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revision 1890 by artak, Fri Oct 17 00:14:22 2008 UTC revision 2439 by artak, Tue May 26 04:34:21 2009 UTC
# Line 25  Line 25 
25  #include "Paso.h"  #include "Paso.h"
26  #include "Solver.h"  #include "Solver.h"
27  #include "PasoUtil.h"  #include "PasoUtil.h"
28    #include "UMFPACK.h"
29    #include "Pattern_coupling.h"
30    
31  /**************************************************************/  /**************************************************************/
32    
# Line 33  Line 35 
35  void Paso_Solver_AMG_free(Paso_Solver_AMG * in) {  void Paso_Solver_AMG_free(Paso_Solver_AMG * in) {
36       if (in!=NULL) {       if (in!=NULL) {
37          Paso_Solver_AMG_free(in->AMG_of_Schur);          Paso_Solver_AMG_free(in->AMG_of_Schur);
38            Paso_Solver_Jacobi_free(in->GS);
39          MEMFREE(in->inv_A_FF);          MEMFREE(in->inv_A_FF);
40          MEMFREE(in->A_FF_pivot);          MEMFREE(in->A_FF_pivot);
41          Paso_SparseMatrix_free(in->A_FC);          Paso_SparseMatrix_free(in->A_FC);
# Line 68  to Line 71  to
71     then AMG is applied to S again until S becomes empty     then AMG is applied to S again until S becomes empty
72    
73  */  */
74  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso_SparseMatrix *A_p,bool_t verbose,dim_t level) {  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso_SparseMatrix *A_p,bool_t verbose,dim_t level, double couplingParam) {
75    Paso_Solver_AMG* out=NULL;    Paso_Solver_AMG* out=NULL;
76    dim_t n=A_p->numRows;    dim_t n=A_p->numRows;
77    dim_t n_block=A_p->row_block_size;    dim_t n_block=A_p->row_block_size;
78    index_t* mis_marker=NULL;      index_t* mis_marker=NULL;  
79    index_t* counter=NULL;    index_t* counter=NULL;
   double *rs=NULL;    
80    index_t iPtr,*index, *where_p, iPtr_s;    index_t iPtr,*index, *where_p, iPtr_s;
81    dim_t i,k,j,j0;    dim_t i,k,j;
82    Paso_SparseMatrix * schur=NULL;    Paso_SparseMatrix * schur=NULL;
83    Paso_SparseMatrix * schur_withFillIn=NULL;    Paso_SparseMatrix * schur_withFillIn=NULL;
84    schur_withFillIn=MEMALLOC(1,Paso_SparseMatrix);    double S=0;
85        
86      /*Make sure we have block sizes 1*/
87      A_p->pattern->input_block_size=A_p->col_block_size;
88      A_p->pattern->output_block_size=A_p->row_block_size;
89      A_p->pattern->block_size=A_p->block_size;
90        
   double A11,A12,A13,A21,A22,A23,A31,A32,A33,D,time0,time1,time2;  
     
   
91    /* identify independend set of rows/columns */    /* identify independend set of rows/columns */
92    mis_marker=TMPMEMALLOC(n,index_t);    mis_marker=TMPMEMALLOC(n,index_t);
93    counter=TMPMEMALLOC(n,index_t);    counter=TMPMEMALLOC(n,index_t);
   rs=TMPMEMALLOC(n,double);  
94    out=MEMALLOC(1,Paso_Solver_AMG);    out=MEMALLOC(1,Paso_Solver_AMG);
95    out->AMG_of_Schur=NULL;    out->AMG_of_Schur=NULL;
96    out->inv_A_FF=NULL;    out->inv_A_FF=NULL;
# Line 103  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 105  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
105    out->b_F=NULL;    out->b_F=NULL;
106    out->x_C=NULL;    out->x_C=NULL;
107    out->b_C=NULL;    out->b_C=NULL;
108      out->GS=NULL;
109    out->A=Paso_SparseMatrix_getReference(A_p);    out->A=Paso_SparseMatrix_getReference(A_p);
110      /*out->GS=Paso_Solver_getGS(A_p,verbose);*/
111      out->GS=Paso_Solver_getJacobi(A_p);
112      /*out->GS->sweeps=2;*/
113    out->level=level;    out->level=level;
114        
  /* fprintf(stderr,"START OF MATRIX \n\n");  
   for (i = 0; i < A_p->numRows; ++i) {  
      for (iPtr=A_p->pattern->ptr[i];iPtr<A_p->pattern->ptr[i + 1]; ++iPtr) {  
        j=A_p->pattern->index[iPtr];  
        fprintf(stderr,"A[%d,%d]=%.2f ",i,j,A_p->val[iPtr]);  
      }  
      fprintf(stderr,"\n");  
    }  
    fprintf(stderr,"END OF MATRIX \n\n");  
  */  
115    if ( !(Paso_checkPtr(mis_marker) || Paso_checkPtr(out) || Paso_checkPtr(counter) ) ) {    if ( !(Paso_checkPtr(mis_marker) || Paso_checkPtr(out) || Paso_checkPtr(counter) ) ) {
116       /* identify independend set of rows/columns */       /* identify independend set of rows/columns */
      time0=Paso_timer();  
117       #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)       #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
118       for (i=0;i<n;++i) mis_marker[i]=-1;       for (i=0;i<n;++i) mis_marker[i]=-1;
119       Paso_Pattern_RS(A_p,mis_marker,0.25);       Paso_Pattern_coup(A_p,mis_marker,couplingParam);
120       /*      /*Paso_Pattern_RS(A_p,mis_marker,couplingParam);*/
