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revision 471 by jgs, Fri Jan 27 01:33:02 2006 UTC revision 1733 by gross, Thu Aug 28 01:46:07 2008 UTC
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1  /*  
2   ******************************************************************************  /* $Id$ */
3   *                                                                            *  
4   *       COPYRIGHT  ACcESS 2003,2004,2005 -  All Rights Reserved              *  /*******************************************************
5   *                                                                            *   *
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11   *                                                                            *   *  Licensed under the Open Software License version 3.0
12   ******************************************************************************   *     http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php
13  */   *
14     *******************************************************/
15    
16  /**************************************************************/  /**************************************************************/
17    
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23    
24  /**************************************************************/  /**************************************************************/
25    
 /*  Author: gross@access.edu.au */  
 /*  Version: $Id$ */  
   
 /**************************************************************/  
   
26  #include "RectangularMesh.h"  #include "RectangularMesh.h"
27    
28  /**************************************************************/  Finley_Mesh* Finley_RectangularMesh_Hex8(dim_t* numElements,
29                                              double* Length,
30  Finley_Mesh* Finley_RectangularMesh_Hex8(dim_t* numElements,double* Length,bool_t* periodic, index_t order,bool_t useElementsOnFace) {                                            bool_t* periodic,
31    dim_t N0,N1,N2,NE0,NE1,NE2,i0,i1,i2,k,totalNECount,faceNECount,NDOF0,NDOF1,NDOF2,NFaceElements,NUMNODES,M0,M1,M2;                                            index_t order,
32    index_t node0;                                            index_t reduced_order,
33                                              bool_t useElementsOnFace,
34                                              bool_t useFullElementOrder,
35                                              bool_t optimize)
36    {
37      #define N_PER_E 1
38      #define DIM 3
39      dim_t N0,N1,N2,NE0,NE1,NE2,i0,i1,i2,k,Nstride0,Nstride1,Nstride2, local_NE0, local_NE1, local_NE2, local_N0, local_N1, local_N2;
40      dim_t totalNECount,faceNECount,NDOF0,NDOF1,NDOF2,NFaceElements, NN;
41      index_t node0, myRank, e_offset2, e_offset1, e_offset0, offset1, offset2, offset0, global_i0, global_i1, global_i2;
42    Finley_Mesh* out;    Finley_Mesh* out;
43      Paso_MPIInfo *mpi_info = NULL;
44    char name[50];    char name[50];
45    double time0=Finley_timer();    double time0=Finley_timer();
46    
47      /* get MPI information */
48      mpi_info = Paso_MPIInfo_alloc( MPI_COMM_WORLD );
49      if (! Finley_noError()) {
50            return NULL;
51      }
52      myRank=mpi_info->rank;
53    
54      /* set up the global dimensions of the mesh */
55    
56    NE0=MAX(1,numElements[0]);    NE0=MAX(1,numElements[0]);
57    NE1=MAX(1,numElements[1]);    NE1=MAX(1,numElements[1]);
58    NE2=MAX(1,numElements[2]);    NE2=MAX(1,numElements[2]);
59    N0=NE0+1;    N0=N_PER_E*NE0+1;
60    N1=NE1+1;    N1=N_PER_E*NE1+1;
61    N2=NE2+1;    N2=N_PER_E*NE2+1;
   
