/[escript]/trunk/finley/src/Mesh_saveVTK.c
ViewVC logotype

Diff of /trunk/finley/src/Mesh_saveVTK.c

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

temp_trunk_copy/finley/src/Mesh_saveVTK.c revision 1384 by phornby, Fri Jan 11 02:29:38 2008 UTC trunk/finley/src/Mesh_saveVTK.c revision 2748 by gross, Tue Nov 17 07:32:59 2009 UTC
# Line 1  Line 1 
1    
 /* $Id$ */  
   
2  /*******************************************************  /*******************************************************
3   *  *
4   *           Copyright 2003-2007 by ACceSS MNRF  * Copyright (c) 2003-2009 by University of Queensland
5   *       Copyright 2007 by University of Queensland  * Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)
6   *  * http://www.uq.edu.au/esscc
7   *                http://esscc.uq.edu.au  *
8   *        Primary Business: Queensland, Australia  * Primary Business: Queensland, Australia
9   *  Licensed under the Open Software License version 3.0  * Licensed under the Open Software License version 3.0
10   *     http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php  * http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php
11   *  *
12   *******************************************************/  *******************************************************/
13    
14  /**************************************************************/  /***************************************************************************/
15    /*   Writes data and mesh in VTK XML format to a VTU file.                 */
16  /*   writes data and mesh in a vtk file */  /*   Nodal data needs to be given on FINLEY_NODES or FINLEY_REDUCED_NODES  */
17  /*   nodal data needs to be given on FINLEY_NODES or FINLEY_REDUCED_NODES */  /***************************************************************************/
   
 /**************************************************************/  
   
18    
19  #include "Mesh.h"  #include "Mesh.h"
20  #include "Assemble.h"  #include "Assemble.h"
21  #include "vtkCellType.h"  /* copied from vtk source directory !!! */  #include "vtkCellType.h"  /* copied from vtk source directory */
22    #include "paso/PasoUtil.h"
23    
 #define LEN_PRINTED_INT_FORMAT (9+1)  
24  #define INT_FORMAT "%d "  #define INT_FORMAT "%d "
25    #define LEN_INT_FORMAT (unsigned int)(9+2)
26  #define INT_NEWLINE_FORMAT "%d\n"  #define INT_NEWLINE_FORMAT "%d\n"
27  #define FLOAT_SCALAR_FORMAT "%12.6e\n"  #define SCALAR_FORMAT "%12.6e\n"
28  #define FLOAT_VECTOR_FORMAT "%12.6e %12.6e %12.6e\n"  #define VECTOR_FORMAT "%12.6e %12.6e %12.6e\n"
29  #define FLOAT_TENSOR_FORMAT "%12.6e %12.6e %12.6e %12.6e %12.6e %12.6e %12.6e %12.6e %12.6e\n"  #define TENSOR_FORMAT "%12.6e %12.6e %12.6e %12.6e %12.6e %12.6e %12.6e %12.6e %12.6e\n"
30  #define LEN_PRINTED_FLOAT_SCALAR_FORMAT (12+1)  /* strlen("-1.234567e+789 ") == 15 */
31  #define LEN_PRINTED_FLOAT_VECTOR_FORMAT (3*(12+1)+1)  #define LEN_TENSOR_FORMAT (unsigned int)(9*15+2)
 #define LEN_PRINTED_FLOAT_TENSOR_FORMAT (9*(12+1)+1)  
32  #define NEWLINE "\n"  #define NEWLINE "\n"
33  #define LEN_TMP_BUFFER LEN_PRINTED_FLOAT_TENSOR_FORMAT+(MAX_numNodes*LEN_PRINTED_INT_FORMAT+1)+2  #define LEN_TMP_BUFFER LEN_TENSOR_FORMAT+(MAX_numNodes*LEN_INT_FORMAT+1)+2
34  #define NCOMP_MAX 9  #define NCOMP_MAX (unsigned int)9
35  #define __STRCAT(dest,chunk,dest_in_use)  \  
36  {                  \  #define __STRCAT(dest, chunk, dest_in_use) \
37    strcpy(&dest[dest_in_use], chunk); \  do {\
38    dest_in_use+=strlen(chunk); \      strcpy(&dest[dest_in_use], chunk);\
39        dest_in_use += strlen(chunk);\
40    } while(0)
41    
42    #ifdef PASO_MPI
43    /* writes buffer to file catching the empty buffer case which causes problems
44     * with some MPI versions */
45    #define MPI_WRITE_ORDERED(BUF) \
46    do {\
47        int LLEN=0; \
48        LLEN=(int) strlen(BUF); \
49        if (LLEN==0) { strcpy(BUF, ""); LLEN=0; }\
50        MPI_File_write_ordered(mpi_fileHandle_p, BUF, LLEN, MPI_CHAR, &mpi_status);\
51    } while(0)
52    
53    /* writes buffer to file on master only */
54    #define MPI_RANK0_WRITE_SHARED(BUF) \
55    do {\
56        int LLEN=0; \
57        if (my_mpi_rank == 0) {\
58            LLEN=(int) strlen(BUF); \
59            if (LLEN==0) { strcpy(BUF,""); LLEN=0; }\
60            MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p, BUF, LLEN, MPI_CHAR, &mpi_req);\
61            MPI_Wait(&mpi_req, &mpi_status);\
62        }\
63    } while(0)
64    
65    /* For reference only. Investigation needed as to which values may improve
66     * performance */
67    #if 0
68    void create_MPIInfo(MPI_Info& info)
69    {
70        MPI_Info_create(&info);
71        MPI_Info_set(info, "access_style", "write_once, sequential");
72        MPI_Info_set(info, "collective_buffering", "true");
73        MPI_Info_set(info, "cb_block_size",        "131072");
74        MPI_Info_set(info, "cb_buffer_size",       "1048567");
75        MPI_Info_set(info, "cb_nodes",             "8");
76        MPI_Info_set(info, "striping_factor",      "16");
77        MPI_Info_set(info, "striping_unit",        "424288");
78    }
79    #endif
80    
81    #else
82    
83    #define MPI_WRITE_ORDERED(A)
84    #define MPI_RANK0_WRITE_SHARED(A)
85    
86    #endif /* PASO_MPI */
87    
88    
89    /* Returns one if the node given by coords and idx is within the quadrant
90     * indexed by q and if the element type is Rec9 or Hex27, zero otherwise */
91    int nodeInQuadrant(const double *coords, ElementTypeId type, int idx, int q)
92    {
93    #define INSIDE_1D(_X_,_C_,_R_) ( ABS((_X_)-(_C_)) <= (_R_) )
94    #define INSIDE_2D(_X_,_Y_,_CX_,_CY_,_R_) ( INSIDE_1D(_X_,_CX_,_R_) && INSIDE_1D(_Y_,_CY_,_R_))
95    #define INSIDE_3D(_X_,_Y_,_Z_,_CX_,_CY_,_CZ_,_R_) ( INSIDE_1D(_X_,_CX_,_R_) && INSIDE_1D(_Y_,_CY_,_R_) && INSIDE_1D(_Z_,_CZ_,_R_) )
96    
97        int ret;
98        if ( (type == Rec9) || (type == Rec9Macro) ) {
99            if (q==0)
100                ret = INSIDE_2D(coords[2*idx], coords[2*idx+1], 0.25, 0.25, 0.25);
101            else if (q==1)
102                ret = INSIDE_2D(coords[2*idx], coords[2*idx+1], 0.75, 0.25, 0.25);
103            else if (q==2)
104                ret = INSIDE_2D(coords[2*idx], coords[2*idx+1], 0.25, 0.75, 0.25);
105            else if (q==3)
106                ret = INSIDE_2D(coords[2*idx], coords[2*idx+1], 0.75, 0.75, 0.25);
107            else
108                ret = 0;
109        } else if ((type == Hex27) || (type == Hex27Macro) ){
110            if (q==0)
111                ret = INSIDE_3D(coords[3*idx], coords[3*idx+1], coords[3*idx+2],
112                        0.25, 0.25, 0.25, 0.25);
113            else if (q==1)
114                ret = INSIDE_3D(coords[3*idx], coords[3*idx+1], coords[3*idx+2],
115                        0.75, 0.25, 0.25, 0.25);
116            else if (q==2)
117                ret = INSIDE_3D(coords[3*idx], coords[3*idx+1], coords[3*idx+2],
118                        0.25, 0.75, 0.25, 0.25);
119            else if (q==3)
120                ret = INSIDE_3D(coords[3*idx], coords[3*idx+1], coords[3*idx+2],
121                        0.75, 0.75, 0.25, 0.25);
122            else if (q==4)
123                ret = INSIDE_3D(coords[3*idx], coords[3*idx+1], coords[3*idx+2],
124                        0.25, 0.25, 0.75, 0.25);
125            else if (q==5)
126                ret = INSIDE_3D(coords[3*idx], coords[3*idx+1], coords[3*idx+2],
127                        0.75, 0.25, 0.75, 0.25);
128            else if (q==6)
129                ret = INSIDE_3D(coords[3*idx], coords[3*idx+1], coords[3*idx+2],
130                        0.25, 0.75, 0.75, 0.25);
131            else if (q==7)
132                ret = INSIDE_3D(coords[3*idx], coords[3*idx+1], coords[3*idx+2],
133                        0.75, 0.75, 0.75, 0.25);
134            else
135                ret = 0;
136        } else {
137            ret = 1;
138        }
139        return ret;
140  }  }
141    
142  void Finley_Mesh_saveVTK(const char * filename_p,  void Finley_Mesh_saveVTK(const char *filename_p,
143                           Finley_Mesh *mesh_p,                           Finley_Mesh *mesh_p,
144                           const dim_t num_data,                           const dim_t num_data,
145                           char* *names_p,                           char **names_p,
146                           escriptDataC* *data_pp)                           escriptDataC **data_pp,
147                             const char* metadata,
148                             const char*metadata_schema)
149  {  {
150    char error_msg[LenErrorMsg_MAX], *txt_buffer=NULL, tmp_buffer[LEN_TMP_BUFFER];  #ifdef PASO_MPI
151    double sampleAvg[NCOMP_MAX], *values, rtmp;      MPI_File mpi_fileHandle_p;
152    size_t len_txt_buffer, max_len_names, txt_buffer_in_use;      MPI_Status mpi_status;
153    FILE * fileHandle_p = NULL;      MPI_Request mpi_req;
154    int mpi_size, i_data, i,j , cellType;      MPI_Info mpi_info = MPI_INFO_NULL;
155    dim_t nDim, globalNumPoints, numCells, globalNumCells, numVTKNodesPerElement, myNumPoints, numPointsPerSample, rank, nComp, nCompReqd, shape, NN, numCellFactor, myNumCells, max_name_len;  #endif
156    bool_t do_write, *isCellCentered=NULL,write_celldata=FALSE,write_pointdata=FALSE;      Paso_MPI_rank my_mpi_rank;
157    bool_t set_scalar=FALSE,set_vector=FALSE, set_tensor=FALSE;      FILE *fileHandle_p = NULL;
158    index_t myFirstNode, myLastNode, *globalNodeIndex, k, *node_index, myFirstCell;      char errorMsg[LenErrorMsg_MAX], *txtBuffer;
159    #ifdef PASO_MPI      char tmpBuffer[LEN_TMP_BUFFER];
160    int ierr;      size_t txtBufferSize, txtBufferInUse, maxNameLen;
161    int amode = MPI_MODE_CREATE | MPI_MODE_WRONLY |  MPI_MODE_SEQUENTIAL;      double *quadNodes_p = NULL;
162    MPI_File mpi_fileHandle_p;      dim_t dataIdx, nDim;
163    MPI_Status mpi_status;      dim_t numCells=0, globalNumCells=0, numVTKNodesPerElement=0;
164    MPI_Request mpi_req;      dim_t myNumPoints=0, globalNumPoints=0;
165    MPI_Info mpi_info=MPI_INFO_NULL;      dim_t shape, NN=0, numCellFactor=1, myNumCells=0;
166    #endif      bool_t *isCellCentered;
167    Paso_MPI_rank my_mpi_rank;      bool_t writeCellData=FALSE, writePointData=FALSE, hasReducedElements=FALSE;
168    int nodetype=FINLEY_NODES;      index_t myFirstNode=0, myLastNode=0, *globalNodeIndex=NULL;
169    int elementtype=FINLEY_UNKNOWN;      index_t myFirstCell=0, k;
170    char elemTypeStr[32];      int mpi_size, i, j, l;
171    Finley_NodeMapping *nodeMapping=NULL;      int cellType=0, nodeType=FINLEY_NODES, elementType=FINLEY_UNKNOWN;
172    Finley_ElementFile* elements=NULL;      Finley_ElementFile *elements = NULL;
173    ElementTypeId TypeId;      ElementTypeId typeId = NoRef;
174      
175        const char *vtkHeader = \
176    /****************************************/        "<?xml version=\"1.0\"?>\n" \
177    /*                                      */        "<VTKFile type=\"UnstructuredGrid\" version=\"0.1\"%s%s>\n%s%s" \
178    /*       tags in the vtk file           */        "<UnstructuredGrid>\n" \
179          "<Piece NumberOfPoints=\"%d\" NumberOfCells=\"%d\">\n" \
180    char* tags_header="<?xml version=\"1.0\"?>\n" \        "<Points>\n" \
181                      "<VTKFile type=\"UnstructuredGrid\" version=\"0.1\">\n" \        "<DataArray NumberOfComponents=\"%d\" type=\"Float64\" format=\"ascii\">\n";
182                      "<UnstructuredGrid>\n" \      char *vtkFooter = "</Piece>\n</UnstructuredGrid>\n</VTKFile>\n";
183                      "<Piece NumberOfPoints=\"%d\" NumberOfCells=\"%d\">\n" \      const char *tag_Float_DataArray="<DataArray Name=\"%s\" type=\"Float64\" NumberOfComponents=\"%d\" format=\"ascii\">\n";
184                      "<Points>\n" \      char *tags_End_Points_and_Start_Conn = "</DataArray>\n</Points>\n<Cells>\n<DataArray Name=\"connectivity\" type=\"Int32\" format=\"ascii\">\n" ;
185                      "<DataArray NumberOfComponents=\"%d\" type=\"Float64\" format=\"ascii\">\n";      char *tags_End_Conn_and_Start_Offset = "</DataArray>\n<DataArray Name=\"offsets\" type=\"Int32\" format=\"ascii\">\n";
186    char *tag_End_DataArray = "</DataArray>\n";      char *tags_End_Offset_and_Start_Type = "</DataArray>\n<DataArray Name=\"types\" type=\"UInt8\" format=\"ascii\">\n";
187    char* tag_End_PointData =  "</PointData>\n";      char *tag_End_DataArray = "</DataArray>\n";
188    char* tag_End_CellData =  "</CellData>\n";  
189    char *footer = "</Piece>\n</UnstructuredGrid>\n</VTKFile>\n";      const int VTK_HEX20_INDEX[] =
190    char* tags_End_Points_and_Start_Conn = "</DataArray>\n</Points>\n<Cells>\n<DataArray Name=\"connectivity\" type=\"Int32\" format=\"ascii\">\n" ;        { 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 16, 17, 18, 19, 12, 13, 14, 15 };
191    char* tags_End_Conn_and_Start_Offset = "</DataArray>\n<DataArray Name=\"offsets\" type=\"Int32\" format=\"ascii\">\n";      const int VTK_REC9_INDEX[] =
192    char* tags_End_Offset_and_Start_Type = "</DataArray>\n<DataArray Name=\"types\" type=\"UInt8\" format=\"ascii\">\n";        { 0, 4, 8, 7,  4, 1, 5, 8,  7, 8, 6, 3,  8, 5, 2, 6 };
193    char* tag_Float_DataArray="<DataArray Name=\"%s\" type=\"Float64\" NumberOfComponents=\"%d\" format=\"ascii\">\n";      const int VTK_HEX27_INDEX[] =
194    char *tags_End_Type_And_Cells = "</DataArray>\n</Cells>\n";        {  0,  8, 20, 11, 12, 21, 26, 24,
195             8,  1,  9, 20, 21, 13, 22, 26,
196    int VTK_QUADRATIC_HEXAHEDRON_INDEX[] = { 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 16, 17, 18, 19, 12, 13, 14, 15 };          11, 20, 10,  3, 24, 26, 23, 15,
197    /* if there is no mesh we just return */          20,  9,  2, 10, 26, 22, 14, 23,
198    if (mesh_p==NULL) return;          12, 21, 26, 24,  4, 16, 25, 19,
199            21, 13, 22, 26, 16,  5, 17, 25,
200    my_mpi_rank = mesh_p->Nodes->MPIInfo->rank;          24, 26, 23, 15, 19, 25, 18,  7,
201    mpi_size  = mesh_p->Nodes->MPIInfo->size;          26, 22, 14, 23, 25, 17,  6, 18 };
202    nDim = mesh_p->Nodes->numDim;  
203        /* if there is no mesh we just return */
204    if (! ( (nDim ==2) || (nDim == 3) ) ) {      if (mesh_p==NULL) return;
205          Finley_setError(IO_ERROR, "saveVTK: spatial dimension 2 or 3 is supported only.");  
206          return;        nDim = mesh_p->Nodes->numDim;
207    }  
208    /*************************************************************************************/      if (nDim != 2 && nDim != 3) {
209            Finley_setError(TYPE_ERROR, "saveVTK: spatial dimension 2 or 3 is supported only.");
210    /* open the file and check handle */          return;
211        }
212    if (mpi_size > 1) {      my_mpi_rank = mesh_p->Nodes->MPIInfo->rank;
213          #ifdef PASO_MPI      mpi_size = mesh_p->Nodes->MPIInfo->size;
214            /* Collective Call */  
215            #ifdef MPIO_HINTS      /************************************************************************
216              MPI_Info_create(&mpi_info);       * open the file and check handle *
217              /*  MPI_Info_set(mpi_info, "striping_unit",        "424288"); */       */
218              /*  MPI_Info_set(mpi_info, "striping_factor",      "16"); */      if (mpi_size > 1) {
219              /*  MPI_Info_set(mpi_info, "collective_buffering", "true"); */  #ifdef PASO_MPI
220              /*  MPI_Info_set(mpi_info, "cb_block_size",        "131072"); */          const int amode = MPI_MODE_CREATE|MPI_MODE_WRONLY|MPI_MODE_UNIQUE_OPEN;
221              /*  MPI_Info_set(mpi_info, "cb_buffer_size",       "1048567"); */          int ierr;
222              /*  MPI_Info_set(mpi_info, "cb_nodes",             "8"); */          if (my_mpi_rank == 0 && Paso_fileExists(filename_p)) {
223              /*    MPI_Info_set(mpi_info, "access_style", "write_once, sequential"); */              remove(filename_p);
             