121       for (i=0;i<n;++i) fprintf(stderr," i=%d mis[i]=%d \n",i,mis_marker[i]);       /*Paso_Pattern_Aggregiation(A_p,mis_marker,couplingParam);*/
      */  
      time2=Paso_timer()-time0;  
122       if (Paso_noError()) {       if (Paso_noError()) {
123          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
124          for (i = 0; i < n; ++i) counter[i]=mis_marker[i];          for (i = 0; i < n; ++i) counter[i]=mis_marker[i];
# Line 137  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 130  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
130          out->inv_A_FF=MEMALLOC(n_block*n_block*out->n_F,double);          out->inv_A_FF=MEMALLOC(n_block*n_block*out->n_F,double);
131          out->A_FF_pivot=NULL; /* later use for block size>3 */          out->A_FF_pivot=NULL; /* later use for block size>3 */
132          if (! (Paso_checkPtr(out->mask_F) || Paso_checkPtr(out->inv_A_FF) || Paso_checkPtr(out->rows_in_F) ) ) {          if (! (Paso_checkPtr(out->mask_F) || Paso_checkPtr(out->inv_A_FF) || Paso_checkPtr(out->rows_in_F) ) ) {
            #pragma omp parallel  
            {  
133                /* creates an index for F from mask */                /* creates an index for F from mask */
134                #pragma omp for private(i) schedule(static)                #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
135                for (i = 0; i < out->n_F; ++i) out->rows_in_F[i]=-1;                for (i = 0; i < out->n_F; ++i) out->rows_in_F[i]=-1;
136                #pragma omp for private(i) schedule(static)                #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
137                for (i = 0; i < n; ++i) {                for (i = 0; i < n; ++i) {
138                   if  (mis_marker[i]) {                   if  (mis_marker[i]) {
139                          out->rows_in_F[counter[i]]=i;                          out->rows_in_F[counter[i]]=i;
# Line 151  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 142  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
142                          out->mask_F[i]=-1;                          out->mask_F[i]=-1;
143                   }                   }
144                }                }
145                /* Compute row-sum for getting rs(A_FF)*/                
146                #pragma omp for private(i,iPtr) schedule(static)                /* Compute row-sum for getting rs(A_FF)^-1*/
147                  #pragma omp parallel for private(i,iPtr,j,S) schedule(static)
148                for (i = 0; i < out->n_F; ++i) {                for (i = 0; i < out->n_F; ++i) {
149                  rs[i]=0;                  S=0;
150                  for (iPtr=A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]];iPtr<A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i] + 1]; ++iPtr) {                  for (iPtr=A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]];iPtr<A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i] + 1]; ++iPtr) {
151                   rs[i]+=A_p->val[iPtr];                   j=A_p->pattern->index[iPtr];
152                     if (mis_marker[j])
153                         S+=A_p->val[iPtr];
154                  }                  }
155                       out->inv_A_FF[i]=1./S;
156                }                }
               
               #pragma omp for private(i, where_p,iPtr,A11,A12,A13,A21,A22,A23,A31,A32,A33,D,index) schedule(static)  
               for (i = 0; i < out->n_F; i++) {  
                 /* find main diagonal */  
                 iPtr=A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]];  
                 index=&(A_p->pattern->index[iPtr]);  
                 where_p=(index_t*)bsearch(&out->rows_in_F[i],  
                                         index,  
                                         A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i] + 1]-A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]],  
                                         sizeof(index_t),  
                                         Paso_comparIndex);  
                 if (where_p==NULL) {  
                     Paso_setError(VALUE_ERROR, "Paso_Solver_getAMG: main diagonal element missing.");  
                 } else {  
                     iPtr+=(index_t)(where_p-index);  
                     /* get inverse of A_FF block: */  
                       if (ABS(rs[i])>0.) {  
                             out->inv_A_FF[i]=1./rs[i];  
                       } else {  
                         out->inv_A_FF[i]=0;  
                       }  
                       
