/[escript]/trunk/finley/src/Mesh_saveVTK.c
ViewVC logotype

Diff of /trunk/finley/src/Mesh_saveVTK.c

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

temp_trunk_copy/finley/src/Mesh_saveVTK.c revision 1384 by phornby, Fri Jan 11 02:29:38 2008 UTC trunk/finley/src/Mesh_saveVTK.c revision 2744 by caltinay, Mon Nov 16 23:45:55 2009 UTC
# Line 1  Line 1 
1    
 /* $Id$ */  
   
2  /*******************************************************  /*******************************************************
3   *  *
4   *           Copyright 2003-2007 by ACceSS MNRF  * Copyright (c) 2003-2009 by University of Queensland
5   *       Copyright 2007 by University of Queensland  * Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)
6   *  * http://www.uq.edu.au/esscc
7   *                http://esscc.uq.edu.au  *
8   *        Primary Business: Queensland, Australia  * Primary Business: Queensland, Australia
9   *  Licensed under the Open Software License version 3.0  * Licensed under the Open Software License version 3.0
10   *     http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php  * http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php
11   *  *
12   *******************************************************/  *******************************************************/
13    
14  /**************************************************************/  /***************************************************************************/
15    /*   Writes data and mesh in VTK XML format to a VTU file.                 */
16  /*   writes data and mesh in a vtk file */  /*   Nodal data needs to be given on FINLEY_NODES or FINLEY_REDUCED_NODES  */
17  /*   nodal data needs to be given on FINLEY_NODES or FINLEY_REDUCED_NODES */  /***************************************************************************/
   
 /**************************************************************/  
   
18    
19  #include "Mesh.h"  #include "Mesh.h"
20  #include "Assemble.h"  #include "Assemble.h"
21  #include "vtkCellType.h"  /* copied from vtk source directory !!! */  #include "vtkCellType.h"  /* copied from vtk source directory */
22    #include "paso/PasoUtil.h"
23    
 #define LEN_PRINTED_INT_FORMAT (9+1)  
24  #define INT_FORMAT "%d "  #define INT_FORMAT "%d "
25    #define LEN_INT_FORMAT (unsigned int)(9+2)
26  #define INT_NEWLINE_FORMAT "%d\n"  #define INT_NEWLINE_FORMAT "%d\n"
27  #define FLOAT_SCALAR_FORMAT "%12.6e\n"  #define SCALAR_FORMAT "%12.6e\n"
28  #define FLOAT_VECTOR_FORMAT "%12.6e %12.6e %12.6e\n"  #define VECTOR_FORMAT "%12.6e %12.6e %12.6e\n"
29  #define FLOAT_TENSOR_FORMAT "%12.6e %12.6e %12.6e %12.6e %12.6e %12.6e %12.6e %12.6e %12.6e\n"  #define TENSOR_FORMAT "%12.6e %12.6e %12.6e %12.6e %12.6e %12.6e %12.6e %12.6e %12.6e\n"
30  #define LEN_PRINTED_FLOAT_SCALAR_FORMAT (12+1)  /* strlen("-1.234567e+789 ") == 15 */
31  #define LEN_PRINTED_FLOAT_VECTOR_FORMAT (3*(12+1)+1)  #define LEN_TENSOR_FORMAT (unsigned int)(9*15+2)
 #define LEN_PRINTED_FLOAT_TENSOR_FORMAT (9*(12+1)+1)  
32  #define NEWLINE "\n"  #define NEWLINE "\n"
33  #define LEN_TMP_BUFFER LEN_PRINTED_FLOAT_TENSOR_FORMAT+(MAX_numNodes*LEN_PRINTED_INT_FORMAT+1)+2  #define LEN_TMP_BUFFER LEN_TENSOR_FORMAT+(MAX_numNodes*LEN_INT_FORMAT+1)+2
34  #define NCOMP_MAX 9  #define NCOMP_MAX (unsigned int)9
35  #define __STRCAT(dest,chunk,dest_in_use)  \  
36  {                  \  #define __STRCAT(dest, chunk, dest_in_use) \
37    strcpy(&dest[dest_in_use], chunk); \  do {\
38    dest_in_use+=strlen(chunk); \      strcpy(&dest[dest_in_use], chunk);\
39        dest_in_use += strlen(chunk);\
40    } while(0)
41    
42    #ifdef PASO_MPI
43    /* writes buffer to file catching the empty buffer case which causes problems
44     * with some MPI versions */
45    #define MPI_WRITE_ORDERED(BUF) \
46    do {\
47        int LLEN=0; \
48        LLEN=(int) strlen(BUF); \
49        if (LLEN==0) { strcpy(BUF, ""); LLEN=0; }\
50        MPI_File_write_ordered(mpi_fileHandle_p, BUF, LLEN, MPI_CHAR, &mpi_status);\
51    } while(0)
52    
53    /* writes buffer to file on master only */
54    #define MPI_RANK0_WRITE_SHARED(BUF) \
55    do {\
56        int LLEN=0; \
57        if (my_mpi_rank == 0) {\
58            LLEN=(int) strlen(BUF); \
59            if (LLEN==0) { strcpy(BUF,""); LLEN=0; }\
60            MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p, BUF, LLEN, MPI_CHAR, &mpi_req);\
61            MPI_Wait(&mpi_req, &mpi_status);\
62        }\
63    } while(0)
64    
65    /* For reference only. Investigation needed as to which values may improve
66     * performance */
67    #if 0
68    void create_MPIInfo(MPI_Info& info)
69    {
70        MPI_Info_create(&info);
71        MPI_Info_set(info, "access_style", "write_once, sequential");
72        MPI_Info_set(info, "collective_buffering", "true");
73        MPI_Info_set(info, "cb_block_size",        "131072");
74        MPI_Info_set(info, "cb_buffer_size",       "1048567");
75        MPI_Info_set(info, "cb_nodes",             "8");
76        MPI_Info_set(info, "striping_factor",      "16");
77        MPI_Info_set(info, "striping_unit",        "424288");
78    }
79    #endif
80    
81    #else
82    
83    #define MPI_WRITE_ORDERED(A)
84    #define MPI_RANK0_WRITE_SHARED(A)
85    
86    #endif /* PASO_MPI */
87    
88    
89    /* Returns one if the node given by coords and idx is within the quadrant
90     * indexed by q and if the element type is Rec9 or Hex27, zero otherwise */
91    int nodeInQuadrant(const double *coords, ElementTypeId type, int idx, int q)
92    {
93    #define INSIDE_1D(_X_,_C_,_R_) ( ABS((_X_)-(_C_)) <= (_R_) )
94    #define INSIDE_2D(_X_,_Y_,_CX_,_CY_,_R_) ( INSIDE_1D(_X_,_CX_,_R_) && INSIDE_1D(_Y_,_CY_,_R_))
95    #define INSIDE_3D(_X_,_Y_,_Z_,_CX_,_CY_,_CZ_,_R_) ( INSIDE_1D(_X_,_CX_,_R_) && INSIDE_1D(_Y_,_CY_,_R_) && INSIDE_1D(_Z_,_CZ_,_R_) )
96    
97        int ret;
98        if (type == Rec9) {
99            if (q==0)
100                ret = INSIDE_2D(coords[2*idx], coords[2*idx+1], 0.25, 0.25, 0.25);
101            else if (q==1)
102                ret = INSIDE_2D(coords[2*idx], coords[2*idx+1], 0.75, 0.25, 0.25);
103            else if (q==2)
104                ret = INSIDE_2D(coords[2*idx], coords[2*idx+1], 0.25, 0.75, 0.25);
105            else if (q==3)
106                ret = INSIDE_2D(coords[2*idx], coords[2*idx+1], 0.75, 0.75, 0.25);
107            else
108                ret = 0;
109        } else if (type == Hex27) {
110            if (q==0)
111                ret = INSIDE_3D(coords[3*idx], coords[3*idx+1], coords[3*idx+2],
112                        0.25, 0.25, 0.25, 0.25);
113            else if (q==1)
114                ret = INSIDE_3D(coords[3*idx], coords[3*idx+1], coords[3*idx+2],
115                        0.75, 0.25, 0.25, 0.25);
116            else if (q==2)
117                ret = INSIDE_3D(coords[3*idx], coords[3*idx+1], coords[3*idx+2],
118                        0.25, 0.75, 0.25, 0.25);
119            else if (q==3)
120                ret = INSIDE_3D(coords[3*idx], coords[3*idx+1], coords[3*idx+2],
121                        0.75, 0.75, 0.25, 0.25);
122            else if (q==4)
123                ret = INSIDE_3D(coords[3*idx], coords[3*idx+1], coords[3*idx+2],
124                        0.25, 0.25, 0.75, 0.25);
125            else if (q==5)
126                ret = INSIDE_3D(coords[3*idx], coords[3*idx+1], coords[3*idx+2],
127                        0.75, 0.25, 0.75, 0.25);
128            else if (q==6)
129                ret = INSIDE_3D(coords[3*idx], coords[3*idx+1], coords[3*idx+2],
130                        0.25, 0.75, 0.75, 0.25);
131            else if (q==7)
132                ret = INSIDE_3D(coords[3*idx], coords[3*idx+1], coords[3*idx+2],
133                        0.75, 0.75, 0.75, 0.25);
134            else
135                ret = 0;
136        } else {
137            ret = 1;
138        }
139        return ret;
140  }  }
141    
142  void Finley_Mesh_saveVTK(const char * filename_p,  void Finley_Mesh_saveVTK(const char *filename_p,
143                           Finley_Mesh *mesh_p,                           Finley_Mesh *mesh_p,
144                           const dim_t num_data,                           const dim_t num_data,
145                           char* *names_p,                           char **names_p,
146                           escriptDataC* *data_pp)                           escriptDataC **data_pp,
147                             const char* metadata,
148                             const char*metadata_schema)
149  {  {
150    char error_msg[LenErrorMsg_MAX], *txt_buffer=NULL, tmp_buffer[LEN_TMP_BUFFER];  #ifdef PASO_MPI
151    double sampleAvg[NCOMP_MAX], *values, rtmp;      MPI_File mpi_fileHandle_p;
152    size_t len_txt_buffer, max_len_names, txt_buffer_in_use;      MPI_Status mpi_status;
153    FILE * fileHandle_p = NULL;      MPI_Request mpi_req;
154    int mpi_size, i_data, i,j , cellType;      MPI_Info mpi_info = MPI_INFO_NULL;
155    dim_t nDim, globalNumPoints, numCells, globalNumCells, numVTKNodesPerElement, myNumPoints, numPointsPerSample, rank, nComp, nCompReqd, shape, NN, numCellFactor, myNumCells, max_name_len;  #endif
156    bool_t do_write, *isCellCentered=NULL,write_celldata=FALSE,write_pointdata=FALSE;      Paso_MPI_rank my_mpi_rank;
157    bool_t set_scalar=FALSE,set_vector=FALSE, set_tensor=FALSE;      FILE *fileHandle_p = NULL;
158    index_t myFirstNode, myLastNode, *globalNodeIndex, k, *node_index, myFirstCell;      char errorMsg[LenErrorMsg_MAX], *txtBuffer;
159    #ifdef PASO_MPI      char tmpBuffer[LEN_TMP_BUFFER];
160    int ierr;      size_t txtBufferSize, txtBufferInUse, maxNameLen;
161    int amode = MPI_MODE_CREATE | MPI_MODE_WRONLY |  MPI_MODE_SEQUENTIAL;      double *quadNodes_p = NULL;
162    MPI_File mpi_fileHandle_p;      dim_t dataIdx, nDim;
163    MPI_Status mpi_status;      dim_t numCells=0, globalNumCells=0, numVTKNodesPerElement=0;
164    MPI_Request mpi_req;      dim_t myNumPoints=0, globalNumPoints=0;
165    MPI_Info mpi_info=MPI_INFO_NULL;      dim_t shape, NN=0, numCellFactor=1, myNumCells=0;
166    #endif      bool_t *isCellCentered;
167    Paso_MPI_rank my_mpi_rank;      bool_t writeCellData=FALSE, writePointData=FALSE, hasReducedElements=FALSE;
168    int nodetype=FINLEY_NODES;      index_t myFirstNode=0, myLastNode=0, *globalNodeIndex=NULL;
169    int elementtype=FINLEY_UNKNOWN;      index_t myFirstCell=0, k;
170    char elemTypeStr[32];      int mpi_size, i, j, l;
171    Finley_NodeMapping *nodeMapping=NULL;      int cellType=0, nodeType=FINLEY_NODES, elementType=FINLEY_UNKNOWN;
172    Finley_ElementFile* elements=NULL;      Finley_ElementFile *elements = NULL;
173    ElementTypeId TypeId;      ElementTypeId typeId = NoType;
174      
175        const char *vtkHeader = \
176    /****************************************/        "<?xml version=\"1.0\"?>\n" \
177    /*                                      */        "<VTKFile type=\"UnstructuredGrid\" version=\"0.1\"%s%s>\n%s%s" \
178    /*       tags in the vtk file           */        "<UnstructuredGrid>\n" \
179          "<Piece NumberOfPoints=\"%d\" NumberOfCells=\"%d\">\n" \
180    char* tags_header="<?xml version=\"1.0\"?>\n" \        "<Points>\n" \
181                      "<VTKFile type=\"UnstructuredGrid\" version=\"0.1\">\n" \        "<DataArray NumberOfComponents=\"%d\" type=\"Float64\" format=\"ascii\">\n";
182                      "<UnstructuredGrid>\n" \      char *vtkFooter = "</Piece>\n</UnstructuredGrid>\n</VTKFile>\n";
183                      "<Piece NumberOfPoints=\"%d\" NumberOfCells=\"%d\">\n" \      const char *tag_Float_DataArray="<DataArray Name=\"%s\" type=\"Float64\" NumberOfComponents=\"%d\" format=\"ascii\">\n";
184                      "<Points>\n" \      char *tags_End_Points_and_Start_Conn = "</DataArray>\n</Points>\n<Cells>\n<DataArray Name=\"connectivity\" type=\"Int32\" format=\"ascii\">\n" ;
185                      "<DataArray NumberOfComponents=\"%d\" type=\"Float64\" format=\"ascii\">\n";      char *tags_End_Conn_and_Start_Offset = "</DataArray>\n<DataArray Name=\"offsets\" type=\"Int32\" format=\"ascii\">\n";
186    char *tag_End_DataArray = "</DataArray>\n";      char *tags_End_Offset_and_Start_Type = "</DataArray>\n<DataArray Name=\"types\" type=\"UInt8\" format=\"ascii\">\n";
187    char* tag_End_PointData =  "</PointData>\n";      char *tag_End_DataArray = "</DataArray>\n";
188    char* tag_End_CellData =  "</CellData>\n";  
189    char *footer = "</Piece>\n</UnstructuredGrid>\n</VTKFile>\n";      const int VTK_HEX20_INDEX[] =
190    char* tags_End_Points_and_Start_Conn = "</DataArray>\n</Points>\n<Cells>\n<DataArray Name=\"connectivity\" type=\"Int32\" format=\"ascii\">\n" ;        { 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 16, 17, 18, 19, 12, 13, 14, 15 };
191    char* tags_End_Conn_and_Start_Offset = "</DataArray>\n<DataArray Name=\"offsets\" type=\"Int32\" format=\"ascii\">\n";      const int VTK_REC9_INDEX[] =
192    char* tags_End_Offset_and_Start_Type = "</DataArray>\n<DataArray Name=\"types\" type=\"UInt8\" format=\"ascii\">\n";        { 0, 4, 8, 7,  4, 1, 5, 8,  7, 8, 6, 3,  8, 5, 2, 6 };
193    char* tag_Float_DataArray="<DataArray Name=\"%s\" type=\"Float64\" NumberOfComponents=\"%d\" format=\"ascii\">\n";      const int VTK_HEX27_INDEX[] =
194    char *tags_End_Type_And_Cells = "</DataArray>\n</Cells>\n";        {  0,  8, 20, 11, 12, 21, 26, 24,
195             8,  1,  9, 20, 21, 13, 22, 26,
196    int VTK_QUADRATIC_HEXAHEDRON_INDEX[] = { 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 16, 17, 18, 19, 12, 13, 14, 15 };          11, 20, 10,  3, 24, 26, 23, 15,
197    /* if there is no mesh we just return */          20,  9,  2, 10, 26, 22, 14, 23,
198    if (mesh_p==NULL) return;          12, 21, 26, 24,  4, 16, 25, 19,
199            21, 13, 22, 26, 16,  5, 17, 25,
200    my_mpi_rank = mesh_p->Nodes->MPIInfo->rank;          24, 26, 23, 15, 19, 25, 18,  7,
201    mpi_size  = mesh_p->Nodes->MPIInfo->size;          26, 22, 14, 23, 25, 17,  6, 18 };
202    nDim = mesh_p->Nodes->numDim;  
203        /* if there is no mesh we just return */
204    if (! ( (nDim ==2) || (nDim == 3) ) ) {      if (mesh_p==NULL) return;
205          Finley_setError(IO_ERROR, "saveVTK: spatial dimension 2 or 3 is supported only.");  
206          return;        nDim = mesh_p->Nodes->numDim;
207    }  
208    /*************************************************************************************/      if (nDim != 2 && nDim != 3) {
209            Finley_setError(TYPE_ERROR, "saveVTK: spatial dimension 2 or 3 is supported only.");
210    /* open the file and check handle */          return;
211        }
212    if (mpi_size > 1) {      my_mpi_rank = mesh_p->Nodes->MPIInfo->rank;
213          #ifdef PASO_MPI      mpi_size = mesh_p->Nodes->MPIInfo->size;
214            /* Collective Call */  
215            #ifdef MPIO_HINTS      /************************************************************************
216              MPI_Info_create(&mpi_info);       * open the file and check handle *
217              /*  MPI_Info_set(mpi_info, "striping_unit",        "424288"); */       */
218              /*  MPI_Info_set(mpi_info, "striping_factor",      "16"); */      if (mpi_size > 1) {
219              /*  MPI_Info_set(mpi_info, "collective_buffering", "true"); */  #ifdef PASO_MPI
220              /*  MPI_Info_set(mpi_info, "cb_block_size",        "131072"); */          const int amode = MPI_MODE_CREATE|MPI_MODE_WRONLY|MPI_MODE_UNIQUE_OPEN;
221              /*  MPI_Info_set(mpi_info, "cb_buffer_size",       "1048567"); */          int ierr;
222              /*  MPI_Info_set(mpi_info, "cb_nodes",             "8"); */          if (my_mpi_rank == 0 && Paso_fileExists(filename_p)) {
223              /*    MPI_Info_set(mpi_info, "access_style", "write_once, sequential"); */              remove(filename_p);
             
