/[escript]/trunk/ripley/src/Rectangle.cpp
ViewVC logotype

Diff of /trunk/ripley/src/Rectangle.cpp

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

branches/ripleygmg_from_3668/ripley/src/Rectangle.cpp revision 3791 by caltinay, Wed Feb 1 05:10:22 2012 UTC trunk/ripley/src/Rectangle.cpp revision 4618 by caltinay, Wed Jan 15 04:35:19 2014 UTC
# Line 1  Line 1 
1    
2  /*******************************************************  /*****************************************************************************
3  *  *
4  * Copyright (c) 2003-2012 by University of Queensland  * Copyright (c) 2003-2013 by University of Queensland
5  * Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)  * http://www.uq.edu.au
 * http://www.uq.edu.au/esscc  
6  *  *
7  * Primary Business: Queensland, Australia  * Primary Business: Queensland, Australia
8  * Licensed under the Open Software License version 3.0  * Licensed under the Open Software License version 3.0
9  * http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php  * http://www.opensource.org/licenses/osl-3.0.php
10  *  *
11  *******************************************************/  * Development until 2012 by Earth Systems Science Computational Center (ESSCC)
12    * Development since 2012 by School of Earth Sciences
13    *
14    *****************************************************************************/
15    
16  #include <ripley/Rectangle.h>  #include <ripley/Rectangle.h>
 extern "C" {  
17  #include <paso/SystemMatrix.h>  #include <paso/SystemMatrix.h>
18  }  #include <esysUtils/esysFileWriter.h>
19    
20    #include <boost/scoped_array.hpp>
21    #include "esysUtils/EsysRandom.h"
22    
23    #ifdef USE_NETCDF
24    #include <netcdfcpp.h>
25    #endif
26    
27  #if USE_SILO  #if USE_SILO
28  #include <silo.h>  #include <silo.h>
# Line 26  extern "C" { Line 34  extern "C" {
34  #include <iomanip>  #include <iomanip>
35    
36  using namespace std;  using namespace std;
37    using esysUtils::FileWriter;
38    
39  namespace ripley {  namespace ripley {
40    
41  Rectangle::Rectangle(int n0, int n1, double x0, double y0, double x1,  Rectangle::Rectangle(int n0, int n1, double x0, double y0, double x1,
42                       double y1, int d0, int d1) :                       double y1, int d0, int d1) :
43      RipleyDomain(2),      RipleyDomain(2)
     m_gNE0(n0),  
     m_gNE1(n1),  
     m_x0(x0),  
     m_y0(y0),  
     m_l0(x1-x0),  
     m_l1(y1-y0),  
     m_NX(d0),  
     m_NY(d1)  
44  {  {
45        // ignore subdivision parameters for serial run
46        if (m_mpiInfo->size == 1) {
47            d0=1;
48            d1=1;
49        }
50    
51        bool warn=false;
52        // if number of subdivisions is non-positive, try to subdivide by the same
53        // ratio as the number of elements
54        if (d0<=0 && d1<=0) {
55            warn=true;
56            d0=max(1, (int)(sqrt(m_mpiInfo->size*(n0+1)/(float)(n1+1))));
57            d1=m_mpiInfo->size/d0;
58            if (d0*d1 != m_mpiInfo->size) {
59                // ratios not the same so subdivide side with more elements only
60                if (n0>n1) {
61                    d0=0;
62                    d1=1;
63                } else {
64                    d0=1;
65                    d1=0;
66                }
67            }
68        }
69        if (d0<=0) {
70            // d1 is preset, determine d0 - throw further down if result is no good
71            d0=m_mpiInfo->size/d1;
72        } else if (d1<=0) {
73            // d0 is preset, determine d1 - throw further down if result is no good
74            d1=m_mpiInfo->size/d0;
75        }
76    
77      // ensure number of subdivisions is valid and nodes can be distributed      // ensure number of subdivisions is valid and nodes can be distributed
78      // among number of ranks      // among number of ranks
79      if (m_NX*m_NY != m_mpiInfo->size)      if (d0*d1 != m_mpiInfo->size)
80          throw RipleyException("Invalid number of spatial subdivisions");          throw RipleyException("Invalid number of spatial subdivisions");
81    
82      if ((n0+1)%m_NX > 0 || (n1+1)%m_NY > 0)      if (warn) {
83          throw RipleyException("Number of elements+1 must be separable into number of ranks in each dimension");          cout << "Warning: Automatic domain subdivision (d0=" << d0 << ", d1="
84                << d1 << "). This may not be optimal!" << endl;
85        }
86    
87        double l0 = x1-x0;
88        double l1 = y1-y0;
89        m_dx[0] = l0/n0;
90        m_dx[1] = l1/n1;
91    
92        if ((n0+1)%d0 > 0) {
93            n0=(int)round((float)(n0+1)/d0+0.5)*d0-1;
94            l0=m_dx[0]*n0;
95            cout << "Warning: Adjusted number of elements and length. N0="
96                << n0 << ", l0=" << l0 << endl;
97        }
98        if ((n1+1)%d1 > 0) {
99            n1=(int)round((float)(n1+1)/d1+0.5)*d1-1;
100            l1=m_dx[1]*n1;
101            cout << "Warning: Adjusted number of elements and length. N1="
102                << n1 << ", l1=" << l1 << endl;
103        }
104    
105      if ((m_NX > 1 && (n0+1)/m_NX<2) || (m_NY > 1 && (n1+1)/m_NY<2))      if ((d0 > 1 && (n0+1)/d0<2) || (d1 > 1 && (n1+1)/d1<2))
106          throw RipleyException("Too few elements for the number of ranks");          throw RipleyException("Too few elements for the number of ranks");
107    
108        m_gNE[0] = n0;
109        m_gNE[1] = n1;
110        m_origin[0] = x0;
111        m_origin[1] = y0;
112        m_length[0] = l0;
113        m_length[1] = l1;
114        m_NX[0] = d0;
115        m_NX[1] = d1;
116    
117      // local number of elements (with and without overlap)      // local number of elements (with and without overlap)
118      m_NE0 = m_ownNE0 = (m_NX>1 ? (n0+1)/m_NX : n0);      m_NE[0] = m_ownNE[0] = (d0>1 ? (n0+1)/d0 : n0);
119      if (m_mpiInfo->rank%m_NX>0 && m_mpiInfo->rank%m_NX<m_NX-1)      if (m_mpiInfo->rank%d0>0 && m_mpiInfo->rank%d0<d0-1)
120          m_NE0++;          m_NE[0]++;
121      else if (m_NX>1 && m_mpiInfo->rank%m_NX==m_NX-1)      else if (d0>1 && m_mpiInfo->rank%d0==d0-1)
122          m_ownNE0--;          m_ownNE[0]--;
123    
124      m_NE1 = m_ownNE1 = (m_NY>1 ? (n1+1)/m_NY : n1);      m_NE[1] = m_ownNE[1] = (d1>1 ? (n1+1)/d1 : n1);
125      if (m_mpiInfo->rank/m_NX>0 && m_mpiInfo->rank/m_NX<m_NY-1)      if (m_mpiInfo->rank/d0>0 && m_mpiInfo->rank/d0<d1-1)
126          m_NE1++;          m_NE[1]++;
127      else if (m_NY>1 && m_mpiInfo->rank/m_NX==m_NY-1)      else if (d1>1 && m_mpiInfo->rank/d0==d1-1)
128          m_ownNE1--;          m_ownNE[1]--;
129    
130      // local number of nodes      // local number of nodes
131      m_N0 = m_NE0+1;      m_NN[0] = m_NE[0]+1;
132      m_N1 = m_NE1+1;      m_NN[1] = m_NE[1]+1;
133    
134      // bottom-left node is at (offset0,offset1) in global mesh      // bottom-left node is at (offset0,offset1) in global mesh
135      m_offset0 = (n0+1)/m_NX*(m_mpiInfo->rank%m_NX);      m_offset[0] = (n0+1)/d0*(m_mpiInfo->rank%d0);
136      if (m_offset0 > 0)      if (m_offset[0] > 0)
137          m_offset0--;          m_offset[0]--;
138      m_offset1 = (n1+1)/m_NY*(m_mpiInfo->rank/m_NX);      m_offset[1] = (n1+1)/d1*(m_mpiInfo->rank/d0);
139      if (m_offset1 > 0)      if (m_offset[1] > 0)
140          m_offset1--;          m_offset[1]--;
141    
142      populateSampleIds();      populateSampleIds();
143      createPattern();      createPattern();
# Line 97  bool Rectangle::operator==(const Abstrac Line 159  bool Rectangle::operator==(const Abstrac
159      const Rectangle* o=dynamic_cast<const Rectangle*>(&other);      const Rectangle* o=dynamic_cast<const Rectangle*>(&other);
160      if (o) {      if (o) {
161          return (RipleyDomain::operator==(other) &&          return (RipleyDomain::operator==(other) &&
162                  m_gNE0==o->m_gNE0 && m_gNE1==o->m_gNE1                  m_gNE[0]==o->m_gNE[0] && m_gNE[1]==o->m_gNE[1]
163                  && m_x0==o->m_x0 && m_y0==o->m_y0                  && m_origin[0]==o->m_origin[0] && m_origin[1]==o->m_origin[1]
164                  && m_l0==o->m_l0 && m_l1==o->m_l1                  && m_length[0]==o->m_length[0] && m_length[1]==o->m_length[1]
165                  && m_NX==o->m_NX && m_NY==o->m_NY);                  && m_NX[0]==o->m_NX[0] && m_NX[1]==o->m_NX[1]);
166      }      }
167    
168      return false;      return false;
169  }  }
170    
171    void Rectangle::readNcGrid(escript::Data& out, string filename, string varname,
172                const ReaderParameters& params) const
173    {
174    #ifdef USE_NETCDF
175        // check destination function space
176        int myN0, myN1;
177        if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Nodes) {
178            myN0 = m_NN[0];
179            myN1 = m_NN[1];
180        } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements ||
181                    out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
182            myN0 = m_NE[0];
183            myN1 = m_NE[1];
184        } else
185            throw RipleyException("readNcGrid(): invalid function space for output data object");
186    
187        if (params.first.size() != 2)
188            throw RipleyException("readNcGrid(): argument 'first' must have 2 entries");
189    
190        if (params.numValues.size() != 2)
191            throw RipleyException("readNcGrid(): argument 'numValues' must have 2 entries");
192    
193        if (params.multiplier.size() != 2)
194            throw RipleyException("readNcGrid(): argument 'multiplier' must have 2 entries");
195        for (size_t i=0; i<params.multiplier.size(); i++)
196            if (params.multiplier[i]<1)
197                throw RipleyException("readNcGrid(): all multipliers must be positive");
198        if (params.reverse.size() != 2)
199            throw RipleyException("readNcGrid(): argument 'reverse' must have 2 entries");
200    
201        // check file existence and size
202        NcFile f(filename.c_str(), NcFile::ReadOnly);
203        if (!f.is_valid())
204            throw RipleyException("readNcGrid(): cannot open file");
205    
206        NcVar* var = f.get_var(varname.c_str());
207        if (!var)
208            throw RipleyException("readNcGrid(): invalid variable");
209    
210        // TODO: rank>0 data support
211        const int numComp = out.getDataPointSize();
212        if (numComp > 1)
213            throw RipleyException("readNcGrid(): only scalar data supported");
214    
215        const int dims = var->num_dims();
216        boost::scoped_array<long> edges(var->edges());
217    
218        // is this a slice of the data object (dims!=2)?
219        // note the expected ordering of edges (as in numpy: y,x)
220        if ( (dims==2 && (params.numValues[1] > edges[0] || params.numValues[0] > edges[1]))
221                || (dims==1 && params.numValues[1]>1) ) {
222            throw RipleyException("readNcGrid(): not enough data in file");
223        }
224    
225        // check if this rank contributes anything
226        if (params.first[0] >= m_offset[0]+myN0 ||
227                params.first[0]+params.numValues[0]*params.multiplier[0] <= m_offset[0] ||
228                params.first[1] >= m_offset[1]+myN1 ||
229                params.first[1]+params.numValues[1]*params.multiplier[1] <= m_offset[1])
230            return;
231    
232        // now determine how much this rank has to write
233    
234        // first coordinates in data object to write to
235        const int first0 = max(0, params.first[0]-m_offset[0]);
236        const int first1 = max(0, params.first[1]-m_offset[1]);
237        // indices to first value in file (not accounting for reverse yet)
238        int idx0 = max(0, m_offset[0]-params.first[0]);
239        int idx1 = max(0, m_offset[1]-params.first[1]);
240        // number of values to read
241        const int num0 = min(params.numValues[0]-idx0, myN0-first0);
242        const int num1 = min(params.numValues[1]-idx1, myN1-first1);
243    
244        // make sure we read the right block if going backwards through file
245        if (params.reverse[0])
246            idx0 = edges[dims-1]-num0-idx0;
247        if (dims>1 && params.reverse[1])
248            idx1 = edges[dims-2]-num1-idx1;
249    
250        vector<double> values(num0*num1);
251        if (dims==2) {
252            var->set_cur(idx1, idx0);
253            var->get(&values[0], num1, num0);
254        } else {
255            var->set_cur(idx0);
256            var->get(&values[0], num0);
257        }
258    
259        const int dpp = out.getNumDataPointsPerSample();
260        out.requireWrite();
261    
262        // helpers for reversing
263        const int x0 = (params.reverse[0] ? num0-1 : 0);
264        const int x_mult = (params.reverse[0] ? -1 : 1);
265        const int y0 = (params.reverse[1] ? num1-1 : 0);
266        const int y_mult = (params.reverse[1] ? -1 : 1);
267    
268        for (index_t y=0; y<num1; y++) {
269    #pragma omp parallel for
270            for (index_t x=0; x<num0; x++) {
271                const int baseIndex = first0+x*params.multiplier[0]
272                                      +(first1+y*params.multiplier[1])*myN0;
273                const int srcIndex = (y0+y_mult*y)*num0+(x0+x_mult*x);
274                if (!isnan(values[srcIndex])) {
275                    for (index_t m1=0; m1<params.multiplier[1]; m1++) {
276                        for (index_t m0=0; m0<params.multiplier[0]; m0++) {
277                            const int dataIndex = baseIndex+m0+m1*myN0;
278                            double* dest = out.getSampleDataRW(dataIndex);
279                            for (index_t q=0; q<dpp; q++) {
280                                *dest++ = values[srcIndex];
281                            }
282                        }
283                    }
284                }
285            }
286        }
287    #else
288        throw RipleyException("readNcGrid(): not compiled with netCDF support");
289    #endif
290    }
291    
292    void Rectangle::readBinaryGrid(escript::Data& out, string filename,
293                                   const ReaderParameters& params) const
294    {
295        // the mapping is not universally correct but should work on our
296        // supported platforms
297        switch (params.dataType) {
298            case DATATYPE_INT32:
299                readBinaryGridImpl<int>(out, filename, params);
300                break;
301            case DATATYPE_FLOAT32:
302                readBinaryGridImpl<float>(out, filename, params);
303                break;
304            case DATATYPE_FLOAT64:
305                readBinaryGridImpl<double>(out, filename, params);
306                break;
307            default:
308                throw RipleyException("readBinaryGrid(): invalid or unsupported datatype");
309        }
310    }
311    
312    template<typename ValueType>
313    void Rectangle::readBinaryGridImpl(escript::Data& out, const string& filename,
314                                       const ReaderParameters& params) const
315    {
316        // check destination function space
317        int myN0, myN1;
318        if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Nodes) {
319            myN0 = m_NN[0];
320            myN1 = m_NN[1];
321        } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements ||
322                    out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
323            myN0 = m_NE[0];
324            myN1 = m_NE[1];
325        } else
326            throw RipleyException("readBinaryGrid(): invalid function space for output data object");
327    
328        // check file existence and size
329        ifstream f(filename.c_str(), ifstream::binary);
330        if (f.fail()) {
331            throw RipleyException("readBinaryGrid(): cannot open file");
332        }
333        f.seekg(0, ios::end);
334        const int numComp = out.getDataPointSize();
335        const int filesize = f.tellg();
336        const int reqsize = params.numValues[0]*params.numValues[1]*numComp*sizeof(ValueType);
337        if (filesize < reqsize) {
338            f.close();
339            throw RipleyException("readBinaryGrid(): not enough data in file");
340        }
341    
342        // check if this rank contributes anything
343        if (params.first[0] >= m_offset[0]+myN0 ||
344                params.first[0]+params.numValues[0] <= m_offset[0] ||
345                params.first[1] >= m_offset[1]+myN1 ||
346                params.first[1]+params.numValues[1] <= m_offset[1]) {
347            f.close();
348            return;
349        }
350    
351        // now determine how much this rank has to write
352    
353        // first coordinates in data object to write to
354        const int first0 = max(0, params.first[0]-m_offset[0]);
355        const int first1 = max(0, params.first[1]-m_offset[1]);
356        // indices to first value in file
357        const int idx0 = max(0, m_offset[0]-params.first[0]);
358        const int idx1 = max(0, m_offset[1]-params.first[1]);
359        // number of values to read
360        const int num0 = min(params.numValues[0]-idx0, myN0-first0);
361        const int num1 = min(params.numValues[1]-idx1, myN1-first1);
362    
363        out.requireWrite();
364        vector<ValueType> values(num0*numComp);
365        const int dpp = out.getNumDataPointsPerSample();
366    
367        for (int y=0; y<num1; y++) {
368            const int fileofs = numComp*(idx0+(idx1+y)*params.numValues[0]);
369            f.seekg(fileofs*sizeof(ValueType));
370            f.read((char*)&values[0], num0*numComp*sizeof(ValueType));
371            for (int x=0; x<num0; x++) {
372                const int baseIndex = first0+x*params.multiplier[0]
373                                        +(first1+y*params.multiplier[1])*myN0;
374                for (int m1=0; m1<params.multiplier[1]; m1++) {
375                    for (int m0=0; m0<params.multiplier[0]; m0++) {
376                        const int dataIndex = baseIndex+m0+m1*myN0;
377                        double* dest = out.getSampleDataRW(dataIndex);
378                        for (int c=0; c<numComp; c++) {
379                            ValueType val = values[x*numComp+c];
380    
381                            if (params.byteOrder != BYTEORDER_NATIVE) {
382                                char* cval = reinterpret_cast<char*>(&val);
383                                // this will alter val!!
384                                byte_swap32(cval);
385                            }
386                            if (!std::isnan(val)) {
387                                for (int q=0; q<dpp; q++) {
388                                    *dest++ = static_cast<double>(val);
389                                }
390                            }
391                        }
392                    }
393                }
394            }
395        }
396    
397        f.close();
398    }
399    
400    void Rectangle::writeBinaryGrid(const escript::Data& in, string filename,
401                                    int byteOrder, int dataType) const
402    {
403        // the mapping is not universally correct but should work on our
404        // supported platforms
405        switch (dataType) {
406            case DATATYPE_INT32:
407                writeBinaryGridImpl<int>(in, filename, byteOrder);
408                break;
409            case DATATYPE_FLOAT32:
410                writeBinaryGridImpl<float>(in, filename, byteOrder);
411                break;
412            case DATATYPE_FLOAT64:
413                writeBinaryGridImpl<double>(in, filename, byteOrder);
414                break;
415            default:
416                throw RipleyException("writeBinaryGrid(): invalid or unsupported datatype");
417        }
418    }
419    
420    template<typename ValueType>
421    void Rectangle::writeBinaryGridImpl(const escript::Data& in,
422                                        const string& filename, int byteOrder) const
423    {
424        // check function space and determine number of points
425        int myN0, myN1;
426        int totalN0, totalN1;
427        if (in.getFunctionSpace().getTypeCode() == Nodes) {
428            myN0 = m_NN[0];
429            myN1 = m_NN[1];
430            totalN0 = m_gNE[0]+1;
431            totalN1 = m_gNE[1]+1;
432        } else if (in.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements ||
433                    in.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
434            myN0 = m_NE[0];
435            myN1 = m_NE[1];
436            totalN0 = m_gNE[0];
437            totalN1 = m_gNE[1];
438        } else
439            throw RipleyException("writeBinaryGrid(): invalid function space of data object");
440    
441        const int numComp = in.getDataPointSize();
442        const int dpp = in.getNumDataPointsPerSample();
443    
444        if (numComp > 1 || dpp > 1)
445            throw RipleyException("writeBinaryGrid(): only scalar, single-value data supported");
446    
447        escript::Data* _in = const_cast<escript::Data*>(&in);
448        const int fileSize = sizeof(ValueType)*numComp*dpp*totalN0*totalN1;
449    
450        // from here on we know that each sample consists of one value
451        FileWriter fw;
452        fw.openFile(filename, fileSize);
453        MPIBarrier();
454    
455        for (index_t y=0; y<myN1; y++) {
456            const int fileofs = (m_offset[0]+(m_offset[1]+y)*totalN0)*sizeof(ValueType);
457            ostringstream oss;
458    
459            for (index_t x=0; x<myN0; x++) {
460                const double* sample = _in->getSampleDataRO(y*myN0+x);
461                ValueType fvalue = static_cast<ValueType>(*sample);
462                if (byteOrder == BYTEORDER_NATIVE) {
463                    oss.write((char*)&fvalue, sizeof(fvalue));
464                } else {
465                    char* value = reinterpret_cast<char*>(&fvalue);
466                    oss.write(byte_swap32(value), sizeof(fvalue));
467                }
468            }
469            fw.writeAt(oss, fileofs);
470        }
471        fw.close();
472    }
473    
474  void Rectangle::dump(const string& fileName) const  void Rectangle::dump(const string& fileName) const
475  {  {
476  #if USE_SILO  #if USE_SILO
# Line 114  void Rectangle::dump(const string& fileN Line 479  void Rectangle::dump(const string& fileN
479          fn+=".silo";          fn+=".silo";
480      }      }
481    
     const int NUM_SILO_FILES = 1;  
     const char* blockDirFmt = "/block%04d";  
482      int driver=DB_HDF5;          int driver=DB_HDF5;    
483      DBfile* dbfile = NULL;      DBfile* dbfile = NULL;
484        const char* blockDirFmt = "/block%04d";
485    
486  #ifdef ESYS_MPI  #ifdef ESYS_MPI
487      PMPIO_baton_t* baton = NULL;      PMPIO_baton_t* baton = NULL;
488        const int NUM_SILO_FILES = 1;
489  #endif  #endif
490    
491      if (m_mpiInfo->size > 1) {      if (m_mpiInfo->size > 1) {
# Line 168  void Rectangle::dump(const string& fileN Line 533  void Rectangle::dump(const string& fileN
533      }      }
534      */      */
535    
536      boost::scoped_ptr<double> x(new double[m_N0]);      boost::scoped_ptr<double> x(new double[m_NN[0]]);
537      boost::scoped_ptr<double> y(new double[m_N1]);      boost::scoped_ptr<double> y(new double[m_NN[1]]);
538      double* coords[2] = { x.get(), y.get() };      double* coords[2] = { x.get(), y.get() };
     pair<double,double> xdx = getFirstCoordAndSpacing(0);  
     pair<double,double> ydy = getFirstCoordAndSpacing(1);  
539  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
540      {      {
541  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
542          for (dim_t i0 = 0; i0 < m_N0; i0++) {          for (dim_t i0 = 0; i0 < m_NN[0]; i0++) {
543              coords[0][i0]=xdx.first+i0*xdx.second;              coords[0][i0]=getLocalCoordinate(i0, 0);
544          }          }
545  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
546          for (dim_t i1 = 0; i1 < m_N1; i1++) {          for (dim_t i1 = 0; i1 < m_NN[1]; i1++) {
547              coords[1][i1]=ydy.first+i1*ydy.second;              coords[1][i1]=getLocalCoordinate(i1, 1);
548          }          }
549      }      }
550      IndexVector dims = getNumNodesPerDim();      int* dims = const_cast<int*>(getNumNodesPerDim());
551    
552      // write mesh      // write mesh
553      DBPutQuadmesh(dbfile, "mesh", NULL, coords, &dims[0], 2, DB_DOUBLE,      DBPutQuadmesh(dbfile, "mesh", NULL, coords, dims, 2, DB_DOUBLE,
554              DB_COLLINEAR, NULL);              DB_COLLINEAR, NULL);
555    
556      // write node ids      // write node ids
557      DBPutQuadvar1(dbfile, "nodeId", "mesh", (void*)&m_nodeId[0], &dims[0], 2,      DBPutQuadvar1(dbfile, "nodeId", "mesh", (void*)&m_nodeId[0], dims, 2,
558              NULL, 0, DB_INT, DB_NODECENT, NULL);              NULL, 0, DB_INT, DB_NODECENT, NULL);
559    
560      // write element ids      // write element ids
561      dims = getNumElementsPerDim();      dims = const_cast<int*>(getNumElementsPerDim());
562      DBPutQuadvar1(dbfile, "elementId", "mesh", (void*)&m_elementId[0],      DBPutQuadvar1(dbfile, "elementId", "mesh", (void*)&m_elementId[0],
563              &dims[0], 2, NULL, 0, DB_INT, DB_ZONECENT, NULL);              dims, 2, NULL, 0, DB_INT, DB_ZONECENT, NULL);
564    
565      // rank 0 writes multimesh and multivar      // rank 0 writes multimesh and multivar
566      if (m_mpiInfo->rank == 0) {      if (m_mpiInfo->rank == 0) {
# Line 289  bool Rectangle::ownSample(int fsType, in Line 652  bool Rectangle::ownSample(int fsType, in
652          case Elements:          case Elements:
653          case ReducedElements:          case ReducedElements:
654              // check ownership of element's bottom left node              // check ownership of element's bottom left node
655              return (m_dofMap[id%m_NE0+m_N0*(id/m_NE0)] < getNumDOF());              return (m_dofMap[id%m_NE[0]+m_NN[0]*(id/m_NE[0])] < getNumDOF());
656          case FaceElements:          case FaceElements:
657          case ReducedFaceElements:          case ReducedFaceElements:
658              {              {
659                  // determine which face the sample belongs to before                  // determine which face the sample belongs to before
660                  // checking ownership of corresponding element's first node                  // checking ownership of corresponding element's first node
                 const IndexVector faces = getNumFacesPerBoundary();  
661                  dim_t n=0;                  dim_t n=0;
662                  for (size_t i=0; i<faces.size(); i++) {                  for (size_t i=0; i<4; i++) {
663                      n+=faces[i];                      n+=m_faceCount[i];
664                      if (id<n) {                      if (id<n) {
665                          index_t k;                          index_t k;
666                          if (i==1)                          if (i==1)
667                              k=m_N0-2;                              k=m_NN[0]-2;
668                          else if (i==3)                          else if (i==3)
669                              k=m_N0*(m_N1-2);                              k=m_NN[0]*(m_NN[1]-2);
670                          else                          else
671                              k=0;                              k=0;
672                          // determine whether to move right or up                          // determine whether to move right or up
673                          const index_t delta=(i/2==0 ? m_N0 : 1);                          const index_t delta=(i/2==0 ? m_NN[0] : 1);
674                          return (m_dofMap[k+(id-n+faces[i])*delta] < getNumDOF());                          return (m_dofMap[k+(id-n+m_faceCount[i])*delta] < getNumDOF());
675                      }                      }
676                  }                  }
677                  return false;                  return false;
# Line 331  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat Line 693  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat
693          {          {
694              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
695  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
696                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
697                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+k1);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+k1);
698                      // set vector at two quadrature points                      // set vector at two quadrature points
699                      *o++ = -1.;                      *o++ = -1.;
# Line 343  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat Line 705  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat
705    
706              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
707  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
708                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
709                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+k1);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+k1);
710                      // set vector at two quadrature points                      // set vector at two quadrature points
711                      *o++ = 1.;                      *o++ = 1.;
# Line 355  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat Line 717  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat
717    
718              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
719  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
720                  for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                  for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
721                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+k0);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+k0);
722                      // set vector at two quadrature points                      // set vector at two quadrature points
723                      *o++ = 0.;                      *o++ = 0.;
# Line 367  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat Line 729  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat
729    
730              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
731  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
732                  for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                  for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
733                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+k0);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+k0);
734                      // set vector at two quadrature points                      // set vector at two quadrature points
735                      *o++ = 0.;                      *o++ = 0.;
# Line 383  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat Line 745  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat
745          {          {
746              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
