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revision 935 by gross, Tue Jan 23 09:53:10 2007 UTC revision 1887 by ksteube, Wed Oct 15 03:26:25 2008 UTC
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 /*  
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  *          Copyright 2006, 2007 by ACcESS MNRF             *  
  *                                                          *  
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  *       Primary Business: Queensland, Australia            *  
  *  Licensed under the Open Software License version 3.0    *  
  *     http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php       *  
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1    
2  /**************************************************************/  /*******************************************************
3    *
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5    * Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)
6    * http://www.uq.edu.au/esscc
7    *
8    * Primary Business: Queensland, Australia
9    * Licensed under the Open Software License version 3.0
10    * http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php
11    *
12    *******************************************************/
13    
 /*   Finley: read mesh */  
14    
15  /**************************************************************/  /**************************************************************/
16    
17  /*   Author: gross@access.edu.au */  /*   Finley: read mesh */
 /*   Version: $Id: Mesh_read.c 730 2006-05-15 04:03:49Z bcumming $ */  
18    
19  /**************************************************************/  /**************************************************************/
20    
21  #include "Mesh.h"  #include "Mesh.h"
22  #include <stdio.h>  #include <stdio.h>
23    
24    #define FSCANF_CHECK(scan_ret, reason) { if (scan_ret == EOF) perror(reason); return NULL; }
25    
26    
27  /**************************************************************/  /**************************************************************/
28    
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30    
31  #define MAX_numNodes_gmsh 10  #define MAX_numNodes_gmsh 10
32    
33  Finley_Mesh* Finley_Mesh_readGmsh(char* fname ,index_t numDim, index_t order, index_t reduced_order, bool_t optimize_labeling) {  Finley_Mesh* Finley_Mesh_readGmsh(char* fname ,index_t numDim, index_t order, index_t reduced_order, bool_t optimize) {
34    
35    double version = 1.0;    double version = 1.0;
36    int format = 0, size = sizeof(double);    int format = 0, size = sizeof(double), scan_ret;
37    dim_t numNodes, totalNumElements=0, numTags=0, numNodesPerElement, numNodesPerElement2, element_dim;    dim_t numNodes, totalNumElements=0, numTags=0, numNodesPerElement, numNodesPerElement2, element_dim;
38    index_t e, i0, j, gmsh_type, partition_id, itmp, final_element_type,  elementary_id;    index_t e, i0, j, gmsh_type, partition_id, itmp, elementary_id;
39      index_t numElements=0, numFaceElements=0, *id=NULL, *tag=NULL, *vertices=NULL;
40    Finley_Mesh *mesh_p=NULL;    Finley_Mesh *mesh_p=NULL;
41    char name[LenString_MAX],element_type[LenString_MAX],frm[20], line[LenString_MAX+1];    char line[LenString_MAX+1];
42    char error_msg[LenErrorMsg_MAX];    char error_msg[LenErrorMsg_MAX];
43    double rtmp0, rtmp1;    double rtmp0, rtmp1;
44    double time0=Finley_timer();    double time0=Finley_timer();
45      FILE * fileHandle_p = NULL;
46      ElementTypeId* element_type=NULL;
47    
48      Paso_MPIInfo *mpi_info = Paso_MPIInfo_alloc( MPI_COMM_WORLD );
49    Finley_resetError();    Finley_resetError();
50   #if PASO_MPI    if (mpi_info->size>1) {
51      sprintf(error_msg,"reading GMSH with MPI is not supported yet.");      Finley_setError(IO_ERROR,"reading GMSH with MPI is not supported yet.");
52      Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);      Paso_MPIInfo_free( mpi_info );
53      return NULL;      return NULL;
54      } else {
55    
56  #else       /* allocate mesh */
57    /* allocate mesh */    
58    mesh_p = Finley_Mesh_alloc(fname,numDim,order);       mesh_p = Finley_Mesh_alloc(fname,numDim,order, reduced_order, mpi_info);
59    if (! Finley_noError()) return NULL;       if (! Finley_noError()) return NULL;
60      
61    /* get file handle */       /* get file handle */
62    FILE * fileHandle_p = fopen(fname, "r");       fileHandle_p = fopen(fname, "r");
63    if (fileHandle_p==NULL) {       if (fileHandle_p==NULL) {
64      sprintf(error_msg,"Opening Gmsh file %s for reading failed.",fname);         sprintf(error_msg,"Opening Gmsh file %s for reading failed.",fname);
