/[escript]/trunk/paso/src/Solver_AMG.c
ViewVC logotype

Diff of /trunk/paso/src/Solver_AMG.c

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

revision 1931 by artak, Mon Oct 27 01:31:28 2008 UTC revision 2507 by artak, Thu Jul 2 03:14:35 2009 UTC
# Line 14  Line 14 
14    
15  /**************************************************************/  /**************************************************************/
16    
17  /* Paso: AMG preconditioner with reordering                 */  /* Paso: AMG preconditioner                                  */
18    
19  /**************************************************************/  /**************************************************************/
20    
# Line 24  Line 24 
24    
25  #include "Paso.h"  #include "Paso.h"
26  #include "Solver.h"  #include "Solver.h"
27    #include "Options.h"
28  #include "PasoUtil.h"  #include "PasoUtil.h"
29  #include "UMFPACK.h"  #include "UMFPACK.h"
30    #include "MKL.h"
31    #include "SystemMatrix.h"
32  #include "Pattern_coupling.h"  #include "Pattern_coupling.h"
33    
34  /**************************************************************/  /**************************************************************/
# Line 35  Line 38 
38  void Paso_Solver_AMG_free(Paso_Solver_AMG * in) {  void Paso_Solver_AMG_free(Paso_Solver_AMG * in) {
39       if (in!=NULL) {       if (in!=NULL) {
40          Paso_Solver_AMG_free(in->AMG_of_Schur);          Paso_Solver_AMG_free(in->AMG_of_Schur);
41            Paso_Solver_Jacobi_free(in->GS);
42          MEMFREE(in->inv_A_FF);          MEMFREE(in->inv_A_FF);
43          MEMFREE(in->A_FF_pivot);          MEMFREE(in->A_FF_pivot);
44          Paso_SparseMatrix_free(in->A_FC);          Paso_SparseMatrix_free(in->A_FC);
# Line 70  to Line 74  to
74     then AMG is applied to S again until S becomes empty     then AMG is applied to S again until S becomes empty
75    
76  */  */
77  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso_SparseMatrix *A_p,bool_t verbose,dim_t level) {  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso_SparseMatrix *A_p,bool_t verbose,dim_t level, double coarsening_threshold, dim_t coarsening_method) {
78    Paso_Solver_AMG* out=NULL;    Paso_Solver_AMG* out=NULL;
79    dim_t n=A_p->numRows;    dim_t n=A_p->numRows;
80    dim_t n_block=A_p->row_block_size;    dim_t n_block=A_p->row_block_size;
81    index_t* mis_marker=NULL;      index_t* mis_marker=NULL;  
82    index_t* counter=NULL;    index_t* counter=NULL;
83    index_t iPtr,*index, *where_p, iPtr_s;    index_t iPtr,*index, *where_p, iPtr_s;
84    dim_t i,k,j,j0;    dim_t i,k,j;
85    Paso_SparseMatrix * schur=NULL;    Paso_SparseMatrix * schur=NULL;
86    Paso_SparseMatrix * schur_withFillIn=NULL;    Paso_SparseMatrix * schur_withFillIn=NULL;
87    double time0,time1,time2,S;    double S=0;
88      double time0;
89      
90      /*Make sure we have block sizes 1*/
91      A_p->pattern->input_block_size=A_p->col_block_size;
92      A_p->pattern->output_block_size=A_p->row_block_size;
93      A_p->pattern->block_size=A_p->block_size;
94        
95    /* identify independend set of rows/columns */    /* identify independend set of rows/columns */
96    mis_marker=TMPMEMALLOC(n,index_t);    mis_marker=TMPMEMALLOC(n,index_t);
# Line 99  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 109  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
109    out->b_F=NULL;    out->b_F=NULL;
110    out->x_C=NULL;    out->x_C=NULL;
111    out->b_C=NULL;    out->b_C=NULL;
112      out->GS=NULL;
113    out->A=Paso_SparseMatrix_getReference(A_p);    out->A=Paso_SparseMatrix_getReference(A_p);
114      /*out->GS=Paso_Solver_getGS(A_p,verbose);*/
115      out->GS=Paso_Solver_getJacobi(A_p);
116      /*out->GS->sweeps=2;*/
117    out->level=level;    out->level=level;
118      
119    if ( !(Paso_checkPtr(mis_marker) || Paso_checkPtr(out) || Paso_checkPtr(counter) ) ) {    if ( !(Paso_checkPtr(mis_marker) || Paso_checkPtr(out) || Paso_checkPtr(counter) || level==0 ) ) {
120       /* identify independend set of rows/columns */       /* identify independend set of rows/columns */
      time0=Paso_timer();  
121       #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)       #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
122       for (i=0;i<n;++i) mis_marker[i]=-1;       for (i=0;i<n;++i) mis_marker[i]=-1;
