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revision 1890 by artak, Fri Oct 17 00:14:22 2008 UTC revision 2240 by artak, Wed Feb 4 01:17:06 2009 UTC
# Line 25  Line 25 
25  #include "Paso.h"  #include "Paso.h"
26  #include "Solver.h"  #include "Solver.h"
27  #include "PasoUtil.h"  #include "PasoUtil.h"
28    #include "UMFPACK.h"
29    #include "Pattern_coupling.h"
30    
31  /**************************************************************/  /**************************************************************/
32    
# Line 33  Line 35 
35  void Paso_Solver_AMG_free(Paso_Solver_AMG * in) {  void Paso_Solver_AMG_free(Paso_Solver_AMG * in) {
36       if (in!=NULL) {       if (in!=NULL) {
37          Paso_Solver_AMG_free(in->AMG_of_Schur);          Paso_Solver_AMG_free(in->AMG_of_Schur);
38            Paso_Solver_Jacobi_free(in->GS);
39          MEMFREE(in->inv_A_FF);          MEMFREE(in->inv_A_FF);
40          MEMFREE(in->A_FF_pivot);          MEMFREE(in->A_FF_pivot);
41          Paso_SparseMatrix_free(in->A_FC);          Paso_SparseMatrix_free(in->A_FC);
# Line 68  to Line 71  to
71     then AMG is applied to S again until S becomes empty     then AMG is applied to S again until S becomes empty
72    
73  */  */
74  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso_SparseMatrix *A_p,bool_t verbose,dim_t level) {  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso_SparseMatrix *A_p,bool_t verbose,dim_t level, double couplingParam) {
75    Paso_Solver_AMG* out=NULL;    Paso_Solver_AMG* out=NULL;
76    dim_t n=A_p->numRows;    dim_t n=A_p->numRows;
77    dim_t n_block=A_p->row_block_size;    dim_t n_block=A_p->row_block_size;
78    index_t* mis_marker=NULL;      index_t* mis_marker=NULL;  
79    index_t* counter=NULL;    index_t* counter=NULL;
   double *rs=NULL;    
80    index_t iPtr,*index, *where_p, iPtr_s;    index_t iPtr,*index, *where_p, iPtr_s;
81    dim_t i,k,j,j0;    dim_t i,k,j;
82    Paso_SparseMatrix * schur=NULL;    Paso_SparseMatrix * schur=NULL;
83    Paso_SparseMatrix * schur_withFillIn=NULL;    Paso_SparseMatrix * schur_withFillIn=NULL;
84    schur_withFillIn=MEMALLOC(1,Paso_SparseMatrix);    double time0=0,time1=0,time2=0,S=0;
85      /*Paso_Pattern* test;*/
86        
     
   double A11,A12,A13,A21,A22,A23,A31,A32,A33,D,time0,time1,time2;  
     
   
87    /* identify independend set of rows/columns */    /* identify independend set of rows/columns */
88    mis_marker=TMPMEMALLOC(n,index_t);    mis_marker=TMPMEMALLOC(n,index_t);
89    counter=TMPMEMALLOC(n,index_t);    counter=TMPMEMALLOC(n,index_t);
   rs=TMPMEMALLOC(n,double);  
90    out=MEMALLOC(1,Paso_Solver_AMG);    out=MEMALLOC(1,Paso_Solver_AMG);
91    out->AMG_of_Schur=NULL;    out->AMG_of_Schur=NULL;
92    out->inv_A_FF=NULL;    out->inv_A_FF=NULL;
# Line 103  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 101  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
101    out->b_F=NULL;    out->b_F=NULL;
102    out->x_C=NULL;    out->x_C=NULL;
103    out->b_C=NULL;    out->b_C=NULL;
104      out->GS=NULL;
105    out->A=Paso_SparseMatrix_getReference(A_p);    out->A=Paso_SparseMatrix_getReference(A_p);
106      /*out->GS=Paso_Solver_getGS(A_p,verbose);*/
107      out->GS=Paso_Solver_getJacobi(A_p);
108      /*out->GS->sweeps=2;*/
109    out->level=level;    out->level=level;
110        
  /* fprintf(stderr,"START OF MATRIX \n\n");  
   for (i = 0; i < A_p->numRows; ++i) {  
      for (iPtr=A_p->pattern->ptr[i];iPtr<A_p->pattern->ptr[i + 1]; ++iPtr) {  
        j=A_p->pattern->index[iPtr];  
        fprintf(stderr,"A[%d,%d]=%.2f ",i,j,A_p->val[iPtr]);  
      }  
      fprintf(stderr,"\n");  
    }  
    fprintf(stderr,"END OF MATRIX \n\n");  
  */  
111    if ( !(Paso_checkPtr(mis_marker) || Paso_checkPtr(out) || Paso_checkPtr(counter) ) ) {    if ( !(Paso_checkPtr(mis_marker) || Paso_checkPtr(out) || Paso_checkPtr(counter) ) ) {
112       /* identify independend set of rows/columns */       /* identify independend set of rows/columns */
      time0=Paso_timer();  
113       #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)       #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
114       for (i=0;i<n;++i) mis_marker[i]=-1;       for (i=0;i<n;++i) mis_marker[i]=-1;
115       Paso_Pattern_RS(A_p,mis_marker,0.25);       /*Paso_Pattern_RS(A_p,mis_marker,0.25);*/
116       /*       /*Paso_Pattern_Aggregiation(A_p,mis_marker,0.5);*/
