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revision 1931 by artak, Mon Oct 27 01:31:28 2008 UTC revision 2652 by artak, Mon Sep 7 05:04:45 2009 UTC
# Line 1  Line 1 
1    
2  /*******************************************************  /*******************************************************
3  *  *
4  * Copyright (c) 2003-2008 by University of Queensland  * Copyright (c) 2003-2009 by University of Queensland
5  * Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)  * Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)
6  * http://www.uq.edu.au/esscc  * http://www.uq.edu.au/esscc
7  *  *
# Line 14  Line 14 
14    
15  /**************************************************************/  /**************************************************************/
16    
17  /* Paso: AMG preconditioner with reordering                 */  /* Paso: AMG preconditioner                                  */
18    
19  /**************************************************************/  /**************************************************************/
20    
21  /* Author: artak@access.edu.au                                */  /* Author: artak@uq.edu.au                                */
22    
23  /**************************************************************/  /**************************************************************/
24    
25  #include "Paso.h"  #include "Paso.h"
26  #include "Solver.h"  #include "Solver.h"
27    #include "Options.h"
28  #include "PasoUtil.h"  #include "PasoUtil.h"
29  #include "UMFPACK.h"  #include "UMFPACK.h"
30    #include "MKL.h"
31    #include "SystemMatrix.h"
32  #include "Pattern_coupling.h"  #include "Pattern_coupling.h"
33    
34  /**************************************************************/  /**************************************************************/
# Line 35  Line 38 
38  void Paso_Solver_AMG_free(Paso_Solver_AMG * in) {  void Paso_Solver_AMG_free(Paso_Solver_AMG * in) {
39       if (in!=NULL) {       if (in!=NULL) {
40          Paso_Solver_AMG_free(in->AMG_of_Schur);          Paso_Solver_AMG_free(in->AMG_of_Schur);
41            Paso_Solver_Jacobi_free(in->GS);
42          MEMFREE(in->inv_A_FF);          MEMFREE(in->inv_A_FF);
43          MEMFREE(in->A_FF_pivot);          MEMFREE(in->A_FF_pivot);
44          Paso_SparseMatrix_free(in->A_FC);          Paso_SparseMatrix_free(in->A_FC);
45          Paso_SparseMatrix_free(in->A_CF);          Paso_SparseMatrix_free(in->A_CF);
46            Paso_SparseMatrix_free(in->A);
47          MEMFREE(in->rows_in_F);          MEMFREE(in->rows_in_F);
48          MEMFREE(in->rows_in_C);          MEMFREE(in->rows_in_C);
49          MEMFREE(in->mask_F);          MEMFREE(in->mask_F);
# Line 47  void Paso_Solver_AMG_free(Paso_Solver_AM Line 52  void Paso_Solver_AMG_free(Paso_Solver_AM
52          MEMFREE(in->b_F);          MEMFREE(in->b_F);
53          MEMFREE(in->x_C);          MEMFREE(in->x_C);
54          MEMFREE(in->b_C);          MEMFREE(in->b_C);
55            #ifdef MKL
56            #else
57               #ifdef UMFPACK
58               Paso_UMFPACK1_free((Paso_UMFPACK_Handler*)(in->solver));
59               #endif
60            #endif
61            in->solver=NULL;
62            MEMFREE(in->b_C);
63          MEMFREE(in);          MEMFREE(in);
64       }       }
65  }  }
# Line 70  to Line 83  to
83     then AMG is applied to S again until S becomes empty     then AMG is applied to S again until S becomes empty
84    
85  */  */
86  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso_SparseMatrix *A_p,bool_t verbose,dim_t level) {  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso_SparseMatrix *A_p,dim_t level,Paso_Options* options) {
87    Paso_Solver_AMG* out=NULL;    Paso_Solver_AMG* out=NULL;
88      Paso_Pattern* temp1=NULL;
89      Paso_Pattern* temp2=NULL;
90      bool_t verbose=options->verbose;
91    dim_t n=A_p->numRows;    dim_t n=A_p->numRows;
92    dim_t n_block=A_p->row_block_size;    dim_t n_block=A_p->row_block_size;
93    index_t* mis_marker=NULL;      index_t* mis_marker=NULL;  
94    index_t* counter=NULL;    index_t* counter=NULL;
95    index_t iPtr,*index, *where_p, iPtr_s;    index_t iPtr,*index, *where_p, iPtr_s;
96    dim_t i,k,j,j0;    dim_t i,k,j;
97    Paso_SparseMatrix * schur=NULL;    Paso_SparseMatrix * schur=NULL;
98    Paso_SparseMatrix * schur_withFillIn=NULL;    Paso_SparseMatrix * schur_withFillIn=NULL;