123       Paso_Pattern_RS(A_p,mis_marker,0.25);      
124       /*Paso_Pattern_coup(A_p,mis_marker,0.05);*/       time0=Paso_timer();
125       time2=Paso_timer()-time0;  
126       if (Paso_noError()) {       if (coarsening_method == PASO_YAIR_SHAPIRA_COARSENING) {
127          Paso_Pattern_coup(A_p,mis_marker,coarsening_threshold);
128         }
129         else if (coarsening_method == PASO_RUGE_STUEBEN_COARSENING) {
130          Paso_Pattern_RS(A_p,mis_marker,coarsening_threshold);
131         }
132         else if (coarsening_method == PASO_AGGREGATION_COARSENING) {
133          Paso_Pattern_Aggregiation(A_p,mis_marker,coarsening_threshold);
134         }
135         else {
136          /*Default coarseneing*/
137          Paso_Pattern_RS(A_p,mis_marker,coarsening_threshold);
138         }
139        
140         time0=Paso_timer()-time0;
141         if (verbose) fprintf(stderr,"timing: Coarseneing: %e\n",time0);
142        if (Paso_noError()) {
143          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
144          for (i = 0; i < n; ++i) counter[i]=mis_marker[i];          for (i = 0; i < n; ++i) counter[i]=mis_marker[i];
145          out->n=n;          out->n=n;
# Line 121  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 150  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
150          out->inv_A_FF=MEMALLOC(n_block*n_block*out->n_F,double);          out->inv_A_FF=MEMALLOC(n_block*n_block*out->n_F,double);
151          out->A_FF_pivot=NULL; /* later use for block size>3 */          out->A_FF_pivot=NULL; /* later use for block size>3 */
152          if (! (Paso_checkPtr(out->mask_F) || Paso_checkPtr(out->inv_A_FF) || Paso_checkPtr(out->rows_in_F) ) ) {          if (! (Paso_checkPtr(out->mask_F) || Paso_checkPtr(out->inv_A_FF) || Paso_checkPtr(out->rows_in_F) ) ) {
            #pragma omp parallel  
            {  
153                /* creates an index for F from mask */                /* creates an index for F from mask */
154                #pragma omp for private(i) schedule(static)                #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
155                for (i = 0; i < out->n_F; ++i) out->rows_in_F[i]=-1;                for (i = 0; i < out->n_F; ++i) out->rows_in_F[i]=-1;
156                #pragma omp for private(i) schedule(static)                #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
157                for (i = 0; i < n; ++i) {                for (i = 0; i < n; ++i) {
158                   if  (mis_marker[i]) {                   if  (mis_marker[i]) {
159                          out->rows_in_F[counter[i]]=i;                          out->rows_in_F[counter[i]]=i;
# Line 135  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 162  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
162                          out->mask_F[i]=-1;                          out->mask_F[i]=-1;
163                   }                   }
164                }                }
165                /* Compute row-sum for getting rs(A_FF)*/                
166                #pragma omp for private(i,iPtr) schedule(static)                /* Compute row-sum for getting rs(A_FF)^-1*/
167                  #pragma omp parallel for private(i,iPtr,j,S) schedule(static)
168                for (i = 0; i < out->n_F; ++i) {                for (i = 0; i < out->n_F; ++i) {
169                  out->inv_A_FF[i]=0;                  S=0;
170                  for (iPtr=A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]];iPtr<A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i] + 1]; ++iPtr) {                  for (iPtr=A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]];iPtr<A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i] + 1]; ++iPtr) {
171                   out->inv_A_FF[i]+=A_p->val[iPtr];                   j=A_p->pattern->index[iPtr];
172                     if (mis_marker[j])
173                         S+=A_p->val[iPtr];
174                  }                  }
175                    out->inv_A_FF[i]=1./S;
176                }                }
177    
               #pragma omp for private(i, where_p,iPtr,index) schedule(static)  
               for (i = 0; i < out->n_F; i++) {  
                 /* find main diagonal */  
                 iPtr=A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]];  
                 index=&(A_p->pattern->index[iPtr]);  