             /*XFS only */  
             /*   MPI_Info_set(mpi_info, "direct_write",          "true"); */  
           #endif  
           ierr=MPI_File_open(mesh_p->Nodes->MPIInfo->comm, (char*)filename_p, amode,mpi_info, &mpi_fileHandle_p);  
           if (! ierr) {  
           perror(filename_p);  
               sprintf(error_msg, "saveVTK: File %s could not be opened for writing in parallel.", filename_p);  
               Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);  
           } else {  
              MPI_File_set_view(mpi_fileHandle_p,MPI_DISPLACEMENT_CURRENT,MPI_CHAR, MPI_CHAR, "native" , mpi_info);  
           }  
         #endif  
   } else {  
         fileHandle_p = fopen(filename_p, "w");  
         if (fileHandle_p==NULL) {  
            sprintf(error_msg, "saveVTK: File %s could not be opened for writing.", filename_p);  
            Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);  
          }  
   }  
   if (! Paso_MPIInfo_noError(mesh_p->Nodes->MPIInfo) ) return;  
   /*************************************************************************************/  
   
   /* find the mesh type to be written */  
   
   isCellCentered=TMPMEMALLOC(num_data,bool_t);  
   max_len_names=0;  
   if (!Finley_checkPtr(isCellCentered)) {  
      nodetype=FINLEY_UNKNOWN;  
      elementtype=FINLEY_UNKNOWN;  
      for (i_data=0;i_data<num_data;++i_data) {  
        if (! isEmpty(data_pp[i_data])) {  
          switch(getFunctionSpaceType(data_pp[i_data]) ) {  
          case FINLEY_NODES:  
            nodetype = (nodetype == FINLEY_REDUCED_NODES) ? FINLEY_REDUCED_NODES : FINLEY_NODES;  
            isCellCentered[i_data]=FALSE;  
            if (elementtype==FINLEY_UNKNOWN || elementtype==FINLEY_ELEMENTS) {  
              elementtype=FINLEY_ELEMENTS;  
            } else {  
              Finley_setError(TYPE_ERROR,"saveVTK: cannot write given data in single file.");  
            }  
            break;  
          case FINLEY_REDUCED_NODES:  
            nodetype = FINLEY_REDUCED_NODES;  
            isCellCentered[i_data]=FALSE;  
            if (elementtype==FINLEY_UNKNOWN || elementtype==FINLEY_ELEMENTS) {  
              elementtype=FINLEY_ELEMENTS;  
            } else {  
              Finley_setError(TYPE_ERROR,"saveVTK: cannot write given data in single file.");  
            }  
            break;  
          case FINLEY_ELEMENTS:  
          case FINLEY_REDUCED_ELEMENTS:  
            isCellCentered[i_data]=TRUE;  
            if (elementtype==FINLEY_UNKNOWN || elementtype==FINLEY_ELEMENTS) {  
              elementtype=FINLEY_ELEMENTS;  
            } else {  
              Finley_setError(TYPE_ERROR,"saveVTK: cannot write given data in single file.");  
            }  
            break;  
          case FINLEY_FACE_ELEMENTS:  
          case FINLEY_REDUCED_FACE_ELEMENTS:  
            isCellCentered[i_data]=TRUE;  
            if (elementtype==FINLEY_UNKNOWN || elementtype==FINLEY_FACE_ELEMENTS) {  
              elementtype=FINLEY_FACE_ELEMENTS;  
            } else {  
              Finley_setError(TYPE_ERROR,"saveVTK: cannot write given data in single file.");  
            }  
            break;  
          case FINLEY_POINTS:  
            isCellCentered[i_data]=TRUE;  
            if (elementtype==FINLEY_UNKNOWN || elementtype==FINLEY_POINTS) {  
              elementtype=FINLEY_POINTS;  
            } else {  
              Finley_setError(TYPE_ERROR,"saveVTK: cannot write given data in single file.");  
            }  
            break;  
          case FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1:  
          case FINLEY_REDUCED_CONTACT_ELEMENTS_1:  
            isCellCentered[i_data]=TRUE;  
            if (elementtype==FINLEY_UNKNOWN || elementtype==FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1) {  
              elementtype=FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1;  
            } else {  
              Finley_setError(TYPE_ERROR,"saveVTK: cannot write given data in single file.");  
            }  
            break;  
          case FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_2:  
          case FINLEY_REDUCED_CONTACT_ELEMENTS_2:  
            isCellCentered[i_data]=TRUE;  
            if (elementtype==FINLEY_UNKNOWN || elementtype==FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1) {  
              elementtype=FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1;  
            } else {  
              Finley_setError(TYPE_ERROR,"saveVTK: cannot write given data in single file.");  
            }  
            break;  
          default:  
            sprintf(error_msg,"saveVTK: unknown function space type %d",getFunctionSpaceType(data_pp[i_data]));  
            Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
          }  
          if (isCellCentered[i_data]) {  
            write_celldata=TRUE;  
          } else {  
            write_pointdata=TRUE;  
          }  
          max_len_names =MAX(max_len_names,strlen(names_p[i_data]));  
        }  
      }  
      nodetype = (nodetype == FINLEY_UNKNOWN) ? FINLEY_NODES : nodetype;  
   }  
   if (Finley_noError()) {  
   