   if (N0<=MIN(N1,N2)) {  
      if (N1 <= N2) {  
         M0=1;  
         M1=N0;  
         M2=N0*N1;  
      } else {  
         M0=1;  
         M2=N0;  
         M1=N0*N2;  
      }  
   } else if (N1<=MIN(N2,N0)) {  
      if (N2 <= N0) {  
         M1=1;  
         M2=N1;  
         M0=N2*N1;  
      } else {  
         M1=1;  
         M0=N1;  
         M2=N1*N0;  
      }  
   } else {  
      if (N0 <= N1) {  
         M2=1;  
         M0=N2;  
         M1=N2*N0;  
      } else {  
         M2=1;  
         M1=N2;  
         M0=N1*N2;  
      }  
   }  
62    
63      /*  allocate mesh: */  
64      sprintf(name,"Rectangular %d x %d x %d mesh",N0,N1,N2);
65      out=Finley_Mesh_alloc(name,DIM,order, reduced_order, mpi_info);
66      if (! Finley_noError()) {
67          Paso_MPIInfo_free( mpi_info );
68          return NULL;
69      }
70    
71    NFaceElements=0;   Finley_Mesh_setElements(out,Finley_ElementFile_alloc(Hex8,out->order,out->reduced_order,mpi_info));
72    if (!periodic[0]) {   if (useElementsOnFace) {
73        NDOF0=N0;           Finley_Mesh_setFaceElements(out,Finley_ElementFile_alloc(Hex8Face,
74        NFaceElements+=2*NE1*NE2;                                                                    out->order,
75                                                                      out->reduced_order,
76                                                                      mpi_info));
77             Finley_Mesh_setContactElements(out,Finley_ElementFile_alloc(Hex8Face_Contact,
78                                                                        out->order,
79                                                                        out->reduced_order,
80                                                                        mpi_info));
81    } else {    } else {
82        NDOF0=N0-1;           Finley_Mesh_setFaceElements(out,Finley_ElementFile_alloc(Rec4,
83                                                                      out->order,
84                                                                      out->reduced_order,
85                                                                      mpi_info));
86             Finley_Mesh_setContactElements(out,Finley_ElementFile_alloc(Rec4_Contact,
87                                                                         out->order,
88                                                                         out->reduced_order,
89                                                                         mpi_info));
90      }
91      Finley_Mesh_setPoints(out,Finley_ElementFile_alloc(Point1,
92                                                     out->order,
93                                                     out->reduced_order,
94                                                     mpi_info));
95      if (! Finley_noError()) {
96          Paso_MPIInfo_free( mpi_info );
97          Finley_Mesh_free(out);
98          return NULL;
99    }    }
100    if (!periodic[1]) {  
101        NDOF1=N1;    /* work out the largest dimension */
102        NFaceElements+=2*NE0*NE2;    if (N2==MAX3(N0,N1,N2)) {
103         Nstride0=1;
104         Nstride1=N0;
105         Nstride2=N0*N1;
106         local_NE0=NE0;
107         e_offset0=0;
108         local_NE1=NE1;
109         e_offset1=0;
110         Paso_MPIInfo_Split(mpi_info,NE2,&local_NE2,&e_offset2);
111      } else if (N1==MAX3(N0,N1,N2)) {
112         Nstride0=N2;
113         Nstride1=N0*N2;
114         Nstride2=1;
115         local_NE0=NE0;
116         e_offset0=0;
117         Paso_MPIInfo_Split(mpi_info,NE1,&local_NE1,&e_offset1);
118         local_NE2=NE2;
119         e_offset2=0;
120    } else {    } else {
121        NDOF1=N1-1;       Nstride0=N1*N2;
122    }       Nstride1=1;
123    if (!periodic[2]) {       Nstride2=N1;
124        NDOF2=N2;       Paso_MPIInfo_Split(mpi_info,NE0,&local_NE0,&e_offset0);
125        NFaceElements+=2*NE0*NE1;       local_NE1=NE1;
126         e_offset1=0;
127         local_NE2=NE2;
128         e_offset2=0;
129      }
130      offset0=e_offset0*N_PER_E;
131      offset1=e_offset1*N_PER_E;
132      offset2=e_offset2*N_PER_E;
133      local_N0=local_NE0>0 ? local_NE0*N_PER_E+1 : 0;
134      local_N1=local_NE1>0 ? local_NE1*N_PER_E+1 : 0;
135      local_N2=local_NE2>0 ? local_NE2*N_PER_E+1 : 0;
136    
137      /* get the number of surface elements */
138    
139      NFaceElements=0;
140      if (!periodic[2] && (local_NE2>0)) {
141        NDOF2=N2;
142        if (offset2==0) NFaceElements+=local_NE1*local_NE0;
143        if (local_NE2+e_offset2 == NE2) NFaceElements+=local_NE1*local_NE0;
144    } else {    } else {
145        NDOF2=N2-1;        NDOF2=N2-1;
146    }    }
147      
148    /*  allocate mesh: */    if (!periodic[0] && (local_NE0>0)) {
149           NDOF0=N0;
150    sprintf(name,"Rectangular %d x %d x %d mesh",N0,N1,N2);       if (e_offset0 == 0) NFaceElements+=local_NE1*local_NE2;
151    out=Finley_Mesh_alloc(name,3,order);       if (local_NE0+e_offset0 == NE0) NFaceElements+=local_NE1*local_NE2;
   if (! Finley_noError()) return NULL;  
   
   out->Elements=Finley_ElementFile_alloc(Hex8,out->order);  
   if (useElementsOnFace) {  
      out->FaceElements=Finley_ElementFile_alloc(Hex8Face,out->order);  
      out->ContactElements=Finley_ElementFile_alloc(Hex8Face_Contact,out->order);  
152    } else {    } else {
153       out->FaceElements=Finley_ElementFile_alloc(Rec4,out->order);        NDOF0=N0-1;
      out->ContactElements=Finley_ElementFile_alloc(Rec4_Contact,out->order);  
154    }    }
155    out->Points=Finley_ElementFile_alloc(Point1,out->order);    if (!periodic[1] && (local_NE1>0)) {
156    if (! Finley_noError()) {       NDOF1=N1;
157        Finley_Mesh_dealloc(out);       if (e_offset1 == 0) NFaceElements+=local_NE0*local_NE2;
158        return NULL;       if (local_NE1+e_offset1 == NE1) NFaceElements+=local_NE0*local_NE2;
159      } else {
160          NDOF1=N1-1;
161    }    }
162    
     
163    /*  allocate tables: */    /*  allocate tables: */
     
   Finley_NodeFile_allocTable(out->Nodes,N0*N1*N2);  
   Finley_ElementFile_allocTable(out->Elements,NE0*NE1*NE2);  
   Finley_ElementFile_allocTable(out->FaceElements,NFaceElements);  
   if (! Finley_noError()) {  
       Finley_Mesh_dealloc(out);  
       return NULL;  
   }  
     
