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revision 1915 by phornby, Thu Oct 23 08:40:09 2008 UTC revision 1980 by artak, Thu Nov 6 04:45:08 2008 UTC
# Line 35  Line 35 
35  /***************************************************************/  /***************************************************************/
36    
37  #define IS_AVAILABLE -1  #define IS_AVAILABLE -1
38  #define IS_IN_MIS_NOW -2  #define IS_IN_SET -3
39  #define IS_IN_MIS -3  #define IS_REMOVED -4
 #define IS_CONNECTED_TO_MIS -4  
40    
41    void Paso_Pattern_coup(Paso_SparseMatrix* A, index_t* mis_marker, double threshold) {
   
 void Paso_Pattern_coup(Paso_SparseMatrix* A, index_t* mis_marker) {  
42    
43    index_t index_offset=(A->pattern->type & PATTERN_FORMAT_OFFSET1 ? 1:0);    index_t index_offset=(A->pattern->type & PATTERN_FORMAT_OFFSET1 ? 1:0);
44    dim_t i,j;    dim_t i,j;
45    double threshold=0.05;    /*double threshold=0.05;*/
46    index_t iptr,*index,*where_p,diagptr;    index_t iptr,*index,*where_p,diagptr;
47    bool_t flag;    bool_t fail;
48    dim_t n=A->pattern->numOutput;    dim_t n=A->numRows;
49      /*double sum;*/
50    if (A->pattern->type & PATTERN_FORMAT_SYM) {    if (A->pattern->type & PATTERN_FORMAT_SYM) {
51      Paso_setError(TYPE_ERROR,"Paso_Pattern_mis: symmetric matrix pattern is not supported yet");      Paso_setError(TYPE_ERROR,"Paso_Pattern_mis: symmetric matrix pattern is not supported yet");
52      return;      return;
53    }    }
54        
55       /* is there any vertex available ?*/       /* is there any vertex available ?*/
56       while (Paso_Util_isAny(n,mis_marker,IS_AVAILABLE)) {       if (Paso_Util_isAny(n,mis_marker,IS_AVAILABLE)) {
57    
58             #pragma omp parallel for private(i,iptr,flag) schedule(static)              #pragma omp parallel for private(i,iptr,index,where_p,diagptr,j) schedule(static)
59             for (i=0;i<n;++i) {              for (i=0;i<n;++i) {
60                if (mis_marker[i]==IS_AVAILABLE) {                if (mis_marker[i]==IS_AVAILABLE) {
                  flag=IS_IN_MIS;  
61                   diagptr=A->pattern->ptr[i];                   diagptr=A->pattern->ptr[i];
62                   index=&(A->pattern->index[diagptr]);                   index=&(A->pattern->index[diagptr]);
63                   where_p=(index_t*)bsearch(&i,                   where_p=(index_t*)bsearch(&i,
# Line 75  void Paso_Pattern_coup(Paso_SparseMatrix Line 72  void Paso_Pattern_coup(Paso_SparseMatrix
72                  }                  }
73                   for (iptr=A->pattern->ptr[i]-index_offset;iptr<A->pattern->ptr[i+1]-index_offset; ++iptr) {                   for (iptr=A->pattern->ptr[i]-index_offset;iptr<A->pattern->ptr[i+1]-index_offset; ++iptr) {
74                       j=A->pattern->index[iptr]-index_offset;                       j=A->pattern->index[iptr]-index_offset;
75                       if (j!=i && A->val[iptr]>=threshold*A->val[diagptr]) {                       if (j!=i && ABS(A->val[iptr])>=threshold*ABS(A->val[diagptr])) {
76                          flag=IS_AVAILABLE;                          mis_marker[j]=IS_REMOVED;
77                          break;                         }
                      }  
78                   }                   }
                  mis_marker[i]=flag;  
79                  }                  }
80              }              }
81                          
82                #pragma omp parallel for private(i,iptr) schedule(static)              #pragma omp parallel for private(i,iptr) schedule(static)
83                for (i=0;i<n;++i)
84                    if(mis_marker[i]==IS_AVAILABLE)
85                               mis_marker[i]=IS_IN_SET;
86                
87                  #pragma omp parallel for private(i,iptr,index,where_p,diagptr) schedule(static)
