,m} u_m = -(X_{k,i})_i + Y_k */  
   
 /*    u has numComp components. */  
   
 /*    Shape of the coefficients: */  
14    
15  /*      A = numEqu x numDim x numComp x numDim */  /**************************************************************/
 /*      B = numDim x numEqu x numComp  */  
 /*      C = numEqu x numDim x numComp  */  
 /*      D = numEqu x numComp  */  
 /*      X = numEqu x numDim   */  
 /*      Y = numEqu */  
16    
17  /*    The coefficients A,B,C,D,X and Y have to be defined on the integartion points or not present (=NULL). */  /*    assembles the mass matrix in lumped form                */
18    
19  /*    S and F have to be initialized before the routine is called. S or F can be NULL. In this case the left or */  /*    The coefficient D has to be defined on the integration points or not present. */
 /*    the right hand side of the PDE is not processed.  */  
20    
21  /*    The routine does not consider any boundary conditions. */  /*    lumpedMat has to be initialized before the routine is called. */
   
 /**************************************************************/  
   
 /*  Author: gross@access.edu.au */  
 /*  Version: $Id$ */  
22    
23  /**************************************************************/  /**************************************************************/
24    
# Line 51  Line 29 
29  #endif  #endif
30    
31    
32    /* Disabled until the tests pass */
33    /* #define NEW_LUMPING */ /* */
34    
35  /**************************************************************/  /**************************************************************/
36    
37  void Finley_Assemble_PDE(Finley_NodeFile* nodes,Finley_ElementFile* elements,Paso_SystemMatrix* S, escriptDataC* F,  void Finley_Assemble_LumpedSystem(Finley_NodeFile* nodes,Finley_ElementFile* elements, escriptDataC* lumpedMat, escriptDataC* D)
38               escriptDataC* A, escriptDataC* B, escriptDataC* C, escriptDataC* D, escriptDataC* X, escriptDataC* Y ) {  {
39    
40    bool_t reducedIntegrationOrder=FALSE;    bool_t reducedIntegrationOrder=FALSE, expandedD;
41    char error_msg[LenErrorMsg_MAX];    char error_msg[LenErrorMsg_MAX];
42    Assemble_Parameters p;    Assemble_Parameters p;
43    double time0;    dim_t dimensions[ESCRIPT_MAX_DATA_RANK], k, e, len_EM_lumpedMat, q, s;
44    dim_t dimensions[ESCRIPT_MAX_DATA_RANK];    type_t funcspace;
45      index_t color,*row_index=NULL;
46      __const double *D_p=NULL;
47      double *S=NULL, *EM_lumpedMat=NULL, *Vol=NULL, *lumpedMat_p=NULL;
48      register double rtmp;
49      size_t len_EM_lumpedMat_size;
50    
51    #ifdef NEW_LUMPING
52      register double m_t, diagS;
53    #endif
54    
55    Finley_resetError();    Finley_resetError();
56    
57    if (nodes==NULL || elements==NULL) return;    if (nodes==NULL || elements==NULL) return;
58    if (S==NULL && isEmpty(F)) return;    if (isEmpty(lumpedMat) || isEmpty(D)) return;
59      if (isEmpty(lumpedMat) && !isEmpty(D)) {
60    if (isEmpty(F) && !isEmpty(X) && !isEmpty(F)) {          Finley_setError(TYPE_ERROR,"Assemble_LumpedSystem: coefficients are non-zero but no lumped matrix is given.");
61          Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: right hand side coefficients are non-zero bat no right hand side vector given.");          return;
   }  
   
   if (S==NULL && !isEmpty(A) && !isEmpty(B) && !isEmpty(C) && !isEmpty(D)) {  
         Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: coefficients are non-zero but no matrix is given.");  
62    }    }
63      funcspace=getFunctionSpaceType(D);
   /*  get the functionspace for this assemblage call */  
   type_t funcspace=UNKNOWN;  
   updateFunctionSpaceType(funcspace,A);  
   updateFunctionSpaceType(funcspace,B);  
   updateFunctionSpaceType(funcspace,C);  
   updateFunctionSpaceType(funcspace,D);  
   updateFunctionSpaceType(funcspace,X);  
   updateFunctionSpaceType(funcspace,Y);  
   if (funcspace==UNKNOWN) return; /* all  data are empty */  
   
   
   /* check if all function spaces are the same */  
   if (! functionSpaceTypeEqual(funcspace,A) ) {  
         Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: unexpected function space type for coefficient A");  