65      Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);         Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);
66      return NULL;         Paso_MPIInfo_free( mpi_info );
67    }         return NULL;
68         }
69    /* start reading */    
70    while(1) {       /* start reading */
71      if (! Finley_noError()) break;       while(1) {
72      /* find line staring with $ */         if (! Finley_noError()) break;
73      do {         /* find line staring with $ */
74        if( ! fgets(line, sizeof(line), fileHandle_p) ) break;         do {
75        if(feof(fileHandle_p)) break;           if( ! fgets(line, sizeof(line), fileHandle_p) ) break;
76      } while(line[0] != '$');           if(feof(fileHandle_p)) break;
77           } while(line[0] != '$');
     if (feof(fileHandle_p)) break;  
   
   
     /* format */  
     if (!strncmp(&line[1], "MeshFormat", 10)) {  
       fscanf(fileHandle_p, "%lf %d %d\n", &version, &format, &size);  
     }  
     /* nodes are read */  
     if ( !strncmp(&line[1], "NOD", 3)   ||  
          !strncmp(&line[1], "NOE", 3)   ||  
          !strncmp(&line[1], "Nodes", 5)    ) {  
       
       fscanf(fileHandle_p, "%d", &numNodes);  
       if (! Finley_noError()) break;  
       Finley_NodeFile_allocTable(mesh_p->Nodes, numNodes);  
       if (! Finley_noError()) break;  
       for (i0 = 0; i0 < numNodes; i0++) {  
          if (1 == numDim) {  
            fscanf(fileHandle_p, "%d %le %le %le\n", &mesh_p->Nodes->Id[i0],  
                   &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0,i0,numDim)],  
                       &rtmp0,  
                       &rtmp1);  
          } else if (2 == numDim) {  
            fscanf(fileHandle_p, "%d %le %le %le\n", &mesh_p->Nodes->Id[i0],  
                   &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0,i0,numDim)],  
                   &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1,i0,numDim)],  
                       &rtmp0);  
          } else if (3 == numDim) {  
            fscanf(fileHandle_p, "%d %le %le %le\n", &mesh_p->Nodes->Id[i0],  
                   &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0,i0,numDim)],  
                   &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1,i0,numDim)],  
                   &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(2,i0,numDim)]);  
78        
79                 if (feof(fileHandle_p)) break;
80      
81      
82           /* format */
83           if (!strncmp(&line[1], "MeshFormat", 10)) {
84             scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%lf %d %d\n", &version, &format, &size);
85         FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Finley_Mesh_readGmsh");
86           }
87           /* nodes are read */
88           if ( !strncmp(&line[1], "NOD", 3)   ||
89                !strncmp(&line[1], "NOE", 3)   ||
90                !strncmp(&line[1], "Nodes", 5)    ) {
91            
92             scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d", &numNodes);
93         FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Finley_Mesh_readGmsh");
94             if (! Finley_noError()) break;
95             Finley_NodeFile_allocTable(mesh_p->Nodes, numNodes);
96             if (! Finley_noError()) break;
97             for (i0 = 0; i0 < numNodes; i0++) {
98                if (1 == numDim) {
99               scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d %le %le %le\n", &mesh_p->Nodes->Id[i0],
100                      &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0,i0,numDim)],
101                             &rtmp0,
102                             &rtmp1);
103               FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Finley_Mesh_readGmsh");
104                } else if (2 == numDim) {
105               scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d %le %le %le\n", &mesh_p->Nodes->Id[i0],
106                      &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0,i0,numDim)],
107                      &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1,i0,numDim)],
108                             &rtmp0);
109               FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Finley_Mesh_readGmsh");
110                } else if (3 == numDim) {
111               scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d %le %le %le\n", &mesh_p->Nodes->Id[i0],
112                      &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0,i0,numDim)],
113                      &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1,i0,numDim)],
114                      &mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(2,i0,numDim)]);