747  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
748                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
749                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+k1);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+k1);
750                      *o++ = -1.;                      *o++ = -1.;
751                      *o = 0.;                      *o = 0.;
# Line 392  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat Line 754  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat
754    
755              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
756  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
757                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
758                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+k1);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+k1);
759                      *o++ = 1.;                      *o++ = 1.;
760                      *o = 0.;                      *o = 0.;
# Line 401  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat Line 763  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat
763    
764              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
765  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
766                  for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                  for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
767                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+k0);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+k0);
768                      *o++ = 0.;                      *o++ = 0.;
769                      *o = -1.;                      *o = -1.;
# Line 410  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat Line 772  void Rectangle::setToNormal(escript::Dat
772    
773              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
774  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
775                  for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                  for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
776                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+k0);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+k0);
777                      *o++ = 0.;                      *o++ = 0.;
778                      *o = 1.;                      *o = 1.;
# Line 432  void Rectangle::setToSize(escript::Data& Line 794  void Rectangle::setToSize(escript::Data&
794              || out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {              || out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
795          out.requireWrite();          out.requireWrite();
796          const dim_t numQuad=out.getNumDataPointsPerSample();          const dim_t numQuad=out.getNumDataPointsPerSample();
797          const double hSize=getFirstCoordAndSpacing(0).second;          const double size=sqrt(m_dx[0]*m_dx[0]+m_dx[1]*m_dx[1]);
         const double vSize=getFirstCoordAndSpacing(1).second;  
         const double size=min(hSize,vSize);  
798  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel for
799          for (index_t k = 0; k < getNumElements(); ++k) {          for (index_t k = 0; k < getNumElements(); ++k) {
800              double* o = out.getSampleDataRW(k);              double* o = out.getSampleDataRW(k);
# Line 444  void Rectangle::setToSize(escript::Data& Line 804  void Rectangle::setToSize(escript::Data&
804              || out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedFaceElements) {              || out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedFaceElements) {
805          out.requireWrite();          out.requireWrite();
806          const dim_t numQuad=out.getNumDataPointsPerSample();          const dim_t numQuad=out.getNumDataPointsPerSample();
         const double hSize=getFirstCoordAndSpacing(0).second;  
         const double vSize=getFirstCoordAndSpacing(1).second;  
807  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
808          {          {
809              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
810  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
811                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
812                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+k1);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+k1);
813                      fill(o, o+numQuad, vSize);                      fill(o, o+numQuad, m_dx[1]);
814                  }                  }
815              }              }
816    
817              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
818  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
819                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = 0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
820                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+k1);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+k1);
821                      fill(o, o+numQuad, vSize);                      fill(o, o+numQuad, m_dx[1]);
822                  }                  }
823              }              }
824    
825              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
826  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
827                  for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                  for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
828                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+k0);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+k0);
829                      fill(o, o+numQuad, hSize);                      fill(o, o+numQuad, m_dx[0]);
830                  }                  }
831              }              }
832    
833              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
834  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
835                  for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE0; ++k0) {                  for (index_t k0 = 0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
836                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+k0);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+k0);
837                      fill(o, o+numQuad, hSize);                      fill(o, o+numQuad, m_dx[0]);
838                  }                  }
839              }              }
840          } // end of parallel section          } // end of parallel section
# Line 489  void Rectangle::setToSize(escript::Data& Line 847  void Rectangle::setToSize(escript::Data&
847      }      }
848  }  }
849    
 Paso_SystemMatrixPattern* Rectangle::getPattern(bool reducedRowOrder,  
                                                 bool reducedColOrder) const  
 {  
     /* FIXME: reduced  
     if (reducedRowOrder || reducedColOrder)  
         throw RipleyException("getPattern() not implemented for reduced order");  
     */  
     return m_pattern;  
 }  
   
850  void Rectangle::Print_Mesh_Info(const bool full) const  void Rectangle::Print_Mesh_Info(const bool full) const
851  {  {
852      RipleyDomain::Print_Mesh_Info(full);      RipleyDomain::Print_Mesh_Info(full);
# Line 506  void Rectangle::Print_Mesh_Info(const bo Line 854  void Rectangle::Print_Mesh_Info(const bo
854          cout << "     Id  Coordinates" << endl;          cout << "     Id  Coordinates" << endl;
855          cout.precision(15);          cout.precision(15);
856          cout.setf(ios::scientific, ios::floatfield);          cout.setf(ios::scientific, ios::floatfield);
         pair<double,double> xdx = getFirstCoordAndSpacing(0);  
         pair<double,double> ydy = getFirstCoordAndSpacing(1);  
857          for (index_t i=0; i < getNumNodes(); i++) {          for (index_t i=0; i < getNumNodes(); i++) {
858              cout << "  " << setw(5) << m_nodeId[i]              cout << "  " << setw(5) << m_nodeId[i]
859                  << "  " << xdx.first+(i%m_N0)*xdx.second                  << "  " << getLocalCoordinate(i%m_NN[0], 0)
860                  << "  " << ydy.first+(i/m_N0)*ydy.second << endl;                  << "  " << getLocalCoordinate(i/m_NN[0], 1) << endl;
861          }          }
862      }      }
863  }  }
864    
 IndexVector Rectangle::getNumNodesPerDim() const  
 {  
     IndexVector ret;  
     ret.push_back(m_N0);  
     ret.push_back(m_N1);  
     return ret;  
 }  
   
 IndexVector Rectangle::getNumElementsPerDim() const  
 {  
     IndexVector ret;  
     ret.push_back(m_NE0);  
     ret.push_back(m_NE1);  
     return ret;  
 }  
   
 IndexVector Rectangle::getNumFacesPerBoundary() const  
 {  
     IndexVector ret(4, 0);  
     //left  
     if (m_offset0==0)  
         ret[0]=m_NE1;  
     //right  
     if (m_mpiInfo->rank%m_NX==m_NX-1)  
         ret[1]=m_NE1;  
     //bottom  
     if (m_offset1==0)  
         ret[2]=m_NE0;  
     //top  
     if (m_mpiInfo->rank/m_NX==m_NY-1)  
         ret[3]=m_NE0;  
     return ret;  
 }  
   
 IndexVector Rectangle::getNumSubdivisionsPerDim() const  
 {  
     IndexVector ret;  
     ret.push_back(m_NX);  
     ret.push_back(m_NY);  
     return ret;  
 }  
   
 pair<double,double> Rectangle::getFirstCoordAndSpacing(dim_t dim) const  
 {  
     if (dim==0) {  
         return pair<double,double>(m_x0+(m_l0*m_offset0)/m_gNE0, m_l0/m_gNE0);  
     } else if (dim==1) {  
         return pair<double,double>(m_y0+(m_l1*m_offset1)/m_gNE1, m_l1/m_gNE1);  
     }  
     throw RipleyException("getFirstCoordAndSpacing: invalid argument");  
 }  
   
 //protected  
 dim_t Rectangle::getNumDOF() const  
 {  
     return (m_gNE0+1)/m_NX*(m_gNE1+1)/m_NY;  
 }  
   
 //protected  
 dim_t Rectangle::getNumFaceElements() const  
 {  
     const IndexVector faces = getNumFacesPerBoundary();  
     dim_t n=0;  
     for (size_t i=0; i<faces.size(); i++)  
         n+=faces[i];  
     return n;  
 }  
865    
866  //protected  //protected
867  void Rectangle::assembleCoordinates(escript::Data& arg) const  void Rectangle::assembleCoordinates(escript::Data& arg) const
# Line 594  void Rectangle::assembleCoordinates(escr Line 873  void Rectangle::assembleCoordinates(escr
873      if (!numSamplesEqual(&x, 1, getNumNodes()))      if (!numSamplesEqual(&x, 1, getNumNodes()))
874          throw RipleyException("setToX: Illegal number of samples in Data object");          throw RipleyException("setToX: Illegal number of samples in Data object");
875    
     pair<double,double> xdx = getFirstCoordAndSpacing(0);  
     pair<double,double> ydy = getFirstCoordAndSpacing(1);  
876      arg.requireWrite();      arg.requireWrite();
877  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel for
878      for (dim_t i1 = 0; i1 < m_N1; i1++) {      for (dim_t i1 = 0; i1 < m_NN[1]; i1++) {
879          for (dim_t i0 = 0; i0 < m_N0; i0++) {          for (dim_t i0 = 0; i0 < m_NN[0]; i0++) {
880              double* point = arg.getSampleDataRW(i0+m_N0*i1);              double* point = arg.getSampleDataRW(i0+m_NN[0]*i1);
881              point[0] = xdx.first+i0*xdx.second;              point[0] = getLocalCoordinate(i0, 0);
882              point[1] = ydy.first+i1*ydy.second;              point[1] = getLocalCoordinate(i1, 1);
883          }          }
884      }      }
885  }  }
# Line 611  void Rectangle::assembleCoordinates(escr Line 888  void Rectangle::assembleCoordinates(escr
888  void Rectangle::assembleGradient(escript::Data& out, escript::Data& in) const  void Rectangle::assembleGradient(escript::Data& out, escript::Data& in) const
889  {  {
890      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();
891      const double h0 = m_l0/m_gNE0;      const double cx0 = .21132486540518711775/m_dx[0];
892      const double h1 = m_l1/m_gNE1;      const double cx1 = .78867513459481288225/m_dx[0];
893      const double cx0 = -1./h0;      const double cx2 = 1./m_dx[0];
894      const double cx1 = -.78867513459481288225/h0;      const double cy0 = .21132486540518711775/m_dx[1];
895      const double cx2 = -.5/h0;      const double cy1 = .78867513459481288225/m_dx[1];
896      const double cx3 = -.21132486540518711775/h0;      const double cy2 = 1./m_dx[1];
     const double cx4 = .21132486540518711775/h0;  
     const double cx5 = .5/h0;  
     const double cx6 = .78867513459481288225/h0;  
     const double cx7 = 1./h0;  
     const double cy0 = -1./h1;  
     const double cy1 = -.78867513459481288225/h1;  
     const double cy2 = -.5/h1;  
     const double cy3 = -.21132486540518711775/h1;  
     const double cy4 = .21132486540518711775/h1;  
     const double cy5 = .5/h1;  
     const double cy6 = .78867513459481288225/h1;  
     const double cy7 = 1./h1;  
897    
898      if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements) {      if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements) {
899          out.requireWrite();          out.requireWrite();
900  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel
901          for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {          {
902              for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {              vector<double> f_00(numComp);
903                  const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1, m_N0));              vector<double> f_01(numComp);
904                  const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1+1, m_N0));              vector<double> f_10(numComp);
905                  const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1+1, m_N0));              vector<double> f_11(numComp);
906                  const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1, m_N0));  #pragma omp for
907                  double* o = out.getSampleDataRW(INDEX2(k0,k1,m_NE0));              for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
908                  for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
909                      o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = f_00[i]*cx1 + f_01[i]*cx3 + f_10[i]*cx6 + f_11[i]*cx4;                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
910                      o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = f_00[i]*cy1 + f_01[i]*cy6 + f_10[i]*cy3 + f_11[i]*cy4;                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
911                      o[INDEX3(i,0,1,numComp,2)] = f_00[i]*cx1 + f_01[i]*cx3 + f_10[i]*cx6 + f_11[i]*cx4;                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
912                      o[INDEX3(i,1,1,numComp,2)] = f_00[i]*cy3 + f_01[i]*cy4 + f_10[i]*cy1 + f_11[i]*cy6;                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
913                      o[INDEX3(i,0,2,numComp,2)] = f_00[i]*cx3 + f_01[i]*cx1 + f_10[i]*cx4 + f_11[i]*cx6;                      double* o = out.getSampleDataRW(INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
914                      o[INDEX3(i,1,2,numComp,2)] = f_00[i]*cy1 + f_01[i]*cy6 + f_10[i]*cy3 + f_11[i]*cy4;                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
915                      o[INDEX3(i,0,3,numComp,2)] = f_00[i]*cx3 + f_01[i]*cx1 + f_10[i]*cx4 + f_11[i]*cx6;                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = (f_10[i]-f_00[i])*cx1 + (f_11[i]-f_01[i])*cx0;
916                      o[INDEX3(i,1,3,numComp,2)] = f_00[i]*cy3 + f_01[i]*cy4 + f_10[i]*cy1 + f_11[i]*cy6;                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = (f_01[i]-f_00[i])*cy1 + (f_11[i]-f_10[i])*cy0;
917                  } /* end of component loop i */                          o[INDEX3(i,0,1,numComp,2)] = (f_10[i]-f_00[i])*cx1 + (f_11[i]-f_01[i])*cx0;
918              } /* end of k0 loop */                          o[INDEX3(i,1,1,numComp,2)] = (f_01[i]-f_00[i])*cy0 + (f_11[i]-f_10[i])*cy1;
919          } /* end of k1 loop */                          o[INDEX3(i,0,2,numComp,2)] = (f_10[i]-f_00[i])*cx0 + (f_11[i]-f_01[i])*cx1;
920                            o[INDEX3(i,1,2,numComp,2)] = (f_01[i]-f_00[i])*cy1 + (f_11[i]-f_10[i])*cy0;
921                            o[INDEX3(i,0,3,numComp,2)] = (f_10[i]-f_00[i])*cx0 + (f_11[i]-f_01[i])*cx1;
922                            o[INDEX3(i,1,3,numComp,2)] = (f_01[i]-f_00[i])*cy0 + (f_11[i]-f_10[i])*cy1;
923                        } // end of component loop i
924                    } // end of k0 loop
925                } // end of k1 loop
926            } // end of parallel section
927      } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {      } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {
928          out.requireWrite();          out.requireWrite();
929  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel
930          for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {          {
931              for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {              vector<double> f_00(numComp);
932                  const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1, m_N0));              vector<double> f_01(numComp);
933                  const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1+1, m_N0));              vector<double> f_10(numComp);
934                  const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1+1, m_N0));              vector<double> f_11(numComp);
935                  const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1, m_N0));  #pragma omp for
936                  double* o = out.getSampleDataRW(INDEX2(k0,k1,m_NE0));              for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
937                  for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
938                      o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = cx5*(f_10[i] + f_11[i]) + cx2*(f_00[i] + f_01[i]);                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
939                      o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = cy2*(f_00[i] + f_10[i]) + cy5*(f_01[i] + f_11[i]);                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
940                  } /* end of component loop i */                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
941              } /* end of k0 loop */                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
942          } /* end of k1 loop */                      double* o = out.getSampleDataRW(INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
943                        for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
944                            o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = (f_10[i] + f_11[i] - f_00[i] - f_01[i])*cx2/2;
945                            o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = (f_01[i] + f_11[i] - f_00[i] - f_10[i])*cy2/2;
946                        } // end of component loop i
947                    } // end of k0 loop
948                } // end of k1 loop
949            } // end of parallel section
950      } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == FaceElements) {      } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == FaceElements) {
951          out.requireWrite();          out.requireWrite();
952  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
953          {          {
954                vector<double> f_00(numComp);
955                vector<double> f_01(numComp);
956                vector<double> f_10(numComp);
957                vector<double> f_11(numComp);
958              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
959  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
960                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
961                      const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(1,k1, m_N0));                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
962                      const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(1,k1+1, m_N0));                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
963                      const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1+1, m_N0));                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(1,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
964                      const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1, m_N0));                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(1,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
965                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+k1);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+k1);
966                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
967                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = f_00[i]*cx1 + f_01[i]*cx3 + f_10[i]*cx6 + f_11[i]*cx4;                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = (f_10[i]-f_00[i])*cx1 + (f_11[i]-f_01[i])*cx0;
968                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = f_00[i]*cy0 + f_01[i]*cy7;                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = (f_01[i]-f_00[i])*cy2;
969                          o[INDEX3(i,0,1,numComp,2)] = f_00[i]*cx3 + f_01[i]*cx1 + f_10[i]*cx4 + f_11[i]*cx6;                          o[INDEX3(i,0,1,numComp,2)] = (f_10[i]-f_00[i])*cx0 + (f_11[i]-f_01[i])*cx1;
970                          o[INDEX3(i,1,1,numComp,2)] = f_00[i]*cy0 + f_01[i]*cy7;                          o[INDEX3(i,1,1,numComp,2)] = (f_01[i]-f_00[i])*cy2;
971                      } /* end of component loop i */                      } // end of component loop i
972                  } /* end of k1 loop */                  } // end of k1 loop
973              } /* end of face 0 */              } // end of face 0
974              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
975  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
976                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
977                      const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(m_N0-1,k1, m_N0));                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(m_NN[0]-2,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
978                      const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(m_N0-1,k1+1, m_N0));                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(m_NN[0]-2,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
979                      const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(m_N0-2,k1+1, m_N0));                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(m_NN[0]-1,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
980                      const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(m_N0-2,k1, m_N0));                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(m_NN[0]-1,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
981                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+k1);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+k1);
982                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
983                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = f_00[i]*cx1 + f_01[i]*cx3 + f_10[i]*cx6 + f_11[i]*cx4;                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = (f_10[i]-f_00[i])*cx1 + (f_11[i]-f_01[i])*cx0;
984                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = f_10[i]*cy0 + f_11[i]*cy7;                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = (f_11[i]-f_10[i])*cy2;
985                          o[INDEX3(i,0,1,numComp,2)] = f_00[i]*cx3 + f_01[i]*cx1 + f_10[i]*cx4 + f_11[i]*cx6;                          o[INDEX3(i,0,1,numComp,2)] = (f_10[i]-f_00[i])*cx0 + (f_11[i]-f_01[i])*cx1;
986                          o[INDEX3(i,1,1,numComp,2)] = f_10[i]*cy0 + f_11[i]*cy7;                          o[INDEX3(i,1,1,numComp,2)] = (f_11[i]-f_10[i])*cy2;
987                      } /* end of component loop i */                      } // end of component loop i
988                  } /* end of k1 loop */                  } // end of k1 loop
989              } /* end of face 1 */              } // end of face 1
990              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
991  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
992                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
993                      const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,0, m_N0));                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,0, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
994                      const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,0, m_N0));                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
995                      const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,1, m_N0));                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,0, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
996                      const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,1, m_N0));                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
997                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+k0);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+k0);
998                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
999                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = f_00[i]*cx0 + f_10[i]*cx7;                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = (f_10[i]-f_00[i])*cx2;
1000                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = f_00[i]*cy1 + f_01[i]*cy6 + f_10[i]*cy3 + f_11[i]*cy4;                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = (f_01[i]-f_00[i])*cy1 + (f_11[i]-f_10[i])*cy0;
1001                          o[INDEX3(i,0,1,numComp,2)] = f_00[i]*cx0 + f_10[i]*cx7;                          o[INDEX3(i,0,1,numComp,2)] = (f_10[i]-f_00[i])*cx2;
1002                          o[INDEX3(i,1,1,numComp,2)] = f_00[i]*cy3 + f_01[i]*cy4 + f_10[i]*cy1 + f_11[i]*cy6;                          o[INDEX3(i,1,1,numComp,2)] = (f_01[i]-f_00[i])*cy0 + (f_11[i]-f_10[i])*cy1;
1003                      } /* end of component loop i */                      } // end of component loop i
1004                  } /* end of k0 loop */                  } // end of k0 loop
1005              } /* end of face 2 */              } // end of face 2
1006              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
1007  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1008                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1009                      const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,m_N1-1, m_N0));                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,m_NN[1]-2, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1010                      const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,m_N1-1, m_N0));                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,m_NN[1]-1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1011                      const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,m_N1-2, m_N0));                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,m_NN[1]-2, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1012                      const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,m_N1-2, m_N0));                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,m_NN[1]-1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1013                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+k0);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+k0);
1014                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1015                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = f_01[i]*cx0 + f_11[i]*cx7;                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = (f_11[i]-f_01[i])*cx2;
1016                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = f_00[i]*cy1 + f_01[i]*cy6 + f_10[i]*cy3 + f_11[i]*cy4;                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = (f_01[i]-f_00[i])*cy1 + (f_11[i]-f_10[i])*cy0;
1017                          o[INDEX3(i,0,1,numComp,2)] = f_01[i]*cx0 + f_11[i]*cx7;                          o[INDEX3(i,0,1,numComp,2)] = (f_11[i]-f_01[i])*cx2;
1018                          o[INDEX3(i,1,1,numComp,2)] = f_00[i]*cy3 + f_01[i]*cy4 + f_10[i]*cy1 + f_11[i]*cy6;                          o[INDEX3(i,1,1,numComp,2)] = (f_01[i]-f_00[i])*cy0 + (f_11[i]-f_10[i])*cy1;
1019                      } /* end of component loop i */                      } // end of component loop i
1020                  } /* end of k0 loop */                  } // end of k0 loop
1021              } /* end of face 3 */              } // end of face 3
1022          } // end of parallel section          } // end of parallel section
1023    
1024      } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedFaceElements) {      } else if (out.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedFaceElements) {
1025          out.requireWrite();          out.requireWrite();
1026  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1027          {          {
1028                vector<double> f_00(numComp);
1029                vector<double> f_01(numComp);
1030                vector<double> f_10(numComp);
1031                vector<double> f_11(numComp);
1032              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
1033  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1034                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1035                      const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(1,k1, m_N0));                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1036                      const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(1,k1+1, m_N0));                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1037                      const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1+1, m_N0));                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(1,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1038                      const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1, m_N0));                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(1,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1039                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+k1);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+k1);
1040                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1041                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = cx5*(f_10[i] + f_11[i]) + cx2*(f_00[i] + f_01[i]);                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = (f_10[i] + f_11[i] - f_00[i] - f_01[i])*cx2/2;
1042                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = f_00[i]*cy0 + f_01[i]*cy7;                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = (f_01[i]-f_00[i])*cy2;
1043                      } /* end of component loop i */                      } // end of component loop i
1044                  } /* end of k1 loop */                  } // end of k1 loop
1045              } /* end of face 0 */              } // end of face 0