                 where_p=(index_t*)bsearch(&out->rows_in_F[i],  
                                         index,  
                                         A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i] + 1]-A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]],  
                                         sizeof(index_t),  
                                         Paso_comparIndex);  
                 if (where_p==NULL) {  
                     Paso_setError(VALUE_ERROR, "Paso_Solver_getAMG: main diagonal element missing.");  
                 } else {  
                     iPtr+=(index_t)(where_p-index);  
                     /* get inverse of A_FF block: */  
                       S=out->inv_A_FF[i];  
                       if (ABS(A_p->val[iPtr])>0.) {  
                             if(ABS(S)>0.)  
                                out->inv_A_FF[i]=1./S;  
 /*                            else  
                             {  
                                fprintf(stderr,"ROWSUM OF ROW %d is 0\n",out->rows_in_F[i]);  
                                S=0;  
                                for (iPtr=A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]];iPtr<A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i] + 1]; ++iPtr) {  
                                if(A_p->val[iPtr]!=0) {  
                                 fprintf(stderr,"A_p[%d,%d]=%f ",out->rows_in_F[i],A_p->pattern->index[iPtr],A_p->val[iPtr]);  
                                 S+=A_p->val[iPtr];  
                                }  
                               }  
                               fprintf(stderr,"\n SUMMMMMMM %f\n",S);  
                             }  
 */                      } else {  
                             Paso_setError(ZERO_DIVISION_ERROR, "Paso_Solver_getAMG: Break-down in AMG decomposition: non-regular main diagonal block.");  
                       }  
                 }  
               }  
            } /* end parallel region */  
   
178             if( Paso_noError()) {             if( Paso_noError()) {
179                /* if there are no nodes in the coarse level there is no more work to do */                /* if there are no nodes in the coarse level there is no more work to do */
180                out->n_C=n-out->n_F;                out->n_C=n-out->n_F;
181                 if (level>0) {                if (level>0 && out->n_C>500) {
182                   /*if (out->n_F>500) {*/
183                     out->rows_in_C=MEMALLOC(out->n_C,index_t);                     out->rows_in_C=MEMALLOC(out->n_C,index_t);
184                     out->mask_C=MEMALLOC(n,index_t);                     out->mask_C=MEMALLOC(n,index_t);
185                     if (! (Paso_checkPtr(out->mask_C) || Paso_checkPtr(out->rows_in_C) ) ) {                     if (! (Paso_checkPtr(out->mask_C) || Paso_checkPtr(out->rows_in_C) ) ) {
# Line 193  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 187  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
187                         #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)                         #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
188                         for (i = 0; i < n; ++i) counter[i]=! mis_marker[i];                         for (i = 0; i < n; ++i) counter[i]=! mis_marker[i];
189                         Paso_Util_cumsum(n,counter);                         Paso_Util_cumsum(n,counter);
190                         #pragma omp parallel                            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
                        {  
                           #pragma omp for private(i) schedule(static)  
191                            for (i = 0; i < out->n_C; ++i) out->rows_in_C[i]=-1;                            for (i = 0; i < out->n_C; ++i) out->rows_in_C[i]=-1;
192                            #pragma omp for private(i) schedule(static)                            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
193                            for (i = 0; i < n; ++i) {                            for (i = 0; i < n; ++i) {
194                               if  (! mis_marker[i]) {                               if  (! mis_marker[i]) {
195                                  out->rows_in_C[counter[i]]=i;                                  out->rows_in_C[counter[i]]=i;
