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revision 1890 by artak, Fri Oct 17 00:14:22 2008 UTC revision 2509 by artak, Thu Jul 2 04:51:51 2009 UTC
# Line 14  Line 14 
14    
15  /**************************************************************/  /**************************************************************/
16    
17  /* Paso: AMG preconditioner with reordering                 */  /* Paso: AMG preconditioner                                  */
18    
19  /**************************************************************/  /**************************************************************/
20    
# Line 24  Line 24 
24    
25  #include "Paso.h"  #include "Paso.h"
26  #include "Solver.h"  #include "Solver.h"
27    #include "Options.h"
28  #include "PasoUtil.h"  #include "PasoUtil.h"
29    #include "UMFPACK.h"
30    #include "MKL.h"
31    #include "SystemMatrix.h"
32    #include "Pattern_coupling.h"
33    
34  /**************************************************************/  /**************************************************************/
35    
# Line 33  Line 38 
38  void Paso_Solver_AMG_free(Paso_Solver_AMG * in) {  void Paso_Solver_AMG_free(Paso_Solver_AMG * in) {
39       if (in!=NULL) {       if (in!=NULL) {
40          Paso_Solver_AMG_free(in->AMG_of_Schur);          Paso_Solver_AMG_free(in->AMG_of_Schur);
41            Paso_Solver_Jacobi_free(in->GS);
42          MEMFREE(in->inv_A_FF);          MEMFREE(in->inv_A_FF);
43          MEMFREE(in->A_FF_pivot);          MEMFREE(in->A_FF_pivot);
44          Paso_SparseMatrix_free(in->A_FC);          Paso_SparseMatrix_free(in->A_FC);
# Line 68  to Line 74  to
74     then AMG is applied to S again until S becomes empty     then AMG is applied to S again until S becomes empty
75    
76  */  */
77  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso_SparseMatrix *A_p,bool_t verbose,dim_t level) {  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso_SparseMatrix *A_p,bool_t verbose,dim_t level, double coarsening_threshold, dim_t coarsening_method) {
78    Paso_Solver_AMG* out=NULL;    Paso_Solver_AMG* out=NULL;
79    dim_t n=A_p->numRows;    dim_t n=A_p->numRows;
80    dim_t n_block=A_p->row_block_size;    dim_t n_block=A_p->row_block_size;
81    index_t* mis_marker=NULL;      index_t* mis_marker=NULL;  
82    index_t* counter=NULL;    index_t* counter=NULL;
   double *rs=NULL;    
83    index_t iPtr,*index, *where_p, iPtr_s;    index_t iPtr,*index, *where_p, iPtr_s;
84    dim_t i,k,j,j0;    dim_t i,k,j;
85    Paso_SparseMatrix * schur=NULL;    Paso_SparseMatrix * schur=NULL;
86    Paso_SparseMatrix * schur_withFillIn=NULL;    Paso_SparseMatrix * schur_withFillIn=NULL;
87    schur_withFillIn=MEMALLOC(1,Paso_SparseMatrix);    double S=0;
88        
89      /*Make sure we have block sizes 1*/
90      A_p->pattern->input_block_size=A_p->col_block_size;
91      A_p->pattern->output_block_size=A_p->row_block_size;
92      A_p->pattern->block_size=A_p->block_size;
93        
   double A11,A12,A13,A21,A22,A23,A31,A32,A33,D,time0,time1,time2;  
     
   
94    /* identify independend set of rows/columns */    /* identify independend set of rows/columns */
95    mis_marker=TMPMEMALLOC(n,index_t);    mis_marker=TMPMEMALLOC(n,index_t);
96    counter=TMPMEMALLOC(n,index_t);    counter=TMPMEMALLOC(n,index_t);
   rs=TMPMEMALLOC(n,double);  
97    out=MEMALLOC(1,Paso_Solver_AMG);    out=MEMALLOC(1,Paso_Solver_AMG);
98    out->AMG_of_Schur=NULL;    out->AMG_of_Schur=NULL;
99    out->inv_A_FF=NULL;    out->inv_A_FF=NULL;
# Line 103  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 108  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
108    out->b_F=NULL;    out->b_F=NULL;
109    out->x_C=NULL;    out->x_C=NULL;
110    out->b_C=NULL;    out->b_C=NULL;
111      out->GS=NULL;
112    out->A=Paso_SparseMatrix_getReference(A_p);    out->A=Paso_SparseMatrix_getReference(A_p);
113      /*out->GS=Paso_Solver_getGS(A_p,verbose);*/
114      out->GS=Paso_Solver_getJacobi(A_p);
115      /*out->GS->sweeps=2;*/
116    out->level=level;    out->level=level;
117      
118   /* fprintf(stderr,"START OF MATRIX \n\n");    if ( !(Paso_checkPtr(mis_marker) || Paso_checkPtr(out) || Paso_checkPtr(counter) || level==0 ) ) {
   for (i = 0; i < A_p->numRows; ++i) {  
      for (iPtr=A_p->pattern->ptr[i];iPtr<A_p->pattern->ptr[i + 1]; ++iPtr) {  
        j=A_p->pattern->index[iPtr];  
        fprintf(stderr,"A[%d,%d]=%.2f ",i,j,A_p->val[iPtr]);  
      }  
      fprintf(stderr,"\n");  
    }  
    fprintf(stderr,"END OF MATRIX \n\n");  
  */  
   if ( !(Paso_checkPtr(mis_marker) || Paso_checkPtr(out) || Paso_checkPtr(counter) ) ) {  