      /***************************************/  
   
      /* select number of points and the mesh component */  
     
      if (nodetype == FINLEY_REDUCED_NODES) {  
         myFirstNode = Finley_NodeFile_getFirstReducedNode(mesh_p->Nodes);  
         myLastNode = Finley_NodeFile_getLastReducedNode(mesh_p->Nodes);  
         globalNumPoints = Finley_NodeFile_getGlobalNumReducedNodes(mesh_p->Nodes);  
         globalNodeIndex= Finley_NodeFile_borrowGlobalReducedNodesIndex(mesh_p->Nodes);  
      } else {  
         myFirstNode = Finley_NodeFile_getFirstNode(mesh_p->Nodes);  
         myLastNode = Finley_NodeFile_getLastNode(mesh_p->Nodes);  
         globalNumPoints = Finley_NodeFile_getGlobalNumNodes(mesh_p->Nodes);  
         globalNodeIndex= Finley_NodeFile_borrowGlobalNodesIndex(mesh_p->Nodes);  
      }  
      myNumPoints = myLastNode - myFirstNode;  
      if (elementtype==FINLEY_UNKNOWN) elementtype=FINLEY_ELEMENTS;  
      switch(elementtype) {  
        case FINLEY_ELEMENTS:  
           elements=mesh_p->Elements;  
           break;  
         case FINLEY_FACE_ELEMENTS:  
           elements=mesh_p->FaceElements;  
           break;  
         case FINLEY_POINTS:  
           elements=mesh_p->Points;  
           break;  
         case FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1:  
           elements=mesh_p->ContactElements;  
           break;  
      }  
      if (elements==NULL) {  
        Finley_setError(SYSTEM_ERROR,"saveVTK: undefined element file");  
      } else {  
        /* map finley element type to VTK element type */  
        numCells = elements->numElements;  
        globalNumCells = Finley_ElementFile_getGlobalNumElements(elements);  
        myNumCells= Finley_ElementFile_getMyNumElements(elements);  
        myFirstCell= Finley_ElementFile_getFirstElement(elements);  
        NN = elements->numNodes;  
        if (nodetype==FINLEY_REDUCED_NODES || nodetype==FINLEY_REDUCED_NODES) {  
           TypeId = elements->LinearReferenceElement->Type->TypeId;  
        } else {  
           TypeId = elements->ReferenceElement->Type->TypeId;  
        }  
        switch(TypeId) {  
         case Point1:  
         case Line2Face:  
         case Line3Face:  
         case Point1_Contact:  
         case Line2Face_Contact:  
         case Line3Face_Contact:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_VERTEX;  
           numVTKNodesPerElement = 1;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_VERTEX");  
           break;  
         
         case Line2:  
         case Tri3Face:  
         case Rec4Face:  
         case Line2_Contact:  
         case Tri3_Contact:  
         case Tri3Face_Contact:  
         case Rec4Face_Contact:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_LINE;  
           numVTKNodesPerElement = 2;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_LINE");  
           break;  
         
         case Tri3:  
         case Tet4Face:  
         case Tet4Face_Contact:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_TRIANGLE;  
           numVTKNodesPerElement = 3;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_TRIANGLE");  
           break;  
         
         case Rec4:  
         case Hex8Face:  
         case Rec4_Contact:  
         case Hex8Face_Contact:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_QUAD;  
           numVTKNodesPerElement = 4;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_QUAD");  
           break;  
         
         case Tet4:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_TETRA;  
           numVTKNodesPerElement = 4;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_TETRA");  
           break;  
         
         case Hex8:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_HEXAHEDRON;  
           numVTKNodesPerElement = 8;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_HEXAHEDRON");  
           break;  
         
         case Line3:  
         case Tri6Face:  
         case Rec8Face:  
         case Line3_Contact:  
         case Tri6Face_Contact:  
         case Rec8Face_Contact:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_QUADRATIC_EDGE;  
           numVTKNodesPerElement = 3;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_QUADRATIC_EDGE");  
           break;  
         
         case Tri6:  
         case Tet10Face:  
         case Tri6_Contact:  
         case Tet10Face_Contact:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_QUADRATIC_TRIANGLE;  
           numVTKNodesPerElement = 6;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_QUADRATIC_TRIANGLE");  
           break;  
         
         case Rec8:  
         case Hex20Face:  
         case Rec8_Contact:  
         case Hex20Face_Contact:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_QUADRATIC_QUAD;  
           numVTKNodesPerElement = 8;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_QUADRATIC_QUAD");  
           break;  
         
         case Tet10:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_QUADRATIC_TETRA;  
           numVTKNodesPerElement = 10;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_QUADRATIC_TETRA");  
           break;  
         
         case Hex20:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_QUADRATIC_HEXAHEDRON;  
           numVTKNodesPerElement = 20;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_QUADRATIC_HEXAHEDRON");  
           break;  
         
         default:  
           sprintf(error_msg, "saveVTK: Element type %s is not supported by VTK",elements->ReferenceElement->Type->Name);  
           Finley_setError(VALUE_ERROR,error_msg);  
         }  
      }  
   }  
   /***************************************/  
   
   /***************************************/  
   /*                                     */  
   /*   allocate text buffer              */  
   /*                                     */  
   max_name_len=0;  
   for (i_data =0 ;i_data<num_data;++i_data) max_name_len=MAX(max_name_len,strlen(names_p[i_data]));  
   len_txt_buffer= strlen(tags_header) + 3 * LEN_PRINTED_INT_FORMAT + (30+3*max_name_len); /* header */  
   if (mpi_size > 1) len_txt_buffer=MAX(len_txt_buffer, myNumPoints * LEN_TMP_BUFFER);  
   if (mpi_size > 1) len_txt_buffer=MAX(len_txt_buffer, numCellFactor*myNumCells*(LEN_PRINTED_INT_FORMAT*numVTKNodesPerElement+1));  
   len_txt_buffer=MAX(len_txt_buffer,200+3*max_len_names);  
   len_txt_buffer=MAX(len_txt_buffer, strlen(tag_Float_DataArray) + LEN_PRINTED_INT_FORMAT + max_len_names);  
   if (mpi_size > 1) len_txt_buffer=MAX(len_txt_buffer, numCellFactor*myNumCells*LEN_PRINTED_FLOAT_TENSOR_FORMAT);  
   if (mpi_size > 1) len_txt_buffer=MAX(len_txt_buffer, myNumPoints*LEN_PRINTED_FLOAT_TENSOR_FORMAT);  
   txt_buffer=TMPMEMALLOC(len_txt_buffer+1,char);  
   Finley_checkPtr(txt_buffer);  
     
   if (Finley_noError()) {  
   
      /* select number of points and the mesh component */  
   
      sprintf(txt_buffer,tags_header,globalNumPoints,numCellFactor*globalNumCells,3);  
   
       if (mpi_size > 1) {  
           if ( my_mpi_rank == 0) {  
             #ifdef PASO_MPI  
               MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,txt_buffer,strlen(txt_buffer),MPI_CHAR,&mpi_req);  
               MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);  
             #endif  
           }  
       } else {  
          fprintf(fileHandle_p,txt_buffer);  
       }  
   
       /* write the nodes */  
         
       if (mpi_size > 1) {  
   
          txt_buffer[0] = '\0';  
          txt_buffer_in_use=0;  
          if (nDim==2) {  
             for (i = 0; i < mesh_p->Nodes->numNodes; i++) {  
                if ( (myFirstNode <= globalNodeIndex[i]) && (globalNodeIndex[i] < myLastNode) ) {  
                  sprintf(tmp_buffer,FLOAT_VECTOR_FORMAT,  
                                     mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0, i, nDim)],  
                                     mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1, i, nDim)],  
                                     0.);  
                  __STRCAT(txt_buffer,tmp_buffer,txt_buffer_in_use);  
                }  
             }        
          } else {  
             for (i = 0; i < mesh_p->Nodes->numNodes; i++) {  
                if ( (myFirstNode <= globalNodeIndex[i]) && (globalNodeIndex[i] < myLastNode) ) {  
                  sprintf(tmp_buffer,FLOAT_VECTOR_FORMAT,  
                                                   mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0, i, nDim)],  
                                                   mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1, i, nDim)],  
                                                   mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(2, i, nDim)]);  
                  __STRCAT(txt_buffer,tmp_buffer,txt_buffer_in_use);  
                }  
             }      
     
          }  
          #ifdef PASO_MPI  
             MPI_File_write_ordered(mpi_fileHandle_p, txt_buffer,txt_buffer_in_use, MPI_CHAR, &mpi_status);  
          #endif      
       } else {  
          if (nDim==2) {  
             for (i = 0; i < mesh_p->Nodes->numNodes; i++) {  
                if ( (myFirstNode <= globalNodeIndex[i]) && (globalNodeIndex[i] < myLastNode) ) {  
                  fprintf(fileHandle_p,FLOAT_VECTOR_FORMAT,  
                                       mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0, i, nDim)],  
                                       mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1, i, nDim)],  
                                       0.);  
                }  
             }        
          } else {  
             for (i = 0; i < mesh_p->Nodes->numNodes; i++) {  
                if ( (myFirstNode <= globalNodeIndex[i]) && (globalNodeIndex[i] < myLastNode) ) {  
                  fprintf(fileHandle_p,FLOAT_VECTOR_FORMAT,  
                                               mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0, i, nDim)],  
                                               mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1, i, nDim)],  
                                               mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(2, i, nDim)]);  
                }  
             }      
     
          }  
       }  
   
       /* close the Points and open connectivity */  
   
       if (mpi_size > 1) {  
           if ( my_mpi_rank == 0) {  
              #ifdef PASO_MPI  
                 MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p, tags_End_Points_and_Start_Conn, strlen(tags_End_Points_and_Start_Conn), MPI_CHAR, &mpi_req);  
                 MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);  
              #endif  
           }  
       } else {  
          fprintf(fileHandle_p,tags_End_Points_and_Start_Conn);  
       }  
   