115               FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Finley_Mesh_readGmsh");
116                }
117                mesh_p->Nodes->globalDegreesOfFreedom[i0]=mesh_p->Nodes->Id[i0];
118                mesh_p->Nodes->Tag[i0]=0;
119           }           }
120           mesh_p->Nodes->degreeOfFreedom[i0]=mesh_p->Nodes->Id[i0];         }
121           mesh_p->Nodes->Tag[i0]=0;         /* elements */
122        }         else if(!strncmp(&line[1], "ELM", 3) ||
123      }          !strncmp(&line[1], "Elements", 8)) {
124      /* elements */    
125      else if(!strncmp(&line[1], "ELM", 3) ||           ElementTypeId final_element_type = NoType;
126          !strncmp(&line[1], "Elements", 8)) {           ElementTypeId final_face_element_type = NoType;
127             ElementTypeId contact_element_type = NoType;
128        ElementTypeId final_element_type = NoType;           numElements=0;
129        ElementTypeId final_face_element_type = NoType;           numFaceElements=0;
130        index_t numElements=0;           scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d", &totalNumElements);
131        index_t numFaceElements=0;       FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Finley_Mesh_readGmsh");
132        fscanf(fileHandle_p, "%d", &totalNumElements);    
133             id=TMPMEMALLOC(totalNumElements,index_t);
134        index_t* id=TMPMEMALLOC(totalNumElements,index_t);           tag=TMPMEMALLOC(totalNumElements,index_t);
135        index_t* tag=TMPMEMALLOC(totalNumElements,index_t);    
136        ElementTypeId* element_type=TMPMEMALLOC(totalNumElements,ElementTypeId);    
137        index_t* vertices=TMPMEMALLOC(totalNumElements*MAX_numNodes_gmsh,index_t);           element_type=TMPMEMALLOC(totalNumElements,ElementTypeId);
138        if (! (Finley_checkPtr(id) || Finley_checkPtr(tag) || Finley_checkPtr(element_type) || Finley_checkPtr(vertices) ) ) {           vertices=TMPMEMALLOC(totalNumElements*MAX_numNodes_gmsh,index_t);
139           /* read all in */           if (! (Finley_checkPtr(id) || Finley_checkPtr(tag) || Finley_checkPtr(element_type) || Finley_checkPtr(vertices) ) ) {
140           for(e = 0; e < totalNumElements; e++) {              /* read all in */
141             fscanf(fileHandle_p, "%d %d", &id[e], &gmsh_type);              for(e = 0; e < totalNumElements; e++) {
142             switch (gmsh_type) {                scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d %d", &id[e], &gmsh_type);
143                 case 1:  /* line order 1 */            FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Finley_Mesh_readGmsh");
144                     element_type[e]=Line2;                switch (gmsh_type) {
145                     element_dim=1;                    case 1:  /* line order 1 */
146                     numNodesPerElement=2;                          element_type[e]=Line2;
147                     break;                        element_dim=1;
148                 case 2:  /* traingle order 1 */                        numNodesPerElement=2;  
149                     element_type[e]=Tri3;                        break;
150                     numNodesPerElement= 3;                    case 2:  /* traingle order 1 */
151                     element_dim=2;                        element_type[e]=Tri3;
152                     break;                        numNodesPerElement= 3;
153                 case 3:  /* quadrilateral order 1 */                        element_dim=2;
154                     element_type[e]=Rec4;                        break;
155                     numNodesPerElement= 4;                    case 3:  /* quadrilateral order 1 */
156                     element_dim=2;                        element_type[e]=Rec4;
157                     break;                        numNodesPerElement= 4;
158                 case 4:  /* tetrahedron order 1 */                        element_dim=2;
159                     element_type[e]=Tet4;                        break;
160                     numNodesPerElement= 4;                    case 4:  /* tetrahedron order 1 */
161                     element_dim=3;                        element_type[e]=Tet4;
162                     break;                        numNodesPerElement= 4;
163                 case 5:  /* hexahedron order 1 */                        element_dim=3;
164                     element_type[e]=Hex8;                        break;
165                     numNodesPerElement= 8;                    case 5:  /* hexahedron order 1 */
166                     element_dim=3;                        element_type[e]=Hex8;
167                     break;                        numNodesPerElement= 8;