   /*  set nodes: */  
   
   #pragma omp parallel for private(i0,i1,i2,k)  
   for (i2=0;i2<N2;i2++) {  
     for (i1=0;i1<N1;i1++) {  
       for (i0=0;i0<N0;i0++) {  
         k=M0*i0+M1*i1+M2*i2;  
         out->Nodes->Coordinates[INDEX2(0,k,3)]=DBLE(i0)/DBLE(N0-1)*Length[0];  
         out->Nodes->Coordinates[INDEX2(1,k,3)]=DBLE(i1)/DBLE(N1-1)*Length[1];  
         out->Nodes->Coordinates[INDEX2(2,k,3)]=DBLE(i2)/DBLE(N2-1)*Length[2];  
         out->Nodes->Id[k]=i0+N0*i1+N0*N1*i2;  
         out->Nodes->Tag[k]=0;  
         out->Nodes->degreeOfFreedom[k]=M0*(i0%NDOF0) +M1*(i1%NDOF1) +M2*(i2%NDOF2);  
       }  
     }  
   }  
   /* tags for the faces: */  
   /* tags for the faces: */  
   if (!periodic[2]) {  
      for (i1=0;i1<N1;i1++) {  
        for (i0=0;i0<N0;i0++) {  
          out->Nodes->Tag[M0*i0+M1*i1+M2*0]+=100;  
          out->Nodes->Tag[M0*i0+M1*i1+M2*(N2-1)]+=200;  
        }  
      }  
   }  
   if (!periodic[1]) {  
     for (i2=0;i2<N2;i2++) {  
       for (i0=0;i0<N0;i0++) {  
          out->Nodes->Tag[M0*i0+M1*0+M2*i2]+=10;  
          out->Nodes->Tag[M0*i0+M1*(N1-1)+M2*i2]+=20;  
       }  
     }  
   }  
   if (!periodic[0]) {  
     for (i2=0;i2<N2;i2++) {  
       for (i1=0;i1<N1;i1++) {  
         out->Nodes->Tag[M0*0+M1*i1+M2*i2]+=1;  
         out->Nodes->Tag[M0*(N0-1)+M1*i1+M2*i2]+=2;  
       }  
     }  
   }  
164    
165    /*   set the elements: */    Finley_NodeFile_allocTable(out->Nodes,local_N0*local_N1*local_N2);
166        Finley_ElementFile_allocTable(out->Elements,local_NE0*local_NE1*local_NE2);
167    #pragma omp parallel for private(i0,i1,i2,k,node0)    Finley_ElementFile_allocTable(out->FaceElements,NFaceElements);
   for (i2=0;i2<NE2;i2++) {  
     for (i1=0;i1<NE1;i1++) {  
       for (i0=0;i0<NE0;i0++) {  
         k=i0+NE0*i1+NE0*NE1*i2;  
         node0=i0+i1*N0+N0*N1*i2;  
   
         out->Elements->Id[k]=k;  
         out->Elements->Tag[k]=0;  
         out->Elements->Color[k]=COLOR_MOD(i0)+3*COLOR_MOD(i1)+9*COLOR_MOD(i2);;  
   
         out->Elements->Nodes[INDEX2(0,k,8)]=node0;  
         out->Elements->Nodes[INDEX2(1,k,8)]=node0+1;  
         out->Elements->Nodes[INDEX2(2,k,8)]=node0+N0+1;  
         out->Elements->Nodes[INDEX2(3,k,8)]=node0+N0;  
         out->Elements->Nodes[INDEX2(4,k,8)]=node0+N0*N1;  
         out->Elements->Nodes[INDEX2(5,k,8)]=node0+N0*N1+1;  
         out->Elements->Nodes[INDEX2(6,k,8)]=node0+N0*N1+N0+1;  
         out->Elements->Nodes[INDEX2(7,k,8)]=node0+N0*N1+N0;  
168    
169        }    if (Finley_noError()) {
170      }       /* create nodes */
   }  
   out->Elements->minColor=0;  
   out->Elements->maxColor=COLOR_MOD(0)+3*COLOR_MOD(0)+9*COLOR_MOD(0);  
     
   /*   face elements: */  
     
   if  (useElementsOnFace) {  
      NUMNODES=8;  
   } else {  
      NUMNODES=4;  
   }  
   totalNECount=NE0*NE1*NE2;  
   faceNECount=0;  
     
   /*   these are the quadrilateral elements on boundary 1 (x3=0): */  
   if (!periodic[2]) {  
      /* **  elements on boundary 100 (x3=0): */  
     
