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revision 1890 by artak, Fri Oct 17 00:14:22 2008 UTC revision 2113 by artak, Mon Dec 1 06:27:14 2008 UTC
# Line 25  Line 25 
25  #include "Paso.h"  #include "Paso.h"
26  #include "Solver.h"  #include "Solver.h"
27  #include "PasoUtil.h"  #include "PasoUtil.h"
28    #include "UMFPACK.h"
29    #include "Pattern_coupling.h"
30    
31  /**************************************************************/  /**************************************************************/
32    
# Line 33  Line 35 
35  void Paso_Solver_AMG_free(Paso_Solver_AMG * in) {  void Paso_Solver_AMG_free(Paso_Solver_AMG * in) {
36       if (in!=NULL) {       if (in!=NULL) {
37          Paso_Solver_AMG_free(in->AMG_of_Schur);          Paso_Solver_AMG_free(in->AMG_of_Schur);
38            Paso_Solver_Jacobi_free(in->GS);
39          MEMFREE(in->inv_A_FF);          MEMFREE(in->inv_A_FF);
40          MEMFREE(in->A_FF_pivot);          MEMFREE(in->A_FF_pivot);
41          Paso_SparseMatrix_free(in->A_FC);          Paso_SparseMatrix_free(in->A_FC);
# Line 74  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 77  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
77    dim_t n_block=A_p->row_block_size;    dim_t n_block=A_p->row_block_size;
78    index_t* mis_marker=NULL;      index_t* mis_marker=NULL;  
79    index_t* counter=NULL;    index_t* counter=NULL;
   double *rs=NULL;    
80    index_t iPtr,*index, *where_p, iPtr_s;    index_t iPtr,*index, *where_p, iPtr_s;
81    dim_t i,k,j,j0;    dim_t i,k,j;
82    Paso_SparseMatrix * schur=NULL;    Paso_SparseMatrix * schur=NULL;
83    Paso_SparseMatrix * schur_withFillIn=NULL;    Paso_SparseMatrix * schur_withFillIn=NULL;
84    schur_withFillIn=MEMALLOC(1,Paso_SparseMatrix);    double time0=0,time1=0,time2=0,S=0;
85      /*Paso_Pattern* test;*/
86        
     
   double A11,A12,A13,A21,A22,A23,A31,A32,A33,D,time0,time1,time2;  
     
   
87    /* identify independend set of rows/columns */    /* identify independend set of rows/columns */
88    mis_marker=TMPMEMALLOC(n,index_t);    mis_marker=TMPMEMALLOC(n,index_t);
89    counter=TMPMEMALLOC(n,index_t);    counter=TMPMEMALLOC(n,index_t);
   rs=TMPMEMALLOC(n,double);  
90    out=MEMALLOC(1,Paso_Solver_AMG);    out=MEMALLOC(1,Paso_Solver_AMG);
91    out->AMG_of_Schur=NULL;    out->AMG_of_Schur=NULL;
92    out->inv_A_FF=NULL;    out->inv_A_FF=NULL;
# Line 103  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 101  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
101    out->b_F=NULL;    out->b_F=NULL;
102    out->x_C=NULL;    out->x_C=NULL;
103    out->b_C=NULL;    out->b_C=NULL;
104      out->GS=NULL;
105    out->A=Paso_SparseMatrix_getReference(A_p);    out->A=Paso_SparseMatrix_getReference(A_p);
106      /*out->GS=Paso_Solver_getGS(A_p,verbose);*/
107      out->GS=Paso_Solver_getJacobi(A_p);
108      /*out->GS->sweeps=2;*/
109    out->level=level;    out->level=level;
110        
  /* fprintf(stderr,"START OF MATRIX \n\n");  
   for (i = 0; i < A_p->numRows; ++i) {  
      for (iPtr=A_p->pattern->ptr[i];iPtr<A_p->pattern->ptr[i + 1]; ++iPtr) {  
        j=A_p->pattern->index[iPtr];  
        fprintf(stderr,"A[%d,%d]=%.2f ",i,j,A_p->val[iPtr]);  
      }  
      fprintf(stderr,"\n");  
    }  
    fprintf(stderr,"END OF MATRIX \n\n");  
  */  
111    if ( !(Paso_checkPtr(mis_marker) || Paso_checkPtr(out) || Paso_checkPtr(counter) ) ) {    if ( !(Paso_checkPtr(mis_marker) || Paso_checkPtr(out) || Paso_checkPtr(counter) ) ) {
112       /* identify independend set of rows/columns */       /* identify independend set of rows/columns */
      time0=Paso_timer();  
113       #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)       #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
114       for (i=0;i<n;++i) mis_marker[i]=-1;       for (i=0;i<n;++i) mis_marker[i]=-1;
115       Paso_Pattern_RS(A_p,mis_marker,0.25);       /*Paso_Pattern_RS(A_p,mis_marker,0.25);*/
116       /*       /*Paso_Pattern_Aggregiation(A_p,mis_marker,0.5);*/
117       for (i=0;i<n;++i) fprintf(stderr," i=%d mis[i]=%d \n",i,mis_marker[i]);       Paso_Pattern_coup(A_p,mis_marker,0.05);
      */  
      time2=Paso_timer()-time0;  
118       if (Paso_noError()) {       if (Paso_noError()) {
119          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
120          for (i = 0; i < n; ++i) counter[i]=mis_marker[i];          for (i = 0; i < n; ++i) counter[i]=mis_marker[i];