168                 case 8:  /* line order 2 */                        element_dim=3;
169                     element_type[e]=Line3;                        break;
170                     numNodesPerElement= 3;                    case 8:  /* line order 2 */
171                     element_dim=1;                        element_type[e]=Line3;
172                     break;                        numNodesPerElement= 3;
173                 case 9:  /* traingle order 2 */                        element_dim=1;
174                     element_type[e]=Tri6;                        break;
175                     numNodesPerElement= 6;                    case 9:  /* traingle order 2 */
176                     element_dim=2;                        element_type[e]=Tri6;
177                     break;                        numNodesPerElement= 6;
178                 case 10:  /* quadrilateral order 2 */                        element_dim=2;
179                     element_type[e]=Rec9;                        break;
180                     numNodesPerElement= 9;                    case 10:  /* quadrilateral order 2 */
181                     element_dim=2;                        element_type[e]=Rec9;
182                     break;                        numNodesPerElement= 9;
183                 case 11:  /* tetrahedron order 2 */                        element_dim=2;
184                     element_type[e]=Tet10;                        break;
185                     numNodesPerElement= 10;                    case 11:  /* tetrahedron order 2 */
186                     element_dim=3;                        element_type[e]=Tet10;
187                     break;                        numNodesPerElement= 10;
188                 case 15 :  /* point */                        element_dim=3;
189                     element_type[e]=Point1;                        break;
190                     numNodesPerElement= 1;                    case 15 :  /* point */
191                     element_dim=0;                        element_type[e]=Point1;
192                     break;                        numNodesPerElement= 1;
193                 default:                        element_dim=0;
194                    element_type[e]=NoType;                        break;
195                    sprintf(error_msg,"Unexected gmsh element type %d in mesh file %s.",gmsh_type,fname);                    default:
196                    Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);                       element_type[e]=NoType;
197             }                       sprintf(error_msg,"Unexected gmsh element type %d in mesh file %s.",gmsh_type,fname);
198             if (element_dim == numDim) {                       Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);
199                  }
200                  if (element_dim == numDim) {
201                     if (final_element_type == NoType) {
202                        final_element_type = element_type[e];
203                     } else if (final_element_type != element_type[e]) {
204                         sprintf(error_msg,"Finley can handle a single type of internal elements only.");
205                         Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);
206                         break;
207                     }
208                     numElements++;
209                  } else if (element_dim == numDim-1) {
210                     if (final_face_element_type == NoType) {
211                        final_face_element_type = element_type[e];
212                     } else if (final_face_element_type != element_type[e]) {
213                         sprintf(error_msg,"Finley can handle a single type of face elements only.");
214                         Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);
215                         break;
216                     }
217                     numFaceElements++;
218                  }
219                  
220           if(version <= 1.0){
221             scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d %d %d", &tag[e], &elementary_id, &numNodesPerElement2);
222             FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Finley_Mesh_readGmsh");
223             partition_id = 1;
224                    if (numNodesPerElement2 != numNodesPerElement) {
225                         sprintf(error_msg,"Illegal number of nodes for element %d in mesh file %s.",id[e],fname);
226                         Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);
227                    }
228           } else {
229             scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d", &numTags);
230             FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Finley_Mesh_readGmsh");
