/[escript]/trunk/finley/src/Assemble_PDE.c
ViewVC logotype

Diff of /trunk/finley/src/Assemble_PDE.c

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

trunk/esys2/finley/src/finleyC/Assemble_PDE.c revision 123 by jgs, Fri Jul 8 04:08:13 2005 UTC trunk/finley/src/Assemble_PDE.c revision 2156 by gross, Mon Dec 15 05:09:02 2008 UTC
# Line 1  Line 1 
1  /* $Id$ */  
2    /*******************************************************
3    *
4    * Copyright (c) 2003-2008 by University of Queensland
5    * Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)
6    * http://www.uq.edu.au/esscc
7    *
8    * Primary Business: Queensland, Australia
9    * Licensed under the Open Software License version 3.0
10    * http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php
11    *
12    *******************************************************/
13    
14    
15  /**************************************************************/  /**************************************************************/
16    
# Line 28  Line 40 
40    
41  /**************************************************************/  /**************************************************************/
42    
 /*   Copyrights by ACcESS Australia, 2003,2004 */  
 /*   author: gross@access.edu.au */  
 /*   Version: $Id$ */  
   
 /**************************************************************/  
   
 #include "escript/Data/DataC.h"  
 #include "Finley.h"  
43  #include "Assemble.h"  #include "Assemble.h"
 #include "NodeFile.h"  
 #include "ElementFile.h"  
44  #include "Util.h"  #include "Util.h"
45    #include "esysUtils/blocktimer.h"
46  #ifdef _OPENMP  #ifdef _OPENMP
47  #include <omp.h>  #include <omp.h>
48  #endif  #endif
# Line 47  Line 50 
50    
51  /**************************************************************/  /**************************************************************/
52    
53  void Finley_Assemble_PDE(Finley_NodeFile* nodes,Finley_ElementFile* elements,Finley_SystemMatrix* S, escriptDataC* F,  void Finley_Assemble_PDE(Finley_NodeFile* nodes,Finley_ElementFile* elements,Paso_SystemMatrix* S, escriptDataC* F,
54               escriptDataC* A, escriptDataC* B, escriptDataC* C, escriptDataC* D, escriptDataC* X, escriptDataC* Y ) {               escriptDataC* A, escriptDataC* B, escriptDataC* C, escriptDataC* D, escriptDataC* X, escriptDataC* Y ) {
55    
56    double *EM_S=NULL,*EM_F=NULL,*V=NULL,*dVdv=NULL,*dSdV=NULL,*Vol=NULL,*dvdV=NULL;    bool_t reducedIntegrationOrder=FALSE;
57    double time0;    char error_msg[LenErrorMsg_MAX];
   dim_t dimensions[ESCRIPT_MAX_DATA_RANK],e,q;  
58    Assemble_Parameters p;    Assemble_Parameters p;
59    index_t *index_row=NULL,*index_col=NULL,color;    double time0;
60      dim_t dimensions[ESCRIPT_MAX_DATA_RANK];
61      type_t funcspace;
62      double blocktimer_start = blocktimer_time();
63    
64      Finley_resetError();
65    
66      {
67    #ifdef Paso_MPI
68      int iam, numCPUs;
69      iam = elements->elementDistribution->MPIInfo->rank;
70      numCPUs = elements->elementDistribution->MPIInfo->size;
71    #endif
72      }
73    
74    if (nodes==NULL || elements==NULL) return;    if (nodes==NULL || elements==NULL) return;
75    if (S==NULL && isEmpty(F)) return;    if (S==NULL && isEmpty(F)) return;
76    
77    /* set all parameters in p*/    if (isEmpty(F) && !isEmpty(X) && !isEmpty(F)) {
78    Assemble_getAssembleParameters(nodes,elements,S,F,&p);          Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: right hand side coefficients are non-zero bat no right hand side vector given.");
79    if (Finley_ErrorCode!=NO_ERROR) return;    }
80    
81    /*  this function assumes NS=NN */    if (S==NULL && !isEmpty(A) && !isEmpty(B) && !isEmpty(C) && !isEmpty(D)) {
82    if (p.NN!=p.NS) {          Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: coefficients are non-zero but no matrix is given.");
     Finley_ErrorCode=SYSTEM_ERROR;  
     sprintf(Finley_ErrorMsg,"for Finley_Assemble_PDE numNodes and numShapes have to be identical.");  
     return;  
   }  
   if (p.numDim!=p.numElementDim) {  
     Finley_ErrorCode=SYSTEM_ERROR;  
     sprintf(Finley_ErrorMsg,"Finley_Assemble_PDE accepts volume elements only.");  