   }  
   if (! functionSpaceTypeEqual(funcspace,B) ) {  
         Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: unexpected function space type for coefficient B");  
   }  
   if (! functionSpaceTypeEqual(funcspace,C) ) {  
         Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: unexpected function space type for coefficient C");  
   }  
   if (! functionSpaceTypeEqual(funcspace,D) ) {  
         Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: unexpected function space type for coefficient D");  
   }  
   if (! functionSpaceTypeEqual(funcspace,X) ) {  
         Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: unexpected function space type for coefficient X");  
   }  
   if (! functionSpaceTypeEqual(funcspace,Y) ) {  
         Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: unexpected function space type for coefficient Y");  
   }  
   if (! Finley_noError()) return;  
   
64    /* check if all function spaces are the same */    /* check if all function spaces are the same */
65    if (funcspace==FINLEY_ELEMENTS) {    if (funcspace==FINLEY_ELEMENTS) {
66         reducedIntegrationOrder=FALSE;         reducedIntegrationOrder=FALSE;
67    } else if (funcspace==FINLEY_FACE_ELEMENTS)  {    } else if (funcspace==FINLEY_FACE_ELEMENTS)  {
68         reducedIntegrationOrder=FALSE;         reducedIntegrationOrder=FALSE;
69    } else if (funcspace==FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1)  {    } else if (funcspace==FINLEY_REDUCED_ELEMENTS) {
70         reducedIntegrationOrder=FALSE;         reducedIntegrationOrder=TRUE;
71    } else if (funcspace==FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_2)  {    } else if (funcspace==FINLEY_REDUCED_FACE_ELEMENTS)  {
72         reducedIntegrationOrder=FALSE;         reducedIntegrationOrder=TRUE;
73    } else {    } else {
74         Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: assemblage failed because of illegal function space.");         Finley_setError(TYPE_ERROR,"Assemble_LumpedSystem: assemblage failed because of illegal function space.");
75    }    }
76    if (! Finley_noError()) return;    if (! Finley_noError()) return;
77    
78    /* set all parameters in p*/    /* set all parameters in p*/
79    Assemble_getAssembleParameters(nodes,elements,S,F, reducedIntegrationOrder, &p);    Assemble_getAssembleParameters(nodes,elements,NULL,lumpedMat, reducedIntegrationOrder, &p);
80    if (! Finley_noError()) return;    if (! Finley_noError()) return;
81    
82    /* check if all function spaces are the same */    /* check if all function spaces are the same */
83    
   if (! numSamplesEqual(A,p.numQuad,elements->numElements) ) {  
         sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: sample points of coefficient A don't match (%d,%d)",p.numQuad,elements->numElements);  
         Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
   }  
   
   if (! numSamplesEqual(B,p.numQuad,elements->numElements) ) {  
         sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: sample points of coefficient B don't match (%d,%d)",p.numQuad,elements->numElements);  
         Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
   }  
   
   if (! numSamplesEqual(C,p.numQuad,elements->numElements) ) {  
         sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: sample points of coefficient C don't match (%d,%d)",p.numQuad,elements->numElements);  
         Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
   }  
   
84    if (! numSamplesEqual(D,p.numQuad,elements->numElements) ) {    if (! numSamplesEqual(D,p.numQuad,elements->numElements) ) {
85          sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: sample points of coefficient D don't match (%d,%d)",p.numQuad,elements->numElements);          sprintf(error_msg,"Assemble_LumpedSystem: sample points of coefficient D don't match (%d,%d)",p.numQuad,elements->numElements);
         Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
   }  
   
   if (! numSamplesEqual(X,p.numQuad,elements->numElements) ) {  
         sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: sample points of coefficient X don't match (%d,%d)",p.numQuad,elements->numElements);  
         Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
   }  
   
   if (! numSamplesEqual(Y,p.numQuad,elements->numElements) ) {  
         sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: sample points of coefficient Y don't match (%d,%d)",p.numQuad,elements->numElements);  
86          Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);          Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);
87    }    }
88    
89    /*  check the dimensions: */    /*  check the dimensions: */
90        
91    if (p.numEqu==1 && p.numComp==1) {    if (p.numEqu==1) {
     if (!isEmpty(A)) {  
       dimensions[0]=p.numDim;  
       dimensions[1]=p.numDim;  
       if (!isDataPointShapeEqual(A,2,dimensions)) {  
           sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: coefficient A: illegal shape, expected shape (%d,%d)",dimensions[0],dimensions[1]);  
           Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
       }  
     }  
     if (!isEmpty(B)) {  
        dimensions[0]=p.numDim;  
        if (!isDataPointShapeEqual(B,1,dimensions)) {  
           sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: coefficient B: illegal shape (%d,)",dimensions[0]);  
           Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
        }  
     }  
     if (!isEmpty(C)) {  
        dimensions[0]=p.numDim;  
        if (!isDataPointShapeEqual(C,1,dimensions)) {  
           sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: coefficient C, expected shape (%d,)",dimensions[0]);  
           Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
        }  
     }  
92      if (!isEmpty(D)) {      if (!isEmpty(D)) {
93         if (!isDataPointShapeEqual(D,0,dimensions)) {         if (!isDataPointShapeEqual(D,0,dimensions)) {
94            Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: coefficient D, rank 0 expected.");            Finley_setError(TYPE_ERROR,"Assemble_LumpedSystem: coefficient D, rank 0 expected.");
        }  
     }  
     if (!isEmpty(X)) {  
        dimensions[0]=p.numDim;  
        if (!isDataPointShapeEqual(X,1,dimensions)) {  
           sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: coefficient X, expected shape (%d,",dimensions[0]);  
           Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
95         }         }
96    
97      }      }
     if (!isEmpty(Y)) {  
        if (!isDataPointShapeEqual(Y,0,dimensions)) {  
           Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: coefficient Y, rank 0 expected.");  
        }  
     }  
98    } else {    } else {
     if (!isEmpty(A)) {  
       dimensions[0]=p.numEqu;  
       dimensions[1]=p.numDim;  
       dimensions[2]=p.numComp;  
       dimensions[3]=p.numDim;  
       if (!isDataPointShapeEqual(A,4,dimensions)) {  
           sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: coefficient A, expected shape (%d,%d,%d,%d)",dimensions[0],dimensions[1],dimensions[2],dimensions[3]);  
           Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
       }  
     }  
     if (!isEmpty(B)) {  
       dimensions[0]=p.numEqu;  
       dimensions[1]=p.numDim;  
       dimensions[2]=p.numComp;  
       if (!isDataPointShapeEqual(B,3,dimensions)) {  
           sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: coefficient B, expected shape (%d,%d,%d)",dimensions[0],dimensions[1],dimensions[2]);  
           Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
       }  
     }  
     if (!isEmpty(C)) {  
       dimensions[0]=p.numEqu;  
       dimensions[1]=p.numComp;  
       dimensions[2]=p.numDim;  
       if (!isDataPointShapeEqual(C,3,dimensions)) {  
           sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: coefficient C, expected shape (%d,%d,%d)",dimensions[0],dimensions[1],dimensions[2]);  
           Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
       }  
     }  
99      if (!isEmpty(D)) {      if (!isEmpty(D)) {
100        dimensions[0]=p.numEqu;        dimensions[0]=p.numEqu;
101        dimensions[1]=p.numComp;        if (!isDataPointShapeEqual(D,1,dimensions)) {
102        if (!isDataPointShapeEqual(D,2,dimensions)) {            sprintf(error_msg,"Assemble_LumpedSystem: coefficient D, expected shape (%d,)",dimensions[0]);
           sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: coefficient D, expected shape (%d,%d)",dimensions[0],dimensions[1]);  
           Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
       }  
     }  
     if (!isEmpty(X)) {  
       dimensions[0]=p.numEqu;  
       dimensions[1]=p.numDim;  
       if (!isDataPointShapeEqual(X,2,dimensions)) {  
           sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: coefficient X, expected shape (%d,%d)",dimensions[0],dimensions[1]);  
           Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
       }  
     }  
     if (!isEmpty(Y)) {  
       dimensions[0]=p.numEqu;  
       if (!isDataPointShapeEqual(Y,1,dimensions)) {  
           sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: coefficient Y, expected shape (%d,)",dimensions[0]);  
103            Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);            Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);
104        }        }
105      }      }
106    }    }
107    
108    if (Finley_noError()) {    if (Finley_noError()) {
109       time0=Finley_timer();      void* buffer=allocSampleBuffer(D);
110       if (p.numEqu == p. numComp) {      requireWrite(lumpedMat);
111          if (p.numEqu > 1) {      lumpedMat_p=getSampleDataRW(lumpedMat,0);
112            /* system of PDESs */      len_EM_lumpedMat=p.row_NN*p.numEqu;
113            if (p.numDim==3) {      len_EM_lumpedMat_size=len_EM_lumpedMat*sizeof(double);
114              if (p.row_NS == p.col_NS && p.row_NS == p.row_NN && p.col_NS == p.col_NN ) {      expandedD=isExpanded(D);
115                 Finley_Assemble_PDE_System2_3D(p,elements,S,F,A,B,C,D,X,Y);      S=p.row_jac->ReferenceElement->S;
116              } else if ( p.row_NS == p.col_NS &&  2*p.row_NS == p.row_NN && 2*p.col_NS == p.col_NN ) {      #pragma omp parallel private(color, EM_lumpedMat, row_index, Vol, D_p, s, q, k, rtmp)
117                 if ( !isEmpty(A) || !isEmpty(B) || !isEmpty(C) || !isEmpty(X) ) {      {
118                    Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: Contact elements require A, B, C and X to be empty.");         EM_lumpedMat=THREAD_MEMALLOC(len_EM_lumpedMat,double);
119                 } else {         row_index=THREAD_MEMALLOC(p.row_NN,index_t);
120                    Finley_Assemble_PDE_System2_C(p,elements,S,F,D,Y);         if ( !Finley_checkPtr(EM_lumpedMat) && !Finley_checkPtr(row_index) ) {
121                 }            if (p.numEqu == 1) {
122              } else {               if (expandedD) {
123                 Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE supports numShape=NumNodes or 2*numShape=NumNodes only.");                   for (color=elements->minColor;color<=elements->maxColor;color++) {
124              }                      /*  open loop over all elements: */
125            } else if (p.numDim==2) {                      #pragma omp for private(e) schedule(static)
126              if ((p.row_NS == p.col_NS) && (p.row_NS == p.row_NN) && (p.col_NS == p.col_NN )) {                      for(e=0;e<elements->numElements;e++){
127                 Finley_Assemble_PDE_System2_2D(p,elements,S,F,A,B,C,D,X,Y);                         if (elements->Color[e]==color) {
128              } else if ( p.row_NS == p.col_NS &&  2*p.row_NS == p.row_NN && 2*p.col_NS == p.col_NN ) {                            Vol=&(p.row_jac->volume[INDEX2(0,e,p.numQuad)]);
129                 if ( !isEmpty(A) || !isEmpty(B) || !isEmpty(C) || !isEmpty(X) ) {                            memset(EM_lumpedMat,0,len_EM_lumpedMat_size);
130                    Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: Contact elements require A, B, C and X to be empty.");                            D_p=getSampleDataRO(D,e,buffer);
131                 } else {                            #ifdef NEW_LUMPING /* HRZ lumping */
132                    Finley_Assemble_PDE_System2_C(p,elements,S,F,D,Y);                            /*
133                 }                             *           Number of PDEs: 1
134              } else {                             *  D_p varies over element: True
