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# Line 13  Line 13 
13   ******************************************************************************   ******************************************************************************
14  */  */
15    
16    #ifdef PASO_MPI
17    #include <mpi.h>
18    #endif
19  #include "MeshAdapter.h"  #include "MeshAdapter.h"
20    
21  #include "escript/Data.h"  #include "escript/Data.h"
# Line 252  void MeshAdapter::addPDEToSystem( Line 255  void MeshAdapter::addPDEToSystem(
255                       const escript::Data& d, const escript::Data& y,                       const escript::Data& d, const escript::Data& y,
256                       const escript::Data& d_contact,const escript::Data& y_contact) const                       const escript::Data& d_contact,const escript::Data& y_contact) const
257  {  {
258    escriptDataC _rhs=rhs.getDataC();     escriptDataC _rhs=rhs.getDataC();
259    escriptDataC _A  =A.getDataC();     escriptDataC _A  =A.getDataC();
260    escriptDataC _B=B.getDataC();     escriptDataC _B=B.getDataC();
261    escriptDataC _C=C.getDataC();     escriptDataC _C=C.getDataC();
262    escriptDataC _D=D.getDataC();     escriptDataC _D=D.getDataC();
263    escriptDataC _X=X.getDataC();     escriptDataC _X=X.getDataC();
264    escriptDataC _Y=Y.getDataC();     escriptDataC _Y=Y.getDataC();
265    escriptDataC _d=d.getDataC();     escriptDataC _d=d.getDataC();
266    escriptDataC _y=y.getDataC();     escriptDataC _y=y.getDataC();
267    escriptDataC _d_contact=d_contact.getDataC();     escriptDataC _d_contact=d_contact.getDataC();
268    escriptDataC _y_contact=y_contact.getDataC();     escriptDataC _y_contact=y_contact.getDataC();
269    
270     Finley_Mesh* mesh=m_finleyMesh.get();     Finley_Mesh* mesh=m_finleyMesh.get();
    Finley_Assemble_PDE(mesh->Nodes,mesh->Elements,mat.getPaso_SystemMatrix(), &_rhs, &_A, &_B, &_C, &_D, &_X, &_Y );  
271    
272       Finley_Assemble_PDE(mesh->Nodes,mesh->Elements,mat.getPaso_SystemMatrix(), &_rhs, &_A, &_B, &_C, &_D, &_X, &_Y );
273     checkFinleyError();     checkFinleyError();
274    
275     Finley_Assemble_RobinCondition(mesh->Nodes,mesh->FaceElements, mat.getPaso_SystemMatrix(), &_rhs, &_d, &_y, Finley_Assemble_handelShapeMissMatch_Mean_out);     Finley_Assemble_PDE(mesh->Nodes,mesh->FaceElements, mat.getPaso_SystemMatrix(), &_rhs, 0, 0, 0, &_d, 0, &_y );
276     checkFinleyError();     checkFinleyError();
277    
278     Finley_Assemble_RobinCondition(mesh->Nodes,mesh->ContactElements, mat.getPaso_SystemMatrix(), &_rhs , &_d_contact, &_y_contact ,             Finley_Assemble_handelShapeMissMatch_Step_out);     Finley_Assemble_PDE(mesh->Nodes,mesh->ContactElements, mat.getPaso_SystemMatrix(), &_rhs , 0, 0, 0, &_d_contact, 0, &_y_contact );
279     checkFinleyError();     checkFinleyError();
280  }  }
281    
# Line 283  void MeshAdapter::addPDEToRHS( escript:: Line 286  void MeshAdapter::addPDEToRHS( escript::
286  {  {
287     Finley_Mesh* mesh=m_finleyMesh.get();     Finley_Mesh* mesh=m_finleyMesh.get();
288    
289     // Finley_Assemble_PDE_RHS(mesh->Nodes,mesh->Elements,&(rhs.getDataC()),&(X.getDataC()),&(Y.getDataC()));     escriptDataC _rhs=rhs.getDataC();