     return;  
83    }    }
84    /*  get a functionspace */  
85    type_t funcspace=UNKNOWN;    /*  get the functionspace for this assemblage call */
86      funcspace=UNKNOWN;
87    updateFunctionSpaceType(funcspace,A);    updateFunctionSpaceType(funcspace,A);
88    updateFunctionSpaceType(funcspace,B);    updateFunctionSpaceType(funcspace,B);
89    updateFunctionSpaceType(funcspace,C);    updateFunctionSpaceType(funcspace,C);
# Line 85  void Finley_Assemble_PDE(Finley_NodeFile Line 93  void Finley_Assemble_PDE(Finley_NodeFile
93    if (funcspace==UNKNOWN) return; /* all  data are empty */    if (funcspace==UNKNOWN) return; /* all  data are empty */
94    
95    /* check if all function spaces are the same */    /* check if all function spaces are the same */
   
96    if (! functionSpaceTypeEqual(funcspace,A) ) {    if (! functionSpaceTypeEqual(funcspace,A) ) {
97          Finley_ErrorCode=TYPE_ERROR;          Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: unexpected function space type for coefficient A");
         sprintf(Finley_ErrorMsg,"unexpected function space typ for coefficient A");  
98    }    }
99    if (! functionSpaceTypeEqual(funcspace,B) ) {    if (! functionSpaceTypeEqual(funcspace,B) ) {
100          Finley_ErrorCode=TYPE_ERROR;          Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: unexpected function space type for coefficient B");
         sprintf(Finley_ErrorMsg,"unexpected function space typ for coefficient B");  
101    }    }
102    if (! functionSpaceTypeEqual(funcspace,C) ) {    if (! functionSpaceTypeEqual(funcspace,C) ) {
103          Finley_ErrorCode=TYPE_ERROR;          Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: unexpected function space type for coefficient C");
         sprintf(Finley_ErrorMsg,"unexpected function space typ for coefficient C");  
104    }    }
105    if (! functionSpaceTypeEqual(funcspace,D) ) {    if (! functionSpaceTypeEqual(funcspace,D) ) {
106          Finley_ErrorCode=TYPE_ERROR;          Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: unexpected function space type for coefficient D");
         sprintf(Finley_ErrorMsg,"unexpected function space typ for coefficient D");  
107    }    }
108    if (! functionSpaceTypeEqual(funcspace,X) ) {    if (! functionSpaceTypeEqual(funcspace,X) ) {
109          Finley_ErrorCode=TYPE_ERROR;          Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: unexpected function space type for coefficient X");
         sprintf(Finley_ErrorMsg,"unexpected function space typ for coefficient X");  
110    }    }
111    if (! functionSpaceTypeEqual(funcspace,Y) ) {    if (! functionSpaceTypeEqual(funcspace,Y) ) {
112          Finley_ErrorCode=TYPE_ERROR;          Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: unexpected function space type for coefficient Y");
         sprintf(Finley_ErrorMsg,"unexpected function space typ for coefficient Y");  
113    }    }
114      if (! Finley_noError()) return;
115    
116      /* check if all function spaces are the same */
117      if (funcspace==FINLEY_ELEMENTS) {
118           reducedIntegrationOrder=FALSE;
119      } else if (funcspace==FINLEY_FACE_ELEMENTS)  {
120           reducedIntegrationOrder=FALSE;
121      } else if (funcspace==FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1)  {
122           reducedIntegrationOrder=FALSE;
123      } else if (funcspace==FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_2)  {
124           reducedIntegrationOrder=FALSE;
125      } else if (funcspace==FINLEY_REDUCED_ELEMENTS) {
126           reducedIntegrationOrder=TRUE;
127      } else if (funcspace==FINLEY_REDUCED_FACE_ELEMENTS)  {
128           reducedIntegrationOrder=TRUE;
129      } else if (funcspace==FINLEY_REDUCED_CONTACT_ELEMENTS_1)  {
130           reducedIntegrationOrder=TRUE;
131      } else if (funcspace==FINLEY_REDUCED_CONTACT_ELEMENTS_2)  {
132           reducedIntegrationOrder=TRUE;
133      } else {
134           Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: assemblage failed because of illegal function space.");
135      }
136      if (! Finley_noError()) return;
137    
138      /* set all parameters in p*/