1046              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
1047  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1048                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1049                      const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(m_N0-1,k1, m_N0));                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(m_NN[0]-2,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1050                      const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(m_N0-1,k1+1, m_N0));                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(m_NN[0]-2,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1051                      const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(m_N0-2,k1+1, m_N0));                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(m_NN[0]-1,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1052                      const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(m_N0-2,k1, m_N0));                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(m_NN[0]-1,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1053                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+k1);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+k1);
1054                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1055                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = cx5*(f_10[i] + f_11[i]) + cx2*(f_00[i] + f_01[i]);                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = (f_10[i] + f_11[i] - f_00[i] - f_01[i])*cx2/2;
1056                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = f_10[i]*cy0 + f_11[i]*cy7;                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = (f_11[i]-f_10[i])*cy2;
1057                      } /* end of component loop i */                      } // end of component loop i
1058                  } /* end of k1 loop */                  } // end of k1 loop
1059              } /* end of face 1 */              } // end of face 1
1060              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
1061  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1062                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1063                      const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,0, m_N0));                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,0, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1064                      const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,0, m_N0));                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1065                      const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,1, m_N0));                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,0, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1066                      const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,1, m_N0));                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1067                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+k0);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+k0);
1068                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1069                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = f_00[i]*cx0 + f_10[i]*cx7;                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = (f_10[i]-f_00[i])*cx2;
1070                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = cy2*(f_00[i] + f_10[i]) + cy5*(f_01[i] + f_11[i]);                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = (f_01[i] + f_11[i] - f_00[i] - f_10[i])*cy2/2;
1071                      } /* end of component loop i */                      } // end of component loop i
1072                  } /* end of k0 loop */                  } // end of k0 loop
1073              } /* end of face 2 */              } // end of face 2
1074              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
1075  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1076                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1077                      const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,m_N1-1, m_N0));                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,m_NN[1]-2, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1078                      const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,m_N1-1, m_N0));                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,m_NN[1]-1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1079                      const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,m_N1-2, m_N0));                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,m_NN[1]-2, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1080                      const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,m_N1-2, m_N0));                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,m_NN[1]-1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1081                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+k0);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+k0);
1082                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1083                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = f_01[i]*cx0 + f_11[i]*cx7;                          o[INDEX3(i,0,0,numComp,2)] = (f_11[i]-f_01[i])*cx2;
1084                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = cy5*(f_01[i] + f_11[i]) + cy2*(f_00[i] + f_10[i]);                          o[INDEX3(i,1,0,numComp,2)] = (f_01[i] + f_11[i] - f_00[i] - f_10[i])*cy2/2;
1085                      } /* end of component loop i */                      } // end of component loop i
1086                  } /* end of k0 loop */                  } // end of k0 loop
1087              } /* end of face 3 */              } // end of face 3
1088          } // end of parallel section          } // end of parallel section
1089      }      }
1090  }  }
# Line 805  void Rectangle::assembleGradient(escript Line 1093  void Rectangle::assembleGradient(escript
1093  void Rectangle::assembleIntegrate(vector<double>& integrals, escript::Data& arg) const  void Rectangle::assembleIntegrate(vector<double>& integrals, escript::Data& arg) const
1094  {  {
1095      const dim_t numComp = arg.getDataPointSize();      const dim_t numComp = arg.getDataPointSize();
1096      const double h0 = m_l0/m_gNE0;      const index_t left = (m_offset[0]==0 ? 0 : 1);
1097      const double h1 = m_l1/m_gNE1;      const index_t bottom = (m_offset[1]==0 ? 0 : 1);
1098      const index_t left = (m_offset0==0 ? 0 : 1);      const int fs=arg.getFunctionSpace().getTypeCode();
1099      const index_t bottom = (m_offset1==0 ? 0 : 1);      if (fs == Elements && arg.actsExpanded()) {
     if (arg.getFunctionSpace().getTypeCode() == Elements) {  
         const double w = h0*h1/4.;  
1100  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1101          {          {
1102              vector<double> int_local(numComp, 0);              vector<double> int_local(numComp, 0);
1103                const double w = m_dx[0]*m_dx[1]/4.;
1104  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1105              for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {              for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1106                  for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                  for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1107                      const double* f = arg.getSampleDataRO(INDEX2(k0, k1, m_NE0));                      const double* f = arg.getSampleDataRO(INDEX2(k0, k1, m_NE[0]));
1108                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1109                          const double f0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                          const double f0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1110                          const double f1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                          const double f1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1111                          const double f2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];                          const double f2 = f[INDEX2(i,2,numComp)];
1112                          const double f3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];                          const double f3 = f[INDEX2(i,3,numComp)];
1113                          int_local[i]+=(f0+f1+f2+f3)*w;                          int_local[i]+=(f0+f1+f2+f3)*w;
1114                      }  /* end of component loop i */                      }  // end of component loop i
1115                  } /* end of k0 loop */                  } // end of k0 loop
1116              } /* end of k1 loop */              } // end of k1 loop
   
1117  #pragma omp critical  #pragma omp critical
1118              for (index_t i=0; i<numComp; i++)              for (index_t i=0; i<numComp; i++)
1119                  integrals[i]+=int_local[i];                  integrals[i]+=int_local[i];
1120          } // end of parallel section          } // end of parallel section
1121      } else if (arg.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedElements) {  
1122          const double w = h0*h1;      } else if (fs==ReducedElements || (fs==Elements && !arg.actsExpanded())) {
1123            const double w = m_dx[0]*m_dx[1];
1124  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1125          {          {
1126              vector<double> int_local(numComp, 0);              vector<double> int_local(numComp, 0);
1127  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1128              for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {              for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1129                  for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                  for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1130                      const double* f = arg.getSampleDataRO(INDEX2(k0, k1, m_NE0));                      const double* f = arg.getSampleDataRO(INDEX2(k0, k1, m_NE[0]));
1131                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1132                          int_local[i]+=f[i]*w;                          int_local[i]+=f[i]*w;
1133                      }  /* end of component loop i */                      }
1134                  } /* end of k0 loop */                  }
1135              } /* end of k1 loop */              }
   
1136  #pragma omp critical  #pragma omp critical
1137              for (index_t i=0; i<numComp; i++)              for (index_t i=0; i<numComp; i++)
1138                  integrals[i]+=int_local[i];                  integrals[i]+=int_local[i];
1139          } // end of parallel section          } // end of parallel section
1140      } else if (arg.getFunctionSpace().getTypeCode() == FaceElements) {  
1141          const double w0 = h0/2.;      } else if (fs == FaceElements && arg.actsExpanded()) {
         const double w1 = h1/2.;  
1142  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1143          {          {
1144              vector<double> int_local(numComp, 0);              vector<double> int_local(numComp, 0);
1145                const double w0 = m_dx[0]/2.;
1146                const double w1 = m_dx[1]/2.;
1147              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
1148  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1149                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1150                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[0]+k1);                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[0]+k1);
1151                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1152                          const double f0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                          const double f0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1153                          const double f1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                          const double f1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1154                          int_local[i]+=(f0+f1)*w1;                          int_local[i]+=(f0+f1)*w1;
1155                      }  /* end of component loop i */                      }  // end of component loop i
1156                  } /* end of k1 loop */                  } // end of k1 loop
1157              }              }
1158    
1159              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
1160  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1161                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1162                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[1]+k1);                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[1]+k1);
1163                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1164                          const double f0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                          const double f0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1165                          const double f1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                          const double f1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1166                          int_local[i]+=(f0+f1)*w1;                          int_local[i]+=(f0+f1)*w1;
1167                      }  /* end of component loop i */                      }  // end of component loop i
1168                  } /* end of k1 loop */                  } // end of k1 loop
1169              }              }
1170    
1171              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
1172  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1173                  for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                  for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1174                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[2]+k0);                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[2]+k0);
1175                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1176                          const double f0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                          const double f0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1177                          const double f1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                          const double f1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1178                          int_local[i]+=(f0+f1)*w0;                          int_local[i]+=(f0+f1)*w0;
1179                      }  /* end of component loop i */                      }  // end of component loop i
1180                  } /* end of k0 loop */                  } // end of k0 loop
1181              }              }
1182    
1183              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
1184  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1185                  for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                  for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1186                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[3]+k0);                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[3]+k0);
1187                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1188                          const double f0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];                          const double f0 = f[INDEX2(i,0,numComp)];
1189                          const double f1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];                          const double f1 = f[INDEX2(i,1,numComp)];
1190                          int_local[i]+=(f0+f1)*w0;                          int_local[i]+=(f0+f1)*w0;
1191                      }  /* end of component loop i */                      }  // end of component loop i
1192                  } /* end of k0 loop */                  } // end of k0 loop
1193              }              }
   
1194  #pragma omp critical  #pragma omp critical
1195              for (index_t i=0; i<numComp; i++)              for (index_t i=0; i<numComp; i++)
1196                  integrals[i]+=int_local[i];                  integrals[i]+=int_local[i];
1197          } // end of parallel section          } // end of parallel section
1198      } else if (arg.getFunctionSpace().getTypeCode() == ReducedFaceElements) {  
1199        } else if (fs==ReducedFaceElements || (fs==FaceElements && !arg.actsExpanded())) {
1200  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1201          {          {
1202              vector<double> int_local(numComp, 0);              vector<double> int_local(numComp, 0);
1203              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
1204  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1205                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1206                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[0]+k1);                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[0]+k1);
1207                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1208                          int_local[i]+=f[i]*h1;                          int_local[i]+=f[i]*m_dx[1];
1209                      }  /* end of component loop i */                      }
1210                  } /* end of k1 loop */                  }
1211              }              }
1212    
1213              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
1214  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1215                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE1; ++k1) {                  for (index_t k1 = bottom; k1 < bottom+m_ownNE[1]; ++k1) {
1216                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[1]+k1);                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[1]+k1);
1217                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1218                          int_local[i]+=f[i]*h1;                          int_local[i]+=f[i]*m_dx[1];
1219                      }  /* end of component loop i */                      }
1220                  } /* end of k1 loop */                  }
1221              }              }
1222    
1223              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
1224  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1225                  for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                  for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1226                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[2]+k0);                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[2]+k0);
1227                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1228                          int_local[i]+=f[i]*h0;                          int_local[i]+=f[i]*m_dx[0];
1229                      }  /* end of component loop i */                      }
1230                  } /* end of k0 loop */                  }
1231              }              }
1232    
1233              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
1234  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1235                  for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE0; ++k0) {                  for (index_t k0 = left; k0 < left+m_ownNE[0]; ++k0) {
1236                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[3]+k0);                      const double* f = arg.getSampleDataRO(m_faceOffset[3]+k0);
1237                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1238                          int_local[i]+=f[i]*h0;                          int_local[i]+=f[i]*m_dx[0];
1239                      }  /* end of component loop i */                      }
1240                  } /* end of k0 loop */                  }
1241              }              }
1242    
1243  #pragma omp critical  #pragma omp critical
1244              for (index_t i=0; i<numComp; i++)              for (index_t i=0; i<numComp; i++)
1245                  integrals[i]+=int_local[i];                  integrals[i]+=int_local[i];
1246          } // end of parallel section          } // end of parallel section
1247      }      } // function space selector
1248  }  }
1249    
1250  //protected  //protected
1251  dim_t Rectangle::insertNeighbourNodes(IndexVector& index, index_t node) const  dim_t Rectangle::insertNeighbourNodes(IndexVector& index, index_t node) const
1252  {  {
1253      const dim_t nDOF0 = (m_gNE0+1)/m_NX;      const dim_t nDOF0 = (m_gNE[0]+1)/m_NX[0];
1254      const dim_t nDOF1 = (m_gNE1+1)/m_NY;      const dim_t nDOF1 = (m_gNE[1]+1)/m_NX[1];
1255      const int x=node%nDOF0;      const int x=node%nDOF0;
1256      const int y=node/nDOF0;      const int y=node/nDOF0;
1257      dim_t num=0;      dim_t num=0;
# Line 994  void Rectangle::nodesToDOF(escript::Data Line 1281  void Rectangle::nodesToDOF(escript::Data
1281      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();
1282      out.requireWrite();      out.requireWrite();
1283    
1284      const index_t left = (m_offset0==0 ? 0 : 1);      const index_t left = (m_offset[0]==0 ? 0 : 1);
1285      const index_t bottom = (m_offset1==0 ? 0 : 1);      const index_t bottom = (m_offset[1]==0 ? 0 : 1);
1286      const dim_t nDOF0 = (m_gNE0+1)/m_NX;      const dim_t nDOF0 = (m_gNE[0]+1)/m_NX[0];
1287      const dim_t nDOF1 = (m_gNE1+1)/m_NY;      const dim_t nDOF1 = (m_gNE[1]+1)/m_NX[1];
1288  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel for
1289      for (index_t i=0; i<nDOF1; i++) {      for (index_t i=0; i<nDOF1; i++) {
1290          for (index_t j=0; j<nDOF0; j++) {          for (index_t j=0; j<nDOF0; j++) {
1291              const index_t n=j+left+(i+bottom)*m_N0;              const index_t n=j+left+(i+bottom)*m_NN[0];
1292              const double* src=in.getSampleDataRO(n);              const double* src=in.getSampleDataRO(n);
1293              copy(src, src+numComp, out.getSampleDataRW(j+i*nDOF0));              copy(src, src+numComp, out.getSampleDataRW(j+i*nDOF0));
1294          }          }
# Line 1027  void Rectangle::dofToNodes(escript::Data Line 1314  void Rectangle::dofToNodes(escript::Data
1314                  : &buffer[(m_dofMap[i]-numDOF)*numComp]);                  : &buffer[(m_dofMap[i]-numDOF)*numComp]);
1315          copy(src, src+numComp, out.getSampleDataRW(i));          copy(src, src+numComp, out.getSampleDataRW(i));
1316      }      }
1317        Paso_Coupler_free(coupler);
1318  }  }
1319    
1320  //private  //private
1321  void Rectangle::populateSampleIds()  void Rectangle::populateSampleIds()
1322  {  {
1323      // identifiers are ordered from left to right, bottom to top globablly.      // degrees of freedom are numbered from left to right, bottom to top in
1324        // each rank, continuing on the next rank (ranks also go left-right,
1325        // bottom-top).
1326        // This means rank 0 has id 0...n0-1, rank 1 has id n0...n1-1 etc. which
1327        // helps when writing out data rank after rank.
1328    
1329      // build node distribution vector first.      // build node distribution vector first.
1330      // rank i owns m_nodeDistribution[i+1]-nodeDistribution[i] nodes      // rank i owns m_nodeDistribution[i+1]-nodeDistribution[i] nodes which is
1331        // constant for all ranks in this implementation
1332      m_nodeDistribution.assign(m_mpiInfo->size+1, 0);      m_nodeDistribution.assign(m_mpiInfo->size+1, 0);
1333      const dim_t numDOF=getNumDOF();      const dim_t numDOF=getNumDOF();
1334      for (dim_t k=1; k<m_mpiInfo->size; k++) {      for (dim_t k=1; k<m_mpiInfo->size; k++) {
# Line 1045  void Rectangle::populateSampleIds() Line 1338  void Rectangle::populateSampleIds()
1338      m_nodeId.resize(getNumNodes());      m_nodeId.resize(getNumNodes());
1339      m_dofId.resize(numDOF);      m_dofId.resize(numDOF);
1340      m_elementId.resize(getNumElements());      m_elementId.resize(getNumElements());
1341    
1342        // populate face element counts
1343        //left
1344        if (m_offset[0]==0)
1345            m_faceCount[0]=m_NE[1];
1346        else
1347            m_faceCount[0]=0;
1348        //right
1349        if (m_mpiInfo->rank%m_NX[0]==m_NX[0]-1)
1350            m_faceCount[1]=m_NE[1];
1351        else
1352            m_faceCount[1]=0;
1353        //bottom
1354        if (m_offset[1]==0)
1355            m_faceCount[2]=m_NE[0];
1356        else
1357            m_faceCount[2]=0;
1358        //top
1359        if (m_mpiInfo->rank/m_NX[0]==m_NX[1]-1)
1360            m_faceCount[3]=m_NE[0];
1361        else
1362            m_faceCount[3]=0;
1363    
1364      m_faceId.resize(getNumFaceElements());      m_faceId.resize(getNumFaceElements());
1365    
1366        const index_t left = (m_offset[0]==0 ? 0 : 1);
1367        const index_t bottom = (m_offset[1]==0 ? 0 : 1);
1368        const dim_t nDOF0 = (m_gNE[0]+1)/m_NX[0];
1369        const dim_t nDOF1 = (m_gNE[1]+1)/m_NX[1];
1370    
1371    #define globalNodeId(x,y) \
1372        ((m_offset[0]+x)/nDOF0)*nDOF0*nDOF1+(m_offset[0]+x)%nDOF0 \
1373        + ((m_offset[1]+y)/nDOF1)*nDOF0*nDOF1*m_NX[0]+((m_offset[1]+y)%nDOF1)*nDOF0
1374    
1375        // set corner id's outside the parallel region
1376        m_nodeId[0] = globalNodeId(0, 0);
1377        m_nodeId[m_NN[0]-1] = globalNodeId(m_NN[0]-1, 0);
1378        m_nodeId[m_NN[0]*(m_NN[1]-1)] = globalNodeId(0, m_NN[1]-1);
1379        m_nodeId[m_NN[0]*m_NN[1]-1] = globalNodeId(m_NN[0]-1,m_NN[1]-1);
1380    #undef globalNodeId
1381    
1382  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1383      {      {
1384          // nodes          // populate degrees of freedom and own nodes (identical id)
1385  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1386          for (dim_t i1=0; i1<m_N1; i1++) {          for (dim_t i=0; i<nDOF1; i++) {
1387              for (dim_t i0=0; i0<m_N0; i0++) {              for (dim_t j=0; j<nDOF0; j++) {
1388                  m_nodeId[i0+i1*m_N0] = (m_offset1+i1)*(m_gNE0+1)+m_offset0+i0;                  const index_t nodeIdx=j+left+(i+bottom)*m_NN[0];
1389                    const index_t dofIdx=j+i*nDOF0;
1390                    m_dofId[dofIdx] = m_nodeId[nodeIdx]
1391                        = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank]+dofIdx;
1392              }              }
1393          }          }
1394    
1395          // degrees of freedom          // populate the rest of the nodes (shared with other ranks)
1396            if (m_faceCount[0]==0) { // left column
1397  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1398          for (dim_t k=0; k<numDOF; k++)              for (dim_t i=0; i<nDOF1; i++) {
1399              m_dofId[k] = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank]+k;                  const index_t nodeIdx=(i+bottom)*m_NN[0];
1400                    const index_t dofId=(i+1)*nDOF0-1;
1401                    m_nodeId[nodeIdx]
1402                        = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank-1]+dofId;
1403                }
1404            }
1405            if (m_faceCount[1]==0) { // right column
1406    #pragma omp for nowait
1407                for (dim_t i=0; i<nDOF1; i++) {
1408                    const index_t nodeIdx=(i+bottom+1)*m_NN[0]-1;
1409                    const index_t dofId=i*nDOF0;
1410                    m_nodeId[nodeIdx]
1411                        = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank+1]+dofId;
1412                }
1413            }
1414            if (m_faceCount[2]==0) { // bottom row
1415    #pragma omp for nowait
1416                for (dim_t i=0; i<nDOF0; i++) {
1417                    const index_t nodeIdx=i+left;
1418                    const index_t dofId=nDOF0*(nDOF1-1)+i;
1419                    m_nodeId[nodeIdx]
1420                        = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank-m_NX[0]]+dofId;
1421                }
1422            }
1423            if (m_faceCount[3]==0) { // top row
1424    #pragma omp for nowait
1425                for (dim_t i=0; i<nDOF0; i++) {
1426                    const index_t nodeIdx=m_NN[0]*(m_NN[1]-1)+i+left;
1427                    const index_t dofId=i;
1428                    m_nodeId[nodeIdx]
1429                        = m_nodeDistribution[m_mpiInfo->rank+m_NX[0]]+dofId;
1430                }
1431            }
1432    
1433          // elements          // populate element id's
1434  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1435          for (dim_t i1=0; i1<m_NE1; i1++) {          for (dim_t i1=0; i1<m_NE[1]; i1++) {
1436              for (dim_t i0=0; i0<m_NE0; i0++) {              for (dim_t i0=0; i0<m_NE[0]; i0++) {
1437                  m_elementId[i0+i1*m_NE0]=(m_offset1+i1)*m_gNE0+m_offset0+i0;                  m_elementId[i0+i1*m_NE[0]]=(m_offset[1]+i1)*m_gNE[0]+m_offset[0]+i0;
1438              }              }
1439          }          }
1440    
# Line 1083  void Rectangle::populateSampleIds() Line 1451  void Rectangle::populateSampleIds()
1451      updateTagsInUse(Elements);      updateTagsInUse(Elements);
1452    
1453      // generate face offset vector and set face tags      // generate face offset vector and set face tags
     const IndexVector facesPerEdge = getNumFacesPerBoundary();  
1454      const index_t LEFT=1, RIGHT=2, BOTTOM=10, TOP=20;      const index_t LEFT=1, RIGHT=2, BOTTOM=10, TOP=20;
1455      const index_t faceTag[] = { LEFT, RIGHT, BOTTOM, TOP };      const index_t faceTag[] = { LEFT, RIGHT, BOTTOM, TOP };
1456      m_faceOffset.assign(facesPerEdge.size(), -1);      m_faceOffset.assign(4, -1);
1457      m_faceTags.clear();      m_faceTags.clear();
1458      index_t offset=0;      index_t offset=0;
1459      for (size_t i=0; i<facesPerEdge.size(); i++) {      for (size_t i=0; i<4; i++) {
1460          if (facesPerEdge[i]>0) {          if (m_faceCount[i]>0) {
1461              m_faceOffset[i]=offset;              m_faceOffset[i]=offset;
1462              offset+=facesPerEdge[i];              offset+=m_faceCount[i];
1463              m_faceTags.insert(m_faceTags.end(), facesPerEdge[i], faceTag[i]);              m_faceTags.insert(m_faceTags.end(), m_faceCount[i], faceTag[i]);
1464          }          }
1465      }      }
1466      setTagMap("left", LEFT);      setTagMap("left", LEFT);
# Line 1106  void Rectangle::populateSampleIds() Line 1473  void Rectangle::populateSampleIds()
1473  //private  //private
1474  void Rectangle::createPattern()  void Rectangle::createPattern()
1475  {  {
1476      const dim_t nDOF0 = (m_gNE0+1)/m_NX;      const dim_t nDOF0 = (m_gNE[0]+1)/m_NX[0];
1477      const dim_t nDOF1 = (m_gNE1+1)/m_NY;      const dim_t nDOF1 = (m_gNE[1]+1)/m_NX[1];
1478      const index_t left = (m_offset0==0 ? 0 : 1);      const index_t left = (m_offset[0]==0 ? 0 : 1);
1479      const index_t bottom = (m_offset1==0 ? 0 : 1);      const index_t bottom = (m_offset[1]==0 ? 0 : 1);
1480    
1481      // populate node->DOF mapping with own degrees of freedom.      // populate node->DOF mapping with own degrees of freedom.
