/[escript]/trunk/finley/src/Mesh_saveVTK.c
ViewVC logotype

Diff of /trunk/finley/src/Mesh_saveVTK.c

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

temp_trunk_copy/finley/src/Mesh_saveVTK.c revision 1384 by phornby, Fri Jan 11 02:29:38 2008 UTC trunk/finley/src/Mesh_saveVTK.c revision 2814 by caltinay, Tue Dec 8 01:50:29 2009 UTC
# Line 1  Line 1 
1    
 /* $Id$ */  
   
2  /*******************************************************  /*******************************************************
3   *  *
4   *           Copyright 2003-2007 by ACceSS MNRF  * Copyright (c) 2003-2009 by University of Queensland
5   *       Copyright 2007 by University of Queensland  * Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)
6   *  * http://www.uq.edu.au/esscc
7   *                http://esscc.uq.edu.au  *
8   *        Primary Business: Queensland, Australia  * Primary Business: Queensland, Australia
9   *  Licensed under the Open Software License version 3.0  * Licensed under the Open Software License version 3.0
10   *     http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php  * http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php
11   *  *
12   *******************************************************/  *******************************************************/
13    
14  /**************************************************************/  /***************************************************************************/
15    /*   Writes data and mesh in VTK XML format to a VTU file.                 */
16  /*   writes data and mesh in a vtk file */  /*   Nodal data needs to be given on FINLEY_NODES or FINLEY_REDUCED_NODES  */
17  /*   nodal data needs to be given on FINLEY_NODES or FINLEY_REDUCED_NODES */  /***************************************************************************/
   
 /**************************************************************/  
   
18    
19  #include "Mesh.h"  #include "Mesh.h"
20  #include "Assemble.h"  #include "Assemble.h"
21  #include "vtkCellType.h"  /* copied from vtk source directory !!! */  #include "vtkCellType.h"  /* copied from vtk source directory */
22    #include "paso/PasoUtil.h"
23    
 #define LEN_PRINTED_INT_FORMAT (9+1)  
24  #define INT_FORMAT "%d "  #define INT_FORMAT "%d "
25    #define LEN_INT_FORMAT (unsigned int)(9+2)
26  #define INT_NEWLINE_FORMAT "%d\n"  #define INT_NEWLINE_FORMAT "%d\n"
27  #define FLOAT_SCALAR_FORMAT "%12.6e\n"  #define SCALAR_FORMAT "%12.6e\n"
28  #define FLOAT_VECTOR_FORMAT "%12.6e %12.6e %12.6e\n"  #define VECTOR_FORMAT "%12.6e %12.6e %12.6e\n"
29  #define FLOAT_TENSOR_FORMAT "%12.6e %12.6e %12.6e %12.6e %12.6e %12.6e %12.6e %12.6e %12.6e\n"  #define TENSOR_FORMAT "%12.6e %12.6e %12.6e %12.6e %12.6e %12.6e %12.6e %12.6e %12.6e\n"
30  #define LEN_PRINTED_FLOAT_SCALAR_FORMAT (12+1)  /* strlen("-1.234567e+789 ") == 15 */
31  #define LEN_PRINTED_FLOAT_VECTOR_FORMAT (3*(12+1)+1)  #define LEN_TENSOR_FORMAT (unsigned int)(9*15+2)
 #define LEN_PRINTED_FLOAT_TENSOR_FORMAT (9*(12+1)+1)  
32  #define NEWLINE "\n"  #define NEWLINE "\n"
33  #define LEN_TMP_BUFFER LEN_PRINTED_FLOAT_TENSOR_FORMAT+(MAX_numNodes*LEN_PRINTED_INT_FORMAT+1)+2  #define LEN_TMP_BUFFER LEN_TENSOR_FORMAT+(MAX_numNodes*LEN_INT_FORMAT+1)+2
34  #define NCOMP_MAX 9  #define NCOMP_MAX (unsigned int)9
35  #define __STRCAT(dest,chunk,dest_in_use)  \  
36  {                  \  #define __STRCAT(dest, chunk, dest_in_use) \
37    strcpy(&dest[dest_in_use], chunk); \  do {\
38    dest_in_use+=strlen(chunk); \      strcpy(&dest[dest_in_use], chunk);\
39        dest_in_use += strlen(chunk);\
40    } while(0)
41    
42    #ifdef PASO_MPI
43    /* writes buffer to file catching the empty buffer case which causes problems
44     * with some MPI versions */
45    #define MPI_WRITE_ORDERED(BUF) \
46    do {\
47        int LLEN=0; \
48        LLEN=(int) strlen(BUF); \
49        if (LLEN==0) { strcpy(BUF, ""); LLEN=0; }\
50        MPI_File_write_ordered(mpi_fileHandle_p, BUF, LLEN, MPI_CHAR, &mpi_status);\
51    } while(0)
52    
53    /* writes buffer to file on master only */
54    #define MPI_RANK0_WRITE_SHARED(BUF) \
55    do {\
56        int LLEN=0; \
57        if (my_mpi_rank == 0) {\
58            LLEN=(int) strlen(BUF); \
59            if (LLEN==0) { strcpy(BUF,""); LLEN=0; }\
60            MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p, BUF, LLEN, MPI_CHAR, &mpi_req);\
61            MPI_Wait(&mpi_req, &mpi_status);\
62        }\
63    } while(0)
64    
65    /* For reference only. Investigation needed as to which values may improve
66     * performance */
67    #if 0
68    void create_MPIInfo(MPI_Info& info)
69    {
70        MPI_Info_create(&info);
71        MPI_Info_set(info, "access_style", "write_once, sequential");
72        MPI_Info_set(info, "collective_buffering", "true");
73        MPI_Info_set(info, "cb_block_size",        "131072");
74        MPI_Info_set(info, "cb_buffer_size",       "1048567");
75        MPI_Info_set(info, "cb_nodes",             "8");
76        MPI_Info_set(info, "striping_factor",      "16");
77        MPI_Info_set(info, "striping_unit",        "424288");
78    }
79    #endif
80    
81    #else
82    
83    #define MPI_WRITE_ORDERED(A)
84    #define MPI_RANK0_WRITE_SHARED(A)
85    
86    #endif /* PASO_MPI */
87    
88    
89    /* Returns one if the node given by coords and idx is within the quadrant
90     * indexed by q and if the element type is Rec9 or Hex27, zero otherwise */
91    int nodeInQuadrant(const double *coords, ElementTypeId type, int idx, int q)
92    {
93    #define INSIDE_1D(_X_,_C_,_R_) ( ABS((_X_)-(_C_)) <= (_R_) )
94    #define INSIDE_2D(_X_,_Y_,_CX_,_CY_,_R_) ( INSIDE_1D(_X_,_CX_,_R_) && INSIDE_1D(_Y_,_CY_,_R_))
95    #define INSIDE_3D(_X_,_Y_,_Z_,_CX_,_CY_,_CZ_,_R_) ( INSIDE_1D(_X_,_CX_,_R_) && INSIDE_1D(_Y_,_CY_,_R_) && INSIDE_1D(_Z_,_CZ_,_R_) )
96    
97        int ret;
98        if ( type == Line3Macro ) {
99            if (q==0)
100                ret = INSIDE_1D(coords[idx],0.25,0.25);
101            else if (q==1)
102                ret = INSIDE_1D(coords[idx],0.75,0.25);
103            else
104                ret=1;
105        } else if ( (type == Rec9) || (type == Rec9Macro) ) {
106            if (q==0)
107                ret = INSIDE_2D(coords[2*idx], coords[2*idx+1], 0.25, 0.25, 0.25);
108            else if (q==1)
109                ret = INSIDE_2D(coords[2*idx], coords[2*idx+1], 0.75, 0.25, 0.25);
110            else if (q==2)
111                ret = INSIDE_2D(coords[2*idx], coords[2*idx+1], 0.25, 0.75, 0.25);
112            else if (q==3)
113                ret = INSIDE_2D(coords[2*idx], coords[2*idx+1], 0.75, 0.75, 0.25);
114            else
115                ret = 0;
116        } else if ((type == Hex27) || (type == Hex27Macro) ){
117            if (q==0)
118                ret = INSIDE_3D(coords[3*idx], coords[3*idx+1], coords[3*idx+2],
119                        0.25, 0.25, 0.25, 0.25);
120            else if (q==1)
121                ret = INSIDE_3D(coords[3*idx], coords[3*idx+1], coords[3*idx+2],
122                        0.75, 0.25, 0.25, 0.25);
123            else if (q==2)
124                ret = INSIDE_3D(coords[3*idx], coords[3*idx+1], coords[3*idx+2],
125                        0.25, 0.75, 0.25, 0.25);
126            else if (q==3)
127                ret = INSIDE_3D(coords[3*idx], coords[3*idx+1], coords[3*idx+2],
128                        0.75, 0.75, 0.25, 0.25);
129            else if (q==4)
130                ret = INSIDE_3D(coords[3*idx], coords[3*idx+1], coords[3*idx+2],
131                        0.25, 0.25, 0.75, 0.25);
132            else if (q==5)
133                ret = INSIDE_3D(coords[3*idx], coords[3*idx+1], coords[3*idx+2],
134                        0.75, 0.25, 0.75, 0.25);
135            else if (q==6)
136                ret = INSIDE_3D(coords[3*idx], coords[3*idx+1], coords[3*idx+2],
137                        0.25, 0.75, 0.75, 0.25);
138            else if (q==7)
139                ret = INSIDE_3D(coords[3*idx], coords[3*idx+1], coords[3*idx+2],
140                        0.75, 0.75, 0.75, 0.25);
141            else
142                ret = 0;
143        } else {
144            ret = 1;
145        }
146        return ret;
147  }  }
148    
149  void Finley_Mesh_saveVTK(const char * filename_p,  void Finley_Mesh_saveVTK(const char *filename_p,
150                           Finley_Mesh *mesh_p,                           Finley_Mesh *mesh_p,
151                           const dim_t num_data,                           const dim_t num_data,
152                           char* *names_p,                           char **names_p,
153                           escriptDataC* *data_pp)                           escriptDataC **data_pp,
154                             const char* metadata,
155                             const char*metadata_schema)
156  {  {
157    char error_msg[LenErrorMsg_MAX], *txt_buffer=NULL, tmp_buffer[LEN_TMP_BUFFER];  #ifdef PASO_MPI
158    double sampleAvg[NCOMP_MAX], *values, rtmp;      MPI_File mpi_fileHandle_p;
159    size_t len_txt_buffer, max_len_names, txt_buffer_in_use;      MPI_Status mpi_status;
160    FILE * fileHandle_p = NULL;      MPI_Request mpi_req;
161    int mpi_size, i_data, i,j , cellType;      MPI_Info mpi_info = MPI_INFO_NULL;
162    dim_t nDim, globalNumPoints, numCells, globalNumCells, numVTKNodesPerElement, myNumPoints, numPointsPerSample, rank, nComp, nCompReqd, shape, NN, numCellFactor, myNumCells, max_name_len;  #endif
163    bool_t do_write, *isCellCentered=NULL,write_celldata=FALSE,write_pointdata=FALSE;      Paso_MPI_rank my_mpi_rank;
164    bool_t set_scalar=FALSE,set_vector=FALSE, set_tensor=FALSE;      FILE *fileHandle_p = NULL;
165    index_t myFirstNode, myLastNode, *globalNodeIndex, k, *node_index, myFirstCell;      char errorMsg[LenErrorMsg_MAX], *txtBuffer;
166    #ifdef PASO_MPI      char tmpBuffer[LEN_TMP_BUFFER];
167    int ierr;      size_t txtBufferSize, txtBufferInUse, maxNameLen;
168    int amode = MPI_MODE_CREATE | MPI_MODE_WRONLY |  MPI_MODE_SEQUENTIAL;      double *quadNodes_p = NULL;
169    MPI_File mpi_fileHandle_p;      dim_t dataIdx, nDim;
170    MPI_Status mpi_status;      dim_t numCells=0, globalNumCells=0, numVTKNodesPerElement=0;
171    MPI_Request mpi_req;      dim_t myNumPoints=0, globalNumPoints=0;
172    MPI_Info mpi_info=MPI_INFO_NULL;      dim_t shape, NN=0, numCellFactor=1, myNumCells=0;
173    #endif      bool_t *isCellCentered;
174    Paso_MPI_rank my_mpi_rank;      bool_t writeCellData=FALSE, writePointData=FALSE, hasReducedElements=FALSE;
175    int nodetype=FINLEY_NODES;      index_t myFirstNode=0, myLastNode=0, *globalNodeIndex=NULL;
176    int elementtype=FINLEY_UNKNOWN;      index_t myFirstCell=0, k;
177    char elemTypeStr[32];      int mpi_size, i, j, l;
178    Finley_NodeMapping *nodeMapping=NULL;      int cellType=0, nodeType=FINLEY_NODES, elementType=FINLEY_UNKNOWN;
179    Finley_ElementFile* elements=NULL;      Finley_ElementFile *elements = NULL;
180    ElementTypeId TypeId;      ElementTypeId typeId = NoRef;
181      
182        const char *vtkHeader = \
183    /****************************************/        "<?xml version=\"1.0\"?>\n" \
184    /*                                      */        "<VTKFile type=\"UnstructuredGrid\" version=\"0.1\"%s%s>\n%s%s" \
185    /*       tags in the vtk file           */        "<UnstructuredGrid>\n" \
186          "<Piece NumberOfPoints=\"%d\" NumberOfCells=\"%d\">\n" \
187    char* tags_header="<?xml version=\"1.0\"?>\n" \        "<Points>\n" \
188                      "<VTKFile type=\"UnstructuredGrid\" version=\"0.1\">\n" \        "<DataArray NumberOfComponents=\"%d\" type=\"Float64\" format=\"ascii\">\n";
189                      "<UnstructuredGrid>\n" \      char *vtkFooter = "</Piece>\n</UnstructuredGrid>\n</VTKFile>\n";
190                      "<Piece NumberOfPoints=\"%d\" NumberOfCells=\"%d\">\n" \      const char *tag_Float_DataArray="<DataArray Name=\"%s\" type=\"Float64\" NumberOfComponents=\"%d\" format=\"ascii\">\n";
191                      "<Points>\n" \      char *tags_End_Points_and_Start_Conn = "</DataArray>\n</Points>\n<Cells>\n<DataArray Name=\"connectivity\" type=\"Int32\" format=\"ascii\">\n" ;
192                      "<DataArray NumberOfComponents=\"%d\" type=\"Float64\" format=\"ascii\">\n";      char *tags_End_Conn_and_Start_Offset = "</DataArray>\n<DataArray Name=\"offsets\" type=\"Int32\" format=\"ascii\">\n";
193    char *tag_End_DataArray = "</DataArray>\n";      char *tags_End_Offset_and_Start_Type = "</DataArray>\n<DataArray Name=\"types\" type=\"UInt8\" format=\"ascii\">\n";
194    char* tag_End_PointData =  "</PointData>\n";      char *tag_End_DataArray = "</DataArray>\n";
195    char* tag_End_CellData =  "</CellData>\n";  
196    char *footer = "</Piece>\n</UnstructuredGrid>\n</VTKFile>\n";      const int VTK_LINE3_INDEX[] =
197    char* tags_End_Points_and_Start_Conn = "</DataArray>\n</Points>\n<Cells>\n<DataArray Name=\"connectivity\" type=\"Int32\" format=\"ascii\">\n" ;        { 0, 2,
198    char* tags_End_Conn_and_Start_Offset = "</DataArray>\n<DataArray Name=\"offsets\" type=\"Int32\" format=\"ascii\">\n";          2, 1 };
199    char* tags_End_Offset_and_Start_Type = "</DataArray>\n<DataArray Name=\"types\" type=\"UInt8\" format=\"ascii\">\n";      const int VTK_HEX20_INDEX[] =
200    char* tag_Float_DataArray="<DataArray Name=\"%s\" type=\"Float64\" NumberOfComponents=\"%d\" format=\"ascii\">\n";        { 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 16, 17, 18, 19, 12, 13, 14, 15 };
201    char *tags_End_Type_And_Cells = "</DataArray>\n</Cells>\n";      const int VTK_REC9_INDEX[] =
202          { 0, 4, 8, 7,  4, 1, 5, 8,  7, 8, 6, 3,  8, 5, 2, 6 };
203    int VTK_QUADRATIC_HEXAHEDRON_INDEX[] = { 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 16, 17, 18, 19, 12, 13, 14, 15 };      const int VTK_HEX27_INDEX[] =
204    /* if there is no mesh we just return */        {  0,  8, 20, 11, 12, 21, 26, 24,
205    if (mesh_p==NULL) return;           8,  1,  9, 20, 21, 13, 22, 26,
206            11, 20, 10,  3, 24, 26, 23, 15,
207    my_mpi_rank = mesh_p->Nodes->MPIInfo->rank;          20,  9,  2, 10, 26, 22, 14, 23,
208    mpi_size  = mesh_p->Nodes->MPIInfo->size;          12, 21, 26, 24,  4, 16, 25, 19,
209    nDim = mesh_p->Nodes->numDim;          21, 13, 22, 26, 16,  5, 17, 25,
210            24, 26, 23, 15, 19, 25, 18,  7,
211    if (! ( (nDim ==2) || (nDim == 3) ) ) {          26, 22, 14, 23, 25, 17,  6, 18 };
212          Finley_setError(IO_ERROR, "saveVTK: spatial dimension 2 or 3 is supported only.");  
213          return;        /* if there is no mesh we just return */
214    }      if (mesh_p==NULL) return;
215    /*************************************************************************************/  
216        nDim = mesh_p->Nodes->numDim;
217    /* open the file and check handle */  
218        if (nDim != 2 && nDim != 3) {
219    if (mpi_size > 1) {          Finley_setError(TYPE_ERROR, "saveVTK: spatial dimension 2 or 3 is supported only.");
220          #ifdef PASO_MPI          return;
221            /* Collective Call */      }
222            #ifdef MPIO_HINTS      my_mpi_rank = mesh_p->Nodes->MPIInfo->rank;
223              MPI_Info_create(&mpi_info);      mpi_size = mesh_p->Nodes->MPIInfo->size;
224              /*  MPI_Info_set(mpi_info, "striping_unit",        "424288"); */  
225              /*  MPI_Info_set(mpi_info, "striping_factor",      "16"); */      /************************************************************************
226              /*  MPI_Info_set(mpi_info, "collective_buffering", "true"); */       * open the file and check handle *
227              /*  MPI_Info_set(mpi_info, "cb_block_size",        "131072"); */       */
228              /*  MPI_Info_set(mpi_info, "cb_buffer_size",       "1048567"); */      if (mpi_size > 1) {
229              /*  MPI_Info_set(mpi_info, "cb_nodes",             "8"); */  #ifdef PASO_MPI
230              /*    MPI_Info_set(mpi_info, "access_style", "write_once, sequential"); */          const int amode = MPI_MODE_CREATE|MPI_MODE_WRONLY|MPI_MODE_UNIQUE_OPEN;
231                      int ierr;
232              /*XFS only */          if (my_mpi_rank == 0 && Paso_fileExists(filename_p)) {
233              /*   MPI_Info_set(mpi_info, "direct_write",          "true"); */              remove(filename_p);
           #endif  
           ierr=MPI_File_open(mesh_p->Nodes->MPIInfo->comm, (char*)filename_p, amode,mpi_info, &mpi_fileHandle_p);  
           if (! ierr) {  
           perror(filename_p);  
               sprintf(error_msg, "saveVTK: File %s could not be opened for writing in parallel.", filename_p);  
               Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);  
           } else {  
              MPI_File_set_view(mpi_fileHandle_p,MPI_DISPLACEMENT_CURRENT,MPI_CHAR, MPI_CHAR, "native" , mpi_info);  
           }  
         #endif  
   } else {  
         fileHandle_p = fopen(filename_p, "w");  
         if (fileHandle_p==NULL) {  
            sprintf(error_msg, "saveVTK: File %s could not be opened for writing.", filename_p);  
            Finley_setError(IO_ERROR,error_msg);  
          }  
   }  
   if (! Paso_MPIInfo_noError(mesh_p->Nodes->MPIInfo) ) return;  
   /*************************************************************************************/  
   