117       for (i=0;i<n;++i) fprintf(stderr," i=%d mis[i]=%d \n",i,mis_marker[i]);       Paso_Pattern_coup(A_p,mis_marker,couplingParam);
      */  
      time2=Paso_timer()-time0;  
118       if (Paso_noError()) {       if (Paso_noError()) {
119          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
120          for (i = 0; i < n; ++i) counter[i]=mis_marker[i];          for (i = 0; i < n; ++i) counter[i]=mis_marker[i];
# Line 137  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 126  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
126          out->inv_A_FF=MEMALLOC(n_block*n_block*out->n_F,double);          out->inv_A_FF=MEMALLOC(n_block*n_block*out->n_F,double);
127          out->A_FF_pivot=NULL; /* later use for block size>3 */          out->A_FF_pivot=NULL; /* later use for block size>3 */
128          if (! (Paso_checkPtr(out->mask_F) || Paso_checkPtr(out->inv_A_FF) || Paso_checkPtr(out->rows_in_F) ) ) {          if (! (Paso_checkPtr(out->mask_F) || Paso_checkPtr(out->inv_A_FF) || Paso_checkPtr(out->rows_in_F) ) ) {
            #pragma omp parallel  
            {  
129                /* creates an index for F from mask */                /* creates an index for F from mask */
130                #pragma omp for private(i) schedule(static)                #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
131                for (i = 0; i < out->n_F; ++i) out->rows_in_F[i]=-1;                for (i = 0; i < out->n_F; ++i) out->rows_in_F[i]=-1;
132                #pragma omp for private(i) schedule(static)                #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
133                for (i = 0; i < n; ++i) {                for (i = 0; i < n; ++i) {
134                   if  (mis_marker[i]) {                   if  (mis_marker[i]) {
135                          out->rows_in_F[counter[i]]=i;                          out->rows_in_F[counter[i]]=i;
# Line 151  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 138  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
138                          out->mask_F[i]=-1;                          out->mask_F[i]=-1;
139                   }                   }
140                }                }
141                /* Compute row-sum for getting rs(A_FF)*/                
142                #pragma omp for private(i,iPtr) schedule(static)                /* Compute row-sum for getting rs(A_FF)^-1*/
143                  #pragma omp parallel for private(i,iPtr,j,S) schedule(static)
144                for (i = 0; i < out->n_F; ++i) {                for (i = 0; i < out->n_F; ++i) {
145                  rs[i]=0;                  S=0;
146                  for (iPtr=A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]];iPtr<A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i] + 1]; ++iPtr) {                  for (iPtr=A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]];iPtr<A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i] + 1]; ++iPtr) {
147                   rs[i]+=A_p->val[iPtr];                   j=A_p->pattern->index[iPtr];
148                     if (mis_marker[j])
149                         S+=A_p->val[iPtr];
150                  }                  }
151                       out->inv_A_FF[i]=1./S;
152                }                }
               
               #pragma omp for private(i, where_p,iPtr,A11,A12,A13,A21,A22,A23,A31,A32,A33,D,index) schedule(static)  
               for (i = 0; i < out->n_F; i++) {  
                 /* find main diagonal */  
                 iPtr=A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]];  
                 index=&(A_p->pattern->index[iPtr]);  
                 where_p=(index_t*)bsearch(&out->rows_in_F[i],  
                                         index,  
                                         A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i] + 1]-A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]],  
                                         sizeof(index_t),  
                                         Paso_comparIndex);  
                 if (where_p==NULL) {  
                     Paso_setError(VALUE_ERROR, "Paso_Solver_getAMG: main diagonal element missing.");  
                 } else {  
                     iPtr+=(index_t)(where_p-index);  
                     /* get inverse of A_FF block: */  
                       if (ABS(rs[i])>0.) {  
                             out->inv_A_FF[i]=1./rs[i];  
                       } else {  
                         out->inv_A_FF[i]=0;  