231             elementary_id = tag[e] = partition_id = 1;
232                    numNodesPerElement2=-1;
233             for(j = 0; j < numTags; j++){
234               scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d", &itmp);        
235               FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Finley_Mesh_readGmsh");
236               if (j == 0) {
237                 tag[e] = itmp;
238               } else if (j == 1) {
239                 elementary_id = itmp;
240               } else if (j == 2) {
241                 partition_id = itmp;
242                      }
243               /* ignore any other tags */
244             }
245           }
246                  if (! Finley_noError()) break;
247                  for(j = 0; j < numNodesPerElement; j++) {
248            scan_ret = fscanf(fileHandle_p, "%d", &vertices[INDEX2(j,e,MAX_numNodes_gmsh)]);
249                FSCANF_CHECK(scan_ret, "fscanf: Finley_Mesh_readGmsh");
250              }
251                  /* for tet10 the last two nodes need to be swapped */
252                  if (element_type[e]==Tet10) {
253                       itmp=vertices[INDEX2(9,e,MAX_numNodes_gmsh)];
254                       vertices[INDEX2(9,e,MAX_numNodes_gmsh)]=vertices[INDEX2(8,e,MAX_numNodes_gmsh)];
255                       vertices[INDEX2(8,e,MAX_numNodes_gmsh)]=itmp;
256                  }
257                }
258                /* all elements have been read, now we have to identify the elements for finley */
259            
260                if (Finley_noError()) {
261                  /* first we have to identify the elements to define Elementis and FaceElements */
262                if (final_element_type == NoType) {                if (final_element_type == NoType) {
263                   final_element_type = element_type[e];                   if (numDim==1) {
264                } else if (final_element_type != element_type[e]) {                      final_element_type=Line2;
265                    sprintf(error_msg,"Finley can handle a single type of internal elements only.");                   } else if (numDim==2) {
266                    Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);                      final_element_type=Tri3;
267                    break;                   } else if (numDim==3) {
268                        final_element_type=Tet4;
269                     }
270                }                }
               numElements++;  
            } else if (element_dim == numDim-1) {  
271                if (final_face_element_type == NoType) {                if (final_face_element_type == NoType) {
272                   final_face_element_type = element_type[e];                   if (numDim==1) {
273                } else if (final_face_element_type != element_type[e]) {                      final_face_element_type=Point1;
274                    sprintf(error_msg,"Finley can handle a single type of face elements only.");                   } else if (numDim==2) {
275                    Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);                      final_face_element_type=Line2;
276                    break;                   } else if (numDim==3) {
277                        final_face_element_type=Tri3;
278                     }
279                }                }
280                numFaceElements++;                if (final_face_element_type == Line2) {
281             }                    contact_element_type=Line2_Contact;
282                            } else  if (final_face_element_type == Line3) {
283         if(version <= 1.0){                    contact_element_type=Line3_Contact;
284           fscanf(fileHandle_p, "%d %d %d", &tag[e], &elementary_id, &numNodesPerElement2);                } else  if (final_face_element_type == Tri3) {
285           partition_id = 1;                    contact_element_type=Tri3_Contact;
286               if (numNodesPerElement2 != numNodesPerElement) {                } else  if (final_face_element_type == Tri6) {
287                    sprintf(error_msg,"Illegal number of nodes for element %d in mesh file %s.",id[e],fname);                    contact_element_type=Tri6_Contact;
288                    Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);                } else {
289               }                    contact_element_type=Point1_Contact;
290         } else {                }
291           fscanf(fileHandle_p, "%d", &numTags);  
292           elementary_id = tag[e] = partition_id = 1;                mesh_p->Elements=Finley_ElementFile_alloc(final_element_type,mesh_p->order, mesh_p->reduced_order, mpi_info);