   /* find the mesh type to be written */  
   
   isCellCentered=TMPMEMALLOC(num_data,bool_t);  
   max_len_names=0;  
   if (!Finley_checkPtr(isCellCentered)) {  
      nodetype=FINLEY_UNKNOWN;  
      elementtype=FINLEY_UNKNOWN;  
      for (i_data=0;i_data<num_data;++i_data) {  
        if (! isEmpty(data_pp[i_data])) {  
          switch(getFunctionSpaceType(data_pp[i_data]) ) {  
          case FINLEY_NODES:  
            nodetype = (nodetype == FINLEY_REDUCED_NODES) ? FINLEY_REDUCED_NODES : FINLEY_NODES;  
            isCellCentered[i_data]=FALSE;  
            if (elementtype==FINLEY_UNKNOWN || elementtype==FINLEY_ELEMENTS) {  
              elementtype=FINLEY_ELEMENTS;  
            } else {  
              Finley_setError(TYPE_ERROR,"saveVTK: cannot write given data in single file.");  
            }  
            break;  
          case FINLEY_REDUCED_NODES:  
            nodetype = FINLEY_REDUCED_NODES;  
            isCellCentered[i_data]=FALSE;  
            if (elementtype==FINLEY_UNKNOWN || elementtype==FINLEY_ELEMENTS) {  
              elementtype=FINLEY_ELEMENTS;  
            } else {  
              Finley_setError(TYPE_ERROR,"saveVTK: cannot write given data in single file.");  
            }  
            break;  
          case FINLEY_ELEMENTS:  
          case FINLEY_REDUCED_ELEMENTS:  
            isCellCentered[i_data]=TRUE;  
            if (elementtype==FINLEY_UNKNOWN || elementtype==FINLEY_ELEMENTS) {  
              elementtype=FINLEY_ELEMENTS;  
            } else {  
              Finley_setError(TYPE_ERROR,"saveVTK: cannot write given data in single file.");  
            }  
            break;  
          case FINLEY_FACE_ELEMENTS:  
          case FINLEY_REDUCED_FACE_ELEMENTS:  
            isCellCentered[i_data]=TRUE;  
            if (elementtype==FINLEY_UNKNOWN || elementtype==FINLEY_FACE_ELEMENTS) {  
              elementtype=FINLEY_FACE_ELEMENTS;  
            } else {  
              Finley_setError(TYPE_ERROR,"saveVTK: cannot write given data in single file.");  
            }  
            break;  
          case FINLEY_POINTS:  
            isCellCentered[i_data]=TRUE;  
            if (elementtype==FINLEY_UNKNOWN || elementtype==FINLEY_POINTS) {  
              elementtype=FINLEY_POINTS;  
            } else {  
              Finley_setError(TYPE_ERROR,"saveVTK: cannot write given data in single file.");  
            }  
            break;  
          case FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1:  
          case FINLEY_REDUCED_CONTACT_ELEMENTS_1:  
            isCellCentered[i_data]=TRUE;  
            if (elementtype==FINLEY_UNKNOWN || elementtype==FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1) {  
              elementtype=FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1;  
            } else {  
              Finley_setError(TYPE_ERROR,"saveVTK: cannot write given data in single file.");  
            }  
            break;  
          case FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_2:  
          case FINLEY_REDUCED_CONTACT_ELEMENTS_2:  
            isCellCentered[i_data]=TRUE;  
            if (elementtype==FINLEY_UNKNOWN || elementtype==FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1) {  
              elementtype=FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1;  
            } else {  
              Finley_setError(TYPE_ERROR,"saveVTK: cannot write given data in single file.");  
            }  
            break;  
          default:  
            sprintf(error_msg,"saveVTK: unknown function space type %d",getFunctionSpaceType(data_pp[i_data]));  
            Finley_setError(TYPE_ERROR,error_msg);  
          }  
          if (isCellCentered[i_data]) {  
            write_celldata=TRUE;  
          } else {  
            write_pointdata=TRUE;  
          }  
          max_len_names =MAX(max_len_names,strlen(names_p[i_data]));  
        }  
      }  
      nodetype = (nodetype == FINLEY_UNKNOWN) ? FINLEY_NODES : nodetype;  
   }  
   if (Finley_noError()) {  
   
