/[escript]/trunk/ripley/src/Rectangle.cpp
ViewVC logotype

Diff of /trunk/ripley/src/Rectangle.cpp

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

branches/ripleygmg_from_3668/ripley/src/Rectangle.cpp revision 3791 by caltinay, Wed Feb 1 05:10:22 2012 UTC trunk/ripley/src/Rectangle.cpp revision 4599 by sshaw, Sun Dec 15 23:51:13 2013 UTC
# Line 1  Line 1 
1    
2  /*******************************************************  /*****************************************************************************
3  *  *
4  * Copyright (c) 2003-2012 by University of Queensland  * Copyright (c) 2003-2013 by University of Queensland
5  * Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)  * http://www.uq.edu.au
 * http://www.uq.edu.au/esscc  
6  *  *
7  * Primary Business: Queensland, Australia  * Primary Business: Queensland, Australia
8  * Licensed under the Open Software License version 3.0  * Licensed under the Open Software License version 3.0
9  * http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php  * http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php
10  *  *
11  *******************************************************/  * Development until 2012 by Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)
12    * Development since 2012 by School of Earth Sciences
13    *
14    *****************************************************************************/
15    
16  #include <ripley/Rectangle.h>  #include <ripley/Rectangle.h>
 extern "C" {  
17  #include <paso/SystemMatrix.h>  #include <paso/SystemMatrix.h>
18  }  #include <esysUtils/esysFileWriter.h>
19    
20    #include <boost/scoped_array.hpp>
21    #include "esysUtils/EsysRandom.h"
22    
23    #ifdef USE_NETCDF
24    #include <netcdfcpp.h>
25    #endif
26    
27  #if USE_SILO  #if USE_SILO
28  #include <silo.h>  #include <silo.h>
# Line 26  extern "C" { Line 34  extern "C" {
34  #include <iomanip>  #include <iomanip>
35    
36  using namespace std;  using namespace std;
37    using esysUtils::FileWriter;
38    
39  namespace ripley {  namespace ripley {
40    
41  Rectangle::Rectangle(int n0, int n1, double x0, double y0, double x1,  Rectangle::Rectangle(int n0, int n1, double x0, double y0, double x1,
42                       double y1, int d0, int d1) :                       double y1, int d0, int d1) :
43      RipleyDomain(2),      RipleyDomain(2)
     m_gNE0(n0),  
     m_gNE1(n1),  
     m_x0(x0),  
     m_y0(y0),  
     m_l0(x1-x0),  
     m_l1(y1-y0),  
     m_NX(d0),  
     m_NY(d1)  
44  {  {
45        // ignore subdivision parameters for serial run
46        if (m_mpiInfo->size == 1) {
47            d0=1;
48            d1=1;
49        }
50    
51        bool warn=false;
52        // if number of subdivisions is non-positive, try to subdivide by the same
53        // ratio as the number of elements
54        if (d0<=0 && d1<=0) {
55            warn=true;
56            d0=max(1, (int)(sqrt(m_mpiInfo->size*(n0+1)/(float)(n1+1))));
57            d1=m_mpiInfo->size/d0;
58            if (d0*d1 != m_mpiInfo->size) {
59                // ratios not the same so subdivide side with more elements only
60                if (n0>n1) {
61                    d0=0;
62                    d1=1;
63                } else {
64                    d0=1;
65                    d1=0;
66                }
67            }
68        }
69        if (d0<=0) {
70            // d1 is preset, determine d0 - throw further down if result is no good
71            d0=m_mpiInfo->size/d1;
72        } else if (d1<=0) {
73            // d0 is preset, determine d1 - throw further down if result is no good
74            d1=m_mpiInfo->size/d0;
75        }
76    
77      // ensure number of subdivisions is valid and nodes can be distributed      // ensure number of subdivisions is valid and nodes can be distributed
78      // among number of ranks      // among number of ranks
79      if (m_NX*m_NY != m_mpiInfo->size)      if (d0*d1 != m_mpiInfo->size)
80          throw RipleyException("Invalid number of spatial subdivisions");          throw RipleyException("Invalid number of spatial subdivisions");
81    
82      if ((n0+1)%m_NX > 0 || (n1+1)%m_NY > 0)      if (warn) {
83          throw RipleyException("Number of elements+1 must be separable into number of ranks in each dimension");          cout << "Warning: Automatic domain subdivision (d0=" << d0 << ", d1="
84                << d1 << "). This may not be optimal!" << endl;
85        }
86    
87        double l0 = x1-x0;
88        double l1 = y1-y0;
89        m_dx[0] = l0/n0;
90        m_dx[1] = l1/n1;
91    
92        if ((n0+1)%d0 > 0) {
93            n0=(int)round((float)(n0+1)/d0+0.5)*d0-1;
94            l0=m_dx[0]*n0;
95            cout << "Warning: Adjusted number of elements and length. N0="
96                << n0 << ", l0=" << l0 << endl;
97        }
98        if ((n1+1)%d1 > 0) {
99            n1=(int)round((float)(n1+1)/d1+0.5)*d1-1;
100            l1=m_dx[1]*n1;
101            cout << "Warning: Adjusted number of elements and length. N1="
102                << n1 << ", l1=" << l1 << endl;
103        }
104    
105      if ((m_NX > 1 && (n0+1)/m_NX<2) || (m_NY > 1 && (n1+1)/m_NY<2))      if ((d0 > 1 && (n0+1)/d0<2) || (d1 > 1 && (n1+1)/d1<2))
106          throw RipleyException("Too few elements for the number of ranks");          throw RipleyException("Too few elements for the number of ranks");
107    
108        m_gNE[0] = n0;
109        m_gNE[1] = n1;
110        m_origin[0] = x0;
111        m_origin[1] = y0;
112        m_length[0] = l0;
113        m_length[1] = l1;
114        m_NX[0] = d0;
115        m_NX[1] = d1;
116    
117      // local number of elements (with and without overlap)      // local number of elements (with and without overlap)
118      m_NE0 = m_ownNE0 = (m_NX>1 ? (n0+1)/m_NX : n0);      m_NE[0] = m_ownNE[0] = (d0>1 ? (n0+1)/d0 : n0);
119      if (m_mpiInfo->rank%m_NX>0 && m_mpiInfo->rank%m_NX<m_NX-1)      if (m_mpiInfo->rank%d0>0 && m_mpiInfo->rank%d0<d0-1)
120          m_NE0++;          m_NE[0]++;
121      else if (m_NX>1 && m_mpiInfo->rank%m_NX==m_NX-1)      else if (d0>1 && m_mpiInfo->rank%d0==d0-1)
122          m_ownNE0--;          m_ownNE[0]--;
123    
124      m_NE1 = m_ownNE1 = (m_NY>1 ? (n1+1)/m_NY : n1);      m_NE[1] = m_ownNE[1] = (d1>1 ? (n1+1)/d1 : n1);
125      if (m_mpiInfo->rank/m_NX>0 && m_mpiInfo->rank/m_NX<m_NY-1)      if (m_mpiInfo->rank/d0>0 && m_mpiInfo->rank/d0<d1-1)
126          m_NE1++;          m_NE[1]++;
127      else if (m_NY>1 && m_mpiInfo->rank/m_NX==m_NY-1)      else if (d1>1 && m_mpiInfo->rank/d0==d1-1)
128          m_ownNE1--;          m_ownNE[1]--;
129    
130      // local number of nodes      // local number of nodes
131      m_N0 = m_NE0+1;      m_NN[0] = m_NE[0]+1;
132      m_N1 = m_NE1+1;      m_NN[1] = m_NE[1]+1;
133    
134      // bottom-left node is at (offset0,offset1) in global mesh      // bottom-left node is at (offset0,offset1) in global mesh
135      m_offset0 = (n0+1)/m_NX*(m_mpiInfo->rank%m_NX);      m_offset[0] = (n0+1)/d0*(m_mpiInfo->rank%d0);
136      if (m_offset0 > 0)      if (m_offset[0] > 0)
137          m_offset0--;          m_offset[0]--;
138      m_offset1 = (n1+1)/m_NY*(m_mpiInfo->rank/m_NX);      m_offset[1] = (n1+1)/d1*(m_mpiInfo->rank/d0);
139      if (m_offset1 > 0)      if (m_offset[1] > 0)
140          m_offset1--;          m_offset[1]--;
141    
142      populateSampleIds();      populateSampleIds();
143      createPattern();      createPattern();
# Line 97  bool Rectangle::operator==(const Abstrac Line 159  bool Rectangle::operator==(const Abstrac
159      const Rectangle* o=dynamic_cast<const Rectangle*>(&other);      const Rectangle* o=dynamic_cast<const Rectangle*>(&other);
160      if (o) {      if (o) {
161          return (RipleyDomain::operator==(other) &&          return (RipleyDomain::operator==(other) &&
162                  m_gNE0==o->m_gNE0 && m_gNE1==o->m_gNE1                  m_gNE[0]==o->m_gNE[0] && m_gNE[1]==o->m_gNE[1]
163                  && m_x0==o->m_x0 && m_y0==o->m_y0                  && m_origin[0]==o->m_origin[0] && m_origin[1]==o->m_origin[1]
164                  && m_l0==o->m_l0 && m_l1==o->m_l1                  && m_length[0]==o->m_length[0] && m_length[1]==o->m_length[1]
165                  && m_NX==o->m_NX && m_NY==o->m_NY);                  && m_NX[0]==o->m_NX[0] && m_NX[1]==o->m_NX[1]);
166      }      }
167    
168      return false;      return false;
169  }  }
170    
171    void Rectangle::readNcGrid(escript::Data& out, string filename, string varname,
172                const vector<int>& first, const vector<int>& numValues,
173                const vector<int>& multiplier) const
174    {
175    #ifdef USE_NETCDF
176        // check destination function space
177        int myN0, myN1;
178        if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Nodes) {
179            myN0 = m_NN[0];
180            myN1 = m_NN[1];
181        } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements ||
182                    out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
183            myN0 = m_NE[0];
184            myN1 = m_NE[1];
185        } else
186            throw RipleyException("readNcGrid(): invalid function space for output data object");
187    
188        if (first.size() != 2)
189            throw RipleyException("readNcGrid(): argument 'first' must have 2 entries");
190    
191        if (numValues.size() != 2)
192            throw RipleyException("readNcGrid(): argument 'numValues' must have 2 entries");
193    
194        if (multiplier.size() != 2)
195            throw RipleyException("readNcGrid(): argument 'multiplier' must have 2 entries");
196        for (size_t i=0; i<multiplier.size(); i++)
197            if (multiplier[i]<1)
198                throw RipleyException("readNcGrid(): all multipliers must be positive");
199    
200        // check file existence and size
201        NcFile f(filename.c_str(), NcFile::ReadOnly);
202        if (!f.is_valid())
203            throw RipleyException("readNcGrid(): cannot open file");
204    
205        NcVar* var = f.get_var(varname.c_str());
206        if (!var)
207            throw RipleyException("readNcGrid(): invalid variable");
208    
209        // TODO: rank>0 data support
210        const int numComp = out.getDataPointSize();
211        if (numComp > 1)
212            throw RipleyException("readNcGrid(): only scalar data supported");
213    
214        const int dims = var->num_dims();
215        boost::scoped_array<long> edges(var->edges());
216    
217        // is this a slice of the data object (dims!=2)?
218        // note the expected ordering of edges (as in numpy: y,x)
219        if ( (dims==2 && (numValues[1] > edges[0] || numValues[0] > edges[1]))
220                || (dims==1 && numValues[1]>1) ) {
221            throw RipleyException("readNcGrid(): not enough data in file");
222        }
223    
224        // check if this rank contributes anything
225        if (first[0] >= m_offset[0]+myN0 || first[0]+numValues[0]*multiplier[0] <= m_offset[0] ||
226                first[1] >= m_offset[1]+myN1 || first[1]+numValues[1]*multiplier[1] <= m_offset[1])
227            return;
228    
229        // now determine how much this rank has to write
230    
231        // first coordinates in data object to write to
232        const int first0 = max(0, first[0]-m_offset[0]);
233        const int first1 = max(0, first[1]-m_offset[1]);
234        // indices to first value in file
235        const int idx0 = max(0, m_offset[0]-first[0]);
236        const int idx1 = max(0, m_offset[1]-first[1]);
237        // number of values to read
238        const int num0 = min(numValues[0]-idx0, myN0-first0);
239        const int num1 = min(numValues[1]-idx1, myN1-first1);
240    
241        vector<double> values(num0*num1);
242        if (dims==2) {
243            var->set_cur(idx1, idx0);
244            var->get(&values[0], num1, num0);
245        } else {
246            var->set_cur(idx0);
247            var->get(&values[0], num0);
248        }
249    
250        const int dpp = out.getNumDataPointsPerSample();
251        out.requireWrite();
252    
253        for (index_t y=0; y<num1; y++) {
254    #pragma omp parallel for
255            for (index_t x=0; x<num0; x++) {
256                const int baseIndex = first0+x*multiplier[0]
257                                      +(first1+y*multiplier[1])*myN0;
258                const int srcIndex = y*num0+x;
259                if (!isnan(values[srcIndex])) {
260                    for (index_t m1=0; m1<multiplier[1]; m1++) {
261                        for (index_t m0=0; m0<multiplier[0]; m0++) {
262                            const int dataIndex = baseIndex+m0+m1*myN0;
263                            double* dest = out.getSampleDataRW(dataIndex);
264                            for (index_t q=0; q<dpp; q++) {
265                                *dest++ = values[srcIndex];
266                            }
267                        }
268                    }
269                }
270            }
271        }
272    #else
273        throw RipleyException("readNcGrid(): not compiled with netCDF support");
274    #endif
275    }
276    
277    void Rectangle::readBinaryGrid(escript::Data& out, string filename,
278                                   const vector<int>& first,
279                                   const vector<int>& numValues,
280                                   const std::vector<int>& multiplier,
281                                   int byteOrder, int dataType) const
282    {
283        // the mapping is not universally correct but should work on our
284        // supported platforms
285        switch (dataType) {
286            case DATATYPE_INT32:
287                readBinaryGridImpl<int>(out, filename, first, numValues,
288                                        multiplier, byteOrder);
289                break;
290            case DATATYPE_FLOAT32:
291                readBinaryGridImpl<float>(out, filename, first, numValues,
292                                          multiplier, byteOrder);
293                break;
294            case DATATYPE_FLOAT64:
295                readBinaryGridImpl<double>(out, filename, first, numValues,
296                                           multiplier, byteOrder);
297                break;
298            default:
299                throw RipleyException("readBinaryGrid(): invalid or unsupported datatype");
300        }
301    }
302    
303    template<typename ValueType>
304    void Rectangle::readBinaryGridImpl(escript::Data& out, const string& filename,
305                                       const vector<int>& first,
306                                       const vector<int>& numValues,
307                                       const std::vector<int>& multiplier,
308                                       int byteOrder) const
309    {
310        // check destination function space
311        int myN0, myN1;
312        if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Nodes) {
313            myN0 = m_NN[0];
314            myN1 = m_NN[1];
315        } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements ||
316                    out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
317            myN0 = m_NE[0];
318            myN1 = m_NE[1];
319        } else
320            throw RipleyException("readBinaryGrid(): invalid function space for output data object");
321    
322        // check file existence and size
323        ifstream f(filename.c_str(), ifstream::binary);
324        if (f.fail()) {
325            throw RipleyException("readBinaryGrid(): cannot open file");
326        }
327        f.seekg(0, ios::end);
328        const int numComp = out.getDataPointSize();
329        const int filesize = f.tellg();
330        const int reqsize = numValues[0]*numValues[1]*numComp*sizeof(ValueType);
331        if (filesize < reqsize) {
332            f.close();
333            throw RipleyException("readBinaryGrid(): not enough data in file");
334        }
335    
336        // check if this rank contributes anything
337        if (first[0] >= m_offset[0]+myN0 || first[0]+numValues[0] <= m_offset[0] ||
338                first[1] >= m_offset[1]+myN1 || first[1]+numValues[1] <= m_offset[1]) {
339            f.close();
340            return;
341        }
342    
343        // now determine how much this rank has to write
344    
345        // first coordinates in data object to write to
346        const int first0 = max(0, first[0]-m_offset[0]);
347        const int first1 = max(0, first[1]-m_offset[1]);
348        // indices to first value in file
349        const int idx0 = max(0, m_offset[0]-first[0]);
350        const int idx1 = max(0, m_offset[1]-first[1]);
351        // number of values to read
352        const int num0 = min(numValues[0]-idx0, myN0-first0);
353        const int num1 = min(numValues[1]-idx1, myN1-first1);
354    
355        out.requireWrite();
356        vector<ValueType> values(num0*numComp);
357        const int dpp = out.getNumDataPointsPerSample();
358    
359        for (int y=0; y<num1; y++) {
360            const int fileofs = numComp*(idx0+(idx1+y)*numValues[0]);
361            f.seekg(fileofs*sizeof(ValueType));
362            f.read((char*)&values[0], num0*numComp*sizeof(ValueType));
363            for (int x=0; x<num0; x++) {
364                const int baseIndex = first0+x*multiplier[0]
365                                        +(first1+y*multiplier[1])*myN0;
366                for (int m1=0; m1<multiplier[1]; m1++) {
367                    for (int m0=0; m0<multiplier[0]; m0++) {
368                        const int dataIndex = baseIndex+m0+m1*myN0;
369                        double* dest = out.getSampleDataRW(dataIndex);
370                        for (int c=0; c<numComp; c++) {
371                            ValueType val = values[x*numComp+c];
372    
373                            if (byteOrder != BYTEORDER_NATIVE) {
374                                char* cval = reinterpret_cast<char*>(&val);
375                                // this will alter val!!
376                                byte_swap32(cval);
377                            }
378                            if (!std::isnan(val)) {
379                                for (int q=0; q<dpp; q++) {
380                                    *dest++ = static_cast<double>(val);
381                                }
382                            }
383                        }
384                    }
385                }
386            }
387        }
388    
389        f.close();
390    }
391    
392    void Rectangle::writeBinaryGrid(const escript::Data& in, string filename,
393                                    int byteOrder, int dataType) const
394    {
395        // the mapping is not universally correct but should work on our
396        // supported platforms
397        switch (dataType) {
398            case DATATYPE_INT32:
399                writeBinaryGridImpl<int>(in, filename, byteOrder);
400                break;
401            case DATATYPE_FLOAT32:
402                writeBinaryGridImpl<float>(in, filename, byteOrder);
403                break;
404            case DATATYPE_FLOAT64:
405                writeBinaryGridImpl<double>(in, filename, byteOrder);
406                break;
407            default:
408                throw RipleyException("writeBinaryGrid(): invalid or unsupported datatype");
409        }
410    }
411    
412    template<typename ValueType>
413    void Rectangle::writeBinaryGridImpl(const escript::Data& in,
414                                        const string& filename, int byteOrder) const
415    {
416        // check function space and determine number of points
417        int myN0, myN1;
418        int totalN0, totalN1;
419        if (in.getFunctionSpace().getTypeCode() == Nodes) {
420            myN0 = m_NN[0];
421            myN1 = m_NN[1];
422            totalN0 = m_gNE[0]+1;
423            totalN1 = m_gNE[1]+1;
424        } else if (in.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements ||
425                    in.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
426            myN0 = m_NE[0];
427            myN1 = m_NE[1];
428            totalN0 = m_gNE[0];
429            totalN1 = m_gNE[1];
430        } else
431            throw RipleyException("writeBinaryGrid(): invalid function space of data object");
432    
433        const int numComp = in.getDataPointSize();
434        const int dpp = in.getNumDataPointsPerSample();
435    
436        if (numComp > 1 || dpp > 1)
437            throw RipleyException("writeBinaryGrid(): only scalar, single-value data supported");
438    
439        escript::Data* _in = const_cast<escript::Data*>(&in);
440        const int fileSize = sizeof(ValueType)*numComp*dpp*totalN0*totalN1;
441    
442        // from here on we know that each sample consists of one value
443        FileWriter fw;
444        fw.openFile(filename, fileSize);
445        MPIBarrier();
446    
447        for (index_t y=0; y<myN1; y++) {
448            const int fileofs = (m_offset[0]+(m_offset[1]+y)*totalN0)*sizeof(ValueType);
449            ostringstream oss;
450    
451            for (index_t x=0; x<myN0; x++) {
452                const double* sample = _in->getSampleDataRO(y*myN0+x);
453                ValueType fvalue = static_cast<ValueType>(*sample);
454                if (byteOrder == BYTEORDER_NATIVE) {
455                    oss.write((char*)&fvalue, sizeof(fvalue));
456                } else {
457                    char* value = reinterpret_cast<char*>(&fvalue);
458                    oss.write(byte_swap32(value), sizeof(fvalue));
459                }
460            }
461            fw.writeAt(oss, fileofs);
462        }
463        fw.close();
464    }
465    
466  void Rectangle::dump(const string& fileName) const  void Rectangle::dump(const string& fileName) const
467  {  {
468  #if USE_SILO  #if USE_SILO
# Line 114  void Rectangle::dump(const string& fileN Line 471  void Rectangle::dump(const string& fileN
471          fn+=".silo";          fn+=".silo";
472      }      }
473    
     const int NUM_SILO_FILES = 1;  
     const char* blockDirFmt = "/block%04d";  
474      int driver=DB_HDF5;          int driver=DB_HDF5;    
475      DBfile* dbfile = NULL;      DBfile* dbfile = NULL;
476        const char* blockDirFmt = "/block%04d";
477    
478  #ifdef ESYS_MPI  #ifdef ESYS_MPI
479      PMPIO_baton_t* baton = NULL;      PMPIO_baton_t* baton = NULL;
480        const int NUM_SILO_FILES = 1;
481  #endif  #endif
482    
483      if (m_mpiInfo->size > 1) {      if (m_mpiInfo->size > 1) {
# Line 168  void Rectangle::dump(const string& fileN Line 525  void Rectangle::dump(const string& fileN
525      }      }
526      */      */
527    
528      boost::scoped_ptr<double> x(new double[m_N0]);      boost::scoped_ptr<double> x(new double[m_NN[0]]);
529      boost::scoped_ptr<double> y(new double[m_N1]);      boost::scoped_ptr<double> y(new double[m_NN[1]]);
530      double* coords[2] = { x.get(), y.get() };      double* coords[2] = { x.get(), y.get() };
     pair<double,double> xdx = getFirstCoordAndSpacing(0);  
     pair<double,double> ydy = getFirstCoordAndSpacing(1);  
531  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
532      {      {
533  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
534          for (dim_t i0 = 0; i0 < m_N0; i0++) {          for (dim_t i0 = 0; i0 < m_NN[0]; i0++) {
535              coords[0][i0]=xdx.first+i0*xdx.second;              coords[0][i0]=getLocalCoordinate(i0, 0);
536          }          }
537  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
538          for (dim_t i1 = 0; i1 < m_N1; i1++) {          for (dim_t i1 = 0; i1 < m_NN[1]; i1++) {
539              coords[1][i1]=ydy.first+i1*ydy.second;              coords[1][i1]=getLocalCoordinate(i1, 1);
540          }          }
541      }      }
542      IndexVector dims = getNumNodesPerDim();      int* dims = const_cast<int*>(getNumNodesPerDim());
543    
544      // write mesh      // write mesh
545      DBPutQuadmesh(dbfile, "mesh", NULL, coords, &dims[0], 2, DB_DOUBLE,      DBPutQuadmesh(dbfile, "mesh", NULL, coords, dims, 2, DB_DOUBLE,
546              DB_COLLINEAR, NULL);              DB_COLLINEAR, NULL);
547    
548      // write node ids      // write node ids
549      DBPutQuadvar1(dbfile, "nodeId", "mesh", (void*)&m_nodeId[0], &dims[0], 2,      DBPutQuadvar1(dbfile, "nodeId", "mesh", (void*)&m_nodeId[0], dims, 2,
550              NULL, 0, DB_INT, DB_NODECENT, NULL);              NULL, 0, DB_INT, DB_NODECENT, NULL);
551    
552      // write element ids      // write element ids
553      dims = getNumElementsPerDim();      dims = const_cast<int*>(getNumElementsPerDim());
554      DBPutQuadvar1(dbfile, "elementId", "mesh", (void*)&m_elementId[0],      DBPutQuadvar1(dbfile, "elementId", "mesh", (void*)&m_elementId[0],
555              &dims[0], 2, NULL, 0, DB_INT, DB_ZONECENT, NULL);              dims, 2, NULL, 0, DB_INT, DB_ZONECENT, NULL);
556    
557      // rank 0 writes multimesh and multivar      // rank 0 writes multimesh and multivar
558      if (m_mpiInfo->rank == 0) {      if (m_mpiInfo->rank == 0) {
# Line 289  bool Rectangle::ownSample(int fsType, in Line 644  bool Rectangle::ownSample(int fsType, in
644          case Elements:          case Elements:
645          case ReducedElements:          case ReducedElements:
646              // check ownership of element's bottom left node              // check ownership of element's bottom left node
647              return (m_dofMap[id%m_NE0+m_N0*(id/m_NE0)] < getNumDOF());              return (m_dofMap[id%m_NE[0]+m_NN[0]*(id/m_NE[0])] < getNumDOF());
648          case FaceElements:          case FaceElements:
649          case ReducedFaceElements:          case ReducedFaceElements:
650              {              {
651                  // determine which face the sample belongs to before                  // determine which face the sample belongs to before
652                  // checking ownership of corresponding element's first node                  // checking ownership of corresponding element's first node
                 const IndexVector faces = getNumFacesPerBoundary();  
653                  dim_t n=0;                  dim_t n=0;
654                  for (size_t i=0; i<faces.size(); i++) {                  for (size_t i=0; i<4; i++) {
655                      n+=faces[i];                      n+=m_faceCount[i];
656                      if (id<n) {                      if (id<n) {
657                          index_t k;                          index_t k;
658                          if (i==1)                          if (i==1)
659                              k=m_N0-2;                              k=m_NN[0]-2;
660                          else if (i==3)                          else if (i==3)
661                              k=m_N0*(m_N1-2);                              k=m_NN[0]*(m_NN[1]-2);
662                          else                          else
663                              k=0;                              k=0;
664                          // determine whether to move right or up                          // determine whether to move right or up
665                          const index_t delta=(i/2==0 ? m_N0 : 1);                          const index_t delta=(i/2==0 ? m_NN[0] : 1);
666                          return (m_dofMap[k+(id-n+faces[i])*delta] < getNumDOF());                          return (m_dofMap[k+(id-n+m_faceCount[i])*delta] < getNumDOF());
667                      }                      }
668                  }                  }
669                  return false;                  return false;
# Line 331  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat Line 685  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat
685          {          {
686              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
687  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
688                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
689                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+k1);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+k1);
690                      // set vector at two quadrature points                      // set vector at two quadrature points
691                      *o++ = -1.;                      *o++ = -1.;
# Line 343  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat Line 697  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat
697    
698              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
699  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
700                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
701                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+k1);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+k1);
702                      // set vector at two quadrature points                      // set vector at two quadrature points
703                      *o++ = 1.;                      *o++ = 1.;
# Line 355  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat Line 709  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat
709    
710              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
711  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
712                  for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                  for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
713                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+k0);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+k0);
714                      // set vector at two quadrature points                      // set vector at two quadrature points
715                      *o++ = 0.;                      *o++ = 0.;
# Line 367  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat Line 721  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat
721    
722              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
723  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
724                  for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                  for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
725                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+k0);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+k0);
726                      // set vector at two quadrature points                      // set vector at two quadrature points
727                      *o++ = 0.;                      *o++ = 0.;
# Line 383  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat Line 737  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat
737          {          {
738              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
739  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
740                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
741                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+k1);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+k1);
742                      *o++ = -1.;                      *o++ = -1.;