135                 Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE supports numShape=NumNodes or 2*numShape=NumNodes only.");                             */
136              }                            #pragma omp parallel private(m_t)
137            } else if (p.numDim==2) {                            m_t=0; /* mass of the element: m_t */
138              if (p.row_NS == p.col_NS && p.row_NS == p.row_NN && p.col_NS == p.col_NN ) {                            for (q=0;q<p.numQuad;q++) {
139                 Finley_Assemble_PDE_System2_1D(p,elements,S,F,A,B,C,D,X,Y);                                m_t+=Vol[q]*D_p[q];
140              } else if ( p.row_NS == p.col_NS &&  2*p.row_NS == p.row_NN && 2*p.col_NS == p.col_NN ) {                            }                          
141                 if ( !isEmpty(A) || !isEmpty(B) || !isEmpty(C) || !isEmpty(X) ) {                            #pragma omp parallel private(diagS)
142                    Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: Contact elements require A, B, C and X to be empty.");                            diagS=0; /* diagonal sum: S */
143                 } else {                            for (s=0;s<p.row_NS;s++) {
144                    Finley_Assemble_PDE_System2_C(p,elements,S,F,D,Y);                                rtmp=0;
145                 }                                for (q=0;q<p.numQuad;q++) {
146              } else {                                    rtmp+=Vol[q]*D_p[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)];
147                 Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE supports numShape=NumNodes or 2*numShape=NumNodes only.");                                }
148              }                                EM_lumpedMat[INDEX2(0,s,p.numEqu)]+=rtmp;
149            } else {                                diagS+=EM_lumpedMat[INDEX2(0,s,p.numEqu)];
150              Finley_setError(VALUE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE supports spatial dimensions 1,2,3 only.");                            }
151            }                            /* rescale diagonals by m_t/diagS to ensure consistent mass over element */
152          } else {                            for (s=0;s<p.row_NS;s++) {
153            /* single PDES */                                EM_lumpedMat[INDEX2(0,s,p.numEqu)]*=m_t/diagS;
154            if (p.numDim==3) {                            }
155              if (p.row_NS == p.col_NS && p.row_NS == p.row_NN && p.col_NS == p.col_NN ) {                            #else /* row-sum lumping */
156                 Finley_Assemble_PDE_Single2_3D(p,elements,S,F,A,B,C,D,X,Y);                            for (s=0;s<p.row_NS;s++) {
157              } else if ( p.row_NS == p.col_NS &&  2*p.row_NS == p.row_NN && 2*p.col_NS == p.col_NN ) {                                rtmp=0;
158                 if ( !isEmpty(A) || !isEmpty(B) || !isEmpty(C) || !isEmpty(X) ) {                                for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*D_p[q];
159                    Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: Contact elements require A, B, C and X to be empty.");                                EM_lumpedMat[INDEX2(0,s,p.numEqu)]+=rtmp;
160                 } else {                            }
161                    Finley_Assemble_PDE_Single2_C(p,elements,S,F,D,Y);                            #endif
162                 }                            for (q=0;q<p.row_NN;q++) row_index[q]=p.row_DOF[elements->Nodes[INDEX2(p.row_node[q],e,p.NN)]];
163              } else {                            Finley_Util_AddScatter(p.row_NN,row_index,p.numEqu,EM_lumpedMat,lumpedMat_p, p.row_DOF_UpperBound);
164                 Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE supports numShape=NumNodes or 2*numShape=NumNodes only.");                         } /* end color check */
165              }                      } /* end element loop */
166            } else if (p.numDim==2) {                    } /* end color loop */
167              if ((p.row_NS == p.col_NS) && (p.row_NS == p.row_NN) && (p.col_NS == p.col_NN )) {               } else  {
168                 Finley_Assemble_PDE_Single2_2D(p,elements,S,F,A,B,C,D,X,Y);                   for (color=elements->minColor;color<=elements->maxColor;color++) {