293               numNodesPerElement2=-1;                mesh_p->FaceElements=Finley_ElementFile_alloc(final_face_element_type,mesh_p->order, mesh_p->reduced_order, mpi_info);
294           for(j = 0; j < numTags; j++){                mesh_p->ContactElements=Finley_ElementFile_alloc(contact_element_type,mesh_p->order, mesh_p->reduced_order, mpi_info);
295             fscanf(fileHandle_p, "%d", &itmp);                      mesh_p->Points=Finley_ElementFile_alloc(Point1,mesh_p->order, mesh_p->reduced_order, mpi_info);
296             if (j == 0) {                if (Finley_noError()) {
297               tag[e] = itmp;                    Finley_ElementFile_allocTable(mesh_p->Elements, numElements);
298             } else if (j == 1) {                    Finley_ElementFile_allocTable(mesh_p->FaceElements, numFaceElements);
299               elementary_id = itmp;                    Finley_ElementFile_allocTable(mesh_p->ContactElements, 0);
300             } else if (j == 2) {                    Finley_ElementFile_allocTable(mesh_p->Points, 0);
301               partition_id = itmp;                    if (Finley_noError()) {
302                 }                        mesh_p->Elements->minColor=0;
303             // ignore any other tags                        mesh_p->Elements->maxColor=numElements-1;
304           }                        mesh_p->FaceElements->minColor=0;
305         }                        mesh_p->FaceElements->maxColor=numFaceElements-1;
306             if (! Finley_noError()) break;                        mesh_p->ContactElements->minColor=0;
307             for(j = 0; j < numNodesPerElement; j++) fscanf(fileHandle_p, "%d", &vertices[INDEX2(j,e,MAX_numNodes_gmsh)]);                        mesh_p->ContactElements->maxColor=0;
308           }                        mesh_p->Points->minColor=0;
309           /* all elements have been read, now we have to identify the elements for finley */                        mesh_p->Points->maxColor=0;
310           if (Finley_noError()) {                        numElements=0;
311              /* first we have to identify the elements to define Elementis and FaceElements */                        numFaceElements=0;
312             mesh_p->Elements=Finley_ElementFile_alloc(final_element_type,mesh_p->order);                        for(e = 0; e < totalNumElements; e++) {
313             mesh_p->FaceElements=Finley_ElementFile_alloc(final_face_element_type,mesh_p->order);                           if (element_type[e] == final_element_type) {
314             mesh_p->ContactElements=Finley_ElementFile_alloc(Point1_Contact,mesh_p->order);                              mesh_p->Elements->Id[numElements]=id[e];
315             mesh_p->Points=Finley_ElementFile_alloc(Point1,mesh_p->order);                              mesh_p->Elements->Tag[numElements]=tag[e];
316             if (Finley_noError()) {                              mesh_p->Elements->Color[numElements]=numElements;
317                 Finley_ElementFile_allocTable(mesh_p->Elements, numElements);                              mesh_p->Elements->Owner[numElements]=0;
318                 Finley_ElementFile_allocTable(mesh_p->FaceElements, numFaceElements);                              for (j = 0; j<  mesh_p->Elements->ReferenceElement->Type->numNodes; ++j)  {
319                 Finley_ElementFile_allocTable(mesh_p->ContactElements, 0);                                    mesh_p->Elements->Nodes[INDEX2(j, numElements, mesh_p->Elements->ReferenceElement->Type->numNodes)]=vertices[INDEX2(j,e,MAX_numNodes_gmsh)];
320                 Finley_ElementFile_allocTable(mesh_p->Points, 0);                              }
321                 if (Finley_noError()) {                              numElements++;
322                     mesh_p->Elements->minColor=0;                           } else if (element_type[e] == final_face_element_type) {
323                     mesh_p->Elements->maxColor=numElements-1;                              mesh_p->FaceElements->Id[numFaceElements]=id[e];
324                     mesh_p->FaceElements->minColor=0;                              mesh_p->FaceElements->Tag[numFaceElements]=tag[e];
325                     mesh_p->FaceElements->maxColor=numFaceElements-1;                              mesh_p->FaceElements->Color[numFaceElements]=numFaceElements;
326                     mesh_p->ContactElements->minColor=0;                              mesh_p->FaceElements->Owner[numElements]=0;
327                     mesh_p->ContactElements->maxColor=0;                              for (j = 0; j<  mesh_p->FaceElements->ReferenceElement->Type->numNodes; ++j) {