      #pragma omp parallel for private(i0,i1,k,node0)  
      for (i1=0;i1<NE1;i1++) {  
        for (i0=0;i0<NE0;i0++) {  
          k=i0+NE0*i1+faceNECount;  
          node0=i0+i1*N0;  
171        
172           out->FaceElements->Id[k]=i0+NE0*i1+totalNECount;       #pragma omp parallel for private(i0,i1,i2,k,global_i0,global_i1,global_i2)
173           out->FaceElements->Tag[k]=100;       for (i2=0;i2<local_N2;i2++) {
174           out->FaceElements->Color[k]=(i0%2)+2*(i1%2);         for (i1=0;i1<local_N1;i1++) {
175             for (i0=0;i0<local_N0;i0++) {
176           if  (useElementsOnFace) {             k=i0+local_N0*i1+local_N0*local_N1*i2;
177              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(0,k,NUMNODES)]=node0;             global_i0=i0+offset0;
178              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(1,k,NUMNODES)]=node0+N0;             global_i1=i1+offset1;
179              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(2,k,NUMNODES)]=node0+N0+1;             global_i2=i2+offset2;
180              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(3,k,NUMNODES)]=node0+1;             out->Nodes->Coordinates[INDEX2(0,k,DIM)]=DBLE(global_i0)/DBLE(N0-1)*Length[0];
181              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(4,k,NUMNODES)]=node0+N0*N1;             out->Nodes->Coordinates[INDEX2(1,k,DIM)]=DBLE(global_i1)/DBLE(N1-1)*Length[1];
182              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(5,k,NUMNODES)]=node0+N0*N1+N0;             out->Nodes->Coordinates[INDEX2(2,k,DIM)]=DBLE(global_i2)/DBLE(N2-1)*Length[2];
183              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(6,k,NUMNODES)]=node0+N0*N1+N0+1;             out->Nodes->Id[k]=Nstride0*global_i0+Nstride1*global_i1+Nstride2*global_i2;
184              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(7,k,NUMNODES)]=node0+N0*N1+1;             out->Nodes->Tag[k]=0;
185           } else {             out->Nodes->globalDegreesOfFreedom[k]=Nstride0*(global_i0%NDOF0)
186              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(0,k,NUMNODES)]=node0;                                                 +Nstride1*(global_i1%NDOF1)
187              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(1,k,NUMNODES)]=node0+N0;                                                 +Nstride2*(global_i2%NDOF2);
             out->FaceElements->Nodes[INDEX2(2,k,NUMNODES)]=node0+N0+1;  
             out->FaceElements->Nodes[INDEX2(3,k,NUMNODES)]=node0+1;  
188           }           }
189         }         }
190       }       }
191       totalNECount+=NE1*NE0;       /*   set the elements: */
192       faceNECount+=NE1*NE0;       NN=out->Elements->numNodes;
193           #pragma omp parallel for private(i0,i1,i2,k,node0)
194       /* **  elements on boundary 200 (x3=1) */       for (i2=0;i2<local_NE2;i2++) {
195             for (i1=0;i1<local_NE1;i1++) {
196       #pragma omp parallel for private(i0,i1,k,node0)           for (i0=0;i0<local_NE0;i0++) {
197       for (i1=0;i1<NE1;i1++) {            
198         for (i0=0;i0<NE0;i0++) {             k=i0+local_NE0*i1+local_NE0*local_NE1*i2;        
199           k=i0+NE0*i1+faceNECount;             node0=Nstride0*N_PER_E*(i0+e_offset0)+Nstride1*N_PER_E*(i1+e_offset1)+Nstride2*N_PER_E*(i2+e_offset2);
          node0=i0+i1*N0+N0*N1*(NE2-1);  
200        
201           out->FaceElements->Id[k]=i0+NE0*i1+totalNECount;             out->Elements->Id[k]=(i0+e_offset0)+NE0*(i1+e_offset1)+NE0*NE1*(i2+e_offset2);
202           out->FaceElements->Tag[k]=200;             out->Elements->Tag[k]=0;
203           out->FaceElements->Color[k]=(i0%2)+2*(i1%2)+4;             out->Elements->Owner[k]=myRank;
204    
205           if  (useElementsOnFace) {             out->Elements->Nodes[INDEX2(0,k,NN)] =node0                             ;
206              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(0,k,NUMNODES)]=node0+ N0 * N1;             out->Elements->Nodes[INDEX2(1,k,NN)] =node0+                    Nstride0;
207              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(1,k,NUMNODES)]=node0+ N0 * N1+1;             out->Elements->Nodes[INDEX2(2,k,NN)] =node0+           Nstride1+Nstride0;
208              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(2,k,NUMNODES)]=node0+ N0 * N1+N0+1;             out->Elements->Nodes[INDEX2(3,k,NN)] =node0+           Nstride1;
209              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(3,k,NUMNODES)]=node0+ N0 * N1+N0;             out->Elements->Nodes[INDEX2(4,k,NN)] =node0+Nstride2                   ;
210              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(4,k,NUMNODES)]=node0;             out->Elements->Nodes[INDEX2(5,k,NN)] =node0+Nstride2         +Nstride0;
211              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(5,k,NUMNODES)]=node0+1;             out->Elements->Nodes[INDEX2(6,k,NN)] =node0+Nstride2+Nstride1+Nstride0;
212              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(6,k,NUMNODES)]=node0+N0+1;             out->Elements->Nodes[INDEX2(7,k,NN)] =node0+Nstride2+Nstride1           ;
             out->FaceElements->Nodes[INDEX2(7,k,NUMNODES)]=node0+N0;  
          } else {  
             out->FaceElements->Nodes[INDEX2(0,k,NUMNODES)]=node0+ N0 * N1;  
             out->FaceElements->Nodes[INDEX2(1,k,NUMNODES)]=node0+ N0 * N1+1;  
             out->FaceElements->Nodes[INDEX2(2,k,NUMNODES)]=node0+ N0 * N1+N0+1;  
             out->FaceElements->Nodes[INDEX2(3,k,NUMNODES)]=node0+ N0 * N1+N0;  
213           }           }
   