# Line 137  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 126  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
126          out->inv_A_FF=MEMALLOC(n_block*n_block*out->n_F,double);          out->inv_A_FF=MEMALLOC(n_block*n_block*out->n_F,double);
127          out->A_FF_pivot=NULL; /* later use for block size>3 */          out->A_FF_pivot=NULL; /* later use for block size>3 */
128          if (! (Paso_checkPtr(out->mask_F) || Paso_checkPtr(out->inv_A_FF) || Paso_checkPtr(out->rows_in_F) ) ) {          if (! (Paso_checkPtr(out->mask_F) || Paso_checkPtr(out->inv_A_FF) || Paso_checkPtr(out->rows_in_F) ) ) {
            #pragma omp parallel  
            {  
129                /* creates an index for F from mask */                /* creates an index for F from mask */
130                #pragma omp for private(i) schedule(static)                #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
131                for (i = 0; i < out->n_F; ++i) out->rows_in_F[i]=-1;                for (i = 0; i < out->n_F; ++i) out->rows_in_F[i]=-1;
132                #pragma omp for private(i) schedule(static)                #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
133                for (i = 0; i < n; ++i) {                for (i = 0; i < n; ++i) {
134                   if  (mis_marker[i]) {                   if  (mis_marker[i]) {
135                          out->rows_in_F[counter[i]]=i;                          out->rows_in_F[counter[i]]=i;
# Line 151  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 138  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
138                          out->mask_F[i]=-1;                          out->mask_F[i]=-1;
139                   }                   }
140                }                }
141                /* Compute row-sum for getting rs(A_FF)*/                
142                #pragma omp for private(i,iPtr) schedule(static)                /* Compute row-sum for getting rs(A_FF)^-1*/
143                  #pragma omp parallel for private(i,iPtr,j) schedule(static)
144                for (i = 0; i < out->n_F; ++i) {                for (i = 0; i < out->n_F; ++i) {
145                  rs[i]=0;                  S=0;
146                  for (iPtr=A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]];iPtr<A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i] + 1]; ++iPtr) {                  for (iPtr=A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]];iPtr<A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i] + 1]; ++iPtr) {
147                   rs[i]+=A_p->val[iPtr];                   j=A_p->pattern->index[iPtr];
148                     if (mis_marker[j])
149                         S+=A_p->val[iPtr];
150                  }                  }
151                    /* This check is to make sure we dont get some nusty rows which were not removed durring coarsing process.*/
152                    /* TODO: we have to mechanism that this does not happend at all, and get rid of this 'If'. */
153                    if (ABS(S)>1.e-10)
154                       out->inv_A_FF[i]=1./S;
155                    else
156                       out->inv_A_FF[i]=1.;
157                }                }
               
               #pragma omp for private(i, where_p,iPtr,A11,A12,A13,A21,A22,A23,A31,A32,A33,D,index) schedule(static)  
               for (i = 0; i < out->n_F; i++) {  
                 /* find main diagonal */  
                 iPtr=A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]];  
                 index=&(A_p->pattern->index[iPtr]);  
                 where_p=(index_t*)bsearch(&out->rows_in_F[i],  
                                         index,  
                                         A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i] + 1]-A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]],  
                                         sizeof(index_t),  
                                         Paso_comparIndex);  
                 if (where_p==NULL) {  
                     Paso_setError(VALUE_ERROR, "Paso_Solver_getAMG: main diagonal element missing.");  
                 } else {  
                     iPtr+=(index_t)(where_p-index);  
                     /* get inverse of A_FF block: */  
                       if (ABS(rs[i])>0.) {  
                             out->inv_A_FF[i]=1./rs[i];  
                       } else {  
                         out->inv_A_FF[i]=0;  