743                      *o = 0.;                      *o = 0.;
# Line 392  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat Line 746  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat
746    
747              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
748  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
749                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
750                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+k1);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+k1);
751                      *o++ = 1.;                      *o++ = 1.;
752                      *o = 0.;                      *o = 0.;
# Line 401  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat Line 755  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat
755    
756              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
757  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
758                  for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                  for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
759                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+k0);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+k0);
760                      *o++ = 0.;                      *o++ = 0.;
761                      *o = -1.;                      *o = -1.;
# Line 410  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat Line 764  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat
764    
765              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
766  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
767                  for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                  for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
768                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+k0);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+k0);
769                      *o++ = 0.;                      *o++ = 0.;
770                      *o = 1.;                      *o = 1.;
# Line 432  void Rectangle::setToSize(escript::Data& Line 786  void Rectangle::setToSize(escript::Data&
786              || out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {              || out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
787          out.requireWrite();          out.requireWrite();
788          const dim_t numQuad=out.getNumDataPointsPerSample();          const dim_t numQuad=out.getNumDataPointsPerSample();
789          const double hSize=getFirstCoordAndSpacing(0).second;          const double size=sqrt(m_dx[0]*m_dx[0]+m_dx[1]*m_dx[1]);
         const double vSize=getFirstCoordAndSpacing(1).second;  
         const double size=min(hSize,vSize);  
790  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel for
791          for (index_t k = 0; k < getNumElements(); ++k) {          for (index_t k = 0; k < getNumElements(); ++k) {
792              double* o = out.getSampleDataRW(k);              double* o = out.getSampleDataRW(k);
# Line 444  void Rectangle::setToSize(escript::Data& Line 796  void Rectangle::setToSize(escript::Data&
796              || out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedFaceElements) {              || out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedFaceElements) {
797          out.requireWrite();          out.requireWrite();
798          const dim_t numQuad=out.getNumDataPointsPerSample();          const dim_t numQuad=out.getNumDataPointsPerSample();
         const double hSize=getFirstCoordAndSpacing(0).second;  
         const double vSize=getFirstCoordAndSpacing(1).second;  
799  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
800          {          {
801              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
802  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
803                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
804                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+k1);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+k1);
805                      fill(o, o+numQuad, vSize);                      fill(o, o+numQuad, m_dx[1]);
806                  }                  }
807              }              }
808    
809              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
810  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
811                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
812                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+k1);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+k1);
813                      fill(o, o+numQuad, vSize);                      fill(o, o+numQuad, m_dx[1]);
814                  }                  }
815              }              }
816    
817              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
818  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
819                  for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                  for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
820                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+k0);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+k0);
821                      fill(o, o+numQuad, hSize);                      fill(o, o+numQuad, m_dx[0]);
822                  }                  }
823              }              }
824    
825              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
826  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
827                  for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                  for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
828                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+k0);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+k0);
829                      fill(o, o+numQuad, hSize);                      fill(o, o+numQuad, m_dx[0]);
830                  }                  }
831              }              }
832          } // end of parallel section          } // end of parallel section
# Line 489  void Rectangle::setToSize(escript::Data& Line 839  void Rectangle::setToSize(escript::Data&
839      }      }
840  }  }
841    
 Paso_SystemMatrixPattern* Rectangle::getPattern(bool reducedRowOrder,  
                                                 bool reducedColOrder) const  
 {  
     /* FIXME: reduced  
     if (reducedRowOrder || reducedColOrder)  
         throw RipleyException("getPattern() not implemented for reduced order");  
     */  
     return m_pattern;  
 }  
   
842  void Rectangle::Print_Mesh_Info(const bool full) const  void Rectangle::Print_Mesh_Info(const bool full) const
843  {  {
844      RipleyDomain::Print_Mesh_Info(full);      RipleyDomain::Print_Mesh_Info(full);
# Line 506  void Rectangle::Print_Mesh_Info(const bo Line 846  void Rectangle::Print_Mesh_Info(const bo
846          cout << "     Id  Coordinates" << endl;          cout << "     Id  Coordinates" << endl;
847          cout.precision(15);          cout.precision(15);
848          cout.setf(ios::scientific, ios::floatfield);          cout.setf(ios::scientific, ios::floatfield);
         pair<double,double> xdx = getFirstCoordAndSpacing(0);  
         pair<double,double> ydy = getFirstCoordAndSpacing(1);  
849          for (index_t i=0; i < getNumNodes(); i++) {          for (index_t i=0; i < getNumNodes(); i++) {
850              cout << "  " << setw(5) << m_nodeId[i]              cout << "  " << setw(5) << m_nodeId[i]
851                  << "  " << xdx.first+(i%m_N0)*xdx.second                  << "  " << getLocalCoordinate(i%m_NN[0], 0)
852                  << "  " << ydy.first+(i/m_N0)*ydy.second << endl;                  << "  " << getLocalCoordinate(i/m_NN[0], 1) << endl;
853          }          }
854      }      }
855  }  }
856    
 IndexVector Rectangle::getNumNodesPerDim() const  
 {  
     IndexVector ret;  
     ret.push_back(m_N0);  
     ret.push_back(m_N1);  
     return ret;  
 }  
   
 IndexVector Rectangle::getNumElementsPerDim() const  
 {  
     IndexVector ret;  
     ret.push_back(m_NE0);  
     ret.push_back(m_NE1);  
     return ret;  
 }  
   
 IndexVector Rectangle::getNumFacesPerBoundary() const  
 {  
     IndexVector ret(4, 0);  
     //left  
     if (m_offset0==0)  
         ret[0]=m_NE1;  
     //right  
     if (m_mpiInfo->rank%m_NX==m_NX-1)  
         ret[1]=m_NE1;  
     //bottom  
     if (m_offset1==0)  
         ret[2]=m_NE0;  
     //top  
     if (m_mpiInfo->rank/m_NX==m_NY-1)  
         ret[3]=m_NE0;  
     return ret;  
 }  
   
 IndexVector Rectangle::getNumSubdivisionsPerDim() const  
 {  
     IndexVector ret;  
     ret.push_back(m_NX);  
     ret.push_back(m_NY);  
     return ret;  
 }  
   
 pair<double,double> Rectangle::getFirstCoordAndSpacing(dim_t dim) const  
 {  
     if (dim==0) {  
         return pair<double,double>(m_x0+(m_l0*m_offset0)/m_gNE0, m_l0/m_gNE0);  
     } else if (dim==1) {  
         return pair<double,double>(m_y0+(m_l1*m_offset1)/m_gNE1, m_l1/m_gNE1);  
     }  
     throw RipleyException("getFirstCoordAndSpacing: invalid argument");  
 }  
   
 //protected  
 dim_t Rectangle::getNumDOF() const  
 {  
     return (m_gNE0+1)/m_NX*(m_gNE1+1)/m_NY;  
 }  
   
 //protected  
 dim_t Rectangle::getNumFaceElements() const  
 {  
     const IndexVector faces = getNumFacesPerBoundary();  
     dim_t n=0;  
     for (size_t i=0; i<faces.size(); i++)  
         n+=faces[i];  
     return n;  
 }  
857    
858  //protected  //protected
859  void Rectangle::assembleCoordinates(escript::Data& arg) const  void Rectangle::assembleCoordinates(escript::Data& arg) const
# Line 594  void Rectangle::assembleCoordinates(escr Line 865  void Rectangle::assembleCoordinates(escr
865      if (!numSamplesEqual(&x, 1, getNumNodes()))      if (!numSamplesEqual(&x, 1, getNumNodes()))
866          throw RipleyException("setToX: Illegal number of samples in Data object");          throw RipleyException("setToX: Illegal number of samples in Data object");
867    
     pair<double,double> xdx = getFirstCoordAndSpacing(0);  
     pair<double,double> ydy = getFirstCoordAndSpacing(1);  
868      arg.requireWrite();      arg.requireWrite();
869  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel for
870      for (dim_t i1 = 0; i1 < m_N1; i1++) {      for (dim_t i1 = 0; i1 < m_NN[1]; i1++) {
871          for (dim_t i0 = 0; i0 < m_N0; i0++) {          for (dim_t i0 = 0; i0 < m_NN[0]; i0++) {
872              double* point = arg.getSampleDataRW(i0+m_N0*i1);              double* point = arg.getSampleDataRW(i0+m_NN[0]*i1);
873              point[0] = xdx.first+i0*xdx.second;              point[0] = getLocalCoordinate(i0, 0);
874              point[1] = ydy.first+i1*ydy.second;              point[1] = getLocalCoordinate(i1, 1);
875          }          }
876      }      }
877  }  }
# Line 611  void Rectangle::assembleCoordinates(escr Line 880  void Rectangle::assembleCoordinates(escr
880  void Rectangle::assembleGradient(escript::Data& out, escript::Data& in) const  void Rectangle::assembleGradient(escript::Data& out, escript::Data& in) const
881  {  {
882      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();
883      const double h0 = m_l0/m_gNE0;      const double cx0 = .21132486540518711775/m_dx[0];
884      const double h1 = m_l1/m_gNE1;      const double cx1 = .78867513459481288225/m_dx[0];
885      const double cx0 = -1./h0;      const double cx2 = 1./m_dx[0];
886      const double cx1 = -.78867513459481288225/h0;      const double cy0 = .21132486540518711775/m_dx[1];
887      const double cx2 = -.5/h0;      const double cy1 = .78867513459481288225/m_dx[1];
888      const double cx3 = -.21132486540518711775/h0;      const double cy2 = 1./m_dx[1];
     const double cx4 = .21132486540518711775/h0;  
     const double cx5 = .5/h0;  
     const double cx6 = .78867513459481288225/h0;  
     const double cx7 = 1./h0;  
     const double cy0 = -1./h1;  
     const double cy1 = -.78867513459481288225/h1;  
     const double cy2 = -.5/h1;  
     const double cy3 = -.21132486540518711775/h1;  
     const double cy4 = .21132486540518711775/h1;  
     const double cy5 = .5/h1;  
     const double cy6 = .78867513459481288225/h1;  
     const double cy7 = 1./h1;  
889    
890      if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements) {      if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements) {
891          out.requireWrite();          out.requireWrite();
892  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel
893          for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {          {
894              for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {              vector<double> f_00(numComp);
895                  const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1, m_N0));              vector<double> f_01(numComp);
896                  const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1+1, m_N0));              vector<double> f_10(numComp);
897                  const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1+1, m_N0));              vector<double> f_11(numComp);
898                  const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1, m_N0));  #pragma omp for
899                  double* o = out.getSampleDataRW(INDEX2(k0,k1,m_NE0));              for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
900                  for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
901                      o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = f_00[i]*cx1 + f_01[i]*cx3 + f_10[i]*cx6 + f_11[i]*cx4;                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
902                      o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = f_00[i]*cy1 + f_01[i]*cy6 + f_10[i]*cy3 + f_11[i]*cy4;                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
903                      o[INDEX3(i,0,1,numComp,2)] = f_00[i]*cx1 + f_01[i]*cx3 + f_10[i]*cx6 + f_11[i]*cx4;                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
904                      o[INDEX3(i,1,1,numComp,2)] = f_00[i]*cy3 + f_01[i]*cy4 + f_10[i]*cy1 + f_11[i]*cy6;                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
905                      o[INDEX3(i,0,2,numComp,2)] = f_00[i]*cx3 + f_01[i]*cx1 + f_10[i]*cx4 + f_11[i]*cx6;                      double* o = out.getSampleDataRW(INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
906                      o[INDEX3(i,1,2,numComp,2)] = f_00[i]*cy1 + f_01[i]*cy6 + f_10[i]*cy3 + f_11[i]*cy4;                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
907                      o[INDEX3(i,0,3,numComp,2)] = f_00[i]*cx3 + f_01[i]*cx1 + f_10[i]*cx4 + f_11[i]*cx6;                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = (f_10[i]-f_00[i])*cx1 + (f_11[i]-f_01[i])*cx0;
908                      o[INDEX3(i,1,3,numComp,2)] = f_00[i]*cy3 + f_01[i]*cy4 + f_10[i]*cy1 + f_11[i]*cy6;                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = (f_01[i]-f_00[i])*cy1 + (f_11[i]-f_10[i])*cy0;
909                  } /* end of component loop i */                          o[INDEX3(i,0,1,numComp,2)] = (f_10[i]-f_00[i])*cx1 + (f_11[i]-f_01[i])*cx0;
910              } /* end of k0 loop */                          o[INDEX3(i,1,1,numComp,2)] = (f_01[i]-f_00[i])*cy0 + (f_11[i]-f_10[i])*cy1;
911          } /* end of k1 loop */                          o[INDEX3(i,0,2,numComp,2)] = (f_10[i]-f_00[i])*cx0 + (f_11[i]-f_01[i])*cx1;
912                            o[INDEX3(i,1,2,numComp,2)] = (f_01[i]-f_00[i])*cy1 + (f_11[i]-f_10[i])*cy0;
913                            o[INDEX3(i,0,3,numComp,2)] = (f_10[i]-f_00[i])*cx0 + (f_11[i]-f_01[i])*cx1;
914                            o[INDEX3(i,1,3,numComp,2)] = (f_01[i]-f_00[i])*cy0 + (f_11[i]-f_10[i])*cy1;
915                        } // end of component loop i
916                    } // end of k0 loop
917                } // end of k1 loop
918            } // end of parallel section
919      } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {      } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
920          out.requireWrite();          out.requireWrite();
921  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel
922          for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {          {
923              for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {              vector<double> f_00(numComp);
924                  const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1, m_N0));              vector<double> f_01(numComp);
925                  const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1+1, m_N0));              vector<double> f_10(numComp);
926                  const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1+1, m_N0));              vector<double> f_11(numComp);
927                  const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1, m_N0));  #pragma omp for
928                  double* o = out.getSampleDataRW(INDEX2(k0,k1,m_NE0));              for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
929                  for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
930                      o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = cx5*(f_10[i] + f_11[i]) + cx2*(f_00[i] + f_01[i]);                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
931                      o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = cy2*(f_00[i] + f_10[i]) + cy5*(f_01[i] + f_11[i]);                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
932                  } /* end of component loop i */                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
933              } /* end of k0 loop */                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
934          } /* end of k1 loop */                      double* o = out.getSampleDataRW(INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
935                        for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
936                            o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = (f_10[i] + f_11[i] - f_00[i] - f_01[i])*cx2/2;
937                            o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = (f_01[i] + f_11[i] - f_00[i] - f_10[i])*cy2/2;
938                        } // end of component loop i
939                    } // end of k0 loop
940                } // end of k1 loop
941            } // end of parallel section
942      } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == FaceElements) {      } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == FaceElements) {
943          out.requireWrite();          out.requireWrite();
944  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
945          {          {
946                vector<double> f_00(numComp);
947                vector<double> f_01(numComp);
948                vector<double> f_10(numComp);
949                vector<double> f_11(numComp);
950              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
951  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
952                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
953                      const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(1,k1, m_N0));                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
954                      const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(1,k1+1, m_N0));                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
955                      const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1+1, m_N0));                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(1,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
956                      const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1, m_N0));                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(1,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
957                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+k1);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+k1);
958                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
959                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = f_00[i]*cx1 + f_01[i]*cx3 + f_10[i]*cx6 + f_11[i]*cx4;                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = (f_10[i]-f_00[i])*cx1 + (f_11[i]-f_01[i])*cx0;
960                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = f_00[i]*cy0 + f_01[i]*cy7;                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = (f_01[i]-f_00[i])*cy2;
961                          o[INDEX3(i,0,1,numComp,2)] = f_00[i]*cx3 + f_01[i]*cx1 + f_10[i]*cx4 + f_11[i]*cx6;                          o[INDEX3(i,0,1,numComp,2)] = (f_10[i]-f_00[i])*cx0 + (f_11[i]-f_01[i])*cx1;
962                          o[INDEX3(i,1,1,numComp,2)] = f_00[i]*cy0 + f_01[i]*cy7;                          o[INDEX3(i,1,1,numComp,2)] = (f_01[i]-f_00[i])*cy2;
963                      } /* end of component loop i */                      } // end of component loop i
964                  } /* end of k1 loop */                  } // end of k1 loop
965              } /* end of face 0 */              } // end of face 0
966              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
967  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
968                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
969                      const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(m_N0-1,k1, m_N0));                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(m_NN[0]-2,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
970                      const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(m_N0-1,k1+1, m_N0));                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(m_NN[0]-2,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
971                      const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(m_N0-2,k1+1, m_N0));                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(m_NN[0]-1,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
972                      const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(m_N0-2,k1, m_N0));                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(m_NN[0]-1,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
973                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+k1);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+k1);
974                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
975                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = f_00[i]*cx1 + f_01[i]*cx3 + f_10[i]*cx6 + f_11[i]*cx4;                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = (f_10[i]-f_00[i])*cx1 + (f_11[i]-f_01[i])*cx0;
976                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = f_10[i]*cy0 + f_11[i]*cy7;                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = (f_11[i]-f_10[i])*cy2;
977                          o[INDEX3(i,0,1,numComp,2)] = f_00[i]*cx3 + f_01[i]*cx1 + f_10[i]*cx4 + f_11[i]*cx6;                          o[INDEX3(i,0,1,numComp,2)] = (f_10[i]-f_00[i])*cx0 + (f_11[i]-f_01[i])*cx1;
978                          o[INDEX3(i,1,1,numComp,2)] = f_10[i]*cy0 + f_11[i]*cy7;                          o[INDEX3(i,1,1,numComp,2)] = (f_11[i]-f_10[i])*cy2;
979                      } /* end of component loop i */                      } // end of component loop i
980                  } /* end of k1 loop */                  } // end of k1 loop
981              } /* end of face 1 */              } // end of face 1
982              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
983  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
984                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
985                      const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,0, m_N0));                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,0, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
986                      const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,0, m_N0));                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
987                      const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,1, m_N0));                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,0, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
988                      const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,1, m_N0));                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
989                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+k0);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+k0);
990                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
991                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = f_00[i]*cx0 + f_10[i]*cx7;                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = (f_10[i]-f_00[i])*cx2;
992                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = f_00[i]*cy1 + f_01[i]*cy6 + f_10[i]*cy3 + f_11[i]*cy4;                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = (f_01[i]-f_00[i])*cy1 + (f_11[i]-f_10[i])*cy0;
993                          o[INDEX3(i,0,1,numComp,2)] = f_00[i]*cx0 + f_10[i]*cx7;                          o[INDEX3(i,0,1,numComp,2)] = (f_10[i]-f_00[i])*cx2;
994                          o[INDEX3(i,1,1,numComp,2)] = f_00[i]*cy3 + f_01[i]*cy4 + f_10[i]*cy1 + f_11[i]*cy6;                          o[INDEX3(i,1,1,numComp,2)] = (f_01[i]-f_00[i])*cy0 + (f_11[i]-f_10[i])*cy1;
995                      } /* end of component loop i */                      } // end of component loop i
996                  } /* end of k0 loop */                  } // end of k0 loop
997              } /* end of face 2 */              } // end of face 2
998              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
999  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1000                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1001                      const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,m_N1-1, m_N0));                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,m_NN[1]-2, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1002                      const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,m_N1-1, m_N0));                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,m_NN[1]-1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1003                      const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,m_N1-2, m_N0));                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,m_NN[1]-2, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1004                      const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,m_N1-2, m_N0));                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,m_NN[1]-1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1005                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+k0);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+k0);
1006                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1007                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = f_01[i]*cx0 + f_11[i]*cx7;                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = (f_11[i]-f_01[i])*cx2;
1008                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = f_00[i]*cy1 + f_01[i]*cy6 + f_10[i]*cy3 + f_11[i]*cy4;                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = (f_01[i]-f_00[i])*cy1 + (f_11[i]-f_10[i])*cy0;
1009                          o[INDEX3(i,0,1,numComp,2)] = f_01[i]*cx0 + f_11[i]*cx7;                          o[INDEX3(i,0,1,numComp,2)] = (f_11[i]-f_01[i])*cx2;
1010                          o[INDEX3(i,1,1,numComp,2)] = f_00[i]*cy3 + f_01[i]*cy4 + f_10[i]*cy1 + f_11[i]*cy6;                          o[INDEX3(i,1,1,numComp,2)] = (f_01[i]-f_00[i])*cy0 + (f_11[i]-f_10[i])*cy1;
1011                      } /* end of component loop i */                      } // end of component loop i
1012                  } /* end of k0 loop */                  } // end of k0 loop
1013              } /* end of face 3 */              } // end of face 3
1014          } // end of parallel section          } // end of parallel section
1015    
1016      } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedFaceElements) {      } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedFaceElements) {
1017          out.requireWrite();          out.requireWrite();
1018  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1019          {          {
1020                vector<double> f_00(numComp);
1021                vector<double> f_01(numComp);
1022                vector<double> f_10(numComp);
1023                vector<double> f_11(numComp);
1024              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
1025  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1026                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1027                      const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(1,k1, m_N0));                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1028                      const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(1,k1+1, m_N0));                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1029                      const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1+1, m_N0));                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(1,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1030                      const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1, m_N0));                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(1,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1031                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+k1);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+k1);
1032                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1033                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = cx5*(f_10[i] + f_11[i]) + cx2*(f_00[i] + f_01[i]);                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = (f_10[i] + f_11[i] - f_00[i] - f_01[i])*cx2/2;
1034                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = f_00[i]*cy0 + f_01[i]*cy7;                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = (f_01[i]-f_00[i])*cy2;
1035                      } /* end of component loop i */                      } // end of component loop i
1036                  } /* end of k1 loop */                  } // end of k1 loop
1037              } /* end of face 0 */              } // end of face 0
1038              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