99    double time0,time1,time2,S;    double S=0;
100        
101      /*Make sure we have block sizes 1*/
102      if (A_p->col_block_size>1) {
103         Paso_setError(TYPE_ERROR,"Paso_Solver_getAMG: AMG requires column block size 1.");
104         return NULL;
105      }
106      if (A_p->row_block_size>1) {
107         Paso_setError(TYPE_ERROR,"Paso_Solver_getAMG: AMG requires row block size 1.");
108         return NULL;
109      }
110      out=MEMALLOC(1,Paso_Solver_AMG);
111    /* identify independend set of rows/columns */    /* identify independend set of rows/columns */
112    mis_marker=TMPMEMALLOC(n,index_t);    mis_marker=TMPMEMALLOC(n,index_t);
113    counter=TMPMEMALLOC(n,index_t);    counter=TMPMEMALLOC(n,index_t);
114    out=MEMALLOC(1,Paso_Solver_AMG);    if ( !( Paso_checkPtr(mis_marker) || Paso_checkPtr(counter) || Paso_checkPtr(out)) ) {
115    out->AMG_of_Schur=NULL;       out->AMG_of_Schur=NULL;
116    out->inv_A_FF=NULL;       out->inv_A_FF=NULL;
117    out->A_FF_pivot=NULL;       out->A_FF_pivot=NULL;
118    out->A_FC=NULL;       out->A_FC=NULL;
119    out->A_CF=NULL;       out->A_CF=NULL;
120    out->rows_in_F=NULL;       out->rows_in_F=NULL;
121    out->rows_in_C=NULL;       out->rows_in_C=NULL;
122    out->mask_F=NULL;       out->mask_F=NULL;
123    out->mask_C=NULL;       out->mask_C=NULL;
124    out->x_F=NULL;       out->x_F=NULL;
125    out->b_F=NULL;       out->b_F=NULL;
126    out->x_C=NULL;       out->x_C=NULL;
127    out->b_C=NULL;       out->b_C=NULL;
128    out->A=Paso_SparseMatrix_getReference(A_p);       out->GS=NULL;
129    out->level=level;       out->A=Paso_SparseMatrix_getReference(A_p);
130           out->GS=NULL;
131    if ( !(Paso_checkPtr(mis_marker) || Paso_checkPtr(out) || Paso_checkPtr(counter) ) ) {       out->solver=NULL;
132       /* identify independend set of rows/columns */       /*out->GS=Paso_Solver_getGS(A_p,verbose);*/
133       time0=Paso_timer();       out->level=level;
134       #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)      
135       for (i=0;i<n;++i) mis_marker[i]=-1;       if (level==0 || n<=options->min_coarse_matrix_size) {
136       Paso_Pattern_RS(A_p,mis_marker,0.25);           out->coarsest_level=TRUE;
137       /*Paso_Pattern_coup(A_p,mis_marker,0.05);*/           #ifdef MKL
138       time2=Paso_timer()-time0;           #else
139       if (Paso_noError()) {              #ifdef UMFPACK
140          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)              #else
141          for (i = 0; i < n; ++i) counter[i]=mis_marker[i];                  out->GS=Paso_Solver_getJacobi(A_p);
142          out->n=n;              #endif
143          out->n_block=n_block;           #endif
144          out->n_F=Paso_Util_cumsum(n,counter);       } else {
145          out->mask_F=MEMALLOC(n,index_t);           out->coarsest_level=FALSE;
146          out->rows_in_F=MEMALLOC(out->n_F,index_t);           out->GS=Paso_Solver_getJacobi(A_p);
147          out->inv_A_FF=MEMALLOC(n_block*n_block*out->n_F,double);  
148          out->A_FF_pivot=NULL; /* later use for block size>3 */           /* identify independend set of rows/columns */
149          if (! (Paso_checkPtr(out->mask_F) || Paso_checkPtr(out->inv_A_FF) || Paso_checkPtr(out->rows_in_F) ) ) {           #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
150             #pragma omp parallel           for (i=0;i<n;++i) mis_marker[i]=-1;
151             {  
152             if (options->coarsening_method == PASO_YAIR_SHAPIRA_COARSENING) {
153                  Paso_Pattern_YS(A_p,mis_marker,options->coarsening_threshold);
154             }
155             else if (options->coarsening_method == PASO_RUGE_STUEBEN_COARSENING) {
156                  Paso_Pattern_RS(A_p,mis_marker,options->coarsening_threshold);
157             }
158             else if (options->coarsening_method == PASO_AGGREGATION_COARSENING) {
159                 Paso_Pattern_Aggregiation(A_p,mis_marker,options->coarsening_threshold);
160            }
161            else {
162               /*Default coarseneing*/
163                /*Paso_Pattern_RS(A_p,mis_marker,options->coarsening_threshold);*/
164                Paso_Pattern_YS(A_p,mis_marker,options->coarsening_threshold);
165                 /*Paso_Pattern_Aggregiation(A_p,mis_marker,options->coarsening_threshold);*/