                       }  
                       
                      /* } else {  
                             Paso_setError(ZERO_DIVISION_ERROR, "Paso_Solver_getAMG: Break-down in AMG decomposition: non-regular main diagonal block.");  
                       }*/  
                 }  
               }  
            } /* end parallel region */  
158    
159             if( Paso_noError()) {             if( Paso_noError()) {
160                /* if there are no nodes in the coarse level there is no more work to do */                /* if there are no nodes in the coarse level there is no more work to do */
161                out->n_C=n-out->n_F;                out->n_C=n-out->n_F;
162                 /*if (out->n_C>11) {*/                if (level<3) {
163                 if (level>0) {                 /*if (out->n_F>500) {*/
164                     out->rows_in_C=MEMALLOC(out->n_C,index_t);                     out->rows_in_C=MEMALLOC(out->n_C,index_t);
165                     out->mask_C=MEMALLOC(n,index_t);                     out->mask_C=MEMALLOC(n,index_t);
166                     if (! (Paso_checkPtr(out->mask_C) || Paso_checkPtr(out->rows_in_C) ) ) {                     if (! (Paso_checkPtr(out->mask_C) || Paso_checkPtr(out->rows_in_C) ) ) {
# Line 200  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 168  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
168                         #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)                         #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
169                         for (i = 0; i < n; ++i) counter[i]=! mis_marker[i];                         for (i = 0; i < n; ++i) counter[i]=! mis_marker[i];
170                         Paso_Util_cumsum(n,counter);                         Paso_Util_cumsum(n,counter);
171                         #pragma omp parallel                            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
                        {  
                           #pragma omp for private(i) schedule(static)  
172                            for (i = 0; i < out->n_C; ++i) out->rows_in_C[i]=-1;                            for (i = 0; i < out->n_C; ++i) out->rows_in_C[i]=-1;
173                            #pragma omp for private(i) schedule(static)                            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
174                            for (i = 0; i < n; ++i) {                            for (i = 0; i < n; ++i) {
175                               if  (! mis_marker[i]) {                               if  (! mis_marker[i]) {
176                                  out->rows_in_C[counter[i]]=i;                                  out->rows_in_C[counter[i]]=i;
# Line 213  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 179  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
179                                  out->mask_C[i]=-1;                                  out->mask_C[i]=-1;
180                               }                               }
181                            }                            }
                       } /* end parallel region */  
182                        /* get A_CF block: */                        /* get A_CF block: */
183                        out->A_CF=Paso_SparseMatrix_getSubmatrix(A_p,out->n_C,out->n_F,out->rows_in_C,out->mask_F);                        out->A_CF=Paso_SparseMatrix_getSubmatrix(A_p,out->n_C,out->n_F,out->rows_in_C,out->mask_F);
184                        if (Paso_noError()) {                        if (Paso_noError()) {
# Line 222  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 187  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
187                           /* get A_CC block: */                           /* get A_CC block: */
188                           if (Paso_noError()) {                           if (Paso_noError()) {
189                              schur=Paso_SparseMatrix_getSubmatrix(A_p,out->n_C,out->n_C,out->rows_in_C,out->mask_C);                              schur=Paso_SparseMatrix_getSubmatrix(A_p,out->n_C,out->n_C,out->rows_in_C,out->mask_C);
                               
190                              /*find the pattern of the schur complement with fill in*/                              /*find the pattern of the schur complement with fill in*/
191    