      /* write the cells */  
      if (nodetype == FINLEY_REDUCED_NODES) {  
         node_index=elements->ReferenceElement->Type->linearNodes;  
      } else if (VTK_QUADRATIC_HEXAHEDRON==cellType) {  
         node_index=VTK_QUADRATIC_HEXAHEDRON_INDEX;  
      } else if (numVTKNodesPerElement!=NN) {  
         node_index=elements->ReferenceElement->Type->geoNodes;  
      } else {  
         node_index=NULL;  
      }  
   
      if ( mpi_size > 1) {  
         txt_buffer[0] = '\0';  
         txt_buffer_in_use=0;  
         if (node_index == NULL) {  
            for (i = 0; i < numCells; i++) {  
               if (elements->Owner[i] == my_mpi_rank) {  
                  for (j = 0; j < numVTKNodesPerElement; j++) {  
                      sprintf(tmp_buffer,INT_FORMAT,globalNodeIndex[elements->Nodes[INDEX2(j, i, NN)]]);  
                      __STRCAT(txt_buffer,tmp_buffer,txt_buffer_in_use)  
                  }  
                  __STRCAT(txt_buffer,NEWLINE,txt_buffer_in_use)  
               }  
            }  
         } else {  
            for (i = 0; i < numCells; i++) {  
               if (elements->Owner[i] == my_mpi_rank) {  
                  for (j = 0; j < numVTKNodesPerElement; j++) {  
                      sprintf(tmp_buffer,INT_FORMAT,globalNodeIndex[elements->Nodes[INDEX2(node_index[j], i, NN)]]);  
                      __STRCAT(txt_buffer,tmp_buffer,txt_buffer_in_use)  
                  }  
                  __STRCAT(txt_buffer,NEWLINE,txt_buffer_in_use)  
               }  
            }  
224          }          }
225          #ifdef PASO_MPI          ierr = MPI_File_open(mesh_p->Nodes->MPIInfo->comm, (char*)filename_p,
226             MPI_File_write_ordered(mpi_fileHandle_p,txt_buffer,txt_buffer_in_use, MPI_CHAR, &mpi_status);                               amode, mpi_info, &mpi_fileHandle_p);
227          #endif              if (ierr != MPI_SUCCESS) {
228       } else {              sprintf(errorMsg, "saveVTK: File %s could not be opened for writing in parallel.", filename_p);
229          if (node_index == NULL) {              Finley_setError(IO_ERROR, errorMsg);
            for (i = 0; i < numCells; i++) {  
               for (j = 0; j < numVTKNodesPerElement; j++) {  
                  fprintf(fileHandle_p,INT_FORMAT,globalNodeIndex[elements->Nodes[INDEX2(j, i, NN)]]);  
                }  
               fprintf(fileHandle_p,NEWLINE);  
            }  
230          } else {          } else {
231             for (i = 0; i < numCells; i++) {              ierr=MPI_File_set_view(mpi_fileHandle_p,MPI_DISPLACEMENT_CURRENT,
232                for (j = 0; j < numVTKNodesPerElement; j++) {                      MPI_CHAR, MPI_CHAR, "native", mpi_info);
                  fprintf(fileHandle_p,INT_FORMAT,globalNodeIndex[elements->Nodes[INDEX2(node_index[j], i, NN)]]);  
                }  
               fprintf(fileHandle_p,NEWLINE);  
            }  
         }  
   
      }  
       
      /* finalize the connection and start the offset section */  
      if (mpi_size > 1) {  
         if( my_mpi_rank == 0) {  
            #ifdef PASO_MPI  
               MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,tags_End_Conn_and_Start_Offset,strlen(tags_End_Conn_and_Start_Offset),MPI_CHAR,&mpi_req);  
               MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);  
            #endif  
         }  
      } else {  
         fprintf(fileHandle_p,tags_End_Conn_and_Start_Offset);  
      }  
   
     /* write the offsets */  
         
      if ( mpi_size > 1) {  
         txt_buffer[0] = '\0';  
         txt_buffer_in_use=0;  
         for (i=numVTKNodesPerElement*(myFirstCell*numCellFactor+1); i<=numCells*numVTKNodesPerElement*numCellFactor; i+=numVTKNodesPerElement) {  
            sprintf(tmp_buffer, INT_NEWLINE_FORMAT, i);  
            __STRCAT(txt_buffer,tmp_buffer,txt_buffer_in_use);  
          }  
          #ifdef PASO_MPI  
             MPI_File_write_ordered(mpi_fileHandle_p,txt_buffer,txt_buffer_in_use, MPI_CHAR, &mpi_status);  
          #endif      
      } else {  
         for (i=numVTKNodesPerElement; i<=numCells*numVTKNodesPerElement*numCellFactor; i+=numVTKNodesPerElement) {  
            fprintf(fileHandle_p, INT_NEWLINE_FORMAT, i);  
         }  
       