119       /* identify independend set of rows/columns */       /* identify independend set of rows/columns */
      time0=Paso_timer();  
120       #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)       #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
121       for (i=0;i<n;++i) mis_marker[i]=-1;       for (i=0;i<n;++i) mis_marker[i]=-1;
122       Paso_Pattern_RS(A_p,mis_marker,0.25);      
123       /*       if (coarsening_method == PASO_YAIR_SHAPIRA_COARSENING) {
124       for (i=0;i<n;++i) fprintf(stderr," i=%d mis[i]=%d \n",i,mis_marker[i]);        Paso_Pattern_coup(A_p,mis_marker,coarsening_threshold);
125       */       }
126       time2=Paso_timer()-time0;       else if (coarsening_method == PASO_RUGE_STUEBEN_COARSENING) {
127       if (Paso_noError()) {        Paso_Pattern_RS(A_p,mis_marker,coarsening_threshold);
128         }
129         else if (coarsening_method == PASO_AGGREGATION_COARSENING) {
130          Paso_Pattern_Aggregiation(A_p,mis_marker,coarsening_threshold);
131         }
132         else {
133          /*Default coarseneing*/
134          Paso_Pattern_RS(A_p,mis_marker,coarsening_threshold);
135         }
136    
137        if (Paso_noError()) {
138          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
139          for (i = 0; i < n; ++i) counter[i]=mis_marker[i];          for (i = 0; i < n; ++i) counter[i]=mis_marker[i];
140          out->n=n;          out->n=n;
# Line 137  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 145  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
145          out->inv_A_FF=MEMALLOC(n_block*n_block*out->n_F,double);          out->inv_A_FF=MEMALLOC(n_block*n_block*out->n_F,double);
146          out->A_FF_pivot=NULL; /* later use for block size>3 */          out->A_FF_pivot=NULL; /* later use for block size>3 */
147          if (! (Paso_checkPtr(out->mask_F) || Paso_checkPtr(out->inv_A_FF) || Paso_checkPtr(out->rows_in_F) ) ) {          if (! (Paso_checkPtr(out->mask_F) || Paso_checkPtr(out->inv_A_FF) || Paso_checkPtr(out->rows_in_F) ) ) {
            #pragma omp parallel  
            {  
148                /* creates an index for F from mask */                /* creates an index for F from mask */
149                #pragma omp for private(i) schedule(static)                #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
150                for (i = 0; i < out->n_F; ++i) out->rows_in_F[i]=-1;                for (i = 0; i < out->n_F; ++i) out->rows_in_F[i]=-1;
151                #pragma omp for private(i) schedule(static)                #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
152                for (i = 0; i < n; ++i) {                for (i = 0; i < n; ++i) {
153                   if  (mis_marker[i]) {                   if  (mis_marker[i]) {
154                          out->rows_in_F[counter[i]]=i;                          out->rows_in_F[counter[i]]=i;
# Line 151  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 157  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
157                          out->mask_F[i]=-1;                          out->mask_F[i]=-1;
158                   }                   }
159                }                }
160                /* Compute row-sum for getting rs(A_FF)*/                
161                #pragma omp for private(i,iPtr) schedule(static)                /* Compute row-sum for getting rs(A_FF)^-1*/
162                  #pragma omp parallel for private(i,iPtr,j,S) schedule(static)
163                for (i = 0; i < out->n_F; ++i) {                for (i = 0; i < out->n_F; ++i) {
164                  rs[i]=0;                  S=0;
165                  for (iPtr=A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]];iPtr<A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i] + 1]; ++iPtr) {                  for (iPtr=A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]];iPtr<A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i] + 1]; ++iPtr) {
166                   rs[i]+=A_p->val[iPtr];                   j=A_p->pattern->index[iPtr];
167                     if (mis_marker[j])
168                         S+=A_p->val[iPtr];
169                  }                  }
170                    out->inv_A_FF[i]=1./S;
171                }                }
               
               #pragma omp for private(i, where_p,iPtr,A11,A12,A13,A21,A22,A23,A31,A32,A33,D,index) schedule(static)  
               for (i = 0; i < out->n_F; i++) {  
                 /* find main diagonal */  
                 iPtr=A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]];  
                 index=&(A_p->pattern->index[iPtr]);  
