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revision 1931 by artak, Mon Oct 27 01:31:28 2008 UTC revision 2475 by artak, Wed Jun 17 01:48:46 2009 UTC
# Line 14  Line 14 
14    
15  /**************************************************************/  /**************************************************************/
16    
17  /* Paso: AMG preconditioner with reordering                 */  /* Paso: AMG preconditioner                                  */
18    
19  /**************************************************************/  /**************************************************************/
20    
# Line 24  Line 24 
24    
25  #include "Paso.h"  #include "Paso.h"
26  #include "Solver.h"  #include "Solver.h"
27    #include "Options.h"
28  #include "PasoUtil.h"  #include "PasoUtil.h"
29  #include "UMFPACK.h"  #include "UMFPACK.h"
30  #include "Pattern_coupling.h"  #include "Pattern_coupling.h"
# Line 35  Line 36 
36  void Paso_Solver_AMG_free(Paso_Solver_AMG * in) {  void Paso_Solver_AMG_free(Paso_Solver_AMG * in) {
37       if (in!=NULL) {       if (in!=NULL) {
38          Paso_Solver_AMG_free(in->AMG_of_Schur);          Paso_Solver_AMG_free(in->AMG_of_Schur);
39            Paso_Solver_Jacobi_free(in->GS);
40          MEMFREE(in->inv_A_FF);          MEMFREE(in->inv_A_FF);
41          MEMFREE(in->A_FF_pivot);          MEMFREE(in->A_FF_pivot);
42          Paso_SparseMatrix_free(in->A_FC);          Paso_SparseMatrix_free(in->A_FC);
# Line 70  to Line 72  to
72     then AMG is applied to S again until S becomes empty     then AMG is applied to S again until S becomes empty
73    
74  */  */
75  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso_SparseMatrix *A_p,bool_t verbose,dim_t level) {  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso_SparseMatrix *A_p,bool_t verbose,dim_t level, double coarsening_threshold, dim_t coarsening_method) {
76    Paso_Solver_AMG* out=NULL;    Paso_Solver_AMG* out=NULL;
77    dim_t n=A_p->numRows;    dim_t n=A_p->numRows;
78    dim_t n_block=A_p->row_block_size;    dim_t n_block=A_p->row_block_size;
79    index_t* mis_marker=NULL;      index_t* mis_marker=NULL;  
80    index_t* counter=NULL;    index_t* counter=NULL;
81    index_t iPtr,*index, *where_p, iPtr_s;    index_t iPtr,*index, *where_p, iPtr_s;
82    dim_t i,k,j,j0;    dim_t i,k,j;
83    Paso_SparseMatrix * schur=NULL;    Paso_SparseMatrix * schur=NULL;
84    Paso_SparseMatrix * schur_withFillIn=NULL;    Paso_SparseMatrix * schur_withFillIn=NULL;
85    double time0,time1,time2,S;    double S=0;
86      
87      /*Make sure we have block sizes 1*/
88      A_p->pattern->input_block_size=A_p->col_block_size;
89      A_p->pattern->output_block_size=A_p->row_block_size;
90      A_p->pattern->block_size=A_p->block_size;
91        
92    /* identify independend set of rows/columns */    /* identify independend set of rows/columns */
93    mis_marker=TMPMEMALLOC(n,index_t);    mis_marker=TMPMEMALLOC(n,index_t);
# Line 99  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 106  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
106    out->b_F=NULL;    out->b_F=NULL;
107    out->x_C=NULL;    out->x_C=NULL;
108    out->b_C=NULL;    out->b_C=NULL;
109      out->GS=NULL;
110    out->A=Paso_SparseMatrix_getReference(A_p);    out->A=Paso_SparseMatrix_getReference(A_p);
111      /*out->GS=Paso_Solver_getGS(A_p,verbose);*/
112      out->GS=Paso_Solver_getJacobi(A_p);
113      /*out->GS->sweeps=2;*/
114    out->level=level;    out->level=level;
115      
116    if ( !(Paso_checkPtr(mis_marker) || Paso_checkPtr(out) || Paso_checkPtr(counter) ) ) {    if ( !(Paso_checkPtr(mis_marker) || Paso_checkPtr(out) || Paso_checkPtr(counter) || level==0 ) ) {
117       /* identify independend set of rows/columns */       /* identify independend set of rows/columns */
      time0=Paso_timer();  
118       #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)       #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
119       for (i=0;i<n;++i) mis_marker[i]=-1;       for (i=0;i<n;++i) mis_marker[i]=-1;
120       Paso_Pattern_RS(A_p,mis_marker,0.25);      
121       /*Paso_Pattern_coup(A_p,mis_marker,0.05);*/       /*Paso_Pattern_RS(A_p,mis_marker,coarsening_threshold);*/
122       time2=Paso_timer()-time0;       /*fprintf(stderr,"\n Coarsening method == %d, %d \n",coarsening_method,PASO_RUGE_STUEBEN_COARSENING);*/
123       if (Paso_noError()) {       if (coarsening_method == PASO_YAIR_SHAPIRA_COARSENING) {
124          Paso_Pattern_coup(A_p,mis_marker,coarsening_threshold);
125         }
126         else if (coarsening_method == PASO_RUGE_STUEBEN_COARSENING) {