290     Finley_Assemble_PDE(mesh->Nodes,mesh->Elements,0,&(rhs.getDataC()),0,0,0,0,&(X.getDataC()),&(Y.getDataC()));     escriptDataC _X=X.getDataC();
291     checkFinleyError();     escriptDataC _Y=Y.getDataC();
292       escriptDataC _y=y.getDataC();
293       escriptDataC _y_contact=y_contact.getDataC();
294    
295     // Finley_Assemble_RobinCondition_RHS(mesh->Nodes,mesh->FaceElements,&(rhs.getDataC()),&(y.getDataC()),Finley_Assemble_handelShapeMissMatch_Mean_out);     Finley_Assemble_PDE(mesh->Nodes,mesh->Elements, 0, &_rhs, 0, 0, 0, 0, &_X, &_Y );
296     Finley_Assemble_RobinCondition(mesh->Nodes,mesh->FaceElements,0,&(rhs.getDataC()),0,&(y.getDataC()),Finley_Assemble_handelShapeMissMatch_Mean_out);     checkFinleyError();
297    
298       Finley_Assemble_PDE(mesh->Nodes,mesh->FaceElements, 0, &_rhs, 0, 0, 0, 0, 0, &_y );
299     checkFinleyError();     checkFinleyError();
300     Finley_Assemble_RobinCondition(mesh->Nodes,mesh->ContactElements,0,&(rhs.getDataC()),0,&(y_contact.getDataC()),Finley_Assemble_handelShapeMissMatch_Step_out);  
301     // Finley_Assemble_RobinCondition_RHS(mesh->Nodes,mesh->ContactElements,&(rhs.getDataC()),&(y_contact.getDataC()),Finley_Assemble_handelShapeMissMatch_Step_out);     Finley_Assemble_PDE(mesh->Nodes,mesh->ContactElements, 0, &_rhs , 0, 0, 0, 0, 0, &_y_contact );
302     checkFinleyError();     checkFinleyError();
303  }  }
304    
# Line 716  void MeshAdapter::saveDX(const std::stri Line 722  void MeshAdapter::saveDX(const std::stri
722      for (int i=0;i<num_data;++i) {      for (int i=0;i<num_data;++i) {
723           escript::Data& d=boost::python::extract<escript::Data&>(arg[keys[i]]);           escript::Data& d=boost::python::extract<escript::Data&>(arg[keys[i]]);
724           if (dynamic_cast<const MeshAdapter&>(d.getFunctionSpace().getDomain()) !=*this)           if (dynamic_cast<const MeshAdapter&>(d.getFunctionSpace().getDomain()) !=*this)
725               throw FinleyAdapterException("Error  in saveVTK: Data must be defined on same Domain");               throw FinleyAdapterException("Error  in saveDX: Data must be defined on same Domain");
726           data[i]=d.getDataC();           data[i]=d.getDataC();
727           ptr_data[i]=&(data[i]);           ptr_data[i]=&(data[i]);
728           std::string n=boost::python::extract<std::string>(keys[i]);           std::string n=boost::python::extract<std::string>(keys[i]);
# Line 776  void MeshAdapter::saveVTK(const std::str Line 782  void MeshAdapter::saveVTK(const std::str
782              strcpy(c_names[i],n.c_str());              strcpy(c_names[i],n.c_str());
783           }           }
784      }      }
785    #ifndef PASO_MPI    
786      Finley_Mesh_saveVTK(filename.c_str(),m_finleyMesh.get(),num_data,c_names,ptr_data);      Finley_Mesh_saveVTK(filename.c_str(),m_finleyMesh.get(),num_data,c_names,ptr_data);
787      checkFinleyError();  #else
788        Finley_Mesh_saveVTK_MPIO(filename.c_str(),m_finleyMesh.get(),num_data,c_names,ptr_data);
789    #endif
790    
791    checkFinleyError();
792    /* win32 refactor */    /* win32 refactor */
793    TMPMEMFREE(c_names);    TMPMEMFREE(c_names);
794    TMPMEMFREE(data);    TMPMEMFREE(data);

Legend:
Removed from v.767  
changed lines
  Added in v.817

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