                 where_p=(index_t*)bsearch(&out->rows_in_F[i],  
                                         index,  
                                         A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i] + 1]-A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]],  
                                         sizeof(index_t),  
                                         Paso_comparIndex);  
                 if (where_p==NULL) {  
                     Paso_setError(VALUE_ERROR, "Paso_Solver_getAMG: main diagonal element missing.");  
                 } else {  
                     iPtr+=(index_t)(where_p-index);  
                     /* get inverse of A_FF block: */  
                       if (ABS(rs[i])>0.) {  
                             out->inv_A_FF[i]=1./rs[i];  
                       } else {  
                         out->inv_A_FF[i]=0;  
                       }  
                       
                      /* } else {  
                             Paso_setError(ZERO_DIVISION_ERROR, "Paso_Solver_getAMG: Break-down in AMG decomposition: non-regular main diagonal block.");  
                       }*/  
                 }  
               }  
            } /* end parallel region */  
172    
173             if( Paso_noError()) {             if( Paso_noError()) {
174                /* if there are no nodes in the coarse level there is no more work to do */                /* if there are no nodes in the coarse level there is no more work to do */
175                out->n_C=n-out->n_F;                out->n_C=n-out->n_F;
176                 /*if (out->n_C>11) {*/                if (level>0 && out->n_C>500) {
177                 if (level>0) {                 /*if (out->n_F>500) {*/
178                     out->rows_in_C=MEMALLOC(out->n_C,index_t);                     out->rows_in_C=MEMALLOC(out->n_C,index_t);
179                     out->mask_C=MEMALLOC(n,index_t);                     out->mask_C=MEMALLOC(n,index_t);
180                     if (! (Paso_checkPtr(out->mask_C) || Paso_checkPtr(out->rows_in_C) ) ) {                     if (! (Paso_checkPtr(out->mask_C) || Paso_checkPtr(out->rows_in_C) ) ) {
# Line 200  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 182  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
182                         #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)                         #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
183                         for (i = 0; i < n; ++i) counter[i]=! mis_marker[i];                         for (i = 0; i < n; ++i) counter[i]=! mis_marker[i];
184                         Paso_Util_cumsum(n,counter);                         Paso_Util_cumsum(n,counter);
185                         #pragma omp parallel                            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
                        {  
                           #pragma omp for private(i) schedule(static)  
186                            for (i = 0; i < out->n_C; ++i) out->rows_in_C[i]=-1;                            for (i = 0; i < out->n_C; ++i) out->rows_in_C[i]=-1;
187                            #pragma omp for private(i) schedule(static)                            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
188                            for (i = 0; i < n; ++i) {                            for (i = 0; i < n; ++i) {
189                               if  (! mis_marker[i]) {                               if  (! mis_marker[i]) {
190                                  out->rows_in_C[counter[i]]=i;                                  out->rows_in_C[counter[i]]=i;
# Line 213  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 193  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
193                                  out->mask_C[i]=-1;                                  out->mask_C[i]=-1;
194                               }                               }
195                            }                            }
                       } /* end parallel region */  
196                        /* get A_CF block: */                        /* get A_CF block: */
197                        out->A_CF=Paso_SparseMatrix_getSubmatrix(A_p,out->n_C,out->n_F,out->rows_in_C,out->mask_F);                        out->A_CF=Paso_SparseMatrix_getSubmatrix(A_p,out->n_C,out->n_F,out->rows_in_C,out->mask_F);
198                        if (Paso_noError()) {                        if (Paso_noError()) {
# Line 222  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 201  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
201                           /* get A_CC block: */                           /* get A_CC block: */