      /***************************************/  
   
      /* select number of points and the mesh component */  
     
      if (nodetype == FINLEY_REDUCED_NODES) {  
         myFirstNode = Finley_NodeFile_getFirstReducedNode(mesh_p->Nodes);  
         myLastNode = Finley_NodeFile_getLastReducedNode(mesh_p->Nodes);  
         globalNumPoints = Finley_NodeFile_getGlobalNumReducedNodes(mesh_p->Nodes);  
         globalNodeIndex= Finley_NodeFile_borrowGlobalReducedNodesIndex(mesh_p->Nodes);  
      } else {  
         myFirstNode = Finley_NodeFile_getFirstNode(mesh_p->Nodes);  
         myLastNode = Finley_NodeFile_getLastNode(mesh_p->Nodes);  
         globalNumPoints = Finley_NodeFile_getGlobalNumNodes(mesh_p->Nodes);  
         globalNodeIndex= Finley_NodeFile_borrowGlobalNodesIndex(mesh_p->Nodes);  
      }  
      myNumPoints = myLastNode - myFirstNode;  
      if (elementtype==FINLEY_UNKNOWN) elementtype=FINLEY_ELEMENTS;  
      switch(elementtype) {  
        case FINLEY_ELEMENTS:  
           elements=mesh_p->Elements;  
           break;  
         case FINLEY_FACE_ELEMENTS:  
           elements=mesh_p->FaceElements;  
           break;  
         case FINLEY_POINTS:  
           elements=mesh_p->Points;  
           break;  
         case FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1:  
           elements=mesh_p->ContactElements;  
           break;  
      }  
      if (elements==NULL) {  
        Finley_setError(SYSTEM_ERROR,"saveVTK: undefined element file");  
      } else {  
        /* map finley element type to VTK element type */  
        numCells = elements->numElements;  
        globalNumCells = Finley_ElementFile_getGlobalNumElements(elements);  
        myNumCells= Finley_ElementFile_getMyNumElements(elements);  
        myFirstCell= Finley_ElementFile_getFirstElement(elements);  
        NN = elements->numNodes;  
        if (nodetype==FINLEY_REDUCED_NODES || nodetype==FINLEY_REDUCED_NODES) {  
           TypeId = elements->LinearReferenceElement->Type->TypeId;  
        } else {  
           TypeId = elements->ReferenceElement->Type->TypeId;  
        }  
        switch(TypeId) {  
         case Point1:  
         case Line2Face:  
         case Line3Face:  
         case Point1_Contact:  
         case Line2Face_Contact:  
         case Line3Face_Contact:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_VERTEX;  
           numVTKNodesPerElement = 1;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_VERTEX");  
           break;  
         
         case Line2:  
         case Tri3Face:  
         case Rec4Face:  
         case Line2_Contact:  
         case Tri3_Contact:  
         case Tri3Face_Contact:  
         case Rec4Face_Contact:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_LINE;  
           numVTKNodesPerElement = 2;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_LINE");  
           break;  
         
         case Tri3:  
         case Tet4Face:  
         case Tet4Face_Contact:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_TRIANGLE;  
           numVTKNodesPerElement = 3;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_TRIANGLE");  
           break;  
         
         case Rec4:  
         case Hex8Face:  
         case Rec4_Contact:  
         case Hex8Face_Contact:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_QUAD;  
           numVTKNodesPerElement = 4;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_QUAD");  
           break;  
         
         case Tet4:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_TETRA;  
           numVTKNodesPerElement = 4;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_TETRA");  
           break;  
         
         case Hex8:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_HEXAHEDRON;  
           numVTKNodesPerElement = 8;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_HEXAHEDRON");  
           break;  
         
         case Line3:  
         case Tri6Face:  
         case Rec8Face:  
         case Line3_Contact:  
         case Tri6Face_Contact:  
         case Rec8Face_Contact:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_QUADRATIC_EDGE;  
           numVTKNodesPerElement = 3;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_QUADRATIC_EDGE");  
           break;  
         
         case Tri6:  
         case Tet10Face:  
         case Tri6_Contact:  
         case Tet10Face_Contact:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_QUADRATIC_TRIANGLE;  
           numVTKNodesPerElement = 6;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_QUADRATIC_TRIANGLE");  
           break;  
         
         case Rec8:  
         case Hex20Face:  
         case Rec8_Contact:  
         case Hex20Face_Contact:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_QUADRATIC_QUAD;  
           numVTKNodesPerElement = 8;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_QUADRATIC_QUAD");  
           break;  
         
         case Tet10:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_QUADRATIC_TETRA;  
           numVTKNodesPerElement = 10;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_QUADRATIC_TETRA");  
           break;  
         
         case Hex20:  
           numCellFactor=1;  
           cellType = VTK_QUADRATIC_HEXAHEDRON;  
           numVTKNodesPerElement = 20;  
           strcpy(elemTypeStr, "VTK_QUADRATIC_HEXAHEDRON");  
           break;  
         
         default:  
           sprintf(error_msg, "saveVTK: Element type %s is not supported by VTK",elements->ReferenceElement->Type->Name);  
           Finley_setError(VALUE_ERROR,error_msg);  
         }  
      }  
   }  
   /***************************************/  
   
   /***************************************/  
   /*                                     */  
   /*   allocate text buffer              */  
   /*                                     */  
   max_name_len=0;  
   for (i_data =0 ;i_data<num_data;++i_data) max_name_len=MAX(max_name_len,strlen(names_p[i_data]));  
   len_txt_buffer= strlen(tags_header) + 3 * LEN_PRINTED_INT_FORMAT + (30+3*max_name_len); /* header */  
   if (mpi_size > 1) len_txt_buffer=MAX(len_txt_buffer, myNumPoints * LEN_TMP_BUFFER);  
   if (mpi_size > 1) len_txt_buffer=MAX(len_txt_buffer, numCellFactor*myNumCells*(LEN_PRINTED_INT_FORMAT*numVTKNodesPerElement+1));  
   len_txt_buffer=MAX(len_txt_buffer,200+3*max_len_names);  
   len_txt_buffer=MAX(len_txt_buffer, strlen(tag_Float_DataArray) + LEN_PRINTED_INT_FORMAT + max_len_names);  
   if (mpi_size > 1) len_txt_buffer=MAX(len_txt_buffer, numCellFactor*myNumCells*LEN_PRINTED_FLOAT_TENSOR_FORMAT);  
   if (mpi_size > 1) len_txt_buffer=MAX(len_txt_buffer, myNumPoints*LEN_PRINTED_FLOAT_TENSOR_FORMAT);  
   txt_buffer=TMPMEMALLOC(len_txt_buffer+1,char);  
   Finley_checkPtr(txt_buffer);  
     
   if (Finley_noError()) {  
   
      /* select number of points and the mesh component */  
   
      sprintf(txt_buffer,tags_header,globalNumPoints,numCellFactor*globalNumCells,3);  
   
       if (mpi_size > 1) {  
           if ( my_mpi_rank == 0) {  
             #ifdef PASO_MPI  
               MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,txt_buffer,strlen(txt_buffer),MPI_CHAR,&mpi_req);  
               MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);  
             #endif  
           }  
       } else {  
          fprintf(fileHandle_p,txt_buffer);  
       }  
   
       /* write the nodes */  
         
       if (mpi_size > 1) {  
   
          txt_buffer[0] = '\0';  
          txt_buffer_in_use=0;  
          if (nDim==2) {  
             for (i = 0; i < mesh_p->Nodes->numNodes; i++) {  
                if ( (myFirstNode <= globalNodeIndex[i]) && (globalNodeIndex[i] < myLastNode) ) {  
                  sprintf(tmp_buffer,FLOAT_VECTOR_FORMAT,  
                                     mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0, i, nDim)],  
                                     mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1, i, nDim)],  
                                     0.);  
                  __STRCAT(txt_buffer,tmp_buffer,txt_buffer_in_use);  
                }  
             }        
          } else {  
             for (i = 0; i < mesh_p->Nodes->numNodes; i++) {  
                if ( (myFirstNode <= globalNodeIndex[i]) && (globalNodeIndex[i] < myLastNode) ) {  
                  sprintf(tmp_buffer,FLOAT_VECTOR_FORMAT,  
                                                   mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0, i, nDim)],  
                                                   mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1, i, nDim)],  
                                                   mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(2, i, nDim)]);  
                  __STRCAT(txt_buffer,tmp_buffer,txt_buffer_in_use);  
                }  
             }      
     
          }  
          #ifdef PASO_MPI  
             MPI_File_write_ordered(mpi_fileHandle_p, txt_buffer,txt_buffer_in_use, MPI_CHAR, &mpi_status);  
          #endif      
       } else {  
          if (nDim==2) {  
             for (i = 0; i < mesh_p->Nodes->numNodes; i++) {  
                if ( (myFirstNode <= globalNodeIndex[i]) && (globalNodeIndex[i] < myLastNode) ) {  
                  fprintf(fileHandle_p,FLOAT_VECTOR_FORMAT,  
                                       mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0, i, nDim)],  
                                       mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1, i, nDim)],  
                                       0.);  
                }  
             }        
          } else {  
             for (i = 0; i < mesh_p->Nodes->numNodes; i++) {  
                if ( (myFirstNode <= globalNodeIndex[i]) && (globalNodeIndex[i] < myLastNode) ) {  
                  fprintf(fileHandle_p,FLOAT_VECTOR_FORMAT,  
                                               mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0, i, nDim)],  
                                               mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1, i, nDim)],  
                                               mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(2, i, nDim)]);  
                }  
             }      
     
          }  
       }  
   
       /* close the Points and open connectivity */  
   
       if (mpi_size > 1) {  
           if ( my_mpi_rank == 0) {  
              #ifdef PASO_MPI  
                 MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p, tags_End_Points_and_Start_Conn, strlen(tags_End_Points_and_Start_Conn), MPI_CHAR, &mpi_req);  
                 MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);  
              #endif  
           }  
       } else {  
          fprintf(fileHandle_p,tags_End_Points_and_Start_Conn);  
       }  
   