      }  
      /* finalize the offset section and start the type section */  
      if ( mpi_size > 1) {  
         if ( my_mpi_rank == 0) {  
            #ifdef PASO_MPI  
               MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,tags_End_Offset_and_Start_Type,strlen(tags_End_Offset_and_Start_Type),MPI_CHAR,&mpi_req);  
               MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);  
            #endif  
233          }          }
234    #endif /* PASO_MPI */
235      } else {      } else {
236         fprintf(fileHandle_p,tags_End_Offset_and_Start_Type);          fileHandle_p = fopen(filename_p, "w");
237      }          if (fileHandle_p==NULL) {
238                    sprintf(errorMsg, "saveVTK: File %s could not be opened for writing.", filename_p);
239                      Finley_setError(IO_ERROR, errorMsg);
      /* write element type */  
      sprintf(tmp_buffer, INT_NEWLINE_FORMAT, cellType);  
      if ( mpi_size > 1) {  
         txt_buffer[0] = '\0';  
         txt_buffer_in_use=0;  
         for (i=0; i<numCells*numCellFactor; i++) __STRCAT(txt_buffer,tmp_buffer,txt_buffer_in_use);  
          #ifdef PASO_MPI  
             MPI_File_write_ordered(mpi_fileHandle_p,txt_buffer,txt_buffer_in_use, MPI_CHAR, &mpi_status);  
          #endif      
      } else {  
         for (i=0; i<numCells*numCellFactor; i++) fprintf(fileHandle_p, tmp_buffer);  
      }  
      /* finalize cell information */  
      if ( mpi_size > 1) {  
         if ( my_mpi_rank == 0) {  
            #ifdef PASO_MPI  
               MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,tags_End_Type_And_Cells,strlen(tags_End_Type_And_Cells),MPI_CHAR,&mpi_req);  
               MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);  
            #endif  
240          }          }
     } else {  
        fprintf(fileHandle_p,tags_End_Type_And_Cells);  
241      }      }
242   }      if (!Paso_MPIInfo_noError(mesh_p->Nodes->MPIInfo)) return;
243    
244   /* Write cell data */      /* General note: From this point if an error occurs Finley_setError is
245   if (write_celldata && Finley_noError()) {       * called and subsequent steps are skipped until the end of this function
246        /* mark the active data arrays */       * where allocated memory is freed and the file is closed. */
247        txt_buffer[0] = '\0';  
248        set_scalar=FALSE,set_vector=FALSE, set_tensor=FALSE;      /************************************************************************/
249        strcat(txt_buffer, "<CellData");      /* find the mesh type to be written */
250        for (i_data =0 ;i_data<num_data;++i_data) {  
251          if (! isEmpty(data_pp[i_data]) && isCellCentered[i_data]) {      isCellCentered = TMPMEMALLOC(num_data, bool_t);
252            /* if the rank == 0:   --> scalar data */      maxNameLen = 0;
253            /* if the rank == 1:   --> vector data */      if (!Finley_checkPtr(isCellCentered)) {
254            /* if the rank == 2:   --> tensor data */          for (dataIdx=0; dataIdx<num_data; ++dataIdx) {
255                if (! isEmpty(data_pp[dataIdx])) {
256            switch(getDataPointRank(data_pp[i_data])) {                  switch(getFunctionSpaceType(data_pp[dataIdx]) ) {
257            case 0:                      case FINLEY_NODES:
258              if (! set_scalar) {                          nodeType = (nodeType == FINLEY_REDUCED_NODES) ? FINLEY_REDUCED_NODES : FINLEY_NODES;
259                strcat(txt_buffer," Scalars=\"");                          isCellCentered[dataIdx] = FALSE;
260                strcat(txt_buffer,names_p[i_data]);                          if (elementType==FINLEY_UNKNOWN || elementType==FINLEY_ELEMENTS) {
261                strcat(txt_buffer,"\"");                              elementType = FINLEY_ELEMENTS;
262                set_scalar=TRUE;                          } else {
263                                Finley_setError(TYPE_ERROR, "saveVTK: cannot write given data in single file.");
264                            }
265                        break;
266                        case FINLEY_REDUCED_NODES:
267                            nodeType = FINLEY_REDUCED_NODES;
268                            isCellCentered[dataIdx] = FALSE;
269                            if (elementType==FINLEY_UNKNOWN || elementType==FINLEY_ELEMENTS) {
270                                elementType = FINLEY_ELEMENTS;
271                            } else {
272                                Finley_setError(TYPE_ERROR, "saveVTK: cannot write given data in single file.");
273                        }
274                        break;
275                        case FINLEY_REDUCED_ELEMENTS:
276                            hasReducedElements = TRUE;
277                        case FINLEY_ELEMENTS:
278                            isCellCentered[dataIdx] = TRUE;
279                            if (elementType==FINLEY_UNKNOWN || elementType==FINLEY_ELEMENTS) {
280                                elementType = FINLEY_ELEMENTS;
281                            } else {
282                                Finley_setError(TYPE_ERROR, "saveVTK: cannot write given data in single file.");
283                            }
284                        break;
285                        case FINLEY_REDUCED_FACE_ELEMENTS:
286                            hasReducedElements = TRUE;
287                        case FINLEY_FACE_ELEMENTS:
288                            isCellCentered[dataIdx] = TRUE;
289                            if (elementType==FINLEY_UNKNOWN || elementType==FINLEY_FACE_ELEMENTS) {
290                                elementType = FINLEY_FACE_ELEMENTS;
291                            } else {
292                                Finley_setError(TYPE_ERROR, "saveVTK: cannot write given data in single file.");
293                            }
294                        break;
295                        case FINLEY_POINTS:
296                            isCellCentered[dataIdx]=TRUE;
297                            if (elementType==FINLEY_UNKNOWN || elementType==FINLEY_POINTS) {
298                                elementType = FINLEY_POINTS;
299                            } else {
300                                Finley_setError(TYPE_ERROR, "saveVTK: cannot write given data in single file.");
301                            }
302                        break;
303                        case FINLEY_REDUCED_CONTACT_ELEMENTS_1:
304                            hasReducedElements = TRUE;
305                        case FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1:
306                            isCellCentered[dataIdx] = TRUE;
307                            if (elementType==FINLEY_UNKNOWN || elementType==FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1) {
308                                elementType = FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1;
309                            } else {
310                                Finley_setError(TYPE_ERROR, "saveVTK: cannot write given data in single file.");
311                            }
312                        break;
313                        case FINLEY_REDUCED_CONTACT_ELEMENTS_2:
314                            hasReducedElements = TRUE;
315                        case FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_2:
316                            isCellCentered[dataIdx] = TRUE;
317                            if (elementType==FINLEY_UNKNOWN || elementType==FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1) {
318                                elementType = FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1;
319                            } else {
320                                Finley_setError(TYPE_ERROR, "saveVTK: cannot write given data in single file.");
321                            }
322                        break;
323                        default:
324                            sprintf(errorMsg, "saveVTK: unknown function space type %d",getFunctionSpaceType(data_pp[dataIdx]));
325                            Finley_setError(TYPE_ERROR, errorMsg);
326                    }
327                    if (isCellCentered[dataIdx]) {
328                        writeCellData = TRUE;
329                    } else {
330                        writePointData = TRUE;
331                    }
332                    maxNameLen = MAX(maxNameLen, strlen(names_p[dataIdx]));
333              }              }
334            }
335        }
336    
337        /************************************************************************/
338        /* select number of points and the mesh component */
339    
340        if (Finley_noError()) {
341            if (nodeType == FINLEY_REDUCED_NODES) {
342                myFirstNode = Finley_NodeFile_getFirstReducedNode(mesh_p->Nodes);
343                myLastNode = Finley_NodeFile_getLastReducedNode(mesh_p->Nodes);
344                globalNumPoints = Finley_NodeFile_getGlobalNumReducedNodes(mesh_p->Nodes);
345                globalNodeIndex = Finley_NodeFile_borrowGlobalReducedNodesIndex(mesh_p->Nodes);
346            } else {
347                myFirstNode = Finley_NodeFile_getFirstNode(mesh_p->Nodes);
348                myLastNode = Finley_NodeFile_getLastNode(mesh_p->Nodes);
349                globalNumPoints = Finley_NodeFile_getGlobalNumNodes(mesh_p->Nodes);
350                globalNodeIndex = Finley_NodeFile_borrowGlobalNodesIndex(mesh_p->Nodes);
351            }
352            myNumPoints = myLastNode - myFirstNode;
353            if (elementType==FINLEY_UNKNOWN) elementType=FINLEY_ELEMENTS;
354            switch(elementType) {
355                case FINLEY_ELEMENTS:
356                    elements = mesh_p->Elements;
357              break;              break;
358            case 1:              case FINLEY_FACE_ELEMENTS:
359              if (! set_vector) {                  elements = mesh_p->FaceElements;
               strcat(txt_buffer," Vectors=\"");  
               strcat(txt_buffer,names_p[i_data]);  
               strcat(txt_buffer,"\"");  
               set_vector=TRUE;  
             }  
360              break;              break;
361            case 2:              case FINLEY_POINTS:
362              if (! set_tensor) {                  elements = mesh_p->Points;
363                strcat(txt_buffer," Tensors=\"");              break;
364                strcat(txt_buffer,names_p[i_data]);              case FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1:
365                strcat(txt_buffer,"\"");                  elements = mesh_p->ContactElements;
               set_tensor=TRUE;  
             }  
366              break;              break;
367            default:          }
368              sprintf(error_msg, "saveVTK: data %s: Vtk can't handle objects with rank greater than 2.",names_p[i_data]);          if (elements==NULL) {
369              Finley_setError(VALUE_ERROR,error_msg);              Finley_setError(SYSTEM_ERROR, "saveVTK: undefined element file");
370              return;          } else {
371            }              /* map finley element type to VTK element type */
372          }              numCells = elements->numElements;
373        }              globalNumCells = Finley_ElementFile_getGlobalNumElements(elements);
374        strcat(txt_buffer, ">\n");              myNumCells = Finley_ElementFile_getMyNumElements(elements);
375        if ( mpi_size > 1) {              myFirstCell = Finley_ElementFile_getFirstElement(elements);
376          if ( my_mpi_rank == 0) {              NN = elements->numNodes;
377             #ifdef PASO_MPI              if (nodeType==FINLEY_REDUCED_NODES) {
378                MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,txt_buffer,strlen(txt_buffer),MPI_CHAR,&mpi_req);                  typeId = elements->LinearReferenceElement->Type->TypeId;
379                MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);                  if (hasReducedElements) {
380             #endif                      quadNodes_p=elements->LinearReferenceElementReducedOrder->QuadNodes;
381          }                  } else {
382        } else {                      quadNodes_p=elements->LinearReferenceElement->QuadNodes;
383            fprintf(fileHandle_p,txt_buffer);                  }
       }  
       /* write the arrays */  
       for (i_data =0 ;i_data<num_data;++i_data) {  
          if (! isEmpty(data_pp[i_data]) && isCellCentered[i_data]) {  
             txt_buffer[0] = '\0';  
             txt_buffer_in_use=0;  
             numPointsPerSample=getNumDataPointsPerSample(data_pp[i_data]);  
             rank = getDataPointRank(data_pp[i_data]);  
             nComp = getDataPointSize(data_pp[i_data]);  
             nCompReqd=1;   /* the number of components mpi_required by vtk */  
             shape=0;  
             if (rank == 0) {  
               nCompReqd = 1;  
             } else if (rank == 1) {  
               shape=getDataPointShape(data_pp[i_data], 0);  
               if  (shape>3) {  
                 Finley_setError(VALUE_ERROR, "saveVTK: rank 1 object must have less then 4 components");  
               }  
               nCompReqd = 3;  
384              } else {              } else {
385                shape=getDataPointShape(data_pp[i_data], 0);                  typeId = elements->ReferenceElement->Type->TypeId;
386                if  (shape>3 || shape != getDataPointShape(data_pp[i_data], 1)) {                  if (hasReducedElements)
387                  Finley_setError(VALUE_ERROR, "saveVTK: rank 2 object must have less then 4x4 components and must have a square shape");                      quadNodes_p=elements->ReferenceElementReducedOrder->QuadNodes;
388                }                  else
389                nCompReqd = 9;                      quadNodes_p=elements->ReferenceElement->QuadNodes;
390              }              }
391              if (Finley_noError()) {              switch (typeId) {
392                 sprintf(txt_buffer,tag_Float_DataArray,names_p[i_data], nCompReqd);                  case Point1:
393                 if ( mpi_size > 1) {                  case Line2Face:
394                   if ( my_mpi_rank == 0) {                  case Line3Face:
395                      #ifdef PASO_MPI                  case Point1_Contact:
396                         MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,txt_buffer,strlen(txt_buffer),MPI_CHAR,&mpi_req);                  case Line2Face_Contact:
397                         MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);                  case Line3Face_Contact:
398                      #endif                      cellType = VTK_VERTEX;
399                   }                      numVTKNodesPerElement = 1;
400                 } else {                  break;
401                     fprintf(fileHandle_p,txt_buffer);  
402                 }                  case Line2:
403                 for (i=0; i<numCells; i++) {                  case Tri3Face:
404                     if (elements->Owner[i] == my_mpi_rank) {                  case Rec4Face:
405                        values = getSampleData(data_pp[i_data], i);                  case Line2_Contact:
406                        /* averaging over the number of points in the sample */                  case Tri3_Contact:
407                        for (k=0; k<MIN(nComp,NCOMP_MAX); k++) {                  case Tri3Face_Contact:
408                           if (isExpanded(data_pp[i_data])) {                  case Rec4Face_Contact:
409                             rtmp = 0.;                      cellType = VTK_LINE;
410                             for (j=0; j<numPointsPerSample; j++) rtmp += values[INDEX2(k,j,nComp)];                      numVTKNodesPerElement = 2;
411                             sampleAvg[k] = rtmp/numPointsPerSample;                  break;
412                          } else {  
413                             sampleAvg[k] = values[k];                  case Tri3:
414                          }                  case Tet4Face:
415                        }                  case Tet4Face_Contact:
416                        /* if the number of mpi_required components is more than the number                      cellType = VTK_TRIANGLE;
417                        * of actual components, pad with zeros                      numVTKNodesPerElement = 3;
418                        */                  break;
419                        /* probably only need to get shape of first element */  
420                        /* write the data different ways for scalar, vector and tensor */                  case Rec4:
421                        if (nCompReqd == 1) {                  case Hex8Face:
422                          sprintf(tmp_buffer,FLOAT_SCALAR_FORMAT,sampleAvg[0]);                  case Rec4_Contact:
423                        } else if (nCompReqd == 3) {                  case Hex8Face_Contact:
424                          if (shape==1) {                      cellType = VTK_QUAD;
425                           sprintf(tmp_buffer,FLOAT_VECTOR_FORMAT,sampleAvg[0],0.,0.);                      numVTKNodesPerElement = 4;
426                          } else if (shape==2) {                  break;
427                           sprintf(tmp_buffer,FLOAT_VECTOR_FORMAT,sampleAvg[0],sampleAvg[1],0.);  
428                          } else if (shape==3) {                  case Rec9:
429                           sprintf(tmp_buffer,FLOAT_VECTOR_FORMAT,sampleAvg[0],sampleAvg[1],sampleAvg[2]);                      numCellFactor = 4;
430                          }                      cellType = VTK_QUAD;
431                        } else if (nCompReqd == 9) {                      numVTKNodesPerElement = 4;
432                          if (shape==1) {                  break;
433                           sprintf(tmp_buffer,FLOAT_TENSOR_FORMAT,sampleAvg[0],0.,0.,  
434                                                                  0.,0.,0.,                  case Tet4:
435                                                                  0.,0.,0.);                      cellType = VTK_TETRA;
436                          } else if (shape==2) {                      numVTKNodesPerElement = 4;
437                           sprintf(tmp_buffer,FLOAT_TENSOR_FORMAT,sampleAvg[0],sampleAvg[1],0.,                  break;
438                                                                  sampleAvg[2],sampleAvg[3],0.,  
439                                                                  0.,0.,0.);                  case Hex8:
440                          } else if (shape==3) {                      cellType = VTK_HEXAHEDRON;
441                           sprintf(tmp_buffer,FLOAT_TENSOR_FORMAT,sampleAvg[0],sampleAvg[1],sampleAvg[2],                      numVTKNodesPerElement = 8;
442                                                                  sampleAvg[3],sampleAvg[4],sampleAvg[5],                  break;
443                                                                  sampleAvg[6],sampleAvg[7],sampleAvg[8]);  
444                          }                  case Line3:
445                        }                  case Tri6Face:
446                        if ( mpi_size > 1) {                  case Rec8Face:
447                          __STRCAT(txt_buffer,tmp_buffer,txt_buffer_in_use);                  case Line3_Contact:
448                        } else {                  case Tri6Face_Contact:
449                          fprintf(fileHandle_p,tmp_buffer);                  case Rec8Face_Contact:
450                        }                      cellType = VTK_QUADRATIC_EDGE;
451                    }                      numVTKNodesPerElement = 3;
452                 }                  break;
453                 if ( mpi_size > 1) {  
454                       #ifdef PASO_MPI                  case Tri6:
455                          MPI_File_write_ordered(mpi_fileHandle_p,txt_buffer,txt_buffer_in_use, MPI_CHAR, &mpi_status);                  case Tet10Face:
456                       #endif                      case Tri6_Contact:
457                       if ( my_mpi_rank == 0) {                  case Tet10Face_Contact:
458                          #ifdef PASO_MPI                      cellType = VTK_QUADRATIC_TRIANGLE;
459                             MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,tag_End_DataArray,strlen(tag_End_DataArray),MPI_CHAR,&mpi_req);                      numVTKNodesPerElement = 6;
460                             MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);                  break;
461                          #endif  
462                       }                  case Rec8:
463                 } else {                  case Hex20Face:
464                     fprintf(fileHandle_p,tag_End_DataArray);                  case Rec8_Contact:
465                 }                  case Hex20Face_Contact:
466              }                      cellType = VTK_QUADRATIC_QUAD;
467           }                      numVTKNodesPerElement = 8;
468        }                  break;
469        if ( mpi_size > 1) {  
470          if ( my_mpi_rank == 0) {                  case Tet10:
471             #ifdef PASO_MPI                      cellType = VTK_QUADRATIC_TETRA;
472                MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,tag_End_CellData,strlen(tag_End_CellData),MPI_CHAR,&mpi_req);                      numVTKNodesPerElement = 10;
473                MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);                  break;
474             #endif  
475          }                  case Hex20:
476        } else {                      cellType = VTK_QUADRATIC_HEXAHEDRON;
477            fprintf(fileHandle_p,tag_End_CellData);                      numVTKNodesPerElement = 20;
478        }                  break;
479    }  
480    /* point data */                  case Hex27:
481    if (write_pointdata && Finley_noError()) {                      numCellFactor = 8;
482        /* mark the active data arrays */                      cellType = VTK_HEXAHEDRON;
483        set_scalar=FALSE,set_vector=FALSE, set_tensor=FALSE;                      numVTKNodesPerElement = 8;
484        txt_buffer[0] = '\0';                  break;
485        strcat(txt_buffer, "<PointData");  
486        for (i_data =0 ;i_data<num_data;++i_data) {                  default:
487          if (! isEmpty(data_pp[i_data]) && !isCellCentered[i_data]) {                      sprintf(errorMsg, "saveVTK: Element type %s is not supported by VTK.", elements->ReferenceElement->Type->Name);
488            /* if the rank == 0:   --> scalar data */                      Finley_setError(VALUE_ERROR, errorMsg);
           /* if the rank == 1:   --> vector data */  
           /* if the rank == 2:   --> tensor data */  
   