166            }
167        
168            if (Paso_noError()) {
169               #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
170               for (i = 0; i < n; ++i) counter[i]=mis_marker[i];
171    
172               out->n=n;
173               out->n_block=n_block;
174               out->n_F=Paso_Util_cumsum(n,counter);
175               out->mask_F=MEMALLOC(n,index_t);
176               out->rows_in_F=MEMALLOC(out->n_F,index_t);
177               out->inv_A_FF=MEMALLOC(n_block*n_block*out->n_F,double);
178               out->A_FF_pivot=NULL; /* later use for block size>3 */
179               if (! (Paso_checkPtr(out->mask_F) || Paso_checkPtr(out->inv_A_FF) || Paso_checkPtr(out->rows_in_F) ) ) {
180                /* creates an index for F from mask */                /* creates an index for F from mask */
181                #pragma omp for private(i) schedule(static)                #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
182                for (i = 0; i < out->n_F; ++i) out->rows_in_F[i]=-1;                for (i = 0; i < out->n_F; ++i) out->rows_in_F[i]=-1;
183                #pragma omp for private(i) schedule(static)                #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
184                for (i = 0; i < n; ++i) {                for (i = 0; i < n; ++i) {
185                   if  (mis_marker[i]) {                   if  (mis_marker[i]) {
186                          out->rows_in_F[counter[i]]=i;                          out->rows_in_F[counter[i]]=i;
# Line 135  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 189  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
189                          out->mask_F[i]=-1;                          out->mask_F[i]=-1;
190                   }                   }
191                }                }
192                /* Compute row-sum for getting rs(A_FF)*/                
193                #pragma omp for private(i,iPtr) schedule(static)                /* Compute row-sum for getting rs(A_FF)^-1*/
194                  #pragma omp parallel for private(i,iPtr,j,S) schedule(static)
195                for (i = 0; i < out->n_F; ++i) {                for (i = 0; i < out->n_F; ++i) {
196                  out->inv_A_FF[i]=0;                  S=0;
197    /*printf("%d : %d -> ",i, out->rows_in_F[i]);*/
198                  for (iPtr=A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]];iPtr<A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i] + 1]; ++iPtr) {                  for (iPtr=A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]];iPtr<A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i] + 1]; ++iPtr) {
199                   out->inv_A_FF[i]+=A_p->val[iPtr];                   j=A_p->pattern->index[iPtr];
200    /*if (j==out->rows_in_F[i]) printf("diagonal %e",A_p->val[iPtr]);*/
201                     if (mis_marker[j] && j==out->rows_in_F[i])
202                         S=A_p->val[iPtr];
203                  }                  }
204    /*printf("-> %e\n",S);*/
205                    out->inv_A_FF[i]=1./S;
206                }                }
207               }
208            }
209    
210                #pragma omp for private(i, where_p,iPtr,index) schedule(static)          if ( Paso_noError()) {
               for (i = 0; i < out->n_F; i++) {  
                 /* find main diagonal */  
                 iPtr=A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]];  
                 index=&(A_p->pattern->index[iPtr]);  
                 where_p=(index_t*)bsearch(&out->rows_in_F[i],  
                                         index,  
                                         A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i] + 1]-A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]],  
                                         sizeof(index_t),  
                                         Paso_comparIndex);  
                 if (where_p==NULL) {  
                     Paso_setError(VALUE_ERROR, "Paso_Solver_getAMG: main diagonal element missing.");  
                 } else {  
                     iPtr+=(index_t)(where_p-index);  
                     /* get inverse of A_FF block: */  
                       S=out->inv_A_FF[i];  
                       if (ABS(A_p->val[iPtr])>0.) {  
                             if(ABS(S)>0.)  
