/[escript]/trunk/finley/src/Assemble_PDE_Single2_3D.c
ViewVC logotype

Diff of /trunk/finley/src/Assemble_PDE_Single2_3D.c

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

revision 798 by gross, Fri Aug 4 01:05:36 2006 UTC revision 2548 by jfenwick, Mon Jul 20 06:20:06 2009 UTC
# Line 1  Line 1 
1  /*  
2   ***********************************************************  /*******************************************************
3   *          Copyright 2006 by ACcESS MNRF                   *  *
4   *                                                          *  * Copyright (c) 2003-2009 by University of Queensland
5   *              http://www.access.edu.au                    *  * Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)
6   *       Primary Business: Queensland, Australia            *  * http://www.uq.edu.au/esscc
7   *  Licensed under the Open Software License version 3.0    *  *
8   *     http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php       *  * Primary Business: Queensland, Australia
9   *                                                          *  * Licensed under the Open Software License version 3.0
10   ************************************************************  * http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php
11  */  *
12    *******************************************************/
13    
14    
15  /**************************************************************/  /**************************************************************/
16    
# Line 33  Line 35 
35    
36  /**************************************************************/  /**************************************************************/
37    
 /*  Author: gross@access.edu.au */  
 /*  Version: $Id:$ */  
   
 /**************************************************************/  
   
38    
39  #include "Assemble.h"  #include "Assemble.h"
40  #include "Util.h"  #include "Util.h"
41    #ifdef _OPENMP
42    #include <omp.h>
43    #endif
44    
45    
46  /**************************************************************/  /**************************************************************/
47    
# Line 51  void  Finley_Assemble_PDE_Single2_3D(Ass Line 52  void  Finley_Assemble_PDE_Single2_3D(Ass
52      #define DIM 3      #define DIM 3
53      index_t color;      index_t color;
54      dim_t e;      dim_t e;
55        __const double *A_p, *B_p, *C_p, *D_p, *X_p, *Y_p;
56        double *EM_S, *EM_F, *Vol, *DSDX;
57        index_t *row_index;
58        register dim_t q, s,r;
59        register double rtmp, rtmp00, rtmp01, rtmp02, rtmp10, rtmp11, rtmp12, rtmp20, rtmp21, rtmp22, rtmp0, rtmp1, rtmp2;
60        bool_t add_EM_F, add_EM_S;
61    
62      bool_t extendedA=isExpanded(A);      bool_t extendedA=isExpanded(A);
63      bool_t extendedB=isExpanded(B);      bool_t extendedB=isExpanded(B);
64      bool_t extendedC=isExpanded(C);      bool_t extendedC=isExpanded(C);
65      bool_t extendedD=isExpanded(D);      bool_t extendedD=isExpanded(D);
66      bool_t extendedX=isExpanded(X);      bool_t extendedX=isExpanded(X);
67      bool_t extendedY=isExpanded(Y);      bool_t extendedY=isExpanded(Y);
68      double *F_p=getSampleData(F,0);      double *F_p=(requireWrite(F), getSampleDataRW(F,0));    /* use comma, to get around the mixed code and declarations thing */
69      double *S=p.row_jac->ReferenceElement->S;      double *S=p.row_jac->ReferenceElement->S;
70      dim_t len_EM_S=p.row_NN*p.col_NN;      dim_t len_EM_S=p.row_NN*p.col_NN;
71      dim_t len_EM_F=p.row_NN;      dim_t len_EM_F=p.row_NN;
72    
73        void* ABuff=allocSampleBuffer(A);
74      #pragma omp parallel private(color)      void* BBuff=allocSampleBuffer(B);
75        void* CBuff=allocSampleBuffer(C);
76        void* DBuff=allocSampleBuffer(D);
77        void* XBuff=allocSampleBuffer(X);
78        void* YBuff=allocSampleBuffer(Y);
79        #pragma omp parallel private(color,EM_S, EM_F, Vol, DSDX, A_p, B_p, C_p, D_p, X_p, Y_p,row_index,q, s,r,rtmp, rtmp00, rtmp01, rtmp02, rtmp10, rtmp11, rtmp12, rtmp20, rtmp21, rtmp22, rtmp0, rtmp1, rtmp2,add_EM_F, add_EM_S)
80      {      {
81         double EM_S[len_EM_S], EM_F[len_EM_F];         EM_S=THREAD_MEMALLOC(len_EM_S,double);
82         index_t row_index[p.row_NN];         EM_F=THREAD_MEMALLOC(len_EM_F,double);
83         register dim_t q, s,r;         row_index=THREAD_MEMALLOC(p.row_NN,index_t);
84         register double rtmp, rtmp00, rtmp01, rtmp02, rtmp10, rtmp11, rtmp12, rtmp20, rtmp21, rtmp22, rtmp0, rtmp1, rtmp2;                                                                                                                                                                                                      
85         double *Vol, *DSDX, *A_p, *B_p, *C_p, *D_p, *X_p, *Y_p;         if (!Finley_checkPtr(EM_S) && !Finley_checkPtr(EM_F) && !Finley_checkPtr(row_index) ) {
86         bool_t add_EM_F, add_EM_S;  
87              for (color=elements->minColor;color<=elements->maxColor;color++) {
88         #ifndef PASO_MPI               /*  open loop over all elements: */
89         for (color=elements->minColor;color<=elements->maxColor;color++) {               #pragma omp for private(e) schedule(static)
90            /*  open loop over all elements: */               for(e=0;e<elements->numElements;e++){
91            #pragma omp for private(e) schedule(static)                  if (elements->Color[e]==color) {
92            for(e=0;e<elements->numElements;e++){                     Vol=&(p.row_jac->volume[INDEX2(0,e,p.numQuad)]);
93               if (elements->Color[e]==color) {                     DSDX=&(p.row_jac->DSDX[INDEX4(0,0,0,e,p.row_NN,DIM,p.numQuad)]);
94         #else                     for (q=0;q<len_EM_S;++q) EM_S[q]=0;
95         {                     for (q=0;q<len_EM_F;++q) EM_F[q]=0;
96            for(e=0;e<elements->numElements;e++) {                     add_EM_F=FALSE;
97               {                     add_EM_S=FALSE;
98         #endif                     /**************************************************************/
99                  Vol=&(p.row_jac->volume[INDEX2(0,e,p.numQuad)]);                     /*   process A: */