             /*XFS only */  
             /*   MPI_Info_set(mpi_info, "direct_write",          "true"); */  
           #endif  
           ierr=MPI_File_open(mesh_p->Nodes->MPIInfo->comm, (char*)filename_p, amode,mpi_info, &mpi_fileHandle_p);  
           if (! ierr) {  
           perror(filename_p);  
               sprintf(error_msg, "saveVTK: File %s could not be opened for writing in parallel.", filename_p);  
               Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);  
           } else {  
              MPI_File_set_view(mpi_fileHandle_p,MPI_DISPLACEMENT_CURRENT,MPI_CHAR, MPI_CHAR, "native" , mpi_info);  
           }  
         #endif  
   } else {  
         fileHandle_p = fopen(filename_p, "w");  
         if (fileHandle_p==NULL) {  
            sprintf(error_msg, "saveVTK: File %s could not be opened for writing.", filename_p);  
            Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);  
          }  
   }  
   if (! Paso_MPIInfo_noError(mesh_p->Nodes->MPIInfo) ) return;  
   /*************************************************************************************/  
   
   /* find the mesh type to be written */  
   
   isCellCentered=TMPMEMALLOC(num_data,bool_t);  
   max_len_names=0;  
   if (!Finley_checkPtr(isCellCentered)) {  
      nodetype=FINLEY_UNKNOWN;  
      elementtype=FINLEY_UNKNOWN;  
      for (i_data=0;i_data<num_data;++i_data) {  
        if (! isEmpty(data_pp[i_data])) {  
          switch(getFunctionSpaceType(data_pp[i_data]) ) {  
          case FINLEY_NODES:  
            nodetype = (nodetype == FINLEY_REDUCED_NODES) ? FINLEY_REDUCED_NODES : FINLEY_NODES;  
            isCellCentered[i_data]=FALSE;  
            if (elementtype==FINLEY_UNKNOWN || elementtype==FINLEY_ELEMENTS) {  
              elementtype=FINLEY_ELEMENTS;  
            } else {  
              Finley_setError(TYPE_ERROR,"saveVTK: cannot write given data in single file.");  
            }  
            break;  
          case FINLEY_REDUCED_NODES:  
            nodetype = FINLEY_REDUCED_NODES;  
            isCellCentered[i_data]=FALSE;  
            if (elementtype==FINLEY_UNKNOWN || elementtype==FINLEY_ELEMENTS) {  
              elementtype=FINLEY_ELEMENTS;  
            } else {  
              Finley_setError(TYPE_ERROR,"saveVTK: cannot write given data in single file.");  
            }  
            break;  
          case FINLEY_ELEMENTS:  
          case FINLEY_REDUCED_ELEMENTS:  
            isCellCentered[i_data]=TRUE;  
            if (elementtype==FINLEY_UNKNOWN || elementtype==FINLEY_ELEMENTS) {  
              elementtype=FINLEY_ELEMENTS;  
            } else {  
              Finley_setError(TYPE_ERROR,"saveVTK: cannot write given data in single file.");  
            }  
            break;  
          case FINLEY_FACE_ELEMENTS:  
          case FINLEY_REDUCED_FACE_ELEMENTS:  
            isCellCentered[i_data]=TRUE;  
            if (elementtype==FINLEY_UNKNOWN || elementtype==FINLEY_FACE_ELEMENTS) {  
              elementtype=FINLEY_FACE_ELEMENTS;  
            } else {  
              Finley_setError(TYPE_ERROR,"saveVTK: cannot write given data in single file.");  
            }  
            break;  
          case FINLEY_POINTS:  
            isCellCentered[i_data]=TRUE;  
            if (elementtype==FINLEY_UNKNOWN || elementtype==FINLEY_POINTS) {  
              elementtype=FINLEY_POINTS;  
            } else {  
              Finley_setError(TYPE_ERROR,"saveVTK: cannot write given data in single file.");  
            }  
            break;  
          case FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1:  
          case FINLEY_REDUCED_CONTACT_ELEMENTS_1:  
            isCellCentered[i_data]=TRUE;  
            if (elementtype==FINLEY_UNKNOWN || elementtype==FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1) {  
              elementtype=FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1;  
            } else {  
              Finley_setError(TYPE_ERROR,"saveVTK: cannot write given data in single file.");  
            }  
            break;  
          case FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_2:  
          case FINLEY_REDUCED_CONTACT_ELEMENTS_2:  
            isCellCentered[i_data]=TRUE;  
            if (elementtype==FINLEY_UNKNOWN || elementtype==FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1) {  
              elementtype=FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1;  
            } else {  
              Finley_setError(TYPE_ERROR,"saveVTK: cannot write given data in single file.");  
            }  
            break;  
          default:  
            sprintf(error_msg,"saveVTK: unknown function space type %d",getFunctionSpaceType(data_pp[i_data]));  
            Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
          }  
          if (isCellCentered[i_data]) {  
            write_celldata=TRUE;  
          } else {  
            write_pointdata=TRUE;  
          }  
          max_len_names =MAX(max_len_names,strlen(names_p[i_data]));  
        }  
      }  
      nodetype = (nodetype == FINLEY_UNKNOWN) ? FINLEY_NODES : nodetype;  
   }  
   if (Finley_noError()) {  
   