                                out->inv_A_FF[i]=1./S;  
 /*                            else  
                             {  
                                fprintf(stderr,"ROWSUM OF ROW %d is 0\n",out->rows_in_F[i]);  
                                S=0;  
                                for (iPtr=A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i]];iPtr<A_p->pattern->ptr[out->rows_in_F[i] + 1]; ++iPtr) {  
                                if(A_p->val[iPtr]!=0) {  
                                 fprintf(stderr,"A_p[%d,%d]=%f ",out->rows_in_F[i],A_p->pattern->index[iPtr],A_p->val[iPtr]);  
                                 S+=A_p->val[iPtr];  
                                }  
                               }  
                               fprintf(stderr,"\n SUMMMMMMM %f\n",S);  
                             }  
 */                      } else {  
                             Paso_setError(ZERO_DIVISION_ERROR, "Paso_Solver_getAMG: Break-down in AMG decomposition: non-regular main diagonal block.");  
                       }  
                 }  
               }  
            } /* end parallel region */  
   
            if( Paso_noError()) {  
211                /* if there are no nodes in the coarse level there is no more work to do */                /* if there are no nodes in the coarse level there is no more work to do */
212                out->n_C=n-out->n_F;                out->n_C=n-out->n_F;
213                 if (level>0) {              
214                     out->rows_in_C=MEMALLOC(out->n_C,index_t);               /*if (out->n_F>500) */
215                     out->mask_C=MEMALLOC(n,index_t);                out->rows_in_C=MEMALLOC(out->n_C,index_t);
216                     if (! (Paso_checkPtr(out->mask_C) || Paso_checkPtr(out->rows_in_C) ) ) {                out->mask_C=MEMALLOC(n,index_t);
217                         /* creates an index for C from mask */                if (! (Paso_checkPtr(out->mask_C) || Paso_checkPtr(out->rows_in_C) ) ) {
218                         #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)                     /* creates an index for C from mask */
219                         for (i = 0; i < n; ++i) counter[i]=! mis_marker[i];                     #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
220                         Paso_Util_cumsum(n,counter);                     for (i = 0; i < n; ++i) counter[i]=! mis_marker[i];
221                         #pragma omp parallel                     Paso_Util_cumsum(n,counter);
222                         {                     #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
223                            #pragma omp for private(i) schedule(static)                     for (i = 0; i < out->n_C; ++i) out->rows_in_C[i]=-1;
224                            for (i = 0; i < out->n_C; ++i) out->rows_in_C[i]=-1;                     #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
225                            #pragma omp for private(i) schedule(static)                     for (i = 0; i < n; ++i) {
226                            for (i = 0; i < n; ++i) {                              if  (! mis_marker[i]) {
                              if  (! mis_marker[i]) {  
227                                  out->rows_in_C[counter[i]]=i;                                  out->rows_in_C[counter[i]]=i;
228                                  out->mask_C[i]=counter[i];                                  out->mask_C[i]=counter[i];
229                               } else {                               } else {
230                                  out->mask_C[i]=-1;                                  out->mask_C[i]=-1;
231                               }                               }
232                            }                     }
233                        } /* end parallel region */                }
234                        /* get A_CF block: */          }
235                        out->A_CF=Paso_SparseMatrix_getSubmatrix(A_p,out->n_C,out->n_F,out->rows_in_C,out->mask_F);          if ( Paso_noError()) {
236                        if (Paso_noError()) {                  /* get A_CF block: */
237                           /* get A_FC block: */                  out->A_CF=Paso_SparseMatrix_getSubmatrix(A_p,out->n_C,out->n_F,out->rows_in_C,out->mask_F);
238                           out->A_FC=Paso_SparseMatrix_getSubmatrix(A_p,out->n_F,out->n_C,out->rows_in_F,out->mask_C);                  /* get A_FC block: */
239                           /* get A_CC block: */                  out->A_FC=Paso_SparseMatrix_getSubmatrix(A_p,out->n_F,out->n_C,out->rows_in_F,out->mask_C);