                       }  
                       
                      /* } else {  
                             Paso_setError(ZERO_DIVISION_ERROR, "Paso_Solver_getAMG: Break-down in AMG decomposition: non-regular main diagonal block.");  
                       }*/  
                 }  
               }  
            } /* end parallel region */  
153    
154             if( Paso_noError()) {             if( Paso_noError()) {
155                /* if there are no nodes in the coarse level there is no more work to do */                /* if there are no nodes in the coarse level there is no more work to do */
156                out->n_C=n-out->n_F;                out->n_C=n-out->n_F;
157                 /*if (out->n_C>11) {*/                /*if (level<3) {*/
158                 if (level>0) {                 if (out->n_F>500) {
159                     out->rows_in_C=MEMALLOC(out->n_C,index_t);                     out->rows_in_C=MEMALLOC(out->n_C,index_t);
160                     out->mask_C=MEMALLOC(n,index_t);                     out->mask_C=MEMALLOC(n,index_t);
161                     if (! (Paso_checkPtr(out->mask_C) || Paso_checkPtr(out->rows_in_C) ) ) {                     if (! (Paso_checkPtr(out->mask_C) || Paso_checkPtr(out->rows_in_C) ) ) {
# Line 200  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 163  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
163                         #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)                         #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
164                         for (i = 0; i < n; ++i) counter[i]=! mis_marker[i];                         for (i = 0; i < n; ++i) counter[i]=! mis_marker[i];
165                         Paso_Util_cumsum(n,counter);                         Paso_Util_cumsum(n,counter);
166                         #pragma omp parallel                            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
                        {  
                           #pragma omp for private(i) schedule(static)  
167                            for (i = 0; i < out->n_C; ++i) out->rows_in_C[i]=-1;                            for (i = 0; i < out->n_C; ++i) out->rows_in_C[i]=-1;
168                            #pragma omp for private(i) schedule(static)                            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
169                            for (i = 0; i < n; ++i) {                            for (i = 0; i < n; ++i) {
170                               if  (! mis_marker[i]) {                               if  (! mis_marker[i]) {
171                                  out->rows_in_C[counter[i]]=i;                                  out->rows_in_C[counter[i]]=i;
# Line 213  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 174  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
174                                  out->mask_C[i]=-1;                                  out->mask_C[i]=-1;
175                               }                               }
176                            }                            }
                       } /* end parallel region */  
177                        /* get A_CF block: */                        /* get A_CF block: */
178                        out->A_CF=Paso_SparseMatrix_getSubmatrix(A_p,out->n_C,out->n_F,out->rows_in_C,out->mask_F);                        out->A_CF=Paso_SparseMatrix_getSubmatrix(A_p,out->n_C,out->n_F,out->rows_in_C,out->mask_F);
179                        if (Paso_noError()) {                        if (Paso_noError()) {
# Line 222  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 182  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
182                           /* get A_CC block: */                           /* get A_CC block: */
183                           if (Paso_noError()) {                           if (Paso_noError()) {
184                              schur=Paso_SparseMatrix_getSubmatrix(A_p,out->n_C,out->n_C,out->rows_in_C,out->mask_C);                              schur=Paso_SparseMatrix_getSubmatrix(A_p,out->n_C,out->n_C,out->rows_in_C,out->mask_C);
                               
185                              /*find the pattern of the schur complement with fill in*/                              /*find the pattern of the schur complement with fill in*/
186    