328                     mesh_p->Points->minColor=0;                                       mesh_p->FaceElements->Nodes[INDEX2(j, numFaceElements, mesh_p->FaceElements->ReferenceElement->Type->numNodes)]=vertices[INDEX2(j,e,MAX_numNodes_gmsh)];
329                     mesh_p->Points->maxColor=0;                              }
330                     numElements=0;                              numFaceElements++;
331                     numFaceElements=0;                           }
                    for(e = 0; e < totalNumElements; e++) {  
                       if (element_type[e] == final_element_type) {  
                          mesh_p->Elements->Id[numElements]=id[e];  
                          mesh_p->Elements->Tag[numElements]=tag[e];  
                          mesh_p->Elements->Color[numElements]=numElements;  
                          for (j = 0; j<  mesh_p->Elements->ReferenceElement->Type->numNodes; ++j)  
                                   mesh_p->Elements->Nodes[INDEX2(j, numElements, mesh_p->Elements->ReferenceElement->Type->numNodes)]=  
                                                                                                   vertices[INDEX2(j,e,MAX_numNodes_gmsh)];  
                          numElements++;  
                       } else if (element_type[e] == final_face_element_type) {  
                          mesh_p->FaceElements->Id[numFaceElements]=id[e];  
                          mesh_p->FaceElements->Tag[numFaceElements]=tag[e];  
                          mesh_p->FaceElements->Color[numFaceElements]=numFaceElements;  
                          for (j = 0; j<  mesh_p->FaceElements->ReferenceElement->Type->numNodes; ++j)  
                                   mesh_p->FaceElements->Nodes[INDEX2(j, numFaceElements, mesh_p->FaceElements->ReferenceElement->Type->numNodes)]=  
                                                                                                   vertices[INDEX2(j,e,MAX_numNodes_gmsh)];  
                          numFaceElements++;  
332                        }                        }
333                     }                   }
334                }                }
335             }              }
336           }           }
337             /* and clean up */
338             TMPMEMFREE(id);
339             TMPMEMFREE(tag);
340             TMPMEMFREE(element_type);
341             TMPMEMFREE(vertices);
342        }        }
343        /* and clean up */        /* serach for end of data block */
344        TMPMEMFREE(id);        do {
345        TMPMEMFREE(tag);           if (!fgets(line, sizeof(line), fileHandle_p)) {
346        TMPMEMFREE(element_type);              sprintf(error_msg,"Unexected end of file in %s",fname);
347        TMPMEMFREE(vertices);              Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);
348     }           }
349     /* serach for end of data block */           if (feof(fileHandle_p)) {
350     do {              sprintf(error_msg,"Unexected end of file in %s",fname);
351        if (!fgets(line, sizeof(line), fileHandle_p)) {              Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);
352           sprintf(error_msg,"Unexected end of file in %s",fname);           }
353           Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);           if (! Finley_noError()) break;
354        }         } while(line[0] != '$');
355        if (feof(fileHandle_p)) {       }
356           sprintf(error_msg,"%s:Unexected end of file in %s",fname);    
357           Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);       /* close file */
358        }       fclose(fileHandle_p);
359        if (! Finley_noError()) break;       /* clean up */
360      } while(line[0] != '$');       if (! Finley_noError()) {
361    }          Finley_Mesh_free(mesh_p);
362            return NULL;
363    /* close file */       }
364    fclose(fileHandle_p);       /*   resolve id's : */
365    /* clean up */       Finley_Mesh_resolveNodeIds(mesh_p);
366    if (! Finley_noError()) {       /* rearrange elements: */
367       Finley_Mesh_dealloc(mesh_p);       Finley_Mesh_prepare(mesh_p, optimize);
368       return NULL;       /* that's it */
369         #ifdef Finley_TRACE
370         printf("timing: reading mesh: %.4e sec\n",Finley_timer()-time0);
371         #endif
372         Paso_MPIInfo_free( mpi_info );
373         return mesh_p;
374    }    }
   /*   resolve id's : */  
   Finley_Mesh_resolveNodeIds(mesh_p);  
   /* rearrange elements: */  
   Finley_Mesh_prepare(mesh_p);  
   /* that's it */  
   #ifdef Finley_TRACE  
   printf("timing: reading mesh: %.4e sec\n",Finley_timer()-time0);  
   #endif  
   #endif  
   return mesh_p;  
375  }  }
 /*  
 * $Log$  
 *  
 */  
   

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