# Line 206  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 198  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
198                                  out->mask_C[i]=-1;                                  out->mask_C[i]=-1;
199                               }                               }
200                            }                            }
                       } /* end parallel region */  
201                        /* get A_CF block: */                        /* get A_CF block: */
202                        out->A_CF=Paso_SparseMatrix_getSubmatrix(A_p,out->n_C,out->n_F,out->rows_in_C,out->mask_F);                        out->A_CF=Paso_SparseMatrix_getSubmatrix(A_p,out->n_C,out->n_F,out->rows_in_C,out->mask_F);
203                        if (Paso_noError()) {                        if (Paso_noError()) {
# Line 215  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 206  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
206                           /* get A_CC block: */                           /* get A_CC block: */
207                           if (Paso_noError()) {                           if (Paso_noError()) {
208                              schur=Paso_SparseMatrix_getSubmatrix(A_p,out->n_C,out->n_C,out->rows_in_C,out->mask_C);                              schur=Paso_SparseMatrix_getSubmatrix(A_p,out->n_C,out->n_C,out->rows_in_C,out->mask_C);
                               
209                              /*find the pattern of the schur complement with fill in*/                              /*find the pattern of the schur complement with fill in*/
210        
211                                time0=Paso_timer();
212                              schur_withFillIn=Paso_SparseMatrix_alloc(A_p->type,Paso_Pattern_binop(PATTERN_FORMAT_DEFAULT, schur->pattern, Paso_Pattern_multiply(PATTERN_FORMAT_DEFAULT,out->A_CF->pattern,out->A_FC->pattern)),1,1);                              schur_withFillIn=Paso_SparseMatrix_alloc(A_p->type,Paso_Pattern_binop(PATTERN_FORMAT_DEFAULT, schur->pattern, Paso_Pattern_multiply(PATTERN_FORMAT_DEFAULT,out->A_CF->pattern,out->A_FC->pattern)),1,1);
213                                time0=Paso_timer()-time0;
214                                if (verbose) fprintf(stderr,"timing: Fill_in pattern computation: %e\n",time0);
215        
216                                time0=Paso_timer();
217                              /* copy values over*/                              /* copy values over*/
218                              #pragma omp for private(i,iPtr,iPtr_s,j,j0) schedule(static)                              #pragma omp parallel for private(i,iPtr,j,iPtr_s,index,where_p) schedule(static)
219                              for (i = 0; i < schur_withFillIn->numRows; ++i) {                              for (i = 0; i < schur_withFillIn->numRows; ++i) {
220                                for (iPtr=schur_withFillIn->pattern->ptr[i];iPtr<schur_withFillIn->pattern->ptr[i + 1]; ++iPtr) {                                for (iPtr=schur_withFillIn->pattern->ptr[i];iPtr<schur_withFillIn->pattern->ptr[i + 1]; ++iPtr) {
221                                  j=schur_withFillIn->pattern->index[iPtr];                                  j=schur_withFillIn->pattern->index[iPtr];
222                                    iPtr_s=schur->pattern->ptr[i];
223                                  schur_withFillIn->val[iPtr]=0.;                                  schur_withFillIn->val[iPtr]=0.;
224                                  for (iPtr_s=schur->pattern->ptr[i];iPtr_s<schur->pattern->ptr[i + 1]; ++iPtr_s){                                  index=&(schur->pattern->index[iPtr_s]);
225                                      j0=schur->pattern->index[iPtr_s];                                  where_p=(index_t*)bsearch(&j,
226                                      if (j==j0) {                                          index,
227                                        schur_withFillIn->val[iPtr]=schur->val[iPtr_s];                                          schur->pattern->ptr[i + 1]-schur->pattern->ptr[i],
228                                        break;                                          sizeof(index_t),
229                                      }                                          Paso_comparIndex);
230                                    if (where_p!=NULL) {
231                                        schur_withFillIn->val[iPtr]=schur->val[iPtr_s+(index_t)(where_p-index)];