127          Paso_Pattern_RS(A_p,mis_marker,coarsening_threshold);
128         }
129         else if (coarsening_method == PASO_AGGREGATION_COARSENING) {
130          Paso_Pattern_Aggregiation(A_p,mis_marker,coarsening_threshold);
131         }
132         else {
133          /*Default coarseneing*/
134          Paso_Pattern_RS(A_p,mis_marker,coarsening_threshold);
135         }
136        
137        if (Paso_noError()) {
138          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
139          for (i = 0; i < n; ++i) counter[i]=mis_marker[i];          for (i = 0; i < n; ++i) counter[i]=mis_marker[i];
140          out->n=n;          out->n=n;
# Line 121  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 145  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
145          out->inv_A_FF=MEMALLOC(n_block*n_block*out->n_F,double);          out->inv_A_FF=MEMALLOC(n_block*n_block*out->n_F,double);
146          out->A_FF_pivot=NULL; /* later use for block size>3 */          out->A_FF_pivot=NULL; /* later use for block size>3 */
147          if (! (Paso_checkPtr(out->mask_F) || Paso_checkPtr(out->inv_A_FF) || Paso_checkPtr(out->rows_in_F) ) ) {          if (! (Paso_checkPtr(out->mask_F) || Paso_checkPtr(out->inv_A_FF) || Paso_checkPtr(out->rows_in_F) ) ) {
            #pragma omp parallel  
            {  
148                /* creates an index for F from mask */                /* creates an index for F from mask */
149                #pragma omp for private(i) schedule(static)                #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
150                for (i = 0; i < out->n_F; ++i) out->rows_in_F[i]=-1;                for (i = 0; i < out->n_F; ++i) out->rows_in_F[i]=-1;
151                #pragma omp for private(i) schedule(static)                #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
152                for (i = 0; i < n; ++i) {                for (i = 0; i < n; ++i) {
153                   if  (mis_marker[i]) {                   if  (mis_marker[i]) {
154                          out->rows_in_F[counter[i]]=i;                          out->rows_in_F[counter[i]]=i;
# Line 135  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 157  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
157                          out->mask_F[i]=-1;                          out->mask_F[i]=-1;
158                   }                   }
159                }                }
160                /* Compute row-sum for getting rs(A_FF)*/                
161                #pragma omp for private(i,iPtr) schedule(static)                /* Compute row-sum for getting rs(A_FF)^-1*/
162                  #pragma omp parallel for private(i,iPtr,j,S) schedule(static)
163                for (i = 0; i < out->n_F; ++i) {                for (i = 0; i < out->n_F; ++i) {
164                  out->inv_A_FF[i]=0;                  S=0;
165                  for (iPtr=A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]];iPtr<A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i] + 1]; ++iPtr) {                  for (iPtr=A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]];iPtr<A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i] + 1]; ++iPtr) {
166                   out->inv_A_FF[i]+=A_p->val[iPtr];                   j=A_p->pattern->index[iPtr];
167                     if (mis_marker[j])
168                         S+=A_p->val[iPtr];
169                  }                  }
170                    out->inv_A_FF[i]=1./S;
171                }                }
172    
               #pragma omp for private(i, where_p,iPtr,index) schedule(static)  
               for (i = 0; i < out->n_F; i++) {  
                 /* find main diagonal */  
                 iPtr=A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]];  
                 index=&(A_p->pattern->index[iPtr]);  
                 where_p=(index_t*)bsearch(&out->rows_in_F[i],  
                                         index,  
                                         A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i] + 1]-A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]],  
                                         sizeof(index_t),  
                                         Paso_comparIndex);  
                 if (where_p==NULL) {  
                     Paso_setError(VALUE_ERROR, "Paso_Solver_getAMG: main diagonal element missing.");  
                 } else {  
                     iPtr+=(index_t)(where_p-index);  
                     /* get inverse of A_FF block: */  
                       S=out->inv_A_FF[i];  
                       if (ABS(A_p->val[iPtr])>0.) {  
                             if(ABS(S)>0.)  