187                              schur_withFillIn=Paso_SparseMatrix_alloc(A_p->type,Paso_Pattern_binop(PATTERN_FORMAT_DEFAULT, schur->pattern, Paso_Pattern_multiply(PATTERN_FORMAT_DEFAULT,out->A_CF->pattern,out->A_FC->pattern)),1,1);                              schur_withFillIn=Paso_SparseMatrix_alloc(A_p->type,Paso_Pattern_binop(PATTERN_FORMAT_DEFAULT, schur->pattern, Paso_Pattern_multiply(PATTERN_FORMAT_DEFAULT,out->A_CF->pattern,out->A_FC->pattern)),1,1);
188                                                            
189                                fprintf(stderr,"Sparsity of Schure: %dx%d LEN %d Percentage %f\n",schur_withFillIn->pattern->numOutput,schur_withFillIn->pattern->numInput,schur_withFillIn->len,schur_withFillIn->len/(1.*schur_withFillIn->pattern->numOutput*schur_withFillIn->pattern->numInput));
190                                
191                              /* copy values over*/                              /* copy values over*/
192                              #pragma omp for private(i,iPtr,iPtr_s,j,j0) schedule(static)                              #pragma omp parallel for private(i,iPtr,j,iPtr_s,index,where_p) schedule(static)
193                              for (i = 0; i < schur_withFillIn->numRows; ++i) {                              for (i = 0; i < schur_withFillIn->numRows; ++i) {
194                                for (iPtr=schur_withFillIn->pattern->ptr[i];iPtr<schur_withFillIn->pattern->ptr[i + 1]; ++iPtr) {                                for (iPtr=schur_withFillIn->pattern->ptr[i];iPtr<schur_withFillIn->pattern->ptr[i + 1]; ++iPtr) {
195                                  j=schur_withFillIn->pattern->index[iPtr];                                  j=schur_withFillIn->pattern->index[iPtr];
196                                    iPtr_s=schur->pattern->ptr[i];
197                                  schur_withFillIn->val[iPtr]=0.;                                  schur_withFillIn->val[iPtr]=0.;
198                                  for (iPtr_s=schur->pattern->ptr[i];iPtr_s<schur->pattern->ptr[i + 1]; ++iPtr_s){                                  index=&(schur->pattern->index[iPtr_s]);
199                                      j0=schur->pattern->index[iPtr_s];                                  where_p=(index_t*)bsearch(&j,
200                                      if (j==j0) {                                          index,
201                                        schur_withFillIn->val[iPtr]=schur->val[iPtr_s];                                          schur->pattern->ptr[i + 1]-schur->pattern->ptr[i],
202                                        break;                                          sizeof(index_t),
203                                      }                                          Paso_comparIndex);
204                                    if (where_p!=NULL) {
205                                        schur_withFillIn->val[iPtr]=schur->val[iPtr_s+(index_t)(where_p-index)];
206                                  }                                  }
207                                }                                }
208                              }                              }
209                                                                
                           /*  for (i = 0; i < schur_withFillIn->numRows; ++i) {  
                               for (iPtr=schur_withFillIn->pattern->ptr[i];iPtr<schur_withFillIn->pattern->ptr[i + 1]; ++iPtr) {  
                                 j=schur_withFillIn->pattern->index[iPtr];  
                                 fprintf(stderr,"A_CC[%d,%d]=%.2f ",i,j,schur_withFillIn->val[iPtr]);  
                               }  
                               fprintf(stderr,"\n");  
                             }*/  
                             time0=Paso_timer()-time0;  
210                              if (Paso_noError()) {                              if (Paso_noError()) {
                                 time1=Paso_timer();  
                                 /* update A_CC block to get Schur complement and then apply AMG to it */  
211                                  Paso_Solver_updateIncompleteSchurComplement(schur_withFillIn,out->A_CF,out->inv_A_FF,out->A_FF_pivot,out->A_FC);                                  Paso_Solver_updateIncompleteSchurComplement(schur_withFillIn,out->A_CF,out->inv_A_FF,out->A_FF_pivot,out->A_FC);
212                                  time1=Paso_timer()-time1;                                  out->AMG_of_Schur=Paso_Solver_getAMG(schur_withFillIn,verbose,level+1,couplingParam);