1482      // The rest is assigned in the loop further down      // The rest is assigned in the loop further down
# Line 1117  void Rectangle::createPattern() Line 1484  void Rectangle::createPattern()
1484  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel for
1485      for (index_t i=bottom; i<bottom+nDOF1; i++) {      for (index_t i=bottom; i<bottom+nDOF1; i++) {
1486          for (index_t j=left; j<left+nDOF0; j++) {          for (index_t j=left; j<left+nDOF0; j++) {
1487              m_dofMap[i*m_N0+j]=(i-bottom)*nDOF0+j-left;              m_dofMap[i*m_NN[0]+j]=(i-bottom)*nDOF0+j-left;
1488          }          }
1489      }      }
1490    
# Line 1130  void Rectangle::createPattern() Line 1497  void Rectangle::createPattern()
1497      IndexVector offsetInShared(1,0);      IndexVector offsetInShared(1,0);
1498      IndexVector sendShared, recvShared;      IndexVector sendShared, recvShared;
1499      int numShared=0;      int numShared=0;
1500      const int x=m_mpiInfo->rank%m_NX;      const int x=m_mpiInfo->rank%m_NX[0];
1501      const int y=m_mpiInfo->rank/m_NX;      const int y=m_mpiInfo->rank/m_NX[0];
1502      for (int i1=-1; i1<2; i1++) {      for (int i1=-1; i1<2; i1++) {
1503          for (int i0=-1; i0<2; i0++) {          for (int i0=-1; i0<2; i0++) {
1504              // skip this rank              // skip this rank
# Line 1140  void Rectangle::createPattern() Line 1507  void Rectangle::createPattern()
1507              // location of neighbour rank              // location of neighbour rank
1508              const int nx=x+i0;              const int nx=x+i0;
1509              const int ny=y+i1;              const int ny=y+i1;
1510              if (nx>=0 && ny>=0 && nx<m_NX && ny<m_NY) {              if (nx>=0 && ny>=0 && nx<m_NX[0] && ny<m_NX[1]) {
1511                  neighbour.push_back(ny*m_NX+nx);                  neighbour.push_back(ny*m_NX[0]+nx);
1512                  if (i0==0) {                  if (i0==0) {
1513                      // sharing top or bottom edge                      // sharing top or bottom edge
1514                      const int firstDOF=(i1==-1 ? 0 : numDOF-nDOF0);                      const int firstDOF=(i1==-1 ? 0 : numDOF-nDOF0);
1515                      const int firstNode=(i1==-1 ? left : m_N0*(m_N1-1)+left);                      const int firstNode=(i1==-1 ? left : m_NN[0]*(m_NN[1]-1)+left);
1516                      offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF0);                      offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF0);
1517                      for (dim_t i=0; i<nDOF0; i++, numShared++) {                      for (dim_t i=0; i<nDOF0; i++, numShared++) {
1518                          sendShared.push_back(firstDOF+i);                          sendShared.push_back(firstDOF+i);
# Line 1160  void Rectangle::createPattern() Line 1527  void Rectangle::createPattern()
1527                  } else if (i1==0) {                  } else if (i1==0) {
1528                      // sharing left or right edge                      // sharing left or right edge
1529                      const int firstDOF=(i0==-1 ? 0 : nDOF0-1);                      const int firstDOF=(i0==-1 ? 0 : nDOF0-1);
1530                      const int firstNode=(i0==-1 ? bottom*m_N0 : (bottom+1)*m_N0-1);                      const int firstNode=(i0==-1 ? bottom*m_NN[0] : (bottom+1)*m_NN[0]-1);
1531                      offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF1);                      offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+nDOF1);
1532                      for (dim_t i=0; i<nDOF1; i++, numShared++) {                      for (dim_t i=0; i<nDOF1; i++, numShared++) {
1533                          sendShared.push_back(firstDOF+i*nDOF0);                          sendShared.push_back(firstDOF+i*nDOF0);
# Line 1170  void Rectangle::createPattern() Line 1537  void Rectangle::createPattern()
1537                          colIndices[firstDOF+i*nDOF0].push_back(numShared);                          colIndices[firstDOF+i*nDOF0].push_back(numShared);
1538                          if (i<nDOF1-1)                          if (i<nDOF1-1)
1539                              colIndices[firstDOF+(i+1)*nDOF0].push_back(numShared);                              colIndices[firstDOF+(i+1)*nDOF0].push_back(numShared);
1540                          m_dofMap[firstNode+i*m_N0]=numDOF+numShared;                          m_dofMap[firstNode+i*m_NN[0]]=numDOF+numShared;
1541                      }                      }
1542                  } else {                  } else {
1543                      // sharing a node                      // sharing a node
1544                      const int dof=(i0+1)/2*(nDOF0-1)+(i1+1)/2*(numDOF-nDOF0);                      const int dof=(i0+1)/2*(nDOF0-1)+(i1+1)/2*(numDOF-nDOF0);
1545                      const int node=(i0+1)/2*(m_N0-1)+(i1+1)/2*m_N0*(m_N1-1);                      const int node=(i0+1)/2*(m_NN[0]-1)+(i1+1)/2*m_NN[0]*(m_NN[1]-1);
1546                      offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+1);                      offsetInShared.push_back(offsetInShared.back()+1);
1547                      sendShared.push_back(dof);                      sendShared.push_back(dof);
1548                      recvShared.push_back(numDOF+numShared);                      recvShared.push_back(numDOF+numShared);
# Line 1285  void Rectangle::addToMatrixAndRHS(Paso_S Line 1652  void Rectangle::addToMatrixAndRHS(Paso_S
1652      IndexVector rowIndex;      IndexVector rowIndex;
1653      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode]);      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode]);
1654      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+1]);      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+1]);
1655      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_N0]);      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_NN[0]]);
1656      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_N0+1]);      rowIndex.push_back(m_dofMap[firstNode+m_NN[0]+1]);
1657      if (addF) {      if (addF) {
1658          double *F_p=F.getSampleDataRW(0);          double *F_p=F.getSampleDataRW(0);
1659          for (index_t i=0; i<rowIndex.size(); i++) {          for (index_t i=0; i<rowIndex.size(); i++) {
# Line 1309  void Rectangle::interpolateNodesOnElemen Line 1676  void Rectangle::interpolateNodesOnElemen
1676      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();
1677      if (reduced) {      if (reduced) {
1678          out.requireWrite();          out.requireWrite();
1679          const double c0 = .25;          const double c0 = 0.25;
1680  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel
1681          for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {          {
1682              for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {              vector<double> f_00(numComp);
1683                  const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1+1, m_N0));              vector<double> f_01(numComp);
1684                  const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1, m_N0));              vector<double> f_10(numComp);
1685                  const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1, m_N0));              vector<double> f_11(numComp);
1686                  const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1+1, m_N0));  #pragma omp for
1687                  double* o = out.getSampleDataRW(INDEX2(k0,k1,m_NE0));              for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1688                  for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1689                      o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_00[i] + f_01[i] + f_10[i] + f_11[i]);                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1690                  } /* end of component loop i */                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1691              } /* end of k0 loop */                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1692          } /* end of k1 loop */                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1693                        double* o = out.getSampleDataRW(INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1694                        for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1695                            o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_00[i] + f_01[i] + f_10[i] + f_11[i]);
1696                        } /* end of component loop i */
1697                    } /* end of k0 loop */
1698                } /* end of k1 loop */
1699            } /* end of parallel section */
1700      } else {      } else {
1701          out.requireWrite();          out.requireWrite();
1702          const double c0 = .16666666666666666667;          const double c0 = 0.16666666666666666667;
1703          const double c1 = .044658198738520451079;          const double c1 = 0.044658198738520451079;
1704          const double c2 = .62200846792814621559;          const double c2 = 0.62200846792814621559;
1705  #pragma omp parallel for  #pragma omp parallel
1706          for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {          {
1707              for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {              vector<double> f_00(numComp);
1708                  const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1, m_N0));              vector<double> f_01(numComp);
1709                  const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1+1, m_N0));              vector<double> f_10(numComp);
1710                  const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1+1, m_N0));              vector<double> f_11(numComp);
1711                  const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1, m_N0));  #pragma omp for
1712                  double* o = out.getSampleDataRW(INDEX2(k0,k1,m_NE0));              for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1713                  for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1714                      o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_00[i]*c2 + f_11[i]*c1 + c0*(f_01[i] + f_10[i]);                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1715                      o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_01[i]*c1 + f_10[i]*c2 + c0*(f_00[i] + f_11[i]);                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1716                      o[INDEX2(i,numComp,2)] = f_01[i]*c2 + f_10[i]*c1 + c0*(f_00[i] + f_11[i]);                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1717                      o[INDEX2(i,numComp,3)] = f_00[i]*c1 + f_11[i]*c2 + c0*(f_01[i] + f_10[i]);                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1718                  } /* end of component loop i */                      double* o = out.getSampleDataRW(INDEX2(k0,k1,m_NE[0]));
1719              } /* end of k0 loop */                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1720          } /* end of k1 loop */                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_01[i] + f_10[i]) + c1*f_11[i] + c2*f_00[i];
1721                            o[INDEX2(i,numComp,1)] = c0*(f_00[i] + f_11[i]) + c1*f_01[i] + c2*f_10[i];
1722                            o[INDEX2(i,numComp,2)] = c0*(f_00[i] + f_11[i]) + c1*f_10[i] + c2*f_01[i];
1723                            o[INDEX2(i,numComp,3)] = c0*(f_01[i] + f_10[i]) + c1*f_00[i] + c2*f_11[i];
1724                        } /* end of component loop i */
1725                    } /* end of k0 loop */
1726                } /* end of k1 loop */
1727            } /* end of parallel section */
1728      }      }
1729  }  }
1730    
# Line 1354  void Rectangle::interpolateNodesOnFaces( Line 1735  void Rectangle::interpolateNodesOnFaces(
1735      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();      const dim_t numComp = in.getDataPointSize();
1736      if (reduced) {      if (reduced) {
1737          out.requireWrite();          out.requireWrite();
         const double c0 = .5;  
1738  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1739          {          {
1740                vector<double> f_00(numComp);
1741                vector<double> f_01(numComp);
1742                vector<double> f_10(numComp);
1743                vector<double> f_11(numComp);
1744              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
1745  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1746                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1747                      const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1, m_N0));                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1748                      const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1+1, m_N0));                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1749                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+k1);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+k1);
1750                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1751                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_00[i] + f_01[i]);                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_00[i] + f_01[i])/2;
1752                      } /* end of component loop i */                      } /* end of component loop i */
1753                  } /* end of k1 loop */                  } /* end of k1 loop */
1754              } /* end of face 0 */              } /* end of face 0 */
1755              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
1756  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1757                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1758                      const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(m_N0-1,k1, m_N0));                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(m_NN[0]-1,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1759                      const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(m_N0-1,k1+1, m_N0));                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(m_NN[0]-1,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1760                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+k1);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+k1);
1761                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1762                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_10[i] + f_11[i]);                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_10[i] + f_11[i])/2;
1763                      } /* end of component loop i */                      } /* end of component loop i */
1764                  } /* end of k1 loop */                  } /* end of k1 loop */
1765              } /* end of face 1 */              } /* end of face 1 */
1766              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
1767  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1768                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1769                      const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,0, m_N0));                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,0, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1770                      const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,0, m_N0));                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,0, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1771                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+k0);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+k0);
1772                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1773                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_00[i] + f_10[i]);                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_00[i] + f_10[i])/2;
1774                      } /* end of component loop i */                      } /* end of component loop i */
1775                  } /* end of k0 loop */                  } /* end of k0 loop */
1776              } /* end of face 2 */              } /* end of face 2 */
1777              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
1778  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1779                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1780                      const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,m_N1-1, m_N0));                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,m_NN[1]-1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1781                      const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,m_N1-1, m_N0));                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,m_NN[1]-1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1782                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+k0);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+k0);
1783                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1784                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*(f_01[i] + f_11[i]);                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = (f_01[i] + f_11[i])/2;
1785                      } /* end of component loop i */                      } /* end of component loop i */
1786                  } /* end of k0 loop */                  } /* end of k0 loop */
1787              } /* end of face 3 */              } /* end of face 3 */
1788          } // end of parallel section          } /* end of parallel section */
1789      } else {      } else {
1790          out.requireWrite();          out.requireWrite();
1791          const double c0 = 0.21132486540518711775;          const double c0 = 0.21132486540518711775;
1792          const double c1 = 0.78867513459481288225;          const double c1 = 0.78867513459481288225;
1793  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1794          {          {
1795                vector<double> f_00(numComp);
1796                vector<double> f_01(numComp);
1797                vector<double> f_10(numComp);
1798                vector<double> f_11(numComp);
1799              if (m_faceOffset[0] > -1) {              if (m_faceOffset[0] > -1) {
1800  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1801                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1802                      const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1+1, m_N0));                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1803                      const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1, m_N0));                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(0,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1804                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+k1);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[0]+k1);
1805                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1806                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_00[i]*c1 + f_01[i]*c0;                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*f_01[i] + c1*f_00[i];
1807                          o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_00[i]*c0 + f_01[i]*c1;                          o[INDEX2(i,numComp,1)] = c0*f_00[i] + c1*f_01[i];
1808                      } /* end of component loop i */                      } /* end of component loop i */
1809                  } /* end of k1 loop */                  } /* end of k1 loop */
1810              } /* end of face 0 */              } /* end of face 0 */
1811              if (m_faceOffset[1] > -1) {              if (m_faceOffset[1] > -1) {
1812  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1813                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE1; ++k1) {                  for (index_t k1=0; k1 < m_NE[1]; ++k1) {
1814                      const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(m_N0-1,k1, m_N0));                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(m_NN[0]-1,k1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1815                      const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(m_N0-1,k1+1, m_N0));                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(m_NN[0]-1,k1+1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1816                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+k1);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[1]+k1);
1817                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1818                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_10[i]*c1 + f_11[i]*c0;                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = c1*f_10[i] + c0*f_11[i];
1819                          o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_10[i]*c0 + f_11[i]*c1;                          o[INDEX2(i,numComp,1)] = c1*f_11[i] + c0*f_10[i];
1820                      } /* end of component loop i */                      } /* end of component loop i */
1821                  } /* end of k1 loop */                  } /* end of k1 loop */
1822              } /* end of face 1 */              } /* end of face 1 */
1823              if (m_faceOffset[2] > -1) {              if (m_faceOffset[2] > -1) {
1824  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1825                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1826                      const double* f_10 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,0, m_N0));                      memcpy(&f_00[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,0, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1827                      const double* f_00 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,0, m_N0));                      memcpy(&f_10[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,0, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1828                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+k0);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[2]+k0);
1829                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1830                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_00[i]*c1 + f_10[i]*c0;                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*f_10[i] + c1*f_00[i];
1831                          o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_00[i]*c0 + f_10[i]*c1;                          o[INDEX2(i,numComp,1)] = c0*f_00[i] + c1*f_10[i];
1832                      } /* end of component loop i */                      } /* end of component loop i */
1833                  } /* end of k0 loop */                  } /* end of k0 loop */
1834              } /* end of face 2 */              } /* end of face 2 */
1835              if (m_faceOffset[3] > -1) {              if (m_faceOffset[3] > -1) {
1836  #pragma omp for nowait  #pragma omp for nowait
1837                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE0; ++k0) {                  for (index_t k0=0; k0 < m_NE[0]; ++k0) {
1838                      const double* f_11 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,m_N1-1, m_N0));                      memcpy(&f_01[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,m_NN[1]-1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1839                      const double* f_01 = in.getSampleDataRO(INDEX2(k0,m_N1-1, m_N0));                      memcpy(&f_11[0], in.getSampleDataRO(INDEX2(k0+1,m_NN[1]-1, m_NN[0])), numComp*sizeof(double));
1840                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+k0);                      double* o = out.getSampleDataRW(m_faceOffset[3]+k0);
1841                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {                      for (index_t i=0; i < numComp; ++i) {
1842                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = f_01[i]*c1 + f_11[i]*c0;                          o[INDEX2(i,numComp,0)] = c0*f_11[i] + c1*f_01[i];
1843                          o[INDEX2(i,numComp,1)] = f_01[i]*c0 + f_11[i]*c1;                          o[INDEX2(i,numComp,1)] = c0*f_01[i] + c1*f_11[i];
1844                      } /* end of component loop i */                      } /* end of component loop i */
1845                  } /* end of k0 loop */                  } /* end of k0 loop */
1846              } /* end of face 3 */              } /* end of face 3 */
1847          } // end of parallel section          } /* end of parallel section */
1848      }      }
1849  }  }
1850    
# Line 1466  void Rectangle::assemblePDESingle(Paso_S Line 1854  void Rectangle::assemblePDESingle(Paso_S
1854          const escript::Data& C, const escript::Data& D,          const escript::Data& C, const escript::Data& D,
1855          const escript::Data& X, const escript::Data& Y) const          const escript::Data& X, const escript::Data& Y) const
1856  {  {
1857      const double h0 = m_l0/m_gNE0;      const double SQRT3 = 1.73205080756887719318;
1858      const double h1 = m_l1/m_gNE1;      const double w1 = 1.0/24.0;
1859      const double w0 = -0.1555021169820365539*h1/h0;      const double w5 = -SQRT3/24 + 1.0/12;
1860      const double w1 = 0.041666666666666666667;      const double w2 = -SQRT3/24 - 1.0/12;
1861      const double w2 = -0.15550211698203655390;      const double w19 = -m_dx[0]/12;
1862      const double w3 = 0.041666666666666666667*h0/h1;      const double w11 = w19*(SQRT3 + 3)/12;
1863      const double w4 = 0.15550211698203655390;      const double w14 = w19*(-SQRT3 + 3)/12;
1864      const double w5 = -0.041666666666666666667;      const double w16 = w19*(5*SQRT3 + 9)/12;
1865      const double w6 = -0.01116454968463011277*h1/h0;      const double w17 = w19*(-5*SQRT3 + 9)/12;
1866      const double w7 = 0.011164549684630112770;      const double w27 = w19*(-SQRT3 - 3)/2;
1867      const double w8 = -0.011164549684630112770;      const double w28 = w19*(SQRT3 - 3)/2;
1868      const double w9 = -0.041666666666666666667*h1/h0;      const double w18 = -m_dx[1]/12;
1869      const double w10 = -0.041666666666666666667*h0/h1;      const double w12 = w18*(5*SQRT3 + 9)/12;
1870      const double w11 = 0.1555021169820365539*h1/h0;      const double w13 = w18*(-5*SQRT3 + 9)/12;
1871      const double w12 = 0.1555021169820365539*h0/h1;      const double w10 = w18*(SQRT3 + 3)/12;
1872      const double w13 = 0.01116454968463011277*h0/h1;      const double w15 = w18*(-SQRT3 + 3)/12;
1873      const double w14 = 0.01116454968463011277*h1/h0;      const double w25 = w18*(-SQRT3 - 3)/2;
1874      const double w15 = 0.041666666666666666667*h1/h0;      const double w26 = w18*(SQRT3 - 3)/2;
1875      const double w16 = -0.01116454968463011277*h0/h1;      const double w22 = m_dx[0]*m_dx[1]/144;
1876      const double w17 = -0.1555021169820365539*h0/h1;      const double w20 = w22*(SQRT3 + 2);
1877      const double w18 = -0.33333333333333333333*h1/h0;      const double w21 = w22*(-SQRT3 + 2);
1878      const double w19 = 0.25;      const double w23 = w22*(4*SQRT3 + 7);
1879      const double w20 = -0.25;      const double w24 = w22*(-4*SQRT3 + 7);
1880      const double w21 = 0.16666666666666666667*h0/h1;      const double w3 = m_dx[0]/(24*m_dx[1]);
1881      const double w22 = -0.16666666666666666667*h1/h0;      const double w7 = w3*(SQRT3 + 2);
1882      const double w23 = -0.16666666666666666667*h0/h1;      const double w8 = w3*(-SQRT3 + 2);
1883      const double w24 = 0.33333333333333333333*h1/h0;      const double w6 = -m_dx[1]/(24*m_dx[0]);
1884      const double w25 = 0.33333333333333333333*h0/h1;      const double w0 = w6*(SQRT3 + 2);
1885      const double w26 = 0.16666666666666666667*h1/h0;      const double w4 = w6*(-SQRT3 + 2);
     const double w27 = -0.33333333333333333333*h0/h1;  
     const double w28 = -0.032861463941450536761*h1;  
     const double w29 = -0.032861463941450536761*h0;  
     const double w30 = -0.12264065304058601714*h1;  
     const double w31 = -0.0023593469594139828636*h1;  
     const double w32 = -0.008805202725216129906*h0;  
     const double w33 = -0.008805202725216129906*h1;  
     const double w34 = 0.032861463941450536761*h1;  
     const double w35 = 0.008805202725216129906*h1;  
     const double w36 = 0.008805202725216129906*h0;  
     const double w37 = 0.0023593469594139828636*h1;  
     const double w38 = 0.12264065304058601714*h1;  
     const double w39 = 0.032861463941450536761*h0;  
     const double w40 = -0.12264065304058601714*h0;  
     const double w41 = -0.0023593469594139828636*h0;  
     const double w42 = 0.0023593469594139828636*h0;  
     const double w43 = 0.12264065304058601714*h0;  
     const double w44 = -0.16666666666666666667*h1;  
     const double w45 = -0.083333333333333333333*h0;  
     const double w46 = 0.083333333333333333333*h1;  
     const double w47 = 0.16666666666666666667*h1;  
     const double w48 = 0.083333333333333333333*h0;  
     const double w49 = -0.16666666666666666667*h0;  
     const double w50 = 0.16666666666666666667*h0;  
     const double w51 = -0.083333333333333333333*h1;  
     const double w52 = 0.025917019497006092316*h0*h1;  
     const double w53 = 0.0018607582807716854616*h0*h1;  
     const double w54 = 0.0069444444444444444444*h0*h1;  
     const double w55 = 0.09672363354357992482*h0*h1;  
     const double w56 = 0.00049858867864229740201*h0*h1;  
     const double w57 = 0.055555555555555555556*h0*h1;  
     const double w58 = 0.027777777777777777778*h0*h1;  
     const double w59 = 0.11111111111111111111*h0*h1;  
     const double w60 = -0.19716878364870322056*h1;  
     const double w61 = -0.19716878364870322056*h0;  
     const double w62 = -0.052831216351296779436*h0;  
     const double w63 = -0.052831216351296779436*h1;  
     const double w64 = 0.19716878364870322056*h1;  
     const double w65 = 0.052831216351296779436*h1;  
     const double w66 = 0.19716878364870322056*h0;  
     const double w67 = 0.052831216351296779436*h0;  
     const double w68 = -0.5*h1;  
     const double w69 = -0.5*h0;  
     const double w70 = 0.5*h1;  
     const double w71 = 0.5*h0;  
     const double w72 = 0.1555021169820365539*h0*h1;  
     const double w73 = 0.041666666666666666667*h0*h1;  
     const double w74 = 0.01116454968463011277*h0*h1;  
     const double w75 = 0.25*h0*h1;  
1886    
1887      rhs.requireWrite();      rhs.requireWrite();
1888  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
1889      {      {
1890          for (index_t k1_0=0; k1_0<2; k1_0++) { // colouring          for (index_t k1_0=0; k1_0<2; k1_0++) { // colouring
1891  #pragma omp for  #pragma omp for
1892              for (index_t k1=k1_0; k1<m_NE1; k1+=2) {              for (index_t k1=k1_0; k1<m_NE[1]; k1+=2) {
1893                  for (index_t k0=0; k0<m_NE0; ++k0)  {                  for (index_t k0=0; k0<m_NE[0]; ++k0)  {
1894                      bool add_EM_S=false;                      bool add_EM_S=false;
1895                      bool add_EM_F=false;                      bool add_EM_F=false;
1896                      vector<double> EM_S(4*4, 0);                      vector<double> EM_S(4*4, 0);
1897                      vector<double> EM_F(4, 0);                      vector<double> EM_F(4, 0);
1898                      const index_t e = k0 + m_NE0*k1;                      const index_t e = k0 + m_NE[0]*k1;
1899                      ///////////////                      ///////////////
1900                      // process A //                      // process A //
1901                      ///////////////                      ///////////////
1902                      if (!A.isEmpty()) {                      if (!A.isEmpty()) {
1903                          add_EM_S=true;                          add_EM_S = true;
1904                          const double* A_p=const_cast<escript::Data*>(&A)->getSampleDataRO(e);                          const double* A_p = const_cast<escript::Data*>(&A)->getSampleDataRO(e);
1905                          if (A.actsExpanded()) {                          if (A.actsExpanded()) {
1906                              const double A_00_0 = A_p[INDEX3(0,0,0,2,2)];                              const double A_00_0 = A_p[INDEX3(0,0,0,2,2)];