           switch(getDataPointRank(data_pp[i_data])) {  
           case 0:  
             if (! set_scalar) {  
               strcat(txt_buffer," Scalars=\"");  
               strcat(txt_buffer,names_p[i_data]);  
               strcat(txt_buffer,"\"");  
               set_scalar=TRUE;  
489              }              }
490              break;          }
491            case 1:      }
492              if (! set_vector) {  
493                strcat(txt_buffer," Vectors=\"");      /* allocate enough memory for text buffer */
494                strcat(txt_buffer,names_p[i_data]);  
495                strcat(txt_buffer,"\"");      txtBufferSize = strlen(vtkHeader) + 3*LEN_INT_FORMAT + (30+3*maxNameLen)+strlen(metadata)+strlen(metadata_schema);
496                set_vector=TRUE;      if (mpi_size > 1) {
497            txtBufferSize = MAX(txtBufferSize, myNumPoints * LEN_TMP_BUFFER);
498            txtBufferSize = MAX(txtBufferSize, numCellFactor * myNumCells *
499                    (LEN_INT_FORMAT * numVTKNodesPerElement + 1));
500            txtBufferSize = MAX(txtBufferSize,
501                    numCellFactor * myNumCells * LEN_TENSOR_FORMAT);
502            txtBufferSize = MAX(txtBufferSize, myNumPoints * LEN_TENSOR_FORMAT);
503        }
504        txtBuffer = TMPMEMALLOC(txtBufferSize+1, char);
505    
506        /* sets error if memory allocation failed */
507        Finley_checkPtr(txtBuffer);
508    
509        /************************************************************************/
510        /* write number of points and the mesh component */
511    
512        if (Finley_noError()) {
513            const index_t *nodeIndex;
514            if (FINLEY_REDUCED_NODES == nodeType) {
515                nodeIndex = elements->ReferenceElement->Type->linearNodes;
516            } else if (Rec9 == typeId) {
517                nodeIndex = VTK_REC9_INDEX;
518            } else if (Hex20 == typeId) {
519                nodeIndex = VTK_HEX20_INDEX;
520            } else if (Hex27 == typeId) {
521                nodeIndex = VTK_HEX27_INDEX;
522            } else if (numVTKNodesPerElement != NN) {
523                nodeIndex = elements->ReferenceElement->Type->geoNodes;
524            } else {
525                nodeIndex = NULL;
526            }
527    
528            if (strlen(metadata)>0) {
529               if (strlen(metadata_schema)>0) {
530                  sprintf(txtBuffer, vtkHeader," ",metadata_schema,metadata,"\n",globalNumPoints, numCellFactor*globalNumCells, 3);
531               } else {
532                  sprintf(txtBuffer, vtkHeader,"","",metadata,"\n",globalNumPoints, numCellFactor*globalNumCells, 3);
533               }
534            } else {
535               if (strlen(metadata_schema)>0) {
536                  sprintf(txtBuffer, vtkHeader," ",metadata_schema,"","",globalNumPoints, numCellFactor*globalNumCells, 3);
537               } else {
538                  sprintf(txtBuffer, vtkHeader,"","","","",globalNumPoints, numCellFactor*globalNumCells, 3);
539               }
540            }
541    
542            if (mpi_size > 1) {
543                /* write the nodes */
544                MPI_RANK0_WRITE_SHARED(txtBuffer);
545                txtBuffer[0] = '\0';
546                txtBufferInUse = 0;
547                if (nDim==2) {
548                    for (i = 0; i < mesh_p->Nodes->numNodes; i++) {
549                        if ( (myFirstNode <= globalNodeIndex[i]) && (globalNodeIndex[i] < myLastNode) ) {
550                            sprintf(tmpBuffer, VECTOR_FORMAT,
551                                mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0, i, nDim)],
552                                mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1, i, nDim)],
553                                0.);
554                            __STRCAT(txtBuffer, tmpBuffer, txtBufferInUse);
555                        }
556                    }
557                } else {
558                    for (i = 0; i < mesh_p->Nodes->numNodes; i++) {
559                        if ( (myFirstNode <= globalNodeIndex[i]) && (globalNodeIndex[i] < myLastNode) ) {
560                            sprintf(tmpBuffer, VECTOR_FORMAT,
561                                mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0, i, nDim)],
562                                mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1, i, nDim)],
563                                mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(2, i, nDim)]);
564                            __STRCAT(txtBuffer, tmpBuffer, txtBufferInUse);
565                        }
566                    }
567                } /* nDim */
568                MPI_WRITE_ORDERED(txtBuffer);
569    
570                /* write the cells */
571                MPI_RANK0_WRITE_SHARED(tags_End_Points_and_Start_Conn);
572                txtBuffer[0] = '\0';
573                txtBufferInUse = 0;
574                if (nodeIndex == NULL) {
575                    for (i = 0; i < numCells; i++) {
576                        if (elements->Owner[i] == my_mpi_rank) {
577                            for (j = 0; j < numVTKNodesPerElement; j++) {
578                                sprintf(tmpBuffer, INT_FORMAT, globalNodeIndex[elements->Nodes[INDEX2(j, i, NN)]]);
579                                __STRCAT(txtBuffer, tmpBuffer, txtBufferInUse);
580                            }
581                            __STRCAT(txtBuffer, NEWLINE, txtBufferInUse);
582                        }
583                    }
584                } else {
585                    for (i = 0; i < numCells; i++) {
586                        if (elements->Owner[i] == my_mpi_rank) {
587                            for (l = 0; l < numCellFactor; l++) {
588                                const int* idx=&nodeIndex[l*numVTKNodesPerElement];
589                                for (j = 0; j < numVTKNodesPerElement; j++) {
590                                    sprintf(tmpBuffer, INT_FORMAT, globalNodeIndex[elements->Nodes[INDEX2(idx[j], i, NN)]]);
591                                    __STRCAT(txtBuffer, tmpBuffer, txtBufferInUse);
592                                }
593                                __STRCAT(txtBuffer, NEWLINE, txtBufferInUse);
594                            }
595                        }
596                    }
597                } /* nodeIndex */
598                MPI_WRITE_ORDERED(txtBuffer);
599    
600                /* write the offsets */
601                MPI_RANK0_WRITE_SHARED(tags_End_Conn_and_Start_Offset);
602                txtBuffer[0] = '\0';
603                txtBufferInUse = 0;
604                for (i = numVTKNodesPerElement*(myFirstCell*numCellFactor+1);
605                        i <= (myFirstCell+myNumCells)*numVTKNodesPerElement*numCellFactor; i += numVTKNodesPerElement)
606                {
607                    sprintf(tmpBuffer, INT_NEWLINE_FORMAT, i);
608                    __STRCAT(txtBuffer, tmpBuffer, txtBufferInUse);
609              }              }
610              break;              MPI_WRITE_ORDERED(txtBuffer);
611            case 2:  
612              if (! set_tensor) {              /* write element type */
613                strcat(txt_buffer," Tensors=\"");              sprintf(tmpBuffer, INT_NEWLINE_FORMAT, cellType);
614                strcat(txt_buffer,names_p[i_data]);              MPI_RANK0_WRITE_SHARED(tags_End_Offset_and_Start_Type);
615                strcat(txt_buffer,"\"");              txtBuffer[0] = '\0';
616                set_tensor=TRUE;              txtBufferInUse = 0;
617                for (i = numVTKNodesPerElement*(myFirstCell*numCellFactor+1);
618                        i <= (myFirstCell+myNumCells)*numVTKNodesPerElement*numCellFactor; i += numVTKNodesPerElement)
619                {
620                    __STRCAT(txtBuffer, tmpBuffer, txtBufferInUse);
621              }              }
622              break;              MPI_WRITE_ORDERED(txtBuffer);
623            default:              /* finalize cell information */
624              sprintf(error_msg, "saveVTK: data %s: Vtk can't handle objects with rank greater than 2.",names_p[i_data]);              strcpy(txtBuffer, "</DataArray>\n</Cells>\n");
625              Finley_setError(VALUE_ERROR,error_msg);              MPI_RANK0_WRITE_SHARED(txtBuffer);
626              return;  
627            }          } else { /***** mpi_size == 1 *****/
628          }  
629        }              /* write the nodes */
630        strcat(txt_buffer, ">\n");              fputs(txtBuffer, fileHandle_p);
631        if ( mpi_size > 1) {              if (nDim==2) {
632          if ( my_mpi_rank == 0) {                  for (i = 0; i < mesh_p->Nodes->numNodes; i++) {
633             #ifdef PASO_MPI                      if ( (myFirstNode <= globalNodeIndex[i]) && (globalNodeIndex[i] < myLastNode) ) {
634                MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,txt_buffer,strlen(txt_buffer),MPI_CHAR,&mpi_req);                          fprintf(fileHandle_p, VECTOR_FORMAT,
635                MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);                              mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0, i, nDim)],
636             #endif                              mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1, i, nDim)],
637          }                              0.);
638        } else {                      }
639            fprintf(fileHandle_p,txt_buffer);                  }
       }  
       /* write the arrays */  
       for (i_data =0 ;i_data<num_data;++i_data) {  
          if (! isEmpty(data_pp[i_data]) && !isCellCentered[i_data]) {  
             txt_buffer[0] = '\0';  
             txt_buffer_in_use=0;  
             numPointsPerSample=getNumDataPointsPerSample(data_pp[i_data]);  
             rank = getDataPointRank(data_pp[i_data]);  
             nComp = getDataPointSize(data_pp[i_data]);  
             if (getFunctionSpaceType(data_pp[i_data]) == FINLEY_REDUCED_NODES) {  
                nodeMapping=mesh_p->Nodes->reducedNodesMapping;  
640              } else {              } else {
641                 nodeMapping=mesh_p->Nodes->nodesMapping;                  for (i = 0; i < mesh_p->Nodes->numNodes; i++) {
642              }                      if ( (myFirstNode <= globalNodeIndex[i]) && (globalNodeIndex[i] < myLastNode) ) {
643              nCompReqd=1;   /* the number of components mpi_required by vtk */                          fprintf(fileHandle_p, VECTOR_FORMAT,
644              shape=0;                              mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0, i, nDim)],
645              if (rank == 0) {                              mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1, i, nDim)],
646                nCompReqd = 1;                              mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(2, i, nDim)]);
647              } else if (rank == 1) {                      }
648                shape=getDataPointShape(data_pp[i_data], 0);                  }
649                if  (shape>3) {              } /* nDim */
650                  Finley_setError(VALUE_ERROR, "saveVTK: rank 1 object must have less then 4 components");  
651                }              /* write the cells */
652                nCompReqd = 3;              fputs(tags_End_Points_and_Start_Conn, fileHandle_p);
653                if (nodeIndex == NULL) {
654                    for (i = 0; i < numCells; i++) {
655                        for (j = 0; j < numVTKNodesPerElement; j++) {
656                            fprintf(fileHandle_p, INT_FORMAT, globalNodeIndex[elements->Nodes[INDEX2(j, i, NN)]]);
657                        }
658                        fprintf(fileHandle_p, NEWLINE);
659                    }
660              } else {              } else {
661                shape=getDataPointShape(data_pp[i_data], 0);                  for (i = 0; i < numCells; i++) {
662                if  (shape>3 || shape != getDataPointShape(data_pp[i_data], 1)) {                      for (l = 0; l < numCellFactor; l++) {
663                  Finley_setError(VALUE_ERROR, "saveVTK: rank 2 object must have less then 4x4 components and must have a square shape");                          const int* idx=&nodeIndex[l*numVTKNodesPerElement];
664                }                          for (j = 0; j < numVTKNodesPerElement; j++) {
665                nCompReqd = 9;                              fprintf(fileHandle_p, INT_FORMAT, globalNodeIndex[elements->Nodes[INDEX2(idx[j], i, NN)]]);