232                                  }                                  }
233                                }                                }
234                              }                              }
235                             time0=Paso_timer()-time0;                              time0=Paso_timer()-time0;
236                                                          if (verbose) fprintf(stderr,"timing: Copying values for Fill in: %e\n",time0);
237                                    
238                              if (Paso_noError()) {                              if (Paso_noError()) {
                                 time1=Paso_timer();  
                                 /* update A_CC block to get Schur complement and then apply AMG to it */  
239                                  Paso_Solver_updateIncompleteSchurComplement(schur_withFillIn,out->A_CF,out->inv_A_FF,out->A_FF_pivot,out->A_FC);                                  Paso_Solver_updateIncompleteSchurComplement(schur_withFillIn,out->A_CF,out->inv_A_FF,out->A_FF_pivot,out->A_FC);
240                                  time1=Paso_timer()-time1;                                  out->AMG_of_Schur=Paso_Solver_getAMG(schur_withFillIn,verbose,level-1,coarsening_threshold,coarsening_method);
241                                  out->AMG_of_Schur=Paso_Solver_getAMG(schur_withFillIn,verbose,level-1);                                  Paso_SparseMatrix_free(schur);
                                   
                                 /*Paso_SparseMatrix_free(schur);*/  
                                 /* Paso_SparseMatrix_free(schur_withFillIn);*/  
242                              }                              }
243                              /* allocate work arrays for AMG application */                              /* allocate work arrays for AMG application */
244                              if (Paso_noError()) {                              if (Paso_noError()) {
# Line 254  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 248  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
248                                out->b_C=MEMALLOC(n_block*out->n_C,double);                                out->b_C=MEMALLOC(n_block*out->n_C,double);
249    
250                                if (! (Paso_checkPtr(out->x_F) || Paso_checkPtr(out->b_F) || Paso_checkPtr(out->x_C) || Paso_checkPtr(out->b_C) ) ) {                                if (! (Paso_checkPtr(out->x_F) || Paso_checkPtr(out->b_F) || Paso_checkPtr(out->x_C) || Paso_checkPtr(out->b_C) ) ) {
251                                    #pragma omp parallel                                      #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)
                                   {  
                                     #pragma omp for private(i,k) schedule(static)  
252                                      for (i = 0; i < out->n_F; ++i) {                                      for (i = 0; i < out->n_F; ++i) {
253                                            for (k=0; k<n_block;++k) {                                            for (k=0; k<n_block;++k) {
254                                               out->x_F[i*n_block+k]=0.;                                               out->x_F[i*n_block+k]=0.;
255                                               out->b_F[i*n_block+k]=0.;                                               out->b_F[i*n_block+k]=0.;
256                                            }                                            }
257                                      }                                      }
258                                      #pragma omp for private(i,k) schedule(static)                                      #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)
259                                      for (i = 0; i < out->n_C; ++i) {                                      for (i = 0; i < out->n_C; ++i) {
260                                          for (k=0; k<n_block;++k) {                                          for (k=0; k<n_block;++k) {
261                                            out->x_C[i*n_block+k]=0.;                                            out->x_C[i*n_block+k]=0.;
262                                            out->b_C[i*n_block+k]=0.;                                            out->b_C[i*n_block+k]=0.;
263                                          }                                          }