     
214         }         }
215       }       }
216       totalNECount+=NE1*NE0;       /* face elements */
217       faceNECount+=NE1*NE0;       NN=out->FaceElements->numNodes;
218    }       totalNECount=NE0*NE1*NE2;
219    if (!periodic[0]) {       faceNECount=0;
220       /* **  elements on boundary 001 (x1=0): */       /*   these are the quadrilateral elements on boundary 1 (x3=0): */
221           if (!periodic[2]  && (local_NE2>0)) {
222       #pragma omp parallel for private(i1,i2,k,node0)         /* **  elements on boundary 100 (x3=0): */
223       for (i2=0;i2<NE2;i2++) {         if (e_offset2==0) {
224         for (i1=0;i1<NE1;i1++) {            #pragma omp parallel for private(i0,i1,k,node0)
225           k=i1+NE1*i2+faceNECount;            for (i1=0;i1<local_NE1;i1++) {
226           node0=i1*N0+N0*N1*i2;              for (i0=0;i0<local_NE0;i0++) {
227                
228           out->FaceElements->Id[k]=i1+NE1*i2+totalNECount;                k=i0+local_NE0*i1+faceNECount;
229           out->FaceElements->Tag[k]=1;                node0=Nstride0*N_PER_E*(i0+e_offset0)+Nstride1*N_PER_E*(i1+e_offset1);
230           out->FaceElements->Color[k]=(i2%2)+2*(i1%2)+8;      
231                  out->FaceElements->Id[k]=(i0+e_offset0)+NE0*(i1+e_offset1)+totalNECount;
232           if  (useElementsOnFace) {                out->FaceElements->Tag[k]=100;
233              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(0,k,NUMNODES)]=node0;                out->FaceElements->Owner[k]=myRank;
234              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(1,k,NUMNODES)]=node0+N0*N1;          
235              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(2,k,NUMNODES)]=node0+N0*N1+N0;                if  (useElementsOnFace) {
236              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(3,k,NUMNODES)]=node0+N0;                   out->FaceElements->Nodes[INDEX2(0,k,NN)] =node0                                 ;
237              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(4,k,NUMNODES)]=node0+1;                   out->FaceElements->Nodes[INDEX2(1,k,NN)] =node0         +Nstride1           ;
238              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(5,k,NUMNODES)]=node0+N0*N1+1;                   out->FaceElements->Nodes[INDEX2(2,k,NN)] =node0         +Nstride1+Nstride0;
239              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(6,k,NUMNODES)]=node0+N0*N1+N0+1;                   out->FaceElements->Nodes[INDEX2(3,k,NN)] =node0+          Nstride0           ;
240              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(7,k,NUMNODES)]=node0+N0+1;                   out->FaceElements->Nodes[INDEX2(4,k,NN)] =node0+Nstride2                      ;
241           } else {                   out->FaceElements->Nodes[INDEX2(5,k,NN)] =node0+Nstride2+Nstride1           ;
242              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(0,k,NUMNODES)]=node0;                   out->FaceElements->Nodes[INDEX2(6,k,NN)] =node0+Nstride2+Nstride1+Nstride0;
243              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(1,k,NUMNODES)]=node0+N0*N1;                   out->FaceElements->Nodes[INDEX2(7,k,NN)] =node0+Nstride2          +Nstride0;
244              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(2,k,NUMNODES)]=node0+N0*N1+N0;                } else {
245              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(3,k,NUMNODES)]=node0+N0;                   out->FaceElements->Nodes[INDEX2(0,k,NN)] =node0                                 ;
246           }                   out->FaceElements->Nodes[INDEX2(1,k,NN)] =node0+           Nstride1           ;
247                     out->FaceElements->Nodes[INDEX2(2,k,NN)] =node0+           Nstride1+Nstride0;
248                     out->FaceElements->Nodes[INDEX2(3,k,NN)] =node0+                     Nstride0;
249                  }
250                }
251              }
252              faceNECount+=local_NE1*local_NE0;
253         }         }
254           totalNECount+=NE1*NE0;
255           /* **  elements on boundary 200 (x3=1) */
256           if (local_NE2+e_offset2 == NE2) {
257              #pragma omp parallel for private(i0,i1,k,node0)
258              for (i1=0;i1<local_NE1;i1++) {
259                for (i0=0;i0<local_NE0;i0++) {
260          
261                  k=i0+local_NE0*i1+faceNECount;
262                  node0=Nstride0*N_PER_E*(i0+e_offset0)+Nstride1*N_PER_E*(i1+e_offset1)+Nstride2*N_PER_E*(NE2-1);
263            
264                  out->FaceElements->Id[k]=(i0+e_offset0)+NE0*(i1+e_offset1)+totalNECount;
265                  out->FaceElements->Tag[k]=200;
266                  out->FaceElements->Owner[k]=myRank;
267                  if  (useElementsOnFace) {
268                     out->FaceElements->Nodes[INDEX2(0,k,NN)] =node0+Nstride2                      ;
269                     out->FaceElements->Nodes[INDEX2(1,k,NN)] =node0+Nstride2+           Nstride0;
270                     out->FaceElements->Nodes[INDEX2(2,k,NN)] =node0+Nstride2+Nstride1+Nstride0;
271                     out->FaceElements->Nodes[INDEX2(3,k,NN)] =node0+Nstride2+Nstride1           ;
272          
273                     out->FaceElements->Nodes[INDEX2(4,k,NN)] =node0                                 ;