666                            }
667                            fprintf(fileHandle_p, NEWLINE);
668                        }
669                    }
670                } /* nodeIndex */
671    
672                /* write the offsets */
673                fputs(tags_End_Conn_and_Start_Offset, fileHandle_p);
674                for (i = numVTKNodesPerElement; i <= numCells*numVTKNodesPerElement*numCellFactor; i += numVTKNodesPerElement) {
675                    fprintf(fileHandle_p, INT_NEWLINE_FORMAT, i);
676                }
677    
678                /* write element type */
679                sprintf(tmpBuffer, INT_NEWLINE_FORMAT, cellType);
680                fputs(tags_End_Offset_and_Start_Type, fileHandle_p);
681                for (i = 0; i < numCells*numCellFactor; i++)
682                    fputs(tmpBuffer, fileHandle_p);
683                /* finalize cell information */
684                fputs("</DataArray>\n</Cells>\n", fileHandle_p);
685            } /* mpi_size */
686    
687        } /* Finley_noError */
688    
689        /************************************************************************/
690        /* write cell data */
691    
692        if (writeCellData && Finley_noError()) {
693            bool_t set_scalar=FALSE, set_vector=FALSE, set_tensor=FALSE;
694            /* mark the active data arrays */
695            strcpy(txtBuffer, "<CellData");
696            for (dataIdx = 0; dataIdx < num_data; dataIdx++) {
697                if (!isEmpty(data_pp[dataIdx]) && isCellCentered[dataIdx]) {
698                    /* rank == 0 <--> scalar data */
699                    /* rank == 1 <--> vector data */
700                    /* rank == 2 <--> tensor data */
701                    switch (getDataPointRank(data_pp[dataIdx])) {
702                        case 0:
703                            if (!set_scalar) {
704                                strcat(txtBuffer, " Scalars=\"");
705                                strcat(txtBuffer, names_p[dataIdx]);
706                                strcat(txtBuffer, "\"");
707                                set_scalar = TRUE;
708                            }
709                        break;
710                        case 1:
711                            if (!set_vector) {
712                                strcat(txtBuffer, " Vectors=\"");
713                                strcat(txtBuffer, names_p[dataIdx]);
714                                strcat(txtBuffer, "\"");
715                                set_vector = TRUE;
716                            }
717                        break;
718                        case 2:
719                            if (!set_tensor) {
720                                strcat(txtBuffer, " Tensors=\"");
721                                strcat(txtBuffer, names_p[dataIdx]);
722                                strcat(txtBuffer, "\"");
723                                set_tensor = TRUE;
724                            }
725                        break;
726                        default:
727                            sprintf(errorMsg, "saveVTK: data %s: VTK supports data with rank <= 2 only.", names_p[dataIdx]);
728                            Finley_setError(VALUE_ERROR, errorMsg);
729                    }
730              }              }
731              if (Finley_noError()) {              if (!Finley_noError())
732                 sprintf(txt_buffer,tag_Float_DataArray,names_p[i_data], nCompReqd);                  break;
733                 if ( mpi_size > 1) {          }
734                   if ( my_mpi_rank == 0) {      }
735                      #ifdef PASO_MPI      /* only continue if no error occurred */
736                         MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,txt_buffer,strlen(txt_buffer),MPI_CHAR,&mpi_req);      if (writeCellData && Finley_noError()) {
737                         MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);          strcat(txtBuffer, ">\n");
738                      #endif          if ( mpi_size > 1) {
739                   }              MPI_RANK0_WRITE_SHARED(txtBuffer);
740                 } else {          } else {
741                     fprintf(fileHandle_p,txt_buffer);              fputs(txtBuffer, fileHandle_p);
742                 }          }
743                 for (i=0; i<mesh_p->Nodes->numNodes; i++) {  
744                    k=globalNodeIndex[i];          /* write the arrays */
745                    if ( (myFirstNode <= k) && (k < myLastNode) ) {          for (dataIdx = 0; dataIdx < num_data; dataIdx++) {
746                       values = getSampleData(data_pp[i_data], nodeMapping->target[i]);              if (!isEmpty(data_pp[dataIdx]) && isCellCentered[dataIdx]) {
747                       /* if the number of mpi_required components is more than the number                  dim_t numPointsPerSample=getNumDataPointsPerSample(data_pp[dataIdx]);
748                       * of actual components, pad with zeros                  dim_t rank = getDataPointRank(data_pp[dataIdx]);
749                       */                  dim_t nComp = getDataPointSize(data_pp[dataIdx]);
750                       /* probably only need to get shape of first element */                  dim_t nCompReqd = 1; /* number of components mpi_required */
751                       /* write the data different ways for scalar, vector and tensor */                  if (rank == 0) {
752                       if (nCompReqd == 1) {                      nCompReqd = 1;
753                         sprintf(tmp_buffer,FLOAT_SCALAR_FORMAT,values[0]);                      shape = 0;
754                       } else if (nCompReqd == 3) {                  } else if (rank == 1) {
755                         if (shape==1) {                      nCompReqd = 3;
756                          sprintf(tmp_buffer,FLOAT_VECTOR_FORMAT,values[0],0.,0.);                      shape = getDataPointShape(data_pp[dataIdx], 0);
757                         } else if (shape==2) {                      if (shape > 3) {
758                          sprintf(tmp_buffer,FLOAT_VECTOR_FORMAT,values[0],values[1],0.);                          Finley_setError(VALUE_ERROR, "saveVTK: rank 1 objects must have 3 components at most.");
759                         } else if (shape==3) {                      }
760                          sprintf(tmp_buffer,FLOAT_VECTOR_FORMAT,values[0],values[1],values[2]);                  } else {
761                         }                      nCompReqd = 9;
762                       } else if (nCompReqd == 9) {                      shape = getDataPointShape(data_pp[dataIdx], 0);
763                         if (shape==1) {                      if (shape > 3 || shape != getDataPointShape(data_pp[dataIdx], 1)) {
764                          sprintf(tmp_buffer,FLOAT_TENSOR_FORMAT,values[0],0.,0.,                          Finley_setError(VALUE_ERROR, "saveVTK: rank 2 objects of shape 2x2 or 3x3 supported only.");
765                                                                 0.,0.,0.,                      }
766                                                                 0.,0.,0.);                  }
767                         } else if (shape==2) {                  /* bail out if an error occurred */
768                          sprintf(tmp_buffer,FLOAT_TENSOR_FORMAT,values[0],values[1],0.,                  if (!Finley_noError())
769                                                                 values[2],values[3],0.,                      break;
770                                                                 0.,0.,0.);  
771                         } else if (shape==3) {                  sprintf(txtBuffer, tag_Float_DataArray, names_p[dataIdx], nCompReqd);
772                          sprintf(tmp_buffer,FLOAT_TENSOR_FORMAT,values[0],values[1],values[2],                  if ( mpi_size > 1) {
773                                                                 values[3],values[4],values[5],                      MPI_RANK0_WRITE_SHARED(txtBuffer);
774                                                                 values[6],values[7],values[8]);                  } else {
775                         }                      fputs(txtBuffer, fileHandle_p);
776                       }                  }
777                       if ( mpi_size > 1) {  
778                         __STRCAT(txt_buffer,tmp_buffer,txt_buffer_in_use);                  txtBuffer[0] = '\0';
779                       } else {                  txtBufferInUse = 0;
780                         fprintf(fileHandle_p,tmp_buffer);                  for (i=0; i<numCells; i++) {
781                       }                      if (elements->Owner[i] == my_mpi_rank) {
782                    }                          void* sampleBuffer=allocSampleBuffer(data_pp[dataIdx]);
783                 }                          __const double *values = getSampleDataRO(data_pp[dataIdx], i,sampleBuffer);
784                 if ( mpi_size > 1) {                          for (l = 0; l < numCellFactor; l++) {
785                     #ifdef PASO_MPI                              double sampleAvg[NCOMP_MAX];
786                       MPI_File_write_ordered(mpi_fileHandle_p,txt_buffer,txt_buffer_in_use, MPI_CHAR, &mpi_status);                              dim_t nCompUsed = MIN(nComp, NCOMP_MAX);
787                     #endif      
788                     if ( my_mpi_rank == 0) {                              /* average over number of points in the sample */
789                        #ifdef PASO_MPI                              if (isExpanded(data_pp[dataIdx])) {
790                           MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,tag_End_DataArray,strlen(tag_End_DataArray),MPI_CHAR,&mpi_req);                                  dim_t hits=0, hits_old;
791                           MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);                                  for (k=0; k<nCompUsed; k++) sampleAvg[k]=0;
792                        #endif                                  for (j=0; j<numPointsPerSample; j++) {
793                     }                                      hits_old=hits;
794                 } else {                                      if (nodeInQuadrant(quadNodes_p, typeId, j, l)) {
795                    fprintf(fileHandle_p,tag_End_DataArray);                                          hits++;
796                 }                                          for (k=0; k<nCompUsed; k++) {
797                                                sampleAvg[k] += values[INDEX2(k,j,nComp)];
798                                            }
799                                        }
800                                    }
801                                    for (k=0; k<nCompUsed; k++)
802                                        sampleAvg[k] /= MAX(hits, 1);
803                                } else {
804                                    for (k=0; k<nCompUsed; k++)
805                                        sampleAvg[k] = values[k];
806                                } /* isExpanded */
807    
808                                /* if the number of required components is more than
809                                 * the number of actual components, pad with zeros
810                                 */
811                                /* probably only need to get shape of first element */
812                                if (nCompReqd == 1) {
813                                    sprintf(tmpBuffer, SCALAR_FORMAT, sampleAvg[0]);
814                                } else if (nCompReqd == 3) {
815                                    if (shape==1) {
816                                        sprintf(tmpBuffer, VECTOR_FORMAT,
817                                            sampleAvg[0], 0.f, 0.f);
818                                    } else if (shape==2) {
819                                        sprintf(tmpBuffer, VECTOR_FORMAT,
820                                            sampleAvg[0], sampleAvg[1], 0.f);
821                                    } else if (shape==3) {
822                                        sprintf(tmpBuffer, VECTOR_FORMAT,
823                                            sampleAvg[0],sampleAvg[1],sampleAvg[2]);
824                                    }
825                                } else if (nCompReqd == 9) {
826                                    if (shape==1) {
827                                        sprintf(tmpBuffer, TENSOR_FORMAT,
828                                            sampleAvg[0], 0.f, 0.f,