                             const double A_10_0 = A_p[INDEX3(1,0,0,2,2)];  
1907                              const double A_01_0 = A_p[INDEX3(0,1,0,2,2)];                              const double A_01_0 = A_p[INDEX3(0,1,0,2,2)];
1908                                const double A_10_0 = A_p[INDEX3(1,0,0,2,2)];
1909                              const double A_11_0 = A_p[INDEX3(1,1,0,2,2)];                              const double A_11_0 = A_p[INDEX3(1,1,0,2,2)];
1910                              const double A_00_1 = A_p[INDEX3(0,0,1,2,2)];                              const double A_00_1 = A_p[INDEX3(0,0,1,2,2)];
                             const double A_10_1 = A_p[INDEX3(1,0,1,2,2)];  
1911                              const double A_01_1 = A_p[INDEX3(0,1,1,2,2)];                              const double A_01_1 = A_p[INDEX3(0,1,1,2,2)];
1912                                const double A_10_1 = A_p[INDEX3(1,0,1,2,2)];
1913                              const double A_11_1 = A_p[INDEX3(1,1,1,2,2)];                              const double A_11_1 = A_p[INDEX3(1,1,1,2,2)];
1914                              const double A_00_2 = A_p[INDEX3(0,0,2,2,2)];                              const double A_00_2 = A_p[INDEX3(0,0,2,2,2)];
                             const double A_10_2 = A_p[INDEX3(1,0,2,2,2)];  
1915                              const double A_01_2 = A_p[INDEX3(0,1,2,2,2)];                              const double A_01_2 = A_p[INDEX3(0,1,2,2,2)];
1916                                const double A_10_2 = A_p[INDEX3(1,0,2,2,2)];
1917                              const double A_11_2 = A_p[INDEX3(1,1,2,2,2)];                              const double A_11_2 = A_p[INDEX3(1,1,2,2,2)];
1918                              const double A_00_3 = A_p[INDEX3(0,0,3,2,2)];                              const double A_00_3 = A_p[INDEX3(0,0,3,2,2)];
                             const double A_10_3 = A_p[INDEX3(1,0,3,2,2)];  
1919                              const double A_01_3 = A_p[INDEX3(0,1,3,2,2)];                              const double A_01_3 = A_p[INDEX3(0,1,3,2,2)];
1920                                const double A_10_3 = A_p[INDEX3(1,0,3,2,2)];
1921                              const double A_11_3 = A_p[INDEX3(1,1,3,2,2)];                              const double A_11_3 = A_p[INDEX3(1,1,3,2,2)];
1922                              const double tmp0_0 = A_01_0 + A_01_3;                              const double tmp0 = w3*(A_11_0 + A_11_1 + A_11_2 + A_11_3);
1923                              const double tmp1_0 = A_00_0 + A_00_1;                              const double tmp1 = w1*(A_01_0 + A_01_3 - A_10_1 - A_10_2);
1924                              const double tmp2_0 = A_11_0 + A_11_1 + A_11_2 + A_11_3;                              const double tmp2 = w4*(A_00_2 + A_00_3);
1925                              const double tmp3_0 = A_00_2 + A_00_3;                              const double tmp3 = w0*(A_00_0 + A_00_1);
1926                              const double tmp4_0 = A_10_1 + A_10_2;                              const double tmp4 = w5*(A_01_2 - A_10_3);
1927                              const double tmp5_0 = A_00_0 + A_00_1 + A_00_2 + A_00_3;                              const double tmp5 = w2*(-A_01_1 + A_10_0);
1928                              const double tmp6_0 = A_01_3 + A_10_0;                              const double tmp6 = w5*(A_01_3 + A_10_0);
1929                              const double tmp7_0 = A_01_0 + A_10_3;                              const double tmp7 = w3*(-A_11_0 - A_11_1 - A_11_2 - A_11_3);
1930                              const double tmp8_0 = A_01_1 + A_01_2 + A_10_1 + A_10_2;                              const double tmp8 = w6*(A_00_0 + A_00_1 + A_00_2 + A_00_3);
1931                              const double tmp9_0 = A_01_0 + A_10_0;                              const double tmp9 = w1*(A_01_1 + A_01_2 + A_10_1 + A_10_2);
1932                              const double tmp12_0 = A_11_0 + A_11_2;                              const double tmp10 = w2*(-A_01_0 - A_10_3);
1933                              const double tmp10_0 = A_01_3 + A_10_3;                              const double tmp11 = w4*(A_00_0 + A_00_1);
1934                              const double tmp14_0 = A_01_0 + A_01_3 + A_10_0 + A_10_3;                              const double tmp12 = w0*(A_00_2 + A_00_3);
1935                              const double tmp13_0 = A_01_2 + A_10_1;                              const double tmp13 = w5*(A_01_1 - A_10_0);
1936                              const double tmp11_0 = A_11_1 + A_11_3;                              const double tmp14 = w2*(-A_01_2 + A_10_3);
1937                              const double tmp18_0 = A_01_1 + A_10_1;                              const double tmp15 = w7*(A_11_0 + A_11_2);
1938                              const double tmp15_0 = A_01_1 + A_10_2;                              const double tmp16 = w4*(-A_00_2 - A_00_3);
1939                              const double tmp16_0 = A_10_0 + A_10_3;                              const double tmp17 = w0*(-A_00_0 - A_00_1);
1940                              const double tmp17_0 = A_01_1 + A_01_2;                              const double tmp18 = w5*(A_01_3 + A_10_3);
1941                              const double tmp19_0 = A_01_2 + A_10_2;                              const double tmp19 = w8*(A_11_1 + A_11_3);
1942                              const double tmp0_1 = A_10_3*w8;                              const double tmp20 = w2*(-A_01_0 - A_10_0);
1943                              const double tmp1_1 = tmp0_0*w1;                              const double tmp21 = w7*(A_11_1 + A_11_3);
1944                              const double tmp2_1 = A_01_1*w4;                              const double tmp22 = w4*(-A_00_0 - A_00_1);
1945                              const double tmp3_1 = tmp1_0*w0;                              const double tmp23 = w0*(-A_00_2 - A_00_3);
1946                              const double tmp4_1 = A_01_2*w7;                              const double tmp24 = w5*(A_01_0 + A_10_0);
1947                              const double tmp5_1 = tmp2_0*w3;                              const double tmp25 = w8*(A_11_0 + A_11_2);
1948                              const double tmp6_1 = tmp3_0*w6;                              const double tmp26 = w2*(-A_01_3 - A_10_3);
1949                              const double tmp7_1 = A_10_0*w2;                              const double tmp27 = w5*(-A_01_1 - A_10_2);
1950                              const double tmp8_1 = tmp4_0*w5;                              const double tmp28 = w1*(-A_01_0 - A_01_3 - A_10_0 - A_10_3);
1951                              const double tmp9_1 = tmp2_0*w10;                              const double tmp29 = w2*(A_01_2 + A_10_1);
1952                              const double tmp14_1 = A_10_0*w8;                              const double tmp30 = w7*(-A_11_1 - A_11_3);
1953                              const double tmp23_1 = tmp3_0*w14;                              const double tmp31 = w1*(-A_01_1 - A_01_2 + A_10_0 + A_10_3);
1954                              const double tmp35_1 = A_01_0*w8;                              const double tmp32 = w5*(-A_01_0 + A_10_2);
1955                              const double tmp54_1 = tmp13_0*w8;                              const double tmp33 = w8*(-A_11_0 - A_11_2);
1956                              const double tmp20_1 = tmp9_0*w4;                              const double tmp34 = w6*(-A_00_0 - A_00_1 - A_00_2 - A_00_3);
1957                              const double tmp25_1 = tmp12_0*w12;                              const double tmp35 = w2*(A_01_3 - A_10_1);
1958                              const double tmp44_1 = tmp7_0*w7;                              const double tmp36 = w5*(A_01_0 + A_10_3);
1959                              const double tmp26_1 = tmp10_0*w4;                              const double tmp37 = w2*(-A_01_3 - A_10_0);
1960                              const double tmp52_1 = tmp18_0*w8;                              const double tmp38 = w7*(-A_11_0 - A_11_2);
1961                              const double tmp48_1 = A_10_1*w7;                              const double tmp39 = w5*(-A_01_3 + A_10_1);
1962                              const double tmp46_1 = A_01_3*w8;                              const double tmp40 = w8*(-A_11_1 - A_11_3);
1963                              const double tmp50_1 = A_01_0*w2;                              const double tmp41 = w2*(A_01_0 - A_10_2);
1964                              const double tmp56_1 = tmp19_0*w8;                              const double tmp42 = w5*(A_01_1 - A_10_3);
1965                              const double tmp19_1 = A_10_3*w2;                              const double tmp43 = w2*(-A_01_2 + A_10_0);
1966                              const double tmp47_1 = A_10_2*w4;                              const double tmp44 = w5*(A_01_2 - A_10_0);
1967                              const double tmp16_1 = tmp3_0*w0;                              const double tmp45 = w2*(-A_01_1 + A_10_3);
1968                              const double tmp18_1 = tmp1_0*w6;                              const double tmp46 = w5*(-A_01_0 + A_10_1);
1969                              const double tmp31_1 = tmp11_0*w12;                              const double tmp47 = w2*(A_01_3 - A_10_2);
1970                              const double tmp55_1 = tmp15_0*w2;                              const double tmp48 = w5*(-A_01_1 - A_10_1);
1971                              const double tmp39_1 = A_10_2*w7;                              const double tmp49 = w2*(A_01_2 + A_10_2);
1972                              const double tmp11_1 = tmp6_0*w7;                              const double tmp50 = w5*(-A_01_3 + A_10_2);
1973                              const double tmp40_1 = tmp11_0*w17;                              const double tmp51 = w2*(A_01_0 - A_10_1);
1974                              const double tmp34_1 = tmp15_0*w8;                              const double tmp52 = w5*(-A_01_2 - A_10_1);
1975                              const double tmp33_1 = tmp14_0*w5;                              const double tmp53 = w2*(A_01_1 + A_10_2);
1976                              const double tmp24_1 = tmp11_0*w13;                              const double tmp54 = w5*(-A_01_2 - A_10_2);
1977                              const double tmp43_1 = tmp17_0*w5;                              const double tmp55 = w2*(A_01_1 + A_10_1);
1978                              const double tmp15_1 = A_01_2*w4;                              EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=tmp15 + tmp16 + tmp17 + tmp18 + tmp19 + tmp20 + tmp9;
1979                              const double tmp53_1 = tmp19_0*w2;                              EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=tmp0 + tmp1 + tmp2 + tmp3 + tmp4 + tmp5;
1980                              const double tmp27_1 = tmp3_0*w11;                              EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=tmp31 + tmp34 + tmp38 + tmp39 + tmp40 + tmp41;
1981                              const double tmp32_1 = tmp13_0*w2;                              EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp28 + tmp52 + tmp53 + tmp7 + tmp8;
1982                              const double tmp10_1 = tmp5_0*w9;                              EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=tmp0 + tmp2 + tmp3 + tmp31 + tmp50 + tmp51;
1983                              const double tmp37_1 = A_10_1*w4;                              EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=tmp16 + tmp17 + tmp21 + tmp25 + tmp28 + tmp54 + tmp55;
1984                              const double tmp38_1 = tmp5_0*w15;                              EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp10 + tmp6 + tmp7 + tmp8 + tmp9;
1985                              const double tmp17_1 = A_01_1*w7;                              EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=tmp1 + tmp30 + tmp33 + tmp34 + tmp44 + tmp45;
1986                              const double tmp12_1 = tmp7_0*w4;                              EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=tmp1 + tmp34 + tmp38 + tmp40 + tmp42 + tmp43;
1987                              const double tmp22_1 = tmp10_0*w7;                              EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp36 + tmp37 + tmp7 + tmp8 + tmp9;
1988                              const double tmp57_1 = tmp18_0*w2;                              EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=tmp15 + tmp19 + tmp22 + tmp23 + tmp28 + tmp48 + tmp49;
1989                              const double tmp28_1 = tmp9_0*w7;                              EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=tmp0 + tmp11 + tmp12 + tmp31 + tmp46 + tmp47;
1990                              const double tmp29_1 = tmp1_0*w14;                              EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp27 + tmp28 + tmp29 + tmp7 + tmp8;
1991                              const double tmp51_1 = tmp11_0*w16;                              EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=tmp30 + tmp31 + tmp32 + tmp33 + tmp34 + tmp35;
1992                              const double tmp42_1 = tmp12_0*w16;                              EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=tmp0 + tmp1 + tmp11 + tmp12 + tmp13 + tmp14;
1993                              const double tmp49_1 = tmp12_0*w17;                              EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=tmp21 + tmp22 + tmp23 + tmp24 + tmp25 + tmp26 + tmp9;
                             const double tmp21_1 = tmp1_0*w11;  
                             const double tmp45_1 = tmp6_0*w4;  
                             const double tmp13_1 = tmp8_0*w1;  
                             const double tmp36_1 = tmp16_0*w1;  
                             const double tmp41_1 = A_01_3*w2;  
                             const double tmp30_1 = tmp12_0*w13;  
                             EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=tmp13_1 + tmp20_1 + tmp21_1 + tmp22_1 + tmp23_1 + tmp24_1 + tmp25_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=tmp36_1 + tmp37_1 + tmp39_1 + tmp3_1 + tmp43_1 + tmp46_1 + tmp50_1 + tmp5_1 + tmp6_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=tmp0_1 + tmp15_1 + tmp17_1 + tmp1_1 + tmp38_1 + tmp49_1 + tmp51_1 + tmp7_1 + tmp8_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp10_1 + tmp32_1 + tmp33_1 + tmp34_1 + tmp9_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1 + tmp2_1 + tmp3_1 + tmp4_1 + tmp5_1 + tmp6_1 + tmp7_1 + tmp8_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=tmp21_1 + tmp23_1 + tmp30_1 + tmp31_1 + tmp33_1 + tmp56_1 + tmp57_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp10_1 + tmp13_1 + tmp44_1 + tmp45_1 + tmp9_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=tmp35_1 + tmp36_1 + tmp37_1 + tmp38_1 + tmp39_1 + tmp40_1 + tmp41_1 + tmp42_1 + tmp43_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=tmp36_1 + tmp38_1 + tmp43_1 + tmp46_1 + tmp47_1 + tmp48_1 + tmp49_1 + tmp50_1 + tmp51_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp10_1 + tmp11_1 + tmp12_1 + tmp13_1 + tmp9_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=tmp24_1 + tmp25_1 + tmp27_1 + tmp29_1 + tmp33_1 + tmp52_1 + tmp53_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=tmp14_1 + tmp15_1 + tmp16_1 + tmp17_1 + tmp18_1 + tmp19_1 + tmp1_1 + tmp5_1 + tmp8_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp10_1 + tmp33_1 + tmp54_1 + tmp55_1 + tmp9_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=tmp14_1 + tmp19_1 + tmp1_1 + tmp2_1 + tmp38_1 + tmp40_1 + tmp42_1 + tmp4_1 + tmp8_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=tmp16_1 + tmp18_1 + tmp35_1 + tmp36_1 + tmp41_1 + tmp43_1 + tmp47_1 + tmp48_1 + tmp5_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=tmp13_1 + tmp26_1 + tmp27_1 + tmp28_1 + tmp29_1 + tmp30_1 + tmp31_1;  
1994                          } else { // constant data                          } else { // constant data
1995                              const double A_00 = A_p[INDEX2(0,0,2)];                              const double A_00 = A_p[INDEX2(0,0,2)];
                             const double A_10 = A_p[INDEX2(1,0,2)];  
1996                              const double A_01 = A_p[INDEX2(0,1,2)];                              const double A_01 = A_p[INDEX2(0,1,2)];
1997                                const double A_10 = A_p[INDEX2(1,0,2)];
1998                              const double A_11 = A_p[INDEX2(1,1,2)];                              const double A_11 = A_p[INDEX2(1,1,2)];
1999                              const double tmp0_0 = A_01 + A_10;                              const double tmp0 = 6*w1*(A_01 - A_10);
2000                              const double tmp0_1 = A_00*w18;                              const double tmp1 = 6*w1*(A_01 + A_10);
2001                              const double tmp1_1 = A_01*w19;                              const double tmp2 = 6*w1*(-A_01 - A_10);
2002                              const double tmp2_1 = A_10*w20;                              const double tmp3 = 6*w1*(-A_01 + A_10);
2003                              const double tmp3_1 = A_11*w21;                              EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=-8*A_00*w6 + 8*A_11*w3 + tmp1;
2004                              const double tmp4_1 = A_00*w22;                              EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=8*A_00*w6 + 4*A_11*w3 + tmp0;
2005                              const double tmp5_1 = tmp0_0*w19;                              EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=-4*A_00*w6 - 8*A_11*w3 + tmp3;
2006                              const double tmp6_1 = A_11*w23;                              EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=4*A_00*w6 - 4*A_11*w3 + tmp2;
2007                              const double tmp7_1 = A_11*w25;                              EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=8*A_00*w6 + 4*A_11*w3 + tmp3;
2008                              const double tmp8_1 = A_00*w24;                              EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=-8*A_00*w6 + 8*A_11*w3 + tmp2;
2009                              const double tmp9_1 = tmp0_0*w20;                              EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=4*A_00*w6 - 4*A_11*w3 + tmp1;
2010                              const double tmp10_1 = A_01*w20;                              EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=-4*A_00*w6 - 8*A_11*w3 + tmp0;
2011                              const double tmp11_1 = A_11*w27;                              EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=-4*A_00*w6 - 8*A_11*w3 + tmp0;
2012                              const double tmp12_1 = A_00*w26;                              EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=4*A_00*w6 - 4*A_11*w3 + tmp1;
2013                              const double tmp13_1 = A_10*w19;                              EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=-8*A_00*w6 + 8*A_11*w3 + tmp2;
2014                              EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=tmp5_1 + tmp7_1 + tmp8_1;                              EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=8*A_00*w6 + 4*A_11*w3 + tmp3;
2015                              EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=tmp0_1 + tmp10_1 + tmp13_1 + tmp3_1;                              EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=4*A_00*w6 - 4*A_11*w3 + tmp2;
2016                              EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=tmp11_1 + tmp12_1 + tmp1_1 + tmp2_1;                              EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=-4*A_00*w6 - 8*A_11*w3 + tmp3;
2017                              EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp4_1 + tmp6_1 + tmp9_1;                              EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=8*A_00*w6 + 4*A_11*w3 + tmp0;
2018                              EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1 + tmp2_1 + tmp3_1;                              EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=-8*A_00*w6 + 8*A_11*w3 + tmp1;
                             EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=tmp7_1 + tmp8_1 + tmp9_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp4_1 + tmp5_1 + tmp6_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=tmp10_1 + tmp11_1 + tmp12_1 + tmp13_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=tmp10_1 + tmp11_1 + tmp12_1 + tmp13_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp4_1 + tmp5_1 + tmp6_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=tmp7_1 + tmp8_1 + tmp9_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1 + tmp2_1 + tmp3_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp4_1 + tmp6_1 + tmp9_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=tmp11_1 + tmp12_1 + tmp1_1 + tmp2_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=tmp0_1 + tmp10_1 + tmp13_1 + tmp3_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=tmp5_1 + tmp7_1 + tmp8_1;  
2019                          }                          }
2020                      }                      }
2021                      ///////////////                      ///////////////
# Line 1727  void Rectangle::assemblePDESingle(Paso_S Line 2033  void Rectangle::assemblePDESingle(Paso_S
2033                              const double B_1_2 = B_p[INDEX2(1,2,2)];                              const double B_1_2 = B_p[INDEX2(1,2,2)];
2034                              const double B_0_3 = B_p[INDEX2(0,3,2)];                              const double B_0_3 = B_p[INDEX2(0,3,2)];
2035                              const double B_1_3 = B_p[INDEX2(1,3,2)];                              const double B_1_3 = B_p[INDEX2(1,3,2)];
2036                              const double tmp0_0 = B_1_0 + B_1_1;                              const double tmp0 = w11*(B_1_0 + B_1_1);
2037                              const double tmp1_0 = B_1_2 + B_1_3;                              const double tmp1 = w14*(B_1_2 + B_1_3);
2038                              const double tmp2_0 = B_0_1 + B_0_3;                              const double tmp2 = w15*(-B_0_1 - B_0_3);
2039                              const double tmp3_0 = B_0_0 + B_0_2;                              const double tmp3 = w10*(-B_0_0 - B_0_2);
2040                              const double tmp63_1 = B_1_1*w42;                              const double tmp4 = w11*(B_1_2 + B_1_3);
2041                              const double tmp79_1 = B_1_1*w40;                              const double tmp5 = w14*(B_1_0 + B_1_1);
2042                              const double tmp37_1 = tmp3_0*w35;                              const double tmp6 = w11*(-B_1_2 - B_1_3);
2043                              const double tmp8_1 = tmp0_0*w32;                              const double tmp7 = w14*(-B_1_0 - B_1_1);
2044                              const double tmp71_1 = B_0_1*w34;                              const double tmp8 = w11*(-B_1_0 - B_1_1);
2045                              const double tmp19_1 = B_0_3*w31;                              const double tmp9 = w14*(-B_1_2 - B_1_3);
2046                              const double tmp15_1 = B_0_3*w34;                              const double tmp10 = w10*(-B_0_1 - B_0_3);
2047                              const double tmp9_1 = tmp3_0*w34;                              const double tmp11 = w15*(-B_0_0 - B_0_2);
2048                              const double tmp35_1 = B_1_0*w36;                              const double tmp12 = w15*(B_0_0 + B_0_2);
2049                              const double tmp66_1 = B_0_3*w28;                              const double tmp13 = w10*(B_0_1 + B_0_3);
2050                              const double tmp28_1 = B_1_0*w42;                              const double tmp14 = w10*(B_0_0 + B_0_2);
2051                              const double tmp22_1 = B_1_0*w40;                              const double tmp15 = w15*(B_0_1 + B_0_3);
2052                              const double tmp16_1 = B_1_2*w29;                              EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=B_0_0*w12 + B_0_1*w10 + B_0_2*w15 + B_0_3*w13 + B_1_0*w16 + B_1_1*w14 + B_1_2*w11 + B_1_3*w17;
2053                              const double tmp6_1 = tmp2_0*w35;                              EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=B_0_0*w10 + B_0_1*w12 + B_0_2*w13 + B_0_3*w15 + tmp0 + tmp1;
2054                              const double tmp55_1 = B_1_3*w40;                              EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=B_1_0*w11 + B_1_1*w17 + B_1_2*w16 + B_1_3*w14 + tmp14 + tmp15;
2055                              const double tmp50_1 = B_1_3*w42;                              EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp12 + tmp13 + tmp4 + tmp5;
2056                              const double tmp7_1 = tmp1_0*w29;                              EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=-B_0_0*w12 - B_0_1*w10 - B_0_2*w15 - B_0_3*w13 + tmp0 + tmp1;
2057                              const double tmp1_1 = tmp1_0*w32;                              EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=-B_0_0*w10 - B_0_1*w12 - B_0_2*w13 - B_0_3*w15 + B_1_0*w14 + B_1_1*w16 + B_1_2*w17 + B_1_3*w11;
2058                              const double tmp57_1 = B_0_3*w30;                              EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp2 + tmp3 + tmp4 + tmp5;
2059                              const double tmp18_1 = B_1_1*w32;                              EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=B_1_0*w17 + B_1_1*w11 + B_1_2*w14 + B_1_3*w16 + tmp10 + tmp11;
2060                              const double tmp53_1 = B_1_0*w41;                              EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=-B_1_0*w16 - B_1_1*w14 - B_1_2*w11 - B_1_3*w17 + tmp14 + tmp15;
2061                              const double tmp61_1 = B_1_3*w36;                              EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp12 + tmp13 + tmp8 + tmp9;
2062                              const double tmp27_1 = B_0_3*w38;                              EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=B_0_0*w15 + B_0_1*w13 + B_0_2*w12 + B_0_3*w10 - B_1_0*w11 - B_1_1*w17 - B_1_2*w16 - B_1_3*w14;
2063                              const double tmp64_1 = B_0_2*w30;                              EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=B_0_0*w13 + B_0_1*w15 + B_0_2*w10 + B_0_3*w12 + tmp6 + tmp7;
2064                              const double tmp76_1 = B_0_1*w38;                              EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp2 + tmp3 + tmp8 + tmp9;
2065                              const double tmp39_1 = tmp2_0*w34;                              EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=-B_1_0*w14 - B_1_1*w16 - B_1_2*w17 - B_1_3*w11 + tmp10 + tmp11;
2066                              const double tmp62_1 = B_0_1*w31;                              EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=-B_0_0*w15 - B_0_1*w13 - B_0_2*w12 - B_0_3*w10 + tmp6 + tmp7;
2067                              const double tmp56_1 = B_0_0*w31;                              EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=-B_0_0*w13 - B_0_1*w15 - B_0_2*w10 - B_0_3*w12 - B_1_0*w17 - B_1_1*w11 - B_1_2*w14 - B_1_3*w16;
                             const double tmp49_1 = B_1_1*w36;  
                             const double tmp2_1 = B_0_2*w31;  
                             const double tmp23_1 = B_0_2*w33;  
                             const double tmp38_1 = B_1_1*w43;  
                             const double tmp74_1 = B_1_2*w41;  
                             const double tmp43_1 = B_1_1*w41;  
                             const double tmp58_1 = B_0_2*w28;  
                             const double tmp67_1 = B_0_0*w33;  
                             const double tmp33_1 = tmp0_0*w39;  
                             const double tmp4_1 = B_0_0*w28;  
                             const double tmp20_1 = B_0_0*w30;  
                             const double tmp13_1 = B_0_2*w38;  
                             const double tmp65_1 = B_1_2*w43;  
                             const double tmp0_1 = tmp0_0*w29;  
                             const double tmp41_1 = tmp3_0*w33;  
                             const double tmp73_1 = B_0_2*w37;  
                             const double tmp69_1 = B_0_0*w38;  
                             const double tmp48_1 = B_1_2*w39;  
                             const double tmp59_1 = B_0_1*w33;  
                             const double tmp17_1 = B_1_3*w41;  
                             const double tmp5_1 = B_0_3*w33;  
                             const double tmp3_1 = B_0_1*w30;  
                             const double tmp21_1 = B_0_1*w28;  
                             const double tmp42_1 = B_1_0*w29;  
                             const double tmp54_1 = B_1_2*w32;  
                             const double tmp60_1 = B_1_0*w39;  
                             const double tmp32_1 = tmp1_0*w36;  
                             const double tmp10_1 = B_0_1*w37;  
                             const double tmp14_1 = B_0_0*w35;  
                             const double tmp29_1 = B_0_1*w35;  
                             const double tmp26_1 = B_1_2*w36;  
                             const double tmp30_1 = B_1_3*w43;  
                             const double tmp70_1 = B_0_2*w35;  
                             const double tmp34_1 = B_1_3*w39;  
                             const double tmp51_1 = B_1_0*w43;  
                             const double tmp31_1 = B_0_2*w34;  
                             const double tmp45_1 = tmp3_0*w28;  
                             const double tmp11_1 = tmp1_0*w39;  
                             const double tmp52_1 = B_1_1*w29;  
                             const double tmp44_1 = B_1_3*w32;  
                             const double tmp25_1 = B_1_1*w39;  
                             const double tmp47_1 = tmp2_0*w33;  
                             const double tmp72_1 = B_1_3*w29;  
                             const double tmp40_1 = tmp2_0*w28;  
                             const double tmp46_1 = B_1_2*w40;  
                             const double tmp36_1 = B_1_2*w42;  
                             const double tmp24_1 = B_0_0*w37;  
                             const double tmp77_1 = B_0_3*w35;  
                             const double tmp68_1 = B_0_3*w37;  
                             const double tmp78_1 = B_0_0*w34;  
                             const double tmp12_1 = tmp0_0*w36;  
                             const double tmp75_1 = B_1_0*w32;  
                             EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=tmp16_1 + tmp17_1 + tmp18_1 + tmp19_1 + tmp20_1 + tmp21_1 + tmp22_1 + tmp23_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1 + tmp68_1 + tmp69_1 + tmp70_1 + tmp71_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=tmp45_1 + tmp47_1 + tmp48_1 + tmp49_1 + tmp50_1 + tmp51_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp32_1 + tmp33_1 + tmp6_1 + tmp9_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1 + tmp2_1 + tmp3_1 + tmp4_1 + tmp5_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=tmp72_1 + tmp73_1 + tmp74_1 + tmp75_1 + tmp76_1 + tmp77_1 + tmp78_1 + tmp79_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp32_1 + tmp33_1 + tmp40_1 + tmp41_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=tmp34_1 + tmp35_1 + tmp36_1 + tmp37_1 + tmp38_1 + tmp39_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=tmp42_1 + tmp43_1 + tmp44_1 + tmp45_1 + tmp46_1 + tmp47_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp6_1 + tmp7_1 + tmp8_1 + tmp9_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=tmp60_1 + tmp61_1 + tmp62_1 + tmp63_1 + tmp64_1 + tmp65_1 + tmp66_1 + tmp67_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=tmp10_1 + tmp11_1 + tmp12_1 + tmp13_1 + tmp14_1 + tmp15_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp40_1 + tmp41_1 + tmp7_1 + tmp8_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=tmp37_1 + tmp39_1 + tmp52_1 + tmp53_1 + tmp54_1 + tmp55_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=tmp11_1 + tmp12_1 + tmp56_1 + tmp57_1 + tmp58_1 + tmp59_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=tmp24_1 + tmp25_1 + tmp26_1 + tmp27_1 + tmp28_1 + tmp29_1 + tmp30_1 + tmp31_1;  