274                     out->FaceElements->Nodes[INDEX2(5,k,NN)] =node0+Nstride0                      ;
275                     out->FaceElements->Nodes[INDEX2(6,k,NN)] =node0+           Nstride1+Nstride0;
276                     out->FaceElements->Nodes[INDEX2(7,k,NN)] =node0+           Nstride1;
277                  } else {
278                     out->FaceElements->Nodes[INDEX2(0,k,NN)] =node0+Nstride2                      ;
279                     out->FaceElements->Nodes[INDEX2(1,k,NN)] =node0+Nstride2           +Nstride0;
280                     out->FaceElements->Nodes[INDEX2(2,k,NN)] =node0+Nstride2+Nstride1+Nstride0;
281                     out->FaceElements->Nodes[INDEX2(3,k,NN)] =node0+Nstride2+Nstride1           ;
282                  }
283                }
284              }
285              faceNECount+=local_NE1*local_NE0;
286           }
287           totalNECount+=NE1*NE0;
288       }       }
289       totalNECount+=NE1*NE2;       if (!periodic[0]  && (local_NE0>0)) {
290       faceNECount+=NE1*NE2;          /* **  elements on boundary 001 (x1=0): */
291            
292       /* **  elements on boundary 002 (x1=1): */          if (e_offset0 == 0) {
293                 #pragma omp parallel for private(i1,i2,k,node0)
294       #pragma omp parallel for private(i1,i2,k,node0)             for (i2=0;i2<local_NE2;i2++) {
295       for (i2=0;i2<NE2;i2++) {               for (i1=0;i1<local_NE1;i1++) {
296         for (i1=0;i1<NE1;i1++) {        
297           k=i1+NE1*i2+faceNECount;                 k=i1+local_NE1*i2+faceNECount;
298           node0=(NE0-1)+i1*N0+N0*N1*i2 ;                 node0=Nstride1*N_PER_E*(i1+e_offset1)+Nstride2*N_PER_E*(i2+e_offset2);
299                   out->FaceElements->Id[k]=(i1+e_offset1)+NE1*(i2+e_offset2)+totalNECount;
300                   out->FaceElements->Tag[k]=1;
301                   out->FaceElements->Owner[k]=myRank;
302          
303                   if  (useElementsOnFace) {
304                      out->FaceElements->Nodes[INDEX2(0,k,NN)] =node0                                 ;
305                      out->FaceElements->Nodes[INDEX2(1,k,NN)] =node0+Nstride2                      ;
306                      out->FaceElements->Nodes[INDEX2(2,k,NN)] =node0+Nstride2+Nstride1           ;
307                      out->FaceElements->Nodes[INDEX2(3,k,NN)] =node0+Nstride1                      ;
308                      out->FaceElements->Nodes[INDEX2(4,k,NN)] =node0+Nstride0                      ;
309                      out->FaceElements->Nodes[INDEX2(5,k,NN)] =node0+Nstride2+Nstride0           ;
310                      out->FaceElements->Nodes[INDEX2(6,k,NN)] =node0+Nstride2+Nstride1+Nstride0;
311                      out->FaceElements->Nodes[INDEX2(7,k,NN)] =node0+Nstride1+Nstride0           ;
312                   } else {
313                      out->FaceElements->Nodes[INDEX2(0,k,NN)] =node0                                 ;
314                      out->FaceElements->Nodes[INDEX2(1,k,NN)] =node0+Nstride2                      ;
315                      out->FaceElements->Nodes[INDEX2(2,k,NN)] =node0+Nstride2+Nstride1           ;
316                      out->FaceElements->Nodes[INDEX2(3,k,NN)] =node0+           Nstride1           ;
317                   }
318                 }
319               }
320               faceNECount+=local_NE1*local_NE2;
321            }
322            totalNECount+=NE1*NE2;
323            /* **  elements on boundary 002 (x1=1): */
324            if (local_NE0+e_offset0 == NE0) {
325               #pragma omp parallel for private(i1,i2,k,node0)
326               for (i2=0;i2<local_NE2;i2++) {
327                 for (i1=0;i1<local_NE1;i1++) {
328                   k=i1+local_NE1*i2+faceNECount;
329                   node0=Nstride0*N_PER_E*(NE0-1)+Nstride1*N_PER_E*(i1+e_offset1)+Nstride2*N_PER_E*(i2+e_offset2);
330                   out->FaceElements->Id[k]=(i1+e_offset1)+NE1*(i2+e_offset2)+totalNECount;
331                   out->FaceElements->Tag[k]=2;
332                   out->FaceElements->Owner[k]=myRank;
333        
334           out->FaceElements->Id[k]=i1+NE1*i2+totalNECount;                 if  (useElementsOnFace) {
335           out->FaceElements->Tag[k]=2;                    out->FaceElements->Nodes[INDEX2(0,k,NN)]=node0+                      Nstride0;
336           out->FaceElements->Color[k]=(i2%2)+2*(i1%2)+12;                    out->FaceElements->Nodes[INDEX2(1,k,NN)]=node0+           Nstride1+Nstride0;
337                      out->FaceElements->Nodes[INDEX2(2,k,NN)]=node0+Nstride2+Nstride1+Nstride0;
338           if  (useElementsOnFace) {                    out->FaceElements->Nodes[INDEX2(3,k,NN)]=node0+Nstride2+           Nstride0;
339              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(0,k,NUMNODES)]=node0+1;        
340              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(1,k,NUMNODES)]=node0+N0+1;                    out->FaceElements->Nodes[INDEX2(4,k,NN)]=node0                                 ;
341              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(2,k,NUMNODES)]=node0+N0*N1+N0+1;                    out->FaceElements->Nodes[INDEX2(5,k,NN)]=node0+           Nstride1           ;
342              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(3,k,NUMNODES)]=node0+N0*N1+1;                    out->FaceElements->Nodes[INDEX2(6,k,NN)]=node0+Nstride2+Nstride1           ;