88                for (i=0;i<n;i++) {                for (i=0;i<n;i++) {
89                 if (mis_marker[i]==IS_AVAILABLE) {                 if (mis_marker[i]==IS_REMOVED) {
90                     fail=FALSE;
91                   diagptr=A->pattern->ptr[i];                   diagptr=A->pattern->ptr[i];
92                   index=&(A->pattern->index[diagptr]);                   index=&(A->pattern->index[diagptr]);
93                   where_p=(index_t*)bsearch(&i,                   where_p=(index_t*)bsearch(&i,
# Line 101  void Paso_Pattern_coup(Paso_SparseMatrix Line 102  void Paso_Pattern_coup(Paso_SparseMatrix
102                  }                  }
103                   for (iptr=A->pattern->ptr[i]-index_offset;iptr<A->pattern->ptr[i+1]-index_offset; ++iptr) {                   for (iptr=A->pattern->ptr[i]-index_offset;iptr<A->pattern->ptr[i+1]-index_offset; ++iptr) {
104                       j=A->pattern->index[iptr]-index_offset;                       j=A->pattern->index[iptr]-index_offset;
105                       if (j!=i && mis_marker[j]==IS_IN_MIS && (A->val[iptr]/A->val[diagptr])>=-threshold){                       if (mis_marker[j]==IS_IN_SET && (A->val[iptr]/A->val[diagptr])<-threshold){
106                           mis_marker[i]=IS_IN_MIS;                           fail=TRUE;
107                       }                           #ifndef _OPENMP  
108                       else {                           break;
109                           mis_marker[i]=IS_CONNECTED_TO_MIS;                           #endif
110                       }                       }
111                   }                   }
112                     if(!fail) {
113                        mis_marker[i]=IS_IN_SET;
114                     }
115                 }                 }
116                }                }
117                  
118          }          }
119       /* swap to TRUE/FALSE in mis_marker */       /* swap to TRUE/FALSE in mis_marker */
120       #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)       #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
121       for (i=0;i<n;i++) mis_marker[i]=(mis_marker[i]==IS_IN_MIS);       for (i=0;i<n;i++) mis_marker[i]=(mis_marker[i]==IS_IN_SET);
122  }  }
123    
124  /*  /*
# Line 132  void Paso_Pattern_coup(Paso_SparseMatrix Line 137  void Paso_Pattern_coup(Paso_SparseMatrix
137  void Paso_Pattern_RS(Paso_SparseMatrix* A, index_t* mis_marker, double theta)  void Paso_Pattern_RS(Paso_SparseMatrix* A, index_t* mis_marker, double theta)
138  {  {
139    index_t index_offset=(A->pattern->type & PATTERN_FORMAT_OFFSET1 ? 1:0);    index_t index_offset=(A->pattern->type & PATTERN_FORMAT_OFFSET1 ? 1:0);
140    dim_t i,j;    dim_t i;
141    index_t iptr;    index_t iptr;
142    double threshold,min_offdiagonal;    double threshold,min_offdiagonal;
143    bool_t flag;    dim_t n=A->numRows;
   dim_t n=A->pattern->numOutput;  
144    if (A->pattern->type & PATTERN_FORMAT_SYM) {    if (A->pattern->type & PATTERN_FORMAT_SYM) {
145      Paso_setError(TYPE_ERROR,"Paso_Pattern_RS: symmetric matrix pattern is not supported yet");      Paso_setError(TYPE_ERROR,"Paso_Pattern_RS: symmetric matrix pattern is not supported yet");
146      return;      return;
# Line 149  void Paso_Pattern_RS(Paso_SparseMatrix* Line 153  void Paso_Pattern_RS(Paso_SparseMatrix*
153        for (i=0;i<n;++i) {        for (i=0;i<n;++i) {
154          min_offdiagonal = A->val[A->pattern->ptr[i]-index_offset];          min_offdiagonal = A->val[A->pattern->ptr[i]-index_offset];
155          for (iptr=A->pattern->ptr[i]-index_offset;iptr<A->pattern->ptr[i+1]-index_offset; ++iptr) {          for (iptr=A->pattern->ptr[i]-index_offset;iptr<A->pattern->ptr[i+1]-index_offset; ++iptr) {
156              if(A->pattern->index[iptr] != i){              if(A->pattern->index[iptr-index_offset] != i){