      /***************************************/  
   
      /* select number of points and the mesh component */  
     
      if (nodetype == FINLEY_REDUCED_NODES) {  
         myFirstNode = Finley_NodeFile_getFirstReducedNode(mesh_p->Nodes);  
         myLastNode = Finley_NodeFile_getLastReducedNode(mesh_p->Nodes);  
         globalNumPoints = Finley_NodeFile_getGlobalNumReducedNodes(mesh_p->Nodes);  
         globalNodeIndex= Finley_NodeFile_borrowGlobalReducedNodesIndex(mesh_p->Nodes);  
      } else {  
         myFirstNode = Finley_NodeFile_getFirstNode(mesh_p->Nodes);  
         myLastNode = Finley_NodeFile_getLastNode(mesh_p->Nodes);  
         globalNumPoints = Finley_NodeFile_getGlobalNumNodes(mesh_p->Nodes);  
         globalNodeIndex= Finley_NodeFile_borrowGlobalNodesIndex(mesh_p->Nodes);  
      }  
      myNumPoints = myLastNode - myFirstNode;  
      if (elementtype==FINLEY_UNKNOWN) elementtype=FINLEY_ELEMENTS;  
      switch(elementtype) {  
        case FINLEY_ELEMENTS:  
           elements=mesh_p->Elements;  
           break;  
         case FINLEY_FACE_ELEMENTS:  
           elements=mesh_p->FaceElements;  
           break;  
         case FINLEY_POINTS:  
           elements=mesh_p->Points;  
           break;  
         case FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1:  
           elements=mesh_p->ContactElements;  
           break;  
      }  
      if (elements==NULL) {  
        Finley_setError(SYSTEM_ERROR,"saveVTK: undefined element file");  
      } else {  
        /* map finley element type to VTK element type */  
        numCells = elements->numElements;  
        globalNumCells = Finley_ElementFile_getGlobalNumElements(elements);  
        myNumCells= Finley_ElementFile_getMyNumElements(elements);  
        myFirstCell= Finley_ElementFile_getFirstElement(elements);  
        NN = elements->numNodes;  
        if (nodetype==FINLEY_REDUCED_NODES || nodetype==FINLEY_REDUCED_NODES) {  
           TypeId = elements->LinearReferenceElement->Type->TypeId;  
        } else {  
           TypeId = elements->ReferenceElement->Type->TypeId;  
        }  
        switch(TypeId) {  
         case Point1:  
         case Line2Face:  
         case Line3Face:  
         case Point1_Contact:  
         case Line2Face_Contact:  
         case Line3Face_Contact:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_VERTEX;  
           numVTKNodesPerElement = 1;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_VERTEX");  
           break;  
         
         case Line2:  
         case Tri3Face:  
         case Rec4Face:  
         case Line2_Contact:  
         case Tri3_Contact:  
         case Tri3Face_Contact:  
         case Rec4Face_Contact:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_LINE;  
           numVTKNodesPerElement = 2;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_LINE");  
           break;  
         
         case Tri3:  
         case Tet4Face:  
         case Tet4Face_Contact:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_TRIANGLE;  
           numVTKNodesPerElement = 3;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_TRIANGLE");  
           break;  
         
         case Rec4:  
         case Hex8Face:  
         case Rec4_Contact:  
         case Hex8Face_Contact:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_QUAD;  
           numVTKNodesPerElement = 4;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_QUAD");  
           break;  
         
         case Tet4:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_TETRA;  
           numVTKNodesPerElement = 4;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_TETRA");  
           break;  
         
         case Hex8:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_HEXAHEDRON;  
           numVTKNodesPerElement = 8;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_HEXAHEDRON");  
           break;  
         
         case Line3:  
         case Tri6Face:  
         case Rec8Face:  
         case Line3_Contact:  
         case Tri6Face_Contact:  
         case Rec8Face_Contact:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_QUADRATIC_EDGE;  
           numVTKNodesPerElement = 3;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_QUADRATIC_EDGE");  
           break;  
         
         case Tri6:  
         case Tet10Face:  
         case Tri6_Contact:  
         case Tet10Face_Contact:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_QUADRATIC_TRIANGLE;  
           numVTKNodesPerElement = 6;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_QUADRATIC_TRIANGLE");  
           break;  
         
         case Rec8:  
         case Hex20Face:  
         case Rec8_Contact:  
         case Hex20Face_Contact:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_QUADRATIC_QUAD;  
           numVTKNodesPerElement = 8;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_QUADRATIC_QUAD");  
           break;  
         
         case Tet10:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_QUADRATIC_TETRA;  
           numVTKNodesPerElement = 10;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_QUADRATIC_TETRA");  
           break;  
         
         case Hex20:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_QUADRATIC_HEXAHEDRON;  
           numVTKNodesPerElement = 20;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_QUADRATIC_HEXAHEDRON");  
           break;  
         
         default:  
           sprintf(error_msg, "saveVTK: Element type %s is not supported by VTK",elements->ReferenceElement->Type->Name);  
           Finley_setError(VALUE_ERROR,error_msg);  
         }  
      }  
   }  
   /***************************************/  
   
   /***************************************/  
   /*                                     */  
   /*   allocate text buffer              */  
   /*                                     */  
   max_name_len=0;  
   for (i_data =0 ;i_data<num_data;++i_data) max_name_len=MAX(max_name_len,strlen(names_p[i_data]));  
   len_txt_buffer= strlen(tags_header) + 3 * LEN_PRINTED_INT_FORMAT + (30+3*max_name_len); /* header */  
   if (mpi_size > 1) len_txt_buffer=MAX(len_txt_buffer, myNumPoints * LEN_TMP_BUFFER);  
   if (mpi_size > 1) len_txt_buffer=MAX(len_txt_buffer, numCellFactor*myNumCells*(LEN_PRINTED_INT_FORMAT*numVTKNodesPerElement+1));  
   len_txt_buffer=MAX(len_txt_buffer,200+3*max_len_names);  
   len_txt_buffer=MAX(len_txt_buffer, strlen(tag_Float_DataArray) + LEN_PRINTED_INT_FORMAT + max_len_names);  
   if (mpi_size > 1) len_txt_buffer=MAX(len_txt_buffer, numCellFactor*myNumCells*LEN_PRINTED_FLOAT_TENSOR_FORMAT);  
   if (mpi_size > 1) len_txt_buffer=MAX(len_txt_buffer, myNumPoints*LEN_PRINTED_FLOAT_TENSOR_FORMAT);  
   txt_buffer=TMPMEMALLOC(len_txt_buffer+1,char);  
   Finley_checkPtr(txt_buffer);  
     
   if (Finley_noError()) {  
   
      /* select number of points and the mesh component */  
   
      sprintf(txt_buffer,tags_header,globalNumPoints,numCellFactor*globalNumCells,3);  
   
       if (mpi_size > 1) {  
           if ( my_mpi_rank == 0) {  
             #ifdef PASO_MPI  
               MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,txt_buffer,strlen(txt_buffer),MPI_CHAR,&mpi_req);  
               MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);  
             #endif  
           }  
       } else {  
          fprintf(fileHandle_p,txt_buffer);  
       }  
   
       /* write the nodes */  
         
       if (mpi_size > 1) {  
   
          txt_buffer[0] = '\0';  
          txt_buffer_in_use=0;  
          if (nDim==2) {  
             for (i = 0; i < mesh_p->Nodes->numNodes; i++) {  
                if ( (myFirstNode <= globalNodeIndex[i]) && (globalNodeIndex[i] < myLastNode) ) {  
                  sprintf(tmp_buffer,FLOAT_VECTOR_FORMAT,  
                                     mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0, i, nDim)],  
                                     mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1, i, nDim)],  
                                     0.);  
                  __STRCAT(txt_buffer,tmp_buffer,txt_buffer_in_use);  
                }  
             }        
          } else {  
             for (i = 0; i < mesh_p->Nodes->numNodes; i++) {  
                if ( (myFirstNode <= globalNodeIndex[i]) && (globalNodeIndex[i] < myLastNode) ) {  
                  sprintf(tmp_buffer,FLOAT_VECTOR_FORMAT,  
                                                   mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0, i, nDim)],  
                                                   mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1, i, nDim)],  
                                                   mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(2, i, nDim)]);  
                  __STRCAT(txt_buffer,tmp_buffer,txt_buffer_in_use);  
                }  
             }      
     
          }  
          #ifdef PASO_MPI  
             MPI_File_write_ordered(mpi_fileHandle_p, txt_buffer,txt_buffer_in_use, MPI_CHAR, &mpi_status);  
          #endif      
       } else {  
          if (nDim==2) {  
             for (i = 0; i < mesh_p->Nodes->numNodes; i++) {  
                if ( (myFirstNode <= globalNodeIndex[i]) && (globalNodeIndex[i] < myLastNode) ) {  
                  fprintf(fileHandle_p,FLOAT_VECTOR_FORMAT,  
                                       mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0, i, nDim)],  
                                       mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1, i, nDim)],  
                                       0.);  
                }  
             }        
          } else {  
             for (i = 0; i < mesh_p->Nodes->numNodes; i++) {  
                if ( (myFirstNode <= globalNodeIndex[i]) && (globalNodeIndex[i] < myLastNode) ) {  
                  fprintf(fileHandle_p,FLOAT_VECTOR_FORMAT,  
                                               mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0, i, nDim)],  
                                               mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1, i, nDim)],  
                                               mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(2, i, nDim)]);  
                }  
             }      
     
          }  
       }  
   
       /* close the Points and open connectivity */  
   
       if (mpi_size > 1) {  
           if ( my_mpi_rank == 0) {  
              #ifdef PASO_MPI  
                 MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p, tags_End_Points_and_Start_Conn, strlen(tags_End_Points_and_Start_Conn), MPI_CHAR, &mpi_req);  
                 MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);  
              #endif  
           }  
       } else {  
          fprintf(fileHandle_p,tags_End_Points_and_Start_Conn);  
       }  
   