240                           if (Paso_noError()) {                  /* get A_CC block: */
241                              schur=Paso_SparseMatrix_getSubmatrix(A_p,out->n_C,out->n_C,out->rows_in_C,out->mask_C);                  schur=Paso_SparseMatrix_getSubmatrix(A_p,out->n_C,out->n_C,out->rows_in_C,out->mask_C);
242                                
243                              /*find the pattern of the schur complement with fill in*/          }
244                              schur_withFillIn=Paso_SparseMatrix_alloc(A_p->type,Paso_Pattern_binop(PATTERN_FORMAT_DEFAULT, schur->pattern, Paso_Pattern_multiply(PATTERN_FORMAT_DEFAULT,out->A_CF->pattern,out->A_FC->pattern)),1,1);          if ( Paso_noError()) {
245                   /*find the pattern of the schur complement with fill in*/
246                              /* copy values over*/                temp1=Paso_Pattern_multiply(PATTERN_FORMAT_DEFAULT,out->A_CF->pattern,out->A_FC->pattern);
247                              #pragma omp for private(i,iPtr,iPtr_s,j,j0) schedule(static)                temp2=Paso_Pattern_binop(PATTERN_FORMAT_DEFAULT, schur->pattern, temp1);
248                              for (i = 0; i < schur_withFillIn->numRows; ++i) {                schur_withFillIn=Paso_SparseMatrix_alloc(A_p->type,temp2,1,1, TRUE);
249                                for (iPtr=schur_withFillIn->pattern->ptr[i];iPtr<schur_withFillIn->pattern->ptr[i + 1]; ++iPtr) {                Paso_Pattern_free(temp1);
250                                  j=schur_withFillIn->pattern->index[iPtr];                Paso_Pattern_free(temp2);
251                                  schur_withFillIn->val[iPtr]=0.;          }
252                                  for (iPtr_s=schur->pattern->ptr[i];iPtr_s<schur->pattern->ptr[i + 1]; ++iPtr_s){          if ( Paso_noError()) {
253                                      j0=schur->pattern->index[iPtr_s];                /* copy values over*/
254                                      if (j==j0) {                #pragma omp parallel for private(i,iPtr,j,iPtr_s,index,where_p) schedule(static)
255                                        schur_withFillIn->val[iPtr]=schur->val[iPtr_s];                for (i = 0; i < schur_withFillIn->numRows; ++i) {
256                                        break;                  for (iPtr=schur_withFillIn->pattern->ptr[i];iPtr<schur_withFillIn->pattern->ptr[i + 1]; ++iPtr) {
257                                      }                     j=schur_withFillIn->pattern->index[iPtr];
258                                  }                     iPtr_s=schur->pattern->ptr[i];
259                                }                     schur_withFillIn->val[iPtr]=0.;
260                              }                     index=&(schur->pattern->index[iPtr_s]);
261                             time0=Paso_timer()-time0;                     where_p=(index_t*)bsearch(&j,
262                                                                      index,
263                              if (Paso_noError()) {                                          schur->pattern->ptr[i + 1]-schur->pattern->ptr[i],
264                                  time1=Paso_timer();                                          sizeof(index_t),
265                                  /* update A_CC block to get Schur complement and then apply AMG to it */                                          Paso_comparIndex);
266                                  Paso_Solver_updateIncompleteSchurComplement(schur_withFillIn,out->A_CF,out->inv_A_FF,out->A_FF_pivot,out->A_FC);                     if (where_p!=NULL) {
267                                  time1=Paso_timer()-time1;                            schur_withFillIn->val[iPtr]=schur->val[iPtr_s+(index_t)(where_p-index)];
268                                  out->AMG_of_Schur=Paso_Solver_getAMG(schur_withFillIn,verbose,level-1);                     }
                                   
                                 /*Paso_SparseMatrix_free(schur);*/  
                                 /* Paso_SparseMatrix_free(schur_withFillIn);*/  
                             }  
                             /* allocate work arrays for AMG application */  
                             if (Paso_noError()) {  
                               out->x_F=MEMALLOC(n_block*out->n_F,double);  
                               out->b_F=MEMALLOC(n_block*out->n_F,double);  
                               out->x_C=MEMALLOC(n_block*out->n_C,double);  
                               out->b_C=MEMALLOC(n_block*out->n_C,double);  
   
                               if (! (Paso_checkPtr(out->x_F) || Paso_checkPtr(out->b_F) || Paso_checkPtr(out->x_C) || Paso_checkPtr(out->b_C) ) ) {  