                                 out->AMG_of_Schur=Paso_Solver_getAMG(schur_withFillIn,verbose,level-1);  
                                   
213                                  Paso_SparseMatrix_free(schur);                                  Paso_SparseMatrix_free(schur);
                                 /* Paso_SparseMatrix_free(schur_withFillIn);*/  
214                              }                              }
215                              /* allocate work arrays for AMG application */                              /* allocate work arrays for AMG application */
216                              if (Paso_noError()) {                              if (Paso_noError()) {
# Line 268  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 220  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
220                                out->b_C=MEMALLOC(n_block*out->n_C,double);                                out->b_C=MEMALLOC(n_block*out->n_C,double);
221    
222                                if (! (Paso_checkPtr(out->x_F) || Paso_checkPtr(out->b_F) || Paso_checkPtr(out->x_C) || Paso_checkPtr(out->b_C) ) ) {                                if (! (Paso_checkPtr(out->x_F) || Paso_checkPtr(out->b_F) || Paso_checkPtr(out->x_C) || Paso_checkPtr(out->b_C) ) ) {
223                                    #pragma omp parallel                                      #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)
                                   {  
                                     #pragma omp for private(i,k) schedule(static)  
224                                      for (i = 0; i < out->n_F; ++i) {                                      for (i = 0; i < out->n_F; ++i) {
225                                            for (k=0; k<n_block;++k) {                                            for (k=0; k<n_block;++k) {
226                                               out->x_F[i*n_block+k]=0.;                                               out->x_F[i*n_block+k]=0.;
227                                               out->b_F[i*n_block+k]=0.;                                               out->b_F[i*n_block+k]=0.;
228                                            }                                            }
229                                      }                                      }
230                                      #pragma omp for private(i,k) schedule(static)                                      #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)
231                                      for (i = 0; i < out->n_C; ++i) {                                      for (i = 0; i < out->n_C; ++i) {
232                                          for (k=0; k<n_block;++k) {                                          for (k=0; k<n_block;++k) {
233                                            out->x_C[i*n_block+k]=0.;                                            out->x_C[i*n_block+k]=0.;
234                                            out->b_C[i*n_block+k]=0.;                                            out->b_C[i*n_block+k]=0.;
235                                          }                                          }
236                                      }                                      }
                                   } /* end parallel region */  
237                                }                                }
238                              }                              }
239                           }                           }
# Line 297  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 246  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
246    }    }
247    TMPMEMFREE(mis_marker);    TMPMEMFREE(mis_marker);
248    TMPMEMFREE(counter);    TMPMEMFREE(counter);
   TMPMEMFREE(rs);  
249    if (Paso_noError()) {    if (Paso_noError()) {
250        if (verbose) {        if (verbose) {
251           printf("AMG: %d unknowns eliminated. %d left.\n",out->n_F,n-out->n_F);           printf("AMG: %d unknowns eliminated. %d left.\n",out->n_F,n-out->n_F);
252           if (out->n_C>0) {           /*if (level<3) {*/
253             if (out->n_F<500) {
254              printf("timing: AMG: MIS/reordering/elemination : %e/%e/%e\n",time2,time0,time1);              printf("timing: AMG: MIS/reordering/elemination : %e/%e/%e\n",time2,time0,time1);
255           } else {           } else {
256              printf("timing: AMG: MIS: %e\n",time2);              printf("timing: AMG: MIS: %e\n",time2);