264                                      }                                      }
                                   } /* end parallel region */  
265                                }                                }
266                              }                              }
267                           }                           }
# Line 284  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 275  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
275    TMPMEMFREE(mis_marker);    TMPMEMFREE(mis_marker);
276    TMPMEMFREE(counter);    TMPMEMFREE(counter);
277    if (Paso_noError()) {    if (Paso_noError()) {
278        if (verbose) {        if (verbose && level>0) {
279           printf("AMG: %d unknowns eliminated. %d left.\n",out->n_F,n-out->n_F);           printf("AMG: %d unknowns eliminated. %d left.\n",out->n_F,out->n_C);
          if (out->n_C>0) {  
             printf("timing: AMG: MIS/reordering/elemination : %e/%e/%e\n",time2,time0,time1);  
          } else {  
             printf("timing: AMG: MIS: %e\n",time2);  
          }  
280       }       }
281       return out;       return out;
282    } else  {    } else  {
# Line 305  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 291  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
291    
292       in fact it solves       in fact it solves
293    
294    [      I         0  ]  [ A_FF 0 ] [ I    invA_FF*A_FF ]  [ x_F ]  = [b_F]    [      I         0  ]  [ A_FF 0 ] [ I    invA_FF*A_FC ]  [ x_F ]  = [b_F]
295    [ A_CF*invA_FF   I  ]  [   0  S ] [ 0          I      ]  [ x_C ]  = [b_C]    [ A_CF*invA_FF   I  ]  [   0  S ] [ 0          I      ]  [ x_C ]  = [b_C]
296    
297   in the form   in the form
# Line 324  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 310  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
310  */  */
311    
312  void Paso_Solver_solveAMG(Paso_Solver_AMG * amg, double * x, double * b) {  void Paso_Solver_solveAMG(Paso_Solver_AMG * amg, double * x, double * b) {
313       dim_t i,k,oldsweeps;       dim_t i;
      dim_t n_block=amg->n_block;  
314       double *r=MEMALLOC(amg->n,double);       double *r=MEMALLOC(amg->n,double);
315       Paso_Solver_GS* GS=NULL;       double *x0=MEMALLOC(amg->n,double);
316       double *bold=MEMALLOC(amg->n*amg->n_block,double);       double time0=0;
317       double *bnew=MEMALLOC(amg->n*amg->n_block,double);       bool_t verbose=1;
318        
319         #ifdef MKL
320         Paso_SparseMatrix *temp=NULL;
321         #endif
322            
323       if (amg->level==0) {      
324          Paso_UMFPACK1(amg->A,x,b,1);       if (amg->level==0  || amg->n_C<=500) {
325          
326         /*if (amg->n_F<=500) {*/
327          time0=Paso_timer();
328          
329            
330           /* Paso_Solver_solveJacobi(amg->GS,x,b);*/
331            
332            /* #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
333            for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];
334            Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);
335            Paso_Solver_solveGS(amg->GS,x0,r);
336            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
337            for (i=0;i<amg->n;++i) {
338             x[i]+=x0[i];
339            }
340            */
341          
342           #ifdef MKL
343            /*dim_t iptr;
344            temp=Paso_SparseMatrix_alloc(MATRIX_FORMAT_BLK1 + MATRIX_FORMAT_OFFSET1, amg->A->pattern,1,1);
345            #pragma omp parallel for private(i,iptr) schedule(static)
346            for (i=0;i<amg->A->numRows;++i) {
347             for (iptr=amg->A->pattern->ptr[i];iptr<amg->A->pattern->ptr[i+1]; ++iptr)
348                 temp->val[iptr]=amg->A->val[iptr];
349            }*/
350            temp=Paso_SparseMatrix_alloc(MATRIX_FORMAT_BLK1 + MATRIX_FORMAT_OFFSET1, amg->A->pattern,1,1);
351            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
352            for (i=0;i<amg->A->len;++i) {
353                 temp->val[i]=amg->A->val[i];
354            }
355            Paso_MKL1(temp,x,b,0);
356            Paso_SparseMatrix_free(temp);
357           #else
358            #ifdef UMFPACK
359             Paso_UMFPACK1(amg->A,x,b,0);
360            #else
361            Paso_Solver_solveJacobi(amg->GS,x,b);
362            #endif
363           #endif
364          