1039  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1040                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1041                      const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(m_N0-1,k1, m_N0));                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(m_NN[0]-2,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1042                      const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(m_N0-1,k1+1, m_N0));                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(m_NN[0]-2,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1043                      const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(m_N0-2,k1+1, m_N0));                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(m_NN[0]-1,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1044                      const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(m_N0-2,k1, m_N0));                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(m_NN[0]-1,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1045                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+k1);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+k1);
1046                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1047                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = cx5*(f_10[i] + f_11[i]) + cx2*(f_00[i] + f_01[i]);                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = (f_10[i] + f_11[i] - f_00[i] - f_01[i])*cx2/2;
1048                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = f_10[i]*cy0 + f_11[i]*cy7;                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = (f_11[i]-f_10[i])*cy2;
1049                      } /* end of component loop i */                      } // end of component loop i
1050                  } /* end of k1 loop */                  } // end of k1 loop
1051              } /* end of face 1 */              } // end of face 1
1052              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
1053  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1054                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1055                      const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,0, m_N0));                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,0, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1056                      const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,0, m_N0));                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1057                      const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,1, m_N0));                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,0, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1058                      const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,1, m_N0));                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1059                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+k0);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+k0);
1060                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1061                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = f_00[i]*cx0 + f_10[i]*cx7;                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = (f_10[i]-f_00[i])*cx2;
1062                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = cy2*(f_00[i] + f_10[i]) + cy5*(f_01[i] + f_11[i]);                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = (f_01[i] + f_11[i] - f_00[i] - f_10[i])*cy2/2;
1063                      } /* end of component loop i */                      } // end of component loop i
1064                  } /* end of k0 loop */                  } // end of k0 loop
1065              } /* end of face 2 */              } // end of face 2
1066              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
1067  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1068                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1069                      const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,m_N1-1, m_N0));                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,m_NN[1]-2, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1070                      const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,m_N1-1, m_N0));                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,m_NN[1]-1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1071                      const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,m_N1-2, m_N0));                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,m_NN[1]-2, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1072                      const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,m_N1-2, m_N0));                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,m_NN[1]-1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1073                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+k0);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+k0);
1074                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1075                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = f_01[i]*cx0 + f_11[i]*cx7;                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = (f_11[i]-f_01[i])*cx2;
1076                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = cy5*(f_01[i] + f_11[i]) + cy2*(f_00[i] + f_10[i]);                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = (f_01[i] + f_11[i] - f_00[i] - f_10[i])*cy2/2;
1077                      } /* end of component loop i */                      } // end of component loop i
1078                  } /* end of k0 loop */                  } // end of k0 loop
1079              } /* end of face 3 */              } // end of face 3
1080          } // end of parallel section          } // end of parallel section
1081      }      }
1082  }  }
# Line 805  void Rectangle::assembleGradient(escript Line 1085  void Rectangle::assembleGradient(escript
1085  void Rectangle::assembleIntegrate(vector<double>& integrals, escript::Data& arg) const  void Rectangle::assembleIntegrate(vector<double>& integrals, escript::Data& arg) const
1086  {  {
1087      const dim_t numComp = arg.getDataPointSize();      const dim_t numComp = arg.getDataPointSize();
1088      const double h0 = m_l0/m_gNE0;      const index_t left = (m_offset[0]==0 ? 0 : 1);
1089      const double h1 = m_l1/m_gNE1;      const index_t bottom = (m_offset[1]==0 ? 0 : 1);
1090      const index_t left = (m_offset0==0 ? 0 : 1);      const int fs=arg.getFunctionSpace().getTypeCode();
1091      const index_t bottom = (m_offset1==0 ? 0 : 1);      if (fs == Elements && arg.actsExpanded()) {
     if (arg.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements) {  
         const double w = h0*h1/4.;  
1092  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1093          {          {
1094              vector<double> int_local(numComp, 0);              vector<double> int_local(numComp, 0);
1095                const double w = m_dx[0]*m_dx[1]/4.;
1096  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1097              for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {              for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1098                  for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                  for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1099                      const double* f = arg.getSampleDataRO(INDEX2(k0, k1, m_NE0));                      const double* f = arg.getSampleDataRO(INDEX2(k0, k1, m_NE[0]));
1100                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1101                          const double f0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                          const double f0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1102                          const double f1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                          const double f1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1103                          const double f2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];                          const double f2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];
1104                          const double f3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];                          const double f3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];
1105                          int_local[i]+=(f0+f1+f2+f3)*w;                          int_local[i]+=(f0+f1+f2+f3)*w;
1106                      }  /* end of component loop i */                      }  // end of component loop i
1107                  } /* end of k0 loop */                  } // end of k0 loop
1108              } /* end of k1 loop */              } // end of k1 loop
   
1109  #pragma omp critical  #pragma omp critical
1110              for (index_t i=0; i<numComp; i++)              for (index_t i=0; i<numComp; i++)
1111                  integrals[i]+=int_local[i];                  integrals[i]+=int_local[i];
1112          } // end of parallel section          } // end of parallel section
1113      } else if (arg.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {  
1114          const double w = h0*h1;      } else if (fs==ReducedElements || (fs==Elements && !arg.actsExpanded())) {
1115            const double w = m_dx[0]*m_dx[1];
1116  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1117          {          {
1118              vector<double> int_local(numComp, 0);              vector<double> int_local(numComp, 0);
1119  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1120              for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {              for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1121                  for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                  for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1122                      const double* f = arg.getSampleDataRO(INDEX2(k0, k1, m_NE0));                      const double* f = arg.getSampleDataRO(INDEX2(k0, k1, m_NE[0]));
1123                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1124                          int_local[i]+=f[i]*w;                          int_local[i]+=f[i]*w;
1125                      }  /* end of component loop i */                      }
1126                  } /* end of k0 loop */                  }
1127              } /* end of k1 loop */              }
   
1128  #pragma omp critical  #pragma omp critical
1129              for (index_t i=0; i<numComp; i++)              for (index_t i=0; i<numComp; i++)
1130                  integrals[i]+=int_local[i];                  integrals[i]+=int_local[i];
1131          } // end of parallel section          } // end of parallel section
1132      } else if (arg.getFunctionSpace().getTypeCode() == FaceElements) {  
1133          const double w0 = h0/2.;      } else if (fs == FaceElements && arg.actsExpanded()) {
         const double w1 = h1/2.;  
1134  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1135          {          {
1136              vector<double> int_local(numComp, 0);              vector<double> int_local(numComp, 0);
1137                const double w0 = m_dx[0]/2.;
1138                const double w1 = m_dx[1]/2.;
1139              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
1140  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1141                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1142                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[0]+k1);                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[0]+k1);
1143                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1144                          const double f0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                          const double f0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1145                          const double f1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                          const double f1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1146                          int_local[i]+=(f0+f1)*w1;                          int_local[i]+=(f0+f1)*w1;
1147                      }  /* end of component loop i */                      }  // end of component loop i
1148                  } /* end of k1 loop */                  } // end of k1 loop
1149              }              }
1150    
1151              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
1152  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1153                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1154                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[1]+k1);                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[1]+k1);
1155                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1156                          const double f0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                          const double f0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1157                          const double f1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                          const double f1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1158                          int_local[i]+=(f0+f1)*w1;                          int_local[i]+=(f0+f1)*w1;
1159                      }  /* end of component loop i */                      }  // end of component loop i
1160                  } /* end of k1 loop */                  } // end of k1 loop
1161              }              }
1162    
1163              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
1164  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1165                  for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                  for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1166                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[2]+k0);                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[2]+k0);
1167                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1168                          const double f0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                          const double f0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1169                          const double f1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                          const double f1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1170                          int_local[i]+=(f0+f1)*w0;                          int_local[i]+=(f0+f1)*w0;
1171                      }  /* end of component loop i */                      }  // end of component loop i
1172                  } /* end of k0 loop */                  } // end of k0 loop
1173              }              }
1174    
1175              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
1176  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1177                  for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                  for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1178                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[3]+k0);                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[3]+k0);
1179                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1180                          const double f0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                          const double f0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1181                          const double f1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                          const double f1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1182                          int_local[i]+=(f0+f1)*w0;                          int_local[i]+=(f0+f1)*w0;
1183                      }  /* end of component loop i */                      }  // end of component loop i
1184                  } /* end of k0 loop */                  } // end of k0 loop
1185              }              }
   
1186  #pragma omp critical  #pragma omp critical
1187              for (index_t i=0; i<numComp; i++)              for (index_t i=0; i<numComp; i++)
1188                  integrals[i]+=int_local[i];                  integrals[i]+=int_local[i];
1189          } // end of parallel section          } // end of parallel section
1190      } else if (arg.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedFaceElements) {  
1191        } else if (fs==ReducedFaceElements || (fs==FaceElements && !arg.actsExpanded())) {
1192  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1193          {          {
1194              vector<double> int_local(numComp, 0);              vector<double> int_local(numComp, 0);
1195              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
1196  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1197                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1198                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[0]+k1);                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[0]+k1);
1199                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1200                          int_local[i]+=f[i]*h1;                          int_local[i]+=f[i]*m_dx[1];
1201                      }  /* end of component loop i */                      }
1202                  } /* end of k1 loop */                  }
1203              }              }
1204    
1205              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
1206  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1207                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1208                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[1]+k1);                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[1]+k1);
1209                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1210                          int_local[i]+=f[i]*h1;                          int_local[i]+=f[i]*m_dx[1];
1211                      }  /* end of component loop i */                      }
1212                  } /* end of k1 loop */                  }
1213              }              }
1214    
1215              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
1216  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1217                  for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                  for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1218                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[2]+k0);                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[2]+k0);
1219                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1220                          int_local[i]+=f[i]*h0;                          int_local[i]+=f[i]*m_dx[0];
1221                      }  /* end of component loop i */                      }
1222                  } /* end of k0 loop */                  }
1223              }              }
1224    
1225              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
1226  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1227                  for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                  for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1228                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[3]+k0);                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[3]+k0);
1229                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1230                          int_local[i]+=f[i]*h0;                          int_local[i]+=f[i]*m_dx[0];
1231                      }  /* end of component loop i */                      }
1232                  } /* end of k0 loop */                  }
1233              }              }
1234    
1235  #pragma omp critical  #pragma omp critical
1236              for (index_t i=0; i<numComp; i++)              for (index_t i=0; i<numComp; i++)
1237                  integrals[i]+=int_local[i];                  integrals[i]+=int_local[i];
1238          } // end of parallel section          } // end of parallel section
1239      }      } // function space selector
1240  }  }
1241    
1242  //protected  //protected
1243  dim_t Rectangle::insertNeighbourNodes(IndexVector& index, index_t node) const  dim_t Rectangle::insertNeighbourNodes(IndexVector& index, index_t node) const
1244  {  {
1245      const dim_t nDOF0 = (m_gNE0+1)/m_NX;      const dim_t nDOF0 = (m_gNE[0]+1)/m_NX[0];
1246      const dim_t nDOF1 = (m_gNE1+1)/m_NY;      const dim_t nDOF1 = (m_gNE[1]+1)/m_NX[1];
1247      const int x=node%nDOF0;      const int x=node%nDOF0;
1248      const int y=node/nDOF0;      const int y=node/nDOF0;
1249      dim_t num=0;      dim_t num=0;
# Line 994  void Rectangle::nodesToDOF(escript::Data Line 1273  void Rectangle::nodesToDOF(escript::Data
1273      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();
1274      out.requireWrite();      out.requireWrite();
1275    
1276      const index_t left = (m_offset0==0 ? 0 : 1);      const index_t left = (m_offset[0]==0 ? 0 : 1);
1277      const index_t bottom = (m_offset1==0 ? 0 : 1);      const index_t bottom = (m_offset[1]==0 ? 0 : 1);
1278      const dim_t nDOF0 = (m_gNE0+1)/m_NX;      const dim_t nDOF0 = (m_gNE[0]+1)/m_NX[0];
1279      const dim_t nDOF1 = (m_gNE1+1)/m_NY;      const dim_t nDOF1 = (m_gNE[1]+1)/m_NX[1];
1280  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel for
1281      for (index_t i=0; i<nDOF1; i++) {      for (index_t i=0; i<nDOF1; i++) {
1282          for (index_t j=0; j<nDOF0; j++) {          for (index_t j=0; j<nDOF0; j++) {
1283              const index_t n=j+left+(i+bottom)*m_N0;              const index_t n=j+left+(i+bottom)*m_NN[0];
1284              const double* src=in.getSampleDataRO(n);              const double* src=in.getSampleDataRO(n);
1285              copy(src, src+numComp, out.getSampleDataRW(j+i*nDOF0));              copy(src, src+numComp, out.getSampleDataRW(j+i*nDOF0));
1286          }          }
# Line 1027  void Rectangle::dofToNodes(escript::Data Line 1306  void Rectangle::dofToNodes(escript::Data
1306                  : &buffer[(m_dofMap[i]-numDOF)*numComp]);                  : &buffer[(m_dofMap[i]-numDOF)*numComp]);
1307          copy(src, src+numComp, out.getSampleDataRW(i));          copy(src, src+numComp, out.getSampleDataRW(i));
1308      }      }
1309        Paso_Coupler_free(coupler);
1310  }  }
1311    
1312  //private  //private
1313  void Rectangle::populateSampleIds()  void Rectangle::populateSampleIds()
1314  {  {
1315      // identifiers are ordered from left to right, bottom to top globablly.      // degrees of freedom are numbered from left to right, bottom to top in
1316        // each rank, continuing on the next rank (ranks also go left-right,
1317        // bottom-top).
1318        // This means rank 0 has id 0...n0-1, rank 1 has id n0...n1-1 etc. which
1319        // helps when writing out data rank after rank.
1320    
1321      // build node distribution vector first.      // build node distribution vector first.
1322      // rank i owns m_nodeDistribution[i+1]-nodeDistribution[i] nodes      // rank i owns m_nodeDistribution[i+1]-nodeDistribution[i] nodes which is
1323        // constant for all ranks in this implementation
1324      m_nodeDistribution.assign(m_mpiInfo->size+1, 0);      m_nodeDistribution.assign(m_mpiInfo->size+1, 0);
1325      const dim_t numDOF=getNumDOF();      const dim_t numDOF=getNumDOF();
1326      for (dim_t k=1; k<m_mpiInfo->size; k++) {      for (dim_t k=1; k<m_mpiInfo->size; k++) {
# Line 1045  void Rectangle::populateSampleIds() Line 1330  void Rectangle::populateSampleIds()
1330      m_nodeId.resize(getNumNodes());      m_nodeId.resize(getNumNodes());
1331      m_dofId.resize(numDOF);      m_dofId.resize(numDOF);
1332      m_elementId.resize(getNumElements());      m_elementId.resize(getNumElements());
1333    
1334        // populate face element counts
1335        //left
1336        if (m_offset[0]==0)
1337            m_faceCount[0]=m_NE[1];
1338        else
1339            m_faceCount[0]=0;
1340        //right
1341        if (m_mpiInfo->rank%m_NX[0]==m_NX[0]-1)
1342            m_faceCount[1]=m_NE[1];
1343        else
1344            m_faceCount[1]=0;
1345        //bottom
1346        if (m_offset[1]==0)
1347            m_faceCount[2]=m_NE[0];
1348        else
1349            m_faceCount[2]=0;
1350        //top
1351        if (m_mpiInfo->rank/m_NX[0]==m_NX[1]-1)
1352            m_faceCount[3]=m_NE[0];
1353        else
1354            m_faceCount[3]=0;
1355    
1356      m_faceId.resize(getNumFaceElements());      m_faceId.resize(getNumFaceElements());
1357    
1358        const index_t left = (m_offset[0]==0 ? 0 : 1);
1359        const index_t bottom = (m_offset[1]==0 ? 0 : 1);
1360        const dim_t nDOF0 = (m_gNE[0]+1)/m_NX[0];
1361        const dim_t nDOF1 = (m_gNE[1]+1)/m_NX[1];
1362    
1363    #define globalNodeId(x,y) \
1364        ((m_offset[0]+x)/nDOF0)*nDOF0*nDOF1+(m_offset[0]+x)%nDOF0 \
1365        + ((m_offset[1]+y)/nDOF1)*nDOF0*nDOF1*m_NX[0]+((m_offset[1]+y)%nDOF1)*nDOF0
1366    
1367        // set corner id's outside the parallel region
1368        m_nodeId[0] = globalNodeId(0, 0);
1369        m_nodeId[m_NN[0]-1] = globalNodeId(m_NN[0]-1, 0);
1370        m_nodeId[m_NN[0]*(m_NN[1]-1)] = globalNodeId(0, m_NN[1]-1);
1371        m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]-1] = globalNodeId(m_NN[0]-1,m_NN[1]-1);
1372    #undef globalNodeId
1373    
1374  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1375      {      {
1376          // nodes          // populate degrees of freedom and own nodes (identical id)
1377  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1378          for (dim_t i1=0; i1<m_N1; i1++) {          for (dim_t i=0; i<nDOF1; i++) {
1379              for (dim_t i0=0; i0<m_N0; i0++) {              for (dim_t j=0; j<nDOF0; j++) {
1380                  m_nodeId[i0+i1*m_N0] = (m_offset1+i1)*(m_gNE0+1)+m_offset0+i0;                  const index_t nodeIdx=j+left+(i+bottom)*m_NN[0];
1381                    const index_t dofIdx=j+i*nDOF0;
1382                    m_dofId[dofIdx] = m_nodeId[nodeIdx]
1383                        = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank]+dofIdx;
1384              }              }
1385          }          }
1386    
1387          // degrees of freedom          // populate the rest of the nodes (shared with other ranks)
1388            if (m_faceCount[0]==0) { // left column
1389    #pragma omp for nowait
1390                for (dim_t i=0; i<nDOF1; i++) {
1391                    const index_t nodeIdx=(i+bottom)*m_NN[0];
1392                    const index_t dofId=(i+1)*nDOF0-1;
1393                    m_nodeId[nodeIdx]
1394                        = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank-1]+dofId;
1395                }
1396            }
1397            if (m_faceCount[1]==0) { // right column
1398    #pragma omp for nowait
1399                for (dim_t i=0; i<nDOF1; i++) {
1400                    const index_t nodeIdx=(i+bottom+1)*m_NN[0]-1;
1401                    const index_t dofId=i*nDOF0;
1402                    m_nodeId[nodeIdx]
1403                        = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank+1]+dofId;
1404                }
1405            }
1406            if (m_faceCount[2]==0) { // bottom row
1407  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1408          for (dim_t k=0; k<numDOF; k++)              for (dim_t i=0; i<nDOF0; i++) {
1409              m_dofId[k] = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank]+k;                  const index_t nodeIdx=i+left;
1410                    const index_t dofId=nDOF0*(nDOF1-1)+i;
1411                    m_nodeId[nodeIdx]
1412                        = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank-m_NX[0]]+dofId;
1413                }
1414            }
1415            if (m_faceCount[3]==0) { // top row
1416    #pragma omp for nowait
1417                for (dim_t i=0; i<nDOF0; i++) {
1418                    const index_t nodeIdx=m_NN[0]*(m_NN[1]-1)+i+left;
1419                    const index_t dofId=i;
1420                    m_nodeId[nodeIdx]
1421                        = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank+m_NX[0]]+dofId;
1422                }
1423            }
1424    
1425          // elements          // populate element id's
1426  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1427          for (dim_t i1=0; i1<m_NE1; i1++) {          for (dim_t i1=0; i1<m_NE[1]; i1++) {
1428              for (dim_t i0=0; i0<m_NE0; i0++) {              for (dim_t i0=0; i0<m_NE[0]; i0++) {
1429                  m_elementId[i0+i1*m_NE0]=(m_offset1+i1)*m_gNE0+m_offset0+i0;                  m_elementId[i0+i1*m_NE[0]]=(m_offset[1]+i1)*m_gNE[0]+m_offset[0]+i0;
1430              }              }
1431          }          }
1432    
# Line 1083  void Rectangle::populateSampleIds() Line 1443  void Rectangle::populateSampleIds()
1443      updateTagsInUse(Elements);      updateTagsInUse(Elements);
1444    
1445      // generate face offset vector and set face tags      // generate face offset vector and set face tags
     const IndexVector facesPerEdge = getNumFacesPerBoundary();  
1446      const index_t LEFT=1, RIGHT=2, BOTTOM=10, TOP=20;      const index_t LEFT=1, RIGHT=2, BOTTOM=10, TOP=20;
1447      const index_t faceTag[] = { LEFT, RIGHT, BOTTOM, TOP };      const index_t faceTag[] = { LEFT, RIGHT, BOTTOM, TOP };
1448      m_faceOffset.assign(facesPerEdge.size(), -1);      m_faceOffset.assign(4, -1);
1449      m_faceTags.clear();      m_faceTags.clear();
1450      index_t offset=0;      index_t offset=0;
1451      for (size_t i=0; i<facesPerEdge.size(); i++) {      for (size_t i=0; i<4; i++) {
1452          if (facesPerEdge[i]>0) {          if (m_faceCount[i]>0) {
1453              m_faceOffset[i]=offset;              m_faceOffset[i]=offset;
1454              offset+=facesPerEdge[i];              offset+=m_faceCount[i];
1455              m_faceTags.insert(m_faceTags.end(), facesPerEdge[i], faceTag[i]);              m_faceTags.insert(m_faceTags.end(), m_faceCount[i], faceTag[i]);
1456          }          }
1457      }      }
1458      setTagMap("left", LEFT);      setTagMap("left", LEFT);
# Line 1106  void Rectangle::populateSampleIds() Line 1465  void Rectangle::populateSampleIds()
1465  //private  //private
1466  void Rectangle::createPattern()  void Rectangle::createPattern()
1467  {  {
1468      const dim_t nDOF0 = (m_gNE0+1)/m_NX;      const dim_t nDOF0 = (m_gNE[0]+1)/m_NX[0];
1469      const dim_t nDOF1 = (m_gNE1+1)/m_NY;      const dim_t nDOF1 = (m_gNE[1]+1)/m_NX[1];
1470      const index_t left = (m_offset0==0 ? 0 : 1);      const index_t left = (m_offset[0]==0 ? 0 : 1);
1471      const index_t bottom = (m_offset1==0 ? 0 : 1);      const index_t bottom = (m_offset[1]==0 ? 0 : 1);
1472    
1473      // populate node->DOF mapping with own degrees of freedom.      // populate node->DOF mapping with own degrees of freedom.