      /* write the cells */  
      if (nodetype == FINLEY_REDUCED_NODES) {  
         node_index=elements->ReferenceElement->Type->linearNodes;  
      } else if (VTK_QUADRATIC_HEXAHEDRON==cellType) {  
         node_index=VTK_QUADRATIC_HEXAHEDRON_INDEX;  
      } else if (numVTKNodesPerElement!=NN) {  
         node_index=elements->ReferenceElement->Type->geoNodes;  
      } else {  
         node_index=NULL;  
      }  
   
      if ( mpi_size > 1) {  
         txt_buffer[0] = '\0';  
         txt_buffer_in_use=0;  
         if (node_index == NULL) {  
            for (i = 0; i < numCells; i++) {  
               if (elements->Owner[i] == my_mpi_rank) {  
                  for (j = 0; j < numVTKNodesPerElement; j++) {  
                      sprintf(tmp_buffer,INT_FORMAT,globalNodeIndex[elements->Nodes[INDEX2(j, i, NN)]]);  
                      __STRCAT(txt_buffer,tmp_buffer,txt_buffer_in_use)  
                  }  
                  __STRCAT(txt_buffer,NEWLINE,txt_buffer_in_use)  
               }  
            }  
         } else {  
            for (i = 0; i < numCells; i++) {  
               if (elements->Owner[i] == my_mpi_rank) {  
                  for (j = 0; j < numVTKNodesPerElement; j++) {  
                      sprintf(tmp_buffer,INT_FORMAT,globalNodeIndex[elements->Nodes[INDEX2(node_index[j], i, NN)]]);  
                      __STRCAT(txt_buffer,tmp_buffer,txt_buffer_in_use)  
                  }  
                  __STRCAT(txt_buffer,NEWLINE,txt_buffer_in_use)  
               }  
            }  
234          }          }
235          #ifdef PASO_MPI          ierr = MPI_File_open(mesh_p->Nodes->MPIInfo->comm, (char*)filename_p,
236             MPI_File_write_ordered(mpi_fileHandle_p,txt_buffer,txt_buffer_in_use, MPI_CHAR, &mpi_status);                               amode, mpi_info, &mpi_fileHandle_p);
237          #endif              if (ierr != MPI_SUCCESS) {
238       } else {              sprintf(errorMsg, "saveVTK: File %s could not be opened for writing in parallel.", filename_p);
239          if (node_index == NULL) {              Finley_setError(IO_ERROR, errorMsg);
            for (i = 0; i < numCells; i++) {  
               for (j = 0; j < numVTKNodesPerElement; j++) {  
                  fprintf(fileHandle_p,INT_FORMAT,globalNodeIndex[elements->Nodes[INDEX2(j, i, NN)]]);  
                }  
               fprintf(fileHandle_p,NEWLINE);  
            }  
240          } else {          } else {
241             for (i = 0; i < numCells; i++) {              ierr=MPI_File_set_view(mpi_fileHandle_p,MPI_DISPLACEMENT_CURRENT,
242                for (j = 0; j < numVTKNodesPerElement; j++) {                      MPI_CHAR, MPI_CHAR, "native", mpi_info);
                  fprintf(fileHandle_p,INT_FORMAT,globalNodeIndex[elements->Nodes[INDEX2(node_index[j], i, NN)]]);  
                }  
               fprintf(fileHandle_p,NEWLINE);  
            }  
         }  
   
      }  
       
      /* finalize the connection and start the offset section */  
      if (mpi_size > 1) {  
         if( my_mpi_rank == 0) {  
            #ifdef PASO_MPI  
               MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,tags_End_Conn_and_Start_Offset,strlen(tags_End_Conn_and_Start_Offset),MPI_CHAR,&mpi_req);  
               MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);  
            #endif  
         }  
      } else {  
         fprintf(fileHandle_p,tags_End_Conn_and_Start_Offset);  
      }  
   
     /* write the offsets */  
         
      if ( mpi_size > 1) {  
         txt_buffer[0] = '\0';  
         txt_buffer_in_use=0;  
         for (i=numVTKNodesPerElement*(myFirstCell*numCellFactor+1); i<=numCells*numVTKNodesPerElement*numCellFactor; i+=numVTKNodesPerElement) {  
            sprintf(tmp_buffer, INT_NEWLINE_FORMAT, i);  
            __STRCAT(txt_buffer,tmp_buffer,txt_buffer_in_use);  
          }  
          #ifdef PASO_MPI  
             MPI_File_write_ordered(mpi_fileHandle_p,txt_buffer,txt_buffer_in_use, MPI_CHAR, &mpi_status);  
          #endif      
      } else {  
         for (i=numVTKNodesPerElement; i<=numCells*numVTKNodesPerElement*numCellFactor; i+=numVTKNodesPerElement) {  
            fprintf(fileHandle_p, INT_NEWLINE_FORMAT, i);  
         }  
       