139      Assemble_getAssembleParameters(nodes,elements,S,F, reducedIntegrationOrder, &p);
140      if (! Finley_noError()) return;
141    
142    /* check if all function spaces are the same */    /* check if all function spaces are the same */
143    
144    if (! numSamplesEqual(A,p.numQuad,elements->numElements) ) {    if (! numSamplesEqual(A,p.numQuad,elements->numElements) ) {
145          Finley_ErrorCode=TYPE_ERROR;          sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: sample points of coefficient A don't match (%d,%d)",p.numQuad,elements->numElements);
146          sprintf(Finley_ErrorMsg,"sample points of coefficient A don't match (%d,%d)",p.numQuad,elements->numElements);          Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);
147    }    }
148    
149    if (! numSamplesEqual(B,p.numQuad,elements->numElements) ) {    if (! numSamplesEqual(B,p.numQuad,elements->numElements) ) {
150          Finley_ErrorCode=TYPE_ERROR;          sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: sample points of coefficient B don't match (%d,%d)",p.numQuad,elements->numElements);
151          sprintf(Finley_ErrorMsg,"sample points of coefficient B don't match (%d,%d)",p.numQuad,elements->numElements);          Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);
152    }    }
153    
154    if (! numSamplesEqual(C,p.numQuad,elements->numElements) ) {    if (! numSamplesEqual(C,p.numQuad,elements->numElements) ) {
155          Finley_ErrorCode=TYPE_ERROR;          sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: sample points of coefficient C don't match (%d,%d)",p.numQuad,elements->numElements);
156          sprintf(Finley_ErrorMsg,"sample points of coefficient C don't match (%d,%d)",p.numQuad,elements->numElements);          Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);
157    }    }
158    
159    if (! numSamplesEqual(D,p.numQuad,elements->numElements) ) {    if (! numSamplesEqual(D,p.numQuad,elements->numElements) ) {
160          Finley_ErrorCode=TYPE_ERROR;          sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: sample points of coefficient D don't match (%d,%d)",p.numQuad,elements->numElements);
161          sprintf(Finley_ErrorMsg,"sample points of coefficient D don't match (%d,%d)",p.numQuad,elements->numElements);          Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);
162    }    }
163    
164    if (! numSamplesEqual(X,p.numQuad,elements->numElements) ) {    if (! numSamplesEqual(X,p.numQuad,elements->numElements) ) {
165          Finley_ErrorCode=TYPE_ERROR;          sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: sample points of coefficient X don't match (%d,%d)",p.numQuad,elements->numElements);
166          sprintf(Finley_ErrorMsg,"sample points of coefficient X don't match (%d,%d)",p.numQuad,elements->numElements);          Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);
167    }    }
168    
169    if (! numSamplesEqual(Y,p.numQuad,elements->numElements) ) {    if (! numSamplesEqual(Y,p.numQuad,elements->numElements) ) {
170          Finley_ErrorCode=TYPE_ERROR;          sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: sample points of coefficient Y don't match (%d,%d)",p.numQuad,elements->numElements);
171          sprintf(Finley_ErrorMsg,"sample points of coefficient Y don't match (%d,%d)",p.numQuad,elements->numElements);          Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);
172    }    }
173    
174    /*  check the dimensions: */    /*  check the dimensions: */
175      
176    if (p.numEqu==1 && p.numComp==1) {    if (p.numEqu==1 && p.numComp==1) {
177      if (!isEmpty(A)) {      if (!isEmpty(A)) {
178        dimensions[0]=p.numDim;        dimensions[0]=p.numDim;
179        dimensions[1]=p.numDim;        dimensions[1]=p.numDim;
180        if (!isDataPointShapeEqual(A,2,dimensions)) {        if (!isDataPointShapeEqual(A,2,dimensions)) {
181            Finley_ErrorCode=TYPE_ERROR;            sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: coefficient A: illegal shape, expected shape (%d,%d)",dimensions[0],dimensions[1]);