                      /* } else {  
                             Paso_setError(ZERO_DIVISION_ERROR, "Paso_Solver_getAMG: Break-down in AMG decomposition: non-regular main diagonal block.");  
                       }*/  
                 }  
               }  
            } /* end parallel region */  
157    
158             if( Paso_noError()) {             if( Paso_noError()) {
159                /* if there are no nodes in the coarse level there is no more work to do */                /* if there are no nodes in the coarse level there is no more work to do */
160                out->n_C=n-out->n_F;                out->n_C=n-out->n_F;
161                 /*if (out->n_C>11) {*/                if (level>0 && out->n_C>500) {
162                 if (level>0) {                 /*if (out->n_F>500) {*/
163                     out->rows_in_C=MEMALLOC(out->n_C,index_t);                     out->rows_in_C=MEMALLOC(out->n_C,index_t);
164                     out->mask_C=MEMALLOC(n,index_t);                     out->mask_C=MEMALLOC(n,index_t);
165                     if (! (Paso_checkPtr(out->mask_C) || Paso_checkPtr(out->rows_in_C) ) ) {                     if (! (Paso_checkPtr(out->mask_C) || Paso_checkPtr(out->rows_in_C) ) ) {
# Line 200  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 167  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
167                         #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)                         #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
168                         for (i = 0; i < n; ++i) counter[i]=! mis_marker[i];                         for (i = 0; i < n; ++i) counter[i]=! mis_marker[i];
169                         Paso_Util_cumsum(n,counter);                         Paso_Util_cumsum(n,counter);
170                         #pragma omp parallel                            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
                        {  
                           #pragma omp for private(i) schedule(static)  
171                            for (i = 0; i < out->n_C; ++i) out->rows_in_C[i]=-1;                            for (i = 0; i < out->n_C; ++i) out->rows_in_C[i]=-1;
172                            #pragma omp for private(i) schedule(static)                            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
173                            for (i = 0; i < n; ++i) {                            for (i = 0; i < n; ++i) {
174                               if  (! mis_marker[i]) {                               if  (! mis_marker[i]) {
175                                  out->rows_in_C[counter[i]]=i;                                  out->rows_in_C[counter[i]]=i;
# Line 213  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 178  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
178                                  out->mask_C[i]=-1;                                  out->mask_C[i]=-1;
179                               }                               }
180                            }                            }
                       } /* end parallel region */  
181                        /* get A_CF block: */                        /* get A_CF block: */
182                        out->A_CF=Paso_SparseMatrix_getSubmatrix(A_p,out->n_C,out->n_F,out->rows_in_C,out->mask_F);                        out->A_CF=Paso_SparseMatrix_getSubmatrix(A_p,out->n_C,out->n_F,out->rows_in_C,out->mask_F);
183                        if (Paso_noError()) {                        if (Paso_noError()) {
# Line 222  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 186  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
186                           /* get A_CC block: */                           /* get A_CC block: */
187                           if (Paso_noError()) {                           if (Paso_noError()) {
188                              schur=Paso_SparseMatrix_getSubmatrix(A_p,out->n_C,out->n_C,out->rows_in_C,out->mask_C);                              schur=Paso_SparseMatrix_getSubmatrix(A_p,out->n_C,out->n_C,out->rows_in_C,out->mask_C);
                               
189                              /*find the pattern of the schur complement with fill in*/                              /*find the pattern of the schur complement with fill in*/
190    
191                              schur_withFillIn=Paso_SparseMatrix_alloc(A_p->type,Paso_Pattern_binop(PATTERN_FORMAT_DEFAULT, schur->pattern, Paso_Pattern_multiply(PATTERN_FORMAT_DEFAULT,out->A_CF->pattern,out->A_FC->pattern)),1,1);                              schur_withFillIn=Paso_SparseMatrix_alloc(A_p->type,Paso_Pattern_binop(PATTERN_FORMAT_DEFAULT, schur->pattern, Paso_Pattern_multiply(PATTERN_FORMAT_DEFAULT,out->A_CF->pattern,out->A_FC->pattern)),1,1);