      /* write the cells */  
      if (nodetype == FINLEY_REDUCED_NODES) {  
         node_index=elements->ReferenceElement->Type->linearNodes;  
      } else if (VTK_QUADRATIC_HEXAHEDRON==cellType) {  
         node_index=VTK_QUADRATIC_HEXAHEDRON_INDEX;  
      } else if (numVTKNodesPerElement!=NN) {  
         node_index=elements->ReferenceElement->Type->geoNodes;  
      } else {  
         node_index=NULL;  
      }  
   
      if ( mpi_size > 1) {  
         txt_buffer[0] = '\0';  
         txt_buffer_in_use=0;  
         if (node_index == NULL) {  
            for (i = 0; i < numCells; i++) {  
               if (elements->Owner[i] == my_mpi_rank) {  
                  for (j = 0; j < numVTKNodesPerElement; j++) {  
                      sprintf(tmp_buffer,INT_FORMAT,globalNodeIndex[elements->Nodes[INDEX2(j, i, NN)]]);  
                      __STRCAT(txt_buffer,tmp_buffer,txt_buffer_in_use)  
                  }  
                  __STRCAT(txt_buffer,NEWLINE,txt_buffer_in_use)  
               }  
            }  
         } else {  
            for (i = 0; i < numCells; i++) {  
               if (elements->Owner[i] == my_mpi_rank) {  
                  for (j = 0; j < numVTKNodesPerElement; j++) {  
                      sprintf(tmp_buffer,INT_FORMAT,globalNodeIndex[elements->Nodes[INDEX2(node_index[j], i, NN)]]);  
                      __STRCAT(txt_buffer,tmp_buffer,txt_buffer_in_use)  
                  }  
                  __STRCAT(txt_buffer,NEWLINE,txt_buffer_in_use)  
               }  
            }  
224          }          }
225          #ifdef PASO_MPI          ierr = MPI_File_open(mesh_p->Nodes->MPIInfo->comm, (char*)filename_p,
226             MPI_File_write_ordered(mpi_fileHandle_p,txt_buffer,txt_buffer_in_use, MPI_CHAR, &mpi_status);                               amode, mpi_info, &mpi_fileHandle_p);
227          #endif              if (ierr != MPI_SUCCESS) {
228       } else {              sprintf(errorMsg, "saveVTK: File %s could not be opened for writing in parallel.", filename_p);
229          if (node_index == NULL) {              Finley_setError(IO_ERROR, errorMsg);
            for (i = 0; i < numCells; i++) {  
               for (j = 0; j < numVTKNodesPerElement; j++) {  
                  fprintf(fileHandle_p,INT_FORMAT,globalNodeIndex[elements->Nodes[INDEX2(j, i, NN)]]);  
                }  
               fprintf(fileHandle_p,NEWLINE);  
            }  
230          } else {          } else {
231             for (i = 0; i < numCells; i++) {              ierr=MPI_File_set_view(mpi_fileHandle_p,MPI_DISPLACEMENT_CURRENT,
232                for (j = 0; j < numVTKNodesPerElement; j++) {                      MPI_CHAR, MPI_CHAR, "native", mpi_info);
                  fprintf(fileHandle_p,INT_FORMAT,globalNodeIndex[elements->Nodes[INDEX2(node_index[j], i, NN)]]);  
                }  
               fprintf(fileHandle_p,NEWLINE);  
            }  
         }  
   
      }  
       
      /* finalize the connection and start the offset section */  
      if (mpi_size > 1) {  
         if( my_mpi_rank == 0) {  
            #ifdef PASO_MPI  
               MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,tags_End_Conn_and_Start_Offset,strlen(tags_End_Conn_and_Start_Offset),MPI_CHAR,&mpi_req);  
               MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);  
            #endif  
         }  
      } else {  
         fprintf(fileHandle_p,tags_End_Conn_and_Start_Offset);  
      }  
   
     /* write the offsets */  
         
      if ( mpi_size > 1) {  
         txt_buffer[0] = '\0';  
         txt_buffer_in_use=0;  
         for (i=numVTKNodesPerElement*(myFirstCell*numCellFactor+1); i<=numCells*numVTKNodesPerElement*numCellFactor; i+=numVTKNodesPerElement) {  
            sprintf(tmp_buffer, INT_NEWLINE_FORMAT, i);  
            __STRCAT(txt_buffer,tmp_buffer,txt_buffer_in_use);  
          }  
          #ifdef PASO_MPI  
             MPI_File_write_ordered(mpi_fileHandle_p,txt_buffer,txt_buffer_in_use, MPI_CHAR, &mpi_status);  
          #endif      
      } else {  
         for (i=numVTKNodesPerElement; i<=numCells*numVTKNodesPerElement*numCellFactor; i+=numVTKNodesPerElement) {  
            fprintf(fileHandle_p, INT_NEWLINE_FORMAT, i);  
         }  
       