      }  
      /* finalize the offset section and start the type section */  
      if ( mpi_size > 1) {  
         if ( my_mpi_rank == 0) {  
            #ifdef PASO_MPI  
               MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,tags_End_Offset_and_Start_Type,strlen(tags_End_Offset_and_Start_Type),MPI_CHAR,&mpi_req);  
               MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);  
            #endif  
243          }          }
244    #endif /* PASO_MPI */
245      } else {      } else {
246         fprintf(fileHandle_p,tags_End_Offset_and_Start_Type);          fileHandle_p = fopen(filename_p, "w");
247      }          if (fileHandle_p==NULL) {
248                    sprintf(errorMsg, "saveVTK: File %s could not be opened for writing.", filename_p);
249                      Finley_setError(IO_ERROR, errorMsg);
      /* write element type */  
      sprintf(tmp_buffer, INT_NEWLINE_FORMAT, cellType);  
      if ( mpi_size > 1) {  
         txt_buffer[0] = '\0';  
         txt_buffer_in_use=0;  
         for (i=0; i<numCells*numCellFactor; i++) __STRCAT(txt_buffer,tmp_buffer,txt_buffer_in_use);  
          #ifdef PASO_MPI  
             MPI_File_write_ordered(mpi_fileHandle_p,txt_buffer,txt_buffer_in_use, MPI_CHAR, &mpi_status);  
          #endif      
      } else {  
         for (i=0; i<numCells*numCellFactor; i++) fprintf(fileHandle_p, tmp_buffer);  
      }  
      /* finalize cell information */  
      if ( mpi_size > 1) {  
         if ( my_mpi_rank == 0) {  
            #ifdef PASO_MPI  
               MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,tags_End_Type_And_Cells,strlen(tags_End_Type_And_Cells),MPI_CHAR,&mpi_req);  
               MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);  
            #endif  
250          }          }
     } else {  
        fprintf(fileHandle_p,tags_End_Type_And_Cells);  
251      }      }
252   }      if (!Paso_MPIInfo_noError(mesh_p->Nodes->MPIInfo)) return;
253    
254   /* Write cell data */      /* General note: From this point if an error occurs Finley_setError is
255   if (write_celldata && Finley_noError()) {       * called and subsequent steps are skipped until the end of this function
256        /* mark the active data arrays */       * where allocated memory is freed and the file is closed. */
257        txt_buffer[0] = '\0';  
258        set_scalar=FALSE,set_vector=FALSE, set_tensor=FALSE;      /************************************************************************/
259        strcat(txt_buffer, "<CellData");      /* find the mesh type to be written */
260        for (i_data =0 ;i_data<num_data;++i_data) {  
261          if (! isEmpty(data_pp[i_data]) && isCellCentered[i_data]) {      isCellCentered = TMPMEMALLOC(num_data, bool_t);
262            /* if the rank == 0:   --> scalar data */      maxNameLen = 0;
263            /* if the rank == 1:   --> vector data */      if (!Finley_checkPtr(isCellCentered)) {
264            /* if the rank == 2:   --> tensor data */          for (dataIdx=0; dataIdx<num_data; ++dataIdx) {
265                if (! isEmpty(data_pp[dataIdx])) {
266            switch(getDataPointRank(data_pp[i_data])) {                  switch(getFunctionSpaceType(data_pp[dataIdx]) ) {
267            case 0:                      case FINLEY_NODES:
268              if (! set_scalar) {                          nodeType = (nodeType == FINLEY_REDUCED_NODES) ? FINLEY_REDUCED_NODES : FINLEY_NODES;
269                strcat(txt_buffer," Scalars=\"");                          isCellCentered[dataIdx] = FALSE;
270                strcat(txt_buffer,names_p[i_data]);                          if (elementType==FINLEY_UNKNOWN || elementType==FINLEY_ELEMENTS) {
271                strcat(txt_buffer,"\"");                              elementType = FINLEY_ELEMENTS;
272                set_scalar=TRUE;                          } else {
273                                Finley_setError(TYPE_ERROR, "saveVTK: cannot write given data in single file.");
274                            }
275                        break;
276                        case FINLEY_REDUCED_NODES:
277                            nodeType = FINLEY_REDUCED_NODES;
278                            isCellCentered[dataIdx] = FALSE;
279                            if (elementType==FINLEY_UNKNOWN || elementType==FINLEY_ELEMENTS) {
280                                elementType = FINLEY_ELEMENTS;
281                            } else {
282                                Finley_setError(TYPE_ERROR, "saveVTK: cannot write given data in single file.");
283                        }
284                        break;
285                        case FINLEY_REDUCED_ELEMENTS:
286                            hasReducedElements = TRUE;
287                        case FINLEY_ELEMENTS:
288                            isCellCentered[dataIdx] = TRUE;
289                            if (elementType==FINLEY_UNKNOWN || elementType==FINLEY_ELEMENTS) {
290                                elementType = FINLEY_ELEMENTS;
291                            } else {
292                                Finley_setError(TYPE_ERROR, "saveVTK: cannot write given data in single file.");
293                            }
294                        break;
295                        case FINLEY_REDUCED_FACE_ELEMENTS:
296                            hasReducedElements = TRUE;
297                        case FINLEY_FACE_ELEMENTS:
298                            isCellCentered[dataIdx] = TRUE;
299                            if (elementType==FINLEY_UNKNOWN || elementType==FINLEY_FACE_ELEMENTS) {
300                                elementType = FINLEY_FACE_ELEMENTS;
301                            } else {
302                                Finley_setError(TYPE_ERROR, "saveVTK: cannot write given data in single file.");
303                            }
304                        break;
305                        case FINLEY_POINTS:
306                            isCellCentered[dataIdx]=TRUE;
307                            if (elementType==FINLEY_UNKNOWN || elementType==FINLEY_POINTS) {
308                                elementType = FINLEY_POINTS;
309                            } else {
310                                Finley_setError(TYPE_ERROR, "saveVTK: cannot write given data in single file.");
311                            }
312                        break;
313                        case FINLEY_REDUCED_CONTACT_ELEMENTS_1:
314                            hasReducedElements = TRUE;
315                        case FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1:
316                            isCellCentered[dataIdx] = TRUE;
317                            if (elementType==FINLEY_UNKNOWN || elementType==FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1) {
318                                elementType = FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1;
319                            } else {
320                                Finley_setError(TYPE_ERROR, "saveVTK: cannot write given data in single file.");
321                            }
322                        break;
323                        case FINLEY_REDUCED_CONTACT_ELEMENTS_2:
324                            hasReducedElements = TRUE;
325                        case FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_2:
326                            isCellCentered[dataIdx] = TRUE;
327                            if (elementType==FINLEY_UNKNOWN || elementType==FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1) {
328                                elementType = FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1;
329                            } else {
330                                Finley_setError(TYPE_ERROR, "saveVTK: cannot write given data in single file.");
331                            }
332                        break;
333                        default:
334                            sprintf(errorMsg, "saveVTK: unknown function space type %d",getFunctionSpaceType(data_pp[dataIdx]));
335                            Finley_setError(TYPE_ERROR, errorMsg);
336                    }
337                    if (isCellCentered[dataIdx]) {
338                        writeCellData = TRUE;
339                    } else {
340                        writePointData = TRUE;
341                    }
342                    maxNameLen = MAX(maxNameLen, strlen(names_p[dataIdx]));
343              }              }
344            }
345        }
346    
347        /************************************************************************/
348        /* select number of points and the mesh component */
349    
350        if (Finley_noError()) {
351            if (nodeType == FINLEY_REDUCED_NODES) {
352                myFirstNode = Finley_NodeFile_getFirstReducedNode(mesh_p->Nodes);
353                myLastNode = Finley_NodeFile_getLastReducedNode(mesh_p->Nodes);
354                globalNumPoints = Finley_NodeFile_getGlobalNumReducedNodes(mesh_p->Nodes);
355                globalNodeIndex = Finley_NodeFile_borrowGlobalReducedNodesIndex(mesh_p->Nodes);
356            } else {
357                myFirstNode = Finley_NodeFile_getFirstNode(mesh_p->Nodes);
358                myLastNode = Finley_NodeFile_getLastNode(mesh_p->Nodes);
359                globalNumPoints = Finley_NodeFile_getGlobalNumNodes(mesh_p->Nodes);
360                globalNodeIndex = Finley_NodeFile_borrowGlobalNodesIndex(mesh_p->Nodes);
361            }
362            myNumPoints = myLastNode - myFirstNode;
363            if (elementType==FINLEY_UNKNOWN) elementType=FINLEY_ELEMENTS;
364            switch(elementType) {
365                case FINLEY_ELEMENTS:
366                    elements = mesh_p->Elements;
367              break;              break;
368            case 1:              case FINLEY_FACE_ELEMENTS:
369              if (! set_vector) {                  elements = mesh_p->FaceElements;
               strcat(txt_buffer," Vectors=\"");  
               strcat(txt_buffer,names_p[i_data]);  
               strcat(txt_buffer,"\"");  
               set_vector=TRUE;  
             }  
370              break;              break;
371            case 2:              case FINLEY_POINTS:
372              if (! set_tensor) {                  elements = mesh_p->Points;
373                strcat(txt_buffer," Tensors=\"");              break;
374                strcat(txt_buffer,names_p[i_data]);              case FINLEY_CONTACT_ELEMENTS_1:
375                strcat(txt_buffer,"\"");                  elements = mesh_p->ContactElements;
               set_tensor=TRUE;  
             }  
376              break;              break;
377            default:          }
378              sprintf(error_msg, "saveVTK: data %s: Vtk can't handle objects with rank greater than 2.",names_p[i_data]);          if (elements==NULL) {
379              Finley_setError(VALUE_ERROR,error_msg);              Finley_setError(SYSTEM_ERROR, "saveVTK: undefined element file");
380              return;          } else {
381            }              /* map finley element type to VTK element type */
382          }              numCells = elements->numElements;
383        }              globalNumCells = Finley_ElementFile_getGlobalNumElements(elements);
384        strcat(txt_buffer, ">\n");              myNumCells = Finley_ElementFile_getMyNumElements(elements);
385        if ( mpi_size > 1) {              myFirstCell = Finley_ElementFile_getFirstElement(elements);
386          if ( my_mpi_rank == 0) {              NN = elements->numNodes;
387             #ifdef PASO_MPI              if (hasReducedElements) {
388                MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,txt_buffer,strlen(txt_buffer),MPI_CHAR,&mpi_req);                  quadNodes_p=elements->referenceElementSet->referenceElementReducedQuadrature->Parametrization->QuadNodes;
               MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);  
            #endif  
         }  
       } else {  
           fprintf(fileHandle_p,txt_buffer);  
       }  
       /* write the arrays */  
       for (i_data =0 ;i_data<num_data;++i_data) {  
          if (! isEmpty(data_pp[i_data]) && isCellCentered[i_data]) {  
             txt_buffer[0] = '\0';  
             txt_buffer_in_use=0;  
             numPointsPerSample=getNumDataPointsPerSample(data_pp[i_data]);  
             rank = getDataPointRank(data_pp[i_data]);  
             nComp = getDataPointSize(data_pp[i_data]);  
             nCompReqd=1;   /* the number of components mpi_required by vtk */  
             shape=0;  
             if (rank == 0) {  
               nCompReqd = 1;  
             } else if (rank == 1) {  
               shape=getDataPointShape(data_pp[i_data], 0);  
               if  (shape>3) {  
                 Finley_setError(VALUE_ERROR, "saveVTK: rank 1 object must have less then 4 components");  
               }  
               nCompReqd = 3;  
389              } else {              } else {
390                shape=getDataPointShape(data_pp[i_data], 0);                  quadNodes_p=elements->referenceElementSet->referenceElement->Parametrization->QuadNodes;
               if  (shape>3 || shape != getDataPointShape(data_pp[i_data], 1)) {  
                 Finley_setError(VALUE_ERROR, "saveVTK: rank 2 object must have less then 4x4 components and must have a square shape");  
               }  
               nCompReqd = 9;  
391              }              }
392              if (Finley_noError()) {              if (nodeType==FINLEY_REDUCED_NODES) {
393                 sprintf(txt_buffer,tag_Float_DataArray,names_p[i_data], nCompReqd);                  typeId = elements->referenceElementSet->referenceElement->LinearType->TypeId;
394                 if ( mpi_size > 1) {              } else {
395                   if ( my_mpi_rank == 0) {                  typeId = elements->referenceElementSet->referenceElement->Type->TypeId;
                     #ifdef PASO_MPI  
                        MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,txt_buffer,strlen(txt_buffer),MPI_CHAR,&mpi_req);  
                        MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);  
                     #endif  
                  }  
                } else {  
                    fprintf(fileHandle_p,txt_buffer);  
                }  
                for (i=0; i<numCells; i++) {  
                    if (elements->Owner[i] == my_mpi_rank) {  
                       values = getSampleData(data_pp[i_data], i);  
                       /* averaging over the number of points in the sample */  
                       for (k=0; k<MIN(nComp,NCOMP_MAX); k++) {  
                          if (isExpanded(data_pp[i_data])) {  
                            rtmp = 0.;  
                            for (j=0; j<numPointsPerSample; j++) rtmp += values[INDEX2(k,j,nComp)];  
                            sampleAvg[k] = rtmp/numPointsPerSample;  
                         } else {  
                            sampleAvg[k] = values[k];  
                         }  
                       }  
                       /* if the number of mpi_required components is more than the number  