182            sprintf(Finley_ErrorMsg,"coefficient A: illegal shape, expected shape (%d,%d)",dimensions[0],dimensions[1]);            Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);
183        }        }
184      }      }
185      if (!isEmpty(B)) {      if (!isEmpty(B)) {
186         dimensions[0]=p.numDim;         dimensions[0]=p.numDim;
187         if (!isDataPointShapeEqual(B,1,dimensions)) {         if (!isDataPointShapeEqual(B,1,dimensions)) {
188            Finley_ErrorCode=TYPE_ERROR;            sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: coefficient B: illegal shape (%d,)",dimensions[0]);
189            sprintf(Finley_ErrorMsg,"coefficient B: illegal shape (%d,)",dimensions[0]);            Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);
190         }         }
191      }      }
192      if (!isEmpty(C)) {      if (!isEmpty(C)) {
193         dimensions[0]=p.numDim;         dimensions[0]=p.numDim;
194         if (!isDataPointShapeEqual(C,1,dimensions)) {         if (!isDataPointShapeEqual(C,1,dimensions)) {
195            Finley_ErrorCode=TYPE_ERROR;            sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: coefficient C, expected shape (%d,)",dimensions[0]);
196            sprintf(Finley_ErrorMsg,"coefficient C, expected shape (%d,)",dimensions[0]);            Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);
197         }         }
198      }      }
199      if (!isEmpty(D)) {      if (!isEmpty(D)) {
200         if (!isDataPointShapeEqual(D,0,dimensions)) {         if (!isDataPointShapeEqual(D,0,dimensions)) {
201            Finley_ErrorCode=TYPE_ERROR;            Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: coefficient D, rank 0 expected.");
           sprintf(Finley_ErrorMsg,"coefficient D, rank 0 expected.");  
202         }         }
203      }      }
204      if (!isEmpty(X)) {      if (!isEmpty(X)) {
205         dimensions[0]=p.numDim;         dimensions[0]=p.numDim;
206         if (!isDataPointShapeEqual(X,1,dimensions)) {         if (!isDataPointShapeEqual(X,1,dimensions)) {
207            Finley_ErrorCode=TYPE_ERROR;            sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: coefficient X, expected shape (%d,",dimensions[0]);
208            sprintf(Finley_ErrorMsg,"coefficient X, expected shape (%d,",dimensions[0]);            Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);
209         }         }
210      }      }
211      if (!isEmpty(Y)) {      if (!isEmpty(Y)) {
212         if (!isDataPointShapeEqual(Y,0,dimensions)) {         if (!isDataPointShapeEqual(Y,0,dimensions)) {
213            Finley_ErrorCode=TYPE_ERROR;            Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: coefficient Y, rank 0 expected.");
           sprintf(Finley_ErrorMsg,"coefficient Y, rank 0 expected.");  
214         }         }
215      }      }
216    } else {    } else {
217      if (!isEmpty(A)) {      if (!isEmpty(A)) {
218        dimensions[0]=p.numEqu;        dimensions[0]=p.numEqu;
# Line 194  void Finley_Assemble_PDE(Finley_NodeFile Line 220  void Finley_Assemble_PDE(Finley_NodeFile
220        dimensions[2]=p.numComp;        dimensions[2]=p.numComp;
221        dimensions[3]=p.numDim;        dimensions[3]=p.numDim;
222        if (!isDataPointShapeEqual(A,4,dimensions)) {        if (!isDataPointShapeEqual(A,4,dimensions)) {
223            Finley_ErrorCode=TYPE_ERROR;            sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: coefficient A, expected shape (%d,%d,%d,%d)",dimensions[0],dimensions[1],dimensions[2],dimensions[3]);
224            sprintf(Finley_ErrorMsg,"coefficient A, expected shape (%d,%d,%d,%d)",dimensions[0],dimensions[1],dimensions[2],dimensions[3]);            Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);
225        }        }
226      }      }
227      if (!isEmpty(B)) {      if (!isEmpty(B)) {
# Line 203  void Finley_Assemble_PDE(Finley_NodeFile Line 229  void Finley_Assemble_PDE(Finley_NodeFile
229        dimensions[1]=p.numDim;        dimensions[1]=p.numDim;
230        dimensions[2]=p.numComp;        dimensions[2]=p.numComp;
231        if (!isDataPointShapeEqual(B,3,dimensions)) {        if (!isDataPointShapeEqual(B,3,dimensions)) {