169              } else if ( p.row_NS == p.col_NS &&  2*p.row_NS == p.row_NN && 2*p.col_NS == p.col_NN ) {                   /*  open loop over all elements: */
170                 if ( !isEmpty(A) || !isEmpty(B) || !isEmpty(C) || !isEmpty(X) ) {                   #pragma omp for private(e) schedule(static)
171                    Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: Contact elements require A, B, C and X to be empty.");                   for(e=0;e<elements->numElements;e++){
172                 } else {                      if (elements->Color[e]==color) {
173                    Finley_Assemble_PDE_Single2_C(p,elements,S,F,D,Y);                            Vol=&(p.row_jac->volume[INDEX2(0,e,p.numQuad)]);
174                 }                            memset(EM_lumpedMat,0,len_EM_lumpedMat_size);
175              } else {                            D_p=getSampleDataRO(D,e,buffer);
176                 Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE supports numShape=NumNodes or 2*numShape=NumNodes only.");                            #ifdef NEW_LUMPING /* HRZ lumping */
177              }                            /*
178            } else if (p.numDim==2) {                             *           Number of PDEs: 1
179              if (p.row_NS == p.col_NS && p.row_NS == p.row_NN && p.col_NS == p.col_NN ) {                             *  D_p varies over element: False
180                 Finley_Assemble_PDE_Single2_1D(p,elements,S,F,A,B,C,D,X,Y);                             */
181              } else if ( p.row_NS == p.col_NS &&  2*p.row_NS == p.row_NN && 2*p.col_NS == p.col_NN ) {                            m_t=0; /* mass of the element: m_t */
182                 if ( !isEmpty(A) || !isEmpty(B) || !isEmpty(C) || !isEmpty(X) ) {                            for (q=0;q<p.numQuad;q++) {
183                    Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: Contact elements require A, B, C and X to be empty.");                                m_t+=Vol[q]*D_p[0];
184                 } else {                            }                          
185                    Finley_Assemble_PDE_Single2_C(p,elements,S,F,D,Y);                            diagS=0; /* diagonal sum: S */
186                 }                            for (s=0;s<p.row_NS;s++) {
187              } else {                                rtmp=0;
188                 Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE supports numShape=NumNodes or 2*numShape=NumNodes only.");                                for (q=0;q<p.numQuad;q++) {
189              }                                    rtmp+=Vol[q]*D_p[0]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)];
190                                  }
191                                  EM_lumpedMat[INDEX2(0,s,p.numEqu)]+=rtmp;
192                                  diagS+=EM_lumpedMat[INDEX2(0,s,p.numEqu)];
193                              }
194                              /* rescale diagonals by m_t/diagS to ensure consistent mass over element */
195                              for (s=0;s<p.row_NS;s++) {
196                                  EM_lumpedMat[INDEX2(0,s,p.numEqu)]*=m_t/diagS;
197                              }
198                              #else /* row-sum lumping */
199                              for (s=0;s<p.row_NS;s++) {
200                                  rtmp=0;
201                                  for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)];
202                                  EM_lumpedMat[INDEX2(0,s,p.numEqu)]+=rtmp*D_p[0];
203                              }
204                              #endif
205                              for (q=0;q<p.row_NN;q++) row_index[q]=p.row_DOF[elements->Nodes[INDEX2(p.row_node[q],e,p.NN)]];
206                              Finley_Util_AddScatter(p.row_NN,row_index,p.numEqu,EM_lumpedMat,lumpedMat_p, p.row_DOF_UpperBound);
207                          } /* end color check */
208                        } /* end element loop */
209                     } /* end color loop */
210                 }
211            } else {            } else {