100                  DSDX=&(p.row_jac->DSDX[INDEX4(0,0,0,e,p.row_NN,DIM,p.numQuad)]);                     /**************************************************************/
101                  for (q=0;q<len_EM_S;++q) EM_S[q]=0;                     A_p=getSampleDataRO(A,e,ABuff);
102                  for (q=0;q<len_EM_F;++q) EM_F[q]=0;                     if (NULL!=A_p) {
103                  add_EM_F=FALSE;                        add_EM_S=TRUE;
104                  add_EM_S=FALSE;                        if (extendedA) {
105                  /**************************************************************/                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {
106                  /*   process A: */                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {
107                  /**************************************************************/                               rtmp=0;
108                  A_p=getSampleData(A,e);                               for (q=0;q<p.numQuad;q++) {
109                  if (NULL!=A_p) {                                     rtmp+=Vol[q]*( DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX3(0,0,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)]
110                     add_EM_S=TRUE;                                                  + DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX3(0,1,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)]
111                     if (extendedA) {                                                  + DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX3(0,2,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)]
112                        for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                                                  + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX3(1,0,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)]
113                          for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                                                  + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX3(1,1,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)]
114                            rtmp=0;                                                  + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX3(1,2,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)]
115                            for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                                                  + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX3(2,0,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)]
116                                  rtmp+=Vol[q]*( DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX3(0,0,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)]                                                  + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX3(2,1,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)]
117                                               + DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX3(0,1,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)]                                                  + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX3(2,2,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)]);
118                                               + DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX3(0,2,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)]                               }
119                                               + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX3(1,0,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)]                               EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;
120                                               + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX3(1,1,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)]                             }
121                                               + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX3(1,2,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)]                           }
122                                               + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX3(2,0,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)]                        } else {
123                                               + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX3(2,1,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)]                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {
124                                               + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)]*A_p[INDEX3(2,2,q,DIM,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)]);                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {
125                            }                                      rtmp00=0;
126                            EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;                                      rtmp01=0;
127                          }                                      rtmp02=0;
128                        }                                      rtmp10=0;
129                     } else {                                      rtmp11=0;
130                        for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                                      rtmp12=0;
131                          for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                                      rtmp20=0;
132                                   rtmp00=0;                                      rtmp21=0;
133                                   rtmp01=0;                                      rtmp22=0;
134                                   rtmp02=0;                                      for (q=0;q<p.numQuad;q++) {
135                                   rtmp10=0;    
136                                   rtmp11=0;                                          rtmp0=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)];
137                                   rtmp12=0;                                          rtmp00+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];