232            Finley_ErrorCode=TYPE_ERROR;            sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: coefficient B, expected shape (%d,%d,%d)",dimensions[0],dimensions[1],dimensions[2]);
233            sprintf(Finley_ErrorMsg,"coefficient B, expected shape (%d,%d,%d)",dimensions[0],dimensions[1],dimensions[2]);            Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);
234        }        }
235      }      }
236      if (!isEmpty(C)) {      if (!isEmpty(C)) {
# Line 212  void Finley_Assemble_PDE(Finley_NodeFile Line 238  void Finley_Assemble_PDE(Finley_NodeFile
238        dimensions[1]=p.numComp;        dimensions[1]=p.numComp;
239        dimensions[2]=p.numDim;        dimensions[2]=p.numDim;
240        if (!isDataPointShapeEqual(C,3,dimensions)) {        if (!isDataPointShapeEqual(C,3,dimensions)) {
241             Finley_ErrorCode=TYPE_ERROR;            sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: coefficient C, expected shape (%d,%d,%d)",dimensions[0],dimensions[1],dimensions[2]);
242            sprintf(Finley_ErrorMsg,"coefficient C, expected shape (%d,%d,%d)",dimensions[0],dimensions[1],dimensions[2]);            Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);
243        }        }
244      }      }
245      if (!isEmpty(D)) {      if (!isEmpty(D)) {
246        dimensions[0]=p.numEqu;        dimensions[0]=p.numEqu;
247        dimensions[1]=p.numComp;        dimensions[1]=p.numComp;
248        if (!isDataPointShapeEqual(D,2,dimensions)) {        if (!isDataPointShapeEqual(D,2,dimensions)) {
249            Finley_ErrorCode=TYPE_ERROR;            sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: coefficient D, expected shape (%d,%d)",dimensions[0],dimensions[1]);
250            sprintf(Finley_ErrorMsg,"coefficient D, expected shape (%d,%d)",dimensions[0],dimensions[1]);            Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);
251        }        }
252      }      }
253      if (!isEmpty(X)) {      if (!isEmpty(X)) {
254        dimensions[0]=p.numEqu;        dimensions[0]=p.numEqu;
255        dimensions[1]=p.numDim;        dimensions[1]=p.numDim;
256        if (!isDataPointShapeEqual(X,2,dimensions)) {        if (!isDataPointShapeEqual(X,2,dimensions)) {
257             Finley_ErrorCode=TYPE_ERROR;            sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: coefficient X, expected shape (%d,%d)",dimensions[0],dimensions[1]);
258            sprintf(Finley_ErrorMsg,"coefficient X, expected shape (%d,%d)",dimensions[0],dimensions[1]);            Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);
259        }        }
260      }      }
261      if (!isEmpty(Y)) {      if (!isEmpty(Y)) {
262        dimensions[0]=p.numEqu;        dimensions[0]=p.numEqu;
263        if (!isDataPointShapeEqual(Y,1,dimensions)) {        if (!isDataPointShapeEqual(Y,1,dimensions)) {
264             Finley_ErrorCode=TYPE_ERROR;            sprintf(error_msg,"Finley_Assemble_PDE: coefficient Y, expected shape (%d,)",dimensions[0]);
265            sprintf(Finley_ErrorMsg,"coefficient Y, expected shape (%d,)",dimensions[0]);            Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);
266        }        }
267      }      }
268    }    }
269      if (Finley_noError()) {
   if (Finley_ErrorCode==NO_ERROR) {  
270       time0=Finley_timer();       time0=Finley_timer();
271       #pragma omp parallel private(index_col,index_row,EM_S,EM_F,V,dVdv,dSdV,Vol,dvdV,color,q) \       if (p.numEqu == p. numComp) {
272              firstprivate(elements,nodes,S,F,A,B,C,D,X,Y)          if (p.numEqu > 1) {
273       {            /* system of PDESs */
274           EM_S=EM_F=V=dVdv=dSdV=Vol=dvdV=NULL;            if (p.numDim==3) {
275           index_row=index_col=NULL;              if (p.row_NS == p.col_NS && p.row_NS == p.row_NN && p.col_NS == p.col_NN ) {
276                   Finley_Assemble_PDE_System2_3D(p,elements,S,F,A,B,C,D,X,Y);
277           /* allocate work arrays: */              } else if ( p.row_NS == p.col_NS &&  2*p.row_NS == p.row_NN && 2*p.col_NS == p.col_NN ) {
278                   if ( !isEmpty(A) || !isEmpty(B) || !isEmpty(C) || !isEmpty(X) ) {