192                                                            
193                                /*fprintf(stderr,"Sparsity of Schure: %dx%d LEN %d Percentage %f\n",schur_withFillIn->pattern->numOutput,schur_withFillIn->pattern->numInput,schur_withFillIn->len,schur_withFillIn->len/(1.*schur_withFillIn->pattern->numOutput*schur_withFillIn->pattern->numInput));*/
194                                
195                              /* copy values over*/                              /* copy values over*/
196                              #pragma omp for private(i,iPtr,iPtr_s,j,j0) schedule(static)                              #pragma omp parallel for private(i,iPtr,j,iPtr_s,index,where_p) schedule(static)
197                              for (i = 0; i < schur_withFillIn->numRows; ++i) {                              for (i = 0; i < schur_withFillIn->numRows; ++i) {
198                                for (iPtr=schur_withFillIn->pattern->ptr[i];iPtr<schur_withFillIn->pattern->ptr[i + 1]; ++iPtr) {                                for (iPtr=schur_withFillIn->pattern->ptr[i];iPtr<schur_withFillIn->pattern->ptr[i + 1]; ++iPtr) {
199                                  j=schur_withFillIn->pattern->index[iPtr];                                  j=schur_withFillIn->pattern->index[iPtr];
200                                    iPtr_s=schur->pattern->ptr[i];
201                                  schur_withFillIn->val[iPtr]=0.;                                  schur_withFillIn->val[iPtr]=0.;
202                                  for (iPtr_s=schur->pattern->ptr[i];iPtr_s<schur->pattern->ptr[i + 1]; ++iPtr_s){                                  index=&(schur->pattern->index[iPtr_s]);
203                                      j0=schur->pattern->index[iPtr_s];                                  where_p=(index_t*)bsearch(&j,
204                                      if (j==j0) {                                          index,
205                                        schur_withFillIn->val[iPtr]=schur->val[iPtr_s];                                          schur->pattern->ptr[i + 1]-schur->pattern->ptr[i],
206                                        break;                                          sizeof(index_t),
207                                      }                                          Paso_comparIndex);
208                                    if (where_p!=NULL) {
209                                        schur_withFillIn->val[iPtr]=schur->val[iPtr_s+(index_t)(where_p-index)];
210                                  }                                  }
211                                }                                }
212                              }                              }
213                                                                
                           /*  for (i = 0; i < schur_withFillIn->numRows; ++i) {  
                               for (iPtr=schur_withFillIn->pattern->ptr[i];iPtr<schur_withFillIn->pattern->ptr[i + 1]; ++iPtr) {  
                                 j=schur_withFillIn->pattern->index[iPtr];  
                                 fprintf(stderr,"A_CC[%d,%d]=%.2f ",i,j,schur_withFillIn->val[iPtr]);  
                               }  
                               fprintf(stderr,"\n");  
                             }*/  
                             time0=Paso_timer()-time0;  
214                              if (Paso_noError()) {                              if (Paso_noError()) {
                                 time1=Paso_timer();  
                                 /* update A_CC block to get Schur complement and then apply AMG to it */  
215                                  Paso_Solver_updateIncompleteSchurComplement(schur_withFillIn,out->A_CF,out->inv_A_FF,out->A_FF_pivot,out->A_FC);                                  Paso_Solver_updateIncompleteSchurComplement(schur_withFillIn,out->A_CF,out->inv_A_FF,out->A_FF_pivot,out->A_FC);
216                                  time1=Paso_timer()-time1;                                  out->AMG_of_Schur=Paso_Solver_getAMG(schur_withFillIn,verbose,level-1,couplingParam);
                                 out->AMG_of_Schur=Paso_Solver_getAMG(schur_withFillIn,verbose,level-1);  
                                   
217                                  Paso_SparseMatrix_free(schur);                                  Paso_SparseMatrix_free(schur);