2068                          } else { // constant data                          } else { // constant data
2069                              const double B_0 = B_p[0];                              const double B_0 = B_p[0];
2070                              const double B_1 = B_p[1];                              const double B_1 = B_p[1];
2071                              const double tmp0_1 = B_0*w44;                              EM_S[INDEX2(0,0,4)]+= 2*B_0*w18 + 2*B_1*w19;
2072                              const double tmp1_1 = B_1*w45;                              EM_S[INDEX2(0,1,4)]+= 2*B_0*w18 +   B_1*w19;
2073                              const double tmp2_1 = B_0*w46;                              EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=   B_0*w18 + 2*B_1*w19;
2074                              const double tmp3_1 = B_0*w47;                              EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=   B_0*w18 +   B_1*w19;
2075                              const double tmp4_1 = B_1*w48;                              EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=-2*B_0*w18 +   B_1*w19;
2076                              const double tmp5_1 = B_1*w49;                              EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=-2*B_0*w18 + 2*B_1*w19;
2077                              const double tmp6_1 = B_1*w50;                              EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=  -B_0*w18 +   B_1*w19;
2078                              const double tmp7_1 = B_0*w51;                              EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=  -B_0*w18 + 2*B_1*w19;
2079                              EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=tmp0_1 + tmp5_1;                              EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=   B_0*w18 - 2*B_1*w19;
2080                              EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=tmp1_1 + tmp3_1;                              EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=   B_0*w18 -   B_1*w19;
2081                              EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=tmp6_1 + tmp7_1;                              EM_S[INDEX2(2,2,4)]+= 2*B_0*w18 - 2*B_1*w19;
2082                              EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp2_1 + tmp4_1;                              EM_S[INDEX2(2,3,4)]+= 2*B_0*w18 -   B_1*w19;
2083                              EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1;                              EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=  -B_0*w18 -   B_1*w19;
2084                              EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=tmp3_1 + tmp5_1;                              EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=  -B_0*w18 - 2*B_1*w19;
2085                              EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp4_1 + tmp7_1;                              EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=-2*B_0*w18 -   B_1*w19;
2086                              EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=tmp2_1 + tmp6_1;                              EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=-2*B_0*w18 - 2*B_1*w19;
                             EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=tmp5_1 + tmp7_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp1_1 + tmp2_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=tmp0_1 + tmp6_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=tmp3_1 + tmp4_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp1_1 + tmp7_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=tmp2_1 + tmp5_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=tmp0_1 + tmp4_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=tmp3_1 + tmp6_1;  
2087                          }                          }
2088                      }                      }
2089                      ///////////////                      ///////////////
# Line 1871  void Rectangle::assemblePDESingle(Paso_S Line 2101  void Rectangle::assemblePDESingle(Paso_S
2101                              const double C_1_2 = C_p[INDEX2(1,2,2)];                              const double C_1_2 = C_p[INDEX2(1,2,2)];
2102                              const double C_0_3 = C_p[INDEX2(0,3,2)];                              const double C_0_3 = C_p[INDEX2(0,3,2)];
2103                              const double C_1_3 = C_p[INDEX2(1,3,2)];                              const double C_1_3 = C_p[INDEX2(1,3,2)];
2104                              const double tmp0_0 = C_1_0 + C_1_1;                              const double tmp0 = w11*(C_1_0 + C_1_1);
2105                              const double tmp1_0 = C_1_2 + C_1_3;                              const double tmp1 = w14*(C_1_2 + C_1_3);
2106                              const double tmp2_0 = C_0_1 + C_0_3;                              const double tmp2 = w15*(C_0_0 + C_0_2);
2107                              const double tmp3_0 = C_0_0 + C_0_2;                              const double tmp3 = w10*(C_0_1 + C_0_3);
2108                              const double tmp64_1 = C_0_2*w30;                              const double tmp4 = w11*(-C_1_0 - C_1_1);
2109                              const double tmp14_1 = C_0_2*w28;                              const double tmp5 = w14*(-C_1_2 - C_1_3);
2110                              const double tmp19_1 = C_0_3*w31;                              const double tmp6 = w11*(-C_1_2 - C_1_3);
2111                              const double tmp22_1 = C_1_0*w40;                              const double tmp7 = w14*(-C_1_0 - C_1_1);
2112                              const double tmp37_1 = tmp3_0*w35;                              const double tmp8 = w11*(C_1_2 + C_1_3);
2113                              const double tmp29_1 = C_0_1*w35;                              const double tmp9 = w14*(C_1_0 + C_1_1);
2114                              const double tmp73_1 = C_0_2*w37;                              const double tmp10 = w10*(-C_0_1 - C_0_3);
2115                              const double tmp74_1 = C_1_2*w41;                              const double tmp11 = w15*(-C_0_0 - C_0_2);
2116                              const double tmp52_1 = C_1_3*w39;                              const double tmp12 = w15*(-C_0_1 - C_0_3);
2117                              const double tmp25_1 = C_1_1*w39;                              const double tmp13 = w10*(-C_0_0 - C_0_2);
2118                              const double tmp62_1 = C_0_1*w31;                              const double tmp14 = w10*(C_0_0 + C_0_2);
2119                              const double tmp79_1 = C_1_1*w40;                              const double tmp15 = w15*(C_0_1 + C_0_3);
2120                              const double tmp43_1 = C_1_1*w36;                              EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=C_0_0*w12 + C_0_1*w10 + C_0_2*w15 + C_0_3*w13 + C_1_0*w16 + C_1_1*w14 + C_1_2*w11 + C_1_3*w17;
2121                              const double tmp27_1 = C_0_3*w38;                              EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=-C_0_0*w12 - C_0_1*w10 - C_0_2*w15 - C_0_3*w13 + tmp0 + tmp1;
2122                              const double tmp28_1 = C_1_0*w42;                              EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=-C_1_0*w16 - C_1_1*w14 - C_1_2*w11 - C_1_3*w17 + tmp14 + tmp15;
2123                              const double tmp63_1 = C_1_1*w42;                              EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp12 + tmp13 + tmp4 + tmp5;
2124                              const double tmp59_1 = C_0_3*w34;                              EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=C_0_0*w10 + C_0_1*w12 + C_0_2*w13 + C_0_3*w15 + tmp0 + tmp1;
2125                              const double tmp72_1 = C_1_3*w29;                              EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=-C_0_0*w10 - C_0_1*w12 - C_0_2*w13 - C_0_3*w15 + C_1_0*w14 + C_1_1*w16 + C_1_2*w17 + C_1_3*w11;
2126                              const double tmp40_1 = tmp2_0*w35;                              EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp2 + tmp3 + tmp4 + tmp5;
2127                              const double tmp13_1 = C_0_3*w30;                              EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=-C_1_0*w14 - C_1_1*w16 - C_1_2*w17 - C_1_3*w11 + tmp10 + tmp11;
2128                              const double tmp51_1 = C_1_2*w40;                              EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=C_1_0*w11 + C_1_1*w17 + C_1_2*w16 + C_1_3*w14 + tmp14 + tmp15;
2129                              const double tmp54_1 = C_1_2*w42;                              EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp12 + tmp13 + tmp8 + tmp9;
2130                              const double tmp12_1 = C_0_0*w31;                              EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=C_0_0*w15 + C_0_1*w13 + C_0_2*w12 + C_0_3*w10 - C_1_0*w11 - C_1_1*w17 - C_1_2*w16 - C_1_3*w14;
2131                              const double tmp2_1 = tmp1_0*w32;                              EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=-C_0_0*w15 - C_0_1*w13 - C_0_2*w12 - C_0_3*w10 + tmp6 + tmp7;
2132                              const double tmp68_1 = C_0_2*w31;                              EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp2 + tmp3 + tmp8 + tmp9;
2133                              const double tmp75_1 = C_1_0*w32;                              EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=C_1_0*w17 + C_1_1*w11 + C_1_2*w14 + C_1_3*w16 + tmp10 + tmp11;
2134                              const double tmp49_1 = C_1_1*w41;                              EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=C_0_0*w13 + C_0_1*w15 + C_0_2*w10 + C_0_3*w12 + tmp6 + tmp7;
2135                              const double tmp4_1 = C_0_2*w35;                              EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=-C_0_0*w13 - C_0_1*w15 - C_0_2*w10 - C_0_3*w12 - C_1_0*w17 - C_1_1*w11 - C_1_2*w14 - C_1_3*w16;
                             const double tmp66_1 = C_0_3*w28;  
                             const double tmp56_1 = C_0_1*w37;  
                             const double tmp5_1 = C_0_1*w34;  
                             const double tmp38_1 = tmp2_0*w34;  
                             const double tmp76_1 = C_0_1*w38;  
                             const double tmp21_1 = C_0_1*w28;  
                             const double tmp69_1 = C_0_1*w30;  
                             const double tmp53_1 = C_1_0*w36;  
                             const double tmp42_1 = C_1_2*w39;  
                             const double tmp32_1 = tmp1_0*w29;  
                             const double tmp45_1 = C_1_0*w43;  
                             const double tmp33_1 = tmp0_0*w32;  
                             const double tmp35_1 = C_1_0*w41;  
                             const double tmp26_1 = C_1_2*w36;  
                             const double tmp67_1 = C_0_0*w33;  
                             const double tmp31_1 = C_0_2*w34;  
                             const double tmp20_1 = C_0_0*w30;  
                             const double tmp70_1 = C_0_0*w28;  
                             const double tmp8_1 = tmp0_0*w39;  
                             const double tmp30_1 = C_1_3*w43;  
                             const double tmp0_1 = tmp0_0*w29;  
                             const double tmp17_1 = C_1_3*w41;  
                             const double tmp58_1 = C_0_0*w35;  
                             const double tmp9_1 = tmp3_0*w33;  
                             const double tmp61_1 = C_1_3*w36;  
                             const double tmp41_1 = tmp3_0*w34;  
                             const double tmp50_1 = C_1_3*w32;  
                             const double tmp18_1 = C_1_1*w32;  
                             const double tmp6_1 = tmp1_0*w36;  
                             const double tmp3_1 = C_0_0*w38;  
                             const double tmp34_1 = C_1_1*w29;  
                             const double tmp77_1 = C_0_3*w35;  
                             const double tmp65_1 = C_1_2*w43;  
                             const double tmp71_1 = C_0_3*w33;  
                             const double tmp55_1 = C_1_1*w43;  
                             const double tmp46_1 = tmp3_0*w28;  
                             const double tmp24_1 = C_0_0*w37;  
                             const double tmp10_1 = tmp1_0*w39;  
                             const double tmp48_1 = C_1_0*w29;  
                             const double tmp15_1 = C_0_1*w33;  
                             const double tmp36_1 = C_1_2*w32;  
                             const double tmp60_1 = C_1_0*w39;  
                             const double tmp47_1 = tmp2_0*w33;  
                             const double tmp16_1 = C_1_2*w29;  
                             const double tmp1_1 = C_0_3*w37;  
                             const double tmp7_1 = tmp2_0*w28;  
                             const double tmp39_1 = C_1_3*w40;  
                             const double tmp44_1 = C_1_3*w42;  
                             const double tmp57_1 = C_0_2*w38;  
                             const double tmp78_1 = C_0_0*w34;  
                             const double tmp11_1 = tmp0_0*w36;  
                             const double tmp23_1 = C_0_2*w33;  
                             EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=tmp16_1 + tmp17_1 + tmp18_1 + tmp19_1 + tmp20_1 + tmp21_1 + tmp22_1 + tmp23_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=tmp0_1 + tmp2_1 + tmp68_1 + tmp69_1 + tmp70_1 + tmp71_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=tmp46_1 + tmp47_1 + tmp48_1 + tmp49_1 + tmp50_1 + tmp51_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp32_1 + tmp33_1 + tmp7_1 + tmp9_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1 + tmp2_1 + tmp3_1 + tmp4_1 + tmp5_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=tmp72_1 + tmp73_1 + tmp74_1 + tmp75_1 + tmp76_1 + tmp77_1 + tmp78_1 + tmp79_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp32_1 + tmp33_1 + tmp40_1 + tmp41_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=tmp34_1 + tmp35_1 + tmp36_1 + tmp37_1 + tmp38_1 + tmp39_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=tmp42_1 + tmp43_1 + tmp44_1 + tmp45_1 + tmp46_1 + tmp47_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp6_1 + tmp7_1 + tmp8_1 + tmp9_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=tmp60_1 + tmp61_1 + tmp62_1 + tmp63_1 + tmp64_1 + tmp65_1 + tmp66_1 + tmp67_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=tmp10_1 + tmp11_1 + tmp12_1 + tmp13_1 + tmp14_1 + tmp15_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp40_1 + tmp41_1 + tmp6_1 + tmp8_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=tmp37_1 + tmp38_1 + tmp52_1 + tmp53_1 + tmp54_1 + tmp55_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=tmp10_1 + tmp11_1 + tmp56_1 + tmp57_1 + tmp58_1 + tmp59_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=tmp24_1 + tmp25_1 + tmp26_1 + tmp27_1 + tmp28_1 + tmp29_1 + tmp30_1 + tmp31_1;  
2136                          } else { // constant data                          } else { // constant data
2137                              const double C_0 = C_p[0];                              const double C_0 = C_p[0];
2138                              const double C_1 = C_p[1];                              const double C_1 = C_p[1];
2139                              const double tmp0_1 = C_0*w47;                              EM_S[INDEX2(0,0,4)]+= 2*C_0*w18 + 2*C_1*w19;
2140                              const double tmp1_1 = C_1*w45;                              EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=-2*C_0*w18 +   C_1*w19;
2141                              const double tmp2_1 = C_1*w48;                              EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=   C_0*w18 - 2*C_1*w19;
2142                              const double tmp3_1 = C_0*w51;                              EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=  -C_0*w18 -   C_1*w19;
2143                              const double tmp4_1 = C_0*w44;                              EM_S[INDEX2(1,0,4)]+= 2*C_0*w18 +   C_1*w19;
2144                              const double tmp5_1 = C_1*w49;                              EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=-2*C_0*w18 + 2*C_1*w19;
2145                              const double tmp6_1 = C_1*w50;                              EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=   C_0*w18 -   C_1*w19;
2146                              const double tmp7_1 = C_0*w46;                              EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=  -C_0*w18 - 2*C_1*w19;
2147                              EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=tmp4_1 + tmp5_1;                              EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=   C_0*w18 + 2*C_1*w19;
2148                              EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=tmp1_1 + tmp4_1;                              EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=  -C_0*w18 +   C_1*w19;
2149                              EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=tmp3_1 + tmp5_1;                              EM_S[INDEX2(2,2,4)]+= 2*C_0*w18 - 2*C_1*w19;
2150                              EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp1_1 + tmp3_1;                              EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=-2*C_0*w18 -   C_1*w19;
2151                              EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1;                              EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=   C_0*w18 +   C_1*w19;
2152                              EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=tmp0_1 + tmp5_1;                              EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=  -C_0*w18 + 2*C_1*w19;
2153                              EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp1_1 + tmp7_1;                              EM_S[INDEX2(3,2,4)]+= 2*C_0*w18 -   C_1*w19;
2154                              EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=tmp5_1 + tmp7_1;                              EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=-2*C_0*w18 - 2*C_1*w19;
                             EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=tmp3_1 + tmp6_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp2_1 + tmp3_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=tmp4_1 + tmp6_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=tmp2_1 + tmp4_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp2_1 + tmp7_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=tmp6_1 + tmp7_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=tmp0_1 + tmp2_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=tmp0_1 + tmp6_1;  
2155                          }                          }
2156                      }                      }
2157                      ///////////////                      ///////////////
# Line 2011  void Rectangle::assemblePDESingle(Paso_S Line 2165  void Rectangle::assemblePDESingle(Paso_S
2165                              const double D_1 = D_p[1];                              const double D_1 = D_p[1];
2166                              const double D_2 = D_p[2];                              const double D_2 = D_p[2];
2167                              const double D_3 = D_p[3];                              const double D_3 = D_p[3];
2168                              const double tmp0_0 = D_0 + D_1;                              const double tmp0 = w21*(D_2 + D_3);
2169                              const double tmp1_0 = D_2 + D_3;                              const double tmp1 = w20*(D_0 + D_1);
2170                              const double tmp2_0 = D_0 + D_1 + D_2 + D_3;                              const double tmp2 = w22*(D_0 + D_1 + D_2 + D_3);
2171                              const double tmp3_0 = D_1 + D_2;                              const double tmp3 = w21*(D_0 + D_1);
2172                              const double tmp4_0 = D_1 + D_3;                              const double tmp4 = w20*(D_2 + D_3);
2173                              const double tmp5_0 = D_0 + D_2;                              const double tmp5 = w22*(D_1 + D_2);
2174                              const double tmp6_0 = D_0 + D_3;                              const double tmp6 = w21*(D_0 + D_2);
2175                              const double tmp0_1 = tmp0_0*w52;                              const double tmp7 = w20*(D_1 + D_3);
2176                              const double tmp1_1 = tmp1_0*w53;                              const double tmp8 = w21*(D_1 + D_3);
2177                              const double tmp2_1 = tmp2_0*w54;                              const double tmp9 = w20*(D_0 + D_2);
2178                              const double tmp3_1 = tmp1_0*w52;                              const double tmp10 = w22*(D_0 + D_3);
2179                              const double tmp4_1 = tmp0_0*w53;                              EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=D_0*w23 + D_3*w24 + tmp5;
2180                              const double tmp5_1 = tmp3_0*w54;                              EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=tmp0 + tmp1;
2181                              const double tmp6_1 = D_0*w55;                              EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=tmp8 + tmp9;
2182                              const double tmp7_1 = D_3*w56;                              EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp2;
2183                              const double tmp8_1 = D_3*w55;                              EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=tmp0 + tmp1;
2184                              const double tmp9_1 = D_0*w56;                              EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=D_1*w23 + D_2*w24 + tmp10;
2185                              const double tmp10_1 = tmp4_0*w52;                              EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp2;
2186                              const double tmp11_1 = tmp5_0*w53;                              EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=tmp6 + tmp7;
2187                              const double tmp12_1 = tmp5_0*w52;                              EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=tmp8 + tmp9;
2188                              const double tmp13_1 = tmp4_0*w53;                              EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp2;
2189                              const double tmp14_1 = tmp6_0*w54;                              EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=D_1*w24 + D_2*w23 + tmp10;
2190                              const double tmp15_1 = D_2*w55;                              EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=tmp3 + tmp4;
2191                              const double tmp16_1 = D_1*w56;                              EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp2;
2192                              const double tmp17_1 = D_1*w55;                              EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=tmp6 + tmp7;
2193                              const double tmp18_1 = D_2*w56;                              EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=tmp3 + tmp4;
2194                              EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=tmp5_1 + tmp6_1 + tmp7_1;                              EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=D_0*w24 + D_3*w23 + tmp5;
                             EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=tmp12_1 + tmp13_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp2_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=tmp14_1 + tmp17_1 + tmp18_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp2_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=tmp10_1 + tmp11_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=tmp12_1 + tmp13_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp2_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=tmp14_1 + tmp15_1 + tmp16_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=tmp3_1 + tmp4_1;  
                             EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp2_1;  
                             EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=tmp10_1 + tmp11_1;  
                             EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=tmp3_1 + tmp4_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=tmp5_1 + tmp8_1 + tmp9_1;  
2195                          } else { // constant data                          } else { // constant data
2196                              const double tmp0_1 = D_p[0]*w57;                              const double D_0 = D_p[0];
2197                              const double tmp1_1 = D_p[0]*w58;                              EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=16*D_0*w22;
2198                              const double tmp2_1 = D_p[0]*w59;                              EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=8*D_0*w22;
2199                              EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=tmp2_1;                              EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=8*D_0*w22;
2200                              EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=tmp0_1;                              EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=4*D_0*w22;
2201                              EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=tmp0_1;                              EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=8*D_0*w22;
2202                              EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp1_1;                              EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=16*D_0*w22;
2203                              EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=tmp0_1;                              EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=4*D_0*w22;
2204                              EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=tmp2_1;                              EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=8*D_0*w22;
2205                              EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp1_1;                              EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=8*D_0*w22;
2206                              EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=tmp0_1;                              EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=4*D_0*w22;
2207                              EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=tmp0_1;                              EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=16*D_0*w22;
2208                              EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp1_1;                              EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=8*D_0*w22;
2209                              EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=tmp2_1;                              EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=4*D_0*w22;
2210                              EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=tmp0_1;                              EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=8*D_0*w22;
2211                              EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp1_1;                              EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=8*D_0*w22;
2212                              EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=tmp0_1;                              EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=16*D_0*w22;
                             EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=tmp0_1;  
                             EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=tmp2_1;  
2213                          }                          }
2214                      }                      }
2215                      ///////////////                      ///////////////
# Line 2090  void Rectangle::assemblePDESingle(Paso_S Line 2227  void Rectangle::assemblePDESingle(Paso_S
2227                              const double X_1_2 = X_p[INDEX2(1,2,2)];                              const double X_1_2 = X_p[INDEX2(1,2,2)];
2228                              const double X_0_3 = X_p[INDEX2(0,3,2)];                              const double X_0_3 = X_p[INDEX2(0,3,2)];
2229                              const double X_1_3 = X_p[INDEX2(1,3,2)];                              const double X_1_3 = X_p[INDEX2(1,3,2)];
2230                              const double tmp0_0 = X_0_2 + X_0_3;                              const double tmp0 = 6*w15*(X_0_2 + X_0_3);
2231                              const double tmp1_0 = X_1_1 + X_1_3;                              const double tmp1 = 6*w10*(X_0_0 + X_0_1);
2232                              const double tmp2_0 = X_1_0 + X_1_2;                              const double tmp2 = 6*w11*(X_1_0 + X_1_2);
2233                              const double tmp3_0 = X_0_0 + X_0_1;                              const double tmp3 = 6*w14*(X_1_1 + X_1_3);
2234                              const double tmp0_1 = tmp0_0*w63;                              const double tmp4 = 6*w11*(X_1_1 + X_1_3);
2235                              const double tmp1_1 = tmp1_0*w62;                              const double tmp5 = w25*(X_0_0 + X_0_1);
2236                              const double tmp2_1 = tmp2_0*w61;                              const double tmp6 = w26*(X_0_2 + X_0_3);
2237                              const double tmp3_1 = tmp3_0*w60;                              const double tmp7 = 6*w14*(X_1_0 + X_1_2);
2238                              const double tmp4_1 = tmp0_0*w65;                              const double tmp8 = w27*(X_1_0 + X_1_2);
2239                              const double tmp5_1 = tmp3_0*w64;                              const double tmp9 = w28*(X_1_1 + X_1_3);
2240                              const double tmp6_1 = tmp2_0*w62;                              const double tmp10 = w25*(-X_0_2 - X_0_3);
2241                              const double tmp7_1 = tmp1_0*w61;                              const double tmp11 = w26*(-X_0_0 - X_0_1);
2242                              const double tmp8_1 = tmp2_0*w66;                              const double tmp12 = w27*(X_1_1 + X_1_3);
2243                              const double tmp9_1 = tmp3_0*w63;                              const double tmp13 = w28*(X_1_0 + X_1_2);
2244                              const double tmp10_1 = tmp0_0*w60;                              const double tmp14 = w25*(X_0_2 + X_0_3);
2245                              const double tmp11_1 = tmp1_0*w67;                              const double tmp15 = w26*(X_0_0 + X_0_1);
2246                              const double tmp12_1 = tmp1_0*w66;                              EM_F[0]+=tmp0 + tmp1 + tmp2 + tmp3;
2247                              const double tmp13_1 = tmp3_0*w65;                              EM_F[1]+=tmp4 + tmp5 + tmp6 + tmp7;
2248                              const double tmp14_1 = tmp0_0*w64;                              EM_F[2]+=tmp10 + tmp11 + tmp8 + tmp9;
2249                              const double tmp15_1 = tmp2_0*w67;                              EM_F[3]+=tmp12 + tmp13 + tmp14 + tmp15;