1474      // The rest is assigned in the loop further down      // The rest is assigned in the loop further down
# Line 1117  void Rectangle::createPattern() Line 1476  void Rectangle::createPattern()
1476  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel for
1477      for (index_t i=bottom; i<bottom+nDOF1; i++) {      for (index_t i=bottom; i<bottom+nDOF1; i++) {
1478          for (index_t j=left; j<left+nDOF0; j++) {          for (index_t j=left; j<left+nDOF0; j++) {
1479              m_dofMap[i*m_N0+j]=(i-bottom)*nDOF0+j-left;              m_dofMap[i*m_NN[0]+j]=(i-bottom)*nDOF0+j-left;
1480          }          }
1481      }      }
1482    
# Line 1130  void Rectangle::createPattern() Line 1489  void Rectangle::createPattern()
1489      IndexVector offsetInShared(1,0);      IndexVector offsetInShared(1,0);
1490      IndexVector sendShared, recvShared;      IndexVector sendShared, recvShared;
1491      int numShared=0;      int numShared=0;
1492      const int x=m_mpiInfo->rank%m_NX;      const int x=m_mpiInfo->rank%m_NX[0];
1493      const int y=m_mpiInfo->rank/m_NX;      const int y=m_mpiInfo->rank/m_NX[0];
1494      for (int i1=-1; i1<2; i1++) {      for (int i1=-1; i1<2; i1++) {
1495          for (int i0=-1; i0<2; i0++) {          for (int i0=-1; i0<2; i0++) {
1496              // skip this rank              // skip this rank
# Line 1140  void Rectangle::createPattern() Line 1499  void Rectangle::createPattern()
1499              // location of neighbour rank              // location of neighbour rank
1500              const int nx=x+i0;              const int nx=x+i0;
1501              const int ny=y+i1;              const int ny=y+i1;
1502              if (nx>=0 && ny>=0 && nx<m_NX && ny<m_NY) {              if (nx>=0 && ny>=0 && nx<m_NX[0] && ny<m_NX[1]) {
1503                  neighbour.push_back(ny*m_NX+nx);                  neighbour.push_back(ny*m_NX[0]+nx);
1504                  if (i0==0) {                  if (i0==0) {
1505                      // sharing top or bottom edge                      // sharing top or bottom edge
1506                      const int firstDOF=(i1==-1 ? 0 : numDOF-nDOF0);                      const int firstDOF=(i1==-1 ? 0 : numDOF-nDOF0);
1507                      const int firstNode=(i1==-1 ? left : m_N0*(m_N1-1)+left);                      const int firstNode=(i1==-1 ? left : m_NN[0]*(m_NN[1]-1)+left);
1508                      offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF0);                      offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF0);
1509                      for (dim_t i=0; i<nDOF0; i++, numShared++) {                      for (dim_t i=0; i<nDOF0; i++, numShared++) {
1510                          sendShared.push_back(firstDOF+i);                          sendShared.push_back(firstDOF+i);
# Line 1160  void Rectangle::createPattern() Line 1519  void Rectangle::createPattern()
1519                  } else if (i1==0) {                  } else if (i1==0) {
1520                      // sharing left or right edge                      // sharing left or right edge
1521                      const int firstDOF=(i0==-1 ? 0 : nDOF0-1);                      const int firstDOF=(i0==-1 ? 0 : nDOF0-1);
1522                      const int firstNode=(i0==-1 ? bottom*m_N0 : (bottom+1)*m_N0-1);                      const int firstNode=(i0==-1 ? bottom*m_NN[0] : (bottom+1)*m_NN[0]-1);
1523                      offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF1);                      offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF1);
1524                      for (dim_t i=0; i<nDOF1; i++, numShared++) {                      for (dim_t i=0; i<nDOF1; i++, numShared++) {
1525                          sendShared.push_back(firstDOF+i*nDOF0);                          sendShared.push_back(firstDOF+i*nDOF0);
# Line 1170  void Rectangle::createPattern() Line 1529  void Rectangle::createPattern()
1529                          colIndices[firstDOF+i*nDOF0].push_back(numShared);                          colIndices[firstDOF+i*nDOF0].push_back(numShared);
1530                          if (i<nDOF1-1)                          if (i<nDOF1-1)
1531                              colIndices[firstDOF+(i+1)*nDOF0].push_back(numShared);                              colIndices[firstDOF+(i+1)*nDOF0].push_back(numShared);
1532                          m_dofMap[firstNode+i*m_N0]=numDOF+numShared;                          m_dofMap[firstNode+i*m_NN[0]]=numDOF+numShared;
1533                      }                      }
1534                  } else {                  } else {
1535                      // sharing a node                      // sharing a node
1536                      const int dof=(i0+1)/2*(nDOF0-1)+(i1+1)/2*(numDOF-nDOF0);                      const int dof=(i0+1)/2*(nDOF0-1)+(i1+1)/2*(numDOF-nDOF0);
1537                      const int node=(i0+1)/2*(m_N0-1)+(i1+1)/2*m_N0*(m_N1-1);                      const int node=(i0+1)/2*(m_NN[0]-1)+(i1+1)/2*m_NN[0]*(m_NN[1]-1);
1538                      offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+1);                      offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+1);
1539                      sendShared.push_back(dof);                      sendShared.push_back(dof);
1540                      recvShared.push_back(numDOF+numShared);                      recvShared.push_back(numDOF+numShared);
# Line 1285  void Rectangle::addToMatrixAndRHS(Paso_S Line 1644  void Rectangle::addToMatrixAndRHS(Paso_S
1644      IndexVector rowIndex;      IndexVector rowIndex;
1645      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode]);      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode]);
1646      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+1]);      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+1]);
1647      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_N0]);      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_NN[0]]);
1648      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_N0+1]);      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_NN[0]+1]);
1649      if (addF) {      if (addF) {
1650          double *F_p=F.getSampleDataRW(0);          double *F_p=F.getSampleDataRW(0);
1651          for (index_t i=0; i<rowIndex.size(); i++) {          for (index_t i=0; i<rowIndex.size(); i++) {
# Line 1309  void Rectangle::interpolateNodesOnElemen Line 1668  void Rectangle::interpolateNodesOnElemen
1668      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();
1669      if (reduced) {      if (reduced) {
1670          out.requireWrite();          out.requireWrite();
1671          const double c0 = .25;          const double c0 = 0.25;
1672  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel
1673          for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {          {
1674              for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {              vector<double> f_00(numComp);
1675                  const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1+1, m_N0));              vector<double> f_01(numComp);
1676                  const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1, m_N0));              vector<double> f_10(numComp);
1677                  const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1, m_N0));              vector<double> f_11(numComp);
1678                  const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1+1, m_N0));  #pragma omp for
1679                  double* o = out.getSampleDataRW(INDEX2(k0,k1,m_NE0));              for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1680                  for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1681                      o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_00[i] + f_01[i] + f_10[i] + f_11[i]);                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1682                  } /* end of component loop i */                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1683              } /* end of k0 loop */                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1684          } /* end of k1 loop */                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1685                        double* o = out.getSampleDataRW(INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1686                        for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1687                            o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_00[i] + f_01[i] + f_10[i] + f_11[i]);
1688                        } /* end of component loop i */
1689                    } /* end of k0 loop */
1690                } /* end of k1 loop */
1691            } /* end of parallel section */
1692      } else {      } else {
1693          out.requireWrite();          out.requireWrite();
1694          const double c0 = .16666666666666666667;          const double c0 = 0.16666666666666666667;
1695          const double c1 = .044658198738520451079;          const double c1 = 0.044658198738520451079;
1696          const double c2 = .62200846792814621559;          const double c2 = 0.62200846792814621559;
1697  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel
1698          for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {          {
1699              for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {              vector<double> f_00(numComp);
1700                  const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1, m_N0));              vector<double> f_01(numComp);
1701                  const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1+1, m_N0));              vector<double> f_10(numComp);
1702                  const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1+1, m_N0));              vector<double> f_11(numComp);
1703                  const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1, m_N0));  #pragma omp for
1704                  double* o = out.getSampleDataRW(INDEX2(k0,k1,m_NE0));              for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1705                  for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1706                      o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_00[i]*c2 + f_11[i]*c1 + c0*(f_01[i] + f_10[i]);                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1707                      o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_01[i]*c1 + f_10[i]*c2 + c0*(f_00[i] + f_11[i]);                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1708                      o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_01[i]*c2 + f_10[i]*c1 + c0*(f_00[i] + f_11[i]);                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1709                      o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_00[i]*c1 + f_11[i]*c2 + c0*(f_01[i] + f_10[i]);                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1710                  } /* end of component loop i */                      double* o = out.getSampleDataRW(INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1711              } /* end of k0 loop */                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1712          } /* end of k1 loop */                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_01[i] + f_10[i]) + c1*f_11[i] + c2*f_00[i];
1713                            o[INDEX2(i,numComp,1)] = c0*(f_00[i] + f_11[i]) + c1*f_01[i] + c2*f_10[i];
1714                            o[INDEX2(i,numComp,2)] = c0*(f_00[i] + f_11[i]) + c1*f_10[i] + c2*f_01[i];
1715                            o[INDEX2(i,numComp,3)] = c0*(f_01[i] + f_10[i]) + c1*f_00[i] + c2*f_11[i];
1716                        } /* end of component loop i */
1717                    } /* end of k0 loop */
1718                } /* end of k1 loop */
1719            } /* end of parallel section */
1720      }      }
1721  }  }
1722    
# Line 1354  void Rectangle::interpolateNodesOnFaces( Line 1727  void Rectangle::interpolateNodesOnFaces(
1727      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();
1728      if (reduced) {      if (reduced) {
1729          out.requireWrite();          out.requireWrite();
         const double c0 = .5;  
1730  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1731          {          {
1732                vector<double> f_00(numComp);
1733                vector<double> f_01(numComp);
1734                vector<double> f_10(numComp);
1735                vector<double> f_11(numComp);
1736              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
1737  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1738                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1739                      const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1, m_N0));                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1740                      const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1+1, m_N0));                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1741                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+k1);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+k1);
1742                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1743                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_00[i] + f_01[i]);                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_00[i] + f_01[i])/2;
1744                      } /* end of component loop i */                      } /* end of component loop i */
1745                  } /* end of k1 loop */                  } /* end of k1 loop */
1746              } /* end of face 0 */              } /* end of face 0 */
1747              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
1748  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1749                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1750                      const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(m_N0-1,k1, m_N0));                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(m_NN[0]-1,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1751                      const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(m_N0-1,k1+1, m_N0));                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(m_NN[0]-1,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1752                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+k1);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+k1);
1753                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1754                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_10[i] + f_11[i]);                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_10[i] + f_11[i])/2;
1755                      } /* end of component loop i */                      } /* end of component loop i */
1756                  } /* end of k1 loop */                  } /* end of k1 loop */
1757              } /* end of face 1 */              } /* end of face 1 */
1758              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
1759  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1760                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1761                      const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,0, m_N0));                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,0, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1762                      const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,0, m_N0));                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,0, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1763                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+k0);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+k0);
1764                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1765                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_00[i] + f_10[i]);                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_00[i] + f_10[i])/2;
1766                      } /* end of component loop i */                      } /* end of component loop i */
1767                  } /* end of k0 loop */                  } /* end of k0 loop */
1768              } /* end of face 2 */              } /* end of face 2 */
1769              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
1770  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1771                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1772                      const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,m_N1-1, m_N0));                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,m_NN[1]-1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1773                      const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,m_N1-1, m_N0));                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,m_NN[1]-1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1774                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+k0);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+k0);
1775                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1776                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_01[i] + f_11[i]);                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_01[i] + f_11[i])/2;
1777                      } /* end of component loop i */                      } /* end of component loop i */
1778                  } /* end of k0 loop */                  } /* end of k0 loop */
1779              } /* end of face 3 */              } /* end of face 3 */
1780          } // end of parallel section          } /* end of parallel section */
1781      } else {      } else {
1782          out.requireWrite();          out.requireWrite();
1783          const double c0 = 0.21132486540518711775;          const double c0 = 0.21132486540518711775;
1784          const double c1 = 0.78867513459481288225;          const double c1 = 0.78867513459481288225;
1785  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1786          {          {
1787                vector<double> f_00(numComp);
1788                vector<double> f_01(numComp);
1789                vector<double> f_10(numComp);
1790                vector<double> f_11(numComp);
1791              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
1792  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1793                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1794                      const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1+1, m_N0));                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1795                      const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1, m_N0));                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1796                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+k1);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+k1);
1797                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1798                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_00[i]*c1 + f_01[i]*c0;                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*f_01[i] + c1*f_00[i];
1799                          o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_00[i]*c0 + f_01[i]*c1;                          o[INDEX2(i,numComp,1)] = c0*f_00[i] + c1*f_01[i];
1800                      } /* end of component loop i */                      } /* end of component loop i */
1801                  } /* end of k1 loop */                  } /* end of k1 loop */
1802              } /* end of face 0 */              } /* end of face 0 */
1803              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
1804  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1805                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1806                      const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(m_N0-1,k1, m_N0));                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(m_NN[0]-1,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1807                      const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(m_N0-1,k1+1, m_N0));                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(m_NN[0]-1,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1808                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+k1);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+k1);
1809                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1810                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_10[i]*c1 + f_11[i]*c0;                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = c1*f_10[i] + c0*f_11[i];
1811                          o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_10[i]*c0 + f_11[i]*c1;                          o[INDEX2(i,numComp,1)] = c1*f_11[i] + c0*f_10[i];
1812                      } /* end of component loop i */                      } /* end of component loop i */
1813                  } /* end of k1 loop */                  } /* end of k1 loop */
1814              } /* end of face 1 */              } /* end of face 1 */
1815              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
1816  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1817                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1818                      const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,0, m_N0));                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,0, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1819                      const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,0, m_N0));                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,0, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1820                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+k0);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+k0);
1821                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1822                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_00[i]*c1 + f_10[i]*c0;                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*f_10[i] + c1*f_00[i];
1823                          o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_00[i]*c0 + f_10[i]*c1;                          o[INDEX2(i,numComp,1)] = c0*f_00[i] + c1*f_10[i];
1824                      } /* end of component loop i */                      } /* end of component loop i */
1825                  } /* end of k0 loop */                  } /* end of k0 loop */
1826              } /* end of face 2 */              } /* end of face 2 */
1827              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
1828  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1829                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1830                      const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,m_N1-1, m_N0));                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,m_NN[1]-1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1831                      const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,m_N1-1, m_N0));                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,m_NN[1]-1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1832                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+k0);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+k0);
1833                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1834                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_01[i]*c1 + f_11[i]*c0;                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*f_11[i] + c1*f_01[i];
1835                          o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_01[i]*c0 + f_11[i]*c1;                          o[INDEX2(i,numComp,1)] = c0*f_01[i] + c1*f_11[i];
1836                      } /* end of component loop i */                      } /* end of component loop i */
1837                  } /* end of k0 loop */                  } /* end of k0 loop */
1838              } /* end of face 3 */              } /* end of face 3 */
1839          } // end of parallel section          } /* end of parallel section */
1840      }      }
1841  }  }
1842    
# Line 1466  void Rectangle::assemblePDESingle(Paso_S Line 1846  void Rectangle::assemblePDESingle(Paso_S
1846          const escript::Data& C, const escript::Data& D,          const escript::Data& C, const escript::Data& D,
1847          const escript::Data& X, const escript::Data& Y) const          const escript::Data& X, const escript::Data& Y) const
1848  {  {
1849      const double h0 = m_l0/m_gNE0;      const double SQRT3 = 1.73205080756887719318;
1850      const double h1 = m_l1/m_gNE1;      const double w1 = 1.0/24.0;
1851      const double w0 = -0.1555021169820365539*h1/h0;      const double w5 = -SQRT3/24 + 1.0/12;
1852      const double w1 = 0.041666666666666666667;      const double w2 = -SQRT3/24 - 1.0/12;
1853      const double w2 = -0.15550211698203655390;      const double w19 = -m_dx[0]/12;
1854      const double w3 = 0.041666666666666666667*h0/h1;      const double w11 = w19*(SQRT3 + 3)/12;
1855      const double w4 = 0.15550211698203655390;      const double w14 = w19*(-SQRT3 + 3)/12;
1856      const double w5 = -0.041666666666666666667;      const double w16 = w19*(5*SQRT3 + 9)/12;
1857      const double w6 = -0.01116454968463011277*h1/h0;      const double w17 = w19*(-5*SQRT3 + 9)/12;
1858      const double w7 = 0.011164549684630112770;      const double w27 = w19*(-SQRT3 - 3)/2;
1859      const double w8 = -0.011164549684630112770;      const double w28 = w19*(SQRT3 - 3)/2;
1860      const double w9 = -0.041666666666666666667*h1/h0;      const double w18 = -m_dx[1]/12;
1861      const double w10 = -0.041666666666666666667*h0/h1;      const double w12 = w18*(5*SQRT3 + 9)/12;
1862      const double w11 = 0.1555021169820365539*h1/h0;      const double w13 = w18*(-5*SQRT3 + 9)/12;
1863      const double w12 = 0.1555021169820365539*h0/h1;      const double w10 = w18*(SQRT3 + 3)/12;
1864      const double w13 = 0.01116454968463011277*h0/h1;      const double w15 = w18*(-SQRT3 + 3)/12;
1865      const double w14 = 0.01116454968463011277*h1/h0;      const double w25 = w18*(-SQRT3 - 3)/2;
1866      const double w15 = 0.041666666666666666667*h1/h0;      const double w26 = w18*(SQRT3 - 3)/2;
1867      const double w16 = -0.01116454968463011277*h0/h1;      const double w22 = m_dx[0]*m_dx[1]/144;
1868      const double w17 = -0.1555021169820365539*h0/h1;      const double w20 = w22*(SQRT3 + 2);
1869      const double w18 = -0.33333333333333333333*h1/h0;      const double w21 = w22*(-SQRT3 + 2);
1870      const double w19 = 0.25;      const double w23 = w22*(4*SQRT3 + 7);
1871      const double w20 = -0.25;      const double w24 = w22*(-4*SQRT3 + 7);
1872      const double w21 = 0.16666666666666666667*h0/h1;      const double w3 = m_dx[0]/(24*m_dx[1]);
1873      const double w22 = -0.16666666666666666667*h1/h0;      const double w7 = w3*(SQRT3 + 2);
1874      const double w23 = -0.16666666666666666667*h0/h1;      const double w8 = w3*(-SQRT3 + 2);
1875      const double w24 = 0.33333333333333333333*h1/h0;      const double w6 = -m_dx[1]/(24*m_dx[0]);
1876      const double w25 = 0.33333333333333333333*h0/h1;      const double w0 = w6*(SQRT3 + 2);
1877      const double w26 = 0.16666666666666666667*h1/h0;      const double w4 = w6*(-SQRT3 + 2);
     const double w27 = -0.33333333333333333333*h0/h1;  
     const double w28 = -0.032861463941450536761*h1;  
     const double w29 = -0.032861463941450536761*h0;  
     const double w30 = -0.12264065304058601714*h1;  
     const double w31 = -0.0023593469594139828636*h1;  
     const double w32 = -0.008805202725216129906*h0;  
     const double w33 = -0.008805202725216129906*h1;  
     const double w34 = 0.032861463941450536761*h1;  
     const double w35 = 0.008805202725216129906*h1;  
     const double w36 = 0.008805202725216129906*h0;  
     const double w37 = 0.0023593469594139828636*h1;  
     const double w38 = 0.12264065304058601714*h1;  
     const double w39 = 0.032861463941450536761*h0;  
     const double w40 = -0.12264065304058601714*h0;  
     const double w41 = -0.0023593469594139828636*h0;  
     const double w42 = 0.0023593469594139828636*h0;  
     const double w43 = 0.12264065304058601714*h0;  
     const double w44 = -0.16666666666666666667*h1;  
     const double w45 = -0.083333333333333333333*h0;  
     const double w46 = 0.083333333333333333333*h1;  
     const double w47 = 0.16666666666666666667*h1;  
     const double w48 = 0.083333333333333333333*h0;  
     const double w49 = -0.16666666666666666667*h0;  
     const double w50 = 0.16666666666666666667*h0;  
     const double w51 = -0.083333333333333333333*h1;  
     const double w52 = 0.025917019497006092316*h0*h1;  
     const double w53 = 0.0018607582807716854616*h0*h1;  
     const double w54 = 0.0069444444444444444444*h0*h1;  
     const double w55 = 0.09672363354357992482*h0*h1;  
     const double w56 = 0.00049858867864229740201*h0*h1;  
     const double w57 = 0.055555555555555555556*h0*h1;  
     const double w58 = 0.027777777777777777778*h0*h1;  
     const double w59 = 0.11111111111111111111*h0*h1;  
     const double w60 = -0.19716878364870322056*h1;  
     const double w61 = -0.19716878364870322056*h0;  
     const double w62 = -0.052831216351296779436*h0;  
     const double w63 = -0.052831216351296779436*h1;  
     const double w64 = 0.19716878364870322056*h1;  
     const double w65 = 0.052831216351296779436*h1;  
     const double w66 = 0.19716878364870322056*h0;  
     const double w67 = 0.052831216351296779436*h0;  
     const double w68 = -0.5*h1;  
     const double w69 = -0.5*h0;  
     const double w70 = 0.5*h1;  
     const double w71 = 0.5*h0;  
     const double w72 = 0.1555021169820365539*h0*h1;  
     const double w73 = 0.041666666666666666667*h0*h1;  
     const double w74 = 0.01116454968463011277*h0*h1;  
     const double w75 = 0.25*h0*h1;  
1878    
1879      rhs.requireWrite();      rhs.requireWrite();
1880  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1881      {      {
1882          for (index_t k1_0=0; k1_0<2; k1_0++) { // colouring          for (index_t k1_0=0; k1_0<2; k1_0++) { // colouring
1883  #pragma omp for  #pragma omp for
1884              for (index_t k1=k1_0; k1<m_NE1; k1+=2) {              for (index_t k1=k1_0; k1<m_NE[1]; k1+=2) {
1885                  for (index_t k0=0; k0<m_NE0; ++k0)  {                  for (index_t k0=0; k0<m_NE[0]; ++k0)  {
1886                      bool add_EM_S=false;                      bool add_EM_S=false;
1887                      bool add_EM_F=false;                      bool add_EM_F=false;
1888                      vector<double> EM_S(4*4, 0);                      vector<double> EM_S(4*4, 0);
1889                      vector<double> EM_F(4, 0);                      vector<double> EM_F(4, 0);
1890                      const index_t e = k0 + m_NE0*k1;                      const index_t e = k0 + m_NE[0]*k1;
1891                      ///////////////                      ///////////////
1892                      // process A //                      // process A //
1893                      ///////////////                      ///////////////
1894                      if (!A.isEmpty()) {                      if (!A.isEmpty()) {
1895                          add_EM_S=true;                          add_EM_S = true;
1896                          const double* A_p=const_cast<escript::Data*>(&A)->getSampleDataRO(e);                          const double* A_p = const_cast<escript::Data*>(&A)->getSampleDataRO(e);
1897                          if (A.actsExpanded()) {                          if (A.actsExpanded()) {
1898                              const double A_00_0 = A_p[INDEX3(0,0,0,2,2)];                              const double A_00_0 = A_p[INDEX3(0,0,0,2,2)];
                             const double A_10_0 = A_p[INDEX3(1,0,0,2,2)];  
1899                              const double A_01_0 = A_p[INDEX3(0,1,0,2,2)];                              const double A_01_0 = A_p[INDEX3(0,1,0,2,2)];
1900                                const double A_10_0 = A_p[INDEX3(1,0,0,2,2)];
1901                              const double A_11_0 = A_p[INDEX3(1,1,0,2,2)];                              const double A_11_0 = A_p[INDEX3(1,1,0,2,2)];