279           EM_S=(double*) THREAD_MEMALLOC(p.NN_row*p.NN_col*p.numEqu*p.numComp,double);                    Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: Contact elements require A, B, C and X to be empty.");
280           EM_F=(double*) THREAD_MEMALLOC(p.NN_row*p.numEqu,double);                 } else {
281           V=(double*) THREAD_MEMALLOC(p.NN*p.numDim,double);                    Finley_Assemble_PDE_System2_C(p,elements,S,F,D,Y);
282           dVdv=(double*) THREAD_MEMALLOC(p.numDim*p.numDim*p.numQuad,double);                 }
283           dvdV=(double*) THREAD_MEMALLOC(p.numDim*p.numDim*p.numQuad,double);              } else {
284           dSdV=(double*) THREAD_MEMALLOC(p.NS_row*p.numQuad*p.numDim,double);                 Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE supports numShape=NumNodes or 2*numShape=NumNodes only.");
285           Vol=(double*) THREAD_MEMALLOC(p.numQuad,double);              }
286           index_col=(index_t*) THREAD_MEMALLOC(p.NN_col,index_t);            } else if (p.numDim==2) {
287           index_row=(index_t*) THREAD_MEMALLOC(p.NN_row,index_t);              if ((p.row_NS == p.col_NS) && (p.row_NS == p.row_NN) && (p.col_NS == p.col_NN )) {
288                   Finley_Assemble_PDE_System2_2D(p,elements,S,F,A,B,C,D,X,Y);
289           if (! (Finley_checkPtr(EM_S) || Finley_checkPtr(EM_F) || Finley_checkPtr(V) || Finley_checkPtr(index_col) ||              } else if ( p.row_NS == p.col_NS &&  2*p.row_NS == p.row_NN && 2*p.col_NS == p.col_NN ) {
290                  Finley_checkPtr(index_row) || Finley_checkPtr(dVdv) || Finley_checkPtr(dSdV) || Finley_checkPtr(Vol) ))  {                 if ( !isEmpty(A) || !isEmpty(B) || !isEmpty(C) || !isEmpty(X) ) {
291                      Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: Contact elements require A, B, C and X to be empty.");
292             /*  open loop over all colors: */                 } else {
293             for (color=elements->minColor;color<=elements->maxColor;color++) {                    Finley_Assemble_PDE_System2_C(p,elements,S,F,D,Y);
294                /*  open loop over all elements: */                 }
295                #pragma omp for private(e) schedule(static)              } else {
296                for(e=0;e<elements->numElements;e++){                 Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE supports numShape=NumNodes or 2*numShape=NumNodes only.");
297                  if (elements->Color[e]==color) {              }
298                    for (q=0;q<p.NN_row;q++) index_row[q]=p.label_row[elements->Nodes[INDEX2(p.row_node[q],e,p.NN)]];            } else if (p.numDim==2) {
299                    /* gather V-coordinates of nodes into V: */              if (p.row_NS == p.col_NS && p.row_NS == p.row_NN && p.col_NS == p.col_NN ) {
300            Finley_Util_Gather_double(p.NN,&(elements->Nodes[INDEX2(0,e,p.NN)]),p.numDim,nodes->Coordinates,V);                 Finley_Assemble_PDE_System2_1D(p,elements,S,F,A,B,C,D,X,Y);
301                    /*  calculate dVdv(i,j,q)=V(i,k)*DSDv(k,j,q) */              } else if ( p.row_NS == p.col_NS &&  2*p.row_NS == p.row_NN && 2*p.col_NS == p.col_NN ) {
302            Finley_Util_SmallMatMult(p.numDim,p.numDim*p.numQuad,dVdv,p.NS,V,p.referenceElement->dSdv);                 if ( !isEmpty(A) || !isEmpty(B) || !isEmpty(C) || !isEmpty(X) ) {
303                    /*  dvdV=invert(dVdv) inplace */                    Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: Contact elements require A, B, C and X to be empty.");
304            Finley_Util_InvertSmallMat(p.numQuad,p.numDim,dVdv,dvdV,Vol);                 } else {
305                    /*  calculate dSdV=DSDv*DvDV */                    Finley_Assemble_PDE_System2_C(p,elements,S,F,D,Y);
306            Finley_Util_SmallMatSetMult(p.numQuad,p.NS_row,p.numDim,dSdV,p.numDim,p.referenceElement_row->dSdv,dvdV);                 }
307                    /*  scale volume: */              } else {
308            for (q=0;q<p.numQuad;q++) Vol[q]=ABS(Vol[q]*p.referenceElement->QuadWeights[q]);                 Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE supports numShape=NumNodes or 2*numShape=NumNodes only.");
309                    }