138                                   rtmp20=0;                                          rtmp01+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)];
139                                   rtmp21=0;                                          rtmp02+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)];
140                                   rtmp22=0;    
141                                   for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                                          rtmp1=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)];
142                                            rtmp10+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];
143                                       rtmp0=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)];                                          rtmp11+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)];
144                                       rtmp00+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];                                          rtmp12+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)];
145                                       rtmp01+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)];    
146                                       rtmp02+=rtmp0*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)];                                          rtmp2=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)];
147                                            rtmp20+=rtmp2*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];
148                                       rtmp1=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)];                                          rtmp21+=rtmp2*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)];
149                                       rtmp10+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];                                          rtmp22+=rtmp2*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)];
150                                       rtmp11+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)];                                      }
151                                       rtmp12+=rtmp1*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)];                                      EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp00*A_p[INDEX2(0,0,DIM)]
152                                                                                          +rtmp01*A_p[INDEX2(0,1,DIM)]
153                                       rtmp2=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)];                                                                                        +rtmp02*A_p[INDEX2(0,2,DIM)]
154                                       rtmp20+=rtmp2*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];                                                                                        +rtmp10*A_p[INDEX2(1,0,DIM)]
155                                       rtmp21+=rtmp2*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)];                                                                                        +rtmp11*A_p[INDEX2(1,1,DIM)]
156                                       rtmp22+=rtmp2*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)];                                                                                        +rtmp12*A_p[INDEX2(1,2,DIM)]
157                                   }                                                                                        +rtmp20*A_p[INDEX2(2,0,DIM)]
158                                   EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp00*A_p[INDEX2(0,0,DIM)]                                                                                        +rtmp21*A_p[INDEX2(2,1,DIM)]
159                                                                                     +rtmp01*A_p[INDEX2(0,1,DIM)]                                                                                        +rtmp22*A_p[INDEX2(2,2,DIM)];
160                                                                                     +rtmp02*A_p[INDEX2(0,2,DIM)]                             }
161                                                                                     +rtmp10*A_p[INDEX2(1,0,DIM)]                           }
162                                                                                     +rtmp11*A_p[INDEX2(1,1,DIM)]                         }
163                                                                                     +rtmp12*A_p[INDEX2(1,2,DIM)]                     }
164                                                                                     +rtmp20*A_p[INDEX2(2,0,DIM)]                     /**************************************************************/
165                                                                                     +rtmp21*A_p[INDEX2(2,1,DIM)]                     /*   process B: */
166                                                                                     +rtmp22*A_p[INDEX2(2,2,DIM)];                     /**************************************************************/
167                          }                     B_p=getSampleDataRO(B,e,BBuff);
168                        }                     if (NULL!=B_p) {
169                      }                        add_EM_S=TRUE;
170                  }                        if (extendedB) {
171                  /**************************************************************/                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {
172                  /*   process B: */                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {
173                  /**************************************************************/                               rtmp=0;
174                  B_p=getSampleData(B,e);                               for (q=0;q<p.numQuad;q++) {
175                  if (NULL!=B_p) {                                   rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)]*
176                     add_EM_S=TRUE;                                                ( DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*B_p[INDEX2(0,q,DIM)]
177                     if (extendedB) {                                                + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*B_p[INDEX2(1,q,DIM)]