                                   #pragma omp parallel  
                                   {  
                                     #pragma omp for private(i,k) schedule(static)  
                                     for (i = 0; i < out->n_F; ++i) {  
                                           for (k=0; k<n_block;++k) {  
                                              out->x_F[i*n_block+k]=0.;  
                                              out->b_F[i*n_block+k]=0.;  
                                           }  
                                     }  
                                     #pragma omp for private(i,k) schedule(static)  
                                     for (i = 0; i < out->n_C; ++i) {  
                                         for (k=0; k<n_block;++k) {  
                                           out->x_C[i*n_block+k]=0.;  
                                           out->b_C[i*n_block+k]=0.;  
                                         }  
                                     }  
                                   } /* end parallel region */  
                               }  
                             }  
                          }  
                      }  
269                   }                   }
270                }                }
271             }                Paso_Solver_updateIncompleteSchurComplement(schur_withFillIn,out->A_CF,out->inv_A_FF,out->A_FF_pivot,out->A_FC);
272                  out->AMG_of_Schur=Paso_Solver_getAMG(schur_withFillIn,level-1,options);
273            }
274            /* allocate work arrays for AMG application */
275            if (Paso_noError()) {
276                       out->x_F=MEMALLOC(n_block*out->n_F,double);
277                       out->b_F=MEMALLOC(n_block*out->n_F,double);
278                       out->x_C=MEMALLOC(n_block*out->n_C,double);
279                       out->b_C=MEMALLOC(n_block*out->n_C,double);
280    
281                       if (! (Paso_checkPtr(out->x_F) || Paso_checkPtr(out->b_F) || Paso_checkPtr(out->x_C) || Paso_checkPtr(out->b_C) ) ) {
282                           #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)
283                           for (i = 0; i < out->n_F; ++i) {
284                                for (k=0; k<n_block;++k) {
285                                       out->x_F[i*n_block+k]=0.;
286                                       out->b_F[i*n_block+k]=0.;
287                                }
288                            }
289                            #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)
290                            for (i = 0; i < out->n_C; ++i) {
291                               for (k=0; k<n_block;++k) {
292                                   out->x_C[i*n_block+k]=0.;
293                                   out->b_C[i*n_block+k]=0.;
294                               }
295                            }
296                       }
297          }          }
298       }       }
299    }    }
300    TMPMEMFREE(mis_marker);    TMPMEMFREE(mis_marker);
301    TMPMEMFREE(counter);    TMPMEMFREE(counter);
302      Paso_SparseMatrix_free(schur);
303      Paso_SparseMatrix_free(schur_withFillIn);
304    if (Paso_noError()) {    if (Paso_noError()) {
305        if (verbose) {        if (verbose && level>0 && !out->coarsest_level) {
306           printf("AMG: %d unknowns eliminated. %d left.\n",out->n_F,n-out->n_F);           printf("AMG: level: %d: %d unknowns eliminated. %d left.\n",level, out->n_F,out->n_C);
          if (out->n_C>0) {  
             printf("timing: AMG: MIS/reordering/elemination : %e/%e/%e\n",time2,time0,time1);  
          } else {  
             printf("timing: AMG: MIS: %e\n",time2);  
          }  
307       }       }
308       return out;       return out;
309    } else  {    } else  {
# Line 305  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 318  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
318    
319       in fact it solves       in fact it solves
320    
321    [      I         0  ]  [ A_FF 0 ] [ I    invA_FF*A_FF ]  [ x_F ]  = [b_F]    [      I         0  ]  [ A_FF 0 ] [ I    invA_FF*A_FC ]  [ x_F ]  = [b_F]
322    [ A_CF*invA_FF   I  ]  [   0  S ] [ 0          I      ]  [ x_C ]  = [b_C]    [ A_CF*invA_FF   I  ]  [   0  S ] [ 0          I      ]  [ x_C ]  = [b_C]
323    
324   in the form   in the form
# Line 324  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso Line 337  Paso_Solver_AMG* Paso_Solver_getAMG(Paso
337  */  */
338    
339  void Paso_Solver_solveAMG(Paso_Solver_AMG * amg, double * x, double * b) {  void Paso_Solver_solveAMG(Paso_Solver_AMG * amg, double * x, double * b) {