310                     /*   integration for the stiffness matrix: */            } else {
311                     /*   in order to optimze the number of operations the case of constants coefficience needs a bit more work */              Finley_setError(VALUE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE supports spatial dimensions 1,2,3 only.");
312                     /*   to make use of some symmetry. */            }
313            } else {
314                       if (S!=NULL) {            /* single PDES */
315                         for (q=0;q<p.NN_row*p.NN_col*p.numEqu*p.numComp;q++) EM_S[q]=0;            if (p.numDim==3) {
316                         if (p.numEqu==1 && p.numComp==1) {              if (p.row_NS == p.col_NS && p.row_NS == p.row_NN && p.col_NS == p.col_NN ) {
317                         Finley_Assemble_PDEMatrix_Single2(p.NS_row,p.numDim,p.numQuad,                 Finley_Assemble_PDE_Single2_3D(p,elements,S,F,A,B,C,D,X,Y);
318                                                                       p.referenceElement_row->S,dSdV,Vol,p.NN_row,EM_S,              } else if ( p.row_NS == p.col_NS &&  2*p.row_NS == p.row_NN && 2*p.col_NS == p.col_NN ) {
319                                                                       getSampleData(A,e),isExpanded(A),                 if ( !isEmpty(A) || !isEmpty(B) || !isEmpty(C) || !isEmpty(X) ) {
320                                                                       getSampleData(B,e),isExpanded(B),                    Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: Contact elements require A, B, C and X to be empty.");
321                                                                       getSampleData(C,e),isExpanded(C),                 } else {
322                                                                       getSampleData(D,e),isExpanded(D));                    Finley_Assemble_PDE_Single2_C(p,elements,S,F,D,Y);
323                         } else {                 }
324                         Finley_Assemble_PDEMatrix_System2(p.NS_row,p.numDim,p.numQuad,p.numEqu,p.numComp,              } else {
325                                                                       p.referenceElement_row->S,dSdV,Vol,p.NN_row,EM_S,                 Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE supports numShape=NumNodes or 2*numShape=NumNodes only.");
                                                                      getSampleData(A,e),isExpanded(A),  
                                                                      getSampleData(B,e),isExpanded(B),  
                                                                      getSampleData(C,e),isExpanded(C),  
                                                                      getSampleData(D,e),isExpanded(D));  
                        }  
                        for (q=0;q<p.NN_col;q++) index_col[q]=p.label_col[elements->Nodes[INDEX2(p.col_node[q],e,p.NN)]];  
                        Finley_SystemMatrix_add(S,p.NN_row,index_row,p.numEqu,p.NN_col,index_col,p.numComp,EM_S);  
                      }  
                      if (!isEmpty(F)) {  
                        for (q=0;q<p.NN_row*p.numEqu;q++) EM_F[q]=0;  
                        if (p.numEqu==1) {  
                        Finley_Assemble_RHSMatrix_Single(p.NS_row,p.numDim,p.numQuad,  
                                                                  p.referenceElement_row->S,dSdV,Vol,p.NN_row,EM_F,  
                                                                  getSampleData(X,e),isExpanded(X),  
                                                                  getSampleData(Y,e),isExpanded(Y));  
                        } else {  
                        Finley_Assemble_RHSMatrix_System(p.NS_row,p.numDim,p.numQuad,  
                                                                  p.numEqu,p.referenceElement_row->S,dSdV,Vol,p.NN_row,EM_F,  
                                                                  getSampleData(X,e),isExpanded(X),  
                                                                  getSampleData(Y,e),isExpanded(Y));  
                        }  
                        /* add  */  