202                           if (Paso_noError()) {                           if (Paso_noError()) {
203                              schur=Paso_SparseMatrix_getSubmatrix(A_p,out->n_C,out->n_C,out->rows_in_C,out->mask_C);                              schur=Paso_SparseMatrix_getSubmatrix(A_p,out->n_C,out->n_C,out->rows_in_C,out->mask_C);
                               
204                              /*find the pattern of the schur complement with fill in*/                              /*find the pattern of the schur complement with fill in*/
205        
206                              schur_withFillIn=Paso_SparseMatrix_alloc(A_p->type,Paso_Pattern_binop(PATTERN_FORMAT_DEFAULT, schur->pattern, Paso_Pattern_multiply(PATTERN_FORMAT_DEFAULT,out->A_CF->pattern,out->A_FC->pattern)),1,1);                              schur_withFillIn=Paso_SparseMatrix_alloc(A_p->type,Paso_Pattern_binop(PATTERN_FORMAT_DEFAULT, schur->pattern, Paso_Pattern_multiply(PATTERN_FORMAT_DEFAULT,out->A_CF->pattern,out->A_FC->pattern)),1,1);
                               
207                              /* copy values over*/                              /* copy values over*/
208                              #pragma omp for private(i,iPtr,iPtr_s,j,j0) schedule(static)                              #pragma omp parallel for private(i,iPtr,j,iPtr_s,index,where_p) schedule(static)
209                              for (i = 0; i < schur_withFillIn->numRows; ++i) {                              for (i = 0; i < schur_withFillIn->numRows; ++i) {
210                                for (iPtr=schur_withFillIn->pattern->ptr[i];iPtr<schur_withFillIn->pattern->ptr[i + 1]; ++iPtr) {                                for (iPtr=schur_withFillIn->pattern->ptr[i];iPtr<schur_withFillIn->pattern->ptr[i + 1]; ++iPtr) {
211                                  j=schur_withFillIn->pattern->index[iPtr];                                  j=schur_withFillIn->pattern->index[iPtr];
212                                    iPtr_s=schur->pattern->ptr[i];
213                                  schur_withFillIn->val[iPtr]=0.;                                  schur_withFillIn->val[iPtr]=0.;
214                                  for (iPtr_s=schur->pattern->ptr[i];iPtr_s<schur->pattern->ptr[i + 1]; ++iPtr_s){                                  index=&(schur->pattern->index[iPtr_s]);
215                                      j0=schur->pattern->index[iPtr_s];                                  where_p=(index_t*)bsearch(&j,
216                                      if (j==j0) {                                          index,
217                                        schur_withFillIn->val[iPtr]=schur->val[iPtr_s];                                          schur->pattern->ptr[i + 1]-schur->pattern->ptr[i],
218                                        break;                                          sizeof(index_t),
219                                      }                                          Paso_comparIndex);
220                                    if (where_p!=NULL) {
221                                        schur_withFillIn->val[iPtr]=schur->val[iPtr_s+(index_t)(where_p-index)];
222                                  }                                  }
223                                }                                }
224                              }                              }                                
                               
                           /*  for (i = 0; i < schur_withFillIn->numRows; ++i) {  
                               for (iPtr=schur_withFillIn->pattern->ptr[i];iPtr<schur_withFillIn->pattern->ptr[i + 1]; ++iPtr) {  
                                 j=schur_withFillIn->pattern->index[iPtr];  
                                 fprintf(stderr,"A_CC[%d,%d]=%.2f ",i,j,schur_withFillIn->val[iPtr]);  
                               }  
                               fprintf(stderr,"\n");  
                             }*/  
                             time0=Paso_timer()-time0;  
225                              if (Paso_noError()) {                              if (Paso_noError()) {
                                 time1=Paso_timer();  
                                 /* update A_CC block to get Schur complement and then apply AMG to it */  
226                                  Paso_Solver_updateIncompleteSchurComplement(schur_withFillIn,out->A_CF,out->inv_A_FF,out->A_FF_pivot,out->A_FC);                                  Paso_Solver_updateIncompleteSchurComplement(schur_withFillIn,out->A_CF,out->inv_A_FF,out->A_FF_pivot,out->A_FC);