178                        for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                                                + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)]*B_p[INDEX2(2,q,DIM)]);
179                          for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                               }
180                            rtmp=0;                               EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;
181                            for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                             }
182                                rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)]*                           }
183                                             ( DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*B_p[INDEX2(0,q,DIM)]                        } else {
184                                             + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*B_p[INDEX2(1,q,DIM)]                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {
185                                             + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)]*B_p[INDEX2(2,q,DIM)]);                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {
186                            }                                 rtmp0=0;
187                            EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;                                 rtmp1=0;
188                          }                                 rtmp2=0;
189                        }                                 for (q=0;q<p.numQuad;q++) {
190                     } else {                                     rtmp=Vol[q]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)];
191                        for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                                     rtmp0+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)];
192                          for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                                     rtmp1+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)];
193                              rtmp0=0;                                     rtmp2+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)];
194                              rtmp1=0;                                 }
195                              rtmp2=0;                                 EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp0*B_p[0]+rtmp1*B_p[1]+rtmp2*B_p[2];
196                              for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                             }
197                                  rtmp=Vol[q]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)];                           }
                                 rtmp0+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)];  
                                 rtmp1+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)];  
                                 rtmp2+=rtmp*DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)];  
                             }  
                             EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp0*B_p[0]+rtmp1*B_p[1]+rtmp2*B_p[2];  
                         }  
198                        }                        }
199                     }                     }
200                  }                     /**************************************************************/
201                  /**************************************************************/                     /*   process C: */
202                  /*   process C: */                     /**************************************************************/
203                  /**************************************************************/                     C_p=getSampleDataRO(C,e,CBuff);
204                  C_p=getSampleData(C,e);                     if (NULL!=C_p) {
205                  if (NULL!=C_p) {                       add_EM_S=TRUE;
206                    add_EM_S=TRUE;                       if (extendedC) {
207                    if (extendedC) {                           for (s=0;s<p.row_NS;s++) {
208                        for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                             for (r=0;r<p.col_NS;r++) {
209                          for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                               rtmp=0;
210                            rtmp=0;                               for (q=0;q<p.numQuad;q++) {
211                            for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                                  rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*
212                               rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*                                        ( C_p[INDEX2(0,q,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)]
213                                     ( C_p[INDEX2(0,q,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)]                                        + C_p[INDEX2(1,q,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)]
214                                     + C_p[INDEX2(1,q,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)]                                        + C_p[INDEX2(2,q,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)]);
215                                     + C_p[INDEX2(2,q,DIM)]*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)]);                               }
216                            }                               EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;
217                            EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;                             }
218                             }
219                         } else {
220                             for (s=0;s<p.row_NS;s++) {
221                               for (r=0;r<p.col_NS;r++) {
222                                   rtmp0=0;
223                                   rtmp1=0;
224                                   rtmp2=0;
225                                   for (q=0;q<p.numQuad;q++) {