1902                              const double A_00_1 = A_p[INDEX3(0,0,1,2,2)];                              const double A_00_1 = A_p[INDEX3(0,0,1,2,2)];
                             const double A_10_1 = A_p[INDEX3(1,0,1,2,2)];  
1903                              const double A_01_1 = A_p[INDEX3(0,1,1,2,2)];                              const double A_01_1 = A_p[INDEX3(0,1,1,2,2)];
1904                                const double A_10_1 = A_p[INDEX3(1,0,1,2,2)];
1905                              const double A_11_1 = A_p[INDEX3(1,1,1,2,2)];                              const double A_11_1 = A_p[INDEX3(1,1,1,2,2)];
1906                              const double A_00_2 = A_p[INDEX3(0,0,2,2,2)];                              const double A_00_2 = A_p[INDEX3(0,0,2,2,2)];
                             const double A_10_2 = A_p[INDEX3(1,0,2,2,2)];  
1907                              const double A_01_2 = A_p[INDEX3(0,1,2,2,2)];                              const double A_01_2 = A_p[INDEX3(0,1,2,2,2)];
1908                                const double A_10_2 = A_p[INDEX3(1,0,2,2,2)];
1909                              const double A_11_2 = A_p[INDEX3(1,1,2,2,2)];                              const double A_11_2 = A_p[INDEX3(1,1,2,2,2)];
1910                              const double A_00_3 = A_p[INDEX3(0,0,3,2,2)];                              const double A_00_3 = A_p[INDEX3(0,0,3,2,2)];
                             const double A_10_3 = A_p[INDEX3(1,0,3,2,2)];  
1911                              const double A_01_3 = A_p[INDEX3(0,1,3,2,2)];                              const double A_01_3 = A_p[INDEX3(0,1,3,2,2)];
1912                                const double A_10_3 = A_p[INDEX3(1,0,3,2,2)];
1913                              const double A_11_3 = A_p[INDEX3(1,1,3,2,2)];                              const double A_11_3 = A_p[INDEX3(1,1,3,2,2)];
1914                              const double tmp0_0 = A_01_0 + A_01_3;                              const double tmp0 = w3*(A_11_0 + A_11_1 + A_11_2 + A_11_3);
1915                              const double tmp1_0 = A_00_0 + A_00_1;                              const double tmp1 = w1*(A_01_0 + A_01_3 - A_10_1 - A_10_2);
1916                              const double tmp2_0 = A_11_0 + A_11_1 + A_11_2 + A_11_3;                              const double tmp2 = w4*(A_00_2 + A_00_3);
1917                              const double tmp3_0 = A_00_2 + A_00_3;                              const double tmp3 = w0*(A_00_0 + A_00_1);
1918                              const double tmp4_0 = A_10_1 + A_10_2;                              const double tmp4 = w5*(A_01_2 - A_10_3);
1919                              const double tmp5_0 = A_00_0 + A_00_1 + A_00_2 + A_00_3;                              const double tmp5 = w2*(-A_01_1 + A_10_0);
1920                              const double tmp6_0 = A_01_3 + A_10_0;                              const double tmp6 = w5*(A_01_3 + A_10_0);
1921                              const double tmp7_0 = A_01_0 + A_10_3;                              const double tmp7 = w3*(-A_11_0 - A_11_1 - A_11_2 - A_11_3);
1922                              const double tmp8_0 = A_01_1 + A_01_2 + A_10_1 + A_10_2;                              const double tmp8 = w6*(A_00_0 + A_00_1 + A_00_2 + A_00_3);
1923                              const double tmp9_0 = A_01_0 + A_10_0;                              const double tmp9 = w1*(A_01_1 + A_01_2 + A_10_1 + A_10_2);
1924                              const double tmp12_0 = A_11_0 + A_11_2;                              const double tmp10 = w2*(-A_01_0 - A_10_3);
1925                              const double tmp10_0 = A_01_3 + A_10_3;                              const double tmp11 = w4*(A_00_0 + A_00_1);
1926                              const double tmp14_0 = A_01_0 + A_01_3 + A_10_0 + A_10_3;                              const double tmp12 = w0*(A_00_2 + A_00_3);
1927                              const double tmp13_0 = A_01_2 + A_10_1;                              const double tmp13 = w5*(A_01_1 - A_10_0);
1928                              const double tmp11_0 = A_11_1 + A_11_3;                              const double tmp14 = w2*(-A_01_2 + A_10_3);
1929                              const double tmp18_0 = A_01_1 + A_10_1;                              const double tmp15 = w7*(A_11_0 + A_11_2);
1930                              const double tmp15_0 = A_01_1 + A_10_2;                              const double tmp16 = w4*(-A_00_2 - A_00_3);
1931                              const double tmp16_0 = A_10_0 + A_10_3;                              const double tmp17 = w0*(-A_00_0 - A_00_1);
1932                              const double tmp17_0 = A_01_1 + A_01_2;                              const double tmp18 = w5*(A_01_3 + A_10_3);
1933                              const double tmp19_0 = A_01_2 + A_10_2;                              const double tmp19 = w8*(A_11_1 + A_11_3);
1934                              const double tmp0_1 = A_10_3*w8;                              const double tmp20 = w2*(-A_01_0 - A_10_0);
1935                              const double tmp1_1 = tmp0_0*w1;                              const double tmp21 = w7*(A_11_1 + A_11_3);
1936                              const double tmp2_1 = A_01_1*w4;                              const double tmp22 = w4*(-A_00_0 - A_00_1);
1937                              const double tmp3_1 = tmp1_0*w0;                              const double tmp23 = w0*(-A_00_2 - A_00_3);
1938                              const double tmp4_1 = A_01_2*w7;                              const double tmp24 = w5*(A_01_0 + A_10_0);
1939                              const double tmp5_1 = tmp2_0*w3;                              const double tmp25 = w8*(A_11_0 + A_11_2);
1940                              const double tmp6_1 = tmp3_0*w6;                              const double tmp26 = w2*(-A_01_3 - A_10_3);
1941                              const double tmp7_1 = A_10_0*w2;                              const double tmp27 = w5*(-A_01_1 - A_10_2);
1942                              const double tmp8_1 = tmp4_0*w5;                              const double tmp28 = w1*(-A_01_0 - A_01_3 - A_10_0 - A_10_3);
1943                              const double tmp9_1 = tmp2_0*w10;                              const double tmp29 = w2*(A_01_2 + A_10_1);
1944                              const double tmp14_1 = A_10_0*w8;                              const double tmp30 = w7*(-A_11_1 - A_11_3);
1945                              const double tmp23_1 = tmp3_0*w14;                              const double tmp31 = w1*(-A_01_1 - A_01_2 + A_10_0 + A_10_3);
1946                              const double tmp35_1 = A_01_0*w8;                              const double tmp32 = w5*(-A_01_0 + A_10_2);
1947                              const double tmp54_1 = tmp13_0*w8;                              const double tmp33 = w8*(-A_11_0 - A_11_2);
1948                              const double tmp20_1 = tmp9_0*w4;                              const double tmp34 = w6*(-A_00_0 - A_00_1 - A_00_2 - A_00_3);
1949                              const double tmp25_1 = tmp12_0*w12;                              const double tmp35 = w2*(A_01_3 - A_10_1);
1950                              const double tmp44_1 = tmp7_0*w7;                              const double tmp36 = w5*(A_01_0 + A_10_3);
1951                              const double tmp26_1 = tmp10_0*w4;                              const double tmp37 = w2*(-A_01_3 - A_10_0);
1952                              const double tmp52_1 = tmp18_0*w8;                              const double tmp38 = w7*(-A_11_0 - A_11_2);
1953                              const double tmp48_1 = A_10_1*w7;                              const double tmp39 = w5*(-A_01_3 + A_10_1);
1954                              const double tmp46_1 = A_01_3*w8;                              const double tmp40 = w8*(-A_11_1 - A_11_3);
1955                              const double tmp50_1 = A_01_0*w2;                              const double tmp41 = w2*(A_01_0 - A_10_2);
1956                              const double tmp56_1 = tmp19_0*w8;                              const double tmp42 = w5*(A_01_1 - A_10_3);
1957                              const double tmp19_1 = A_10_3*w2;                              const double tmp43 = w2*(-A_01_2 + A_10_0);
1958                              const double tmp47_1 = A_10_2*w4;                              const double tmp44 = w5*(A_01_2 - A_10_0);
1959                              const double tmp16_1 = tmp3_0*w0;                              const double tmp45 = w2*(-A_01_1 + A_10_3);
1960                              const double tmp18_1 = tmp1_0*w6;                              const double tmp46 = w5*(-A_01_0 + A_10_1);
1961                              const double tmp31_1 = tmp11_0*w12;                              const double tmp47 = w2*(A_01_3 - A_10_2);
1962                              const double tmp55_1 = tmp15_0*w2;                              const double tmp48 = w5*(-A_01_1 - A_10_1);
1963                              const double tmp39_1 = A_10_2*w7;                              const double tmp49 = w2*(A_01_2 + A_10_2);
1964                              const double tmp11_1 = tmp6_0*w7;                              const double tmp50 = w5*(-A_01_3 + A_10_2);
1965                              const double tmp40_1 = tmp11_0*w17;                              const double tmp51 = w2*(A_01_0 - A_10_1);
1966                              const double tmp34_1 = tmp15_0*w8;                              const double tmp52 = w5*(-A_01_2 - A_10_1);
1967                              const double tmp33_1 = tmp14_0*w5;                              const double tmp53 = w2*(A_01_1 + A_10_2);
1968                              const double tmp24_1 = tmp11_0*w13;                              const double tmp54 = w5*(-A_01_2 - A_10_2);
1969                              const double tmp43_1 = tmp17_0*w5;                              const double tmp55 = w2*(A_01_1 + A_10_1);
1970                              const double tmp15_1 = A_01_2*w4;                              EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=tmp15 + tmp16 + tmp17 + tmp18 + tmp19 + tmp20 + tmp9;
1971                              const double tmp53_1 = tmp19_0*w2;                              EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=tmp0 + tmp1 + tmp2 + tmp3 + tmp4 + tmp5;
1972                              const double tmp27_1 = tmp3_0*w11;                              EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=tmp31 + tmp34 + tmp38 + tmp39 + tmp40 + tmp41;
1973                              const double tmp32_1 = tmp13_0*w2;                              EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp28 + tmp52 + tmp53 + tmp7 + tmp8;
1974                              const double tmp10_1 = tmp5_0*w9;                              EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=tmp0 + tmp2 + tmp3 + tmp31 + tmp50 + tmp51;
1975                              const double tmp37_1 = A_10_1*w4;                              EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=tmp16 + tmp17 + tmp21 + tmp25 + tmp28 + tmp54 + tmp55;
1976                              const double tmp38_1 = tmp5_0*w15;                              EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp10 + tmp6 + tmp7 + tmp8 + tmp9;
1977                              const double tmp17_1 = A_01_1*w7;                              EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=tmp1 + tmp30 + tmp33 + tmp34 + tmp44 + tmp45;
1978                              const double tmp12_1 = tmp7_0*w4;                              EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=tmp1 + tmp34 + tmp38 + tmp40 + tmp42 + tmp43;
1979                              const double tmp22_1 = tmp10_0*w7;                              EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp36 + tmp37 + tmp7 + tmp8 + tmp9;
1980                              const double tmp57_1 = tmp18_0*w2;                              EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=tmp15 + tmp19 + tmp22 + tmp23 + tmp28 + tmp48 + tmp49;
1981                              const double tmp28_1 = tmp9_0*w7;                              EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=tmp0 + tmp11 + tmp12 + tmp31 + tmp46 + tmp47;
1982                              const double tmp29_1 = tmp1_0*w14;                              EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp27 + tmp28 + tmp29 + tmp7 + tmp8;
1983                              const double tmp51_1 = tmp11_0*w16;                              EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=tmp30 + tmp31 + tmp32 + tmp33 + tmp34 + tmp35;
1984                              const double tmp42_1 = tmp12_0*w16;                              EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=tmp0 + tmp1 + tmp11 + tmp12 + tmp13 + tmp14;
1985                              const double tmp49_1 = tmp12_0*w17;                              EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=tmp21 + tmp22 + tmp23 + tmp24 + tmp25 + tmp26 + tmp9;
                             const double tmp21_1 = tmp1_0*w11;  
                             const double tmp45_1 = tmp6_0*w4;  
                             const double tmp13_1 = tmp8_0*w1;  
                             const double tmp36_1 = tmp16_0*w1;  
                             const double tmp41_1 = A_01_3*w2;  
                             const double tmp30_1 = tmp12_0*w13;  
                             EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=tmp13_1 + tmp20_1 + tmp21_1 + tmp22_1 + tmp23_1 + tmp24_1 + tmp25_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=tmp36_1 + tmp37_1 + tmp39_1 + tmp3_1 + tmp43_1 + tmp46_1 + tmp50_1 + tmp5_1 + tmp6_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=tmp0_1 + tmp15_1 + tmp17_1 + tmp1_1 + tmp38_1 + tmp49_1 + tmp51_1 + tmp7_1 + tmp8_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp10_1 + tmp32_1 + tmp33_1 + tmp34_1 + tmp9_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1 + tmp2_1 + tmp3_1 + tmp4_1 + tmp5_1 + tmp6_1 + tmp7_1 + tmp8_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=tmp21_1 + tmp23_1 + tmp30_1 + tmp31_1 + tmp33_1 + tmp56_1 + tmp57_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp10_1 + tmp13_1 + tmp44_1 + tmp45_1 + tmp9_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=tmp35_1 + tmp36_1 + tmp37_1 + tmp38_1 + tmp39_1 + tmp40_1 + tmp41_1 + tmp42_1 + tmp43_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=tmp36_1 + tmp38_1 + tmp43_1 + tmp46_1 + tmp47_1 + tmp48_1 + tmp49_1 + tmp50_1 + tmp51_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp10_1 + tmp11_1 + tmp12_1 + tmp13_1 + tmp9_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=tmp24_1 + tmp25_1 + tmp27_1 + tmp29_1 + tmp33_1 + tmp52_1 + tmp53_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=tmp14_1 + tmp15_1 + tmp16_1 + tmp17_1 + tmp18_1 + tmp19_1 + tmp1_1 + tmp5_1 + tmp8_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp10_1 + tmp33_1 + tmp54_1 + tmp55_1 + tmp9_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=tmp14_1 + tmp19_1 + tmp1_1 + tmp2_1 + tmp38_1 + tmp40_1 + tmp42_1 + tmp4_1 + tmp8_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=tmp16_1 + tmp18_1 + tmp35_1 + tmp36_1 + tmp41_1 + tmp43_1 + tmp47_1 + tmp48_1 + tmp5_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=tmp13_1 + tmp26_1 + tmp27_1 + tmp28_1 + tmp29_1 + tmp30_1 + tmp31_1;  
1986                          } else { // constant data                          } else { // constant data
1987                              const double A_00 = A_p[INDEX2(0,0,2)];                              const double A_00 = A_p[INDEX2(0,0,2)];
                             const double A_10 = A_p[INDEX2(1,0,2)];  
1988                              const double A_01 = A_p[INDEX2(0,1,2)];                              const double A_01 = A_p[INDEX2(0,1,2)];
1989                                const double A_10 = A_p[INDEX2(1,0,2)];
1990                              const double A_11 = A_p[INDEX2(1,1,2)];                              const double A_11 = A_p[INDEX2(1,1,2)];
1991                              const double tmp0_0 = A_01 + A_10;                              const double tmp0 = 6*w1*(A_01 - A_10);
1992                              const double tmp0_1 = A_00*w18;                              const double tmp1 = 6*w1*(A_01 + A_10);
1993                              const double tmp1_1 = A_01*w19;                              const double tmp2 = 6*w1*(-A_01 - A_10);
1994                              const double tmp2_1 = A_10*w20;                              const double tmp3 = 6*w1*(-A_01 + A_10);
1995                              const double tmp3_1 = A_11*w21;                              EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=-8*A_00*w6 + 8*A_11*w3 + tmp1;
1996                              const double tmp4_1 = A_00*w22;                              EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=8*A_00*w6 + 4*A_11*w3 + tmp0;
1997                              const double tmp5_1 = tmp0_0*w19;                              EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=-4*A_00*w6 - 8*A_11*w3 + tmp3;
1998                              const double tmp6_1 = A_11*w23;                              EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=4*A_00*w6 - 4*A_11*w3 + tmp2;
1999                              const double tmp7_1 = A_11*w25;                              EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=8*A_00*w6 + 4*A_11*w3 + tmp3;
2000                              const double tmp8_1 = A_00*w24;                              EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=-8*A_00*w6 + 8*A_11*w3 + tmp2;
2001                              const double tmp9_1 = tmp0_0*w20;                              EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=4*A_00*w6 - 4*A_11*w3 + tmp1;
2002                              const double tmp10_1 = A_01*w20;                              EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=-4*A_00*w6 - 8*A_11*w3 + tmp0;
2003                              const double tmp11_1 = A_11*w27;                              EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=-4*A_00*w6 - 8*A_11*w3 + tmp0;
2004                              const double tmp12_1 = A_00*w26;                              EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=4*A_00*w6 - 4*A_11*w3 + tmp1;
2005                              const double tmp13_1 = A_10*w19;                              EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=-8*A_00*w6 + 8*A_11*w3 + tmp2;
2006                              EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=tmp5_1 + tmp7_1 + tmp8_1;                              EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=8*A_00*w6 + 4*A_11*w3 + tmp3;
2007                              EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=tmp0_1 + tmp10_1 + tmp13_1 + tmp3_1;                              EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=4*A_00*w6 - 4*A_11*w3 + tmp2;
2008                              EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=tmp11_1 + tmp12_1 + tmp1_1 + tmp2_1;                              EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=-4*A_00*w6 - 8*A_11*w3 + tmp3;
2009                              EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp4_1 + tmp6_1 + tmp9_1;                              EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=8*A_00*w6 + 4*A_11*w3 + tmp0;
2010                              EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1 + tmp2_1 + tmp3_1;                              EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=-8*A_00*w6 + 8*A_11*w3 + tmp1;
                             EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=tmp7_1 + tmp8_1 + tmp9_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp4_1 + tmp5_1 + tmp6_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=tmp10_1 + tmp11_1 + tmp12_1 + tmp13_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=tmp10_1 + tmp11_1 + tmp12_1 + tmp13_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp4_1 + tmp5_1 + tmp6_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=tmp7_1 + tmp8_1 + tmp9_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1 + tmp2_1 + tmp3_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp4_1 + tmp6_1 + tmp9_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=tmp11_1 + tmp12_1 + tmp1_1 + tmp2_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=tmp0_1 + tmp10_1 + tmp13_1 + tmp3_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=tmp5_1 + tmp7_1 + tmp8_1;  
2011                          }                          }
2012                      }                      }
2013                      ///////////////                      ///////////////
# Line 1727  void Rectangle::assemblePDESingle(Paso_S Line 2025  void Rectangle::assemblePDESingle(Paso_S
2025                              const double B_1_2 = B_p[INDEX2(1,2,2)];                              const double B_1_2 = B_p[INDEX2(1,2,2)];
2026                              const double B_0_3 = B_p[INDEX2(0,3,2)];                              const double B_0_3 = B_p[INDEX2(0,3,2)];
2027                              const double B_1_3 = B_p[INDEX2(1,3,2)];                              const double B_1_3 = B_p[INDEX2(1,3,2)];
2028                              const double tmp0_0 = B_1_0 + B_1_1;                              const double tmp0 = w11*(B_1_0 + B_1_1);
2029                              const double tmp1_0 = B_1_2 + B_1_3;                              const double tmp1 = w14*(B_1_2 + B_1_3);
2030                              const double tmp2_0 = B_0_1 + B_0_3;                              const double tmp2 = w15*(-B_0_1 - B_0_3);
2031                              const double tmp3_0 = B_0_0 + B_0_2;                              const double tmp3 = w10*(-B_0_0 - B_0_2);
2032                              const double tmp63_1 = B_1_1*w42;                              const double tmp4 = w11*(B_1_2 + B_1_3);
2033                              const double tmp79_1 = B_1_1*w40;                              const double tmp5 = w14*(B_1_0 + B_1_1);
2034                              const double tmp37_1 = tmp3_0*w35;                              const double tmp6 = w11*(-B_1_2 - B_1_3);
2035                              const double tmp8_1 = tmp0_0*w32;                              const double tmp7 = w14*(-B_1_0 - B_1_1);
2036                              const double tmp71_1 = B_0_1*w34;                              const double tmp8 = w11*(-B_1_0 - B_1_1);
2037                              const double tmp19_1 = B_0_3*w31;                              const double tmp9 = w14*(-B_1_2 - B_1_3);
2038                              const double tmp15_1 = B_0_3*w34;                              const double tmp10 = w10*(-B_0_1 - B_0_3);
2039                              const double tmp9_1 = tmp3_0*w34;                              const double tmp11 = w15*(-B_0_0 - B_0_2);
2040                              const double tmp35_1 = B_1_0*w36;                              const double tmp12 = w15*(B_0_0 + B_0_2);
2041                              const double tmp66_1 = B_0_3*w28;                              const double tmp13 = w10*(B_0_1 + B_0_3);
2042                              const double tmp28_1 = B_1_0*w42;                              const double tmp14 = w10*(B_0_0 + B_0_2);
2043                              const double tmp22_1 = B_1_0*w40;                              const double tmp15 = w15*(B_0_1 + B_0_3);
2044                              const double tmp16_1 = B_1_2*w29;                              EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=B_0_0*w12 + B_0_1*w10 + B_0_2*w15 + B_0_3*w13 + B_1_0*w16 + B_1_1*w14 + B_1_2*w11 + B_1_3*w17;
2045                              const double tmp6_1 = tmp2_0*w35;                              EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=B_0_0*w10 + B_0_1*w12 + B_0_2*w13 + B_0_3*w15 + tmp0 + tmp1;
2046                              const double tmp55_1 = B_1_3*w40;                              EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=B_1_0*w11 + B_1_1*w17 + B_1_2*w16 + B_1_3*w14 + tmp14 + tmp15;
2047                              const double tmp50_1 = B_1_3*w42;                              EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp12 + tmp13 + tmp4 + tmp5;
2048                              const double tmp7_1 = tmp1_0*w29;                              EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=-B_0_0*w12 - B_0_1*w10 - B_0_2*w15 - B_0_3*w13 + tmp0 + tmp1;
2049                              const double tmp1_1 = tmp1_0*w32;                              EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=-B_0_0*w10 - B_0_1*w12 - B_0_2*w13 - B_0_3*w15 + B_1_0*w14 + B_1_1*w16 + B_1_2*w17 + B_1_3*w11;
2050                              const double tmp57_1 = B_0_3*w30;                              EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp2 + tmp3 + tmp4 + tmp5;
2051                              const double tmp18_1 = B_1_1*w32;                              EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=B_1_0*w17 + B_1_1*w11 + B_1_2*w14 + B_1_3*w16 + tmp10 + tmp11;
2052                              const double tmp53_1 = B_1_0*w41;                              EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=-B_1_0*w16 - B_1_1*w14 - B_1_2*w11 - B_1_3*w17 + tmp14 + tmp15;
2053                              const double tmp61_1 = B_1_3*w36;                              EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp12 + tmp13 + tmp8 + tmp9;
2054                              const double tmp27_1 = B_0_3*w38;                              EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=B_0_0*w15 + B_0_1*w13 + B_0_2*w12 + B_0_3*w10 - B_1_0*w11 - B_1_1*w17 - B_1_2*w16 - B_1_3*w14;
2055                              const double tmp64_1 = B_0_2*w30;                              EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=B_0_0*w13 + B_0_1*w15 + B_0_2*w10 + B_0_3*w12 + tmp6 + tmp7;
2056                              const double tmp76_1 = B_0_1*w38;                              EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp2 + tmp3 + tmp8 + tmp9;
2057                              const double tmp39_1 = tmp2_0*w34;                              EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=-B_1_0*w14 - B_1_1*w16 - B_1_2*w17 - B_1_3*w11 + tmp10 + tmp11;
2058                              const double tmp62_1 = B_0_1*w31;                              EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=-B_0_0*w15 - B_0_1*w13 - B_0_2*w12 - B_0_3*w10 + tmp6 + tmp7;
2059                              const double tmp56_1 = B_0_0*w31;                              EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=-B_0_0*w13 - B_0_1*w15 - B_0_2*w10 - B_0_3*w12 - B_1_0*w17 - B_1_1*w11 - B_1_2*w14 - B_1_3*w16;
                             const double tmp49_1 = B_1_1*w36;  
                             const double tmp2_1 = B_0_2*w31;  
                             const double tmp23_1 = B_0_2*w33;  
                             const double tmp38_1 = B_1_1*w43;  
                             const double tmp74_1 = B_1_2*w41;  
                             const double tmp43_1 = B_1_1*w41;  
                             const double tmp58_1 = B_0_2*w28;  
                             const double tmp67_1 = B_0_0*w33;  
                             const double tmp33_1 = tmp0_0*w39;  
                             const double tmp4_1 = B_0_0*w28;  
                             const double tmp20_1 = B_0_0*w30;  
                             const double tmp13_1 = B_0_2*w38;  
                             const double tmp65_1 = B_1_2*w43;  
                             const double tmp0_1 = tmp0_0*w29;  
                             const double tmp41_1 = tmp3_0*w33;  
                             const double tmp73_1 = B_0_2*w37;  
                             const double tmp69_1 = B_0_0*w38;  
                             const double tmp48_1 = B_1_2*w39;  
                             const double tmp59_1 = B_0_1*w33;  
                             const double tmp17_1 = B_1_3*w41;  
                             const double tmp5_1 = B_0_3*w33;  
                             const double tmp3_1 = B_0_1*w30;  
                             const double tmp21_1 = B_0_1*w28;  
                             const double tmp42_1 = B_1_0*w29;  
                             const double tmp54_1 = B_1_2*w32;  
                             const double tmp60_1 = B_1_0*w39;  
                             const double tmp32_1 = tmp1_0*w36;  
                             const double tmp10_1 = B_0_1*w37;  
                             const double tmp14_1 = B_0_0*w35;  
                             const double tmp29_1 = B_0_1*w35;  
                             const double tmp26_1 = B_1_2*w36;  
                             const double tmp30_1 = B_1_3*w43;  
                             const double tmp70_1 = B_0_2*w35;  
                             const double tmp34_1 = B_1_3*w39;  
                             const double tmp51_1 = B_1_0*w43;  
                             const double tmp31_1 = B_0_2*w34;  
                             const double tmp45_1 = tmp3_0*w28;  
                             const double tmp11_1 = tmp1_0*w39;  
                             const double tmp52_1 = B_1_1*w29;  
                             const double tmp44_1 = B_1_3*w32;  
                             const double tmp25_1 = B_1_1*w39;  
                             const double tmp47_1 = tmp2_0*w33;  
                             const double tmp72_1 = B_1_3*w29;  
                             const double tmp40_1 = tmp2_0*w28;  
                             const double tmp46_1 = B_1_2*w40;  
                             const double tmp36_1 = B_1_2*w42;  
                             const double tmp24_1 = B_0_0*w37;  
                             const double tmp77_1 = B_0_3*w35;  
                             const double tmp68_1 = B_0_3*w37;  
                             const double tmp78_1 = B_0_0*w34;  
                             const double tmp12_1 = tmp0_0*w36;  
                             const double tmp75_1 = B_1_0*w32;  
                             EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=tmp16_1 + tmp17_1 + tmp18_1 + tmp19_1 + tmp20_1 + tmp21_1 + tmp22_1 + tmp23_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1 + tmp68_1 + tmp69_1 + tmp70_1 + tmp71_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=tmp45_1 + tmp47_1 + tmp48_1 + tmp49_1 + tmp50_1 + tmp51_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp32_1 + tmp33_1 + tmp6_1 + tmp9_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1 + tmp2_1 + tmp3_1 + tmp4_1 + tmp5_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=tmp72_1 + tmp73_1 + tmp74_1 + tmp75_1 + tmp76_1 + tmp77_1 + tmp78_1 + tmp79_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp32_1 + tmp33_1 + tmp40_1 + tmp41_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=tmp34_1 + tmp35_1 + tmp36_1 + tmp37_1 + tmp38_1 + tmp39_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=tmp42_1 + tmp43_1 + tmp44_1 + tmp45_1 + tmp46_1 + tmp47_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp6_1 + tmp7_1 + tmp8_1 + tmp9_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=tmp60_1 + tmp61_1 + tmp62_1 + tmp63_1 + tmp64_1 + tmp65_1 + tmp66_1 + tmp67_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=tmp10_1 + tmp11_1 + tmp12_1 + tmp13_1 + tmp14_1 + tmp15_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp40_1 + tmp41_1 + tmp7_1 + tmp8_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=tmp37_1 + tmp39_1 + tmp52_1 + tmp53_1 + tmp54_1 + tmp55_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=tmp11_1 + tmp12_1 + tmp56_1 + tmp57_1 + tmp58_1 + tmp59_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=tmp24_1 + tmp25_1 + tmp26_1 + tmp27_1 + tmp28_1 + tmp29_1 + tmp30_1 + tmp31_1;  
2060                          } else { // constant data                          } else { // constant data