# Line 339  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 288  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
288  */  */
289    
290  void Paso_Solver_solveAMG(Paso_Solver_AMG * amg, double * x, double * b) {  void Paso_Solver_solveAMG(Paso_Solver_AMG * amg, double * x, double * b) {
291       dim_t i,k;       dim_t i;
      dim_t n_block=amg->n_block;  
292       double *r=MEMALLOC(amg->n,double);       double *r=MEMALLOC(amg->n,double);
293         /*Paso_Solver_GS* GS=NULL;*/
294       double *x0=MEMALLOC(amg->n,double);       double *x0=MEMALLOC(amg->n,double);
295         double time0=0;
296            
297       if (amg->level==0) {       /*if (amg->level==3) {*/
298          /* x=invA_FF*b  */       if (amg->n_F<=500) {
299          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(n_block,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,x,b);        time0=Paso_timer();
300            
301            Paso_Solver_solveJacobi(amg->GS,x,b);
302            
303            /* #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
304            for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];
305            Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);
306            Paso_Solver_solveGS(amg->GS,x0,r);
307            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
308            for (i=0;i<amg->n;++i) {
309             x[i]+=x0[i];
310            }
311            */
312            /*Paso_UMFPACK1(amg->A,x,b,0);*/
313    
314           time0=Paso_timer()-time0;
315           /*fprintf(stderr,"timing: DIRECT SOLVER: %e/\n",time0);*/
316       } else {       } else {
317           fprintf(stdout,"LEVEL %d \n",amg->level);      
318          /* presmoothing on (Shure, x, b, r) */          /* presmoothing */
319          /****************/           Paso_Solver_solveJacobi(amg->GS,x,b);
320           Paso_Solver_GS* GS=MEMALLOC(1,Paso_Solver_GS);           /*
321           GS=Paso_Solver_getGS(amg->A,-1);           #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
322           Paso_Solver_solveGS(GS,x,b);           for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];
323    
324              Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);
325              Paso_Solver_solveGS(amg->GS,x0,r);
326              
327              #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
328              for (i=0;i<amg->n;++i) {
329               x[i]+=x0[i];
330              }
331              */
332            /* end of presmoothing */
333                    
334           #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)           #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
335           for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];           for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];
336                    
337           /*r=b-Ax*/           /*r=b-Ax*/
338           Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);           Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);
339         /****************/                
340          /* b->[b_F,b_C]     */          /* b->[b_F,b_C]     */
341          if (n_block==1) {          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
342             #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)          for (i=0;i<amg->n_F;++i) amg->b_F[i]=r[amg->rows_in_F[i]];
            for (i=0;i<amg->n_F;++i) amg->b_F[i]=r[amg->rows_in_F[i]];    /* was b istead of r */  
           #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n_C;++i) amg->b_C[i]=r[amg->rows_in_C[i]];  
         } else {  
            #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n_F;++i)  
                  for (k=0;k<n_block;k++) amg->b_F[amg->n_block*i+k]=r[n_block*amg->rows_in_F[i]+k];  
            #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n_C;++i)  
                  for (k=0;k<n_block;k++) amg->b_C[amg->n_block*i+k]=r[n_block*amg->rows_in_C[i]+k];  
         }  
   
         /****************/  
         /* Coursening part */  
343                    
344          /* r_F=A_FF^-1*r_F  */          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
345          /*Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(n_block,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->b_F,amg->b_F);          for (i=0;i<amg->n_C;++i) amg->b_C[i]=r[amg->rows_in_C[i]];
         fprintf(stderr,"2\n");  
         */  