340       dim_t i,k,oldsweeps;       dim_t i;
341       dim_t n_block=amg->n_block;       double time0=0;
342       double *r=MEMALLOC(amg->n,double);       double *r=NULL, *x0=NULL;
343       Paso_Solver_GS* GS=NULL;       bool_t verbose=0;
344       double *bold=MEMALLOC(amg->n*amg->n_block,double);       #ifdef MKL
345       double *bnew=MEMALLOC(amg->n*amg->n_block,double);          Paso_SparseMatrix *temp=NULL;
346         #else
347            #ifdef UMFPACK
348               Paso_UMFPACK_Handler * ptr=NULL;
349            #endif
350         #endif
351         r=MEMALLOC(amg->n,double);
352         x0=MEMALLOC(amg->n,double);
353            
354       if (amg->level==0) {       if (amg->coarsest_level) {
355          Paso_UMFPACK1(amg->A,x,b,1);        
356          time0=Paso_timer();
357           #ifdef MKL
358            temp=Paso_SparseMatrix_alloc(MATRIX_FORMAT_BLK1 + MATRIX_FORMAT_OFFSET1, amg->A->pattern,1,1, FALSE);
359            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
360            for (i=0;i<amg->A->len;++i) {
361                 temp->val[i]=amg->A->val[i];
362            }
363            Paso_MKL1(temp,x,b,0);
364            Paso_SparseMatrix_free(temp);
365           #else
366              #ifdef UMFPACK
367                 ptr=(Paso_UMFPACK_Handler *)(amg->solver);
368                 Paso_UMFPACK1(&ptr,amg->A,x,b,verbose);
369                 amg->solver=(void*) ptr;
370              #else
371                 Paso_Solver_solveJacobi(amg->GS,x,b);
372              #endif
373           #endif
374           time0=Paso_timer()-time0;
375           if (verbose) fprintf(stderr,"timing: DIRECT SOLVER: %e\n",time0);
376          
377       } else {       } else {
   
378          /* presmoothing */          /* presmoothing */
379           GS=Paso_Solver_getGS(amg->A,-1);           time0=Paso_timer();
380           Paso_Solver_solveGS(GS,x,b);           Paso_Solver_solveJacobi(amg->GS,x,b);
381           oldsweeps=GS->sweeps;           time0=Paso_timer()-time0;
382           if (GS->sweeps>1) {           if (verbose) fprintf(stderr,"timing: Presmooting: %e\n",time0);
             
            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)  
            for (i=0;i<GS->n*GS->n_block;++i) bold[i]=b[i];  
             
            while(GS->sweeps>1) {  
                #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)  
                for (i=0;i<GS->n*GS->n_block;++i) bnew[i]=bold[i]+b[i];  
                 /* Compute the residual b=b-Ax*/  
                Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(DBLE(-1), amg->A, x, DBLE(1), bnew);  
                /* Go round again*/  
                Paso_Solver_solveGS(GS,x,bnew);  
                #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)  
                for (i=0;i<GS->n*GS->n_block;++i) bold[i]=bnew[i];  
                GS->sweeps=GS->sweeps-1;  
            }  
            }  
            GS->sweeps=oldsweeps;  
383          /* end of presmoothing */          /* end of presmoothing */
384            
385            
386             time0=Paso_timer();
387           #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)           #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
388           for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];           for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];
389                    
390           /*r=b-Ax*/           /*r=b-Ax*/
391           Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);           Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);
392          
393          /* b->[b_F,b_C]     */          /* b->[b_F,b_C]     */
394          if (n_block==1) {          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
395             #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)          for (i=0;i<amg->n_F;++i) amg->b_F[i]=r[amg->rows_in_F[i]];
396             for (i=0;i<amg->n_F;++i) amg->b_F[i]=r[amg->rows_in_F[i]];            
397            #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
398             for (i=0;i<amg->n_C;++i) amg->b_C[i]=r[amg->rows_in_C[i]];          for (i=0;i<amg->n_C;++i) amg->b_C[i]=r[amg->rows_in_C[i]];
         } else {  
            #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n_F;++i)  
                  for (k=0;k<n_block;k++) amg->b_F[amg->n_block*i+k]=r[n_block*amg->rows_in_F[i]+k];  
            #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n_C;++i)  
                  for (k=0;k<n_block;k++) amg->b_C[amg->n_block*i+k]=r[n_block*amg->rows_in_C[i]+k];  
         }  
399    
400          /* x_F=invA_FF*b_F  */          /* x_F=invA_FF*b_F  */