365           time0=Paso_timer()-time0;
366           if (verbose) fprintf(stderr,"timing: DIRECT SOLVER: %e\n\n\n",time0);
367          
368       } else {       } else {
   
369          /* presmoothing */          /* presmoothing */
370           GS=Paso_Solver_getGS(amg->A,-1);           time0=Paso_timer();
371           Paso_Solver_solveGS(GS,x,b);           Paso_Solver_solveJacobi(amg->GS,x,b);
372           oldsweeps=GS->sweeps;           time0=Paso_timer()-time0;
373           if (GS->sweeps>1) {           if (verbose) fprintf(stderr,"timing: Presmooting: %e\n",time0);
374                       /* #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
375             #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)           for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];
            for (i=0;i<GS->n*GS->n_block;++i) bold[i]=b[i];  
             
            while(GS->sweeps>1) {  
                #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)  
                for (i=0;i<GS->n*GS->n_block;++i) bnew[i]=bold[i]+b[i];  
                 /* Compute the residual b=b-Ax*/  
                Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(DBLE(-1), amg->A, x, DBLE(1), bnew);  
                /* Go round again*/  
                Paso_Solver_solveGS(GS,x,bnew);  
                #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)  
                for (i=0;i<GS->n*GS->n_block;++i) bold[i]=bnew[i];  
                GS->sweeps=GS->sweeps-1;  
            }  
            }  
            GS->sweeps=oldsweeps;  
         /* end of presmoothing */  
376    
377              Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);
378              Paso_Solver_solveJacobi(amg->GS,x0,r);
379              
380              #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
381              for (i=0;i<amg->n;++i) {
382               x[i]+=x0[i];
383              }
384             */
385            /* end of presmoothing */
386            
387            
388             time0=Paso_timer();
389           #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)           #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
390           for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];           for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];
391                    
392           /*r=b-Ax*/           /*r=b-Ax*/
393           Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);           Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);
394          
395          /* b->[b_F,b_C]     */          /* b->[b_F,b_C]     */
396          if (n_block==1) {          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
397             #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)          for (i=0;i<amg->n_F;++i) amg->b_F[i]=r[amg->rows_in_F[i]];
398             for (i=0;i<amg->n_F;++i) amg->b_F[i]=r[amg->rows_in_F[i]];            
399            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
400             for (i=0;i<amg->n_C;++i) amg->b_C[i]=r[amg->rows_in_C[i]];          for (i=0;i<amg->n_C;++i) amg->b_C[i]=r[amg->rows_in_C[i]];
         } else {  
            #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n_F;++i)  
                  for (k=0;k<n_block;k++) amg->b_F[amg->n_block*i+k]=r[n_block*amg->rows_in_F[i]+k];  
            #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n_C;++i)  
                  for (k=0;k<n_block;k++) amg->b_C[amg->n_block*i+k]=r[n_block*amg->rows_in_C[i]+k];  
         }  
401    
402          /* x_F=invA_FF*b_F  */          /* x_F=invA_FF*b_F  */
403          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(n_block,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->x_F,amg->b_F);          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(1,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->x_F,amg->b_F);
404                    
405          /* b_C=b_C-A_CF*x_F */          /* b_C=b_C-A_CF*x_F */
406          Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_CF,amg->x_F,1.,amg->b_C);          Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_CF,amg->x_F,1.,amg->b_C);
407                    
408            time0=Paso_timer()-time0;
409            if (verbose) fprintf(stderr,"timing: Before next level: %e\n",time0);
410            
411          /* x_C=AMG(b_C)     */          /* x_C=AMG(b_C)     */