                             EM_F[0]+=tmp0_1 + tmp1_1 + tmp2_1 + tmp3_1;  
                             EM_F[1]+=tmp4_1 + tmp5_1 + tmp6_1 + tmp7_1;  
                             EM_F[2]+=tmp10_1 + tmp11_1 + tmp8_1 + tmp9_1;  
                             EM_F[3]+=tmp12_1 + tmp13_1 + tmp14_1 + tmp15_1;  
2250                          } else { // constant data                          } else { // constant data
2251                              const double tmp0_1 = X_p[1]*w69;                              const double X_0 = X_p[0];
2252                              const double tmp1_1 = X_p[0]*w68;                              const double X_1 = X_p[1];
2253                              const double tmp2_1 = X_p[0]*w70;                              EM_F[0]+= 6*X_0*w18 + 6*X_1*w19;
2254                              const double tmp3_1 = X_p[1]*w71;                              EM_F[1]+=-6*X_0*w18 + 6*X_1*w19;
2255                              EM_F[0]+=tmp0_1 + tmp1_1;                              EM_F[2]+= 6*X_0*w18 - 6*X_1*w19;
2256                              EM_F[1]+=tmp0_1 + tmp2_1;                              EM_F[3]+=-6*X_0*w18 - 6*X_1*w19;
                             EM_F[2]+=tmp1_1 + tmp3_1;  
                             EM_F[3]+=tmp2_1 + tmp3_1;  
2257                          }                          }
2258                      }                      }
2259                      ///////////////                      ///////////////
# Line 2136  void Rectangle::assemblePDESingle(Paso_S Line 2267  void Rectangle::assemblePDESingle(Paso_S
2267                              const double Y_1 = Y_p[1];                              const double Y_1 = Y_p[1];
2268                              const double Y_2 = Y_p[2];                              const double Y_2 = Y_p[2];
2269                              const double Y_3 = Y_p[3];                              const double Y_3 = Y_p[3];
2270                              const double tmp0_0 = Y_1 + Y_2;                              const double tmp0 = 6*w22*(Y_1 + Y_2);
2271                              const double tmp1_0 = Y_0 + Y_3;                              const double tmp1 = 6*w22*(Y_0 + Y_3);
2272                              const double tmp0_1 = Y_0*w72;                              EM_F[0]+=6*Y_0*w20 + 6*Y_3*w21 + tmp0;
2273                              const double tmp1_1 = tmp0_0*w73;                              EM_F[1]+=6*Y_1*w20 + 6*Y_2*w21 + tmp1;
2274                              const double tmp2_1 = Y_3*w74;                              EM_F[2]+=6*Y_1*w21 + 6*Y_2*w20 + tmp1;
2275                              const double tmp3_1 = Y_1*w72;                              EM_F[3]+=6*Y_0*w21 + 6*Y_3*w20 + tmp0;
                             const double tmp4_1 = tmp1_0*w73;  
                             const double tmp5_1 = Y_2*w74;  
                             const double tmp6_1 = Y_2*w72;  
                             const double tmp7_1 = Y_1*w74;  
                             const double tmp8_1 = Y_3*w72;  
                             const double tmp9_1 = Y_0*w74;  
                             EM_F[0]+=tmp0_1 + tmp1_1 + tmp2_1;  
                             EM_F[1]+=tmp3_1 + tmp4_1 + tmp5_1;  
                             EM_F[2]+=tmp4_1 + tmp6_1 + tmp7_1;  
                             EM_F[3]+=tmp1_1 + tmp8_1 + tmp9_1;  
2276                          } else { // constant data                          } else { // constant data
2277                              const double tmp0_1 = Y_p[0]*w75;                              EM_F[0]+=36*Y_p[0]*w22;
2278                              EM_F[0]+=tmp0_1;                              EM_F[1]+=36*Y_p[0]*w22;
2279                              EM_F[1]+=tmp0_1;                              EM_F[2]+=36*Y_p[0]*w22;
2280                              EM_F[2]+=tmp0_1;                              EM_F[3]+=36*Y_p[0]*w22;
                             EM_F[3]+=tmp0_1;  
2281                          }                          }
2282                      }                      }
2283    
2284                      // add to matrix (if add_EM_S) and RHS (if add_EM_F)                      // add to matrix (if add_EM_S) and RHS (if add_EM_F)
2285                      const index_t firstNode=m_N0*k1+k0;                      const index_t firstNode=m_NN[0]*k1+k0;
2286                      addToMatrixAndRHS(mat, rhs, EM_S, EM_F, add_EM_S, add_EM_F, firstNode);                      addToMatrixAndRHS(mat, rhs, EM_S, EM_F, add_EM_S, add_EM_F, firstNode);
2287                  } // end k0 loop                  } // end k0 loop
2288              } // end k1 loop              } // end k1 loop
# Line 2176  void Rectangle::assemblePDESingleReduced Line 2296  void Rectangle::assemblePDESingleReduced
2296          const escript::Data& C, const escript::Data& D,          const escript::Data& C, const escript::Data& D,
2297          const escript::Data& X, const escript::Data& Y) const          const escript::Data& X, const escript::Data& Y) const
2298  {  {
2299      const double h0 = m_l0/m_gNE0;      const double w0 = 1./4;
2300      const double h1 = m_l1/m_gNE1;      const double w1 = m_dx[0]/8;
2301      const double w0 = -.25*h1/h0;      const double w2 = m_dx[1]/8;
2302      const double w1 = .25;      const double w3 = m_dx[0]*m_dx[1]/16;
2303      const double w2 = -.25;      const double w4 = m_dx[0]/(4*m_dx[1]);
2304      const double w3 = .25*h0/h1;      const double w5 = m_dx[1]/(4*m_dx[0]);
     const double w4 = -.25*h0/h1;  
     const double w5 = .25*h1/h0;  
     const double w6 = -.125*h1;  
     const double w7 = -.125*h0;  
     const double w8 = .125*h1;  
     const double w9 = .125*h0;  
     const double w10 = .0625*h0*h1;  
     const double w11 = -.5*h1;  
     const double w12 = -.5*h0;  
     const double w13 = .5*h1;  
     const double w14 = .5*h0;  
     const double w15 = .25*h0*h1;  
2305    
2306      rhs.requireWrite();      rhs.requireWrite();
2307  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
2308      {      {
2309          for (index_t k1_0=0; k1_0<2; k1_0++) { // colouring          for (index_t k1_0=0; k1_0<2; k1_0++) { // colouring
2310  #pragma omp for  #pragma omp for
2311              for (index_t k1=k1_0; k1<m_NE1; k1+=2) {              for (index_t k1=k1_0; k1<m_NE[1]; k1+=2) {
2312                  for (index_t k0=0; k0<m_NE0; ++k0)  {                  for (index_t k0=0; k0<m_NE[0]; ++k0)  {
2313                      bool add_EM_S=false;                      bool add_EM_S=false;
2314                      bool add_EM_F=false;                      bool add_EM_F=false;
2315                      vector<double> EM_S(4*4, 0);                      vector<double> EM_S(4*4, 0);
2316                      vector<double> EM_F(4, 0);                      vector<double> EM_F(4, 0);
2317                      const index_t e = k0 + m_NE0*k1;                      const index_t e = k0 + m_NE[0]*k1;
2318                      ///////////////                      ///////////////
2319                      // process A //                      // process A //
2320                      ///////////////                      ///////////////
# Line 2217  void Rectangle::assemblePDESingleReduced Line 2325  void Rectangle::assemblePDESingleReduced
2325                          const double A_10 = A_p[INDEX2(1,0,2)];                          const double A_10 = A_p[INDEX2(1,0,2)];
2326                          const double A_01 = A_p[INDEX2(0,1,2)];                          const double A_01 = A_p[INDEX2(0,1,2)];
2327                          const double A_11 = A_p[INDEX2(1,1,2)];                          const double A_11 = A_p[INDEX2(1,1,2)];
2328                          const double tmp0_0 = A_01 + A_10;                          const double tmp0 = (A_01 + A_10)*w0;
2329                          const double tmp0_1 = A_11*w3;                          const double tmp1 = A_00*w5;
2330                          const double tmp1_1 = A_00*w0;                          const double tmp2 = A_01*w0;
2331                          const double tmp2_1 = A_01*w1;                          const double tmp3 = A_10*w0;
2332                          const double tmp3_1 = A_10*w2;                          const double tmp4 = A_11*w4;
2333                          const double tmp4_1 = tmp0_0*w1;                          EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=tmp4 + tmp0 + tmp1;
2334                          const double tmp5_1 = A_11*w4;                          EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=tmp4 - tmp1 + tmp3 - tmp2;
2335                          const double tmp6_1 = A_00*w5;                          EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=tmp2 - tmp3 - tmp4 + tmp1;
2336                          const double tmp7_1 = tmp0_0*w2;                          EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=-tmp1 - tmp4 - tmp0;
2337                          const double tmp8_1 = A_10*w1;                          EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=tmp4 - tmp1 + tmp2 - tmp3;
2338                          const double tmp9_1 = A_01*w2;                          EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=tmp4 + tmp1 - tmp0;
2339                          EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=tmp0_1 + tmp4_1 + tmp6_1;                          EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=-tmp1 + tmp0 - tmp4;
2340                          EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1 + tmp8_1 + tmp9_1;                          EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=-tmp4 + tmp1 + tmp3 - tmp2;
2341                          EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=tmp2_1 + tmp3_1 + tmp5_1 + tmp6_1;                          EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=-tmp4 + tmp1 + tmp3 - tmp2;
2342                          EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp1_1 + tmp5_1 + tmp7_1;                          EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=-tmp1 + tmp0 - tmp4;
2343                          EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1 + tmp2_1 + tmp3_1;                          EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=tmp4 + tmp1 - tmp0;
2344                          EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=tmp0_1 + tmp6_1 + tmp7_1;                          EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=tmp4 - tmp1 + tmp2 - tmp3;
2345                          EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp1_1 + tmp4_1 + tmp5_1;                          EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=-tmp1 - tmp4 - tmp0;
2346                          EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=tmp5_1 + tmp6_1 + tmp8_1 + tmp9_1;                          EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=tmp2 - tmp3 - tmp4 + tmp1;
2347                          EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=tmp5_1 + tmp6_1 + tmp8_1 + tmp9_1;                          EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=tmp4 - tmp1 + tmp3 - tmp2;
2348                          EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp1_1 + tmp4_1 + tmp5_1;                          EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=tmp4 + tmp0 + tmp1;
                         EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=tmp0_1 + tmp6_1 + tmp7_1;  
                         EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1 + tmp2_1 + tmp3_1;  
                         EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp1_1 + tmp5_1 + tmp7_1;  
                         EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=tmp2_1 + tmp3_1 + tmp5_1 + tmp6_1;  
                         EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1 + tmp8_1 + tmp9_1;  
                         EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=tmp0_1 + tmp4_1 + tmp6_1;  
2349                      }                      }
2350                      ///////////////                      ///////////////
2351                      // process B //                      // process B //
# Line 2251  void Rectangle::assemblePDESingleReduced Line 2353  void Rectangle::assemblePDESingleReduced
2353                      if (!B.isEmpty()) {                      if (!B.isEmpty()) {
2354                          add_EM_S=true;                          add_EM_S=true;
2355                          const double* B_p=const_cast<escript::Data*>(&B)->getSampleDataRO(e);                          const double* B_p=const_cast<escript::Data*>(&B)->getSampleDataRO(e);
2356                          const double tmp2_1 = B_p[0]*w8;                          const double tmp0 = B_p[0]*w2;
2357                          const double tmp0_1 = B_p[0]*w6;                          const double tmp1 = B_p[1]*w1;
2358                          const double tmp3_1 = B_p[1]*w9;                          EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=-tmp0 - tmp1;
2359                          const double tmp1_1 = B_p[1]*w7;                          EM_S[INDEX2(1,0,4)]+= tmp0 - tmp1;
2360                          EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1;                          EM_S[INDEX2(2,0,4)]+= tmp1 - tmp0;
2361                          EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=tmp1_1 + tmp2_1;                          EM_S[INDEX2(3,0,4)]+= tmp0 + tmp1;
2362                          EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=tmp0_1 + tmp3_1;                          EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=-tmp0 - tmp1;
2363                          EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp2_1 + tmp3_1;                          EM_S[INDEX2(1,1,4)]+= tmp0 - tmp1;
2364                          EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1;                          EM_S[INDEX2(2,1,4)]+= tmp1 - tmp0;
2365                          EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=tmp1_1 + tmp2_1;                          EM_S[INDEX2(3,1,4)]+= tmp0 + tmp1;
2366                          EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp0_1 + tmp3_1;                          EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=-tmp0 - tmp1;
2367                          EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=tmp2_1 + tmp3_1;                          EM_S[INDEX2(1,2,4)]+= tmp0 - tmp1;
2368                          EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1;                          EM_S[INDEX2(2,2,4)]+= tmp1 - tmp0;
2369                          EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp1_1 + tmp2_1;                          EM_S[INDEX2(3,2,4)]+= tmp0 + tmp1;
2370                          EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=tmp0_1 + tmp3_1;                          EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=-tmp0 - tmp1;
2371                          EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=tmp2_1 + tmp3_1;                          EM_S[INDEX2(1,3,4)]+= tmp0 - tmp1;
2372                          EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1;                          EM_S[INDEX2(2,3,4)]+= tmp1 - tmp0;
2373                          EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=tmp1_1 + tmp2_1;                          EM_S[INDEX2(3,3,4)]+= tmp0 + tmp1;
                         EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=tmp0_1 + tmp3_1;  
                         EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=tmp2_1 + tmp3_1;  
2374                      }                      }
2375                      ///////////////                      ///////////////
2376                      // process C //                      // process C //
# Line 2278  void Rectangle::assemblePDESingleReduced Line 2378  void Rectangle::assemblePDESingleReduced
2378                      if (!C.isEmpty()) {                      if (!C.isEmpty()) {
2379                          add_EM_S=true;                          add_EM_S=true;
2380                          const double* C_p=const_cast<escript::Data*>(&C)->getSampleDataRO(e);                          const double* C_p=const_cast<escript::Data*>(&C)->getSampleDataRO(e);
2381                          const double tmp1_1 = C_p[1]*w7;                          const double tmp0 = C_p[0]*w2;
2382                          const double tmp0_1 = C_p[0]*w8;                          const double tmp1 = C_p[1]*w1;
2383                          const double tmp3_1 = C_p[0]*w6;                          EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=-tmp1 - tmp0;
2384                          const double tmp2_1 = C_p[1]*w9;                          EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=-tmp1 - tmp0;
2385                          EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=tmp1_1 + tmp3_1;                          EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=-tmp1 - tmp0;
2386                          EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=tmp1_1 + tmp3_1;                          EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=-tmp1 - tmp0;
2387                          EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=tmp1_1 + tmp3_1;                          EM_S[INDEX2(0,1,4)]+= tmp0 - tmp1;
2388                          EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp1_1 + tmp3_1;                          EM_S[INDEX2(1,1,4)]+= tmp0 - tmp1;
2389                          EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1;                          EM_S[INDEX2(2,1,4)]+= tmp0 - tmp1;
2390                          EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1;                          EM_S[INDEX2(3,1,4)]+= tmp0 - tmp1;
2391                          EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1;                          EM_S[INDEX2(0,2,4)]+= tmp1 - tmp0;
2392                          EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1;                          EM_S[INDEX2(1,2,4)]+= tmp1 - tmp0;
2393                          EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=tmp2_1 + tmp3_1;                          EM_S[INDEX2(2,2,4)]+= tmp1 - tmp0;
2394                          EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp2_1 + tmp3_1;                          EM_S[INDEX2(3,2,4)]+= tmp1 - tmp0;
2395                          EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=tmp2_1 + tmp3_1;                          EM_S[INDEX2(0,3,4)]+= tmp0 + tmp1;
2396                          EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=tmp2_1 + tmp3_1;                          EM_S[INDEX2(1,3,4)]+= tmp0 + tmp1;
2397                          EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp0_1 + tmp2_1;                          EM_S[INDEX2(2,3,4)]+= tmp0 + tmp1;
2398                          EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=tmp0_1 + tmp2_1;                          EM_S[INDEX2(3,3,4)]+= tmp0 + tmp1;
                         EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=tmp0_1 + tmp2_1;  
                         EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=tmp0_1 + tmp2_1;  
2399                      }                      }
2400                      ///////////////                      ///////////////
2401                      // process D //                      // process D //
# Line 2305  void Rectangle::assemblePDESingleReduced Line 2403  void Rectangle::assemblePDESingleReduced
2403                      if (!D.isEmpty()) {                      if (!D.isEmpty()) {
2404                          add_EM_S=true;                          add_EM_S=true;
2405                          const double* D_p=const_cast<escript::Data*>(&D)->getSampleDataRO(e);                          const double* D_p=const_cast<escript::Data*>(&D)->getSampleDataRO(e);
2406                          const double tmp0_1 = D_p[0]*w10;                          EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=D_p[0]*w3;
2407                          EM_S[INDEX2(0,0,4)]+=tmp0_1;                          EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=D_p[0]*w3;
2408                          EM_S[INDEX2(1,0,4)]+=tmp0_1;                          EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=D_p[0]*w3;
2409                          EM_S[INDEX2(2,0,4)]+=tmp0_1;                          EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=D_p[0]*w3;
2410                          EM_S[INDEX2(3,0,4)]+=tmp0_1;                          EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=D_p[0]*w3;
2411                          EM_S[INDEX2(0,1,4)]+=tmp0_1;                          EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=D_p[0]*w3;
2412                          EM_S[INDEX2(1,1,4)]+=tmp0_1;                          EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=D_p[0]*w3;
2413                          EM_S[INDEX2(2,1,4)]+=tmp0_1;                          EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=D_p[0]*w3;
2414                          EM_S[INDEX2(3,1,4)]+=tmp0_1;                          EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=D_p[0]*w3;
2415                          EM_S[INDEX2(0,2,4)]+=tmp0_1;                          EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=D_p[0]*w3;
2416                          EM_S[INDEX2(1,2,4)]+=tmp0_1;                          EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=D_p[0]*w3;
2417                          EM_S[INDEX2(2,2,4)]+=tmp0_1;                          EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=D_p[0]*w3;
2418                          EM_S[INDEX2(3,2,4)]+=tmp0_1;                          EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=D_p[0]*w3;
2419                          EM_S[INDEX2(0,3,4)]+=tmp0_1;                          EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=D_p[0]*w3;
2420                          EM_S[INDEX2(1,3,4)]+=tmp0_1;                          EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=D_p[0]*w3;
2421                          EM_S[INDEX2(2,3,4)]+=tmp0_1;                          EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=D_p[0]*w3;
                         EM_S[INDEX2(3,3,4)]+=tmp0_1;  
2422                      }                      }
2423                      ///////////////                      ///////////////
2424                      // process X //                      // process X //
# Line 2329  void Rectangle::assemblePDESingleReduced Line 2426  void Rectangle::assemblePDESingleReduced
2426                      if (!X.isEmpty()) {                      if (!X.isEmpty()) {
2427                          add_EM_F=true;                          add_EM_F=true;
2428                          const double* X_p=const_cast<escript::Data*>(&X)->getSampleDataRO(e);                          const double* X_p=const_cast<escript::Data*>(&X)->getSampleDataRO(e);
2429                          const double tmp0_1 = X_p[0]*w11;                          const double wX0 = 4*X_p[0]*w2;
2430                          const double tmp2_1 = X_p[0]*w13;                          const double wX1 = 4*X_p[1]*w1;
2431                          const double tmp1_1 = X_p[1]*w12;                          EM_F[0]+=-wX0 - wX1;
2432                          const double tmp3_1 = X_p[1]*w14;                          EM_F[1]+=-wX1 + wX0;
2433                          EM_F[0]+=tmp0_1 + tmp1_1;                          EM_F[2]+=-wX0 + wX1;
2434                          EM_F[1]+=tmp1_1 + tmp2_1;                          EM_F[3]+= wX0 + wX1;
                         EM_F[2]+=tmp0_1 + tmp3_1;  
                         EM_F[3]+=tmp2_1 + tmp3_1;  
2435                      }                      }
2436                      ///////////////                      ///////////////
2437                      // process Y //                      // process Y //
# Line 2344  void Rectangle::assemblePDESingleReduced Line 2439  void Rectangle::assemblePDESingleReduced
2439                      if (!Y.isEmpty()) {                      if (!Y.isEmpty()) {
2440                          add_EM_F=true;                          add_EM_F=true;
2441                          const double* Y_p=const_cast<escript::Data*>(&Y)->getSampleDataRO(e);                          const double* Y_p=const_cast<escript::Data*>(&Y)->getSampleDataRO(e);
2442                          const double tmp0_1 = Y_p[0]*w15;                          EM_F[0]+=4*Y_p[0]*w3;
2443                          EM_F[0]+=tmp0_1;                          EM_F[1]+=4*Y_p[0]*w3;
2444                          EM_F[1]+=tmp0_1;                          EM_F[2]+=4*Y_p[0]*w3;
2445                          EM_F[2]+=tmp0_1;                          EM_F[3]+=4*Y_p[0]*w3;
                         EM_F[3]+=tmp0_1;  
2446                      }                      }
2447    
2448                      // add to matrix (if add_EM_S) and RHS (if add_EM_F)                      // add to matrix (if add_EM_S) and RHS (if add_EM_F)
2449                      const index_t firstNode=m_N0*k1+k0;                      const index_t firstNode=m_NN[0]*k1+k0;
2450                      addToMatrixAndRHS(mat, rhs, EM_S, EM_F, add_EM_S, add_EM_F, firstNode);                      addToMatrixAndRHS(mat, rhs, EM_S, EM_F, add_EM_S, add_EM_F, firstNode);
2451                  } // end k0 loop                  } // end k0 loop
2452              } // end k1 loop              } // end k1 loop
# Line 2366  void Rectangle::assemblePDESystem(Paso_S Line 2460  void Rectangle::assemblePDESystem(Paso_S
2460          const escript::Data& C, const escript::Data& D,          const escript::Data& C, const escript::Data& D,
2461          const escript::Data& X, const escript::Data& Y) const          const escript::Data& X, const escript::Data& Y) const
2462  {  {
     const double h0 = m_l0/m_gNE0;  
     const double h1 = m_l1/m_gNE1;  
2463      dim_t numEq, numComp;      dim_t numEq, numComp;
2464      if (!mat)      if (!mat)
2465          numEq=numComp=(rhs.isEmpty() ? 1 : rhs.getDataPointSize());          numEq=numComp=(rhs.isEmpty() ? 1 : rhs.getDataPointSize());
# Line 2375  void Rectangle::assemblePDESystem(Paso_S Line 2467  void Rectangle::assemblePDESystem(Paso_S
2467          numEq=mat->logical_row_block_size;          numEq=mat->logical_row_block_size;
2468          numComp=mat->logical_col_block_size;          numComp=mat->logical_col_block_size;
2469      }      }
2470        const double SQRT3 = 1.73205080756887719318;
2471      const double w0 = -0.1555021169820365539*h1/h0;      const double w1 = 1.0/24;
2472      const double w1 = 0.041666666666666666667;      const double w5 = -SQRT3/24 + 1.0/12;
2473      const double w2 = -0.15550211698203655390;      const double w2 = -SQRT3/24 - 1.0/12;
2474      const double w3 = 0.041666666666666666667*h0/h1;      const double w19 = -m_dx[0]/12;
2475      const double w4 = 0.15550211698203655390;      const double w11 = w19*(SQRT3 + 3)/12;
2476      const double w5 = -0.041666666666666666667;      const double w14 = w19*(-SQRT3 + 3)/12;
2477      const double w6 = -0.01116454968463011277*h1/h0;      const double w16 = w19*(5*SQRT3 + 9)/12;
2478      const double w7 = 0.011164549684630112770;      const double w17 = w19*(-5*SQRT3 + 9)/12;
2479      const double w8 = -0.011164549684630112770;      const double w27 = w19*(-SQRT3 - 3)/2;
2480      const double w9 = -0.041666666666666666667*h1/h0;      const double w28 = w19*(SQRT3 - 3)/2;
2481      const double w10 = -0.041666666666666666667*h0/h1;      const double w18 = -m_dx[1]/12;
2482      const double w11 = 0.1555021169820365539*h1/h0;      const double w10 = w18*(SQRT3 + 3)/12;
2483      const double w12 = 0.1555021169820365539*h0/h1;      const double w15 = w18*(-SQRT3 + 3)/12;
2484      const double w13 = 0.01116454968463011277*h0/h1;      const double w12 = w18*(5*SQRT3 + 9)/12;
2485      const double w14 = 0.01116454968463011277*h1/h0;      const double w13 = w18*(-5*SQRT3 + 9)/12;
2486      const double w15 = 0.041666666666666666667*h1/h0;      const double w25 = w18*(-SQRT3 - 3)/2;
2487      const double w16 = -0.01116454968463011277*h0/h1;      const double w26 = w18*(SQRT3 - 3)/2;
2488      const double w17 = -0.1555021169820365539*h0/h1;      const double w22 = m_dx[0]*m_dx[1]/144;
2489      const double w18 = -0.33333333333333333333*h1/h0;      const double w20 = w22*(SQRT3 + 2);
2490      const double w19 = 0.25000000000000000000;      const double w21 = w22*(-SQRT3 + 2);
2491      const double w20 = -0.25000000000000000000;      const double w23 = w22*(4*SQRT3 + 7);
2492      const double w21 = 0.16666666666666666667*h0/h1;      const double w24 = w22*(-4*SQRT3 + 7);
2493      const double w22 = -0.16666666666666666667*h1/h0;      const double w3 = m_dx[0]/(24*m_dx[1]);
2494      const double w23 = -0.16666666666666666667*h0/h1;      const double w7 = w3*(SQRT3 + 2);
2495      const double w24 = 0.33333333333333333333*h1/h0;      const double w8 = w3*(-SQRT3 + 2);
2496      const double w25 = 0.33333333333333333333*h0/h1;      const double w6 = -m_dx[1]/(24*m_dx[0]);
2497      const double w26 = 0.16666666666666666667*h1/h0;      const double w0 = w6*(SQRT3 + 2);
2498      const double w27 = -0.33333333333333333333*h0/h1;      const double w4 = w6*(-SQRT3 + 2);
     const double w28 = -0.032861463941450536761*h1;  
     const double w29 = -0.032861463941450536761*h0;  
     const double w30 = -0.12264065304058601714*h1;  
     const double w31 = -0.0023593469594139828636*h1;  
     const double w32 = -0.008805202725216129906*h0;  
     const double w33 = -0.008805202725216129906*h1;  
     const double w34 = 0.032861463941450536761*h1;  
     const double w35 = 0.008805202725216129906*h1;  
     const double w36 = 0.008805202725216129906*h0;  
     const double w37 = 0.0023593469594139828636*h1;  
     const double w38 = 0.12264065304058601714*h1;  
     const double w39 = 0.032861463941450536761*h0;  
     const double w40 = -0.12264065304058601714*h0;  
     const double w41 = -0.0023593469594139828636*h0;  
     const double w42 = 0.0023593469594139828636*h0;  
     const double w43 = 0.12264065304058601714*h0;  
     const double w44 = -0.16666666666666666667*h1;  
     const double w45 = -0.083333333333333333333*h0;  
     const double w46 = 0.083333333333333333333*h1;  
     const double w47 = 0.16666666666666666667*h1;  
     const double w48 = 0.083333333333333333333*h0;  
     const double w49 = -0.16666666666666666667*h0;  
     const double w50 = 0.16666666666666666667*h0;  
     const double w51 = -0.083333333333333333333*h1;  
     const double w52 = 0.025917019497006092316*h0*h1;  
     const double w53 = 0.0018607582807716854616*h0*h1;  
     const double w54 = 0.0069444444444444444444*h0*h1;  
     const double w55 = 0.09672363354357992482*h0*h1;  
     const double w56 = 0.00049858867864229740201*h0*h1;  
     const double w57 = 0.055555555555555555556*h0*h1;  
     const double w58 = 0.027777777777777777778*h0*h1;  
     const double w59 = 0.11111111111111111111*h0*h1;  
     const double w60 = -0.19716878364870322056*h1;  
     const double w61 = -0.19716878364870322056*h0;  
     const double w62 = -0.052831216351296779436*h0;  
     const double w63 = -0.052831216351296779436*h1;  
     const double w64 = 0.19716878364870322056*h1;  
     const double w65 = 0.052831216351296779436*h1;  
     const double w66 = 0.19716878364870322056*h0;  
     const double w67 = 0.052831216351296779436*h0;  
     const double w68 = -0.5*h1;  
     const double w69 = -0.5*h0;  
     const double w70 = 0.5*h1;  
     const double w71 = 0.5*h0;  
     const double w72 = 0.1555021169820365539*h0*h1;  
     const double w73 = 0.041666666666666666667*h0*h1;  
     const double w74 = 0.01116454968463011277*h0*h1;  
     const double w75 = 0.25*h0*h1;  
2499    
2500      rhs.requireWrite();      rhs.requireWrite();
2501  #pragma omp parallel  #pragma omp parallel
2502      {      {