343              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(4,k,NUMNODES)]=node0;                    out->FaceElements->Nodes[INDEX2(7,k,NN)]=node0+Nstride2                      ;
344              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(5,k,NUMNODES)]=node0+N0;        
345              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(6,k,NUMNODES)]=node0+N0*N1+N0;                 } else {
346              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(7,k,NUMNODES)]=node0+N0*N1;                    out->FaceElements->Nodes[INDEX2(0,k,NN)]=node0                      +Nstride0;
347           } else {                    out->FaceElements->Nodes[INDEX2(1,k,NN)]=node0+           Nstride1+Nstride0;
348              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(0,k,NUMNODES)]=node0+1;                    out->FaceElements->Nodes[INDEX2(2,k,NN)]=node0+Nstride2+Nstride1+Nstride0;
349              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(1,k,NUMNODES)]=node0+N0+1;                    out->FaceElements->Nodes[INDEX2(3,k,NN)]=node0+Nstride2+           Nstride0;
350              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(2,k,NUMNODES)]=node0+N0*N1+N0+1;                 }
351              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(3,k,NUMNODES)]=node0+N0*N1+1;          
352                 }
353               }
354               faceNECount+=local_NE1*local_NE2;
355           }           }
356         }           totalNECount+=NE1*NE2;
357       }       }
358       totalNECount+=NE1*NE2;       if (!periodic[1] && (local_NE1>0)) {
359       faceNECount+=NE1*NE2;          /* **  elements on boundary 010 (x2=0): */
360    }          if (e_offset1 == 0) {
361    if (!periodic[1]) {             #pragma omp parallel for private(i0,i2,k,node0)
362       /* **  elements on boundary 010 (x2=0): */             for (i2=0;i2<local_NE2;i2++) {
363                   for (i0=0;i0<local_NE0;i0++) {
364       #pragma omp parallel for private(i0,i2,k,node0)                 k=i0+local_NE0*i2+faceNECount;
365       for (i2=0;i2<NE2;i2++) {                 node0=Nstride0*N_PER_E*(i0+e_offset0)+Nstride2*N_PER_E*(i2+e_offset2);
366         for (i0=0;i0<NE0;i0++) {          
367           k=i0+NE0*i2+faceNECount;                 out->FaceElements->Id[k]=(i2+e_offset2)+NE2*(e_offset0+i0)+totalNECount;
368           node0=i0+N0*N1*i2;                 out->FaceElements->Tag[k]=10;
369                   out->FaceElements->Owner[k]=myRank;
370                   if  (useElementsOnFace) {
371                      out->FaceElements->Nodes[INDEX2(0,k,NN)]=node0                                 ;
372                      out->FaceElements->Nodes[INDEX2(1,k,NN)]=node0+                      Nstride0;
373                      out->FaceElements->Nodes[INDEX2(2,k,NN)]=node0+Nstride2           +Nstride0;
374                      out->FaceElements->Nodes[INDEX2(3,k,NN)]=node0+Nstride2                      ;
375          
376                      out->FaceElements->Nodes[INDEX2(4,k,NN)]=node0+           Nstride1           ;
377                      out->FaceElements->Nodes[INDEX2(5,k,NN)]=node0+Nstride1+           Nstride0;
378                      out->FaceElements->Nodes[INDEX2(6,k,NN)]=node0+Nstride2+Nstride1+Nstride0;
379                      out->FaceElements->Nodes[INDEX2(7,k,NN)]=node0+Nstride2+Nstride1           ;
380                   } else {
381                      out->FaceElements->Nodes[INDEX2(0,k,NN)]=node0                                 ;
382                      out->FaceElements->Nodes[INDEX2(1,k,NN)]=node0+                      Nstride0;
383                      out->FaceElements->Nodes[INDEX2(2,k,NN)]=node0+Nstride2+           Nstride0;
384                      out->FaceElements->Nodes[INDEX2(3,k,NN)]=node0+Nstride2                      ;
385                   }
386                 }
387               }
388               faceNECount+=local_NE0*local_NE2;
389            }
390            totalNECount+=NE0*NE2;
391            /* **  elements on boundary 020 (x2=1): */
392            if (local_NE1+e_offset1 == NE1) {
393               #pragma omp parallel for private(i0,i2,k,node0)
394               for (i2=0;i2<local_NE2;i2++) {
395                 for (i0=0;i0<local_NE0;i0++) {
396                   k=i0+local_NE0*i2+faceNECount;
397                   node0=Nstride0*N_PER_E*(i0+e_offset0)+Nstride1*N_PER_E*(NE1-1)+Nstride2*N_PER_E*(i2+e_offset2);
398        
399           out->FaceElements->Id[k]=i2+NE2*i0+totalNECount;                 out->FaceElements->Id[k]=(i2+e_offset2)+NE2*(i0+e_offset0)+totalNECount;
400           out->FaceElements->Tag[k]=10;                 out->FaceElements->Tag[k]=20;
401           out->FaceElements->Color[k]=(i0%2)+2*(i2%2)+16;                 out->FaceElements->Owner[k]=myRank;
402          
403           if  (useElementsOnFace) {                 if  (useElementsOnFace) {
404              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(0,k,NUMNODES)]=node0;                    out->FaceElements->Nodes[INDEX2(0,k,NN)]=node0+           Nstride1           ;
405              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(1,k,NUMNODES)]=node0+1;                    out->FaceElements->Nodes[INDEX2(1,k,NN)]=node0+Nstride2+Nstride1           ;