                                 /* Paso_SparseMatrix_free(schur_withFillIn);*/  
218                              }                              }
219                              /* allocate work arrays for AMG application */                              /* allocate work arrays for AMG application */
220                              if (Paso_noError()) {                              if (Paso_noError()) {
# Line 268  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 224  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
224                                out->b_C=MEMALLOC(n_block*out->n_C,double);                                out->b_C=MEMALLOC(n_block*out->n_C,double);
225    
226                                if (! (Paso_checkPtr(out->x_F) || Paso_checkPtr(out->b_F) || Paso_checkPtr(out->x_C) || Paso_checkPtr(out->b_C) ) ) {                                if (! (Paso_checkPtr(out->x_F) || Paso_checkPtr(out->b_F) || Paso_checkPtr(out->x_C) || Paso_checkPtr(out->b_C) ) ) {
227                                    #pragma omp parallel                                      #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)
                                   {  
                                     #pragma omp for private(i,k) schedule(static)  
228                                      for (i = 0; i < out->n_F; ++i) {                                      for (i = 0; i < out->n_F; ++i) {
229                                            for (k=0; k<n_block;++k) {                                            for (k=0; k<n_block;++k) {
230                                               out->x_F[i*n_block+k]=0.;                                               out->x_F[i*n_block+k]=0.;
231                                               out->b_F[i*n_block+k]=0.;                                               out->b_F[i*n_block+k]=0.;
232                                            }                                            }
233                                      }                                      }
234                                      #pragma omp for private(i,k) schedule(static)                                      #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)
235                                      for (i = 0; i < out->n_C; ++i) {                                      for (i = 0; i < out->n_C; ++i) {
236                                          for (k=0; k<n_block;++k) {                                          for (k=0; k<n_block;++k) {
237                                            out->x_C[i*n_block+k]=0.;                                            out->x_C[i*n_block+k]=0.;
238                                            out->b_C[i*n_block+k]=0.;                                            out->b_C[i*n_block+k]=0.;
239                                          }                                          }
240                                      }                                      }
                                   } /* end parallel region */  
241                                }                                }
242                              }                              }
243                           }                           }
# Line 297  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 250  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
250    }    }
251    TMPMEMFREE(mis_marker);    TMPMEMFREE(mis_marker);
252    TMPMEMFREE(counter);    TMPMEMFREE(counter);
   TMPMEMFREE(rs);  
253    if (Paso_noError()) {    if (Paso_noError()) {
254        if (verbose) {        if (verbose) {
255           printf("AMG: %d unknowns eliminated. %d left.\n",out->n_F,n-out->n_F);           printf("AMG: %d unknowns eliminated. %d left.\n",out->n_F,n-out->n_F);
256           if (out->n_C>0) {           /*if (level>0 && out->n_F>500) {*/
257              printf("timing: AMG: MIS/reordering/elemination : %e/%e/%e\n",time2,time0,time1);          /* if (out->n_F<500) {*/
258            /*   printf("timing: AMG: MIS/reordering/elemination : %e/%e\n",time0,time1);
259           } else {           } else {
260              printf("timing: AMG: MIS: %e\n",time2);              printf("timing: AMG: MIS: %e\n",time2);
261           }           }*/
262       }       }
263       return out;       return out;
264    } else  {    } else  {
# Line 320  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 273  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
273    
274       in fact it solves       in fact it solves
275    