                                out->inv_A_FF[i]=1./S;  
 /*                            else  
                             {  
                                fprintf(stderr,"ROWSUM OF ROW %d is 0\n",out->rows_in_F[i]);  
                                S=0;  
                                for (iPtr=A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]];iPtr<A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i] + 1]; ++iPtr) {  
                                if(A_p->val[iPtr]!=0) {  
                                 fprintf(stderr,"A_p[%d,%d]=%f ",out->rows_in_F[i],A_p->pattern->index[iPtr],A_p->val[iPtr]);  
                                 S+=A_p->val[iPtr];  
                                }  
                               }  
                               fprintf(stderr,"\n SUMMMMMMM %f\n",S);  
                             }  
 */                      } else {  
                             Paso_setError(ZERO_DIVISION_ERROR, "Paso_Solver_getAMG: Break-down in AMG decomposition: non-regular main diagonal block.");  
                       }  
                 }  
               }  
            } /* end parallel region */  
   
173             if( Paso_noError()) {             if( Paso_noError()) {
174                /* if there are no nodes in the coarse level there is no more work to do */                /* if there are no nodes in the coarse level there is no more work to do */
175                out->n_C=n-out->n_F;                out->n_C=n-out->n_F;
176                 if (level>0) {                if (level>0 && out->n_C>500) {
177                   /*if (out->n_F>500) {*/
178                     out->rows_in_C=MEMALLOC(out->n_C,index_t);                     out->rows_in_C=MEMALLOC(out->n_C,index_t);
179                     out->mask_C=MEMALLOC(n,index_t);                     out->mask_C=MEMALLOC(n,index_t);
180                     if (! (Paso_checkPtr(out->mask_C) || Paso_checkPtr(out->rows_in_C) ) ) {                     if (! (Paso_checkPtr(out->mask_C) || Paso_checkPtr(out->rows_in_C) ) ) {
# Line 193  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 182  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
182                         #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)                         #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
183                         for (i = 0; i < n; ++i) counter[i]=! mis_marker[i];                         for (i = 0; i < n; ++i) counter[i]=! mis_marker[i];
184                         Paso_Util_cumsum(n,counter);                         Paso_Util_cumsum(n,counter);
185                         #pragma omp parallel                            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
                        {  
                           #pragma omp for private(i) schedule(static)  
186                            for (i = 0; i < out->n_C; ++i) out->rows_in_C[i]=-1;                            for (i = 0; i < out->n_C; ++i) out->rows_in_C[i]=-1;
187                            #pragma omp for private(i) schedule(static)                            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
188                            for (i = 0; i < n; ++i) {                            for (i = 0; i < n; ++i) {
189                               if  (! mis_marker[i]) {                               if  (! mis_marker[i]) {
190                                  out->rows_in_C[counter[i]]=i;                                  out->rows_in_C[counter[i]]=i;
# Line 206  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 193  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
193                                  out->mask_C[i]=-1;                                  out->mask_C[i]=-1;
194                               }                               }
195                            }                            }
                       } /* end parallel region */  
196                        /* get A_CF block: */                        /* get A_CF block: */
197                        out->A_CF=Paso_SparseMatrix_getSubmatrix(A_p,out->n_C,out->n_F,out->rows_in_C,out->mask_F);                        out->A_CF=Paso_SparseMatrix_getSubmatrix(A_p,out->n_C,out->n_F,out->rows_in_C,out->mask_F);
198                        if (Paso_noError()) {                        if (Paso_noError()) {
# Line 215  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 201  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
201                           /* get A_CC block: */                           /* get A_CC block: */
202                           if (Paso_noError()) {                           if (Paso_noError()) {