      }  
      /* finalize the offset section and start the type section */  
      if ( mpi_size > 1) {  
         if ( my_mpi_rank == 0) {  
            #ifdef PASO_MPI  
               MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,tags_End_Offset_and_Start_Type,strlen(tags_End_Offset_and_Start_Type),MPI_CHAR,&mpi_req);  
               MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);  
            #endif  
233          }          }
234    #endif /* PASO_MPI */
235      } else {      } else {
236         fprintf(fileHandle_p,tags_End_Offset_and_Start_Type);          fileHandle_p = fopen(filename_p, "w");
237      }          if (fileHandle_p==NULL) {
238                    sprintf(errorMsg, "saveVTK: File %s could not be opened for writing.", filename_p);
239                      Finley_setError(IO_ERROR, errorMsg);
      /* write element type */  
      sprintf(tmp_buffer, INT_NEWLINE_FORMAT, cellType);  
      if ( mpi_size > 1) {  
         txt_buffer[0] = '\0';  
         txt_buffer_in_use=0;  
         for (i=0; i<numCells*numCellFactor; i++) __STRCAT(txt_buffer,tmp_buffer,txt_buffer_in_use);  
          #ifdef PASO_MPI  
             MPI_File_write_ordered(mpi_fileHandle_p,txt_buffer,txt_buffer_in_use, MPI_CHAR, &mpi_status);  
          #endif      
      } else {  
         for (i=0; i<numCells*numCellFactor; i++) fprintf(fileHandle_p, tmp_buffer);  
      }  
      /* finalize cell information */  
      if ( mpi_size > 1) {  
         if ( my_mpi_rank == 0) {  
            #ifdef PASO_MPI  
               MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,tags_End_Type_And_Cells,strlen(tags_End_Type_And_Cells),MPI_CHAR,&mpi_req);  
               MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);  
            #endif  
240          }          }
     } else {  
        fprintf(fileHandle_p,tags_End_Type_And_Cells);  
241      }      }
242   }      if (!Paso_MPIInfo_noError(mesh_p->Nodes->MPIInfo)) return;
243    
244   /* Write cell data */      /* General note: From this point if an error occurs Finley_setError is
245   if (write_celldata && Finley_noError()) {       * called and subsequent steps are skipped until the end of this function
246        /* mark the active data arrays */       * where allocated memory is freed and the file is closed. */
247        txt_buffer[0] = '\0';  
248        set_scalar=FALSE,set_vector=FALSE, set_tensor=FALSE;      /************************************************************************/
249        strcat(txt_buffer, "<CellData");      /* find the mesh type to be written */
250        for (i_data =0 ;i_data<num_data;++i_data) {  
251          if (! isEmpty(data_pp[i_data]) && isCellCentered[i_data]) {      isCellCentered = TMPMEMALLOC(num_data, bool_t);
252            /* if the rank == 0:   --> scalar data */      maxNameLen = 0;
253            /* if the rank == 1:   --> vector data */      if (!Finley_checkPtr(isCellCentered)) {
254            /* if the rank == 2:   --> tensor data */          for (dataIdx=0; dataIdx<num_data; ++dataIdx) {
255                if (! isEmpty(data_pp[dataIdx])) {
256            switch(getDataPointRank(data_pp[i_data])) {                  switch(getFunctionSpaceType(data_pp[dataIdx]) ) {
257            case 0:                      case FINLEY_NODES:
258              if (! set_scalar) {                          nodeType = (nodeType == FINLEY_REDUCED_NODES) ? FINLEY_REDUCED_NODES : FINLEY_NODES;
259                strcat(txt_buffer," Scalars=\"");                          isCellCentered[dataIdx] = FALSE;
260                strcat(txt_buffer,names_p[i_data]);                          if (elementType==FINLEY_UNKNOWN || elementType==FINLEY_ELEMENTS) {
261                strcat(txt_buffer,"\"");                              elementType = FINLEY_ELEMENTS;
262                set_scalar=TRUE;                          } else {
263                                Finley_setError(TYPE_ERROR, "saveVTK: cannot write given data in single file.");
264                            }
265                        break;
266                        case FINLEY_REDUCED_NODES:
267                            nodeType = FINLEY_REDUCED_NODES;
268                            isCellCentered[dataIdx] = FALSE;
269                            if (elementType==FINLEY_UNKNOWN || elementType==FINLEY_ELEMENTS) {
270                                elementType = FINLEY_ELEMENTS;
271                            } else {
272                                Finley_setError(TYPE_ERROR, "saveVTK: cannot write given data in single file.");
273                        }
274                        break;
275                        case FINLEY_REDUCED_ELEMENTS:
276                            hasReducedElements = TRUE;
277                        case FINLEY_ELEMENTS:
278                            isCellCentered[dataIdx] = TRUE;
279                            if (elementType==FINLEY_UNKNOWN || elementType==FINLEY_ELEMENTS) {
280                                elementType = FINLEY_ELEMENTS;
281                            } else {
282                                Finley_setError(TYPE_ERROR, "saveVTK: cannot write given data in single file.");
283                            }
284                        break;
285                        case FINLEY_REDUCED_FACE_ELEMENTS:
286                            hasReducedElements = TRUE;
287                        case FINLEY_FACE_ELEMENTS:
288                            isCellCentered[dataIdx] = TRUE;
289                            if (elementType==FINLEY_UNKNOWN || elementType==FINLEY_FACE_ELEMENTS) {
290                                elementType = FINLEY_FACE_ELEMENTS;
291                            } else {
292                                Finley_setError(TYPE_ERROR, "saveVTK: cannot write given data in single file.");
293                            }
294                        break;
295                        case FINLEY_POINTS:
296                            isCellCentered[dataIdx]=TRUE;
297                            if (elementType==FINLEY_UNKNOWN || elementType==FINLEY_POINTS) {
298                                elementType = FINLEY_POINTS;
299                            } else {
300                                Finley_setError(TYPE_ERROR, "saveVTK: cannot write given data in single file.");
301                            }
302                        break;
303                        case FINLEY_REDUCED_CONTACT_ELEMENTS_1:
304                            hasReducedElements = TRUE;
305                        case FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1:
306                            isCellCentered[dataIdx] = TRUE;
307                            if (elementType==FINLEY_UNKNOWN || elementType==FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1) {
308                                elementType = FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1;
309                            } else {
310                                Finley_setError(TYPE_ERROR, "saveVTK: cannot write given data in single file.");
311                            }
312                        break;
313                        case FINLEY_REDUCED_CONTACT_ELEMENTS_2:
314                            hasReducedElements = TRUE;
315                        case FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_2:
316                            isCellCentered[dataIdx] = TRUE;
317                            if (elementType==FINLEY_UNKNOWN || elementType==FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1) {
318                                elementType = FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1;
319                            } else {
320                                Finley_setError(TYPE_ERROR, "saveVTK: cannot write given data in single file.");
321                            }
322                        break;
323                        default:
324                            sprintf(errorMsg, "saveVTK: unknown function space type %d",getFunctionSpaceType(data_pp[dataIdx]));
325                            Finley_setError(TYPE_ERROR, errorMsg);
326                    }
327                    if (isCellCentered[dataIdx]) {
328                        writeCellData = TRUE;
329                    } else {
330                        writePointData = TRUE;
331                    }
332                    maxNameLen = MAX(maxNameLen, strlen(names_p[dataIdx]));
333              }              }
334            }
335        }
336    
337        /************************************************************************/
338        /* select number of points and the mesh component */
339    
340        if (Finley_noError()) {
341            if (nodeType == FINLEY_REDUCED_NODES) {
342                myFirstNode = Finley_NodeFile_getFirstReducedNode(mesh_p->Nodes);
343                myLastNode = Finley_NodeFile_getLastReducedNode(mesh_p->Nodes);
344                globalNumPoints = Finley_NodeFile_getGlobalNumReducedNodes(mesh_p->Nodes);
345                globalNodeIndex = Finley_NodeFile_borrowGlobalReducedNodesIndex(mesh_p->Nodes);
346            } else {
347                myFirstNode = Finley_NodeFile_getFirstNode(mesh_p->Nodes);
348                myLastNode = Finley_NodeFile_getLastNode(mesh_p->Nodes);
349                globalNumPoints = Finley_NodeFile_getGlobalNumNodes(mesh_p->Nodes);
350                globalNodeIndex = Finley_NodeFile_borrowGlobalNodesIndex(mesh_p->Nodes);
351            }
352            myNumPoints = myLastNode - myFirstNode;
353            if (elementType==FINLEY_UNKNOWN) elementType=FINLEY_ELEMENTS;
354            switch(elementType) {
355                case FINLEY_ELEMENTS:
356                    elements = mesh_p->Elements;
357              break;              break;
358            case 1:              case FINLEY_FACE_ELEMENTS:
359              if (! set_vector) {                  elements = mesh_p->FaceElements;
               strcat(txt_buffer," Vectors=\"");  
               strcat(txt_buffer,names_p[i_data]);  
               strcat(txt_buffer,"\"");  
               set_vector=TRUE;  
             }  
360              break;              break;
361            case 2:              case FINLEY_POINTS:
362              if (! set_tensor) {                  elements = mesh_p->Points;
363                strcat(txt_buffer," Tensors=\"");              break;
364                strcat(txt_buffer,names_p[i_data]);              case FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1:
365                strcat(txt_buffer,"\"");                  elements = mesh_p->ContactElements;
               set_tensor=TRUE;  
             }  
366              break;              break;
367            default:          }
368              sprintf(error_msg, "saveVTK: data %s: Vtk can't handle objects with rank greater than 2.",names_p[i_data]);          if (elements==NULL) {
369              Finley_setError(VALUE_ERROR,error_msg);              Finley_setError(SYSTEM_ERROR, "saveVTK: undefined element file");
370              return;          } else {
371            }              /* map finley element type to VTK element type */
372          }              numCells = elements->numElements;
373        }              globalNumCells = Finley_ElementFile_getGlobalNumElements(elements);
374        strcat(txt_buffer, ">\n");              myNumCells = Finley_ElementFile_getMyNumElements(elements);
375        if ( mpi_size > 1) {              myFirstCell = Finley_ElementFile_getFirstElement(elements);
376          if ( my_mpi_rank == 0) {              NN = elements->numNodes;
377             #ifdef PASO_MPI              if (nodeType==FINLEY_REDUCED_NODES) {
378                MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,txt_buffer,strlen(txt_buffer),MPI_CHAR,&mpi_req);          typeId = elements->referenceElementSet->referenceElement->LinearType->TypeId;
379                MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);                  if (hasReducedElements) {
380             #endif                      quadNodes_p=elements->referenceElementSet->referenceElementReducedQuadrature->Parametrization->QuadNodes;
381          }                  } else {
382        } else {                      quadNodes_p=elements->referenceElementSet->referenceElement->Parametrization->QuadNodes;
383            fprintf(fileHandle_p,txt_buffer);                  }
       }  
       /* write the arrays */  
       for (i_data =0 ;i_data<num_data;++i_data) {  
          if (! isEmpty(data_pp[i_data]) && isCellCentered[i_data]) {  
             txt_buffer[0] = '\0';  
             txt_buffer_in_use=0;  
             numPointsPerSample=getNumDataPointsPerSample(data_pp[i_data]);  
             rank = getDataPointRank(data_pp[i_data]);  
             nComp = getDataPointSize(data_pp[i_data]);  
             nCompReqd=1;   /* the number of components mpi_required by vtk */  
             shape=0;  
             if (rank == 0) {  
               nCompReqd = 1;  
             } else if (rank == 1) {  
               shape=getDataPointShape(data_pp[i_data], 0);  
               if  (shape>3) {  
                 Finley_setError(VALUE_ERROR, "saveVTK: rank 1 object must have less then 4 components");  
               }  
               nCompReqd = 3;  
384              } else {              } else {
385                shape=getDataPointShape(data_pp[i_data], 0);                  typeId = elements->referenceElementSet->referenceElement->Type->TypeId;
386                if  (shape>3 || shape != getDataPointShape(data_pp[i_data], 1)) {                  if (hasReducedElements) {
387                  Finley_setError(VALUE_ERROR, "saveVTK: rank 2 object must have less then 4x4 components and must have a square shape");                      quadNodes_p=elements->referenceElementSet->referenceElementReducedQuadrature->Parametrization->QuadNodes;
388                }                  } else {
389                nCompReqd = 9;                      quadNodes_p=elements->referenceElementSet->referenceElement->Parametrization->QuadNodes;
390                    }
391              }              }
392              if (Finley_noError()) {              switch (typeId) {
393                 sprintf(txt_buffer,tag_Float_DataArray,names_p[i_data], nCompReqd);                  case Point1:
394                 if ( mpi_size > 1) {                  case Line2Face:
395                   if ( my_mpi_rank == 0) {                  case Line3Face:
396                      #ifdef PASO_MPI                  case Point1_Contact:
397                         MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,txt_buffer,strlen(txt_buffer),MPI_CHAR,&mpi_req);                  case Line2Face_Contact:
398                         MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);                  case Line3Face_Contact:
399                      #endif                      cellType = VTK_VERTEX;
400                   }                      numVTKNodesPerElement = 1;
401                 } else {                  break;
402                     fprintf(fileHandle_p,txt_buffer);  
403                 }                  case Line2:
404                 for (i=0; i<numCells; i++) {                  case Tri3Face:
405                     if (elements->Owner[i] == my_mpi_rank) {                  case Rec4Face:
406                        values = getSampleData(data_pp[i_data], i);                  case Line2_Contact:
407                        /* averaging over the number of points in the sample */                  case Tri3_Contact:
408                        for (k=0; k<MIN(nComp,NCOMP_MAX); k++) {                  case Tri3Face_Contact:
409                           if (isExpanded(data_pp[i_data])) {                  case Rec4Face_Contact:
410                             rtmp = 0.;                      cellType = VTK_LINE;
411                             for (j=0; j<numPointsPerSample; j++) rtmp += values[INDEX2(k,j,nComp)];                      numVTKNodesPerElement = 2;
412                             sampleAvg[k] = rtmp/numPointsPerSample;                  break;
413                          } else {  
414                             sampleAvg[k] = values[k];                  case Tri3:
415                          }                  case Tet4Face:
416                        }                  case Tet4Face_Contact:
417                        /* if the number of mpi_required components is more than the number                      cellType = VTK_TRIANGLE;
418                        * of actual components, pad with zeros                      numVTKNodesPerElement = 3;
419                        */                  break;
420                        /* probably only need to get shape of first element */  
421                        /* write the data different ways for scalar, vector and tensor */                  case Rec4:
422                        if (nCompReqd == 1) {                  case Hex8Face:
423                          sprintf(tmp_buffer,FLOAT_SCALAR_FORMAT,sampleAvg[0]);                  case Rec4_Contact:
424                        } else if (nCompReqd == 3) {                  case Hex8Face_Contact:
425                          if (shape==1) {                      cellType = VTK_QUAD;
426                           sprintf(tmp_buffer,FLOAT_VECTOR_FORMAT,sampleAvg[0],0.,0.);                      numVTKNodesPerElement = 4;
427                          } else if (shape==2) {                  break;
428                           sprintf(tmp_buffer,FLOAT_VECTOR_FORMAT,sampleAvg[0],sampleAvg[1],0.);  
429                          } else if (shape==3) {                  case Rec9Macro:
430                           sprintf(tmp_buffer,FLOAT_VECTOR_FORMAT,sampleAvg[0],sampleAvg[1],sampleAvg[2]);          case Rec9:
431                          }                      numCellFactor = 4;
432                        } else if (nCompReqd == 9) {                      cellType = VTK_QUAD;
433                          if (shape==1) {                      numVTKNodesPerElement = 4;
434                           sprintf(tmp_buffer,FLOAT_TENSOR_FORMAT,sampleAvg[0],0.,0.,                  break;
435                                                                  0.,0.,0.,  
436                                                                  0.,0.,0.);                  case Tet4:
437                          } else if (shape==2) {                      cellType = VTK_TETRA;
438                           sprintf(tmp_buffer,FLOAT_TENSOR_FORMAT,sampleAvg[0],sampleAvg[1],0.,                      numVTKNodesPerElement = 4;
439                                                                  sampleAvg[2],sampleAvg[3],0.,                  break;
440                                                                  0.,0.,0.);  
441                          } else if (shape==3) {                  case Hex8:
442                           sprintf(tmp_buffer,FLOAT_TENSOR_FORMAT,sampleAvg[0],sampleAvg[1],sampleAvg[2],                      cellType = VTK_HEXAHEDRON;
443                                                                  sampleAvg[3],sampleAvg[4],sampleAvg[5],                      numVTKNodesPerElement = 8;
444                                                                  sampleAvg[6],sampleAvg[7],sampleAvg[8]);                  break;
445                          }  
446                        }                  case Line3:
447                        if ( mpi_size > 1) {                  case Line3Macro:
448                          __STRCAT(txt_buffer,tmp_buffer,txt_buffer_in_use);                  case Tri6Face:
449                        } else {                  case Rec8Face:
450                          fprintf(fileHandle_p,tmp_buffer);                  case Line3_Contact:
451                        }                  case Tri6Face_Contact:
452                    }                  case Rec8Face_Contact:
453                 }                      cellType = VTK_QUADRATIC_EDGE;
454                 if ( mpi_size > 1) {                      numVTKNodesPerElement = 3;
455                       #ifdef PASO_MPI                  break;
456                          MPI_File_write_ordered(mpi_fileHandle_p,txt_buffer,txt_buffer_in_use, MPI_CHAR, &mpi_status);  
457                       #endif                      case Tri6:
458                       if ( my_mpi_rank == 0) {          case Tri6Macro:    
459                          #ifdef PASO_MPI                  case Tet10Face:
460                             MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,tag_End_DataArray,strlen(tag_End_DataArray),MPI_CHAR,&mpi_req);                  case Tri6_Contact:
461                             MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);                  case Tet10Face_Contact:
462                          #endif                      cellType = VTK_QUADRATIC_TRIANGLE;
463                       }                      numVTKNodesPerElement = 6;
464                 } else {                  break;
465                     fprintf(fileHandle_p,tag_End_DataArray);  
466                 }                  case Rec8:
467              }                  case Hex20Face:
468           }                  case Rec8_Contact:
469        }                  case Hex20Face_Contact:
470        if ( mpi_size > 1) {                      cellType = VTK_QUADRATIC_QUAD;
471          if ( my_mpi_rank == 0) {                      numVTKNodesPerElement = 8;
472             #ifdef PASO_MPI                  break;
473                MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,tag_End_CellData,strlen(tag_End_CellData),MPI_CHAR,&mpi_req);  
474                MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);          case Tet10Macro:
475             #endif                  case Tet10:
476          }                      cellType = VTK_QUADRATIC_TETRA;
477        } else {                      numVTKNodesPerElement = 10;
478            fprintf(fileHandle_p,tag_End_CellData);                  break;
479        }  
480    }                  case Hex20:
481    /* point data */                      cellType = VTK_QUADRATIC_HEXAHEDRON;
482    if (write_pointdata && Finley_noError()) {                      numVTKNodesPerElement = 20;
483        /* mark the active data arrays */                  break;
484        set_scalar=FALSE,set_vector=FALSE, set_tensor=FALSE;  
485        txt_buffer[0] = '\0';          case Hex27Macro:
486        strcat(txt_buffer, "<PointData");                  case Hex27:
487        for (i_data =0 ;i_data<num_data;++i_data) {                      numCellFactor = 8;
488          if (! isEmpty(data_pp[i_data]) && !isCellCentered[i_data]) {                      cellType = VTK_HEXAHEDRON;
489            /* if the rank == 0:   --> scalar data */                      numVTKNodesPerElement = 8;
490            /* if the rank == 1:   --> vector data */                  break;
491            /* if the rank == 2:   --> tensor data */  
492                    default:
493            switch(getDataPointRank(data_pp[i_data])) {                      sprintf(errorMsg, "saveVTK: Element type %s is not supported by VTK.", elements->referenceElementSet->referenceElement->Type->Name);
494            case 0:                      Finley_setError(VALUE_ERROR, errorMsg);
             if (! set_scalar) {  
               strcat(txt_buffer," Scalars=\"");  
               strcat(txt_buffer,names_p[i_data]);  
               strcat(txt_buffer,"\"");  
               set_scalar=TRUE;  
495              }              }
496              break;          }
497            case 1:      }
498              if (! set_vector) {  
499                strcat(txt_buffer," Vectors=\"");      /* allocate enough memory for text buffer */
500                strcat(txt_buffer,names_p[i_data]);  
501                strcat(txt_buffer,"\"");      txtBufferSize = strlen(vtkHeader) + 3*LEN_INT_FORMAT + (30+3*maxNameLen)+strlen(metadata)+strlen(metadata_schema);
502                set_vector=TRUE;      if (mpi_size > 1) {
503            txtBufferSize = MAX(txtBufferSize, myNumPoints * LEN_TMP_BUFFER);
504            txtBufferSize = MAX(txtBufferSize, numCellFactor * myNumCells *
505                    (LEN_INT_FORMAT * numVTKNodesPerElement + 1));
506            txtBufferSize = MAX(txtBufferSize,
507                    numCellFactor * myNumCells * LEN_TENSOR_FORMAT);
508            txtBufferSize = MAX(txtBufferSize, myNumPoints * LEN_TENSOR_FORMAT);
509        }
510        txtBuffer = TMPMEMALLOC(txtBufferSize+1, char);
511    
512        /* sets error if memory allocation failed */
513        Finley_checkPtr(txtBuffer);
514    
515        /************************************************************************/
516        /* write number of points and the mesh component */
517    
518        if (Finley_noError()) {
519            const index_t *nodeIndex;
520            if (FINLEY_REDUCED_NODES == nodeType) {
521                nodeIndex = elements->referenceElementSet->referenceElement->Type->linearNodes;
522            } else if ( (Rec9 == typeId) || (Rec9Macro == typeId) ) {
523                nodeIndex = VTK_REC9_INDEX;
524            } else if (Hex20 == typeId) {
525                nodeIndex = VTK_HEX20_INDEX;
526            } else if ( (Hex27 == typeId) || (Hex27Macro == typeId) ){
527                nodeIndex = VTK_HEX27_INDEX;
528            } else if (numVTKNodesPerElement  !=  elements->referenceElementSet->referenceElement->Type->numNodes) {
529                nodeIndex = elements->referenceElementSet->referenceElement->Type->relevantGeoNodes;
530            } else {
531                nodeIndex = NULL;
532            }
533    
534            if (strlen(metadata)>0) {
535               if (strlen(metadata_schema)>0) {
536                  sprintf(txtBuffer, vtkHeader," ",metadata_schema,metadata,"\n",globalNumPoints, numCellFactor*globalNumCells, 3);
537               } else {
538                  sprintf(txtBuffer, vtkHeader,"","",metadata,"\n",globalNumPoints, numCellFactor*globalNumCells, 3);
539               }
540            } else {
541               if (strlen(metadata_schema)>0) {
542                  sprintf(txtBuffer, vtkHeader," ",metadata_schema,"","",globalNumPoints, numCellFactor*globalNumCells, 3);
543               } else {
544                  sprintf(txtBuffer, vtkHeader,"","","","",globalNumPoints, numCellFactor*globalNumCells, 3);
545               }
546            }
547    
548            if (mpi_size > 1) {
549                /* write the nodes */
550                MPI_RANK0_WRITE_SHARED(txtBuffer);
551                txtBuffer[0] = '\0';
552                txtBufferInUse = 0;
553                if (nDim==2) {
554                    for (i = 0; i < mesh_p->Nodes->numNodes; i++) {
555                        if ( (myFirstNode <= globalNodeIndex[i]) && (globalNodeIndex[i] < myLastNode) ) {
556                            sprintf(tmpBuffer, VECTOR_FORMAT,
557                                mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0, i, nDim)],
558                                mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1, i, nDim)],
559                                0.);
560                            __STRCAT(txtBuffer, tmpBuffer, txtBufferInUse);
561                        }
562                    }
563                } else {
564                    for (i = 0; i < mesh_p->Nodes->numNodes; i++) {
565                        if ( (myFirstNode <= globalNodeIndex[i]) && (globalNodeIndex[i] < myLastNode) ) {
566                            sprintf(tmpBuffer, VECTOR_FORMAT,
567                                mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0, i, nDim)],
568                                mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1, i, nDim)],
569                                mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(2, i, nDim)]);
570                            __STRCAT(txtBuffer, tmpBuffer, txtBufferInUse);
571                        }
572                    }
573                } /* nDim */
574                MPI_WRITE_ORDERED(txtBuffer);
575    
576                /* write the cells */
577                MPI_RANK0_WRITE_SHARED(tags_End_Points_and_Start_Conn);
578                txtBuffer[0] = '\0';
579                txtBufferInUse = 0;
580                if (nodeIndex == NULL) {
581                    for (i = 0; i < numCells; i++) {
582                        if (elements->Owner[i] == my_mpi_rank) {
583                            for (j = 0; j < numVTKNodesPerElement; j++) {
584                                sprintf(tmpBuffer, INT_FORMAT, globalNodeIndex[elements->Nodes[INDEX2(j, i, NN)]]);
585                                __STRCAT(txtBuffer, tmpBuffer, txtBufferInUse);
586                            }
587                            __STRCAT(txtBuffer, NEWLINE, txtBufferInUse);
588                        }
589                    }
590                } else {
591                    for (i = 0; i < numCells; i++) {
592                        if (elements->Owner[i] == my_mpi_rank) {
593                            for (l = 0; l < numCellFactor; l++) {
594                                const int* idx=&nodeIndex[l*numVTKNodesPerElement];
595                                for (j = 0; j < numVTKNodesPerElement; j++) {
596                                    sprintf(tmpBuffer, INT_FORMAT, globalNodeIndex[elements->Nodes[INDEX2(idx[j], i, NN)]]);
597                                    __STRCAT(txtBuffer, tmpBuffer, txtBufferInUse);
598                                }
599                                __STRCAT(txtBuffer, NEWLINE, txtBufferInUse);
600                            }
601                        }
602                    }
603                } /* nodeIndex */
604                MPI_WRITE_ORDERED(txtBuffer);
605    
606                /* write the offsets */
607                MPI_RANK0_WRITE_SHARED(tags_End_Conn_and_Start_Offset);
608                txtBuffer[0] = '\0';
609                txtBufferInUse = 0;
610                for (i = numVTKNodesPerElement*(myFirstCell*numCellFactor+1);
611                        i <= (myFirstCell+myNumCells)*numVTKNodesPerElement*numCellFactor; i += numVTKNodesPerElement)
612                {
613                    sprintf(tmpBuffer, INT_NEWLINE_FORMAT, i);
614                    __STRCAT(txtBuffer, tmpBuffer, txtBufferInUse);
615              }              }
616              break;              MPI_WRITE_ORDERED(txtBuffer);