                        Finley_Util_AddScatter(p.NN_row,index_row,p.numEqu,EM_F,getSampleData(F,0));  
                     }  
                 }  
               }  
326              }              }
327           }            } else if (p.numDim==2) {
328           /* clean up */              if ((p.row_NS == p.col_NS) && (p.row_NS == p.row_NN) && (p.col_NS == p.col_NN )) {
329           THREAD_MEMFREE(EM_S);                 Finley_Assemble_PDE_Single2_2D(p,elements,S,F,A,B,C,D,X,Y);
330           THREAD_MEMFREE(EM_F);              } else if ( p.row_NS == p.col_NS &&  2*p.row_NS == p.row_NN && 2*p.col_NS == p.col_NN ) {
331           THREAD_MEMFREE(V);                 if ( !isEmpty(A) || !isEmpty(B) || !isEmpty(C) || !isEmpty(X) ) {
332           THREAD_MEMFREE(dVdv);                    Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: Contact elements require A, B, C and X to be empty.");
333           THREAD_MEMFREE(dvdV);                 } else {
334           THREAD_MEMFREE(dSdV);                    Finley_Assemble_PDE_Single2_C(p,elements,S,F,D,Y);
335           THREAD_MEMFREE(Vol);                 }
336           THREAD_MEMFREE(index_col);              } else {
337           THREAD_MEMFREE(index_row);                 Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE supports numShape=NumNodes or 2*numShape=NumNodes only.");
338                }
339              } else if (p.numDim==1) {
340                if (p.row_NS == p.col_NS && p.row_NS == p.row_NN && p.col_NS == p.col_NN ) {
341                   Finley_Assemble_PDE_Single2_1D(p,elements,S,F,A,B,C,D,X,Y);
342                } else if ( p.row_NS == p.col_NS &&  2*p.row_NS == p.row_NN && 2*p.col_NS == p.col_NN ) {
343                   if ( !isEmpty(A) || !isEmpty(B) || !isEmpty(C) || !isEmpty(X) ) {
344                      Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE: Contact elements require A, B, C and X to be empty.");
345                   } else {
346                      Finley_Assemble_PDE_Single2_C(p,elements,S,F,D,Y);
347                   }
348                } else {
349                   Finley_setError(TYPE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE supports numShape=NumNodes or 2*numShape=NumNodes only.");
350                }
351              } else {
352                Finley_setError(VALUE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE supports spatial dimensions 1,2,3 only.");
353              }
354            }
355         } else {
356              Finley_setError(VALUE_ERROR,"Finley_Assemble_PDE requires number of equations == number of solutions  .");
357       }       }
358         #ifdef Finley_TRACE
359       printf("timing: assemblage PDE: %.4e sec\n",Finley_timer()-time0);       printf("timing: assemblage PDE: %.4e sec\n",Finley_timer()-time0);
360         #endif
361    }    }
362      blocktimer_increment("Finley_Assemble_PDE()", blocktimer_start);
363  }  }
364  /*  /*
365   * $Log$   * $Log$
366     * Revision 1.8  2005/09/15 03:44:21  jgs
367     * Merge of development branch dev-02 back to main trunk on 2005-09-15
368     *
369     * Revision 1.7  2005/09/01 03:31:35  jgs
370     * Merge of development branch dev-02 back to main trunk on 2005-09-01
371     *
372     * Revision 1.6  2005/08/12 01:45:42  jgs
373     * erge of development branch dev-02 back to main trunk on 2005-08-12
374     *
375     * Revision 1.5.2.3  2005/09/07 06:26:17  gross
376     * the solver from finley are put into the standalone package paso now
377     *
378     * Revision 1.5.2.2  2005/08/24 02:02:18  gross
379     * timing output switched off. solver output can be swiched through getSolution(verbose=True) now.
380     *
381     * Revision 1.5.2.1  2005/08/03 08:54:27  gross
382     * contact element assemblage was called with wrong element table pointer
383     *
384   * Revision 1.5  2005/07/08 04:07:46  jgs   * Revision 1.5  2005/07/08 04:07:46  jgs
385   * Merge of development branch back to main trunk on 2005-07-08   * Merge of development branch back to main trunk on 2005-07-08
386   *   *

Legend:
Removed from v.123  
changed lines
  Added in v.2156

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.26