                       * of actual components, pad with zeros  
                       */  
                       /* probably only need to get shape of first element */  
                       /* write the data different ways for scalar, vector and tensor */  
                       if (nCompReqd == 1) {  
                         sprintf(tmp_buffer,FLOAT_SCALAR_FORMAT,sampleAvg[0]);  
                       } else if (nCompReqd == 3) {  
                         if (shape==1) {  
                          sprintf(tmp_buffer,FLOAT_VECTOR_FORMAT,sampleAvg[0],0.,0.);  
                         } else if (shape==2) {  
                          sprintf(tmp_buffer,FLOAT_VECTOR_FORMAT,sampleAvg[0],sampleAvg[1],0.);  
                         } else if (shape==3) {  
                          sprintf(tmp_buffer,FLOAT_VECTOR_FORMAT,sampleAvg[0],sampleAvg[1],sampleAvg[2]);  
                         }  
                       } else if (nCompReqd == 9) {  
                         if (shape==1) {  
                          sprintf(tmp_buffer,FLOAT_TENSOR_FORMAT,sampleAvg[0],0.,0.,  
                                                                 0.,0.,0.,  
                                                                 0.,0.,0.);  
                         } else if (shape==2) {  
                          sprintf(tmp_buffer,FLOAT_TENSOR_FORMAT,sampleAvg[0],sampleAvg[1],0.,  
                                                                 sampleAvg[2],sampleAvg[3],0.,  
                                                                 0.,0.,0.);  
                         } else if (shape==3) {  
                          sprintf(tmp_buffer,FLOAT_TENSOR_FORMAT,sampleAvg[0],sampleAvg[1],sampleAvg[2],  
                                                                 sampleAvg[3],sampleAvg[4],sampleAvg[5],  
                                                                 sampleAvg[6],sampleAvg[7],sampleAvg[8]);  
                         }  
                       }  
                       if ( mpi_size > 1) {  
                         __STRCAT(txt_buffer,tmp_buffer,txt_buffer_in_use);  
                       } else {  
                         fprintf(fileHandle_p,tmp_buffer);  
                       }  
                   }  
                }  
                if ( mpi_size > 1) {  
                      #ifdef PASO_MPI  
                         MPI_File_write_ordered(mpi_fileHandle_p,txt_buffer,txt_buffer_in_use, MPI_CHAR, &mpi_status);  
                      #endif      
                      if ( my_mpi_rank == 0) {  
                         #ifdef PASO_MPI  
                            MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,tag_End_DataArray,strlen(tag_End_DataArray),MPI_CHAR,&mpi_req);  
                            MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);  
                         #endif  
                      }  
                } else {  
                    fprintf(fileHandle_p,tag_End_DataArray);  
                }  
396              }              }
397           }              switch (typeId) {
398        }                  case Point1:
399        if ( mpi_size > 1) {                  case Line2Face:
400          if ( my_mpi_rank == 0) {                  case Line3Face:
401             #ifdef PASO_MPI                  case Point1_Contact:
402                MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,tag_End_CellData,strlen(tag_End_CellData),MPI_CHAR,&mpi_req);                  case Line2Face_Contact:
403                MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);                  case Line3Face_Contact:
404             #endif                      cellType = VTK_VERTEX;
405          }                      numVTKNodesPerElement = 1;
406        } else {                  break;
407            fprintf(fileHandle_p,tag_End_CellData);  
408        }                  case Line2:
409    }                  case Tri3Face:
410    /* point data */                  case Rec4Face:
411    if (write_pointdata && Finley_noError()) {                  case Line2_Contact:
412        /* mark the active data arrays */                  case Tri3_Contact:
413        set_scalar=FALSE,set_vector=FALSE, set_tensor=FALSE;                  case Tri3Face_Contact:
414        txt_buffer[0] = '\0';                  case Rec4Face_Contact:
415        strcat(txt_buffer, "<PointData");                      cellType = VTK_LINE;
416        for (i_data =0 ;i_data<num_data;++i_data) {                      numVTKNodesPerElement = 2;
417          if (! isEmpty(data_pp[i_data]) && !isCellCentered[i_data]) {                  break;
418            /* if the rank == 0:   --> scalar data */  
419            /* if the rank == 1:   --> vector data */          case Line3Macro:
420            /* if the rank == 2:   --> tensor data */                      cellType = VTK_LINE;
421                        numCellFactor = 2;
422            switch(getDataPointRank(data_pp[i_data])) {                      numVTKNodesPerElement = 2;
423            case 0:                  break;
424              if (! set_scalar) {  
425                strcat(txt_buffer," Scalars=\"");                  case Tri3:
426                strcat(txt_buffer,names_p[i_data]);                  case Tet4Face:
427                strcat(txt_buffer,"\"");                  case Tet4Face_Contact:
428                set_scalar=TRUE;                      cellType = VTK_TRIANGLE;
429                        numVTKNodesPerElement = 3;
430                    break;
431    
432                    case Rec4:
433                    case Hex8Face:
434                    case Rec4_Contact:
435                    case Hex8Face_Contact:
436                        cellType = VTK_QUAD;
437                        numVTKNodesPerElement = 4;
438                    break;
439    
440                    case Rec9Macro:
441            case Rec9:
442                        numCellFactor = 4;
443                        cellType = VTK_QUAD;
444                        numVTKNodesPerElement = 4;
445                    break;
446    
447                    case Tet4:
448                        cellType = VTK_TETRA;
449                        numVTKNodesPerElement = 4;
450                    break;
451    
452                    case Hex8:
453                        cellType = VTK_HEXAHEDRON;
454                        numVTKNodesPerElement = 8;
455                    break;
456    
457                    case Line3:
458                    case Tri6Face:
459                    case Rec8Face:
460                    case Line3_Contact:
461                    case Tri6Face_Contact:
462                    case Rec8Face_Contact:
463                        cellType = VTK_QUADRATIC_EDGE;
464                        numVTKNodesPerElement = 3;
465                    break;
466    
467                    case Tri6:
468            case Tri6Macro:    
469                    case Tet10Face:
470                    case Tri6_Contact:
471                    case Tet10Face_Contact:
472                        cellType = VTK_QUADRATIC_TRIANGLE;
473                        numVTKNodesPerElement = 6;
474                    break;
475    
476    
477                    case Rec8:
478                    case Hex20Face:
479                    case Rec8_Contact:
480                    case Hex20Face_Contact:
481                        cellType = VTK_QUADRATIC_QUAD;
482                        numVTKNodesPerElement = 8;
483                    break;
484    
485            case Tet10Macro:
486                    case Tet10:
487                        cellType = VTK_QUADRATIC_TETRA;
488                        numVTKNodesPerElement = 10;
489                    break;
490    
491                    case Hex20:
492                        cellType = VTK_QUADRATIC_HEXAHEDRON;
493                        numVTKNodesPerElement = 20;
494                    break;
495    
496            case Hex27Macro:
497                    case Hex27:
498                        numCellFactor = 8;
499                        cellType = VTK_HEXAHEDRON;
500                        numVTKNodesPerElement = 8;
501                    break;
502    
503                    default:
504                        sprintf(errorMsg, "saveVTK: Element type %s is not supported by VTK.", elements->referenceElementSet->referenceElement->Type->Name);
505                        Finley_setError(VALUE_ERROR, errorMsg);
506              }              }
507              break;          }
508            case 1:      }
509              if (! set_vector) {  
510                strcat(txt_buffer," Vectors=\"");      /* allocate enough memory for text buffer */
511                strcat(txt_buffer,names_p[i_data]);  
512                strcat(txt_buffer,"\"");      txtBufferSize = strlen(vtkHeader) + 3*LEN_INT_FORMAT + (30+3*maxNameLen)+strlen(metadata)+strlen(metadata_schema);
513                set_vector=TRUE;      if (mpi_size > 1) {
514            txtBufferSize = MAX(txtBufferSize, myNumPoints * LEN_TMP_BUFFER);
515            txtBufferSize = MAX(txtBufferSize, numCellFactor * myNumCells *
516                    (LEN_INT_FORMAT * numVTKNodesPerElement + 1));
517            txtBufferSize = MAX(txtBufferSize,
518                    numCellFactor * myNumCells * LEN_TENSOR_FORMAT);
519            txtBufferSize = MAX(txtBufferSize, myNumPoints * LEN_TENSOR_FORMAT);
520        }
521        txtBuffer = TMPMEMALLOC(txtBufferSize+1, char);
522    
523        /* sets error if memory allocation failed */
524        Finley_checkPtr(txtBuffer);
525    
526        /************************************************************************/
527        /* write number of points and the mesh component */
528    
529        if (Finley_noError()) {
530            const index_t *nodeIndex;
531            if (FINLEY_REDUCED_NODES == nodeType) {
532                nodeIndex = elements->referenceElementSet->referenceElement->Type->linearNodes;
533            } else if (Line3Macro == typeId) {
534                 nodeIndex = VTK_LINE3_INDEX;
535            } else if ( (Rec9 == typeId) || (Rec9Macro == typeId) ) {
536                nodeIndex = VTK_REC9_INDEX;
537            } else if (Hex20 == typeId) {
538                nodeIndex = VTK_HEX20_INDEX;
539            } else if ( (Hex27 == typeId) || (Hex27Macro == typeId) ){
540                nodeIndex = VTK_HEX27_INDEX;
541            } else if (numVTKNodesPerElement  !=  elements->referenceElementSet->referenceElement->Type->numNodes) {
542                nodeIndex = elements->referenceElementSet->referenceElement->Type->relevantGeoNodes;
543            } else {
544                nodeIndex = NULL;
545            }
546    
547            if (strlen(metadata)>0) {
548               if (strlen(metadata_schema)>0) {
549                  sprintf(txtBuffer, vtkHeader," ",metadata_schema,metadata,"\n",globalNumPoints, numCellFactor*globalNumCells, 3);
550               } else {
551                  sprintf(txtBuffer, vtkHeader,"","",metadata,"\n",globalNumPoints, numCellFactor*globalNumCells, 3);
552               }
553            } else {
554               if (strlen(metadata_schema)>0) {
555                  sprintf(txtBuffer, vtkHeader," ",metadata_schema,"","",globalNumPoints, numCellFactor*globalNumCells, 3);
556               } else {
557                  sprintf(txtBuffer, vtkHeader,"","","","",globalNumPoints, numCellFactor*globalNumCells, 3);
558               }
559            }
560    
561            if (mpi_size > 1) {
562                /* write the nodes */
563                MPI_RANK0_WRITE_SHARED(txtBuffer);
564                txtBuffer[0] = '\0';
565                txtBufferInUse = 0;
566                if (nDim==2) {
567                    for (i = 0; i < mesh_p->Nodes->numNodes; i++) {
568                        if ( (myFirstNode <= globalNodeIndex[i]) && (globalNodeIndex[i] < myLastNode) ) {
569                            sprintf(tmpBuffer, VECTOR_FORMAT,
570                                mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0, i, nDim)],
571                                mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1, i, nDim)],
572                                0.);
573                            __STRCAT(txtBuffer, tmpBuffer, txtBufferInUse);
574                        }
575                    }
576                } else {
577                    for (i = 0; i < mesh_p->Nodes->numNodes; i++) {
578                        if ( (myFirstNode <= globalNodeIndex[i]) && (globalNodeIndex[i] < myLastNode) ) {
579                            sprintf(tmpBuffer, VECTOR_FORMAT,
580                                mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0, i, nDim)],
581                                mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1, i, nDim)],
582                                mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(2, i, nDim)]);
583                            __STRCAT(txtBuffer, tmpBuffer, txtBufferInUse);
584                        }
585                    }
586                } /* nDim */
587                MPI_WRITE_ORDERED(txtBuffer);
588    
589                /* write the cells */
590                MPI_RANK0_WRITE_SHARED(tags_End_Points_and_Start_Conn);
591                txtBuffer[0] = '\0';
592                txtBufferInUse = 0;
593                if (nodeIndex == NULL) {
594                    for (i = 0; i < numCells; i++) {
595                        if (elements->Owner[i] == my_mpi_rank) {
596                            for (j = 0; j < numVTKNodesPerElement; j++) {
597                                sprintf(tmpBuffer, INT_FORMAT, globalNodeIndex[elements->Nodes[INDEX2(j, i, NN)]]);
598                                __STRCAT(txtBuffer, tmpBuffer, txtBufferInUse);
599                            }
600                            __STRCAT(txtBuffer, NEWLINE, txtBufferInUse);
601                        }
602                    }
603                } else {
604                    for (i = 0; i < numCells; i++) {
605                        if (elements->Owner[i] == my_mpi_rank) {
606                            for (l = 0; l < numCellFactor; l++) {
607                                const int* idx=&nodeIndex[l*numVTKNodesPerElement];
608                                for (j = 0; j < numVTKNodesPerElement; j++) {
609                                    sprintf(tmpBuffer, INT_FORMAT, globalNodeIndex[elements->Nodes[INDEX2(idx[j], i, NN)]]);
610                                    __STRCAT(txtBuffer, tmpBuffer, txtBufferInUse);
611                                }
612                                __STRCAT(txtBuffer, NEWLINE, txtBufferInUse);
613                            }
614                        }
615                    }
616                } /* nodeIndex */
617                MPI_WRITE_ORDERED(txtBuffer);
618    
619                /* write the offsets */
620                MPI_RANK0_WRITE_SHARED(tags_End_Conn_and_Start_Offset);
621                txtBuffer[0] = '\0';
622                txtBufferInUse = 0;
623                for (i = numVTKNodesPerElement*(myFirstCell*numCellFactor+1);
624                        i <= (myFirstCell+myNumCells)*numVTKNodesPerElement*numCellFactor; i += numVTKNodesPerElement)