157                  min_offdiagonal = MIN(min_offdiagonal,A->val[iptr-index_offset]);                  min_offdiagonal = MIN(min_offdiagonal,A->val[iptr-index_offset]);
158              }              }
159          }          }
160    
161          threshold = theta*min_offdiagonal;          threshold = theta*min_offdiagonal;
162          mis_marker[i]=IS_CONNECTED_TO_MIS;          mis_marker[i]=IS_IN_SET;
163          #pragma omp parallel for private(iptr) schedule(static)          #pragma omp parallel for private(iptr) schedule(static)
164          for (iptr=A->pattern->ptr[i]-index_offset;iptr<A->pattern->ptr[i+1]-index_offset; ++iptr) {          for (iptr=A->pattern->ptr[i]-index_offset;iptr<A->pattern->ptr[i+1]-index_offset; ++iptr) {
165              if(-1.*(A->val[iptr-index_offset]) <= threshold){              if(A->val[iptr-index_offset] < threshold){
166                      mis_marker[i]=IS_IN_MIS;                      mis_marker[i]=IS_REMOVED;
167                        #ifndef _OPENMP    
168                         break;
169                        #endif
170              }              }
171          }          }
172        }        }
173      }      }
174       /* swap to TRUE/FALSE in mis_marker */       /* swap to TRUE/FALSE in mis_marker */
175       #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)       #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
176       for (i=0;i<n;i++) mis_marker[i]=(mis_marker[i]==IS_IN_MIS);       for (i=0;i<n;i++) mis_marker[i]=(mis_marker[i]==IS_IN_SET);
177    }
178    
179    
180    
181    
182    void Paso_Pattern_Aggregiation(Paso_SparseMatrix* A, index_t* mis_marker, double theta)
183    {
184      index_t index_offset=(A->pattern->type & PATTERN_FORMAT_OFFSET1 ? 1:0);
185      dim_t i,j;
186      index_t iptr;
187      double diag,eps_Aii,val;
188      dim_t n=A->numRows;
189      double* diags=MEMALLOC(n,double);
190      
191      if (A->pattern->type & PATTERN_FORMAT_SYM) {
192        Paso_setError(TYPE_ERROR,"Paso_Pattern_RS: symmetric matrix pattern is not supported yet");
193        return;
194      }
195        
196       if (Paso_Util_isAny(n,mis_marker,IS_AVAILABLE)) {
197        #pragma omp parallel for private(i,iptr,diag) schedule(static)
198          for (i=0;i<n;++i) {
199            diag = 0;
200            for (iptr=A->pattern->ptr[i]-index_offset;iptr<A->pattern->ptr[i+1]-index_offset; ++iptr) {
201                if(A->pattern->index[iptr-index_offset] != i){
202                    diag+=A->val[iptr-index_offset];
203                }
204            }
205            diags[i]=ABS(diag);
206          }
207        
208        #pragma omp parallel for private(i,iptr,diag,j,val,eps_Aii) schedule(static)
209          for (i=0;i<n;++i) {
210            eps_Aii = theta*theta*diags[i];
211            mis_marker[i]=IS_REMOVED;
212    
213            for (iptr=A->pattern->ptr[i]-index_offset;iptr<A->pattern->ptr[i+1]-index_offset; ++iptr) {
214                j=A->pattern->index[iptr-index_offset];
215                val=A->val[iptr-index_offset];
216                if(j!= i && val*val>=eps_Aii * diags[j]){
217                    mis_marker[i]=IS_IN_SET;
218                }
219            }
220          }
221       }
222        /* swap to TRUE/FALSE in mis_marker */
223         #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
224         for (i=0;i<n;i++) mis_marker[i]=(mis_marker[i]==IS_IN_SET);
225        
226         MEMFREE(diags);
227  }  }
228    
229    
230  #undef IS_AVAILABLE  #undef IS_AVAILABLE
231  #undef IS_IN_MIS_NOW  #undef IS_IN_SET
232  #undef IS_IN_MIS  #undef IS_REMOVED
 #undef IS_CONNECTED_TO_MIS  

Legend:
Removed from v.1915  
changed lines
  Added in v.1980

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