227                                  time1=Paso_timer()-time1;                                  out->AMG_of_Schur=Paso_Solver_getAMG(schur_withFillIn,verbose,level-1,coarsening_threshold,coarsening_method);
                                 out->AMG_of_Schur=Paso_Solver_getAMG(schur_withFillIn,verbose,level-1);  
                                   
228                                  Paso_SparseMatrix_free(schur);                                  Paso_SparseMatrix_free(schur);
                                 /* Paso_SparseMatrix_free(schur_withFillIn);*/  
229                              }                              }
230                              /* allocate work arrays for AMG application */                              /* allocate work arrays for AMG application */
231                              if (Paso_noError()) {                              if (Paso_noError()) {
# Line 268  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 235  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
235                                out->b_C=MEMALLOC(n_block*out->n_C,double);                                out->b_C=MEMALLOC(n_block*out->n_C,double);
236    
237                                if (! (Paso_checkPtr(out->x_F) || Paso_checkPtr(out->b_F) || Paso_checkPtr(out->x_C) || Paso_checkPtr(out->b_C) ) ) {                                if (! (Paso_checkPtr(out->x_F) || Paso_checkPtr(out->b_F) || Paso_checkPtr(out->x_C) || Paso_checkPtr(out->b_C) ) ) {
238                                    #pragma omp parallel                                      #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)
                                   {  
                                     #pragma omp for private(i,k) schedule(static)  
239                                      for (i = 0; i < out->n_F; ++i) {                                      for (i = 0; i < out->n_F; ++i) {
240                                            for (k=0; k<n_block;++k) {                                            for (k=0; k<n_block;++k) {
241                                               out->x_F[i*n_block+k]=0.;                                               out->x_F[i*n_block+k]=0.;
242                                               out->b_F[i*n_block+k]=0.;                                               out->b_F[i*n_block+k]=0.;
243                                            }                                            }
244                                      }                                      }
245                                      #pragma omp for private(i,k) schedule(static)                                      #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)
246                                      for (i = 0; i < out->n_C; ++i) {                                      for (i = 0; i < out->n_C; ++i) {
247                                          for (k=0; k<n_block;++k) {                                          for (k=0; k<n_block;++k) {
248                                            out->x_C[i*n_block+k]=0.;                                            out->x_C[i*n_block+k]=0.;
249                                            out->b_C[i*n_block+k]=0.;                                            out->b_C[i*n_block+k]=0.;
250                                          }                                          }
251                                      }                                      }
                                   } /* end parallel region */  
252                                }                                }
253                              }                              }
254                           }                           }
# Line 297  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 261  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
261    }    }
262    TMPMEMFREE(mis_marker);    TMPMEMFREE(mis_marker);
263    TMPMEMFREE(counter);    TMPMEMFREE(counter);
   TMPMEMFREE(rs);  
264    if (Paso_noError()) {    if (Paso_noError()) {
265        if (verbose) {        if (verbose && level>0) {
266           printf("AMG: %d unknowns eliminated. %d left.\n",out->n_F,n-out->n_F);           printf("AMG: %d unknowns eliminated. %d left.\n",out->n_F,out->n_C);
          if (out->n_C>0) {  
             printf("timing: AMG: MIS/reordering/elemination : %e/%e/%e\n",time2,time0,time1);  
          } else {  
             printf("timing: AMG: MIS: %e\n",time2);  
          }  
267       }       }
268       return out;       return out;
269    } else  {    } else  {
# Line 320  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 278  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
278    
279       in fact it solves       in fact it solves