625                {
626                    sprintf(tmpBuffer, INT_NEWLINE_FORMAT, i);
627                    __STRCAT(txtBuffer, tmpBuffer, txtBufferInUse);
628              }              }
629              break;              MPI_WRITE_ORDERED(txtBuffer);
630            case 2:  
631              if (! set_tensor) {              /* write element type */
632                strcat(txt_buffer," Tensors=\"");              sprintf(tmpBuffer, INT_NEWLINE_FORMAT, cellType);
633                strcat(txt_buffer,names_p[i_data]);              MPI_RANK0_WRITE_SHARED(tags_End_Offset_and_Start_Type);
634                strcat(txt_buffer,"\"");              txtBuffer[0] = '\0';
635                set_tensor=TRUE;              txtBufferInUse = 0;
636                for (i = numVTKNodesPerElement*(myFirstCell*numCellFactor+1);
637                        i <= (myFirstCell+myNumCells)*numVTKNodesPerElement*numCellFactor; i += numVTKNodesPerElement)
638                {
639                    __STRCAT(txtBuffer, tmpBuffer, txtBufferInUse);
640              }              }
641              break;              MPI_WRITE_ORDERED(txtBuffer);
642            default:              /* finalize cell information */
643              sprintf(error_msg, "saveVTK: data %s: Vtk can't handle objects with rank greater than 2.",names_p[i_data]);              strcpy(txtBuffer, "</DataArray>\n</Cells>\n");
644              Finley_setError(VALUE_ERROR,error_msg);              MPI_RANK0_WRITE_SHARED(txtBuffer);
645              return;  
646            }          } else { /***** mpi_size == 1 *****/
647          }  
648        }              /* write the nodes */
649        strcat(txt_buffer, ">\n");              fputs(txtBuffer, fileHandle_p);
650        if ( mpi_size > 1) {              if (nDim==2) {
651          if ( my_mpi_rank == 0) {                  for (i = 0; i < mesh_p->Nodes->numNodes; i++) {
652             #ifdef PASO_MPI                      if ( (myFirstNode <= globalNodeIndex[i]) && (globalNodeIndex[i] < myLastNode) ) {
653                MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,txt_buffer,strlen(txt_buffer),MPI_CHAR,&mpi_req);                          fprintf(fileHandle_p, VECTOR_FORMAT,
654                MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);                              mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0, i, nDim)],
655             #endif                              mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1, i, nDim)],
656          }                              0.);
657        } else {                      }
658            fprintf(fileHandle_p,txt_buffer);                  }
       }  
       /* write the arrays */  
       for (i_data =0 ;i_data<num_data;++i_data) {  
          if (! isEmpty(data_pp[i_data]) && !isCellCentered[i_data]) {  
             txt_buffer[0] = '\0';  
             txt_buffer_in_use=0;  
             numPointsPerSample=getNumDataPointsPerSample(data_pp[i_data]);  
             rank = getDataPointRank(data_pp[i_data]);  
             nComp = getDataPointSize(data_pp[i_data]);  
             if (getFunctionSpaceType(data_pp[i_data]) == FINLEY_REDUCED_NODES) {  
                nodeMapping=mesh_p->Nodes->reducedNodesMapping;  
659              } else {              } else {
660                 nodeMapping=mesh_p->Nodes->nodesMapping;                  for (i = 0; i < mesh_p->Nodes->numNodes; i++) {
661              }                      if ( (myFirstNode <= globalNodeIndex[i]) && (globalNodeIndex[i] < myLastNode) ) {
662              nCompReqd=1;   /* the number of components mpi_required by vtk */                          fprintf(fileHandle_p, VECTOR_FORMAT,
663              shape=0;                              mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(0, i, nDim)],
664              if (rank == 0) {                              mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(1, i, nDim)],
665                nCompReqd = 1;                              mesh_p->Nodes->Coordinates[INDEX2(2, i, nDim)]);
666              } else if (rank == 1) {                      }
667                shape=getDataPointShape(data_pp[i_data], 0);                  }
668                if  (shape>3) {              } /* nDim */
669                  Finley_setError(VALUE_ERROR, "saveVTK: rank 1 object must have less then 4 components");  
670                }              /* write the cells */
671                nCompReqd = 3;              fputs(tags_End_Points_and_Start_Conn, fileHandle_p);
672                if (nodeIndex == NULL) {
673                    for (i = 0; i < numCells; i++) {
674                        for (j = 0; j < numVTKNodesPerElement; j++) {
675                            fprintf(fileHandle_p, INT_FORMAT, globalNodeIndex[elements->Nodes[INDEX2(j, i, NN)]]);
676                        }
677                        fprintf(fileHandle_p, NEWLINE);
678                    }
679              } else {              } else {
680                shape=getDataPointShape(data_pp[i_data], 0);                  for (i = 0; i < numCells; i++) {
681                if  (shape>3 || shape != getDataPointShape(data_pp[i_data], 1)) {                      for (l = 0; l < numCellFactor; l++) {
682                  Finley_setError(VALUE_ERROR, "saveVTK: rank 2 object must have less then 4x4 components and must have a square shape");                          const int* idx=&nodeIndex[l*numVTKNodesPerElement];
683                }                          for (j = 0; j < numVTKNodesPerElement; j++) {
684                nCompReqd = 9;                              fprintf(fileHandle_p, INT_FORMAT, globalNodeIndex[elements->Nodes[INDEX2(idx[j], i, NN)]]);
685                            }
686                            fprintf(fileHandle_p, NEWLINE);
687                        }
688                    }
689                } /* nodeIndex */
690    
691                /* write the offsets */
692                fputs(tags_End_Conn_and_Start_Offset, fileHandle_p);
693                for (i = numVTKNodesPerElement; i <= numCells*numVTKNodesPerElement*numCellFactor; i += numVTKNodesPerElement) {
694                    fprintf(fileHandle_p, INT_NEWLINE_FORMAT, i);
695              }              }
696              if (Finley_noError()) {  
697                 sprintf(txt_buffer,tag_Float_DataArray,names_p[i_data], nCompReqd);              /* write element type */
698                 if ( mpi_size > 1) {              sprintf(tmpBuffer, INT_NEWLINE_FORMAT, cellType);
699                   if ( my_mpi_rank == 0) {              fputs(tags_End_Offset_and_Start_Type, fileHandle_p);
700                      #ifdef PASO_MPI              for (i = 0; i < numCells*numCellFactor; i++)
701                         MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,txt_buffer,strlen(txt_buffer),MPI_CHAR,&mpi_req);                  fputs(tmpBuffer, fileHandle_p);
702                         MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);              /* finalize cell information */
703                      #endif              fputs("</DataArray>\n</Cells>\n", fileHandle_p);
704                   }          } /* mpi_size */
705                 } else {  
706                     fprintf(fileHandle_p,txt_buffer);      } /* Finley_noError */
707                 }  
708                 for (i=0; i<mesh_p->Nodes->numNodes; i++) {      /************************************************************************/
709                    k=globalNodeIndex[i];      /* write cell data */
710                    if ( (myFirstNode <= k) && (k < myLastNode) ) {  
711                       values = getSampleData(data_pp[i_data], nodeMapping->target[i]);      if (writeCellData && Finley_noError()) {
712                       /* if the number of mpi_required components is more than the number          bool_t set_scalar=FALSE, set_vector=FALSE, set_tensor=FALSE;
713                       * of actual components, pad with zeros          /* mark the active data arrays */
714                       */          strcpy(txtBuffer, "<CellData");
715                       /* probably only need to get shape of first element */          for (dataIdx = 0; dataIdx < num_data; dataIdx++) {
716                       /* write the data different ways for scalar, vector and tensor */              if (!isEmpty(data_pp[dataIdx]) && isCellCentered[dataIdx]) {
717                       if (nCompReqd == 1) {                  /* rank == 0 <--> scalar data */
718                         sprintf(tmp_buffer,FLOAT_SCALAR_FORMAT,values[0]);                  /* rank == 1 <--> vector data */
719                       } else if (nCompReqd == 3) {                  /* rank == 2 <--> tensor data */
720                         if (shape==1) {                  switch (getDataPointRank(data_pp[dataIdx])) {
721                          sprintf(tmp_buffer,FLOAT_VECTOR_FORMAT,values[0],0.,0.);                      case 0:
722                         } else if (shape==2) {                          if (!set_scalar) {
723                          sprintf(tmp_buffer,FLOAT_VECTOR_FORMAT,values[0],values[1],0.);                              strcat(txtBuffer, " Scalars=\"");
724                         } else if (shape==3) {                              strcat(txtBuffer, names_p[dataIdx]);
725                          sprintf(tmp_buffer,FLOAT_VECTOR_FORMAT,values[0],values[1],values[2]);                              strcat(txtBuffer, "\"");
726                         }                              set_scalar = TRUE;
727                       } else if (nCompReqd == 9) {                          }
728                         if (shape==1) {                      break;
729                          sprintf(tmp_buffer,FLOAT_TENSOR_FORMAT,values[0],0.,0.,                      case 1:
730                                                                 0.,0.,0.,                          if (!set_vector) {
731                                                                 0.,0.,0.);                              strcat(txtBuffer, " Vectors=\"");
732                         } else if (shape==2) {                              strcat(txtBuffer, names_p[dataIdx]);
733                          sprintf(tmp_buffer,FLOAT_TENSOR_FORMAT,values[0],values[1],0.,                              strcat(txtBuffer, "\"");
734                                                                 values[2],values[3],0.,                              set_vector = TRUE;
735                                                                 0.,0.,0.);                          }
736                         } else if (shape==3) {                      break;
737                          sprintf(tmp_buffer,FLOAT_TENSOR_FORMAT,values[0],values[1],values[2],                      case 2:
738                                                                 values[3],values[4],values[5],                          if (!set_tensor) {
739                                                                 values[6],values[7],values[8]);                              strcat(txtBuffer, " Tensors=\"");
740                         }                              strcat(txtBuffer, names_p[dataIdx]);
741                       }                              strcat(txtBuffer, "\"");
742                       if ( mpi_size > 1) {                              set_tensor = TRUE;
743                         __STRCAT(txt_buffer,tmp_buffer,txt_buffer_in_use);                          }
744                       } else {                      break;
745                         fprintf(fileHandle_p,tmp_buffer);                      default:
746                       }                          sprintf(errorMsg, "saveVTK: data %s: VTK supports data with rank <= 2 only.", names_p[dataIdx]);
747                    }                          Finley_setError(VALUE_ERROR, errorMsg);
748                 }                  }
                if ( mpi_size > 1) {  
                    #ifdef PASO_MPI  
                      MPI_File_write_ordered(mpi_fileHandle_p,txt_buffer,txt_buffer_in_use, MPI_CHAR, &mpi_status);  
                    #endif      
                    if ( my_mpi_rank == 0) {  
                       #ifdef PASO_MPI  
                          MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,tag_End_DataArray,strlen(tag_End_DataArray),MPI_CHAR,&mpi_req);  
                          MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);  
                       #endif  
                    }  
                } else {  
                   fprintf(fileHandle_p,tag_End_DataArray);  
                }  
749              }              }
750            }              if (!Finley_noError())
751                    break;
752          }          }
753        }
754        /* only continue if no error occurred */
755        if (writeCellData && Finley_noError()) {
756            strcat(txtBuffer, ">\n");
757            if ( mpi_size > 1) {
758                MPI_RANK0_WRITE_SHARED(txtBuffer);
759            } else {
760                fputs(txtBuffer, fileHandle_p);
761            }
762    
763            /* write the arrays */
764            for (dataIdx = 0; dataIdx < num_data; dataIdx++) {
765                if (!isEmpty(data_pp[dataIdx]) && isCellCentered[dataIdx]) {
766                    dim_t numPointsPerSample=getNumDataPointsPerSample(data_pp[dataIdx]);
767                    dim_t rank = getDataPointRank(data_pp[dataIdx]);
768                    dim_t nComp = getDataPointSize(data_pp[dataIdx]);
769                    dim_t nCompReqd = 1; /* number of components mpi_required */
770                    if (rank == 0) {
771                        nCompReqd = 1;
772                        shape = 0;
773                    } else if (rank == 1) {
774                        nCompReqd = 3;
775                        shape = getDataPointShape(data_pp[dataIdx], 0);
776                        if (shape > 3) {
777                            Finley_setError(VALUE_ERROR, "saveVTK: rank 1 objects must have 3 components at most.");
778                        }
779                    } else {
780                        nCompReqd = 9;
781                        shape = getDataPointShape(data_pp[dataIdx], 0);
782                        if (shape > 3 || shape != getDataPointShape(data_pp[dataIdx], 1)) {
783                            Finley_setError(VALUE_ERROR, "saveVTK: rank 2 objects of shape 2x2 or 3x3 supported only.");
784                        }
785                    }
786                    /* bail out if an error occurred */
787                    if (!Finley_noError())
788                        break;
789    
790                    sprintf(txtBuffer, tag_Float_DataArray, names_p[dataIdx], nCompReqd);
791                    if ( mpi_size > 1) {
792                        MPI_RANK0_WRITE_SHARED(txtBuffer);
793                    } else {
794                        fputs(txtBuffer, fileHandle_p);
795                    }
796    
797                    txtBuffer[0] = '\0';
798                    txtBufferInUse = 0;
799                    for (i=0; i<numCells; i++) {
800                        if (elements->Owner[i] == my_mpi_rank) {