192                              schur_withFillIn=Paso_SparseMatrix_alloc(A_p->type,Paso_Pattern_binop(PATTERN_FORMAT_DEFAULT, schur->pattern, Paso_Pattern_multiply(PATTERN_FORMAT_DEFAULT,out->A_CF->pattern,out->A_FC->pattern)),1,1);                              schur_withFillIn=Paso_SparseMatrix_alloc(A_p->type,Paso_Pattern_binop(PATTERN_FORMAT_DEFAULT, schur->pattern, Paso_Pattern_multiply(PATTERN_FORMAT_DEFAULT,out->A_CF->pattern,out->A_FC->pattern)),1,1);
193                                                            
194                                fprintf(stderr,"Sparsity of Schure: %dx%d LEN %d Percentage %f\n",schur_withFillIn->pattern->numOutput,schur_withFillIn->pattern->numInput,schur_withFillIn->len,schur_withFillIn->len/(1.*schur_withFillIn->pattern->numOutput*schur_withFillIn->pattern->numInput));
195                                
196                              /* copy values over*/                              /* copy values over*/
197                              #pragma omp for private(i,iPtr,iPtr_s,j,j0) schedule(static)                              #pragma omp parallel for private(i,iPtr,j,iPtr_s,index,where_p) schedule(static)
198                              for (i = 0; i < schur_withFillIn->numRows; ++i) {                              for (i = 0; i < schur_withFillIn->numRows; ++i) {
199                                for (iPtr=schur_withFillIn->pattern->ptr[i];iPtr<schur_withFillIn->pattern->ptr[i + 1]; ++iPtr) {                                for (iPtr=schur_withFillIn->pattern->ptr[i];iPtr<schur_withFillIn->pattern->ptr[i + 1]; ++iPtr) {
200                                  j=schur_withFillIn->pattern->index[iPtr];                                  j=schur_withFillIn->pattern->index[iPtr];
201                                    iPtr_s=schur->pattern->ptr[i];
202                                  schur_withFillIn->val[iPtr]=0.;                                  schur_withFillIn->val[iPtr]=0.;
203                                  for (iPtr_s=schur->pattern->ptr[i];iPtr_s<schur->pattern->ptr[i + 1]; ++iPtr_s){                                  index=&(schur->pattern->index[iPtr_s]);
204                                      j0=schur->pattern->index[iPtr_s];                                  where_p=(index_t*)bsearch(&j,
205                                      if (j==j0) {                                          index,
206                                        schur_withFillIn->val[iPtr]=schur->val[iPtr_s];                                          schur->pattern->ptr[i + 1]-schur->pattern->ptr[i],
207                                        break;                                          sizeof(index_t),
208                                      }                                          Paso_comparIndex);
209                                    if (where_p!=NULL) {
210                                        schur_withFillIn->val[iPtr]=schur->val[iPtr_s+(index_t)(where_p-index)];
211                                  }                                  }
212                                }                                }
213                              }                              }
214                                                                
                           /*  for (i = 0; i < schur_withFillIn->numRows; ++i) {  
                               for (iPtr=schur_withFillIn->pattern->ptr[i];iPtr<schur_withFillIn->pattern->ptr[i + 1]; ++iPtr) {  
                                 j=schur_withFillIn->pattern->index[iPtr];  
                                 fprintf(stderr,"A_CC[%d,%d]=%.2f ",i,j,schur_withFillIn->val[iPtr]);  
                               }  
                               fprintf(stderr,"\n");  
                             }*/  
                             time0=Paso_timer()-time0;  
215                              if (Paso_noError()) {                              if (Paso_noError()) {
                                 time1=Paso_timer();  
                                 /* update A_CC block to get Schur complement and then apply AMG to it */  
216                                  Paso_Solver_updateIncompleteSchurComplement(schur_withFillIn,out->A_CF,out->inv_A_FF,out->A_FF_pivot,out->A_FC);                                  Paso_Solver_updateIncompleteSchurComplement(schur_withFillIn,out->A_CF,out->inv_A_FF,out->A_FF_pivot,out->A_FC);
217                                  time1=Paso_timer()-time1;                                  out->AMG_of_Schur=Paso_Solver_getAMG(schur_withFillIn,verbose,level+1);