226                                       rtmp=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)];
227                                       rtmp0+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];
228                                       rtmp1+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)];
229                                       rtmp2+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)];
230                                   }
231                                   EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp0*C_p[0]+rtmp1*C_p[1]+rtmp2*C_p[2];
232                               }
233                             }
234                         }
235                       }
236                       /************************************************************* */
237                       /* process D */
238                       /**************************************************************/
239                       D_p=getSampleDataRO(D,e,DBuff);
240                       if (NULL!=D_p) {
241                         add_EM_S=TRUE;
242                         if (extendedD) {
243                             for (s=0;s<p.row_NS;s++) {
244                               for (r=0;r<p.col_NS;r++) {
245                                 rtmp=0;
246                                 for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*D_p[q]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)];
247                                 EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;
248                               }
249                             }
250                         } else {
251                             for (s=0;s<p.row_NS;s++) {
252                               for (r=0;r<p.col_NS;r++) {
253                                   rtmp=0;
254                                   for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)];
255                                   EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp*D_p[0];
256                               }
257                             }
258                         }
259                       }
260                       /**************************************************************/
261                       /*   process X: */
262                       /**************************************************************/
263                       X_p=getSampleDataRO(X,e,XBuff);
264                       if (NULL!=X_p) {
265                         add_EM_F=TRUE;
266                         if (extendedX) {
267                            for (s=0;s<p.row_NS;s++) {
268                               rtmp=0;
269                               for (q=0;q<p.numQuad;q++) {
270                                    rtmp+=Vol[q]*( DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*X_p[INDEX2(0,q,DIM)]
271                                                 + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*X_p[INDEX2(1,q,DIM)]
272                                                 + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)]*X_p[INDEX2(2,q,DIM)]);
273                               }
274                               EM_F[INDEX2(0,s,p.numEqu)]+=rtmp;
275                          }                          }
276                        }                        } else {
277                    } else {                          for (s=0;s<p.row_NS;s++) {
278                        for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                             rtmp0=0;
279                          for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                             rtmp1=0;
280                              rtmp0=0;                             rtmp2=0;
281                              rtmp1=0;                             for (q=0;q<p.numQuad;q++) {
282                              rtmp2=0;                                  rtmp0+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)];
283                              for (q=0;q<p.numQuad;q++) {                                  rtmp1+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)];
284                                  rtmp=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)];                                  rtmp2+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)];
285                                  rtmp0+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,0,q,p.row_NN,DIM)];                             }
286                                  rtmp1+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,1,q,p.row_NN,DIM)];                             EM_F[INDEX2(0,s,p.numEqu)]+=rtmp0*X_p[0]+rtmp1*X_p[1]+rtmp2*X_p[2];
                                 rtmp2+=rtmp*DSDX[INDEX3(r,2,q,p.row_NN,DIM)];  
                             }  
                             EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp0*C_p[0]+rtmp1*C_p[1]+rtmp2*C_p[2];  
287                          }                          }
288                        }                       }
289                    }                    }
290                  }                    /**************************************************************/
291                  /************************************************************* */                    /*   process Y: */
292                  /* process D */                    /**************************************************************/
293                  /**************************************************************/                     Y_p=getSampleDataRO(Y,e,YBuff);
294                  D_p=getSampleData(D,e);                     if (NULL!=Y_p) {
295                  if (NULL!=D_p) {                       add_EM_F=TRUE;
296                    add_EM_S=TRUE;                       if (extendedY) {
297                    if (extendedD) {                          for (s=0;s<p.row_NS;s++) {
298                        for (s=0;s<p.row_NS;s++) {                             rtmp=0;
299                          for (r=0;r<p.col_NS;r++) {                             for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*Y_p[q];
300                            rtmp=0;                             EM_F[INDEX2(0,s,p.numEqu)]+=rtmp;