         /* r_C=r_C-A_CF*r_F */  
         /*Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_CF,amg->b_F,1.,amg->b_C);  
         fprintf(stderr,"3\n");  
         */  
        /****************/  
346    
           
347          /* x_F=invA_FF*b_F  */          /* x_F=invA_FF*b_F  */
348          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(n_block,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->x_F,amg->b_F);          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(1,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->x_F,amg->b_F);
349                    
350          /* b_C=b_C-A_CF*x_F */          /* b_C=b_C-A_CF*x_F */
351          Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_CF,amg->x_F,1.,amg->b_C);          Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_CF,amg->x_F,1.,amg->b_C);
# Line 402  void Paso_Solver_solveAMG(Paso_Solver_AM Line 356  void Paso_Solver_solveAMG(Paso_Solver_AM
356          /* b_F=b_F-A_FC*x_C */          /* b_F=b_F-A_FC*x_C */
357          Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_FC,amg->x_C,1.,amg->b_F);          Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_FC,amg->x_C,1.,amg->b_F);
358          /* x_F=invA_FF*b_F  */          /* x_F=invA_FF*b_F  */
359          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(n_block,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->x_F,amg->b_F);          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(1,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->x_F,amg->b_F);
360          /* x<-[x_F,x_C]     */          /* x<-[x_F,x_C]     */
361            
362          /* */          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
363                    for (i=0;i<amg->n;++i) {
364                        if (amg->mask_C[i]>-1) {
365          if (n_block==1) {                   x[i]=amg->x_C[amg->mask_C[i]];
366             #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)              } else {
367             for (i=0;i<amg->n;++i) {                   x[i]=amg->x_F[amg->mask_F[i]];
368                if (amg->mask_C[i]>-1) {              }
                   x[i]+=amg->x_C[amg->mask_C[i]];  
               } else {  
                   x[i]+=amg->x_F[amg->mask_F[i]];  
               }  
            }  
         } else {  
            #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n;++i) {  
                  if (amg->mask_C[i]>-1) {  
                      for (k=0;k<n_block;k++) x[n_block*i+k]+=amg->x_C[n_block*amg->mask_C[i]+k];  
                  } else {  
                      for (k=0;k<n_block;k++) x[n_block*i+k]+=amg->x_F[n_block*amg->mask_F[i]+k];  
                  }  
            }  
         }  
         /* all done */  
      /*post smoothing*/  
 /*     Paso_Solver_solveGS(GS,x0,b);  
      if (n_block==1) {  
            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n;++i) x[i]+=x0[i];  
         } else {  
            #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n;++i) {  
                      for (k=0;k<n_block;k++) x[n_block*i+k]+=x0[n_block*i+k];  
            }  
369          }          }
370  */              
371       Paso_Solver_GS_free(GS);       /*postsmoothing*/
372    
373         #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
374         for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];
375        
376         /*r=b-Ax*/
377         Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);
378         Paso_Solver_solveJacobi(amg->GS,x0,r);
379        
380         #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
381         for (i=0;i<amg->n;++i) x[i]+=x0[i];
382        
383        
384         /*#pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
385         for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];
386    
387         Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);
388         Paso_Solver_solveGS(amg->GS,x0,r);
389        
390         #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
391         for (i=0;i<amg->n;++i) {
392          x[i]+=x0[i];
393         }
394         */
395         /*end of postsmoothing*/
396        
397       }       }
      MEMFREE(x0);  
398       MEMFREE(r);       MEMFREE(r);
399       return;       MEMFREE(x0);
400        return;
401  }  }
402    
403  /*  /*

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changed lines
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