276    [      I         0  ]  [ A_FF 0 ] [ I    invA_FF*A_FF ]  [ x_F ]  = [b_F]    [      I         0  ]  [ A_FF 0 ] [ I    invA_FF*A_FC ]  [ x_F ]  = [b_F]
277    [ A_CF*invA_FF   I  ]  [   0  S ] [ 0          I      ]  [ x_C ]  = [b_C]    [ A_CF*invA_FF   I  ]  [   0  S ] [ 0          I      ]  [ x_C ]  = [b_C]
278    
279   in the form   in the form
# Line 339  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 292  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
292  */  */
293    
294  void Paso_Solver_solveAMG(Paso_Solver_AMG * amg, double * x, double * b) {  void Paso_Solver_solveAMG(Paso_Solver_AMG * amg, double * x, double * b) {
295       dim_t i,k;       dim_t i;
      dim_t n_block=amg->n_block;  
296       double *r=MEMALLOC(amg->n,double);       double *r=MEMALLOC(amg->n,double);
297       double *x0=MEMALLOC(amg->n,double);       double *x0=MEMALLOC(amg->n,double);
298         /*double time0=0;*/
299            
300       if (amg->level==0) {       if (amg->level==0  || amg->n_C<=500) {
301          /* x=invA_FF*b  */       /*if (amg->n_F<=500) {*/
302          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(n_block,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,x,b);        /*time0=Paso_timer();*/
303            
304            Paso_Solver_solveJacobi(amg->GS,x,b);
305            
306            /* #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
307            for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];
308            Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);
309            Paso_Solver_solveGS(amg->GS,x0,r);
310            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
311            for (i=0;i<amg->n;++i) {
312             x[i]+=x0[i];
313            }
314            */
315            /*Paso_UMFPACK1(amg->A,x,b,0);*/
316            
317           /*time0=Paso_timer()-time0;
318           fprintf(stderr,"timing: DIRECT SOLVER: %e/\n",time0);*/
319       } else {       } else {
320           fprintf(stdout,"LEVEL %d \n",amg->level);          /* presmoothing */
321          /* presmoothing on (Shure, x, b, r) */           Paso_Solver_solveJacobi(amg->GS,x,b);
322          /****************/           /*
323           Paso_Solver_GS* GS=MEMALLOC(1,Paso_Solver_GS);           #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
324           GS=Paso_Solver_getGS(amg->A,-1);           for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];
325           Paso_Solver_solveGS(GS,x,b);  
326              Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);
327              Paso_Solver_solveGS(amg->GS,x0,r);
328              
329              #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
330              for (i=0;i<amg->n;++i) {
331               x[i]+=x0[i];
332              }
333              */
334            /* end of presmoothing */
335                    
336           #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)           #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
337           for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];           for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];
338                    
339           /*r=b-Ax*/           /*r=b-Ax*/
340           Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);           Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);
341         /****************/                
342          /* b->[b_F,b_C]     */          /* b->[b_F,b_C]     */
343          if (n_block==1) {          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
344             #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)          for (i=0;i<amg->n_F;++i) amg->b_F[i]=r[amg->rows_in_F[i]];
            for (i=0;i<amg->n_F;++i) amg->b_F[i]=r[amg->rows_in_F[i]];    /* was b istead of r */  
           #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n_C;++i) amg->b_C[i]=r[amg->rows_in_C[i]];  
         } else {  
            #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n_F;++i)  
                  for (k=0;k<n_block;k++) amg->b_F[amg->n_block*i+k]=r[n_block*amg->rows_in_F[i]+k];  
            #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n_C;++i)  
                  for (k=0;k<n_block;k++) amg->b_C[amg->n_block*i+k]=r[n_block*amg->rows_in_C[i]+k];  
         }  
   
         /****************/  
         /* Coursening part */  
345                    
346          /* r_F=A_FF^-1*r_F  */          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
347          /*Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(n_block,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->b_F,amg->b_F);          for (i=0;i<amg->n_C;++i) amg->b_C[i]=r[amg->rows_in_C[i]];