                           for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*D_p[q]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)];  
                           EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp;  
301                          }                          }
302                        }                        } else {
303                    } else {                          for (s=0;s<p.row_NS;s++) {
                       for (s=0;s<p.row_NS;s++) {  
                         for (r=0;r<p.col_NS;r++) {  
304                              rtmp=0;                              rtmp=0;
305                              for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*S[INDEX2(r,q,p.row_NS)];                              for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)];
306                              EM_S[INDEX4(0,0,s,r,p.numEqu,p.numComp,p.row_NN)]+=rtmp*D_p[0];                              EM_F[INDEX2(0,s,p.numEqu)]+=rtmp*Y_p[0];
307                          }                          }
308                        }                        }
309                    }                      }
310                  }                      /***********************************************************************************************/
311                  /**************************************************************/                      /* add the element matrices onto the matrix and right hand side                                */
312                  /*   process X: */                      /***********************************************************************************************/
313                  /**************************************************************/                      for (q=0;q<p.row_NN;q++) row_index[q]=p.row_DOF[elements->Nodes[INDEX2(p.row_node[q],e,p.NN)]];
314                  X_p=getSampleData(X,e);                      if (add_EM_F) Finley_Util_AddScatter(p.row_NN,row_index,p.numEqu,EM_F,F_p, p.row_DOF_UpperBound);
315                  if (NULL!=X_p) {                      if (add_EM_S) Finley_Assemble_addToSystemMatrix(Mat,p.row_NN,row_index,p.numEqu,p.col_NN,row_index,p.numComp,EM_S);
316                    add_EM_F=TRUE;    
317                    if (extendedX) {                  } /* end color check */
318                       for (s=0;s<p.row_NS;s++) {               } /* end element loop */
319                          rtmp=0;           } /* end color loop */
320                          for (q=0;q<p.numQuad;q++) {            
321                               rtmp+=Vol[q]*( DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)]*X_p[INDEX2(0,q,DIM)]           THREAD_MEMFREE(EM_S);
322                                            + DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)]*X_p[INDEX2(1,q,DIM)]           THREAD_MEMFREE(EM_F);
323                                            + DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)]*X_p[INDEX2(2,q,DIM)]);           THREAD_MEMFREE(row_index);
324                          }  
325                          EM_F[INDEX2(0,s,p.numEqu)]+=rtmp;        } /* end of pointer check */
                      }  
                    } else {  
                      for (s=0;s<p.row_NS;s++) {  
                         rtmp0=0;  
                         rtmp1=0;  
                         rtmp2=0;  
                         for (q=0;q<p.numQuad;q++) {  
                              rtmp0+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,0,q,p.row_NN,DIM)];  
                              rtmp1+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,1,q,p.row_NN,DIM)];  
                              rtmp2+=Vol[q]*DSDX[INDEX3(s,2,q,p.row_NN,DIM)];  
                         }  
                         EM_F[INDEX2(0,s,p.numEqu)]+=rtmp0*X_p[0]+rtmp1*X_p[1]+rtmp2*X_p[2];  
                      }  
                   }  
                }  
                /**************************************************************/  
                /*   process Y: */  
                /**************************************************************/  
                 Y_p=getSampleData(Y,e);  
                 if (NULL!=Y_p) {  
                   add_EM_F=TRUE;  
                   if (extendedY) {  
                      for (s=0;s<p.row_NS;s++) {  
                         rtmp=0;  
                         for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)]*Y_p[q];  
                         EM_F[INDEX2(0,s,p.numEqu)]+=rtmp;  
                      }  
                    } else {  
                      for (s=0;s<p.row_NS;s++) {  
                          rtmp=0;  
                          for (q=0;q<p.numQuad;q++) rtmp+=Vol[q]*S[INDEX2(s,q,p.row_NS)];  
                          EM_F[INDEX2(0,s,p.numEqu)]+=rtmp*Y_p[0];  
                      }  
                    }  
                  }  
                  /***********************************************************************************************/  
                  /* add the element matrices onto the matrix and right hand side                                */  
                  /***********************************************************************************************/  
                  for (q=0;q<p.row_NN;q++) row_index[q]=p.row_DOF[elements->Nodes[INDEX2(p.row_node[q],e,p.NN)]];  
                  if (add_EM_F) Finley_Util_AddScatter(p.row_NN,row_index,p.numEqu,EM_F,F_p, p.row_DOF_UpperBound);  
                  if (add_EM_S) Finley_Assemble_addToSystemMatrix(Mat,p.row_NN,row_index,p.numEqu,p.col_NN,row_index,p.numComp,EM_S);  
   
              } /* end color check */  
           } /* end element loop */  
       } /* end color loop */  
326     } /* end parallel region */     } /* end parallel region */
327       freeSampleBuffer(ABuff);
328       freeSampleBuffer(BBuff);
329       freeSampleBuffer(CBuff);
330       freeSampleBuffer(DBuff);
331       freeSampleBuffer(XBuff);
332       freeSampleBuffer(YBuff);
333  }  }
334  /*  /*
335   * $Log$   * $Log$

Legend:
Removed from v.798  
changed lines
  Added in v.2548

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.26