212              Finley_setError(VALUE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE supports spatial dimensions 1,2,3 only.");               if (expandedD) {
213                     for (color=elements->minColor;color<=elements->maxColor;color++) {
214                        /*  open loop over all elements: */
215                        #pragma omp for private(e) schedule(static)
216                        for(e=0;e<elements->numElements;e++){
217                           if (elements->Color[e]==color) {
218                              Vol=&(p.row_jac->volume[INDEX2(0,e,p.numQuad)]);
219                              memset(EM_lumpedMat,0,len_EM_lumpedMat_size);
220                              D_p=getSampleDataRO(D,e,buffer);
221                              #ifdef NEW_LUMPING /* HRZ lumping */
222                              /*
223                               *           Number of PDEs: Multiple
224                               *  D_p varies over element: True
225                               */
226                              for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
227                                  m_t=0; /* mass of the element: m_t */
228                                  for (q=0;q<p.numQuad;q++) {
229                                      m_t+=Vol[q]*D_p[INDEX2(k,q,p.numEqu)];
230                                  }                          
231                                  diagS=0; /* diagonal sum: S */
232                                  for (s=0;s<p.row_NS;s++) {
233                                      rtmp=0;
234                                      for (q=0;q<p.numQuad;q++) {
235                                          rtmp+=Vol[q]*D_p[INDEX2(k,q,p.numEqu)]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)];
236                                      }
237                                      EM_lumpedMat[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp;
238                                      diagS+=EM_lumpedMat[INDEX2(k,s,p.numEqu)];
239                                  }
240                                  /* rescale diagonals by m_t/diagS to ensure consistent mass over element */
241                                  for (s=0;s<p.row_NS;s++) {
242                                      EM_lumpedMat[INDEX2(k,s,p.numEqu)]*=m_t/diagS;
243                                  }
244                              }
245                              #else /* row-sum lumping */
246                              for (s=0;s<p.row_NS;s++) {
247                                  for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
248                                      rtmp=0.;
249                                      for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*D_p[INDEX2(k,q,p.numEqu)];
250                                      EM_lumpedMat[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp;
251                                  }
252                              }
253                              #endif
254                              for (q=0;q<p.row_NN;q++) row_index[q]=p.row_DOF[elements->Nodes[INDEX2(p.row_node[q],e,p.NN)]];
255                              Finley_Util_AddScatter(p.row_NN,row_index,p.numEqu,EM_lumpedMat,lumpedMat_p, p.row_DOF_UpperBound);
256                           } /* end color check */
257                        } /* end element loop */
258                    } /* end color loop */
259                 } else {
260                     /*  open loop over all elements: */
261                     for (color=elements->minColor;color<=elements->maxColor;color++) {
262                        #pragma omp for private(e) schedule(static)
263                        for(e=0;e<elements->numElements;e++){
264                           if (elements->Color[e]==color) {
265                              Vol=&(p.row_jac->volume[INDEX2(0,e,p.numQuad)]);
266                              memset(EM_lumpedMat,0,len_EM_lumpedMat_size);
267                              D_p=getSampleDataRO(D,e,buffer);
268                              #ifdef NEW_LUMPING /* HRZ lumping */
269                              /*
270                               *           Number of PDEs: Multiple
271                               *  D_p varies over element: False