                                 out->AMG_of_Schur=Paso_Solver_getAMG(schur_withFillIn,verbose,level-1);  
                                   
218                                  Paso_SparseMatrix_free(schur);                                  Paso_SparseMatrix_free(schur);
                                 /* Paso_SparseMatrix_free(schur_withFillIn);*/  
219                              }                              }
220                              /* allocate work arrays for AMG application */                              /* allocate work arrays for AMG application */
221                              if (Paso_noError()) {                              if (Paso_noError()) {
# Line 268  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 225  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
225                                out->b_C=MEMALLOC(n_block*out->n_C,double);                                out->b_C=MEMALLOC(n_block*out->n_C,double);
226    
227                                if (! (Paso_checkPtr(out->x_F) || Paso_checkPtr(out->b_F) || Paso_checkPtr(out->x_C) || Paso_checkPtr(out->b_C) ) ) {                                if (! (Paso_checkPtr(out->x_F) || Paso_checkPtr(out->b_F) || Paso_checkPtr(out->x_C) || Paso_checkPtr(out->b_C) ) ) {
228                                    #pragma omp parallel                                      #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)
                                   {  
                                     #pragma omp for private(i,k) schedule(static)  
229                                      for (i = 0; i < out->n_F; ++i) {                                      for (i = 0; i < out->n_F; ++i) {
230                                            for (k=0; k<n_block;++k) {                                            for (k=0; k<n_block;++k) {
231                                               out->x_F[i*n_block+k]=0.;                                               out->x_F[i*n_block+k]=0.;
232                                               out->b_F[i*n_block+k]=0.;                                               out->b_F[i*n_block+k]=0.;
233                                            }                                            }
234                                      }                                      }
235                                      #pragma omp for private(i,k) schedule(static)                                      #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)
236                                      for (i = 0; i < out->n_C; ++i) {                                      for (i = 0; i < out->n_C; ++i) {
237                                          for (k=0; k<n_block;++k) {                                          for (k=0; k<n_block;++k) {
238                                            out->x_C[i*n_block+k]=0.;                                            out->x_C[i*n_block+k]=0.;
239                                            out->b_C[i*n_block+k]=0.;                                            out->b_C[i*n_block+k]=0.;
240                                          }                                          }
241                                      }                                      }
                                   } /* end parallel region */  
242                                }                                }
243                              }                              }
244                           }                           }
# Line 297  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 251  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
251    }    }
252    TMPMEMFREE(mis_marker);    TMPMEMFREE(mis_marker);
253    TMPMEMFREE(counter);    TMPMEMFREE(counter);
   TMPMEMFREE(rs);  
254    if (Paso_noError()) {    if (Paso_noError()) {
255        if (verbose) {        if (verbose) {
256           printf("AMG: %d unknowns eliminated. %d left.\n",out->n_F,n-out->n_F);           printf("AMG: %d unknowns eliminated. %d left.\n",out->n_F,n-out->n_F);
257           if (out->n_C>0) {           if (level<3) {
258             /*if (out->n_F<500) {*/
259              printf("timing: AMG: MIS/reordering/elemination : %e/%e/%e\n",time2,time0,time1);              printf("timing: AMG: MIS/reordering/elemination : %e/%e/%e\n",time2,time0,time1);
260           } else {           } else {
261              printf("timing: AMG: MIS: %e\n",time2);              printf("timing: AMG: MIS: %e\n",time2);