406              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(2,k,NUMNODES)]=node0+N1*N0+1;                    out->FaceElements->Nodes[INDEX2(2,k,NN)]=node0+Nstride2+Nstride1+Nstride0;
407              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(3,k,NUMNODES)]=node0+N1*N0;                    out->FaceElements->Nodes[INDEX2(3,k,NN)]=node0+Nstride1+Nstride0           ;
408              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(4,k,NUMNODES)]=node0+N0;        
409              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(5,k,NUMNODES)]=node0+N0+1;                    out->FaceElements->Nodes[INDEX2(4,k,NN)]=node0                                 ;
410              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(6,k,NUMNODES)]=node0+N1*N0+N0+1;                    out->FaceElements->Nodes[INDEX2(5,k,NN)]=node0+Nstride2                      ;
411              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(7,k,NUMNODES)]=node0+N1*N0+N0;                    out->FaceElements->Nodes[INDEX2(6,k,NN)]=node0+Nstride2+           Nstride0;
412           } else {                    out->FaceElements->Nodes[INDEX2(7,k,NN)]=node0+                      Nstride0;
413              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(0,k,NUMNODES)]=node0;                 } else {
414              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(1,k,NUMNODES)]=node0+1;                    out->FaceElements->Nodes[INDEX2(0,k,NN)]=node0+           Nstride1           ;
415              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(2,k,NUMNODES)]=node0+N1*N0+1;                    out->FaceElements->Nodes[INDEX2(1,k,NN)]=node0+Nstride2+Nstride1           ;
416              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(3,k,NUMNODES)]=node0+N1*N0;                    out->FaceElements->Nodes[INDEX2(2,k,NN)]=node0+Nstride2+Nstride1+Nstride0;
417           }                    out->FaceElements->Nodes[INDEX2(3,k,NN)]=node0+           Nstride1+Nstride0;
418         }                 }
419                 }
420               }
421               faceNECount+=local_NE0*local_NE2;
422            }
423            totalNECount+=NE0*NE2;
424       }       }
425       totalNECount+=NE0*NE2;       /* add tag names */
426       faceNECount+=NE0*NE2;       Finley_Mesh_addTagMap(out,"top", 200);
427           Finley_Mesh_addTagMap(out,"bottom", 100);
428       /* **  elements on boundary 020 (x2=1): */       Finley_Mesh_addTagMap(out,"left", 1);
429           Finley_Mesh_addTagMap(out,"right", 2);
430       #pragma omp parallel for private(i0,i2,k,node0)       Finley_Mesh_addTagMap(out,"front", 10);
431       for (i2=0;i2<NE2;i2++) {       Finley_Mesh_addTagMap(out,"back", 20);
        for (i0=0;i0<NE0;i0++) {  
          k=i0+NE0*i2+faceNECount;  
          node0=i0+(NE1-1)*N0+N0*N1*i2;  
432        
433           out->FaceElements->Tag[k]=20;       /* prepare mesh for further calculatuions:*/
434           out->FaceElements->Id[k]=i2+NE2*i0+totalNECount;       if (Finley_noError()) {
435           out->FaceElements->Color[k]=(i0%2)+2*(i2%2)+20;           Finley_Mesh_resolveNodeIds(out);
436         }
437           if  (useElementsOnFace) {       if (Finley_noError()) {
438              out->FaceElements->Nodes[INDEX2(0,k,NUMNODES)]=node0+N0;           Finley_Mesh_prepare(out, optimize);
             out->FaceElements->Nodes[INDEX2(1,k,NUMNODES)]=node0+N0*N1+N0;  
             out->FaceElements->Nodes[INDEX2(2,k,NUMNODES)]=node0+N0*N1+N0+1;  
             out->FaceElements->Nodes[INDEX2(3,k,NUMNODES)]=node0+N0+1;  
             out->FaceElements->Nodes[INDEX2(4,k,NUMNODES)]=node0;  
             out->FaceElements->Nodes[INDEX2(5,k,NUMNODES)]=node0+N0*N1;  
             out->FaceElements->Nodes[INDEX2(6,k,NUMNODES)]=node0+N0*N1+1;  
             out->FaceElements->Nodes[INDEX2(7,k,NUMNODES)]=node0+1;  
          } else {  
             out->FaceElements->Nodes[INDEX2(0,k,NUMNODES)]=node0+N0;  
             out->FaceElements->Nodes[INDEX2(1,k,NUMNODES)]=node0+N0*N1+N0;  
             out->FaceElements->Nodes[INDEX2(2,k,NUMNODES)]=node0+N0*N1+N0+1;  
             out->FaceElements->Nodes[INDEX2(3,k,NUMNODES)]=node0+N0+1;  
          }  
   
        }  
439       }       }
      totalNECount+=NE0*NE2;  
      faceNECount+=NE0*NE2;  
440    }    }
   out->FaceElements->minColor=0;  
   out->FaceElements->maxColor=23;  
     
   /*  face elements done: */  
     
   /*   condense the nodes: */  
     
   Finley_Mesh_resolveNodeIds(out);  
   
   /* prepare mesh for further calculatuions:*/  
   Finley_Mesh_prepare(out) ;  
441    
442      if (!Finley_noError()) {
443          Finley_Mesh_free(out);
444      }
445      /* free up memory */
446      Paso_MPIInfo_free( mpi_info );  
447    #ifdef Finley_TRACE    #ifdef Finley_TRACE
448    printf("timing: mesh generation: %.4e sec\n",Finley_timer()-time0);    printf("timing: mesh generation: %.4e sec\n",Finley_timer()-time0);
449    #endif    #endif
450    
   if (! Finley_noError()) {  
       Finley_Mesh_dealloc(out);  
       return NULL;  
   }  
451    return out;    return out;
452  }  }

Legend:
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changed lines
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