401          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(n_block,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->x_F,amg->b_F);          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(1,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->x_F,amg->b_F);
402                    
403          /* b_C=b_C-A_CF*x_F */          /* b_C=b_C-A_CF*x_F */
404          Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_CF,amg->x_F,1.,amg->b_C);          Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_CF,amg->x_F,1.,amg->b_C);
405                    
406            time0=Paso_timer()-time0;
407            if (verbose) fprintf(stderr,"timing: Before next level: %e\n",time0);
408            
409          /* x_C=AMG(b_C)     */          /* x_C=AMG(b_C)     */
410          Paso_Solver_solveAMG(amg->AMG_of_Schur,amg->x_C,amg->b_C);          Paso_Solver_solveAMG(amg->AMG_of_Schur,amg->x_C,amg->b_C);
411                    
412            time0=Paso_timer();
413          /* b_F=b_F-A_FC*x_C */          /* b_F=b_F-A_FC*x_C */
414          Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_FC,amg->x_C,1.,amg->b_F);          Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A_FC,amg->x_C,1.,amg->b_F);
415          /* x_F=invA_FF*b_F  */          /* x_F=invA_FF*b_F  */
416          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(n_block,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->x_F,amg->b_F);          Paso_Solver_applyBlockDiagonalMatrix(1,amg->n_F,amg->inv_A_FF,amg->A_FF_pivot,amg->x_F,amg->b_F);
417          /* x<-[x_F,x_C]     */          /* x<-[x_F,x_C]     */
418            
419          if (n_block==1) {          #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
420             #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)          for (i=0;i<amg->n;++i) {
421             for (i=0;i<amg->n;++i) {              if (amg->mask_C[i]>-1) {
422                if (amg->mask_C[i]>-1) {                   x[i]=amg->x_C[amg->mask_C[i]];
423                    x[i]+=amg->x_C[amg->mask_C[i]];              } else {
424                } else {                   x[i]=amg->x_F[amg->mask_F[i]];
425                    x[i]+=amg->x_F[amg->mask_F[i]];              }
               }  
            }  
         } else {  
            #pragma omp parallel for private(i,k) schedule(static)  
            for (i=0;i<amg->n;++i) {  
                  if (amg->mask_C[i]>-1) {  
                      for (k=0;k<n_block;k++) x[n_block*i+k]+=amg->x_C[n_block*amg->mask_C[i]+k];  
                  } else {  
                      for (k=0;k<n_block;k++) x[n_block*i+k]+=amg->x_F[n_block*amg->mask_F[i]+k];  
                  }  
            }  
426          }          }
427            
428            time0=Paso_timer()-time0;
429            if (verbose) fprintf(stderr,"timing: After next level: %e\n",time0);
430    
431       /*postsmoothing*/       /*postsmoothing*/
432       Paso_Solver_solveGS1(GS,x,b);       time0=Paso_timer();
433       if (GS->sweeps>1) {       #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
434             #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)       for (i=0;i<amg->n;++i) r[i]=b[i];
435             for (i=0;i<GS->n*GS->n_block;++i) bold[i]=b[i];      
436                   /*r=b-Ax */
437             while(GS->sweeps>1) {       Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(-1.,amg->A,x,1.,r);
438                 #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)       Paso_Solver_solveJacobi(amg->GS,x0,r);
439                 for (i=0;i<GS->n*GS->n_block;++i) bnew[i]=bold[i]+b[i];      
440                  /* Compute the residual b=b-Ax*/       #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)
441                 Paso_SparseMatrix_MatrixVector_CSR_OFFSET0(DBLE(-1), amg->A, x, DBLE(1), bnew);       for (i=0;i<amg->n;++i) x[i]+=x0[i];
442                 /* Go round again*/      
443                 Paso_Solver_solveGS(GS,x,bnew);       time0=Paso_timer()-time0;
444                 #pragma omp parallel for private(i) schedule(static)       if (verbose) fprintf(stderr,"timing: Postsmoothing: %e\n",time0);
445                 for (i=0;i<GS->n*GS->n_block;++i) bold[i]=bnew[i];  
                GS->sweeps=GS->sweeps-1;  
            }  
            }  
446       /*end of postsmoothing*/       /*end of postsmoothing*/
447            
      Paso_Solver_GS_free(GS);  
448       }       }
449       MEMFREE(r);       MEMFREE(r);
450       MEMFREE(bold);       MEMFREE(x0);
451       MEMFREE(bnew);       return;
     return;  
452  }  }
   
 /*  
  * $Log$  
  *  
  */  

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