203                              schur=Paso_SparseMatrix_getSubmatrix(A_p,out->n_C,out->n_C,out->rows_in_C,out->mask_C);                              schur=Paso_SparseMatrix_getSubmatrix(A_p,out->n_C,out->n_C,out->rows_in_C,out->mask_C);
                               
204                              /*find the pattern of the schur complement with fill in*/                              /*find the pattern of the schur complement with fill in*/
205                              schur_withFillIn=Paso_SparseMatrix_alloc(A_p->type,Paso_Pattern_binop(PATTERN_FORMAT_DEFAULT, schur->pattern, Paso_Pattern_multiply(PATTERN_FORMAT_DEFAULT,out->A_CF->pattern,out->A_FC->pattern)),1,1);                              schur_withFillIn=Paso_SparseMatrix_alloc(A_p->type,Paso_Pattern_binop(PATTERN_FORMAT_DEFAULT, schur->pattern, Paso_Pattern_multiply(PATTERN_FORMAT_DEFAULT,out->A_CF->pattern,out->A_FC->pattern)),1,1);
206                              
207                              /* copy values over*/                              /* copy values over*/
208                              #pragma omp for private(i,iPtr,iPtr_s,j,j0) schedule(static)                              #pragma omp parallel for private(i,iPtr,j,iPtr_s,index,where_p) schedule(static)
209                              for (i = 0; i < schur_withFillIn->numRows; ++i) {                              for (i = 0; i < schur_withFillIn->numRows; ++i) {
210                                for (iPtr=schur_withFillIn->pattern->ptr[i];iPtr<schur_withFillIn->pattern->ptr[i + 1]; ++iPtr) {                                for (iPtr=schur_withFillIn->pattern->ptr[i];iPtr<schur_withFillIn->pattern->ptr[i + 1]; ++iPtr) {
211                                  j=schur_withFillIn->pattern->index[iPtr];                                  j=schur_withFillIn->pattern->index[iPtr];
212                                  schur_withFillIn->val[iPtr]=0.;                                  iPtr_s=schur->pattern->ptr[i];
213                                  for (iPtr_s=schur->pattern->ptr[i];iPtr_s<schur->pattern->ptr[i + 1]; ++iPtr_s){                                  /*schur_withFillIn->val[iPtr]=0.;*/
214                                      j0=schur->pattern->index[iPtr_s];                                  index=&(schur->pattern->index[iPtr_s]);
215                                      if (j==j0) {                                  where_p=(index_t*)bsearch(&j,
216                                        schur_withFillIn->val[iPtr]=schur->val[iPtr_s];                                          index,
217                                        break;                                          schur->pattern->ptr[i + 1]-schur->pattern->ptr[i],
218                                      }                                          sizeof(index_t),
219                                            Paso_comparIndex);
220                                    if (where_p!=NULL) {
221                                        schur_withFillIn->val[iPtr]=schur->val[iPtr_s+(index_t)(where_p-index)];
222                                  }                                  }
223                                }                                }
224                              }                              }
225                             time0=Paso_timer()-time0;                                  
                             
226                              if (Paso_noError()) {                              if (Paso_noError()) {
                                 time1=Paso_timer();  
                                 /* update A_CC block to get Schur complement and then apply AMG to it */  
227                                  Paso_Solver_updateIncompleteSchurComplement(schur_withFillIn,out->A_CF,out->inv_A_FF,out->A_FF_pivot,out->A_FC);                                  Paso_Solver_updateIncompleteSchurComplement(schur_withFillIn,out->A_CF,out->inv_A_FF,out->A_FF_pivot,out->A_FC);
228                                  time1=Paso_timer()-time1;                                  out->AMG_of_Schur=Paso_Solver_getAMG(schur_withFillIn,verbose,level-1,coarsening_threshold,coarsening_method);
229                                  out->AMG_of_Schur=Paso_Solver_getAMG(schur_withFillIn,verbose,level-1);                                  Paso_SparseMatrix_free(schur);
                                   
                                 /*Paso_SparseMatrix_free(schur);*/  
                                 /* Paso_SparseMatrix_free(schur_withFillIn);*/  
230                              }                              }
231                              /* allocate work arrays for AMG application */                              /* allocate work arrays for AMG application */