2061                              const double B_0 = B_p[0];                              const double B_0 = B_p[0];
2062                              const double B_1 = B_p[1];                              const double B_1 = B_p[1];
2063                              const double tmp0_1 = B_0*w44;                              EM_S[INDEX2(0,0,4)]+= 2*B_0*w18 + 2*B_1*w19;
2064                              const double tmp1_1 = B_1*w45;                              EM_S[INDEX2(0,1,4)]+= 2*B_0*w18 +   B_1*w19;
2065                              const double tmp2_1 = B_0*w46;                              EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=   B_0*w18 + 2*B_1*w19;
2066                              const double tmp3_1 = B_0*w47;                              EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=   B_0*w18 +   B_1*w19;
2067                              const double tmp4_1 = B_1*w48;                              EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=-2*B_0*w18 +   B_1*w19;
2068                              const double tmp5_1 = B_1*w49;                              EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=-2*B_0*w18 + 2*B_1*w19;
2069                              const double tmp6_1 = B_1*w50;                              EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=  -B_0*w18 +   B_1*w19;
2070                              const double tmp7_1 = B_0*w51;                              EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=  -B_0*w18 + 2*B_1*w19;
2071                              EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=tmp0_1 + tmp5_1;                              EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=   B_0*w18 - 2*B_1*w19;
2072                              EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=tmp1_1 + tmp3_1;                              EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=   B_0*w18 -   B_1*w19;
2073                              EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=tmp6_1 + tmp7_1;                              EM_S[INDEX2(2,2,4)]+= 2*B_0*w18 - 2*B_1*w19;
2074                              EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp2_1 + tmp4_1;                              EM_S[INDEX2(2,3,4)]+= 2*B_0*w18 -   B_1*w19;
2075                              EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1;                              EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=  -B_0*w18 -   B_1*w19;
2076                              EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=tmp3_1 + tmp5_1;                              EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=  -B_0*w18 - 2*B_1*w19;
2077                              EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp4_1 + tmp7_1;                              EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=-2*B_0*w18 -   B_1*w19;
2078                              EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=tmp2_1 + tmp6_1;                              EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=-2*B_0*w18 - 2*B_1*w19;
                             EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=tmp5_1 + tmp7_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp1_1 + tmp2_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=tmp0_1 + tmp6_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=tmp3_1 + tmp4_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp1_1 + tmp7_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=tmp2_1 + tmp5_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=tmp0_1 + tmp4_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=tmp3_1 + tmp6_1;  
2079                          }                          }
2080                      }                      }
2081                      ///////////////                      ///////////////
# Line 1871  void Rectangle::assemblePDESingle(Paso_S Line 2093  void Rectangle::assemblePDESingle(Paso_S
2093                              const double C_1_2 = C_p[INDEX2(1,2,2)];                              const double C_1_2 = C_p[INDEX2(1,2,2)];
2094                              const double C_0_3 = C_p[INDEX2(0,3,2)];                              const double C_0_3 = C_p[INDEX2(0,3,2)];
2095                              const double C_1_3 = C_p[INDEX2(1,3,2)];                              const double C_1_3 = C_p[INDEX2(1,3,2)];
2096                              const double tmp0_0 = C_1_0 + C_1_1;                              const double tmp0 = w11*(C_1_0 + C_1_1);
2097                              const double tmp1_0 = C_1_2 + C_1_3;                              const double tmp1 = w14*(C_1_2 + C_1_3);
2098                              const double tmp2_0 = C_0_1 + C_0_3;                              const double tmp2 = w15*(C_0_0 + C_0_2);
2099                              const double tmp3_0 = C_0_0 + C_0_2;                              const double tmp3 = w10*(C_0_1 + C_0_3);
2100                              const double tmp64_1 = C_0_2*w30;                              const double tmp4 = w11*(-C_1_0 - C_1_1);
2101                              const double tmp14_1 = C_0_2*w28;                              const double tmp5 = w14*(-C_1_2 - C_1_3);
2102                              const double tmp19_1 = C_0_3*w31;                              const double tmp6 = w11*(-C_1_2 - C_1_3);
2103                              const double tmp22_1 = C_1_0*w40;                              const double tmp7 = w14*(-C_1_0 - C_1_1);
2104                              const double tmp37_1 = tmp3_0*w35;                              const double tmp8 = w11*(C_1_2 + C_1_3);
2105                              const double tmp29_1 = C_0_1*w35;                              const double tmp9 = w14*(C_1_0 + C_1_1);
2106                              const double tmp73_1 = C_0_2*w37;                              const double tmp10 = w10*(-C_0_1 - C_0_3);
2107                              const double tmp74_1 = C_1_2*w41;                              const double tmp11 = w15*(-C_0_0 - C_0_2);
2108                              const double tmp52_1 = C_1_3*w39;                              const double tmp12 = w15*(-C_0_1 - C_0_3);
2109                              const double tmp25_1 = C_1_1*w39;                              const double tmp13 = w10*(-C_0_0 - C_0_2);
2110                              const double tmp62_1 = C_0_1*w31;                              const double tmp14 = w10*(C_0_0 + C_0_2);
2111                              const double tmp79_1 = C_1_1*w40;                              const double tmp15 = w15*(C_0_1 + C_0_3);
2112                              const double tmp43_1 = C_1_1*w36;                              EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=C_0_0*w12 + C_0_1*w10 + C_0_2*w15 + C_0_3*w13 + C_1_0*w16 + C_1_1*w14 + C_1_2*w11 + C_1_3*w17;
2113                              const double tmp27_1 = C_0_3*w38;                              EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=-C_0_0*w12 - C_0_1*w10 - C_0_2*w15 - C_0_3*w13 + tmp0 + tmp1;
2114                              const double tmp28_1 = C_1_0*w42;                              EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=-C_1_0*w16 - C_1_1*w14 - C_1_2*w11 - C_1_3*w17 + tmp14 + tmp15;
2115                              const double tmp63_1 = C_1_1*w42;                              EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp12 + tmp13 + tmp4 + tmp5;
2116                              const double tmp59_1 = C_0_3*w34;                              EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=C_0_0*w10 + C_0_1*w12 + C_0_2*w13 + C_0_3*w15 + tmp0 + tmp1;
2117                              const double tmp72_1 = C_1_3*w29;                              EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=-C_0_0*w10 - C_0_1*w12 - C_0_2*w13 - C_0_3*w15 + C_1_0*w14 + C_1_1*w16 + C_1_2*w17 + C_1_3*w11;
2118                              const double tmp40_1 = tmp2_0*w35;                              EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp2 + tmp3 + tmp4 + tmp5;
2119                              const double tmp13_1 = C_0_3*w30;                              EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=-C_1_0*w14 - C_1_1*w16 - C_1_2*w17 - C_1_3*w11 + tmp10 + tmp11;
2120                              const double tmp51_1 = C_1_2*w40;                              EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=C_1_0*w11 + C_1_1*w17 + C_1_2*w16 + C_1_3*w14 + tmp14 + tmp15;
2121                              const double tmp54_1 = C_1_2*w42;                              EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp12 + tmp13 + tmp8 + tmp9;
2122                              const double tmp12_1 = C_0_0*w31;                              EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=C_0_0*w15 + C_0_1*w13 + C_0_2*w12 + C_0_3*w10 - C_1_0*w11 - C_1_1*w17 - C_1_2*w16 - C_1_3*w14;
2123                              const double tmp2_1 = tmp1_0*w32;                              EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=-C_0_0*w15 - C_0_1*w13 - C_0_2*w12 - C_0_3*w10 + tmp6 + tmp7;
2124                              const double tmp68_1 = C_0_2*w31;                              EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp2 + tmp3 + tmp8 + tmp9;
2125                              const double tmp75_1 = C_1_0*w32;                              EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=C_1_0*w17 + C_1_1*w11 + C_1_2*w14 + C_1_3*w16 + tmp10 + tmp11;
2126                              const double tmp49_1 = C_1_1*w41;                              EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=C_0_0*w13 + C_0_1*w15 + C_0_2*w10 + C_0_3*w12 + tmp6 + tmp7;
2127                              const double tmp4_1 = C_0_2*w35;                              EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=-C_0_0*w13 - C_0_1*w15 - C_0_2*w10 - C_0_3*w12 - C_1_0*w17 - C_1_1*w11 - C_1_2*w14 - C_1_3*w16;
                             const double tmp66_1 = C_0_3*w28;  
                             const double tmp56_1 = C_0_1*w37;  
                             const double tmp5_1 = C_0_1*w34;  
                             const double tmp38_1 = tmp2_0*w34;  
                             const double tmp76_1 = C_0_1*w38;  
                             const double tmp21_1 = C_0_1*w28;  
                             const double tmp69_1 = C_0_1*w30;  
                             const double tmp53_1 = C_1_0*w36;  
                             const double tmp42_1 = C_1_2*w39;  
                             const double tmp32_1 = tmp1_0*w29;  
                             const double tmp45_1 = C_1_0*w43;  
                             const double tmp33_1 = tmp0_0*w32;  
                             const double tmp35_1 = C_1_0*w41;  
                             const double tmp26_1 = C_1_2*w36;  
                             const double tmp67_1 = C_0_0*w33;  
                             const double tmp31_1 = C_0_2*w34;  
                             const double tmp20_1 = C_0_0*w30;  
                             const double tmp70_1 = C_0_0*w28;  
                             const double tmp8_1 = tmp0_0*w39;  
                             const double tmp30_1 = C_1_3*w43;  
                             const double tmp0_1 = tmp0_0*w29;  
                             const double tmp17_1 = C_1_3*w41;  
                             const double tmp58_1 = C_0_0*w35;  
                             const double tmp9_1 = tmp3_0*w33;  
                             const double tmp61_1 = C_1_3*w36;  
                             const double tmp41_1 = tmp3_0*w34;  
                             const double tmp50_1 = C_1_3*w32;  
                             const double tmp18_1 = C_1_1*w32;  
                             const double tmp6_1 = tmp1_0*w36;  
                             const double tmp3_1 = C_0_0*w38;  
                             const double tmp34_1 = C_1_1*w29;  
                             const double tmp77_1 = C_0_3*w35;  
                             const double tmp65_1 = C_1_2*w43;  
                             const double tmp71_1 = C_0_3*w33;  
                             const double tmp55_1 = C_1_1*w43;  
                             const double tmp46_1 = tmp3_0*w28;  
                             const double tmp24_1 = C_0_0*w37;  
                             const double tmp10_1 = tmp1_0*w39;  
                             const double tmp48_1 = C_1_0*w29;  
                             const double tmp15_1 = C_0_1*w33;  
                             const double tmp36_1 = C_1_2*w32;  
                             const double tmp60_1 = C_1_0*w39;  
                             const double tmp47_1 = tmp2_0*w33;  
                             const double tmp16_1 = C_1_2*w29;  
                             const double tmp1_1 = C_0_3*w37;  
                             const double tmp7_1 = tmp2_0*w28;  
                             const double tmp39_1 = C_1_3*w40;  
                             const double tmp44_1 = C_1_3*w42;  
                             const double tmp57_1 = C_0_2*w38;  
                             const double tmp78_1 = C_0_0*w34;  
                             const double tmp11_1 = tmp0_0*w36;  
                             const double tmp23_1 = C_0_2*w33;  
                             EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=tmp16_1 + tmp17_1 + tmp18_1 + tmp19_1 + tmp20_1 + tmp21_1 + tmp22_1 + tmp23_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=tmp0_1 + tmp2_1 + tmp68_1 + tmp69_1 + tmp70_1 + tmp71_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=tmp46_1 + tmp47_1 + tmp48_1 + tmp49_1 + tmp50_1 + tmp51_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp32_1 + tmp33_1 + tmp7_1 + tmp9_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1 + tmp2_1 + tmp3_1 + tmp4_1 + tmp5_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=tmp72_1 + tmp73_1 + tmp74_1 + tmp75_1 + tmp76_1 + tmp77_1 + tmp78_1 + tmp79_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp32_1 + tmp33_1 + tmp40_1 + tmp41_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=tmp34_1 + tmp35_1 + tmp36_1 + tmp37_1 + tmp38_1 + tmp39_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=tmp42_1 + tmp43_1 + tmp44_1 + tmp45_1 + tmp46_1 + tmp47_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp6_1 + tmp7_1 + tmp8_1 + tmp9_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=tmp60_1 + tmp61_1 + tmp62_1 + tmp63_1 + tmp64_1 + tmp65_1 + tmp66_1 + tmp67_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=tmp10_1 + tmp11_1 + tmp12_1 + tmp13_1 + tmp14_1 + tmp15_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp40_1 + tmp41_1 + tmp6_1 + tmp8_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=tmp37_1 + tmp38_1 + tmp52_1 + tmp53_1 + tmp54_1 + tmp55_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=tmp10_1 + tmp11_1 + tmp56_1 + tmp57_1 + tmp58_1 + tmp59_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=tmp24_1 + tmp25_1 + tmp26_1 + tmp27_1 + tmp28_1 + tmp29_1 + tmp30_1 + tmp31_1;  
2128                          } else { // constant data                          } else { // constant data
2129                              const double C_0 = C_p[0];                              const double C_0 = C_p[0];
2130                              const double C_1 = C_p[1];                              const double C_1 = C_p[1];
2131                              const double tmp0_1 = C_0*w47;                              EM_S[INDEX2(0,0,4)]+= 2*C_0*w18 + 2*C_1*w19;
2132                              const double tmp1_1 = C_1*w45;                              EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=-2*C_0*w18 +   C_1*w19;
2133                              const double tmp2_1 = C_1*w48;                              EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=   C_0*w18 - 2*C_1*w19;
2134                              const double tmp3_1 = C_0*w51;                              EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=  -C_0*w18 -   C_1*w19;
2135                              const double tmp4_1 = C_0*w44;                              EM_S[INDEX2(1,0,4)]+= 2*C_0*w18 +   C_1*w19;
2136                              const double tmp5_1 = C_1*w49;                              EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=-2*C_0*w18 + 2*C_1*w19;
2137                              const double tmp6_1 = C_1*w50;                              EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=   C_0*w18 -   C_1*w19;
2138                              const double tmp7_1 = C_0*w46;                              EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=  -C_0*w18 - 2*C_1*w19;
2139                              EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=tmp4_1 + tmp5_1;                              EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=   C_0*w18 + 2*C_1*w19;
2140                              EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=tmp1_1 + tmp4_1;                              EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=  -C_0*w18 +   C_1*w19;
2141                              EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=tmp3_1 + tmp5_1;                              EM_S[INDEX2(2,2,4)]+= 2*C_0*w18 - 2*C_1*w19;
2142                              EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp1_1 + tmp3_1;                              EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=-2*C_0*w18 -   C_1*w19;
2143                              EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1;                              EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=   C_0*w18 +   C_1*w19;
2144                              EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=tmp0_1 + tmp5_1;                              EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=  -C_0*w18 + 2*C_1*w19;
2145                              EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp1_1 + tmp7_1;                              EM_S[INDEX2(3,2,4)]+= 2*C_0*w18 -   C_1*w19;
2146                              EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=tmp5_1 + tmp7_1;                              EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=-2*C_0*w18 - 2*C_1*w19;
                             EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=tmp3_1 + tmp6_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp2_1 + tmp3_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=tmp4_1 + tmp6_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=tmp2_1 + tmp4_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp2_1 + tmp7_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=tmp6_1 + tmp7_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=tmp0_1 + tmp2_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=tmp0_1 + tmp6_1;  
2147                          }                          }
2148                      }                      }
2149                      ///////////////                      ///////////////
# Line 2011  void Rectangle::assemblePDESingle(Paso_S Line 2157  void Rectangle::assemblePDESingle(Paso_S
2157                              const double D_1 = D_p[1];                              const double D_1 = D_p[1];
2158                              const double D_2 = D_p[2];                              const double D_2 = D_p[2];
2159                              const double D_3 = D_p[3];                              const double D_3 = D_p[3];
2160                              const double tmp0_0 = D_0 + D_1;                              const double tmp0 = w21*(D_2 + D_3);
2161                              const double tmp1_0 = D_2 + D_3;                              const double tmp1 = w20*(D_0 + D_1);
2162                              const double tmp2_0 = D_0 + D_1 + D_2 + D_3;                              const double tmp2 = w22*(D_0 + D_1 + D_2 + D_3);
2163                              const double tmp3_0 = D_1 + D_2;                              const double tmp3 = w21*(D_0 + D_1);
2164                              const double tmp4_0 = D_1 + D_3;                              const double tmp4 = w20*(D_2 + D_3);
2165                              const double tmp5_0 = D_0 + D_2;                              const double tmp5 = w22*(D_1 + D_2);
2166                              const double tmp6_0 = D_0 + D_3;                              const double tmp6 = w21*(D_0 + D_2);
2167                              const double tmp0_1 = tmp0_0*w52;                              const double tmp7 = w20*(D_1 + D_3);
2168                              const double tmp1_1 = tmp1_0*w53;                              const double tmp8 = w21*(D_1 + D_3);
2169                              const double tmp2_1 = tmp2_0*w54;                              const double tmp9 = w20*(D_0 + D_2);
2170                              const double tmp3_1 = tmp1_0*w52;                              const double tmp10 = w22*(D_0 + D_3);
2171                              const double tmp4_1 = tmp0_0*w53;                              EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=D_0*w23 + D_3*w24 + tmp5;
2172                              const double tmp5_1 = tmp3_0*w54;                              EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=tmp0 + tmp1;
2173                              const double tmp6_1 = D_0*w55;                              EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=tmp8 + tmp9;
2174                              const double tmp7_1 = D_3*w56;                              EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp2;
2175                              const double tmp8_1 = D_3*w55;                              EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=tmp0 + tmp1;
2176                              const double tmp9_1 = D_0*w56;                              EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=D_1*w23 + D_2*w24 + tmp10;
2177                              const double tmp10_1 = tmp4_0*w52;                              EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp2;
2178                              const double tmp11_1 = tmp5_0*w53;                              EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=tmp6 + tmp7;
2179                              const double tmp12_1 = tmp5_0*w52;                              EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=tmp8 + tmp9;
2180                              const double tmp13_1 = tmp4_0*w53;                              EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp2;
2181                              const double tmp14_1 = tmp6_0*w54;                              EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=D_1*w24 + D_2*w23 + tmp10;
2182                              const double tmp15_1 = D_2*w55;                              EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=tmp3 + tmp4;
2183                              const double tmp16_1 = D_1*w56;                              EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp2;
2184                              const double tmp17_1 = D_1*w55;                              EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=tmp6 + tmp7;
2185                              const double tmp18_1 = D_2*w56;                              EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=tmp3 + tmp4;
2186                              EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=tmp5_1 + tmp6_1 + tmp7_1;                              EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=D_0*w24 + D_3*w23 + tmp5;
                             EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=tmp12_1 + tmp13_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp2_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=tmp14_1 + tmp17_1 + tmp18_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp2_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=tmp10_1 + tmp11_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=tmp12_1 + tmp13_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp2_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=tmp14_1 + tmp15_1 + tmp16_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=tmp3_1 + tmp4_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp2_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=tmp10_1 + tmp11_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=tmp3_1 + tmp4_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=tmp5_1 + tmp8_1 + tmp9_1;  
2187                          } else { // constant data                          } else { // constant data
2188                              const double tmp0_1 = D_p[0]*w57;                              const double D_0 = D_p[0];
2189                              const double tmp1_1 = D_p[0]*w58;                              EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=16*D_0*w22;
2190                              const double tmp2_1 = D_p[0]*w59;                              EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=8*D_0*w22;
2191                              EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=tmp2_1;                              EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=8*D_0*w22;
2192                              EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=tmp0_1;                              EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=4*D_0*w22;
2193                              EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=tmp0_1;                              EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=8*D_0*w22;
2194                              EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp1_1;                              EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=16*D_0*w22;
2195                              EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=tmp0_1;                              EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=4*D_0*w22;
2196                              EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=tmp2_1;                              EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=8*D_0*w22;
2197                              EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp1_1;                              EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=8*D_0*w22;
2198                              EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=tmp0_1;                              EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=4*D_0*w22;
2199                              EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=tmp0_1;                              EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=16*D_0*w22;
2200                              EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp1_1;                              EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=8*D_0*w22;
2201                              EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=tmp2_1;                              EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=4*D_0*w22;
2202                              EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=tmp0_1;                              EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=8*D_0*w22;
2203                              EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp1_1;                              EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=8*D_0*w22;
2204                              EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=tmp0_1;                              EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=16*D_0*w22;
                             EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=tmp0_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=tmp2_1;  
2205                          }                          }
2206                      }                      }
2207                      ///////////////                      ///////////////
# Line 2090  void Rectangle::assemblePDESingle(Paso_S Line 2219  void Rectangle::assemblePDESingle(Paso_S
2219                              const double X_1_2 = X_p[INDEX2(1,2,2)];                              const double X_1_2 = X_p[INDEX2(1,2,2)];
2220                              const double X_0_3 = X_p[INDEX2(0,3,2)];                              const double X_0_3 = X_p[INDEX2(0,3,2)];
2221                              const double X_1_3 = X_p[INDEX2(1,3,2)];                              const double X_1_3 = X_p[INDEX2(1,3,2)];
2222                              const double tmp0_0 = X_0_2 + X_0_3;                              const double tmp0 = 6*w15*(X_0_2 + X_0_3);
2223                              const double tmp1_0 = X_1_1 + X_1_3;                              const double tmp1 = 6*w10*(X_0_0 + X_0_1);
2224                              const double tmp2_0 = X_1_0 + X_1_2;                              const double tmp2 = 6*w11*(X_1_0 + X_1_2);
2225                              const double tmp3_0 = X_0_0 + X_0_1;                              const double tmp3 = 6*w14*(X_1_1 + X_1_3);
2226                              const double tmp0_1 = tmp0_0*w63;                              const double tmp4 = 6*w11*(X_1_1 + X_1_3);
2227                              const double tmp1_1 = tmp1_0*w62;                              const double tmp5 = w25*(X_0_0 + X_0_1);
2228                              const double tmp2_1 = tmp2_0*w61;                              const double tmp6 = w26*(X_0_2 + X_0_3);
2229                              const double tmp3_1 = tmp3_0*w60;                              const double tmp7 = 6*w14*(X_1_0 + X_1_2);
2230                              const double tmp4_1 = tmp0_0*w65;                              const double tmp8 = w27*(X_1_0 + X_1_2);
2231                              const double tmp5_1 = tmp3_0*w64;                              const double tmp9 = w28*(X_1_1 + X_1_3);
2232                              const double tmp6_1 = tmp2_0*w62;                              const double tmp10 = w25*(-X_0_2 - X_0_3);
2233                              const double tmp7_1 = tmp1_0*w61;                              const double tmp11 = w26*(-X_0_0 - X_0_1);
2234                              const double tmp8_1 = tmp2_0*w66;                              const double tmp12 = w27*(X_1_1 + X_1_3);
2235                              const double tmp9_1 = tmp3_0*w63;                              const double tmp13 = w28*(X_1_0 + X_1_2);
2236                              const double tmp10_1 = tmp0_0*w60;                              const double tmp14 = w25*(X_0_2 + X_0_3);
2237                              const double tmp11_1 = tmp1_0*w67;                              const double tmp15 = w26*(X_0_0 + X_0_1);
2238                              const double tmp12_1 = tmp1_0*w66;                              EM_F[0]+=tmp0 + tmp1 + tmp2 + tmp3;
2239                              const double tmp13_1 = tmp3_0*w65;                              EM_F[1]+=tmp4 + tmp5 + tmp6 + tmp7;
2240                              const double tmp14_1 = tmp0_0*w64;                              EM_F[2]+=tmp10 + tmp11 + tmp8 + tmp9;
2241                              const double tmp15_1 = tmp2_0*w67;                              EM_F[3]+=tmp12 + tmp13 + tmp14 + tmp15;
                             EM_F[0]+=tmp0_1 + tmp1_1 + tmp2_1 + tmp3_1;  
                             EM_F[1]+=tmp4_1 + tmp5_1 + tmp6_1 + tmp7_1;  
                             EM_F[2]+=tmp10_1 + tmp11_1 + tmp8_1 + tmp9_1;  
                             EM_F[3]+=tmp12_1 + tmp13_1 + tmp14_1 + tmp15_1;  
2242                          } else { // constant data                          } else { // constant data
2243                              const double tmp0_1 = X_p[1]*w69;                              const double X_0 = X_p[0];
2244                              const double tmp1_1 = X_p[0]*w68;                              const double X_1 = X_p[1];
2245                              const double tmp2_1 = X_p[0]*w70;                              EM_F[0]+= 6*X_0*w18 + 6*X_1*w19;