617            case 2:  
618              if (! set_tensor) {              /* write element type */
619                strcat(txt_buffer," Tensors=\"");              sprintf(tmpBuffer, INT_NEWLINE_FORMAT, cellType);
620                strcat(txt_buffer,names_p[i_data]);              MPI_RANK0_WRITE_SHARED(tags_End_Offset_and_Start_Type);
621                strcat(txt_buffer,"\"");              txtBuffer[0] = '\0';
622                set_tensor=TRUE;              txtBufferInUse = 0;
623                for (i = numVTKNodesPerElement*(myFirstCell*numCellFactor+1);
624                        i <= (myFirstCell+myNumCells)*numVTKNodesPerElement*numCellFactor; i += numVTKNodesPerElement)
625                {
626                    __STRCAT(txtBuffer, tmpBuffer, txtBufferInUse);
627              }              }
628              break;              MPI_WRITE_ORDERED(txtBuffer);
629            default:              /* finalize cell information */
630              sprintf(error_msg, "saveVTK: data %s: Vtk can't handle objects with rank greater than 2.",names_p[i_data]);              strcpy(txtBuffer, "</DataArray>\n</Cells>\n");
631              Finley_setError(VALUE_ERROR,error_msg);              MPI_RANK0_WRITE_SHARED(txtBuffer);
632              return;  
633            }          } else { /***** mpi_size == 1 *****/
634          }  
635        }              /* write the nodes */
636        strcat(txt_buffer, ">\n");              fputs(txtBuffer, fileHandle_p);
637        if ( mpi_size > 1) {              if (nDim==2) {
638          if ( my_mpi_rank == 0) {                  for (i = 0; i < mesh_p->Nodes->numNodes; i++) {
639             #ifdef PASO_MPI                      if ( (myFirstNode <= globalNodeIndex[i]) && (globalNodeIndex[i] < myLastNode) ) {
640                MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,txt_buffer,strlen(txt_buffer),MPI_CHAR,&mpi_req);                          fprintf(fileHandle_p, VECTOR_FORMAT,
641                MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);                              mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0, i, nDim)],
642             #endif                              mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1, i, nDim)],
643          }                              0.);
644        } else {                      }
645            fprintf(fileHandle_p,txt_buffer);                  }
       }  
       /* write the arrays */  
       for (i_data =0 ;i_data<num_data;++i_data) {  
          if (! isEmpty(data_pp[i_data]) && !isCellCentered[i_data]) {  
             txt_buffer[0] = '\0';  
             txt_buffer_in_use=0;  
             numPointsPerSample=getNumDataPointsPerSample(data_pp[i_data]);  
             rank = getDataPointRank(data_pp[i_data]);  
             nComp = getDataPointSize(data_pp[i_data]);  
             if (getFunctionSpaceType(data_pp[i_data]) == FINLEY_REDUCED_NODES) {  
                nodeMapping=mesh_p->Nodes->reducedNodesMapping;  
646              } else {              } else {
647                 nodeMapping=mesh_p->Nodes->nodesMapping;                  for (i = 0; i < mesh_p->Nodes->numNodes; i++) {
648              }                      if ( (myFirstNode <= globalNodeIndex[i]) && (globalNodeIndex[i] < myLastNode) ) {
649              nCompReqd=1;   /* the number of components mpi_required by vtk */                          fprintf(fileHandle_p, VECTOR_FORMAT,
650              shape=0;                              mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0, i, nDim)],
651              if (rank == 0) {                              mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1, i, nDim)],
652                nCompReqd = 1;                              mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(2, i, nDim)]);
653              } else if (rank == 1) {                      }
654                shape=getDataPointShape(data_pp[i_data], 0);                  }
655                if  (shape>3) {              } /* nDim */
656                  Finley_setError(VALUE_ERROR, "saveVTK: rank 1 object must have less then 4 components");  
657                }              /* write the cells */
658                nCompReqd = 3;              fputs(tags_End_Points_and_Start_Conn, fileHandle_p);
659                if (nodeIndex == NULL) {
660                    for (i = 0; i < numCells; i++) {
661                        for (j = 0; j < numVTKNodesPerElement; j++) {
662                            fprintf(fileHandle_p, INT_FORMAT, globalNodeIndex[elements->Nodes[INDEX2(j, i, NN)]]);
663                        }
664                        fprintf(fileHandle_p, NEWLINE);
665                    }
666              } else {              } else {
667                shape=getDataPointShape(data_pp[i_data], 0);                  for (i = 0; i < numCells; i++) {
668                if  (shape>3 || shape != getDataPointShape(data_pp[i_data], 1)) {                      for (l = 0; l < numCellFactor; l++) {
669                  Finley_setError(VALUE_ERROR, "saveVTK: rank 2 object must have less then 4x4 components and must have a square shape");                          const int* idx=&nodeIndex[l*numVTKNodesPerElement];
670                }                          for (j = 0; j < numVTKNodesPerElement; j++) {
671                nCompReqd = 9;                              fprintf(fileHandle_p, INT_FORMAT, globalNodeIndex[elements->Nodes[INDEX2(idx[j], i, NN)]]);
672                            }
673                            fprintf(fileHandle_p, NEWLINE);
674                        }
675                    }
676                } /* nodeIndex */
677    
678                /* write the offsets */
679                fputs(tags_End_Conn_and_Start_Offset, fileHandle_p);
680                for (i = numVTKNodesPerElement; i <= numCells*numVTKNodesPerElement*numCellFactor; i += numVTKNodesPerElement) {
681                    fprintf(fileHandle_p, INT_NEWLINE_FORMAT, i);
682                }
683    
684                /* write element type */
685                sprintf(tmpBuffer, INT_NEWLINE_FORMAT, cellType);
686                fputs(tags_End_Offset_and_Start_Type, fileHandle_p);
687                for (i = 0; i < numCells*numCellFactor; i++)
688                    fputs(tmpBuffer, fileHandle_p);
689                /* finalize cell information */
690                fputs("</DataArray>\n</Cells>\n", fileHandle_p);
691            } /* mpi_size */
692    
693        } /* Finley_noError */
694    
695        /************************************************************************/
696        /* write cell data */
697    
698        if (writeCellData && Finley_noError()) {
699            bool_t set_scalar=FALSE, set_vector=FALSE, set_tensor=FALSE;
700            /* mark the active data arrays */
701            strcpy(txtBuffer, "<CellData");
702            for (dataIdx = 0; dataIdx < num_data; dataIdx++) {
703                if (!isEmpty(data_pp[dataIdx]) && isCellCentered[dataIdx]) {
704                    /* rank == 0 <--> scalar data */
705                    /* rank == 1 <--> vector data */
706                    /* rank == 2 <--> tensor data */
707                    switch (getDataPointRank(data_pp[dataIdx])) {
708                        case 0:
709                            if (!set_scalar) {
710                                strcat(txtBuffer, " Scalars=\"");
711                                strcat(txtBuffer, names_p[dataIdx]);
712                                strcat(txtBuffer, "\"");
713                                set_scalar = TRUE;
714                            }
715                        break;
716                        case 1:
717                            if (!set_vector) {
718                                strcat(txtBuffer, " Vectors=\"");
719                                strcat(txtBuffer, names_p[dataIdx]);
720                                strcat(txtBuffer, "\"");
721                                set_vector = TRUE;
722                            }
723                        break;
724                        case 2:
725                            if (!set_tensor) {
726                                strcat(txtBuffer, " Tensors=\"");
727                                strcat(txtBuffer, names_p[dataIdx]);
728                                strcat(txtBuffer, "\"");
729                                set_tensor = TRUE;
730                            }
731                        break;
732                        default:
733                            sprintf(errorMsg, "saveVTK: data %s: VTK supports data with rank <= 2 only.", names_p[dataIdx]);
734                            Finley_setError(VALUE_ERROR, errorMsg);
735                    }
736              }              }
737              if (Finley_noError()) {              if (!Finley_noError())
738                 sprintf(txt_buffer,tag_Float_DataArray,names_p[i_data], nCompReqd);                  break;
739                 if ( mpi_size > 1) {          }
740                   if ( my_mpi_rank == 0) {      }
741                      #ifdef PASO_MPI      /* only continue if no error occurred */
742                         MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,txt_buffer,strlen(txt_buffer),MPI_CHAR,&mpi_req);      if (writeCellData && Finley_noError()) {
743                         MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);          strcat(txtBuffer, ">\n");
744                      #endif          if ( mpi_size > 1) {
745                   }              MPI_RANK0_WRITE_SHARED(txtBuffer);
746                 } else {          } else {
747                     fprintf(fileHandle_p,txt_buffer);              fputs(txtBuffer, fileHandle_p);
748                 }          }
749                 for (i=0; i<mesh_p->Nodes->numNodes; i++) {  
750                    k=globalNodeIndex[i];          /* write the arrays */
751                    if ( (myFirstNode <= k) && (k < myLastNode) ) {          for (dataIdx = 0; dataIdx < num_data; dataIdx++) {
752                       values = getSampleData(data_pp[i_data], nodeMapping->target[i]);              if (!isEmpty(data_pp[dataIdx]) && isCellCentered[dataIdx]) {
753                       /* if the number of mpi_required components is more than the number                  dim_t numPointsPerSample=getNumDataPointsPerSample(data_pp[dataIdx]);
754                       * of actual components, pad with zeros                  dim_t rank = getDataPointRank(data_pp[dataIdx]);
755                       */                  dim_t nComp = getDataPointSize(data_pp[dataIdx]);
756                       /* probably only need to get shape of first element */                  dim_t nCompReqd = 1; /* number of components mpi_required */
757                       /* write the data different ways for scalar, vector and tensor */                  if (rank == 0) {
758                       if (nCompReqd == 1) {                      nCompReqd = 1;
759                         sprintf(tmp_buffer,FLOAT_SCALAR_FORMAT,values[0]);                      shape = 0;
760                       } else if (nCompReqd == 3) {                  } else if (rank == 1) {
761                         if (shape==1) {                      nCompReqd = 3;
762                          sprintf(tmp_buffer,FLOAT_VECTOR_FORMAT,values[0],0.,0.);                      shape = getDataPointShape(data_pp[dataIdx], 0);
763                         } else if (shape==2) {                      if (shape > 3) {
764                          sprintf(tmp_buffer,FLOAT_VECTOR_FORMAT,values[0],values[1],0.);                          Finley_setError(VALUE_ERROR, "saveVTK: rank 1 objects must have 3 components at most.");
765                         } else if (shape==3) {                      }
766                          sprintf(tmp_buffer,FLOAT_VECTOR_FORMAT,values[0],values[1],values[2]);                  } else {
767                         }                      nCompReqd = 9;
768                       } else if (nCompReqd == 9) {                      shape = getDataPointShape(data_pp[dataIdx], 0);
769                         if (shape==1) {                      if (shape > 3 || shape != getDataPointShape(data_pp[dataIdx], 1)) {
770                          sprintf(tmp_buffer,FLOAT_TENSOR_FORMAT,values[0],0.,0.,                          Finley_setError(VALUE_ERROR, "saveVTK: rank 2 objects of shape 2x2 or 3x3 supported only.");
771                                                                 0.,0.,0.,                      }
772                                                                 0.,0.,0.);                  }
773                         } else if (shape==2) {                  /* bail out if an error occurred */
774                          sprintf(tmp_buffer,FLOAT_TENSOR_FORMAT,values[0],values[1],0.,                  if (!Finley_noError())
775                                                                 values[2],values[3],0.,                      break;
776                                                                 0.,0.,0.);  
777                         } else if (shape==3) {                  sprintf(txtBuffer, tag_Float_DataArray, names_p[dataIdx], nCompReqd);
778                          sprintf(tmp_buffer,FLOAT_TENSOR_FORMAT,values[0],values[1],values[2],                  if ( mpi_size > 1) {
779                                                                 values[3],values[4],values[5],                      MPI_RANK0_WRITE_SHARED(txtBuffer);
780                                                                 values[6],values[7],values[8]);                  } else {
781                         }                      fputs(txtBuffer, fileHandle_p);
782                       }                  }
783                       if ( mpi_size > 1) {  
784                         __STRCAT(txt_buffer,tmp_buffer,txt_buffer_in_use);                  txtBuffer[0] = '\0';
785                       } else {                  txtBufferInUse = 0;
786                         fprintf(fileHandle_p,tmp_buffer);                  for (i=0; i<numCells; i++) {
787                       }                      if (elements->Owner[i] == my_mpi_rank) {
788                    }                          void* sampleBuffer=allocSampleBuffer(data_pp[dataIdx]);
789                 }                          __const double *values = getSampleDataRO(data_pp[dataIdx], i,sampleBuffer);
790                 if ( mpi_size > 1) {                          for (l = 0; l < numCellFactor; l++) {
791                     #ifdef PASO_MPI                              double sampleAvg[NCOMP_MAX];
792                       MPI_File_write_ordered(mpi_fileHandle_p,txt_buffer,txt_buffer_in_use, MPI_CHAR, &mpi_status);                              dim_t nCompUsed = MIN(nComp, NCOMP_MAX);
793                     #endif      
794                     if ( my_mpi_rank == 0) {                              /* average over number of points in the sample */
795                        #ifdef PASO_MPI                              if (isExpanded(data_pp[dataIdx])) {
796                           MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,tag_End_DataArray,strlen(tag_End_DataArray),MPI_CHAR,&mpi_req);                                  dim_t hits=0;