829                                                     0.f, 0.f, 0.f,
830                                                     0.f, 0.f, 0.f);
831                                    } else if (shape==2) {
832                                        sprintf(tmpBuffer, TENSOR_FORMAT,
833                                            sampleAvg[0], sampleAvg[1], 0.f,
834                                            sampleAvg[2], sampleAvg[3], 0.f,
835                                                     0.f,          0.f, 0.f);
836                                    } else if (shape==3) {
837                                        sprintf(tmpBuffer, TENSOR_FORMAT,
838                                            sampleAvg[0],sampleAvg[1],sampleAvg[2],
839                                            sampleAvg[3],sampleAvg[4],sampleAvg[5],
840                                            sampleAvg[6],sampleAvg[7],sampleAvg[8]);
841                                    }
842                                }
843                                if ( mpi_size > 1) {
844                                    __STRCAT(txtBuffer, tmpBuffer, txtBufferInUse);
845                                } else {
846                                    fputs(tmpBuffer, fileHandle_p);
847                                }
848                            } /* for l (numCellFactor) */
849                            freeSampleBuffer(sampleBuffer);
850                        } /* if I am the owner */
851                    } /* for i (numCells) */
852    
853                    if ( mpi_size > 1) {
854                        MPI_WRITE_ORDERED(txtBuffer);
855                        MPI_RANK0_WRITE_SHARED(tag_End_DataArray);
856                    } else {
857                        fputs(tag_End_DataArray, fileHandle_p);
858                    }
859                } /* !isEmpty && cellCentered */
860            } /* for dataIdx */
861    
862            strcpy(txtBuffer, "</CellData>\n");
863            if ( mpi_size > 1) {
864                MPI_RANK0_WRITE_SHARED(txtBuffer);
865            } else {
866                fputs(txtBuffer, fileHandle_p);
867            }
868        } /* if noError && writeCellData */
869    
870        /************************************************************************/
871        /* write point data */
872    
873        if (writePointData && Finley_noError()) {
874            /* mark the active data arrays */
875            bool_t set_scalar=FALSE, set_vector=FALSE, set_tensor=FALSE;
876            strcpy(txtBuffer, "<PointData");
877            for (dataIdx = 0; dataIdx<num_data; dataIdx++) {
878                if (!isEmpty(data_pp[dataIdx]) && !isCellCentered[dataIdx]) {
879                    switch (getDataPointRank(data_pp[dataIdx])) {
880                        case 0:
881                            if (!set_scalar) {
882                                strcat(txtBuffer, " Scalars=\"");
883                                strcat(txtBuffer, names_p[dataIdx]);
884                                strcat(txtBuffer, "\"");
885                                set_scalar = TRUE;
886                            }
887                        break;
888                        case 1:
889                            if (!set_vector) {
890                                strcat(txtBuffer, " Vectors=\"");
891                                strcat(txtBuffer, names_p[dataIdx]);
892                                strcat(txtBuffer, "\"");
893                                set_vector = TRUE;
894                            }
895                        break;
896                        case 2:
897                            if (!set_tensor) {
898                                strcat(txtBuffer, " Tensors=\"");
899                                strcat(txtBuffer, names_p[dataIdx]);
900                                strcat(txtBuffer, "\"");
901                                set_tensor = TRUE;
902                            }
903                        break;
904                        default:
905                            sprintf(errorMsg, "saveVTK: data %s: VTK supports data with rank <= 2 only.", names_p[dataIdx]);
906                            Finley_setError(VALUE_ERROR, errorMsg);
907                    }
908              }              }
909            }              if (!Finley_noError())
910                    break;
911          }          }
912        }
913        /* only continue if no error occurred */
914        if (writePointData && Finley_noError()) {
915            strcat(txtBuffer, ">\n");
916            if ( mpi_size > 1) {
917                MPI_RANK0_WRITE_SHARED(txtBuffer);
918            } else {
919                fputs(txtBuffer, fileHandle_p);
920            }
921    
922            /* write the arrays */
923            for (dataIdx = 0; dataIdx < num_data; dataIdx++) {
924                if (!isEmpty(data_pp[dataIdx]) && !isCellCentered[dataIdx]) {
925                    Finley_NodeMapping* nodeMapping;
926                    dim_t rank = getDataPointRank(data_pp[dataIdx]);
927                    dim_t nCompReqd = 1; /* number of components mpi_required */
928                    if (getFunctionSpaceType(data_pp[dataIdx]) == FINLEY_REDUCED_NODES) {
929                        nodeMapping = mesh_p->Nodes->reducedNodesMapping;
930                    } else {
931                        nodeMapping = mesh_p->Nodes->nodesMapping;
932                    }
933                    if (rank == 0) {
934                        nCompReqd = 1;
935                        shape = 0;
936                    } else if (rank == 1) {
937                        nCompReqd = 3;
938                        shape = getDataPointShape(data_pp[dataIdx], 0);
939                        if (shape > 3) {
940                            Finley_setError(VALUE_ERROR, "saveVTK: rank 1 objects must have 3 components at most.");
941                        }
942                    } else {
943                        nCompReqd = 9;
944                        shape=getDataPointShape(data_pp[dataIdx], 0);
945                        if (shape > 3 || shape != getDataPointShape(data_pp[dataIdx], 1)) {
946                            Finley_setError(VALUE_ERROR, "saveVTK: rank 2 objects of shape 2x2 or 3x3 supported only.");
947                        }
948                    }
949                    /* bail out if an error occurred */
950                    if (!Finley_noError())
951                        break;
952    
953                    sprintf(txtBuffer, tag_Float_DataArray, names_p[dataIdx], nCompReqd);
954                    if ( mpi_size > 1) {
955                        MPI_RANK0_WRITE_SHARED(txtBuffer);
956                    } else {
957                        fputs(txtBuffer, fileHandle_p);
958                    }
959    
960                    txtBuffer[0] = '\0';
961                    txtBufferInUse = 0;
962                    for (i=0; i<mesh_p->Nodes->numNodes; i++) {
963                        k = globalNodeIndex[i];
964                        if ( (myFirstNode <= k) && (k < myLastNode) ) {
965                            void* sampleBuffer=allocSampleBuffer(data_pp[dataIdx]);
966                            __const double *values = getSampleDataRO(data_pp[dataIdx], nodeMapping->target[i], sampleBuffer);
967                            /* if the number of mpi_required components is more than
968                             * the number of actual components, pad with zeros.
969                             * Probably only need to get shape of first element */
970                            if (nCompReqd == 1) {
971                                sprintf(tmpBuffer, SCALAR_FORMAT, values[0]);
972                            } else if (nCompReqd == 3) {
973                                if (shape==1) {
974                                    sprintf(tmpBuffer, VECTOR_FORMAT,
975                                            values[0], 0.f, 0.f);
976                                } else if (shape==2) {
977                                    sprintf(tmpBuffer, VECTOR_FORMAT,
978                                            values[0], values[1], 0.f);
979                                } else if (shape==3) {
980                                    sprintf(tmpBuffer, VECTOR_FORMAT,
981                                            values[0], values[1], values[2]);
982                                }
983                            } else if (nCompReqd == 9) {
984                                if (shape==1) {
985                                    sprintf(tmpBuffer, TENSOR_FORMAT,
986                                        values[0], 0.f, 0.f,
987                                              0.f, 0.f, 0.f,
988                                              0.f, 0.f, 0.f);
989                                } else if (shape==2) {
990                                    sprintf(tmpBuffer, TENSOR_FORMAT,
991                                        values[0], values[1], 0.f,
992                                        values[2], values[3], 0.f,
993                                              0.f,       0.f, 0.f);
994                                } else if (shape==3) {
995                                    sprintf(tmpBuffer, TENSOR_FORMAT,
996                                        values[0], values[1], values[2],
997                                        values[3], values[4], values[5],
998                                        values[6], values[7], values[8]);
999                                }
1000                            }
1001                            if ( mpi_size > 1) {
1002                                __STRCAT(txtBuffer, tmpBuffer, txtBufferInUse);
1003                            } else {
1004                                fputs(tmpBuffer, fileHandle_p);
1005                            }
1006                            freeSampleBuffer(sampleBuffer);                 /* no-one needs values anymore */
1007                        } /* if this is my node */
1008                    } /* for i (numNodes) */
1009    
1010                    if ( mpi_size > 1) {
1011                        MPI_WRITE_ORDERED(txtBuffer);
1012                        MPI_RANK0_WRITE_SHARED(tag_End_DataArray);
1013                    } else {
1014                        fputs(tag_End_DataArray, fileHandle_p);
1015                    }
1016                } /* !isEmpty && !isCellCentered */
1017            } /* for dataIdx */
1018    
1019            strcpy(txtBuffer, "</PointData>\n");
1020          if ( mpi_size > 1) {          if ( mpi_size > 1) {
1021            if ( my_mpi_rank == 0) {              MPI_RANK0_WRITE_SHARED(txtBuffer);
              #ifdef PASO_MPI  
                 MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,tag_End_CellData,strlen(tag_End_PointData),MPI_CHAR,&mpi_req);  
                 MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);  
              #endif  
           }  
1022          } else {          } else {
1023              fprintf(fileHandle_p,tag_End_PointData);              fputs(txtBuffer, fileHandle_p);
1024          }          }
1025    }      } /* if noError && writePointData */
1026    if (Finley_noError()) {  
1027       if ( mpi_size > 1) {      /* Final write to VTK file */
1028         if ( my_mpi_rank == 0) {      if (Finley_noError()) {
1029            #ifdef PASO_MPI          if (mpi_size > 1) {
1030               MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,footer,strlen(footer),MPI_CHAR,&mpi_req);              MPI_RANK0_WRITE_SHARED(vtkFooter);
1031               MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);          } else {
1032               #ifdef MPIO_HINTS              fputs(vtkFooter, fileHandle_p);
1033                 MPI_Info_free(&mpi_info);          }
1034                 #undef MPIO_HINTS      }
1035               #endif  
1036               MPI_File_close(&mpi_fileHandle_p);      if ( mpi_size > 1) {
1037            #endif  #ifdef PASO_MPI
1038          }          MPI_File_close(&mpi_fileHandle_p);
1039       } else {          MPI_Barrier(mesh_p->Nodes->MPIInfo->comm);
1040           fprintf(fileHandle_p,footer);  #endif
1041           fclose(fileHandle_p);      } else {
1042       }          fclose(fileHandle_p);
1043    }      }
1044    TMPMEMFREE(isCellCentered);      TMPMEMFREE(isCellCentered);
1045    TMPMEMFREE(txt_buffer);      TMPMEMFREE(txtBuffer);
   return;  
1046  }  }
1047    

Legend:
Removed from v.1384  
changed lines
  Added in v.2744

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.26