280    
281    [      I         0  ]  [ A_FF 0 ] [ I    invA_FF*A_FF ]  [ x_F ]  = [b_F]    [      I         0  ]  [ A_FF 0 ] [ I    invA_FF*A_FC ]  [ x_F ]  = [b_F]
282    [ A_CF*invA_FF   I  ]  [   0  S ] [ 0          I      ]  [ x_C ]  = [b_C]    [ A_CF*invA_FF   I  ]  [   0  S ] [ 0          I      ]  [ x_C ]  = [b_C]
283    
284   in the form   in the form
# Line 339  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 297  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
297  */  */
298    
299  void Paso_Solver_solveAMG(Paso_Solver_AMG * amg, double * x, double * b) {  void Paso_Solver_solveAMG(Paso_Solver_AMG * amg, double * x, double * b) {
300       dim_t i,k;       dim_t i;
      dim_t n_block=amg->n_block;  
301       double *r=MEMALLOC(amg->n,double);       double *r=MEMALLOC(amg->n,double);
302       double *x0=MEMALLOC(amg->n,double);       double *x0=MEMALLOC(amg->n,double);
303         double time0=0;
304         bool_t verbose=0;
305        
306         #ifdef MKL
307         Paso_SparseMatrix *temp=NULL;
308         #endif
309            
310       if (amg->level==0) {      
311          /* x=invA_FF*b  */       if (amg->level==0  || amg->n_C<=500) {
312          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(n_block,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,x,b);        
313          time0=Paso_timer();
314           #ifdef MKL
315            temp=Paso_SparseMatrix_alloc(MATRIX_FORMAT_BLK1 + MATRIX_FORMAT_OFFSET1, amg->A->pattern,1,1);
316            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
317            for (i=0;i<amg->A->len;++i) {
318                 temp->val[i]=amg->A->val[i];
319            }
320            Paso_MKL1(temp,x,b,0);
321            Paso_SparseMatrix_free(temp);
322           #else
323            #ifdef UMFPACK
324             Paso_UMFPACK1(amg->A,x,b,0);
325            #else
326            Paso_Solver_solveJacobi(amg->GS,x,b);
327            #endif
328           #endif
329          
330           time0=Paso_timer()-time0;
331           if (verbose) fprintf(stderr,"timing: DIRECT SOLVER: %e\n\n\n",time0);
332          
333       } else {       } else {
334           fprintf(stdout,"LEVEL %d \n",amg->level);          /* presmoothing */
335          /* presmoothing on (Shure, x, b, r) */           time0=Paso_timer();
336          /****************/           Paso_Solver_solveJacobi(amg->GS,x,b);
337           Paso_Solver_GS* GS=MEMALLOC(1,Paso_Solver_GS);           time0=Paso_timer()-time0;
338           GS=Paso_Solver_getGS(amg->A,-1);           if (verbose) fprintf(stderr,"timing: Presmooting: %e\n",time0);
339           Paso_Solver_solveGS(GS,x,b);          /* end of presmoothing */
340            
341                    
342             time0=Paso_timer();
343           #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)           #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
344           for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];           for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];
345                    
346           /*r=b-Ax*/           /*r=b-Ax*/
347           Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);           Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);
348         /****************/                
349          /* b->[b_F,b_C]     */          /* b->[b_F,b_C]     */
350          if (n_block==1) {          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
351             #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)          for (i=0;i<amg->n_F;++i) amg->b_F[i]=r[amg->rows_in_F[i]];
            for (i=0;i<amg->n_F;++i) amg->b_F[i]=r[amg->rows_in_F[i]];    /* was b istead of r */  
           #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n_C;++i) amg->b_C[i]=r[amg->rows_in_C[i]];  
         } else {  
            #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n_F;++i)  
                  for (k=0;k<n_block;k++) amg->b_F[amg->n_block*i+k]=r[n_block*amg->rows_in_F[i]+k];  
            #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n_C;++i)  
                  for (k=0;k<n_block;k++) amg->b_C[amg->n_block*i+k]=r[n_block*amg->rows_in_C[i]+k];  
         }  
   
         /****************/  
         /* Coursening part */  
352                    
353          /* r_F=A_FF^-1*r_F  */          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
354          /*Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(n_block,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->b_F,amg->b_F);          for (i=0;i<amg->n_C;++i) amg->b_C[i]=r[amg->rows_in_C[i]];