412          Paso_Solver_solveAMG(amg->AMG_of_Schur,amg->x_C,amg->b_C);          Paso_Solver_solveAMG(amg->AMG_of_Schur,amg->x_C,amg->b_C);
413                    
414            time0=Paso_timer();
415          /* b_F=b_F-A_FC*x_C */          /* b_F=b_F-A_FC*x_C */
416          Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_FC,amg->x_C,1.,amg->b_F);          Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_FC,amg->x_C,1.,amg->b_F);
417          /* x_F=invA_FF*b_F  */          /* x_F=invA_FF*b_F  */
418          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(n_block,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->x_F,amg->b_F);          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(1,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->x_F,amg->b_F);
419          /* x<-[x_F,x_C]     */          /* x<-[x_F,x_C]     */
420            
421          if (n_block==1) {          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
422             #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)          for (i=0;i<amg->n;++i) {
423             for (i=0;i<amg->n;++i) {              if (amg->mask_C[i]>-1) {
424                if (amg->mask_C[i]>-1) {                   x[i]=amg->x_C[amg->mask_C[i]];
425                    x[i]+=amg->x_C[amg->mask_C[i]];              } else {
426                } else {                   x[i]=amg->x_F[amg->mask_F[i]];
427                    x[i]+=amg->x_F[amg->mask_F[i]];              }
               }  
            }  
         } else {  
            #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n;++i) {  
                  if (amg->mask_C[i]>-1) {  
                      for (k=0;k<n_block;k++) x[n_block*i+k]+=amg->x_C[n_block*amg->mask_C[i]+k];  
                  } else {  
                      for (k=0;k<n_block;k++) x[n_block*i+k]+=amg->x_F[n_block*amg->mask_F[i]+k];  
                  }  
            }  
428          }          }
429            
430            time0=Paso_timer()-time0;
431            if (verbose) fprintf(stderr,"timing: After next level: %e\n",time0);
432    
433       /*postsmoothing*/       /*postsmoothing*/
434       Paso_Solver_solveGS1(GS,x,b);       time0=Paso_timer();
435       if (GS->sweeps>1) {       #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
436             #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)       for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];
437             for (i=0;i<GS->n*GS->n_block;++i) bold[i]=b[i];      
438                   /*r=b-Ax */
439             while(GS->sweeps>1) {       Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);
440                 #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)       Paso_Solver_solveJacobi(amg->GS,x0,r);
441                 for (i=0;i<GS->n*GS->n_block;++i) bnew[i]=bold[i]+b[i];      
442                  /* Compute the residual b=b-Ax*/       #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
443                 Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(DBLE(-1), amg->A, x, DBLE(1), bnew);       for (i=0;i<amg->n;++i) x[i]+=x0[i];
444                 /* Go round again*/      
445                 Paso_Solver_solveGS(GS,x,bnew);       time0=Paso_timer()-time0;
446                 #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)       if (verbose) fprintf(stderr,"timing: Postsmoothing: %e\n",time0);
447                 for (i=0;i<GS->n*GS->n_block;++i) bold[i]=bnew[i];       /*
448                 GS->sweeps=GS->sweeps-1;       #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
449             }       for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];
450             }      
451         Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);
452         Paso_Solver_solveJacobi(amg->GS,x0,r);
453        
454         #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
455         for (i=0;i<amg->n;++i) {
456          x[i]+=x0[i];
457         }
458         */
459       /*end of postsmoothing*/       /*end of postsmoothing*/
460            
      Paso_Solver_GS_free(GS);  
461       }       }
462       MEMFREE(r);       MEMFREE(r);
463       MEMFREE(bold);       MEMFREE(x0);
      MEMFREE(bnew);  
464      return;      return;
465  }  }
466    

Legend:
Removed from v.1931  
changed lines
  Added in v.2507

  ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.1.26