232                              if (Paso_noError()) {                              if (Paso_noError()) {
# Line 254  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 236  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
236                                out->b_C=MEMALLOC(n_block*out->n_C,double);                                out->b_C=MEMALLOC(n_block*out->n_C,double);
237    
238                                if (! (Paso_checkPtr(out->x_F) || Paso_checkPtr(out->b_F) || Paso_checkPtr(out->x_C) || Paso_checkPtr(out->b_C) ) ) {                                if (! (Paso_checkPtr(out->x_F) || Paso_checkPtr(out->b_F) || Paso_checkPtr(out->x_C) || Paso_checkPtr(out->b_C) ) ) {
239                                    #pragma omp parallel                                      #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)
                                   {  
                                     #pragma omp for private(i,k) schedule(static)  
240                                      for (i = 0; i < out->n_F; ++i) {                                      for (i = 0; i < out->n_F; ++i) {
241                                            for (k=0; k<n_block;++k) {                                            for (k=0; k<n_block;++k) {
242                                               out->x_F[i*n_block+k]=0.;                                               out->x_F[i*n_block+k]=0.;
243                                               out->b_F[i*n_block+k]=0.;                                               out->b_F[i*n_block+k]=0.;
244                                            }                                            }
245                                      }                                      }
246                                      #pragma omp for private(i,k) schedule(static)                                      #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)
247                                      for (i = 0; i < out->n_C; ++i) {                                      for (i = 0; i < out->n_C; ++i) {
248                                          for (k=0; k<n_block;++k) {                                          for (k=0; k<n_block;++k) {
249                                            out->x_C[i*n_block+k]=0.;                                            out->x_C[i*n_block+k]=0.;
250                                            out->b_C[i*n_block+k]=0.;                                            out->b_C[i*n_block+k]=0.;
251                                          }                                          }
252                                      }                                      }
                                   } /* end parallel region */  
253                                }                                }
254                              }                              }
255                           }                           }
# Line 284  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 263  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
263    TMPMEMFREE(mis_marker);    TMPMEMFREE(mis_marker);
264    TMPMEMFREE(counter);    TMPMEMFREE(counter);
265    if (Paso_noError()) {    if (Paso_noError()) {
266        if (verbose) {        if (verbose && level>0) {
267           printf("AMG: %d unknowns eliminated. %d left.\n",out->n_F,n-out->n_F);           printf("AMG: %d unknowns eliminated. %d left.\n",out->n_F,out->n_C);
268           if (out->n_C>0) {           /*if (level>0 && out->n_F>500) {*/
269              printf("timing: AMG: MIS/reordering/elemination : %e/%e/%e\n",time2,time0,time1);          /* if (out->n_F<500) {*/
270            /*   printf("timing: AMG: MIS/reordering/elemination : %e/%e\n",time0,time1);
271           } else {           } else {
272              printf("timing: AMG: MIS: %e\n",time2);              printf("timing: AMG: MIS: %e\n",time2);
273           }           }*/
274       }       }
275       return out;       return out;
276    } else  {    } else  {
# Line 305  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 285  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
285    
286       in fact it solves       in fact it solves
287    
288    [      I         0  ]  [ A_FF 0 ] [ I    invA_FF*A_FF ]  [ x_F ]  = [b_F]    [      I         0  ]  [ A_FF 0 ] [ I    invA_FF*A_FC ]  [ x_F ]  = [b_F]
289    [ A_CF*invA_FF   I  ]  [   0  S ] [ 0          I      ]  [ x_C ]  = [b_C]    [ A_CF*invA_FF   I  ]  [   0  S ] [ 0          I      ]  [ x_C ]  = [b_C]
290    
291   in the form   in the form
# Line 324  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 304  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
304  */  */