         fprintf(stderr,"2\n");  
         */  
         /* r_C=r_C-A_CF*r_F */  
         /*Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_CF,amg->b_F,1.,amg->b_C);  
         fprintf(stderr,"3\n");  
         */  
        /****************/  
355    
           
356          /* x_F=invA_FF*b_F  */          /* x_F=invA_FF*b_F  */
357          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(n_block,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->x_F,amg->b_F);          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(1,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->x_F,amg->b_F);
358                    
359          /* b_C=b_C-A_CF*x_F */          /* b_C=b_C-A_CF*x_F */
360          Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_CF,amg->x_F,1.,amg->b_C);          Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_CF,amg->x_F,1.,amg->b_C);
361                    
362            time0=Paso_timer()-time0;
363            if (verbose) fprintf(stderr,"timing: Before next level: %e\n",time0);
364            
365          /* x_C=AMG(b_C)     */          /* x_C=AMG(b_C)     */
366          Paso_Solver_solveAMG(amg->AMG_of_Schur,amg->x_C,amg->b_C);          Paso_Solver_solveAMG(amg->AMG_of_Schur,amg->x_C,amg->b_C);
367                    
368            time0=Paso_timer();
369          /* b_F=b_F-A_FC*x_C */          /* b_F=b_F-A_FC*x_C */
370          Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_FC,amg->x_C,1.,amg->b_F);          Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_FC,amg->x_C,1.,amg->b_F);
371          /* x_F=invA_FF*b_F  */          /* x_F=invA_FF*b_F  */
372          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(n_block,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->x_F,amg->b_F);          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(1,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->x_F,amg->b_F);
373          /* x<-[x_F,x_C]     */          /* x<-[x_F,x_C]     */
374            
375          /* */          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
376                    for (i=0;i<amg->n;++i) {
377                        if (amg->mask_C[i]>-1) {
378          if (n_block==1) {                   x[i]=amg->x_C[amg->mask_C[i]];
379             #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)              } else {
380             for (i=0;i<amg->n;++i) {                   x[i]=amg->x_F[amg->mask_F[i]];
381                if (amg->mask_C[i]>-1) {              }
                   x[i]+=amg->x_C[amg->mask_C[i]];  
               } else {  
                   x[i]+=amg->x_F[amg->mask_F[i]];  
               }  
            }  
         } else {  
            #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n;++i) {  
                  if (amg->mask_C[i]>-1) {  
                      for (k=0;k<n_block;k++) x[n_block*i+k]+=amg->x_C[n_block*amg->mask_C[i]+k];  
                  } else {  
                      for (k=0;k<n_block;k++) x[n_block*i+k]+=amg->x_F[n_block*amg->mask_F[i]+k];  
                  }  
            }  
         }  
         /* all done */  
      /*post smoothing*/  
 /*     Paso_Solver_solveGS(GS,x0,b);  
      if (n_block==1) {  
            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n;++i) x[i]+=x0[i];  
         } else {  
            #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n;++i) {  
                      for (k=0;k<n_block;k++) x[n_block*i+k]+=x0[n_block*i+k];  
            }  
382          }          }
383  */              
384       Paso_Solver_GS_free(GS);          time0=Paso_timer()-time0;
385            if (verbose) fprintf(stderr,"timing: After next level: %e\n",time0);
386    
387         /*postsmoothing*/
388         time0=Paso_timer();
389         #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
390         for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];
391        
392         /*r=b-Ax */
393         Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);
394         Paso_Solver_solveJacobi(amg->GS,x0,r);
395        
396         #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
397         for (i=0;i<amg->n;++i) x[i]+=x0[i];
398        
399         time0=Paso_timer()-time0;
400         if (verbose) fprintf(stderr,"timing: Postsmoothing: %e\n",time0);
401    
402         /*end of postsmoothing*/
403        
404       }       }
      MEMFREE(x0);  
405       MEMFREE(r);       MEMFREE(r);
406       return;       MEMFREE(x0);
407        return;
408  }  }
409    
410  /*  /*

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changed lines
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