2246                              const double tmp3_1 = X_p[1]*w71;                              EM_F[1]+=-6*X_0*w18 + 6*X_1*w19;
2247                              EM_F[0]+=tmp0_1 + tmp1_1;                              EM_F[2]+= 6*X_0*w18 - 6*X_1*w19;
2248                              EM_F[1]+=tmp0_1 + tmp2_1;                              EM_F[3]+=-6*X_0*w18 - 6*X_1*w19;
                             EM_F[2]+=tmp1_1 + tmp3_1;  
                             EM_F[3]+=tmp2_1 + tmp3_1;  
2249                          }                          }
2250                      }                      }
2251                      ///////////////                      ///////////////
# Line 2136  void Rectangle::assemblePDESingle(Paso_S Line 2259  void Rectangle::assemblePDESingle(Paso_S
2259                              const double Y_1 = Y_p[1];                              const double Y_1 = Y_p[1];
2260                              const double Y_2 = Y_p[2];                              const double Y_2 = Y_p[2];
2261                              const double Y_3 = Y_p[3];                              const double Y_3 = Y_p[3];
2262                              const double tmp0_0 = Y_1 + Y_2;                              const double tmp0 = 6*w22*(Y_1 + Y_2);
2263                              const double tmp1_0 = Y_0 + Y_3;                              const double tmp1 = 6*w22*(Y_0 + Y_3);
2264                              const double tmp0_1 = Y_0*w72;                              EM_F[0]+=6*Y_0*w20 + 6*Y_3*w21 + tmp0;
2265                              const double tmp1_1 = tmp0_0*w73;                              EM_F[1]+=6*Y_1*w20 + 6*Y_2*w21 + tmp1;
2266                              const double tmp2_1 = Y_3*w74;                              EM_F[2]+=6*Y_1*w21 + 6*Y_2*w20 + tmp1;
2267                              const double tmp3_1 = Y_1*w72;                              EM_F[3]+=6*Y_0*w21 + 6*Y_3*w20 + tmp0;
                             const double tmp4_1 = tmp1_0*w73;  
                             const double tmp5_1 = Y_2*w74;  
                             const double tmp6_1 = Y_2*w72;  
                             const double tmp7_1 = Y_1*w74;  
                             const double tmp8_1 = Y_3*w72;  
                             const double tmp9_1 = Y_0*w74;  
                             EM_F[0]+=tmp0_1 + tmp1_1 + tmp2_1;  
                             EM_F[1]+=tmp3_1 + tmp4_1 + tmp5_1;  
                             EM_F[2]+=tmp4_1 + tmp6_1 + tmp7_1;  
                             EM_F[3]+=tmp1_1 + tmp8_1 + tmp9_1;  
2268                          } else { // constant data                          } else { // constant data
2269                              const double tmp0_1 = Y_p[0]*w75;                              EM_F[0]+=36*Y_p[0]*w22;
2270                              EM_F[0]+=tmp0_1;                              EM_F[1]+=36*Y_p[0]*w22;
2271                              EM_F[1]+=tmp0_1;                              EM_F[2]+=36*Y_p[0]*w22;
2272                              EM_F[2]+=tmp0_1;                              EM_F[3]+=36*Y_p[0]*w22;
                             EM_F[3]+=tmp0_1;  
2273                          }                          }
2274                      }                      }
2275    
2276                      // add to matrix (if add_EM_S) and RHS (if add_EM_F)                      // add to matrix (if add_EM_S) and RHS (if add_EM_F)
2277                      const index_t firstNode=m_N0*k1+k0;                      const index_t firstNode=m_NN[0]*k1+k0;
2278                      addToMatrixAndRHS(mat, rhs, EM_S, EM_F, add_EM_S, add_EM_F, firstNode);                      addToMatrixAndRHS(mat, rhs, EM_S, EM_F, add_EM_S, add_EM_F, firstNode);
2279                  } // end k0 loop                  } // end k0 loop
2280              } // end k1 loop              } // end k1 loop
# Line 2176  void Rectangle::assemblePDESingleReduced Line 2288  void Rectangle::assemblePDESingleReduced
2288          const escript::Data& C, const escript::Data& D,          const escript::Data& C, const escript::Data& D,
2289          const escript::Data& X, const escript::Data& Y) const          const escript::Data& X, const escript::Data& Y) const
2290  {  {
2291      const double h0 = m_l0/m_gNE0;      const double w0 = 1./4;
2292      const double h1 = m_l1/m_gNE1;      const double w1 = m_dx[0]/8;
2293      const double w0 = -.25*h1/h0;      const double w2 = m_dx[1]/8;
2294      const double w1 = .25;      const double w3 = m_dx[0]*m_dx[1]/16;
2295      const double w2 = -.25;      const double w4 = m_dx[0]/(4*m_dx[1]);
2296      const double w3 = .25*h0/h1;      const double w5 = m_dx[1]/(4*m_dx[0]);
     const double w4 = -.25*h0/h1;  
     const double w5 = .25*h1/h0;  
     const double w6 = -.125*h1;  
     const double w7 = -.125*h0;  
     const double w8 = .125*h1;  
     const double w9 = .125*h0;  
     const double w10 = .0625*h0*h1;  
     const double w11 = -.5*h1;  
     const double w12 = -.5*h0;  
     const double w13 = .5*h1;  
     const double w14 = .5*h0;  
     const double w15 = .25*h0*h1;  
2297    
2298      rhs.requireWrite();      rhs.requireWrite();
2299  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
2300      {      {
2301          for (index_t k1_0=0; k1_0<2; k1_0++) { // colouring          for (index_t k1_0=0; k1_0<2; k1_0++) { // colouring
2302  #pragma omp for  #pragma omp for
2303              for (index_t k1=k1_0; k1<m_NE1; k1+=2) {              for (index_t k1=k1_0; k1<m_NE[1]; k1+=2) {
2304                  for (index_t k0=0; k0<m_NE0; ++k0)  {                  for (index_t k0=0; k0<m_NE[0]; ++k0)  {
2305                      bool add_EM_S=false;                      bool add_EM_S=false;
2306                      bool add_EM_F=false;                      bool add_EM_F=false;
2307                      vector<double> EM_S(4*4, 0);                      vector<double> EM_S(4*4, 0);
2308                      vector<double> EM_F(4, 0);                      vector<double> EM_F(4, 0);
2309                      const index_t e = k0 + m_NE0*k1;                      const index_t e = k0 + m_NE[0]*k1;
2310                      ///////////////                      ///////////////
2311                      // process A //                      // process A //
2312                      ///////////////                      ///////////////
# Line 2217  void Rectangle::assemblePDESingleReduced Line 2317  void Rectangle::assemblePDESingleReduced
2317                          const double A_10 = A_p[INDEX2(1,0,2)];                          const double A_10 = A_p[INDEX2(1,0,2)];
2318                          const double A_01 = A_p[INDEX2(0,1,2)];                          const double A_01 = A_p[INDEX2(0,1,2)];
2319                          const double A_11 = A_p[INDEX2(1,1,2)];                          const double A_11 = A_p[INDEX2(1,1,2)];
2320                          const double tmp0_0 = A_01 + A_10;                          const double tmp0 = (A_01 + A_10)*w0;
2321                          const double tmp0_1 = A_11*w3;                          const double tmp1 = A_00*w5;
2322                          const double tmp1_1 = A_00*w0;                          const double tmp2 = A_01*w0;
2323                          const double tmp2_1 = A_01*w1;                          const double tmp3 = A_10*w0;
2324                          const double tmp3_1 = A_10*w2;                          const double tmp4 = A_11*w4;
2325                          const double tmp4_1 = tmp0_0*w1;                          EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=tmp4 + tmp0 + tmp1;
2326                          const double tmp5_1 = A_11*w4;                          EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=tmp4 - tmp1 + tmp3 - tmp2;
2327                          const double tmp6_1 = A_00*w5;                          EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=tmp2 - tmp3 - tmp4 + tmp1;
2328                          const double tmp7_1 = tmp0_0*w2;                          EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=-tmp1 - tmp4 - tmp0;
2329                          const double tmp8_1 = A_10*w1;                          EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=tmp4 - tmp1 + tmp2 - tmp3;
2330                          const double tmp9_1 = A_01*w2;                          EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=tmp4 + tmp1 - tmp0;
2331                          EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=tmp0_1 + tmp4_1 + tmp6_1;                          EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=-tmp1 + tmp0 - tmp4;
2332                          EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1 + tmp8_1 + tmp9_1;                          EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=-tmp4 + tmp1 + tmp3 - tmp2;
2333                          EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=tmp2_1 + tmp3_1 + tmp5_1 + tmp6_1;                          EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=-tmp4 + tmp1 + tmp3 - tmp2;
2334                          EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp1_1 + tmp5_1 + tmp7_1;                          EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=-tmp1 + tmp0 - tmp4;
2335                          EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1 + tmp2_1 + tmp3_1;                          EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=tmp4 + tmp1 - tmp0;
2336                          EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=tmp0_1 + tmp6_1 + tmp7_1;                          EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=tmp4 - tmp1 + tmp2 - tmp3;
2337                          EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp1_1 + tmp4_1 + tmp5_1;                          EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=-tmp1 - tmp4 - tmp0;
2338                          EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=tmp5_1 + tmp6_1 + tmp8_1 + tmp9_1;                          EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=tmp2 - tmp3 - tmp4 + tmp1;
2339                          EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=tmp5_1 + tmp6_1 + tmp8_1 + tmp9_1;                          EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=tmp4 - tmp1 + tmp3 - tmp2;
2340                          EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp1_1 + tmp4_1 + tmp5_1;                          EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=tmp4 + tmp0 + tmp1;
                         EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=tmp0_1 + tmp6_1 + tmp7_1;  
                         EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1 + tmp2_1 + tmp3_1;  
                         EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp1_1 + tmp5_1 + tmp7_1;  
                         EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=tmp2_1 + tmp3_1 + tmp5_1 + tmp6_1;  
                         EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1 + tmp8_1 + tmp9_1;  
                         EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=tmp0_1 + tmp4_1 + tmp6_1;  
2341                      }                      }
2342                      ///////////////                      ///////////////
2343                      // process B //                      // process B //
# Line 2251  void Rectangle::assemblePDESingleReduced Line 2345  void Rectangle::assemblePDESingleReduced
2345                      if (!B.isEmpty()) {                      if (!B.isEmpty()) {
2346                          add_EM_S=true;                          add_EM_S=true;
2347                          const double* B_p=const_cast<escript::Data*>(&B)->getSampleDataRO(e);                          const double* B_p=const_cast<escript::Data*>(&B)->getSampleDataRO(e);
2348                          const double tmp2_1 = B_p[0]*w8;                          const double tmp0 = B_p[0]*w2;
2349                          const double tmp0_1 = B_p[0]*w6;                          const double tmp1 = B_p[1]*w1;
2350                          const double tmp3_1 = B_p[1]*w9;                          EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=-tmp0 - tmp1;
2351                          const double tmp1_1 = B_p[1]*w7;                          EM_S[INDEX2(1,0,4)]+= tmp0 - tmp1;
2352                          EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1;                          EM_S[INDEX2(2,0,4)]+= tmp1 - tmp0;
2353                          EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=tmp1_1 + tmp2_1;                          EM_S[INDEX2(3,0,4)]+= tmp0 + tmp1;
2354                          EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=tmp0_1 + tmp3_1;                          EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=-tmp0 - tmp1;
2355                          EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp2_1 + tmp3_1;                          EM_S[INDEX2(1,1,4)]+= tmp0 - tmp1;
2356                          EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1;                          EM_S[INDEX2(2,1,4)]+= tmp1 - tmp0;
2357                          EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=tmp1_1 + tmp2_1;                          EM_S[INDEX2(3,1,4)]+= tmp0 + tmp1;
2358                          EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp0_1 + tmp3_1;                          EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=-tmp0 - tmp1;
2359                          EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=tmp2_1 + tmp3_1;                          EM_S[INDEX2(1,2,4)]+= tmp0 - tmp1;
2360                          EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1;                          EM_S[INDEX2(2,2,4)]+= tmp1 - tmp0;
2361                          EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp1_1 + tmp2_1;                          EM_S[INDEX2(3,2,4)]+= tmp0 + tmp1;
2362                          EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=tmp0_1 + tmp3_1;                          EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=-tmp0 - tmp1;
2363                          EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=tmp2_1 + tmp3_1;                          EM_S[INDEX2(1,3,4)]+= tmp0 - tmp1;
2364                          EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1;                          EM_S[INDEX2(2,3,4)]+= tmp1 - tmp0;
2365                          EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=tmp1_1 + tmp2_1;                          EM_S[INDEX2(3,3,4)]+= tmp0 + tmp1;
                         EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=tmp0_1 + tmp3_1;  
                         EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=tmp2_1 + tmp3_1;  
2366                      }                      }
2367                      ///////////////                      ///////////////
2368                      // process C //                      // process C //
# Line 2278  void Rectangle::assemblePDESingleReduced Line 2370  void Rectangle::assemblePDESingleReduced
2370                      if (!C.isEmpty()) {                      if (!C.isEmpty()) {
2371                          add_EM_S=true;                          add_EM_S=true;
2372                          const double* C_p=const_cast<escript::Data*>(&C)->getSampleDataRO(e);                          const double* C_p=const_cast<escript::Data*>(&C)->getSampleDataRO(e);
2373                          const double tmp1_1 = C_p[1]*w7;                          const double tmp0 = C_p[0]*w2;
2374                          const double tmp0_1 = C_p[0]*w8;                          const double tmp1 = C_p[1]*w1;
2375                          const double tmp3_1 = C_p[0]*w6;                          EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=-tmp1 - tmp0;
2376                          const double tmp2_1 = C_p[1]*w9;                          EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=-tmp1 - tmp0;
2377                          EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=tmp1_1 + tmp3_1;                          EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=-tmp1 - tmp0;
2378                          EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=tmp1_1 + tmp3_1;                          EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=-tmp1 - tmp0;
2379                          EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=tmp1_1 + tmp3_1;                          EM_S[INDEX2(0,1,4)]+= tmp0 - tmp1;
2380                          EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp1_1 + tmp3_1;                          EM_S[INDEX2(1,1,4)]+= tmp0 - tmp1;
2381                          EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1;                          EM_S[INDEX2(2,1,4)]+= tmp0 - tmp1;
2382                          EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1;                          EM_S[INDEX2(3,1,4)]+= tmp0 - tmp1;
2383                          EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1;                          EM_S[INDEX2(0,2,4)]+= tmp1 - tmp0;
2384                          EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1;                          EM_S[INDEX2(1,2,4)]+= tmp1 - tmp0;
2385                          EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=tmp2_1 + tmp3_1;                          EM_S[INDEX2(2,2,4)]+= tmp1 - tmp0;
2386                          EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp2_1 + tmp3_1;                          EM_S[INDEX2(3,2,4)]+= tmp1 - tmp0;
2387                          EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=tmp2_1 + tmp3_1;                          EM_S[INDEX2(0,3,4)]+= tmp0 + tmp1;
2388                          EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=tmp2_1 + tmp3_1;                          EM_S[INDEX2(1,3,4)]+= tmp0 + tmp1;
2389                          EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp0_1 + tmp2_1;                          EM_S[INDEX2(2,3,4)]+= tmp0 + tmp1;
2390                          EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=tmp0_1 + tmp2_1;                          EM_S[INDEX2(3,3,4)]+= tmp0 + tmp1;
                         EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=tmp0_1 + tmp2_1;  
                         EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=tmp0_1 + tmp2_1;  
2391                      }                      }
2392                      ///////////////                      ///////////////
2393                      // process D //                      // process D //
# Line 2305  void Rectangle::assemblePDESingleReduced Line 2395  void Rectangle::assemblePDESingleReduced
2395                      if (!D.isEmpty()) {                      if (!D.isEmpty()) {
2396                          add_EM_S=true;                          add_EM_S=true;
2397                          const double* D_p=const_cast<escript::Data*>(&D)->getSampleDataRO(e);                          const double* D_p=const_cast<escript::Data*>(&D)->getSampleDataRO(e);
2398                          const double tmp0_1 = D_p[0]*w10;                          EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=D_p[0]*w3;
2399                          EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=tmp0_1;                          EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=D_p[0]*w3;
2400                          EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=tmp0_1;                          EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=D_p[0]*w3;
2401                          EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=tmp0_1;                          EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=D_p[0]*w3;
2402                          EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp0_1;                          EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=D_p[0]*w3;
2403                          EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=tmp0_1;                          EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=D_p[0]*w3;
2404                          EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=tmp0_1;                          EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=D_p[0]*w3;
2405                          EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp0_1;                          EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=D_p[0]*w3;
2406                          EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=tmp0_1;                          EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=D_p[0]*w3;
2407                          EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=tmp0_1;                          EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=D_p[0]*w3;
2408                          EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp0_1;                          EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=D_p[0]*w3;
2409                          EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=tmp0_1;                          EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=D_p[0]*w3;
2410                          EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=tmp0_1;                          EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=D_p[0]*w3;
2411                          EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp0_1;                          EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=D_p[0]*w3;
2412                          EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=tmp0_1;                          EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=D_p[0]*w3;
2413                          EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=tmp0_1;                          EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=D_p[0]*w3;
                         EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=tmp0_1;  
2414                      }                      }
2415                      ///////////////                      ///////////////
2416                      // process X //                      // process X //
# Line 2329  void Rectangle::assemblePDESingleReduced Line 2418  void Rectangle::assemblePDESingleReduced
2418                      if (!X.isEmpty()) {                      if (!X.isEmpty()) {
2419                          add_EM_F=true;                          add_EM_F=true;
2420                          const double* X_p=const_cast<escript::Data*>(&X)->getSampleDataRO(e);                          const double* X_p=const_cast<escript::Data*>(&X)->getSampleDataRO(e);
2421                          const double tmp0_1 = X_p[0]*w11;                          const double wX0 = 4*X_p[0]*w2;
2422                          const double tmp2_1 = X_p[0]*w13;                          const double wX1 = 4*X_p[1]*w1;
2423                          const double tmp1_1 = X_p[1]*w12;                          EM_F[0]+=-wX0 - wX1;
2424                          const double tmp3_1 = X_p[1]*w14;                          EM_F[1]+=-wX1 + wX0;
2425                          EM_F[0]+=tmp0_1 + tmp1_1;                          EM_F[2]+=-wX0 + wX1;
2426                          EM_F[1]+=tmp1_1 + tmp2_1;                          EM_F[3]+= wX0 + wX1;
                         EM_F[2]+=tmp0_1 + tmp3_1;  
                         EM_F[3]+=tmp2_1 + tmp3_1;  
2427                      }                      }
2428                      ///////////////                      ///////////////
2429                      // process Y //                      // process Y //
# Line 2344  void Rectangle::assemblePDESingleReduced Line 2431  void Rectangle::assemblePDESingleReduced
2431                      if (!Y.isEmpty()) {                      if (!Y.isEmpty()) {
2432                          add_EM_F=true;                          add_EM_F=true;
2433                          const double* Y_p=const_cast<escript::Data*>(&Y)->getSampleDataRO(e);                          const double* Y_p=const_cast<escript::Data*>(&Y)->getSampleDataRO(e);
2434                          const double tmp0_1 = Y_p[0]*w15;                          EM_F[0]+=4*Y_p[0]*w3;
2435                          EM_F[0]+=tmp0_1;                          EM_F[1]+=4*Y_p[0]*w3;
2436                          EM_F[1]+=tmp0_1;                          EM_F[2]+=4*Y_p[0]*w3;
2437                          EM_F[2]+=tmp0_1;                          EM_F[3]+=4*Y_p[0]*w3;
                         EM_F[3]+=tmp0_1;  
2438                      }                      }
2439    
2440                      // add to matrix (if add_EM_S) and RHS (if add_EM_F)                      // add to matrix (if add_EM_S) and RHS (if add_EM_F)
2441                      const index_t firstNode=m_N0*k1+k0;                      const index_t firstNode=m_NN[0]*k1+k0;
2442                      addToMatrixAndRHS(mat, rhs, EM_S, EM_F, add_EM_S, add_EM_F, firstNode);                      addToMatrixAndRHS(mat, rhs, EM_S, EM_F, add_EM_S, add_EM_F, firstNode);
2443                  } // end k0 loop                  } // end k0 loop
2444              } // end k1 loop              } // end k1 loop
# Line 2366  void Rectangle::assemblePDESystem(Paso_S Line 2452  void Rectangle::assemblePDESystem(Paso_S
2452          const escript::Data& C, const escript::Data& D,          const escript::Data& C, const escript::Data& D,
2453          const escript::Data& X, const escript::Data& Y) const          const escript::Data& X, const escript::Data& Y) const
2454  {  {
     const double h0 = m_l0/m_gNE0;  
     const double h1 = m_l1/m_gNE1;  
2455      dim_t numEq, numComp;      dim_t numEq, numComp;
2456      if (!mat)      if (!mat)
2457          numEq=numComp=(rhs.isEmpty() ? 1 : rhs.getDataPointSize());          numEq=numComp=(rhs.isEmpty() ? 1 : rhs.getDataPointSize());
# Line 2375  void Rectangle::assemblePDESystem(Paso_S Line 2459  void Rectangle::assemblePDESystem(Paso_S
2459          numEq=mat->logical_row_block_size;          numEq=mat->logical_row_block_size;
2460          numComp=mat->logical_col_block_size;          numComp=mat->logical_col_block_size;
2461      }      }
2462        const double SQRT3 = 1.73205080756887719318;
2463      const double w0 = -0.1555021169820365539*h1/h0;      const double w1 = 1.0/24;
2464      const double w1 = 0.041666666666666666667;      const double w5 = -SQRT3/24 + 1.0/12;
2465      const double w2 = -0.15550211698203655390;      const double w2 = -SQRT3/24 - 1.0/12;
2466      const double w3 = 0.041666666666666666667*h0/h1;      const double w19 = -m_dx[0]/12;
2467      const double w4 = 0.15550211698203655390;      const double w11 = w19*(SQRT3 + 3)/12;
2468      const double w5 = -0.041666666666666666667;      const double w14 = w19*(-SQRT3 + 3)/12;
2469      const double w6 = -0.01116454968463011277*h1/h0;      const double w16 = w19*(5*SQRT3 + 9)/12;
2470      const double w7 = 0.011164549684630112770;      const double w17 = w19*(-5*SQRT3 + 9)/12;
2471      const double w8 = -0.011164549684630112770;      const double w27 = w19*(-SQRT3 - 3)/2;
2472      const double w9 = -0.041666666666666666667*h1/h0;      const double w28 = w19*(SQRT3 - 3)/2;
2473      const double w10 = -0.041666666666666666667*h0/h1;      const double w18 = -m_dx[1]/12;
2474      const double w11 = 0.1555021169820365539*h1/h0;      const double w10 = w18*(SQRT3 + 3)/12;
2475      const double w12 = 0.1555021169820365539*h0/h1;      const double w15 = w18*(-SQRT3 + 3)/12;
2476      const double w13 = 0.01116454968463011277*h0/h1;      const double w12 = w18*(5*SQRT3 + 9)/12;
2477      const double w14 = 0.01116454968463011277*h1/h0;      const double w13 = w18*(-5*SQRT3 + 9)/12;
2478      const double w15 = 0.041666666666666666667*h1/h0;      const double w25 = w18*(-SQRT3 - 3)/2;
2479      const double w16 = -0.01116454968463011277*h0/h1;      const double w26 = w18*(SQRT3 - 3)/2;
2480      const double w17 = -0.1555021169820365539*h0/h1;      const double w22 = m_dx[0]*m_dx[1]/144;
2481      const double w18 = -0.33333333333333333333*h1/h0;      const double w20 = w22*(SQRT3 + 2);
2482      const double w19 = 0.25000000000000000000;      const double w21 = w22*(-SQRT3 + 2);
2483      const double w20 = -0.25000000000000000000;      const double w23 = w22*(4*SQRT3 + 7);
2484      const double w21 = 0.16666666666666666667*h0/h1;      const double w24 = w22*(-4*SQRT3 + 7);
2485      const double w22 = -0.16666666666666666667*h1/h0;      const double w3 = m_dx[0]/(24*m_dx[1]);
2486      const double w23 = -0.16666666666666666667*h0/h1;      const double w7 = w3*(SQRT3 + 2);
2487      const double w24 = 0.33333333333333333333*h1/h0;      const double w8 = w3*(-SQRT3 + 2);
2488      const double w25 = 0.33333333333333333333*h0/h1;      const double w6 = -m_dx[1]/(24*m_dx[0]);
2489      const double w26 = 0.16666666666666666667*h1/h0;      const double w0 = w6*(SQRT3 + 2);
2490      const double w27 = -0.33333333333333333333*h0/h1;      const double w4 = w6*(-SQRT3 + 2);
     const double w28 = -0.032861463941450536761*h1;  
     const double w29 = -0.032861463941450536761*h0;  
     const double w30 = -0.12264065304058601714*h1;  
     const double w31 = -0.0023593469594139828636*h1;  
     const double w32 = -0.008805202725216129906*h0;  
     const double w33 = -0.008805202725216129906*h1;  
     const double w34 = 0.032861463941450536761*h1;  
     const double w35 = 0.008805202725216129906*h1;  
     const double w36 = 0.008805202725216129906*h0;  
     const double w37 = 0.0023593469594139828636*h1;  
     const double w38 = 0.12264065304058601714*h1;  
     const double w39 = 0.032861463941450536761*h0;  
     const double w40 = -0.12264065304058601714*h0;  
     const double w41 = -0.0023593469594139828636*h0;  
     const double w42 = 0.0023593469594139828636*h0;  
     const double w43 = 0.12264065304058601714*h0;  
     const double w44 = -0.16666666666666666667*h1;  
     const double w45 = -0.083333333333333333333*h0;  
     const double w46 = 0.083333333333333333333*h1;  
     const double w47 = 0.16666666666666666667*h1;  
     const double w48 = 0.083333333333333333333*h0;  
     const double w49 = -0.16666666666666666667*h0;  
     const double w50 = 0.16666666666666666667*h0;  
     const double w51 = -0.083333333333333333333*h1;  
     const double w52 = 0.025917019497006092316*h0*h1;  
     const double w53 = 0.0018607582807716854616*h0*h1;  
     const double w54 = 0.0069444444444444444444*h0*h1;  
     const double w55 = 0.09672363354357992482*h0*h1;  
     const double w56 = 0.00049858867864229740201*h0*h1;  
     const double w57 = 0.055555555555555555556*h0*h1;  
     const double w58 = 0.027777777777777777778*h0*h1;  
     const double w59 = 0.11111111111111111111*h0*h1;  
     const double w60 = -0.19716878364870322056*h1;  
     const double w61 = -0.19716878364870322056*h0;  
     const double w62 = -0.052831216351296779436*h0;  
     const double w63 = -0.052831216351296779436*h1;  
     const double w64 = 0.19716878364870322056*h1;  
     const double w65 = 0.052831216351296779436*h1;  
     const double w66 = 0.19716878364870322056*h0;  
     const double w67 = 0.052831216351296779436*h0;  
     const double w68 = -0.5*h1;  
     const double w69 = -0.5*h0;  
     const double w70 = 0.5*h1;  
     const double w71 = 0.5*h0;  
     const double w72 = 0.1555021169820365539*h0*h1;  
     const double w73 = 0.041666666666666666667*h0*h1;  
     const double w74 = 0.01116454968463011277*h0*h1;  
     const double w75 = 0.25*h0*h1;  
2491    
2492      rhs.requireWrite();      rhs.requireWrite();
2493  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
2494      {      {
2495          for (index_t k1_0=0; k1_0<2; k1_0++) { // colouring          for (index_t k1_0=0; k1_0<2; k1_0++) { // colouring
2496  #pragma omp for  #pragma omp for
2497              for (index_t k1=k1_0; k1<m_NE1; k1+=2) {              for (index_t k1=k1_0; k1<m_NE[1]; k1+=2) {
2498                  for (index_t k0=0; k0<m_NE0; ++k0)  {                  for (index_t k0=0; k0<m_NE[0]; ++k0)  {
2499                      bool add_EM_S=false;                      bool add_EM_S=false;