# Line 339  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 293  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
293  */  */
294    
295  void Paso_Solver_solveAMG(Paso_Solver_AMG * amg, double * x, double * b) {  void Paso_Solver_solveAMG(Paso_Solver_AMG * amg, double * x, double * b) {
296       dim_t i,k;       dim_t i;
      dim_t n_block=amg->n_block;  
297       double *r=MEMALLOC(amg->n,double);       double *r=MEMALLOC(amg->n,double);
298         /*Paso_Solver_GS* GS=NULL;*/
299       double *x0=MEMALLOC(amg->n,double);       double *x0=MEMALLOC(amg->n,double);
300         double time0=0;
301            
302       if (amg->level==0) {       if (amg->level==3) {
303          /* x=invA_FF*b  */       /*if (amg->n_F<=500) {*/
304          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(n_block,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,x,b);        time0=Paso_timer();
305            
306            Paso_Solver_solveJacobi(amg->GS,x,b);
307            
308            /* #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
309            for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];
310            Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);
311            Paso_Solver_solveGS(amg->GS,x0,r);
312            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
313            for (i=0;i<amg->n;++i) {
314             x[i]+=x0[i];
315            }
316            */
317            /*Paso_UMFPACK1(amg->A,x,b,0);*/
318    
319           time0=Paso_timer()-time0;
320           /*fprintf(stderr,"timing: DIRECT SOLVER: %e/\n",time0);*/
321       } else {       } else {
322           fprintf(stdout,"LEVEL %d \n",amg->level);      
323          /* presmoothing on (Shure, x, b, r) */          /* presmoothing */
324          /****************/           Paso_Solver_solveJacobi(amg->GS,x,b);
325           Paso_Solver_GS* GS=MEMALLOC(1,Paso_Solver_GS);           /*
326           GS=Paso_Solver_getGS(amg->A,-1);           #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
327           Paso_Solver_solveGS(GS,x,b);           for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];
328    
329              Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);
330              Paso_Solver_solveGS(amg->GS,x0,r);
331              
332              #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
333              for (i=0;i<amg->n;++i) {
334               x[i]+=x0[i];
335              }
336              */
337            /* end of presmoothing */
338                    
339           #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)           #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
340           for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];           for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];
341                    
342           /*r=b-Ax*/           /*r=b-Ax*/
343           Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);           Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);
344         /****************/                
345          /* b->[b_F,b_C]     */          /* b->[b_F,b_C]     */
346          if (n_block==1) {          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
347             #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)          for (i=0;i<amg->n_F;++i) amg->b_F[i]=r[amg->rows_in_F[i]];
            for (i=0;i<amg->n_F;++i) amg->b_F[i]=r[amg->rows_in_F[i]];    /* was b istead of r */  
           #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n_C;++i) amg->b_C[i]=r[amg->rows_in_C[i]];  
         } else {  
            #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n_F;++i)  
                  for (k=0;k<n_block;k++) amg->b_F[amg->n_block*i+k]=r[n_block*amg->rows_in_F[i]+k];  
            #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n_C;++i)  
                  for (k=0;k<n_block;k++) amg->b_C[amg->n_block*i+k]=r[n_block*amg->rows_in_C[i]+k];  
         }  
   
         /****************/  
         /* Coursening part */  
348                    
349          /* r_F=A_FF^-1*r_F  */          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
350          /*Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(n_block,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->b_F,amg->b_F);          for (i=0;i<amg->n_C;++i) amg->b_C[i]=r[amg->rows_in_C[i]];
         fprintf(stderr,"2\n");  
         */  
         /* r_C=r_C-A_CF*r_F */  