801                            __const double *values = getSampleDataRO(data_pp[dataIdx], i);
802                            for (l = 0; l < numCellFactor; l++) {
803                                double sampleAvg[NCOMP_MAX];
804                                dim_t nCompUsed = MIN(nComp, NCOMP_MAX);
805    
806                                /* average over number of points in the sample */
807                                if (isExpanded(data_pp[dataIdx])) {
808                                    dim_t hits=0;
809                                    for (k=0; k<nCompUsed; k++) sampleAvg[k]=0;
810                                    for (j=0; j<numPointsPerSample; j++) {
811                                        if (nodeInQuadrant(quadNodes_p, typeId, j, l)) {
812                                            hits++;
813                                            for (k=0; k<nCompUsed; k++) {
814                                                sampleAvg[k] += values[INDEX2(k,j,nComp)];
815                                            }
816                                        }
817                                    }
818                                    for (k=0; k<nCompUsed; k++)
819                                        sampleAvg[k] /= MAX(hits, 1);
820                                } else {
821                                    for (k=0; k<nCompUsed; k++)
822                                        sampleAvg[k] = values[k];
823                                } /* isExpanded */
824    
825                                /* if the number of required components is more than
826                                 * the number of actual components, pad with zeros
827                                 */
828                                /* probably only need to get shape of first element */
829                                if (nCompReqd == 1) {
830                                    sprintf(tmpBuffer, SCALAR_FORMAT, sampleAvg[0]);
831                                } else if (nCompReqd == 3) {
832                                    if (shape==1) {
833                                        sprintf(tmpBuffer, VECTOR_FORMAT,
834                                            sampleAvg[0], 0.f, 0.f);
835                                    } else if (shape==2) {
836                                        sprintf(tmpBuffer, VECTOR_FORMAT,
837                                            sampleAvg[0], sampleAvg[1], 0.f);
838                                    } else if (shape==3) {
839                                        sprintf(tmpBuffer, VECTOR_FORMAT,
840                                            sampleAvg[0],sampleAvg[1],sampleAvg[2]);
841                                    }
842                                } else if (nCompReqd == 9) {
843                                    if (shape==1) {
844                                        sprintf(tmpBuffer, TENSOR_FORMAT,
845                                            sampleAvg[0], 0.f, 0.f,
846                                                     0.f, 0.f, 0.f,
847                                                     0.f, 0.f, 0.f);
848                                    } else if (shape==2) {
849                                        sprintf(tmpBuffer, TENSOR_FORMAT,
850                                            sampleAvg[0], sampleAvg[1], 0.f,
851                                            sampleAvg[2], sampleAvg[3], 0.f,
852                                                     0.f,          0.f, 0.f);
853                                    } else if (shape==3) {
854                                        sprintf(tmpBuffer, TENSOR_FORMAT,
855                                            sampleAvg[0],sampleAvg[1],sampleAvg[2],
856                                            sampleAvg[3],sampleAvg[4],sampleAvg[5],
857                                            sampleAvg[6],sampleAvg[7],sampleAvg[8]);
858                                    }
859                                }
860                                if ( mpi_size > 1) {
861                                    __STRCAT(txtBuffer, tmpBuffer, txtBufferInUse);
862                                } else {
863                                    fputs(tmpBuffer, fileHandle_p);
864                                }
865                            } /* for l (numCellFactor) */
866                        } /* if I am the owner */
867                    } /* for i (numCells) */
868    
869                    if ( mpi_size > 1) {
870                        MPI_WRITE_ORDERED(txtBuffer);
871                        MPI_RANK0_WRITE_SHARED(tag_End_DataArray);
872                    } else {
873                        fputs(tag_End_DataArray, fileHandle_p);
874                    }
875                } /* !isEmpty && cellCentered */
876            } /* for dataIdx */
877    
878            strcpy(txtBuffer, "</CellData>\n");
879            if ( mpi_size > 1) {
880                MPI_RANK0_WRITE_SHARED(txtBuffer);
881            } else {
882                fputs(txtBuffer, fileHandle_p);
883            }
884        } /* if noError && writeCellData */
885    
886        /************************************************************************/
887        /* write point data */
888    
889        if (writePointData && Finley_noError()) {
890            /* mark the active data arrays */
891            bool_t set_scalar=FALSE, set_vector=FALSE, set_tensor=FALSE;
892            strcpy(txtBuffer, "<PointData");
893            for (dataIdx = 0; dataIdx<num_data; dataIdx++) {
894                if (!isEmpty(data_pp[dataIdx]) && !isCellCentered[dataIdx]) {
895                    switch (getDataPointRank(data_pp[dataIdx])) {
896                        case 0:
897                            if (!set_scalar) {
898                                strcat(txtBuffer, " Scalars=\"");
899                                strcat(txtBuffer, names_p[dataIdx]);
900                                strcat(txtBuffer, "\"");
901                                set_scalar = TRUE;
902                            }
903                        break;
904                        case 1:
905                            if (!set_vector) {
906                                strcat(txtBuffer, " Vectors=\"");
907                                strcat(txtBuffer, names_p[dataIdx]);
908                                strcat(txtBuffer, "\"");
909                                set_vector = TRUE;
910                            }
911                        break;
912                        case 2:
913                            if (!set_tensor) {
914                                strcat(txtBuffer, " Tensors=\"");
915                                strcat(txtBuffer, names_p[dataIdx]);
916                                strcat(txtBuffer, "\"");
917                                set_tensor = TRUE;
918                            }
919                        break;
920                        default:
921                            sprintf(errorMsg, "saveVTK: data %s: VTK supports data with rank <= 2 only.", names_p[dataIdx]);
922                            Finley_setError(VALUE_ERROR, errorMsg);
923                    }
924                }
925                if (!Finley_noError())
926                    break;
927            }
928        }
929        /* only continue if no error occurred */
930        if (writePointData && Finley_noError()) {
931            strcat(txtBuffer, ">\n");
932          if ( mpi_size > 1) {          if ( mpi_size > 1) {
933            if ( my_mpi_rank == 0) {              MPI_RANK0_WRITE_SHARED(txtBuffer);
              #ifdef PASO_MPI  
                 MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,tag_End_CellData,strlen(tag_End_PointData),MPI_CHAR,&mpi_req);  
                 MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);  
              #endif  
           }  
934          } else {          } else {
935              fprintf(fileHandle_p,tag_End_PointData);              fputs(txtBuffer, fileHandle_p);
936          }          }
937    }  
938    if (Finley_noError()) {          /* write the arrays */
939       if ( mpi_size > 1) {          for (dataIdx = 0; dataIdx < num_data; dataIdx++) {
940         if ( my_mpi_rank == 0) {              if (!isEmpty(data_pp[dataIdx]) && !isCellCentered[dataIdx]) {
941            #ifdef PASO_MPI                  Finley_NodeMapping* nodeMapping;
942               MPI_File_iwrite_shared(mpi_fileHandle_p,footer,strlen(footer),MPI_CHAR,&mpi_req);                  dim_t rank = getDataPointRank(data_pp[dataIdx]);
943               MPI_Wait(&mpi_req,&mpi_status);                  dim_t nCompReqd = 1; /* number of components mpi_required */
944               #ifdef MPIO_HINTS                  if (getFunctionSpaceType(data_pp[dataIdx]) == FINLEY_REDUCED_NODES) {
945                 MPI_Info_free(&mpi_info);                      nodeMapping = mesh_p->Nodes->reducedNodesMapping;
946                 #undef MPIO_HINTS                  } else {
947               #endif                      nodeMapping = mesh_p->Nodes->nodesMapping;
948               MPI_File_close(&mpi_fileHandle_p);                  }
949            #endif                  if (rank == 0) {
950          }                      nCompReqd = 1;
951       } else {                      shape = 0;
952           fprintf(fileHandle_p,footer);                  } else if (rank == 1) {
953           fclose(fileHandle_p);                      nCompReqd = 3;
954       }                      shape = getDataPointShape(data_pp[dataIdx], 0);
955    }                      if (shape > 3) {
956    TMPMEMFREE(isCellCentered);                          Finley_setError(VALUE_ERROR, "saveVTK: rank 1 objects must have 3 components at most.");
957    TMPMEMFREE(txt_buffer);                      }
958    return;                  } else {
959                        nCompReqd = 9;
960                        shape=getDataPointShape(data_pp[dataIdx], 0);
961                        if (shape > 3 || shape != getDataPointShape(data_pp[dataIdx], 1)) {
962                            Finley_setError(VALUE_ERROR, "saveVTK: rank 2 objects of shape 2x2 or 3x3 supported only.");
963                        }
964                    }
965                    /* bail out if an error occurred */
966                    if (!Finley_noError())
967                        break;
968    
969                    sprintf(txtBuffer, tag_Float_DataArray, names_p[dataIdx], nCompReqd);
970                    if ( mpi_size > 1) {
971                        MPI_RANK0_WRITE_SHARED(txtBuffer);
972                    } else {
973                        fputs(txtBuffer, fileHandle_p);
974                    }
975    
976                    txtBuffer[0] = '\0';
977                    txtBufferInUse = 0;
978                    for (i=0; i<mesh_p->Nodes->numNodes; i++) {
979                        k = globalNodeIndex[i];
980                        if ( (myFirstNode <= k) && (k < myLastNode) ) {
981                            __const double *values = getSampleDataRO(data_pp[dataIdx], nodeMapping->target[i]);
982                            /* if the number of mpi_required components is more than
983                             * the number of actual components, pad with zeros.
984                             * Probably only need to get shape of first element */
985                            if (nCompReqd == 1) {
986                                sprintf(tmpBuffer, SCALAR_FORMAT, values[0]);
987                            } else if (nCompReqd == 3) {
988                                if (shape==1) {
989                                    sprintf(tmpBuffer, VECTOR_FORMAT,
990                                            values[0], 0.f, 0.f);
991                                } else if (shape==2) {
992                                    sprintf(tmpBuffer, VECTOR_FORMAT,
993                                            values[0], values[1], 0.f);
994                                } else if (shape==3) {
995                                    sprintf(tmpBuffer, VECTOR_FORMAT,
996                                            values[0], values[1], values[2]);
997                                }
998                            } else if (nCompReqd == 9) {
999                                if (shape==1) {
1000                                    sprintf(tmpBuffer, TENSOR_FORMAT,
1001                                        values[0], 0.f, 0.f,
1002                                              0.f, 0.f, 0.f,
1003                                              0.f, 0.f, 0.f);
1004                                } else if (shape==2) {
1005                                    sprintf(tmpBuffer, TENSOR_FORMAT,
1006                                        values[0], values[1], 0.f,
1007                                        values[2], values[3], 0.f,
1008                                              0.f,       0.f, 0.f);
1009                                } else if (shape==3) {
1010                                    sprintf(tmpBuffer, TENSOR_FORMAT,
1011                                        values[0], values[1], values[2],
1012                                        values[3], values[4], values[5],
1013                                        values[6], values[7], values[8]);
1014                                }
1015                            }
1016                            if ( mpi_size > 1) {
1017                                __STRCAT(txtBuffer, tmpBuffer, txtBufferInUse);
1018                            } else {
1019                                fputs(tmpBuffer, fileHandle_p);
1020                            }
1021                        } /* if this is my node */
1022                    } /* for i (numNodes) */
1023    
1024                    if ( mpi_size > 1) {
1025                        MPI_WRITE_ORDERED(txtBuffer);
1026                        MPI_RANK0_WRITE_SHARED(tag_End_DataArray);
1027                    } else {
1028                        fputs(tag_End_DataArray, fileHandle_p);
1029                    }
1030                } /* !isEmpty && !isCellCentered */
1031            } /* for dataIdx */
1032    
1033            strcpy(txtBuffer, "</PointData>\n");
1034            if ( mpi_size > 1) {
1035                MPI_RANK0_WRITE_SHARED(txtBuffer);
1036            } else {
1037                fputs(txtBuffer, fileHandle_p);
1038            }
1039        } /* if noError && writePointData */
1040    
1041        /* Final write to VTK file */
1042        if (Finley_noError()) {
1043            if (mpi_size > 1) {
1044                MPI_RANK0_WRITE_SHARED(vtkFooter);
1045            } else {
1046                fputs(vtkFooter, fileHandle_p);
1047            }
1048        }
1049    
1050        if ( mpi_size > 1) {
1051    #ifdef PASO_MPI
1052            MPI_File_close(&mpi_fileHandle_p);
1053            MPI_Barrier(mesh_p->Nodes->MPIInfo->comm);
1054    #endif
1055        } else {
1056            fclose(fileHandle_p);
1057        }
1058        TMPMEMFREE(isCellCentered);
1059        TMPMEMFREE(txtBuffer);
1060  }  }
1061    

Legend:
Removed from v.1384  
changed lines
  Added in v.2814

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.26