2503          for (index_t k1_0=0; k1_0<2; k1_0++) { // colouring          for (index_t k1_0=0; k1_0<2; k1_0++) { // colouring
2504  #pragma omp for  #pragma omp for
2505              for (index_t k1=k1_0; k1<m_NE1; k1+=2) {              for (index_t k1=k1_0; k1<m_NE[1]; k1+=2) {
2506                  for (index_t k0=0; k0<m_NE0; ++k0)  {                  for (index_t k0=0; k0<m_NE[0]; ++k0)  {
2507                      bool add_EM_S=false;                      bool add_EM_S=false;
2508                      bool add_EM_F=false;                      bool add_EM_F=false;
2509                      vector<double> EM_S(4*4*numEq*numComp, 0);                      vector<double> EM_S(4*4*numEq*numComp, 0);
2510                      vector<double> EM_F(4*numEq, 0);                      vector<double> EM_F(4*numEq, 0);
2511                      const index_t e = k0 + m_NE0*k1;                      const index_t e = k0 + m_NE[0]*k1;
2512                      ///////////////                      ///////////////
2513                      // process A //                      // process A //
2514                      ///////////////                      ///////////////
2515                      if (!A.isEmpty()) {                      if (!A.isEmpty()) {
2516                          add_EM_S=true;                          add_EM_S = true;
2517                          const double* A_p=const_cast<escript::Data*>(&A)->getSampleDataRO(e);                          const double* A_p = const_cast<escript::Data*>(&A)->getSampleDataRO(e);
2518                          if (A.actsExpanded()) {                          if (A.actsExpanded()) {
2519                              for (index_t k=0; k<numEq; k++) {                              for (index_t k=0; k<numEq; k++) {
2520                                  for (index_t m=0; m<numComp; m++) {                                  for (index_t m=0; m<numComp; m++) {
2521                                      const double A_00_0 = A_p[INDEX5(k,0,m,0,0, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_00_0 = A_p[INDEX5(k,0,m,0,0,numEq,2,numComp,2)];
2522                                      const double A_01_0 = A_p[INDEX5(k,0,m,1,0, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_01_0 = A_p[INDEX5(k,0,m,1,0,numEq,2,numComp,2)];
2523                                      const double A_10_0 = A_p[INDEX5(k,1,m,0,0, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_10_0 = A_p[INDEX5(k,1,m,0,0,numEq,2,numComp,2)];
2524                                      const double A_11_0 = A_p[INDEX5(k,1,m,1,0, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_11_0 = A_p[INDEX5(k,1,m,1,0,numEq,2,numComp,2)];
2525                                      const double A_00_1 = A_p[INDEX5(k,0,m,0,1, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_00_1 = A_p[INDEX5(k,0,m,0,1,numEq,2,numComp,2)];
2526                                      const double A_01_1 = A_p[INDEX5(k,0,m,1,1, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_01_1 = A_p[INDEX5(k,0,m,1,1,numEq,2,numComp,2)];
2527                                      const double A_10_1 = A_p[INDEX5(k,1,m,0,1, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_10_1 = A_p[INDEX5(k,1,m,0,1,numEq,2,numComp,2)];
2528                                      const double A_11_1 = A_p[INDEX5(k,1,m,1,1, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_11_1 = A_p[INDEX5(k,1,m,1,1,numEq,2,numComp,2)];
2529                                      const double A_00_2 = A_p[INDEX5(k,0,m,0,2, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_00_2 = A_p[INDEX5(k,0,m,0,2,numEq,2,numComp,2)];
2530                                      const double A_01_2 = A_p[INDEX5(k,0,m,1,2, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_01_2 = A_p[INDEX5(k,0,m,1,2,numEq,2,numComp,2)];
2531                                      const double A_10_2 = A_p[INDEX5(k,1,m,0,2, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_10_2 = A_p[INDEX5(k,1,m,0,2,numEq,2,numComp,2)];
2532                                      const double A_11_2 = A_p[INDEX5(k,1,m,1,2, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_11_2 = A_p[INDEX5(k,1,m,1,2,numEq,2,numComp,2)];
2533                                      const double A_00_3 = A_p[INDEX5(k,0,m,0,3, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_00_3 = A_p[INDEX5(k,0,m,0,3,numEq,2,numComp,2)];
2534                                      const double A_01_3 = A_p[INDEX5(k,0,m,1,3, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_01_3 = A_p[INDEX5(k,0,m,1,3,numEq,2,numComp,2)];
2535                                      const double A_10_3 = A_p[INDEX5(k,1,m,0,3, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_10_3 = A_p[INDEX5(k,1,m,0,3,numEq,2,numComp,2)];
2536                                      const double A_11_3 = A_p[INDEX5(k,1,m,1,3, numEq,2,numComp,2)];                                      const double A_11_3 = A_p[INDEX5(k,1,m,1,3,numEq,2,numComp,2)];
2537                                      const double tmp0_0 = A_01_0 + A_01_3;                                      const double tmp0 = w3*(A_11_0 + A_11_1 + A_11_2 + A_11_3);
2538                                      const double tmp1_0 = A_00_0 + A_00_1;                                      const double tmp1 = w1*(A_01_0 + A_01_3 - A_10_1 - A_10_2);
2539                                      const double tmp2_0 = A_11_0 + A_11_1 + A_11_2 + A_11_3;                                      const double tmp2 = w4*(A_00_2 + A_00_3);
2540                                      const double tmp3_0 = A_00_2 + A_00_3;                                      const double tmp3 = w0*(A_00_0 + A_00_1);
2541                                      const double tmp4_0 = A_10_1 + A_10_2;                                      const double tmp4 = w5*(A_01_2 - A_10_3);
2542                                      const double tmp5_0 = A_00_0 + A_00_1 + A_00_2 + A_00_3;                                      const double tmp5 = w2*(-A_01_1 + A_10_0);
2543                                      const double tmp6_0 = A_01_3 + A_10_0;                                      const double tmp6 = w5*(A_01_3 + A_10_0);
2544                                      const double tmp7_0 = A_01_0 + A_10_3;                                      const double tmp7 = w3*(-A_11_0 - A_11_1 - A_11_2 - A_11_3);
2545                                      const double tmp8_0 = A_01_1 + A_01_2 + A_10_1 + A_10_2;                                      const double tmp8 = w6*(A_00_0 + A_00_1 + A_00_2 + A_00_3);
2546                                      const double tmp9_0 = A_01_0 + A_10_0;                                      const double tmp9 = w1*(A_01_1 + A_01_2 + A_10_1 + A_10_2);
2547                                      const double tmp10_0 = A_01_3 + A_10_3;                                      const double tmp10 = w2*(-A_01_0 - A_10_3);
2548                                      const double tmp11_0 = A_11_1 + A_11_3;                                      const double tmp11 = w4*(A_00_0 + A_00_1);
2549                                      const double tmp12_0 = A_11_0 + A_11_2;                                      const double tmp12 = w0*(A_00_2 + A_00_3);
2550                                      const double tmp13_0 = A_01_2 + A_10_1;                                      const double tmp13 = w5*(A_01_1 - A_10_0);
2551                                      const double tmp14_0 = A_01_0 + A_01_3 + A_10_0 + A_10_3;                                      const double tmp14 = w2*(-A_01_2 + A_10_3);
2552                                      const double tmp15_0 = A_01_1 + A_10_2;                                      const double tmp15 = w7*(A_11_0 + A_11_2);
2553                                      const double tmp16_0 = A_10_0 + A_10_3;                                      const double tmp16 = w4*(-A_00_2 - A_00_3);
2554                                      const double tmp17_0 = A_01_1 + A_01_2;                                      const double tmp17 = w0*(-A_00_0 - A_00_1);
2555                                      const double tmp18_0 = A_01_1 + A_10_1;                                      const double tmp18 = w5*(A_01_3 + A_10_3);
2556                                      const double tmp19_0 = A_01_2 + A_10_2;                                      const double tmp19 = w8*(A_11_1 + A_11_3);
2557                                      const double tmp0_1 = A_10_3*w8;                                      const double tmp20 = w2*(-A_01_0 - A_10_0);
2558                                      const double tmp1_1 = tmp0_0*w1;                                      const double tmp21 = w7*(A_11_1 + A_11_3);
2559                                      const double tmp2_1 = A_01_1*w4;                                      const double tmp22 = w4*(-A_00_0 - A_00_1);
2560                                      const double tmp3_1 = tmp1_0*w0;                                      const double tmp23 = w0*(-A_00_2 - A_00_3);
2561                                      const double tmp4_1 = A_01_2*w7;                                      const double tmp24 = w5*(A_01_0 + A_10_0);
2562                                      const double tmp5_1 = tmp2_0*w3;                                      const double tmp25 = w8*(A_11_0 + A_11_2);
2563                                      const double tmp6_1 = tmp3_0*w6;                                      const double tmp26 = w2*(-A_01_3 - A_10_3);
2564                                      const double tmp7_1 = A_10_0*w2;                                      const double tmp27 = w5*(-A_01_1 - A_10_2);
2565                                      const double tmp8_1 = tmp4_0*w5;                                      const double tmp28 = w1*(-A_01_0 - A_01_3 - A_10_0 - A_10_3);
2566                                      const double tmp9_1 = tmp2_0*w10;                                      const double tmp29 = w2*(A_01_2 + A_10_1);
2567                                      const double tmp10_1 = tmp5_0*w9;                                      const double tmp30 = w7*(-A_11_1 - A_11_3);
2568                                      const double tmp11_1 = tmp6_0*w7;                                      const double tmp31 = w1*(-A_01_1 - A_01_2 + A_10_0 + A_10_3);
2569                                      const double tmp12_1 = tmp7_0*w4;                                      const double tmp32 = w5*(-A_01_0 + A_10_2);
2570                                      const double tmp13_1 = tmp8_0*w1;                                      const double tmp33 = w8*(-A_11_0 - A_11_2);
2571                                      const double tmp14_1 = A_10_0*w8;                                      const double tmp34 = w6*(-A_00_0 - A_00_1 - A_00_2 - A_00_3);
2572                                      const double tmp15_1 = A_01_2*w4;                                      const double tmp35 = w2*(A_01_3 - A_10_1);
2573                                      const double tmp16_1 = tmp3_0*w0;                                      const double tmp36 = w5*(A_01_0 + A_10_3);
2574                                      const double tmp17_1 = A_01_1*w7;                                      const double tmp37 = w2*(-A_01_3 - A_10_0);
2575                                      const double tmp18_1 = tmp1_0*w6;                                      const double tmp38 = w7*(-A_11_0 - A_11_2);
2576                                      const double tmp19_1 = A_10_3*w2;                                      const double tmp39 = w5*(-A_01_3 + A_10_1);
2577                                      const double tmp20_1 = tmp9_0*w4;                                      const double tmp40 = w8*(-A_11_1 - A_11_3);
2578                                      const double tmp21_1 = tmp1_0*w11;                                      const double tmp41 = w2*(A_01_0 - A_10_2);
2579                                      const double tmp22_1 = tmp10_0*w7;                                      const double tmp42 = w5*(A_01_1 - A_10_3);
2580                                      const double tmp23_1 = tmp3_0*w14;                                      const double tmp43 = w2*(-A_01_2 + A_10_0);
2581                                      const double tmp24_1 = tmp11_0*w13;                                      const double tmp44 = w5*(A_01_2 - A_10_0);
2582                                      const double tmp25_1 = tmp12_0*w12;                                      const double tmp45 = w2*(-A_01_1 + A_10_3);
2583                                      const double tmp26_1 = tmp10_0*w4;                                      const double tmp46 = w5*(-A_01_0 + A_10_1);
2584                                      const double tmp27_1 = tmp3_0*w11;                                      const double tmp47 = w2*(A_01_3 - A_10_2);
2585                                      const double tmp28_1 = tmp9_0*w7;                                      const double tmp48 = w5*(-A_01_1 - A_10_1);
2586                                      const double tmp29_1 = tmp1_0*w14;                                      const double tmp49 = w2*(A_01_2 + A_10_2);
2587                                      const double tmp30_1 = tmp12_0*w13;                                      const double tmp50 = w5*(-A_01_3 + A_10_2);
2588                                      const double tmp31_1 = tmp11_0*w12;                                      const double tmp51 = w2*(A_01_0 - A_10_1);
2589                                      const double tmp32_1 = tmp13_0*w2;                                      const double tmp52 = w5*(-A_01_2 - A_10_1);
2590                                      const double tmp33_1 = tmp14_0*w5;                                      const double tmp53 = w2*(A_01_1 + A_10_2);
2591                                      const double tmp34_1 = tmp15_0*w8;                                      const double tmp54 = w5*(-A_01_2 - A_10_2);
2592                                      const double tmp35_1 = A_01_0*w8;                                      const double tmp55 = w2*(A_01_1 + A_10_1);
2593                                      const double tmp36_1 = tmp16_0*w1;                                      EM_S[INDEX4(k,m,0,0,numEq,numComp,4)]+=tmp15 + tmp16 + tmp17 + tmp18 + tmp19 + tmp20 + tmp9;
2594                                      const double tmp37_1 = A_10_1*w4;                                      EM_S[INDEX4(k,m,0,1,numEq,numComp,4)]+=tmp0 + tmp1 + tmp2 + tmp3 + tmp4 + tmp5;
2595                                      const double tmp38_1 = tmp5_0*w15;                                      EM_S[INDEX4(k,m,0,2,numEq,numComp,4)]+=tmp31 + tmp34 + tmp38 + tmp39 + tmp40 + tmp41;
2596                                      const double tmp39_1 = A_10_2*w7;                                      EM_S[INDEX4(k,m,0,3,numEq,numComp,4)]+=tmp28 + tmp52 + tmp53 + tmp7 + tmp8;
2597                                      const double tmp40_1 = tmp11_0*w17;                                      EM_S[INDEX4(k,m,1,0,numEq,numComp,4)]+=tmp0 + tmp2 + tmp3 + tmp31 + tmp50 + tmp51;
2598                                      const double tmp41_1 = A_01_3*w2;                                      EM_S[INDEX4(k,m,1,1,numEq,numComp,4)]+=tmp16 + tmp17 + tmp21 + tmp25 + tmp28 + tmp54 + tmp55;
2599                                      const double tmp42_1 = tmp12_0*w16;                                      EM_S[INDEX4(k,m,1,2,numEq,numComp,4)]+=tmp10 + tmp6 + tmp7 + tmp8 + tmp9;
2600                                      const double tmp43_1 = tmp17_0*w5;                                      EM_S[INDEX4(k,m,1,3,numEq,numComp,4)]+=tmp1 + tmp30 + tmp33 + tmp34 + tmp44 + tmp45;
2601                                      const double tmp44_1 = tmp7_0*w7;                                      EM_S[INDEX4(k,m,2,0,numEq,numComp,4)]+=tmp1 + tmp34 + tmp38 + tmp40 + tmp42 + tmp43;
2602                                      const double tmp45_1 = tmp6_0*w4;                                      EM_S[INDEX4(k,m,2,1,numEq,numComp,4)]+=tmp36 + tmp37 + tmp7 + tmp8 + tmp9;
2603                                      const double tmp46_1 = A_01_3*w8;                                      EM_S[INDEX4(k,m,2,2,numEq,numComp,4)]+=tmp15 + tmp19 + tmp22 + tmp23 + tmp28 + tmp48 + tmp49;
2604                                      const double tmp47_1 = A_10_2*w4;                                      EM_S[INDEX4(k,m,2,3,numEq,numComp,4)]+=tmp0 + tmp11 + tmp12 + tmp31 + tmp46 + tmp47;
2605                                      const double tmp48_1 = A_10_1*w7;                                      EM_S[INDEX4(k,m,3,0,numEq,numComp,4)]+=tmp27 + tmp28 + tmp29 + tmp7 + tmp8;
2606                                      const double tmp49_1 = tmp12_0*w17;                                      EM_S[INDEX4(k,m,3,1,numEq,numComp,4)]+=tmp30 + tmp31 + tmp32 + tmp33 + tmp34 + tmp35;
2607                                      const double tmp50_1 = A_01_0*w2;                                      EM_S[INDEX4(k,m,3,2,numEq,numComp,4)]+=tmp0 + tmp1 + tmp11 + tmp12 + tmp13 + tmp14;
2608                                      const double tmp51_1 = tmp11_0*w16;                                      EM_S[INDEX4(k,m,3,3,numEq,numComp,4)]+=tmp21 + tmp22 + tmp23 + tmp24 + tmp25 + tmp26 + tmp9;
                                     const double tmp52_1 = tmp18_0*w8;  
                                     const double tmp53_1 = tmp19_0*w2;  
                                     const double tmp54_1 = tmp13_0*w8;  
                                     const double tmp55_1 = tmp15_0*w2;  
                                     const double tmp56_1 = tmp19_0*w8;  
                                     const double tmp57_1 = tmp18_0*w2;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,0,0,numEq,numComp,4)]+=tmp13_1 + tmp20_1 + tmp21_1 + tmp22_1 + tmp23_1 + tmp24_1 + tmp25_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,1,0,numEq,numComp,4)]+=tmp36_1 + tmp37_1 + tmp39_1 + tmp3_1 + tmp43_1 + tmp46_1 + tmp50_1 + tmp5_1 + tmp6_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,2,0,numEq,numComp,4)]+=tmp0_1 + tmp15_1 + tmp17_1 + tmp1_1 + tmp38_1 + tmp49_1 + tmp51_1 + tmp7_1 + tmp8_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,3,0,numEq,numComp,4)]+=tmp10_1 + tmp32_1 + tmp33_1 + tmp34_1 + tmp9_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,0,1,numEq,numComp,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1 + tmp2_1 + tmp3_1 + tmp4_1 + tmp5_1 + tmp6_1 + tmp7_1 + tmp8_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,1,1,numEq,numComp,4)]+=tmp21_1 + tmp23_1 + tmp30_1 + tmp31_1 + tmp33_1 + tmp56_1 + tmp57_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,2,1,numEq,numComp,4)]+=tmp10_1 + tmp13_1 + tmp44_1 + tmp45_1 + tmp9_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,3,1,numEq,numComp,4)]+=tmp35_1 + tmp36_1 + tmp37_1 + tmp38_1 + tmp39_1 + tmp40_1 + tmp41_1 + tmp42_1 + tmp43_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,0,2,numEq,numComp,4)]+=tmp36_1 + tmp38_1 + tmp43_1 + tmp46_1 + tmp47_1 + tmp48_1 + tmp49_1 + tmp50_1 + tmp51_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,1,2,numEq,numComp,4)]+=tmp10_1 + tmp11_1 + tmp12_1 + tmp13_1 + tmp9_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,2,2,numEq,numComp,4)]+=tmp24_1 + tmp25_1 + tmp27_1 + tmp29_1 + tmp33_1 + tmp52_1 + tmp53_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,3,2,numEq,numComp,4)]+=tmp14_1 + tmp15_1 + tmp16_1 + tmp17_1 + tmp18_1 + tmp19_1 + tmp1_1 + tmp5_1 + tmp8_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,0,3,numEq,numComp,4)]+=tmp10_1 + tmp33_1 + tmp54_1 + tmp55_1 + tmp9_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,1,3,numEq,numComp,4)]+=tmp14_1 + tmp19_1 + tmp1_1 + tmp2_1 + tmp38_1 + tmp40_1 + tmp42_1 + tmp4_1 + tmp8_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,2,3,numEq,numComp,4)]+=tmp16_1 + tmp18_1 + tmp35_1 + tmp36_1 + tmp41_1 + tmp43_1 + tmp47_1 + tmp48_1 + tmp5_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,3,3,numEq,numComp,4)]+=tmp13_1 + tmp26_1 + tmp27_1 + tmp28_1 + tmp29_1 + tmp30_1 + tmp31_1;  
2609                                  }                                  }
2610                              }                              }
2611                          } else { // constant data                          } else { // constant data
# Line 2593  void Rectangle::assemblePDESystem(Paso_S Line 2615  void Rectangle::assemblePDESystem(Paso_S
2615                                      const double A_01 = A_p[INDEX4(k,0,m,1, numEq,2, numComp)];                                      const double A_01 = A_p[INDEX4(k,0,m,1, numEq,2, numComp)];
2616                                      const double A_10 = A_p[INDEX4(k,1,m,0, numEq,2, numComp)];                                      const double A_10 = A_p[INDEX4(k,1,m,0, numEq,2, numComp)];
2617                                      const double A_11 = A_p[INDEX4(k,1,m,1, numEq,2, numComp)];                                      const double A_11 = A_p[INDEX4(k,1,m,1, numEq,2, numComp)];
2618                                      const double tmp0_0 = A_01 + A_10;                                      const double tmp0 = 6*w1*(A_01 - A_10);
2619                                      const double tmp0_1 = A_00*w18;                                      const double tmp1 = 6*w1*(A_01 + A_10);
2620                                      const double tmp1_1 = A_01*w19;                                      const double tmp2 = 6*w1*(-A_01 - A_10);
2621                                      const double tmp2_1 = A_10*w20;                                      const double tmp3 = 6*w1*(-A_01 + A_10);
2622                                      const double tmp3_1 = A_11*w21;                                      EM_S[INDEX4(k,m,0,0,numEq,numComp,4)]+=-8*A_00*w6 + 8*A_11*w3 + tmp1;
2623                                      const double tmp4_1 = A_00*w22;                                      EM_S[INDEX4(k,m,0,1,numEq,numComp,4)]+=8*A_00*w6 + 4*A_11*w3 + tmp0;
2624                                      const double tmp5_1 = tmp0_0*w19;                                      EM_S[INDEX4(k,m,0,2,numEq,numComp,4)]+=-4*A_00*w6 - 8*A_11*w3 + tmp3;
2625                                      const double tmp6_1 = A_11*w23;                                      EM_S[INDEX4(k,m,0,3,numEq,numComp,4)]+=4*A_00*w6 - 4*A_11*w3 + tmp2;
2626                                      const double tmp7_1 = A_11*w25;                                      EM_S[INDEX4(k,m,1,0,numEq,numComp,4)]+=8*A_00*w6 + 4*A_11*w3 + tmp3;
2627                                      const double tmp8_1 = A_00*w24;                                      EM_S[INDEX4(k,m,1,1,numEq,numComp,4)]+=-8*A_00*w6 + 8*A_11*w3 + tmp2;
2628                                      const double tmp9_1 = tmp0_0*w20;                                      EM_S[INDEX4(k,m,1,2,numEq,numComp,4)]+=4*A_00*w6 - 4*A_11*w3 + tmp1;
2629                                      const double tmp10_1 = A_01*w20;                                      EM_S[INDEX4(k,m,1,3,numEq,numComp,4)]+=-4*A_00*w6 - 8*A_11*w3 + tmp0;
2630                                      const double tmp11_1 = A_11*w27;                                      EM_S[INDEX4(k,m,2,0,numEq,numComp,4)]+=-4*A_00*w6 - 8*A_11*w3 + tmp0;
2631                                      const double tmp12_1 = A_00*w26;                                      EM_S[INDEX4(k,m,2,1,numEq,numComp,4)]+=4*A_00*w6 - 4*A_11*w3 + tmp1;
2632                                      const double tmp13_1 = A_10*w19;                                      EM_S[INDEX4(k,m,2,2,numEq,numComp,4)]+=-8*A_00*w6 + 8*A_11*w3 + tmp2;
2633                                      EM_S[INDEX4(k,m,0,0,numEq,numComp,4)]+=tmp5_1 + tmp7_1 + tmp8_1;                                      EM_S[INDEX4(k,m,2,3,numEq,numComp,4)]+=8*A_00*w6 + 4*A_11*w3 + tmp3;
2634                                      EM_S[INDEX4(k,m,1,0,numEq,numComp,4)]+=tmp0_1 + tmp10_1 + tmp13_1 + tmp3_1;                                      EM_S[INDEX4(k,m,3,0,numEq,numComp,4)]+=4*A_00*w6 - 4*A_11*w3 + tmp2;
2635                                      EM_S[INDEX4(k,m,2,0,numEq,numComp,4)]+=tmp11_1 + tmp12_1 + tmp1_1 + tmp2_1;                                      EM_S[INDEX4(k,m,3,1,numEq,numComp,4)]+=-4*A_00*w6 - 8*A_11*w3 + tmp3;
2636                                      EM_S[INDEX4(k,m,3,0,numEq,numComp,4)]+=tmp4_1 + tmp6_1 + tmp9_1;                                      EM_S[INDEX4(k,m,3,2,numEq,numComp,4)]+=8*A_00*w6 + 4*A_11*w3 + tmp0;
2637                                      EM_S[INDEX4(k,m,0,1,numEq,numComp,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1 + tmp2_1 + tmp3_1;                                      EM_S[INDEX4(k,m,3,3,numEq,numComp,4)]+=-8*A_00*w6 + 8*A_11*w3 + tmp1;
                                     EM_S[INDEX4(k,m,1,1,numEq,numComp,4)]+=tmp7_1 + tmp8_1 + tmp9_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,2,1,numEq,numComp,4)]+=tmp4_1 + tmp5_1 + tmp6_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,3,1,numEq,numComp,4)]+=tmp10_1 + tmp11_1 + tmp12_1 + tmp13_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,0,2,numEq,numComp,4)]+=tmp10_1 + tmp11_1 + tmp12_1 + tmp13_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,1,2,numEq,numComp,4)]+=tmp4_1 + tmp5_1 + tmp6_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,2,2,numEq,numComp,4)]+=tmp7_1 + tmp8_1 + tmp9_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,3,2,numEq,numComp,4)]+=tmp0_1 + tmp1_1 + tmp2_1 + tmp3_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,0,3,numEq,numComp,4)]+=tmp4_1 + tmp6_1 + tmp9_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,1,3,numEq,numComp,4)]+=tmp11_1 + tmp12_1 + tmp1_1 + tmp2_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,2,3,numEq,numComp,4)]+=tmp0_1 + tmp10_1 + tmp13_1 + tmp3_1;  
                                     EM_S[INDEX4(k,m,3,3,numEq,numComp,4)]+=tmp5_1 + tmp7_1 + tmp8_1;  
2638                                  }                                  }
2639                              }                              }
2640                          }                          }
# Line 2645  void Rectangle::assemblePDESystem(Paso_S Line 2656  void Rectangle::assemblePDESystem(Paso_S
2656                                      const double B_1_2 = B_p[INDEX4(k,1,m,2, numEq,2,numComp)];                                      const double B_1_2 = B_p[INDEX4(k,1,m,2, numEq,2,numComp)];
2657                                      const double B_0_3 = B_p[INDEX4(k,0,m,3, numEq,2,numComp)];                                      const double B_0_3 = B_p[INDEX4(k,0,m,3, numEq,2,numComp)];
2658                                      const double B_1_3 = B_p[INDEX4(k,1,m,3, numEq,2,numComp)];                                      const double B_1_3 = B_p[INDEX4(k,1,m,3, numEq,2,numComp)];
2659                                      const double tmp0_0 = B_1_0 + B_1_1;                                      const double tmp0 = w11*(B_1_0 + B_1_1);
2660                                      const double tmp1_0 = B_1_2 + B_1_3;                                      const double tmp1 = w14*(B_1_2 + B_1_3);
2661                                      const double tmp2_0 = B_0_1 + B_0_3;                                      const double tmp2 = w15*(-B_0_1 - B_0_3);
2662                                      const double tmp3_0 = B_0_0 + B_0_2;                                      const double tmp3 = w10*(-B_0_0 - B_0_2);
2663                                      const double tmp63_1 = B_1_1*w42;                                      const double tmp4 = w11*(B_1_2 + B_1_3);
2664                                      const double tmp79_1 = B_1_1*w40;                                      const double tmp5 = w14*(B_1_0 + B_1_1);
2665                                      const double tmp37_1 = tmp3_0*w35;                                      const double tmp6 = w11*(-B_1_2 - B_1_3);
2666                                      const double tmp8_1 = tmp0_0*w32;                                      const double tmp7 = w14*(-B_1_0 - B_1_1);
2667                                      const double tmp71_1 = B_0_1*w34;                                      const double tmp8 = w11*(-B_1_0 - B_1_1);
2668                                      const double tmp19_1 = B_0_3*w31;                                      const double tmp9 = w14*(-B_1_2 - B_1_3);
2669                                      const double tmp15_1 = B_0_3*w34;                                      const double tmp10 = w10*(-B_0_1 - B_0_3);
2670                                      const double tmp9_1 = tmp3_0*w34;                                      const double tmp11 = w15*(-B_0_0 - B_0_2);
2671                                      const double tmp35_1 = B_1_0*w36;                                      const double tmp12 = w15*(B_0_0 + B_0_2);
2672                                      const double tmp66_1 = B_0_3*w28;                                      const double tmp13 = w10*(B_0_1 + B_0_3);
2673                                      const double tmp28_1 = B_1_0*w42;                                      const double tmp14 = w10*(B_0_0 + B_0_2);
2674                                      const double tmp22_1 = B_1_0*w40;                                      const double tmp15 = w15*(B_0_1 + B_0_3);
2675                                      const double tmp16_1 = B_1_2*w29;                                      EM_S[INDEX4(k,m,0,0,numEq,numComp,4)]+=B_0_0*w12 + B_0_1*w10 + B_0_2*w15 + B_0_3*w13 + B_1_0*w16 + B_1_1*w14 + B_1_2*w11 + B_1_3*w17;
2676                                      const double tmp6_1 = tmp2_0*w35;                                      EM_S[INDEX4(k,m,0,1,numEq,numComp,4)]+=B_0_0*w10 + B_0_1*w12 + B_0_2*w13 + B_0_3*w15 + tmp0 + tmp1;
2677                                      const double tmp55_1 = B_1_3*w40;                                      EM_S[INDEX4(k,m,0,2,numEq,numComp,4)]+=B_1_0*w11 + B_1_1*w17 + B_1_2*w16 + B_1_3*w14 + tmp14 + tmp15;
2678                                      const double tmp50_1 = B_1_3*w42;                                      EM_S[INDEX4(k,m,0,3,numEq,numComp,4)]+=tmp12 + tmp13 + tmp4 + tmp5;
2679                                      const double tmp7_1 = tmp1_0*w29;                                      EM_S[INDEX4(k,m,1,0,numEq,numComp,4)]+=-B_0_0*w12 - B_0_1*w10 - B_0_2*w15 - B_0_3*w13 + tmp0 + tmp1;
2680                                      const double tmp1_1 = tmp1_0*w32;                                      EM_S[INDEX4(k,m,1,1,numEq,numComp,4)]+=-B_0_0*w10 - B_0_1*w12 - B_0_2*w13 - B_0_3*w15 + B_1_0*w14 + B_1_1*w16 + B_1_2*w17 + B_1_3*w11;
2681                                      const double tmp57_1 = B_0_3*w30;                                      EM_S[INDEX4(k,m,1,2,numEq,numComp,4)]+=tmp2 + tmp3 + tmp4 + tmp5;
2682                                      const double tmp18_1 = B_1_1*w32;                                      EM_S[INDEX4(k,m,1,3,numEq,numComp,4)]+=B_1_0*w17 + B_1_1*w11 + B_1_2*w14 + B_1_3*w16 + tmp10 + tmp11;
2683                                      const double tmp53_1 = B_1_0*w41;                                      EM_S[INDEX4(k,m,2,0,numEq,numComp,4)]+=-B_1_0*w16 - B_1_1*w14 - B_1_2*w11 - B_1_3*w17 + tmp14 + tmp15;
2684                                      const double tmp61_1 = B_1_3*w36;                                      EM_S[INDEX4(k,m,2,1,numEq,numComp,4)]+=tmp12 + tmp13 + tmp8 + tmp9;
2685                                      const double tmp27_1 = B_0_3*w38;                                      EM_S[INDEX4(k,m,2,2,numEq,numComp,4)]+=B_0_0*w15 + B_0_1*w13 + B_0_2*w12 + B_0_3*w10 - B_1_0*w11 - B_1_1*w17 - B_1_2*w16 - B_1_3*w14;
2686                                      const double tmp64_1 = B_0_2*w30;                                      EM_S[INDEX4(k,m,2,3,numEq,numComp,4)]+=B_0_0*w13 + B_0_1*w15 + B_0_2*w10 + B_0_3*w12 + tmp6 + tmp7;
2687                                      const double tmp76_1 = B_0_1*w38;                                      EM_S[INDEX4(k,m,3,0,numEq,numComp,4)]+=tmp2 + tmp3 + tmp8 + tmp9;
2688                                      const double tmp39_1 = tmp2_0*w34;                                      EM_S[INDEX4(k,m,3,1,numEq,numComp,4)]+=-B_1_0*w14 - B_1_1*w16 - B_1_2*w17 - B_1_3*w11 + tmp10 + tmp11;
2689                                      const double tmp62_1 = B_0_1*w31;                                      EM_S[INDEX4(k,m,3,2,numEq,numComp,4)]+=-B_0_0*w15 - B_0_1*w13 - B_0_2*w12 - B_0_3*w10 + tmp6 + tmp7;
2690               &nbs