272                               */
273                              for (k=0;k<p.numEqu;k++) {
274                                  m_t=0; /* mass of the element: m_t */
275                                  for (q=0;q<p.numQuad;q++) {
276                                      m_t+=Vol[q]*D_p[k];
277                                  }                          
278                                  diagS=0; /* diagonal sum: S */
279                                  for (s=0;s<p.row_NS;s++) {
280                                      rtmp=0;
281                                      for (q=0;q<p.numQuad;q++) {
282                                          rtmp+=Vol[q]*D_p[k]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)];
283                                      }
284                                      EM_lumpedMat[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp;
285                                      diagS+=EM_lumpedMat[INDEX2(k,s,p.numEqu)];
286                                  }
287                                  /* rescale diagonals by m_t/diagS to ensure consistent mass over element */
288                                  for (s=0;s<p.row_NS;s++) {
289                                      EM_lumpedMat[INDEX2(k,s,p.numEqu)]*=m_t/diagS;
290                                  }
291                              }
292                              #else /* row-sum lumping */
293                              for (s=0;s<p.row_NS;s++) {
294                                  rtmp=0;
295                                  for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)];
296                                  for (k=0;k<p.numEqu;k++) EM_lumpedMat[INDEX2(k,s,p.numEqu)]+=rtmp*D_p[k];
297                              }
298                              #endif
299                              for (q=0;q<p.row_NN;q++) row_index[q]=p.row_DOF[elements->Nodes[INDEX2(p.row_node[q],e,p.NN)]];
300                              Finley_Util_AddScatter(p.row_NN,row_index,p.numEqu,EM_lumpedMat,lumpedMat_p, p.row_DOF_UpperBound);
301                           } /* end color check */
302                        } /* end element loop */
303                    } /* end color loop */
304                 }
305            }            }
306          }         } /* end of pointer check */
307       } else {         THREAD_MEMFREE(EM_lumpedMat);
308            Finley_setError(VALUE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE requires number of equations == number of solutions  .");         THREAD_MEMFREE(row_index);
309       }      } /* end parallel region */
310       #ifdef Finley_TRACE      freeSampleBuffer(buffer);
      printf("timing: assemblage PDE: %.4e sec\n",Finley_timer()-time0);  
      #endif  
311    }    }
312  }  }
 /*  
  * $Log$  
  * Revision 1.8  2005/09/15 03:44:21  jgs  
  * Merge of development branch dev-02 back to main trunk on 2005-09-15  
  *  
  * Revision 1.7  2005/09/01 03:31:35  jgs  
  * Merge of development branch dev-02 back to main trunk on 2005-09-01  
  *  
  * Revision 1.6  2005/08/12 01:45:42  jgs  
  * erge of development branch dev-02 back to main trunk on 2005-08-12  
  *  
  * Revision 1.5.2.3  2005/09/07 06:26:17  gross  
  * the solver from finley are put into the standalone package paso now  
  *  
  * Revision 1.5.2.2  2005/08/24 02:02:18  gross  
  * timing output switched off. solver output can be swiched through getSolution(verbose=True) now.  
  *  
  * Revision 1.5.2.1  2005/08/03 08:54:27  gross  
  * contact element assemblage was called with wrong element table pointer  
  *  
  * Revision 1.5  2005/07/08 04:07:46  jgs  
  * Merge of development branch back to main trunk on 2005-07-08  
  *  
  * Revision 1.4  2004/12/15 07:08:32  jgs  
  * *** empty log message ***  
  * Revision 1.1.1.1.2.2  2005/06/29 02:34:47  gross  
  * some changes towards 64 integers in finley  
  *  
  * Revision 1.1.1.1.2.1  2004/11/24 01:37:12  gross  
  * some changes dealing with the integer overflow in memory allocation. Finley solves 4M unknowns now  
  *  
  *  
  *  
  */  

Legend:
Removed from v.971  
changed lines
  Added in v.2548

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.26