2500                      bool add_EM_F=false;                      bool add_EM_F=false;
2501                      vector<double> EM_S(4*4*numEq*numComp, 0);                      vector<double> EM_S(4*4*numEq*numComp, 0);
2502                      vector<double> EM_F(4*numEq, 0);                      vector<double> EM_F(4*numEq, 0);
2503                      const index_t e = k0 + m_NE0*k1;                      const index_t e = k0 + m_NE[0]*k1;
2504                      ///////////////                      ///////////////
2505                      // process A //                      // process A //
2506                      ///////////////                      ///////////////
2507                      if (!A.isEmpty()) {                      if (!A.isEmpty()) {
2508                          add_EM_S=true;                          add_EM_S = true;
2509                          const double* A_p=const_cast<escript::Data*>(&A)->getSampleDataRO(e);                          const double* A_p = const_cast<escript::Data*>(&A)->getSampleDataRO(e);
2510                          if (A.actsExpanded()) {                          if (A.actsExpanded()) {
2511                              for (index_t k=0; k<numEq; k++) {                              for (index_t k=0; k<numEq; k++) {
2512                                  for (index_t m=0; m<numComp; m++) {                                  for (index_t m=0; m<numComp; m++) {
2513                                      const double A_00_0 = A_p[INDEX5(k,0,m,0,0, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_00_0 = A_p[INDEX5(k,0,m,0,0,numEq,2,numComp,2)];
2514                                      const double A_01_0 = A_p[INDEX5(k,0,m,1,0, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_01_0 = A_p[INDEX5(k,0,m,1,0,numEq,2,numComp,2)];
2515                                      const double A_10_0 = A_p[INDEX5(k,1,m,0,0, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_10_0 = A_p[INDEX5(k,1,m,0,0,numEq,2,numComp,2)];
2516                                      const double A_11_0 = A_p[INDEX5(k,1,m,1,0, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_11_0 = A_p[INDEX5(k,1,m,1,0,numEq,2,numComp,2)];
2517                                      const double A_00_1 = A_p[INDEX5(k,0,m,0,1, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_00_1 = A_p[INDEX5(k,0,m,0,1,numEq,2,numComp,2)];
2518                                      const double A_01_1 = A_p[INDEX5(k,0,m,1,1, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_01_1 = A_p[INDEX5(k,0,m,1,1,numEq,2,numComp,2)];
2519                                      const double A_10_1 = A_p[INDEX5(k,1,m,0,1, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_10_1 = A_p[INDEX5(k,1,m,0,1,numEq,2,numComp,2)];
2520                                      const double A_11_1 = A_p[INDEX5(k,1,m,1,1, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_11_1 = A_p[INDEX5(k,1,m,1,1,numEq,2,numComp,2)];
2521                                      const double A_00_2 = A_p[INDEX5(k,0,m,0,2, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_00_2 = A_p[INDEX5(k,0,m,0,2,numEq,2,numComp,2)];
2522                                      const double A_01_2 = A_p[INDEX5(k,0,m,1,2, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_01_2 = A_p[INDEX5(k,0,m,1,2,numEq,2,numComp,2)];
2523                                      const double A_10_2 = A_p[INDEX5(k,1,m,0,2, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_10_2 = A_p[INDEX5(k,1,m,0,2,numEq,2,numComp,2)];
2524                                      const double A_11_2 = A_p[INDEX5(k,1,m,1,2, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_11_2 = A_p[INDEX5(k,1,m,1,2,numEq,2,numComp,2)];
2525                                      const double A_00_3 = A_p[INDEX5(k,0,m,0,3, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_00_3 = A_p[INDEX5(k,0,m,0,3,numEq,2,numComp,2)];
2526                                      const double A_01_3 = A_p[INDEX5(k,0,m,1,3, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_01_3 = A_p[INDEX5(k,0,m,1,3,numEq,2,numComp,2)];
2527                                      const double A_10_3 = A_p[INDEX5(k,1,m,0,3, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_10_3 = A_p[INDEX5(k,1,m,0,3,numEq,2,numComp,2)];
2528                                      const double A_11_3 = A_p[INDEX5(k,1,m,1,3, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_11_3 = A_p[INDEX5(k,1,m,1,3,numEq,2,numComp,2)];
2529                                      const double tmp0_0 = A_01_0 + A_01_3;                                      const double tmp0 = w3*(A_11_0 + A_11_1 + A_11_2 + A_11_3);
2530                                      const double tmp1_0 = A_00_0 + A_00_1;                                      const double tmp1 = w1*(A_01_0 + A_01_3 - A_10_1 - A_10_2);
2531                                      const double tmp2_0 = A_11_0 + A_11_1 + A_11_2 + A_11_3;                                      const double tmp2 = w4*(A_00_2 + A_00_3);
2532                                      const double tmp3_0 = A_00_2 + A_00_3;                                      const double tmp3 = w0*(A_00_0 + A_00_1);
2533                                      const double tmp4_0 = A_10_1 + A_10_2;                                      const double tmp4 = w5*(A_01_2 - A_10_3);
2534                                      const double tmp5_0 = A_00_0 + A_00_1 + A_00_2 + A_00_3;                                      const double tmp5 = w2*(-A_01_1 + A_10_0);
2535                                      const double tmp6_0 = A_01_3 + A_10_0;                                      const double tmp6 = w5*(A_01_3 + A_10_0);
2536                                      const double tmp7_0 = A_01_0 + A_10_3;                                      const double tmp7 = w3*(-A_11_0 - A_11_1 - A_11_2 - A_11_3);
2537                                      const double tmp8_0 = A_01_1 + A_01_2 + A_10_1 + A_10_2;                                      const double tmp8 = w6*(A_00_0 + A_00_1 + A_00_2 + A_00_3);
2538                                      const double tmp9_0 = A_01_0 + A_10_0;                                      const double tmp9 = w1*(A_01_1 + A_01_2 + A_10_1 + A_10_2);
2539                                      const double tmp10_0 = A_01_3 + A_10_3;                                      const double tmp10 = w2*(-A_01_0 - A_10_3);
2540                                      const double tmp11_0 = A_11_1 + A_11_3;                                      const double tmp11 = w4*(A_00_0 + A_00_1);
2541                                      const double tmp12_0 = A_11_0 + A_11_2;                                      const double tmp12 = w0*(A_00_2 + A_00_3);
2542                                      const double tmp13_0 = A_01_2 + A_10_1;                                      const double tmp13 = w5*(A_01_1 - A_10_0);
2543                                      const double tmp14_0 = A_01_0 + A_01_3 + A_10_0 + A_10_3;                                      const double tmp14 = w2*(-A_01_2 + A_10_3);
2544                                      const double tmp15_0 = A_01_1 + A_10_2;                                      const double tmp15 = w7*(A_11_0 + A_11_2);
2545                                      const double tmp16_0 = A_10_0 + A_10_3;                                      const double tmp16 = w4*(-A_00_2 - A_00_3);
2546                                      const double tmp17_0 = A_01_1 + A_01_2;                                      const double tmp17 = w0*(-A_00_0 - A_00_1);
2547                                      const double tmp18_0 = A_01_1 + A_10_1;                                      const double tmp18 = w5*(A_01_3 + A_10_3);
2548                                      const double tmp19_0 = A_01_2 + A_10_2;                                      const double tmp19 = w8*(A_11_1 + A_11_3);
2549                                      const double tmp0_1 = A_10_3*w8;                                      const double tmp20 = w2*(-A_01_0 - A_10_0);
2550                                      const double tmp1_1 = tmp0_0*w1;                                      const double tmp21 = w7*(A_11_1 + A_11_3);
2551                                      const double tmp2_1 = A_01_1*w4;                                      const double tmp22 = w4*(-A_00_0 - A_00_1);
2552                                      const double tmp3_1 = tmp1_0*w0;                                      const double tmp23 = w0*(-A_00_2 - A_00_3);
2553                                      const double tmp4_1 = A_01_2*w7;                                      const double tmp24 = w5*(A_01_0 + A_10_0);
2554                                      const double tmp5_1 = tmp2_0*w3;                                      const double tmp25 = w8*(A_11_0 + A_11_2);
2555                                      const double tmp6_1 = tmp3_0*w6;                                      const double tmp26 = w2*(-A_01_3 - A_10_3);
2556                                      const double tmp7_1 = A_10_0*w2;                                      const double tmp27 = w5*(-A_01_1 - A_10_2);
2557                                      const double tmp8_1 = tmp4_0*w5;                                      const double tmp28 = w1*(-A_01_0 - A_01_3 - A_10_0 - A_10_3);
2558                                      const double tmp9_1 = tmp2_0*w10;                                      const double tmp29 = w2*(A_01_2 + A_10_1);
2559                                      const double tmp10_1 = tmp5_0*w9;                                      const double tmp30 = w7*(-A_11_1 - A_11_3);
2560                                      const double tmp11_1 = tmp6_0*w7;                                      const double tmp31 = w1*(-A_01_1 - A_01_2 + A_10_0 + A_10_3);
2561                                      const double tmp12_1 = tmp7_0*w4;                                      const double tmp32 = w5*(-A_01_0 + A_10_2);
2562                                      const double tmp13_1 = tmp8_0*w1;                                      const double tmp33 = w8*(-A_11_0 - A_11_2);
2563                                      const double tmp14_1 = A_10_0*w8;                                      const double tmp34 = w6*(-A_00_0 - A_00_1 - A_00_2 - A_00_3);
2564                                      const double tmp15_1 = A_01_2*w4;                                      const double tmp35 = w2*(A_01_3 - A_10_1);
2565                                      const double tmp16_1 = tmp3_0*w0;                                      const double tmp36 = w5*(A_01_0 + A_10_3);
2566                                      const double tmp17_1 = A_01_1*w7;                                      const double tmp37 = w2*(-A_01_3 - A_10_0);
2567                                      const double tmp18_1 = tmp1_0*w6;                                      const double tmp38 = w7*(-A_11_0 - A_11_2);
2568                                      const double tmp19_1 = A_10_3*w2;                                      const double tmp39 = w5*(-A_01_3 + A_10_1);
2569                                      const double tmp20_1 = tmp9_0*w4;                                      const double tmp40 = w8*(-A_11_1 - A_11_3);
2570                                      const double tmp21_1 = tmp1_0*w11;                                      const double tmp41 = w2*(A_01_0 - A_10_2);
2571                                      const double tmp22_1 = tmp10_0*w7;                                      const double tmp42 = w5*(A_01_1 - A_10_3);
2572                                      const double tmp23_1 = tmp3_0*w14;                                      const double tmp43 = w2*(-A_01_2 + A_10_0);
2573                                      const double tmp24_1 = tmp11_0*w13;                                      const double tmp44 = w5*(A_01_2 - A_10_0);
2574                                      const double tmp25_1 = tmp12_0*w12;                                      const double tmp45 = w2*(-A_01_1 + A_10_3);
2575                                      const double tmp26_1 = tmp10_0*w4;                                      const double tmp46 = w5*(-A_01_0 + A_10_1);
2576                                      const double tmp27_1 = tmp3_0*w11;                                      const double tmp47 = w2*(A_01_3 - A_10_2);
2577                                      const double tmp28_1 = tmp9_0*w7;                                      const double tmp48 = w5*(-A_01_1 - A_10_1);
2578                                      const double tmp29_1 = tmp1_0*w14;                                      const double tmp49 = w2*(A_01_2 + A_10_2);
2579                                      const double tmp30_1 = tmp12_0*w13;                                      const double tmp50 = w5*(-A_01_3 + A_10_2);
2580                                      const double tmp31_1 = tmp11_0*w12;                                      const double tmp51 = w2*(A_01_0 - A_10_1);
2581                                      const double tmp32_1 = tmp13_0*w2;                                      const double tmp52 = w5*(-A_01_2 - A_10_1);
2582                                      const double tmp33_1 = tmp14_0*w5;                                      const double tmp53 = w2*(A_01_1 + A_10_2);
2583                                      const double tmp34_1 = tmp15_0*w8;                                      const double tmp54 = w5*(-A_01_2 - A_10_2);
2584                                      const double tmp35_1 = A_01_0*w8;                                      const double tmp55 = w2*(A_01_1 + A_10_1);
2585                                      const double tmp36_1 = tmp16_0*w1;                                      EM_S[INDEX4(k,m,0,0,numEq,numComp,4)]+=tmp15 + tmp16 + tmp17 + tmp18 + tmp19 + tmp20 + tmp9;
2586                                      const double tmp37_1 = A_10_1*w4;                                      EM_S[INDEX4(k,m,0,1,numEq,numComp,4)]+=tmp0 + tmp1 + tmp2 + tmp3 + tmp4 + tmp5;
2587                                      const double tmp38_1 = tmp5_0*w15;                                      EM_S[INDEX4(k,m,0,2,numEq,numComp,4)]+=tmp31 + tmp34 + tmp38 + tmp39 + tmp40 + tmp41;
2588                                      const double tmp39_1 = A_10_2*w7;                                      EM_S[INDEX4(k,m,0,3,numEq,numComp,4)]+=tmp28 + tmp52 + tmp53 + tmp7 + tmp8;
2589                                      const double tmp40_1 = tmp11_0*w17;                                      EM_S[INDEX4(k,m,1,0,numEq,numComp,4)]+=tmp0 + tmp2 + tmp3 + tmp31 + tmp50 + tmp51;
2590                                      const double tmp41_1 = A_01_3*w2;                                      EM_S[INDEX4(k,m,1,1,numEq,numComp,4)]+=tmp16 + tmp17 + tmp21 + tmp25 + tmp28 + tmp54 + tmp55;
2591                                      const double tmp42_1 = tmp12_0*w16;                                      EM_S[INDEX4(k,m,1,2,numEq,numComp,4)]+=tmp10 + tmp6 + tmp7 + tmp8 + tmp9;
2592                                      const double tmp43_1 = tmp17_0*w5;                                      EM_S[INDEX4(k,m,1,3,numEq,numComp,4)]+=tmp1 + tmp30 + tmp33 + tmp34 + tmp44 + tmp45;
2593                                      const double tmp44_1 = tmp7_0*w7;                                      EM_S[INDEX4(k,m,2,0,numEq,numComp,4)]+=tmp1 + tmp34 + tmp38 + tmp40 + tmp42 + tmp43;
2594                                      const double tmp45_1 = tmp6_0*w4;                                      EM_S[INDEX4(k,m,2,1,numEq,numComp,4)]+=tmp36 + tmp37 + tmp7 + tmp8 + tmp9;
2595                                      const double tmp46_1 = A_01_3*w8;                                      EM_S[INDEX4(k,m,2,2,numEq,numComp,4)]+=tmp15 + tmp19 + tmp22 + tmp23 + tmp28 + tmp48 + tmp49;
2596                                      const double tmp47_1 = A_10_2*w4;                                      EM_S[INDEX4(k,m,2,3,numEq,numComp,4)]+=tmp0 + tmp11 + tmp12 + tmp31 + tmp46 + tmp47;
2597                                      const double tmp48_1 = A_10_1*w7;                                      EM_S[INDEX4(k,m,3,0,numEq,numComp,4)]+=tmp27 + tmp28 + tmp29 + tmp7 + tmp8;
2598                                      const double tmp49_1 = tmp12_0*w17;                                      EM_S[INDEX4(k,m,3,1,numEq,numComp,4)]+=tmp30 + tmp31 + tmp32 + tmp33 + tmp34 + tmp35;
2599                                      const double tmp50_1 = A_01_0*w2;                                      EM_S[INDEX4(k,m,3,2,numEq,numComp,4)]+=tmp0 + tmp1 + tmp11 + tmp12 + tmp13 + tmp14;
2600                                      const double tmp51_1 = tmp11_0*w16;                                      EM_S[INDEX4(k,m,3,3,numEq,numComp,4)]+=tmp21 + tmp22 + tmp23 + tmp24 + tmp25 + tmp26 + tmp9;
                                     const double tmp52_1 = tmp18_0*w8;  
                                     const double tmp53_1 = tmp19_0*w2;  
                                     const double tmp54_1 = tmp13_0*w8;  
                                     const double tmp55_1 = tmp15_0*w2;  
                                     const double tmp56_1 = tmp19_0*w8;  
                                     const double tmp57_1 = tmp18_0*w2;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,0,0,numEq,numComp,4)]+=tmp13_1 + tmp20_1 + tmp21_1 + tmp22_1 + tmp23_1 + tmp24_1 + tmp25_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,1,0,numEq,numComp,4)]+=tmp36_1 + tmp37_1 + tmp39_1 + tmp3_1 + tmp43_1 + tmp46_1 + tmp50_1 + tmp5_1 + tmp6_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,2,0,numEq,numComp,4)]+=tmp0_1 + tmp15_1 + tmp17_1 + tmp1_1 + tmp38_1 + tmp49_1 + tmp51_1 + tmp7_1 + tmp8_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,3,0,numEq,numComp,4)]+=tmp10_1 + tmp32_1 + tmp33_1 + tmp34_1 + tmp9_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,0,1,numEq,numComp,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1 + tmp2_1 + tmp3_1 + tmp4_1 + tmp5_1 + tmp6_1 + tmp7_1 + tmp8_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,1,1,numEq,numComp,4)]+=tmp21_1 + tmp23_1 + tmp30_1 + tmp31_1 + tmp33_1 + tmp56_1 + tmp57_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,2,1,numEq,numComp,4)]+=tmp10_1 + tmp13_1 + tmp44_1 + tmp45_1 + tmp9_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,3,1,numEq,numComp,4)]+=tmp35_1 + tmp36_1 + tmp37_1 + tmp38_1 + tmp39_1 + tmp40_1 + tmp41_1 + tmp42_1 + tmp43_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,0,2,numEq,numComp,4)]+=tmp36_1 + tmp38_1 + tmp43_1 + tmp46_1 + tmp47_1 + tmp48_1 + tmp49_1 + tmp50_1 + tmp51_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,1,2,numEq,numComp,4)]+=tmp10_1 + tmp11_1 + tmp12_1 + tmp13_1 + tmp9_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,2,2,numEq,numComp,4)]+=tmp24_1 + tmp25_1 + tmp27_1 + tmp29_1 + tmp33_1 + tmp52_1 + tmp53_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,3,2,numEq,numComp,4)]+=tmp14_1 + tmp15_1 + tmp16_1 + tmp17_1 + tmp18_1 + tmp19_1 + tmp1_1 + tmp5_1 + tmp8_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,0,3,numEq,numComp,4)]+=tmp10_1 + tmp33_1 + tmp54_1 + tmp55_1 + tmp9_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,1,3,numEq,numComp,4)]+=tmp14_1 + tmp19_1 + tmp1_1 + tmp2_1 + tmp38_1 + tmp40_1 + tmp42_1 + tmp4_1 + tmp8_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,2,3,numEq,numComp,4)]+=tmp16_1 + tmp18_1 + tmp35_1 + tmp36_1 + tmp41_1 + tmp43_1 + tmp47_1 + tmp48_1 + tmp5_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,3,3,numEq,numComp,4)]+=tmp13_1 + tmp26_1 + tmp27_1 + tmp28_1 + tmp29_1 + tmp30_1 + tmp31_1;  
2601                                  }                                  }
2602                              }                              }
2603                          } else { // constant data                          } else { // constant data
# Line 2593  void Rectangle::assemblePDESystem(Paso_S Line 2607  void Rectangle::assemblePDESystem(Paso_S
2607                                      const double A_01 = A_p[INDEX4(k,0,m,1, numEq,2, numComp)];                                      const double A_01 = A_p[INDEX4(k,0,m,1, numEq,2, numComp)];
2608                                      const double A_10 = A_p[INDEX4(k,1,m,0, numEq,2, numComp)];                                      const double A_10 = A_p[INDEX4(k,1,m,0, numEq,2, numComp)];
2609                                      const double A_11 = A_p[INDEX4(k,1,m,1, numEq,2, numComp)];                                      const double A_11 = A_p[INDEX4(k,1,m,1, numEq,2, numComp)];
2610                                      const double tmp0_0 = A_01 + A_10;                                      const double tmp0 = 6*w1*(A_01 - A_10);
2611                                      const double tmp0_1 = A_00*w18;                                      const double tmp1 = 6*w1*(A_01 + A_10);
2612                                      const double tmp1_1 = A_01*w19;                                      const double tmp2 = 6*w1*(-A_01 - A_10);
2613                                      const double tmp2_1 = A_10*w20;                                      const double tmp3 = 6*w1*(-A_01 + A_10);
2614                                      const double tmp3_1 = A_11*w21;                                      EM_S[INDEX4(k,m,0,0,numEq,numComp,4)]+=-8*A_00*w6 + 8*A_11*w3 + tmp1;
2615                                      const double tmp4_1 = A_00*w22;                                      EM_S[INDEX4(k,m,0,1,numEq,numComp,4)]+=8*A_00*w6 + 4*A_11*w3 + tmp0;
2616                                      const double tmp5_1 = tmp0_0*w19;                                      EM_S[INDEX4(k,m,0,2,numEq,numComp,4)]+=-4*A_00*w6 - 8*A_11*w3 + tmp3;
2617                                      const double tmp6_1 = A_11*w23;                                      EM_S[INDEX4(k,m,0,3,numEq,numComp,4)]+=4*A_00*w6 - 4*A_11*w3 + tmp2;
2618                                      const double tmp7_1 = A_11*w25;                                      EM_S[INDEX4(k,m,1,0,numEq,numComp,4)]+=8*A_00*w6 + 4*A_11*w3 + tmp3;
2619                                      const double tmp8_1 = A_00*w24;                                      EM_S[INDEX4(k,m,1,1,numEq,numComp,4)]+=-8*A_00*w6 + 8*A_11*w3 + tmp2;
2620                                      const double tmp9_1 = tmp0_0*w20;                                      EM_S[INDEX4(k,m,1,2,numEq,numComp,4)]+=4*A_00*w6 - 4*A_11*w3 + tmp1;
2621                                      const double tmp10_1 = A_01*w20;                                      EM_S[INDEX4(k,m,1,3,numEq,numComp,4)]+=-4*A_00*w6 - 8*A_11*w3 + tmp0;
2622                                      const double tmp11_1 = A_11*w27;                                      EM_S[INDEX4(k,m,2,0,numEq,numComp,4)]+=-4*A_00*w6 - 8*A_11*w3 + tmp0;
2623                                      const double tmp12_1 = A_00*w26;                                      EM_S[INDEX4(k,m,2,1,numEq,numComp,4)]+=4*A_00*w6 - 4*A_11*w3 + tmp1;
2624                                      const double tmp13_1 = A_10*w19;                                      EM_S[INDEX4(k,m,2,2,numEq,numComp,4)]+=-8*A_00*w6 + 8*A_11*w3 + tmp2;
2625                                      EM_S[INDEX4(k,m,0,0,numEq,numComp,4)]+=tmp5_1 + tmp7_1 + tmp8_1;                                      EM_S[INDEX4(k,m,2,3,numEq,numComp,4)]+=8*A_00*w6 + 4*A_11*w3 + tmp3;
2626                                      EM_S[INDEX4(k,m,1,0,numEq,numComp,4)]+=tmp0_1 + tmp10_1 + tmp13_1 + tmp3_1;                                      EM_S[INDEX4(k,m,3,0,numEq,numComp,4)]+=4*A_00*w6 - 4*A_11*w3 + tmp2;
2627                                      EM_S[INDEX4(k,m,2,0,numEq,numComp,4)]+=tmp11_1 + tmp12_1 + tmp1_1 + tmp2_1;                                      EM_S[INDEX4(k,m,3,1,numEq,numComp,4)]+=-4*A_00*w6 - 8*A_11*w3 + tmp3;
2628                                      EM_S[INDEX4(k,m,3,0,numEq,numComp,4)]+=tmp4_1 + tmp6_1 + tmp9_1;                                      EM_S[INDEX4(k,m,3,2,numEq,numComp,4)]+=8*A_00*w6 + 4*A_11*w3 + tmp0;
2629                                      EM_S[INDEX4(k,m,0,1,numEq,numComp,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1 + tmp2_1 + tmp3_1;                                      EM_S[INDEX4(k,m,3,3,numEq,numComp,4)]+=-8*A_00*w6 + 8*A_11*w3 + tmp1;
                                     EM_S[INDEX4(k,m,1,1,numEq,numComp,4)]+=tmp7_1 + tmp8_1 + tmp9_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,2,1,numEq,numComp,4)]+=tmp4_1 + tmp5_1 + tmp6_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,3,1,numEq,numComp,4)]+=tmp10_1 + tmp11_1 + tmp12_1 + tmp13_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,0,2,numEq,numComp,4)]+=tmp10_1 + tmp11_1 + tmp12_1 + tmp13_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,1,2,numEq,numComp,4)]+=tmp4_1 + tmp5_1 + tmp6_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,2,2,numEq,numComp,4)]+=tmp7_1 + tmp8_1 + tmp9_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,3,2,numEq,numComp,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1 + tmp2_1 + tmp3_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,0,3,numEq,numComp,4)]+=tmp4_1 + tmp6_1 + tmp9_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,1,3,numEq,numComp,4)]+=tmp11_1 + tmp12_1 + tmp1_1 + tmp2_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,2,3,numEq,numComp,4)]+=tmp0_1 + tmp10_1 + tmp13_1 + tmp3_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,3,3,numEq,numComp,4)]+=tmp5_1 + tmp7_1 + tmp8_1;  
2630                                  }                                  }
2631                              }                              }
2632                          }                          }
# Line 2645  void Rectangle::assemblePDESystem(Paso_S Line 2648  void Rectangle::assemblePDESystem(Paso_S
2648                                      const double B_1_2 = B_p[INDEX4(k,1,m,2, numEq,2,numComp)];                                      const double B_1_2 = B_p[INDEX4(k,1,m,2, numEq,2,numComp)];
2649                                      const double B_0_3 = B_p[INDEX4(k,0,m,3, numEq,2,numComp)];                                      const double B_0_3 = B_p[INDEX4(k,0,m,3, numEq,2,numComp)];
2650                                      const double B_1_3 = B_p[INDEX4(k,1,m,3, numEq,2,numComp)];                                      const double B_1_3 = B_p[INDEX4(k,1,m,3, numEq,2,numComp)];
2651                                      const double tmp0_0 = B_1_0 + B_1_1;                                      const double tmp0 = w11*(B_1_0 + B_1_1);
2652                                      const double tmp1_0 = B_1_2 + B_1_3;                                      const double tmp1 = w14*(B_1_2 + B_1_3);
2653                                      const double tmp2_0 = B_0_1 + B_0_3;                                      const double tmp2 = w15*(-B_0_1 - B_0_3);
2654                                      const double tmp3_0 = B_0_0 + B_0_2;                                      const double tmp3 = w10*(-B_0_0 - B_0_2);
2655                                      const double tmp63_1 = B_1_1*w42;                                      const double tmp4 = w11*(B_1_2 + B_1_3);
2656                                      const double tmp79_1 = B_1_1*w40;                                      const double tmp5 = w14*(B_1_0 + B_1_1);
2657                                      const double tmp37_1 = tmp3_0*w35;                                      const double tmp6 = w11*(-B_1_2 - B_1_3);
2658                                      const double tmp8_1 = tmp0_0*w32;                                      const double tmp7 = w14*(-B_1_0 - B_1_1);
2659                                      const double tmp71_1 = B_0_1*w34;                                      const double tmp8 = w11*(-B_1_0 - B_1_1);
2660                                      const double tmp19_1 = B_0_3*w31;                                      const double tmp9 = w14*(-B_1_2 - B_1_3);
2661                                      const double tmp15_1 = B_0_3*w34;                                      const double tmp10 = w10*(-B_0_1 - B_0_3);
2662                                      const double tmp9_1 = tmp3_0*w34;                                      const double tmp11 = w15*(-B_0_0 - B_0_2);
2663                                      const double tmp35_1 = B_1_0*w36;                                      const double tmp12 = w15*(B_0_0 + B_0_2);
2664                                      const double tmp66_1 = B_0_3*w28;                                      const double tmp13 = w10*(B_0_1 + B_0_3);
2665                                      const double tmp28_1 = B_1_0*w42;                                      const double tmp14 = w10*(B_0_0 + B_0_2);
2666                                      const double tmp22_1 = B_1_0*w40;                                      const double tmp15 = w15*(B_0_1 + B_0_3);
2667                                      const double tmp16_1 = B_1_2*w29;                                      EM_S[INDEX4(k,m,0,0,numEq,numComp,4)]+=B_0_0*w12 + B_0_1*w10 + B_0_2*w15 + B_0_3*w13 + B_1_0*w16 + B_1_1*w14 + B_1_2*w11 + B_1_3*w17;
2668                                      const double tmp6_1 = tmp2_0*w35;                                      EM_S[INDEX4(k,m,0,1,numEq,numComp,4)]+=B_0_0*w10 + B_0_1*w12 + B_0_2*w13 + B_0_3*w15 + tmp0 + tmp1;
2669                                      const double tmp55_1 = B_1_3*w40;                                      EM_S[INDEX4(k,m,0,2,numEq,numComp,4)]+=B_1_0*w11 + B_1_1*w17 + B_1_2*w16 + B_1_3*w14 + tmp14 + tmp15;
2670                                      const double tmp50_1 = B_1_3*w42;                                      EM_S[INDEX4(k,m,0,3,numEq,numComp,4)]+=tmp12 + tmp13 + tmp4 + tmp5;
2671                                      const double tmp7_1 = tmp1_0*w29;                                      EM_S[INDEX4(k,m,1,0,numEq,numComp,4)]+=-B_0_0*w12 - B_0_1*w10 - B_0_2*w15 - B_0_3*w13 + tmp0 + tmp1;
2672                                      const double tmp1_1 = tmp1_0*w32;                                      EM_S[INDEX4(k,m,1,1,numEq,numComp,4)]+=-B_0_0*w10 - B_0_1*w12 - B_0_2*w13 - B_0_3*w15 + B_1_0*w14 + B_1_1*w16 + B_1_2*w17 + B_1_3*w11;
2673                                      const double tmp57_1 = B_0_3*w30;                                      EM_S[INDEX4(k,m,1,2,numEq,numComp,4)]+=tmp2 + tmp3 + tmp4 + tmp5;
2674                                      const double tmp18_1 = B_1_1*w32;                                      EM_S[INDEX4(k,m,1,3,numEq,numComp,4)]+=B_1_0*w17 + B_1_1*w11 + B_1_2*w14 + B_1_3*w16 + tmp10 + tmp11;
2675                                      const double tmp53_1 = B_1_0*w41;                                      EM_S[INDEX4(k,m,2,0,numEq,numComp,4)]+=-B_1_0*w16 - B_1_1*w14 - B_1_2*w11 - B_1_3*w17 + tmp14 + tmp15;
2676                                      const double tmp61_1 = B_1_3*w36;                                      EM_S[INDEX4(k,m,2,1,numEq,numComp,4)]+=tmp12 + tmp13 + tmp8 + tmp9;
2677                                      const double tmp27_1 = B_0_3*w38;                                      EM_S[INDEX4(k,m,2,2,numEq,numComp,4)]+=B_0_0*w15 + B_0_1*w13 + B_0_2*w12 + B_0_3*w10 - B_1_0*w11 - B_1_1*w17 - B_1_2*w16 - B_1_3*w14;
2678                                      const double tmp64_1 = B_0_2*w30;                                      EM_S[INDEX4(k,m,2,3,numEq,numComp,4)]+=B_0_0*w13 + B_0_1*w15 + B_0_2*w10 + B_0_3*w12 + tmp6 + tmp7;
2679                                      const double tmp76_1 = B_0_1*w38;                                      EM_S[INDEX4(k,m,3,0,numEq,numComp,4)]+=tmp2 + tmp3 + tmp8 + tmp9;
2680                                      const double tmp39_1 = tmp2_0*w34;                                      EM_S[INDEX4(k,m,3,1,numEq,numComp,4)]+=-B_1_0*w14 - B_1_1*w16 - B_1_2*w17 - B_1_3*w11 + tmp10 + tmp11;
2681                                      const double tmp62_1 = B_0_1*w31;                                      EM_S[INDEX4(k,m,3,2,numEq,numComp,4)]+=-B_0_0*w15 - B_0_1*w13 - B_0_2*w12 - B_0_3*w10 + tmp6 + tmp7;
2682                                      const double tmp56_1 = B_0_0*w31;                                      EM_S[INDEX4(k,m,3,3,numEq,numComp,4)]+=-B_0_0*w13 - B_0_1*w15 - B_0_2*w10 - B_0_3*w12 - B_1_0*w17 - B_1_1*w11 - B_1_2*w14 - B_1_3*w16;
                                     const double tmp49_1 = B_1_1*w36;  
                                     const double tmp2_1 = B_0_2*w31;  
                                     const double tmp23_1 = B_0_2*w33;  
                                     const double tmp38_1 = B_1_1*w43;  
                                     const double tmp74_1 = B_1_2*w41;