         fprintf(stderr,"2\n");  
         */  
         /* r_C=r_C-A_CF*r_F */  
         /*Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_CF,amg->b_F,1.,amg->b_C);  
         fprintf(stderr,"3\n");  
         */  
        /****************/  
348    
           
349          /* x_F=invA_FF*b_F  */          /* x_F=invA_FF*b_F  */
350          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(n_block,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->x_F,amg->b_F);          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(1,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->x_F,amg->b_F);
351                    
352          /* b_C=b_C-A_CF*x_F */          /* b_C=b_C-A_CF*x_F */
353          Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_CF,amg->x_F,1.,amg->b_C);          Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_CF,amg->x_F,1.,amg->b_C);
# Line 402  void Paso_Solver_solveAMG(Paso_Solver_AM Line 358  void Paso_Solver_solveAMG(Paso_Solver_AM
358          /* b_F=b_F-A_FC*x_C */          /* b_F=b_F-A_FC*x_C */
359          Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_FC,amg->x_C,1.,amg->b_F);          Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_FC,amg->x_C,1.,amg->b_F);
360          /* x_F=invA_FF*b_F  */          /* x_F=invA_FF*b_F  */
361          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(n_block,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->x_F,amg->b_F);          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(1,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->x_F,amg->b_F);
362          /* x<-[x_F,x_C]     */          /* x<-[x_F,x_C]     */
363            
364          /* */          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
365                    for (i=0;i<amg->n;++i) {
366                        if (amg->mask_C[i]>-1) {
367          if (n_block==1) {                   x[i]=amg->x_C[amg->mask_C[i]];
368             #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)              } else {
369             for (i=0;i<amg->n;++i) {                   x[i]=amg->x_F[amg->mask_F[i]];
370                if (amg->mask_C[i]>-1) {              }
                   x[i]+=amg->x_C[amg->mask_C[i]];  
               } else {  
                   x[i]+=amg->x_F[amg->mask_F[i]];  
               }  
            }  
         } else {  
            #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n;++i) {  
                  if (amg->mask_C[i]>-1) {  
                      for (k=0;k<n_block;k++) x[n_block*i+k]+=amg->x_C[n_block*amg->mask_C[i]+k];  
                  } else {  
                      for (k=0;k<n_block;k++) x[n_block*i+k]+=amg->x_F[n_block*amg->mask_F[i]+k];  
                  }  
            }  
         }  
         /* all done */  
      /*post smoothing*/  
 /*     Paso_Solver_solveGS(GS,x0,b);  
      if (n_block==1) {  
            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n;++i) x[i]+=x0[i];  
         } else {  
            #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n;++i) {  
                      for (k=0;k<n_block;k++) x[n_block*i+k]+=x0[n_block*i+k];  
            }  
371          }          }
372  */              
373       Paso_Solver_GS_free(GS);       /*postsmoothing*/
374    
375         #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
376         for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];
377        
378         /*r=b-Ax*/
379         Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);
380         Paso_Solver_solveJacobi(amg->GS,x0,r);
381        
382         #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
383         for (i=0;i<amg->n;++i) x[i]+=x0[i];
384        
385        
386         /*#pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
387         for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];
388    
389         Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);
390         Paso_Solver_solveGS(amg->GS,x0,r);
391        
392         #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
393         for (i=0;i<amg->n;++i) {
394          x[i]+=x0[i];
395         }
396         */
397         /*end of postsmoothing*/
398        
399       }       }
      MEMFREE(x0);  
400       MEMFREE(r);       MEMFREE(r);
401       return;       MEMFREE(x0);
402        return;
403  }  }
404    
405  /*  /*

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changed lines
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