305    
306  void Paso_Solver_solveAMG(Paso_Solver_AMG * amg, double * x, double * b) {  void Paso_Solver_solveAMG(Paso_Solver_AMG * amg, double * x, double * b) {
307       dim_t i,k,oldsweeps;       dim_t i;
      dim_t n_block=amg->n_block;  
308       double *r=MEMALLOC(amg->n,double);       double *r=MEMALLOC(amg->n,double);
309       Paso_Solver_GS* GS=NULL;       double *x0=MEMALLOC(amg->n,double);
310       double *bold=MEMALLOC(amg->n*amg->n_block,double);       /*double time0=0;*/
      double *bnew=MEMALLOC(amg->n*amg->n_block,double);  
311            
312       if (amg->level==0) {       if (amg->level==0  || amg->n_C<=500) {
313          Paso_UMFPACK1(amg->A,x,b,1);       /*if (amg->n_F<=500) {*/
314          /*time0=Paso_timer();*/
315            
316            /*Paso_Solver_solveJacobi(amg->GS,x,b);*/
317            
318            /* #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
319            for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];
320            Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);
321            Paso_Solver_solveGS(amg->GS,x0,r);
322            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
323            for (i=0;i<amg->n;++i) {
324             x[i]+=x0[i];
325            }
326            */
327            Paso_UMFPACK1(amg->A,x,b,0);
328            
329           /*
330           time0=Paso_timer()-time0;
331           fprintf(stderr,"timing: DIRECT SOLVER: %e/\n",time0);
332           */
333       } else {       } else {
   
334          /* presmoothing */          /* presmoothing */
335           GS=Paso_Solver_getGS(amg->A,-1);           Paso_Solver_solveJacobi(amg->GS,x,b);
336           Paso_Solver_solveGS(GS,x,b);          
337           oldsweeps=GS->sweeps;           /* #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
338           if (GS->sweeps>1) {           for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];
             
            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)  
            for (i=0;i<GS->n*GS->n_block;++i) bold[i]=b[i];  
             
            while(GS->sweeps>1) {  
                #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)  
                for (i=0;i<GS->n*GS->n_block;++i) bnew[i]=bold[i]+b[i];  
                 /* Compute the residual b=b-Ax*/  
                Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(DBLE(-1), amg->A, x, DBLE(1), bnew);  
                /* Go round again*/  
                Paso_Solver_solveGS(GS,x,bnew);  
                #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)  
                for (i=0;i<GS->n*GS->n_block;++i) bold[i]=bnew[i];  
                GS->sweeps=GS->sweeps-1;  
            }  
            }  
            GS->sweeps=oldsweeps;  
         /* end of presmoothing */  
339    
340              Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);
341              Paso_Solver_solveJacobi(amg->GS,x0,r);
342              
343              #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
344              for (i=0;i<amg->n;++i) {
345               x[i]+=x0[i];
346              }
347             */
348            /* end of presmoothing */
349            
350           #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)           #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
351           for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];           for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];
352                    
353           /*r=b-Ax*/           /*r=b-Ax*/
354           Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);           Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);
355          
356          /* b->[b_F,b_C]     */          /* b->[b_F,b_C]     */
357          if (n_block==1) {          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
358             #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)          for (i=0;i<amg->n_F;++i) amg->b_F[i]=r[amg->rows_in_F[i]];
359             for (i=0;i<amg->n_F;++i) amg->b_F[i]=r[amg->rows_in_F[i]];            
360            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
361             for (i=0;i<amg->n_C;++i) amg->b_C[i]=r[amg->rows_in_C[i]];          for (i=0;i<amg->n_C;++i) amg->b_C[i]=r[amg->rows_in_C[i]];
         } else {  
            #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n_F;++i)  
                  for (k=0;k<n_block;k++) amg->b_F[amg->n_block*i+k]=r[n_block*amg->rows_in_F[i]+k];  
            #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n_C;++i)  