         /*Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_CF,amg->b_F,1.,amg->b_C);  
         fprintf(stderr,"3\n");  
         */  
        /****************/  
351    
           
352          /* x_F=invA_FF*b_F  */          /* x_F=invA_FF*b_F  */
353          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(n_block,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->x_F,amg->b_F);          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(1,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->x_F,amg->b_F);
354                    
355          /* b_C=b_C-A_CF*x_F */          /* b_C=b_C-A_CF*x_F */
356          Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_CF,amg->x_F,1.,amg->b_C);          Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_CF,amg->x_F,1.,amg->b_C);
# Line 402  void Paso_Solver_solveAMG(Paso_Solver_AM Line 361  void Paso_Solver_solveAMG(Paso_Solver_AM
361          /* b_F=b_F-A_FC*x_C */          /* b_F=b_F-A_FC*x_C */
362          Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_FC,amg->x_C,1.,amg->b_F);          Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_FC,amg->x_C,1.,amg->b_F);
363          /* x_F=invA_FF*b_F  */          /* x_F=invA_FF*b_F  */
364          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(n_block,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->x_F,amg->b_F);          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(1,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->x_F,amg->b_F);
365          /* x<-[x_F,x_C]     */          /* x<-[x_F,x_C]     */
366            
367          /* */          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
368                    for (i=0;i<amg->n;++i) {
369                        if (amg->mask_C[i]>-1) {
370          if (n_block==1) {                   x[i]=amg->x_C[amg->mask_C[i]];
371             #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)              } else {
372             for (i=0;i<amg->n;++i) {                   x[i]=amg->x_F[amg->mask_F[i]];
373                if (amg->mask_C[i]>-1) {              }
                   x[i]+=amg->x_C[amg->mask_C[i]];  
               } else {  
                   x[i]+=amg->x_F[amg->mask_F[i]];  
               }  
            }  
         } else {  
            #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n;++i) {  
                  if (amg->mask_C[i]>-1) {  
                      for (k=0;k<n_block;k++) x[n_block*i+k]+=amg->x_C[n_block*amg->mask_C[i]+k];  
                  } else {  
                      for (k=0;k<n_block;k++) x[n_block*i+k]+=amg->x_F[n_block*amg->mask_F[i]+k];  
                  }  
            }  
         }  
         /* all done */  
      /*post smoothing*/  
 /*     Paso_Solver_solveGS(GS,x0,b);  
      if (n_block==1) {  
            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n;++i) x[i]+=x0[i];  
         } else {  
            #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n;++i) {  
                      for (k=0;k<n_block;k++) x[n_block*i+k]+=x0[n_block*i+k];  
            }  
374          }          }
375  */              
376       Paso_Solver_GS_free(GS);       /*postsmoothing*/
377    
378         #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
379         for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];
380        
381         /*r=b-Ax*/
382         Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);
383         Paso_Solver_solveJacobi(amg->GS,x0,r);
384        
385         #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
386         for (i=0;i<amg->n;++i) x[i]+=x0[i];
387        
388        
389         /*#pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
390         for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];
391    
392         Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);
393         Paso_Solver_solveGS(amg->GS,x0,r);
394        
395         #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
396         for (i=0;i<amg->n;++i) {
397          x[i]+=x0[i];
398         }
399         */
400         /*end of postsmoothing*/
401        
402       }       }
      MEMFREE(x0);  
403       MEMFREE(r);       MEMFREE(r);
404       return;       MEMFREE(x0);
405        return;
406  }  }
407    
408  /*  /*

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Removed from v.1890  
changed lines
  Added in v.2113

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