797                           MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);                                  for (k=0; k<nCompUsed; k++) sampleAvg[k]=0;
798                        #endif                                  for (j=0; j<numPointsPerSample; j++) {
799                     }                                      if (nodeInQuadrant(quadNodes_p, typeId, j, l)) {
800                 } else {                                          hits++;
801                    fprintf(fileHandle_p,tag_End_DataArray);                                          for (k=0; k<nCompUsed; k++) {
802                 }                                              sampleAvg[k] += values[INDEX2(k,j,nComp)];
803                                            }
804                                        }
805                                    }
806                                    for (k=0; k<nCompUsed; k++)
807                                        sampleAvg[k] /= MAX(hits, 1);
808                                } else {
809                                    for (k=0; k<nCompUsed; k++)
810                                        sampleAvg[k] = values[k];
811                                } /* isExpanded */
812    
813                                /* if the number of required components is more than
814                                 * the number of actual components, pad with zeros
815                                 */
816                                /* probably only need to get shape of first element */
817                                if (nCompReqd == 1) {
818                                    sprintf(tmpBuffer, SCALAR_FORMAT, sampleAvg[0]);
819                                } else if (nCompReqd == 3) {
820                                    if (shape==1) {
821                                        sprintf(tmpBuffer, VECTOR_FORMAT,
822                                            sampleAvg[0], 0.f, 0.f);
823                                    } else if (shape==2) {
824                                        sprintf(tmpBuffer, VECTOR_FORMAT,
825                                            sampleAvg[0], sampleAvg[1], 0.f);
826                                    } else if (shape==3) {
827                                        sprintf(tmpBuffer, VECTOR_FORMAT,
828                                            sampleAvg[0],sampleAvg[1],sampleAvg[2]);
829                                    }
830                                } else if (nCompReqd == 9) {
831                                    if (shape==1) {
832                                        sprintf(tmpBuffer, TENSOR_FORMAT,
833                                            sampleAvg[0], 0.f, 0.f,
834                                                     0.f, 0.f, 0.f,
835                                                     0.f, 0.f, 0.f);
836                                    } else if (shape==2) {
837                                        sprintf(tmpBuffer, TENSOR_FORMAT,
838                                            sampleAvg[0], sampleAvg[1], 0.f,
839                                            sampleAvg[2], sampleAvg[3], 0.f,
840                                                     0.f,          0.f, 0.f);
841                                    } else if (shape==3) {
842                                        sprintf(tmpBuffer, TENSOR_FORMAT,
843                                            sampleAvg[0],sampleAvg[1],sampleAvg[2],
844                                            sampleAvg[3],sampleAvg[4],sampleAvg[5],
845                                            sampleAvg[6],sampleAvg[7],sampleAvg[8]);
846                                    }
847                                }
848                                if ( mpi_size > 1) {
849                                    __STRCAT(txtBuffer, tmpBuffer, txtBufferInUse);
850                                } else {
851                                    fputs(tmpBuffer, fileHandle_p);
852                                }
853                            } /* for l (numCellFactor) */
854                            freeSampleBuffer(sampleBuffer);
855                        } /* if I am the owner */
856                    } /* for i (numCells) */
857    
858                    if ( mpi_size > 1) {
859                        MPI_WRITE_ORDERED(txtBuffer);
860                        MPI_RANK0_WRITE_SHARED(tag_End_DataArray);
861                    } else {
862                        fputs(tag_End_DataArray, fileHandle_p);
863                    }
864                } /* !isEmpty && cellCentered */
865            } /* for dataIdx */
866    
867            strcpy(txtBuffer, "</CellData>\n");
868            if ( mpi_size > 1) {
869                MPI_RANK0_WRITE_SHARED(txtBuffer);
870            } else {
871                fputs(txtBuffer, fileHandle_p);
872            }
873        } /* if noError && writeCellData */
874    
875        /************************************************************************/
876        /* write point data */
877    
878        if (writePointData && Finley_noError()) {
879            /* mark the active data arrays */
880            bool_t set_scalar=FALSE, set_vector=FALSE, set_tensor=FALSE;
881            strcpy(txtBuffer, "<PointData");
882            for (dataIdx = 0; dataIdx<num_data; dataIdx++) {
883                if (!isEmpty(data_pp[dataIdx]) && !isCellCentered[dataIdx]) {
884                    switch (getDataPointRank(data_pp[dataIdx])) {
885                        case 0:
886                            if (!set_scalar) {
887                                strcat(txtBuffer, " Scalars=\"");
888                                strcat(txtBuffer, names_p[dataIdx]);
889                                strcat(txtBuffer, "\"");
890                                set_scalar = TRUE;
891                            }
892                        break;
893                        case 1:
894                            if (!set_vector) {
895                                strcat(txtBuffer, " Vectors=\"");
896                                strcat(txtBuffer, names_p[dataIdx]);
897                                strcat(txtBuffer, "\"");
898                                set_vector = TRUE;
899                            }
900                        break;
901                        case 2:
902                            if (!set_tensor) {
903                                strcat(txtBuffer, " Tensors=\"");
904                                strcat(txtBuffer, names_p[dataIdx]);
905                                strcat(txtBuffer, "\"");
906                                set_tensor = TRUE;
907                            }
908                        break;
909                        default:
910                            sprintf(errorMsg, "saveVTK: data %s: VTK supports data with rank <= 2 only.", names_p[dataIdx]);
911                            Finley_setError(VALUE_ERROR, errorMsg);
912                    }
913              }              }
914            }              if (!Finley_noError())
915                    break;
916          }          }
917        }
918        /* only continue if no error occurred */
919        if (writePointData && Finley_noError()) {
920            strcat(txtBuffer, ">\n");
921            if ( mpi_size > 1) {
922                MPI_RANK0_WRITE_SHARED(txtBuffer);
923            } else {
924                fputs(txtBuffer, fileHandle_p);
925            }
926    
927            /* write the arrays */
928            for (dataIdx = 0; dataIdx < num_data; dataIdx++) {
929                if (!isEmpty(data_pp[dataIdx]) && !isCellCentered[dataIdx]) {
930                    Finley_NodeMapping* nodeMapping;
931                    dim_t rank = getDataPointRank(data_pp[dataIdx]);
932                    dim_t nCompReqd = 1; /* number of components mpi_required */
933                    if (getFunctionSpaceType(data_pp[dataIdx]) == FINLEY_REDUCED_NODES) {
934                        nodeMapping = mesh_p->Nodes->reducedNodesMapping;
935                    } else {
936                        nodeMapping = mesh_p->Nodes->nodesMapping;
937                    }
938                    if (rank == 0) {
939                        nCompReqd = 1;
940                        shape = 0;
941                    } else if (rank == 1) {
942                        nCompReqd = 3;
943                        shape = getDataPointShape(data_pp[dataIdx], 0);
944                        if (shape > 3) {
945                            Finley_setError(VALUE_ERROR, "saveVTK: rank 1 objects must have 3 components at most.");
946                        }
947                    } else {
948                        nCompReqd = 9;
949                        shape=getDataPointShape(data_pp[dataIdx], 0);
950                        if (shape > 3 || shape != getDataPointShape(data_pp[dataIdx], 1)) {
951                            Finley_setError(VALUE_ERROR, "saveVTK: rank 2 objects of shape 2x2 or 3x3 supported only.");
952                        }
953                    }
954                    /* bail out if an error occurred */
955                    if (!Finley_noError())
956                        break;
957    
958                    sprintf(txtBuffer, tag_Float_DataArray, names_p[dataIdx], nCompReqd);
959                    if ( mpi_size > 1) {
960                        MPI_RANK0_WRITE_SHARED(txtBuffer);
961                    } else {
962                        fputs(txtBuffer, fileHandle_p);
963                    }
964    
965                    txtBuffer[0] = '\0';
966                    txtBufferInUse = 0;
967                    for (i=0; i<mesh_p->Nodes->numNodes; i++) {
968                        k = globalNodeIndex[i];
969                        if ( (myFirstNode <= k) && (k < myLastNode) ) {
970                            void* sampleBuffer=allocSampleBuffer(data_pp[dataIdx]);
971                            __const double *values = getSampleDataRO(data_pp[dataIdx], nodeMapping->target[i], sampleBuffer);
972                            /* if the number of mpi_required components is more than
973                             * the number of actual components, pad with zeros.
974                             * Probably only need to get shape of first element */
975                            if (nCompReqd == 1) {
976                                sprintf(tmpBuffer, SCALAR_FORMAT, values[0]);
977                            } else if (nCompReqd == 3) {
978                                if (shape==1) {
979                                    sprintf(tmpBuffer, VECTOR_FORMAT,
980                                            values[0], 0.f, 0.f);
981                                } else if (shape==2) {
982                                    sprintf(tmpBuffer, VECTOR_FORMAT,
983                                            values[0], values[1], 0.f);
984                                } else if (shape==3) {
985                                    sprintf(tmpBuffer, VECTOR_FORMAT,
986                                            values[0], values[1], values[2]);
987                                }
988                            } else if (nCompReqd == 9) {
989                                if (shape==1) {
990                                    sprintf(tmpBuffer, TENSOR_FORMAT,
991                                        values[0], 0.f, 0.f,
992                                              0.f, 0.f, 0.f,
993                                              0.f, 0.f, 0.f);
994                                } else if (shape==2) {
995                                    sprintf(tmpBuffer, TENSOR_FORMAT,
996                                        values[0], values[1], 0.f,
997                                        values[2], values[3], 0.f,
998                                              0.f,       0.f, 0.f);
999                                } else if (shape==3) {
1000                                    sprintf(tmpBuffer, TENSOR_FORMAT,
1001                                        values[0], values[1], values[2],
1002                                        values[3], values[4], values[5],
1003                                        values[6], values[7], values[8]);
1004                                }
1005                            }
1006                            if ( mpi_size > 1) {
1007                                __STRCAT(txtBuffer, tmpBuffer, txtBufferInUse);
1008                            } else {
1009                                fputs(tmpBuffer, fileHandle_p);
1010                            }
1011                            freeSampleBuffer(sampleBuffer);                 /* no-one needs values anymore */
1012                        } /* if this is my node */
1013                    } /* for i (numNodes) */
1014    
1015                    if ( mpi_size > 1) {
1016                        MPI_WRITE_ORDERED(txtBuffer);
1017                        MPI_RANK0_WRITE_SHARED(tag_End_DataArray);
1018                    } else {
1019                        fputs(tag_End_DataArray, fileHandle_p);
1020                    }
1021                } /* !isEmpty && !isCellCentered */
1022            } /* for dataIdx */
1023    
1024            strcpy(txtBuffer, "</PointData>\n");
1025          if ( mpi_size > 1) {          if ( mpi_size > 1) {
1026            if ( my_mpi_rank == 0) {              MPI_RANK0_WRITE_SHARED(txtBuffer);
              #ifdef PASO_MPI  
                 MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,tag_End_CellData,strlen(tag_End_PointData),MPI_CHAR,&mpi_req);  
                 MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);  
              #endif  
           }  
1027          } else {          } else {
1028              fprintf(fileHandle_p,tag_End_PointData);              fputs(txtBuffer, fileHandle_p);
1029          }          }
1030    }      } /* if noError && writePointData */
1031    if (Finley_noError()) {  
1032       if ( mpi_size > 1) {      /* Final write to VTK file */
1033         if ( my_mpi_rank == 0) {      if (Finley_noError()) {
1034            #ifdef PASO_MPI          if (mpi_size > 1) {
1035               MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,footer,strlen(footer),MPI_CHAR,&mpi_req);              MPI_RANK0_WRITE_SHARED(vtkFooter);
1036               MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);          } else {
1037               #ifdef MPIO_HINTS              fputs(vtkFooter, fileHandle_p);
1038                 MPI_Info_free(&mpi_info);          }
1039                 #undef MPIO_HINTS      }
1040               #endif  
1041               MPI_File_close(&mpi_fileHandle_p);      if ( mpi_size > 1) {
1042            #endif  #ifdef PASO_MPI
1043          }          MPI_File_close(&mpi_fileHandle_p);
1044       } else {          MPI_Barrier(mesh_p->Nodes->MPIInfo->comm);
1045           fprintf(fileHandle_p,footer);  #endif
1046           fclose(fileHandle_p);      } else {
1047       }          fclose(fileHandle_p);
1048    }      }
1049    TMPMEMFREE(isCellCentered);      TMPMEMFREE(isCellCentered);
1050    TMPMEMFREE(txt_buffer);      TMPMEMFREE(txtBuffer);
   return;  
1051  }  }
1052    

Legend:
Removed from v.1384  
changed lines
  Added in v.2748

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.26