                  for (k=0;k<n_block;k++) amg->b_C[amg->n_block*i+k]=r[n_block*amg->rows_in_C[i]+k];  
         }  
362    
363          /* x_F=invA_FF*b_F  */          /* x_F=invA_FF*b_F  */
364          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(n_block,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->x_F,amg->b_F);          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(1,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->x_F,amg->b_F);
365                    
366          /* b_C=b_C-A_CF*x_F */          /* b_C=b_C-A_CF*x_F */
367          Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_CF,amg->x_F,1.,amg->b_C);          Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_CF,amg->x_F,1.,amg->b_C);
# Line 392  void Paso_Solver_solveAMG(Paso_Solver_AM Line 372  void Paso_Solver_solveAMG(Paso_Solver_AM
372          /* b_F=b_F-A_FC*x_C */          /* b_F=b_F-A_FC*x_C */
373          Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_FC,amg->x_C,1.,amg->b_F);          Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_FC,amg->x_C,1.,amg->b_F);
374          /* x_F=invA_FF*b_F  */          /* x_F=invA_FF*b_F  */
375          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(n_block,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->x_F,amg->b_F);          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(1,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->x_F,amg->b_F);
376          /* x<-[x_F,x_C]     */          /* x<-[x_F,x_C]     */
           
         if (n_block==1) {  
            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n;++i) {  
               if (amg->mask_C[i]>-1) {  
                   x[i]+=amg->x_C[amg->mask_C[i]];  
               } else {  
                   x[i]+=amg->x_F[amg->mask_F[i]];  
               }  
            }  
         } else {  
            #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n;++i) {  
                  if (amg->mask_C[i]>-1) {  
                      for (k=0;k<n_block;k++) x[n_block*i+k]+=amg->x_C[n_block*amg->mask_C[i]+k];  
                  } else {  
                      for (k=0;k<n_block;k++) x[n_block*i+k]+=amg->x_F[n_block*amg->mask_F[i]+k];  
                  }  
            }  
         }  
377    
378            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
379            for (i=0;i<amg->n;++i) {
380                if (amg->mask_C[i]>-1) {
381                     x[i]=amg->x_C[amg->mask_C[i]];
382                } else {
383                     x[i]=amg->x_F[amg->mask_F[i]];
384                }
385            }
386            
387       /*postsmoothing*/       /*postsmoothing*/
388       Paso_Solver_solveGS1(GS,x,b);  
389       if (GS->sweeps>1) {       #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
390             #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)       for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];
391             for (i=0;i<GS->n*GS->n_block;++i) bold[i]=b[i];      
392                   /*r=b-Ax */
393             while(GS->sweeps>1) {       Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);
394                 #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)       Paso_Solver_solveJacobi(amg->GS,x0,r);
395                 for (i=0;i<GS->n*GS->n_block;++i) bnew[i]=bold[i]+b[i];      
396                  /* Compute the residual b=b-Ax*/       #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
397                 Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(DBLE(-1), amg->A, x, DBLE(1), bnew);       for (i=0;i<amg->n;++i) x[i]+=x0[i];
398                 /* Go round again*/      
399                 Paso_Solver_solveGS(GS,x,bnew);       /*
400                 #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)       #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
401                 for (i=0;i<GS->n*GS->n_block;++i) bold[i]=bnew[i];       for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];
402                 GS->sweeps=GS->sweeps-1;      
403             }       Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);
404             }       Paso_Solver_solveJacobi(amg->GS,x0,r);
405        
406         #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
407         for (i=0;i<amg->n;++i) {
408          x[i]+=x0[i];
409         }
410         */
411       /*end of postsmoothing*/       /*end of postsmoothing*/
412            
      Paso_Solver_GS_free(GS);  
413       }       }
414       MEMFREE(r);       MEMFREE(r);
415       MEMFREE(bold);       MEMFREE(x0);
      MEMFREE(bnew);  
416      return;      return;
417  }  }
418    

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